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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20701_high_11 (Length: 253)

Name: NF20701_high_11
Description: NF20701
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20701_high_11
NF20701_high_11
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (14-242)||(3212947-3213174)
chr7 (40-219)||(8768765-8768943)
chr7 (14-176)||(11206159-11206320)
chr7 (14-176)||(47069799-47069960)
chr7 (14-176)||(47204248-47204409)
chr7 (14-166)||(12117725-12117876)
chr7 (14-176)||(10671951-10672111)
chr7 (74-192)||(11216417-11216537)
chr7 (95-166)||(1335770-1335839)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (14-242)||(29636904-29637131)
chr4 (14-242)||(36077693-36077920)
chr4 (14-176)||(50570749-50570910)
chr4 (14-176)||(42557855-42558015)
chr4 (72-161)||(5261524-5261611)
chr4 (77-162)||(51395162-51395245)
chr4 (14-62)||(29644029-29644077)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (14-219)||(36413388-36413592)
chr2 (14-176)||(9811511-9811672)
chr2 (14-176)||(16578766-16578927)
chr2 (72-133)||(42785208-42785269)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (14-219)||(5802993-5803198)
chr8 (14-166)||(3006374-3006524)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (14-219)||(667372-667576)
chr5 (14-219)||(27886174-27886378)
chr5 (14-201)||(11917536-11917722)
chr5 (14-166)||(15068591-15068742)
chr5 (14-150)||(701351-701485)
chr5 (14-150)||(30002132-30002266)
chr5 (14-150)||(8409121-8409254)
chr5 (72-133)||(35359376-35359437)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (14-201)||(35401976-35402162)
chr3 (14-201)||(10369342-10369528)
chr3 (14-176)||(51149459-51149619)
chr3 (14-176)||(33361084-33361245)
chr3 (14-154)||(34794714-34794853)
chr3 (73-166)||(4669400-4669493)
chr3 (123-203)||(9817650-9817730)
chr3 (14-63)||(4669550-4669599)
chr3 (76-130)||(9817756-9817810)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (14-201)||(5659-5845)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (14-176)||(12270677-12270838)
chr6 (72-206)||(5866863-5867001)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (34-201)||(29707877-29708043)
chr1 (14-176)||(8211409-8211572)
chr1 (14-176)||(5155124-5155285)
chr1 (16-150)||(20493882-20494017)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3213174 - 3212947
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3213174 ttacattaagtctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 3213076  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3213075 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 3212976  T
Q  214 agaacacatcgccttgacacctccatctc 242  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3212975 agaacacatcgcctcgacgcctccatctc 3212947  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8768943 - 8768765
Alignment:
Q  40 agtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagta 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8768943 agtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagta 8768845  T
Q  140 ccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaataagaaca 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8768844 ccaaaataatatttaagaatcaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaataataaca 8768765  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11206320 - 11206159
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206320 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaaacaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 11206222  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206221 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 11206159  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 47069799 - 47069960
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47069799 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaaacaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 47069897  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47069898 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 47069960  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47204409 - 47204248
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47204409 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 47204311  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47204310 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaacaaaaaaaaaacaacttg 47204248  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 12117725 - 12117876
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12117725 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaaat 12117823  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117824 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 12117876  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 10671951 - 10672111
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10671951 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagt-ccaaaatagcattacaataccaataaaagt 10672048  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10672049 tatttatctaaaataacattacagtactaaaataatatttaagaaccataaaagaacaacttg 10672111  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Original strand, 11216417 - 11216537
Alignment:
Q  74 acttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaaga--aca 171  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |  ||| || |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  11216417 acttgaagttccaaaataaaattatactaccaataaaactggtttttccaaaataacattatagcatcaaaataacatttaagaacctaaaaagaacaca 11216516  T
Q  172 acttgaagttccaaagtaaca 192  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11216517 gcttgaagttccaaagtaaca 11216537  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 166
Target Start/End: Original strand, 1335770 - 1335839
Alignment:
Q  95 ttacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1335770 ttacaataccaataaaagttatctattcaaaataacat--cataaccaaaataacatttaagaaccaaaaaa 1335839  T

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Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 29636904 - 29637131
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29636904 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 29637002  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29637003 tatttatctaaaataacattccagtaccaaaataatatttaagaacccaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 29637102  T
Q  214 agaacacatcgccttgacacctccatctc 242  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29637103 agaacacatcgcctcgacgcctccatctc 29637131  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 36077693 - 36077920
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36077693 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaaaagcattacaataccaataaaagt 36077791  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36077792 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatggctccaaaata 36077891  T
Q  214 agaacacatcgccttgacacctccatctc 242  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  36077892 agaacacatcgcctcgatgcctccatctc 36077920  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50570910 - 50570749
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50570910 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaaacaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 50570812  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50570811 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 50570749  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 42557855 - 42558015
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42557855 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaaacaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagt-ccaaaataacattacaataccaataaaagt 42557952  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42557953 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 42558015  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5261611 - 5261524
Alignment:
Q  72 gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaacca 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5261611 gaacttgaagttccaaaataacattacaataccaataaaagttatctatccaaaataacat--cagaaccaaaataacatttaagaacca 5261524  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 51395162 - 51395245
Alignment:
Q  77 tgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaa 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  51395162 tgaagttccaaaataacattacaataccaataaaagttatctttccaaaataacat--cagaaccaaaataacatttaagaaccaa 51395245  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29644077 - 29644029
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644077 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattatt 29644029  T

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Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36413592 - 36413388
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36413592 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 36413494  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36413493 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 36413394  T
Q  214 agaaca 219  Q
    | ||||    
T  36413393 ataaca 36413388  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 9811511 - 9811672
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811511 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaaacaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 9811609  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811610 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 9811672  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 16578766 - 16578927
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578766 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 16578864  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16578865 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaagaacttg 16578927  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42785269 - 42785208
Alignment:
Q  72 gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacatt 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42785269 gaacttgaagttccaaaataacattacaataccaataaaagttatctatccaaaataacatt 42785208  T

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Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5803198 - 5802993
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5803198 ttacattaactctaatactgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 5803100  T
Q  114 tatttatctaaaat-aacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaat 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5803099 tatttatctaaaattaacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaat 5803000  T
Q  213 aagaaca 219  Q
    || ||||    
T  5802999 aataaca 5802993  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3006524 - 3006374
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3006524 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattt-aattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 3006427  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3006426 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 3006374  T

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Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 667576 - 667372
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  667576 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaaa-aacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 667478  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  667477 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaattaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 667378  T
Q  214 agaaca 219  Q
    | ||||    
T  667377 ataaca 667372  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27886378 - 27886174
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27886378 ttacattaactctaatattgccaaccagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaaat 27886280  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27886279 tatttatctaaaataacattacattaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactccaaaata 27886180  T
Q  214 agaaca 219  Q
    | ||||    
T  27886179 ataaca 27886174  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 11917536 - 11917722
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917536 ttacatttactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 11917634  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 201  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917635 tatttatctaaaataaaattacactaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 11917722  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 15068591 - 15068742
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068591 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 15068689  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068690 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 15068742  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 701351 - 701485
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  701351 ttacattaact-taatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattgcaataccaataaaagt 701448  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  701449 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataata 701485  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 30002132 - 30002266
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002132 ttacattaact-taatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaatttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 30002229  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30002230 tatttatctaaaataacattacagaaccaaaataata 30002266  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 8409121 - 8409254
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8409121 ttacattaact-taatattgccaaccagtaccaatcaattttaattatt--aaaaaaagaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 8409217  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataata 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8409218 tatttatctaaaataacattaaagtaccaaaataata 8409254  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 133
Target Start/End: Original strand, 35359376 - 35359437
Alignment:
Q  72 gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacatt 133  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35359376 gaacttgaagttccaaaataacgttacaataccaataaaagttatctatccaaaataacatt 35359437  T

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Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35402162 - 35401976
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402162 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 35402064  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35402063 tatttatctaaaataacattacagtaccaaagtaatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaaattccaaagtaacacattatcat 35401976  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 10369342 - 10369528
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10369342 ttacattaacactaatattgccaattagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattaaaataccaataaaagt 10369440  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10369441 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 10369528  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51149619 - 51149459
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51149619 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagt-ccaaaatagcattacaataccaataaaagt 51149522  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51149521 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 51149459  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 33361084 - 33361245
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33361084 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattatt-aaaaaaaagaacttgaagttccaaaatagtattacaataccaataaaagt 33361182  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361183 tatttatctaaaataacactacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 33361245  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 34794714 - 34794853
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34794714 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataacagt 34794812  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatattta 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34794813 tatttatctaaaataacattacaataccaaaataatattta 34794853  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4669493 - 4669400
Alignment:
Q  73 aacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4669493 aacttgaagttcaaaaatagcattacaataccaatgaaagttatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaa 4669400  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9817730 - 9817650
Alignment:
Q  123 aaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatga 203  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9817730 aaaataacattgcattaccaaaataacatttaagaaccaaaaaagaataacttgaagttccaaagtaacacattatcatga 9817650  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 4669599 - 4669550
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattc 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4669599 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattc 4669550  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 9817810 - 9817756
Alignment:
Q  76 ttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataac 130  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9817810 ttgaagttccaaaataaaattacaataccaataaaagttatttatccaaaataac 9817756  T

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Target: scaffold0308 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5845 - 5659
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5845 ttacattaactctaatattgcgaactagtaccaatcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaataacattacaataccaataaaagt 5747  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5746 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaataaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 5659  T

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Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 12270677 - 12270838
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12270677 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 12270775  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12270776 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 12270838  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5867001 - 5866863
Alignment:
Q  72 gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacattacagtac----caaaataatatttaagaaccaaaaaag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5867001 gaacttgaagttccaaaatagcattacaatacaaataaaagttatttatctaaaataacattacagtacgtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaag 5866902  T
Q  168 aacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866901 aacaacttgaagttccaaagtaacacattatcatgactc 5866863  T

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Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29708043 - 29707877
Alignment:
Q  34 ccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatctaaaataacatt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29708043 ccaactagtaccaagcaattttaattattcaaaaaaa-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagttatttatataaaataacatt 29707945  T
Q  134 acagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29707944 acaataccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttgaagttccaaagtaacacattatcat 29707877  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Original strand, 8211409 - 8211572
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnn-gaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211409 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattaaaaaaaaaagaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaag 8211508  T
Q  113 ttatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211509 ttatttatctaaaataacactacaataccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 8211572  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5155285 - 5155124
Alignment:
Q  14 ttacattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattattcnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5155285 ttacattaactctaatattaccaactagtaccaagcaattttaattatt-aaaaaaaagaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagt 5155187  T
Q  114 tatttatctaaaataacattacagtaccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 176  Q
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T  5155186 tatttatctaaaataacactacaataccaaaataatatttaagaaccaaaaaagaacaacttg 5155124  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 150
Target Start/End: Original strand, 20493882 - 20494017
Alignment:
Q  16 acattaactctaatattgccaactagtaccaagcaattttaattatt-cnnnnnnnngaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagtt 114  Q
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T  20493882 acattaactctaatattgccaactaataccaaacaattttaattattacaaaaaaaagaacttgaagttccaaaatagcattacaataccaataaaagtt 20493981  T
Q  115 atttatctaaaataacattacagtaccaaaataata 150  Q
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T  20493982 atttatctaaaataacattacagtaccaaaataata 20494017  T

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