View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20638_high_20 (Length: 322)

Name: NF20638_high_20
Description: NF20638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20638_high_20
NF20638_high_20
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (21-310)||(12497799-12498088)
chr3 (21-310)||(14876789-14877078)
chr3 (21-310)||(17489401-17489690)
chr3 (21-312)||(9522270-9522561)
chr3 (21-310)||(16370964-16371253)
chr3 (21-310)||(16492471-16492760)
chr3 (21-307)||(16807219-16807505)
chr3 (21-310)||(16691711-16692000)
chr3 (33-310)||(10905773-10906050)
chr3 (21-310)||(15725223-15725512)
chr3 (21-310)||(15348535-15348824)
chr3 (33-310)||(10005163-10005440)
chr3 (33-310)||(48425010-48425287)
chr3 (21-309)||(15208442-15208730)
chr3 (33-310)||(13252253-13252530)
chr3 (33-310)||(15589682-15589959)
chr3 (33-310)||(16635336-16635613)
chr3 (33-310)||(43162660-43162937)
chr3 (21-310)||(15338820-15339109)
chr3 (21-310)||(15402800-15403089)
chr3 (21-310)||(16412572-16412861)
chr3 (33-310)||(20062344-20062621)
chr3 (28-310)||(26792689-26792971)
chr3 (21-310)||(5425220-5425508)
chr3 (21-310)||(53385308-53385597)
chr3 (21-310)||(6600298-6600587)
chr3 (21-310)||(16756875-16757164)
chr3 (48-312)||(15247725-15247989)
chr3 (39-310)||(15227228-15227499)
chr3 (48-310)||(13972399-13972661)
chr3 (22-310)||(47123506-47123794)
chr3 (22-310)||(10383531-10383819)
chr3 (36-312)||(16329936-16330212)
chr3 (39-310)||(13322931-13323202)
chr3 (21-310)||(14571409-14571698)
chr3 (57-310)||(15953247-15953500)
chr3 (39-310)||(18134625-18134896)
chr3 (21-310)||(10420324-10420613)
chr3 (57-312)||(8759359-8759614)
chr3 (57-312)||(13941621-13941876)
chr3 (57-312)||(41177119-41177374)
chr3 (87-310)||(12850558-12850781)
chr3 (48-310)||(14086261-14086523)
chr3 (160-310)||(15016034-15016184)
chr3 (21-307)||(11304055-11304341)
chr3 (39-307)||(12360824-12361092)
chr3 (36-310)||(11961313-11961587)
chr3 (57-297)||(16381219-16381459)
chr3 (48-312)||(16836787-16837045)
chr3 (21-310)||(44776808-44777097)
chr3 (21-165)||(31945033-31945177)
chr3 (21-163)||(31689049-31689191)
chr3 (180-310)||(8274689-8274819)
chr3 (180-310)||(16742993-16743123)
chr3 (180-310)||(13975335-13975465)
chr3 (180-310)||(15576470-15576600)
chr3 (196-310)||(18748401-18748515)
chr3 (196-298)||(21686681-21686783)
chr3 (18-73)||(320781-320835)
chr3 (231-310)||(17192865-17192944)
chr3 (180-298)||(6153141-6153259)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (21-309)||(24675052-24675340)
chr2 (21-310)||(22757054-22757343)
chr2 (21-310)||(21325857-21326146)
chr2 (21-310)||(23188571-23188860)
chr2 (21-310)||(24708073-24708362)
chr2 (21-310)||(23138600-23138889)
chr2 (21-310)||(23550390-23550679)
chr2 (21-271)||(27377101-27377351)
chr2 (45-310)||(23063664-23063929)
chr2 (33-310)||(16924835-16925112)
chr2 (33-310)||(16998575-16998852)
chr2 (21-310)||(44386160-44386449)
chr2 (33-310)||(16981727-16982004)
chr2 (33-310)||(17063292-17063569)
chr2 (27-310)||(21145621-21145904)
chr2 (33-310)||(9609711-9609988)
chr2 (21-310)||(22325447-22325736)
chr2 (21-310)||(24709596-24709885)
chr2 (33-310)||(27217591-27217868)
chr2 (21-310)||(24261933-24262222)
chr2 (21-310)||(24878586-24878875)
chr2 (21-310)||(27370832-27371121)
chr2 (33-310)||(10868425-10868702)
chr2 (33-310)||(17066953-17067227)
chr2 (21-309)||(23087013-23087301)
chr2 (36-310)||(30211508-30211782)
chr2 (123-310)||(24825873-24826060)
chr2 (22-310)||(31830222-31830510)
chr2 (48-310)||(27365670-27365932)
chr2 (36-310)||(11358465-11358739)
chr2 (22-309)||(20832549-20832836)
chr2 (41-310)||(45529100-45529363)
chr2 (21-198)||(41609047-41609224)
chr2 (22-310)||(1063315-1063603)
chr2 (39-310)||(23293539-23293810)
chr2 (57-312)||(27787340-27787595)
chr2 (21-310)||(23276339-23276628)
chr2 (59-298)||(24653946-24654185)
chr2 (36-118)||(24833356-24833438)
chr2 (57-312)||(12573952-12574207)
chr2 (57-229)||(24944966-24945138)
chr2 (180-310)||(22276001-22276131)
chr2 (21-65)||(45676685-45676729)
chr2 (21-64)||(23599834-23599877)
chr2 (180-310)||(12640510-12640640)
chr2 (180-310)||(24831778-24831908)
chr2 (281-310)||(27368423-27368452)
chr2 (42-82)||(17967577-17967617)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (21-310)||(21167031-21167320)
chr8 (21-310)||(30313638-30313927)
chr8 (21-310)||(15533378-15533667)
chr8 (21-310)||(19977965-19978254)
chr8 (21-310)||(21250940-21251229)
chr8 (21-310)||(16408539-16408828)
chr8 (21-310)||(22164685-22164974)
chr8 (21-310)||(22133535-22133824)
chr8 (21-310)||(23650039-23650328)
chr8 (21-310)||(32600142-32600431)
chr8 (21-310)||(21394359-21394648)
chr8 (21-310)||(21788852-21789141)
chr8 (21-307)||(22046372-22046657)
chr8 (21-310)||(22032030-22032319)
chr8 (21-310)||(21922229-21922518)
chr8 (21-310)||(17674517-17674806)
chr8 (33-310)||(19112700-19112977)
chr8 (21-310)||(22987199-22987488)
chr8 (21-262)||(15441179-15441420)
chr8 (21-310)||(20018244-20018533)
chr8 (21-310)||(19485364-19485653)
chr8 (36-310)||(20396619-20396893)
chr8 (21-310)||(22120668-22120957)
chr8 (21-296)||(23948887-23949162)
chr8 (22-310)||(6679110-6679398)
chr8 (57-309)||(20388133-20388385)
chr8 (21-309)||(21681965-21682253)
chr8 (170-310)||(22377947-22378087)
chr8 (170-310)||(22384122-22384262)
chr8 (39-310)||(20010394-20010665)
chr8 (22-310)||(804167-804455)
chr8 (39-310)||(1266255-1266526)
chr8 (39-310)||(19851427-19851698)
chr8 (39-310)||(19857463-19857734)
chr8 (21-310)||(22061927-22062216)
chr8 (21-310)||(23654925-23655214)
chr8 (22-310)||(14565141-14565429)
chr8 (39-310)||(21324903-21325175)
chr8 (21-295)||(16265127-16265401)
chr8 (21-310)||(21840415-21840704)
chr8 (22-310)||(6603657-6603945)
chr8 (39-307)||(20007866-20008134)
chr8 (57-312)||(31571334-31571589)
chr8 (36-310)||(12304771-12305045)
chr8 (36-310)||(29303920-29304194)
chr8 (22-298)||(28982356-28982632)
chr8 (22-298)||(28987576-28987852)
chr8 (39-310)||(31416968-31417239)
chr8 (22-233)||(27347225-27347436)
chr8 (178-310)||(22051018-22051150)
chr8 (180-310)||(22982593-22982723)
chr8 (180-296)||(21197010-21197126)
chr8 (180-310)||(20652827-20652957)
chr8 (261-310)||(23949158-23949207)
chr8 (180-310)||(16877589-16877719)
chr8 (180-310)||(21850831-21850961)
chr8 (189-265)||(19863223-19863299)
chr8 (189-265)||(19867860-19867936)
chr8 (196-310)||(22315364-22315478)
chr8 (21-53)||(22179309-22179341)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (21-310)||(23573606-23573895)
chr5 (21-310)||(23516405-23516694)
chr5 (21-310)||(23440089-23440378)
chr5 (21-309)||(18775641-18775929)
chr5 (35-310)||(26738938-26739213)
chr5 (21-310)||(21984538-21984827)
chr5 (56-307)||(20798659-20798910)
chr5 (21-310)||(22333120-22333409)
chr5 (21-310)||(25423053-25423342)
chr5 (21-310)||(14999972-15000261)
chr5 (21-310)||(19769824-19770113)
chr5 (21-310)||(23471093-23471382)
chr5 (21-310)||(27518271-27518560)
chr5 (21-310)||(27610218-27610507)
chr5 (33-310)||(40708656-40708933)
chr5 (21-312)||(41770706-41770997)
chr5 (21-310)||(27668723-27669012)
chr5 (21-310)||(27685633-27685922)
chr5 (33-310)||(34566370-34566647)
chr5 (33-310)||(16356378-16356655)
chr5 (21-310)||(22134532-22134821)
chr5 (21-310)||(37291729-37292018)
chr5 (21-312)||(29476304-29476595)
chr5 (21-298)||(20468341-20468618)
chr5 (33-235)||(21343666-21343868)
chr5 (21-262)||(20573385-20573626)
chr5 (46-310)||(22348314-22348576)
chr5 (100-310)||(21498269-21498479)
chr5 (48-310)||(23442526-23442788)
chr5 (21-310)||(28924001-28924290)
chr5 (22-310)||(25847922-25848210)
chr5 (58-307)||(21564202-21564451)
chr5 (21-310)||(28895175-28895464)
chr5 (22-310)||(14887224-14887512)
chr5 (39-310)||(21890992-21891263)
chr5 (22-310)||(37545729-37546018)
chr5 (39-310)||(22461816-22462087)
chr5 (39-310)||(24735844-24736115)
chr5 (39-310)||(24737018-24737289)
chr5 (39-310)||(24749787-24750058)
chr5 (36-310)||(24798630-24798904)
chr5 (22-310)||(20342129-20342417)
chr5 (36-255)||(21404715-21404934)
chr5 (21-283)||(21662300-21662561)
chr5 (21-310)||(20773606-20773895)
chr5 (36-309)||(22502540-22502813)
chr5 (18-310)||(22236153-22236445)
chr5 (36-310)||(22381060-22381334)
chr5 (39-310)||(20821317-20821588)
chr5 (57-283)||(21665761-21665986)
chr5 (36-310)||(23080322-23080596)
chr5 (57-310)||(17269566-17269819)
chr5 (246-310)||(21339519-21339583)
chr5 (180-310)||(11210927-11211057)
chr5 (180-310)||(21937421-21937551)
chr5 (196-310)||(23503464-23503578)
chr5 (180-310)||(27011089-27011219)
chr5 (21-109)||(21625382-21625470)
chr5 (276-312)||(21404939-21404975)
chr5 (199-298)||(16065935-16066034)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (21-310)||(19864483-19864772)
chr6 (21-309)||(21833178-21833466)
chr6 (23-310)||(12497824-12498111)
chr6 (23-310)||(12510790-12511077)
chr6 (21-310)||(16963563-16963852)
chr6 (21-309)||(25765487-25765774)
chr6 (23-310)||(12505153-12505440)
chr6 (21-312)||(25610055-25610346)
chr6 (21-310)||(16927836-16928125)
chr6 (21-309)||(22078885-22079173)
chr6 (21-310)||(5839415-5839704)
chr6 (21-310)||(27331629-27331918)
chr6 (21-310)||(27392369-27392658)
chr6 (21-310)||(16626913-16627202)
chr6 (21-310)||(23078265-23078554)
chr6 (21-310)||(28263393-28263682)
chr6 (21-310)||(28342142-28342431)
chr6 (27-310)||(1543280-1543563)
chr6 (21-310)||(24313364-24313653)
chr6 (21-310)||(25112348-25112637)
chr6 (33-310)||(29592116-29592393)
chr6 (21-309)||(18408140-18408428)
chr6 (21-310)||(2874999-2875288)
chr6 (21-310)||(27187232-27187521)
chr6 (21-310)||(27261719-27262008)
chr6 (21-309)||(22762652-22762940)
chr6 (21-310)||(28292568-28292857)
chr6 (21-243)||(17032358-17032580)
chr6 (36-310)||(21471412-21471686)
chr6 (21-310)||(25750605-25750894)
chr6 (47-310)||(18197743-18198006)
chr6 (21-156)||(22433793-22433928)
chr6 (39-310)||(15459150-15459421)
chr6 (57-310)||(25768023-25768276)
chr6 (48-310)||(14131375-14131637)
chr6 (36-310)||(10469045-10469319)
chr6 (39-310)||(19879112-19879383)
chr6 (39-310)||(34645782-34646053)
chr6 (48-309)||(21564329-21564590)
chr6 (39-310)||(18794504-18794775)
chr6 (21-307)||(22796831-22797117)
chr6 (36-310)||(24364223-24364497)
chr6 (57-310)||(27560813-27561066)
chr6 (50-310)||(11287794-11288054)
chr6 (39-309)||(8766345-8766615)
chr6 (50-310)||(11280701-11280961)
chr6 (179-303)||(25750900-25751024)
chr6 (170-312)||(1640717-1640859)
chr6 (104-309)||(17415365-17415570)
chr6 (231-310)||(11291818-11291897)
chr6 (57-312)||(28283007-28283262)
chr6 (180-309)||(16098005-16098134)
chr6 (180-310)||(16382569-16382699)
chr6 (141-310)||(18800858-18801027)
chr6 (39-115)||(1640613-1640689)
chr6 (183-303)||(16233167-16233287)
chr6 (196-310)||(1648980-1649094)
chr6 (140-310)||(14381663-14381833)
chr6 (39-105)||(18787702-18787768)
chr6 (180-298)||(18838116-18838234)
chr6 (196-298)||(21413146-21413248)
chr6 (180-310)||(25743283-25743413)
chr6 (180-310)||(15078560-15078690)
chr6 (196-310)||(18571622-18571736)
chr6 (180-310)||(23996203-23996333)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (23-310)||(278884-279171)
scaffold0005 (21-310)||(164763-165052)
scaffold0005 (21-310)||(308622-308911)
scaffold0005 (21-310)||(260271-260560)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (21-310)||(65369-65657)
scaffold0042 (21-229)||(39924-40132)
scaffold0042 (277-309)||(39874-39906)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (21-310)||(16355236-16355525)
chr4 (21-310)||(16252236-16252525)
chr4 (21-310)||(12523608-12523897)
chr4 (21-309)||(7090365-7090652)
chr4 (54-310)||(15149797-15150053)
chr4 (21-310)||(14680499-14680788)
chr4 (21-310)||(18227237-18227526)
chr4 (21-310)||(14159424-14159713)
chr4 (21-310)||(14652240-14652529)
chr4 (21-310)||(14851157-14851446)
chr4 (21-310)||(14266690-14266979)
chr4 (33-310)||(18297149-18297426)
chr4 (21-310)||(19778584-19778873)
chr4 (33-310)||(23955691-23955968)
chr4 (33-310)||(8386356-8386633)
chr4 (33-310)||(12476544-12476821)
chr4 (21-310)||(14303769-14304057)
chr4 (21-310)||(27711268-27711557)
chr4 (33-310)||(29039195-29039472)
chr4 (21-309)||(40472972-40473260)
chr4 (21-310)||(8053414-8053703)
chr4 (33-286)||(15364330-15364583)
chr4 (21-209)||(14927151-14927339)
chr4 (39-310)||(15003415-15003686)
chr4 (22-310)||(3264845-3265133)
chr4 (22-310)||(11207282-11207570)
chr4 (22-310)||(29453588-29453876)
chr4 (39-310)||(16145862-16146133)
chr4 (36-310)||(15070360-15070634)
chr4 (39-310)||(1649328-1649599)
chr4 (36-310)||(33222865-33223139)
chr4 (36-310)||(44661917-44662191)
chr4 (21-310)||(15245856-15246145)
chr4 (57-312)||(51606230-51606485)
chr4 (36-310)||(20890930-20891203)
chr4 (189-310)||(15415077-15415198)
chr4 (21-108)||(18607823-18607910)
chr4 (57-268)||(42702871-42703082)
chr4 (140-310)||(15359141-15359311)
chr4 (224-310)||(16676494-16676580)
chr4 (76-218)||(18164332-18164474)
chr4 (180-310)||(16445263-16445393)
chr4 (182-310)||(55375409-55375537)
chr4 (249-310)||(1640216-1640277)
chr4 (161-310)||(16752665-16752814)
chr4 (180-310)||(13247736-13247866)
chr4 (180-310)||(14997407-14997537)
chr4 (180-310)||(27900477-27900607)
chr4 (39-115)||(15415225-15415301)
chr4 (21-148)||(15319515-15319642)
chr4 (196-298)||(12132472-12132574)
chr4 (180-310)||(15293208-15293338)
chr4 (189-303)||(18550120-18550234)
chr4 (158-223)||(9849616-9849681)
chr4 (21-53)||(15351934-15351966)
chr4 (180-310)||(9290926-9291056)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (21-310)||(5977-6266)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (21-310)||(64085-64374)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (21-310)||(639-928)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (21-310)||(14323-14612)
scaffold0044 (21-310)||(583-872)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-310)||(180180-180469)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (21-310)||(17045138-17045427)
chr1 (21-310)||(20249797-20250086)
chr1 (21-310)||(19106314-19106603)
chr1 (21-310)||(50620367-50620656)
chr1 (21-310)||(20136725-20137014)
chr1 (21-310)||(21747482-21747770)
chr1 (21-310)||(16350722-16351011)
chr1 (21-310)||(19760989-19761278)
chr1 (21-310)||(33391152-33391441)
chr1 (21-256)||(16078810-16079045)
chr1 (44-309)||(16369267-16369532)
chr1 (21-310)||(21830250-21830539)
chr1 (21-310)||(51333616-51333905)
chr1 (21-307)||(21836897-21837183)
chr1 (21-310)||(41354592-41354881)
chr1 (21-241)||(50612608-50612828)
chr1 (39-310)||(19664999-19665270)
chr1 (21-175)||(21163227-21163381)
chr1 (22-310)||(37677027-37677316)
chr1 (57-310)||(20940186-20940439)
chr1 (36-307)||(31550307-31550578)
chr1 (39-310)||(20856884-20857155)
chr1 (36-310)||(20294374-20294648)
chr1 (39-307)||(19854279-19854547)
chr1 (36-307)||(20075185-20075456)
chr1 (21-310)||(22433239-22433528)
chr1 (158-310)||(11382678-11382830)
chr1 (22-237)||(20395189-20395404)
chr1 (140-310)||(41307891-41308061)
chr1 (57-310)||(20244183-20244436)
chr1 (87-310)||(20836011-20836237)
chr1 (180-310)||(20831515-20831645)
chr1 (21-115)||(24476927-24477021)
chr1 (180-310)||(46518827-46518957)
chr1 (180-298)||(20914316-20914434)
chr1 (196-298)||(21202422-21202524)
chr1 (180-242)||(22142232-22142294)
chr1 (279-310)||(16078775-16078806)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (21-308)||(15154714-15155001)
chr7 (21-310)||(17376-17665)
chr7 (21-310)||(11553162-11553451)
chr7 (21-310)||(12687422-12687711)
chr7 (21-310)||(11237273-11237562)
chr7 (21-310)||(14954541-14954830)
chr7 (21-310)||(15203800-15204089)
chr7 (33-310)||(8198561-8198838)
chr7 (21-310)||(8707526-8707815)
chr7 (21-310)||(10870916-10871205)
chr7 (21-310)||(14332318-14332607)
chr7 (21-310)||(15161117-15161406)
chr7 (21-312)||(14037728-14038019)
chr7 (21-312)||(14347758-14348049)
chr7 (21-310)||(23516829-23517118)
chr7 (21-310)||(18177663-18177952)
chr7 (21-310)||(18551818-18552107)
chr7 (33-310)||(44791411-44791688)
chr7 (21-310)||(13685984-13686274)
chr7 (87-310)||(15624539-15624762)
chr7 (39-310)||(12206838-12207109)
chr7 (21-310)||(15102639-15102928)
chr7 (39-310)||(8212166-8212437)
chr7 (39-310)||(19147151-19147422)
chr7 (39-310)||(20746550-20746821)
chr7 (21-310)||(14264282-14264571)
chr7 (22-310)||(11306301-11306589)
chr7 (22-310)||(49152224-49152512)
chr7 (36-312)||(21661900-21662173)
chr7 (39-310)||(16072332-16072603)
chr7 (39-310)||(11388466-11388736)
chr7 (57-312)||(23199779-23200034)
chr7 (57-312)||(23505906-23506161)
chr7 (21-310)||(14129795-14130084)
chr7 (21-310)||(14433613-14433902)
chr7 (39-310)||(13665493-13665759)
chr7 (57-312)||(18053989-18054244)
chr7 (204-310)||(35964910-35965016)
chr7 (57-310)||(16950509-16950762)
chr7 (57-309)||(14286415-14286667)
chr7 (36-310)||(13021294-13021568)
chr7 (18-310)||(6413430-6413722)
chr7 (36-310)||(12455640-12455913)
chr7 (21-82)||(12254326-12254387)
chr7 (249-309)||(11772302-11772362)
chr7 (57-312)||(1443-1698)
chr7 (57-168)||(15340454-15340565)
chr7 (141-310)||(26118643-26118812)
chr7 (57-310)||(26288075-26288327)
chr7 (189-303)||(41213-41327)
chr7 (180-310)||(7823980-7824110)
chr7 (196-310)||(14936443-14936557)
chr7 (36-126)||(26118806-26118896)
chr7 (180-310)||(27107834-27107964)
chr7 (39-148)||(15479338-15479447)
chr7 (180-310)||(4440008-4440138)
chr7 (196-310)||(15364036-15364150)
chr7 (195-295)||(20466877-20466977)
chr7 (279-310)||(9596236-9596267)
chr7 (180-303)||(21674600-21674723)
chr7 (180-310)||(12368636-12368766)
chr7 (196-225)||(13353247-13353276)
chr7 (21-53)||(13634038-13634070)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (21-310)||(27930-28219)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (21-310)||(33627-33916)
scaffold0109 (21-310)||(8559-8848)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (21-310)||(36-325)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (21-312)||(875-1165)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (21-310)||(4459-4748)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (21-306)||(32810-33095)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (21-310)||(127253-127542)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (21-310)||(5986-6275)
scaffold0120 (57-310)||(1578-1831)
scaffold0120 (180-310)||(22816-22946)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (21-310)||(1102-1391)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (21-310)||(5184-5473)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (21-310)||(219471-219760)
scaffold0012 (21-310)||(229006-229295)
scaffold0012 (180-310)||(33049-33179)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (21-317)||(111984-112280)
scaffold0004 (21-310)||(203522-203811)
scaffold0004 (22-312)||(117532-117822)
scaffold0004 (57-310)||(322703-322956)
scaffold0004 (36-310)||(385797-386071)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (21-310)||(14840-15129)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (21-310)||(162076-162365)
scaffold0001 (21-310)||(448022-448311)
scaffold0001 (57-310)||(90986-91239)
scaffold0001 (180-303)||(78690-78813)
scaffold0001 (147-222)||(175352-175427)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (21-309)||(9306-9594)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (21-309)||(749-1036)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (21-310)||(16950-17239)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (21-310)||(968-1257)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (21-310)||(6335-6624)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (21-310)||(3995-4284)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (21-310)||(14002-14291)
scaffold0106 (21-310)||(31373-31662)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (27-310)||(109865-110148)
scaffold0029 (21-310)||(96056-96345)
scaffold0029 (39-310)||(112540-112811)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (21-310)||(377-666)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (21-310)||(15133-15422)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (33-310)||(3115-3392)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (21-310)||(7340-7629)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (21-310)||(16519-16808)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (27-307)||(43123-43403)
scaffold0028 (21-310)||(8448-8737)
scaffold0028 (224-310)||(13832-13918)
scaffold0028 (48-310)||(50568-50830)
scaffold0028 (180-310)||(106627-106757)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (21-310)||(15456-15744)
scaffold0333 (246-310)||(15843-15907)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (34-310)||(314-590)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (21-310)||(6900-7191)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (33-310)||(26587-26864)
scaffold0011 (21-309)||(195758-196045)
scaffold0011 (39-310)||(148551-148822)
scaffold0011 (21-229)||(68575-68783)
scaffold0011 (180-310)||(122004-122134)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (21-243)||(16920-17142)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (57-310)||(1-254)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (21-310)||(13031-13320)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (36-303)||(886-1153)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (75-310)||(49510-49745)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (36-310)||(25773-26047)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (21-310)||(16470-16759)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (36-310)||(116959-117233)
scaffold0037 (180-310)||(98137-98267)
scaffold0037 (180-277)||(23553-23650)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (123-309)||(21932-22118)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (36-312)||(86556-86832)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (123-310)||(7855-8042)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (36-310)||(25125-25399)
scaffold0234 (180-310)||(16225-16355)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (36-310)||(5645-5918)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (135-310)||(9047-9222)
scaffold0507 (21-133)||(6940-7052)
scaffold0507 (180-298)||(399-517)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (39-310)||(10793-11064)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (48-310)||(26132-26394)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (21-310)||(13955-14244)
scaffold0034 (93-310)||(5007-5224)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (57-305)||(3874-4122)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (39-309)||(79-349)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (48-310)||(7090-7352)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (48-310)||(19973-20235)
scaffold0298 (21-310)||(13415-13704)
scaffold0298 (21-310)||(17185-17474)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (57-307)||(28826-29076)
scaffold0064 (57-307)||(40817-41067)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (57-310)||(47123-47376)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (57-309)||(51918-52170)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (159-309)||(835-985)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (21-310)||(18591-18880)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (102-303)||(58467-58668)
scaffold0058 (58-310)||(19120-19372)
scaffold0058 (36-94)||(59042-59100)
scaffold0058 (196-298)||(74038-74140)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (57-310)||(2750-3003)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (183-307)||(7522-7646)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (39-310)||(10137-10408)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (39-310)||(27500-27771)
scaffold0139 (21-310)||(1203-1491)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (87-222)||(4567-4702)
scaffold0023 (21-136)||(36974-37089)
scaffold0023 (258-310)||(4508-4560)
scaffold0023 (57-109)||(18993-19045)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (48-310)||(1223-1485)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (57-310)||(5968-6220)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (21-310)||(9761-10045)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (21-310)||(14049-14337)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-310)||(39702-39991)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (39-310)||(18830-19101)
scaffold0090 (141-310)||(23094-23263)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (22-309)||(38942-39229)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (39-309)||(3872-4142)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (48-266)||(1167-1385)
scaffold0165 (21-72)||(26213-26264)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (57-310)||(37201-37454)
scaffold0026 (140-310)||(27391-27561)
scaffold0026 (140-310)||(38228-38398)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (39-310)||(172-443)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (39-310)||(25919-26190)
scaffold0113 (36-310)||(16654-16928)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (48-310)||(21725-21987)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (39-309)||(27207-27476)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (57-310)||(5056-5309)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (21-310)||(10851-11140)
scaffold0124 (48-310)||(453-715)
scaffold0124 (180-310)||(7864-7994)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (21-310)||(42387-42676)
scaffold0010 (21-310)||(47453-47742)
scaffold0010 (160-235)||(2252-2327)
scaffold0010 (87-118)||(2212-2243)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (39-310)||(14305-14576)
scaffold0203 (39-202)||(9039-9202)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (39-310)||(509-780)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (39-310)||(49261-49532)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (36-310)||(26239-26513)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (36-310)||(16767-17041)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (21-310)||(49087-49376)
scaffold0053 (21-310)||(57871-58159)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (57-309)||(12836-13088)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (21-268)||(4235-4482)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (68-310)||(4760-5002)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (39-310)||(6164-6436)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (48-310)||(33731-33993)
scaffold0076 (180-310)||(40380-40510)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (21-310)||(61267-61556)
scaffold0067 (21-310)||(52233-52522)
scaffold0067 (57-310)||(67655-67908)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (57-310)||(248612-248865)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (39-310)||(20103-20374)
scaffold0114 (24-309)||(43471-43756)
scaffold0114 (24-309)||(44483-44768)
scaffold0114 (39-222)||(36036-36219)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (21-217)||(136082-136278)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (23-118)||(6238-6333)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (180-310)||(1916-2046)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (59-310)||(42784-43035)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (57-207)||(2023-2173)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (57-235)||(13382-13560)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (57-310)||(7292-7543)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (180-310)||(14779-14909)
scaffold0132 (257-310)||(43737-43790)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (21-82)||(7498-7559)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (180-303)||(24002-24125)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (180-310)||(964-1094)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (196-310)||(1108-1222)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (180-310)||(46276-46406)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (189-309)||(1-121)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (158-310)||(5313-5465)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (48-156)||(45835-45943)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (180-303)||(28327-28450)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (180-310)||(440-570)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (180-310)||(3929-4059)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (196-310)||(10493-10607)
scaffold0447 (196-310)||(5879-5993)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (196-310)||(14661-14775)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (180-310)||(13030-13160)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (180-310)||(3281-3411)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (196-310)||(8488-8602)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (180-309)||(10891-11020)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (245-310)||(1288-1353)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (273-310)||(3773-3810)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (21-126)||(3506-3611)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (39-126)||(875-962)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (21-136)||(9182-9297)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (180-310)||(8217-8347)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (180-310)||(14791-14921)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (182-310)||(23518-23646)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (196-303)||(4005-4112)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (256-310)||(26211-26265)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498088
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12498088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876789
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14876789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489690
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17489690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522561
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtg 9522561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371253
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492471
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16492471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807219
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| | |||  |||| |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgact 16807219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692000
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | || || || ||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 16692000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906050
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10906050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725223
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 15725223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348535
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15348535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005440
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10005440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425287
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 48425287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208730
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 15208730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252530
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 13252530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589682
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15589682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635613
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16635613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43162937
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 43162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339109
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| || |||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 15339109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402800
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 15402800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412572
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctg 16412572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062344
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 20062344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792689
Alignment:
Q  28 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcg 127  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||  | |||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  128 gtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagga 227  Q
    ||| |||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  228 gtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 26792689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425220
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || ||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425308 cataggagtgactct-caaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 5425220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385308
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 53385308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600587
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||| ||||  | | |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 6600587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756875
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||||||||  | |  ||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 16756875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 48 - 312
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15247989
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| ||||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    |||| |||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
     ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtg 15247989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227499
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 15227499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972399
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 13972399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123794
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | |||||||||||| | ||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 47123794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383819
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329936
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtg 16329936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322931
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |  || ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||  || ||  ||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||| ||||| |     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 13322931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571698
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctg 14571698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953247
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| | |||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||||| || ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||| | ||| | ||| ||||| ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15953247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134625
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | | | || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 18134625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420324
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||| ||  |||||||| | ||| ||||||||||| | |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || | ||| | ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 10420324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759359
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 8759359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941876
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 13941876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177374
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 41177374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850558
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtca 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | ||||||||| || |||| ||| || |||| ||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  187 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 286  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| | ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  287 atgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctg 12850558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086523
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || |  || ||||| |  || ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| |||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 14086523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15016034
Alignment:
Q  160 gatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttg 259  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  260 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctg 15016034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11304055
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || |||||   |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    || |||    ||||| | ||| | ||| || || ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgact 11304055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360824
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||  | ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| || ||| ||||| |     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 12360824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961313
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||  || ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |   ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| ||||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11961313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381219
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || |||||||  ||||  || ||||| |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| | ||| || || ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 297  Q
      ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct 16381219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16837045 - 16836787
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |      | || ||||| || |||||||  || | ||||| |||||  |    
T  16837045 ggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagt------ggtgtggtggcaaaccaactctatatgtcaccgttccaatcc 16836952  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| | |||    
T  16836951 tctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatg 16836852  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
     || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16836851 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtg 16836787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777097
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||||| ||| |  || ||||| | ||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||  ||||||||||| | ||| | ||| || || ||||| ||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 44777097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacg 165  Q
    |||||   || ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgata 163  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274689
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 8274689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742993
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  ||||| |||||| ||| ||||| |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16742993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975335
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 13975335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576600
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 15576600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748515
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||| ||| || ||  ||||||||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  18748501 cttctgtctactctg 18748515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686783
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| || | ||||||||||| | ||| || ||  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  296 ctt 298  Q
    |||    
T  21686781 ctt 21686783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320835
Alignment:
Q  18 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttg 73  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttg 320835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Original strand, 17192865 - 17192944
Alignment:
Q  231 actctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17192865 actctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 17192944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6153259 - 6153141
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||| |||||| || | ||||| | ||||| ||| || ||  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  6153259 ggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatatcctttctcc 6153160  T
Q  280 gcttatcatgataactctt 298  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6153159 tcttatcatgataactctt 6153141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675340
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 24675340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22757054
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22757054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325857
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21325857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188860
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
      ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23188860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708073
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctg 24708073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138889
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23138889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550679
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377101
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatc 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063929
Alignment:
Q  45 gatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaa 144  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  145 ctctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacat 244  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  245 atggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctg 23063929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925112
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16925112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998852
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16998852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386160
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 44386160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982004
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16982004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063569
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17063569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145621
Alignment:
Q  27 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactc 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  127 ggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 226  Q
    | || |||| || ||||||||||||  ||| ||||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  227 agtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21145621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9609988
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 9609988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325447
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22325447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709885
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  | |||||||| ||||||||| ||||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24709885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217868
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27217868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262222
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||  |||||| ||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24262222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878586
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||| |||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24878586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371121
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| |||||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctg 27371121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868702
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctg 10868702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067227
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17067227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087301
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
      ||||  |||||||| | ||||||||| || |||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactct 23087301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211508
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||   ||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    ||   |||||| |||| || | ||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctg 30211508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24826060 - 24825873
Alignment:
Q  123 actcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24826060 actcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtca 24825961  T
Q  223 caggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||  |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24825960 caggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctg 24825873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830510
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | |||||||||||| | ||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 31830510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365670
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || |||| |||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 27365670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358465
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11358465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 309
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832836
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 20832836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 310
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529363
Alignment:
Q  41 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgat 140  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||      
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  141 ccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaa 240  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||   |||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  241 acatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| ||||      |||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45529300 acacatgg------tcttcaaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctg 45529363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgact 198  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063603
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||| ||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 1063603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293810
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctg 23293810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787595
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 27787595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276628
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| | ||| | ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctg 23276628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 298
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  59 atacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataac 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | ||||||  |  |||| | |    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  159 tgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || || | ||| | ||| || || || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  259 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 298  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833356
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaa 24833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574207
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || |||||||  ||||  || ||||| |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  || || || || | ||| | ||| || || ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 12574207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 229
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945138
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| || | ||| |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagt 229  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 24945138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276131
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 22276131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 64  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640510
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || || || |||| ||| |||||  | |||||||||| ||| || || |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 12640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831778
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 24831778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368423
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctg 27368423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  42 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatg 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21167031
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21167031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313638
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 30313638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533667
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 15533667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978254
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19978254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251229
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 21251229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408539
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| || || |  |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16408539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164685
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22164685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133535
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 22133535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650328
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 23650328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600431
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 32600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394359
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21394359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788852
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21788852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046657
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgact 22046657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032319
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||||||| || | |||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctg 22032319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922229
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctg 21922229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674517
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17674517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19112977
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19112977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987488
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22987488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
     ||| || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaa 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018244
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 20018244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485364
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19485364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396619
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |   | ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctg 20396619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120668
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22120668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679398
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6679398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 309
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388385
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||  || | ||| |  |||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     || ||| |||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactct 20388385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681965
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    || |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 21681965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22378087 - 22377947
Alignment:
Q  170 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaaga 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||| |||| |||||||||| |    
T  22378087 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaata 22377988  T
Q  270 tcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377987 tctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22377947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22384262 - 22384122
Alignment:
Q  170 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaaga 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||| |||| |||||||||| |    
T  22384262 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaata 22384163  T
Q  270 tcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384162 tctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22384122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010394
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||| |     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20010394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804167
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 804167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266526
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| |     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctg 1266526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851698
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||  ||||||||||| |     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctg 19851698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857734
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||  ||||||||||| |     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctg 19857734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061927
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || | ||||| ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22061927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655214
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | | |   ||  |||| | || ||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 23655214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565429
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 14565429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324903
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa-gatgcggtggtaatccaactcggtacgccacc 137  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||  || |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  138 gatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaa 237  Q
    | |||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  238 aaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||| | ||| || || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 21324903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    || ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840704
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
      |||| ||| ||||| | |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctg 21840704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603945
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||| ||| ||||| |  |||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6603945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 307
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008134
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgact 20008134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571334
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 31571334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305045
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | | |||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 12305045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303920
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||| ||| ||||| | |||||||||||  || |   | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 29303920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 298  Q
    |  |||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 298  Q
    |  |||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416968
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  || ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| |||||||| | || |||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctg 31416968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    ||||   || ||||| |  ||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  222 acaggagtgact 233  Q
    | ||||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 310
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051150
Alignment:
Q  178 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttct 277  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | ||||| | ||| || || ||||||||||||||  | || ||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  278 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 22051150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982723
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||||  ||| || ||  | |||||||||| ||||||||  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
      ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctg 22982723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21197010
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| ||| || ||| | |||||||||| ||| ||||| |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  280 gcttatcatgataactc 296  Q
     ||||||||||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactc 21197010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652827
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||| | ||| || ||  |||||||||| | ||| ||||| |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctg 20652827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 310
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949207
Alignment:
Q  261 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23949207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877589
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || || || |||| ||| |||||  | |||||||||| ||| || || |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850831
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 21850831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863299
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactc 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactc 19863299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19867936
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactc 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactc 19867936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315478
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||| | ||||| ||||||| ||| || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  22315464 cttctgtctactctg 22315478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573895
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23573895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516694
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23516694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440378
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23440378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775929
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 18775929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 35 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738938
Alignment:
Q  35 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  135 accgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  235 taaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 26738938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984538
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctg 21984538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 56 - 307
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798910
Alignment:
Q  56 aacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgat 155  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  156 aactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctcctt 255  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  256 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgact 20798910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333120
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22333120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423342
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||  | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 25423342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999972
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 14999972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770113
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19770113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471382
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||  |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctg 23471382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518560
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27518560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610507
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27610507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40708933
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 40708933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41770997
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 41770997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668723
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27668723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685633
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27685633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566647
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 34566647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356655
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16356655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134821
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 22134821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291729
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctg 37291729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476304
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtg 29476304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468341
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  |||||||| | | | | ||||||| ||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 298  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactctt 20468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  233 tct 235  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaa 262  Q
    ||  ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 310
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348576
Alignment:
Q  46 atggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaac 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  146 tctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacata 245  Q
    ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |      
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  246 tggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctg 22348576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498269
Alignment:
Q  100 tcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  200 caaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 299  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  300 tgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctg 21498269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442526
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||  ||| ||||| | |||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 23442526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28924001
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| | ||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 28924001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848210
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | |||||||||||| ||||| | ||| || || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25848210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564202
Alignment:
Q  58 catacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |  | |||||| || ||||     
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  158 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttct 257  Q
    |||||| |||| |||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  258 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgact 21564202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895175
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  |||||||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| | ||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 28895175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887224
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14887224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890992
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| || ||||| |     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 21890992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545729
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| || || | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  222 acaggagtgactct-aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | |||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctg 37545729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462087
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||||||||| | ||| || |||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | |||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 22462087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735844
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24735844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737018
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24737018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749787
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24749787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798630
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | |  |||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 24798630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342417
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||| |||||||| | ||| | ||| || |  || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20342417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21404934
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | |  ||||||||||| || | ||||||||  | |||||| | ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  236 aaaaaacatatggtctcctt 255  Q
    |||||||| ||| |||||||    
T  21404915 aaaaaacacatgatctcctt 21404934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662300
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  |||| ||  | |||||||||||| |||| |||||||  || |||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 283  Q
    || |||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773895
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || | ||| | |||| | ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 20773895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 309
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502813
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 22502813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236153
Alignment:
Q  18 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggta 117  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  118 atccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 217  Q
    | |||||||  || | ||| | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  218 agtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| |||||| || || | ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 22236153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381334
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    ||| |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22381334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821588
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||  |||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| |||||||| | |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 20821588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||  |||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||||  || |||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||    
T  21665886 tctgataca-accaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 283  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080322
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctg 23080322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269566
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || |||||||  || |  || ||||| |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 17269566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21339583 - 21339519
Alignment:
Q  246 tggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339583 tggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21339519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210927
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 11210927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937421
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 21937421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503578
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| || | || |||||||||| ||| || ||   ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  23503564 cttctgtctactctg 23503578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011219
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctg 27011219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625470
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 109  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||   |||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 21404939 - 21404975
Alignment:
Q  276 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21404939 ctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtg 21404975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16066034 - 16065935
Alignment:
Q  199 tcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| || ||  |||| || |||| ||| || || | ||||||||||||||||||    
T  16066034 tcaaagcacgcccaacaccagtcacgggattaactctaaaaaatacatgatcaccaacttggaattcaatatccttcctcctcttatcatgataactctt 16065935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864772
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctg 19864772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833178
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 21833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498111
Alignment:
Q  23 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcca 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  123 actcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  223 caggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12498111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510790
Alignment:
Q  23 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcca 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  123 actcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  223 caggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12510790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963563
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    |||| || ||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16963563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765487
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||| | |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 25765487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505440
Alignment:
Q  23 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcca 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  123 actcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  223 caggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12505440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25610055
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtg 25610055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927836
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    |||  || |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctg 16927836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078885
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactct 22078885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839415
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 5839415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331629
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 27331629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392369
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 27392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626913
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16626913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078554
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctg 23078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263393
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28263393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342142
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28342142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543280
Alignment:
Q  27 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactc 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  127 ggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 226  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  227 agtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 1543280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313364
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24313364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112637
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctg 25112637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592116
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 29592116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408140
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | || || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactct 18408140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2874999
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 2874999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187521
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27187521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261719
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27261719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762652
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||| | ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactct 22762652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292568
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 28292568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032580
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaaca 243  Q
    || |||||||||||| |||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaaca 17032580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471686
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| || |||| ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 21471686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750894
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||| ||| ||||| | ||||||||| || |||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25750894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197743
Alignment:
Q  47 tggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaact 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| | |  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  147 ctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatat 246  Q
    ||||| |||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| | | ||| | ||    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  247 ggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | | ||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18197743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433928
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22433928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459421
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 15459421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768276
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | ||||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||| ||||||| ||||||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25768276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131375
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||  || ||||| | ||||||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || | ||||| |||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 14131375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10469045
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10469045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879383
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |  || ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||| || |||| |||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || |||||||||||| ||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 19879383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34646053 - 34645782
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  34646053 acatgcgaaggatcaggtacgtacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 34645954  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||| || |||| |||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||||||||| || ||    
T  34645953 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaa 34645854  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  34645853 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 34645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564329
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| || || || || ||||  |||||||| | |||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
     ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactct 21564329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794775
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || |  |||| |||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctg 18794775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796831
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||| || || ||||  |||||| ||| ||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    || |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagact 22796831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364497
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 24364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560813
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||  || ||||| |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 27560813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287794
Alignment:
Q  50 atccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctt 149  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |  || ||||| | |||||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  150 tctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggt 249  Q
    || |||| |||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| || |||| ||| |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  250 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11287794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766345
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||| || ||| || || |     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||| ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 8766345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280701
Alignment:
Q  50 atccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctt 149  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |  || ||||| | |||||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  150 tctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggt 249  Q
    || |||| |||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| ||| |||| ||| || |||| ||| |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  250 ctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11280701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 303
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  179 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttcta 278  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 312
Target Start/End: Original strand, 1640717 - 1640859
Alignment:
Q  170 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaaga 269  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| | ||| |||||     
T  1640717 aataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaagg 1640816  T
Q  270 tcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1640817 tcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtg 1640859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415570
Alignment:
Q  104 aagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 203  Q
    |||||||||||| || || ||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  204 gcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  304 gactct 309  Q
    ||||||    
T  17415565 gactct 17415570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 310
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291897
Alignment:
Q  231 actctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 11291897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28283007
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||| |  |||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || |||||||  || |  || ||||| |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 28283007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098134
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||||||| ||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactct 16098134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382569
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16382569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Original strand, 18800858 - 18801027
Alignment:
Q  141 ccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaa 240  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||| ||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||| ||||| | ||    
T  18800858 ccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaa 18800957  T
Q  241 acatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | | ||| || || ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18800958 atacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 18801027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 115
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640689
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgg 115  Q
    ||||| || |||||||  || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgg 1640689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 303
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233287
Alignment:
Q  183 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 282  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  283 tatcatgataactcttttgtc 303  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtc 16233287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648980
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  1648994 cttctgtctactctg 1648980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14381833 - 14381663
Alignment:
Q  140 tccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaa 239  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || | |    
T  14381833 tccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaga 14381734  T
Q  240 aacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || | ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  14381733 aatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctg 14381663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787768
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa 105  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaa 18787768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838116
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | || |  ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  280 gcttatcatgataactctt 298  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactctt 18838116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21413146
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  || |||||||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  296 ctt 298  Q
    |||    
T  21413148 ctt 21413146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743283
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | || |||||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 25743283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078560
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||| ||||| | ||| || ||  | |||||||| | ||| |||||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctg 15078560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571736
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||| || | || || ||||| | ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  18571722 cttctgtctactctg 18571736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996333
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||  || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 23996333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278884
Alignment:
Q  23 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcca 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  123 actcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  223 caggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 278884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164763
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 164763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308911
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 308911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260560
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| || |    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
     |||||  || ||||||| || ||  || ||||| | ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| | ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 260560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65657
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65369 acatcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 65657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  221 cacaggagt 229  Q
    |||||||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39874
Alignment:
Q  277 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 39874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355236
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctg 16355236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252236
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16252236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523897
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctg 12523897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090652
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgagc-aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactct 7090652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149797
Alignment:
Q  54 ggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctg 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  154 ataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctcc 253  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  254 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15149797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680788
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14680788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227237
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18227237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159713
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||  ||||| ||||| |  |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctg 14159713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652529
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14652529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851157
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14851157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266690
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14266690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297426
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18297426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778584
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19778584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23955968
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23955968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386633
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8386633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476821
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12476821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303769
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 14303769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711557
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039195
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 29039195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473260
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||| || ||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactct 40473260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053414
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | || ||||| |||| || ||||||||||||   || ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 8053414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 286
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 286  Q
    ||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927151
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 209  Q
    | |||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003415
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||| || |||| |||||| |||  ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15003415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264845
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 3264845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207282
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | |||||||||||| | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11207282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453588
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 29453588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146133
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 16146133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070634
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||   |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || | ||| ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| ||  ||| ||| || |||| ||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 15070634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649328
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||  || ||||||| ||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctg 1649328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223139
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 33223139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661917
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctg 44661917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246145
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
      |||| ||| ||||| | |||||| || |||| || ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || ||| || ||||| | ||| | ||| ||||| || ||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15246145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606230
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 51606230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891203
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||| | |  || ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgcca 20891028  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | |||||| || ||||| | |||||||| || ||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20891203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415077
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 288  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  289 gataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctg 15415077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607823
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 108  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703082
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 42703070  T
Q  257 ttgaaactcaag 268  Q
    ||||||||||||    
T  42703071 ttgaaactcaag 42703082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15359311 - 15359141
Alignment:
Q  140 tccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaa 239  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||   |    
T  15359311 tccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcgga 15359212  T
Q  240 aacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  15359211 aatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctg 15359141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676494
Alignment:
Q  224 aggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16676494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  76 acacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaa 175  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  176 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacca 218  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445263
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || |||||||||||| | || |||||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375409
Alignment:
Q  182 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| |||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  282 ttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctg 55375409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1640277 - 1640216
Alignment:
Q  249 tctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1640277 tctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 1640216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752814
Alignment:
Q  161 atacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttga 260  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| | ||| || || || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  261 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 16752814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13247866
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  ||||| || | || || ||||| | ||| || ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 13247866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997537
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctg 14997537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 27900477 - 27900607
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||  |||| |||||| || || | ||| | ||| || || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  27900477 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 27900576  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  27900577 gcttgtcatgatagctcttctatcgactctg 27900607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415225
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtgg 15415225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Original strand, 15319515 - 15319642
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||| | ||| || |    
T  15319515 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaac 15319614  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactct 148  Q
    | |||| ||| ||||| | |||||||||    
T  15319615 ccactctgtatgccactgttccaactct 15319642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132472
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||| ||| || ||  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  296 ctt 298  Q
    |||    
T  12132474 ctt 12132472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293208
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| |||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
      ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctg 15293208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18550234 - 18550120
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 288  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |  | ||| |||||||| |    ||| || ||||||||||    
T  18550234 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaacaaatgatacctttcctgaaactccaatgatttccttcgcttatcat 18550135  T
Q  289 gataactcttttgtc 303  Q
    |||| ||||||||||    
T  18550134 gatagctcttttgtc 18550120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9849681 - 9849616
Alignment:
Q  158 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 223  Q
    |||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9849681 ctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 9849616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291056
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| | ||||||||| | || || ||||| |  || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 9291056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6266
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctg 6266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64085
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 64085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 639 - 928
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    |||| || |||||||||  |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctg 928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14612
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | || || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 583 - 872
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||  ||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctg 872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180469
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 180469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045138
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17045138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250086
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 20250086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106603
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19106603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620367
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 50620367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137014
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    |||| || |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 20137014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747770
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctg 21747770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16351011 - 16350722
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16351011 acatcgtcattctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16350912  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350911 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16350812  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350811 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16350722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760989
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19760989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391152
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 33391152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078810
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 16078810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 309
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369532
Alignment:
Q  44 agatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatcca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  144 actctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaca 243  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  244 tatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
     ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactct 16369532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830539
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 21830539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333616
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 51333616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837183
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgact 21837183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354592
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||||  |||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 41354592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612608
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaa 241  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaa 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664999
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| |||||| ||||| |     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 19664999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaa 175  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677316
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    ||||| ||| ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  222 acaggagtgactct-aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || || ||| | ||| || || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 37677316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940186
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| || |||||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 20940186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550307
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgact 31550307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856884
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||||||||| | ||| || |||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctg 20856884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294648
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | |  |||||||| ||||| | |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20294648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 307
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854547
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 19854547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075185
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgact 20075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433239
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| || |    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | | |||| || ||||| | |||||||| ||  || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || |  |||| ||| || || || |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22433239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Original strand, 11382678 - 11382830
Alignment:
Q  158 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttct 257  Q
    ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||| || || ||     
T  11382678 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11382777  T
Q  258 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11382778 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11382830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395189
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || |||||   ||||||||| ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  222 acaggagtgactctaa 237  Q
    | ||||||||| ||||    
T  20395204 aaaggagtgaccctaa 20395189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308061
Alignment:
Q  140 tccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaa 239  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| || || | |    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  240 aacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 41308061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244436
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| || ||||| |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || || | ||| | ||| || || ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20244436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20836011
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtca 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  187 act---tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 283  Q
    |||   |||| ||||| || | |||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||| || || || | ||||| |||  | || | ||||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  284 atcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctg 20836011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831515
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 20831515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477021
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgg 115  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtgg 24477021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518957
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 46518957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 298
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914434
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||| | ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  280 gcttatcatgataactctt 298  Q
      |||| ||||||||||||    
T  20914416 atttataatgataactctt 20914434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202422
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||| |||||||||||| || | |||| | ||||| ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  296 ctt 298  Q
    |||    
T  21202424 ctt 21202422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaac 242  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16078806 - 16078775
Alignment:
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078806 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16078775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154714
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactc 308  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactc 15154714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17376
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctg 17376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553162
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 11553162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687711
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12687711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237273
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 11237273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954830
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
      ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14954830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204089
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||| | |||| ||||| ||||||||  | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15204089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198838
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8198838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707815
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8707815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871205
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10871205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332607
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 14332607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161117
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15161117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038019
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||  || ||||||||| |||| |||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    || |||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 14038019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348049
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||  || ||||||||| |||| |||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    || |||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 14348049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516829
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  | | |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23516829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18177952
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | |||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18177952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551818
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791411
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 44791411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686274
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaga-catcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaat 119  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||  |||||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  120 ccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 219  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  220 tcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 13686274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624762
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  187 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 286  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  287 atgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctg 15624762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206838
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     | ||||||| || |||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctg 12206838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102639
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15102639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212166
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
      |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 8212166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147422
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || |  |||| ||| ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 19147422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746821
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || |  |||| ||| ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20746821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264282
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| || |    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14264282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306301
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11306301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 310
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152512
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||||||| || | ||| | ||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 49152512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662173
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    ||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |||  ||||||||||  || | ||||||||| | |||||| |||||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
     ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtg 21662173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072332
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 16072332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388466
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11388536 gaacacatgatctcc-tcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11388466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199779
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || | || || ||| |  || ||||| |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 23199779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505906
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || | || || ||| |  || ||||| |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 23505906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130084
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || |||| || |||||  || ||| | | ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||  ||||| ||||||||||| | ||| || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 14130084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433902
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || |||| || |||||  || ||| | | ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||  ||||| ||||||||||| | ||| || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 14433902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665759
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| |||||||| | |||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctg 13665759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053989
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||| |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 18053989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964910
Alignment:
Q  204 gcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  304 gactctg 310  Q
     ||||||    
T  35964916 tactctg 35964910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950509
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| | |||||| |||||||| |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 16950509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286415
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||  || | ||| |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| | ||| || || ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 14286415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021568
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | |||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||| ||||| | |||||||| ||||||   || || |||| ||||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 13021568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413722
Alignment:
Q  18 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggta 117  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||   ||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  118 atccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 217  Q
    | |||||||  || ||||| | |||||| || ||||| | ||||| || || ||| ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  218 agtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| |||||| || || | ||||| ||| || || || ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6413722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455913
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||| ||  || ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | || |||||| ||||| | ||||||| ||| ||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 12455913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatg 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11772302
Alignment:
Q  249 tctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 11772302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1443
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||  | |||||| |||||| | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| || ||| ||| | | ||| | ||| || || ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtg 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340565
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||  || ||||| |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  157 actgatacggac 168  Q
     |||||||||||    
T  15340554 tctgatacggac 15340565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26118812 - 26118643
Alignment:
Q  141 ccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaa 240  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| || | ||    
T  26118812 ccaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaa 26118713  T
Q  241 acatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | | ||| || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26118712 aaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 26118643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288075
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | || ||| |||||||| |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||||| || ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| | ||| || || ||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctc 26288128  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| || ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26288127 ctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctg 26288075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41213
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  289 gataactcttttgtc 303  Q
    |||| ||||| ||||    
T  41227 gatagctcttctgtc 41213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824110
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 7824110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936557
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||| || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  14936543 cttctgtctactctg 14936557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118806
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactc 126  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactc 26118806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107834
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 27107834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479338
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  139 atccaactct 148  Q
     |||||||||    
T  15479347 ttccaactct 15479338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440138
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||| ||||||| ||| || ||  | ||||||||||  || || || |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 4440138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364150
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||||| ||| || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  15364136 cttctgtctactctg 15364150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 295
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20466977
Alignment:
Q  195 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 294  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  | ||||||||||||| ||  ||| |  || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  295 t 295  Q
    |    
T  20466977 t 20466977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 310
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596267
Alignment:
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 9596267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674600
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | ||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| ||||  || || || |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtc 21674600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368636
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | ||||| |||||||  || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 12368636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 225
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353276
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacag 13353276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28219
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33627
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 33627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8848
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 36
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
      ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 36  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 875
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||| ||  |||||  |||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtg 875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4459
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32810
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 306  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 32810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127253
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 127253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6275
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 6275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1578
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||   ||| | ||| ||| |  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctg 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22946
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 22946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1391
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctg 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5473
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctg 5473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219471
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 219471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229295
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctg 229295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33049
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 33049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 317
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112280
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtggtgct 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgct 112280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203522
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctg 203522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 312
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117822
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    | |||||| || || | ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtg 117822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 322703 - 322956
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||  | |||||| || |||||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||| || || ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 322956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386071
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| || |||| ||| || | ||  |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  ||||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| ||||| ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctg 386071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15129
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctg 15129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162365
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctg 162365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448311
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||| | | |||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctg 448311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90986
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     || ||| |||||||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 90986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78690
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtc 78690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  147 ctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9594
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 9594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 749
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | || || |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  836 cacacgagggactct-caaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17239
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 968 - 1257
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||| |||||||| || || | ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctg 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6624
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| ||  |||||   |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctg 6624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4284
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14291
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31662
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||  || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || || ||| ||||| | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctg 31662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109865
Alignment:
Q  27 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactc 126  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  127 ggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 226  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  227 agtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 109865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96056
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||| ||  |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || ||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 96056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112811
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |  || ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||| || |||| |||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 112811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 377 - 666
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15133
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| |||||||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3392
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7629
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 7629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16519
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 16519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 307
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43403
Alignment:
Q  27 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactc 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  127 ggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagg 226  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  227 agtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgact 43403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8737
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8448 acatcgtcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 8547  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8548 ccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 8647  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8648 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13918
Alignment:
Q  224 aggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 13918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50568
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || |  || ||||| |  || ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| |||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||| | ||||| |||||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctg 50568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106627
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctg 106627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15744
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| || ||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 15744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 15843 - 15907
Alignment:
Q  246 tggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15843 tggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 314
Alignment:
Q  34 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgc 133  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  134 caccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 233  Q
    ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  234 ctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctg 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7191
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaaga-tgcggtggtaat 119  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||| |||||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  120 ccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccag 219  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  220 tcacaggagtgactct-aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26587
Alignment:
Q  33 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  133 ccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |||||| | |||  |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  233 tctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| ||||| |  || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 26587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195758
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | ||||||  | ||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    || |||||| || || | ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctct 195758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148822
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||| ||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctg 148822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68575
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||| ||| ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  221 cacaggagt 229  Q
    || ||||||    
T  68583 cataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 122004
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||| | ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 122004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  |||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaaca 243  Q
    |||| |||||||||| |||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 1 - 254
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||   |||||||||||| ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |  || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctg 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 13031
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||||||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  ||||| |||  ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 13031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 303
Target Start/End: Original strand, 886 - 1153
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Original strand, 49510 - 49745
Alignment:
Q  75 gacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataa 174  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| | |||||    
T  49510 gacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataa 49609  T
Q  175 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttt 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49610 atctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttt 49709  T
Q  275 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  49710 cctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctg 49745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25773
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 25773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16470
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||  | |||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctg 16470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116959
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    ||| | ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |  || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctg 116959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98267
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||  || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 98267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23553
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttct 277  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  | |||||||||| ||| |||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacatgaaactcaatatcctttct 23553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 123 - 309
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22118
Alignment:
Q  123 actcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  223 caggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactct 22118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86556
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |||| ||||||||||| || |  |||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 312  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtg 86556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8042
Alignment:
Q  123 actcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  223 caggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | | ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 8042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25125
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | |||||||||||| |||| ||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||||    
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctg 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16355 - 16225
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  ||||||| || | ||| || || |    
T  16355 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaacttgaaagtctatatccttcctcc 16256  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16255 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5645
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||  ||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | |  |||||||||| ||| |  ||||||| || | |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctg 5645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 135 - 310
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9222
Alignment:
Q  135 accgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  235 taaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    | ||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 9222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7052
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaac 7039  T
Q  121 caactcggtacgc 133  Q
    | ||||| |||||    
T  7040 ccactcgatacgc 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 399
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | ||||| || |||| ||| || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  280 gcttatcatgataactctt 298  Q
     ||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactctt 399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10793
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||  || ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||| | || |||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctg 10793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26394
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | ||||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctg 26394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13955
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 13955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 5007
Alignment:
Q  93 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttct 192  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  193 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 292  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||| ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  293 actcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctg 5007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 305
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4122
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| | | ||||| ||| ||||| ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcga 305  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcga 4122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 79 - 349
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7090
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | ||||||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| ||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || | ||||| |||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20235
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | ||||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | |||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 20235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13415
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| | ||| | ||| || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17185
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || |||| ||| | ||| || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 17185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28826
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||  | || ||||  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40817
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||  | || ||||  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 40817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47376
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||| || || | ||||| ||| ||||| ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctg 47376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51918
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||| |||| | ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 51918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 835
Alignment:
Q  159 tgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  259 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18591
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||| ||| ||||| | || ||| || ||||||| |||||||  || ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 18591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58467
Alignment:
Q  102 gaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 201  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  202 aagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 301  Q
      ||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  302 tc 303  Q
    ||    
T  58468 tc 58467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 310
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19372
Alignment:
Q  58 catacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| || || ||||     
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  158 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttct 257  Q
    |||||||| || ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| || || | ||| | ||| || || ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  258 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 19372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatg 94  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74140
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | ||||| ||| ||  |  | |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  296 ctt 298  Q
    |||    
T  74138 ctt 74140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3003
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| || |||||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||| | ||| ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctg 3003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 307
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7646
Alignment:
Q  183 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  283 tatcatgataactcttttgtcgact 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgact 7646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10137
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||||||||||||   |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 10137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27771
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||||| || |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 27771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1203
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||   || |    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||   || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||| ||| ||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4702 - 4567
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4702 acatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaataaatctcggagtaa 4603  T
Q  187 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4602 acttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  121 caactcggtacgccac 136  Q
    ||||| | ||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4508
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 109  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1223
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |   || ||||| | |||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5968
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| | ||||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || | ||||| |||  |||| ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 5968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10045
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||| ||| ||||| | |||||| || || |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||| |     | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14337
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||  ||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||  |||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 39702 - 39991
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||| ||| ||||| | |||||| || || |||| | ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| ||||| | ||| | ||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctg 39991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19101
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  |||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
      |||||||| || |||| |||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctg 19101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 310
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23263
Alignment:
Q  141 ccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaa 240  Q
    |||||||| || |||| |||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  241 acatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctg 23263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38942
Alignment:
Q  22 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  122 aactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtc 221  Q
    |||||  || ||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  222 acaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    | |||||||||||| | ||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 38942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4142
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||  |||||  ||| ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || || |||| ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactct 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 266
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | |  |||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  248 gtctccttcttgaaactca 266  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26213
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtt 72  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagtt 26213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37454
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||   |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 37454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27561 - 27391
Alignment:
Q  140 tccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaa 239  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | |    
T  27561 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaga 27462  T
Q  240 aacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  27461 aatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctg 27391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38398 - 38228
Alignment:
Q  140 tccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaa 239  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | |    
T  38398 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaga 38299  T
Q  240 aacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || | ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  38298 aatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctg 38228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 172 - 443
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||  || ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| |||||| || || |     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25919
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16928
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |   |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 16928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21725
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| || |||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| | |||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||  || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 21725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27476
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || |||||| ||||| |     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    ||| | ||| | ||| |||||||| |||||  | || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactct 27476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5056
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||  | |||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     |||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||| ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11140
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| || || |||| ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || |||| ||| | ||| || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 11140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 453
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| | |||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     || || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7864
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42387
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || | ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctg 42387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47453
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || | ||| | ||| || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctg 47453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 235
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2327
Alignment:
Q  160 gatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactct 2327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 118
Target Start/End: Original strand, 2212 - 2243
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2212 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 2243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14305
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||| | ||| || || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 14305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 202  Q
     |||||| || ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 509 - 780
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| |  ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctg 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49261
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| || |     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 49261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26513
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||  || ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||| || || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 26513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16767
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  136 ccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    | | ||||||||| ||||| | || |||||||| ||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  236 aaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     | ||| | ||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctg 16767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49087
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | |||  ||| ||| | | |||||| || || |||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || ||| || ||||| | ||||| ||| | ||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 49087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57871
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||||| |||||  || ||||| | ||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| | ||| || || |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctg 57871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12836
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||  || ||||| |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     || |||||||| ||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| | ||| || || ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactct 12836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4235
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    ||||||  || ||||| | |||||| || | ||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaag 268  Q
    || |||||| ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 310
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5002
Alignment:
Q  68 aagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacgga 167  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| | |||||| || || |||| || |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  168 ctaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaa 267  Q
    | ||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  268 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6436
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||| || |||| ||  || ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct-aa 237  Q
     ||||| ||||||||| | |||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || || |     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  238 aaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 6436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33731
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || || |  || ||||| |  || ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  148 tttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatg 247  Q
    | || |||| |||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || |||| |||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 33731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40510
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 40510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61267
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||| ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || | ||| | ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 61267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52233
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 220  Q
    | ||||  || ||||| | |||||| ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  221 cacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    || |||||| || || | ||| | ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 52233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67655
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||| | |||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| || || | ||| | ||| || || ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 67655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248865
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||   ||||||| | ||||| |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| | ||| || || ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 310
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20374
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaa 238  Q
     |||||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || || |     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  239 aaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||| ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43756
Alignment:
Q  24 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 123  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  124 ctcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 223  Q
    |||  || ||||| | |||||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  224 aggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||||| || || | ||||| ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactct 43756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 309
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44768
Alignment:
Q  24 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 123  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  124 ctcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 223  Q
    |||  || ||||| | |||||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  224 aggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||||| || || | ||||| ||| || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactct 44768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccg 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  139 atccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 222  Q
     |||||| || ||||| | |||||||||||  || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  121 caactcggtacgccaccgatccaactctttctgataactgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 217  Q
    ||||||  || ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6333
Alignment:
Q  23 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2046
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 310
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43035
Alignment:
Q  59 atacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgataac 158  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||  || ||||| | ||||||  | ||||| | |    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  159 tgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttctt 258  Q
    |||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||| || || || |    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  259 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctg 43035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| | |||||| || || ||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 207  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13382
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| | ||| | |||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
     |||||||  || ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactct 13382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7292
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactctttctgata 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||  | |||||| |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa--ccttctgaaa 7446  T
Q  157 actgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttc 256  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| || ||| || || | ||| | ||| || || ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctg 7292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14909
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctg 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 310
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43790
Alignment:
Q  257 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctg 43790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatg 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 303
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24125
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtc 24125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 964
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctg 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1108
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||  |  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  1122 cttctgtctactctg 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46406
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || |||||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctg 46406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 309
Target Start/End: Original strand, 1 - 121
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 288  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  289 gataactcttttgtcgactct 309  Q
    | |||||||| || |||||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactct 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Original strand, 5313 - 5465
Alignment:
Q  158 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttct 257  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| | ||| || || ||     
T  5313 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 5412  T
Q  258 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  5413 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45943
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcggtacgccaccgatccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||  || ||||| | |||||| |    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 45934  T
Q  148 tttctgata 156  Q
    | |||||||    
T  45935 tctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28450 - 28327
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || || ||||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||| |    
T  28450 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcc 28351  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  28350 tcttatcatgataactcttctgtc 28327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 440
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||| |||  | ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3929
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 3929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10607
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || || ||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  10593 cttctgtctactctg 10607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 5879 - 5993
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || || ||||||| ||| || ||  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  5979 cttctgtctactctg 5993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14775
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||| || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  14761 cttctgtctactctg 14775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13160
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || |||| ||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 13160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3411
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||| || ||  | |||||||| |  || ||||| |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 3411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 310
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8602
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || || ||||||| ||| || ||  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  296 cttttgtcgactctg 310  Q
    ||| |||| ||||||    
T  8588 cttctgtctactctg 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Original strand, 10891 - 11020
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||| || ||| || |||| ||||| ||| || || || |||||||||||  | ||||| |    
T  10891 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 10990  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactct 309  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  10991 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 11020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1288
Alignment:
Q  245 atggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1353 atggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctg 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3773
Alignment:
Q  273 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 3773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3506
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 3512  T
Q  121 caactc 126  Q
    ||||||    
T  3511 caactc 3506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 875
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactc 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactc 875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9297
Alignment:
Q  21 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatc 9281  T
Q  121 caactcggtacgccac 136  Q
    | |||| ||| |||||    
T  9282 ccactctgtatgccac 9297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8347
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| |||||| || | || || ||||| | ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctg 8347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14791
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  |||||| || | || || ||||||| ||| || ||  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 14791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 310
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23646
Alignment:
Q  182 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgc 281  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||  || || |   |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  282 ttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctg 23646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 4005
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacatatggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | ||||| ||||||| ||| || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  296 cttttgtc 303  Q
    ||| ||||    
T  4012 cttatgtc 4005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26211
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 310  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University