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Alignment Overview

Query: NF20663_low_3 (Length: 592)

Name: NF20663_low_3
Description: NF20663
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20663_low_3
NF20663_low_3
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-569)||(30809916-30810476)
chr3 (395-568)||(10853224-10853397)
chr3 (392-571)||(26519632-26519811)
chr3 (395-568)||(23496295-23496461)
chr3 (395-568)||(38172264-38172437)
chr3 (392-568)||(52966766-52966942)
chr3 (392-568)||(53074871-53075046)
chr3 (395-568)||(10334109-10334282)
chr3 (395-568)||(50664730-50664902)
chr3 (395-568)||(15511333-15511505)
chr3 (395-568)||(44224733-44224906)
chr3 (394-562)||(42475679-42475847)
chr3 (395-568)||(3348214-3348387)
chr3 (392-568)||(38340774-38340949)
chr3 (435-568)||(4984592-4984725)
chr3 (395-568)||(20813117-20813289)
chr3 (395-544)||(35425305-35425453)
chr3 (395-568)||(42318301-42318473)
chr3 (400-563)||(21224966-21225129)
chr3 (401-568)||(38125399-38125565)
chr3 (395-541)||(8424714-8424859)
chr3 (395-568)||(30811489-30811661)
chr3 (395-568)||(48189399-48189571)
chr3 (401-568)||(44939373-44939538)
chr3 (395-563)||(16246058-16246224)
chr3 (395-562)||(35930709-35930876)
chr3 (395-528)||(31084179-31084311)
chr3 (472-568)||(55154549-55154645)
chr3 (395-534)||(53179820-53179958)
chr3 (395-541)||(34561079-34561225)
chr3 (428-537)||(29716674-29716783)
chr3 (401-541)||(23207052-23207190)
chr3 (392-528)||(25848001-25848136)
chr3 (401-482)||(31618930-31619011)
chr3 (465-541)||(19877458-19877534)
chr3 (463-563)||(40415258-40415358)
chr3 (395-543)||(49526651-49526799)
chr3 (395-542)||(14651085-14651231)
chr3 (486-541)||(52813277-52813332)
chr3 (459-511)||(10852727-10852779)
chr3 (465-531)||(22737055-22737121)
chr3 (395-541)||(45423753-45423898)
chr3 (463-512)||(7012679-7012728)
chr3 (515-568)||(31618369-31618422)
chr3 (395-511)||(32357482-32357597)
chr3 (464-526)||(29252124-29252186)
chr3 (463-541)||(44225604-44225681)
chr3 (465-541)||(21023201-21023275)
chr3 (395-456)||(22736952-22737013)
chr3 (463-512)||(23918881-23918930)
chr3 (463-544)||(42644301-42644382)
chr3 (463-543)||(25181249-25181328)
chr3 (463-511)||(52931586-52931634)
chr3 (394-449)||(37698465-37698520)
chr3 (373-451)||(41459022-41459099)
chr3 (376-428)||(47517151-47517205)
chr3 (514-544)||(35930878-35930908)
chr3 (463-500)||(38626751-38626788)
chr3 (463-512)||(39981124-39981172)
chr3 (472-512)||(30736172-30736212)
chr3 (400-432)||(55087595-55087627)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (369-568)||(39987921-39988120)
chr5 (369-561)||(8049012-8049204)
chr5 (395-568)||(22482174-22482347)
chr5 (369-568)||(7385886-7386085)
chr5 (395-571)||(41834877-41835053)
chr5 (392-568)||(35760171-35760347)
chr5 (400-568)||(42146298-42146465)
chr5 (392-571)||(3667836-3668015)
chr5 (401-568)||(32454528-32454695)
chr5 (400-568)||(40791024-40791191)
chr5 (395-563)||(13253042-13253209)
chr5 (395-568)||(10058059-10058232)
chr5 (400-568)||(40495312-40495479)
chr5 (395-561)||(2430258-2430423)
chr5 (395-568)||(32030701-32030872)
chr5 (400-568)||(5710340-5710507)
chr5 (395-563)||(24045816-24045983)
chr5 (395-568)||(40885195-40885369)
chr5 (395-563)||(7714925-7715093)
chr5 (395-563)||(9275443-9275611)
chr5 (401-563)||(4292140-4292302)
chr5 (395-563)||(27021113-27021281)
chr5 (395-557)||(41740558-41740720)
chr5 (395-543)||(3060203-3060349)
chr5 (395-541)||(7178763-7178908)
chr5 (393-563)||(34106906-34107076)
chr5 (401-569)||(33953855-33954022)
chr5 (395-541)||(16158446-16158592)
chr5 (395-544)||(2694738-2694887)
chr5 (410-484)||(28869541-28869615)
chr5 (486-543)||(35847869-35847926)
chr5 (422-541)||(23914235-23914354)
chr5 (463-541)||(2483695-2483773)
chr5 (419-529)||(20068923-20069033)
chr5 (490-542)||(16843609-16843661)
chr5 (463-541)||(19784866-19784944)
chr5 (409-511)||(41959460-41959561)
chr5 (463-512)||(22811079-22811128)
chr5 (376-430)||(19784778-19784833)
chr5 (463-566)||(33467948-33468051)
chr5 (376-430)||(2868445-2868500)
chr5 (464-526)||(24036627-24036689)
chr5 (463-512)||(2868363-2868412)
chr5 (472-512)||(4569090-4569130)
chr5 (464-512)||(5969957-5970005)
chr5 (503-543)||(33082342-33082382)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (392-568)||(3467509-3467685)
chr8 (395-568)||(22936750-22936923)
chr8 (395-568)||(3097163-3097336)
chr8 (395-569)||(25697916-25698089)
chr8 (395-562)||(41289021-41289188)
chr8 (395-568)||(28425429-28425602)
chr8 (401-543)||(44926826-44926967)
chr8 (395-568)||(6399065-6399238)
chr8 (403-563)||(42143326-42143486)
chr8 (402-563)||(24897550-24897710)
chr8 (395-544)||(27649725-27649873)
chr8 (392-560)||(40742260-40742426)
chr8 (395-563)||(4941743-4941911)
chr8 (395-563)||(36114003-36114170)
chr8 (403-568)||(440146-440311)
chr8 (392-541)||(8124947-8125095)
chr8 (421-563)||(26243129-26243271)
chr8 (402-568)||(33626991-33627157)
chr8 (395-565)||(38152135-38152304)
chr8 (411-544)||(15206691-15206824)
chr8 (395-511)||(43550870-43550986)
chr8 (392-541)||(31246299-31246448)
chr8 (395-568)||(38114424-38114596)
chr8 (395-528)||(40742103-40742236)
chr8 (395-511)||(42148984-42149100)
chr8 (467-568)||(30759262-30759363)
chr8 (441-568)||(25497717-25497844)
chr8 (394-541)||(30081635-30081781)
chr8 (463-569)||(36121501-36121606)
chr8 (376-541)||(3619053-3619217)
chr8 (490-568)||(30085596-30085674)
chr8 (395-570)||(35615688-35615863)
chr8 (486-543)||(3465422-3465479)
chr8 (386-506)||(34342873-34342991)
chr8 (395-571)||(26490912-26491088)
chr8 (392-451)||(41981133-41981192)
chr8 (395-481)||(29023218-29023304)
chr8 (400-544)||(11126500-11126644)
chr8 (501-568)||(29023308-29023375)
chr8 (465-511)||(10552923-10552969)
chr8 (419-529)||(23018099-23018209)
chr8 (463-544)||(36779438-36779518)
chr8 (395-528)||(45147247-45147380)
chr8 (394-541)||(8702392-8702538)
chr8 (463-511)||(19649233-19649281)
chr8 (395-478)||(26125551-26125634)
chr8 (395-512)||(37458312-37458433)
chr8 (462-512)||(42600967-42601017)
chr8 (463-512)||(39219768-39219817)
chr8 (395-451)||(16915040-16915096)
chr8 (501-561)||(26125842-26125902)
chr8 (394-509)||(14382171-14382285)
chr8 (395-541)||(22552724-22552870)
chr8 (394-449)||(24297667-24297722)
chr8 (441-511)||(1373064-1373134)
chr8 (439-541)||(31201649-31201750)
chr8 (463-541)||(38715194-38715271)
chr8 (463-528)||(2071565-2071629)
chr8 (515-544)||(26125826-26125855)
chr8 (463-512)||(33588767-33588816)
chr8 (464-541)||(40792188-40792264)
chr8 (463-511)||(20190186-20190234)
chr8 (503-543)||(26575890-26575930)
chr8 (524-568)||(45147222-45147266)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (400-568)||(1944994-1945162)
chr2 (395-571)||(7472626-7472801)
chr2 (395-568)||(9988456-9988629)
chr2 (392-570)||(2213483-2213661)
chr2 (395-568)||(5916197-5916369)
chr2 (395-568)||(36312257-36312429)
chr2 (392-571)||(28127239-28127418)
chr2 (395-568)||(39141425-39141597)
chr2 (402-544)||(44619040-44619182)
chr2 (427-568)||(2213659-2213800)
chr2 (395-572)||(25747833-25748009)
chr2 (395-568)||(36548180-36548352)
chr2 (395-563)||(14821143-14821310)
chr2 (392-553)||(28261271-28261432)
chr2 (392-563)||(32501963-32502133)
chr2 (395-568)||(8170293-8170465)
chr2 (463-559)||(30007517-30007613)
chr2 (392-571)||(26207881-26208060)
chr2 (394-541)||(42089510-42089661)
chr2 (395-565)||(42515934-42516103)
chr2 (395-544)||(3853880-3854029)
chr2 (395-563)||(31562647-31562812)
chr2 (395-541)||(7296135-7296281)
chr2 (417-544)||(34433285-34433413)
chr2 (395-568)||(2215234-2215405)
chr2 (401-543)||(16467072-16467214)
chr2 (395-544)||(18511082-18511231)
chr2 (395-568)||(23358238-23358410)
chr2 (427-541)||(31224692-31224806)
chr2 (395-541)||(7295330-7295474)
chr2 (395-534)||(8041260-8041397)
chr2 (392-541)||(28641619-28641768)
chr2 (463-543)||(45714648-45714728)
chr2 (463-542)||(41580691-41580770)
chr2 (464-542)||(38600424-38600502)
chr2 (395-512)||(43436292-43436409)
chr2 (486-542)||(23267345-23267401)
chr2 (394-526)||(27911385-27911517)
chr2 (464-563)||(34997196-34997295)
chr2 (463-541)||(12110922-12110999)
chr2 (463-568)||(30599859-30599964)
chr2 (392-512)||(39106680-39106799)
chr2 (395-541)||(3602442-3602587)
chr2 (463-512)||(23359941-23359990)
chr2 (395-500)||(25940264-25940369)
chr2 (392-456)||(2234904-2234967)
chr2 (463-512)||(10918651-10918700)
chr2 (411-544)||(11240667-11240799)
chr2 (463-511)||(23377552-23377600)
chr2 (516-568)||(27911492-27911544)
chr2 (395-541)||(43858194-43858340)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (393-568)||(48510901-48511076)
chr1 (395-568)||(35569160-35569333)
chr1 (395-568)||(1199822-1199995)
chr1 (395-568)||(20800235-20800408)
chr1 (392-568)||(7826312-7826488)
chr1 (395-568)||(42850177-42850350)
chr1 (395-568)||(31223369-31223542)
chr1 (395-568)||(43728836-43729008)
chr1 (395-568)||(13055993-13056165)
chr1 (394-568)||(47123380-47123554)
chr1 (395-563)||(5410635-5410802)
chr1 (392-568)||(6166102-6166277)
chr1 (395-567)||(45710044-45710215)
chr1 (395-568)||(12468208-12468379)
chr1 (395-568)||(50977298-50977470)
chr1 (395-563)||(25230002-25230169)
chr1 (392-526)||(4369803-4369936)
chr1 (395-568)||(10470585-10470757)
chr1 (395-568)||(26058236-26058409)
chr1 (392-563)||(11023293-11023463)
chr1 (415-568)||(27801610-27801763)
chr1 (376-568)||(50406106-50406298)
chr1 (395-563)||(40229433-40229601)
chr1 (395-569)||(6464603-6464776)
chr1 (391-541)||(25061217-25061367)
chr1 (395-544)||(15884221-15884371)
chr1 (395-568)||(12247415-12247587)
chr1 (395-563)||(36205186-36205354)
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[»] chr6 (25 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 30810476 - 30809916
Alignment:
Q  1 aatcgtcgacgatgatctcagagggaaaagggggatgaaaaattgaaaataaatgtttatgaaacaagggggagaagaattgtgtgatgtgaggatgaca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30810476 aatcgtcgacgatgatctgagagggaaaagggggatgagaaattgaaaataaatgtttatgaaacaagggggagaagaattgtgtgatgtgaggatgaca 30810377  T
Q  101 tcgagagatatggagagaagaaaaagcataatcaaagatgtaaatttgaggtatgaagctatcgaatttctgaaaaatggagagtggcaccattgagaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30810376 tcgagagatatggagagaagaaaaagcagaatcaaagatgtaaatttgaggtatgaagctatcgaatttttgaaaaatggagagtggtaccattgagagt 30810277  T
Q  201 gaagcagagtcaaagatgtaaagggtgatgatt---ttttatttgttttataactttgga-nnnnnnnnnnngttctctttctactgtt-ggttggaata 295  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||| ||||             |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30810276 gaagcagaatcaaagatgtaaagggtgatgattttttttttttttttttataactatggattttttttcttctttctctttctactgttgggttggaata 30810177  T
Q  296 ttattgtttcacatggggagttagctcacacaaaaaagagggtgtgtgattttattttatatatatt--tgtgttaagacctttttggtaatttacactt 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30810176 ttattgtttcacatggggagttagctcacacaaaaaagagggtgtgtgattttattttatgtatatttatgtgttaagacctttttggtaatttacactt 30810077  T
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30810076 taaaagtaattttgattcaaactatccaaacatcatcaatttataagaatcacttttaagtaagcgtaatcaatcataaatcaattcacatttaactcac 30809977  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 569  Q
    |||||||               ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30809976 ttttaac---------------caaactcaattttatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 30809916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 10853397 - 10853224
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  10853397 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaatttatattaaactcact 10853298  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||    
T  10853297 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgctataccaaacacacac 10853224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 571
Target Start/End: Original strand, 26519632 - 26519811
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26519632 tttaaaatcaattttgtttcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 26519731  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  26519732 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacacata 26519811  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 23496295 - 23496461
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23496295 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccgcaagaatcactttta-------gtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 23496387  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23496388 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcctcgccgccataccaaacacacac 23496461  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 38172437 - 38172264
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  38172437 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcccactcact 38172338  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  38172337 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 38172264  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 52966942 - 52966766
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  52966942 tttaaaatcaattttgattcaacctatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaagtc 52966843  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||| |||||||| ||||    
T  52966842 acttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccacctccaaaccaaacacacac 52966766  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 53074871 - 53075046
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  53074871 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactc 53074969  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||    
T  53074970 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttcaccgccgccgtatcaaacacacac 53075046  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 10334109 - 10334282
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  10334109 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcatattcaactgact 10334208  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||    
T  10334209 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccatatcaaacacacac 10334282  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 50664730 - 50664902
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||| || || |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50664730 aaaatcaattttaatttaaactatctaaacaacat-aactcttaagaatcacttctaagtgtgtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 50664828  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  50664829 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 50664902  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 15511505 - 15511333
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15511505 aaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactcact 15511407  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  15511406 tttaaccaaaatcaattctttcaaactccgttctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacacacac 15511333  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 44224733 - 44224906
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  44224733 aaaatcaattttgactaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 44224832  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44224833 tttaaccataatcaattatctcaaactcaattctaccggaatcaattctccccgccgccaaaccaaacaaacac 44224906  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 394 - 562
Target Start/End: Original strand, 42475679 - 42475847
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| |||  |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42475679 taaaagcaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtattcaaacaaaaatcaattcacatctaactcac 42475778  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  42475779 ttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctataaaaatcaattctcgtcaccgccaaaccaaac 42475847  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 3348214 - 3348387
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  3348214 aaaatcaattttgatataaaatatccaaacaacatcaactcataagaattacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaatttacatccaactcact 3348313  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||    
T  3348314 tctaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgctatgccaaacacacac 3348387  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 38340774 - 38340949
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38340774 tttaaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacgtcaacttataaaaattacttttaa-taagcatatccaaacataaatcaattcacatccaactc 38340872  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  38340873 acttttaaccaaaatcaattctttcaaacttcattctatcaaaatcaattctcaccaacgccataccaaacacacac 38340949  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 435 - 568
Target Start/End: Original strand, 4984592 - 4984725
Alignment:
Q  435 cataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaa 534  Q
    ||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||    
T  4984592 cataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactcacttttaaccaaaatcaattttctcaaattcaattatatcaaa 4984691  T
Q  535 atcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4984692 atcaattctccccaccgccataccaaacacacac 4984725  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 20813117 - 20813289
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||  || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  20813117 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttgaataagtatatccaaacaaaaatcaattcaaatccaactcact 20813216  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||    
T  20813217 tttaaccaaacacaattctctcaaactc-attctatcaaaatcaattctctccaccgatataccaaacacacac 20813289  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Original strand, 35425305 - 35425453
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |    ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35425305 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcact 35425403  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35425404 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 35425453  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 42318301 - 42318473
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||    
T  42318301 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcact 42318399  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||| ||||    
T  42318400 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgtcaccgctataccaaacacacac 42318473  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 21224966 - 21225129
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  21224966 caattttgattcaaactatcaaaacgacatcaactcgtaagaatcgcttttaagaaagtgtatccaaacatatatcaatttacatcaaactcacttttaa 21225065  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21225066 ccaaaatcaattctctcaaactcaattctatagagatcaattctcgccgccgctaaaccaaaca 21225129  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 38125565 - 38125399
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  38125565 aattttgattcaaactatccaaacgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaacccacttttaac 38125467  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  38125466 caaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccataccaaacacacac 38125399  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 8424859 - 8424714
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  8424859 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaacataa-tcaattcacgttcaactcact 8424761  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8424760 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaattcaatt 8424714  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 30811661 - 30811489
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |    ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30811661 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaagtcataagaatcacttctgttaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcact 30811563  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||    
T  30811562 tttaatcaaaatcaattctctcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccgccctaccaaacacacac 30811489  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 48189571 - 48189399
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    | | ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  48189571 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacataa-tcaatttacattcaactcact 48189473  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||    
T  48189472 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccctaccaaacacacac 48189399  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 44939538 - 44939373
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||     
T  44939538 aattttgattaaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttata-gtaaatgtatccaaacataa-tcaattcatattcaactcacttttaat 44939441  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||    
T  44939440 caaaatcaattcactcaaattcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacac 44939373  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 16246224 - 16246058
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||   ||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16246224 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcctaagaatcacttctattaaagtgtttccaaacataaatcaatttacatctaactcact 16246125  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  16246124 tttaactaaaatcaatt--ctcaaactcaattctattaatatcaattctcgctaccgccaaaccaaaca 16246058  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 395 - 562
Target Start/End: Original strand, 35930709 - 35930876
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||  | || ||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  35930709 aaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattatcaactcataagaatgacttatacattagtgtatccaagcataaatcaattcatatcaaactcact 35930808  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  35930809 tttaataaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgatataccaaac 35930876  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 528
Target Start/End: Original strand, 31084179 - 31084311
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31084179 aaaatcaattatgattcaaactatccaaataatatcaagtcataagaatcacttttaag-aagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 31084277  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  31084278 tttaatcaaaatcaattctttcaaaatcaattct 31084311  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 472 - 568
Target Start/End: Original strand, 55154549 - 55154645
Alignment:
Q  472 aatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||    
T  55154549 aatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccactgccataccaaacacacac 55154645  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 534
Target Start/End: Original strand, 53179820 - 53179958
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  53179820 aaaatcaattttgatttaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcact 53179918  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaa 534  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  53179919 tttaaccaaaatcaattatataaaactcaattctatcaaa 53179958  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Original strand, 34561079 - 34561225
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||| || ||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34561079 aaaatcaattttgggtcaaactatccaaccaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcgcattcaactcact 34561178  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34561179 tttaaccaaaatcaattttatcaaacttaattctatcaaaatcaatt 34561225  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 428 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 29716783 - 29716674
Alignment:
Q  428 atcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattc 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  29716783 atcaattcataagaatcacttttaattaaacgtgtctataaataaatcaattcatatttaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattt 29716684  T
Q  528 tatcaaaatc 537  Q
    ||||||||||    
T  29716683 tatcaaaatc 29716674  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 401 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 23207190 - 23207052
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  23207190 aattttgattcaaactatc-aaacaacatcaactcataa-aatcacttgtaaaaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcatttttaac 23207093  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||    |||| |||||| ||||||||||||||    
T  23207092 caaaatcaattataacaaaatcaattatatcaaaatcaatt 23207052  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 392 - 528
Target Start/End: Original strand, 25848001 - 25848136
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25848001 tttaaaatcaatttttattcaa-ctatccaaacaacacaaactcataagaatcatttttaagtgaaggtatccaaacataaatcaattcatattaaactc 25848099  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  25848100 actttttaccaaaattaattttctcaaactcaattct 25848136  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 401 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 31619011 - 31618930
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcac 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  31619011 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctaagtgagagtatccaaacataaatcaattcac 31618930  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 465 - 541
Target Start/End: Original strand, 19877458 - 19877534
Alignment:
Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19877458 aaacataaatcaatttacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaataaatt 19877534  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 40415358 - 40415258
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  40415358 ccaaacataaattaatttacatccaactcacttttaactaaaatcgattcctttaaactcaattctatcaaaatcaattctcctagccggcaaaccaaac 40415259  T
Q  563 a 563  Q
    |    
T  40415258 a 40415258  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 395 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 49526799 - 49526651
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||| ||| |||| |||||||||| |||||  | |  ||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||    
T  49526799 aaaagcaattttgatttagactatttaaacaacataaattgataagaatcaattttacatgaatgtatccaaacataaatcaatttacaatcaattcact 49526700  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  49526699 tttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaatttcatcaaactcaattct 49526651  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 395 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 14651231 - 14651085
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||  ||| |||||||| || |||||  || | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||    
T  14651231 aaaagctattttgattcaaattatccaaacaacttgaattggtaaaaatcacttctatgtaagtatatcaaaacacaaatcaatt-atattcaactcact 14651133  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  14651132 tttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaattttattaaaatcaattc 14651085  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 541
Target Start/End: Original strand, 52813277 - 52813332
Alignment:
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52813277 taactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaatt 52813332  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 459 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 10852779 - 10852727
Alignment:
Q  459 gtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10852779 gtagccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 10852727  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 531
Target Start/End: Original strand, 22737055 - 22737121
Alignment:
Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatc 531  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22737055 aaacataaatcaatttacattctacttacttttaaccaaaatcaattttttcaaactcaattctatc 22737121  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 45423898 - 45423753
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  | |   || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||    
T  45423898 aaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatgaattgataagaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaatt-aagttcaactcact 45423800  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||  ||||||||||||  ||| | |||||| |  |||||||||||    
T  45423799 tttaggcaaaatcaattctatcagaatcaattatgccaaaatcaatt 45423753  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 7012679 - 7012728
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7012679 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 7012728  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 515 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 31618422 - 31618369
Alignment:
Q  515 tcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31618422 tcaaactcaattctatcaaaatcaattcttcccaccgtcataccaaacacacac 31618369  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 511
Target Start/End: Original strand, 32357482 - 32357597
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | || ||   |||||||||||||||| ||||  || ||||     
T  32357482 aaaatcaattttaattcaaagtacccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaaatgagtgttttcaaacataaatcaatttacatcaaattcac- 32357580  T
Q  495 tttaaccaaaatcaatt 511  Q
    || ||||||||||||||    
T  32357581 ttcaaccaaaatcaatt 32357597  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29252186 - 29252124
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  29252186 caaacataaatcaatttacaattaactcacttttgatcaaaatcaattcaatcaaaatcaatt 29252124  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Original strand, 44225604 - 44225681
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  44225604 ccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaacgaaaatcaattc-tacaaaatcaattatattaaaatcaatt 44225681  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 21023275 - 21023201
Alignment:
Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||   |  || |||||||||||||||||||||    
T  21023275 aaacataaatcacttcaaattcaactcacatttaaccaaaatcaatt--ttacaaatcaattctatcaaaatcaatt 21023201  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 456
Target Start/End: Original strand, 22736952 - 22737013
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaa 456  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  22736952 aaaatcaattttgattcaaaccatcccaacaacattaactcataataatcacttttaagtaa 22737013  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 23918881 - 23918930
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23918881 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaattaattc 23918930  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 544
Target Start/End: Original strand, 42644301 - 42644382
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||     ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  42644301 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaactaaaatcaatttttataaaatcaattcactcaaaatcaattctc 42644382  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 543
Target Start/End: Original strand, 25181249 - 25181328
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  25181249 ccaaacataaataattttacattaaactcacttttaatcaaaatcaattc-tacaaaatcaattcaatcaatatcaattct 25181328  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 52931634 - 52931586
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  52931634 ccaaacataaatcaatttacactaaactcacttttaactaaaatcaatt 52931586  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 37698520 - 37698465
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttt 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||    
T  37698520 taaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatacattactaagaatcacttt 37698465  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 451
Target Start/End: Original strand, 41459022 - 41459099
Alignment:
Q  373 cctttttggtaatttacacttt-aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttta 451  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  41459022 cctttttggtaatt-acacattcaaaatcaatttt-attcaaattatccaaacaccatgaattgataagaatcactttta 41459099  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 47517205 - 47517151
Alignment:
Q  376 ttttggtaatttacactttaaaagcaattttg--attcaaactatccaaacatca 428  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  47517205 ttttggtaatttacaatttagaagcaattttggttttcaaactatccaaacatca 47517151  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 514 - 544
Target Start/End: Original strand, 35930878 - 35930908
Alignment:
Q  514 ctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35930878 ctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 35930908  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 500
Target Start/End: Original strand, 38626751 - 38626788
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38626751 ccaaacataaatcatttcacattcaactcacttttaac 38626788  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 39981124 - 39981172
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39981124 ccaaacataaaccacttc-catttaactcacttttaactaaaatcaattc 39981172  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 512
Target Start/End: Original strand, 30736172 - 30736212
Alignment:
Q  472 aatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  30736172 aatcaattcacatacaactcacttttaactaaaatcaattc 30736212  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 400 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 55087627 - 55087595
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55087627 caattttgattcaaactatccaaacaacatcaa 55087595  T

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Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 369 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 39988120 - 39987921
Alignment:
Q  369 aagacctttttggtaatttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaac 468  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  39988120 aagaccctttttgtaatttacactttaaaagaaattttgatttaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaac 39988021  T
Q  469 ataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  39988020 ataaatcaattcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccggtataccaaacacacac 39987921  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 369 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 8049204 - 8049012
Alignment:
Q  369 aagacctttttggtaatttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaac 468  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  8049204 aagaccctttttgtaatttacactttaaaagcaattttgatttaaatcatccaaacaacaacaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaac 8049105  T
Q  469 ataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaa 561  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8049104 ataaatcaattaacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgctataccaaa 8049012  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 22482174 - 22482347
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22482174 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 22482273  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22482274 tttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 22482347  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 369 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 7386085 - 7385886
Alignment:
Q  369 aagacctttttggtaatttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaac 468  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||   ||||    
T  7386085 aagacccttttggtaatttacactttaaaagcaattttgatttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatttaaac 7385986  T
Q  469 ataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  7385985 ataaatcaattcacctcaaacccacttttaaccaaaatcaattctctaaaacttaattctatcaaaatcaattctcaccgccgctatactaaacacacac 7385886  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 395 - 571
Target Start/End: Original strand, 41834877 - 41835053
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  41834877 aaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcact 41834976  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41834977 tttaaccaaaatcaattctctcaaactgaattctatcaaaatcaattctccccaccgccataccaaacacacacata 41835053  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 35760171 - 35760347
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35760171 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcagttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 35760270  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  35760271 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacac 35760347  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 400 - 568
Target Start/End: Original strand, 42146298 - 42146465
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  42146298 caattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataa-tcaattcatatctaactcacttttaa 42146396  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42146397 ccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtcataccaaacacacac 42146465  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 392 - 571
Target Start/End: Original strand, 3667836 - 3668015
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3667836 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 3667935  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| |||||||    
T  3667936 actttttaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccactataccaaacacacacata 3668015  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 32454528 - 32454695
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  32454528 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacat-aatcaattcacctcaaactcacttttaac 32454626  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattct-atcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  32454627 caaaatcaattctctcaaactcaattctaatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 32454695  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 400 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 40791191 - 40791024
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  40791191 caattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataa-tcaattcatatctaactcacttttaa 40791093  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  40791092 ccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgtgataccaaacacacac 40791024  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 13253209 - 13253042
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  13253209 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaattcatattcaactcact 13253111  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  13253110 tttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgcccaaccaaaca 13253042  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 10058059 - 10058232
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||| ||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||    
T  10058059 aaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcatttccaactcact 10058158  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  10058159 tttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattctccccaccgccatactaaacacacac 10058232  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 400 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 40495479 - 40495312
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  40495479 caattttgatttaaactattcaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaa 40495381  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40495380 ccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattcttcccgccgccataccaaacacacac 40495312  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 395 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 2430423 - 2430258
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  2430423 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattgaagtgtatccaaacataa-tcaattcatgttcaactcact 2430325  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaa 561  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  2430324 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattccatcaaaatgaattctcgccaccgccataccaaa 2430258  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 32030701 - 32030872
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||  || | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  32030701 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaa--cataagaatcacttttgaataagtatatcaaaacaaaaatcaattcacatctaacttact 32030798  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||    
T  32030799 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccactataccaaacacacac 32030872  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 400 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 5710507 - 5710340
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  5710507 caatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaa-taagcgtatccaaacataaagcaattcacaccaaactcacttttaa 5710409  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  5710408 ccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 5710340  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 24045816 - 24045983
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  24045816 aaaatcaattttaattcaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtgagagcatccaaacataaatcaattcacatcagactcact 24045914  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24045915 tttaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaaca 24045983  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 40885195 - 40885369
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaa-tcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40885195 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaactcacttttaaacaagtgtgtccaaacataaatcaattcacatccaactcac 40885294  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  40885295 ttttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattctaacaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacacacac 40885369  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 7714925 - 7715093
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Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||| || ||  | ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  7714925 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacttataagaatcaatttcaagtgagtgtgtcaaaacatatatcaattcatatctaactcact 7715024  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||    
T  7715025 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttaccaccgccatacaaaaca 7715093  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 9275611 - 9275443
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||| ||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||   ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9275611 aaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttattaaagtgtatccaaacataaatcaattaacatctaactcact 9275512  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  9275511 tttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattttatcaaaatcaattttccccaccgccaaaccaaaca 9275443  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 563
Target Start/End: Original strand, 4292140 - 4292302
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||   | ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||     
T  4292140 aattttgattcaaattatccaaacaatatcaaccaacaagaatcacttctaattaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaacttatttttaat 4292239  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  4292240 caaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattcttcctgccgccatcccaaaca 4292302  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 27021113 - 27021281
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaact-atccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27021113 aaaatcaattttgattcaatcttatccaaacaacatcaacttctaagaatcacttttaagtgagtata-ccaaacataaatcaattcacatttaactcat 27021211  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||    
T  27021212 ttttaaccaaaatcaattttctcaaactcaattatatcaaaatcagttctaaccaccgccaaaccaaaca 27021281  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 41740720 - 41740558
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||  |||||||||| |||||||  |  |||||||     
T  41740720 aaaatcaattttgatttaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcacttttaaacaagtgtattcaaacataaaccaattcatctcaaactcacc 41740621  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccatac 557  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  41740620 tataatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccggcatac 41740558  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 395 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3060349 - 3060203
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  3060349 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaatcacttt-aagtgagtatatccaaacataaattaattcatataaaactcact 3060252  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3060251 tttaatcaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattct 3060203  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Original strand, 7178763 - 7178908
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7178763 aaaagcaattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcact 7178861  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7178862 tttagtcaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 7178908  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 393 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 34107076 - 34106906
Alignment:
Q  393 ttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactca 492  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |  |||   |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34107076 ttaaaagtaattttgattcaacctattcaaacaacattaattcataagaattacttttaaatgaatgtatttaaacattaatcaattcacatctaactca 34106977  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||    
T  34106976 cttttaaccaaaaacaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaattttgtctgccgccaaaccaaaca 34106906  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 401 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 33954022 - 33953855
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| ||   ||| ||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||     
T  33954022 aattttgattcaaactatccgaacaacatcaactcatcagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaatttacgttcaactcacttttaaa 33953924  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 569  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||| |||||    
T  33953923 taaaatcaattctctcaaactcaattctaccaaaatcaattttcaccactgccataccaaacacacaca 33953855  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 16158592 - 16158446
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||| | | ||||| |||||| |||||||||  ||||||||    
T  16158592 aaaatcaattttgattcaaatcatccaaagaacatcaattcctaagaatcacttttaaaaaagtgcatccaaatataaattaattcacatcaaactcact 16158493  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16158492 tttaatcaaaatcaattctttcaaactcaaatctataaaaatcaatt 16158446  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2694887 - 2694738
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |   || | ||| |||||| |||| |   | ||||||||    
T  2694887 aaaatcaattttgattcaaattatacaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaagttatctaaaaataaattaatttatgatcaactcact 2694788  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  2694787 tttaaccaaaatcaattcaatcaaaatcaattctgacaaaatcaattctc 2694738  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 410 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 28869615 - 28869541
Alignment:
Q  410 tcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacat 484  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  28869615 tcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtaagtgtattcaaacataaatcaatccacat 28869541  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 486 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35847926 - 35847869
Alignment:
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35847926 taactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattct 35847869  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 23914354 - 23914235
Alignment:
Q  422 aacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaact 521  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||| |  | ||| |||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||  | ||||||||| |||||| |    
T  23914354 aacatcgttaatacataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaacgtaaatcaattcatatccaactcaattttaagtataatcaattctctcaaaat 23914255  T
Q  522 caattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23914254 caattctatcaaaatcaatt 23914235  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 2483773 - 2483695
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||| | || |||||||||    
T  2483773 ccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaactaaaatcaattccaacaaaatcaattatgtccaaatcaatt 2483695  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Original strand, 20068923 - 20069033
Alignment:
Q  419 ccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaa 518  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||||   | || ||| |||||||||||| |||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20068923 ccaaacaaaatcaattaacaagaatcacttttgcattagtgtatccaaacataaataaatttaaactcaactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaa 20069022  T
Q  519 actcaattcta 529  Q
    |||||||||||    
T  20069023 actcaattcta 20069033  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 490 - 542
Target Start/End: Original strand, 16843609 - 16843661
Alignment:
Q  490 tcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16843609 tcacttttaaccaaaatctattcgttcaaactcaattatatcaaaatcaattc 16843661  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Original strand, 19784866 - 19784944
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19784866 ccaaacataaaccactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcaaataaaatcaattcaatcaaaatcaatt 19784944  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 409 - 511
Target Start/End: Original strand, 41959460 - 41959561
Alignment:
Q  409 ttcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatca 508  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  41959460 ttcaaactatgaaaacaacattaactcataagaatcacttttatgtg-gtgtttccaaacataaattaattcacttttaactcacttttaactaaaatta 41959558  T
Q  509 att 511  Q
    |||    
T  41959559 att 41959561  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 22811079 - 22811128
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22811079 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 22811128  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 430
Target Start/End: Original strand, 19784778 - 19784833
Alignment:
Q  376 ttttggtaatttacac-tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatc 430  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  19784778 ttttggtaatttacacatttaaaagcaattttgatcaaaactatccaaacaacatc 19784833  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 33468051 - 33467948
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    ||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| | | ||||||||||||  || ||| || |||||||    
T  33468051 ccaaacacaaatcaatatacactcaactcacttttaaccaaaatcagttctatcaaaatcaattttgttaaaatcaattctaaccaccgtcaaaccaaac 33467952  T
Q  563 atac 566  Q
    ||||    
T  33467951 atac 33467948  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 2868500 - 2868445
Alignment:
Q  376 ttttggtaatttacactt-taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatc 430  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2868500 ttttggtaatttacacacctaaaagcaattttgattcaagctatccaaacaccatc 2868445  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 526
Target Start/End: Original strand, 24036627 - 24036689
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  24036627 caaacataaatcattttacattcaactcacttttcatcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 24036689  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2868412 - 2868363
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2868412 ccaaacttaaatcactttacattcaactcacttttaactaaaatcaattc 2868363  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4569130 - 4569090
Alignment:
Q  472 aatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4569130 aatcaattcacactcaactcacttttaatcaaaatcaattc 4569090  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5970005 - 5969957
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  5970005 caaacataaatcactttacattcaactcacttatatccaaaatcaattc 5969957  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33082382 - 33082342
Alignment:
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33082382 aaatcaattctctcaaaatcaattctatcagaatcaattct 33082342  T

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Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 3467509 - 3467685
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3467509 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaccaacatcaattcataagaatcacttttaaataaatatatccaaacagaaatcaattcacattcaactc 3467608  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  3467609 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 3467685  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 22936923 - 22936750
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22936923 aaaaccaaatttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 22936824  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  22936823 tttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 22936750  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 3097336 - 3097163
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  3097336 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 3097237  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || |||||||||| ||||    
T  3097236 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccactgctataccaaacacacac 3097163  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 395 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 25698089 - 25697916
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  25698089 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 25697991  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 569  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || |||||    
T  25697990 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgctataccaagcacacaca 25697916  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 41289188 - 41289021
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41289188 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacctataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacaatcaactcact 41289089  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41289088 tttaattaaaatcaattctctcaaactcaattctgtcaaaatcaattctcgccgccgccaaaccaaac 41289021  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 28425602 - 28425429
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  28425602 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttgtaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 28425503  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||    
T  28425502 tttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccaccgtcataccaaacacacac 28425429  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 401 - 543
Target Start/End: Original strand, 44926826 - 44926967
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  44926826 aattttgattcaaactatccaaataacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcacttttaac 44926924  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44926925 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattct 44926967  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6399238 - 6399065
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6399238 aaaatcaattttgattaaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgtatcgaaacataaatcaattcacatcaaactcact 6399139  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||  | | ||||||| |||||||| ||||    
T  6399138 tttaaccataatcaattctatcaaactcaattctaccagaatcaattaactctgccgccaaaccaaacacacac 6399065  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 403 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 42143486 - 42143326
Alignment:
Q  403 ttttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacca 502  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |    
T  42143486 ttttgtttcaaattatccaaacaacgtcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcacttttaacta 42143387  T
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42143386 aaatcaattttctcaaactcaattatatcataatcaattctcgccaccgccataccaaaca 42143326  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 402 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 24897710 - 24897550
Alignment:
Q  402 attttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacc 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  24897710 attttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaaataaatgtatccaaacataattca-ttcatatccaactcacttttaacc 24897612  T
Q  502 aaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24897611 aaaatcaattctcataaactcaattttatcaaaatcaattcttaccgccgccataccaaaca 24897550  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Original strand, 27649725 - 27649873
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||| | |||||||  |||||||| ||  || |||||    
T  27649725 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaatgagtgtatctaaacatat-tcaattcatatccaaatcact 27649823  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27649824 tttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 27649873  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 392 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 40742426 - 40742260
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  | || ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  40742426 tttaaaatcaattttgatttaaaatatccaaacatcatcaactcataagaatcacttaca--ttagtgtatccaaacataaatcaattcagatcaaactc 40742329  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaa 560  Q
    ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  40742328 acttttaacgaaaatcaattcttttaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgtcgctataccaa 40742260  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 4941911 - 4941743
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||   || |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  4941911 aaaatcaattttaattcaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcgcttttaaataattttatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 4941812  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4941811 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattatatcagaatcaattctagccaccgccataccaaaca 4941743  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 36114170 - 36114003
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||  ||||  ||||  |||| |||    
T  36114170 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatatcaactcataagaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataac-caatctacatcaaacttact 36114072  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  36114071 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgtcataccaaaca 36114003  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 403 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 440311 - 440146
Alignment:
Q  403 ttttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacca 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||| |||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  440311 ttttgattcaatctatccaaacaacgttaactcataagaatcatttttaactgaatgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcacatttaacca 440212  T
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||| ||||    
T  440211 aaatcaattctctcagactcaattctatcaaaatcaattatctccgccgtccaaccaaacacacac 440146  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 541
Target Start/End: Original strand, 8124947 - 8125095
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  8124947 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacttcaactcctaagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacat-aatcaattcacatcaaactc 8125045  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  8125046 acttctaaccaaaatcaattctctcaaactcgattcaaccaaaatcaatt 8125095  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 421 - 563
Target Start/End: Original strand, 26243129 - 26243271
Alignment:
Q  421 aaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaac 520  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||   || ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  26243129 aaacatcaccaactcataagaatcacttttaaacaattatatccaaacataaatcaattcatatcaaactcacttttaacaaaaatcaattctcttaaac 26243228  T
Q  521 tcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  26243229 tcaattctatcaaaatcaattctcactgccgctataccaaaca 26243271  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 402 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 33627157 - 33626991
Alignment:
Q  402 attttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||      
T  33627157 attttgattcaaactatccaaacaacattaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcttatccaactcagttttaaat 33627058  T
Q  502 aaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||| ||||    
T  33627057 aaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattccctccaccgccgaaccaaacacacac 33626991  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 395 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 38152304 - 38152135
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  38152304 aaaatcaattttgatttaaagtatccaaaccacatcaactcataagaatcatttttaagtaaatatttccaaacataaatcaatttacatcaaactcact 38152205  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacata 565  Q
    || ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  38152204 tt-aactaaaatcaattttctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcaccgccaccaaaccaaacata 38152135  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 411 - 544
Target Start/End: Original strand, 15206691 - 15206824
Alignment:
Q  411 caaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaat 510  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15206691 caaactatccaaacaacatgaatttttaagaatcacttctaagtcaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttacccaaaatcaat 15206790  T
Q  511 tcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15206791 tttgtcaaactcaattctatcaaaattaattctc 15206824  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 511
Target Start/End: Original strand, 43550870 - 43550986
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43550870 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 43550969  T
Q  495 tttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||||||    
T  43550970 tttaaccaaaatcaatt 43550986  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 392 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 31246448 - 31246299
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||   | |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31246448 tttaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 31246349  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||    
T  31246348 acttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 31246299  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 38114424 - 38114596
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||  ||| || ||| |||||| | |||| |||||||||||||||  ||   || ||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||    
T  38114424 aaaatcaatttttgttcgaaatattcaaacaacctcaactcataagaatcacttgaaaccgagtgtatccaaacataa-tcaattcacatccaacttact 38114522  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  38114523 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaataaattctcaccaccgccaaaccaaacacacac 38114596  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 528
Target Start/End: Original strand, 40742103 - 40742236
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||| ||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40742103 aaaatcaagtttcattcaaatcatccaaacaatatcaactcataagaatcaattttattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 40742202  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40742203 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattct 40742236  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 395 - 511
Target Start/End: Original strand, 42148984 - 42149100
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  42148984 aaaatcaattttgattcaaattatctaaacaacatcaactcatacgaatcacttttaaataagtctatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 42149083  T
Q  495 tttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||||||    
T  42149084 tttaaccaaaatcaatt 42149100  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 467 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 30759363 - 30759262
Alignment:
Q  467 acataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatac 566  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||    
T  30759363 acataaatcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatattaaaatcaattcttcccatcgccaaaccaaacacac 30759264  T
Q  567 ac 568  Q
    ||    
T  30759263 ac 30759262  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 441 - 568
Target Start/End: Original strand, 25497717 - 25497844
Alignment:
Q  441 aatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaat 540  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  25497717 aatcacttttaaataagtgtatccaaacataa-tcaattcacatccaactcacttttaaccaaaatcaattctcctaaactcaattttatcaaaatcaat 25497815  T
Q  541 tc-tccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    || | ||| | ||||||||||||| ||||    
T  25497816 tcttaccctcggccataccaaacacacac 25497844  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 394 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 30081781 - 30081635
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||   |||||||||  |||||  || ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30081781 taaaatcaattttgaaacaaactatccaaacaacatcagcccataagaattgcttttgtgtcagcttatccaaacataaatcaattcac-tttaactcac 30081683  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  30081682 ttttaactaaaatcaattttcacaaaatcaattttatcaaaatcaatt 30081635  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 463 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 36121606 - 36121501
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||    
T  36121606 ccaaacataa-tctattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgacaccgctgtaccaaac 36121508  T
Q  563 atacaca 569  Q
    | |||||    
T  36121507 acacaca 36121501  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 376 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 3619217 - 3619053
Alignment:
Q  376 ttttggtaatt-tacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaat 474  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||| |  | |  ||| ||||||| ||||    
T  3619217 ttttggtaattataca-tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatacattgataagaatcactttcatattaatgtatccaaacacaaat 3619119  T
Q  475 caattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||  || | ||||||||||| | || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3619118 caatt-tcactcaactcacttttgatcagaatcaattcattcaaaatcaattctatcaaaatcaatt 3619053  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 490 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 30085674 - 30085596
Alignment:
Q  490 tcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  30085674 tcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattatatcaaaatcaattctcaccgccgctataccaaacacacac 30085596  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 395 - 570
Target Start/End: Original strand, 35615688 - 35615863
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  |||   || |||||| |||||||| |  ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35615688 aaaatcaattttgagccaaactatccaaacaacaagaatatttaggaatcaattttaagtgaatgtatctaaacataaatcaattcccattcaactcact 35615787  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacat 570  Q
    | |  |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||| ||||||    
T  35615788 tctttccaaaatcaatcttgtcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgctgaaccaaacagacacat 35615863  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 486 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3465479 - 3465422
Alignment:
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465479 taactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattct 3465422  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 386 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34342991 - 34342873
Alignment:
Q  386 ttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatt 485  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||   || ||||||| ||||||||||| ||     
T  34342991 ttacacttcaaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatccact-ataagaatcacttttaaataaatttatccaaacaaaaatcaattcatatc 34342893  T
Q  486 taactcacttttaaccaaaat 506  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  34342892 t-actcacttttaaccaaaat 34342873  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 395 - 571
Target Start/End: Original strand, 26490912 - 26491088
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||||||||||| ||   ||||||| |||||  || |||| ||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  26490912 aaaagcaatttttatctcaactatctaaacaaaataaattaataagaatcacttctatataaaggtatccaaacacaaatcaatttacactcaactcact 26491011  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||| |  || ||||||||||   | |||||| |||||||| |||||||    
T  26491012 tttaaccaaaatcaattctaccaaaatcaattttgacagaatcaattctagtcaccgccacaccaaacacacacata 26491088  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Original strand, 41981133 - 41981192
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttta 451  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41981133 tttaaaatcaattttgattcaaagtatccaaacaacatcaactcataagaatcactttta 41981192  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 481
Target Start/End: Original strand, 29023218 - 29023304
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattca 481  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  29023218 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataacaatcaattttaaacaagtgtatccaaatataaaccaattca 29023304  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 544
Target Start/End: Original strand, 11126500 - 11126644
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| | |||||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||  |   | ||||  |||||||    
T  11126500 caattttgattcaaactatccaaacaacacaaactcatgaaaatcacttatttataagtgtatccaaacataaatcaatctatgatcaactttcttttaa 11126599  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    | ||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  11126600 ctaaaatcaattctctcgaaataaattctaacaaaatcaattctc 11126644  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 568
Target Start/End: Original strand, 29023308 - 29023375
Alignment:
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||| |||| ||||    
T  29023308 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcgccaccaccataccgaacacacac 29023375  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 10552969 - 10552923
Alignment:
Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10552969 aaacataaatcaatttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 10552923  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 529
Target Start/End: Original strand, 23018099 - 23018209
Alignment:
Q  419 ccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaa 518  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||   |  | ||| |||||||||||| |||| | | | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  23018099 ccaaacaaaatcaattaataagaatcacttttgcattcgtgtatccaaacataaataaatttatactcaactcacttttgatcaaaatcaattcgatcaa 23018198  T
Q  519 actcaattcta 529  Q
    |||||||||||    
T  23018199 actcaattcta 23018209  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 544
Target Start/End: Original strand, 36779438 - 36779518
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36779438 ccaaacataaattactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattc-tacaaaatcaattatatcaaaatcaattctc 36779518  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 45147380 - 45147247
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||| | || ||  ||||||||||   ||||  |||| ||||||||    
T  45147380 aaaatcaattttgattcaagttattcaaacaatatcaacttataagaatcacttttaaatgagagtgtccaaacataaccaaatttgcattcaactcact 45147281  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    |||||||||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  45147280 tttaaccaaattcgattctatcaaaatcaattct 45147247  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 8702538 - 8702392
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |  |  ||| ||||||||||||||||| |  || || |||     
T  8702538 taaaagtaattttgacccaagctatccaaacaacatgaattgataagaatcactttaaggataatgtatccaaacataaatcaatt-atcttcaaatcat 8702440  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaa-ttcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8702439 ttttaactaaaatcaattttgct-aaagtcaattctatcaaaatcaatt 8702392  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Original strand, 19649233 - 19649281
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19649233 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaatt 19649281  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 478
Target Start/End: Original strand, 26125551 - 26125634
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaat 478  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  | || ||| ||||||||||||||||    
T  26125551 aaaatcaattttgatttaaaccgtccaaacattatcaactcataagaatcatttttacattagtgtatccaaacataaatcaat 26125634  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 37458433 - 37458312
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatca-----tcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaac 489  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||     | |||| |||||||||||||||| || |   || ||||||||||||||||| |  || |||    
T  37458433 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacatcacatcatgaattgataagaatcacttttatgtcaatatatccaaacataaatcaatttagcttcaac 37458334  T
Q  490 tcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
     || |||| ||||||||||||||    
T  37458333 aca-tttttaccaaaatcaattc 37458312  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 512
Target Start/End: Original strand, 42600967 - 42601017
Alignment:
Q  462 gccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  42600967 gccaaaaataaatcaattcacattcaactcactttgaacaaaaatcaattc 42601017  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 39219768 - 39219817
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39219768 ccaaacataaatcacttcatattaaactcacttttaacgaaaatcaattc 39219817  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 451
Target Start/End: Original strand, 16915040 - 16915096
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttta 451  Q
    |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16915040 aaaatcaattttgatacaaaccaaccaaacatcattaactcataagaatcactttta 16915096  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 501 - 561
Target Start/End: Original strand, 26125842 - 26125902
Alignment:
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaa 561  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||    
T  26125842 caaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaattaattctcaccaccgctgtaccaaa 26125902  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 509
Target Start/End: Original strand, 14382171 - 14382285
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| | |  |  ||| ||||||||||||||||| |  || || ||||    
T  14382171 taaaagtaattttgacccaaactatccaaataacatgaattgataagaatcactttaaggataatgtatccaaacataaatcaatt-atgttcaaatcac 14382269  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaa 509  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14382270 ttttaactaaaatcaa 14382285  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 22552870 - 22552724
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttta-agtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||| |||||||  || ||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| | |||  | | |||||||||||||||||  |  | |||||||    
T  22552870 aaaatcaattttagttgaaagtatccaaacaacatgaattgataataatcacttttacaataat-gcatccaaacataaatcaattttccatcaactcac 22552772  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| |||||| | ||||||||||||    
T  22552771 ttttatccaaaatcaattcaattaaaatcaattatgtcaaaatcaatt 22552724  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24297722 - 24297667
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttt 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||    
T  24297722 taaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatgcattactaagaatcacttt 24297667  T

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Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 511
Target Start/End: Original strand, 1373064 - 1373134
Alignment:
Q  441 aatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  1373064 aatcacttttttgtaattgtatccaaacataaatcacttcaacttcaactcacttttatccaaaatcaatt 1373134  T

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Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 541
Target Start/End: Original strand, 31201649 - 31201750
Alignment:
Q  439 agaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatca 538  Q
    ||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||   |||| || |||||||  |||||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||    
T  31201649 agaatcacttttaagcaaatgaatccaaacataaatcaattca-tcttaattcgcttttaattaaaatcaattctgtcaaactcaattttataaaactca 31201747  T
Q  539 att 541  Q
    |||    
T  31201748 att 31201750  T

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Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 38715271 - 38715194
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||    
T  38715271 ccaaacataaatcactttacacttaactcaattttaactaaaatcaattc-tgcaaaatcaattcaattaaaatcaatt 38715194  T

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Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2071629 - 2071565
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  2071629 ccaaacatgaatcaatt-acattcaactcacttttagtcaaaatcaattctgtcaaaatcaattct 2071565  T

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Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 544
Target Start/End: Original strand, 26125826 - 26125855
Alignment:
Q  515 tcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125826 tcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 26125855  T

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Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 33588767 - 33588816
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33588767 ccaaacataaataattttacattaaactcacttttaatcaaaatcaattc 33588816  T

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Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 40792264 - 40792188
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  40792264 caaatataaatcaattg-cattcaactcacttttaatcaaaatcaattatatcaaaatcaattttattaaaatcaatt 40792188  T

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Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Original strand, 20190186 - 20190234
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  20190186 ccaaacataaatcattttatcttaaactcacttttaaccaaaatcaatt 20190234  T

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Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Original strand, 26575890 - 26575930
Alignment:
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26575890 aaatcaattctctcaaaatcaattctatcagaatcaattct 26575930  T

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Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 45147266 - 45147222
Alignment:
Q  524 attctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  45147266 attctatcaaaatcaattctcaccgccgccgaaccaaacacacac 45147222  T

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Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 400 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 1945162 - 1944994
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1945162 caattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaa 1945063  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1945062 ccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 1944994  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 395 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7472801 - 7472626
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7472801 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaacataa-tcaattcacatcaaactcact 7472703  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  7472702 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacacacata 7472626  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 9988629 - 9988456
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9988629 aaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 9988530  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  9988529 tttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 9988456  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 392 - 570
Target Start/End: Original strand, 2213483 - 2213661
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2213483 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 2213582  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacat 570  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  2213583 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacacat 2213661  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 5916369 - 5916197
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5916369 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcact 5916271  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5916270 tttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 5916197  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 36312257 - 36312429
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36312257 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcact 36312355  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36312356 tttaaccaaaatcaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 36312429  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28127418 - 28127239
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28127418 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 28127319  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  28127318 actttttagcaaaatcaattctctcaaactaaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaacacacacata 28127239  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 39141597 - 39141425
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | || ||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  39141597 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaattcatatccaactcact 39141499  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||    
T  39141498 tttaaccaaaatcaattctttcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgccaccgcccaaccaaacacacac 39141425  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 44619182 - 44619040
Alignment:
Q  402 attttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacc 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  44619182 attttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataataatcatttttaaacaagtgtatccaaacataaatcaattcccctcaaactcacttttaacc 44619083  T
Q  502 aaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44619082 aaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 44619040  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 427 - 568
Target Start/End: Original strand, 2213659 - 2213800
Alignment:
Q  427 catcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2213659 catcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatccaaagacaaatcaattcacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaatt 2213758  T
Q  527 ctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||    
T  2213759 ctatcaaaatcaattctctcatctgccataccaaacacacac 2213800  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 25748009 - 25747833
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25748009 aaaagcaattttgattcaaactacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcact 25747911  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacatat 572  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||   |||||||| ||||||||    
T  25747910 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaattatcaccaccgcggaaccaaacacacacatat 25747833  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 36548180 - 36548352
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  36548180 aaaatcaattttaatttaaattatccaaacaacatcaacccataaaaatca-ttttaagtgagagtatccaaacataaatcaattcacatcagactcact 36548278  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  36548279 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacacacac 36548352  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 14821143 - 14821310
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14821143 aaaatcaattttgattcaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattaaactcact 14821241  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||| ||||||||||    
T  14821242 tttaactaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaattaattatcgtcaccgctataccaaaca 14821310  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 392 - 553
Target Start/End: Original strand, 28261271 - 28261432
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || || || ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  28261271 tttaaaattaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctatgtgagagtatccaaatataaatcaattcacatccaactc 28261370  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgcc 553  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||    
T  28261371 acttttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattgtattaaaattaattctctccaccgcc 28261432  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 392 - 563
Target Start/End: Original strand, 32501963 - 32502133
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| ||| |||||||| | |  ||| |||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  32501963 tttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattgaatgtatccaaacataa-tcaattcacctaaaactc 32502061  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  32502062 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcacgaccgccataccaaaca 32502133  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 8170293 - 8170465
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |    | | ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  8170293 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacatctgttaacgtgtatccaaacataa-tcaatttacattcaactcact 8170391  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  8170392 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctcgccaccgccctaccaaacacacac 8170465  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 463 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30007613 - 30007517
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccatacca 559  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30007613 ccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagccatacca 30007517  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26208060 - 26207881
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||     
T  26208060 tttaaaatcaattttgattcatataatccaaacaacatcaacttgtaagaatcaattttaattaagtgtatcaaaacataaatcaattcacatccaactg 26207961  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||| |||||||    
T  26207960 acttttaaccaaaaccaattctctcaaaattaattctatcaaaatcaattttcgtcaccgtcataccaaacacacacata 26207881  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 394 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 42089661 - 42089510
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcg----tagccaaacataaatcaattcacatttaac 489  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |    || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42089661 taaaagcagttttgattcgatttatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtgtatctatccaaacataaatcaattcacattcaac 42089562  T
Q  490 tcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  42089561 tcacttttaatcaaaatcaattctcttgaacttaattctatcaaaatcaatt 42089510  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 395 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 42516103 - 42515934
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| | | ||  ||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  42516103 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcattttttaatgagtatattcaaacataa-tcaattcacatcaaactcact 42516005  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacata 565  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  42516004 tttaactaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattttctccaccgccataccaaacata 42515934  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Original strand, 3853880 - 3854029
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||  | |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3853880 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacaacatagattgataagaatcaattttacatgaatgtatccaaacataaatcaatttacattcaactcact 3853979  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  3853980 tttaatcaaaatcaattctatcaaaatcaattccatcaaactcaattctc 3854029  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 31562812 - 31562647
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||||   || ||  |||||||||| ||||||||| |  || |||||    
T  31562812 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaatataaactcataagaatcacttttaaacgagtgt--ccaaacataa-tcaattcacctcaaattcact 31562716  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  31562715 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccaccataccaaaca 31562647  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Original strand, 7296135 - 7296281
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  7296135 aaaatcaattttgacttaaactatccaaataacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcatt 7296234  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7296235 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaagtcaatt 7296281  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34433413 - 34433285
Alignment:
Q  417 atccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagta-agcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgct 515  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |  |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  34433413 atccaaacaacatgaatttataagaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaatcaaaatcaattctgt 34433314  T
Q  516 caaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34433313 caaactcaattctatcaaaatcaattctc 34433285  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 2215234 - 2215405
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||| | ||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||  || | ||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  2215234 aaaatcaattctaatttaaattatccaaacaacatcaactcaaaa--attatttttaaacaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 2215331  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  2215332 tttaaccaaaatcaattctctcaagctcaattctatcaaaatcaattctcacaaccgctataccaaacacacac 2215405  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 543
Target Start/End: Original strand, 16467072 - 16467214
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||  | | | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16467072 aattttgatctaaactatccaaactacatcaacccataagaatcacttttacattatcatatccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaac 16467171  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16467172 caaaatcaattatgccaaaatcaattctatcaaaatcaattct 16467214  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Original strand, 18511082 - 18511231
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||  |    ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18511082 aaaatcaattttgatttaaattatccaaacaacatcactttataagaatcatttttacattgatgtatccaaacataaatcaattaacatttaaatcact 18511181  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18511182 tttaaccaaaatcaattatatcaaaatcaattttatcaaaatcaattctc 18511231  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 23358238 - 23358410
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||  | ||||  |  ||||||||    
T  23358238 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacattaactcatcacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaactatttcatctcaaactcact 23358337  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  23358338 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctat-taaatcaattctcgccaacaccataccaaacacacac 23358410  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 427 - 541
Target Start/End: Original strand, 31224692 - 31224806
Alignment:
Q  427 catcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||   || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  31224692 catcaactcataagaatcacttttagtaaaatatatccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaaatcaattctttcaaactcaatt 31224791  T
Q  527 ctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||||    
T  31224792 ctatcaaaatcaatt 31224806  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 7295474 - 7295330
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  7295474 aaaatcaagtttgacttaaactatccaaacaacatcaactcatgataatcactttta--tatgtgtatccaaacataaatcaatttacgtcaaactcatt 7295377  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7295376 tttaaccagaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaatt 7295330  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 395 - 534
Target Start/End: Original strand, 8041260 - 8041397
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||| | ||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  8041260 aaaaacaattttgattcaaacta-ccaaacaacataaattgataaaaataaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaattcact 8041357  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaa 534  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8041358 tttattcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 8041397  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 541
Target Start/End: Original strand, 28641619 - 28641768
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| | |   || ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  28641619 tttaaaatcaattttaattcaacatatccaaacaacatcaacttataataatcacttttaaatgaagttacccaaatataaatcaattcacatccaactc 28641718  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    || |||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||    
T  28641719 acatttaaccaaaatcaattctctcagaatcaattcaattaaaatcaatt 28641768  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 463 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45714728 - 45714648
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45714728 ccaaacataaatcaattcacatcgaactcatttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattct 45714648  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 463 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 41580770 - 41580691
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41580770 ccaaacataaattaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattcgatcaaaatcaattc 41580691  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 38600502 - 38600424
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  38600502 caaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattcgatcaaaattaattc 38600424  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 43436409 - 43436292
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | || | | | ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  43436409 aaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatcaaaacataaatcaatttacatctaattcact 43436310  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  43436309 tttaatcaaaatcaattc 43436292  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23267401 - 23267345
Alignment:
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23267401 taactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattc 23267345  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 526
Target Start/End: Original strand, 27911385 - 27911517
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| |   || |||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27911385 taaaatcaattttaatttaaagtatccaaataacatcaacttgaaataatcacttttaaatgagtatatccaaacataaatcaattcacatcaaactcac 27911484  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  27911485 ttttaaccaaactcaattctatcaaaatcaatt 27911517  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 464 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 34997295 - 34997196
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  34997295 caaacataaatcaattcacatccaattcatttttaacaaaaatcaattttgtcaaactaaattttatcaaaatcaattttcaccgcagccaaaccaaaca 34997196  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Original strand, 12110922 - 12110999
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  12110922 ccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatttg-acaaaatcaattctatcaaaatcaatt 12110999  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 30599964 - 30599859
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| | | | ||||||||||  || |||||| |||||||    
T  30599964 ccaaacacaaatcaattgacactcaactcacttttaaccaaaatcaattctatcaaaattaattttgttagaatcaattctaaccaccgccaaaccaaac 30599865  T
Q  563 atacac 568  Q
    ||||||    
T  30599864 atacac 30599859  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39106799 - 39106680
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | | ||||| || ||||||||||||||| |  ||| |||||||| || ||||| | ||  |||||    
T  39106799 tttaaaatcaattttgattcaaattatctaaacaacttaaattcgta-gaatcacttttaagtgaatgtatccaaacattaaacaatttatatcaaactc 39106701  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  39106700 actttttaccaaaatcaattc 39106680  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 3602587 - 3602442
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||  | |   || |||||||||| |||||| |  || ||||||||    
T  3602587 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatgaattaataaaaatcacttttattttaatatatccaaacataattcaatt-aagttcaactcact 3602489  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||| |||||||  | ||||||||||    
T  3602488 tttagacaaaatcaattctatcaaaatcaattcagtaaaaatcaatt 3602442  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23359990 - 23359941
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23359990 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 23359941  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 25940369 - 25940264
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||| ||    || |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  25940369 aaaatcaattttgattcaaactgtccaaacaacatcatctcataataatcacttctatacgagtgtattcaaatataaatcaattcacatcaaactcact 25940270  T
Q  495 tttaac 500  Q
    ||||||    
T  25940269 tttaac 25940264  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 456
Target Start/End: Original strand, 2234904 - 2234967
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaa 456  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  2234904 tttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacat-aactcataagaatcacttttaggtaa 2234967  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 10918651 - 10918700
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10918651 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttatccaaaatcaattc 10918700  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 411 - 544
Target Start/End: Original strand, 11240667 - 11240799
Alignment:
Q  411 caaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaat 510  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||| || ||||| |  |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||    
T  11240667 caaactatccaaacaacaagaatttttaagaatcaattctaagtgaatgtattcaaacataaatcaattcacattcaactcgcttttttcc-aaatcaat 11240765  T
Q  511 tcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |   | |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11240766 tttgttaaacccaattaaatcaaaatcaattctc 11240799  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Original strand, 23377552 - 23377600
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23377552 ccaaacataaatcaacttacattcaactcacttttaaccaaaattaatt 23377600  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 568
Target Start/End: Original strand, 27911492 - 27911544
Alignment:
Q  516 caaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||    
T  27911492 caaactcaattctatcaaaatcaattatcgccgccgccgaaccaaacacacac 27911544  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 43858340 - 43858194
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttta-agtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||| |||||||  || ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| | | |||  | | |||||||||||||||||     | |||||||    
T  43858340 aaaatcaattttagttaaaactatccaaacaatatgaattgataagaatcactttcacaataat-gcatccaaacataaatcaattattcatcaactcac 43858242  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||  |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||    
T  43858241 ttttgcccaaaatcaattcaattaaaatcaattctatcaaaatcaatt 43858194  T

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Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 568
Target Start/End: Original strand, 48510901 - 48511076
Alignment:
Q  393 ttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactca 492  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48510901 ttaaaatcaattttgatacatactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagcaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactca 48511000  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48511001 cttttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattcaatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacacacac 48511076  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 35569333 - 35569160
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35569333 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 35569234  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35569233 tttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 35569160  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 1199822 - 1199995
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1199822 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaatccacaagaatcacttctaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 1199921  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  1199922 tttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 1199995  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 20800408 - 20800235
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20800408 aaaatcaatattgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 20800309  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20800308 tttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 20800235  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 7826488 - 7826312
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | |||    
T  7826488 tttaaaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaagctc 7826389  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||    
T  7826388 acttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaatcaattttctccaccgccaaaccaaacacacac 7826312  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 42850350 - 42850177
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42850350 aaaatcaattttgatgtaaaatatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaggaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 42850251  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  42850250 tttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 42850177  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 31223369 - 31223542
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31223369 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 31223468  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  31223469 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctattaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 31223542  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 43729008 - 43728836
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  43729008 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacataa-tcaattcacatccaactcact 43728910  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||    
T  43728909 tttaagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccatcgctataccaaacacacac 43728836  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 13055993 - 13056165
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13055993 aaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcgtattcaaacataaatcaattcacactcaactcact 13056091  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  13056092 tttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacacacac 13056165  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 394 - 568
Target Start/End: Original strand, 47123380 - 47123554
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47123380 taaaagcaattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcacttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcac 47123479  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||    
T  47123480 ttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatttttgccaccgccataccaaacacacac 47123554  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 5410635 - 5410802
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  5410635 aaaatcaattatgattcaaactatccaaacaacatcaagtcataagaatcacttttaagta-gtgtattcaaacataaatcaatttacatccaactcact 5410733  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5410734 tttaatcaaaatcaattctttcaaattcaattatatcaaaatcaattctcgccgccgccaaaccaaaca 5410802  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 6166102 - 6166277
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  6166102 tttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaacatcaactcctaagaatcacttttaaatgagtgtatccaaacataa-tcaattcagatcaaactc 6166200  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||    
T  6166201 acttctaaccaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgcgataccaaacacacac 6166277  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 567
Target Start/End: Original strand, 45710044 - 45710215
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| |||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  45710044 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtattcaaacataa-tcaattcacatacaactcact 45710142  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacataca 567  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||    
T  45710143 tttaatcaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacataca 45710215  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 12468208 - 12468379
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12468208 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaa-atcaactcataaaaatcacttttaaaaaagtgtatccaaatataaatcaatttacatcaaactcact 12468306  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12468307 tttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatc-aaatcaattcttcccgccgccataccaaacacacac 12468379  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 50977470 - 50977298
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||    
T  50977470 aaaatcaatttttattcaaactatccaaacaatatctactcataaaaatcacttgtaa-taagcgtatccaaacataaaacaattcacaccaaactcact 50977372  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  50977371 tttaaccaaaatcaattctttcaaactccattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 50977298  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 25230002 - 25230169
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25230002 aaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactaataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcact 25230100  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25230101 tttaactaaaatcaattctctcaaactcagttctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaaca 25230169  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4369936 - 4369803
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4369936 tttaaaatcaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcaca-tcaactc 4369838  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4369837 acttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaatt 4369803  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 10470585 - 10470757
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    | | ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  10470585 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctgttaacgtgtatccaaacataa-tcaatttacattcaactcact 10470683  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  10470684 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccctaccaaacacacac 10470757  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 26058236 - 26058409
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | || | | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  26058236 aaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaattcact 26058335  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  26058336 tttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 26058409  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 392 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 11023463 - 11023293
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| ||| |||||||| | |  ||| |||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  11023463 tttaaaatcaattttgattcaaactacccaaacaatatcaactcgtaaaaattacttttaattgaatgtatccaaacataa-tcaattcacctaaaactc 11023365  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  11023364 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaaca 11023293  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 27801763 - 27801610
Alignment:
Q  415 ctatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgc 514  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | || | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27801763 ctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcacttttaatcaaaatcaattctc 27801664  T
Q  515 tcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  27801663 ttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacacacac 27801610  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 376 - 568
Target Start/End: Original strand, 50406106 - 50406298
Alignment:
Q  376 ttttggtaatt-tacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaat 474  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||  ||| | | ||||||| ||||    
T  50406106 ttttggtaattataca-tttaaaaacaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaacttataagaatcatttttaacgaagtgcatccaaacaaaaat 50406204  T
Q  475 caattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||    
T  50406205 caattcacatctaactcacttttaatcaaaatcaaatctttcaaactcaattttatcaaaatcaattctcgccaccgctataccaaacacacac 50406298  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 40229601 - 40229433
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  40229601 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcagaagaatcacctgtaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 40229502  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  40229501 tttaaccaaaatcaattccaacaaaatcaattctatcaaaatcaattttcatcaccgtcataccaaaca 40229433  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 569
Target Start/End: Original strand, 6464603 - 6464776
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6464603 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctagtaaagtgtataaaaacataa-tcaattcacattaaactcact 6464701  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 569  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | || | |||||||||| |||||    
T  6464702 tttaaccaaaatgaactcactcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgtcaccactataccaaacaaacaca 6464776  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 391 - 541
Target Start/End: Original strand, 25061217 - 25061367
Alignment:
Q  391 ctttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaact 490  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| |  || ||||    
T  25061217 ctttaaaatcaattttgattcaaattatccaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaacataaatcaatttatgttcaact 25061316  T
Q  491 cacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||||||||||    
T  25061317 cacttttaaccaaaatcaattcaaccaaaatcaattttaacaaaatcaatt 25061367  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Original strand, 15884221 - 15884371
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagta-agcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | |  |  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15884221 aaaatcaattttgatccaaactatccaaacaacatgaatttataaaaatcactttttactttattgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcac 15884320  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15884321 ttttaaccaaaatcaattctgtcaaactcaactctatcaaaatcaattctc 15884371  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 12247415 - 12247587
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||| | |||| ||||  ||||||||    
T  12247415 aaaatcaattttgattcaaattctccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataatt-aatttacatccaactcact 12247513  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||| |||||||||| ||||    
T  12247514 tttaaccagaatcaattctcttaaactcaattctattaaaatcaattttcatcaccgctataccaaacacacac 12247587  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 36205186 - 36205354
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | || |||||||||||||||| ||||  || |||| || ||| ||||||| || |||| ||||    
T  36205186 aaaatcaattttgattcaaactatccaagcaacattcactcgtaagaatcacttttaaataagtttatccaatcaaaaaccaattcatatctaacccact 36205285  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  36205286 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattccgttaaaatcaattctcaccaccgtcataccaaaca 36205354  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 35536067 - 35536239
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   || ||| | |||||| || |||||||| |  || |||||    
T  35536067 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacgagtgtatctaaacat-aaccaattcacgtcaaagtcact 35536165  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||  | ||||||||||||||| ||||    
T  35536166 tttaatcaaaattaattctctcaaactcaattctattaaaattaattttcatcaccgccataccaaacacacac 35536239  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 13931618 - 13931789
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||  |||||| |    
T  13931618 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttgtaagaatcatgtttaagtgagtatatccaaacat-aatcaattcacatcaaactcatt 13931716  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||    
T  13931717 tttaaacaaaatcaatttttggaaactcaattctatcaaaatcaa-tcccaccaccgccataccaaacacacac 13931789  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 541
Target Start/End: Original strand, 34718447 - 34718592
Alignment:
Q  396 aaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcactt 495  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||    ||| |||  |||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  34718447 aaagtaattttaattcaaagtatccaaacaactataattcataagaatcacttttgtacaagtgtattcaaacataaatcaatttatatcaaactcactt 34718546  T
Q  496 ttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34718547 ttaaccaaaattaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 34718592  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 464 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 49243044 - 49242964
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  49243044 caaacataaatcaattcacatccaactcatttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaattaattctc 49242964  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Original strand, 9447533 - 9447694
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| | ||  || | |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  9447533 caattttaattcaaactatccaaacaacatcaactcgaaagaatcacttttaaatgagtatatctaaacat-aatccattcacatcaaactcacttttaa 9447631  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    || ||| || ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  9447632 cc-aaaccatttctctcaaattcaattttattaaaatcaattctcttcaccgccataccaaaca 9447694  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 395 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 23628836 - 23628706
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23628836 aaaagtaattttgattcaaaccacccaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcact 23628738  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    ||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  23628737 tttagtcaaaatcaattatctcaaactcaatt 23628706  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 463 - 545
Target Start/End: Original strand, 40352454 - 40352535
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcc 545  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40352454 ccaaacataaatcactttacattaaactcacttttaaccaaaatcaattc-cacaaaatcaattctatcaaaatcaattctcc 40352535  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 486 - 543
Target Start/End: Original strand, 29441270 - 29441327
Alignment:
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29441270 taactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattct 29441327  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 526
Target Start/End: Original strand, 11561826 - 11561948
Alignment:
Q  404 tttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaa 503  Q
    ||||| ||||||||||||||    || || |||||||||||||||||||   ||  ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11561826 tttgagtcaaactatccaaattaaatgaactcataagaatcacttttaaaatagtatattcaaatataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaa 11561925  T
Q  504 aatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    ||| |||||  ||||||||||||    
T  11561926 aattaattctttcaaactcaatt 11561948  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Original strand, 4347037 - 4347114
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||    
T  4347037 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc-tacaaaatcaattctaccaaaatcaatt 4347114  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 544
Target Start/End: Original strand, 43134532 - 43134594
Alignment:
Q  482 catttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43134532 cattcaactcacttttaaccaaaatcaattctcttaaactcaattctatccaaataaattctc 43134594  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 395 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 43730175 - 43729999
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||   ||| |||||||||  || |||| ||||||||||||| |   |||  ||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  43730175 aaaaacaattttgatctcaaccatccaaacaaaataaattaataagaatcacttatgcataaaggtatccaaacacaaatcaattgacactcaactcact 43730076  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||| | | | ||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||    
T  43730075 tttaaccaaaatcaattatatcaaaattaattttgttagaatcaattctagccactgccaaaccaaacatacacata 43729999  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11051441 - 11051339
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| || || |||||| || ||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11051441 aaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacat-aactcttaagaaccatttttaagtgtgtgtattcaaacataaatcaattcacatcaaactcact 11051343  T
Q  495 ttta 498  Q
    ||||    
T  11051342 ttta 11051339  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 528
Target Start/End: Original strand, 47085898 - 47085961
Alignment:
Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  47085898 aaacataaatcaattcacattcaactcacttttaattaaaatcaattctatcaaaatcaattct 47085961  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Original strand, 13344836 - 13344913
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||    
T  13344836 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattc-tacaaaatcaattcaatcaaaatcaatt 13344913  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 541
Target Start/End: Original strand, 41989 - 42066
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  41989 caaacataaatcaattcacgttcaactcaccttttactaaaatcaattctaacaaaatcaattttatcaaaatcaatt 42066  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 291809 - 291731
Alignment:
Q  434 tcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  291809 tcataacaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataaaccaattcatctcaaactcacttttaatcaaaatcaattc 291731  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 511
Target Start/End: Original strand, 29759709 - 29759762
Alignment:
Q  458 cgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29759709 cgtatccaaacataaatcattttacattcaactcacttttaaccataatcaatt 29759762  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 47978424 - 47978359
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  47978424 ccaaccataaatcactttacattcaactcacttttacccaaaatcaattcactcaaaatgaattct 47978359  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 541
Target Start/End: Original strand, 15576519 - 15576595
Alignment:
Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||    
T  15576519 aaacataaaacaattaatatctaactcacttttaattaaaatcaattctcttaaactcaatttaattaaaatcaatt 15576595  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 511
Target Start/End: Original strand, 32365074 - 32365190
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||   ||||| |||||  |||   |   |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32365074 aaaaacaattttaattcaaactatctaaacatcataaattgatggtaatcaattttatttaaatatgttcaaacataaatcaatttacattcaactcact 32365173  T
Q  495 tttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||| || ||||||||||    
T  32365174 tttgactaaaatcaatt 32365190  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7336030 - 7335975
Alignment:
Q  376 ttttggtaatttacactt-taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatc 430  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7336030 ttttggtaatttacacacctaaaagcaattttgattcaagctatccaaacaccatc 7335975  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 5930823 - 5930872
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  5930823 ccaaacataaatcactttacattcaatttacttttaaccaaaatcaattc 5930872  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 536
Target Start/End: Original strand, 43134454 - 43134495
Alignment:
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaat 536  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43134454 tttaaccaaaatcaattatctcaaactcaattctattaaaat 43134495  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 464 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8746176 - 8746128
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8746176 caaatataaatcaatttacttttaacccacttttaatcaaaatcaattc 8746128  T

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Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 3622580 - 3622404
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3622580 tttaaaatcaattttgatttatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactc 3622481  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  3622480 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataacaaacacacac 3622404  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 393 - 568
Target Start/End: Original strand, 48459700 - 48459875
Alignment:
Q  393 ttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactca 492  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48459700 ttaaaatcaattttaatacatactatccaaacaacatccattcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactca 48459799  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||    
T  48459800 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaacgtcataccaaacacacac 48459875  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 37639419 - 37639595
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||  |||  |  ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37639419 tttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaatcacttttaataaagtttctccaaacataaatcaattcacattcaattc 37639518  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37639519 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacacacac 37639595  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 37562562 - 37562735
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37562562 aaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactcact 37562661  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37562662 tttaacaaaaatcaattctcttaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 37562735  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 392 - 563
Target Start/End: Original strand, 38230057 - 38230228
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38230057 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaaatgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 38230156  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38230157 acttttaaccaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaattctctcggccgccataccaaaca 38230228  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 43631807 - 43631645
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  43631807 caattttgattcaatatatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcatatccaaacataa-tcaattcatatctaactcacttttaa 43631709  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43631708 ccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccgccataccaaaca 43631645  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 3342782 - 3342955
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  3342782 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataaatcaattcatatccaactcact 3342881  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  3342882 tttaactaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 3342955  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 10372075 - 10371902
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10372075 aaaatcaattttgattcaaactatccgaacaacatcaacccacaagaatcacttctaataaactgtaaccaaacataaatcaattcacattcaactcact 10371976  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||    
T  10371975 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgttttaccaaacacacac 10371902  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 39391254 - 39391086
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  39391254 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaattcataagaatcacttgtaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 39391155  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  39391154 tttaaccaaaatcaattctaaaaaaatcaattctatcaaaatcaattttcgccaccgccataccaaaca 39391086  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 44967516 - 44967349
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44967516 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtgtattcaaacataaatcaattcacattcaactcact 44967417  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  44967416 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattctcgctaccgtcataccaaac 44967349  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 395 - 569
Target Start/End: Original strand, 41715649 - 41715823
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | || | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41715649 aaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcact 41715748  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 569  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  41715749 tttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacaca 41715823  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 34366098 - 34365926
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||    
T  34366098 aaaatcaatttttattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcgtatccaaacataaatcaattcacacccaactaact 34366000  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  34365999 tttaactaaaatcaattctttcaaactccattatatcaaaatcaattctagccaccgccataccaaacacacac 34365926  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 47021911 - 47022079
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||   ||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  47021911 aaaatcaattttcattcaaattatccaaacaacatcaattcgtaagaatcacatctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcactttcaacttact 47022010  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  47022011 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattatccccaccatcataccaaaca 47022079  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 47217658 - 47217490
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47217658 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcgagtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 47217559  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  47217558 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccgccgccgaaccaaaca 47217490  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Original strand, 3375482 - 3375631
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  3375482 aaaatcaattttgatccaaatcatccaaacaacatcgactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacacaaatcaattcacaccaaactcact 3375581  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3375582 tttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 3375631  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 32186932 - 32187105
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| | || | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32186932 aaaatcaattttaatccaatctatccaaacaacatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcact 32187031  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  32187032 tttaatcaaaatcaattctcttaaaattaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaacatacac 32187105  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 43738056 - 43737883
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  43738056 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatccactcataagaatcacttttaaataagtttatccaaacaaaaatcaattcatatctaactaact 43737957  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  43737956 tttaatcaaaatcaattctcttaaactcaattatgttaaaatcaattctcaccgtcgccatactaaacacacac 43737883  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 12632200 - 12632032
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||   |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12632200 aaaatcaattttgattcaaacaattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagcgagtacactcaaacataaatcaattcacatctaactcact 12632101  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||    
T  12632100 tttaaccaaaatctattctctcaaacaaaattctatcaaaatcaattctctccaccgcgaaaccaaaca 12632032  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 34010338 - 34010503
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | || |||  ||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  34010338 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaaccacttttaaatgagtgtattcaaacataa-tcagttcatatccaactcacttttaac 34010436  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  34010437 caaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgcca-accaaacacacac 34010503  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 386 - 544
Target Start/End: Original strand, 3750669 - 3750827
Alignment:
Q  386 ttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatt 485  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  3750669 ttacacattaaaattaattttgatttaaactatccaaacaacatcaattcataagattcaattatattaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatc 3750768  T
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  3750769 caactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttattaaaatctattctc 3750827  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 395 - 561
Target Start/End: Original strand, 9456097 - 9456262
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| || |  ||||||||    
T  9456097 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaagatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaatttacctcaaactcact 9456195  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaa 561  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  9456196 tttaaccaaaatcaattctctcgaacttaattctatcaaaatcaattctcactaccgccgtaccaaa 9456262  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 386597 - 386430
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||  || ||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  386597 aaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacatcaat-cataagaatcacttttcggttagtatatccaaacataaatcaattcacattcagctaact 386499  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| ||||||||    
T  386498 tttaaccaaaatcaatactctcaaactcaattatatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaaca 386430  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 42904542 - 42904718
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||   || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42904542 tttaaaagtaattttgatttaaaatatacaaacaaaattaattcataagaatcacttttaaacgagtgtatcaaaacataaatcaattcacatctaactc 42904641  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    | ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| | ||||||||||||| ||||    
T  42904642 atttttatccaaaaacaattctctcaaactcaattctatcaaaattcatttttcccactgccataccaaacacacac 42904718  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 400 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 36920290 - 36920127
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  36920290 caattttgattcaatgtacccaaacaacatcaactcaaaagaatcacctttaattaaacgtattcaaacataaatcaatttatatctaactcacttttaa 36920191  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||    
T  36920190 ccaaaatcaattctttcaaactcaattttatcaaaattaattctcaccgcagcccgaccaaaca 36920127  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 393 - 532
Target Start/End: Original strand, 42740382 - 42740521
Alignment:
Q  393 ttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactca 492  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  42740382 ttaaaatcaattttgatacatactatccaaacaatatcaacacataagaatcacttttaagtaagtatatctaaacataaatcaattaacattcaactta 42740481  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatca 532  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42740482 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatca 42740521  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 46541593 - 46541760
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  || |   ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  46541593 aaaatcaattttgattcaatctatcaaaacaatatcaat-cataagaatcacttttcggtgaatatactcaaacataaaccaattcacattcaactcact 46541691  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||    
T  46541692 tctaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttaaccaccgccaaaccaaaca 46541760  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 48134572 - 48134739
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||  |||  || |||||||||| ||||||| | |  ||| ||||    
T  48134572 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacttataaaaatcacttttaaacaagtttatccaaacataa-tcaattctcctcaaacccact 48134670  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||    
T  48134671 tttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaattaattttcgcaaccgccataccaaaca 48134739  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 522
Target Start/End: Original strand, 32205916 - 32206044
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  32205916 tttaaaatcaattttgattcatactatc-aaacaacat-aactcataagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaaccc 32206013  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactc 522  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  32206014 acttttaattaaaatcaattctttcaaactc 32206044  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 34011079 - 34010910
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatcc-aaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaa-ctca 492  Q
    |||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||| |||| ||| | || ||||    
T  34011079 aaaatcaattttgatttaaagtaccccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgaatgtttccaaacataaattaatttacactcaaactca 34010980  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  34010979 cttt-aaccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcaccgctgccaaaccaaaca 34010910  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 480 - 568
Target Start/End: Original strand, 19097474 - 19097562
Alignment:
Q  480 cacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19097474 cacatctagctcacttttaatcaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaattaattctcaccgccgccataccaaacacacac 19097562  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 37008447 - 37008325
Alignment:
Q  415 ctatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgc 514  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||      
T  37008447 ctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttataagaaagtgtctccaaacataaatcaa-tcacctcaaactcacttttaaccaaaatcaattcca 37008349  T
Q  515 tcaaactcaattctatcaaaatca 538  Q
     |||| |||||||||| |||||||    
T  37008348 acaaaatcaattctataaaaatca 37008325  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 394 - 568
Target Start/End: Original strand, 39977543 - 39977717
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |   || ||| |||||||  | ||  || ||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  39977543 taaaatcaattttaatttaaagtatccaaacaacatcaacttgaaataataacttttatatgagtttatccaaaaataaatcaattcatatcaaactcac 39977642  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  39977643 ttttgactaaaatcaattctttcaaactaaattctatcaaaatcaattatcgccaccgccataccaaacacacac 39977717  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 395 - 528
Target Start/End: Original strand, 1766417 - 1766550
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |  ||| ||||| ||||||||||| |  || ||||||||    
T  1766417 aaaatcaattttaattcaaattattcaaacatcatcaattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaatataaatcaatttaggttcaactcact 1766516  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||    
T  1766517 tttaatcaaaatcaatttaatcaaaatcaattct 1766550  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 39634282 - 39634133
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||   | |   || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39634282 aaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacaagaatttataagaatcacttttgttttaagttatccaaacataaatcaattcatattcaactcact 39634183  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  39634182 tttaaccaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtccaaatcaattctc 39634133  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 416 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 24771007 - 24770861
Alignment:
Q  416 tatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgct 515  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||  |  |  || | ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24771007 tatccaaacaacataaattgataaaaatcacttttagttttgtatatctaaatataaatcaatttacatccaactcacttttaaccaaaatcaattatct 24770908  T
Q  516 caaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||    
T  24770907 caaacttaattctatcaaaattaattctcgtcaccgtcataccaaac 24770861  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 42752240 - 42752162
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||    
T  42752240 ccaaacataaatcaattcacattcaactcacttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 42752162  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 464 - 541
Target Start/End: Original strand, 12964659 - 12964736
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12964659 caaacataaatcaatctacattcaactcacttataacgaaaatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 12964736  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 491 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12212490 - 12212438
Alignment:
Q  491 cacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12212490 cacttctaaccaaaatcaattcactcaagctcaattctatcaaaatcaattct 12212438  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 511
Target Start/End: Original strand, 33746398 - 33746497
Alignment:
Q  412 aaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||||||||||||  || |||| |||||||||||  |||||| |  ||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33746398 aaactatccaaacaaaatgaatttataagaatcacggttaagttaatgtaaccaaacaaaaatcaatttatattcaactcacttttaatcaaaatcaatt 33746497  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 40903284 - 40903139
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||  | |   || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||    
T  40903284 aaaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaatt-aagttcaactcact 40903186  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  40903185 tttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaatt 40903139  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 543
Target Start/End: Original strand, 20088929 - 20089009
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt-cgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20088929 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattatacttaaa-tcaattctatcaaaatcaattct 20089009  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 38494276 - 38494325
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38494276 ccaaacataaaccacttcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattc 38494325  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41625630 - 41625514
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||  |||  ||| ||||||| |||| |||| ||| | || |||||    
T  41625630 aaaagcaattttgatctcaactatccaaacaaaataaattaataagaatcacttctacttaaaagtatccaaacacaaattaatttacactcaagtcact 41625531  T
Q  495 tttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||| |||||||||||    
T  41625530 tttaatcaaaatcaatt 41625514  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 450
Target Start/End: Original strand, 43581626 - 43581682
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttt 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  43581626 taaaagcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaattaattataatcactttt 43581682  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 47301674 - 47301622
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcact 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  47301674 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcact 47301622  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 529
Target Start/End: Original strand, 20388690 - 20388732
Alignment:
Q  487 aactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattcta 529  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20388690 aactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaaactcaattcta 20388732  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 511
Target Start/End: Original strand, 4228538 - 4228655
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagt-aagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactca 492  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||  | ||  ||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||    
T  4228538 taaaagcaattttgacacaaaatattcaaacaacatct-ttcatatgaatcacttctatcttaaaggtatccaaacataaatcacttttcattcaactca 4228636  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4228637 cttttaatcaaaatcaatt 4228655  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 485
Target Start/End: Original strand, 19095929 - 19096017
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatt 485  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||   || ||| |||||||| || |||||||||||    
T  19095929 aaaatcaattttgattcaaattatccaaacaacat-aactcataagaatcatttttaaacgagtgtatccaaacat-aaccaattcacatt 19096017  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25472192 - 25472150
Alignment:
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25472192 caaaatcaattctgtcaaaatcaattctatcaaaatcaattct 25472150  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 16079462 - 16079511
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16079462 ccaaacataaatcacttttcattcaactcactttaaaccaaaatcaattc 16079511  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37886890 - 37886857
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaaca 425  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37886890 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaaca 37886857  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25472205 - 25472165
Alignment:
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25472205 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcaaaatcaattct 25472165  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Original strand, 44274698 - 44274746
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  44274698 ccaaacataaatcattttatcttaaactcacttttaaccaaaatcaatt 44274746  T

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Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 392 - 563
Target Start/End: Original strand, 39636738 - 39636909
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39636738 tttaaaatcaattttgattcatactatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttttaagtaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactc 39636837  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  39636838 acttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgtcataccaaaca 39636909  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 16566261 - 16566434
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16566261 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 16566360  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16566361 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccctgctgccataccaaacacacac 16566434  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 51922896 - 51923069
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  51922896 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaattacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcagattcaactcact 51922995  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  51922996 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctaacaaaatcaattctcgtcgccgccataccaaacacacac 51923069  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 13167478 - 13167654
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13167478 tttaaaagcaattttgattcaatctatccaaacatcattaatacataagaatcacttttaaatgggtgtatccaaatataaatcaattcacattcaactc 13167577  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  13167578 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaatttttcctaccgccataccaaacacacac 13167654  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 386 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6138759 - 6138577
Alignment:
Q  386 ttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatt 485  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  6138759 ttacacattcaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcatttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacatc 6138660  T
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
     |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  6138659 caactcacttttaaccaaaatcaattatttcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccaaaccaaacacacac 6138577  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 43781642 - 43781481
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  43781642 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcacttttaac 43781544  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43781543 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaaca 43781481  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 26651978 - 26651805
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||   ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26651978 aaaatcaattttgattcaaactatccaaataacatcgactcataagaattacttttagtaaagtgtatctaaacataaatcaattcacattcaactcact 26651879  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26651878 tttaaccaaaatcaattctctcaaacttaattctatcaaaatcaattctcgccgccgccataccaaacacacac 26651805  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 392 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 29149440 - 29149271
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29149440 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaatatcaactaataaaaatcacttttaattgagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactc 29149341  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaa 561  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29149340 actttttagcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgctataccaaa 29149271  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 46830202 - 46830026
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  46830202 tttaaaatcaattttgatgtagaatatccaaacaacatcaactcataagaatcaattttaagaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatccaactc 46830103  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  46830102 acttttaaccaaaatcaattcacttaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 46830026  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 19592361 - 19592188
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19592361 aaaatcaattttcattcaaactatccaaacaacgtcaattcgtaagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacttccaactcact 19592262  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  19592261 tttaaccaaaatcaattctctaaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgccatatcaaacacacac 19592188  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 394 - 571
Target Start/End: Original strand, 25312670 - 25312847
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25312670 taaaagcaattttgattcaatgtatccaaacaacaacaattcataagaatcgcttttaacaaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcac 25312769  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||    
T  25312770 ttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgttaccgccaaaccaaacacacacata 25312847  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 42945031 - 42944854
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42945031 tttaaaatcaattttgatacatactatccaaacaacatcaacacataagaatcacttttaagtaagtatatctaaacataaatcaattcacattcaactc 42944932  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 569  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||| ||||||    
T  42944931 acttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaattctatcaaaataaattcttgccaccgccgtaccaaacttacaca 42944854  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 14564276 - 14564103
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  14564276 aaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaaggtatccaaacataaatcaattcatatccaactcaca 14564177  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  14564176 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccgccgcccaaccaaacacacac 14564103  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 9889464 - 9889297
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  9889464 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatccaaacatata-caattcatatctaactcact 9889366  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9889365 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaaca 9889297  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 571
Target Start/End: Original strand, 14072459 - 14072634
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||   ||| ||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  14072459 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcattagaatcacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaatttaccttcaactcact 14072557  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacata 571  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  14072558 tttaaacaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaacacacacata 14072634  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 400 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 26426239 - 26426072
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  26426239 caattttgattcaatgtatccaaacaatatcaactcaaaagaatcacttttaattaagcgtatccaaacataa-tcaatttatatctaactcacttttaa 26426141  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26426140 ccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgtcataccaaacacacac 26426072  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 394 - 568
Target Start/End: Original strand, 54150481 - 54150655
Alignment:
Q  394 taaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcac 493  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54150481 taaaagcaattttgatttaatgtatccaaacaacaccaacttataagaatcatttttaacgaagtgtatccaaacaaaaatcaattcacatctaactcac 54150580  T
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  54150581 ttttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattcttgccaccgccataccaaacacacac 54150655  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 28986974 - 28987147
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||| || |||  ||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  28986974 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcactt--aagtgagtgtattcaaacataa-tcaattcacctcaaactc 28987070  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  28987071 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattttcaccaccgccataccaaacacacac 28987147  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 9893667 - 9893835
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  9893667 aaaatcaattttaatttaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcactttcaagtgggtgtatccaaacatatatcaattcatatctaactcact 9893766  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9893767 tttgacaaaaatcaattctctcaaattcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaaca 9893835  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 393 - 568
Target Start/End: Original strand, 49519684 - 49519862
Alignment:
Q  393 ttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactca 492  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  49519684 ttaaaatcaattttaatacatactatccaaacaatatcaattcataagaatcatttttaagcaagtgtatccaaacataaataaattcacatccaactca 49519783  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct---ccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   | || ||||||||||||||| ||||    
T  49519784 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaaccaattctcaccaccaccgccataccaaacacacac 49519862  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 403 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 32238180 - 32238016
Alignment:
Q  403 ttttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacca 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||   || ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32238180 ttttgattcaaactatccaaacaacatcaactcatatgaatcacttctaatatagtgtatccaaacataac-caattcacattcaactcacttttaacca 32238082  T
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||    
T  32238081 aaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacac 32238016  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 393 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 43772255 - 43772107
Alignment:
Q  393 ttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactca 492  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  43772255 ttaaaatcaattttgattcatattatccaaacaacatcaactcgtaagaatcacttctaaaaaagtgtatccaaacataaatcgattcacatccaactca 43772156  T
Q  493 cttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43772155 cttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 43772107  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4954184 - 4954050
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4954184 tttaaaattaattttgattcaacctatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagggtacccaaacataaatcaattcacatcaaactc 4954085  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4954084 acttttaaccaaaatcaattctctcaaaatcaatt 4954050  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 48550173 - 48550346
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| || ||| |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| | || | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48550173 aaaatcaattttaatccaatctatccaaacaatatcaattcatatgaattacttttaaatgagtgcatccaaacataaatcaatttacatctaactcact 48550272  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  48550273 tttaatcaaaatcaattctcttaaaatcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 48550346  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 30842088 - 30842255
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||    
T  30842088 aaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcact 30842186  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  30842187 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgtcaccgccataccaaaca 30842255  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 49136478 - 49136646
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  49136478 aaaatcaattttgattaaaattattcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtgagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 49136577  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||  | | ||||||| ||||||||    
T  49136578 tttaaccataatcaattctctcaaactcaattataccagaatcaattaactctgccgccaaaccaaaca 49136646  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 563
Target Start/End: Original strand, 14075977 - 14076138
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  14075977 aattttgatttaaagtactcaaacaacatcaattcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacataaatcaatttacatcaaactcacttt-aac 14076075  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  14076076 caaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgccaaactaaaca 14076138  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 15603316 - 15603489
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||  || | ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15603316 aaaatcaattttgacttaaattatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaagcaagtatatctaaacacaaatcaattcacatcaaactcact 15603415  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  15603416 ttttaccataatcaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccaccgtcaaaccaaacacacac 15603489  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 48407827 - 48407679
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||    
T  48407827 aaaatcaattttgattcaaactatccaaatgaaatcaactcataagaatcactttcaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcact 48407729  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48407728 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 48407679  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 54153001 - 54153168
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||   ||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54153001 aaaatcaattttgattcaaactattcaaacaacatcaactcatgagaatcacttctagtaaagtgtattcaaacataa-tcaattcacattcaactcact 54153099  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||| ||||||||||    
T  54153100 tttaaccaaaatcaattcactcaaactcaattatattaaaatcaattatcgccaccgctataccaaaca 54153168  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 409 - 568
Target Start/End: Original strand, 39187704 - 39187863
Alignment:
Q  409 ttcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatca 508  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| | | ||||||||||| ||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  39187704 ttcaaattattcaaacaacatcaactaacaagaatcacttctagtaaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaaattacttttaaccaaaatca 39187803  T
Q  509 attcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  39187804 attctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaacacacac 39187863  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 392 - 547
Target Start/End: Original strand, 46926001 - 46926156
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  ||| |  || ||||||||| ||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46926001 tttaaaagtaattttgattcaaaatatataaataaaattaattcataaaaatcacttttaaacgagtgtatccaaacataaatcaattcacatctaactc 46926100  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcccc 547  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46926101 acttttaaccaaaaacaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattatcccc 46926156  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 6505157 - 6505330
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||  | || ||| | ||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  6505157 aaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagtcatgataatcacttttatatgagtgtatctaaacataaatcaattcacatcaaactcatt 6505256  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||    
T  6505257 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaagtcaattatcgacgccgccaatccaaacacacac 6505330  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 48550560 - 48550424
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |||  || ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  48550560 tttaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttctattaaagtttatccaaacataaatcaattcacatccaactc 48550461  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  48550460 acttttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaattct 48550424  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 446 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 55638834 - 55638718
Alignment:
Q  446 cttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcc 545  Q
    ||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55638834 cttttaaataagtgtatctaaacataaatcaatttacatttaactcacttttaacaaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcg 55638735  T
Q  546 ccgccgccataccaaac 562  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  55638734 ccgccaccaaaccaaac 55638718  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 48908231 - 48908402
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||  || ||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||    
T  48908231 aaaatcaattttgattcaagctatccaaacaacatcaacttatatgaattacttttaagcgag-gtatccaaacataac-caattcacatcaaactcact 48908328  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  48908329 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaataatattaaaatcaattttcaccgccgccaaaccaaacacacac 48908402  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 400 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 54735775 - 54735616
Alignment:
Q  400 caattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaa 499  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||| ||    
T  54735775 caattttgatttaaaatactcaaacaacatcaactcataagaatcacttttaagtatatgtttccaaacataaaccaatttacatcaaactcaattt-aa 54735677  T
Q  500 ccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaa 560  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  54735676 ccaaaatcaattttctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccgccgccaaaccaa 54735616  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 13183180 - 13183012
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | |||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||    
T  13183180 aaaatcaattttgatttaaattatccaaaaaacatcaacttataaaaatcatttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcaccttaaacttgct 13183081  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  13183080 tttaaccaaaatcaattatctcagactcaattttatcaaaatcaattatcgtcaccgtcataccaaaca 13183012  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 31520503 - 31520328
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||   |||||    
T  31520503 tttaaaatcaatttttattcaaactacccaaaaaacatcaactcataaaaatcacttttaa-taagcatatctaaacataaatccattcacacccaactc 31520405  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||    
T  31520404 acttttaaccaaaattaattctttcaaacttcattctaccaaaatcaattctcgccatcgctataccaaacacacac 31520328  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 19599624 - 19599487
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19599624 aaaagcaattttgattctaaata-ccaaacaacataaattgataagaatcaattttaagtaattgcatccaaacataaatcaatt-acattcaactcact 19599527  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaa 534  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19599526 tttattcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaa 19599487  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 464 - 563
Target Start/End: Original strand, 33574203 - 33574302
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  33574203 caaacataaatcaattcacattcaactcacttttaaccaaaattaattctctcaaactcaattctatcaaaaataattctcgccgcagccaaacctaaca 33574302  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 463 - 568
Target Start/End: Original strand, 41866178 - 41866283
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaac 562  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||    
T  41866178 ccaaacataaatcaattcacatccaactcacttttaactaaactcaattccctcaaactcaattttatcaaaatcaattatcgccaccgccaaaccaaac 41866277  T
Q  563 atacac 568  Q
    | ||||    
T  41866278 acacac 41866283  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 402 - 528
Target Start/End: Original strand, 15619579 - 15619703
Alignment:
Q  402 attttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||| || ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  15619579 attttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttata-gtaat-gtatccaaacatacatcaattcacatccaactcactttttacc 15619676  T
Q  502 aaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15619677 aaaatcaattctctcaaactcaattct 15619703  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Original strand, 38305967 - 38306113
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||   | |  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38305967 aaaatcaattttgatccaagttatccaaacaacatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtatccaaacataaatcaattcgcattcaactcact 38306066  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||| |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||    
T  38306067 tttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 38306113  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 392 - 541
Target Start/End: Original strand, 54488558 - 54488707
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||  || |||| |||||||||||||||   | |  |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54488558 tttaaaatcaattttgatccaagttatccaaacaaaatgaatttataagaatcacttttgctttaaggtattcaaacataaatcaattcacattcaactc 54488657  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||    
T  54488658 acttttaacaaaaatcaattctaacaaaatcaattctgtcaaaatcaatt 54488707  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 395 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2175277 - 2175161
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2175277 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatcaacccatcaaaatcacttttaagcgagtgcatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 2175178  T
Q  495 tttaaccaaaatcaatt 511  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2175177 tttaatcaaaatcaatt 2175161  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 56241965 - 56241848
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  56241965 aaaatcaattttgatttaaatcatctaaacattatcaactcataagaatcacttttacattaatgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 56241866  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  56241865 tttaatcaaaatcaattc 56241848  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 45780095 - 45779972
Alignment:
Q  439 agaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatca 538  Q
    |||||||||||||||| |  ||| | ||||| |||| |||||| |   ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  45780095 agaatcacttttaagtgaatgtatctaaacaaaaattaattcataccaaactcactttttaccaaaatcaattt-ctcaaactcaattctatcgaaatca 45779997  T
Q  539 attctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||    
T  45779996 attctcatcgccgccaaaccaaaca 45779972  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 395 - 542
Target Start/End: Original strand, 14054807 - 14054954
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||| |   || |||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14054807 aaaatcaattttaatttaaagtattcaaacaacatcaacttgaaataatcacttttatataagtttatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 14054906  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    ||| || ||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  14054907 tttgactaaactcaattctttcaaactcaattatgtcaaaatcaattc 14054954  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 541
Target Start/End: Original strand, 38263894 - 38264001
Alignment:
Q  434 tcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaa 533  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  38263894 tcataagtatcacttttaagtgagtatattcaaacataaattaattcacatcaaactcaattttaagcaaaattaattttctcaaactcaattatatcaa 38263993  T
Q  534 aatcaatt 541  Q
    ||||||||    
T  38263994 aatcaatt 38264001  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 459 - 563
Target Start/End: Original strand, 53531997 - 53532101
Alignment:
Q  459 gtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccatacc 558  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  53531997 gtagccaaacataaaccacgttacatccaactcacttttaactaaaatcaattatgtcaaactcaattttatcaaaatcaattctcaccaccgccgaacc 53532096  T
Q  559 aaaca 563  Q
    |||||    
T  53532097 aaaca 53532101  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4649968 - 4649911
Alignment:
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4649968 taactcgcttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattttatcaaaatcaattct 4649911  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 30887283 - 30887167
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||  |||  |||||||     
T  30887283 aaaatcaattttgatacaaaccatccaaacatcattaactcataagaatcacttttatattggtgtatccaaacataaatcaatt-tcatcaaactcacg 30887185  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  30887184 tttaactaaaataaattc 30887167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 512
Target Start/End: Original strand, 28752477 - 28752587
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Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| || |  | | ||||||||||||||| | |   | ||||||||||||||    
T  28752477 aatttttattcaaactatcagaacatcatgaattgataagaatcacttttatgttaaggcatccaaacataaatcaaatta-tgtcaactcacttttaac 28752575  T
Q  501 caaaatcaattc 512  Q
    ||||||||||||    
T  28752576 caaaatcaattc 28752587  T

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Target: chr4; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 465 - 512
Target Start/End: Original strand, 39993579 - 39993626
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Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  39993579 aaacataaatcaattcacatttaactcatttttaatcaaaatcaattc 39993626  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Original strand, 523174 - 523252
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Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| |||||||  |||||||||||||    
T  523174 ccaaacataaatcaattcatattgaactcactttttcccaaaatcaattttgtcaagctcaattaaatcaaaatcaatt 523252  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 401 - 544
Target Start/End: Original strand, 38694010 - 38694153
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Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||  |||||  |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||  ||||  || | |||| |||||||      
T  38694010 aattttgatttaaattattcaagcaagatcaacccataagaatcacttttaagcgagtgtatccaaacataaactaatttgcactcaacttacttttaga 38694109  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  38694110 caaaatcaattcttttaaactcaatcatatcaaaattaattctc 38694153  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 54487282 - 54487219
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Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||    
T  54487282 ccaaacataaatcaatttacattcaactcacttttgatcgaaatcaattctatcaaactcaatt 54487219  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 511
Target Start/End: Original strand, 47384987 - 47385033
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Q  465 aaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  47384987 aaacataaatcaattcacatttaactcatttttaatcaaaaacaatt 47385033  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 22699766 - 22699815
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22699766 ccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattc 22699815  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22980764 - 22980715
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22980764 ccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattc 22980715  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22994351 - 22994302
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22994351 ccaaacataaatcactttacattcaacttacttttaaccaaaatcaattc 22994302  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26403073 - 26402960
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||| ||||||||  ||  | |  |||||||||||||||||| || ||| ||    
T  26403073 tttaaaaacaattatgattcaaaatatacaaacaaaattaattcataagaattacttttaaagaaatggattcaaacataaatcaattcatatctaaatc 26402974  T
Q  492 acttttaaccaaaa 505  Q
    |||| ||| |||||    
T  26402973 acttctaatcaaaa 26402960  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28947811 - 28947762
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28947811 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattc 28947762  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 528
Target Start/End: Original strand, 36150628 - 36150693
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||    
T  36150628 ccaaacataaatcactttacattcaactcacttttaatcaaaatcaattatatcaaaatcaattct 36150693  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 528
Target Start/End: Original strand, 53914923 - 53914987
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  53914923 ccaaacataaatcaatt-acattcaactcacttttagtcaaaatcgattctctgaaactcaattct 53914987  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Original strand, 16492951 - 16492999
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  16492951 ccaaacataaataaattcacattcaactcacttttaatcaaactcaatt 16492999  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 526
Target Start/End: Original strand, 46958047 - 46958110
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaatt 526  Q
    |||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  46958047 ccaaacataaattactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaatt 46958110  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 521 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 48550446 - 48550399
Alignment:
Q  521 tcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  48550446 tcaattctatcaaaatcaattcttcccaccgccaaaccaaacacacac 48550399  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 466 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22694656 - 22694579
Alignment:
Q  466 aacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc-gctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22694656 aacataaatcactttatgttcaactcacttttaaccaaaatcaattctacttaaa-tcaattctaccaaaatcaattct 22694579  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 449
Target Start/End: Original strand, 43628671 - 43628745
Alignment:
Q  375 tttttggtaatttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttt 449  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||||  |||||||||||||    
T  43628671 tttttggtaatttaacatttaaaatcaattttgattcaaactacaaaaacatcttaaattagtaagaatcacttt 43628745  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 541
Target Start/End: Original strand, 48556585 - 48556655
Alignment:
Q  472 aatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaa-tcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| || ||||||||   ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  48556585 aatcaattcacattcaagtcactttttttcaaaaatcaattttatcaaactcaattctatcaaaatcaatt 48556655  T

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Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 543
Target Start/End: Original strand, 1616515 - 1616563
Alignment:
Q  494 ttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1616515 ttttaaccaaaatcaattcta-caaaatcaattctatcaaaatcaattct 1616563  T

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Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26824348 - 26824231
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||  |||  ||| | ||| ||||||||||| ||| | || | | |    
T  26824348 aaaagcaattttgatctcatctatccaaacaaaataaattaataagaatcacttctacataaaagtatctaaatataaatcaatttacactcaatttatt 26824249  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26824248 tttaaccaaaatcaattc 26824231  T

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Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 529
Target Start/End: Original strand, 40335641 - 40335706
Alignment:
Q  464 caaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattcta 529  Q
    ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||    
T  40335641 caaacataaatcactttaaatttaattcacttttaaccaaaattaattttatcaaaatcaattcta 40335706  T

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Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 8683115 - 8683012
Alignment:
Q  440 gaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattc--acatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatc 537  Q
    |||||||||||| || |  ||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||| | |||| | ||| ||||    
T  8683115 gaatcacttttatgttaatgtatccaaacataaattaattcttacattaaactcaattttaaccaaattcaattttctcaaaattaattatttcacaatc 8683016  T
Q  538 aatt 541  Q
    ||||    
T  8683015 aatt 8683012  T

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Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16202572 - 16202532
Alignment:
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16202572 aaatcaattctctcaaaatcaattttatcaaaatcaattct 16202532  T

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Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 524 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 26459897 - 26459853
Alignment:
Q  524 attctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  26459897 attctatcaaaattaattctcgccaccgccataccaaacacacac 26459853  T

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Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 38740364 - 38740316
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||    
T  38740364 ccaaacataaatcacttcaacttcaactcacttttatccaaaatcaatt 38740316  T

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Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 451
Target Start/End: Original strand, 48257059 - 48257115
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttta 451  Q
    |||| |||||||||| |||  |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  48257059 aaaatcaattttgatccaatttatccaaacaacatgaatttataagaatcactttta 48257115  T

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Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 473 - 569
Target Start/End: Original strand, 54655266 - 54655362
Alignment:
Q  473 atcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacaca 569  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||   | |||||||||| | |||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| |||||    
T  54655266 atcaattcacatcaaacacacttttgactaaaatcaattattttaaactcaattatgtcaaaatcaattatcgtcaccgccgtaccaaacacacaca 54655362  T

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Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 55638917 - 55638861
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcactttta 451  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  55638917 aaaatcaattttgattcatattatccaaacaatatcaactcataagaatccctttta 55638861  T

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Target: chr6 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 13739183 - 13739349
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13739183 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcacttttaac 13739281  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  13739282 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 13739349  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 13744683 - 13744849
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13744683 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcacttttaaacaagtgtatccaaacataa-tcaattcacctcaaactcacttttaac 13744781  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  13744782 caaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcgccaccgccataccaaacacacac 13744849  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 392 - 568
Target Start/End: Original strand, 10826059 - 10826235
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  10826059 tttaaaattaattttgattcaaactatccaaacaaaatcaactcataagaatcacttttaaataagtatatccaaacaaaaatcaattcaaattcaactc 10826158  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  10826159 acttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattttatcaaaattaattctcaccgccgccaaaccaaacacacac 10826235  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 33899135 - 33898962
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  33899135 aaaatcaattttgatttaaaccatccaaacattattaactcataagaatcacttttacattagtgtatccaaacataaatcaattcatatcaaactcact 33899036  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||    
T  33899035 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgctataccaaacacacac 33898962  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 17830128 - 17829960
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||  |||| |||  ||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17830128 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacaagaacgacttctaataaactgtaactaaacataaatcaattcacattcaactcact 17830029  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  17830028 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccacagctataccaaaca 17829960  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6208186 - 6208020
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  6208186 aattttgattcaaactatctaaacaacatcaactcataagaatcacttttagtaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcacttttaat 6208088  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||    
T  6208087 caaaatcaattcactcaaaatcaattctatcaaaatcaattatcgccaccgctataccaaacacacac 6208020  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 29409375 - 29409215
Alignment:
Q  401 aattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaac 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  29409375 aattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataagaatcatttttaaaaaactgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcacttttaat 29409276  T
Q  501 caaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaa 561  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||||||    
T  29409275 caaaatcaattctttcaaactcaattctattaaaatcaattttcgccaccgtcataccaaa 29409215  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 21255008 - 21254863
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21255008 aaaagcaattttgattcaaactaccgaaacaacataaattgataagaatcaattttaggttattgtatccaaacataaatcaatt-acattcaactcact 21254910  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21254909 tttaatcaaattcaattctctcaaactcaattctatcaaactcaatt 21254863  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16442480 - 16442347
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16442480 aaaatcaattttcattcaaattatccaaacaatatcaactcatatgaatcacttttaaataagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 16442381  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattct 528  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16442380 tgtaactaaaatcaattctctcaaaatcaattct 16442347  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Original strand, 16548110 - 16548227
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16548110 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccacatgaatcacttttaataaagtgtatccaaacataaatcaattcacattcaactcact 16548209  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16548210 tttaaccaaaatcaattc 16548227  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 377 - 541
Target Start/End: Original strand, 31132417 - 31132580
Alignment:
Q  377 tttggtaatttacactttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatca 476  Q
    |||||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||  |    
T  31132417 tttggtcatttaaagttcaaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaacccataagaatcacttttaaataagtgtatccaaaaat-aacga 31132515  T
Q  477 attcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||| ||||  |||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132516 attaacatccaactcatttttagccaaaataaattatctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 31132580  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 1312569 - 1312423
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| || ||||| |  ||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1312569 aaaatcaattttgggtcaaactatccaaacaacattaatttttaagaatcaattctaagtcaatgtatccgaacataaatcaattcgcattcaactcact 1312470  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1312469 tttaaccaaaatcaattttatcaaactcgattctatcaaaatcaatt 1312423  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 471 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 29399846 - 29399747
Alignment:
Q  471 aaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacat 570  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  29399846 aaatcaattc-cattcaacttactctttaccaaaatcaattctatcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccaccgccaaaccaaacatacacat 29399748  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 395 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 16122131 - 16121965
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||  |||  |||  |||||| ||||||| | ||| | || |||||    
T  16122131 aaaagcaattttgatctcaactatccaaacaaaataaattaataagaatcacttatacataaaggtattcaaacacaaatcaacttacactcaaatcact 16122032  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaa 561  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  16122031 tttaaccaaaatcaattctatcaaaatcaattttatcaaaatcaattataaccaccgccataccaaa 16121965  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 395 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5584178 - 5584030
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||| | | ||||  ||| |||||||| ||  |||   || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5584178 aaaagctattttgatttaaattatccaaacaacttgaattggtaaaaatcacttctatataaatatatccaaacataaatcaatt-acattaaactcact 5584080  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5584079 tttagtcaaaatcaattctgtcaaaatcaattctatcaaaatcaattctc 5584030  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 402 - 542
Target Start/End: Original strand, 699536 - 699674
Alignment:
Q  402 attttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaacc 501  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||| |||||||   ||| | | ||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||     
T  699536 attttgattcaaactatccaa-caacattaacttataagaattacttttagtaaagtgcatccaaacataaatcaattcttatccaactcacttt-aact 699633  T
Q  502 aaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  699634 aaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaattc 699674  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 542
Target Start/End: Original strand, 21455850 - 21455998
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||  |||  ||||||||  ||||     
T  21455850 tttaaaattaattttgattcaaactatgcaaacaacattaactcatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaaca-caattgattcacatccaactt 21455947  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21455948 acttttaactaaaatcaattcttacaaactcaattatatcaaaatcaattc 21455998  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 486 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15151544 - 15151487
Alignment:
Q  486 taactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15151544 taactcacttctaaccaaaatcaattcactcaaactcaattctatcaaaatcaattct 15151487  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 32599505 - 32599443
Alignment:
Q  482 catttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32599505 cattcaactcacttttaatcaaaatcaattctcttaaattcaattctatcaaaatcaattctc 32599443  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 392 - 543
Target Start/End: Original strand, 7215543 - 7215692
Alignment:
Q  392 tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactc 491  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||| |||||| ||| || |||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||  |||||| |  || ||    
T  7215543 tttaaaattaattttgattcaatttatgcaaacaacattaactcatgagaatcacttttaa-taagtgtatacaaacat-aattgattcacgtccaattc 7215640  T
Q  492 acttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    ||||||||| |||||||| ||    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7215641 acttttaactaaaatcaagtcttaaaaactcaattatatcaaaatcaattct 7215692  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26274671 - 26274608
Alignment:
Q  481 acatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctc 544  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26274671 acattcaactcacttttagtcagaatcaattatgtcaaaatcaattctatcaaaatcaattctc 26274608  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 3605813 - 3605736
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  3605813 ccaaacataaatcacttttcactcaactcacttttaatcaaaatcaattc-tacaaaatcaattatatcaaaatcaatt 3605736  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 524
Target Start/End: Original strand, 882781 - 882842
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaa 524  Q
    |||||||||||||| || || || |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  882781 ccaaacataaatcattttaccttcaactcaattttaactagaatcaattcactcaaactcaa 882842  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 568
Target Start/End: Original strand, 16548216 - 16548253
Alignment:
Q  531 caaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16548216 caaaatcaattctccccaccgccataccaaacacacac 16548253  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 512
Target Start/End: Original strand, 29682138 - 29682255
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    ||||| |||||||||   ||| |||||||||  || |||| ||||||||||||| |   |||  ||| ||||||| ||||||||| |||   |||||| |    
T  29682138 aaaagtaattttgatctcaaccatccaaacaaaataaattaataagaatcacttctgcataaaagtatccaaacacaaatcaatttacacgcaactcaat 29682237  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattc 512  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29682238 tttaaccaaaatcaattc 29682255  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 8420 - 8593
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8420 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaactcataaaaatcatttttaaaaaagtgtatccaaacataaatcaattcacatcaaactcact 8519  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8520 tttaaccaaaatcaattatatcaaactcaattctatcaaaatcaattattcccaccgccataccaaacacacac 8593  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Original strand, 253099 - 253272
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  253099 aaaatcaattttgattcaatctatccaaacaacattaactcataagaatcacttttaactgaaggtatccaaacataaatcaattcatatccaactcaca 253198  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  253199 tttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctctccgccgcccaaccaaacacacac 253272  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 563
Target Start/End: Original strand, 9082 - 9249
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  9082 aaaatcaattttaattcaaactatccaaacaacatctactcataagaatcactttcaagtgagtgtatccaaacatata-caattcatatctaactcact 9180  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaaca 563  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9181 tttaatcaaaatcaattctctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcaccaccgccataccaaaca 9249  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 395 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29252 - 29078
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||   ||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29252 aaaatcaattttgattcaaactatccaaacaacatcaattcataagaataacttctattaaagtgtatccaaacataa-tcaattcacattcaactcact 29154  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacacat 570  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |  || || ||| |||||||| ||||||    
T  29153 tttaaccaaaatcaattctttcaaacttaattctatcaaaatcaattattaccaccaccaaaccaaacacacacat 29078  T

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Target: scaffold0983 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 395 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 2398 - 2225
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |  ||| || |||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  2398 aaaatcaattttgattcaaactatctaaacaacgtcaacttgtaaaaaccacttttaaacaagtgtgtccaaacataaatcaattcacctcaaactcact 2299  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  2298 tttaaccaaaatcaattatgtcaaactcaattctgtcaaaatcaattttcgccaccgccataccaaacagacac 2225  T

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Target: scaffold0394 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 473 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 5882 - 5787
Alignment:
Q  473 atcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  5882 atcaattcacattcaactcacttttaaccaaaatcaattctctcaaactcaattatatcaaaatcaattctccctaccaccataccaaacacacac 5787  T

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Target: scaffold0217 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 2157 - 2011
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||  | || | | ||||||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  2157 aaaatcaattttgacttaaactatccaaacaacatcaagccatgataatcacttttatatgagtgcatccaaacataaatcaattcatatcaaactcatt 2058  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2057 ttgaaccaaaatcaattctttcaaactcaattctatcaaaatcaatt 2011  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 431 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 118504 - 118367
Alignment:
Q  431 aattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctat 530  Q
    ||||||||||||||||||||    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  118504 aattcataagaatcacttttgtacaagtgtatccaaacataaatcaatttacatcaaactcacttttaacaaaaatctattctatcaaactcaattcgat 118405  T
Q  531 caaaatcaattctccccgccgccataccaaacatacac 568  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| ||||    
T  118404 caaaatcaattcctcccaccgccaatccaaacacacac 118367  T

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Target: scaffold0172 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 463 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 15319 - 15242
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  15319 ccaaacataaatcactttatattcaactcacttttaaccaaaatcaatttg-acaaaatcaattctatcaaaatcaatt 15242  T

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Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 138660 - 138521
Alignment:
Q  373 cctttttggtaatttacac-tttaaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacata 471  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| | ||  ||| |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||    
T  138660 cctttttggtaatt-acacatttaaaatcaattttgatttaaattatctaaactttatggattgataagaatcacttttatgttaaggtatccaaacata 138562  T
Q  472 aatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||| |  || | |||||||||||| ||||| |||||    
T  138561 aatcaatttatgttcagctcacttttaactaaaattaattc 138521  T

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Target: scaffold0041 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 395 - 541
Target Start/End: Original strand, 46734 - 46879
Alignment:
Q  395 aaaagcaattttgattcaaactatccaaacatcatcaattcataagaatcacttttaagtaagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcact 494  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||  | |   || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||    
T  46734 aaaatcaattttgatttgaactatccaaacaacatgaattgataaaaatcacttttactttaatatatccaaacataaaccaatt-aagttcaactcact 46832  T
Q  495 tttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaatt 541  Q
    ||||  ||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  46833 tttaggcaaaatcaattctatcaaaatcaattatgtcaaaatcaatt 46879  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 529
Target Start/End: Original strand, 301564 - 301630
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattcta 529  Q
    |||||||||||| |||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  301564 ccaaacataaataaatttatactcaactcacttttgaccaaaatcaattcgatcaaactcaattcta 301630  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 463 - 542
Target Start/End: Original strand, 65539 - 65617
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattc 542  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||| |||||    
T  65539 ccaaacataaatcactttacattaaactcatttttaaccaaaatcaatt-tcacagaatcaattctatcaaaattaattc 65617  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 199431 - 199382
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaattc 512  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  199431 ccaaacataaatcactttacgttcaactcacttttaaccaaaatcaattc 199382  T

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Target: scaffold0168 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 547
Target Start/End: Original strand, 32058 - 32101
Alignment:
Q  504 aatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattctcccc 547  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32058 aatcaattctatcaaaatcaattctatcaaaatcaattctcccc 32101  T

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Target: scaffold0128 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 38426 - 38369
Alignment:
Q  454 taagcgtagccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  38426 taagtgtatccaatcataaatcaatttacatttaacttaattttaaccaaaattaatt 38369  T

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Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38412
Alignment:
Q  503 aaatcaattcgctcaaactcaattctatcaaaatcaattct 543  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38372 aaatcaattctctcaaaatcaattctgtcaaaatcaattct 38412  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 511
Target Start/End: Original strand, 99701 - 99749
Alignment:
Q  463 ccaaacataaatcaattcacatttaactcacttttaaccaaaatcaatt 511  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  99701 ccaaacataaattaatttacattcaactcacttttaattaaaatcaatt 99749  T

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