View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20642_high_10 (Length: 311)

Name: NF20642_high_10
Description: NF20642
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20642_high_10
NF20642_high_10
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (28-301)||(2041-2313)
scaffold0234 (28-301)||(10932-11204)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (28-301)||(17684189-17684461)
chr6 (28-301)||(27380972-27381244)
chr6 (28-301)||(27471355-27471627)
chr6 (28-301)||(11651938-11652210)
chr6 (28-301)||(17691160-17691432)
chr6 (28-301)||(29309105-29309377)
chr6 (28-301)||(29316065-29316336)
chr6 (28-268)||(27296877-27297116)
chr6 (28-301)||(188697-188969)
chr6 (28-301)||(16394165-16394437)
chr6 (32-270)||(25536915-25537152)
chr6 (29-251)||(16559193-16559414)
chr6 (45-296)||(13359010-13359256)
chr6 (28-280)||(27508347-27508594)
chr6 (28-280)||(16789126-16789373)
chr6 (28-280)||(22859888-22860135)
chr6 (42-280)||(27527947-27528180)
chr6 (28-268)||(1586108-1586343)
chr6 (38-296)||(2669513-2669768)
chr6 (28-268)||(14074547-14074782)
chr6 (72-280)||(18019885-18020088)
chr6 (50-268)||(10359073-10359285)
chr6 (28-268)||(8612982-8613221)
chr6 (246-301)||(16566257-16566312)
chr6 (113-266)||(20736413-20736562)
chr6 (28-268)||(17120505-17120740)
chr6 (28-141)||(33317055-33317167)
chr6 (97-283)||(8510155-8510338)
chr6 (125-268)||(21994655-21994794)
chr6 (106-300)||(28172772-28172963)
chr6 (162-297)||(27925973-27926103)
chr6 (45-184)||(28756145-28756283)
chr6 (113-261)||(5758565-5758709)
chr6 (131-298)||(17850321-17850484)
chr6 (156-268)||(22560311-22560419)
chr6 (241-280)||(13995151-13995190)
chr6 (125-218)||(19218540-19218630)
chr6 (200-301)||(19347092-19347191)
chr6 (125-259)||(4073652-4073781)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (28-301)||(24695186-24695458)
chr5 (28-301)||(19714218-19714490)
chr5 (28-289)||(18569581-18569841)
chr5 (28-301)||(19706939-19707210)
chr5 (28-295)||(17298621-17298885)
chr5 (28-301)||(17285470-17285740)
chr5 (150-301)||(39538803-39538953)
chr5 (24-202)||(27347252-27347428)
chr5 (28-135)||(24701950-24702057)
chr5 (115-296)||(18806843-18807021)
chr5 (28-280)||(20941082-20941329)
chr5 (28-268)||(22941317-22941552)
chr5 (28-280)||(25805385-25805632)
chr5 (28-280)||(31954-32201)
chr5 (28-280)||(12789663-12789910)
chr5 (28-280)||(23545977-23546224)
chr5 (28-268)||(24933306-24933541)
chr5 (28-268)||(31096883-31097118)
chr5 (161-301)||(22546872-22547008)
chr5 (40-266)||(20100255-20100476)
chr5 (28-261)||(12764990-12765222)
chr5 (115-240)||(18806483-18806606)
chr5 (115-240)||(18806663-18806786)
chr5 (28-261)||(5097725-5097953)
chr5 (28-268)||(7865430-7865669)
chr5 (28-261)||(9811733-9811965)
chr5 (28-261)||(12703874-12704106)
chr5 (24-113)||(28719471-28719558)
chr5 (28-278)||(18829281-18829530)
chr5 (24-268)||(26129689-26129928)
chr5 (28-268)||(26245169-26245404)
chr5 (28-109)||(39538954-39539035)
chr5 (256-301)||(27347425-27347470)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (28-301)||(18262427-18262699)
chr4 (28-301)||(18269288-18269560)
chr4 (28-301)||(19926480-19926752)
chr4 (28-301)||(55612898-55613170)
chr4 (28-301)||(8858382-8858654)
chr4 (28-301)||(26963855-26964127)
chr4 (28-301)||(26970678-26970950)
chr4 (28-301)||(868812-869084)
chr4 (28-301)||(5707535-5707807)
chr4 (28-301)||(5714163-5714435)
chr4 (28-301)||(10621053-10621325)
chr4 (28-301)||(10628132-10628404)
chr4 (28-301)||(28392854-28393126)
chr4 (28-301)||(8845418-8845690)
chr4 (28-301)||(4426336-4426596)
chr4 (28-297)||(5667849-5668115)
chr4 (28-297)||(35223779-35224047)
chr4 (28-261)||(10677303-10677534)
chr4 (28-261)||(10890943-10891174)
chr4 (24-297)||(20311511-20311781)
chr4 (28-280)||(15461552-15461799)
chr4 (28-280)||(34975606-34975853)
chr4 (28-280)||(2677068-2677315)
chr4 (28-280)||(15815076-15815323)
chr4 (28-280)||(18111043-18111290)
chr4 (129-280)||(21453961-21454110)
chr4 (28-280)||(3369023-3369270)
chr4 (28-280)||(17299959-17300206)
chr4 (28-268)||(20244004-20244239)
chr4 (28-268)||(26531680-26531915)
chr4 (28-268)||(1941791-1942026)
chr4 (28-268)||(4675983-4676218)
chr4 (28-268)||(18163229-18163464)
chr4 (44-268)||(19365586-19365806)
chr4 (28-280)||(5870473-5870720)
chr4 (28-297)||(32646523-32646789)
chr4 (28-261)||(9487625-9487853)
chr4 (28-249)||(30040489-30040705)
chr4 (203-301)||(56516271-56516368)
chr4 (44-268)||(5528495-5528714)
chr4 (45-268)||(19362477-19362695)
chr4 (44-261)||(5616469-5616681)
chr4 (130-267)||(32636552-32636685)
chr4 (28-240)||(11421101-11421309)
chr4 (113-268)||(4546147-4546298)
chr4 (44-261)||(9538033-9538244)
chr4 (106-156)||(24701361-24701411)
chr4 (161-289)||(34777850-34777975)
chr4 (125-280)||(33888594-33888743)
chr4 (254-300)||(24700245-24700291)
chr4 (56-137)||(9937745-9937826)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (28-301)||(6110279-6110551)
chr3 (28-301)||(8490710-8490982)
chr3 (28-301)||(16482203-16482475)
chr3 (28-301)||(10572312-10572584)
chr3 (28-301)||(10579075-10579347)
chr3 (28-301)||(15600604-15600876)
chr3 (28-301)||(15607149-15607421)
chr3 (28-301)||(15357306-15357578)
chr3 (28-301)||(18520190-18520462)
chr3 (32-301)||(18522878-18523146)
chr3 (28-301)||(13211517-13211789)
chr3 (28-301)||(13248822-13249094)
chr3 (28-301)||(15341939-15342211)
chr3 (28-301)||(17780838-17781110)
chr3 (28-301)||(32056619-32056892)
chr3 (24-301)||(17199900-17200176)
chr3 (28-301)||(13517026-13517294)
chr3 (28-301)||(1647241-1647513)
chr3 (28-301)||(17136574-17136840)
chr3 (28-298)||(29925189-29925458)
chr3 (28-298)||(29974342-29974611)
chr3 (28-300)||(16200646-16200917)
chr3 (28-280)||(21034293-21034540)
chr3 (28-280)||(15846536-15846783)
chr3 (28-280)||(20147554-20147801)
chr3 (28-280)||(21398847-21399094)
chr3 (28-280)||(14890446-14890693)
chr3 (28-268)||(55427088-55427323)
chr3 (28-267)||(12299978-12300212)
chr3 (28-268)||(25978728-25978963)
chr3 (46-293)||(24253130-24253372)
chr3 (28-213)||(28088227-28088408)
chr3 (62-261)||(15526827-15527021)
chr3 (28-268)||(11787654-11787889)
chr3 (28-268)||(15317176-15317408)
chr3 (126-261)||(14147095-14147226)
chr3 (167-297)||(28953965-28954093)
chr3 (102-295)||(32280313-32280507)
chr3 (66-181)||(30464147-30464261)
chr3 (125-183)||(36138033-36138091)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (28-301)||(18252245-18252517)
chr1 (28-301)||(18532234-18532506)
chr1 (28-301)||(27131130-27131401)
chr1 (28-301)||(27310297-27310569)
chr1 (28-301)||(16358755-16359027)
chr1 (28-301)||(3855639-3855911)
chr1 (28-301)||(36816354-36816625)
chr1 (28-298)||(22641594-22641859)
chr1 (28-297)||(27277278-27277545)
chr1 (156-301)||(21171081-21171225)
chr1 (28-220)||(9916497-9916688)
chr1 (28-280)||(19706439-19706686)
chr1 (28-280)||(28134723-28134970)
chr1 (28-280)||(43802365-43802612)
chr1 (28-280)||(9456171-9456418)
chr1 (28-280)||(20391239-20391486)
chr1 (28-280)||(20779645-20779892)
chr1 (28-280)||(22670257-22670504)
chr1 (28-280)||(42816989-42817236)
chr1 (28-297)||(23507119-23507385)
chr1 (28-280)||(22612547-22612794)
chr1 (48-268)||(634001-634216)
chr1 (106-297)||(12014084-12014272)
chr1 (195-295)||(22657108-22657207)
chr1 (28-261)||(8727741-8727969)
chr1 (226-297)||(9917837-9917906)
chr1 (44-268)||(29096789-29097008)
chr1 (28-280)||(47667485-47667721)
chr1 (28-141)||(28145723-28145835)
chr1 (128-261)||(21881475-21881604)
chr1 (115-281)||(24301691-24301855)
chr1 (95-296)||(12006332-12006526)
chr1 (203-268)||(35930649-35930713)
chr1 (207-261)||(51997353-51997406)
chr1 (130-186)||(10852402-10852458)
chr1 (201-257)||(26923553-26923608)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (29-301)||(21940880-21941151)
chr8 (28-298)||(22171705-22171974)
chr8 (28-301)||(6094338-6094610)
chr8 (28-292)||(15326422-15326685)
chr8 (28-292)||(15506791-15507054)
chr8 (28-301)||(24642864-24643135)
chr8 (28-169)||(28548393-28548534)
chr8 (95-297)||(14983710-14983908)
chr8 (28-280)||(8371253-8371500)
chr8 (28-280)||(12562178-12562425)
chr8 (28-280)||(21969388-21969635)
chr8 (143-280)||(24797224-24797359)
chr8 (28-280)||(25611250-25611497)
chr8 (28-280)||(27007517-27007764)
chr8 (28-280)||(27014660-27014907)
chr8 (28-280)||(27880487-27880734)
chr8 (28-280)||(28020668-28020915)
chr8 (28-280)||(22130609-22130856)
chr8 (28-268)||(22659494-22659729)
chr8 (28-280)||(21916731-21916978)
chr8 (28-268)||(45534273-45534508)
chr8 (44-297)||(38232115-38232365)
chr8 (28-268)||(26240551-26240786)
chr8 (28-268)||(6430953-6431188)
chr8 (113-260)||(8781959-8782102)
chr8 (125-261)||(18835424-18835556)
chr8 (38-135)||(24796731-24796826)
chr8 (137-296)||(2375231-2375386)
chr8 (28-268)||(2962932-2963171)
chr8 (44-231)||(20535226-20535409)
chr8 (23-141)||(36970439-36970556)
chr8 (24-141)||(2375411-2375528)
chr8 (208-301)||(32872741-32872833)
chr8 (55-177)||(29645675-29645797)
chr8 (239-295)||(29645575-29645631)
chr8 (239-289)||(10920427-10920477)
chr8 (28-89)||(8968015-8968076)
chr8 (40-88)||(41368106-41368154)
chr8 (40-88)||(41375077-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (28-301)||(7322-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (28-301)||(6654-6926)
scaffold0390 (28-301)||(13670-13942)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (24-301)||(25706-25982)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (32-301)||(15152658-15152926)
chr7 (28-301)||(29327999-29328271)
chr7 (28-301)||(11535782-11536054)
chr7 (28-301)||(12751041-12751313)
chr7 (28-301)||(11542700-11542972)
chr7 (28-301)||(12738751-12739023)
chr7 (28-301)||(18561222-18561485)
chr7 (28-297)||(13392369-13392637)
chr7 (22-301)||(18257559-18257834)
chr7 (28-280)||(2204607-2204854)
chr7 (28-280)||(8465054-8465301)
chr7 (28-280)||(18400159-18400406)
chr7 (28-280)||(18407143-18407390)
chr7 (28-280)||(48808496-48808743)
chr7 (28-269)||(2365169-2365407)
chr7 (28-268)||(15729818-15730053)
chr7 (28-268)||(18139338-18139573)
chr7 (28-280)||(19230943-19231190)
chr7 (40-280)||(30254193-30254428)
chr7 (28-268)||(41680968-41681203)
chr7 (40-268)||(47166871-47167094)
chr7 (28-268)||(10668901-10669137)
chr7 (28-261)||(34128647-34128875)
chr7 (28-268)||(28130628-28130863)
chr7 (50-268)||(24443349-24443562)
chr7 (28-268)||(18259124-18259359)
chr7 (50-257)||(25845498-25845700)
chr7 (50-257)||(25845917-25846119)
chr7 (66-268)||(19393462-19393659)
chr7 (39-176)||(39112138-39112275)
chr7 (28-261)||(14591924-14592153)
chr7 (28-261)||(16011515-16011744)
chr7 (114-254)||(31190524-31190660)
chr7 (113-261)||(19388626-19388774)
chr7 (128-261)||(22969024-22969153)
chr7 (30-301)||(10235377-10235644)
chr7 (28-216)||(15169290-15169474)
chr7 (212-296)||(7662569-7662651)
chr7 (102-177)||(22948499-22948574)
chr7 (239-280)||(19859177-19859218)
chr7 (247-297)||(29983184-29983234)
chr7 (118-188)||(29984302-29984372)
chr7 (251-297)||(47833899-47833945)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (28-301)||(18503-18774)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (28-301)||(21329968-21330240)
chr2 (28-301)||(18796721-18796993)
chr2 (22-297)||(18620023-18620296)
chr2 (28-300)||(20978091-20978360)
chr2 (28-287)||(36270395-36270650)
chr2 (28-301)||(22183206-22183475)
chr2 (28-280)||(30174432-30174679)
chr2 (42-289)||(6991847-6992094)
chr2 (40-297)||(18822302-18822556)
chr2 (28-280)||(24250032-24250279)
chr2 (28-268)||(24229215-24229450)
chr2 (40-268)||(15342014-15342237)
chr2 (26-261)||(29800545-29800775)
chr2 (28-191)||(17241034-17241196)
chr2 (203-296)||(19279508-19279600)
chr2 (113-261)||(19616509-19616653)
chr2 (205-297)||(18851956-18852047)
chr2 (95-175)||(36799745-36799826)
chr2 (28-95)||(41661694-41661761)
chr2 (126-261)||(40301034-40301164)
chr2 (125-261)||(21626824-21626955)
chr2 (113-186)||(28740910-28740983)
chr2 (226-301)||(36801899-36801974)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (47-301)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-285)||(230111-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (24-301)||(5744-6013)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (28-280)||(238-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (28-280)||(3675-3922)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (28-280)||(119785-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (40-268)||(12961-13184)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-268)||(67374-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (66-280)||(130262-130471)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (28-268)||(26609-26844)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (125-280)||(8360-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-268)||(39988-40223)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (28-218)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (56-259)||(8807-9005)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (28-261)||(11526-11758)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (125-261)||(83111-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (28-268)||(53832-54066)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (169-268)||(9178-9277)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (212-287)||(90019-90093)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2313
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2241 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11204
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11132 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684461
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684389 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17684461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381244
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381172 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27381244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471627
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471555 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27471627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651938
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652010 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 11651938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691432
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17691360 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 17691432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309105
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29309177 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29309105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29316065
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29316137 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 29316065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296877
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296916 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 188697 - 188969
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  188897 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 188969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394437
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16394365 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtg 16394437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 270
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  232 caatataaaatattactcctaatatttatatctatgtga 270  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537115 caatat-aaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 251
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  229 atccaatataaaatattactcct 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  16559393 atccaatat-aaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 296
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359256
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  145 gggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaata 243  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||  |||||| |   |||| |||||| |||||    
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataa--ttttcaatgtagtat--tcatggtgagacaattcaatat-aaata 13359203  T
Q  244 ttactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 296  Q
     |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13359204 ctacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgat 13359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508594
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacatttt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27508543 aatccaatacaaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27508594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789126
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16789177 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 16789126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860135
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22860084 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22860135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 280
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528180
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  142 gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaa 241  Q
     ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||     
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacatttt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaa- 27528141  T
Q  242 tattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27528142 tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27528180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586343
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1586304 aatccaatataaa-tattacttctaatatttatatctatgt 1586343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669513
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  138 ggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaata 236  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | ||   | ||| ||  |||||||||||| |||||  |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  237 taaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 296  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  2669571 taaa-tattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgat 2669513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074547
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14074586 aatccattat-aaatattactcccaatatttatacctatgt 14074547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020088
Alignment:
Q  72 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatga 171  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  172 gaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 271  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18019984 gaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtata 18020079  T
Q  272 gacttgata 280  Q
    |||||||||    
T  18020080 gacttgata 18020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 268
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359285
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactc 249  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||   |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||| |||||||||      
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca--cttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtat-aaatattacct 10359266  T
Q  250 ctaatatttatatctatgt 268  Q
     ||||||||||||||||||    
T  10359267 ataatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612982
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8613024 gtctatccagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 8612982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566312
Alignment:
Q  246 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16566312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736562
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgacatttt-catagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctat 266  Q
    |||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaa-tattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120740
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| |||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatatagggatcat 17120603  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||||||  | || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120701 aatccagtat-aaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510155
Alignment:
Q  97 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataa 196  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||  || |||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgaca-cttacataa 8510240  T
Q  197 cttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataact 283  Q
    | ||  |||||||||||| |||| |  | |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatat-aaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataact 8510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     ||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtat-aaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172772
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttact 204  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  | | |||  |||  |||||  ||   |    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactataaagatgacgtgtgag-tttcacataaagtta--t 28172867  T
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 300  Q
    |||||  |||||||||| || |||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28172866 atgtaacattctcatggagggtcaatccaatataaac-actacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgt 28172772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27926103 - 27925973
Alignment:
Q  162 atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||  ||||| |||  || ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||    
T  27926103 atcactatgataataacctatgacattta-cataatttt--ctgtgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaa-tattattcctaat-ttaata 27926009  T
Q  262 tctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  27926008 tctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatc 27925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  145 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatga 184  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 261
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | | |||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatct-cataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    ||||||  | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaa-tattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 298
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850484
Alignment:
Q  131 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaat 230  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |  || |||||      | |||||||||||| | || || |||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgata-cttacataa--aacccaatgtagtattcttaaggagggtcaat 17850417  T
Q  231 ccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 298  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || |||||||    
T  17850418 ccaatat-atatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatct 17850484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 268
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560419
Alignment:
Q  156 accactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaata 255  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |  | ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtat-aaatattactcctaata 22560406  T
Q  256 tttatatctatgt 268  Q
    |||| | ||||||    
T  22560407 tttaaacctatgt 22560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 280
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995190
Alignment:
Q  241 atattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 13995190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218540
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctca 218  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| | || ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatatcttatga-aattttcataac--atactatgtagtattctca 19218540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347191
Alignment:
Q  200 ttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctg 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||  |||||||| | ||||| ||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccatta-caaatatta-ttctaatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatg 19347189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4073781 - 4073652
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||   || ||||||||||||||| ||  |    
T  4073781 catagtggttttaggtctaagattggtatacatcgttatcattatgagaatatcttatg--aattttcataac--atattatgtagtattctcacggtag 4073686  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatattta 259  Q
     |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  4073685 gtcaatcaaatat-aaatattacctctaatattta 4073652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695458
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695386 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24695458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714490
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714418 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19714490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 289
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569841
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 289  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18569781 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttat 18569841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707210
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707039 agt-tattcaggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19707138 aatccaatat-aaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtg 19707210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298885
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatat-aaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatga 17298885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285740
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | | |||||||||  ||||||||||||||||| | || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17285667 caatccaatat-aaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtg 17285740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538803
Alignment:
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactc 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatat-aaatattactc 39538855  T
Q  250 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538854 ctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 39538803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347428
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataactttta 202  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgaca-ctttcataactttta 27347428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 135
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  128 agtggttt 135  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 296
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807021
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  || ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagtta-caaaacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaac-attacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 18807021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941082
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20941133 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20941082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941317
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 22941454  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22941356 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgt 22941317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805632
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25805581 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 25805632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32005 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 31954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789910
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 12789761  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12789859 aatccaatat-aaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgata 12789910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545977
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23546028 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 23545977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933541
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24933502 aatccaatataaa-tattacttctaatatttatatctatgt 24933541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096883
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcc-acatctagggatcat 31097020  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  31096922 aatccaatat-aaatattactcctataatttatacctatgt 31096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 301
Target Start/End: Original strand, 22546872 - 22547008
Alignment:
Q  161 tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttat 260  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22546872 tatcattatgaaaataacttatgatattta-cataactttt--tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaa-tattactcataatatttat 22546967  T
Q  261 atctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22546968 atctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtg 22547008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100476
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| ||| |    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtat-a 20100449  T
Q  240 aatattactcctaatatttatatctat 266  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20100450 agtattactcctaatattgatacctat 20100476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765222
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 12765088  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| |   | |||||||  ||||||||||||||||||| || ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12765187 gtctatccaatat-aaatattactcctaatatttata 12765222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 240
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806606
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaa 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaa 18806606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 240
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806786
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  || || ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaa 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaa 18806786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097725
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctcgggatcat 5097855  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||| || || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5097757 aatccaatat-aaatattactcataatatttata 5097725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865669
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7865627 gtctatccagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 7865669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9811965
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 9811831  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9811930 gtctatccaatat-aaatattactcctaatatttata 9811965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704106
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 12703972  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| |   | |||||||   |||||||||||||||||| || ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12704071 gtctatccaatat-aaatattactcctaatatttata 12704106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 113
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 278
Target Start/End: Original strand, 18829281 - 18829530
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaa---ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggta 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||  ||  || |||| | |   |||||| || ||||||  ||||| || |||    
T  18829281 catgatccatggagtacccatcaataaccaactttatagtcatcattttatagatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcacatc-agtgta 18829379  T
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  | ||  |||||||||  |||||||  |||||||||| |    
T  18829380 catagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaactta-cataacttt--ctatgtatcattctcatggtg 18829476  T
Q  224 gatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttga 278  Q
    | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  18829477 ggtcaatccaatat-aaatattggtcctaatatttatatatatgagaacacttga 18829530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129928
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||| || |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataac--atactatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  224 gatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtat-aaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245169
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||||  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||| | || || | |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| |||||||| |  | |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26245208 aatcaagtataaa-tattactcctaatatttatacctatgt 26245169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 109  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347470
Alignment:
Q  256 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtg 27347470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262427
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262499 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18262427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269288
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269360 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926752
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926680 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 19926752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612898
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612970 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 55612898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858382
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858454 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8858382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963855
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963927 aatccaatat-aaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26963855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970678
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970750 aatccaatat-aaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 26970678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868812
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  868884 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtg 868812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707535
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707607 aatccaatat-aaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5707535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714163
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714235 aatccaatat-aaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 5714163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621325
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621253 aatccaatat-aaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10621325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628404
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628332 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10628404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393126
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28393054 aatccaatat-aaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtg 28393126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845418
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8845490 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtg 8845418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426596
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgaga------------acttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426524 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 4426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668115
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  5668047 aatccagtat-aaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatc 5668115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223779
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35223847 aatccagtat-aaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatc 35223779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtat-aaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtat-aaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311511
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggc 222  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |  || ||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgata-gttacataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  223 ggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20311584 aggtcaatccaatataaaa-attactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 20311511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461552
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15461603 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15461552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975606
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 34975755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34975657 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 34975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677068
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2677119 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 2677068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15815127 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15815076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111290
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18111239 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18111290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 280
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||| || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  229 atccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21454060 attcaatat-aaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369270
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatcaagagatcat 3369121  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3369219 aatccaata-caaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 3369270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300206
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17300155 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 17300206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20244004
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20244043 aatccaatataaa-tattacttctaatatttatatctatgt 20244004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531680
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 26531817  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26531719 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatttatgt 26531680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941791
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 1941928  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1941830 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 1941791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676218
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4676179 aatccaatataaa-tattacttctaatatttatatctatgt 4676218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163229
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 18163366  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18163268 aatccaatat-aaatattacttctaatatttatatctatgt 18163229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365586
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcact-atgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaat 242  Q
    || |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgaca-ctttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtat-aaat 19365612  T
Q  243 attactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19365611 attactcctaatatttatacctatgt 19365586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870473
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5870524 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 5870473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646789
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||| || | |||| || | |||||| |||  ||||||| ||||| ||||  | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgac-ttatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||    
T  32646720 caatccaatgt-aaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatc 32646789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9487657 tatccagtat-aaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 249
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||| || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  228 aatccaatataaaatattactc 249  Q
    |||| | ||| |||||||||||    
T  30040685 aatctagtat-aaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516271
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaa-tattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtg 56516271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528714
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaata 243  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| |||||| |||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatat-aaata 5528689  T
Q  244 ttactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    | |||||||||||||||| ||||||    
T  5528690 tcactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  45 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 144  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  145 gggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatat 244  Q
    | |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||| ||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ctttgataac--atactatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtat-aaatat 19362501  T
Q  245 tactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  19362500 tactcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616469
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaata 243  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||  |  ||| ||||||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgaca-ctttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtat-aaata 5616487  T
Q  244 ttactcctaatatttata 261  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  5616486 ttacttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636552
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaa 229  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  230 tccaatataaaatattactcctaatatttatatctatg 267  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32636588 tccaatat-aaatattactcataatatttatacctatg 32636552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421101
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| | || || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgacatttt-cataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  228 aatccaatataaa 240  Q
    |||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaa 11421101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546147
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatct-cataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| || || ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaa-tattactcctaatatttatacctatgt 4546147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaata 243  Q
    ||  ||||  || ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||| ||    
T  9538145 agactggac-acgccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt-cataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaa-ta 9538051  T
Q  244 ttactcctaatatttata 261  Q
    |||||||||| |||||||    
T  9538050 ttactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 156  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 289
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  161 tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttat 260  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |   | | |||||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaa-attactcattatatttat 34777946  T
Q  261 atctatgtgaagacttgataactctttat 289  Q
    |  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  34777947 acatatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||| ||| ||||| |  |  ||||| ||||| |||||| ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataaatcat--tatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
     ||||| ||     ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33888645 gtcaattcat----aaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700245
Alignment:
Q  254 tatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgt 24700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 137
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 137  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110279
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110351 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6110279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490710
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490782 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 8490710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482475
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482403 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 16482475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572584
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572512 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10572584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579347
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579275 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 10579347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600876
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600804 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607421
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607349 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15607421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357578
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357506 aacccaatat-aaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15357578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520190
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520262 aatcaaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18520190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522878
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  232 caatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522946 caatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18522878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211517
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211589 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13211517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248822
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248894 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13248822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342211
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15342139 aatccaatat-aaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 15342211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781110
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17781038 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtg 17781110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056819 aatccaatat-aaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 32056892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200176
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  224 gatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200100 ggtcaatccaata-caaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtg 17200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13517026
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517098 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13517026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647513
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647441 aatcaaatat-aaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 1647513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136574
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136640 aatccaatat-aaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 17136574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925189
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29925258 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974342
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29974411 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatct 29974342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200646
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 300  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16200717 aatccaatat-gaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgt 16200646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034293
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 21034442  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21034344 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 21034293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846783
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15846732 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 15846783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147801
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20147750 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20147801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398847
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 21398996  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  21398898 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgata 21398847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890446
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14890497 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 14890446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427088
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  55427127 aatccaatataaa-tattacttctaatatttatatctatgt 55427088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299978
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || ||| |||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcc-acatctagagatcat 12300114  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatg 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12300016 aatccaatat-aaatattactcctaacatttatatctatg 12299978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978963
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 25978826  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978924 tatccagtat-aaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253372
Alignment:
Q  46 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 145  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaa- 24253228  T
Q  146 ggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatatt 245  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    ||  ||||| ||  ||||| | ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||     
T  24253229 tgtggaatacaccgttatcactatgagaataacttatga-tccttaaataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatat-aaatata 24253324  T
Q  246 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccat 293  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253325 actcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccat 24253372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088227
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| |||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcat 28088310  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtat 28088227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  62 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  162 atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    | || | | |||||||||||||||||||| |||| | |  ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgacatttt-catagcat--actatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaa-tattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787654
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatga-aaatatcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787693 tatccagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317408
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15317369 tatctagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 15317408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147095
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataac--atactatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  226 tcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14147129 tcaatccagtat-aaatattcctcctaatatttata 14147095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  167 tatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctat 266  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  267 gtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280313
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataac 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  198 ttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 295  Q
      | |||||||| ||||||||| | || |||| | | | | |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32280407 --tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgt-aaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 165  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  166 ctatgagaatatctta 181  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 183
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138091
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatg 183  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatg 36138091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252245
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252317 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18252245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532506
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532434 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18532506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131401
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131329 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 27131401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310569
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310497 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtg 27310569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359027
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358955 aatccaatat-aaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtg 16359027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3855911
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3855839 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtg 3855911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816625
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataat-ttttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816553 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtg 36816625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641859
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 298  Q
    |||| | ||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22641793 aatctagtat-aaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatct 22641859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277545
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggca-ctttcatgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  27277477 aatctagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatc 27277545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 156 - 301
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171225
Alignment:
Q  156 accactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaata 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat-aaatattactcctaata 21171179  T
Q  256 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171180 tttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21171225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916688
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  128 agtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatg 9916688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706686
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19706635 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19706686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28134970
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28134919 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 28134970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802612
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43802561 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 43802612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456171
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9456222 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 9456171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391486
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20391337  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20391435 aatccaatat-aaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgata 20391486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779892
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20779841 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 20779892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670504
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22670453 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22670504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817236
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42817185 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 42817236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507119
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| || ||| ||  || ||||| ||||| |||| || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg-ctttttacacaacgtt--ctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23507188 taatccaatataaa-tattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatc 23507119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612547
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22612598 aatccaata-aaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgata 22612547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 634001
Alignment:
Q  48 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 147  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  148 tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattac 247  Q
     |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtat-aaatattac 634022  T
Q  248 tcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  634021 tcctaatatttatacctatgt 634001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014272
Alignment:
Q  106 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttact 204  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||  |||| ||||  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgat-ttttacata--ttgttct 12014180  T
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaa-tattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatc 12014272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 295
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657207
Alignment:
Q  195 aacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatg 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaa-tattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatg 22657206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727741
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| |  ||||||||||||||||| || |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggtatttt-cataacat--actatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8727773 aatccagtat-aaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 297
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917906
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9917837 tcaatccaatataaa-tattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 9917906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096789
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaata 243  Q
    || |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtat-aaata 29096814  T
Q  244 ttactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096813 ttattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667721
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 47667583  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||           ||| || || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--act-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47667670 aatccaatataaa-tattactcataatatttatatctatgtatagacttgata 47667721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145835
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  128 agtggtttcaggtc 141  Q
    ||||||||||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtc 28145835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    ||||   ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtat-aaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 281
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301855
Alignment:
Q  115 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtatt 214  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||  | ||||||| |||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtatt 24301788  T
Q  215 ctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataa 281  Q
    ||| ||  || |   || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  24301789 ctcgtgatgggtatttctaatagcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaaatcttgataa 24301855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 296
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006526
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttca 193  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||| |||| |||| ||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaatgacttgtgac-ttttaca 12006430  T
Q  194 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccat 293  Q
    ||||  |  || | ||  |||||||||||||     |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  12006431 taacgct--ctctctaacattctcatggcgg----gtccagtat-aaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaat 12006523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930649
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaa-tattactcctaatatttatacctatgt 35930649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  207 gtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaa-tattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852458
Alignment:
Q  130 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgaca 10852458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923608
Alignment:
Q  201 tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatt 257  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtat-aaatattactcctaatatt 26923608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 29 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940880
Alignment:
Q  29 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  129 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  229 atccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940951 atccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21940880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171705
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 298  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171774 aatccaatat-aaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatct 22171705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094338
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094410 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6094338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatcca 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642864
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642936 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 24642864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 297
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14983908
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttca 193  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  194 taacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccat 293  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatat--aatattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccat 14983904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371500
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 8371351  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8371449 aatccaatat-aaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgata 8371500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562178
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12562229 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 12562178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969388
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21969439 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 21969388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797359
Alignment:
Q  143 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaat 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtat-aaat 24797321  T
Q  243 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
     |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  24797322 tttactcataatatttatacctacgtgaagacatgata 24797359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611250
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagttt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25611301 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 25611250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007764
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27007713 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27007764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014907
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27014856 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27014907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880734
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27880683 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 27880734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020915
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28020864 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 28020915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130856
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22130805 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 22130856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659729
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 22659592  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22659690 aatccagtat-acatattactcctaatatttatacctatgt 22659729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916731
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||  | || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21916782 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgcatagacttgata 21916731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534508
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45534469 aatccaatataaa-tattacttctaatatttatatctatgt 45534508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232365
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  144 agggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaat 242  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgacattta-cataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaa-t 38232310  T
Q  243 attactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    ||||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38232311 attacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatc 38232365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240551
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||| ||||| ||| | |  |||||  |  |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26240590 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 26240551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430953
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 6431090  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430992 tatctagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782102
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttt-cataacag--actatgtagta 8782055  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttat 260  Q
    |||||| || ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtat-aaatattagtcctaatatttat 8782102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835424
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||| || ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgacatttttaa-aacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18835459 gtcaatccagtat-aaatattactcctaatatttata 18835424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  38 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2375386 - 2375231
Alignment:
Q  137 aggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaat 235  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||  ||||||| ||| | |||| || ||||||||||    
T  2375386 aggtcaaatggttgaatacaccacttatcactatgagaataact-atgag-ttttacataactttt--tatgtagaattataatggagggtcaatccaat 2375291  T
Q  236 ataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 296  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  2375290 ataca-tattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgat 2375231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963171
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| || |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acgtctagggatcat 2963030  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | ||||||  | |||||||||||||||||  ||  |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963129 gtctatccagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535409
Alignment:
Q  44 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 143  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  144 agggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    || |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ctttcataac--atactatgcaatattctcatggtgggtcaatc 20535409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970439
Alignment:
Q  23 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggg 122  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  123 tacatagtggtttcaggtc 141  Q
      |||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtc 36970439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  124 acatagtggtttcaggtc 141  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 301
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872833
Alignment:
Q  208 tagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaa-tattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtg 32872833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  55 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaata 154  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  155 caccactatcactatgagaatat 177  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645575
Alignment:
Q  239 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatga 295  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatga 29645575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10920477 - 10920427
Alignment:
Q  239 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttat 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  10920477 aaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 88  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7322
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 7322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 6654 - 6926
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6854 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 6926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 13670 - 13942
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 13942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Original strand, 25706 - 25982
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  224 gatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25906 gatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtg 25982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152658
Alignment:
Q  32 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  132 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  232 caatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152726 caatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 15152658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327999
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328071 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 29327999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536054
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11535982 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtg 11536054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12751041
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12751113 aatccaatat-aaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtg 12751041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11542972
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11542900 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 11542972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738751
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738823 aatccaatat-aaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 12738751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561222
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561294 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18561222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392369
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13392437 aatccagtat-aaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatc 13392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257834
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||| | ||    
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  222 cggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
     || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257756 tgggttaatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18257834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204607
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2204658 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 2204607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8465054
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8465105 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 8465054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400159
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18400210 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18400159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407143
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18407194 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 18407143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808743
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48808692 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 48808743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || |||||||| ||| |||||| || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataac--ttcctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtg 269  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365210 caatccaatgt-aaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729818
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15729857 aatccaatataaa-tattacttctaatatttatatctatgt 15729818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139573
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcc-acatctagagatcat 18139436  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18139534 aatccaata-caaatattactcctaatatttatatctatgt 18139573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230943
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||| || || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19230994 aatccagtataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19230943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254193
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| ||   |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  240 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30254232 a-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 30254193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681203
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681164 aatccagtat-aaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167094
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || || ||| | ||| |    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtat-a 47167065  T
Q  240 aatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47167066 aatattactcataatatttatacctatgt 47167094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669137
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10669097 caatctagtataaa-tattactcctaatatttatacctatgt 10669137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||    |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtat-aaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130628
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||| ||||||||| |||  ||  |||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||||  | || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28130667 aatccagtat-aaatattactcctgatatttatacctatgt 28130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 268
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443562
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactc 249  Q
      |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| || || | |||| | ||| |||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtat-aaatattactc 24443543  T
Q  250 ctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  24443544 ctaatattcatacctatgt 24443562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259359
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |  ||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||| |||||||||| || || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
     ||||| ||| ||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259320 tatccagtat-aaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845700
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactc 249  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtat-aaatattactc 25845692  T
Q  250 ctaatatt 257  Q
    ||||||||    
T  25845693 ctaatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846119
Alignment:
Q  50 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 149  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  150 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactc 249  Q
    | ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtat-aaatattactc 25846111  T
Q  250 ctaatatt 257  Q
    ||||||||    
T  25846112 ctaatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 268
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393659
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 165  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  166 ctatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatcta 265  Q
     | |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| ||  | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtat-aaatattactcctaatatttataccta 19393656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  39 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  139 gtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 176  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14592153 - 14591924
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  14592153 catgattcatcaagtacccattagccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 14592054  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||||||| || || ||    
T  14592053 agtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgacatttt-cataacaa--actgtgtagtattctcacggtgggtc 14591957  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14591956 aatccagtataaa-tattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16011744 - 16011515
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  16011744 catgattcatcaagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 16011645  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    ||| | |||||||||||||| || ||    
T  16011644 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgacatttt-cataacaa--actgtatagtattctcatggtgggtc 16011548  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16011547 aatccagtataaa-tattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  114 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtat 213  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  214 tctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaat 254  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtat-aaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388626
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataactt--ttactatgtag 210  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgaca-ctttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  211 tattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    ||||||||||   |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtat-aaatattactcctaatatttata 19388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    ||||   ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtat-aaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10235644 - 10235377
Alignment:
Q  30 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||   || |||||  ||| ||  |||||| || |||||||||||  ||||    
T  10235644 tgatttatggagtacccatcaaccgagtttatggtcatcctgctacgaacaataattaaatggcaacacagttctcgac-cctacatctagggtcgatag 10235546  T
Q  130 tggtttcaggtc-gaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 228  Q
    |||||||| ||| ||||| ||  || || || ||||| ||  | |||| |||||||| | || ||||||  |  |||||||  |||||||||| |  |||    
T  10235545 tggtttcatgtcagaaggatgatatgcatcattatcattacaataataacttatgac-tcttacataacact--ctatgtataattctcatggtgagtca 10235449  T
Q  229 atccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10235448 atccgatataaa-tattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtg 10235377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Original strand, 15169290 - 15169474
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |||||| |  | |||| ||||| |||  |||    
T  15169290 catgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcat 15169388  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattct 216  Q
    |||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15169389 agtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662651
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 296  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaata-aaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgat 7662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 177
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  102 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 177  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19859218 - 19859177
Alignment:
Q  239 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19859218 aaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 19859177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983184
Alignment:
Q  247 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatc 29983184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984302
Alignment:
Q  118 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt 188  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttatcacatt 29984302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 297
Target Start/End: Original strand, 47833899 - 47833945
Alignment:
Q  251 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  47833899 taatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatc 47833945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18503
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18575 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330240
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330168 aatccaatat-aaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 21330240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796721
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796793 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 18796721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18620023
Alignment:
Q  22 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 121  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  122 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgaca-ctttcataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  222 cggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
     || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatc 18620023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978091
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
    ||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | || ||  ||||||||||||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgacatttt-cataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20978163 caatccaatataaa-tattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270395
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||  ||| |||||  ||| |||||||  ||||||||||||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggt-gaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataa--ttttctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  36270454 caatccaatat-aaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactcttt 36270395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183475
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat 226  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | |||| |||| |||||| ||   ||||||  ||| ||||||||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgac-ttttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  227 caatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22183403 caatccaatataa--tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtg 22183475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174432
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30174483 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 30174432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992094
Alignment:
Q  42 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  141 cgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||  ||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| |    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtca-cttacataa--ttttctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatat-a 6992042  T
Q  240 aatattactcctaatatttatatctatgtgaag--acttgataactctttat 289  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  6992043 aatattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttat 6992094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822302
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacat-ttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatat 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||  ||| || ||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgact--tgagatctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatat 18822361  T
Q  238 aaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
     |||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||    
T  18822360 -aaatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatc 18822302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250279
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24250228 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 24250279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229450
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24229411 aatccagtataaa-tattactcctaatatttatacctatgt 24229450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||| || || | |||||| ||| |    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgaca-ctttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggttaatccagtat-a 15342208  T
Q  240 aatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342209 aatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800545
Alignment:
Q  26 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtac 125  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | ||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  226 tcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800579 tcaatccagtat-aaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacattttt 191  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaa-ggtgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279508
Alignment:
Q  203 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgat 296  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaa-tattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgat 19279508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616509
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgacatttt-cataaaat--actatgtagta 19616557  T
Q  213 ttctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    |||||| || || ||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaa-tgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 297
Target Start/End: Original strand, 18851956 - 18852047
Alignment:
Q  205 atgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatc 297  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18851956 atgtaatattcttatagcgagtcaatccaatataaa-tattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatc 18852047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  95 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 175  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 95  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 261
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  126 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga 225  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| | |  |||||||||||||||||| ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgaca--cttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  226 tcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
    ||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtat-aaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||   |||||||||||||||| ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgaca-ctttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatat-aaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740983
Alignment:
Q  113 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 186  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgaca 28740983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 301
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36801974
Alignment:
Q  226 tcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36801899 tcaattcaatataaa-tattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtg 36801974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1208
Alignment:
Q  47 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 146  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  147 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatatta 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatat-aaatatta 1263  T
Q  247 ctcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1262 ctcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtg 1208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 285
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230311 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5744
Alignment:
Q  24 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  124 acatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca-tttttcataacttttactatgtagtattctcatgg 221  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| |||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  222 cggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtg 5744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 238
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  289 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3922
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3871 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 3922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119785
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  119836 aatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 119785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13184
Alignment:
Q  40 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  140 tcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataa 239  Q
    || ||| |||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||| || || |||||||  ||| |    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtat-a 13155  T
Q  240 aatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13156 aatattactcctaatatttatacctatgt 13184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67609
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 67472  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| || || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67570 aatccaatat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 67609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 280
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130471
Alignment:
Q  66 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatca 165  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  166 ctatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatcta 265  Q
     | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaa-tattactcctaatatttatatcta 130456  T
Q  266 tgtgaagacttgata 280  Q
    |||  ||||||||||    
T  130457 tgtatagacttgata 130471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26609
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||| || || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26648 aatccagtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8360
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgata 280  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8414 gtcaatccaatataaa-tattactcctaatatttatatctatgtatagacttgata 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40223
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  | || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40184 aatccggtat-aaatattactcctaatatttatacctatgt 40223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcag 190  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctca 218  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8807
Alignment:
Q  56 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatac 155  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||| ||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  156 accactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaata 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||| | || |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtat-aaatattactcctaata 8811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11758
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatt---tttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||||||||||||| ||| | |   |||||   ||||| | |||||||||||||||||| |   |  ||||||   ||||||||||||||||||  | ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11723 gtctatccagtat-aaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 261
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  125 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg 224  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||||||||| | ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgaca-ccttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  225 atcaatccaatataaaatattactcctaatatttata 261  Q
     |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtat-aaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53832
Alignment:
Q  28 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||| ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcat 53969  T
Q  128 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |    ||| || | || ||   ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||| || || ||    
T  53968 agtggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 53872  T
Q  228 aatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgt 268  Q
    || ||| | |  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53871 aacccagtgt-gaatattactcttaatatttatacctatgt 53832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9277 - 9178
Alignment:
Q  169 tgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgga-tcaa-tccaa-tataaaatattactcctaatatttatatcta 265  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  | ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9277 tgagaatatcttatgacaattt-cataactt--actatgtagtattctcacagtggggtcaaatccaaatataaaatattacttctaatatttatatcta 9181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 287
Target Start/End: Original strand, 90019 - 90093
Alignment:
Q  212 attctcatggcggatcaatccaatataaaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactcttt 287  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  90019 attctcatcgcgtgtcaatccaatataaa-tgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttt 90093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University