View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20712_high_28 (Length: 261)

Name: NF20712_high_28
Description: NF20712
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20712_high_28
NF20712_high_28
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (5-235)||(34006681-34006910)
chr8 (5-235)||(22180613-22180855)
chr8 (5-235)||(9068075-9068317)
chr8 (5-235)||(16580097-16580339)
chr8 (5-235)||(3298814-3299055)
chr8 (5-235)||(8743191-8743433)
chr8 (5-235)||(11308895-11309137)
chr8 (5-235)||(28370105-28370347)
chr8 (5-235)||(28926051-28926293)
chr8 (5-232)||(4861859-4862097)
chr8 (5-235)||(41577239-41577481)
chr8 (5-235)||(27348038-27348280)
chr8 (1-233)||(12538171-12538415)
chr8 (36-229)||(24040734-24040937)
chr8 (5-226)||(13509984-13510217)
chr8 (5-226)||(13599514-13599747)
chr8 (5-233)||(22243151-22243392)
chr8 (5-235)||(16958562-16958805)
chr8 (5-235)||(22233759-22234000)
chr8 (68-234)||(17992907-17993085)
chr8 (5-235)||(22222584-22222816)
chr8 (5-235)||(22228926-22229158)
chr8 (27-168)||(1607375-1607517)
chr8 (163-208)||(21692206-21692250)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (5-235)||(6172539-6172769)
chr7 (5-235)||(10346213-10346455)
chr7 (5-235)||(12190855-12191096)
chr7 (4-235)||(45500618-45500860)
chr7 (5-235)||(12183878-12184119)
chr7 (5-235)||(31664403-31664644)
chr7 (5-235)||(31158184-31158426)
chr7 (5-234)||(22818425-22818665)
chr7 (5-235)||(8107796-8108038)
chr7 (5-235)||(12090368-12090610)
chr7 (5-235)||(22321709-22321950)
chr7 (1-233)||(2797467-2797711)
chr7 (5-235)||(2631408-2631650)
chr7 (5-235)||(23795106-23795348)
chr7 (5-235)||(31878613-31878853)
chr7 (23-235)||(1953969-1954192)
chr7 (5-170)||(19472098-19472263)
chr7 (5-235)||(22909130-22909371)
chr7 (28-235)||(2477670-2477890)
chr7 (5-232)||(3544787-3545027)
chr7 (5-226)||(1274608-1274841)
chr7 (5-235)||(24482756-24483000)
chr7 (109-235)||(19472276-19472413)
chr7 (27-168)||(29032713-29032856)
chr7 (183-235)||(33160194-33160246)
chr7 (124-226)||(19063534-19063647)
chr7 (186-226)||(29032885-29032925)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (4-235)||(46691944-46692186)
chr4 (5-235)||(5273470-5273701)
chr4 (1-233)||(40995451-40995697)
chr4 (5-235)||(52618526-52618756)
chr4 (5-235)||(4839044-4839286)
chr4 (5-235)||(26069737-26069981)
chr4 (5-228)||(35416604-35416826)
chr4 (8-235)||(19247739-19247977)
chr4 (5-235)||(323450-323692)
chr4 (4-235)||(26373538-26373779)
chr4 (5-235)||(42532795-42533037)
chr4 (5-235)||(22047693-22047935)
chr4 (5-235)||(1187977-1188218)
chr4 (1-170)||(21677571-21677741)
chr4 (5-170)||(55326864-55327030)
chr4 (27-234)||(33110632-33110852)
chr4 (5-235)||(30218295-30218541)
chr4 (4-235)||(20948757-20949001)
chr4 (5-170)||(53895467-53895631)
chr4 (103-235)||(44432060-44432203)
chr4 (65-157)||(6640078-6640170)
chr4 (181-229)||(53895397-53895445)
chr4 (181-235)||(21677763-21677817)
chr4 (163-208)||(9417515-9417559)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (4-235)||(41000011-41000253)
chr1 (5-235)||(38121840-38122082)
chr1 (5-234)||(9667604-9667844)
chr1 (5-235)||(12168124-12168366)
chr1 (5-235)||(39001089-39001331)
chr1 (5-234)||(432249-432489)
chr1 (5-235)||(11738706-11738947)
chr1 (21-232)||(16832707-16832929)
chr1 (5-235)||(33492106-33492348)
chr1 (5-235)||(44505176-44505420)
chr1 (5-232)||(49249087-49249318)
chr1 (31-235)||(13217980-13218195)
chr1 (69-235)||(16129671-16129848)
chr1 (1-235)||(8996166-8996411)
chr1 (69-228)||(16130232-16130402)
chr1 (5-168)||(36083848-36084011)
chr1 (26-145)||(9268748-9268868)
chr1 (31-168)||(13830377-13830515)
chr1 (27-166)||(39454195-39454338)
chr1 (65-170)||(15161190-15161296)
chr1 (21-73)||(15161612-15161664)
chr1 (18-61)||(16130711-16130754)
chr1 (163-208)||(7612368-7612412)
chr1 (18-61)||(16130161-16130203)
chr1 (27-129)||(6244330-6244427)
chr1 (180-225)||(15161124-15161169)
chr1 (26-95)||(30660313-30660382)
chr1 (186-235)||(36080232-36080280)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (5-234)||(43991544-43991778)
chr2 (1-235)||(36667773-36668019)
chr2 (19-235)||(36040185-36040412)
chr2 (5-235)||(29223727-29223968)
chr2 (5-235)||(29337026-29337267)
chr2 (4-235)||(32522941-32523183)
chr2 (4-235)||(13230249-13230491)
chr2 (5-235)||(23924940-23925181)
chr2 (5-170)||(27257473-27257638)
chr2 (65-235)||(42702175-42702356)
chr2 (27-235)||(28457806-28458027)
chr2 (5-235)||(14700653-14700896)
chr2 (5-170)||(21160053-21160219)
chr2 (83-235)||(5784511-5784674)
chr2 (41-235)||(36557465-36557672)
chr2 (5-170)||(9787013-9787180)
chr2 (21-235)||(24663054-24663281)
chr2 (1-117)||(41977736-41977852)
chr2 (180-235)||(8687768-8687823)
chr2 (5-73)||(42700881-42700949)
chr2 (49-104)||(11651893-11651948)
chr2 (163-208)||(31758313-31758357)
chr2 (186-226)||(492759-492799)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (5-235)||(27167006-27167247)
chr5 (5-235)||(11723184-11723426)
chr5 (5-235)||(11766767-11767008)
chr5 (5-235)||(7314977-7315219)
chr5 (5-235)||(9404436-9404678)
chr5 (5-235)||(16904517-16904759)
chr5 (5-235)||(34456309-34456551)
chr5 (5-235)||(31845992-31846233)
chr5 (5-235)||(33434615-33434856)
chr5 (5-235)||(30606984-30607226)
chr5 (5-233)||(24835749-24835989)
chr5 (1-233)||(34869650-34869894)
chr5 (7-229)||(6269908-6270141)
chr5 (5-235)||(14344481-14344715)
chr5 (9-170)||(37251817-37251979)
chr5 (5-104)||(7315358-7315458)
chr5 (21-168)||(39655961-39656110)
chr5 (165-235)||(32226845-32226914)
chr5 (186-226)||(37252005-37252045)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (5-234)||(20837107-20837347)
chr3 (5-235)||(9989408-9989649)
chr3 (5-235)||(27850459-27850700)
chr3 (5-235)||(37471595-37471836)
chr3 (5-235)||(3588412-3588654)
chr3 (5-235)||(8615515-8615757)
chr3 (5-232)||(22097682-22097920)
chr3 (5-235)||(45527659-45527901)
chr3 (5-235)||(48168102-48168343)
chr3 (5-235)||(7653130-7653372)
chr3 (5-235)||(10385978-10386220)
chr3 (5-235)||(36469344-36469585)
chr3 (5-235)||(52307993-52308235)
chr3 (5-220)||(4742911-4743135)
chr3 (5-235)||(26335129-26335361)
chr3 (33-235)||(23385408-23385622)
chr3 (1-170)||(1232395-1232565)
chr3 (83-235)||(27030670-27030833)
chr3 (32-235)||(33248000-33248216)
chr3 (5-234)||(23193936-23194173)
chr3 (1-168)||(49434186-49434354)
chr3 (5-226)||(2357181-2357415)
chr3 (163-235)||(20963731-20963803)
chr3 (5-80)||(37022867-37022942)
chr3 (65-103)||(20963676-20963714)
chr3 (5-41)||(20963164-20963200)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (5-235)||(28807-29049)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (5-235)||(3539059-3539301)
chr6 (5-235)||(26515336-26515578)
chr6 (5-235)||(34006514-34006756)
chr6 (5-235)||(24161164-24161405)
chr6 (5-235)||(32806671-32806912)
chr6 (5-233)||(9932713-9932953)
chr6 (5-235)||(21596436-21596681)
chr6 (5-235)||(5988910-5989152)
chr6 (6-233)||(24878879-24879118)
chr6 (83-235)||(14479572-14479735)
chr6 (5-235)||(21631192-21631436)
chr6 (5-235)||(14270684-14270926)
chr6 (5-170)||(13173732-13173890)
chr6 (5-170)||(13182265-13182423)
chr6 (5-235)||(25976962-25977203)
chr6 (5-235)||(1454808-1455050)
chr6 (5-235)||(1466500-1466742)
chr6 (5-235)||(32821814-32822053)
chr6 (5-143)||(34913803-34913942)
chr6 (21-168)||(15642506-15642655)
chr6 (21-235)||(26604351-26604577)
chr6 (165-235)||(26510392-26510462)
chr6 (21-168)||(9518367-9518516)
chr6 (9-82)||(16698086-16698159)
chr6 (54-138)||(6868010-6868095)
chr6 (163-235)||(34913461-34913532)
chr6 (27-102)||(25541255-25541330)
chr6 (180-226)||(15642437-15642483)
chr6 (163-208)||(14354991-14355035)
chr6 (186-226)||(13173917-13173957)
chr6 (186-226)||(13182450-13182490)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (5-234)||(8755-8996)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (5-234)||(6745-6985)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (5-235)||(25558-25800)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (5-235)||(116476-116717)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (5-235)||(76360-76601)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (5-235)||(12112-12351)
scaffold0298 (5-235)||(15882-16121)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (5-235)||(12207-12448)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (84-235)||(1576-1738)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (5-226)||(892-1125)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (5-116)||(7205-7316)
scaffold0447 (5-116)||(11819-11930)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (5-116)||(9814-9925)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (5-168)||(14274-14438)
scaffold0091 (186-235)||(14197-14245)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (27-232)||(16402-16620)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (18-107)||(12401-12491)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (27-168)||(35212-35355)
scaffold0160 (186-235)||(35384-35432)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (27-166)||(9380-9523)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (134-235)||(8-120)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 34006681 - 34006910
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34006681 aatctcaataa-acaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 34006779  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatc 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34006780 atacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatc 34006879  T
Q  205 ttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34006880 ttggctttaatctactcctaactaccttgct 34006910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22180855 - 22180613
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22180855 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 22180756  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22180755 atacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatg 22180656  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22180655 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 22180613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 9068075 - 9068317
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9068075 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 9068174  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9068175 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 9068274  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9068275 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 9068317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16580339 - 16580097
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16580339 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 16580240  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16580239 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 16580140  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16580139 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 16580097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3299055 - 3298814
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3299055 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 3298956  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3298955 atacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaatggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgt 3298856  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3298855 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 3298814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 8743191 - 8743433
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8743191 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 8743290  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8743291 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 8743390  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743391 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 8743433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 11308895 - 11309137
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11308895 aatctcaataaaacagtaaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 11308994  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatga-----------agattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||| ||||||||||||||||||    
T  11308995 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatg 11309094  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11309095 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 11309137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28370347 - 28370105
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28370347 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 28370248  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28370247 aatacctcaaaactacaagagtaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 28370148  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28370147 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 28370105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 28926051 - 28926293
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28926051 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttg 28926150  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28926151 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 28926250  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28926251 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 28926293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 4861859 - 4862097
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4861859 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 4861958  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4861959 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgt 4862058  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 232  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4862059 ctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaactacctt 4862097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 41577239 - 41577481
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41577239 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 41577338  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41577339 aatacctcaaagctacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 41577438  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577439 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 41577481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27348280 - 27348038
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27348280 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttg 27348181  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27348180 aatacctcaagactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 27348081  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348080 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 27348038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12538415 - 12538171
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12538415 tttaaatctcaataaaataataaaatcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgt 12538316  T
Q  101 ttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaa-----------ggatgaagattcaatgacaagatccat 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||    
T  12538315 ttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtacctacatatgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcat 12538216  T
Q  189 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12538215 gatgtctcaacaaatcatagcttgaatctaatcctaactaccttg 12538171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24040937 - 24040734
Alignment:
Q  36 caacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24040937 caacaatattgaataaatagctaaaaccatatattaaat-atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccataagagtagatatagct 24040839  T
Q  136 acatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactccta 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24040838 acatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttcta 24040739  T
Q  225 actac 229  Q
    |||||    
T  24040738 actac 24040734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13510217 - 13509984
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  13510217 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttga 13510118  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13510117 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatg 13510018  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  13510017 tctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaac 13509984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13599747 - 13599514
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  13599747 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttga 13599648  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13599647 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatg 13599548  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  13599547 tctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaac 13599514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 22243151 - 22243392
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| | ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  22243151 aatctcaataaaacatttaattcaagaataacaataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttg 22243250  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22243251 aatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgat 22243350  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22243351 gtctcaacaaatcttgggttgaatctacttctaactaccttg 22243392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16958805 - 16958562
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  16958805 aatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatagtgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttg 16958706  T
Q  104 aatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||| | |||  ||||||    
T  16958705 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgat 16958606  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16958605 gtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgct 16958562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 22233759 - 22234000
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  22233759 aatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaacagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttga 22233858  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  22233859 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatg 22233958  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  22233959 tctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgct 22234000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17992907
Alignment:
Q  68 attaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 17992986  T
Q  167 -----------aagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
               ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17992985 aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactcttaactaccttgc 17992907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 22222584 - 22222816
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||           ||| ||||||||| | ||||||||    
T  22222584 aatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttga 22222672  T
Q  105 atacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-------------gatgaagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  22222673 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatga 22222772  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  22222773 tgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgct 22222816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 22228926 - 22229158
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||           ||| ||||||||| | ||||||||    
T  22228926 aatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttga 22229014  T
Q  105 atacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-------------gatgaagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  22229015 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatga 22229114  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  22229115 tgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgct 22229158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1607517 - 1607375
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagag 124  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1607517 caagaataataacaatatttaataaataaggtagaaccatatattaaataaataaa-gattacataatagtttgtttgaatacctcaaaatccacaaggg 1607419  T
Q  125 tagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1607418 tagatgtagctacatatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaa 1607375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21692250 - 21692206
Alignment:
Q  163 gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgg 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21692250 gatgaagattca-tgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgg 21692206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6172769 - 6172539
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6172769 aatctcaataaaacaataaacgcaagaataacagcaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 6172670  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatc 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6172669 atacctcaaaactacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaggatctatgatgtctcaacaaatc 6172570  T
Q  205 ttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6172569 ttggcttgaatctactcctaactaccttgct 6172539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 10346213 - 10346455
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10346213 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 10346312  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10346313 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 10346412  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10346413 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 10346455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12191096 - 12190855
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12191096 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatatccagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 12190997  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12190996 atacctcaaaaccacaagagtagatgtaaatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 12190897  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12190896 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 12190855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 45500618 - 45500860
Alignment:
Q  4 aaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  45500618 aaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataactataaccatatattaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttg 45500717  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |           |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45500718 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctgtgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatg 45500817  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45500818 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcataactaccttgct 45500860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12184119 - 12183878
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12184119 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaacaaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 12184020  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12184019 atacctcaaaaccacaaaagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgt 12183920  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12183919 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 12183878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 31664403 - 31664644
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  31664403 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcctgttcga 31664502  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31664503 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 31664602  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664603 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 31664644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 31158184 - 31158426
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31158184 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttg 31158283  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31158284 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatccatgatg 31158383  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31158384 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 31158426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22818665 - 22818425
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22818665 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttga 22818566  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22818565 atacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgt 22818466  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22818465 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 22818425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 8107796 - 8108038
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8107796 aatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 8107895  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8107896 aatacctcaaaattacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 8107995  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8107996 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 8108038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 12090368 - 12090610
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaa-tattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  12090368 aatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttg 12090467  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12090468 aatacctcaaaaccacaagattagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatg 12090567  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12090568 tctcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactaccttgct 12090610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 22321709 - 22321950
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22321709 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatat-gaataaataagctagaaccatatattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttg 22321807  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22321808 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatg 22321907  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22321908 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaacttgct 22321950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 2797467 - 2797711
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2797467 tttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgt 2797566  T
Q  101 ttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccat 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||| |||    
T  2797567 ttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcat 2797666  T
Q  189 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2797667 gatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttg 2797711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2631650 - 2631408
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2631650 aatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaataatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 2631551  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2631550 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 2631451  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2631450 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 2631408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23795348 - 23795106
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23795348 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 23795249  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23795248 aatacctcaaaactacaagagtagatggagctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 23795149  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23795148 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 23795106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31878853 - 31878613
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31878853 aatctcaataaaacattaactgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 31878754  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga----------tgaagattcaatgacaagatccatgatgtc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||          ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31878753 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctttgatagttttgcaaaggatgaaaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtc 31878654  T
Q  195 tcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31878653 tcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgct 31878613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1954192 - 1953969
Alignment:
Q  23 aaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaag 122  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  1954192 aaagcaataaaagcaagaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaaccacaat 1954093  T
Q  123 agtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctt 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1954092 agtagatatagctacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggctt 1953993  T
Q  212 gaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  1953992 gaatctactcctaactacattgct 1953969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 19472098 - 19472263
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19472098 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 19472197  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19472198 atacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaaga 19472263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22909371 - 22909130
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  22909371 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatatatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttga 22909272  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22909271 atacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatg 22909172  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22909171 tctcaacaaatcttagattgaatctactcctaac-accttgct 22909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2477890 - 2477670
Alignment:
Q  28 aagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2477890 aagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggt 2477791  T
Q  126 agatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaa 214  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2477790 agatggagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaa 2477691  T
Q  215 tctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2477690 tctactcctaactaccttgct 2477670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 3544787 - 3545027
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  3544787 aatctcaataaaacattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttg 3544886  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||| | |||||||||||    
T  3544887 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgat 3544986  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3544987 gtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactacctt 3545027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1274841 - 1274608
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  1274841 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttga 1274742  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||||||||| | ||||||||||||    
T  1274741 atacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatg 1274642  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  1274641 tctcaacaaatcttgagttaaatctactcataac 1274608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24483000 - 24482756
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatag-ctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24483000 aatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataaactagaaccatattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttg 24482901  T
Q  104 aatacctc--aaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    ||||||||  ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24482900 aatacctctaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatga 24482801  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||    
T  24482800 tgtctcaacaaatcttgggtttgatctactcataactcccttgct 24482756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Original strand, 19472276 - 19472413
Alignment:
Q  109 ctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctca 197  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19472276 ctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctca 19472375  T
Q  198 acaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472376 acaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 19472413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Original strand, 29032713 - 29032856
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||      
T  29032713 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggt 29032812  T
Q  125 tagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    ||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  29032813 tagatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaatgatgaa 29032856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33160246 - 33160194
Alignment:
Q  183 atccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33160246 atccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 33160194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19063647 - 19063534
Alignment:
Q  124 gtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  19063647 gtagatataactacatatgtctatgatagctttacatagaatgaagaagagatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaattttaggttg 19063548  T
Q  213 aatctactcctaac 226  Q
    ||||||||||||||    
T  19063547 aatctactcctaac 19063534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 29032885 - 29032925
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  29032885 catgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactcctaac 29032925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 46691944 - 46692186
Alignment:
Q  4 aaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46691944 aaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttg 46692043  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46692044 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatg 46692143  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46692144 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 46692186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 5273470 - 5273701
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5273470 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 5273569  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaat 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273570 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaatccatgacaagatccatgatgtctcaacaaat 5273669  T
Q  204 cttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273670 cttggcttgaatctactcctaactaccttgct 5273701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 40995451 - 40995697
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatatt---aaatgatcaaaagattacataatagtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| |    
T  40995451 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattattaaatgatcaaaagattacataatagct 40995550  T
Q  98 tgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatcc 186  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||    
T  40995551 tttttgaatacctcaaaaccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatcc 40995650  T
Q  187 atgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40995651 atgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 40995697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52618756 - 52618526
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52618756 aatctcaataaatcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 52618657  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatc 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  52618656 atacctcaaaaccacaatagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatc 52618557  T
Q  205 ttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52618556 ttgggttgaatctactcctaactaccttgct 52618526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 4839044 - 4839286
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4839044 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 4839143  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4839144 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 4839243  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4839244 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 4839286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26069981 - 26069737
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26069981 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 26069882  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagata--taactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  26069881 atacctcaaaatccacaagggtagatatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatga 26069782  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26069781 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttctaactaccttgct 26069737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 35416604 - 35416826
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35416604 aatctcaataaaacaataaaagcaagaatatcaataatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtt-ga 35416702  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatc 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35416703 atacatcaaaaccacaagagtagatgtaactacatatgtctatgatagttgtgcaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatc 35416802  T
Q  205 ttggcttgaatctactcctaacta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  35416803 ttggcttgaatctactcctaacta 35416826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 19247739 - 19247977
Alignment:
Q  8 ctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaata 107  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19247739 ctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaata 19247838  T
Q  108 cctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctc 196  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19247839 cctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctc 19247938  T
Q  197 aacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19247939 aacaaatattggtttgaatctactcccaactaccttgct 19247977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 323692 - 323450
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  323692 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 323593  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  323592 aatacatcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 323493  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  323492 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgct 323450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 26373538 - 26373779
Alignment:
Q  4 aaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26373538 aaatctcaataaaaca-taaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 26373636  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26373637 aatacctcaaaaccacatgaggtgatatagctatatatgtctatgatagctttgcaaaggataaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgata 26373736  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26373737 tctcaacaaatattggcttgaatctactcctaactaccttgct 26373779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 42532795 - 42533037
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacg-atatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42532795 aatcttaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 42532894  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  42532895 aatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacg 42532994  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42532995 tctcaacaaatctaggcttgaatctactcctaaccaccttgct 42533037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22047935 - 22047693
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22047935 aatctcaataaaacaataaaaacaaaaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 22047836  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||| |||    
T  22047835 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatg 22047736  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22047735 tctcaacaaatcttggcttgaatcttctcctaactaccttgct 22047693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1188218 - 1187977
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1188218 aatctcaataaaacattaaattcaataataacaacaatattaaataaataactagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 1188119  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  1188118 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgcctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgt 1188019  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1188018 ctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaactaccttgct 1187977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 21677571 - 21677741
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttg 99  Q
    ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21677571 tttaaatctcaatcaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagtttg 21677670  T
Q  100 tttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677671 tttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 21677741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 55327030 - 55326864
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  55327030 aatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttg 55326931  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  55326930 aatacctcaaaaccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttggaatggatgaaga 55326864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 33110632 - 33110852
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc-acaagag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  33110632 caagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaaggg 33110731  T
Q  125 tagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 213  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||   ||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33110732 tatatataactacatatgtctacgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttga 33110831  T
Q  214 atctactcctaactaccttgc 234  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  33110832 atctactcttaactaccttgc 33110852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 30218295 - 30218541
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata----gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  30218295 aatctcaataaagcattaaatacaagaatagcaacaatattgaataaataataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgt 30218394  T
Q  101 ttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccat 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||| ||| | |||  |||    
T  30218395 ttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcat 30218494  T
Q  189 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30218495 gacgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgct 30218541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20949001 - 20948757
Alignment:
Q  4 aaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgttt 102  Q
    ||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20949001 aaatctcaataaagctataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaagagtttacataatagcttgttt 20948902  T
Q  103 gaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| | |||||||||||  |||||           ||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  20948901 gaatacctcaaaacccacaaggatagatgtagctacatatatttatgatagcttgacaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatga 20948802  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20948801 tgtctcgacaaatcttgggttgaatctacttttaactaccttgct 20948757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53895631 - 53895467
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || || || ||||||||||| |||||||    
T  53895631 aatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa--at-aagagtttacataatagcttgtttg 53895535  T
Q  104 aatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53895534 aatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 53895467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 235
Target Start/End: Original strand, 44432060 - 44432203
Alignment:
Q  103 gaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||| ||| |||||||||||||    
T  44432060 gaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatgat 44432159  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44432160 gtctcaagaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 44432203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6640170 - 6640078
Alignment:
Q  65 tatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttg 157  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  6640170 tatattaaatgatcaaa-gattccataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgaaagctttg 6640078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53895445 - 53895397
Alignment:
Q  181 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactac 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  53895445 agattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttttaactac 53895397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 21677763 - 21677817
Alignment:
Q  181 agatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  21677763 agattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctattcctaactactttgct 21677817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Original strand, 9417515 - 9417559
Alignment:
Q  163 gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgg 208  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9417515 gatgaagattca-tgaaaagattcatgatgtctcaacaaatcttgg 9417559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 41000011 - 41000253
Alignment:
Q  4 aaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41000011 aaatctcaataaaagaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 41000110  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41000111 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatg 41000210  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41000211 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 41000253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 38121840 - 38122082
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38121840 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 38121939  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38121940 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 38122039  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38122040 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 38122082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 9667604 - 9667844
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9667604 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 9667703  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9667704 atacctcaaaaccacaagaatgtatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 9667803  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9667804 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 9667844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 12168124 - 12168366
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12168124 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 12168223  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12168224 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatg 12168323  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12168324 tctcaacaaatcttggcttgaatctacacctaactaccttgct 12168366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 39001089 - 39001331
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39001089 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 39001188  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39001189 aataccttaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 39001288  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39001289 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 39001331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 432249 - 432489
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  432249 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 432348  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  432349 atacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgt 432448  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  432449 ctcaacaaatcttggcttgagtctactcctaactaccttgc 432489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 11738706 - 11738947
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11738706 aatctcagtaaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttga 11738805  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11738806 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 11738905  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11738906 gtcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactaccttgct 11738947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 16832707 - 16832929
Alignment:
Q  21 taaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccaca 120  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16832707 taaatgcaagaatagcaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccaca 16832806  T
Q  121 agagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggc 209  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832807 agagtagatatagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggc 16832906  T
Q  210 ttgaatctactcctaactacctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16832907 ttgaatctactcctaactacctt 16832929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 33492106 - 33492348
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33492106 aatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 33492205  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33492206 aatacctcagaactacaagagtagatgtggctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 33492305  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33492306 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 33492348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 44505176 - 44505420
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaa-cgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttg-ttt 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  44505176 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacccatatattaaataatcaaaagattacataatagcttgtttt 44505275  T
Q  103 gaatacctc-aaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44505276 gaatacctcaaaaaccacaagtttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatga 44505375  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44505376 tgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactaccttgct 44505420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 49249318 - 49249087
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||        |||||||||||||| |||||||    
T  49249318 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa--------agattacataatagcttgtttg 49249227  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49249226 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 49249127  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49249126 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 49249087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 13217980 - 13218195
Alignment:
Q  31 aataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagata 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13217980 aataacaacaatattgaataaatagctagaaccgtatattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaatgcctcaaaaccacaagagtagatg 13218079  T
Q  131 taactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctac 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13218080 tagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctac 13218179  T
Q  220 tcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13218180 tcctaaccaccttgct 13218195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 69 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16129848 - 16129671
Alignment:
Q  69 ttaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg----- 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         
T  16129848 ttaaatgatcaaaagattacataatagattgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaa 16129749  T
Q  164 ------atgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16129748 gaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgct 16129671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8996166 - 8996411
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||    
T  8996166 tttaaatctcaataaaacattaaatgcaataataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgt 8996265  T
Q  101 ttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccat 188  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | ||||||||    
T  8996266 ttgaatacatcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatccat 8996365  T
Q  189 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8996366 gatgtcgcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgct 8996411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16130402 - 16130232
Alignment:
Q  69 ttaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg----- 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |         
T  16130402 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatcacaagagtagatatagctacatatgtctatgataactttgcaaatgatgaa 16130303  T
Q  164 ------atgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaacta 228  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16130302 gaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaacta 16130232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36084011 - 36083848
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||| | |||||||    
T  36084011 aatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttg 36083913  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  36083912 aatacctcaaaacccacaag-gtagatgtaactacatatgtctatgcaagcttgacaaaggatgaa 36083848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9268868 - 9268748
Alignment:
Q  26 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagag 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  9268868 gcaagaataataacaatattgaataaatagctagaaacatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaaggg 9268769  T
Q  125 tagatataactacatatgtct 145  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  9268768 tagatgtagctacatatgtct 9268748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13830515 - 13830377
Alignment:
Q  31 aataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtaga 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  13830515 aataataacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaagtaat-acataatagcttgtttgaatacctaaaaacccacaagggtaaa 13830417  T
Q  129 tataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13830416 tgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaa 13830377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39454338 - 39454195
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattaca---taatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaa 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  39454338 caagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaaa-gattacaaattaatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaa 39454240  T
Q  122 gagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 166  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39454239 gcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatg 39454195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15161296 - 15161190
Alignment:
Q  65 tatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg 163  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15161296 tatattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccataagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagagg 15161197  T
Q  164 atgaaga 170  Q
    |||||||    
T  15161196 atgaaga 15161190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15161664 - 15161612
Alignment:
Q  21 taaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaa 73  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15161664 taaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaa 15161612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16130754 - 16130711
Alignment:
Q  18 caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16130754 caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatggctagaa 16130711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Original strand, 7612368 - 7612412
Alignment:
Q  163 gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgg 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7612368 gatgaagattca-tgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgg 7612412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16130203 - 16130161
Alignment:
Q  18 caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaa 61  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16130203 caataaaa-caagaataacaacaatattgaataaatggctagaa 16130161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6244427 - 6244330
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaat-agctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagag 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||       ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6244427 caagaatgataacaatattgaataaaagagctggaaccatatattaaatgatcaagagtttaca-------ttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 6244335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15161169 - 15161124
Alignment:
Q  180 aagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  15161169 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactcctaa 15161124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Original strand, 30660313 - 30660382
Alignment:
Q  26 gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatag 95  Q
    ||||||||||   ||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30660313 gcaagaataatctcaatatcaaataaagagctagaatcatatattaaaggatcaaaagattacacaatag 30660382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36080280 - 36080232
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  36080280 catgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaac-accttgct 36080232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43991778 - 43991544
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43991778 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagcaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 43991679  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----aagattcaatgacaagatccatgatgtctcaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43991678 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagattccatgacaagatccatgatgtctcaac 43991579  T
Q  200 aaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43991578 aaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 43991544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 36667773 - 36668019
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36667773 tttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgt 36667872  T
Q  101 ttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccat 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  36667873 ttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccat 36667972  T
Q  189 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36667973 gatgtctcaacaaatcttggcttaagtctactcctaactaccttgct 36668019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 36040185 - 36040412
Alignment:
Q  19 aataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  36040185 aataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacta 36040284  T
Q  119 caagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 207  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36040285 caagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 36040384  T
Q  208 gcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36040385 gcttgaatctactcctaactaccttgct 36040412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29223968 - 29223727
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29223968 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 29223869  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29223868 aatacctc-aaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 29223770  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29223769 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 29223727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29337267 - 29337026
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29337267 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 29337168  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29337167 aatacctc-aaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 29337069  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29337068 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 29337026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32523183 - 32522941
Alignment:
Q  4 aaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32523183 aaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacactattgaataaatcgctataaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 32523084  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32523083 aatacctcaaaaccacaagggtagaaatagctacatatgtccatgatagctttgcaaaggacgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatg 32522984  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32522983 tctcaataaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 32522941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 13230249 - 13230491
Alignment:
Q  4 aaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13230249 aaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 13230348  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13230349 aatacctcagaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatg 13230448  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13230449 tctcaatgaatcttgggttgaatctactcataactaccttgct 13230491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 23924940 - 23925181
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23924940 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttga 23925039  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23925040 atacctcaaaacaacaagagtagatgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgt 23925139  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23925140 ctcaacaaatcttcgcttgaatctactcctaactaccttgct 23925181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27257638 - 27257473
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27257638 aatctcaataaaacattaaatttaagaataacaacaatattgaataaatagctagaactatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 27257539  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27257538 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 27257473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Original strand, 42702175 - 42702356
Alignment:
Q  65 tatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-- 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||      
T  42702175 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttatttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagga 42702274  T
Q  163 ---------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
             ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42702275 ggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 42702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Original strand, 28457806 - 28458027
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagag 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28457806 caagaataacaacaatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggg 28457905  T
Q  125 tagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 213  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  28457906 tagatgtagctacatatgtctatgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttga 28458005  T
Q  214 atctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28458006 atctactcctaactaccttgct 28458027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14700896 - 14700653
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14700896 aatctcaataaagcattaaatacaagaacaacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatagttagtttg 14700797  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga-----------ttcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||  || | |||  || |||    
T  14700796 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagat 14700697  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14700696 gtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgct 14700653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21160219 - 21160053
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  21160219 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttga 21160120  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21160119 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaagatgaaga 21160053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 5784511 - 5784674
Alignment:
Q  83 gattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagat 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||    
T  5784511 gattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagat 5784610  T
Q  172 tcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5784611 tccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaacttccttgct 5784674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 36557465 - 36557672
Alignment:
Q  41 atattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactaca 138  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  36557465 atattgaataaataagttagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctaca 36557564  T
Q  139 tatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaact 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||           |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36557565 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaact 36557664  T
Q  228 accttgct 235  Q
    ||||||||    
T  36557665 accttgct 36557672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 9787013 - 9787180
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  9787013 aatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttg 9787112  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9787113 aatacctcaaaacccacaatggtagatatacttacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 9787180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 24663054 - 24663281
Alignment:
Q  21 taaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaac-ca 118  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24663054 taaatgcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactca 24663153  T
Q  119 caagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 207  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||           |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24663154 caagcgtagatgtagctacatatgtctatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttg 24663253  T
Q  208 gcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  24663254 gtatgaaactactcctaacaaccttgct 24663281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 41977852 - 41977736
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||    
T  41977852 tttaaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaaaatcgtatattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgt 41977753  T
Q  101 ttgaatacctcaaaacc 117  Q
    |||||||||| ||||||    
T  41977752 ttgaataccttaaaacc 41977736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 235
Target Start/End: Original strand, 8687768 - 8687823
Alignment:
Q  180 aagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8687768 aagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 8687823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Original strand, 42700881 - 42700949
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaa 73  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  42700881 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattaaacaaatagctagaaccatatattaaa 42700949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11651948 - 11651893
Alignment:
Q  49 taaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11651948 taaatagctagaatcatatattagatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 11651893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31758357 - 31758313
Alignment:
Q  163 gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgg 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31758357 gatgaagattca-tgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgg 31758313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 492799 - 492759
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  492799 catgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 492759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 27167006 - 27167247
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27167006 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 27167105  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27167106 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 27167205  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27167206 cccaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 27167247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 11723184 - 11723426
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11723184 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 11723283  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11723284 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 11723383  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11723384 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 11723426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11767008 - 11766767
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11767008 aatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 11766909  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11766908 atacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgt 11766809  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11766808 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 11766767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7315219 - 7314977
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7315219 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 7315120  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7315119 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 7315020  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7315019 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 7314977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9404678 - 9404436
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9404678 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 9404579  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9404578 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 9404479  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9404478 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 9404436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 16904517 - 16904759
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatag-ctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16904517 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 16904616  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16904617 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 16904716  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16904717 tctcaacaaatcttggcttgaatctacccctaactaccttgct 16904759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34456551 - 34456309
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34456551 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 34456452  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34456451 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 34456352  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34456351 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 34456309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31846233 - 31845992
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31846233 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 31846134  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31846133 atacctcaaaactacaagattaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgt 31846034  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31846033 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 31845992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33434856 - 33434615
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33434856 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 33434757  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
     ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33434756 gtacctcaaaactacaagaggagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgt 33434657  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33434656 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 33434615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 30606984 - 30607226
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30606984 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 30607083  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30607084 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 30607183  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30607184 tctcaacaaatattggcttgaatctactcctaactaccttgct 30607226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24835989 - 24835749
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24835989 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 24835890  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24835889 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 24835790  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24835789 tctcaacaaatcctgacttgaatctactcctaactaccttg 24835749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 34869650 - 34869894
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    ||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34869650 tttaaatctcaatagaacattatatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcgaaagattacataatagcttgt 34869749  T
Q  101 ttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccat 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  34869750 ttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccat 34869849  T
Q  189 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869850 gatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 34869894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6270141 - 6269908
Alignment:
Q  7 tctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaat 106  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6270141 tctcaataaaacaataaagacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaatatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaat 6270042  T
Q  107 acctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgtct 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||  |||||||||||||| ||||     
T  6270041 acctcaaaaccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtca 6269942  T
Q  196 caacaaatcttggcttgaatctactcctaactac 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6269941 caacaaatcttggcttgaatctactcataactac 6269908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14344715 - 14344481
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||        |||||||||||||| |||||||    
T  14344715 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagttagaaccatatattaaa--------agattacataatagcttgtttg 14344624  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14344623 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 14344524  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14344523 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 14344481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Original strand, 37251817 - 37251979
Alignment:
Q  9 tcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatac 108  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||    
T  37251817 tcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatac 37251916  T
Q  109 ctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251917 ctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaaga 37251979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7315458 - 7315358
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7315458 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 7315359  T
Q  104 a 104  Q
    |    
T  7315358 a 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 39655961 - 39656110
Alignment:
Q  21 taaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-cca 118  Q
    |||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||    
T  39655961 taaatgcaagaataataagaagattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaaccca 39656060  T
Q  119 caagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||  |||||  |||||||||||    
T  39656061 caagggtagatgtagctacatatgtctttgcaagcttgacaaaggatgaa 39656110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32226914 - 32226845
Alignment:
Q  165 tgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32226914 tgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaac-accttgct 32226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 37252005 - 37252045
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37252005 catgatgtctcaataaatcttgggttgaatctacacctaac 37252045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20837347 - 20837107
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20837347 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaataatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 20837248  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20837247 atacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 20837148  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837147 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 20837107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9989649 - 9989408
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9989649 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 9989550  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgca-----------aaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9989549 atacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgt 9989450  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989449 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 9989408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 27850459 - 27850700
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  27850459 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaa 27850558  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27850559 atacctcaaaaccacaagattggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgt 27850658  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27850659 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 27850700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 37471595 - 37471836
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37471595 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 37471694  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  37471695 atacatcaaaaccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgt 37471794  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37471795 ctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactactttgct 37471836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3588654 - 3588412
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3588654 aatctcaataaaataataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 3588555  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588554 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 3588455  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3588454 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 3588412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8615757 - 8615515
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8615757 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 8615658  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||| |||||||||||||    
T  8615657 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatg 8615558  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615557 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 8615515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22097920 - 22097682
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22097920 aatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaacaatattgaataaatggctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttga 22097821  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22097820 atacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgt 22097721  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22097720 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 22097682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45527901 - 45527659
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaa-gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45527901 aatctcaataaaacattaaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 45527802  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45527801 aatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctagatatgtctatgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatg 45527702  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45527701 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 45527659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 48168102 - 48168343
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48168102 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctaaaacaatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 48168201  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatga-----------agattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||| |||| ||||||| ||||||    
T  48168202 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgt 48168301  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48168302 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 48168343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 7653130 - 7653372
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7653130 aatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 7653229  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7653230 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 7653329  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7653330 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 7653372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 10385978 - 10386220
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  10385978 aatctcaataaaacaatacaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttg 10386077  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10386078 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 10386177  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10386178 tctcaacaaatcttggctcgaatctactcctaactaccttgct 10386220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 36469344 - 36469585
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaa-gcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36469344 aatctcaataa-acaataaaatgcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttg 36469442  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36469443 aatacctcaaaaccacaagagtagttgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatg 36469542  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36469543 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 36469585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 52307993 - 52308235
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52307993 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 52308092  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52308093 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 52308192  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52308193 tctaaacaaatattggctagaatctactcctaactaccttgct 52308235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 4742911 - 4743135
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4742911 aatctcaataa-acaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaa-tgatcaaaagattacataatagcttgtttga 4743008  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  4743009 atacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaacgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatct 4743108  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctact 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4743109 ctcaacaaatcttggcttgaatctact 4743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26335361 - 26335129
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  26335361 aatctcaataaagcaataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctaaaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttg 26335262  T
Q  104 aatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaa 202  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||  |||||||||||||||||    
T  26335261 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaa 26335162  T
Q  203 tcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26335161 tcttgggttgaatctactcttaactaccttgct 26335129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385408
Alignment:
Q  33 taacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatat 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |    
T  23385622 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctaaaaactacaagaatagatgt 23385523  T
Q  132 aactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatga-----------agattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 220  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||           |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23385522 agctaaatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctact 23385423  T
Q  221 cctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||    
T  23385422 cctaactaccttgct 23385408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1232395 - 1232565
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgt 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  1232395 tttaaatctcaataaaacattaaatgaaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgt 1232494  T
Q  101 ttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1232495 ttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaaga 1232565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 27030670 - 27030833
Alignment:
Q  83 gattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagat 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||    
T  27030670 gattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagat 27030769  T
Q  172 tcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27030770 tccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 27030833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33248216 - 33248000
Alignment:
Q  32 ataacaacaatattgaataaat-agctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33248216 ataacaacaatattgaataaattagctagaatcatatattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagat 33248117  T
Q  130 ataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatcta 218  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33248116 gcagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatcta 33248017  T
Q  219 ctcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  33248016 ctcctaactaccttgct 33248000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23194173 - 23193936
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23194173 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa---tattgaataaatagatagaaccatatattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttga 23194077  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||           ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23194076 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctctgatag-tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatg 23193978  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23193977 tctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaactaccttgc 23193936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49434354 - 49434186
Alignment:
Q  1 tttaaatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttg 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||| |||    
T  49434354 tttaaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattaaataaataagttagaactatatattaaaagatgaagagtttacataatagcttg 49434255  T
Q  100 tttgaatacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  49434254 tttgaatacctcaaaacgcacaaga-taaatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaa 49434186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2357415 - 2357181
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||| || |||||||||    
T  2357415 aatctcaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtttg 2357316  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||   ||||| ||||||           ||||||||||  ||| | |||  ||||||    
T  2357315 aatacctcaaaacccacaatgttagatgtagctacatatgtctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatgat 2357216  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2357215 gtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac 2357181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 235
Target Start/End: Original strand, 20963731 - 20963803
Alignment:
Q  163 gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20963731 gatgaagattccacgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 20963803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 37022942 - 37022867
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaa 80  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37022942 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaa 37022867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 103
Target Start/End: Original strand, 20963676 - 20963714
Alignment:
Q  65 tatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20963676 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttg 20963714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 41
Target Start/End: Original strand, 20963164 - 20963200
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaa 41  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20963164 aatctcaataaaacaataaaagcaataataacaacaa 20963200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 28807 - 29049
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28807 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 28906  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28907 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 29006  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29007 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 29049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3539301 - 3539059
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3539301 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 3539202  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3539201 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 3539102  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539101 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 3539059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 26515336 - 26515578
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26515336 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 26515435  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26515436 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 26515535  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515536 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 26515578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34006756 - 34006514
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34006756 aatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 34006657  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34006656 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatg 34006557  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34006556 tctcaacaaatcttggtttgaatctactcctaactaccttgct 34006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 24161164 - 24161405
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24161164 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataactagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttga 24161263  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24161264 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgccaagaatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 24161363  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24161364 ctcaacaaatctttgcttgaatctactcctaactaccttgct 24161405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 32806671 - 32806912
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32806671 aatctcaataaaccaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttga 32806770  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32806771 atacctcaaaaccacaagagtaggtgtagatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgt 32806870  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32806871 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 32806912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 9932713 - 9932953
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9932713 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 9932812  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9932813 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 9932912  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9932913 tctcaacaaatcttgccttgaatctactcctaactaccttg 9932953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 21596436 - 21596681
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21596436 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttga 21596535  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattc----aatgacaagatccatg 189  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||     ||||||||||| |||    
T  21596536 atacctcaaaaccacaagtttagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatg 21596635  T
Q  190 atgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21596636 atgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccatgct 21596681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 5988910 - 5989152
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5988910 aatctcaataaagcattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 5989009  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5989010 aatacctcaaaacccacaagggtaaatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatg 5989109  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5989110 tctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgct 5989152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24879118 - 24878879
Alignment:
Q  6 atctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24879118 atctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctatagccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 24879019  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  24879018 atacctcaaaactacaagagtatatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgt 24878919  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 233  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24878918 ctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttg 24878879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14479735 - 14479572
Alignment:
Q  83 gattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagat 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||           |||||    
T  14479735 gattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagat 14479636  T
Q  172 tcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14479635 tccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 14479572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21631436 - 21631192
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||    
T  21631436 aatctcaataaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttg 21631337  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-------------aagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||             ||||||| ||| | ||||||||||    
T  21631336 aatacctcaaatccacaagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatga 21631237  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||    
T  21631236 tgtctcaacaaatcttgtgttaaatctactcttaactaccttgct 21631192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14270926 - 14270684
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| | |||||||    
T  14270926 aatctcaataaaacattaaacacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttg 14270827  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgc-----------aaaggatgaagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||           ||| |||||||||||| || | ||||| |||||    
T  14270826 aatacctcaaaacccacaagggtatatatagctacatatgtctatgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgat 14270727  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14270726 gtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgct 14270684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 13173732 - 13173890
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13173732 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttga 13173831  T
Q  105 atacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13173832 atacctcaaaactcacaagggtagat--------gtatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 13173890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 13182265 - 13182423
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13182265 aatctcaataaaacattaaaaacaagaataacaacaatattgaataaatagctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttga 13182364  T
Q  105 atacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13182365 atacctcaaaactcacaagggtagat--------gtatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga 13182423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25977203 - 25976962
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||   |||||||    
T  25977203 aatctcaataaatcattaaatacaaaaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttg 25977104  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  25977103 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagatgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatg 25977004  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25977003 tctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgct 25976962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1455050 - 1454808
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||    
T  1455050 aatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttg 1454951  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||  ||||| ||||||           ||||||||||| ||| | |||  ||||||    
T  1454950 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgat 1454851  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  1454850 gtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgct 1454808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1466742 - 1466500
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||    
T  1466742 aatctcaataaaacatcaaatacaagaataacaacaatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttg 1466643  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||  ||||| ||||||           ||||||||||| ||| | |||  ||||||    
T  1466642 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgat 1466543  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  1466542 gtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgct 1466500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32822053 - 32821814
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| | || ||||    
T  32822053 aatctcaataaaacagtaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaa-aatctaaagattacataattgcttatttg 32821955  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||           |||||||||||||||   |||||||||||     
T  32821954 aatacctcaaaacc-cacaagtagatgtagctacatttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagattcaatgcatagatccatgatt 32821856  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  32821855 tatcaacaaatcttgggttgaatctattcctaa-taccttgct 32821814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34913942 - 34913803
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||    
T  34913942 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacagcaatattgaataaatagatagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttga 34913843  T
Q  105 atacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgt 143  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34913842 atacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgt 34913803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15642655 - 15642506
Alignment:
Q  21 taaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-cca 118  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15642655 taaaggcaagaataataacaatattcaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaaccca 15642556  T
Q  119 caagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  15642555 caagggtagatttagctacatatgtctatgcaagcttagcaaaggatgaa 15642506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26604577 - 26604351
Alignment:
Q  21 taaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacc-a 118  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    
T  26604577 taaaaacaagaataataacaatattgaataaataagctagaatcttatattaaatgatcaaa-gattacataatagcttttttgaatacctcaataccca 26604479  T
Q  119 caagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgca-----------aaggatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 207  Q
    ||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||           || ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26604478 caaggatagatgtagctacatatgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttg 26604379  T
Q  208 gcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |   ||||||||| |||||  |||||||    
T  26604378 ggaagaatctacttctaacacccttgct 26604351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Original strand, 26510392 - 26510462
Alignment:
Q  165 tgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26510392 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 26510462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 9518367 - 9518516
Alignment:
Q  21 taaaagcaagaataacaacaatattgaataaatag-ctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-cca 118  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  9518367 taaatgcaagaataataacaattatgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaaccca 9518466  T
Q  119 caagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  9518467 caagggtagatgtagctacatatgtctatgcaaacttggcaaaggatgaa 9518516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16698159 - 16698086
Alignment:
Q  9 tcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16698159 tcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagttagaaccatatattaaatgatcaaaa 16698086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 138
Target Start/End: Original strand, 6868010 - 6868095
Alignment:
Q  54 agctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactaca 138  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||    
T  6868010 agctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaacccacaagggtagatgtagctaca 6868095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34913532 - 34913461
Alignment:
Q  163 gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34913532 gatgaagattcaatgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgct 34913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25541330 - 25541255
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgttt 102  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25541330 caagaataataacaatatttaataaataagctagaaccttatatgaaatgatcaaa-gattacataatagcttgttt 25541255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15642483 - 15642437
Alignment:
Q  180 aagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15642483 aagattcatgatgtctcaacaaatcttggtaagaatctactcctaac 15642437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Original strand, 14354991 - 14355035
Alignment:
Q  163 gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgg 208  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14354991 gatgaagattcg-tgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgg 14355035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 13173917 - 13173957
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13173917 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 13173957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 13182450 - 13182490
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13182450 catgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac 13182490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8996 - 8755
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8996 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 8897  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8896 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatg 8797  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 8755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6985 - 6745
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6985 aatctcaagaaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttga 6886  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6885 atacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgt 6786  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 6745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 25558 - 25800
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25558 aatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttg 25657  T
Q  104 aatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25658 aatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatg 25757  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25758 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 25800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 116476 - 116717
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  116476 aatctcaataaaacattaaattcaagaataacaacaatattgaattaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaa 116575  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa-----------gattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |||||||||||||||||||    
T  116576 atacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgt 116675  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116676 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 116717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 76360 - 76601
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  76360 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttga 76459  T
Q  105 atacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagga-----------tgaagattcaatgacaagatccatgatgt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  76460 atacctcaaaatcacaagagtagatgtatctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgt 76559  T
Q  194 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76560 ctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 76601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 12112 - 12351
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12112 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 12211  T
Q  105 atacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  12212 atacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatg 12309  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12310 tctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgct 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 15882 - 16121
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15882 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 15981  T
Q  105 atacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatg 192  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  15982 atacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatg 16079  T
Q  193 tctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16080 tctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgct 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12448 - 12207
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaa-gcaagaataa-caacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgttt 102  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12448 aatctcaataaaacaattaaatgcaagaataaacaacaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgttt 12349  T
Q  103 gaatacctcaaaac-cacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatga 190  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  12348 gaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatga 12251  T
Q  191 tgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12250 tgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaac-accttgct 12207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1738 - 1576
Alignment:
Q  84 attacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg-----------aagatt 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  1738 attacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 1639  T
Q  173 caatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1638 ccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 1576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 892 - 1125
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||    
T  892 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataagcta-caccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttg 990  T
Q  104 aatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattcaatgacaagatccatgat 191  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||           ||||| |||| ||| | |||  ||||||    
T  991 aatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctgtgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgat 1090  T
Q  192 gtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaac 226  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1091 gtctcaacaaatcttggatagaatctactcctaac 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 7316 - 7205
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  7316 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttga 7217  T
Q  105 atacctcaaaac 116  Q
    ||||||||||||    
T  7216 atacctcaaaac 7205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11930 - 11819
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  11930 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttga 11831  T
Q  105 atacctcaaaac 116  Q
    ||||||||||||    
T  11830 atacctcaaaac 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9925 - 9814
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttga 104  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  9925 aatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttga 9826  T
Q  105 atacctcaaaac 116  Q
    ||||||||||||    
T  9825 atacctcaaaac 9814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14438 - 14274
Alignment:
Q  5 aatctcaataagacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatag-ctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttg 103  Q
    |||||||||||  || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||| | |||||||    
T  14438 aatctcaataaagcattaaacacaagaataacaactatattgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttg 14340  T
Q  104 aatacctcaaaacc-acaagagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14339 aatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaa 14274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14245 - 14197
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14245 catgatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcctaac-accttgct 14197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 232
Target Start/End: Original strand, 16402 - 16620
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagag 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| |    
T  16402 caagaataacaaccatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaaggg 16501  T
Q  125 tagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaag-----------gatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttga 213  Q
    || || ||  |||||||||||| |||||||| ||||||           ||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16502 tatatgtagatacatatgtctaagatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtaga 16601  T
Q  214 atctactcctaactacctt 232  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  16602 atctactcttaactacctt 16620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 107
Target Start/End: Original strand, 12401 - 12491
Alignment:
Q  18 caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaata 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12401 caataaaagcaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Original strand, 35212 - 35355
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaac-cacaagag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  |    
T  35212 caagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaatgg 35311  T
Q  125 tagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaa 168  Q
    | ||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35312 tggatgtacctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaa 35355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 35384 - 35432
Alignment:
Q  186 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgct 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  35384 cataatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaac-accttgct 35432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Original strand, 9380 - 9523
Alignment:
Q  27 caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaacgatatattaaatgatcaaaagattaca---taatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaa 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  9380 caagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaaa-gattacaaattaatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaa 9478  T
Q  122 gagtagatataactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 166  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9479 gcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatg 9523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 8 - 120
Alignment:
Q  134 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaag-----------attcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttgaatctactcc 107  T
Q  223 taactaccttgct 235  Q
     ||||||||||||    
T  108 caactaccttgct 120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University