View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20645_high_18 (Length: 315)

Name: NF20645_high_18
Description: NF20645
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20645_high_18
NF20645_high_18
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (19-268)||(43057410-43057659)
chr7 (19-268)||(151964-152213)
chr7 (19-268)||(30110909-30111158)
chr7 (19-268)||(35089835-35090084)
chr7 (19-268)||(27418371-27418620)
chr7 (19-252)||(40097200-40097434)
chr7 (19-176)||(47914878-47915035)
chr7 (19-251)||(39301002-39301223)
chr7 (173-268)||(47914058-47914153)
chr7 (19-143)||(31494345-31494469)
chr7 (19-108)||(24939539-24939628)
chr7 (69-177)||(46037170-46037278)
chr7 (19-76)||(47031351-47031408)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (19-268)||(41386599-41386848)
chr8 (19-268)||(2112897-2113146)
chr8 (21-268)||(7148148-7148395)
chr8 (19-268)||(43605093-43605342)
chr8 (19-268)||(42275078-42275328)
chr8 (19-268)||(40265010-40265259)
chr8 (20-268)||(29260005-29260253)
chr8 (19-268)||(4655153-4655402)
chr8 (18-235)||(10802533-10802750)
chr8 (34-268)||(41965529-41965761)
chr8 (19-252)||(28619949-28620183)
chr8 (19-218)||(9457649-9457848)
chr8 (19-252)||(4302551-4302786)
chr8 (19-251)||(30382420-30382652)
chr8 (19-224)||(8502738-8502943)
chr8 (40-251)||(37567118-37567329)
chr8 (19-224)||(35142148-35142353)
chr8 (19-202)||(9209142-9209325)
chr8 (19-108)||(1605902-1605991)
chr8 (191-268)||(41965327-41965404)
chr8 (19-106)||(40013363-40013450)
chr8 (172-252)||(40013242-40013324)
chr8 (19-122)||(23185803-23185906)
chr8 (19-143)||(24296506-24296630)
chr8 (232-268)||(9457832-9457868)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (19-268)||(6476442-6476691)
chr6 (19-218)||(29834064-29834263)
chr6 (19-218)||(29865498-29865697)
chr6 (19-244)||(3110038-3110263)
chr6 (20-252)||(30877959-30878191)
chr6 (19-251)||(10643758-10643992)
chr6 (19-168)||(7858203-7858352)
chr6 (69-177)||(709070-709178)
chr6 (69-177)||(7100320-7100428)
chr6 (69-177)||(8794202-8794310)
chr6 (69-177)||(5957285-5957393)
chr6 (232-268)||(29834044-29834080)
chr6 (232-268)||(29865478-29865514)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (19-268)||(24150561-24150810)
chr3 (19-268)||(35731038-35731287)
chr3 (19-268)||(36054736-36054985)
chr3 (19-268)||(38629529-38629778)
chr3 (19-268)||(30588945-30589195)
chr3 (19-252)||(13662654-13662887)
chr3 (19-268)||(26293296-26293545)
chr3 (19-252)||(46251948-46252181)
chr3 (19-268)||(50900176-50900425)
chr3 (19-210)||(26005770-26005961)
chr3 (84-268)||(26005584-26005768)
chr3 (19-268)||(19551887-19552126)
chr3 (19-251)||(27593258-27593490)
chr3 (20-251)||(39338046-39338274)
chr3 (19-239)||(26555920-26556123)
chr3 (21-252)||(36786079-36786309)
chr3 (19-245)||(52023955-52024177)
chr3 (19-213)||(38682531-38682728)
chr3 (20-98)||(53183972-53184050)
chr3 (19-108)||(25713327-25713417)
chr3 (19-108)||(6783990-6784079)
chr3 (19-100)||(24574816-24574897)
chr3 (19-64)||(33119571-33119616)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (19-268)||(29941051-29941300)
chr2 (19-266)||(6289232-6289479)
chr2 (19-268)||(45547037-45547286)
chr2 (19-251)||(11534941-11535173)
chr2 (20-251)||(24193232-24193463)
chr2 (19-252)||(20157502-20157735)
chr2 (19-252)||(34028677-34028911)
chr2 (19-246)||(11998169-11998395)
chr2 (19-232)||(24193655-24193875)
chr2 (19-193)||(45485467-45485631)
chr2 (19-177)||(38822753-38822912)
chr2 (19-107)||(2373075-2373163)
chr2 (19-107)||(27090741-27090829)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (19-268)||(42218175-42218424)
chr4 (19-268)||(8583734-8583983)
chr4 (19-268)||(44929983-44930230)
chr4 (19-233)||(8880550-8880764)
chr4 (19-268)||(3435692-3435935)
chr4 (19-251)||(52109512-52109744)
chr4 (20-252)||(25935894-25936127)
chr4 (19-248)||(45332772-45333001)
chr4 (19-246)||(47685250-47685477)
chr4 (19-248)||(45340462-45340691)
chr4 (19-248)||(42720825-42721055)
chr4 (40-252)||(26336195-26336407)
chr4 (18-232)||(33449944-33450158)
chr4 (20-251)||(54509821-54510050)
chr4 (19-251)||(40143882-40144098)
chr4 (90-268)||(7820239-7820402)
chr4 (19-108)||(5117067-5117156)
chr4 (19-57)||(7820202-7820240)
chr4 (69-177)||(38230928-38231036)
chr4 (60-168)||(53272056-53272164)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (19-268)||(26882555-26882804)
chr1 (19-268)||(45318566-45318815)
chr1 (19-268)||(52705499-52705748)
chr1 (19-252)||(1928149-1928382)
chr1 (19-251)||(36402353-36402585)
chr1 (19-248)||(29208861-29209090)
chr1 (19-251)||(33243060-33243288)
chr1 (19-251)||(33263233-33263461)
chr1 (19-251)||(10896906-10897138)
chr1 (19-218)||(45534912-45535089)
chr1 (129-214)||(9831782-9831867)
chr1 (40-122)||(9831417-9831499)
chr1 (19-184)||(9191237-9191402)
chr1 (69-177)||(19007400-19007508)
chr1 (69-177)||(48194746-48194854)
chr1 (69-177)||(48203504-48203612)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (20-268)||(81511-81759)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (19-268)||(40410696-40410945)
chr5 (19-251)||(6828537-6828770)
chr5 (20-232)||(17518535-17518748)
chr5 (19-232)||(10571217-10571430)
chr5 (21-143)||(6902525-6902647)
chr5 (69-177)||(2276025-2276133)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (30-268)||(34543-34781)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (19-218)||(21192-21391)
scaffold0237 (232-268)||(21172-21208)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (19-252)||(16303-16520)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (93-177)||(1705-1789)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43057659 - 43057410
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43057659 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 43057560  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057559 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 43057460  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057459 cttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 43057410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 151964 - 152213
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  151964 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctaatggtattc 152063  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152064 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 152163  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  152164 cttttctatctcccacacatagcctttagattttgtaatactctaccaaa 152213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 30110909 - 30111158
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  30110909 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctgctattattc 30111008  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30111009 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtatctattaacaatctcacacctaaccttgaga 30111108  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30111109 cttttttgtctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 30111158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 35090084 - 35089835
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35090084 gtattcaattaggattttcatgattttttaatgagtccaatgaaatcaagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 35089985  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35089984 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatgaattttgtgagattgtttggtataaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 35089885  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35089884 cttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 35089835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27418620 - 27418371
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  27418620 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctgctagtaatc 27418521  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27418520 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtatctattaacaatctcacacctaaccttgaga 27418421  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27418420 ctttttggtctcccacacaaagccttgagattttgtaatactcttccaaa 27418371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 40097200 - 40097434
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  40097200 gtattcaattatgattttcaaaattttttaatgagtccaataaaattcagtggtattcaattcagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattc 40097299  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40097300 aaaattctaaggattttaatggattgttatgactaatggattttgtgagactttttaatgtaaaatgcatctactaacaatctcacacctagctttgaga 40097399  T
Q  219 c-ttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    | |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  40097400 ctttttttgtctcccacacatagtcttgagatttt 40097434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47915035 - 47914878
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47915035 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctgctagtattc 47914936  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttag 176  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47914935 aaaactctacagatttttatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttag 47914878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39301223 - 39301002
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39301223 gtattcaattaggattttcagaattttttaatgagtccaataaattccagtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattc 39301124  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39301123 aaaattgtaaggattttaatagattgttgtgagtaatggat------------tttaatgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 39301036  T
Q  219 c-ttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    | |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  39301035 ctttttttgtctcccacatatagccttgagattt 39301002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47914153 - 47914058
Alignment:
Q  173 ttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47914153 ttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttttgtctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 47914058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 31494345 - 31494469
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||  |||||  ||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||  | |||||     
T  31494345 gtattcaattaggattttaatgattttttaaagagtcaaacaaaatctggtggtattcaatcaagattttttacaacttaaaaattgtctcttggtatta 31494444  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggatt 143  Q
    |||| | ||  ||||||||||||||    
T  31494445 aaaaatgtattgattttaatggatt 31494469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24939628 - 24939539
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtct 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||   |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  24939628 gtattcaattatgattttcatgaatttttaaagagtccaacaaaatctgatggtattcaattaaaatttttcataacttaaaaatagtct 24939539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 46037278 - 46037170
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| | |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  46037278 tggtattcaattgagatttctcatgacttatgaattgtctattggtattcaaaagtctatagattttgatggattcttggatggaatggattttgtgaga 46037179  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  46037178 ctttttagt 46037170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Original strand, 47031351 - 47031408
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattc 76  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||    
T  47031351 gtattcaattaagattttcaagaatttttaaagagttcaaccaaatccagtggtattc 47031408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41386848 - 41386599
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41386848 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactagtattc 41386749  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386748 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 41386649  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386648 cttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 41386599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 2112897 - 2113146
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2112897 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagatttcgcataacttaaaaattgtctactggtattc 2112996  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2112997 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactgacaatctcacacctagcattgaga 2113096  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2113097 cttttctgtctcccacatatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 2113146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Original strand, 7148148 - 7148395
Alignment:
Q  21 attcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  7148148 attcaattaggattttcaagattttttaaggagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttagaaattgtctactggcattcaa 7148247  T
Q  121 aactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7148248 aactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagact 7148347  T
Q  221 tttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7148348 tttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 7148395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43605342 - 43605093
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43605342 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagatttcgcataacttaaaaattgtctgctagtattc 43605243  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43605242 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttaatgtaaaatgtacttactaacaatctcacacctagccttgaga 43605143  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43605142 cttttttgtctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 43605093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 42275078 - 42275328
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42275078 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtcaaatgaaatccagcggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactagtattc 42275177  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaa-caatctcacacctagccttgag 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42275178 aaaactctacggatttttatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaaccaatctcacacctagccttgag 42275277  T
Q  218 acttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42275278 acttttctgtctcccacacataaccttgagattttgtaatactcttccaaa 42275328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 40265259 - 40265010
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40265259 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctaatggtattc 40265160  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40265159 aaaactctatggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 40265060  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40265059 cttttctatctcccacacgtagcctttagattttgtaatactctaccaaa 40265010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29260253 - 29260005
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattca 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29260253 tattcaattaggattttcgagattttttaacgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattca 29260154  T
Q  120 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29260153 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacgtactaacaatctcacacctaaccttgagac 29260054  T
Q  220 ttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29260053 ttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactattccaaa 29260005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 4655153 - 4655402
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4655153 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaattcagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctaccggtattc 4655252  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655253 aaaactctacggattttaatggattgttatgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacatactaacaatctcacacctagccttgaga 4655352  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4655353 cttttctatctctcacacatagccttgagattttgtgatactcttccaaa 4655402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10802750 - 10802533
Alignment:
Q  18 agtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10802750 agtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactagtatt 10802651  T
Q  118 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10802650 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgag 10802551  T
Q  218 acttttctggctcccaca 235  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  10802550 acttttctgtctcccaca 10802533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 34 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41965761 - 41965529
Alignment:
Q  34 tttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  41965761 tttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaa--ttgtctactggtattcaaaactctacatatt 41965664  T
Q  134 ttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggctccca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41965663 ttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattatttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcgcacctagccttgagacttttctatctccca 41965564  T
Q  234 cacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965563 cacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 41965529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 28619949 - 28620183
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagat-tttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28619949 gtattcaattaggattttcaagatatttttaatgaatccaatgaaattcagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtatt 28620048  T
Q  118 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28620049 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatgaactttgtgagattgtttaatgtacaatgtacctactaacaatctcacacctaatcttgag 28620148  T
Q  218 acttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28620149 acttttctgtctcccacacataaccttgagatttt 28620183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 9457649 - 9457848
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  9457649 gtattcatttagaattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctatcggtattc 9457748  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9457749 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 9457848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4302786 - 4302551
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  4302786 gtattcaattaggattttcaggattttttaatgagtccaataaaattcaatggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattagtattc 4302687  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4302686 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggatttagcgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 4302587  T
Q  219 c--ttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    |  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4302586 catttttttgtctcccacacatagccttgagatttt 4302551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30382652 - 30382420
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  30382652 gtattcaattaggattttcatgattttttaattagttcaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattc 30382553  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30382552 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatcaattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacatctaaccttgaga 30382453  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  30382452 cttttttgtctcccacacataactttgagattt 30382420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 8502738 - 8502943
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||     
T  8502738 gtattcaattaggattttcaagatttttgaatgagtccaataaaatccggtggtattcaattaagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattt 8502837  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8502838 aaaattctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacatagccttaaga 8502937  T
Q  219 cttttc 224  Q
    ||||||    
T  8502938 cttttc 8502943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37567329 - 37567118
Alignment:
Q  40 gattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatg 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  37567329 gattttttaatgagtccaataaaatccagtagtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattcaaaattgtacggattttaatg 37567230  T
Q  140 gattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggctcccacacata 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37567229 aattgttgtgagtaatggattttgtgaggctttttagtgtaaaatgtatctactaacaatctcacacctaaccttgagacttttttgtctcccacacata 37567130  T
Q  240 gccttgagattt 251  Q
    ||||| ||||||    
T  37567129 gccttaagattt 37567118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 35142148 - 35142353
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  35142148 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaatccggtcgtattcaattaagattttgtacaacttaaaaattgtctattggtattc 35142247  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  35142248 aaaatattacggattttattagattgttgtgagtaatggattttatgagactttttagtgtaaaatctacctactaacactctcacaactagcctcaaga 35142347  T
Q  219 cttttc 224  Q
    ||||||    
T  35142348 cttttc 35142353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 9209142 - 9209325
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  9209142 gtattcaattaagattttcaggattttttaatgagttcaataaaatccagtggtattcaattgaaattttggacaacttaaaaattgtctattggtattc 9209241  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctc 202  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9209242 aaaactctaaggattttaatagtttgttgtgggtaatttattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctc 9209325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1605991 - 1605902
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtct 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605991 gtattcaattaagattttcaagattttttaatgagtctaatgaaatccagtagtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtct 1605902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41965404 - 41965327
Alignment:
Q  191 actaacaatctcacacctagccttgagacttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41965404 actaacaatctcgcacctagccttgagacttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 41965327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 40013450 - 40013363
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgt 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40013450 gtatttaattaggattttcaagattttttaatgagttcaataaaattcagtggtattcaatttagattttgcacaacttaaaaattgt 40013363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 40013324 - 40013242
Alignment:
Q  172 tttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggct-cccacacatag-ccttgagatttt 252  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||    
T  40013324 tttagtataaaatatacctactaacaatctcacacttggccttgagacttttctgtctccccacacatagactttgagatttt 40013242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 23185803 - 23185906
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||  |  |||||| |||||  ||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||| || |||||     
T  23185803 gtattcaattaggattttcaaaaaattttataggatccaataaaatctggtggtattcaatcaaaatttttcacaacttaaaaattgtctcctggtatta 23185902  T
Q  119 aaaa 122  Q
    ||||    
T  23185903 aaaa 23185906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24296630 - 24296506
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttg-tatt 117  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||   |||||||||||  | |  || |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  24296630 gtattccactaggattttcatgattttttaaagagttcaataaaatctgatggtattcaataaaaaaatttcataacttaaaaatagtct-cttgatatt 24296532  T
Q  118 caaaactctacggattttaatggatt 143  Q
    ||||| | ||  ||||||||||||||    
T  24296531 caaaaatgtatagattttaatggatt 24296506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Original strand, 9457832 - 9457868
Alignment:
Q  232 cacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9457832 cacacctaaccttgagattttgtaatactcttccaaa 9457868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6476691 - 6476442
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6476691 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactagtattc 6476592  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6476591 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtaactactaacaatctcacacctagccttgaga 6476492  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6476491 cttttctgtctcccacacatagccttgagattttgtaatactctttcaaa 6476442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29834263 - 29834064
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  29834263 gtatgcaattagaattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctatcggtattc 29834164  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29834163 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 29834064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29865697 - 29865498
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  29865697 gtatgcaattagaattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctatcggtattc 29865598  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29865597 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 29865498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3110263 - 3110038
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |   |||||    
T  3110263 gtattcaattagaattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtgatattcaattgagattttgcctaacttgaaaattgtgtgcagttattc 3110164  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  || |||    
T  3110163 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacatactgacaatctcgcacctagtattaaga 3110064  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagcctt 244  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  3110063 cttttctatctcccacacatagcctt 3110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 30877959 - 30878191
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| | |||||||    
T  30877959 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaatctagtggtattcaattcagattttgtacagcttaaaaattgtctattggtattca 30878058  T
Q  120 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagac 219  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30878059 aaattctaaggattttaatggattgttatgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgcatctactaacaatctcacatctagccttgagac 30878158  T
Q  220 ttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  30878159 ttttttgtctcccacacatagtcttgagatttt 30878191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10643992 - 10643758
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttg--cataacttaaaaattgtctacttgtat 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||     
T  10643992 gtattcaattaggattttcaggattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgatcacaacttaaaaattgtctattggtaa 10643893  T
Q  117 tcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttga 216  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  10643892 tcaaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaatcttaa 10643793  T
Q  217 gacttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  10643792 gacttttttgtctcccacacatagccttaagattt 10643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7858352 - 7858203
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  7858352 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagttcaataaagtgcactggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattgatattc 7858253  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7858252 aaaattctacggattttaatgcattgttgtgagtaatagattttgtgaga 7858203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 709070 - 709178
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||  ||||||||| | |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  709070 tggtattcaattgaaatttctcatgacttatgaattgtctattggtattcaaaagtctatagattttgatggattcttggatgtaatggattttgtgaga 709169  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  709170 ctttttagt 709178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 7100320 - 7100428
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| | | |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  7100320 tggtattcaattgagatttctcatgacttatgaattgtccattggtattcaaaagtctatagattttgatggattcttggatggaatggattttgtgaga 7100419  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  7100420 ctttttagt 7100428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8794310 - 8794202
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| | | |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  8794310 tggtattcaattgagatttctcatgacttatgaattgtccattggtattcaaaagtctatagattttgatggattcttggatggaatggattttgtgaga 8794211  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  8794210 ctttttagt 8794202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 5957285 - 5957393
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||||  ||| ||  |  |||||||||||||||||    
T  5957285 tggtattcaattaagatttctcatgacttatgaattgtctattggtattcaaaagtctatagattttaatatattttttcgtataatggattttgtgaga 5957384  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  5957385 ctttttagt 5957393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29834080 - 29834044
Alignment:
Q  232 cacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29834080 cacacctaaccttgagattttgtaatactcttccaaa 29834044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29865514 - 29865478
Alignment:
Q  232 cacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29865514 cacacctaaccttgagattttgtaatactcttccaaa 29865478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24150810 - 24150561
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24150810 gtattcaattaggattttgaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtccactggtattc 24150711  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150710 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 24150611  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150610 cttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 24150561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 35731038 - 35731287
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35731038 gtattcaattaagattttcaagattttttaatgagtccaatcaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 35731137  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35731138 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgcacctgctaacaatctcacacctagcattgaga 35731237  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35731238 cttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 35731287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36054985 - 36054736
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  36054985 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctgctagttttc 36054886  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36054885 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtatctattaacaatctcacacctaaccttgaga 36054786  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36054785 cttttttgtctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 36054736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38629778 - 38629529
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38629778 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagttcaatgaaattcagcggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 38629679  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629678 aaaactatacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 38629579  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629578 tttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 38629529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 30588945 - 30589195
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30588945 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaattcagtggtattcaattgagatttagcataacttaaaaattgtctactggtattc 30589044  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30589045 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 30589144  T
Q  219 cttttctgg-ctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| |   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30589145 ctttttttatcacccacacatagccttcagattttgtaatactcttccaaa 30589195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Original strand, 13662654 - 13662887
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13662654 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagatttcgcacaacttaaaaattgtctactcgtattc 13662753  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662754 aaaacactacgggttttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 13662853  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13662854 cttttctgcctcccacacataaccttgagatttt 13662887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26293545 - 26293296
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26293545 gtattcaattaggattttcaatattttttaatgagtccaatgaaatctagtgatatttaattgagattttgcataacttaaaaattgtttactagtattc 26293446  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  26293445 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgtgattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaacctcacacctaatcttgaga 26293346  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26293345 cttttctgtctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 26293296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 46252181 - 46251948
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  46252181 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctgctggtattc 46252082  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46252081 aaaactttacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 46251982  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    |||||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  46251981 cttttctgtctcccacacataagctcgagatttt 46251948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50900425 - 50900176
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50900425 gtattcaattaggattttcaagcttttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcgattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 50900326  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50900325 aaaactctagagattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttaatgtaaaatgtacatactaacaatctcacacctagccttgaga 50900226  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50900225 cttttctatctcccacacatttccttgagattttgtaatactcttccaaa 50900176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26005961 - 26005770
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26005961 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 26005862  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctag 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005861 aaaactctatggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctag 26005770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 84 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26005768 - 26005584
Alignment:
Q  84 attttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005768 attttgcataacttaaaaattgtctattggtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaa 26005669  T
Q  184 tgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26005668 tgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 26005584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19552126 - 19551887
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19552126 gtattcaattaggattttcaagattttttaacgagttcaatgaaatccagtggtatttaattaagattttgcataacttaaaaattgtctagtggtattc 19552027  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19552026 aaaactctacagattttaattgattgtt----------gattttgtgaaattgtttagtgtaaaatgtacctaataacaatctcacacctagccttgaga 19551937  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19551936 cttttctttctcccacatatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 19551887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 27593258 - 27593490
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||    
T  27593258 gtattcaattaggattttcatgattttttaatgagtccaataaaattcagtggtattcaattgaggttttgcacatcttaaaaattgtctattggtattc 27593357  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27593358 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 27593457  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  27593458 cttttttgtctccaacacatagctttgagattt 27593490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39338274 - 39338046
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattca 119  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  39338274 tattcaattaggatttttaggattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattca 39338175  T
Q  120 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagac 219  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39338174 aaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattt--tgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgagac 39338077  T
Q  220 ttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    |||| || |||||||| |||||||| ||||||    
T  39338076 tttt-tgtctcccacaaatagccttcagattt 39338046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 26555920 - 26556123
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  26555920 gtattcaattaggattttctagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacgggtattc 26556019  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26556020 aaaactctacggattt-----------------taatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 26556102  T
Q  219 cttttctggctcccacacata 239  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  26556103 cttttctatctcccacacata 26556123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 36786079 - 36786309
Alignment:
Q  21 attcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaa 120  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  36786079 attcaattagaattttaaggattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcaaaactttaaacttgtctattggtattcaa 36786178  T
Q  121 aactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagact 220  Q
    || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36786179 aattgtaaggattttaatgaattgttgtgagtaatggattttatgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatcacacacct-gccttgagact 36786277  T
Q  221 tttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  36786278 tttttgtctctcacacatagccttgagatttt 36786309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52024177 - 52023955
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||    
T  52024177 gtattcaattatgattttcaagattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcacaatttaaaaattgtctattagtaatc 52024078  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    |||    
T  52024077 aaaattctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttaagagactttttagtataaaatgtacctagtaacaatctcacacctaac----aga 52023982  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttg 245  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  52023981 cttttttgtctcccacacatagacttg 52023955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Original strand, 38682531 - 38682728
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagatttttt-aatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtatt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||    
T  38682531 gtattcaattatgattttcaagatttttttaatgagtccaataaacttcagtgatattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgt-tattggtatt 38682629  T
Q  118 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaat---gtacctactaacaatctcacacctagcct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38682630 caaaattctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgagagattttttagtataaaatgtagtacctactaacaatctcacacctagcct 38682728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 53184050 - 53183972
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataactta 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53184050 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaatctggtggtattcaattgagattttgcataactta 53183972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25713417 - 25713327
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagatttttt-aatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtct 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||  |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  25713417 gtattcaattaggattttcatgatttttttaaagaatccaacaaaatccgttggtattcaatcaagatttttcacaacttaaaaattgtct 25713327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6784079 - 6783990
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtct 108  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  6784079 gtattaaattaagattttcaggattttttaaagagtccaaccaaattcggtggtattccatcaagattttccacaacttaaaaattgtct 6783990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24574897 - 24574816
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  |||| | || |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  24574897 gtattcaattaggattttcaaaattttttaaagaatccaacaaaattcggtagtattcaatcaagattttacacaacttaaa 24574816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33119616 - 33119571
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  33119616 gtattcaattaggattttcaagattttttaaagaatccaataaaat 33119571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 29941051 - 29941300
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29941051 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtctaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 29941150  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941151 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 29941250  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29941251 cttttctatctcccacatatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 29941300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6289479 - 6289232
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  6289479 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgaatccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctgctagtattc 6289380  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289379 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 6289280  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttcca 266  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6289279 cttttttgtctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttcca 6289232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 45547037 - 45547286
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45547037 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaattcagtggtattcaattgagatttagcataacttaaaaattgtctactggtattc 45547136  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45547137 aaaactctacggattttaatggattgttgtaagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 45547236  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45547237 cttttatatctcccacacatagccttgagattttgtaatacacttccaaa 45547286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 11534941 - 11535173
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  11534941 gtatttaattaggattttcaggattttttaatgagtccaataaaatccagtggaattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattc 11535040  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11535041 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacataaccttgaga 11535140  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  11535141 cttttttgtctcccacacatagctttgagattt 11535173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24193463 - 24193232
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattca 119  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  24193463 tattcaattagaattttcaggattttttaatgagtccaataaaattcagtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattca 24193364  T
Q  120 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagac 219  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24193363 aaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacttaaccttgagac 24193264  T
Q  220 ttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  24193263 ttttttgtctcccacacatagtcttgaaattt 24193232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20157735 - 20157502
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  20157735 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaattcagtggtattcaattcagattttgcacaacttaaatattgtctattggtattc 20157636  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20157635 aaaattctaaggattttaatagattgttatgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgcatctactaacaatctcacacctagctttgaga 20157536  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20157535 cttttttgtctcccacacatagtcttgagatttt 20157502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34028911 - 34028677
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaa-tgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  34028911 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaaataaaatccagtggtattcaattcagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtatt 34028812  T
Q  118 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgag 217  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34028811 caaaattataaggattttaatggattgttacgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgcatctactaacaatctcacacctagccttgag 34028712  T
Q  218 acttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    |||||| || || |||||||||| |||||||||||    
T  34028711 acttttttgtctgccacacatagtcttgagatttt 34028677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11998395 - 11998169
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  11998395 gtattcaattaggattttcagaattttttaatgagtccaataaaatccagaggtattcaattgagattttacacaacttaaaaattgtctattggtattc 11998296  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11998295 aaaattctaaggattttaatggtttgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtatctaccaacaatctcacacc-agccttgaga 11998197  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttga 246  Q
     |||| || |||||||||||||||||||    
T  11998196 tttttttgtctcccacacatagccttga 11998169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 24193655 - 24193875
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||    
T  24193655 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaattcggtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaactgtttattggtattc 24193754  T
Q  119 aaaactctacgga-------ttttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagc 211  Q
    |||| |||||| |       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24193755 aaaattctacgaattttaatttttaatggattgctgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacttagc 24193854  T
Q  212 cttgagacttttctggctccc 232  Q
    ||  ||||||||||| |||||    
T  24193855 ctcaagacttttctgtctccc 24193875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 45485467 - 45485631
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||  |||||    
T  45485467 gtattcaattaggattttcaagatttttcaatgaatccaataaaattcagtggtattcaattgagattttgcataa----------gtctactaatattc 45485556  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctact 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45485557 aaaattctatggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagcgtaaaatgtacctact 45485631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38822912 - 38822753
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagatt-ttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||  | |||||    
T  38822912 gtattcaattaggattttcaagatttttttaaagaatccaacaaaatccggtggtattcgatcaagatttttcacaacttaaaaattgtctcttggtatt 38822813  T
Q  118 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagt 177  Q
     |||| | ||  ||||| ||||||||  |  |  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38822812 aaaaaatgtatagatttcaatggattacttggtataatggattttgtgagattttttagt 38822753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 2373075 - 2373163
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtc 107  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||| |  ||||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  2373075 gtattcaattaggattttcatgaatttttaaagagtccaacaaaattcgttggtatttaatcaagatttttcacaacttaaaaattgtc 2373163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 27090741 - 27090829
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtc 107  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||||||||    
T  27090741 gtattcaattaggattttactgattttttaaagagtccaacaaaattcagtggtattcaactatgatttttaacaacttaaaaattgtc 27090829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42218424 - 42218175
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42218424 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactgatattc 42218325  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42218324 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatgaattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 42218225  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42218224 cttttctatctcctacacatagccttgagattttgtaatattcttccaaa 42218175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8583983 - 8583734
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8583983 gtattcaattaggattttcaagattttttaacgagtccaatgaaattcagtggtattcaattaagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 8583884  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583883 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatgaattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 8583784  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8583783 cttttctatctccaacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 8583734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 44929983 - 44930230
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  44929983 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgag--caatgaaattcagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacgggtattc 44930080  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930081 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaaaggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 44930180  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930181 tttttctatctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 44930230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 8880550 - 8880764
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8880550 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactagtattc 8880649  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8880650 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatgaattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 8880749  T
Q  219 cttttctggctccca 233  Q
    |||||||| ||||||    
T  8880750 cttttctgtctccca 8880764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3435935 - 3435692
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  3435935 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaattcagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtgtgctggtattc 3435836  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435835 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatagattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 3435736  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3435735 cttttctatct------catagccttgagattttgtaatactcttccaaa 3435692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 52109512 - 52109744
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  52109512 gtattcaattaggattttcatgattttttaatgagtccaatgaaatccaatggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtataccgatattc 52109611  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52109612 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttaatgtaaaatgtacctactaacaatcccacacctagccttgaga 52109711  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  52109712 cttttctgtctcccacacataaccttgagattt 52109744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 25935894 - 25936127
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattca 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25935894 tattcaattaggattttcaaaattttttaatgagtccaatgaaatctagtagtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactagtattca 25935993  T
Q  120 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagac 219  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25935994 aaactcatcgaattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgaacctattaacaatctcaca-ctagccttgagac 25936092  T
Q  220 ttttc--tggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    |||||  || ||||||||||||  |||||||||||    
T  25936093 ttttctgtgtctcccacacataatcttgagatttt 25936127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 45332772 - 45333001
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  45332772 gtattcaattaggattttcaggattttttaatgagtccaataaaatccagaggtattcaattgagattttacacaacttaaaaattgtctattggtattc 45332871  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45332872 aaaattctaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgaaactttttagtgtaaaatgtatctaccaacaatctcacacctagccttgaga 45332971  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgaga 248  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45332972 cttttttgtctcccacacatagccttgaga 45333001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Original strand, 47685250 - 47685477
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  47685250 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaattcagtggtattcaattgagattttgctcaacttaaaaattgtctattggtattc 47685349  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  47685350 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatagattttgcgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaacttgaga 47685449  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttga 246  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  47685450 cttttttgtctcccacacatagccttga 47685477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 45340462 - 45340691
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  45340462 gtattcaattaggattttcagaattttttaatgagtccaataaaatccagaggtattcaattgagattttacacaacttaaaaattgtctattggtattc 45340561  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45340562 aaaattctaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgaaactttttagtgtaaaatgtatctaccaacaatctcacacctagccttgaga 45340661  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgaga 248  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45340662 cttttttgtctcccacacatagccttgaga 45340691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 42720825 - 42721055
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42720825 gtattcaattaggattttcagaattttttaatgagtccaataaaatccagaggtattcaattgagattttacacaacttaaaaattgtctattggtattc 42720924  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42720925 aaaattctaaggattttaatgggttgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtatctaccaacaatctcacacctagccttgaga 42721024  T
Q  219 c-ttttctggctcccacacatagccttgaga 248  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  42721025 ctttttttgtctcccacacatagccttgaga 42721055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 252
Target Start/End: Original strand, 26336195 - 26336407
Alignment:
Q  40 gattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatg 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  26336195 gattttttaatgagtccaataaaatccagaggtattcaattgagattttacacaacttaaaaattgtttattggtattcaaaattctaaggattttaatg 26336294  T
Q  140 gattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggctcccacacata 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26336295 gattattgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtatctaccaacaatctcacacctagccttgagacttttttgtctcccacacata 26336394  T
Q  240 gccttgagatttt 252  Q
    |||||||||||||    
T  26336395 gccttgagatttt 26336407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33450158 - 33449944
Alignment:
Q  18 agtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  33450158 agtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaattcggtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtatt 33450059  T
Q  118 caaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgag 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |     
T  33450058 caaaattctacggattttaatggattattgtgagtaatggattttgtgagacattttagtgtaaaatgtatctactaacaatctcacacatagcctcaac 33449959  T
Q  218 acttttctggctccc 232  Q
    ||||||||| |||||    
T  33449958 acttttctgtctccc 33449944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 54509821 - 54510050
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattca 119  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  54509821 tattcaattaggattttcataattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattca 54509920  T
Q  120 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagac 219  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  54509921 aaattgtaaggattttaatggattgttatg---aatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaggc 54510017  T
Q  220 -ttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
     |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  54510018 tttttttgtctcccacacatagctttgagattt 54510050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 40143882 - 40144098
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  40143882 gtattcaattaggattttcatgattttttaataagtccaataaaattcagaggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattc 40143981  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || | ||||||||||||||                |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40143982 aaaattgtaagaattttaatggattg----------------ttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacttaaccttgaga 40144065  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40144066 cttttttgtctcccacacatagccttgagattt 40144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 268
Target Start/End: Original strand, 7820239 - 7820402
Alignment:
Q  90 cataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacc 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||                ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  7820239 cataacttaaaaattgtctactagtattcaaaactctacggattttaatgaatt----------------tttatgagattgtttagtgtaaaatgcacc 7820322  T
Q  190 tactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggctcccacacatag-ccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7820323 tactaacaatctcacacctagcctggagacttttctgtctcccacacatagcccttgggattttgtattactcttccaaa 7820402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 108
Target Start/End: Original strand, 5117067 - 5117156
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtct 108  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  5117067 gtattcaattaagattttcaggactttttaaagagttcaatgaaatccggtggtattccatcaagatttttcgcaacttaaaaattgtct 5117156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Original strand, 7820202 - 7820240
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtcca 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7820202 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtcca 7820240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 38230928 - 38231036
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| | | |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  38230928 tggtattcaattgagatttctcatgacttatgaattgtccattggtattcaaaagtctatagattttgatggattcttggatggaatggattttgtgaga 38231027  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  38231028 ctttttagt 38231036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 53272056 - 53272164
Alignment:
Q  60 gaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggat 159  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||  | ||||| ||| |||||| | |||||||||| | |||  ||||||||||||| || |  | | |||||    
T  53272056 gaaatccggtggtattcaaatgagactttggctgacttataaaatgtctattggtattcaaaagtatacatattttaatggattcttttatggagtggat 53272155  T
Q  160 tttgtgaga 168  Q
    |||||||||    
T  53272156 tttgtgaga 53272164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26882804 - 26882555
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26882804 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 26882705  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26882704 aaaactctacagattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtatatactaacaatctcacacctagccttgaga 26882605  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26882604 cttttctatcacccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 26882555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 45318566 - 45318815
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45318566 gtattcaattaggattttcaagattttctaatgaatccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 45318665  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45318666 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 45318765  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45318766 cttttttatcacccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 45318815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 52705499 - 52705748
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52705499 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactggtattc 52705598  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  52705599 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttggtgtaaaatgtacttactaacaatctcacgcctagccttaaga 52705698  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52705699 cttttctatctcccacacatagccttgagatattgtaatactcttccaaa 52705748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1928382 - 1928149
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  1928382 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattcagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattc 1928283  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1928282 aaaattctaaggattttaatggattgttatgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgcatctactaacaatctcacacctagccttgtga 1928183  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  1928182 cttttttgtctcccacacatagtcttgagatttt 1928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 36402353 - 36402585
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36402353 gtattcaattaggattttcaggattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattggtattc 36402452  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36402453 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacatctaaccttgaga 36402552  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  36402553 cttttttgtctcccacacataactttgagattt 36402585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 29208861 - 29209090
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  29208861 gtattcaattaggattttcaggattttttaatgagtccaataaaatccagaggtattcaattgagattttacacaacttaaaaattgtctattggtattc 29208960  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29208961 aaagttctaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaacatatatctaccaacaatctcacacctagccttgaga 29209060  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgaga 248  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29209061 cttttttgtctcccacacatagccttgaga 29209090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33243288 - 33243060
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  33243288 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtacaataaaatccagtggtattcaattgagattttgtacaacttaaaaattgtctattggtattc 33243189  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  33243188 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaaactttttaatgtaaattgtacctactaacaatctcacaccta----agaga 33243093  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33243092 cttttttgtctcccacacatagccttgagattt 33243060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33263461 - 33263233
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  33263461 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtacaataaaatccagtggtattcaattgagattttgtacaacttaaaaattgtctattggtattc 33263362  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  33263361 aaaattgtaaggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaaactttttaatgtaaattgtacctactaacaatctcacaccta----agaga 33263266  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33263265 cttttttgtctcccacacatagccttgagattt 33263233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 10896906 - 10897138
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  10896906 gtattcaattaggattttcaggattttttaatgagtctaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcccaacttaaaaattgtctattggtattc 10897005  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10897006 aaaattggtaggattttaatggattgttatgagtaatggattttgtgaaacattttaatgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaca 10897105  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    ||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  10897106 cttttttgtctctcacacatagctttgagattt 10897138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 45534912 - 45535089
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||                        
T  45534912 gtatttaattaggatttttaagattttttaatgagtccaatgaaattcagcggtattcaattgagattttgcataactta-------------------- 45534991  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45534992 --aactctactgattttaatggattgttgtgagtaatggattttttgagattgttgagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacgtagccttgaga 45535089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 129 - 214
Target Start/End: Original strand, 9831782 - 9831867
Alignment:
Q  129 ggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagcctt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9831782 ggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatatacttactaacaatctcacacctaacctt 9831867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Original strand, 9831417 - 9831499
Alignment:
Q  40 gattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaa 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  9831417 gattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcacaacttacaaattgtctattggtattcaaaa 9831499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 9191237 - 9191402
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||||||  | ||||||    
T  9191237 gtattcaattaggattttaatgattttttaaagagtccaacaaaatctggtggtattcaatcaagatttattacaacttaaaaattgtctcttggtattc 9191336  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggatt-gttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaat 184  Q
    |||| | ||  ||||| ||||||||  |||  || |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  9191337 aaaaatgtattgatttcaatggattacttggtag-aatggattttgtgagattttttattttaaaat 9191402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19007508 - 19007400
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| | ||||| |||| ||||  |||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  19007508 tggtattcaattgagatttctcatgacttatgaattgtctattggtattaaaaagtctatagattttgatggattcttggatggaatggattttgtgaga 19007409  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  19007408 ctttttagt 19007400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 48194746 - 48194854
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| | | |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  48194746 tggtattcaattgagatttctcatgacttatgaattgtccattggtattcaaaagtctatagattttgatggattcttggatggaatggattttgtgaga 48194845  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  48194846 ctttttagt 48194854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Original strand, 48203504 - 48203612
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |   |||||||||| ||||  |||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  48203504 tggtattcaattgagatttctcatgacttatgaattgtccataggtattcaaaagtctatagattttgatggattcttggatggaatggattttgtgaga 48203603  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
     | ||||||    
T  48203604 ctttttagt 48203612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 81759 - 81511
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  81759 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctcctggtattca 81660  T
Q  120 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  81659 aaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtatctactaacaatctcacacctaaccttgagac 81560  T
Q  220 ttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81559 ttttctatctctcacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 81511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Original strand, 40410696 - 40410945
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40410696 gtattcaattaggattttcatgattttttaatgagtccaatgaaatctagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctactcgtattc 40410795  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40410796 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagacttgaga 40410895  T
Q  219 cttttctggctcccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40410896 cttttctatctcccacacatagccttgaaattttgtaatacttttccaaa 40410945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6828770 - 6828537
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  6828770 gtatttaattaggattttcaggattttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcacaacttaaaaattgtctattgatattc 6828671  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6828670 aaaattgtaaggattttaatggattgttatgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacatctaaccttgaga 6828571  T
Q  219 c-ttttctggctcccacacatagccttgagattt 251  Q
    | |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  6828570 ctttttttgtctcccacacatagctttgagattt 6828537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Original strand, 17518535 - 17518748
Alignment:
Q  20 tattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccag-tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | | ||||    
T  17518535 tattcaattaggattttcaagattttttaaagagtccaataaaatcccggtggtattcaattaagattttgcacaacttaaaaattgtttattgggattc 17518634  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  17518635 aaaattctacggattttaatggaatgttgcgagtaatggattttgtgagactttttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacccagcctcaaga 17518734  T
Q  219 cttttctggctccc 232  Q
    |||||||| |||||    
T  17518735 cttttctgtctccc 17518748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 10571217 - 10571430
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  10571217 gtattcaattaggattttcaaaattttttaaagagtccaataaaatccggtggtattcaattaagattttgtacaacttaaaaattgtctattggtattc 10571316  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||| |||| | | |||||| ||||||||| || |||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  10571317 aaaattctatgaaatttaatagattgttgtcaggaatggattttgtgaaactttttagtataaaatgtacatactaacaatctcacacctaaccttaaga 10571416  T
Q  219 cttttctggctccc 232  Q
    |||||||| |||||    
T  10571417 cttttctgtctccc 10571430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6902647 - 6902525
Alignment:
Q  21 attcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaa 120  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||  | ||||||||    
T  6902647 attcaattaggattttaatgattttttaaagagtccaacaaaatctggtggtattcaatcaagattttttacaacttaaaaattgtctcttggtattcaa 6902548  T
Q  121 aactctacggattttaatggatt 143  Q
    || | ||  ||||| ||||||||    
T  6902547 aaatgtattgatttcaatggatt 6902525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2276133 - 2276025
Alignment:
Q  69 tggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgaga 168  Q
    |||||||||||| | ||||  ||| |||||  ||||||||| |  ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  2276133 tggtattcaattaaaatttctcatgacttatgaattgtctattgatattcaaaagtctatagattttaatggattcttttgtataatggattttgtgaga 2276034  T
Q  169 ttgtttagt 177  Q
    || ||||||    
T  2276033 ttttttagt 2276025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 34781 - 34543
Alignment:
Q  30 ggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34781 ggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatacagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctgctgatattcaaaactctacg 34682  T
Q  130 gattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgagacttttctggct 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  34681 gattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtatctactaacaatctcacacctaaccttgagacttttctatct 34582  T
Q  230 cccacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34581 ctcacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 34543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21391 - 21192
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  21391 gtatgcaattagaattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctatcggtattc 21292  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctagccttgaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21291 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttatgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacctaaccttgaga 21192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21208 - 21172
Alignment:
Q  232 cacacatagccttgagattttgtaatactcttccaaa 268  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21208 cacacctaaccttgagattttgtaatactcttccaaa 21172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16520 - 16303
Alignment:
Q  19 gtattcaattaggattttcaagattttttaatgagtccaatgaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctacttgtattc 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16520 gtattcaattagtattttcaagaatttttaatgagtccaataaaatccagtggtattcaattgagattttgcataacttaaaaattgtctattagtattc 16421  T
Q  119 aaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaaatgtacctactaacaatctcacacc--tagccttga 216  Q
    |||| ||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16420 aaaattcta------------------tgtgagtaatggattttgtgagattgtttagtgtaaagtgtacctactaacaatctcacacctataaccttga 16339  T
Q  217 gacttttctggctcccacacatagccttgagatttt 252  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  16338 gacttttatgtctctcacacatagccttgaaatttt 16303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1789 - 1705
Alignment:
Q  93 aacttaaaaattgtctacttgtattcaaaactctacggattttaatggattgttgtgagtaatggattttgtgagattgtttagt 177  Q
    |||||| ||| |||||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||| | ||||||    
T  1789 aacttataaaatgtctattggtattcaaaaatctgcagattttaatggattcttttgtagaatggattttgtgagactttttagt 1705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University