View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20638_high_22 (Length: 310)

Name: NF20638_high_22
Description: NF20638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20638_high_22
NF20638_high_22
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (28-300)||(2041-2313)
scaffold0234 (28-300)||(10932-11204)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (28-300)||(17684189-17684461)
chr6 (28-300)||(27380972-27381244)
chr6 (28-300)||(27471355-27471627)
chr6 (28-300)||(11651938-11652210)
chr6 (28-300)||(17691160-17691432)
chr6 (28-300)||(29309105-29309377)
chr6 (28-300)||(29316065-29316336)
chr6 (28-261)||(27296883-27297116)
chr6 (28-300)||(188697-188969)
chr6 (28-300)||(16394165-16394437)
chr6 (29-250)||(16559193-16559414)
chr6 (32-269)||(25536915-25537152)
chr6 (45-295)||(13359010-13359256)
chr6 (28-279)||(22859888-22860135)
chr6 (28-279)||(27508347-27508594)
chr6 (28-279)||(16789126-16789373)
chr6 (42-279)||(27527947-27528180)
chr6 (28-267)||(1586108-1586343)
chr6 (38-295)||(2669513-2669768)
chr6 (169-279)||(18019981-18020088)
chr6 (28-260)||(8612989-8613221)
chr6 (50-267)||(10359073-10359285)
chr6 (28-260)||(14074554-14074782)
chr6 (245-300)||(16566257-16566312)
chr6 (113-260)||(20736413-20736557)
chr6 (102-257)||(8510181-8510333)
chr6 (212-299)||(28172772-28172859)
chr6 (206-296)||(27925973-27926062)
chr6 (28-141)||(33317055-33317167)
chr6 (200-300)||(19347092-19347191)
chr6 (125-260)||(21994662-21994794)
chr6 (201-260)||(5758650-5758709)
chr6 (131-297)||(17850321-17850484)
chr6 (28-260)||(17120505-17120733)
chr6 (106-169)||(28172899-28172963)
chr6 (169-258)||(22560324-22560410)
chr6 (78-260)||(19218503-19218676)
chr6 (45-184)||(28756145-28756283)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (28-300)||(24695186-24695458)
chr5 (28-300)||(19714218-19714490)
chr5 (28-288)||(18569581-18569841)
chr5 (28-300)||(19706939-19707210)
chr5 (28-294)||(17298621-17298885)
chr5 (157-300)||(39538803-39538946)
chr5 (24-190)||(27347252-27347417)
chr5 (28-300)||(17285470-17285740)
chr5 (28-135)||(24701950-24702057)
chr5 (115-295)||(18806843-18807021)
chr5 (28-279)||(20941082-20941329)
chr5 (28-267)||(22941317-22941552)
chr5 (28-279)||(25805385-25805632)
chr5 (28-279)||(31954-32201)
chr5 (28-279)||(12789663-12789910)
chr5 (28-279)||(23545977-23546224)
chr5 (204-300)||(22546912-22547008)
chr5 (28-267)||(24933306-24933541)
chr5 (28-260)||(31096890-31097118)
chr5 (40-256)||(20100255-20100467)
chr5 (28-260)||(7865430-7865662)
chr5 (28-267)||(5097718-5097953)
chr5 (115-253)||(18806483-18806619)
chr5 (115-253)||(18806663-18806799)
chr5 (28-260)||(12764990-12765222)
chr5 (28-260)||(9811733-9811965)
chr5 (28-260)||(12703874-12704106)
chr5 (122-277)||(18829377-18829530)
chr5 (24-113)||(28719471-28719558)
chr5 (24-267)||(26129689-26129928)
chr5 (28-260)||(26245176-26245404)
chr5 (28-109)||(39538954-39539035)
chr5 (203-279)||(33477193-33477269)
chr5 (263-300)||(27347433-27347470)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (28-300)||(18262427-18262699)
chr4 (28-300)||(18269288-18269560)
chr4 (28-300)||(55612898-55613170)
chr4 (28-300)||(8858382-8858654)
chr4 (28-300)||(26963855-26964127)
chr4 (28-300)||(26970678-26970950)
chr4 (28-300)||(868812-869084)
chr4 (28-300)||(19926480-19926752)
chr4 (28-300)||(5707535-5707807)
chr4 (28-300)||(5714163-5714435)
chr4 (28-300)||(10621053-10621325)
chr4 (28-300)||(10628132-10628404)
chr4 (28-300)||(28392854-28393126)
chr4 (28-300)||(8845418-8845690)
chr4 (28-300)||(4426336-4426596)
chr4 (28-296)||(5667849-5668115)
chr4 (28-296)||(35223779-35224047)
chr4 (28-260)||(10677303-10677534)
chr4 (28-260)||(10890943-10891174)
chr4 (24-296)||(20311511-20311781)
chr4 (28-279)||(15461552-15461799)
chr4 (28-279)||(34975606-34975853)
chr4 (129-279)||(21453961-21454110)
chr4 (28-279)||(2677068-2677315)
chr4 (28-279)||(15815076-15815323)
chr4 (28-279)||(18111043-18111290)
chr4 (28-267)||(26531680-26531915)
chr4 (28-279)||(3369023-3369270)
chr4 (28-279)||(17299959-17300206)
chr4 (28-279)||(5870473-5870720)
chr4 (28-267)||(20244004-20244239)
chr4 (44-260)||(19365593-19365806)
chr4 (28-260)||(1941798-1942026)
chr4 (28-267)||(4675983-4676218)
chr4 (28-267)||(18163229-18163464)
chr4 (203-300)||(56516271-56516368)
chr4 (28-267)||(9487618-9487853)
chr4 (44-267)||(9538026-9538244)
chr4 (45-256)||(19362488-19362695)
chr4 (44-260)||(5616469-5616681)
chr4 (28-248)||(30040489-30040705)
chr4 (130-260)||(32636558-32636685)
chr4 (28-296)||(32646523-32646789)
chr4 (44-260)||(5528495-5528707)
chr4 (113-260)||(4546154-4546298)
chr4 (161-288)||(34777850-34777975)
chr4 (28-245)||(11421096-11421309)
chr4 (106-155)||(24701362-24701411)
chr4 (45-184)||(23056080-23056218)
chr4 (253-299)||(24700245-24700291)
chr4 (56-137)||(9937745-9937826)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (28-300)||(6110279-6110551)
chr3 (28-300)||(8490710-8490982)
chr3 (28-300)||(16482203-16482475)
chr3 (28-300)||(10579075-10579347)
chr3 (28-300)||(15600604-15600876)
chr3 (28-300)||(15607149-15607421)
chr3 (28-300)||(10572312-10572584)
chr3 (28-300)||(15357306-15357578)
chr3 (28-300)||(18520190-18520462)
chr3 (32-300)||(18522878-18523146)
chr3 (28-300)||(13211517-13211789)
chr3 (28-300)||(13248822-13249094)
chr3 (28-300)||(15341939-15342211)
chr3 (28-300)||(17780838-17781110)
chr3 (28-300)||(32056619-32056892)
chr3 (24-300)||(17199900-17200176)
chr3 (28-300)||(13517026-13517294)
chr3 (28-300)||(1647241-1647513)
chr3 (28-300)||(17136574-17136840)
chr3 (28-297)||(29925189-29925458)
chr3 (28-297)||(29974342-29974611)
chr3 (28-299)||(16200646-16200917)
chr3 (28-279)||(15846536-15846783)
chr3 (28-279)||(21034293-21034540)
chr3 (28-279)||(20147554-20147801)
chr3 (28-279)||(21398847-21399094)
chr3 (28-266)||(12299978-12300212)
chr3 (28-279)||(14890446-14890693)
chr3 (28-267)||(55427088-55427323)
chr3 (28-260)||(25978728-25978956)
chr3 (113-292)||(24253197-24253372)
chr3 (62-267)||(15526820-15527021)
chr3 (126-260)||(14147095-14147226)
chr3 (167-296)||(28953965-28954093)
chr3 (28-186)||(28088251-28088408)
chr3 (28-260)||(11787661-11787889)
chr3 (102-294)||(32280313-32280507)
chr3 (28-260)||(15317176-15317401)
chr3 (66-181)||(30464147-30464261)
chr3 (224-296)||(8251933-8252005)
chr3 (125-189)||(36138033-36138097)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (28-300)||(18252245-18252517)
chr1 (28-300)||(18532234-18532506)
chr1 (28-300)||(27131130-27131401)
chr1 (28-300)||(27310297-27310569)
chr1 (28-300)||(16358755-16359027)
chr1 (28-300)||(3855639-3855911)
chr1 (28-300)||(36816354-36816625)
chr1 (28-297)||(22641594-22641859)
chr1 (28-296)||(27277278-27277545)
chr1 (157-300)||(21171082-21171225)
chr1 (28-220)||(9916497-9916688)
chr1 (28-279)||(19706439-19706686)
chr1 (28-279)||(28134723-28134970)
chr1 (28-279)||(43802365-43802612)
chr1 (28-279)||(9456171-9456418)
chr1 (28-279)||(20391239-20391486)
chr1 (28-279)||(20779645-20779892)
chr1 (28-279)||(22670257-22670504)
chr1 (28-279)||(42816989-42817236)
chr1 (28-296)||(23507119-23507385)
chr1 (106-296)||(12014084-12014272)
chr1 (195-294)||(22657108-22657207)
chr1 (28-279)||(22612547-22612794)
chr1 (48-260)||(634008-634216)
chr1 (28-267)||(8727734-8727969)
chr1 (226-296)||(9917837-9917906)
chr1 (44-260)||(29096796-29097008)
chr1 (128-260)||(21881475-21881604)
chr1 (28-141)||(28145723-28145835)
chr1 (203-260)||(35930656-35930713)
chr1 (207-260)||(51997353-51997406)
chr1 (28-279)||(47667485-47667721)
chr1 (201-256)||(26923553-26923608)
chr1 (230-295)||(12006461-12006526)
chr1 (115-189)||(24301691-24301765)
chr1 (226-279)||(16219748-16219801)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (29-300)||(21940880-21941151)
chr8 (28-297)||(22171705-22171974)
chr8 (28-300)||(6094338-6094610)
chr8 (28-291)||(15326422-15326685)
chr8 (28-291)||(15506791-15507054)
chr8 (28-300)||(24642864-24643135)
chr8 (28-169)||(28548393-28548534)
chr8 (102-296)||(14983717-14983908)
chr8 (143-279)||(24797224-24797359)
chr8 (28-279)||(8371253-8371500)
chr8 (28-279)||(12562178-12562425)
chr8 (28-279)||(21969388-21969635)
chr8 (28-279)||(25611250-25611497)
chr8 (28-279)||(27007517-27007764)
chr8 (28-279)||(27014660-27014907)
chr8 (28-279)||(27880487-27880734)
chr8 (28-279)||(28020668-28020915)
chr8 (28-260)||(22659494-22659722)
chr8 (28-279)||(22130609-22130856)
chr8 (28-279)||(21916731-21916978)
chr8 (28-267)||(45534273-45534508)
chr8 (44-296)||(38232115-38232365)
chr8 (28-260)||(26240558-26240786)
chr8 (45-259)||(8781892-8782102)
chr8 (125-267)||(18835417-18835556)
chr8 (28-260)||(6430960-6431188)
chr8 (204-295)||(2375231-2375322)
chr8 (28-260)||(2962932-2963164)
chr8 (38-135)||(24796731-24796826)
chr8 (208-300)||(32872741-32872833)
chr8 (44-190)||(20535226-20535371)
chr8 (23-141)||(36970439-36970556)
chr8 (24-141)||(2375411-2375528)
chr8 (236-288)||(10920427-10920479)
chr8 (238-294)||(29645575-29645631)
chr8 (204-279)||(27677551-27677626)
chr8 (202-261)||(34659059-34659118)
chr8 (28-89)||(8968015-8968076)
chr8 (228-260)||(36970339-36970371)
chr8 (40-88)||(41368106-41368154)
chr8 (40-88)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (28-300)||(7322-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (28-300)||(6654-6926)
scaffold0390 (28-300)||(13670-13942)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (24-300)||(25706-25982)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (32-300)||(15152658-15152926)
chr7 (28-300)||(29327999-29328271)
chr7 (28-300)||(11535782-11536054)
chr7 (28-300)||(11542700-11542972)
chr7 (28-300)||(12751041-12751313)
chr7 (28-300)||(12738751-12739023)
chr7 (28-300)||(18561222-18561485)
chr7 (28-296)||(13392369-13392637)
chr7 (22-300)||(18257559-18257834)
chr7 (28-279)||(2204607-2204854)
chr7 (28-279)||(8465054-8465301)
chr7 (28-279)||(18400159-18400406)
chr7 (28-279)||(18407143-18407390)
chr7 (28-279)||(19230943-19231190)
chr7 (28-279)||(48808496-48808743)
chr7 (28-268)||(2365169-2365407)
chr7 (28-260)||(41680968-41681196)
chr7 (28-267)||(15729818-15730053)
chr7 (28-267)||(18139338-18139573)
chr7 (40-279)||(30254193-30254428)
chr7 (28-260)||(34128647-34128875)
chr7 (40-260)||(47166871-47167087)
chr7 (28-260)||(10668901-10669130)
chr7 (28-260)||(28130635-28130863)
chr7 (39-176)||(39112138-39112275)
chr7 (50-256)||(24443349-24443551)
chr7 (50-256)||(25845498-25845700)
chr7 (50-256)||(25845917-25846119)
chr7 (113-260)||(19388626-19388774)
chr7 (203-300)||(10235377-10235474)
chr7 (28-260)||(18259124-18259352)
chr7 (125-260)||(14591924-14592056)
chr7 (125-260)||(16011515-16011647)
chr7 (114-253)||(31190524-31190660)
chr7 (66-260)||(19393462-19393652)
chr7 (128-260)||(22969024-22969153)
chr7 (212-295)||(7662569-7662651)
chr7 (102-177)||(22948499-22948574)
chr7 (228-270)||(7396469-7396511)
chr7 (202-279)||(3132910-3132986)
chr7 (235-279)||(19859177-19859221)
chr7 (246-296)||(29983184-29983234)
chr7 (226-296)||(47833875-47833945)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (28-300)||(18503-18774)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (28-300)||(21329968-21330240)
chr2 (28-300)||(18796721-18796993)
chr2 (22-296)||(18620023-18620296)
chr2 (28-299)||(20978091-20978360)
chr2 (28-286)||(36270395-36270650)
chr2 (42-288)||(6991847-6992094)
chr2 (28-279)||(24250032-24250279)
chr2 (28-279)||(30174432-30174679)
chr2 (40-296)||(18822302-18822556)
chr2 (28-300)||(22183206-22183475)
chr2 (40-260)||(15342014-15342230)
chr2 (28-260)||(24229215-24229443)
chr2 (26-260)||(29800545-29800775)
chr2 (203-295)||(19279508-19279600)
chr2 (28-191)||(17241034-17241196)
chr2 (205-296)||(18851956-18852047)
chr2 (113-260)||(19616509-19616653)
chr2 (126-265)||(40301034-40301169)
chr2 (161-267)||(21626817-21626919)
chr2 (226-300)||(36801899-36801974)
chr2 (53-263)||(41316305-41316511)
chr2 (28-95)||(41661694-41661761)
chr2 (106-175)||(36799756-36799826)
chr2 (113-189)||(28740910-28740986)
chr2 (201-261)||(28718943-28719003)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (47-300)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-284)||(230111-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-300)||(5744-6013)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (28-279)||(238-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (28-279)||(3675-3922)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (28-279)||(119785-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (40-260)||(12961-13177)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-260)||(67374-67602)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (66-279)||(130262-130471)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (28-260)||(26616-26844)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (169-279)||(8360-8467)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (56-258)||(8807-9005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-260)||(39988-40216)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (28-218)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (28-260)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (125-260)||(83111-83243)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (212-286)||(90019-90093)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (205-296)||(45956-46051)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (28-141)||(53955-54066)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2313
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11204
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684461
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17684461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381244
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27381244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471627
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27471627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651938
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11651938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691432
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 17691432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309105
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29309105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316065
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29316065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296883
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatat 27296883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 188697 - 188969
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 188969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394437
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtg 16394437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 29 - 250
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  229 atccaatataaatattactcct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 269
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  232 caatataaatattactcctaatatttatatttatgtga 269  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359256
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  145 gggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 243  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||  ||| | |||||||||  |||||| |   |||| |||||||||||     
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  244 tactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgat 295  Q
    |||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgat 13359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860135
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  22860084 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22860135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508594
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27508594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789126
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  16789177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 16789126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528180
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  142 gaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaat 241  Q
     ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  242 attactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27528180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586343
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 1586343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669513
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||  ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  138 ggtcgaagggtggaatacgccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaata 236  Q
    |||| ||  ||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||  |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  237 taaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgat 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgat 2669513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 279
Target Start/End: Original strand, 18019981 - 18020088
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtg 268  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18019981 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 18020077  T
Q  269 aagacttgata 279  Q
     ||||||||||    
T  18020078 tagacttgata 18020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612989
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcc-acatctagggatcat 8613123  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 8612989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359285
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||| ||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  150 gaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 249  Q
    | |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  250 taatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||| |||||    
T  10359268 taatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074554
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  ||||| |||| || || | |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||| |   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttata 14074554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 300
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566312
Alignment:
Q  245 actcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16566312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736557
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||| | | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttata 20736557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8510333 - 8510181
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 201  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| | |||| |||||||||||| || || ||||||| ||  ||||| ||     
T  8510333 actcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataacatt- 8510236  T
Q  202 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattt 257  Q
     |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8510235 -ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattt 8510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172772
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 299  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgt 28172772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925973
Alignment:
Q  206 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatc 27925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347191
Alignment:
Q  200 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatatta-ttctaatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994662
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttata 21994662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Original strand, 5758650 - 5758709
Alignment:
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758650 tactatgtagtattctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 297
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850484
Alignment:
Q  131 ggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | |||||||||||| | || || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  230 tccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 297  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||  |||||||| || || |||||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatct 17850484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120733
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   ||||| |||| || ||| |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcat 17120603  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||| ||| |||||||  | || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17120701 aatccagtataaatactactcctagtatttata 17120733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactat 169  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 258
Target Start/End: Original strand, 22560324 - 22560410
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 258  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| ||||||| |  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22560324 tgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatattta 22560410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19218676 - 19218503
Alignment:
Q  78 acaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatat 177  Q
    ||||||||||||||   | |||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||| || | |||   || ||||| | |||||||||    
T  19218676 acaacgtttgaatgacaataaaacacttgagtccaa-atttagggatcatagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatat 19218578  T
Q  178 cttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || |     |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19218577 cttatgaaa-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggt-----caatataaattttactcctaatatttata 19218503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||  ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  145 gggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatga 184  Q
    || ||  |||   || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695458
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24695458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714490
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19714490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 288
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569841
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttat 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttat 18569841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707210
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtg 19707210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 294
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298885
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatga 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatga 17298885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39538946 - 39538803
Alignment:
Q  157 ccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538946 ccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatt 39538847  T
Q  257 tatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538846 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 39538803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347417
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 190  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285740
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||  |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  ||||||||||||||||| | || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtg 17285740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  128 agtggttt 135  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 295
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807021
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagttacaa-aacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgat 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 18807021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941082
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20941082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941317
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 22941317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805632
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||  ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 25805632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  32005 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 31954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789910
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 12789761  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |  | ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgata 12789910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545977
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  23546028 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 23545977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 300
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22547008
Alignment:
Q  204 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtg 22547008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933541
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 24933541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096890
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcat 31097020  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttata 31096890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100467
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| |||| || ||| |||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcc-acatcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  140 tcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  240 atattactcctaatatt 256  Q
     ||||||||||||||||    
T  20100451 gtattactcctaatatt 20100467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865662
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcc-acatctagggatcat 7865528  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 7865662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097718
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||||||||||||||| || || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaatttc-ataacat--actatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5097757 aatccaatataaatattactcataatatttatacttatgt 5097718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 253
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765222
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12765088  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |   |||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttata 12765222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9811965
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 9811831  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttata 9811965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704106
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catcaagagatcat 12703972  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||| ||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttata 12704106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 277
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829530
Alignment:
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||   ||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaacttac-ataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  221 gcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttga 277  Q
    | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129928
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | ||| |||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| ||||| ||| || |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  224 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245176
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| ||||  | ||||  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||| | | || || | |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||| |||||||| |  | |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  26245208 aatcaagtataaatattactcctaatatttata 26245176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgact 109  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477269
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgata 33477269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 300
Target Start/End: Original strand, 27347433 - 27347470
Alignment:
Q  263 tatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27347433 tatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtg 27347470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262427
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18262427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269288
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612898
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 55612898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858382
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8858382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963855
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26963855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970678
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26970678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868812
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 868812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926752
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19926752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707535
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5707535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714163
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5714163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621325
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10621325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628404
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10628404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393126
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 28393126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845418
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtg 8845418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426596
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga------------acttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 4426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668115
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatc 5668115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223779
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatc 35223779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311511
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggc 222  Q
    | |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||| |  ||  |||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgata-gttacataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  223 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 20311511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461552
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15461552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975606
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 34975755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 34975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 279
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || |||||||||||||||||| || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  229 atccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677068
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  2677119 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 2677068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15815127 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15815076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111290
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18111239 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18111290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531680
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 26531817  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26531719 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 26531680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369270
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 3369270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300206
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  17300155 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 17300206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870473
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 5870473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20244004
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 20244004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365593
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  144 agggtggaatacgccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 242  Q
    || |||| |||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  243 ttactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttata 19365593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941798
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 1941928  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||| |||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttata 1941798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676218
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 4676218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163229
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18163366  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 18163229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516271
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtg 56516271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487618
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgt 9487618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538026
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  144 agggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 243  Q
    ||  ||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacactttc-ataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  244 tactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  9538049 tactcctaacatttatacttatgt 9538026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362488
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| || |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  145 gggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 244  Q
    | |||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  245 actcctaatatt 256  Q
    ||||||||||||    
T  19362499 actcctaatatt 19362488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616469
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  144 agggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 243  Q
    ||  ||| |||| ||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5616485 tacttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| |||||||| || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  228 aatccaatataaatattactc 248  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636558
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    |||||||| |||| || |||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  230 tccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttata 32636558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646789
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||  || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| | |||| || | ||||  | |  ||||| |||  ||||||| ||||| ||||  | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||| ||||||    
T  32646720 caatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatc 32646789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528707
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | ||| |||| || ||| ||||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  144 agggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 243  Q
    || |||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| ||||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
     ||||||||||||||||    
T  5528691 cactcctaatatttata 5528707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546154
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttata 4546154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 288
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  161 tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |   | | |||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  261 tttatgtgaagacttgataactctttat 288  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421096
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | ||| |||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| | | |||  ||||   | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| | || || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  228 aatccaatataaatatta 245  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701362
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 155  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaatac 24701362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 23056080 - 23056218
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||   | |||||||| || | | ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  23056080 ccattaaccaactttatagttatcctgttacagataacatttgaatgtcaataaaacacttgagttc-acatctagggatcatagtggtttgaggtctaa 23056178  T
Q  145 gggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatga 184  Q
    | |||| ||||   | || | |||||||||||||||||||    
T  23056179 gagtggtatacaatattacctctatgagaatatcttatga 23056218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700245
Alignment:
Q  253 tatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgt 24700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||  | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110279
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6110279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490710
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8490710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482475
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16482475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579347
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10579347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600876
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607421
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15607421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572584
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10572584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357578
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15357578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520190
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18520190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 32 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522878
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  232 caatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18522878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211517
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13211517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248822
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13248822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342211
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15342211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781110
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtg 17781110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaata-tttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 32056892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200176
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  224 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtg 17200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13517026
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtggg----gccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13517026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647513
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 1647513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136574
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17136574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925189
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974342
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29974342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200646
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 299  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgt 16200646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846783
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15846783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034293
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 21034293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147801
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20147750 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20147801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398847
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgata 21398847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299978
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg 12299978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890446
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 14890446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427088
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 55427088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978956
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 25978826  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattata 25978956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 292
Target Start/End: Original strand, 24253197 - 24253372
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||    
T  24253197 acatctaaggtacatagtggttttaggtcgaatg-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcatta 24253292  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccat 292  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253293 ttctcatggagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccat 24253372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526820
Alignment:
Q  62 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  162 atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 261  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||| ||| |   |||||| ||||| ||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttatac 15526826  T
Q  262 ttatgt 267  Q
    ||||||    
T  15526825 ttatgt 15526820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147095
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||| ||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||| ||| |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  226 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttata 14147095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  167 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatttat 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  266 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088251
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| | || || ||| ||||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcc-acatctagggatcat 28088310  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787661
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||| | | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatgaaaatatc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttata 11787661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataac 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  198 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatga 294  Q
      | |||||||| ||||||||| | || |||| | | | ||||||||| || ||||  |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317401
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |  ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataacgt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttata 15317401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatca 165  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  166 ctatgagaatatctta 181  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 296
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252005
Alignment:
Q  224 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatc 8252005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 189
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252245
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18252245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532506
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18532506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131401
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27131401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310569
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtg 27310569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359027
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtg 16359027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855911
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtg 3855911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 36816625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641859
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 297  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatct 22641859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277545
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| | |||||| |||| || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcac-tttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatc 27277545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 157 - 300
Target Start/End: Original strand, 21171082 - 21171225
Alignment:
Q  157 ccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171082 ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 21171181  T
Q  257 tatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171182 tatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21171225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916688
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  128 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706686
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19706686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28134970
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 28134970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802612
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 43802612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456171
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  9456222 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 9456171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391486
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20391337  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||   | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgata 20391486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20779841 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20779892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670504
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  22670453 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22670504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817236
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  42817185 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 42817236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507119
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||  |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | || ||||| ||||| |||| || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatc 23507119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 296
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014272
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 204  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatc 12014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 294
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657207
Alignment:
Q  195 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatga 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612547
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgata 22612547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 634008
Alignment:
Q  48 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 147  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  148 tggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattact 247  Q
     |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  248 cctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||    
T  634020 cctaatatttata 634008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727734
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  |||| |   |||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttatacttatgt 8727734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 296
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917906
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 9917906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096796
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | |||||||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  144 agggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatat 243  Q
    || |||  | || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataacatg--ctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T
Q  244 tactcctaatatttata 260  Q
    || ||||||||| ||||    
T  29096812 tattcctaatatgtata 29096796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930656
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttata 35930656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667721
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 47667583  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||           ||| || || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--act-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  47667670 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgata 47667721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 256
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923608
Alignment:
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 256  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatatt 26923608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006526
Alignment:
Q  230 tccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgat 295  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgat 12006526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301765
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatactt 24301765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Original strand, 16219748 - 16219801
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16219748 tcaattcaataaaattattacttctaatatttatacttatgtgacgacttgata 16219801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940880
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  229 atccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21940880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 22171705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094338
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6094338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatcca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatcca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642864
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24642864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 102 - 296
Target Start/End: Original strand, 14983717 - 14983908
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttt 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  14983717 actcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt 14983815  T
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
      |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14983816 --ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatgatc 14983908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797359
Alignment:
Q  143 aagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 242  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  243 ttactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||| |||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgata 24797359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371500
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 8371351  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgata 8371500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562178
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 12562178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969388
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 21969388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611250
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  25611301 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 25611250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007764
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27007713 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27007764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014907
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27014856 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27014907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880734
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27880683 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27880734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020915
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  28020864 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 28020915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659722
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22659592  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttata 22659722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130856
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  22130805 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22130856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916731
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||  | || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  21916782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgata 21916731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534508
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 45534508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232365
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||  |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  144 agggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaata 242  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  243 ttactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||| | |||||| | ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatc 38232365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240558
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  ||||   |  |||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttata 26240558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Original strand, 8781892 - 8782102
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    |||| ||| ||| |||| || ||| ||||||  ||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  8781892 ccattaacgaacgttatggttatcatgttacaaacaacgtttgaatgacaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaa 8781990  T
Q  145 gggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatt 244  Q
    | |||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  8781991 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagtattctcacggtggatcaatcaagtataaatatt 8782087  T
Q  245 actcctaatatttat 259  Q
    | |||||||||||||    
T  8782088 agtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835417
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgt 18835417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430960
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 6431090  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttata 6430960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2375322 - 2375231
Alignment:
Q  204 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgat 295  Q
    ||||||| ||| | |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  2375322 tatgtagaattataatggagggtcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgat 2375231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963164
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| | |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-cgtctagggatcat 2963030  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | ||||  | |||||||||||||||||  ||  |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2963129 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 2963164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872833
Alignment:
Q  208 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtg 32872833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535371
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  144 agggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 190  Q
    || |||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  23 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaggg 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  123 tacatagtggtttcaggtc 141  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  124 acatagtggtttcaggtc 141  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  236 ataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttat 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645575
Alignment:
Q  238 aaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatga 294  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatga 29645575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 279
Target Start/End: Original strand, 27677551 - 27677626
Alignment:
Q  204 tatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  27677551 tatgtagtattctcgtagtgtgtcaatcaaatataaatatcactcctaataattatacttatgtatagacttgata 27677626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34659118 - 34659059
Alignment:
Q  202 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 261  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34659118 actatttagtatttgcatggtggataaatccaatataaatattagtcctaatatatatat 34659059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970339
Alignment:
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttata 36970339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7322
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 7322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6926
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13942
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25982
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  224 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtg 25982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 32 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152658
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  232 caatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15152658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327999
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 29327999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536054
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtg 11536054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11542972
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 11542972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12751041
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtg 12751041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738751
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 12738751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561222
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18561222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392369
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatc 13392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 300
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257834
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| |||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||| |||||| | ||    
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  222 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18257834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204607
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  2204658 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 2204607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8465054
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 8465054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400159
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18400210 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18400159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407143
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18407194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18407143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230943
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| || || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19230943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808743
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  48808692 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 48808743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||||| || |||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||||| ||| |||||| || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtg 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681196
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttata 41681196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729818
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt 15729818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139573
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgt 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgt 18139573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254193
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  140 tcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| ||   ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  240 atattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 30254193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||| | | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||||||||||||||||    |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 260
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167087
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  140 tcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| || || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  240 atattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  47167067 atattactcataatatttata 47167087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669130
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| || | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactat-gagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| |   ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttata 10669130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130635
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||| | | ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||| ||||||||  | || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttata 28130635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  39 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||| ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  139 gtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaata 176  Q
    || |||   |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443551
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  150 gaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 249  Q
      |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||| || || | |||| | |||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  24443545 taatatt 24443551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845700
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  150 gaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 249  Q
    | ||||  || ||| | | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  25845694 taatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846119
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | ||| |||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  150 gaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcc 249  Q
    | ||||  || ||| | | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  250 taatatt 256  Q
    |||||||    
T  25846113 taatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388626
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtag 210  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  211 tattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttata 19388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10235474 - 10235377
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||  |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10235474 ctatgtataattctcatggtgagtcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtg 10235377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259352
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||||| |||||||||| || || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     ||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  18259320 tatccagtataaatattactttcaatatttata 18259352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| ||||||||||||| || ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | |||||||||||||| ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  114 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |  || |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataacat--acaatgtagtat 31190620  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaat 253  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 260
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393652
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatca 165  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||| | | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  166 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttata 19393652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662651
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgat 295  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgat 7662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatat 177  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7396511 - 7396469
Alignment:
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaa 270  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7396511 aatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132910
Alignment:
Q  202 actatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgata 3132910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859177
Alignment:
Q  235 tataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19859177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983184
Alignment:
Q  246 ctcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatc 29983184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 296
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833945
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||| |||||||||||||    |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatc 47833945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18503
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330240
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21330240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796721
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18796721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18620023
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacac-tttcataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  222 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatc 18620023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||| || ||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||  | || ||  ||||||||||||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270395
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||  | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||  ||||  ||| |||||||  ||||||||||||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggt-gaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataa--ttttctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactcttt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||    
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactcttt 36270395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 288
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992094
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaac-actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  141 cgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||  ||||  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcac-ttacataa--ttttctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  240 atattactcctaatatttatatttatgtgaag--acttgataactctttat 288  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttat 6992094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250279
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  24250228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 24250279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174432
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30174483 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 30174432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822302
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  140 tcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatata 238  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  239 aatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatc 18822302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183475
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||  |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
      |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  227 caatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22183403 caatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtg 22183475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 260
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342230
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | ||| || | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  140 tcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||| || || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  240 atattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttata 15342230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229443
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||| |||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttata 24229443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800545
Alignment:
Q  26 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtac 125  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||| ||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  226 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800579 tcaatccagtataaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279508
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgat 295  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgat 19279508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||  ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 191  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaa-ggtgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852047
Alignment:
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatc 18852047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616509
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||| | | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |  |||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataaaat--actatgtagta 19616557  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| || || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301169
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||||||| ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacac--ttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  226 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttat 265  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtatacttat 40301169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21626919 - 21626817
Alignment:
Q  161 tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  |   |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626919 tatcactatgagaatatcttatgacactttc-ataacat--agcgtgtagtattctcatggtgg-tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T
Q  261 tttatgt 267  Q
     ||||||    
T  21626823 cttatgt 21626817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 300
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36801974
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata-tttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtg 36801974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 263
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316511
Alignment:
Q  53 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaa 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||| | ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| |    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  153 tacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaa 252  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| || ||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| |||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  253 tatttatattt 263  Q
    |||||| ||||    
T  41316501 tatttacattt 41316511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 95  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 175
Target Start/End: Original strand, 36799756 - 36799826
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccac-tatcactatgagaat 175  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  36799756 gactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactt 189  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 261
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719003
Alignment:
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatat 261  Q
    |||| ||||||||||||| |  |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatat 28719003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1208
Alignment:
Q  47 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 146  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  147 gtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattac 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  247 tcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtg 1208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 284
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactct 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5744
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| |         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgc---------actatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  222 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtg 5744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 238
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3922
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  3871 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 3922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119785
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  119836 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 119785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 260
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13177
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| || | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  140 tcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||  |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| || || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  240 atattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13157 atattactcctaatatttata 13177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67602
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 67472  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | ||||||||||| |||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttata 67602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 279
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130471
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatca 165  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  ||||   | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  166 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttat 265  Q
     | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  266 gtgaagacttgata 279  Q
    ||  ||||||||||    
T  130458 gtatagacttgata 130471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26616
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||| ||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||| | | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttata 26616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8467 - 8360
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtg 268  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8467 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 8371  T
Q  269 aagacttgata 279  Q
     ||||||||||    
T  8370 tagacttgata 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8807
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 155  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | |||||||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  156 gccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 255  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| ||||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40216
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | ||| |||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||  | || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  228 aatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40184 aatccggtataaatattactcctaatatttata 40216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcag 190  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctca 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||| | | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 260
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11758
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||| |   ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   |||||   ||||||||||||||||||  | ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 260
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacgccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacaccttcg-taacat--actatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  225 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 260  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90093
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactcttt 286  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttt 90093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45956
Alignment:
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactccta----atatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 296  Q
    |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||||| ||| |||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  46051 atgtagcattctaatggtgggtcaattcaatataaatattactcataatatatatttatatctatatgaatatttgacaactttttatccatgatc 45956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53955
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | ||| |||| || ||| ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcat 53969  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  53968 agtggtttcaggtc 53955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University