View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20681_high_9 (Length: 310)

Name: NF20681_high_9
Description: NF20681
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20681_high_9
NF20681_high_9
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (11-283)||(2041-2313)
scaffold0234 (11-283)||(10932-11204)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (11-283)||(17684189-17684461)
chr6 (11-283)||(27380972-27381244)
chr6 (11-283)||(27471355-27471627)
chr6 (11-283)||(11651938-11652210)
chr6 (11-283)||(17691160-17691432)
chr6 (11-283)||(29309105-29309377)
chr6 (11-283)||(29316065-29316336)
chr6 (44-283)||(27296877-27297116)
chr6 (11-283)||(188697-188969)
chr6 (11-283)||(16394165-16394437)
chr6 (42-279)||(25536915-25537152)
chr6 (61-282)||(16559193-16559414)
chr6 (16-266)||(13359010-13359256)
chr6 (32-283)||(27508347-27508594)
chr6 (32-283)||(16789126-16789373)
chr6 (32-283)||(22859888-22860135)
chr6 (32-269)||(27527947-27528180)
chr6 (44-283)||(1586108-1586343)
chr6 (16-273)||(2669513-2669768)
chr6 (32-142)||(18019981-18020088)
chr6 (44-261)||(10359073-10359285)
chr6 (44-283)||(14074547-14074782)
chr6 (11-66)||(16566257-16566312)
chr6 (44-283)||(8612982-8613221)
chr6 (46-198)||(20736413-20736562)
chr6 (29-214)||(8510155-8510338)
chr6 (12-99)||(28172772-28172859)
chr6 (14-180)||(17850321-17850484)
chr6 (15-105)||(27925973-27926062)
chr6 (44-179)||(21994655-21994787)
chr6 (44-283)||(17120505-17120740)
chr6 (51-110)||(5758650-5758709)
chr6 (127-266)||(28756145-28756283)
chr6 (170-283)||(33317055-33317167)
chr6 (11-111)||(19347092-19347191)
chr6 (44-155)||(22560311-22560419)
chr6 (142-205)||(28172899-28172963)
chr6 (32-71)||(13995151-13995190)
chr6 (51-183)||(19218503-19218627)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (11-283)||(24695186-24695458)
chr5 (11-283)||(19714218-19714490)
chr5 (23-283)||(18569581-18569841)
chr5 (11-283)||(19706939-19707210)
chr5 (17-283)||(17298621-17298885)
chr5 (11-161)||(39538803-39538953)
chr5 (11-283)||(17285470-17285740)
chr5 (121-287)||(27347252-27347417)
chr5 (176-283)||(24701950-24702057)
chr5 (16-196)||(18806843-18807021)
chr5 (32-283)||(20941082-20941329)
chr5 (44-283)||(22941317-22941552)
chr5 (32-283)||(25805385-25805632)
chr5 (32-283)||(31954-32201)
chr5 (32-283)||(12789663-12789910)
chr5 (32-283)||(23545977-23546224)
chr5 (11-107)||(22546912-22547008)
chr5 (44-283)||(24933306-24933541)
chr5 (44-283)||(31096883-31097118)
chr5 (46-271)||(20100255-20100476)
chr5 (58-196)||(18806483-18806619)
chr5 (58-196)||(18806663-18806799)
chr5 (34-283)||(18829281-18829530)
chr5 (51-283)||(12764990-12765222)
chr5 (51-283)||(5097725-5097953)
chr5 (44-283)||(7865430-7865669)
chr5 (198-287)||(28719471-28719558)
chr5 (51-283)||(9811733-9811965)
chr5 (51-283)||(12703874-12704106)
chr5 (44-287)||(26129689-26129928)
chr5 (44-283)||(26245169-26245404)
chr5 (202-283)||(39538954-39539035)
chr5 (11-56)||(27347425-27347470)
chr5 (32-108)||(33477193-33477269)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (11-283)||(18262427-18262699)
chr4 (11-283)||(18269288-18269560)
chr4 (11-283)||(55612898-55613170)
chr4 (11-283)||(8858382-8858654)
chr4 (11-283)||(26963855-26964127)
chr4 (11-283)||(26970678-26970950)
chr4 (11-283)||(868812-869084)
chr4 (11-283)||(19926480-19926752)
chr4 (11-283)||(5707535-5707807)
chr4 (11-283)||(5714163-5714435)
chr4 (11-283)||(10621053-10621325)
chr4 (11-283)||(10628132-10628404)
chr4 (11-283)||(28392854-28393126)
chr4 (11-283)||(8845418-8845690)
chr4 (11-283)||(4426336-4426596)
chr4 (15-283)||(5667849-5668115)
chr4 (15-283)||(35223779-35224047)
chr4 (51-283)||(10677303-10677534)
chr4 (51-283)||(10890943-10891174)
chr4 (15-287)||(20311511-20311781)
chr4 (32-283)||(15461552-15461799)
chr4 (32-283)||(34975606-34975853)
chr4 (32-182)||(21453961-21454110)
chr4 (32-283)||(2677068-2677315)
chr4 (32-283)||(15815076-15815323)
chr4 (32-283)||(18111043-18111290)
chr4 (32-283)||(3369023-3369270)
chr4 (32-283)||(17299959-17300206)
chr4 (44-283)||(20244004-20244239)
chr4 (44-283)||(26531680-26531915)
chr4 (44-267)||(19365586-19365806)
chr4 (44-283)||(1941791-1942026)
chr4 (44-283)||(4675983-4676218)
chr4 (44-283)||(18163229-18163464)
chr4 (32-283)||(5870473-5870720)
chr4 (11-108)||(56516271-56516368)
chr4 (44-266)||(19362477-19362695)
chr4 (15-283)||(32646523-32646789)
chr4 (51-267)||(5616469-5616681)
chr4 (45-181)||(32636552-32636685)
chr4 (51-283)||(9487625-9487853)
chr4 (63-283)||(30040489-30040705)
chr4 (44-267)||(5528495-5528714)
chr4 (44-198)||(4546147-4546298)
chr4 (51-267)||(9538033-9538244)
chr4 (23-150)||(34777850-34777975)
chr4 (66-283)||(11421096-11421309)
chr4 (155-205)||(24701361-24701411)
chr4 (32-183)||(33888594-33888740)
chr4 (12-58)||(24700245-24700291)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (11-283)||(6110279-6110551)
chr3 (11-283)||(8490710-8490982)
chr3 (11-283)||(16482203-16482475)
chr3 (11-283)||(10579075-10579347)
chr3 (11-283)||(15600604-15600876)
chr3 (11-283)||(15607149-15607421)
chr3 (11-283)||(10572312-10572584)
chr3 (11-283)||(15357306-15357578)
chr3 (11-283)||(18520190-18520462)
chr3 (11-279)||(18522878-18523146)
chr3 (11-283)||(13211517-13211789)
chr3 (11-283)||(13248822-13249094)
chr3 (11-283)||(15341939-15342211)
chr3 (11-283)||(17780838-17781110)
chr3 (11-283)||(32056619-32056892)
chr3 (11-287)||(17199900-17200176)
chr3 (11-283)||(13517026-13517294)
chr3 (11-283)||(1647241-1647513)
chr3 (11-283)||(17136574-17136840)
chr3 (14-283)||(29925189-29925458)
chr3 (14-283)||(29974342-29974611)
chr3 (12-283)||(16200646-16200917)
chr3 (32-283)||(21034293-21034540)
chr3 (32-283)||(15846536-15846783)
chr3 (32-283)||(20147554-20147801)
chr3 (32-283)||(21398847-21399094)
chr3 (32-283)||(14890446-14890693)
chr3 (44-283)||(55427088-55427323)
chr3 (45-283)||(12299978-12300212)
chr3 (44-283)||(25978728-25978963)
chr3 (19-216)||(24253179-24253372)
chr3 (51-241)||(15526827-15527013)
chr3 (51-183)||(14147095-14147224)
chr3 (44-283)||(11787654-11787889)
chr3 (17-209)||(32280313-32280507)
chr3 (15-144)||(28953965-28954093)
chr3 (44-283)||(15317176-15317408)
chr3 (125-283)||(28088251-28088408)
chr3 (130-239)||(30464147-30464255)
chr3 (122-183)||(36138036-36138097)
chr3 (15-87)||(8251933-8252005)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (11-283)||(18252245-18252517)
chr1 (11-283)||(18532234-18532506)
chr1 (11-283)||(27131130-27131401)
chr1 (11-283)||(27310297-27310569)
chr1 (11-283)||(16358755-16359027)
chr1 (11-283)||(3855639-3855911)
chr1 (11-283)||(36816354-36816625)
chr1 (14-283)||(22641594-22641859)
chr1 (15-283)||(27277278-27277545)
chr1 (11-155)||(21171081-21171225)
chr1 (91-283)||(9916497-9916688)
chr1 (32-283)||(19706439-19706686)
chr1 (32-283)||(28134723-28134970)
chr1 (32-283)||(43802365-43802612)
chr1 (32-283)||(9456171-9456418)
chr1 (32-283)||(20391239-20391486)
chr1 (32-283)||(20779645-20779892)
chr1 (32-283)||(22670257-22670504)
chr1 (32-283)||(42816989-42817236)
chr1 (15-283)||(23507119-23507385)
chr1 (15-205)||(12014084-12014272)
chr1 (17-116)||(22657108-22657207)
chr1 (32-283)||(22612547-22612794)
chr1 (44-263)||(634001-634216)
chr1 (15-85)||(9917837-9917906)
chr1 (51-283)||(8727741-8727969)
chr1 (51-183)||(21881475-21881604)
chr1 (44-196)||(29096789-29096938)
chr1 (44-108)||(35930649-35930713)
chr1 (32-283)||(47667485-47667721)
chr1 (51-104)||(51997353-51997406)
chr1 (16-81)||(12006461-12006526)
chr1 (170-283)||(28145723-28145835)
chr1 (55-110)||(26923553-26923608)
chr1 (136-216)||(12006332-12006413)
chr1 (31-174)||(24301713-24301855)
chr1 (122-181)||(10852402-10852461)
chr1 (225-282)||(35132342-35132399)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (11-282)||(21940880-21941151)
chr8 (14-283)||(22171705-22171974)
chr8 (11-283)||(6094338-6094610)
chr8 (20-283)||(15326422-15326685)
chr8 (20-283)||(15506791-15507054)
chr8 (11-283)||(24642864-24643135)
chr8 (142-283)||(28548393-28548534)
chr8 (15-216)||(14983710-14983908)
chr8 (32-168)||(24797224-24797359)
chr8 (32-283)||(8371253-8371500)
chr8 (32-283)||(12562178-12562425)
chr8 (32-283)||(21969388-21969635)
chr8 (32-283)||(25611250-25611497)
chr8 (32-283)||(27007517-27007764)
chr8 (32-283)||(27014660-27014907)
chr8 (32-283)||(27880487-27880734)
chr8 (32-283)||(28020668-28020915)
chr8 (15-267)||(38232115-38232365)
chr8 (32-283)||(22130609-22130856)
chr8 (44-283)||(22659494-22659729)
chr8 (32-283)||(21916731-21916978)
chr8 (44-283)||(45534273-45534508)
chr8 (44-283)||(26240551-26240786)
chr8 (52-266)||(8781892-8782102)
chr8 (51-181)||(18835424-18835551)
chr8 (44-283)||(6430953-6431188)
chr8 (176-273)||(24796731-24796826)
chr8 (16-174)||(2375231-2375386)
chr8 (11-103)||(32872741-32872833)
chr8 (44-283)||(2962932-2963171)
chr8 (121-267)||(20535226-20535371)
chr8 (23-75)||(10920427-10920479)
chr8 (17-73)||(29645575-29645631)
chr8 (223-271)||(41368106-41368154)
chr8 (223-271)||(41375077-41375125)
chr8 (50-109)||(34659059-34659118)
chr8 (44-83)||(36970332-36970371)
chr8 (170-288)||(36970439-36970556)
chr8 (170-287)||(2375411-2375528)
chr8 (222-283)||(8968015-8968076)
chr8 (134-179)||(29645675-29645720)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (11-283)||(7322-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (11-283)||(6654-6926)
scaffold0390 (11-283)||(13670-13942)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (11-287)||(25706-25982)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (11-279)||(15152658-15152926)
chr7 (11-283)||(29327999-29328271)
chr7 (11-283)||(11535782-11536054)
chr7 (11-283)||(12751041-12751313)
chr7 (11-283)||(11542700-11542972)
chr7 (11-283)||(12738751-12739023)
chr7 (11-283)||(18561222-18561485)
chr7 (15-283)||(13392369-13392637)
chr7 (11-289)||(18257559-18257834)
chr7 (32-283)||(2204607-2204854)
chr7 (32-283)||(8465054-8465301)
chr7 (32-283)||(18400159-18400406)
chr7 (32-283)||(18407143-18407390)
chr7 (32-283)||(48808496-48808743)
chr7 (43-283)||(2365169-2365407)
chr7 (44-283)||(15729818-15730053)
chr7 (44-283)||(18139338-18139573)
chr7 (32-283)||(19230943-19231190)
chr7 (32-271)||(30254193-30254428)
chr7 (44-283)||(41680968-41681203)
chr7 (44-271)||(47166871-47167094)
chr7 (44-283)||(10668901-10669137)
chr7 (51-283)||(34128647-34128875)
chr7 (44-283)||(28130628-28130863)
chr7 (55-261)||(25845498-25845700)
chr7 (55-261)||(25845917-25846119)
chr7 (44-261)||(24443349-24443562)
chr7 (44-283)||(18259124-18259359)
chr7 (44-239)||(19393468-19393659)
chr7 (51-198)||(19388626-19388774)
chr7 (58-183)||(31190538-31190660)
chr7 (11-108)||(10235377-10235474)
chr7 (51-183)||(14591924-14592053)
chr7 (51-183)||(16011515-16011644)
chr7 (51-183)||(22969024-22969153)
chr7 (135-272)||(39112138-39112275)
chr7 (16-99)||(7662569-7662651)
chr7 (32-76)||(19859177-19859221)
chr7 (134-209)||(22948499-22948574)
chr7 (15-85)||(47833875-47833945)
chr7 (32-109)||(3132910-3132986)
chr7 (41-83)||(7396469-7396511)
chr7 (15-65)||(29983184-29983234)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-283)||(18503-18774)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (11-283)||(21329968-21330240)
chr2 (11-283)||(18796721-18796993)
chr2 (15-289)||(18620023-18620296)
chr2 (12-283)||(20978091-20978360)
chr2 (25-283)||(36270395-36270650)
chr2 (15-271)||(18822302-18822556)
chr2 (23-269)||(6991847-6992094)
chr2 (11-283)||(22183206-22183475)
chr2 (32-283)||(30174432-30174679)
chr2 (32-283)||(24250032-24250279)
chr2 (44-271)||(15342014-15342237)
chr2 (44-283)||(24229215-24229450)
chr2 (120-283)||(17241034-17241196)
chr2 (51-285)||(29800545-29800775)
chr2 (16-108)||(19279508-19279600)
chr2 (15-106)||(18851956-18852047)
chr2 (51-198)||(19616509-19616653)
chr2 (51-183)||(40301036-40301164)
chr2 (216-283)||(41661694-41661761)
chr2 (51-183)||(21626824-21626952)
chr2 (136-216)||(36799745-36799826)
chr2 (11-85)||(36801899-36801974)
chr2 (53-258)||(41316305-41316506)
chr2 (122-198)||(28740910-28740986)
chr2 (47-110)||(28718943-28719006)
chr2 (44-85)||(24763751-24763792)
chr2 (44-85)||(28741220-28741261)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (11-264)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (27-283)||(230111-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (11-287)||(5744-6013)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (32-283)||(238-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (32-283)||(3675-3922)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (32-283)||(119785-120032)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (44-271)||(12961-13184)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-283)||(67374-67609)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (32-239)||(130268-130471)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (44-283)||(26609-26844)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (32-183)||(8360-8508)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (53-255)||(8807-9005)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (44-283)||(39988-40223)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (51-283)||(11526-11758)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (93-283)||(102-288)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (51-181)||(83116-83243)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (25-99)||(90019-90093)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (15-106)||(45956-46051)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (44-283)||(53832-54066)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2041
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2313 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 2214  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2213 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 2114  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2113 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11204 - 10932
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11204 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11105  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11104 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11005  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11004 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17684461 - 17684189
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684461 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17684362  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17684361 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17684262  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684261 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27381244 - 27380972
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381244 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27381145  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27381144 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27381045  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381044 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27471627 - 27471355
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471627 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27471528  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27471527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27471428  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471427 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 11651938 - 11652210
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651938 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11652037  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11652038 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11652137  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652138 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17691432 - 17691160
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691432 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17691333  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17691332 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17691233  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691232 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29309105 - 29309377
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309105 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29309204  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  29309205 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtg 29309304  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309305 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29316065 - 29316336
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316065 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29316164  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29316165 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtc-agtg 29316263  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316264 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 188969 - 188697
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188969 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 188870  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  188869 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 188770  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  188769 ctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16394437 - 16394165
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  16394437 cacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagta 16394338  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16394337 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagtg 16394238  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16394237 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  42 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc 141  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  142 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  242 tgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 279  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  61 aggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  161 ccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggt 260  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  261 tgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13359256 - 13359010
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||   | ||||||  ||||||||| | |||  |    
T  13359256 atcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--t 13359161  T
Q  116 tataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  13359160 tatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtatttt 13359062  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgg 266  Q
    ||  || | ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13359061 gttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27508594 - 27508347
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  27508594 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27508498  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27508497 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27508399  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27508398 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 16789126 - 16789373
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  16789126 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 16789222  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  16789223 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 16789321  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  16789322 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22860135 - 22859888
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  22860135 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 22860039  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  22860038 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 22859940  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22859939 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27528180 - 27527947
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  27528180 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27528084  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27528083 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27527985  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27527984 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1586343 - 1586108
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  1586343 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 1586247  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  1586246 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 1586148  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1586147 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 2669513 - 2669768
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||    
T  2669513 atcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgt 2669610  T
Q  116 tataaaaagtgtcataagatattctcatagtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    | |   |||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||  || ||||    
T  2669611 tgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtacttt 2669709  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactcc 273  Q
    ||   | |||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  2669710 gttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtactcc 2669768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18020088 - 18019981
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  18020088 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 18019992  T
Q  132 agatattctca 142  Q
    |||||||||||    
T  18019991 agatattctca 18019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359073
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagtat--gttatgaa--gtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||| |    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  244 atgactataaagttggtt 261  Q
    || || || |||||||||    
T  10359090 ataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 14074547 - 14074782
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||| |||     
T  14074547 acataggtataaatattgggagtaatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattttcac 14074643  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | |||||   ||||||    | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| | || || ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| | |    
T  14074644 aatgataaaagtgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaagg 14074742  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14074743 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16566312 - 16566257
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566312 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 8612982 - 8613221
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||||||||    
T  8612982 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 8613079  T
Q  141 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  8613080 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 8613178  T
Q  241 atgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | ||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8613179 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736413
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatag 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | ||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  146 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 198  Q
    ||||| | ||||||  ||| ||| ||||| |||| ||| ||  ||||||||||    
T  20736465 tgataatagtgtatatcactcttagacctaaaactactatgatccctagatgt 20736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  29 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgt 127  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||  || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  128 cataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 28172772 - 28172859
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 99  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28172772 acagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17850484 - 17850321
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||| |         
T  17850484 agatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacattg----g 17850389  T
Q  114 gttata-aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 180  Q
    ||| ||   |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17850388 gttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 27925973 - 27926062
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactaca 105  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  27925973 gatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994787
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 179  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaac 21994787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||| |||| ||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| || | | |    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatgt-ggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758650
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagta 5758650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756145
Alignment:
Q  127 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||  || |||  |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||  || |||| |||||| ||||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcacca-tcaa 28756185  T
Q  227 acgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgg 266  Q
    | |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatgg 28756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  270 ctccatgaatcatg 283  Q
    ||  ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19347191 - 19347092
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19347191 cacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacattagaa-taatatttgtaatggattgaactgccattagaatactacatagta 19347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22560419 - 22560311
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  22560419 acataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 22560323  T
Q  144 agtgatagtggt 155  Q
    | ||||| ||||    
T  22560322 aatgataatggt 22560311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 205
Target Start/End: Original strand, 28172899 - 28172963
Alignment:
Q  142 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtc 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  28172899 atagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctagatataggagtc 28172963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13995190 - 13995151
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 71  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995190 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 19218503 - 19218627
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||     | || || ||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||| | |||||    
T  19218503 tataaatattaggagtaaaatttatattg-----acccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaaatt-tcataagatattctcagaatgata 19218594  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
     || | ||| | || ||| ||||||||||||||    
T  19218595 atgatatatactactcttagacctgaaaccact 19218627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24695458 - 24695186
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695458 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 24695359  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24695358 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 24695259  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695258 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19714490 - 19714218
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714490 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19714391  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19714390 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19714291  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19714290 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18569841 - 18569581
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569841 ataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 18569742  T
Q  123 agtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18569741 agtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccat 18569642  T
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569641 tcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19707210 - 19706939
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707210 cacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19707111  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19707110 aaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtg 19707012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707011 ctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17298885 - 17298621
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  17298885 tcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtag--aaagtt 17298788  T
Q  117 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttg 215  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  17298787 atgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagtactttg 17298689  T
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |  || | |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17298688 tttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 39538803 - 39538953
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  39538803 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagta 39538902  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattc 161  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39538903 aaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17285740 - 17285470
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||      
T  17285740 cacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaatactacatag-- 17285643  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagt 209  Q
    ||||||||  | | | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| | | ||| ||||||    
T  17285642 aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagt 17285544  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||  || | ||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17285543 actttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27347417 - 27347252
Alignment:
Q  121 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27347417 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgttttgtcacc 27347318  T
Q  221 attcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347317 attcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24702057 - 24701950
Alignment:
Q  176 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccat 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702057 aaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccat 24701958  T
Q  276 gaatcatg 283  Q
    ||||||||    
T  24701957 gaatcatg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18807021 - 18806843
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||    
T  18807021 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagt 18806924  T
Q  116 tataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 196  Q
    | |   || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18806923 t-ttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 20941082 - 20941329
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  20941082 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 20941178  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  20941179 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 20941277  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20941278 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941552
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 22941413  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  22941414 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22941512  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22941513 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25805632 - 25805385
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  25805632 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 25805536  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | |||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25805535 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25805437  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25805436 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 31954 - 32201
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  31954 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 32050  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  32051 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 32149  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32150 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12789910 - 12789663
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  12789910 tatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 12789814  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  ||||| |  | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  12789813 agatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 12789715  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12789714 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 23545977 - 23546224
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  23545977 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 23546073  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  23546074 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 23546172  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  23546173 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22547008 - 22546912
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacata 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22547008 cacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatactacata 22546912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24933541 - 24933306
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  24933541 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 24933445  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  24933444 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 24933346  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24933345 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 31096883 - 31097118
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  31096883 acataggtataaattataggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 31096979  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| | ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  31096980 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 31097078  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31097079 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20100476 - 20100255
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatag 145  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| |     
T  20100476 ataggtatcaatattaggagtaatacttatactggcttgacccaacgtgagaaaactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaa 20100380  T
Q  146 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgat 245  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||  ||| ||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||| |||| | |||    
T  20100379 tgataatggtgtataccactcttagacatgaaaccactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggat 20100281  T
Q  246 gactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     || |||| |||||||||||||||||    
T  20100280 aaccataatgttggttgatgggtact 20100255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806483
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 156  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  157 tattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806663
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtg 156  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  157 tattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactagat 18806663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829281
Alignment:
Q  34 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataag 133  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||  ||||||||   ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttat-gtaagttccataag 18829434  T
Q  134 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttg 232  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| || |||||  |||||| || ||||||   | | |||| ||      
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtacact-gatgtgagagtcgtgtactttgttgtcgtacaaatgtca 18829335  T
Q  233 tccgtaacatgatgactataaagttgg---ttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  18829334 tctataaaatgatgactataaagttggttattgatgggtactccatggatcatg 18829281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12765222 - 12764990
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||   |  || |||||||||| ||||||| | ||    
T  12765222 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatg 12765125  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  12765124 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12765026  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12765025 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 5097725 - 5097953
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||| |||||||| | |||||    
T  5097725 tataaatattatgagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagttattctcacaatgata 5097821  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |    
T  5097822 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataacca 5097920  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  5097921 taacgtttgttgatgggtacatgatgaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7865669 - 7865430
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||||||||    
T  7865669 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 7865572  T
Q  141 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  7865571 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 7865473  T
Q  241 atgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | ||| || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7865472 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  198 ttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9811965 - 9811733
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||    
T  9811965 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 9811868  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  9811867 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 9811769  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9811768 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12704106 - 12703874
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||   |  || ||||||||||| |||||| | ||    
T  12704106 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 12704009  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    ||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  12704008 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12703910  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12703909 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||  | ||||||| |||| || |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| | |    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26245169 - 26245404
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  26245169 acataggtataaatattaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcac 26245265  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | || || | ||||||  | | ||| |||||||||||| | ||  | ||||||  |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  26245266 aatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 26245364  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26245365 ataaccatagcgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Original strand, 39538954 - 39539035
Alignment:
Q  202 agtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | || | ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  39538954 agtcgagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27347470 - 27347425
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347470 cacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33477269 - 33477193
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477269 tatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacataattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18262427 - 18262699
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262427 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18262526  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18262527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18262626  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262627 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18269288 - 18269560
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269288 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18269387  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18269388 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18269487  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269488 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 55612898 - 55613170
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612898 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 55612997  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55612998 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 55613097  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613098 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8858382 - 8858654
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858382 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8858481  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8858482 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8858581  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858582 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26963855 - 26964127
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963855 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26963954  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26963955 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26964054  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964055 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26970678 - 26970950
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970678 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26970777  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26970778 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26970877  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970878 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 868812 - 869084
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868812 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 868911  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  868912 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 869011  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869012 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19926752 - 19926480
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926752 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19926653  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19926652 aaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19926553  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926552 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5707535 - 5707807
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707535 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5707634  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5707635 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5707734  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707735 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5714163 - 5714435
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714163 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5714262  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5714263 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5714362  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714363 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10621325 - 10621053
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621325 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10621226  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10621225 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10621126  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621125 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10628404 - 10628132
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628404 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10628305  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10628304 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10628205  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628204 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28393126 - 28392854
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393126 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 28393027  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28393026 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 28392927  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28392926 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8845418 - 8845690
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845418 cacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8845517  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8845518 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8845617  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845618 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4426596 - 4426336
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426596 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 4426497  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||  ||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4426496 aaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 4426409  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426408 ctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5668115 - 5667849
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  5668115 gatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaag 5668016  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5668015 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgcttt 5667918  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5667917 gtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 35223779 - 35224047
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  35223779 gatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaag 35223878  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35223879 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgcttt 35223978  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35223979 atcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| | |||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 20311511 - 20311781
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  | ||    
T  20311511 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acag 20311608  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||  ||  | |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  20311609 ttatgtaac-tatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactt 20311707  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    |||  || | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  20311708 tgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 15461552 - 15461799
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  15461552 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 15461648  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  15461649 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 15461747  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15461748 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 34975606 - 34975853
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  34975606 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 34975702  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  34975703 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgtt 34975801  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34975802 gtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453961
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac 182  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaaccac 21453961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 2677068 - 2677315
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  2677068 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 2677164  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  2677165 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 2677263  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2677264 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 15815076 - 15815323
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  15815076 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 15815172  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  15815173 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 15815271  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  15815272 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18111290 - 18111043
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  18111290 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 18111194  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18111193 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18111095  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18111094 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3369270 - 3369023
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  3369270 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 3369174  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  3369173 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 3369075  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3369074 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17300206 - 17299959
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  17300206 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 17300110  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  17300109 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 17300011  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  17300010 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgatgaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 20244004 - 20244239
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  20244004 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 20244100  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  20244101 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20244199  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20244200 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26531680 - 26531915
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  26531680 acataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 26531776  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  26531777 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 26531875  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  26531876 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365806
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca- 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  143 tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacat 242  Q
     | ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||     
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  243 gatgactataaagttggttgatggg 267  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatggg 19365806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942026
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| | |    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4676218 - 4675983
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  4676218 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 4676122  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| | |    
T  4676121 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaagg 4676023  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4676022 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 18163229 - 18163464
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  18163229 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 18163325  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18163326 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18163424  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18163425 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 5870473 - 5870720
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  5870473 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 5870569  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
     |||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||   ||||| ||||||    
T  5870570 tgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgtt 5870668  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||  ||| | ||| || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  5870669 gtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatgaatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 56516271 - 56516368
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516271 cacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 266
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362695
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||  || |||||| |||| |  | |||||| |   ||||||||||||||| |||||| |    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgg 266  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatgg 19362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32646789 - 32646523
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||  ||| |    
T  32646789 gatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata--aaagg 32646692  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||  | |  |||| | || |||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||  |||||| || |||    
T  32646691 ttatgtata-agtcacatgacattcccgtagtgataagtggtgtattttacccttcgacctgaaacaactctgtatcctggatgtatgagtcgggtactt 32646593  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||   | | |||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  32646592 tgttgtcgtacaaacgtcatccataacaggatgattatgaagtcggttgatgggtaccggatgaatcatg 32646523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatgaaa-gtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     |||||||| |||  ||| || ||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||||||||  |||||| ||| |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  251 taaagttggttgatggg 267  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 181
Target Start/End: Original strand, 32636552 - 32636685
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  32636552 cataggtataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcaca 32636648  T
Q  145 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 181  Q
     ||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  32636649 atgataatggtgtataccactctccgacgtgaaacca 32636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||||||||||||||| | |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| | ||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  63 gagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcc 162  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagtat--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  163 acccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttg 262  Q
    || ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| || |||||  |||| | ||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  263 atgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||||  ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528495
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| ||||||||  ||| |||  |||||||||  || ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||||| || |||||| |    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  244 atgactataaagttggttgatggg 267  Q
    || || |||| ||||||| |||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatggg 5528495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546298
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | ||||||||||||||||||     
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcac 4546243  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 198  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  4546244 aatgataatagtgtatatcgctctttgacctaaaaccactatgatccctagatgt 4546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538244
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttat-gaaagtgtcataagatattctcacaatgata 9538129  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     ||| ||  ||||  ||| ||||| |||||||  ||  || | |||| |||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||| || |    
T  9538130 atggcgt-gtccagtcttagacctcaaaccaccatgatccttggatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataacca 9538227  T
Q  251 taaagttggttgatggg 267  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  9538228 taacgttggttaatggg 9538244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777850
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||  ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  123 agtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatattttgatagtgata 34777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 283
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421309
Alignment:
Q  66 taatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacc 165  Q
    |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |  |||||  |||     
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattatcacagggataataatgtatatcact 11421192  T
Q  166 cttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatg 265  Q
    | | |||||||||||||| ||  || |||||| || | || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| ||||| | |||    
T  11421193 catagacctgaaaccactatgatccgtagatg-tgtactcaagtgctttattgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataatgttggctaatg 11421291  T
Q  266 ggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11421292 ggtactcgatgaatcatg 11421309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701411
Alignment:
Q  155 tgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtc 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtc 24701411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888740
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||  ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcact 33888740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 24700245 - 24700291
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 58  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700245 acagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6110279 - 6110551
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110279 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6110378  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6110379 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6110478  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110479 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8490710 - 8490982
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490710 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8490809  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8490810 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8490909  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16482475 - 16482203
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482475 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16482376  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16482375 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16482276  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482275 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10579347 - 10579075
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10579347 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 10579248  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10579247 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10579148  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579147 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15600876 - 15600604
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600876 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15600777  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15600776 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15600677  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15600676 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15607421 - 15607149
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607421 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15607322  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15607321 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15607222  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15607221 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10572584 - 10572312
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572584 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10572485  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10572484 aaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtg 10572385  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572384 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15357578 - 15357306
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357578 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagta 15357479  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15357478 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15357379  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357378 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18520190 - 18520462
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520190 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagta 18520289  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18520290 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18520389  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520390 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 18522878 - 18523146
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18522878 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagta 18522977  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18522978 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18523077  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523078 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13211517 - 13211789
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13211517 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagta 13211616  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  13211617 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13211716  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211717 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13248822 - 13249094
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13248822 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagta 13248921  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13248922 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13249021  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249022 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15342211 - 15341939
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15342211 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 15342112  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15342111 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15342012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342011 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17781110 - 17780838
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781110 cacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17781011  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17781010 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17780911  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32056892 - 32056619
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056892 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 32056793  T
Q  110 aaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagt 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32056792 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 32056693  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32056692 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17200176 - 17199900
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17200176 cacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagta 17200077  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17200076 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtg 17199977  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17199976 ttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13517026 - 13517294
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13517026 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagta 13517125  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13517126 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13517221  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13517222 ctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1647513 - 1647241
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  1647513 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataata 1647414  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1647413 aaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtg 1647314  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1647313 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 17136574 - 17136840
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17136574 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 17136667  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17136668 aaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17136767  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17136768 cttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29925189 - 29925458
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||    
T  29925189 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29925288  T
Q  114 gttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29925289 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29925388  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29925389 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29974342 - 29974611
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||    
T  29974342 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29974441  T
Q  114 gttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29974442 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29974541  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29974542 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Original strand, 16200646 - 16200917
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16200646 acagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtca 16200745  T
Q  112 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgc 211  Q
    || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16200746 aaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgaagtcgagtgc 16200845  T
Q  212 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16200846 tttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21034293 - 21034540
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  21034293 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 21034389  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21034390 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21034488  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21034489 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15846783 - 15846536
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  15846783 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 15846687  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  15846686 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 15846588  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15846587 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20147801 - 20147554
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  20147801 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 20147705  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20147704 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20147606  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20147605 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21398847 - 21399094
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  21398847 tatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 21398943  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||| | | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21398944 agatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21399042  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21399043 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 14890446 - 14890693
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  14890446 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 14890542  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  14890543 agatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 14890641  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14890642 gtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 55427088 - 55427323
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  55427088 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 55427184  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  55427185 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 55427283  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  55427284 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 12299978 - 12300212
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  12299978 catagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcaca 12300074  T
Q  145 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatga 244  Q
     ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||    
T  12300075 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 12300173  T
Q  245 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12300174 taacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24253372 - 24253179
Alignment:
Q  19 atggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||    
T  24253372 atggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat 24253275  T
Q  119 aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
       |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||  || |||||| ||||||    
T  24253274 -ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaaccactatgtaccttagatgtatgactcgagtactttgt 24253179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 241
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527013
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   | ||| |||| |||||||||||||||| | | || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagtat--gctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  || || ||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaaca 15527013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 14147095 - 14147224
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||    
T  14147095 tataaatattaggaggaatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgata 14147191  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
      |||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  14147192 aaggtgtatatcactcttagacctgaaaccact 14147224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787889
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | | ||||||||||||||||     
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gatattttcataagatattctcac 11787750  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||| | ||  ||||||||  |  | || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||   |    
T  11787751 aatgataatattgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagat-ctataatcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatgg 11787849  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11787850 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280507
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| | | | |||| || | ||||||||| |||||||| |  ||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagtga--gtc 32280410  T
Q  117 ataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccac----tttgtaccctagatgttggagtcgagt 209  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||  || |||||||||    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgataatgatttattttaccttttcacttgaaaccactatatatgtaccctagatgtaggagtcgagt 32280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954093
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  | ||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  114 gttataaaaagtgtcataagatattctcata 144  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcata 28954093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317176
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||  | | ||||||||||||||||||     
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttat-gagattgtcataagatattctcac 15317312  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | |||||   | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||   |    
T  15317311 aatgataatagtgtaaatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgt---cattctaacgttgtctgtaaacgg 15317216  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15317215 ataatcataacgttggttgacgggtacttgatgaatcatg 15317176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 283
Target Start/End: Original strand, 28088251 - 28088408
Alignment:
Q  125 tgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattc 224  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || || |||||||  ||||||    
T  28088251 tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagggctttgttgccattc 28088349  T
Q  225 aaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28088350 taacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 239
Target Start/End: Original strand, 30464147 - 30464255
Alignment:
Q  130 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||    
T  30464147 taagatattctcataatgataatggtctataccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgacattcaaacg 30464245  T
Q  230 ttgtccgtaa 239  Q
    ||||| ||||    
T  30464246 ttgtctgtaa 30464255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138036
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcact 36138036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8252005 - 8251933
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatc 87  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8252005 gatcatgaataaaatgttatcaaatctttacataaatttacatatttcgagtaatatttatatttgattgatc 8251933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18252245 - 18252517
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252245 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18252344  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18252345 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18252444  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252445 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18532506 - 18532234
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532506 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18532407  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18532406 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18532307  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532306 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27131401 - 27131130
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131401 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27131302  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27131301 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtg 27131203  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131202 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27310569 - 27310297
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310569 cacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27310470  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27310469 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27310370  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310369 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16359027 - 16358755
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359027 cacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16358928  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16358927 aaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16358828  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358827 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3855911 - 3855639
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3855911 cacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagta 3855812  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  3855811 aaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcg 3855712  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3855711 ctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36816625 - 36816354
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36816625 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 36816526  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  36816525 aaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcg 36816427  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  36816426 ttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtactccacaaatcatg 36816354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22641859 - 22641594
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22641859 agatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-actacatagtaaaa 22641764  T
Q  114 gttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22641763 gttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctt 22641664  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22641663 tgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27277545 - 27277278
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||| | |||||||||||    
T  27277545 gatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaag 27277446  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27277445 tcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 27277347  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     |||  |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27277346 atcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21171225 - 21171081
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171225 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21171126  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171125 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916497
Alignment:
Q  91 catgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaa-ccactttgta 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  189 ccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19706686 - 19706439
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  19706686 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 19706590  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  19706589 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 19706491  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19706490 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28134970 - 28134723
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  28134970 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 28134874  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  28134873 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 28134775  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28134774 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43802612 - 43802365
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  43802612 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 43802516  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  43802515 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 43802417  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43802416 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 9456171 - 9456418
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  9456171 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 9456267  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  9456268 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 9456366  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  9456367 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20391486 - 20391239
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||  ||||| |||  | |||||    
T  20391486 tatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagtaa--gttatgaaattt-tcata 20391390  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  ||||| || | ||| |||||||||||||| ||  | |||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20391389 agatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20391291  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20391290 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20779892 - 20779645
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  20779892 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 20779796  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20779795 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20779697  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  20779696 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22670504 - 22670257
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  22670504 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 22670408  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22670407 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22670309  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22670308 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42817236 - 42816989
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  42817236 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 42817140  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  42817139 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 42817041  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  42817040 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 23507119 - 23507385
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| || |        
T  23507119 gatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagagaacgtt 23507218  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
     | |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| |||    
T  23507219 gtgtaaaaag---cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactt 23507315  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| | ||| ||||    ||| |||| | |||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  23507316 tgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12014272 - 12014084
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||     
T  12014272 gatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaat 12014173  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtc 205  Q
     | ||||||   ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12014172 atgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagtc 12014084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22657207 - 22657108
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657207 tcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 22612547 - 22612794
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  22612547 tatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 22612643  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22612644 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22612742  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||  ||| | ||| |  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22612743 gtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 634001 - 634216
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||  | | ||||||||||||||||||     
T  634001 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcac 634097  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  634098 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 634196  T
Q  244 atgactataaagttggttga 263  Q
    || || |||| |||||||||    
T  634197 ataaccataacgttggttga 634216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9917906 - 9917837
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9917906 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727969
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
       ||||||  ||| ||| |||||| ||||||| ||  |||||||||  ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||  |||| | |||||||||  ||||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881475
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 21881475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096938
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||   | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagat 196  Q
    | ||||| |||||| |  ||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatgatccctagat 29096938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 35930649 - 35930713
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930649 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47667721 - 47667485
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||           |||  |||||||  ||| |||||||    
T  47667721 tatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaccgtga-----------agt--aagttat-gaaattgtcata 47667636  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  47667635 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 47667537  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47667536 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 47667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 104
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12006526 - 12006461
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattgga 81  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12006526 atcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  270 ctccatgaatcatg 283  Q
    ||  ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26923608 - 26923553
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  26923608 aatattaggagtaatatttatactgaattgacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12006413 - 12006332
Alignment:
Q  136 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||    
T  12006413 attctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgtagaagtcaagtactttgt 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24301855 - 24301713
Alignment:
Q  31 ttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattta-tattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtca 129  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||   | ||  || |||||||| ||||||| |  |||||   |||| |||    
T  24301855 ttatcaagatttcacataggtatacatattaggagtaatatttgctattagaaatacccatcacgagaataccacatagtga--gttatgttaagtatca 24301758  T
Q  130 taagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacct 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24301757 taagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacct 24301713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10852461 - 10852402
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 181  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  10852461 aagtgtcataagatatttttaaagtgataatggtgtatgtcacccttcaacctgaaacca 10852402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Original strand, 35132342 - 35132399
Alignment:
Q  225 aaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  35132342 aaacgttgtccataacatgataattataaagttgtttgatatgtacttcatgaatcat 35132399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 21940880 - 21941151
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940880 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21940979  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21940980 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21941079  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941080 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 22171705 - 22171974
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171705 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 22171804  T
Q  114 gttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171805 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 22171904  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171905 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6094338 - 6094610
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6094338 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagta 6094437  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6094438 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6094537  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094538 ctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttata 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttata 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 24642864 - 24643135
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24642864 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagta 24642963  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24642964 aaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtg 24643062  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643063 ttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 142 - 283
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548534
Alignment:
Q  142 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548393 atagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 28548492  T
Q  242 tgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548493 gggtgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14983908 - 14983710
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14983908 gatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaag 14983812  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  14983811 ttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactt 14983713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24797359 - 24797224
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24797359 tatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 24797260  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctt 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24797259 agatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8371500 - 8371253
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  8371500 tatcaagtctatacataggtataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 8371404  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  8371403 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 8371305  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8371304 gtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 12562178 - 12562425
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  12562178 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 12562274  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||    
T  12562275 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 12562373  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12562374 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21969388 - 21969635
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  21969388 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 21969484  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21969485 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21969583  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21969584 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 25611250 - 25611497
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  25611250 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaactgtcata 25611346  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25611347 agatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25611445  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||  ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  25611446 gtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27007764 - 27007517
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  27007764 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 27007668  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27007667 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27007569  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27007568 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27014907 - 27014660
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  27014907 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 27014811  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27014810 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27014712  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27014711 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27880734 - 27880487
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  27880734 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 27880638  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27880637 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27880539  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27880538 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28020915 - 28020668
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  28020915 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 28020819  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  28020818 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 28020720  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  28020719 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38232365 - 38232115
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  38232365 gatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaag 38232268  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||  ||| ||||| | | ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||    | |||||||| ||||| | |||||||| |||    
T  38232267 ttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactt 38232169  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 267  Q
    |||   | | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38232168 tgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22130856 - 22130609
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  22130856 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 22130760  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22130759 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22130661  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||  ||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  22130660 gtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22659729 - 22659494
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  22659729 acataggtataaatattaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 22659633  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  22659632 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 22659534  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22659533 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21916731 - 21916978
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||||    
T  21916731 tatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttat-gaaattgtcata 21916827  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21916828 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21916926  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || ||||  |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  21916927 gtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgatgaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45534508 - 45534273
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  45534508 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 45534412  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| | |    
T  45534411 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 45534313  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45534312 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240786
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||  |  |||||  | | ||| ||||| |||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| | |    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781892
Alignment:
Q  52 ataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagtct--gttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  152 tggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactat 251  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||| ||| |   ||||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttattgtcattcaaacgttgtttgtaacatgataaccat 8781907  T
Q  252 aaagttggttgatgg 266  Q
    || ||| ||| ||||    
T  8781906 aacgttcgttaatgg 8781892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 181
Target Start/End: Original strand, 18835424 - 18835551
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  18835424 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttttaaaaa-tgtcataagatattcacacagtgata 18835520  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 181  Q
     ||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  18835521 atggtgtatatcactcttagacctgaaacca 18835551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||  | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||  ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24796826 - 24796731
Alignment:
Q  176 aaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactcc 273  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24796826 aaaccactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtactcc 24796731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 2375231 - 2375386
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||| |||||||  ||||||    
T  2375231 atcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacata--aaaagt 2375328  T
Q  116 tataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacct 174  Q
    |||  |||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2375329 tatgtaaa-actcat-agttattctcatagtgataagtggtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 32872833 - 32872741
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatacta 103  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  32872833 cacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  ||||   |  || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  141 catagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    || | ||||| | | ||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||| | |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  241 atgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | ||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20535371 - 20535226
Alignment:
Q  121 aaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcacc 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||  || || ||  |||| || |||||||| |  ||    
T  20535371 aaagtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaaccactatgatccttaaat-atggactcaagtgctttattgcc 20535273  T
Q  221 attcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatggg 267  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| || |||| ||||||| |||||    
T  20535272 attcaaacgttgtctataacaggataaccataatgttggttaatggg 20535226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 75  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 29645575 - 29645631
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 73  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645575 tcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368106
Alignment:
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41368106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375077
Alignment:
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtact 41375077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 109
Target Start/End: Original strand, 34659059 - 34659118
Alignment:
Q  50 atataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 109  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  34659059 atatatatattaggactaatatttatattggatttatccaccatgcaaatactaaatagt 34659118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 83
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 36970439 - 36970556
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||| |||||| |  |||| | | | || |||| |||||||||||||||    
T  36970439 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttatatgtaaaagggtaacaataacgttggttgatgggta 36970537  T
Q  270 ctccatgaatcatgatgat 288  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  36970538 cttgatgaatcatgctgat 36970556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 287
Target Start/End: Original strand, 2375411 - 2375528
Alignment:
Q  170 gacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |||||||||| | | | |||| ||||||| |||||||||| ||||||  | || ||||| |  |||| ||   ||| |||||||||| |||||||||||     
T  2375411 gacctgaaactattatttaccatagatgtaggagtcgagtactttgttgctatacaaacatcatccgcaattggataactataaagtcggttgatgggtg 2375510  T
Q  270 ctccatgaatcatgatga 287  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2375511 ctccatgaattatgatga 2375528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  222 ttcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 179
Target Start/End: Original strand, 29645675 - 29645720
Alignment:
Q  134 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaac 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  29645675 atattctcatagtgatagtgatgtacttcaccattcgacctgaaac 29645720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 7322 - 7594
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7322 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 7421  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7422 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 7521  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7522 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6926 - 6654
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6926 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6827  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6826 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6727  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13942 - 13670
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13942 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 13843  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13842 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13743  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13742 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25982 - 25706
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25982 cacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 25883  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25882 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 25783  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25782 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 15152658 - 15152926
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152658 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15152757  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15152758 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15152857  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152858 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29327999 - 29328271
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327999 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29328098  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29328099 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 29328198  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29328199 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11536054 - 11535782
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536054 cacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11535955  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11535954 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11535855  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535854 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 12751041 - 12751313
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751041 cacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12751140  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12751141 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtg 12751240  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12751241 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11542972 - 11542700
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542972 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11542873  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11542872 aatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtg 11542773  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542772 atttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 12738751 - 12739023
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738751 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12738850  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12738851 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtg 12738950  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738951 ctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18561222 - 18561485
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  18561222 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagta 18561321  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18561322 aaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtg 18561412  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  18561413 atttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 13392369 - 13392637
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||     
T  13392369 gatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaat 13392468  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  13392469 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgcttt 13392568  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392569 gtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18257834 - 18257559
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || | |||||| ||||||||     
T  18257834 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt- 18257736  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
     | || || |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||    
T  18257735 -atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtg 18257638  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 289  Q
    ||||||  |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  18257637 ctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 2204607 - 2204854
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  2204607 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 2204703  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  2204704 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 2204802  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2204803 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 8465054 - 8465301
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  8465054 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 8465150  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  || |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||    
T  8465151 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacatt 8465249  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8465250 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 18400159 - 18400406
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  18400159 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 18400255  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18400256 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18400354  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18400355 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 18407143 - 18407390
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  18407143 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 18407239  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18407240 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18407338  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18407339 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48808743 - 48808496
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  48808743 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 48808647  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  48808646 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 48808548  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  48808547 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 283
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365407
Alignment:
Q  43 cacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  143 tagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  242 tgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
       |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatgagtgctcaacgaatcatg 2365407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 15729818 - 15730053
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  15729818 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 15729914  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||    | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  15729915 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15730013  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15730014 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18139573 - 18139338
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  18139573 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 18139477  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18139476 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18139378  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18139377 ataataataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 19230943 - 19231190
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||    
T  19230943 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttat-gaaattgtcata 19231039  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  19231040 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 19231138  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||  |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19231139 gtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 271
Target Start/End: Original strand, 30254193 - 30254428
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  30254193 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 30254289  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||   || ||| ||| |||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  30254290 agatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 30254388  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  30254389 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtact 30254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47167094 - 47166871
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  47167094 acataggtataaatattatgagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 47166998  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  47166997 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 47166899  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    || || |||| |||||||||||||||||    
T  47166898 ataaccataacgttggttgatgggtact 47166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10669137 - 10668901
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctc-a 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||      
T  10669137 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcgc 10669041  T
Q  143 tagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacat 242  Q
     | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  || || ||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| |     
T  10669040 aattgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaag 10668942  T
Q  243 gatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10668941 gataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||   ||||| | |  |||||||||||||||||| | | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagtac--gttatgagat-tgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130863
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | | ||| | ||||||  ||  ||| ||||||||| |||| ||  || |||||| |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25845700 - 25845498
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25845700 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25845604  T
Q  155 tgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaa 254  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25845603 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845505  T
Q  255 gttggtt 261  Q
    |||||||    
T  25845504 gttggtt 25845498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25846119 - 25845917
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||  | ||||| |||| | |||||||||||||||| | | ||| ||     
T  25846119 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25846023  T
Q  155 tgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaa 254  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |  |||||||||| || || |||| | ||| |||||||     
T  25846022 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845924  T
Q  255 gttggtt 261  Q
    |||||||    
T  25845923 gttggtt 25845917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24443562 - 24443349
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || || ||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||||     
T  24443562 acataggtatgaatattaggagtaatatttatactagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcac 24443466  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||||||| | ||  ||||||||| |||| || |||||||| |    |||||||||||||  |||||| |    
T  24443465 agtgataatggtgtataacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacagg 24443367  T
Q  244 atgactataaagttggtt 261  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  24443366 atgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| || || || |||||||||| ||||||||  ||||| | |  ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagtaa--gttatgagat-tgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||  | ||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393468
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  || |||||||||||||||||  | ||||| |||| | ||||||||||||||||     
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctcac 19393563  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaa 239  Q
    | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||| ||| | ||  ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||| || |||||| ||||    
T  19393562 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaatccagtatgatccctagatgtt-gactcaagtgctttgttacctttctaatgttgtctgtaa 19393468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Original strand, 19388626 - 19388774
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||||||   |  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19388626 tataaatattaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgg 19388724  T
Q  149 tagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 198  Q
    || | |||||| |||| ||| |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  19388725 taatagtgtataccactcttagacctgaaaccattatgagccctagatgt 19388774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190538
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgt 157  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgt--atgttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  158 attccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccact 31190538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 10235377 - 10235474
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||  |||||||    
T  10235377 cacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatgagaattatacatag 10235474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592053
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcagattgata 14592020  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
     | ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14592021 atagtgtatatcactcttagacttgaaaccact 14592053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011644
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||    ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacattgata 16011611  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
     |  |||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16011612 ataatgtatatcactcttagacctgaaaccact 16011644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969153
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
      ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaagccact 22969153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 272
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112275
Alignment:
Q  135 tattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||| ||||| |||||||| ||| || |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  235 cgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactc 272  Q
     |||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtactc 39112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7662651 - 7662569
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 99  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  7662651 atcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 19859177 - 19859221
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 76  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859177 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  134 atattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagt 209  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47833945 - 47833875
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| ||||||    
T  47833945 gatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatattactcataatatttatatttgattga 47833875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 3132910 - 3132986
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 109  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  3132910 tatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taatatttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 83
Target Start/End: Original strand, 7396469 - 7396511
Alignment:
Q  41 ttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggatt 83  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7396469 ttcacataaatataaatattatgggtaatatttatattggatt 7396511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 29983184 - 29983234
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983184 gatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18503 - 18774
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18503 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18602  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18603 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18702  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18703 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21330240 - 21329968
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330240 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21330141  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21330140 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21330041  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21330040 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18796721 - 18796993
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18796721 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagta 18796820  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18796821 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtg 18796920  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18796921 ctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Original strand, 18620023 - 18620296
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18620023 gatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaag 18620122  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgcttt 214  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18620123 ttatgaaa-gtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgcttt 18620221  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatgatg 289  Q
     |||||||||| |   |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18620222 atcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978360
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  112 aagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatactccacaaatcatg 20978360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 36270395 - 36270650
Alignment:
Q  25 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaag 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||  ||||  ||||    
T  36270395 aaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatagaaaa--ttatgtaaag 36270492  T
Q  125 tgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccatt 223  Q
     |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||||  ||||||| | ||||||  || |     
T  36270493 -gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtattc-acccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgta 36270590  T
Q  224 caaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36270591 caaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 18822302 - 18822556
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |    
T  18822302 gatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacg 18822399  T
Q  115 ttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 213  Q
    ||||  ||||  ||  |||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  18822400 ttatgtaaaga-tctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtactt 18822498  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    | |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18822499 ttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtact 18822556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6992094 - 6991847
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataa 120  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  ||||      
T  6992094 ataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatattggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgt 6991997  T
Q  121 aaagtgtcataagatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgc-tttgtca 218  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||      
T  6991996 aa-gtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgttt 6991898  T
Q  219 ccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6991897 ctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22183475 - 22183206
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||       
T  22183475 cacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--t 22183379  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagt 209  Q
    || |||||  |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22183378 aatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagt 22183280  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
     ||||||     | ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||    
T  22183279 actttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 30174432 - 30174679
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  30174432 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 30174528  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  30174529 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 30174627  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  30174628 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24250279 - 24250032
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  24250279 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 24250183  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||    
T  24250182 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 24250084  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  24250083 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342014
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| |||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| || | || | |||||| |  | |||||||  ||||  |||||| |    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tgaactcaaatgctttattgcaattcaaaaattgtttgtaacagg 15342042  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15342041 atgaccataacgttggttaatgggtact 15342014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24229450 - 24229215
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  24229450 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcataagatattctcac 24229354  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| | | |||||||||| ||  ||||||||| | || || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  24229353 aatgataatagtgtatatcgctcttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 24229255  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24229254 ataaccataacgttggttgaagggtacttgatgaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 283
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttcacc-ttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |  |||||||||||  ||||||||| | ||||||| | ||| |||  ||||| |||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 285
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800775
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | |||||||||| |  ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgacta 250  Q
     |||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||| ||| |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  251 taaagttggttgatgggtactccatgaatcatgat 285  Q
    ||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||    
T  29800741 taatgttggttaatgggcacttgacgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 19279508 - 19279600
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279508 atcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18852047 - 18851956
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18852047 gatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616653
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| || || |||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagt--attttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 198  Q
     | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatgt 19616653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301036
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatgaa--gtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccact 40301036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626952
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgct--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
     | |||| | ||||  || ||||||||| ||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcact 21626952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36799826 - 36799745
Alignment:
Q  136 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  36799826 attctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaaccactatgcgccctagatgtaggagtcaagtactttgt 36799745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36801974 - 36801899
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacataga-tataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  36801974 cacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattgaattga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316305
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| || |||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagt--atgttat-gaaagtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  153 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactata 252  Q
    || | || |||  ||| |||||||| ||||| ||  ||||||||| |||| |  || ||||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  253 aagttg 258  Q
    ||||||    
T  41316310 aagttg 41316305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28740986 - 28740910
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgt 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28740986 aagtgtcataagacattctcataatgataatggtgtataccattcttagatctgaaaccactatgatccctagatgt 28740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  47 tagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28741261 - 28741220
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28741261 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1461
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1208 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagta 1307  T
Q  111 aaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtg 210  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1308 aaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 1407  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  1408 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  27 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  127 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  227 acgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 5744 - 6013
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5744 cacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagta 5843  T
Q  111 aaagttat-aaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcca-cccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgag 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5844 aaagttatgaaaaagtgtcataagatattctcata---------gtgcattccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaag 5934  T
Q  209 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5935 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 238 - 485
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  238 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 334  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  335 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 433  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  434 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3922 - 3675
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  3922 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 3826  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  3825 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 3727  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  3726 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 119785 - 120032
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  119785 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 119881  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  119882 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 119980  T
Q  232 gtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  119981 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13184 - 12961
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  13184 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagtat--gttatgaaat-tgtcataagatattctcat 13088  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| | |    
T  13087 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 12989  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  12988 ataaccataaagttggttgatgggtact 12961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67374
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  | | |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gagattgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    | ||||| | ||||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 130471 - 130268
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  130471 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 130375  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||    
T  130374 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 130276  T
Q  232 gtccgtaa 239  Q
    ||| ||||    
T  130275 gtctgtaa 130268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26844
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    ||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||| |||| ||||||||||| |   ||||  || |||||| |||| | |    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcgagtgctttattgtcattttaatgttgtctgtaaaagg 26804  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  26805 ataaccataacgttggataatgggtactcgatgaatcatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Original strand, 8360 - 8508
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  8360 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttat-gaaattgtcata 8456  T
Q  132 agatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccact 183  Q
    ||||||||||| | ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  8457 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccact 8508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 255
Target Start/End: Original strand, 8807 - 9005
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||| |||||   ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagtat--gttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  153 ggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactata 252  Q
    ||||||| |||| | | |||||||||||||  ||  || || ||| ||||||| |||| ||| |   |||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaaccacaatgatccttaaatg-tggagtcaagtgttttattgtcattcaaacgttctctgtaacatgataactata 9002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40223 - 39988
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  40223 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 40127  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||  |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| | |    
T  40126 agtgataatggtgtatataactcttagacttgaaaccactatgatccctaaat-atggactcaagtgctttatttccattctaacgttgtttgtaaaagg 40028  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||||||||| | |||| ||||  ||||||||||    
T  40027 ataaccataaagttggctaatggttacttgatgaatcatg 39988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat---aaaaagtgtcataagatattctcatagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||   |||||   |  || |||||||||||||||||| | ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagtac--gttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatga 247  Q
    |||   |||||   | | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 283
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  93 tgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccct 192  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  193 agatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatgatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    ||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  199 agatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83116
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcatagtgata 150  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||  | ||||   || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgtta-cgaaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 181  Q
     ||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaacca 83116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 90093 - 90019
Alignment:
Q  25 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  90093 aaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtataacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatat----taggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacat 106  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54066
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttataaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-gaaattgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  144 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactttgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacatg 243  Q
      || || | || |||    | ||| |||||||||||||| ||  |||||| || |||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| | |    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University