View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20633_low_99 (Length: 329)

Name: NF20633_low_99
Description: NF20633
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20633_low_99
NF20633_low_99
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (180-321)||(2533272-2533413)
chr8 (191-321)||(22683999-22684129)
chr8 (180-321)||(28707446-28707587)
chr8 (180-321)||(36400070-36400211)
chr8 (180-317)||(37933646-37933783)
chr8 (180-316)||(15847117-15847253)
chr8 (180-321)||(513308-513448)
chr8 (180-321)||(1293486-1293627)
chr8 (180-321)||(3875908-3876049)
chr8 (180-317)||(38107103-38107240)
chr8 (180-321)||(43806533-43806674)
chr8 (180-319)||(35884430-35884569)
chr8 (191-321)||(9056349-9056479)
chr8 (180-317)||(259982-260118)
chr8 (180-317)||(655803-655939)
chr8 (180-317)||(841538-841674)
chr8 (180-321)||(35443311-35443452)
chr8 (180-321)||(33651841-33651982)
chr8 (201-321)||(7434886-7435006)
chr8 (180-317)||(38208756-38208894)
chr8 (204-321)||(12010549-12010666)
chr8 (180-321)||(38633710-38633851)
chr8 (201-321)||(23935233-23935353)
chr8 (201-319)||(6016207-6016325)
chr8 (180-321)||(23972295-23972437)
chr8 (180-306)||(41536527-41536653)
chr8 (180-321)||(28496355-28496495)
chr8 (180-317)||(40301893-40302030)
chr8 (180-317)||(440844-440981)
chr8 (194-321)||(39513353-39513480)
chr8 (180-321)||(13797089-13797229)
chr8 (180-321)||(24430571-24430712)
chr8 (201-321)||(29485287-29485406)
chr8 (194-321)||(42988240-42988367)
chr8 (180-317)||(4649154-4649291)
chr8 (180-317)||(36218781-36218917)
chr8 (243-321)||(24193356-24193433)
chr8 (181-245)||(24193131-24193195)
chr8 (257-315)||(8137180-8137238)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (200-321)||(27364359-27364480)
chr7 (180-321)||(1469493-1469634)
chr7 (180-321)||(35600122-35600263)
chr7 (180-321)||(47281124-47281265)
chr7 (180-321)||(31684134-31684275)
chr7 (181-321)||(44544409-44544549)
chr7 (180-321)||(23842305-23842446)
chr7 (180-321)||(30971941-30972082)
chr7 (180-321)||(47271981-47272122)
chr7 (181-317)||(33884323-33884459)
chr7 (181-321)||(47219145-47219285)
chr7 (191-321)||(8162723-8162853)
chr7 (180-321)||(30876259-30876400)
chr7 (180-317)||(37393998-37394135)
chr7 (180-321)||(38427563-38427704)
chr7 (180-321)||(43968259-43968400)
chr7 (180-321)||(45723491-45723632)
chr7 (180-321)||(47294291-47294432)
chr7 (180-321)||(48628805-48628946)
chr7 (191-317)||(4923220-4923346)
chr7 (180-321)||(11476556-11476697)
chr7 (180-321)||(30798368-30798509)
chr7 (180-321)||(40851274-40851415)
chr7 (180-321)||(42979338-42979479)
chr7 (180-308)||(2960640-2960768)
chr7 (200-316)||(7336065-7336181)
chr7 (191-321)||(41113377-41113507)
chr7 (180-321)||(43752776-43752917)
chr7 (201-321)||(3797544-3797664)
chr7 (201-317)||(37354284-37354400)
chr7 (192-321)||(47579098-47579228)
chr7 (180-317)||(11050261-11050398)
chr7 (180-296)||(221300-221416)
chr7 (20-108)||(27364179-27364267)
chr7 (213-321)||(41139445-41139553)
chr7 (191-321)||(29248342-29248472)
chr7 (191-317)||(44800421-44800547)
chr7 (201-321)||(27774108-27774228)
chr7 (180-321)||(47119991-47120134)
chr7 (180-317)||(18353148-18353285)
chr7 (228-321)||(40520918-40521011)
chr7 (261-321)||(39034062-39034122)
chr7 (278-321)||(43025112-43025155)
chr7 (272-321)||(29739781-29739829)
chr7 (180-233)||(42888937-42888990)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (180-321)||(55517185-55517326)
chr4 (180-321)||(4544985-4545126)
chr4 (180-321)||(11795154-11795295)
chr4 (180-321)||(33807780-33807921)
chr4 (180-321)||(42273802-42273943)
chr4 (191-321)||(19496113-19496243)
chr4 (180-321)||(28264643-28264784)
chr4 (180-319)||(26017425-26017564)
chr4 (181-320)||(33174021-33174160)
chr4 (191-321)||(12196469-12196599)
chr4 (191-321)||(28159964-28160094)
chr4 (191-321)||(48707744-48707874)
chr4 (180-321)||(17847096-17847236)
chr4 (180-321)||(31591076-31591216)
chr4 (180-321)||(31973591-31973732)
chr4 (181-321)||(40988633-40988773)
chr4 (180-316)||(44490324-44490460)
chr4 (180-316)||(49118616-49118752)
chr4 (180-319)||(2055280-2055419)
chr4 (180-319)||(24458631-24458770)
chr4 (191-317)||(32317957-32318083)
chr4 (180-321)||(5227390-5227531)
chr4 (180-321)||(15985010-15985151)
chr4 (180-317)||(23135006-23135143)
chr4 (180-317)||(23553069-23553205)
chr4 (180-321)||(28812287-28812427)
chr4 (180-319)||(8882013-8882152)
chr4 (191-321)||(9339134-9339267)
chr4 (180-318)||(48149502-48149640)
chr4 (180-321)||(17993017-17993158)
chr4 (180-317)||(30467003-30467140)
chr4 (180-321)||(35930040-35930180)
chr4 (180-317)||(48551764-48551901)
chr4 (180-321)||(50542354-50542495)
chr4 (201-321)||(19168816-19168936)
chr4 (201-321)||(24623148-24623268)
chr4 (181-321)||(32118714-32118854)
chr4 (191-319)||(37381848-37381976)
chr4 (180-321)||(39995167-39995308)
chr4 (182-321)||(10588580-10588719)
chr4 (191-317)||(25734234-25734360)
chr4 (180-321)||(14564796-14564937)
chr4 (180-321)||(30141108-30141249)
chr4 (180-321)||(39700045-39700186)
chr4 (180-321)||(22298517-22298659)
chr4 (180-321)||(33693333-33693474)
chr4 (180-319)||(50276138-50276274)
chr4 (180-321)||(51371047-51371188)
chr4 (180-317)||(25730244-25730381)
chr4 (180-289)||(31208776-31208885)
chr4 (201-321)||(42549643-42549762)
chr4 (240-321)||(56555200-56555281)
chr4 (180-261)||(20534225-20534306)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (180-321)||(23767414-23767555)
chr1 (180-321)||(7553016-7553157)
chr1 (180-321)||(12143072-12143213)
chr1 (180-321)||(19315640-19315781)
chr1 (180-321)||(26549388-26549529)
chr1 (180-321)||(38473626-38473767)
chr1 (180-321)||(7651662-7651803)
chr1 (180-321)||(41106016-41106157)
chr1 (180-321)||(46825531-46825672)
chr1 (180-319)||(49814302-49814441)
chr1 (180-321)||(28425363-28425504)
chr1 (180-317)||(49094711-49094848)
chr1 (180-321)||(50689943-50690084)
chr1 (180-319)||(25988271-25988410)
chr1 (180-321)||(18892329-18892470)
chr1 (180-317)||(26069896-26070033)
chr1 (180-321)||(36157678-36157818)
chr1 (181-321)||(19274559-19274699)
chr1 (180-319)||(36781172-36781311)
chr1 (191-321)||(33674017-33674147)
chr1 (180-321)||(33325727-33325868)
chr1 (200-317)||(45350735-45350852)
chr1 (180-321)||(46051450-46051591)
chr1 (182-317)||(41982237-41982372)
chr1 (180-317)||(9878784-9878921)
chr1 (180-321)||(16705870-16706011)
chr1 (180-321)||(23228194-23228335)
chr1 (180-321)||(46095075-46095216)
chr1 (180-321)||(48802331-48802472)
chr1 (180-321)||(52067651-52067792)
chr1 (180-321)||(52146993-52147134)
chr1 (180-321)||(52349924-52350065)
chr1 (191-321)||(24204482-24204612)
chr1 (180-321)||(6711440-6711581)
chr1 (180-321)||(7608766-7608907)
chr1 (180-317)||(9962755-9962892)
chr1 (180-317)||(48669396-48669533)
chr1 (181-321)||(18917524-18917664)
chr1 (181-321)||(50533383-50533523)
chr1 (180-321)||(40721342-40721484)
chr1 (180-317)||(45670486-45670623)
chr1 (191-316)||(5400876-5401000)
chr1 (180-317)||(8141486-8141623)
chr1 (220-321)||(12964646-12964747)
chr1 (180-317)||(37216900-37217037)
chr1 (201-321)||(33194672-33194792)
chr1 (201-317)||(48319067-48319183)
chr1 (200-317)||(9974846-9974963)
chr1 (180-321)||(17983898-17984039)
chr1 (180-321)||(43396675-43396816)
chr1 (180-317)||(21965069-21965206)
chr1 (180-317)||(34971084-34971221)
chr1 (201-317)||(16506809-16506925)
chr1 (201-321)||(30281631-30281751)
chr1 (180-316)||(33714361-33714495)
chr1 (191-317)||(18782100-18782226)
chr1 (180-316)||(21929526-21929667)
chr1 (180-317)||(25800648-25800782)
chr1 (243-321)||(50099220-50099298)
chr1 (273-321)||(44979281-44979329)
chr1 (180-281)||(44978768-44978868)
chr1 (277-321)||(32373650-32373694)
chr1 (277-319)||(17989864-17989906)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (180-321)||(47329175-47329316)
chr3 (180-321)||(20813441-20813582)
chr3 (180-321)||(26455582-26455723)
chr3 (180-321)||(33151696-33151837)
chr3 (180-317)||(35346471-35346608)
chr3 (180-321)||(38446476-38446617)
chr3 (180-321)||(42107099-42107240)
chr3 (180-321)||(1017044-1017185)
chr3 (180-317)||(1687655-1687792)
chr3 (180-321)||(20760071-20760212)
chr3 (180-321)||(21564496-21564637)
chr3 (180-316)||(42016878-42017014)
chr3 (191-321)||(19664541-19664671)
chr3 (180-321)||(21656518-21656659)
chr3 (180-321)||(31122662-31122803)
chr3 (180-317)||(50287570-50287707)
chr3 (181-321)||(29677476-29677616)
chr3 (194-321)||(22851996-22852123)
chr3 (191-321)||(36314983-36315113)
chr3 (191-321)||(41250886-41251016)
chr3 (180-321)||(20086314-20086455)
chr3 (180-321)||(51562162-51562303)
chr3 (180-321)||(53196014-53196155)
chr3 (180-316)||(21890175-21890311)
chr3 (194-321)||(53925993-53926120)
chr3 (194-321)||(55164129-55164256)
chr3 (191-321)||(12748391-12748521)
chr3 (212-321)||(19268521-19268630)
chr3 (180-321)||(27070739-27070880)
chr3 (180-317)||(40922165-40922302)
chr3 (180-321)||(48651248-48651389)
chr3 (201-317)||(51475267-51475383)
chr3 (191-317)||(32650831-32650957)
chr3 (180-317)||(10618480-10618617)
chr3 (180-321)||(37247956-37248097)
chr3 (180-321)||(44798268-44798408)
chr3 (180-321)||(52821049-52821190)
chr3 (191-319)||(3697148-3697276)
chr3 (201-321)||(50364908-50365028)
chr3 (201-319)||(50977866-50977984)
chr3 (201-319)||(51080998-51081116)
chr3 (212-321)||(1448764-1448873)
chr3 (180-321)||(35608131-35608272)
chr3 (180-319)||(20913754-20913893)
chr3 (180-319)||(20921872-20922011)
chr3 (180-321)||(39069726-39069867)
chr3 (221-321)||(28699685-28699785)
chr3 (180-321)||(33473239-33473380)
chr3 (180-321)||(45380260-45380401)
chr3 (248-321)||(44152700-44152773)
chr3 (201-319)||(34019462-34019580)
chr3 (257-321)||(47473230-47473294)
chr3 (191-306)||(38924009-38924124)
chr3 (215-290)||(42641213-42641288)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (181-321)||(6503718-6503858)
chr6 (191-321)||(1915354-1915484)
chr6 (180-321)||(3408189-3408330)
chr6 (180-321)||(2707459-2707600)
chr6 (180-321)||(12626636-12626777)
chr6 (180-319)||(2390267-2390406)
chr6 (180-321)||(10256237-10256378)
chr6 (180-321)||(8178249-8178390)
chr6 (180-321)||(9382519-9382660)
chr6 (180-317)||(16193314-16193451)
chr6 (180-321)||(26230932-26231073)
chr6 (200-317)||(26393029-26393146)
chr6 (180-321)||(29050272-29050413)
chr6 (180-317)||(30379021-30379158)
chr6 (180-310)||(2598099-2598229)
chr6 (180-317)||(17428272-17428409)
chr6 (180-317)||(17943040-17943177)
chr6 (180-317)||(1077241-1077378)
chr6 (180-321)||(3258807-3258948)
chr6 (180-321)||(11133873-11134015)
chr6 (201-321)||(26936607-26936727)
chr6 (200-306)||(35223919-35224025)
chr6 (193-317)||(26196334-26196458)
chr6 (180-321)||(6785101-6785239)
chr6 (191-317)||(10931159-10931288)
chr6 (180-267)||(31375971-31376058)
chr6 (181-317)||(25820550-25820686)
chr6 (191-255)||(12612859-12612923)
chr6 (180-238)||(12612971-12613029)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (191-319)||(39002036-39002164)
chr5 (180-321)||(3352002-3352143)
chr5 (180-321)||(6739955-6740096)
chr5 (180-321)||(8215900-8216041)
chr5 (180-321)||(11692147-11692288)
chr5 (180-317)||(14717609-14717746)
chr5 (180-321)||(16095960-16096100)
chr5 (180-321)||(27457197-27457338)
chr5 (180-321)||(31710282-31710423)
chr5 (180-321)||(33760470-33760611)
chr5 (180-321)||(38964114-38964254)
chr5 (181-321)||(30863253-30863393)
chr5 (180-329)||(23128913-23129062)
chr5 (180-321)||(26593280-26593421)
chr5 (180-321)||(30297749-30297890)
chr5 (191-321)||(30208413-30208543)
chr5 (191-321)||(40074950-40075080)
chr5 (191-321)||(41282342-41282472)
chr5 (191-321)||(42993518-42993648)
chr5 (180-321)||(8689572-8689713)
chr5 (180-321)||(11000728-11000869)
chr5 (180-321)||(35342180-35342321)
chr5 (180-321)||(39824556-39824697)
chr5 (180-321)||(4015874-4016015)
chr5 (180-321)||(6251972-6252113)
chr5 (180-317)||(6600136-6600273)
chr5 (180-317)||(14952328-14952465)
chr5 (180-321)||(20079258-20079399)
chr5 (191-321)||(43166280-43166410)
chr5 (180-321)||(19659501-19659642)
chr5 (180-321)||(28078405-28078546)
chr5 (180-317)||(20408537-20408674)
chr5 (180-317)||(27116099-27116236)
chr5 (201-321)||(16752116-16752236)
chr5 (201-321)||(26035367-26035487)
chr5 (191-313)||(1052541-1052663)
chr5 (191-317)||(19398204-19398330)
chr5 (220-321)||(6331377-6331478)
chr5 (180-317)||(11935450-11935586)
chr5 (191-321)||(8694866-8694996)
chr5 (201-313)||(444962-445074)
chr5 (272-321)||(27509978-27510027)
chr5 (180-254)||(27510038-27510112)
chr5 (51-87)||(35185298-35185334)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (180-321)||(218885-219027)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (180-321)||(16246193-16246334)
chr2 (180-321)||(27328584-27328725)
chr2 (180-321)||(28650426-28650567)
chr2 (191-321)||(771986-772116)
chr2 (180-321)||(921022-921163)
chr2 (180-321)||(7378963-7379104)
chr2 (180-321)||(9276574-9276715)
chr2 (180-321)||(33865267-33865408)
chr2 (180-317)||(37838301-37838438)
chr2 (180-321)||(40854609-40854750)
chr2 (191-321)||(2456010-2456140)
chr2 (191-321)||(3430635-3430765)
chr2 (180-321)||(2094410-2094551)
chr2 (180-321)||(11949426-11949567)
chr2 (180-321)||(19180422-19180562)
chr2 (180-321)||(33106969-33107110)
chr2 (180-321)||(34253142-34253283)
chr2 (180-321)||(41500502-41500643)
chr2 (181-321)||(17134229-17134369)
chr2 (180-319)||(7297234-7297373)
chr2 (191-321)||(8899682-8899812)
chr2 (180-321)||(12759750-12759890)
chr2 (180-321)||(43249412-43249553)
chr2 (194-321)||(1106573-1106700)
chr2 (180-318)||(2056929-2057067)
chr2 (191-321)||(36211046-36211176)
chr2 (180-321)||(37732193-37732334)
chr2 (191-319)||(2314986-2315114)
chr2 (201-321)||(8396572-8396692)
chr2 (181-321)||(36444229-36444369)
chr2 (181-321)||(38751048-38751188)
chr2 (191-317)||(25087807-25087933)
chr2 (180-317)||(17484550-17484687)
chr2 (191-321)||(29737748-29737878)
chr2 (180-321)||(42629962-42630103)
chr2 (220-321)||(41178059-41178160)
chr2 (205-317)||(37654112-37654224)
chr2 (180-320)||(45124120-45124260)
chr2 (180-272)||(14630663-14630755)
chr2 (201-321)||(19916008-19916128)
chr2 (180-320)||(9331757-9331897)
chr2 (265-321)||(23672958-23673014)
chr2 (180-270)||(23671811-23671901)
chr2 (51-87)||(21646512-21646548)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (180-321)||(114-255)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (180-317)||(5190-5326)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (180-317)||(5027-5164)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (180-316)||(47967-48103)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (201-321)||(1994-2114)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (180-321)||(252438-252579)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (180-317)||(13099-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (180-317)||(59608-59745)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (181-317)||(11362-11498)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (268-321)||(289-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (271-321)||(19781-19831)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (180-261)||(599-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (180-261)||(1913-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (180-261)||(3371-3452)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2533413 - 2533272
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2533413 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaa 2533314  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2533313 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 2533272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 22683999 - 22684129
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22683999 aacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 22684098  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  22684099 tttagccatgacaaatggtgaataatgctct 22684129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 28707446 - 28707587
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28707446 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaa 28707545  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28707546 ttagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctct 28707587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 36400070 - 36400211
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||     
T  36400070 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaac 36400169  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36400170 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36400211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37933783 - 37933646
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37933783 gaatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37933684  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37933683 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37933646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15847253 - 15847117
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15847253 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 15847154  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15847153 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 513448 - 513308
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  513448 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 513349  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  513348 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1293627 - 1293486
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  1293627 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaa 1293528  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1293527 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1293486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3876049 - 3875908
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  3876049 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaa 3875950  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3875949 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3875908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38107240 - 38107103
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38107240 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38107141  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38107140 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 38107103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 43806533 - 43806674
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43806533 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaa 43806632  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  43806633 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 43806674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 35884430 - 35884569
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35884430 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 35884529  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  35884530 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 35884569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 9056349 - 9056479
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9056349 aacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaattagtcatctt 9056448  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9056449 tttaggcatgataaatggtggataatgctct 9056479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 260118 - 259982
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  260118 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 260019  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  260018 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 259982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 655803 - 655939
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  655803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 655902  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  655903 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 655939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 841538 - 841674
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  841538 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 841637  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  841638 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 841674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35443452 - 35443311
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35443452 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35443353  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35443352 ttagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 35443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33651982 - 33651841
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33651982 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 33651883  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  33651882 ttagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctct 33651841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434886
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7434906 acaaatggtggataatgctct 7434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38208894 - 38208756
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38208894 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38208795  T
Q  280 ttagtcat-ctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  38208794 ttagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatg 38208756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12010666 - 12010549
Alignment:
Q  204 gtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgaca 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  12010666 gtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttatgcatggca 12010567  T
Q  304 aatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12010566 aatggtggataatgctct 12010549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 38633710 - 38633851
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  38633710 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaa 38633809  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38633810 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 38633851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23935353 - 23935233
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23935353 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 23935254  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  23935253 gcaaatggtggataatgctct 23935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6016325 - 6016207
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  6016325 attgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 6016226  T
Q  301 acaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6016225 acaaatggtggataatgct 6016207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 23972295 - 23972437
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23972295 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaa 23972394  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgac-aaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23972395 ttagtcatctttttagacatgacaaaatgttggataatactct 23972437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 306
Target Start/End: Original strand, 41536527 - 41536653
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41536527 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41536626  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaat 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41536627 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 28496355 - 28496495
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | | |||| ||||||||||||    
T  28496355 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctag-ttctaatacccacttaaaa 28496453  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28496454 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactct 28496495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 40301893 - 40302030
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40301893 gaatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaa 40301992  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40301993 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40302030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 440981 - 440844
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  440981 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 440882  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  440881 ttactcatctttttagacatggcaaacggtggataatg 440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Original strand, 39513353 - 39513480
Alignment:
Q  194 aagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 293  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39513353 aagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 39513452  T
Q  294 aggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  39513453 aggcatggcatatggtggataatactct 39513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13797229 - 13797089
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13797229 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaa 13797131  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13797130 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggacgatgctct 13797089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 24430571 - 24430712
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||  |||||  ||  ||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  24430571 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaa 24430670  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24430671 ttagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctct 24430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485287
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  29485307 gcaaatgatggataatgctct 29485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Original strand, 42988240 - 42988367
Alignment:
Q  194 aagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 293  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||  ||||| |||| || |||| || |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42988240 aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 42988339  T
Q  294 aggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42988340 aggcatgacaaatggtagataatgctct 42988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4649291 - 4649154
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || || | |||| ||||||||||    
T  4649291 gaatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaa 4649192  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4649191 ttagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatg 4649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 36218781 - 36218917
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  36218781 gaatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaa 36218879  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36218880 ttagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193433
Alignment:
Q  243 tttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 24193433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 245
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatcttt 245  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8137238 - 8137180
Alignment:
Q  257 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataa 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  8137238 tggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Original strand, 27364359 - 27364480
Alignment:
Q  200 tattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtat 299  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364359 tattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtat 27364458  T
Q  300 gacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27364459 gacaaatggtggataatgctct 27364480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 1469493 - 1469634
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1469493 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1469592  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1469593 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1469634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 35600122 - 35600263
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35600122 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 35600221  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35600222 ttagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35600263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 47281124 - 47281265
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47281124 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47281223  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47281224 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47281265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 31684134 - 31684275
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 31684233  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31684234 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31684275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544409
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 44544409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23842446 - 23842305
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23842446 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaa 23842347  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  23842346 ttagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctct 23842305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 30971941 - 30972082
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971941 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 30972040  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  30972041 ttagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctct 30972082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47272122 - 47271981
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47272122 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 47272023  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47272022 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 47271981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884323
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33884323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219145
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47219145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 8162723 - 8162853
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8162723 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 8162822  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8162823 tttaggcatgacaaattgtggataatgctct 8162853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30876400 - 30876259
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30876400 gaatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaa 30876301  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30876300 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30876259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 37393998 - 37394135
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37393998 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaa 37394097  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37394098 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37394135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 38427563 - 38427704
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38427563 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38427662  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38427663 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctct 38427704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 43968259 - 43968400
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43968259 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaa 43968358  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43968359 ttagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctct 43968400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 45723491 - 45723632
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45723491 gaatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 45723590  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45723591 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 45723632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 47294291 - 47294432
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  47294291 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataa 47294390  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47294391 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47294432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48628946 - 48628805
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628946 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 48628847  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48628846 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48628805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4923346 - 4923220
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4923346 aacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagtcatctt 4923247  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4923246 tttaggcatggcaaatggtggataatg 4923220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 11476556 - 11476697
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11476556 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11476655  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  11476656 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 11476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 30798368 - 30798509
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30798368 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30798467  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  30798468 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30798509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40851415 - 40851274
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40851415 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40851316  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40851315 ttagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctct 40851274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 42979338 - 42979479
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  42979338 gaatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaa 42979437  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42979438 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 42979479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Original strand, 2960640 - 2960768
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2960640 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2960739  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatgg 308  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2960740 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7336181 - 7336065
Alignment:
Q  200 tattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtat 299  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7336181 tattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 7336082  T
Q  300 gacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7336081 gacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41113507 - 41113377
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41113507 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 41113408  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||  ||| |||||| || ||||||||||    
T  41113407 tttagacatggcaaatgatgaataatgctct 41113377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 43752776 - 43752917
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  43752776 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaa 43752875  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43752876 ttagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctct 43752917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 3797544 - 3797664
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  3797544 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 3797643  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
      |||||||||||||||||||    
T  3797644 ttaaatggtggataatgctct 3797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Original strand, 37354284 - 37354400
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  37354284 attgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 37354383  T
Q  301 acaaatggtggataatg 317  Q
     ||||||||||||||||    
T  37354384 gcaaatggtggataatg 37354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 321
Target Start/End: Original strand, 47579098 - 47579228
Alignment:
Q  192 acaagtcatattgtagatatcatagttagtaatta-cttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  47579098 acaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaattaaccatctt 47579197  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47579198 tttaggaatgacaaatggtggataatgctct 47579228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 11050261 - 11050398
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  11050261 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaa 11050360  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  11050361 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11050398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 221416 - 221300
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  221416 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221317  T
Q  280 ttagtcatctttttagg 296  Q
    |||||| ||||||||||    
T  221316 ttagtcttctttttagg 221300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 27364179 - 27364267
Alignment:
Q  20 atctttagtgaggttgtaacttataattcattgtaattattacttaataaaagtgaccgtttatatttggtcaaatgtatctaaaggta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364179 atctttagtgaggttgtaacttataatccattgtaattagtacttaataaaagtgacagtttatatttggtcaaatgtatctaaaggta 27364267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 321
Target Start/End: Original strand, 41139445 - 41139553
Alignment:
Q  213 atagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtgga 312  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41139445 atagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgcttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaa 41139544  T
Q  313 taatgctct 321  Q
    |||||||||    
T  41139545 taatgctct 41139553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29248472 - 29248342
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29248472 aacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 29248373  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  29248372 tttaggcatggcaaattgtggataattctct 29248342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 44800421 - 44800547
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44800421 aacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaattagtcatctt 44800520  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||    
T  44800521 tttaggcatgatatatggtggataatg 44800547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27774228 - 27774108
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  27774228 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatg 27774129  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  27774128 gcaaatggtggataatgctct 27774108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47120134 - 47119991
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcata--gttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaa 277  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47120134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaa 47120035  T
Q  278 aattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47120034 aattagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 47119991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18353285 - 18353148
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  18353285 gaatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaa 18353186  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  18353185 ttagtcatctttttagacatgataaatggtggataatg 18353148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520918
Alignment:
Q  228 ttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctct 40520918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034062
Alignment:
Q  261 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39034062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025112
Alignment:
Q  278 aattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggatattgctct 43025112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739781
Alignment:
Q  272 acttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatc-ttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 29739781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42888990 - 42888937
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttcctt 233  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  42888990 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 55517185 - 55517326
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55517185 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 55517284  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55517285 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 55517326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 4544985 - 4545126
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4544985 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 4545084  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4545085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 4545126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 11795154 - 11795295
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795154 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 11795253  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11795254 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11795295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 33807780 - 33807921
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807780 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 33807879  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33807880 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33807921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42273943 - 42273802
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42273943 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 42273844  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42273843 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 42273802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 19496113 - 19496243
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19496113 aacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaattagtcatctt 19496212  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19496213 tttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 19496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28264784 - 28264643
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  28264784 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 28264685  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28264684 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28264643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26017564 - 26017425
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26017564 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26017465  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  26017464 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgct 26017425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 181 - 320
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174160
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctc 320  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 33174160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12196599 - 12196469
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12196599 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattaatcatctt 12196500  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12196499 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 28159964 - 28160094
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28159964 aacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 28160063  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28160064 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28160094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 48707744 - 48707874
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48707744 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaattagtcatctt 48707843  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48707844 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48707874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 17847096 - 17847236
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17847096 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17847195  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17847196 ttagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 17847236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31591216 - 31591076
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591216 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 31591117  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31591116 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 31591076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31973732 - 31973591
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31973732 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 31973633  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31973632 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31973591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988633
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 40988633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44490460 - 44490324
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||     
T  44490460 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaag 44490361  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44490360 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 49118752 - 49118616
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  49118752 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 49118653  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49118652 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2055419 - 2055280
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  2055419 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaag 2055320  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2055319 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 24458631 - 24458770
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24458631 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 24458730  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24458731 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 24458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32318083 - 32317957
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32318083 aacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 32317984  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32317983 tttaggcatgacaaatggtggataatg 32317957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5227531 - 5227390
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  5227531 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaa 5227432  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5227431 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 5227390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15985151 - 15985010
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15985151 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 15985052  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15985051 tcagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 15985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 23135006 - 23135143
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23135006 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23135105  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  23135106 ttagtcatttttttaggcatgccaaatggtggctaatg 23135143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23553205 - 23553069
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23553205 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 23553107  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23553106 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 28812287 - 28812427
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28812287 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 28812385  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28812386 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 28812427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 8882013 - 8882152
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8882013 gaatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8882112  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8882113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 8882152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 9339134 - 9339267
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatc---tttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcat 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9339134 aacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcat 9339233  T
Q  288 ctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  9339234 ctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctct 9339267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48149640 - 48149502
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  48149640 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaa 48149541  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgc 318  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48149540 ttactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 48149502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 17993017 - 17993158
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17993017 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 17993116  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17993117 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 17993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 30467003 - 30467140
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30467003 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaa 30467102  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30467103 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 30467140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35930180 - 35930040
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35930180 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35930081  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35930080 ttagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctct 35930040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 48551764 - 48551901
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  48551764 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaa 48551863  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48551864 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 50542354 - 50542495
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50542354 gaatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 50542453  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  50542454 ttaatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 50542495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 19168816 - 19168936
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  19168816 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 19168915  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19168916 acaaatggtggataatgctct 19168936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24623268 - 24623148
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||    
T  24623268 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatg 24623169  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24623168 acaaatggtggataatgctct 24623148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118714
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 32118714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37381976 - 37381848
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381976 aacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaattagtcatctt 37381877  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37381876 tttagacatgacaaatggtggataatgct 37381848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 39995167 - 39995308
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39995167 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaa 39995266  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  39995267 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatcctct 39995308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588580
Alignment:
Q  182 atcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaatt 281  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  282 agtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatgctct 10588580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 25734234 - 25734360
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25734234 aacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 25734333  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  25734334 tttaggcatgacaaacggtggataatg 25734360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14564937 - 14564796
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14564937 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 14564838  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  14564837 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 14564796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 30141108 - 30141249
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30141108 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 30141207  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  30141208 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30141249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39700186 - 39700045
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  39700186 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaa 39700087  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  39700086 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctct 39700045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22298659 - 22298517
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||| | ||||||||||| |||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22298659 gaatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22298560  T
Q  280 ttagtcatct-ttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22298559 ttagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctct 22298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 33693333 - 33693474
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  33693333 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 33693432  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||    
T  33693433 ttattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctct 33693474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 50276138 - 50276274
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50276138 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 50276237  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  50276238 ttag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatgct 50276274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 51371047 - 51371188
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  51371047 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 51371146  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  51371147 ttagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctct 51371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25730381 - 25730244
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  25730381 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaa 25730282  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  25730281 ttagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatg 25730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31208885 - 31208776
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31208885 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaa 31208786  T
Q  280 ttagtcatct 289  Q
    ||||||||||    
T  31208785 ttagtcatct 31208776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549762
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  42549743 acaaa-ggtggaaaatgctct 42549762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 321
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555281
Alignment:
Q  240 atctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 56555281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20534306 - 20534225
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggct 261  Q
    |||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20534306 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 23767414 - 23767555
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23767414 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23767513  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23767514 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 23767555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 7553016 - 7553157
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7553016 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7553115  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7553116 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctct 7553157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12143213 - 12143072
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12143213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12143114  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12143113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19315781 - 19315640
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19315781 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 19315682  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19315681 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19315640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26549529 - 26549388
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26549529 gaatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 26549430  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26549429 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 26549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 38473626 - 38473767
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38473626 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 38473725  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38473726 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38473767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7651803 - 7651662
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7651803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7651704  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7651703 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41106157 - 41106016
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41106157 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41106058  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41106057 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 41106016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46825672 - 46825531
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46825672 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 46825573  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46825572 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 46825531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 49814441 - 49814302
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49814441 gaatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49814342  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49814341 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 49814302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 28425363 - 28425504
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28425363 gaatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 28425462  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28425463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28425504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 49094711 - 49094848
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49094711 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49094810  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  49094811 ttagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatg 49094848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 50690084 - 50689943
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50690084 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50689985  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  50689984 ttagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctct 50689943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 25988271 - 25988410
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25988271 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25988370  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25988371 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 25988410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18892470 - 18892329
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18892470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaa 18892371  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18892370 ttagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 18892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26070033 - 26069896
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26070033 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaa 26069934  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26069933 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 36157678 - 36157818
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| || | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36157678 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 36157776  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36157777 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36157818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274559
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 36781172 - 36781311
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36781172 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 36781271  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  36781272 ttagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatgct 36781311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33674147 - 33674017
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33674147 aacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 33674048  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33674047 tttaggcatggcaaatggtggataatgctct 33674017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33325868 - 33325727
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  33325868 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaa 33325769  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33325768 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33325727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 317
Target Start/End: Original strand, 45350735 - 45350852
Alignment:
Q  200 tattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtat 299  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45350735 tattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 45350834  T
Q  300 gacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45350835 gacaaatggtggataatg 45350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46051591 - 46051450
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46051591 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 46051492  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46051491 ctagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 46051450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 317
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982372
Alignment:
Q  182 atcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaatt 281  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  282 agtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatg 41982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 9878784 - 9878921
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  9878784 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaa 9878883  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9878884 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 9878921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16706011 - 16705870
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  16706011 gaatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaa 16705912  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16705911 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 16705870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 23228194 - 23228335
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  23228194 gaatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaa 23228293  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23228294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 23228335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 46095075 - 46095216
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  46095075 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaa 46095174  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  46095175 ttagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctct 46095216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 48802331 - 48802472
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48802331 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaa 48802430  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  48802431 ttagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctct 48802472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 52067651 - 52067792
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  52067651 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 52067750  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52067751 ttattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgctct 52067792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 52147134 - 52146993
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52147134 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 52147035  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52147034 ttattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 52146993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 52349924 - 52350065
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52349924 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 52350023  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  52350024 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 52350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 24204482 - 24204612
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24204482 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatgagtcatctt 24204581  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  24204582 tttaggcatggcaaatgatggataatgctct 24204612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6711581 - 6711440
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6711581 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6711482  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||| ||||||||||   |||  |||||||||||||||||||    
T  6711481 ttagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctct 6711440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 7608766 - 7608907
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7608766 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 7608865  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7608866 ttagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7608907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9962892 - 9962755
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  9962892 gaatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaa 9962793  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9962792 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 9962755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 48669396 - 48669533
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48669396 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48669495  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  48669496 ttagtcatctttttaggcatgacaaataatggataatg 48669533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917524
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataattctct 18917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533383
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctct 50533383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40721484 - 40721342
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacaccc-acttaaa 278  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||    
T  40721484 gaatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaa 40721385  T
Q  279 attagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40721384 attaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40721342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 45670486 - 45670623
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttag-taattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaa 278  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  45670486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaa 45670584  T
Q  279 attagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45670585 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45670623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5401000 - 5400876
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5401000 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaattagtcatctt 5400901  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||    
T  5400900 tttaggcatg-caaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 8141486 - 8141623
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  8141486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaa 8141585  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8141586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12964747 - 12964646
Alignment:
Q  220 gtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  12964747 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataatgct 12964648  T
Q  320 ct 321  Q
    ||    
T  12964647 ct 12964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37217037 - 37216900
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  37217037 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaa 37216938  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  37216937 ttagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatg 37216900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 33194672 - 33194792
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  33194672 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 33194771  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
     | |||||||| |||||||||    
T  33194772 gcgaatggtggttaatgctct 33194792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319183
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
Q  301 acaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  48319167 acaaatggtggataatg 48319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9974963 - 9974846
Alignment:
Q  200 tattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtat 299  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9974963 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 9974864  T
Q  300 gacaaatggtggataatg 317  Q
    |  |||||||||||||||    
T  9974863 ggtaaatggtggataatg 9974846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 17983898 - 17984039
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  | |||||| || |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  17983898 gaatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaa 17983997  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17983998 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 17984039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43396816 - 43396675
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43396816 gaatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43396717  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||    
T  43396716 ttagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctct 43396675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21965206 - 21965069
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| || |||||| |||| || |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21965206 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaa 21965107  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  21965106 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 21965069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34971221 - 34971084
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||| || ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  34971221 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaa 34971122  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34971121 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 34971084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Original strand, 16506809 - 16506925
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||    
T  16506809 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatg 16506908  T
Q  301 acaaatggtggataatg 317  Q
     ||||||||||||||||    
T  16506909 gcaaatggtggataatg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30281751 - 30281631
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||    
T  30281751 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatg 30281652  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
      |||||||||||||||||||    
T  30281651 taaaatggtggataatgctct 30281631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Original strand, 33714361 - 33714495
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| | |    
T  33714361 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-aca 33714458  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33714459 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 33714495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 18782100 - 18782226
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  18782100 aacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaattagtcatctt 18782199  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18782200 tttaggcatggcaaatggtggataatg 18782226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21929667 - 21929526
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgat-------accaaatttggctcctaacaccca 272  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||       ||||||| |||||||||| |||||    
T  21929667 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaaccca 21929568  T
Q  273 cttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21929567 cttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataat 21929526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25800782 - 25800648
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctt----tgataccaaatttggctcctaacacccactt 275  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    || |||||||| |      ||||||||||||    
T  25800782 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaatct------taacacccactt 25800690  T
Q  276 aaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25800689 aaaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 25800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099220
Alignment:
Q  243 tttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||| |||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 50099220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979329
Alignment:
Q  273 cttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44979329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 281
Target Start/End: Original strand, 44978768 - 44978868
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44978768 gaatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaa 44978866  T
Q  280 tt 281  Q
    ||    
T  44978867 tt 44978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 321
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373694
Alignment:
Q  277 aaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 32373694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 319
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989906
Alignment:
Q  277 aaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatgct 17989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 47329175 - 47329316
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47329175 gaatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47329274  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47329275 ttagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctct 47329316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 20813441 - 20813582
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20813441 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20813540  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20813541 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 20813582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26455723 - 26455582
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26455723 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 26455624  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26455623 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 26455582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33151837 - 33151696
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33151837 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33151738  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33151737 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33151696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 35346471 - 35346608
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35346471 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35346570  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35346571 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35346608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38446617 - 38446476
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38446617 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38446518  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  38446517 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctct 38446476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 42107099 - 42107240
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42107099 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42107198  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42107199 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 42107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1017185 - 1017044
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  1017185 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 1017086  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1017085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1017044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1687792 - 1687655
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1687792 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1687693  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1687692 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 20760071 - 20760212
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20760071 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 20760170  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20760171 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 20760212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21564637 - 21564496
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21564637 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaa 21564538  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21564537 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 21564496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42017014 - 42016878
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42017014 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42016915  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  42016914 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19664671 - 19664541
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19664671 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagtcatctt 19664572  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19664571 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19664541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21656659 - 21656518
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21656659 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 21656560  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21656559 ttagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 21656518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31122803 - 31122662
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  31122803 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaa 31122704  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31122703 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31122662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50287707 - 50287570
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287707 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50287608  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50287607 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677476
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 22852123 - 22851996
Alignment:
Q  194 aagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 293  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22852123 aagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtcatctgttt 22852024  T
Q  294 aggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22852023 aggcatgacaaatggtggataatgctct 22851996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 36314983 - 36315113
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36314983 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaattagtcatctt 36315082  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36315083 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36315113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41251016 - 41250886
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41251016 aacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagtcatctt 41250917  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41250916 tttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41250886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 20086314 - 20086455
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20086314 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20086413  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  20086414 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 20086455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51562303 - 51562162
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  || |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  51562303 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 51562204  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51562203 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 51562162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 53196155 - 53196014
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53196155 gaatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 53196056  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  53196055 ttagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 53196014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21890311 - 21890175
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21890311 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 21890212  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21890211 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 21890175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Original strand, 53925993 - 53926120
Alignment:
Q  194 aagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53925993 aagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 53926092  T
Q  294 aggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  53926093 aagcatgacaaatggtggataatgctct 53926120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Original strand, 55164129 - 55164256
Alignment:
Q  194 aagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55164129 aagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaattagtcatcttttt 55164228  T
Q  294 aggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  55164229 aggcatgataaatagtggataatgctct 55164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12748521 - 12748391
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748521 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcatctt 12748422  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12748421 tttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12748391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19268630 - 19268521
Alignment:
Q  212 catagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtgg 311  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19268630 catagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgg 19268531  T
Q  312 ataatgctct 321  Q
    ||||||||||    
T  19268530 ataatgctct 19268521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 27070739 - 27070880
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  27070739 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaa 27070838  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||    
T  27070839 ttagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctct 27070880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 40922165 - 40922302
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40922165 gaatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40922264  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||    
T  40922265 ttagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatg 40922302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48651389 - 48651248
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48651389 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 48651290  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48651289 ttaatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 48651248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Original strand, 51475267 - 51475383
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  51475267 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 51475366  T
Q  301 acaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  51475367 acaaatggtggataatg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 32650831 - 32650957
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32650831 aacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 32650930  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  32650931 tctaggcatggcaaatggtggataatg 32650957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 10618480 - 10618617
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| || |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10618480 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 10618579  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10618580 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 10618617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37248097 - 37247956
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37248097 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37247998  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||    
T  37247997 ttagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctct 37247956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44798408 - 44798268
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44798408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 44798309  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44798308 ttactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 44798268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 52821049 - 52821190
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  52821049 gaatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaa 52821148  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  52821149 ttagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctct 52821190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3697276 - 3697148
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697276 aacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 3697177  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3697176 tttaggcatggcaaatggtggataatgct 3697148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365028
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  50365008 gcaaatggtgggtaatgctct 50365028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 50977984 - 50977866
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  50977984 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 50977885  T
Q  301 acaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50977884 acaaatggtggataatgct 50977866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 51081116 - 51080998
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  51081116 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 51081017  T
Q  301 acaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51081016 acaaatggtggataatgct 51080998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 321
Target Start/End: Original strand, 1448764 - 1448873
Alignment:
Q  212 catagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtgg 311  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1448764 catagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatggcaaatggtgg 1448863  T
Q  312 ataatgctct 321  Q
    ||||||||||    
T  1448864 ataatgctct 1448873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 35608131 - 35608272
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||     
T  35608131 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaac 35608230  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35608231 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 35608272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 20913754 - 20913893
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20913754 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20913853  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  20913854 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20913893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 20921872 - 20922011
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20921872 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20921971  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  20921972 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20922011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39069867 - 39069726
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||  |||||  |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39069867 gaatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaa 39069768  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  39069767 ttagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctct 39069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28699785 - 28699685
Alignment:
Q  221 taattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctc 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28699785 taattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctc 28699686  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  28699685 t 28699685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 33473239 - 33473380
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||  | ||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  33473239 gaatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaa 33473338  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  33473339 ttagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctct 33473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 45380260 - 45380401
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttag-taattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaa 278  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45380260 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaa 45380358  T
Q  279 attagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  45380359 attagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctct 45380401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 44152773 - 44152700
Alignment:
Q  248 taccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44152773 taccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44152700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34019580 - 34019462
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||    
T  34019580 attgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatg 34019481  T
Q  301 acaaatggtggataatgct 319  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34019480 tcaaatggtggataatgct 34019462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47473294 - 47473230
Alignment:
Q  257 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47473294 tggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 306
Target Start/End: Original strand, 38924009 - 38924124
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  38924009 aacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaattaatcatctc 38924108  T
Q  291 tttaggtatgacaaat 306  Q
    |||| | |||||||||    
T  38924109 tttaagcatgacaaat 38924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 290
Target Start/End: Original strand, 42641213 - 42641288
Alignment:
Q  215 agttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641213 agttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503718
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6503718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 1915354 - 1915484
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1915354 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaattaatcatctt 1915453  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1915454 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1915484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3408330 - 3408189
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3408330 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 3408231  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3408230 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3408189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2707600 - 2707459
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2707600 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2707501  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2707500 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 2707459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12626777 - 12626636
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626777 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 12626678  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12626677 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12626636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2390406 - 2390267
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  2390406 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataa 2390307  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2390306 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10256378 - 10256237
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10256378 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 10256279  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10256278 ttagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctct 10256237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 8178249 - 8178390
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8178249 gaatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8178348  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  8178349 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 8178390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9382660 - 9382519
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9382660 gaatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 9382561  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9382560 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 9382519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16193451 - 16193314
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||  || || |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193451 gaatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 16193352  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16193351 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 16193314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 26230932 - 26231073
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26230932 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 26231031  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26231032 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26231073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 317
Target Start/End: Original strand, 26393029 - 26393146
Alignment:
Q  200 tattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtat 299  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26393029 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagtcatctttttaggcat 26393128  T
Q  300 gacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26393129 gacaaatggtggataatg 26393146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29050413 - 29050272
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29050413 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 29050314  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  29050313 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 29050272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30379158 - 30379021
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30379158 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 30379059  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  30379058 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 30379021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 2598099 - 2598229
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2598099 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2598198  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtg 310  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2598199 ttactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 17428272 - 17428409
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17428272 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 17428371  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  17428372 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatg 17428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17943177 - 17943040
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17943177 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17943078  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17943077 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17943040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1077378 - 1077241
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  || ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1077378 gaatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 1077279  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1077278 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 3258807 - 3258948
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttag-taattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaa 278  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3258807 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaa 3258905  T
Q  279 attagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  3258906 attagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctct 3258948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11134015 - 11133873
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttcctt-gaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaa 278  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11134015 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 11133916  T
Q  279 attagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  11133915 attagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctct 11133873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26936727 - 26936607
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26936727 attgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 26936628  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26936627 acaaatggtggataatactct 26936607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 306
Target Start/End: Original strand, 35223919 - 35224025
Alignment:
Q  200 tattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtat 299  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35223919 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 35224018  T
Q  300 gacaaat 306  Q
    | |||||    
T  35224019 gtcaaat 35224025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 317
Target Start/End: Original strand, 26196334 - 26196458
Alignment:
Q  193 caagtcatattgtagatatcatagttag-taattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatcttt 291  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  26196334 caagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaaattaatcatcttt 26196432  T
Q  292 ttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26196433 ttaggcatgacaaatggtggataatg 26196458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 6785101 - 6785239
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| |||| || ||   | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6785101 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6785197  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||  || ||||||||||    
T  6785198 ttagtcatctttttagtcatgtcaaattttgtataatgctct 6785239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 10931159 - 10931288
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10931159 aacaagtcctaatgtggatagcatagtt-gtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaattagtcatctt 10931257  T
Q  291 tttaggtatg----acaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| |||    | |||||||||||||||    
T  10931258 tttaggcatgcatgagaaatggtggataatg 10931288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31376058 - 31375971
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaac 267  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31376058 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 317
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820686
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  ||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |  ||| ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||  ||||||  ||| |||||  |||||||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataatg 25820686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Original strand, 12612859 - 12612923
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaat 255  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12612859 aacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaat 12612923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 238
Target Start/End: Original strand, 12612971 - 12613029
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaact 238  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12612971 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Original strand, 39002036 - 39002164
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002036 aacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 39002135  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39002136 tttaggcatgacaaatggtggataatgct 39002164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 3352002 - 3352143
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3352002 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 3352101  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3352102 ttagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctct 3352143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 6739955 - 6740096
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6739955 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 6740054  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6740055 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8216041 - 8215900
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8216041 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8215942  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8215941 ttagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 8215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 11692147 - 11692288
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11692147 gaatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 11692246  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11692247 ttagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctct 11692288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14717746 - 14717609
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14717746 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14717647  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14717646 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 14717609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 16095960 - 16096100
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16095960 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatcttgg-taccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16096058  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16096059 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 16096100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 27457197 - 27457338
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27457197 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaa 27457296  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27457297 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 27457338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31710423 - 31710282
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31710423 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 31710324  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31710323 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 31710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 33760470 - 33760611
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33760470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33760569  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33760570 ttagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctct 33760611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 38964114 - 38964254
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38964114 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38964213  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38964214 ttagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38964254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863253
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30863253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 329
Target Start/End: Original strand, 23128913 - 23129062
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23128913 gaatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaa 23129012  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctctgtgctgct 329  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23129013 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgctgct 23129062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 26593280 - 26593421
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26593280 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26593379  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26593380 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 30297749 - 30297890
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30297749 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaa 30297848  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30297849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30297890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 30208413 - 30208543
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30208413 aacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaattaatcatctt 30208512  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30208513 tttaggcatgataaatggtggataatgctct 30208543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40075080 - 40074950
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40075080 aacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 40074981  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40074980 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41282472 - 41282342
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41282472 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagtcatctt 41282373  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  41282372 tttaggcatgataaatggtggataatgctct 41282342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42993648 - 42993518
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993648 aacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 42993549  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  42993548 tttaggcatggtaaatggtggataatgctct 42993518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8689713 - 8689572
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8689713 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8689614  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  8689613 ttagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 8689572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 11000728 - 11000869
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11000728 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11000827  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  11000828 ttagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctct 11000869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35342321 - 35342180
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35342321 gaatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35342222  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35342221 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35342180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39824697 - 39824556
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39824697 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 39824598  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39824597 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39824556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 4015874 - 4016015
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4015874 gaatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 4015973  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4015974 ttagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatgctct 4016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6252113 - 6251972
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  6252113 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaa 6252014  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6252013 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 6251972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 6600136 - 6600273
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6600136 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6600235  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  6600236 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 6600273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14952465 - 14952328
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14952465 gaatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14952366  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14952365 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 14952328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 20079258 - 20079399
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20079258 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 20079357  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20079358 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 20079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 43166280 - 43166410
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43166280 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaattagtcatctt 43166379  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43166380 tttaggcatgacaaatgatggataatgctct 43166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 19659501 - 19659642
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19659501 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaa 19659600  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19659601 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 19659642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 28078405 - 28078546
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28078405 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28078504  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||| | ||  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28078505 ttagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctct 28078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20408674 - 20408537
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  20408674 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaa 20408575  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20408574 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 20408537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 27116099 - 27116236
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  27116099 gaatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaa 27116198  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  27116199 ttagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatg 27116236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752116
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  16752136 acaaatggtgaataatgctct 16752116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 26035367 - 26035487
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  26035367 attgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacg 26035466  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26035467 acaaatggtggataatgctct 26035487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1052663 - 1052541
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1052663 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattactcatctt 1052564  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggat 313  Q
    |||| | ||| ||||||||||||    
T  1052563 tttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 19398204 - 19398330
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19398204 aacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaattagtcatctt 19398303  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19398304 tttaggtatgacaaatggtggataatg 19398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6331478 - 6331377
Alignment:
Q  220 gtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6331478 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgct 6331379  T
Q  320 ct 321  Q
    ||    
T  6331378 ct 6331377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11935586 - 11935450
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11935586 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatctttga-accaaatgtggctcctaacactcacttaaaa 11935488  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  11935487 ttagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8694996 - 8694866
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  8694996 aacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaattagtcatgtt 8694897  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8694896 cttaggcatgataaatggtggataatgctct 8694866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 445074 - 444962
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||    
T  445074 attgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtg 444975  T
Q  301 acaaatggtggat 313  Q
     ||||||||||||    
T  444974 gcaaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27510027 - 27509978
Alignment:
Q  272 acttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27510027 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27509978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27510112 - 27510038
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaa 254  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||   | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27510112 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaa 27510038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 87
Target Start/End: Original strand, 35185298 - 35185334
Alignment:
Q  51 tgtaattattacttaataaaagtgaccgtttatattt 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35185298 tgtaattattactaaataaaagtgacagtttatattt 35185334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 219027 - 218885
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaaca-cccacttaaa 278  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  219027 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaa 218928  T
Q  279 attagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  218927 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 218885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 16246193 - 16246334
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16246193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16246292  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16246293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 16246334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27328725 - 27328584
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27328725 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 27328626  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27328625 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27328584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 28650426 - 28650567
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28650426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28650525  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28650526 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctct 28650567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 771986 - 772116
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  771986 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 772085  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  772086 tttaggcatggcaaatggtggataatgctct 772116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 921163 - 921022
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  921163 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 921064  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  921063 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 921022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7379104 - 7378963
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7379104 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7379005  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7379004 ttagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7378963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9276715 - 9276574
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276715 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 9276616  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9276615 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 9276574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 33865267 - 33865408
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33865267 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33865366  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33865367 ttagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataatactct 33865408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37838438 - 37838301
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37838438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37838339  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37838338 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 37838301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40854750 - 40854609
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40854750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40854651  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40854650 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40854609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2456140 - 2456010
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2456140 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaattagtcatctt 2456041  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2456040 tttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 2456010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 3430635 - 3430765
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3430635 aacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtcatctt 3430734  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3430735 tttaggcatggcaaatggtgtataatgctct 3430765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 2094410 - 2094551
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2094410 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaa 2094509  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  2094510 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 2094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 11949426 - 11949567
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  11949426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaata 11949525  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11949526 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19180562 - 19180422
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19180562 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctc-taacacccacttaaaa 19180464  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19180463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 19180422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 33106969 - 33107110
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33106969 gaatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 33107068  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||    
T  33107069 ttagtcatctttttaggcatgaaaaatggtaaataatgctct 33107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34253283 - 34253142
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34253283 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaata 34253184  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34253183 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 34253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 41500502 - 41500643
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41500502 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaa 41500601  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41500602 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41500643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134229
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctct 17134229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 7297234 - 7297373
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7297234 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 7297373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8899812 - 8899682
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8899812 aacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaactagtcatctt 8899713  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  8899712 tttaggcatggtaaatggtggataatgctct 8899682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 12759750 - 12759890
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12759750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcctc-taacacccacttaaaa 12759848  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12759849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 43249412 - 43249553
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||  |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43249412 gaatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43249511  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43249512 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 43249553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Original strand, 1106573 - 1106700
Alignment:
Q  194 aagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 293  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106573 aagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatcttttt 1106672  T
Q  294 aggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1106673 aggcatgacaaatggtgaataatgctct 1106700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2057067 - 2056929
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  2057067 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaa 2056968  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgc 318  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2056967 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgc 2056929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36211176 - 36211046
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36211176 aacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctt 36211077  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36211076 tttaggcatggcaaatggtggataatgctct 36211046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 37732193 - 37732334
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37732193 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37732292  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37732293 ttagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctct 37732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Original strand, 2314986 - 2315114
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2314986 aacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaattagtcatctt 2315085  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  2315086 tttaggcatggtaaatggtggataatgct 2315114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 8396572 - 8396692
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  8396572 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 8396671  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8396672 acaaatggtggataatgctct 8396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444369
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 36444369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 181 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751048
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38751048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 25087807 - 25087933
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087807 aacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 25087906  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25087907 tttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 17484550 - 17484687
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17484550 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaa 17484649  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||    
T  17484650 ttagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatg 17484687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29737878 - 29737748
Alignment:
Q  191 aacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctt 290  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  29737878 aacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaattagtcatctt 29737779  T
Q  291 tttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29737778 tttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29737748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42630103 - 42629962
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||  |||||| |||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42630103 gaatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 42630004  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42630003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggatgatgctct 42629962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178160
Alignment:
Q  220 gtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgct 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgct 41178158  T
Q  320 ct 321  Q
    ||    
T  41178159 ct 41178160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37654224 - 37654112
Alignment:
Q  205 tagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaa 304  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37654224 tagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaa 37654125  T
Q  305 atggtggataatg 317  Q
    ||| || ||||||    
T  37654124 atgatgaataatg 37654112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45124260 - 45124120
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| || |||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  45124260 gaatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaa 45124161  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctc 320  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45124160 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 45124120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14630755 - 14630663
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacaccca 272  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14630755 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 19916008 - 19916128
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||||||  ||    
T  19916008 attgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttg 19916107  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  19916108 acaaattgtggataatgctct 19916128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9331897 - 9331757
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||  || ||| |||||| |||||  ||  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9331897 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaaga 9331798  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctc 320  Q
    ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9331797 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 9331757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 321
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673014
Alignment:
Q  265 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatgctct 23673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 270
Target Start/End: Original strand, 23671811 - 23671901
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacc 270  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23671811 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21646548 - 21646512
Alignment:
Q  51 tgtaattattacttaataaaagtgaccgtttatattt 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21646548 tgtaattattacttaataaaagtgacactttatattt 21646512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 114
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  255 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 156  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  155 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5190
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5326 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 5228  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5227 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5164
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5027 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaa 5126  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5127 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 5164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48103 - 47967
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48103 gaatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 48004  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2114
Alignment:
Q  201 attgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggtatg 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  1994 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatg 2093  T
Q  301 acaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2094 acaaatggtggataatgctct 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 321
Target Start/End: Original strand, 252438 - 252579
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  252438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 252537  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  252538 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13099
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  13236 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 13137  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  13136 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 317
Target Start/End: Original strand, 59608 - 59745
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 279  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  59608 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 59707  T
Q  280 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  59708 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 59745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11498 - 11362
Alignment:
Q  181 aatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaat 280  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11498 aatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11399  T
Q  281 tagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 317  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  11398 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 289 - 342
Alignment:
Q  268 acccacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19781
Alignment:
Q  271 cacttaaaattagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 599
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggct 261  Q
    |||||||||  |||||||| || |||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  680 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 261
Target Start/End: Original strand, 1913 - 1994
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggct 261  Q
    |||||||||  |||||||| || |||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1913 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 261
Target Start/End: Original strand, 3371 - 3452
Alignment:
Q  180 gaatcgttttgaacaagtcatattgtagatatcatagttagtaattacttccttgaactcatctttgataccaaatttggct 261  Q
    |||||||||  || ||||| || ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3371 gaatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University