View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20705_high_11 (Length: 310)

Name: NF20705_high_11
Description: NF20705
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20705_high_11
NF20705_high_11
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (11-283)||(2041-2313)
scaffold0234 (11-283)||(10932-11204)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (11-283)||(17684189-17684461)
chr6 (11-283)||(27380972-27381244)
chr6 (11-283)||(27471355-27471627)
chr6 (11-283)||(11651938-11652210)
chr6 (11-283)||(17691160-17691432)
chr6 (11-283)||(29309105-29309377)
chr6 (11-283)||(29316065-29316336)
chr6 (11-283)||(16394165-16394437)
chr6 (44-283)||(27296877-27297116)
chr6 (11-283)||(188697-188969)
chr6 (42-279)||(25536915-25537152)
chr6 (61-282)||(16559193-16559414)
chr6 (16-266)||(13359010-13359256)
chr6 (32-283)||(27508347-27508594)
chr6 (32-283)||(16789126-16789373)
chr6 (32-283)||(22859888-22860135)
chr6 (44-283)||(1586108-1586343)
chr6 (32-142)||(18019981-18020088)
chr6 (32-269)||(27527947-27528180)
chr6 (16-271)||(2669513-2669766)
chr6 (44-261)||(10359073-10359285)
chr6 (11-66)||(16566257-16566312)
chr6 (44-283)||(8612982-8613221)
chr6 (44-283)||(14074547-14074782)
chr6 (46-159)||(20736452-20736562)
chr6 (44-178)||(21994655-21994786)
chr6 (51-110)||(5758650-5758709)
chr6 (44-142)||(22560324-22560419)
chr6 (12-99)||(28172772-28172859)
chr6 (15-105)||(27925973-27926062)
chr6 (44-283)||(17120505-17120740)
chr6 (14-178)||(17850323-17850484)
chr6 (11-111)||(19347092-19347191)
chr6 (29-214)||(8510155-8510338)
chr6 (170-283)||(33317055-33317167)
chr6 (150-194)||(28172908-28172952)
chr6 (32-71)||(13995151-13995190)
chr6 (51-142)||(19218503-19218586)
chr6 (127-279)||(28756132-28756283)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (11-283)||(24695186-24695458)
chr5 (11-283)||(19714218-19714490)
chr5 (11-283)||(19706939-19707210)
chr5 (23-283)||(18569581-18569841)
chr5 (17-283)||(17298621-17298885)
chr5 (11-161)||(39538803-39538953)
chr5 (11-283)||(17285470-17285740)
chr5 (109-287)||(27347252-27347428)
chr5 (16-194)||(18806845-18807021)
chr5 (180-283)||(24701950-24702053)
chr5 (32-283)||(20941082-20941329)
chr5 (44-283)||(22941317-22941552)
chr5 (32-283)||(25805385-25805632)
chr5 (32-283)||(31954-32201)
chr5 (32-283)||(12789663-12789910)
chr5 (32-283)||(23545977-23546224)
chr5 (11-119)||(22546902-22547008)
chr5 (44-283)||(24933306-24933541)
chr5 (44-283)||(31096883-31097118)
chr5 (46-272)||(20100254-20100476)
chr5 (44-283)||(7865430-7865669)
chr5 (44-287)||(26129689-26129928)
chr5 (58-194)||(18806485-18806619)
chr5 (58-194)||(18806665-18806799)
chr5 (198-287)||(28719471-28719558)
chr5 (44-283)||(26245169-26245404)
chr5 (51-283)||(12764990-12765222)
chr5 (51-283)||(5097725-5097953)
chr5 (34-189)||(18829377-18829530)
chr5 (51-283)||(9811733-9811965)
chr5 (51-283)||(12703874-12704106)
chr5 (11-56)||(27347425-27347470)
chr5 (32-108)||(33477193-33477269)
chr5 (54-150)||(31651917-31652009)
chr5 (56-85)||(31267860-31267889)
chr5 (206-283)||(39538958-39539035)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (11-283)||(18262427-18262699)
chr4 (11-283)||(18269288-18269560)
chr4 (11-283)||(55612898-55613170)
chr4 (11-283)||(8858382-8858654)
chr4 (11-283)||(26963855-26964127)
chr4 (11-283)||(26970678-26970950)
chr4 (11-283)||(868812-869084)
chr4 (11-283)||(19926480-19926752)
chr4 (11-283)||(5707535-5707807)
chr4 (11-283)||(5714163-5714435)
chr4 (11-283)||(10621053-10621325)
chr4 (11-283)||(10628132-10628404)
chr4 (11-283)||(28392854-28393126)
chr4 (11-283)||(8845418-8845690)
chr4 (15-283)||(5667849-5668115)
chr4 (11-283)||(4426336-4426596)
chr4 (15-283)||(35223779-35224047)
chr4 (51-283)||(10677303-10677534)
chr4 (51-283)||(10890943-10891174)
chr4 (15-287)||(20311511-20311781)
chr4 (32-178)||(21453965-21454110)
chr4 (32-283)||(15461552-15461799)
chr4 (32-283)||(34975606-34975853)
chr4 (32-283)||(2677068-2677315)
chr4 (32-283)||(15815076-15815323)
chr4 (32-283)||(18111043-18111290)
chr4 (32-283)||(3369023-3369270)
chr4 (32-283)||(17299959-17300206)
chr4 (44-282)||(19365586-19365821)
chr4 (44-283)||(20244004-20244239)
chr4 (44-283)||(26531680-26531915)
chr4 (44-283)||(1941791-1942026)
chr4 (44-283)||(4675983-4676218)
chr4 (44-283)||(18163229-18163464)
chr4 (11-108)||(56516271-56516368)
chr4 (32-283)||(5870473-5870720)
chr4 (44-283)||(19362477-19362712)
chr4 (51-267)||(5616469-5616681)
chr4 (51-283)||(9487625-9487853)
chr4 (63-283)||(30040489-30040705)
chr4 (44-142)||(4546147-4546242)
chr4 (45-178)||(32636552-32636682)
chr4 (32-186)||(33888594-33888743)
chr4 (51-142)||(9538033-9538121)
chr4 (44-283)||(5528479-5528714)
chr4 (15-107)||(32646697-32646789)
chr4 (23-138)||(34777862-34777975)
chr4 (12-58)||(24700245-24700291)
chr4 (174-283)||(9937717-9937826)
chr4 (66-138)||(11421096-11421165)
chr4 (155-204)||(24701361-24701410)
chr4 (207-283)||(9538184-9538260)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (11-283)||(6110279-6110551)
chr3 (11-283)||(8490710-8490982)
chr3 (11-283)||(16482203-16482475)
chr3 (11-283)||(10579075-10579347)
chr3 (11-283)||(15600604-15600876)
chr3 (11-283)||(15607149-15607421)
chr3 (11-283)||(10572312-10572584)
chr3 (11-283)||(15357306-15357578)
chr3 (11-283)||(18520190-18520462)
chr3 (11-279)||(18522878-18523146)
chr3 (11-283)||(13211517-13211789)
chr3 (11-283)||(13248822-13249094)
chr3 (11-283)||(15341939-15342211)
chr3 (11-283)||(17780838-17781110)
chr3 (11-283)||(32056619-32056892)
chr3 (11-287)||(17199900-17200176)
chr3 (11-283)||(13517026-13517294)
chr3 (11-283)||(1647241-1647513)
chr3 (11-283)||(17136574-17136840)
chr3 (14-283)||(29925189-29925458)
chr3 (14-283)||(29974342-29974611)
chr3 (12-283)||(16200646-16200917)
chr3 (32-283)||(21034293-21034540)
chr3 (32-283)||(15846536-15846783)
chr3 (32-283)||(20147554-20147801)
chr3 (32-283)||(21398847-21399094)
chr3 (32-283)||(14890446-14890693)
chr3 (44-283)||(25978728-25978963)
chr3 (44-283)||(55427088-55427323)
chr3 (45-283)||(12299978-12300212)
chr3 (19-190)||(24253205-24253372)
chr3 (44-142)||(11787654-11787749)
chr3 (51-185)||(14147095-14147226)
chr3 (17-150)||(32280313-32280444)
chr3 (44-142)||(15317313-15317408)
chr3 (51-241)||(15526827-15527013)
chr3 (98-283)||(28088227-28088408)
chr3 (15-143)||(28953965-28954092)
chr3 (122-186)||(36138033-36138097)
chr3 (55-143)||(4189223-4189308)
chr3 (207-283)||(11787813-11787889)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (11-283)||(18252245-18252517)
chr1 (11-283)||(18532234-18532506)
chr1 (11-283)||(27131130-27131401)
chr1 (11-283)||(27310297-27310569)
chr1 (11-283)||(16358755-16359027)
chr1 (11-283)||(3855639-3855911)
chr1 (11-271)||(36816366-36816625)
chr1 (14-283)||(22641594-22641859)
chr1 (15-283)||(27277278-27277545)
chr1 (11-155)||(21171081-21171225)
chr1 (91-283)||(9916497-9916688)
chr1 (32-283)||(19706439-19706686)
chr1 (32-283)||(28134723-28134970)
chr1 (32-283)||(43802365-43802612)
chr1 (32-283)||(9456171-9456418)
chr1 (32-283)||(20391239-20391486)
chr1 (32-283)||(20779645-20779892)
chr1 (32-283)||(22670257-22670504)
chr1 (32-283)||(42816989-42817236)
chr1 (17-116)||(22657108-22657207)
chr1 (15-283)||(23507119-23507385)
chr1 (44-283)||(634001-634236)
chr1 (15-204)||(12014085-12014272)
chr1 (32-283)||(22612547-22612794)
chr1 (51-283)||(8727741-8727969)
chr1 (15-85)||(9917837-9917906)
chr1 (51-177)||(21881481-21881604)
chr1 (44-186)||(29096789-29096928)
chr1 (16-81)||(12006461-12006526)
chr1 (44-108)||(35930649-35930713)
chr1 (55-110)||(26923553-26923608)
chr1 (32-85)||(47667668-47667721)
chr1 (51-104)||(51997353-51997406)
chr1 (113-186)||(24301701-24301774)
chr1 (170-283)||(28145723-28145835)
chr1 (207-283)||(47667485-47667561)
chr1 (65-143)||(31236403-31236478)
chr1 (225-282)||(35132342-35132399)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (11-282)||(21940880-21941151)
chr8 (11-283)||(6094338-6094610)
chr8 (14-283)||(22171705-22171974)
chr8 (20-283)||(15326422-15326685)
chr8 (20-283)||(15506791-15507054)
chr8 (11-283)||(24642864-24643135)
chr8 (145-283)||(28548396-28548534)
chr8 (32-168)||(24797224-24797359)
chr8 (15-216)||(14983710-14983908)
chr8 (32-283)||(8371253-8371500)
chr8 (32-283)||(12562178-12562425)
chr8 (32-283)||(21969388-21969635)
chr8 (44-283)||(22659494-22659729)
chr8 (32-283)||(25611250-25611497)
chr8 (32-283)||(27007517-27007764)
chr8 (32-283)||(27014660-27014907)
chr8 (32-283)||(27880487-27880734)
chr8 (32-283)||(28020668-28020915)
chr8 (32-283)||(22130609-22130856)
chr8 (15-267)||(38232115-38232365)
chr8 (44-283)||(6430953-6431188)
chr8 (32-283)||(21916731-21916978)
chr8 (44-283)||(45534273-45534508)
chr8 (44-283)||(26240551-26240786)
chr8 (52-186)||(8781971-8782102)
chr8 (51-178)||(18835424-18835548)
chr8 (16-119)||(2375231-2375332)
chr8 (44-283)||(2962932-2963171)
chr8 (11-103)||(32872741-32872833)
chr8 (180-271)||(24796733-24796822)
chr8 (44-83)||(36970332-36970371)
chr8 (23-75)||(10920427-10920479)
chr8 (17-73)||(29645575-29645631)
chr8 (80-186)||(20535306-20535409)
chr8 (222-283)||(8968015-8968076)
chr8 (223-272)||(41368105-41368154)
chr8 (223-272)||(41375076-41375125)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (11-283)||(7322-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (11-283)||(6654-6926)
scaffold0390 (11-283)||(13670-13942)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (11-287)||(25706-25982)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (11-279)||(15152658-15152926)
chr7 (11-283)||(29327999-29328271)
chr7 (11-283)||(11535782-11536054)
chr7 (11-283)||(12751041-12751313)
chr7 (11-283)||(11542700-11542972)
chr7 (11-283)||(12738751-12739023)
chr7 (11-283)||(18561222-18561485)
chr7 (15-283)||(13392369-13392637)
chr7 (11-289)||(18257559-18257834)
chr7 (32-283)||(2204607-2204854)
chr7 (43-265)||(2365169-2365389)
chr7 (32-283)||(8465054-8465301)
chr7 (32-283)||(18400159-18400406)
chr7 (32-283)||(18407143-18407390)
chr7 (32-283)||(19230943-19231190)
chr7 (44-283)||(41680968-41681203)
chr7 (32-283)||(48808496-48808743)
chr7 (44-283)||(15729818-15730053)
chr7 (44-283)||(18139338-18139573)
chr7 (32-283)||(30254193-30254440)
chr7 (44-283)||(28130628-28130863)
chr7 (44-283)||(47166859-47167094)
chr7 (44-283)||(10668901-10669137)
chr7 (55-283)||(25845476-25845700)
chr7 (55-283)||(25845895-25846119)
chr7 (51-283)||(34128647-34128875)
chr7 (51-142)||(14591924-14592012)
chr7 (51-142)||(16011515-16011603)
chr7 (44-283)||(18259124-18259359)
chr7 (44-142)||(19393564-19393659)
chr7 (51-177)||(22969024-22969147)
chr7 (58-184)||(31190537-31190660)
chr7 (51-178)||(19388626-19388754)
chr7 (44-261)||(24443349-24443562)
chr7 (135-271)||(39112138-39112274)
chr7 (11-108)||(10235377-10235474)
chr7 (16-99)||(7662569-7662651)
chr7 (32-76)||(19859177-19859221)
chr7 (134-209)||(22948499-22948574)
chr7 (15-65)||(29983184-29983234)
chr7 (15-61)||(47833899-47833945)
chr7 (32-109)||(3132910-3132986)
chr7 (46-107)||(3587978-3588039)
chr7 (17-77)||(39112033-39112093)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-283)||(18503-18774)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (11-283)||(21329968-21330240)
chr2 (11-283)||(18796721-18796993)
chr2 (15-289)||(18620023-18620296)
chr2 (12-271)||(20978091-20978348)
chr2 (23-269)||(6991847-6992094)
chr2 (25-283)||(36270395-36270650)
chr2 (15-287)||(18822302-18822572)
chr2 (32-283)||(30174432-30174679)
chr2 (11-283)||(22183206-22183475)
chr2 (32-283)||(24250032-24250279)
chr2 (44-283)||(24229215-24229450)
chr2 (44-186)||(15342098-15342237)
chr2 (51-285)||(29800545-29800775)
chr2 (16-108)||(19279508-19279600)
chr2 (120-283)||(17241034-17241196)
chr2 (15-106)||(18851956-18852047)
chr2 (51-186)||(19616509-19616641)
chr2 (51-185)||(40301034-40301164)
chr2 (51-186)||(21626824-21626955)
chr2 (53-283)||(41316280-41316506)
chr2 (216-283)||(41661694-41661761)
chr2 (47-110)||(28718943-28719006)
chr2 (230-287)||(12298236-12298293)
chr2 (44-85)||(24763751-24763792)
chr2 (44-85)||(28741220-28741261)
chr2 (11-85)||(36801899-36801974)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (11-264)||(1208-1461)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (27-283)||(230111-230367)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (11-287)||(5744-6013)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (44-283)||(12949-13184)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (32-283)||(238-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (32-283)||(3675-3922)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (32-283)||(119785-120032)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-283)||(67374-67609)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (32-142)||(8360-8467)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (44-186)||(26609-26748)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (32-239)||(130268-130471)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (44-159)||(40111-40223)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (53-178)||(8807-8929)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (51-178)||(83119-83243)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (44-283)||(53832-54066)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (93-283)||(102-288)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (51-283)||(11526-11758)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (25-99)||(90019-90093)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (15-106)||(45956-46051)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (63-159)||(11328-11421)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2313 - 2041
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2313 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 2214  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2213 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 2114  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2113 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11204 - 10932
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11204 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11105  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11104 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11005  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11004 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17684461 - 17684189
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684461 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17684362  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17684361 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17684262  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17684261 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17684189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27381244 - 27380972
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381244 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27381145  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27381144 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27381045  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27381044 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27380972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27471627 - 27471355
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471627 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27471528  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27471527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27471428  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27471427 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27471355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 11651938 - 11652210
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651938 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11652037  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11652038 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcataatgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11652137  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11652138 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11652210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17691432 - 17691160
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691432 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17691333  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17691332 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17691233  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17691232 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17691160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29309105 - 29309377
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309105 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29309204  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||    
T  29309205 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaggtg 29309304  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29309305 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29309377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29316065 - 29316336
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316065 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29316164  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  29316165 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggag-tcagtg 29316263  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29316264 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 29316336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16394437 - 16394165
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  16394437 cacatatcatggataaacagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagta 16394338  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  16394337 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggaatcgagtg 16394238  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16394237 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16394165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297116
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27296977 agtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacagg 27297076  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27297077 atgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27297116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 188969 - 188697
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188969 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 188870  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  188869 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 188770  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||| | ||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  188769 ctttgttatcattcaaatattgtctgtaacagaatgactataaagttgattgatggatactccataaatcatg 188697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25536915
Alignment:
Q  42 tcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 141  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  142 attgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537052 atagtgacagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatttaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 25536953  T
Q  242 agatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaat 279  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25536952 ggatgattataaagttggttgatgggtactccatgaat 25536915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16559414 - 16559193
Alignment:
Q  61 aggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtatt 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16559414 aggagtaatatttatattggattgatccaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatt 16559315  T
Q  161 ccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggt 260  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16559314 ccacccttcgacctgaaaccgctatgtaccgtagatgttggagtcgagtgttttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggt 16559215  T
Q  261 tgatgggtacttcatgaatcat 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  16559214 tgatgggtactccatgaatcat 16559193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13359256 - 13359010
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||   | ||||||  ||||||||| | |||  |    
T  13359256 atcatggataaaaagttatcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccatga--atactacattgaaaa--t 13359161  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||  |||    
T  13359160 tatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtatttt 13359062  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgg 266  Q
    ||  || | ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13359061 gttgccgtacaaacatcgtccgtaacaggatgactataaagtcggttgatgg 13359010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27508594 - 27508347
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27508594 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27508498  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27508497 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27508399  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27508398 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 27508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 16789126 - 16789373
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  16789126 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 16789222  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||    
T  16789223 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 16789321  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16789322 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 16789373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22860135 - 22859888
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22860135 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22860039  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||    
T  22860038 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 22859940  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22859939 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22859888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1586343 - 1586108
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  1586343 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 1586247  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  1586246 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 1586148  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1586147 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1586108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18020088 - 18019981
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18020088 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18019992  T
Q  132 agatattctca 142  Q
    |||||||||||    
T  18019991 agatattctca 18019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27528180 - 27527947
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  27528180 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatgaaaa-tgtcata 27528084  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27528083 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27527985  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27527984 gtctgtaaaaggataaaaataacgttggttgatgggta 27527947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 271
Target Start/End: Original strand, 2669513 - 2669766
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  ||||| ||||||||||||  || ||    
T  2669513 atcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgacacatcatgaaaatactacatag--aatgt 2669610  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcattgtga-tagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    | |   |||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||  || |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||   || ||||    
T  2669611 tgt-ttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaatcattatgtactctagatgtaggagtccggtacttt 2669709  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    ||   | |||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  2669710 gttgtcgttcaaatgttatctataacaggatgactataaagtcagttgattggtact 2669766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10359285 - 10359073
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || || || ||| |||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||     
T  10359285 acatagatataaatattataggtaatatttatactggatcgacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttatg--aagtgtcataagatattctcac 10359190  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||  |||||| || |||| | | ||||||| |   ||||||||| |||||||||||| |    
T  10359189 aatgataatggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcgtgtgctttattgtcattcaaacattgtccgtaacagg 10359091  T
Q  244 atgactataaagttggtt 261  Q
    || || || |||||||||    
T  10359090 ataaccattaagttggtt 10359073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16566312 - 16566257
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566312 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 8612982 - 8613221
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  8612982 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 8613079  T
Q  141 cattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    ||   ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  8613080 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 8613178  T
Q  241 aagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | ||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8613179 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 8613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 14074547 - 14074782
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  14074547 acataggtataaatattgggagtaatatttataatggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattttcac 14074643  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      |||||   ||||||    | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || | || |  ||||||||||  || ||| ||| ||||| |||| | |    
T  14074644 aatgataaaagtgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgcctttctaacattgtctgtaaaagg 14074742  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14074743 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 14074782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20736562 - 20736452
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |  | | |||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  20736562 ataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgatccatcgtgagaatactacatatt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattctcacag 20736466  T
Q  146 tgatagtggtgtat 159  Q
    ||||| | ||||||    
T  20736465 tgataatagtgtat 20736452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 21994655 - 21994786
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||     
T  21994655 acatagctataaacattacgagtaatatttatactggaatgacccaccatgagaatactaaatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattttcac 21994751  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
      ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  21994752 aatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaa 21994786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 5758709 - 5758650
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5758709 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccactgtgagaatactacatagta 5758650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22560419 - 22560324
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22560419 acataggtttaaatattaggagtaatatttatactgtattgacctactatgagaacactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctca 22560324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 28172772 - 28172859
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaat 99  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  28172772 acagatcattgttaaaaagttatcaagtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaat 28172859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Original strand, 27925973 - 27926062
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactaca 105  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||| |||||||||    
T  27925973 gatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttatattgaattgactcgccatgataatactaca 27926062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17120740 - 17120505
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||| ||| |||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  17120740 acataggtataaatactaggagtagtatttatactggattgacccactgtgagaatgctaaatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 17120644  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||  || |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| || | | |    
T  17120643 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctatatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtcaaagg 17120545  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17120544 ataaccataacgttggttgatgggtgcttgatgaatcatg 17120505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17850484 - 17850323
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    ||||||| || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || || | ||||||||||||  |        
T  17850484 agatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatattatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacat--tgggt 17850387  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
     |||||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  17850386 tttatg-taagtatcataagttattcttatagtgatagtgatgtataccaccctttgacctgaaa 17850323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19347191 - 19347092
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||| ||||| | |||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19347191 cacatatcattgataaagagttgtcatgttttcacataagtataaacattagaa-taatatttgtaatggattgaactgccattagaatactacatagta 19347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Original strand, 8510155 - 8510338
Alignment:
Q  29 agttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 127  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||| |  | |||| ||||||||||||  || |||||| || ||||    
T  8510155 agttatcatttcttcatatagataaaaaatattagaagtaatatttatatttgattgacctacaatgataatactacatag--aatgttatgtaa-gtgt 8510251  T
Q  128 cataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    ||| || || |||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| |||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||    
T  8510252 cattagttactctcatagtgatggtggtgcattacatgcttcggcctggaaccactatgtaccttagatgtaggagtcgagtacttt 8510338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Original strand, 33317055 - 33317167
Alignment:
Q  170 gacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||    
T  33317055 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggta 33317153  T
Q  270 cttcatgaatcatg 283  Q
    ||| ||||||||||    
T  33317154 cttgatgaatcatg 33317167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 194
Target Start/End: Original strand, 28172908 - 28172952
Alignment:
Q  150 agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctag 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  28172908 agtggtgtattccacccttcgaccggaaaccagtatgtaccctag 28172952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13995190 - 13995151
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatat 71  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13995190 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatat 13995151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Original strand, 19218503 - 19218586
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||     |||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19218503 tataaatattaggagtaaaatttata-----ttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tttcataagatattctca 19218586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28756283 - 28756132
Alignment:
Q  127 tcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaa 226  Q
    |||||| |||||||||| |||||| || | |||  || |||  ||||||||| |||| |||||| ||  ||| |||||   || |||| ||||||| |||    
T  28756283 tcataaaatattctcatagtgataatgatttatctcatcctatgacctgaaaccactgtgtaccatatatgtaggagtcatgtactttatcaccat-caa 28756185  T
Q  227 acgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaat 279  Q
    | |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  28756184 atgttgtatgtaacaagatgcctataaagtcggttgatggttgtttcatgaat 28756132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24695458 - 24695186
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695458 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 24695359  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24695358 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 24695259  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24695258 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24695186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19714490 - 19714218
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714490 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19714391  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19714390 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19714291  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19714290 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactacatgaatcatg 19714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19707210 - 19706939
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707210 cacagatcatggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19707111  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  19707110 aaagttatgaaaagtgtcataagattttctcatagtgataattgtgtattccacccttcgacctg-aataactatgtaccctagatattggagtcgagtg 19707012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19707011 ctctgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19706939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18569841 - 18569581
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569841 ataaagagatatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 18569742  T
Q  123 agtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccat 222  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18569741 agtgtcataagatattatcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctacatgttggagtcgagtgctttatcaccat 18569642  T
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569641 tcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaaattggttgatgggtacttcatgaatcatg 18569581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17298885 - 17298621
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  17298885 tcatggataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtag--aaagtt 17298788  T
Q  117 atgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttg 215  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  17298787 atgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaatatgtaccctaggtttaggagtcgagtactttg 17298689  T
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |  || | |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  17298688 tttccgtacaaacgttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 39538803 - 39538953
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  39538803 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgaaaatactacatagta 39538902  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattc 161  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39538903 aaagttatgaaaagtgtcataaaatattctcatagtgatagtggtatattc 39538953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17285740 - 17285470
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||      
T  17285740 cacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccacaatgagaatactacatag-- 17285643  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagt 209  Q
    ||||||||| | | | ||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||    
T  17285642 aaagttatgtata-tatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaatcaatatgtaccctaggtttaggattcgagt 17285544  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     ||||||  || | ||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  17285543 actttgtttccgtacaaactttgtccgtaataggatgactataaaatcggttgatgggtgctccatgattcatg 17285470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 109 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27347428 - 27347252
Alignment:
Q  109 taaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgag 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27347428 taaaagttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgatagttgtgtattccaccctttgacacgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgag 27347330  T
Q  209 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27347329 tgttttgtcaccattcaaatgttatctttaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 27347252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18807021 - 18806845
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||    
T  18807021 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagt 18806924  T
Q  116 tatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctag 194  Q
    | ||  || ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18806923 tttg-taactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactag 18806845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 180 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24702053 - 24701950
Alignment:
Q  180 cactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaat 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24702053 cactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 24701954  T
Q  280 catg 283  Q
    ||||    
T  24701953 catg 24701950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 20941082 - 20941329
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  20941082 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 20941178  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||    
T  20941179 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 20941277  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20941278 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20941329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941552
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22941413  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  22941414 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 22941512  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22941513 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22941552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25805632 - 25805385
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  25805632 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 25805536  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | |||  |||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25805535 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttacacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25805437  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25805436 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25805385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 31954 - 32201
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  31954 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 32050  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  32051 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 32149  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32150 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 32201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12789910 - 12789663
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  12789910 tatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 12789814  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  ||||| |  | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  12789813 agatattctcacaatgataataatgtatactgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 12789715  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12789714 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 23545977 - 23546224
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  23545977 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 23546073  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  23546074 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 23546172  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23546173 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 23546224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22547008 - 22546902
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |    
T  22547008 cacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatactacata--a 22546911  T
Q  111 aaagttatg 119  Q
    |||||||||    
T  22546910 aaagttatg 22546902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24933541 - 24933306
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24933541 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24933445  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  24933444 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 24933346  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24933345 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 24933306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 31096883 - 31097118
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  31096883 acataggtataaattataggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 31096979  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| || ||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  31096980 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggaatcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 31097078  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31097079 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 31097118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20100476 - 20100254
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattg 145  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  | |||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||       
T  20100476 ataggtatcaatattaggagtaatacttatactggcttgacccaacgtgagaaaactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaa 20100380  T
Q  146 tgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagat 245  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||  ||| || || |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||| |||| | |||    
T  20100379 tgataatggtgtataccactcttagacatgaaaccactatgatcccaagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtctgtaaaaggat 20100281  T
Q  246 gactataaagttggttgatgggtactt 272  Q
     || |||| ||||||||||||||||||    
T  20100280 aaccataatgttggttgatgggtactt 20100254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7865669 - 7865430
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||||||||    
T  7865669 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagatattct 7865572  T
Q  141 cattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    ||   ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  |||  |||||  || ||| ||||||||| ||||     
T  7865571 cacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgtttcccttctaacgttgtctgtaaa 7865473  T
Q  241 aagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | ||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7865472 aggataaccataacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 7865430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26129928 - 26129689
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26129928 acatatatacaaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgaaaataccacatagt--atgttatgaaaa-tgtaataagatattctcac 26129832  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| ||||||||  ||| ||| ||| ||||| |||||||  | |||| || |||| |  |||||||| |  |||||| ||| |||||  ||| |||    
T  26129831 attgataatggtgtatatcactcttagacatgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttattgccattctaacattgtctataaaaag 26129733  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    || || |||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  26129732 ataaccataacgttggctaatgggtacttaatgaatcatgatga 26129689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18806619 - 18806485
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata-gtggtg 156  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||    
T  18806619 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806523  T
Q  157 tattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctag 194  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18806522 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactag 18806485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18806799 - 18806665
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata-gtggtg 156  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||| || ||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||    
T  18806799 attagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatag--aaagttttgtaac-tgtcataagttattctcatagtgataagtgatg 18806703  T
Q  157 tattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctag 194  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  18806702 tattccacccttcaacctgaaaccactatgtacactag 18806665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28719558 - 28719471
Alignment:
Q  198 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28719558 ttggagtcgagtgctttatcaccgt-caaacgttgtctgtaacaagatgac-ataaagttggttgatgggtactccacgaatcatgatga 28719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26245169 - 26245404
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26245169 acataggtataaatattaggagtaatatttatacttgattgatccactgtcagaatactgcatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 26245265  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      || || | ||||||  | | ||| ||||||||| || ||||  | |||| |  |||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  26245266 aatgttaatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccattatgatctctagat-atggacttaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 26245364  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26245365 ataaccatagcgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26245404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12765222 - 12764990
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcattgtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||||    || |||||||||| |||||||   ||    
T  12765222 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatgagattaattgtcataagacattctcacaatg 12765125  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatga 247  Q
    ||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | || | || |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  12765124 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12765026  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12765025 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12764990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 5097725 - 5097953
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||||||||   |||||    
T  5097725 tataaatattatgagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagttattctcacaatgata 5097821  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
     | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  ||| || || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |    
T  5097822 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcccgagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataacca 5097920  T
Q  251 taaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  5097921 taacgtttgttgatgggtacatgatgaatcatg 5097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829377
Alignment:
Q  34 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 133  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||  |||||||||  ||||  ||||||    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatag--aaagttatg-taagttccataag 18829434  T
Q  134 atattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtac 189  Q
     |||||||||  |||| |||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||    
T  18829433 ttattctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaaccactatgtac 18829377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9811965 - 9811733
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcattgtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| ||||||   ||    
T  9811965 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 9811868  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatga 247  Q
    ||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | || | || |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  9811867 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 9811769  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9811768 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 9811733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12704106 - 12703874
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattctcattgtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||    || ||||||||||| ||||||   ||    
T  12704106 tataaatattaggagtaatatttatattggatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatgagattaattgtcataagattttctcacaatg 12704009  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatga 247  Q
    ||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | || | || |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| |  || |    
T  12704008 ataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagaataa 12703910  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12703909 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27347470 - 27347425
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa 56  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347470 cacagatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33477269 - 33477193
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||| ||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33477269 tatcaaatctacaaataaatattaatattaagagtaatatttatacataattgatctgccataagaatactacatag 33477193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31652009 - 31651917
Alignment:
Q  54 aaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |  | ||||||||| ||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31652009 aaatattaggagtaacattaataatggattgacctactatgagaatattacatagt--atgttatg--aagtatcataagatattctcatagtgata 31651917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 31267889 - 31267860
Alignment:
Q  56 atattaggagtaatatttatactggattga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31267889 atattaggagtaatatttatactggattga 31267860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 283
Target Start/End: Original strand, 39538958 - 39539035
Alignment:
Q  206 gagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||  | || | ||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  39538958 gagtgctttatcaccattcaaatgttgtttggaataggatgattataaagttggttggtaggtactccacgaatcatg 39539035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18262427 - 18262699
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262427 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18262526  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18262527 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18262626  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18262627 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18262699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18269288 - 18269560
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269288 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18269387  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18269388 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18269487  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18269488 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18269560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 55612898 - 55613170
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612898 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 55612997  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  55612998 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 55613097  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55613098 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 55613170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8858382 - 8858654
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858382 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8858481  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8858482 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8858581  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8858582 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8858654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26963855 - 26964127
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963855 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26963954  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26963955 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26964054  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26964055 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26964127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26970678 - 26970950
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970678 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 26970777  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26970778 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 26970877  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26970878 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 26970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 868812 - 869084
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868812 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 868911  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  868912 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 869011  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  869012 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 869084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19926752 - 19926480
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926752 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 19926653  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19926652 aaagttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 19926553  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19926552 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 19926480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5707535 - 5707807
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707535 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5707634  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5707635 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5707734  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5707735 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5707807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5714163 - 5714435
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714163 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 5714262  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5714263 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 5714362  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5714363 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 5714435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10621325 - 10621053
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621325 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10621226  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10621225 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10621126  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10621125 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10621053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10628404 - 10628132
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628404 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10628305  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10628304 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgttttccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10628205  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10628204 ctttgtcaccattcaaactttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10628132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28393126 - 28392854
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393126 cacatatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 28393027  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28393026 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 28392927  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28392926 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgagtactccatgaatcatg 28392854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8845418 - 8845690
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845418 cacagatcatggataaagagttatcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8845517  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8845518 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccatccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8845617  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8845618 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgggtactccatgaatcatg 8845690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5668115 - 5667849
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  5668115 gatcatagataaagagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaag 5668016  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  5668015 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttagacctgaaaccactatgtaccctagatgttg--gtcgagtgcttt 5667918  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5667917 gtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccacgaatcatg 5667849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4426596 - 4426336
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426596 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 4426497  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||  ||||||||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4426496 aaatctatgaaaagt------------tctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 4426409  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4426408 ctttgttaccattcaaacattgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 4426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 35223779 - 35224047
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  35223779 gatcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaag 35223878  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  35223879 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgttgtattccaccctttgacctgaaaccacgatgtaccttagatgttggagtcgagtgcttt 35223978  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  35223979 atcaacattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatgtgtactccacgaatcatg 35224047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677303
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  |||| |||||||| |    
T  10677434 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10677336  T
Q  251 taaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  10677335 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10677303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10890943
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  |||| |||||||| |    
T  10891074 gtggtgtatttcaccctttgacttgaaaccactatgtatcctagatgtaggagtcgagtgctttaccaccatttaaacgttgtttgtaataagatgac-a 10890976  T
Q  251 taaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  10890975 taaagttggtagatgggtactccatgaaccatg 10890943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 20311511 - 20311781
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||  | ||    
T  20311511 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatag--acag 20311608  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    |||||  || | |||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||| ||| | |||| |||    
T  20311609 ttatg-taactatcatacattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaaccactatttaccctagatgtaggattcgagtactt 20311707  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    |||  || | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| || |||||| || ||||||||||||    
T  20311708 tgttcccgtacaaacgttgtccgtagcaggatgactataaagtcggttaatcggtactccacgaatcatgatga 20311781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21453965
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacata-tatgagttatgtaaaatatcata 21454012  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21454011 agatattttcattgtgatagtggtgtatgtcacccttcgacctgaaa 21453965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 15461552 - 15461799
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  15461552 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 15461648  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  15461649 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 15461747  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15461748 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15461799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 34975606 - 34975853
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  34975606 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 34975702  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  34975703 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgtttccattctaacgtt 34975801  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34975802 gtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 2677068 - 2677315
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  2677068 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 2677164  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  2677165 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 2677263  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2677264 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 2677315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 15815076 - 15815323
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  15815076 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 15815172  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  15815173 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 15815271  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15815272 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 15815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18111290 - 18111043
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18111290 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18111194  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18111193 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18111095  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18111094 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3369270 - 3369023
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  3369270 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 3369174  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | || | || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  3369173 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctcttgatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 3369075  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3369074 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 3369023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17300206 - 17299959
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  17300206 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 17300110  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  17300109 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 17300011  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  17300010 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgagcacttgatgaatcatg 17299959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 19365586 - 19365821
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca- 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19365586 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcac 19365682  T
Q  143 ttgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaa 242  Q
       ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||  |||||| || |||| |  |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||     
T  19365683 caatgataatggtgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacag 19365781  T
Q  243 gatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcat 282  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||| |||| | |||||||    
T  19365782 gatgaccataacgttagttaatgggcacttgacgaatcat 19365821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 20244004 - 20244239
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20244004 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 20244100  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  20244101 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 20244199  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20244200 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20244239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26531680 - 26531915
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26531680 acataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26531776  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  26531777 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 26531875  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26531876 ataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 26531915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 1941791 - 1942026
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1941791 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 1941887  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||| ||||||  |||||| || |||||| |||| | |    
T  1941888 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaatgttgtctgtaaaagg 1941986  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1941987 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 1942026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4676218 - 4675983
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  4676218 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 4676122  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| | |    
T  4676121 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattataacgttgtctgtaaaagg 4676023  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4676022 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 4675983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 18163229 - 18163464
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18163229 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattcacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18163325  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18163326 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18163424  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18163425 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18163464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 56516271 - 56516368
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  56516271 cacagataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaacactacatag 56516368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 5870473 - 5870720
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  5870473 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 5870569  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
     ||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  |||| |||||   ||||| ||||||    
T  5870570 tgatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgtcattctaacgtt 5870668  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||  ||| | ||| || |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5870669 gtctataataggataacaataacgttggttgatgagtacttgatgaatcatg 5870720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 19362477 - 19362712
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  19362477 acataggtattaatattaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactacatagt--atgttat-caaagtgtcataagatattctcac 19362573  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||  || ||| || |||| || | |||||| |   ||||||||||||||| |||||| |    
T  19362574 aatgataatggtgtataccactcttaaacctgaaaccactatgatccttagatg-tggacttaaatgctttattgtcattcaaacgttgtctgtaacagg 19362672  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||| |||| | ||||| ||||  |||| | ||||||||    
T  19362673 atgaccataacggtggttaatggccacttgacgaatcatg 19362712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 5616469 - 5616681
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||||||||||||| |   |||||    
T  5616469 tataaatattagaagtaatatttatactggattgaccaaccgtgagaatactacagagttta--ttatg-aaagtgtcataagatattcttacaatgata 5616565  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
     |||||||| |||  ||| || |||||| |||||||  |||||| || |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||| |||     
T  5616566 atggtgtataccaatcttagatctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgccattcaaacgttgtttgtaacaagataactg 5616664  T
Q  251 taaagttggttgatggg 267  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  5616665 taacgttggttaatggg 5616681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 9487625 - 9487853
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||   |||||    
T  9487625 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccatcgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcacaatgata 9487721  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
     | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  |||  |||||   ||||  ||||||||| |||| | ||| || |    
T  9487722 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtattttgttgtcattataacgttgtctgtaataggataacca 9487820  T
Q  251 taaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9487821 taacattggttgatgggtacttgatgaatcatg 9487853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30040705 - 30040489
Alignment:
Q  63 gagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattcc 162  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||  |    
T  30040705 gagtaatatttatactagattgacccaccatgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatc 30040609  T
Q  163 acccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttg 262  Q
    || ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||   ||||| || |||||  |||| | ||| || |||| |||||||     
T  30040608 actcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaatgttgtttgtaaaaggataaccataacgttggtta 30040510  T
Q  263 atgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||||| ||||||||||    
T  30040509 atgagtacttgatgaatcatg 30040489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 4546147 - 4546242
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  4546147 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggacagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctca 4546242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 32636552 - 32636682
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatt 144  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  32636552 cataggtataaatattatgagtaatatttatattggattgacccaatgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 32636648  T
Q  145 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
     ||||| |||||||| |||| || |||| |||||    
T  32636649 atgataatggtgtataccactctccgacgtgaaa 32636682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888743
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||| ||||| |||||  |  | ||||| ||||||| |||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatattta---tgaattgacccaccatgataataccacata--atgatttatgtaaagtgtgata 33888688  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
    ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  33888689 agataatatcatattgacagtggtgtatgccacatttcgacctgaaatcactatg 33888743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Original strand, 9538033 - 9538121
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9538033 tataaatgttaggagtaatatttatactggattgacccagcgtgagaatactacatag--catgttatg-aaagtgtcataagatattctca 9538121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5528714 - 5528479
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||  | ||||||||| || ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5528714 acataggtataaatattaggagtgatatttatattgtattaacccaacgtgagaataccacgtagtata--ttatgaaaa-tgccataagatattctcat 5528618  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| ||||||||  ||| |||  ||||||||   |||||  |||||| || |||| |  |||||||| |  ||||||||||||| || |||||| |    
T  5528617 aatgataatggtgtataacactcttatacctgaaactgctatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaacgttatctgtaacagg 5528519  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| ||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  5528518 ataaccataatgttggttaatgggcatttgatgaatcatg 5528479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 32646789 - 32646697
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacata 107  Q
    |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  |||| ||||| |||||||    
T  32646789 gatcattgataaaggaatatcgagtcttcacatagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacata 32646697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34777975 - 34777862
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| || | |||||| || |||||||||||||||| | |   | ||||| ||    
T  34777975 ataaaaagttatcaagtcttcaaatatgtataaatataatgagtaatttttgtattagattgaccctccatgagaatactacacatt--gacttatgtaa 34777878  T
Q  123 agtgtcataagatatt 138  Q
    ||||||||||||||||    
T  34777877 agtgtcataagatatt 34777862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Original strand, 24700245 - 24700291
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 58  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700245 acagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9937826 - 9937717
Alignment:
Q  174 tgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttc 273  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||| || | |||| ||  | ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||   ||||||| ||| ||     
T  9937826 tgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgaatactttatcgtcgttcaaacattgttcgtaaaaggatgactataaagacagttgatgagtatttt 9937727  T
Q  274 atgaatcatg 283  Q
    ||||||||||    
T  9937726 atgaatcatg 9937717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 138
Target Start/End: Original strand, 11421096 - 11421165
Alignment:
Q  66 taatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatatt 138  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  11421096 taatatttatattggattgacccaccgttagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatatt 11421165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 204
Target Start/End: Original strand, 24701361 - 24701410
Alignment:
Q  155 tgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagt 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  24701361 tgtattccacccttcgacctaaaaccactgtgtaccctagatgtaggagt 24701410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 9538184 - 9538260
Alignment:
Q  207 agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  9538184 agtgctttattgccattcaaacattgtccgtaacaggataaccataacgttggttaatgggcacttgacgaatcatg 9538260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6110279 - 6110551
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110279 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6110378  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6110379 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6110478  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6110479 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 8490710 - 8490982
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490710 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 8490809  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8490810 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 8490909  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8490910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 8490982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16482475 - 16482203
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482475 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16482376  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16482375 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16482276  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16482275 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16482203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10579347 - 10579075
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10579347 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 10579248  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10579247 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 10579148  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10579147 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10579075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15600876 - 15600604
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600876 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15600777  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15600776 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15600677  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15600676 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15600604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15607421 - 15607149
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607421 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15607322  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15607321 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15607222  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15607221 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtaccccatgaatcatg 15607149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10572584 - 10572312
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572584 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 10572485  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  10572484 aaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtg 10572385  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10572384 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 10572312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15357578 - 15357306
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357578 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagta 15357479  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15357478 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15357379  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15357378 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15357306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18520190 - 18520462
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520190 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagta 18520289  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18520290 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18520389  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18520390 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 18522878 - 18523146
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18522878 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagta 18522977  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18522978 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtatttcacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18523077  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18523078 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 18523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13211517 - 13211789
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13211517 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagta 13211616  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  13211617 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccattatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13211716  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13211717 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13211789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13248822 - 13249094
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13248822 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagta 13248921  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  13248922 aaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaacctagatgttggagtcgagtg 13249021  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13249022 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 13249094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15342211 - 15341939
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15342211 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagta 15342112  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15342111 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15342012  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15342011 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17781110 - 17780838
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781110 cacaaatcatagataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 17781011  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17781010 aaaattatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17780911  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17780910 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaataggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 17780838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32056892 - 32056619
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaa-tattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056892 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagt 32056793  T
Q  110 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32056792 aaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcaacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagt 32056693  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32056692 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 32056619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17200176 - 17199900
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17200176 cacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagta 17200077  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  17200076 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccttagatgttggagtcgagtg 17199977  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17199976 ttttgtcaccattcaaatgttgttcgtatcaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatgatga 17199900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13517026 - 13517294
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13517026 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactaaatagta 13517125  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13517126 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgg----ccccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13517221  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13517222 ctttatcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggtagatgggtactccatgaatcatg 13517294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1647513 - 1647241
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  1647513 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgagaatactacataata 1647414  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  1647413 aaagttatgaaaagtgtcatacgatattcccatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctaaaaccactatataccctagatgttggagtcgagtg 1647314  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1647313 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaatttggttgatgagtactccatgaatcatg 1647241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 17136574 - 17136840
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17136574 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatat------taggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 17136667  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17136668 aaagttattgaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 17136767  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17136768 cttagtaaacattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 17136840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29925189 - 29925458
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||    
T  29925189 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29925288  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29925289 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29925388  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29925389 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29925458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 29974342 - 29974611
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||    
T  29974342 agatcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaa 29974441  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29974442 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccatttgacctgaaaccattatgtaccctagacgttggagttgagtgctt 29974541  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29974542 tgtcaccaatcaaacgttgtctgtaacaagatgattataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 29974611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Original strand, 16200646 - 16200917
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16200646 acagatcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtca 16200745  T
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgc 211  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  16200746 aaattatgtaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattcaaccctttgacctgaaaccactatgtaccctagatgttgaagtcgagtgc 16200845  T
Q  212 tttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  16200846 tttgtcaccattcaaatgttgtctgtaacaagatgactataaagttggttgatggatactccacgaatcatg 16200917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21034293 - 21034540
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21034293 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 21034389  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21034390 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21034488  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21034489 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21034540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15846783 - 15846536
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  15846783 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 15846687  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||    
T  15846686 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 15846588  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15846587 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20147801 - 20147554
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  20147801 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 20147705  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20147704 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20147606  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20147605 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 20147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21398847 - 21399094
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21398847 tatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 21398943  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    ||||||||| |   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21398944 agatattcttacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21399042  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21399043 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21399094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 14890446 - 14890693
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  14890446 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 14890542  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||| ||  | |||| || |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||    
T  14890543 agatattctcacaatgataataatgtatattgctcttagacctgaaagcactgtgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 14890641  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14890642 gtctgtaaaaggataattataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 14890693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25978963 - 25978728
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  25978963 acataggtataattattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 25978867  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  25978866 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 25978768  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25978767 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 25978728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 55427088 - 55427323
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  55427088 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 55427184  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  55427185 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 55427283  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55427284 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 55427323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 12299978 - 12300212
Alignment:
Q  45 catagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatt 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  12299978 catagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcaca 12300074  T
Q  145 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaaga 244  Q
     ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||| | ||    
T  12300075 atgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgatttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagga 12300173  T
Q  245 tgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12300174 taacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12300212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24253372 - 24253205
Alignment:
Q  19 atggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttat 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||| | |||||  || |||||    
T  24253372 atggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacattaagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatag--aatgttat 24253275  T
Q  119 gaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtacc 190  Q
       |||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  24253274 -ttaaggatcataagttattctcatagtgataacggtgtattcca-cattcgacctaaaaccactatgtacc 24253205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 11787654 - 11787749
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  11787654 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactacatagtaa--gttatgatattt-tcataagatattctca 11787749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 14147095 - 14147226
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||   |||||    
T  14147095 tataaatattaggaggaatatttatactggattgacctgccgtgagaatgctacatagt--atgttatgaaaa-tgtcgtaagatattctcacattgata 14147191  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactat 185  Q
      |||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14147192 aaggtgtatatcactcttagacctgaaaccactat 14147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 150
Target Start/End: Original strand, 32280313 - 32280444
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| ||| | |||| || | ||||||||| ||||||||   |||     
T  32280313 tcatggataaagagttatttaatcttcacataggtataatcattacgaataatatttacactcggttgacccacaatgagaataatacatagt--gagtc 32280410  T
Q  117 atgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32280411 atgtaaagtgtcataagatattctcatagtgata 32280444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15317408 - 15317313
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  15317408 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctca 15317313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 241
Target Start/End: Original strand, 15526827 - 15527013
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||  | | |||||||| |||||||||||||||| |   || ||    
T  15526827 tataaatcttaggagtaatatttatactggattgacccatcgtgagagtactaaatagt--atgctatgaaaa-tgtcataagatattcttacaatgtta 15526923  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  || ||  || |||| |  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  15526924 atggtgtataccactcttagacctgaaaccactatgatccatacatg-tggactcaagtgctttataaccattcaaacgttgtctgtaaca 15527013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 28088227 - 28088408
Alignment:
Q  98 atactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtg 197  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| ||    
T  28088227 atactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg 28088323  T
Q  198 ttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | ||| |  || |||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28088324 t-ggactcaagggctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataaccataacgttggttgatggatacttgatgaatcatg 28088408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 143
Target Start/End: Original strand, 28953965 - 28954092
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt-atactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||  |  |||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28953965 gatcattgataaagagttacaaagtcttcacatatgtatacacattaggagtaatatttgttgttggattaacccatcatgagaatactacata--ataa 28954062  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  28954063 gttatttaaagtgtcatatgatattctcat 28954092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36138097 - 36138033
Alignment:
Q  122 aagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
    ||||| |||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36138097 aagtgccataagatatttccaaagtgataatggtgtataccacccttcaacctgaaatcactatg 36138033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 4189223 - 4189308
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  4189223 aatattatgagtaatatttatactatattgatctgtcatgagaatattacata--aaatattatg-aaggtgtcataaaatattctcat 4189308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 11787813 - 11787889
Alignment:
Q  207 agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||   ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11787813 agtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaatggataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 11787889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18252245 - 18252517
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252245 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18252344  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18252345 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18252444  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18252445 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18252517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18532506 - 18532234
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532506 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18532407  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18532406 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18532307  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18532306 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 18532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27131401 - 27131130
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131401 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27131302  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  27131301 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgta-cctagatgttggagtcgagtg 27131203  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27131202 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27131130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27310569 - 27310297
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310569 cacagattatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 27310470  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27310469 aaagttatgaaaagtgtcataagatattcttatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 27310370  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27310369 ctttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 27310297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16359027 - 16358755
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359027 cacagataatggataaagagttatcaagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 16358928  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16358927 aaagttatgagaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgtcttgaaaccaccatgtaccctagatgttggagtcgagtg 16358828  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16358827 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactttaaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 16358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3855911 - 3855639
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3855911 cacaaatcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatgagaatactacatagta 3855812  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3855811 aaggttatgaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccaccattcgacccgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagcg 3855712  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  3855711 ctttgtcaccattcaagcgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgaccggtactccatgaatcatg 3855639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36816625 - 36816366
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36816625 cacagatcatggataaagagttatcaagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagta 36816526  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  36816525 aaagttatgaaaagtgtcataa-aaattatcatagtgatggtggtgtattccaccctttgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagcg 36816427  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36816426 ttttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagataactataaagttggttgataggtact 36816366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22641859 - 22641594
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22641859 agatcatggataaagagttattaagtgttcacatagatataa---ttaggaataatatttatactagattgacccaccatgagaa-actacatagtaaaa 22641764  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  22641763 gttataaaaagtgtcataagatattctcacagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccgtagatgttggagtcgagtgctt 22641664  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  22641663 tgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaagatgactataaagttggtcgatgggtactccacgaatcatg 22641594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27277545 - 27277278
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||||||    
T  27277545 gatcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaag 27277446  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  27277445 tcatgaaa-gtgccataagatattcttatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctggatgttggagtcgagtgcttt 27277347  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     |||  |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  27277346 atcataattcaaacattgtttgtaacaagatgaccataaagttggttgaagggtactccataaatcatg 27277278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21171225 - 21171081
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171225 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21171126  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21171125 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggt 21171081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916497
Alignment:
Q  91 catgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaatc-actatgta 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatag--aaagttatgtaaa-tgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaaccactatgta 9916592  T
Q  189 ccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || || || ||||||||    
T  9916591 ccctagatgtaggagtcgagtactttgttaccgtccaaacgttgtccgtaacaaggtgactataaagttagtttatgagttctccacgaatcatg 9916497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19706686 - 19706439
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  19706686 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 19706590  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  19706589 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 19706491  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19706490 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 19706439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28134970 - 28134723
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  28134970 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 28134874  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||  || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  28134873 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 28134775  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28134774 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 28134723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43802612 - 43802365
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  43802612 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 43802516  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  43802515 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 43802417  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43802416 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 43802365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 9456171 - 9456418
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  9456171 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 9456267  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  9456268 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 9456366  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9456367 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 9456418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20391486 - 20391239
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||    
T  20391486 tatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattttcata 20391390  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  ||||| || | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20391389 agatattctcacaatgataataatgtataccgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20391291  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20391290 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 20391239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20779892 - 20779645
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  20779892 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 20779796  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  20779795 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 20779697  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20779696 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 20779645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22670504 - 22670257
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22670504 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22670408  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22670407 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22670309  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22670308 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42817236 - 42816989
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  42817236 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 42817140  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  42817139 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 42817041  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42817040 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 42816989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 22657207 - 22657108
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtt 116  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22657207 tcatagataaagagttattaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaatactacatagtaaaagtt 22657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 23507119 - 23507385
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||| ||||| ||  || |    
T  23507119 gatcatggataaggagttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagag--aacg 23507216  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    || || |||  | |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||  || |||||| |||    
T  23507217 ttgtgtaaaaag-cataagttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaagatttgagtactt 23507315  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| | ||| ||||    ||| |||| | |||||||||||| | | || ||||||||| ||| |||||||    
T  23507316 tgttatcatacaaataccgtctgtaataggatgactataaattcgatttatgggtactccataaatcatg 23507385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 634001 - 634236
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  634001 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 634097  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  634098 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 634196  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| ||||||||| | | |||| ||||||||||    
T  634197 ataaccataacgttggttgacgagcacttgatgaatcatg 634236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12014272 - 12014085
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||     
T  12014272 gatcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaat 12014173  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagt 204  Q
     | | ||||   ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  12014172 atgtaaaaa---tcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgtaggagt 12014085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 22612547 - 22612794
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22612547 tatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22612643  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22612644 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatcactagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22612742  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||  ||| | ||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22612743 gtctataaaaggataatcataacgttggttgatggctacttgatgaatcatg 22612794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 8727741 - 8727969
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||    
T  8727741 tataaatattagaagtaatatttatactggattgatccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-taccataagatattctcttagtgata 8727837  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
       ||||||  ||| ||| |||||| || |||||||  |||||| ||  ||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| || |    
T  8727838 agagtgtatatcactcttagacctggaaccactatgatccctagatg-cggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 8727936  T
Q  251 taaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||  |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  8727937 taacattggctaatgggtacttgatgaatcatg 8727969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9917906 - 9917837
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  9917906 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattga 9917837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21881604 - 21881481
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  21881604 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 21881508  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaa 177  Q
      ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  21881507 acggtgtataccactcttagacctgaa 21881481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 29096789 - 29096928
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29096789 acataggtatacatattaggaataatatttatactagattgatccaccgtgtgaatactacatag--catgttatgaaaa-tgtcataagatattctcat 29096885  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
      ||||| |||||| |  ||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  29096886 aatgataatggtgtttcacactcttagacatgaaaccactatg 29096928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12006526 - 12006461
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactgga 81  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12006526 atcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga 12006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 35930649 - 35930713
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  35930649 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacctaccgtgagaatactacatag 35930713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26923608 - 26923553
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  26923608 aatattaggagtaatatttatactgaattgacccaccgtgagaatactacatagta 26923553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 47667721 - 47667668
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattga 85  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47667721 tatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattga 47667668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 104
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997406
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaatactac 51997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24301774 - 24301701
Alignment:
Q  113 agttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||    
T  24301774 agttatgttaagtatcataagacattctcatagtgatagtggtgtatacaaccctttgacctaaaatcattatg 24301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28145835 - 28145723
Alignment:
Q  170 gacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  28145835 gacctgaaaccactatgatccctagatgt-ggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggta 28145737  T
Q  270 cttcatgaatcatg 283  Q
    ||| ||||||||||    
T  28145736 cttgatgaatcatg 28145723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47667561 - 47667485
Alignment:
Q  207 agtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47667561 agtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 47667485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31236478 - 31236403
Alignment:
Q  65 gtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31236478 gtaatacttatactgaattgatctatcatgagaatactacatagtata--ttatg-aaagtgtcgtaagatattctcat 31236403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Original strand, 35132342 - 35132399
Alignment:
Q  225 aaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcat 282  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  35132342 aaacgttgtccataacatgataattataaagttgtttgatatgtacttcatgaatcat 35132399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 21940880 - 21941151
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940880 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21940979  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21940980 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21941079  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21941080 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcat 21941151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6094338 - 6094610
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6094338 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagta 6094437  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6094438 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgaccagaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6094537  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6094538 ctttgtcaccattcaaacgttgttcgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6094610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Original strand, 22171705 - 22171974
Alignment:
Q  14 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171705 agatcatggataaagagttatcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaa 22171804  T
Q  114 gttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22171805 gttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctt 22171904  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22171905 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 22171974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 15326422 - 15326685
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326422 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15326521  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15326522 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15326621  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15326622 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15326685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 15506791 - 15507054
Alignment:
Q  20 tggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506791 tggagaaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg 15506890  T
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15506891 aaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcac 15506990  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15506991 cattcaaatgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 15507054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 24642864 - 24643135
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24642864 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagta 24642963  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  24642964 aaa-ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataatggtgtattccacccttcgaactgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaagtg 24643062  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24643063 ttttgtcaccattcaaacgtggtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 24643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 145 - 283
Target Start/End: Original strand, 28548396 - 28548534
Alignment:
Q  145 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaaga 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28548396 gtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggg 28548495  T
Q  245 tgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28548496 tgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 28548534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24797359 - 24797224
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797359 tatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 24797260  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccaccctt 168  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24797259 agatattctcatagtgat-gtggtgtattccaccctt 24797224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14983908 - 14983710
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14983908 gatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagatattaggagtaata-ttatattagaatgacccgccatgagaatactacatag--aaag 14983812  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||    
T  14983811 ttatgtaaa-tgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtattccgtccttcgacctgaaatcactatgtaccctagatgtaagagtcgagtactt 14983713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8371500 - 8371253
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  8371500 tatcaagtctatacataggtataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 8371404  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  8371403 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 8371305  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8371304 gtctgtaaaaggatgatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 8371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 12562178 - 12562425
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  12562178 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 12562274  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||    
T  12562275 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgtt 12562373  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12562374 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 12562425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21969388 - 21969635
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21969388 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 21969484  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21969485 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21969583  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21969584 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 21969635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22659729 - 22659494
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22659729 acataggtataaatattaggagtaatatgtatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 22659633  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  22659632 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 22659534  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22659533 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 25611250 - 25611497
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  25611250 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaactgtcata 25611346  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  ||| ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  25611347 agatattctcacaatgataataatgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 25611445  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25611446 gtctgtaaaaggataatcatagtgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 25611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27007764 - 27007517
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  27007764 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 27007668  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27007667 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27007569  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27007568 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27007517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27014907 - 27014660
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  27014907 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 27014811  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27014810 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27014712  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27014711 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27014660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27880734 - 27880487
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  27880734 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 27880638  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  27880637 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 27880539  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27880538 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 27880487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28020915 - 28020668
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  28020915 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 28020819  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  28020818 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 28020720  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28020719 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 28020668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22130856 - 22130609
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  22130856 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 22130760  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22130759 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 22130661  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||  ||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22130660 gtctataaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 22130609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38232365 - 38232115
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  38232365 gatcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatag--aaag 38232268  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    ||||| ||| ||||| | | ||||| |||  |||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||   | |||||||| | ||| | ||| |||| |||    
T  38232267 ttatgtaaa-tgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattccatcctcagacttgaaattgatgtgtacccttgatgtagaagtcgagtactt 38232169  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatggg 267  Q
    |||   | | |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  38232168 tgttgtcgtacaaacgttgtccgtgacatgatggttataaagttggttgatggg 38232115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 6430953 - 6431188
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  6430953 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 6431049  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||  |||||||||||||||||  |||||| || |||| |  ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  6431050 aatgataatagtgtatatcgctctaagacctgaaatcactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 6431148  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6431149 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 6431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 21916731 - 21916978
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||    
T  21916731 tatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacattgt--aagttatg-aaattgtcata 21916827  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  21916828 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 21916926  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21916927 gtctgtaaaaggataacaataactttggttgatgggcacttgatgaatcatg 21916978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45534508 - 45534273
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  45534508 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 45534412  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| | |    
T  45534411 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctataaaagg 45534313  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45534312 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 45534273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240786
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 26240647  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||  |  |||||  | | ||| ||||| ||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||  |||| | |    
T  26240648 aatgattataatgtatatcgctcttagacctaaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtttgtaaaagg 26240746  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26240747 ataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 26240786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8782102 - 8781971
Alignment:
Q  52 ataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatag 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||     
T  8782102 ataaatattaggactaatatttatacttgattgatccaccgtgagaatactacatagt--ctgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgataa 8782006  T
Q  152 tggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||    
T  8782005 tggtgtataccactcttagacttgaaaccactatg 8781971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Original strand, 18835424 - 18835548
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||| ||  ||||||    
T  18835424 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgtt-ttaaaaatgtcataagatattcacacagtgata 18835520  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
     ||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  18835521 atggtgtatatcactcttagacctgaaa 18835548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 119
Target Start/End: Original strand, 2375231 - 2375332
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagt 115  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || |||| | ||| |||||||  ||||||    
T  2375231 atcatggataatgagttatcaaattttcacataaatataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacata--aaaagt 2375328  T
Q  116 tatg 119  Q
    ||||    
T  2375329 tatg 2375332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2963171 - 2962932
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga---aaagtgtcataagatattct 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||  ||||||||||||||||| |  ||||||    || ||||||||||||||||    
T  2963171 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatagacctaccgcgagaatactacatagtaca--ttatgagattaattgtcataagatattct 2963074  T
Q  141 cattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaac 240  Q
    ||   ||||| | | ||||  | | ||| ||||||||| |||||||  ||||||  | |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| | ||     
T  2963073 cacaatgataatagcgtatatccctcttagacctgaaaccactatgatccctagacg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgcaaa 2962975  T
Q  241 aagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | ||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2962974 aggataaccataacgttggttgatggttacttgatgaatcatg 2962932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 32872833 - 32872741
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatacta 103  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||| |||||| | ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  32872833 cacagatcatgaataaagaggtatcaagtctttacatcggcataagtattagtaataatatttatattgaattgatctgtcatgagaatacta 32872741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24796822 - 24796733
Alignment:
Q  180 cactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  || |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24796822 cactatataccctagatgttggagtcgagtgctttatcaccattcaatcgt--tctgtaatataatggctataaaattggttgatgggtact 24796733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 83
Target Start/End: Original strand, 36970332 - 36970371
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggatt 83  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36970332 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggatt 36970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 10920427 - 10920479
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttat 75  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  10920427 ataaagagttatcaaatattcacatatgtataaatattatgagtaatatttat 10920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 29645575 - 29645631
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatattt 73  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  29645575 tcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatattt 29645631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20535409 - 20535306
Alignment:
Q  80 gattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaat 179  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||     
T  20535409 gattgacccaccatgagaatattgcatagtat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcacaatgataatggtgtataccactcttagacctggaac 20535313  T
Q  180 cactatg 186  Q
    |||||||    
T  20535312 cactatg 20535306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8968076 - 8968015
Alignment:
Q  222 ttcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||    
T  8968076 ttcaaacgttgtccataaaaagatgattataaagtcgactgatgggtactccataaatcatg 8968015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41368154 - 41368105
Alignment:
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactt 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  41368154 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtactt 41368105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41375125 - 41375076
Alignment:
Q  223 tcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtactt 272  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  41375125 tcaaacgttgtctgtaacatgataactataaagttggttaataggtactt 41375076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 7322 - 7594
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7322 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 7421  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7422 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaacaactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 7521  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7522 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 7594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6926 - 6654
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6926 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 6827  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6826 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 6727  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6726 ctttgtcaccattcaaacgttgtccataacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13942 - 13670
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13942 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataata 13843  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13842 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 13743  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13742 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggttactccatgaatcatg 13670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25982 - 25706
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25982 cacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 25883  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25882 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 25783  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25782 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccataaatcatgatga 25706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 15152658 - 15152926
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152658 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 15152757  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15152758 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 15152857  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152858 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaat 15152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29327999 - 29328271
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327999 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 29328098  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29328099 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 29328198  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29328199 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgcttgatgggtactccatgaatcatg 29328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11536054 - 11535782
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536054 cacagatcatggataaagagttatccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11535955  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11535954 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccaacattcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 11535855  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11535854 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11535782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 12751041 - 12751313
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12751041 cacagatcatggataaagagttatcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12751140  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  12751141 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactaggtaccctagatgttggagtcgagtg 12751240  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12751241 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatggatactccatgaatcatg 12751313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11542972 - 11542700
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542972 cacagatcatggataaagagttatctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 11542873  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  11542872 aatgttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtgatgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgctggagtcgagtg 11542773  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11542772 atttgtcaccattcaaacgttgtctgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 11542700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 12738751 - 12739023
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738751 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 12738850  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  12738851 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccgttcgacctgaaactactatgtaccctagatgttgtagtcgagtg 12738950  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12738951 ctttgtcaccattcaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatgaatcatg 12739023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18561222 - 18561485
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  18561222 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaatactacatagta 18561321  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||         || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18561322 aaagttatgaaaagtgtcataa---------atagtgatagtggtgtattccacccttcgacttgaaaccactatgtaccctagatgttggagttgagtg 18561412  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  18561413 atttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttgattgataggtactgcacgaatcatg 18561485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 13392369 - 13392637
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||     
T  13392369 gatcatagataaagagttatcctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaat 13392468  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||    
T  13392469 ttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccaccctttgacctaaaatcactatgtaccatagatgttggagtcaggtgcttt 13392568  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13392569 gtcaccatacaaacgttgtttgtaacaagatgactataaaattggttgatgggtactccatgaatcatg 13392637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18257834 - 18257559
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || | |||||| ||||||||     
T  18257834 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcagaatattacatagt- 18257736  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
     | || ||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||    
T  18257735 -atgtcatgaaaaatgtcataagatattctcacaatgataatggtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtg 18257638  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatgatg 289  Q
    ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  18257637 ctttgttgccattcaaacgttgtgtgtaacaagataactataaagttggttgatgggtacttgaagaatcatgttgatg 18257559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 2204607 - 2204854
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  2204607 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 2204703  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  2204704 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 2204802  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2204803 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 2204854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 265
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365389
Alignment:
Q  43 cacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacatag--gaagttatgtaaa-tgtcataagttattctca 2365265  T
Q  143 ttgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||   |||||||  ||| ||||||   | | ||||||| ||||||||||    
T  2365266 ttgtgataagtggtgtatttcaccattcgacctaaagccactatgtaccctagaccttggagtcaagtactttgttgtcgtacaaacgtcgtccgtaaca 2365365  T
Q  242 agatgactataaagttggttgatg 265  Q
       |||||||||||| ||||||||    
T  2365366 gattgactataaagtcggttgatg 2365389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 8465054 - 8465301
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  8465054 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 8465150  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  || ||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||    
T  8465151 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccttagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacatt 8465249  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8465250 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 8465301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 18400159 - 18400406
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18400159 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18400255  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18400256 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18400354  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18400355 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18400406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 18407143 - 18407390
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  18407143 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 18407239  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  18407240 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttggacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 18407338  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18407339 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 18407390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 19230943 - 19231190
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  19230943 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacata--ataagttatg-aaattgtcata 19231039  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||  || |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||    
T  19231040 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctaaatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 19231138  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||  |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19231139 gtttgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 19231190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41681203 - 41680968
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  41681203 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 41681107  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||| | |    
T  41681106 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacattgtctgtaaaagg 41681008  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41681007 ataaccataacgttggttgattggtacttgatgaatcatg 41680968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48808743 - 48808496
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  48808743 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 48808647  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  48808646 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 48808548  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48808547 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 48808496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 15729818 - 15730053
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15729818 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 15729914  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||    | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  15729915 aatgataataatgtatattgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 15730013  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15730014 ataacaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 15730053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18139573 - 18139338
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  18139573 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 18139477  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18139476 aatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggattcaagtgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18139378  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18139377 ataataataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18139338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 30254193 - 30254440
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  30254193 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 30254289  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||   || ||| ||| ||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  30254290 agatattctcacaatgataataatgtatattactcttagacttgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 30254388  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  30254389 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgataaatcatg 30254440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 28130628 - 28130863
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  28130628 acataggtataaatatcaggagtaatatttatactggattgacccactgtgagaatattacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcac 28130724  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      | ||| | ||||||  ||  ||| |||||||||||||||||  || ||| || |||| |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  28130725 aataataatagtgtatatcattcttagacctgaaatcactatgatccgtagatg-tggactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 28130823  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28130824 ataaccataacgttggttgatgggtacttaatgaatcatg 28130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47167094 - 47166859
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  47167094 acataggtataaatattatgagtaatatttatactagatagacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 47166998  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  47166997 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 47166899  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  47166898 ataaccataacgttggttgatgggtacttgataaatcatg 47166859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10669137 - 10668901
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattct--c 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||  |    
T  10669137 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcgc 10669041  T
Q  142 attgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaaca 241  Q
    | | ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  || ||  || |||| |  | ||||||||  |||||| ||||||||| |||| |    
T  10669040 aat-tgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccgtaaatg-tggactcaaatgctttgttgccattctaacgttgtctgtaaaa 10668943  T
Q  242 agatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10668942 ggataaaaataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 10668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25845700 - 25845476
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||   | ||| ||     
T  25845700 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25845604  T
Q  155 tgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaa 254  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| || ||||  |||||| || |||| |  |||||||| |  |||||||||| || || |||| ||||| |||||||     
T  25845603 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845505  T
Q  255 gttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||| || || | || ||||||||||    
T  25845504 gttggtttataggaatttgatgaatcatg 25845476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25846119 - 25845895
Alignment:
Q  55 aatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtgg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||   | ||| ||     
T  25846119 aatattaggagtaatatttatactggattgacacaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tatcataagatattctcaaaataataatga 25846023  T
Q  155 tgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaa 254  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| || ||||  |||||| || |||| |  |||||||| |  |||||||||| || || |||| ||||| |||||||     
T  25846022 tgtataccactcttagacctgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttatttccattcaaaccttatctgtaaaaagataactataac 25845924  T
Q  255 gttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||| || || | || ||||||||||    
T  25845923 gttggtttataggaatttgatgaatcatg 25845895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 34128647 - 34128875
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||||||||||||   | |||    
T  34128647 tataaatattaggagtaatatttatactggatagatccattgtgagaatactacatagt--acgttatg-agattgtcataagatattctcacaattata 34128743  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
     | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||| ||||||   ||||| ||||||||| |||| | ||| || |    
T  34128744 atagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaaggataacca 34128842  T
Q  251 taaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34128843 taacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 34128875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Original strand, 14591924 - 14592012
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14591924 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctca 14592012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 142
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011603
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaatactatacagt--ttgttatgaaaa-tgtcataagatattctca 16011603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18259359 - 18259124
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  18259359 acataggtataaatattgaaagtaatatttatactggatagacccaccgtgagaatactgcatagt--aagttatg-agattgtcataagatattctcac 18259263  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |  ||||  |||||| || |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  18259262 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaacccttatgatccctagatg-tggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtctgtaaaagg 18259164  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18259163 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 18259124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19393659 - 19393564
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctca 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19393659 acataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgaccgaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tctcataagatattctca 19393564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 177
Target Start/End: Original strand, 22969024 - 22969147
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||    
T  22969024 tataaatattaggagtaatgtttatacaagattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcacaatgata 22969120  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaa 177  Q
      ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  22969121 acggtgtataccactcttagacctgaa 22969147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31190660 - 31190537
Alignment:
Q  58 attaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgt 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190660 attaggagcaatatttatactggattgacccaccatgagaatactacattgt--atgttatgaata-tgtcttaagatattctcatagtgataatggtgt 31190564  T
Q  158 attccacccttcgacctgaaatcacta 184  Q
    ||  |||  || ||||||||| |||||    
T  31190563 atatcactgttagacctgaaaccacta 31190537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Original strand, 19388626 - 19388754
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaa--aagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||   |  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  19388626 tataaatattaggagtaatatttatactggattgcccaatcatgagaatactacatatatagtatgttatg-aaagtgtcataagatattctcatagtgg 19388724  T
Q  149 tagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
    || | |||||| |||| ||| |||||||||    
T  19388725 taatagtgtataccactcttagacctgaaa 19388754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24443562 - 24443349
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | || || ||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24443562 acataggtatgaatattaggagtaatatttatactagattaacccaccgtgagagtactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagttattctcac 24443466  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
     |||||| ||||||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||  |||||| || |||| |  |||||||| |    |||||||||||||  |||||| |    
T  24443465 agtgataatggtgtataacactcttagacttgaaaccattatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgttattcaaacgttgtgtgtaacagg 24443367  T
Q  244 atgactataaagttggtt 261  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  24443366 atgaccataacgttggtt 24443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 271
Target Start/End: Original strand, 39112138 - 39112274
Alignment:
Q  135 tattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtc 234  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||| |  |||  |||||   | |||||||||||||    
T  39112138 tattctcttagtgatagtggtgtattccattattcaacatgaaatcactatgtactctagatgtaggaatcaagtattttgttgtcgttcaaacgttgtc 39112237  T
Q  235 cgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39112238 tgtaataaggtgactataaagttggttgataggtact 39112274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 10235377 - 10235474
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||||||  | ||||||||||  |||||||    
T  10235377 cacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatgagaattatacatag 10235474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7662651 - 7662569
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaat 99  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  7662651 atcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaat 7662569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 19859177 - 19859221
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 76  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859177 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttata 19859221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22948574 - 22948499
Alignment:
Q  134 atattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagt 209  Q
    |||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22948574 atattctcgtagtaatagtcgtgtatgccacccttcgacatgaaaccgctatgtaccttagatgtaggagttgagt 22948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 29983184 - 29983234
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggag 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  29983184 gatcatggataaagagttaacaaattttcacatatgtataaatattaggag 29983234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 47833945 - 47833899
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 61  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47833945 gatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatatta 47833899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 3132910 - 3132986
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagt 109  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  3132910 tatcaagtcttcacatatgtataattattatgt-taatatttatattggattgacctgtcataagaatactacatagt 3132986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Original strand, 3587978 - 3588039
Alignment:
Q  46 atagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacata 107  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  3587978 ataggtataaatgttaggggtaatattgatactggattgacccaacgtgagaatactacata 3588039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 77
Target Start/End: Original strand, 39112033 - 39112093
Alignment:
Q  17 tcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatac 77  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  39112033 tcatggataaagagttacaatttcttcatatatacataaatattaggagtattatttatac 39112093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18503 - 18774
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18503 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 18602  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18603 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 18702  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18703 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgat-ggtactccatgaatcatg 18774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21330240 - 21329968
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330240 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagta 21330141  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21330140 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 21330041  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  21330040 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagtaggttgatggggactccatgaatcatg 21329968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18796721 - 18796993
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18796721 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagta 18796820  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  18796821 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgatggtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtg 18796920  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  18796921 ctttgtcaccattcaaacgttgtacgtaacaggatgactataaagtttgttgatgggtacaccatgaatcatg 18796993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Original strand, 18620023 - 18620296
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18620023 gatcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaag 18620122  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgcttt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  18620123 ttatg-aaagtgtcataagatattctcatggtgatattggtgtatcccaccctttgacctgaaaccactatgtaccctaaatgttggagtcgagtgcttt 18620221  T
Q  215 gtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatgatg 289  Q
     |||||||||| |   |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  18620222 atcaccattcacattatgtatgtaacaagatgaccataaagttggttgatgggtactccactaatcatgctgatg 18620296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 271
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978348
Alignment:
Q  12 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || || |  |    
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatgg--a 20978188  T
Q  112 aagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||| ||| ||| | ||||     
T  20978189 aaattatgaaaa-tgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgacatgacactactatgtaccctagatgtaggattcgagta 20978287  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtact 271  Q
    |||||    |||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  20978288 ctttgatgtcatataaacgtagtccgtaacatgataactataaagtcgattgatggatact 20978348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6992094 - 6991847
Alignment:
Q  23 ataaagagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatga 120  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||  |||||     
T  6992094 ataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatattggattgatcctccataagaacgctacatagaaaa--ttatgt 6991997  T
Q  121 aaagtgtcataagatattctcattgtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgc-tttgtca 218  Q
    || ||| |||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| | |||||      
T  6991996 aa-gtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaatcactatgttccctagatgtaggagtcgagtacttttgttt 6991898  T
Q  219 ccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggta 269  Q
    |  || ||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6991897 ctgtttaaacgttgtctatgacacgatgactataaagtcggttgatgggta 6991847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 36270395 - 36270650
Alignment:
Q  25 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaag 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||  ||| ||||| ||||    
T  36270395 aaagagttatcaagttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatag--aaaattatgtaaag 36270492  T
Q  125 tgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccatt 223  Q
     |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  |||| || | ||||||  || |     
T  36270493 -gtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatt-cacccttcgacctaaaaccaccatgcaccctagatgtatgagtcgaatactttgttgccgta 36270590  T
Q  224 caaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  36270591 caaaagtcgttcgtaacaggatgactataaagtcggttgttgggtactcaatgaatcatg 36270650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 18822302 - 18822572
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaag 114  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| |    
T  18822302 gatcattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacata--aaacg 18822399  T
Q  115 ttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctt 213  Q
    ||||| ||||  ||  |||  ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||  ||| |||    
T  18822400 ttatgtaaag-atctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgtaggagtcaagtactt 18822498  T
Q  214 tgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    | |   |||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  18822499 ttttgtcatataaacgtcatccgtaacacaatgactataaagttggttaatgggtacttggcgaatcatgatga 18822572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 30174432 - 30174679
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  30174432 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 30174528  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  30174529 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 30174627  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30174628 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 30174679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22183475 - 22183206
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||       
T  22183475 cacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgacaatgttacata--t 22183379  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagt 209  Q
    || |||||| |||  |||| | |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||| || | ||| ||||| ||||    
T  22183378 aatgttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgtaggagtcgagt 22183280  T
Q  210 gctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
     ||||||     | ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  22183279 actttgttgttgtacaaacgttgtttgtaacaggatgactataaagtcgattgatgggtatttgatgaatcatg 22183206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24250279 - 24250032
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  24250279 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 24250183  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  |||| |||||  |||||| ||||||    
T  24250182 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgttttgttgccattctaacgtt 24250084  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24250083 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 24250032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24229450 - 24229215
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  24229450 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcataagatattctcac 24229354  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| | | ||||| |||||||  |||||| || | || |  ||||||||||   ||||| ||||||||| |||| | |    
T  24229353 aatgataatagtgtatatcgctcttagccttgaaaccactatgatccctagatg-tagactcaagtgctttgttgtcattctaacgttgtctgtaaaagg 24229255  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24229254 ataaccataacgttggttgaagggtacttgatgaatcatg 24229215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15342237 - 15342098
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||     
T  15342237 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattaacccaccgtgaaaatactacatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatagtctcac 15342141  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
      |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  15342140 aatgatagtggtgtatgccactcttagacctgaaaccactatg 15342098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 285
Target Start/End: Original strand, 29800545 - 29800775
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| | | ||||||||||    ||||    
T  29800545 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttat-aaaagtgtaacatgatattctcacaaggata 29800641  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgacta 250  Q
     |||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||  |||||| || |||| |  |||||||| |   ||||||||| ||||| |||||| ||| |  |    
T  29800642 atggtgtataccactcttagacttgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttattgtcattcaaacattgtctgtaacaggataatca 29800740  T
Q  251 taaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgat 285  Q
    ||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  29800741 taatgttggttaatgggcacttgacgaatcatgat 29800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 108
Target Start/End: Original strand, 19279508 - 19279600
Alignment:
Q  16 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatag 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  19279508 atcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagatatttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatag 19279600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 283
Target Start/End: Original strand, 17241034 - 17241196
Alignment:
Q  120 aaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcac 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||| |||||  ||| |||| ||||    
T  17241034 aaaagtgtaataagatattctcatagtgataatggtgtatttca-ccttcgacctaaaaccactatgtactgtagatgtaggagtcaagtactttatcac 17241132  T
Q  220 cattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |  |||||||||||  |||||| || | ||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||||    
T  17241133 cgctcaaacgttgtgtgtaacatgaagcctataaaatcggtagatatgtacttcatgaaacatg 17241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18852047 - 18851956
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacat 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||| |||||    
T  18852047 gatcatgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattgactcgctataagaatattacat 18851956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 19616509 - 19616641
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||    
T  19616509 tataaatattaggagtaacatttattctgaattgacccaccgtgagaatactacatagt--attttatgaaaa-tgtcatatgatattctcacagtgata 19616605  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
     | ||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  19616606 atagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 19616641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40301164 - 40301034
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40301164 tatacatattagaagtaatatttataccagattgacccaccatgagaatactacata--acatgttatg--aagtgtcataagatagtctcatagtgata 40301069  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactat 185  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  40301068 atgatgtataccactcttagacatgaaaccactat 40301034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Original strand, 21626824 - 21626955
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||   ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21626824 tataaataatatgagtaatatttatattgaattga-ccaccatgagaatactacacgctat--gttatgaaa-gtgtcataagatattctcatagtgata 21626919  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
     | |||| | ||||  || |||||||||||||||||    
T  21626920 atagtgtctaccactgttagacctgaaatcactatg 21626955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41316506 - 41316280
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagt 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || || || ||||||||||| || |||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||      
T  41316506 taaatattatgagtaatatttatacttaatcgacccaccatgagaatattatatagt--atgttatg-aaagtgtcataagatattctcatactgataac 41316410  T
Q  153 ggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactata 252  Q
    || | || |||  ||| ||||||||  |||||||  |||||| || |||| || || ||||| |   |||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  41316409 ggagaataccattcttagacctgaatccactatgatccctagatg-tggacttaagggctttattgtcattcaaacgttatctgtaacaggataactata 41316311  T
Q  253 aagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||| ||  |||| | || ||||||||||    
T  41316310 aagttgattattgggcaattgatgaatcatg 41316280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 41661694 - 41661761
Alignment:
Q  216 tcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41661694 tcaccattcaaacgttgtctataataagatgatcataaagttggttgatgggtactccatgaaacatg 41661761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28719006 - 28718943
Alignment:
Q  47 tagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  | ||||||||||||| ||||    
T  28719006 tagatataaatattaggagtaatatttatacttgattgactcatcgtgagaatactacacagta 28718943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 287
Target Start/End: Original strand, 12298236 - 12298293
Alignment:
Q  230 ttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12298236 ttgttcgtaacaagatgactataaagtcagttgataggtacttcacaaatcatgatga 12298293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24763792 - 24763751
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24763792 acataggtataaatattatgagtaatatttatactggattga 24763751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28741261 - 28741220
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattga 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28741261 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattga 28741220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36801974 - 36801899
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaggagtaatatttatactggattga 85  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  36801974 cacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattgaattga 36801899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1461
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1208 cacagatcatggataaaaagttatcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagta 1307  T
Q  111 aaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtg 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1308 aaagttatgaaaagtatcataagatattctcatagtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcgagtg 1407  T
Q  211 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  1408 ctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggataaatataaagttggttgat 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 230367 - 230111
Alignment:
Q  27 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230367 agagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtg 230268  T
Q  127 tcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaa 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  230267 tcataagatattctcatagtgatagtggtgtattctacccttcgacctgaaaccattatgtaccctagatgttggagtcgagtgctttgtcactattcaa 230168  T
Q  227 acgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  230167 acgttgtctgtaacaagatgacaataaagttggttggtggatacaccatgaatcatg 230111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 5744 - 6013
Alignment:
Q  11 cacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagta 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5744 cacaggtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaatactacatagta 5843  T
Q  111 aaagttatg-aaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattcca-cccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgag 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||         | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  5844 aaagttatgaaaaagtgtcataagatattctca---------tagtgcattccatcctttcgacatgaaaccactatgtaccctagatgttggagtcaag 5934  T
Q  209 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatgatga 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5935 tgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaggatgactataaagttggttgatgggtactccatcaatcatgatga 6013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13184 - 12949
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13184 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcat 13088  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| | |    
T  13087 aatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaattgctttgttgccattctaacgttgtttgtaaaagg 12989  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12988 ataaccataaagttggttgatgggtacttgatcaatcatg 12949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 238 - 485
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  238 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 334  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  335 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 433  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  434 gtctgtaaaaggataatcataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3922 - 3675
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  3922 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 3826  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  3825 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 3727  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3726 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 283
Target Start/End: Original strand, 119785 - 120032
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  119785 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 119881  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  | |||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  119882 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatctctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 119980  T
Q  232 gtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    ||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  119981 gtctgtaaaaggataacaataacgttggttgatgggcacttgatgaatcatg 120032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67374
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-agattgtcatgagatattctcac 67513  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      ||||| | ||||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | |    
T  67512 aatgataatagtgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaagg 67414  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  67413 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 67374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 8360 - 8467
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  8360 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 8456  T
Q  132 agatattctca 142  Q
    |||||||||||    
T  8457 agatattctca 8467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 26609 - 26748
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26609 acataggtataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccttgagaatactatatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 26705  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatg 186  Q
     |||||| | ||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  26706 agtgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactatg 26748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 130471 - 130268
Alignment:
Q  32 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  130471 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccactgtgagaatactacatagt--aagttatg-aaattgtcata 130375  T
Q  132 agatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgtt 231  Q
    |||||||||||   ||||| |  |||||  | | ||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||| |  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  130374 agatattctcacaatgataataatgtatatcgctcttagacctgaaaccactatgatccctagatg-tggactcaagtgctttgttgccattctaacgtt 130276  T
Q  232 gtccgtaa 239  Q
    ||| ||||    
T  130275 gtctgtaa 130268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40223 - 40111
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40223 acataggtataaatattaggagtaatatttataccggattgacccactgtgagaatactacatagt--atgttatgaaaa-tgtcataagatattctcac 40127  T
Q  144 tgtgatagtggtgtat 159  Q
     |||||| ||||||||    
T  40126 agtgataatggtgtat 40111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 8807 - 8929
Alignment:
Q  53 taaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8807 taaatattaggagtaatatttatactagattgacccccaatgagaatactacttagt--atgttatgaaga-tgtcataagatattctcatagtgataat 8903  T
Q  153 ggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
    ||||||| |||| | | |||||||||    
T  8904 ggtgtataccactcctagacctgaaa 8929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 83243 - 83119
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgata 150  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  | |||| | || ||||||||||||||| |||| || |||    
T  83243 tataaatatcagaagtaatatttatactggattgacccacaatgagaatactacatagt--atgttacg-aaggtgtcataagatattatcatagtcata 83147  T
Q  151 gtggtgtattccacccttcgacctgaaa 178  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  83146 ttggtgtactccactcttagacctgaaa 83119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 53832 - 54066
Alignment:
Q  44 acatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 143  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || || |||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  53832 acataggtataaatattaagagtaatattcacactgggttgacccaccgtgagaatactacatagt--atgttatg-aaattgtcataagatattctcaa 53928  T
Q  144 tgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaag 243  Q
      || || | || |||    | ||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |  |||||||| |  |||||| ||||||||  |||| | |    
T  53929 catgttaatagtttatattgctcttagacctgaaaccactatgatccctaggtg-tggactcaagtgctttat-gccattctaacgttgtatgtaaaagg 54026  T
Q  244 atgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54027 ataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 54066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 283
Target Start/End: Original strand, 102 - 288
Alignment:
Q  93 tgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccct 192  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||  ||| ||| ||||||||| |||| ||  ||||    
T  102 tgagaatactacatagtaa--gttatgaaat-tgtcataagatattctcacaatgataatagtgtatatcactcttagacctgaaaccactctgatccct 198  T
Q  193 aggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatgactataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    || ||| ||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||  |||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  199 agatgt-ggactcaagtactttgttgccattctaacgttgtatgtaaaaggataaccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11758 - 11526
Alignment:
Q  51 tataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatg---aaaagtgtcataagatattctcattgtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||  | ||||||     || ||||||||||||||||||   ||    
T  11758 tataaatattaggagtaatatttatactggatagacccactgtgagaatactacatagt--acgttatgtgattaattgtcataagatattctcacaatg 11661  T
Q  148 atagtggtgtattccacccttcgacctgaaatcactatgtaccctaggtgttggagttgagtgctttgtcaccattcaaacgttgtccgtaacaagatga 247  Q
    |||   |||||   | | ||| ||||||||| |||| ||  |||||| || |||| |  ||| ||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||| |    
T  11660 ataacagtgtacatcgctcttagacctgaaaccactttgatccctagatg-tggactcaagtactttgtttccattctaacgttgtctgtaaaaggataa 11562  T
Q  248 ctataaagttggttgatgggtacttcatgaatcatg 283  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11561 ccataacgttggttgatgggtacttgatgaatcatg 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 90093 - 90019
Alignment:
Q  25 aaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaat 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  90093 aaagagttatcaacacttcacatagatataaatattacgtataacatttatattggattgacacgcgatgagaat 90019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Original strand, 45956 - 46051
Alignment:
Q  15 gatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataa----atattaggagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacat 106  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||| || ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  45956 gatcatggataaaaagttgtcaaatattcatatagatataaatatatattatgagtaatatttatattgaattgacccaccattagaatgctacat 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 159
Target Start/End: Original strand, 11328 - 11421
Alignment:
Q  63 gagtaatatttatactggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcattgtgatagtggtgtat 159  Q
    |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||    
T  11328 gagtaatatttatgatggatttacccaccatgagaatactacatagt--atgttatgaaga-tgttataagttattctaatagtgataatggtgtat 11421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University