View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20712_low_10 (Length: 464)

Name: NF20712_low_10
Description: NF20712
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20712_low_10
NF20712_low_10
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (17-449)||(16832186-16832618)
chr1 (21-450)||(40999506-40999935)
chr1 (21-450)||(11738200-11738629)
chr1 (21-450)||(33491600-33492029)
chr1 (21-450)||(12167618-12168047)
chr1 (21-450)||(38121334-38121763)
chr1 (21-450)||(39000583-39001012)
chr1 (21-450)||(16130836-16131261)
chr1 (21-443)||(431750-432172)
chr1 (21-450)||(9667098-9667527)
chr1 (17-449)||(13217451-13217884)
chr1 (21-419)||(49249395-49249792)
chr1 (154-450)||(20225764-20226060)
chr1 (25-338)||(8995776-8996089)
chr1 (21-338)||(36084089-36084405)
chr1 (21-259)||(44504861-44505099)
chr1 (21-338)||(15161758-15162074)
chr1 (24-301)||(9268969-9269247)
chr1 (206-338)||(3365740-3365872)
chr1 (204-338)||(13830782-13830917)
chr1 (30-105)||(39456627-39456703)
chr1 (204-279)||(39456785-39456860)
chr1 (51-113)||(7063546-7063608)
chr1 (30-114)||(6244534-6244619)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (21-450)||(2796965-2797394)
chr7 (17-450)||(8107290-8107723)
chr7 (21-443)||(22321210-22321632)
chr7 (21-450)||(31878930-31879358)
chr7 (21-450)||(10345708-10346136)
chr7 (17-449)||(45500114-45500546)
chr7 (21-450)||(12089861-12090291)
chr7 (21-449)||(2631727-2632155)
chr7 (21-443)||(31157685-31158107)
chr7 (21-450)||(23795425-23795853)
chr7 (21-449)||(31882441-31882869)
chr7 (21-450)||(6172846-6173275)
chr7 (21-428)||(12184195-12184597)
chr7 (48-436)||(1954285-1954672)
chr7 (21-425)||(12191172-12191576)
chr7 (20-450)||(2477990-2478420)
chr7 (21-450)||(3544280-3544709)
chr7 (21-430)||(24483078-24483485)
chr7 (118-449)||(22825036-22825367)
chr7 (21-450)||(31663914-31664326)
chr7 (21-338)||(22909448-22909765)
chr7 (21-338)||(1274918-1275236)
chr7 (21-260)||(22820435-22820674)
chr7 (115-416)||(4704814-4705115)
chr7 (224-450)||(19471636-19471864)
chr7 (21-178)||(19471864-19472021)
chr7 (24-300)||(29032345-29032622)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (21-450)||(7652624-7653053)
chr3 (21-450)||(9989726-9990155)
chr3 (21-449)||(4742405-4742834)
chr3 (21-443)||(10385479-10385901)
chr3 (21-450)||(36468838-36469267)
chr3 (21-450)||(52307487-52307916)
chr3 (21-443)||(8625954-8626376)
chr3 (21-450)||(20962660-20963087)
chr3 (21-449)||(27849954-27850382)
chr3 (21-450)||(48167593-48168025)
chr3 (21-447)||(33248320-33248746)
chr3 (21-450)||(37023019-37023450)
chr3 (21-392)||(22097997-22098368)
chr3 (24-417)||(20837427-20837820)
chr3 (21-381)||(45527978-45528338)
chr3 (85-449)||(22098375-22098739)
chr3 (21-338)||(1232006-1232322)
chr3 (21-300)||(3588731-3589010)
chr3 (17-295)||(37471244-37471522)
chr3 (21-235)||(49434428-49434642)
chr3 (30-213)||(23411817-23412000)
chr3 (21-316)||(23194250-23194545)
chr3 (250-436)||(11260203-11260389)
chr3 (21-300)||(2357491-2357771)
chr3 (30-322)||(27104326-27104624)
chr3 (220-322)||(23394099-23394201)
chr3 (21-144)||(26335439-26335562)
chr3 (336-443)||(23382950-23383057)
chr3 (359-443)||(23396965-23397048)
chr3 (191-338)||(24899443-24899591)
chr3 (191-338)||(24905909-24906057)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (21-450)||(9067569-9067998)
chr8 (21-427)||(28370424-28370830)
chr8 (21-450)||(8742685-8743114)
chr8 (21-450)||(11308389-11308818)
chr8 (21-443)||(28925552-28925974)
chr8 (21-450)||(3299132-3299561)
chr8 (24-450)||(41576733-41577159)
chr8 (21-450)||(34006175-34006604)
chr8 (21-450)||(27348357-27348786)
chr8 (24-450)||(16958886-16959311)
chr8 (21-303)||(13510294-13510576)
chr8 (21-303)||(13599824-13600106)
chr8 (21-338)||(22222189-22222506)
chr8 (21-338)||(22228531-22228848)
chr8 (21-338)||(22242757-22243074)
chr8 (21-449)||(13848730-13849160)
chr8 (21-300)||(12538494-12538774)
chr8 (21-316)||(22233385-22233681)
chr8 (195-450)||(22181081-22181336)
chr8 (21-316)||(4861487-4861782)
chr8 (21-316)||(17993197-17993492)
chr8 (63-316)||(22227043-22227297)
chr8 (24-237)||(36736821-36737034)
chr8 (21-201)||(21692777-21692957)
chr8 (21-170)||(22180932-22181081)
chr8 (376-443)||(16583062-16583129)
chr8 (206-338)||(1607785-1607918)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (21-450)||(16904011-16904440)
chr5 (21-449)||(27166501-27166929)
chr5 (21-450)||(9404755-9405184)
chr5 (21-450)||(34456626-34457055)
chr5 (21-450)||(7315535-7315964)
chr5 (21-443)||(11767085-11767507)
chr5 (21-450)||(30606478-30606907)
chr5 (21-450)||(11722678-11723107)
chr5 (21-450)||(24836053-24836482)
chr5 (21-450)||(33434933-33435362)
chr5 (21-450)||(14344792-14345220)
chr5 (21-449)||(6270220-6270649)
chr5 (21-449)||(34869147-34869577)
chr5 (17-338)||(37251419-37251740)
chr5 (17-300)||(32226985-32227268)
chr5 (164-450)||(31846426-31846706)
chr5 (21-189)||(519360-519528)
chr5 (21-135)||(31846310-31846424)
chr5 (24-236)||(39655652-39655865)
chr5 (21-67)||(7315296-7315342)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (21-450)||(4838538-4838967)
chr4 (21-450)||(22048012-22048441)
chr4 (17-450)||(26373033-26373466)
chr4 (21-450)||(40994949-40995378)
chr4 (21-450)||(35416098-35416527)
chr4 (21-443)||(42532295-42532717)
chr4 (21-450)||(5272965-5273393)
chr4 (21-450)||(21677070-21677498)
chr4 (21-450)||(52618833-52619262)
chr4 (21-449)||(1188295-1188723)
chr4 (21-443)||(323769-324191)
chr4 (21-449)||(46691440-46691868)
chr4 (21-449)||(19247232-19247659)
chr4 (21-449)||(26070058-26070486)
chr4 (21-450)||(55327107-55327531)
chr4 (54-450)||(21668306-21668703)
chr4 (21-450)||(30217788-30218217)
chr4 (148-450)||(33239375-33239676)
chr4 (95-450)||(42271781-42272136)
chr4 (21-449)||(20949076-20949506)
chr4 (21-332)||(53895709-53896021)
chr4 (220-443)||(44428799-44429023)
chr4 (21-316)||(33110235-33110533)
chr4 (21-213)||(9417072-9417264)
chr4 (192-272)||(19730985-19731065)
chr4 (204-279)||(6640476-6640551)
chr4 (388-450)||(19730922-19730984)
chr4 (30-99)||(8895205-8895275)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (21-450)||(13229744-13230173)
chr2 (21-443)||(29224045-29224467)
chr2 (21-443)||(29337344-29337766)
chr2 (21-450)||(27257715-27258144)
chr2 (23-450)||(42700376-42700802)
chr2 (21-435)||(32523259-32523675)
chr2 (21-449)||(23924435-23924863)
chr2 (21-449)||(36667291-36667700)
chr2 (21-450)||(28457279-28457708)
chr2 (21-450)||(36039664-36040093)
chr2 (21-450)||(43991856-43992272)
chr2 (21-450)||(14700974-14701404)
chr2 (21-450)||(36556964-36557393)
chr2 (120-450)||(8679197-8679527)
chr2 (21-368)||(9786588-9786935)
chr2 (21-285)||(21160296-21160560)
chr2 (21-338)||(41977925-41978242)
chr2 (20-213)||(31758607-31758800)
chr2 (24-449)||(24662530-24662958)
chr2 (21-110)||(40200270-40200359)
chr2 (359-450)||(28006753-28006844)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (21-450)||(15376-15805)
scaffold0298 (21-450)||(11606-12035)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (21-450)||(28301-28730)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (21-449)||(115971-116399)
scaffold0019 (34-450)||(168810-169226)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (21-425)||(26514855-26515259)
chr6 (21-443)||(3539378-3539800)
chr6 (21-443)||(9932214-9932636)
chr6 (21-449)||(21595931-21596359)
chr6 (21-450)||(24160656-24161087)
chr6 (21-450)||(32806165-32806594)
chr6 (21-449)||(16698240-16698668)
chr6 (21-383)||(24879196-24879558)
chr6 (21-435)||(5988419-5988833)
chr6 (21-338)||(14271003-14271319)
chr6 (21-338)||(25977280-25977596)
chr6 (21-338)||(34914019-34914335)
chr6 (21-338)||(1455122-1455439)
chr6 (21-338)||(1466814-1467131)
chr6 (17-300)||(13181908-13182192)
chr6 (17-257)||(13173419-13173659)
chr6 (220-450)||(8667461-8667691)
chr6 (21-211)||(34006833-34007023)
chr6 (231-443)||(5670686-5670898)
chr6 (248-450)||(25055959-25056161)
chr6 (21-338)||(21631514-21631831)
chr6 (24-336)||(15642751-15643064)
chr6 (24-338)||(9517961-9518275)
chr6 (305-449)||(6778170-6778314)
chr6 (267-382)||(34007032-34007147)
chr6 (220-419)||(26604850-26605050)
chr6 (30-113)||(26604679-26604763)
chr6 (365-401)||(14479776-14479812)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (21-443)||(11896-12319)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (21-443)||(12525-12947)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (21-443)||(9073-9495)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (21-443)||(25059-25481)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (21-426)||(7062-7467)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (21-412)||(75892-76283)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (21-300)||(535-815)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (21-315)||(16009-16304)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (21-316)||(14516-14810)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (262-450)||(350008-350196)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (21-300)||(34874-35155)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (92-338)||(4860-5107)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (191-338)||(7257-7403)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (191-338)||(7267-7413)
[»] scaffold0152 (1 HSPs)
scaffold0152 (191-338)||(24878-25024)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (336-450)||(175247-175361)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (219-449)||(6044-6275)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (219-300)||(45781-45861)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (21-67)||(7363-7409)
scaffold0447 (21-67)||(11977-12023)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (21-67)||(9972-10018)
[»] scaffold0457 (2 HSPs)
scaffold0457 (220-289)||(266-334)
scaffold0457 (354-418)||(399-463)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (30-105)||(7014-7090)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16832618 - 16832186
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  16832618 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactt 16832519  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  16832518 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 16832419  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
      || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16832418 atcgcttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctc 16832319  T
Q  317 gttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaata 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16832318 gttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaata 16832219  T
Q  417 cgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16832218 cgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 16832186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40999935 - 40999506
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||    
T  40999935 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaaaaggctttgtg 40999836  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  40999835 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 40999736  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  40999735 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaaattgcaactgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcaaaataaccctatctcttctcgttt 40999636  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||     
T  40999635 tacttttatgtcgaataggaaaatagtttaacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattacgca 40999536  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40999535 actccctgcggaaacgatcctattatactt 40999506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11738629 - 11738200
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||    
T  11738629 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgactaaactatccaatcgactttgtg 11738530  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  11738529 atcgtttaaatttttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 11738430  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11738429 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 11738330  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||      
T  11738329 tacttttatgtcaaatagaaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaattattgtgaaaatgcttatgaaatacgaa 11738230  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11738229 actccctgcggaaatgatcctattatactt 11738200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33492029 - 33491600
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  33492029 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 33491930  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  33491929 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 33491830  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  33491829 tttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 33491730  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  33491729 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 33491630  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  33491629 actccctgtagacacgatcctattatactt 33491600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12168047 - 12167618
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  12168047 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 12167948  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  12167947 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 12167848  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12167847 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 12167748  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||     
T  12167747 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatacgca 12167648  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  12167647 actccctgtggacacgatcctattatactt 12167618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 38121763 - 38121334
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  38121763 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 38121664  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  38121663 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataatgatatcatttgtacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 38121564  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38121563 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 38121464  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  38121463 tacttttatgtcgattaggaaaatagtttcacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 38121364  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  38121363 actccctgtggacacgatcttattatactt 38121334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 39001012 - 39000583
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  39001012 atgtcaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 39000913  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  39000912 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcgcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 39000813  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  39000812 tttaaaaagctagaatccgtaaatcgatcgaaagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagtcctatctcttcttgttt 39000713  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  39000712 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 39000613  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  39000612 actccctgtggacacgatcctattatactt 39000583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 16130836 - 16131261
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  16130836 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatcggttagggaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 16130935  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  16130936 atcgtttaaatatttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 16131035  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||| ||||     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  16131036 tttaaaaagctataatc----catcaatcgagatattgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaataaccctatcccttctcgttt 16131131  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  16131132 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 16131231  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16131232 actccgtgcggaaacgatcctattatactt 16131261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 432172 - 431750
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  432172 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtgaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 432073  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  432072 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 431973  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  431972 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 431873  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  431872 tacttttatgtcaattaggaaaataattttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 431773  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  431772 actccctgtggacacgatcctat 431750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9667527 - 9667098
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  9667527 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttggtaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 9667428  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||   |    
T  9667427 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaggatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatag 9667328  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9667327 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagattgaagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 9667228  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| || | ||||||||||||||| |||||     
T  9667227 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgcgaaaatgcttatgaactacgca 9667128  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  9667127 actccctgtggacacgatcctattatactt 9667098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13217884 - 13217451
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattga-tt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||| || ||    
T  13217884 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatacttttggataatttaattagctgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactt 13217785  T
Q  116 ttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatca 215  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |    
T  13217784 ttgggatcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgattgatattgtcgagtgattgtgataa 13217685  T
Q  216 ttccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttct 315  Q
    |  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  13217684 tatcatttaaaaagctaaaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgtttggttgagctctgtgaccgcaagcgaaatggccctatctctttt 13217585  T
Q  316 cgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaat 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13217584 cgttttacatttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacatacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaat 13217485  T
Q  416 acgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13217484 acgcaactccctgcggaaacgatcctattatact 13217451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 419
Target Start/End: Original strand, 49249395 - 49249792
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  49249395 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgagtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 49249494  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  49249495 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 49249594  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  49249595 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacacttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgctt 49249694  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  49249695 tacatttatgtcaattaggaaaatag-tttacacaaacaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgc 49249792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 154 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20226060 - 20225764
Alignment:
Q  154 cgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgaga 253  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20226060 cgatcgcttataaataacgatatcatttggacacggatgagattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgaga 20225961  T
Q  254 gattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcg 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20225960 gattgtagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatatccccatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttata 20225861  T
Q  354 caaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20225860 caaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgcaactctctgcggaaacgatcctattatactt 20225764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8996089 - 8995776
Alignment:
Q  25 taatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||    
T  8996089 taatatttgataatcacttttaatctaaaaattaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaagctatccaatcgactttgtgatcg 8995990  T
Q  125 tttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttta 224  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |  |||||||||| ||   |||||    
T  8995989 tttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcattttgacacgaatgatattattgagtgattgtgataatgtagttta 8995890  T
Q  225 aaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttac 323  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||  ||||     
T  8995889 aaaagctagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccctatctcttctctattta- 8995791  T
Q  324 ttttatgtcgaatag 338  Q
    ||||||||| |||||    
T  8995790 ttttatgtcaaatag 8995776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 36084089 - 36084405
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  36084089 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcatttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 36084188  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||  ||    
T  36084189 attatataaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcaagtgattgtgataatatcg 36084288  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||  ||    
T  36084289 tttaaaaagctagaatatgttaattgatcgtgagattgcagttgttacgcgtggttga-gtgtctgaccccaagcgaaataaccatatcttttctctatt 36084387  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    |  ||||||||| |||||    
T  36084388 ttattttatgtcaaatag 36084405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44505099 - 44504861
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  44505099 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 44505000  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  44504999 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgacctcttagaaataacgacatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 44504900  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgc 259  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44504899 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgc 44504861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 15161758 - 15162074
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| || ||||||    
T  15161758 atgttaatatttgataatcacttttaatatagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatagtcgattaaacggttcaatcgactttgtg 15161857  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| ||  ||    
T  15161858 attgtttaaatgtttgggaaattgacatttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcg-agtattgtgataatatcg 15161956  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  15161957 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagcgattgcagctgttacgcttagttgatatctctaaccccaagcgaaatagccatacctcttctctatt 15162056  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    |  ||||||||| |||||    
T  15162057 ttattttatgtcaaatag 15162074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 301
Target Start/End: Original strand, 9268969 - 9269247
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| |||||||||||| || || || ||| |||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||    
T  9268969 ttaatctttgataatcaccttgaaatcaagagcttaatgcttttaggtcgtttaattgattgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcggcttt-tgat 9269067  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtt 222  Q
     ||||||  |||| | |||| ||  ||||||   ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||  ||||    
T  9269068 tgtttaatagtttggaaaattgacttttaaatagtccattagaaatcacgacatcatttagacacgaatgatgttgtcgagtgattttgataatatcgtt 9269167  T
Q  223 taaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaata 301  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  9269168 taaaaagttagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagcgaaata 9269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3365872 - 3365740
Alignment:
Q  206 attgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagca 304  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |     
T  3365872 attgtgataatatcgttttaaaagctagaatccgttatttgatcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatgacc 3365773  T
Q  305 ctatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  3365772 ctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 3365740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 338
Target Start/End: Original strand, 13830782 - 13830917
Alignment:
Q  204 tgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatag 302  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||| ||| ||| ||||||      
T  13830782 tgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttggtcaagagattgcagttgttacgtttggttgattaactctaaccccaaacgaaatga 13830881  T
Q  303 cactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
    | ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  13830882 ctctatctcttctctatttatttttatgtcaaatag 13830917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Original strand, 39456627 - 39456703
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgat 105  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||| |||||||||||||||    
T  39456627 tttggtaatcactttgtaatcaagaacttaatgctattggatcgtttaatagattgagaaaacgtcgattagacgat 39456703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 279
Target Start/End: Original strand, 39456785 - 39456860
Alignment:
Q  204 tgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgat 279  Q
    |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| | ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39456785 tgattgtgataatatcgtttgaaaatctagaatctgttatttgatcatgaggttgcagttgttacgcttggttgat 39456860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 113
Target Start/End: Original strand, 7063546 - 7063608
Alignment:
Q  51 agaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattga 113  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7063546 agaacttaatgctattggatcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatacaattga 7063608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 6244534 - 6244619
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgat 114  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | ||| ||||||||    
T  6244534 tttggtaatcactttaaaatcaagaacttaatgttattgggtcatttaatagattgagaaatcatcgattaaaagatacaattgat 6244619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2797394 - 2796965
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  2797394 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 2797295  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  2797294 gtcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 2797195  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2797194 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaataaccctatctcttctcgttt 2797095  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||     
T  2797094 tacttttatgtcaaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttttgaaatacgca 2796995  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2796994 actccatgcggaaacgatcctattatactt 2796965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8107723 - 8107290
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||    
T  8107723 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactt 8107624  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  8107623 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 8107524  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8107523 atagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctc 8107424  T
Q  317 gttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaata 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8107423 gttttacttttatgtcgattaggaaattagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaata 8107324  T
Q  417 cgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  8107323 cgcaactccctgtggacacgatcctattatactt 8107290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22321632 - 22321210
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||    
T  22321632 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattagactacccaattgactttttg 22321533  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  22321532 atcgtttaaaagtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 22321433  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22321432 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 22321333  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  22321332 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgca 22321233  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  22321232 actccctgtggacacgatcctat 22321210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 31878930 - 31879358
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  31878930 atgttagtatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaatctatccaatcgattttgtg 31879029  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  31879030 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggaaacaaatgatattgtcg--tgattgtgataatatcg 31879127  T
Q  221 tttaaaa-agctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31879128 tttaaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgaagctgttacgcttggttgatgtctctgactgtaagcgaaatagccctatctcttctcgtt 31879227  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31879228 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgc 31879327  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31879328 aactccctgcggaaacgatcctattatactt 31879358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 10346136 - 10345708
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  10346136 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 10346037  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  10346036 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 10345937  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10345936 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 10345837  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  10345836 tacttttatgtcaattaggaaaatag-tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 10345738  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  10345737 actccctgtggacacgatcctattatactt 10345708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45500546 - 45500114
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  45500546 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactt 45500447  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| ||    
T  45500446 tgtggtcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttagacatgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 45500347  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45500346 atcgtttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctc 45500247  T
Q  317 gttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaata 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  45500246 gttttacttttatgtcgattaggaaaatagctttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgagaaaatgcttatgaaata 45500147  T
Q  417 cgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    ||| ||||| ||  |||||| || |||||||||    
T  45500146 cgcaactccttgtagaaacgatcatattatact 45500114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12090291 - 12089861
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  12090291 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 12090192  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatatt-gtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||| ||  |    
T  12090191 atcctttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaacctcttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatatttgtcgagtgattgtgataatatc 12090092  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12090091 gtttaaaaagctagaatacgataatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgtt 12089992  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  12089991 ttacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgc 12089892  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12089891 aactccctgcggaaacgatcctattatactt 12089861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 2631727 - 2632155
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  2631727 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 2631826  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  2631827 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatattatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 2631926  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2631927 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 2632026  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  2632027 tacttttatgtcgtttaggaaaatagttttacacaaacaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 2632126  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  2632127 actccctgtggacacgatcctattatact 2632155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31158107 - 31157685
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  31158107 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 31158008  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  31158007 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 31157908  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  31157907 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgctt 31157808  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  31157807 tacttttatgttgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 31157708  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  31157707 actccctgtggacacgatcctat 31157685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 23795425 - 23795853
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  23795425 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttagtcgattgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 23795524  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  23795525 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 23795624  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23795625 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 23795724  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  23795725 tacttttatgtcaattaggaaaatag-tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 23795823  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  23795824 actccctgtggacacgatcctattatactt 23795853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 31882441 - 31882869
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| || ||||||    
T  31882441 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatacttttgggtgatttaatcggttgggaaatcattgattaaactatccaatcgaatttgtg 31882540  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  31882541 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttggaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 31882640  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31882641 tttaaaaagttagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 31882740  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  31882741 tacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacataaacaaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 31882840  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31882841 actccttgcggaaacgatcctattatact 31882869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 6172846 - 6173275
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  6172846 atgttaatatttgataatcagttttaatctaggacttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 6172945  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||||| |||| ||   |    
T  6172946 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgttgagtgattatgataatatag 6173045  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6173046 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctcttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 6173145  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  6173146 tacgtttatgtcaattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 6173245  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  6173246 actccctgtggacacgatcctattatactt 6173275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 428
Target Start/End: Original strand, 12184195 - 12184597
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  12184195 atgttaaaatttgataatcacttttaatctacgacttaatgcttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 12184294  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  12184295 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgat-----ttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 12184389  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12184390 tttaaaaagctagaatttgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 12184489  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  12184490 tattttcatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacaca 12184589  T
Q  421 actccctg 428  Q
    ||||||||    
T  12184590 actccctg 12184597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 48 - 436
Target Start/End: Original strand, 1954285 - 1954672
Alignment:
Q  48 tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1954285 tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgatcgtataaatgtttagaaaatcgatg 1954384  T
Q  148 tttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcga 247  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1954385 tttaaatgatcccatagaaataacgatatcatttggacactaatgat-ttgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttaatcga 1954483  T
Q  248 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1954484 tcgagagattgcagctgttacgcttggtagatgtctctgaccgcaagcgaaatatccctatctcttctccttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 1954583  T
Q  348 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacg 436  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1954584 tttacacaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaactccctgcggaaacg 1954672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 425
Target Start/End: Original strand, 12191172 - 12191576
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | || || || |||  || ||||||| || ||||||    
T  12191172 atgttaaaatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgttttgtaattcttctatttaactatccaatcgactttgtg 12191271  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  |     
T  12191272 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgattgatattgtcgagtgattgtgataatatca 12191371  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12191372 tttaaaaatctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 12191471  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  12191472 tatttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 12191571  T
Q  421 actcc 425  Q
    |||||    
T  12191572 actcc 12191576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 450
Target Start/End: Original strand, 2477990 - 2478420
Alignment:
Q  20 aatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  2477990 aatgttaatatttgataatcacttttcatctagaacttaatgcttttgggtcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgt 2478089  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||| ||  |    
T  2478090 gattgtttaaatgtttggaaaatcaacatttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacatgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatc 2478189  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2478190 gtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagaaattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaatagctctatctcttctcttt 2478289  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  2478290 ttacttctaggtcgaatagaaaaatagttttactcaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgaaaaatattgtggaaatgcttatgaaatacgc 2478389  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2478390 aactccctgcggaaacgatcctattatactt 2478420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 3544709 - 3544280
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3544709 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 3544610  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || ||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  3544609 attgtttaaatgtttgagaaatcgacatttaaacaatctcttagaaataacaatatcatttggacaaaaatgctattgtcgagtgattgtgataatatcg 3544510  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3544509 tttaaaaagctataattcgttatttgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaacccaagcgaaatagccctatctcttctcattt 3544410  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||   |||| ||||||||||||| |||||| |||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  3544409 tacttttatgtcgaatagataaacagttttattcaaacaaacactttatacccaaacatttaatgcgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 3544310  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3544309 actccctgcggaaacaattctattatactt 3544280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 430
Target Start/End: Original strand, 24483078 - 24483485
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  24483078 atgttaatatttgataatcatttttaatctaga-cttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaa-tcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 24483175  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  24483176 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatccattagaaataacgatatcatttggacccgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 24483275  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  24483276 ttaaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatagccatatatcttctcgttt 24483375  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||     
T  24483376 tacttttatgtcgaataagaaaatagttttacataaacaaacaatttatacccaaacacttgatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgca 24483475  T
Q  421 actccctgcg 430  Q
    ||||||||||    
T  24483476 actccctgcg 24483485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 118 - 449
Target Start/End: Original strand, 22825036 - 22825367
Alignment:
Q  118 gtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcatt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||     
T  22825036 gtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataata 22825135  T
Q  218 ccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcg 317  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22825136 tagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcatctgttacgcttggttgatgtctttgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcg 22825235  T
Q  318 ttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatac 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22825236 tttgacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattatgaaaatgcttatgaaatac 22825335  T
Q  418 gcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
     | |||| ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  22825336 acaactctctatggacacgatcctattatact 22825367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31664326 - 31663914
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| || || |||| || ||| |     
T  31664326 atgttagtatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggg-----------------aaatcgtcgattaaactattcaatcgactttttt 31664244  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| | ||  ||    
T  31664243 attgtttaaatgtttggagaatcgatgtttaaacgacctcttaaaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcaaatgattgtgttaatatcg 31664144  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31664143 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcaggtgttacgcttggttgatgtttctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 31664044  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  31664043 tacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgca 31663944  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    || || |||  ||||| |||||||||||||    
T  31663943 accccttgcaaaaacgatcctattatactt 31663914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 22909448 - 22909765
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||    
T  22909448 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtg 22909547  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  22909548 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22909647  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||    
T  22909648 tttaaaaagctagaatctgttatttgatcgagaaattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccatatctcttctcaatt 22909747  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    |  ||||||||| |||||    
T  22909748 ttattttatgtcaaatag 22909765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 1274918 - 1275236
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  1274918 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 1275017  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  1275018 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1275117  T
Q  221 tttaaaaagctagaat-ctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgt 318  Q
    ||||||| |||||||| | |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||     
T  1275118 tttaaaatgctagaatcccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatggccctatctcttatcg- 1275216  T
Q  319 tttacttttatgtcgaatag 338  Q
     ||| ||||||||| |||||    
T  1275217 attaattttatgtcaaatag 1275236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 22820435 - 22820674
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  22820435 atgttaatatttgataatcaattttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 22820534  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  22820535 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 22820634  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgca 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22820635 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgca 22820674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 115 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 4705115 - 4704814
Alignment:
Q  115 tttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatc 214  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||| |  ||||||||||     
T  4705115 tttgtgatcgtttaaatgttttgaaaatcgatatttaaacgatcccttagaactaacgatatcatttggacacatatggtattgttgagtgattgtgata 4705016  T
Q  215 attccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttc 314  Q
    ||  ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  4705015 atatcgtttaaaaagttagaatccgttatttgatcgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctttgaccccaagcgaaatagtcctatctcttc 4704916  T
Q  315 tcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaa 414  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||    
T  4704915 tcattttacttttctatcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaagcacttaatgtgataaatactgtgaaaatacttatgaaa 4704816  T
Q  415 ta 416  Q
    ||    
T  4704815 ta 4704814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 224 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19471864 - 19471636
Alignment:
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattg--cagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtttt 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19471864 aaaaagctagaatccgttaatcaatcgagagagagagcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgtttt 19471765  T
Q  322 acttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcga 421  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  19471764 acctttatgtcgattaggaaaatagttttacacgaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaa 19471665  T
Q  422 ctccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  19471664 ctccctgtggacacgatcctattatactt 19471636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19472021 - 19471864
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  19472021 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 19471922  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatca 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471921 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatca 19471864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29032622 - 29032345
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||| ||||||| | ||||| || || ||||||||     
T  29032622 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcaattaattgattgagaaatcatcgattaaatgatccgatcgactttgtgatt 29032523  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttt 223  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||| |  |||||||||| ||  |||||    
T  29032522 gtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacggatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgttt 29032423  T
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29032422 aaaaagctagaatctgtaatttgatcgtgagaatgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 29032345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7653053 - 7652624
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  7653053 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 7652954  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  7652953 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 7652854  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7652853 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 7652754  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  7652753 tacttttatgtcgattaggaaattagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 7652654  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7652653 actccctgtggacacgatcctattatactt 7652624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 9989726 - 9990155
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  9989726 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 9989825  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  9989826 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9989925  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9989926 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 9990025  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  9990026 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgca 9990125  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  9990126 actccctgtggacacgatcctattatactt 9990155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4742834 - 4742405
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| || ||||||    
T  4742834 atgttaatatttaataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggtttggaaattgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 4742735  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||  ||    
T  4742734 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggtcacgaatgatattttcgagtgattgtgataatatcg 4742635  T
Q  221 ttt-aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4742634 ttttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgtt 4742535  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4742534 ttacttttatgtagattaggaaaatagttttacacaaaaaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgc 4742435  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4742434 aactccctgcggaaacgatcctattatact 4742405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10385901 - 10385479
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  10385901 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 10385802  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  10385801 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 10385702  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10385701 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgctt 10385602  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  10385601 tactttcatgttgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 10385502  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  10385501 actccctgtggacacgatcctat 10385479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 36469267 - 36468838
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||  || ||||||    
T  36469267 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcggttaaaatatctaaacgactttgtg 36469168  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  36469167 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 36469068  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36469067 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatttctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 36468968  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||     
T  36468967 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaagtgcttatgaaatacgca 36468868  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36468867 actccctgcggaaacgatcctattatactt 36468838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 52307916 - 52307487
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||  || ||||||    
T  52307916 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactacccaaacgactttgtg 52307817  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  52307816 atcgtttaaatgtttgtgaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 52307717  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52307716 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 52307617  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  52307616 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 52307517  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  52307516 actccttgtggacacgatcctattatactt 52307487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 8625954 - 8626376
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  8625954 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 8626053  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  8626054 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 8626153  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8626154 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattt 8626253  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  8626254 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgca 8626353  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  8626354 actccctgtggacacgatcctat 8626376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20963087 - 20962660
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||    
T  20963087 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggactcaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcatcgattaaactatccaatcgactttgtg 20962988  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  20962987 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgttgaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 20962888  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20962887 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 20962788  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  20962787 tgcttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacact--atgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 20962690  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  20962689 actccctacagaaacgatcctattatactt 20962660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27850382 - 27849954
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  27850382 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggctaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 27850283  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  27850282 atcgtttaaatgtttgggaaaccgatgtttaaacgatcccttagaaataatgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 27850183  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  27850182 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagctctatctcttctcactt 27850083  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  27850082 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 27849983  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  27849982 actctctgtggacacgatcctattatact 27849954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 48168025 - 48167593
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  48168025 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgaatttgtg 48167926  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  48167925 agcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttgaacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 48167826  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  48167825 tttaaaaaactagaattcgttaatcgatcgagagattgcagccgttacacttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccgtatctcttcttgttt 48167726  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacact---ttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatac 417  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  48167725 tacttttttgtcaaataggaaaatagttttacgcaaacaaacaatttattatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatac 48167626  T
Q  418 gcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    || ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  48167625 gcaactccctgtcgaaacgatcctattatactt 48167593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 447
Target Start/End: Original strand, 33248320 - 33248746
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  33248320 atgttaatatttgataatcactttttatctcgaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcaactttgtg 33248419  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||| |  ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  33248420 attgtttaaatgtatgagaaatcgacatttaaacaatctcttagaaataacgatatcatttggacgcgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 33248519  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  33248520 tttaaaaagctagaattcgttatttgatcgagagattgcatctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcattt 33248619  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  33248620 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 33248719  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattata 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33248720 actccctgcggaaacgatcctattata 33248746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 37023019 - 37023450
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctaga--acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| || ||||    
T  37023019 atgttgatatttgataatcacttttaatctatatgatttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaactatccaatcgactttg 37023118  T
Q  119 tgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattc 218  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||      
T  37023119 tgatcgtttaaatgtttggaaaaacgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacggatgatattgtcgagtgattgtgataatat 37023218  T
Q  219 cgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgt 318  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37023219 cgtttaaaaagttaggatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcat 37023318  T
Q  319 tttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacg 418  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  37023319 tttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacgcaaacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatg 37023418  T
Q  419 cgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
      |||||||| |||  || || ||||||||||    
T  37023419 taactccctgtggactcgatcatattatactt 37023450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 392
Target Start/End: Original strand, 22097997 - 22098368
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  22097997 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggttaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 22098096  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||        
T  22098097 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatataa 22098196  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||    
T  22098197 tttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcattt 22098296  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaa 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22098297 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaa 22098368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 24 - 417
Target Start/End: Original strand, 20837427 - 20837820
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| || || ||||||    
T  20837427 ttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcatcgattaaattatccaatcgacttcgtgatc 20837526  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttt 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   ||||    
T  20837527 gtttgaatgtttgggaaatcgacgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttt 20837626  T
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttac 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20837627 aaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccacaagcggaatagccctatctcttctcgttttac 20837726  T
Q  324 ttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatac 417  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  20837727 ttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatac 20837820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 381
Target Start/End: Original strand, 45527978 - 45528338
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  45527978 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 45528077  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||  ||    
T  45528078 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtgtaaacgatcccttagaaataacgacaacatttggacacgaatgacattgtcgagtgattgtgataatatcg 45528177  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  45528178 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattt 45528277  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacactt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  45528278 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacactt 45528338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 85 - 449
Target Start/End: Original strand, 22098375 - 22098739
Alignment:
Q  85 ggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttgga 184  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22098375 ggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttgga 22098474  T
Q  185 cacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctc 284  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22098475 cacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatataatttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctt 22098574  T
Q  285 tgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaat 384  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||     
T  22098575 tgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcattttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaac 22098674  T
Q  385 gtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  22098675 gtgacaaatattgtgaaaatgtttatgaaatatgcaactccctgtggacacgatcctattatact 22098739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1232322 - 1232006
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  1232322 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtg 1232223  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  ||    
T  1232222 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcctttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcg 1232123  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |   |||||||||||  ||    
T  1232122 tttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgatatggtcatatctcttctctatt 1232023  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    || ||||||||| |||||    
T  1232022 ta-ttttatgtcaaatag 1232006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 3588731 - 3589010
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  3588731 atgttaatatttgataatcacttataatctaggacttaatgcttttgggtcatttagtcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 3588830  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  3588831 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 3588930  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  3588931 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagattacagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaat 3589010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37471522 - 37471244
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  37471522 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaattcttttggataatttaatcagttgagaaatcgtcgattaaattatccaatcgactt 37471423  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  37471422 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 37471323  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagc 295  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  37471322 atcgtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgtttgcttgatgtcgctgaccgcaagc 37471244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 49434428 - 49434642
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  49434428 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 49434527  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||  |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  49434528 attatttaaatgtttgagaaatcgacatttaaacaatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 49434627  T
Q  221 tttaaaaagctagaa 235  Q
    |||||||||||||||    
T  49434628 tttaaaaagctagaa 49434642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Original strand, 23411817 - 23412000
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||    
T  23411817 tttgataatcacttttaatctagaacttaattcttttgggtaatttattcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaa 23411916  T
Q  130 atgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgat 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  23411917 atgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgat 23412000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Original strand, 23194250 - 23194545
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||      
T  23194250 atgttaatatttgataaacacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttaggaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgca 23194349  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || ||||||  |||| ||||||| |  ||| ||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||  ||    
T  23194350 attgtttaatagtttgggaaatcaacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcg 23194449  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   |||||||||||    
T  23194450 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatggtcatatctcttctc 23194545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 250 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 11260389 - 11260203
Alignment:
Q  250 gagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 349  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11260389 gagagattgcagctgttacacttggttagtgtctccgaccgcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttt 11260290  T
Q  350 tgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacg 436  Q
    | | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11260289 tacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaagtccctgcggaaacg 11260203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 2357491 - 2357771
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | || ||||| || ||||||    
T  2357491 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggatcaattaattgattgggaaatcatcgattaaatgaaccaatcgactttgtg 2357590  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   | | |||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||| |  |||||||||| ||  ||    
T  2357591 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagttcattagaaatcacgacatcatttggacacaaatgatgttgttgagtgattgtgataatatcg 2357690  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2357691 tttaaaaagttagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 2357771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 322
Target Start/End: Original strand, 27104326 - 27104624
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaa----tcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    | | ||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  27104326 tttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttggatcaattaacatatagattgagaaatcgtcgattaaatgatccaatcgactttgtgatcgt 27104425  T
Q  126 ttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttta 224  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |  |||||||||| ||  ||||||    
T  27104426 ttaaatagtttgggaaatcgacatttaaatgatcccttcgaaataacgatatgatttggacatgaatgatgttgttgagtgattgtgataatatcgttta 27104525  T
Q  225 aaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtttta 322  Q
    || |||||||||  |||| | || |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||  |||| ||| |||||||||    
T  27104526 aatagctagaattcgttatttgaacgagaggttgtagctgttacgcttagttgagtgtctctgaccccaaacaaaatagtcctatatctactcgtttta 27104624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 322
Target Start/End: Original strand, 23394099 - 23394201
Alignment:
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  23394099 gtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaataaccctatctcttctcgtt 23394198  T
Q  320 tta 322  Q
    |||    
T  23394199 tta 23394201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 26335439 - 26335562
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||| || ||||||    
T  26335439 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttatgggtcgtttaataggtttggaaatcgtcaattaaatgatccaatcgactttgtg 26335538  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcg 144  Q
    || |||||||||||| || |||||    
T  26335539 atagtttaaatgtttggggaatcg 26335562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 443
Target Start/End: Original strand, 23382950 - 23383057
Alignment:
Q  336 taggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaac 435  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| || |||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  23382950 taggaaaatagttttacacaaacaaacaattaatacccaaacacttaacgtcacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacac 23383049  T
Q  436 ggtcctat 443  Q
    | ||||||    
T  23383050 gatcctat 23383057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 443
Target Start/End: Original strand, 23396965 - 23397048
Alignment:
Q  359 aaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  23396965 aaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatg-aatacgcaactccctgtggatacgatcctat 23397048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24899591 - 24899443
Alignment:
Q  191 tgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgacc 289  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||  ||||||||||   |||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||    
T  24899591 tgatattgtcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaattcagaatccgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggtcgagtatctatgacc 24899492  T
Q  290 gcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
     |||||||||| ||  ||||||||||   ||| |||||||||| |||||    
T  24899491 ccaagcgaaatggccatatctcttctatattttcttttatgtcaaatag 24899443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24906057 - 24905909
Alignment:
Q  191 tgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgacc 289  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||  ||||||||||   |||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||    
T  24906057 tgatattgtcaagtgattgtgataatatcgtttaaaaattcagaatccgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggtcgagtatctatgacc 24905958  T
Q  290 gcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
     |||||||||| ||  ||||||||||   ||| |||||||||| |||||    
T  24905957 ccaagcgaaatggccatatctcttctatattttcttttatgtcaaatag 24905909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9067998 - 9067569
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  9067998 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 9067899  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  9067898 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9067799  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9067798 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 9067699  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  9067698 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaaagtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 9067599  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  9067598 actccctgtggacacgatcctattatactt 9067569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 427
Target Start/End: Original strand, 28370424 - 28370830
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  28370424 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaaattaatcggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 28370523  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  28370524 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 28370623  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28370624 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 28370723  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  28370724 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 28370823  T
Q  421 actccct 427  Q
    |||||||    
T  28370824 actccct 28370830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8743114 - 8742685
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  8743114 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 8743015  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  8743014 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 8742915  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8742914 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcaactgttacccttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 8742815  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  8742814 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacatttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 8742715  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  8742714 actccctgtggacacgatcctattatactt 8742685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11308818 - 11308389
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||  || ||||||    
T  11308818 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactgcccaaacgactttgtg 11308719  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  11308718 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 11308619  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11308618 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgaaagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 11308519  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  11308518 tacttttatgtcgattaggaaaataattttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 11308419  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11308418 actccctgtggacacgatcctattatactt 11308389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28925974 - 28925552
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  28925974 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 28925875  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  28925874 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 28925775  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28925774 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 28925675  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||||     
T  28925674 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgggaaaatgcttatgaaatacgca 28925575  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  28925574 actccctgtggacacgatcctat 28925552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 3299132 - 3299561
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  3299132 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 3299231  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  3299232 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 3299331  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3299332 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 3299431  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  3299432 tacttttatgttgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtaacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgca 3299531  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  3299532 actccctgtggacacgatcctattatactt 3299561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 41577159 - 41576733
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || |||||||||    
T  41577159 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtgatc 41577060  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttt 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   ||||    
T  41577059 gtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagttt 41576960  T
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttac 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  41576959 aaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgacagcaagcggaatagccatatctcttctcgatttac 41576860  T
Q  324 ttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgact 423  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41576859 ttttatgtaaattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaact 41576760  T
Q  424 ccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  41576759 ccctgtggacacgatcctattatactt 41576733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 34006604 - 34006175
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||  ||  | ||||||    
T  34006604 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgtttaaattatcttatctactttgtg 34006505  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  34006504 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaagatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 34006405  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  34006404 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctctttt 34006305  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  34006304 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaataatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtaaaaatgcttatgaaatacgca 34006205  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  34006204 acttcctgtggacacgatcctattatactt 34006175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 27348357 - 27348786
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  | ||||||    
T  27348357 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcaactttgtg 27348456  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  27348457 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatgg 27348556  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27348557 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcaagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 27348656  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||     
T  27348657 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttataccccaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgca 27348756  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    | |||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  27348757 attccctgtggacacgattctattatactt 27348786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 24 - 450
Target Start/End: Original strand, 16958886 - 16959311
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||     
T  16958886 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactctgtgatt 16958985  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttt 223  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||  | |||    
T  16958986 gtttaaatgtttgagaaattgacatttaaacgat-ccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcattt 16959084  T
Q  224 aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttac 323  Q
    | ||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16959085 ataaagc-agaatccgttatttaatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctttaaccccaagcgaaatagccctatctcgtctcgttttac 16959183  T
Q  324 ttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgac 422  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16959184 ttttatgtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaac 16959283  T
Q  423 tccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16959284 tccctgcggaaacgatcctattatactt 16959311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 13510294 - 13510576
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  13510294 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 13510393  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  13510394 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaattaccgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 13510493  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagc 303  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  13510494 tttaaaaaggtagaatccgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagtgaaatagc 13510576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 13599824 - 13600106
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  13599824 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 13599923  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  13599924 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaattaccgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 13600023  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagc 303  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  13600024 tttaaaaaggtagaatccgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagtgaaatagc 13600106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22222506 - 22222189
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||    
T  22222506 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtg 22222407  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  22222406 attgttttaatgttcgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22222307  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||  |    
T  22222306 tttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggccctatctcttctctat 22222207  T
Q  320 ttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  22222206 tta-ttttatgtcaaatag 22222189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22228848 - 22228531
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||    
T  22228848 atgttaatatttgataatcatttttaaactagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtg 22228749  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  22228748 attgttttaatgttcgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22228649  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||  |    
T  22228648 tttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggccctatctcttctctat 22228549  T
Q  320 ttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  22228548 tta-ttttatgtcaaatag 22228531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22243074 - 22242757
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||     
T  22243074 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattgaactatccaatcgactttgta 22242975  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  22242974 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaaagatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 22242875  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||   | ||||||||||||  |    
T  22242874 tttaaaaagccagaatccgttatttgatcgcgagattgcagttgttatgcttggttgagtgtctctgacccgaagcgaaaggaccctatctcttctctat 22242775  T
Q  320 ttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  22242774 tta-ttttatgtcaaatag 22242757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13849160 - 13848730
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  13849160 atgttaatctttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttagatcaattaatagattgggaaatcatcgattaaatgatccaatcgattttgtg 13849061  T
Q  121 atcgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    ||| ||||||| |||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || |||||| |  |||||||||| ||  |    
T  13849060 atcatttaaatagtttggaaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgctatcatttgaacatgaatggtattgttgagtgattgtgataatatc 13848961  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgt 318  Q
      |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||     
T  13848960 acttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctctactcga 13848861  T
Q  319 tttacttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatac 417  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||    ||  || |||||| || ||||    
T  13848860 tttacttttatgtcaaatagttaaaatagttttacacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaattgcttaagatatac 13848762  T
Q  418 gcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13848761 gcaactccctgcggaaacgatcctattatact 13848730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 12538494 - 12538774
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  12538494 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtcatttaatcgattagaaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 12538593  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  12538594 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaattccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 12538693  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12538694 tttaaaaagctagaatccattatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 12538774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22233681 - 22233385
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||    
T  22233681 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtg 22233582  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||  ||    
T  22233581 attgttttaatgtttggaaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtggagtgattgtgataatatcg 22233482  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |  ||||||||||||    
T  22233481 tttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaaattgcagttgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggtcctatctcttctc 22233385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 195 - 450
Target Start/End: Original strand, 22181081 - 22181336
Alignment:
Q  195 attgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaag 294  Q
    |||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  22181081 attgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgattcgttgatgtctctgactgcaag 22181180  T
Q  295 cgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaa 394  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22181181 cggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaata 22181280  T
Q  395 tcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  22181281 ttgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatactt 22181336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4861782 - 4861487
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||| |    
T  4861782 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgatccgatcgactttgcg 4861683  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||  ||    
T  4861682 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatcg 4861583  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |   |||||||||||    
T  4861582 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagagattgcagctgttacgcttggttggtatctctgaccccaagcgaaatggtcatatctcttctc 4861487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Original strand, 17993197 - 17993492
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || || |||| |    
T  17993197 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgcttggaaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgcg 17993296  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||| ||  ||    
T  17993297 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcaagtgattgtgataatatcg 17993396  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  17993397 tttaaaaagctagaattcgttatttgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctgaccccaagcgaaatggtcctatctcttctc 17993492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22227297 - 22227043
Alignment:
Q  63 ttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatccctt 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22227297 ttttgggtcatttaatctgttgggaaatcgtcgattaaacgatccagtcgactttgtgattgttttaatgtttggaaaatcgacatttaaacgatccctt 22227198  T
Q  163 agaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagc 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||     
T  22227197 agaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtggagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgaaattgcagt 22227098  T
Q  263 tgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |  ||||||||||||    
T  22227097 tgttacgcttggttgagtatctctgaccccaagtgaattggtcctatctcttctc 22227043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36737034 - 36736821
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatc 123  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||| |||| || |||||||||    
T  36737034 ttaatctttgataatcactattaatctagaacttgaagcttttgagtcatttaatagattgggaaatcatcgattaaatgatgcaatcgactttgtgatc 36736935  T
Q  124 gtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttt 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  |||||    
T  36736934 gtttaaatgtttgtgaaatcgatatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcgttt 36736835  T
Q  224 aaaaagctagaatc 237  Q
    |||| |||||||||    
T  36736834 aaaatgctagaatc 36736821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 21692777 - 21692957
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||| || ||||||    
T  21692777 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatttttgattaaacgatccaatcgactttgtg 21692876  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcg 201  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21692877 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataatgatatcatttggacacgaatgatattgtcg 21692957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 22180932 - 22181081
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  22180932 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 22181031  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 170  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22181032 atcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataa 22181081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 443
Target Start/End: Original strand, 16583062 - 16583129
Alignment:
Q  376 acacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||    
T  16583062 acacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccatgtggacacgatcctat 16583129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 338
Target Start/End: Original strand, 1607785 - 1607918
Alignment:
Q  206 attgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtct-ctgaccgcaagcgaaatagca 304  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||| || |||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||   | || ||| ||||||||||  |     
T  1607785 attgtgataatatcgtttaaaaagttagattccgttatttggtcaagagattgcagttgttacgcttggttgattaattctaaccccaagcgaaatgacc 1607884  T
Q  305 ctatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  1607885 ctatctcttctctatttatttttatgtcaaatag 1607918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16904440 - 16904011
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  16904440 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 16904341  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  16904340 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 16904241  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16904240 ttttaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 16904141  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  16904140 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 16904041  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16904040 actccctgtggacacgatcctattatactt 16904011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27166929 - 27166501
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  27166929 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 27166830  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  27166829 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacaatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 27166730  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27166729 tttaaaaagctacaattcgttaatcgatcgagagattgcaacttttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 27166630  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  27166629 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 27166530  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27166529 actccctgcggaaacgatcctattatact 27166501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 9404755 - 9405184
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  9404755 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 9404854  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||   |    
T  9404855 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatag 9404954  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9404955 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 9405054  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  9405055 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 9405154  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  9405155 actccctgtggacacgatcctattatactt 9405184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 34456626 - 34457055
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  34456626 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 34456725  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  34456726 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 34456825  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  34456826 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcagaatagccctatctcttctcgttt 34456925  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  34456926 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 34457025  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  34457026 actccctgtggacacgatcctattatactt 34457055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 7315535 - 7315964
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  7315535 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 7315634  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  7315635 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 7315734  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7315735 tttaaaaagttagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 7315834  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  7315835 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaataaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 7315934  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7315935 actccctgtggacacgatcctattatactt 7315964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 11767085 - 11767507
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||    
T  11767085 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgattttgtg 11767184  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  11767185 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgaccccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 11767284  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11767285 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 11767384  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  11767385 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 11767484  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  11767485 actccctgtggacacgatcctat 11767507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30606907 - 30606478
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  30606907 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 30606808  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  30606807 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatatttaaacgatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 30606708  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30606707 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 30606608  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  30606607 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttataccctaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 30606508  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  30606507 actccctgtggacacgatcctattatactt 30606478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11723107 - 11722678
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  11723107 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 11723008  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  11723007 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 11722908  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11722907 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 11722808  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  11722807 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 11722708  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11722707 actccctgtggacacgatcctattatactt 11722678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 24836053 - 24836482
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  24836053 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 24836152  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  24836153 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 24836252  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  24836253 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctggttt 24836352  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  24836353 tacttttatgtcaattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 24836452  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||| |||  ||| ||| |||||||||||||    
T  24836453 acttcctttggacacgatcctattatactt 24836482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 33434933 - 33435362
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| || ||||||    
T  33434933 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgacgattaaactacccaatcgactttgtg 33435032  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  33435033 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 33435132  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  33435133 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagcagttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttatcgttt 33435232  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  33435233 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 33435332  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||  || ||| ||| |||||||||||||    
T  33435333 actctttgtggacacgatcctattatactt 33435362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 14344792 - 14345220
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  14344792 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 14344891  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  14344892 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataaagatatcatttgaacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 14344991  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  14344992 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagctctatcttttctcgttt 14345091  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  14345092 tacttttatgtcgattaggaaaatag-tttacacagacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaacattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 14345190  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  14345191 actccctgtggacacgatcctattatactt 14345220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 6270220 - 6270649
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttggg-aaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  6270220 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgctttttggtaatttaatcggttggggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgt 6270319  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  |    
T  6270320 gatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatc 6270419  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  6270420 gtttaaaaagctagaatccgttaatcaatcaagagattgcagctgttacgcatggttgatgtctctgacagcaagcgaaatgaccctatctcttctcgtt 6270519  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  6270520 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacataaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgcaatacgc 6270619  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
     ||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  6270620 aactccctacgaaaatgatcctattatact 6270649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34869577 - 34869147
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| || ||||||    
T  34869577 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcctcgattaaattatccaatcgactttgtg 34869478  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatccctt-agaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  |    
T  34869477 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatccctttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatc 34869378  T
Q  220 gtttaaaaa-gctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgt 318  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||     
T  34869377 gtttaaaaaagctagaatccgttaattaatcgagaggttgcagttgttacacttggttgatgtctctgacccccagcgaaatagccctatctcttctcgc 34869278  T
Q  319 tttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacg 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  34869277 tttacttttatgttgaataggaagatagttttacacaaacaaacaatttatacctaaacacttaatatgataaatattatgaaaatacttatgaaatacg 34869178  T
Q  419 cgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    | | | ||| |||||||| ||||||||||||    
T  34869177 caatttcctacggaaacgatcctattatact 34869147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37251740 - 37251419
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| || ||    
T  37251740 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcgtttgggaaatcgtcgattaagctatccaatcgactt 37251641  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||    
T  37251640 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataat 37251541  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttct 315  Q
       ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  37251540 atagtttaaaaagctagaatctgttatttgatcgtgagattgtagttgttacgcttggttgagtgtctctgacctcaagcgaaatgaccctatctcttct 37251441  T
Q  316 cgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
    |  |||| ||||||||| |||||    
T  37251440 ctattta-ttttatgtcaaatag 37251419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 300
Target Start/End: Original strand, 32226985 - 32227268
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||    
T  32226985 atgaatgtcaatatttgataatcacttttaatctaggacttagtgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactt 32227084  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  32227085 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 32227184  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
      | |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  32227185 atcatttaaaaagcaagaatccgttaattgatcaagagattgaagttgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgaaat 32227268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 164 - 450
Target Start/End: Original strand, 31846426 - 31846706
Alignment:
Q  164 gaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagct 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31846426 gaaataacgatattatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagct 31846525  T
Q  264 gttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaaca 363  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| |  ||| |||||    
T  31846526 g--acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctccttttacttttatgttgattagg-aaatagttttacataaacaaaca 31846622  T
Q  364 ctttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     ||||||| |||||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  31846623 atttatacccaaacac---ctgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctatggacacgatcctattatactt 31846706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 519360 - 519528
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||  | ||||||    
T  519360 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaattgtcgattaaacgatcaaatcaactttgtg 519459  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacga 189  Q
    || |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  519460 attgtttaaatgtttgggaaatcgacaattaaacgatcccttagagataacgatatcatttggacacga 519528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 31846310 - 31846424
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  31846310 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 31846409  T
Q  121 atcgtttaaatgttt 135  Q
    |||||||||||||||    
T  31846410 atcgtttaaatgttt 31846424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39655865 - 39655652
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||    
T  39655865 ttaatctttgataatcactttgtaatcaagaacttaatggttttgggtcgtttaatagattgggaaatcgtcgattgaacgatccgattgactttctgat 39655766  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtt 222  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||| ||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||| |  |||||||||| || |||||    
T  39655765 tgtttaatagtttgggaaatcgacttttgaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacaaatgatgttgttgagtgattgtgataataccgtt 39655666  T
Q  223 taaaaagctagaat 236  Q
    ||||||| ||||||    
T  39655665 taaaaagttagaat 39655652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 7315296 - 7315342
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7315296 atgttaatatttgataatcatttttaatctagaacttaatgcttttg 7315342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4838967 - 4838538
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  4838967 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 4838868  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  4838867 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 4838768  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4838767 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctaaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 4838668  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  4838667 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 4838568  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  4838567 actccctgtggacacgatcctattatactt 4838538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 22048012 - 22048441
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  22048012 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 22048111  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  22048112 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 22048211  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22048212 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcaactgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 22048311  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  22048312 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 22048411  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  22048412 actccctgtggacacgatcctattatactt 22048441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26373466 - 26373033
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  26373466 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactt 26373367  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |    
T  26373366 tgtgatcgtttaaacgtttgggaaatcaatgtttaaacaatcccttagaaataacaatataatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgatagt 26373267  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
      ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26373266 atcgtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcaagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctc 26373167  T
Q  317 gttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaata 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26373166 gttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaata 26373067  T
Q  417 cgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  26373066 cgcaactccttgcggaaacgatcctatcatactt 26373033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40995378 - 40994949
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||    
T  40995378 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgagtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgaaccaatcgactttgtg 40995279  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||        
T  40995278 atcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattt 40995179  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40995178 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcatgcgaaatagccctatctcttctcgttt 40995079  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||     
T  40995078 tacttttatgtcaaataggaaaatagttttacacaaacaaacactttatacccaaacacttaatgtgacaagtattgtgaaaatgcatatgaaatacgca 40994979  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  40994978 actccctgtagaaacgatcttattatactt 40994949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 35416527 - 35416098
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||    
T  35416527 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcaattaaactatccaatcgactttatg 35416428  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  35416427 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgacctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 35416328  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35416327 tttaacaagctagaatttgttaatcgatcaagagattgcagctgttacgcttggctgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 35416228  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  35416227 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacagaaacaaataatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 35416128  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35416127 actccctgcggaaacgatcctattatactt 35416098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42532717 - 42532295
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  42532717 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 42532618  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  42532617 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 42532518  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42532517 tttaaaatgcttgaatcctttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgatcgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 42532418  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  42532417 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacagttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttacgaaatacgca 42532318  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  42532317 actccctgcggaaacgatcctat 42532295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5273393 - 5272965
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  5273393 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 5273294  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  5273293 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 5273194  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5273193 tttaaaaagctagaatccgttaatcggtcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 5273094  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  5273093 tacttttatgtcgattaggaaaatag-tttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 5272995  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  5272994 actccctgtggacacgatcctattatactt 5272965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21677498 - 21677070
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  21677498 atgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 21677399  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||  ||    
T  21677398 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcgagt-attgtgataatatcg 21677300  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21677299 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctattacacttggttgatgtctctgaccccaagcgaaataacactatctcttctcgttt 21677200  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  21677199 tacttttatgtcgaataagaaaatagttttacacaaacaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 21677100  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21677099 actccctgcggaaacgatcctattatactt 21677070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 52618833 - 52619262
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||    
T  52618833 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcgatcgggaaatcgtcaattaaactatccaatcgactttgtg 52618932  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  52618933 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 52619032  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52619033 attaaaaagatagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccccatctcttctcgttt 52619132  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  52619133 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttataaacaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 52619232  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  52619233 actccgtgcggaaacgatcctgttatactt 52619262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 1188295 - 1188723
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||    
T  1188295 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttgatgcttttgggtgatttaatcggttgggaaatcgtcgaataaactatccaatcgactttgtg 1188394  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  1188395 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgtatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1188494  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  1188495 tttaaaaagctagaatctgctaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtgaaataaccctatctcttctcgttt 1188594  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  1188595 tacttttatgtcgaataggaaaatagtttcacacaaacaaacaatttatacccacacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 1188694  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1188695 actccctacggaaacgatcctattatact 1188723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 323769 - 324191
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |  |||||    
T  323769 atgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcaacgttgtg 323868  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  323869 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 323968  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  323969 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 324068  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  324069 tacttttatgtcgattaggtaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 324168  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  324169 actccctgtggacacgatcctat 324191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 46691868 - 46691440
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  46691868 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttaggtcaattaatcggttgggaaatcatcgattaaacgatccaatcaactttgtg 46691769  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  46691768 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 46691669  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46691668 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgtagctgttacgcttgattgatgtctctgagcgcaagcgaaatagtcctatctcttctcgttt 46691569  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||     
T  46691568 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaccaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaacattatgaaaatacttatgaaatacgca 46691469  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||||||||    
T  46691468 actccttacaaaaacgatcctattatact 46691440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19247659 - 19247232
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  19247659 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 19247560  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  19247559 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggatacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 19247460  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19247459 tttaaaaagttagaatctgttaatctatcgagagattgcagttgttatgcttggttgatgtctctaaccgtaagcgaaatagctctatctcttctcgttt 19247360  T
Q  321 tacttttatgtcgaatagg-aaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| |  |||||||||||    
T  19247359 tacttttatgtcgaataggaaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgggataaacattgtgaaaatac--atgaaatacgc 19247262  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||    
T  19247261 aactccctgcggaaacgatcttattatact 19247232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 26070058 - 26070486
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| || ||||||    
T  26070058 atgttaatatttgataatcacttttagtctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcgattgggaaatcgtcgattaaactatctaatcgactttgtg 26070157  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  26070158 gtcgtttaaatgtttgagaaatcgatgttttaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 26070257  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| |||    
T  26070258 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttatgcttggttgatgtctctgacccgaagtgaaattgccctatctcttctcattt 26070357  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||| ||| | | |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||     
T  26070358 tacttttatgtcgaacaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttgttcccaaacaattaatgtggcaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 26070457  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26070458 actccctgcggaaacgatcctattatact 26070486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 55327107 - 55327531
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    |||||||||| ||| || ||||||| || ||||||    
T  55327107 atgttaatatttgataatcacttttaatctagagcttaatgtttttgggtaatttaatcgg----gaaatcgtcggttaaactatccaatcgactttgtg 55327202  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  55327203 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatat-g 55327301  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  55327302 tctaaaaagctggaatccgttaatcgatcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccctgtctcttctcgttt 55327401  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || || ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  55327402 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaatcaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 55327501  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  55327502 actccctgcggaaacgatcatattatactt 55327531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 54 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21668703 - 21668306
Alignment:
Q  54 acttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaa 153  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21668703 acttaatgcttttaggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaa 21668604  T
Q  154 cgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgttt-aaaaagctagaatctgttaatcgatcgag 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21668603 cgatcccttagaaataacgatatcatttggtcacgaatgatattttcgagtgattgtgataatatcgttttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgag 21668504  T
Q  253 agattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgc 352  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21668503 agattgcagctattactcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaataacactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataagaaaatagttttac 21668404  T
Q  353 gcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||| |||||||||||||  |||||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21668403 acaaacaaacactttatacctaaacactttatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcctattatactt 21668306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 30218217 - 30217788
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||    
T  30218217 atgttaatatttgataatcacttttaatctaaaacttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcatcgattaaa-gatccaatcgactttgtg 30218119  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  30218118 atagtttaaatgtttgggaaatcgacatttagacgatccattagaaataacgatatcatttggacaggaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 30218019  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  30218018 tttaaaaagttagaattcgttatttgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaaccccaagcgagctagccctatctcgtctcgttt 30217919  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30217918 tacttttacgtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgc 30217819  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  30217818 aactctctgcgaaaacgatcttattatactt 30217788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 148 - 450
Target Start/End: Original strand, 33239375 - 33239676
Alignment:
Q  148 tttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcga 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33239375 tttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcga 33239474  T
Q  248 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33239475 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtttctgaccgcaagcggaatagccctaactcttctcattttacttttatgtctattaggaaaatagt 33239574  T
Q  348 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 447  Q
    ||| | ||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33239575 tttacacaaa-caacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattata 33239673  T
Q  448 ctt 450  Q
    |||    
T  33239674 ctt 33239676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 95 - 450
Target Start/End: Original strand, 42271781 - 42272136
Alignment:
Q  95 gattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgat 194  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42271781 gattaaactatccaatcgactttgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacggccttttagaaataatgatatcatttggacacgaatgat 42271880  T
Q  195 attgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaa-gctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaa 293  Q
    |||||||  |||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||    
T  42271881 attgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaagttagaatccgttaattgatcgagaggttgcagctgttacgcttgattgatgcctctgaccctaa 42271980  T
Q  294 gcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaa 393  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  42271981 gcgaaatatc-ctatctcttctcgttttactttattgttgaataggaaaatagttttacacaaataaacactttatacccaaacacttaaagtgataaat 42272079  T
Q  394 atcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42272080 attgtgaacatacttatgaaatatgcaactccatgcggaaacgatcctattatactt 42272136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 20949076 - 20949506
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||| || ||||||    
T  20949076 atgttaatctttgataatcacttttaatctagaatttaatgtttttggatcaattaatagattggaaaatcatcgattaaatgatccaatcgactttgtg 20949175  T
Q  121 atcgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
     |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||  |    
T  20949176 gtcgtttaaatagtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatgtc 20949275  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgt 318  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||     
T  20949276 gtttaaaaagctagaatccgttatttaatcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaagtagccttatctctactcga 20949375  T
Q  319 tttacttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatac 417  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||    ||  ||||||||| || ||||    
T  20949376 tttacttttatgtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatac 20949474  T
Q  418 gcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    || ||| || |||||| || || |||||||||    
T  20949475 gcaacttccagcggaatcgatcttattatact 20949506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 332
Target Start/End: Original strand, 53895709 - 53896021
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  53895709 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaccttaatgtttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtctattaaacgatccaatcgactttgtg 53895808  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  ||||||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  53895809 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttaaatagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 53895908  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  53895909 tttaaaaatctagaatctgttatttgatcgtgagattgcagttgttaggcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctctat 53896008  T
Q  320 ttacttttatgtc 332  Q
    ||| |||||||||    
T  53896009 ttatttttatgtc 53896021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 220 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44429023 - 44428799
Alignment:
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  44429023 gtttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtggtatagccctatctcttctcgtt 44428924  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44428923 ttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgc 44428824  T
Q  420 gac-tccctgcggaaacggtcctat 443  Q
     || |||||| ||| ||| ||||||    
T  44428823 aacttccctgtggacacgatcctat 44428799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33110533 - 33110235
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  33110533 atgttaatatttgataatcacttttaatctataacttaatgttcaggggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 33110434  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||   |    
T  33110433 attgtttaaatgtttgggagatcgacatttgaacaatcccttagaaatcacgacaacatttggacacgaatgatgttgttgagtgattgtgataatattg 33110334  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagaga--ttgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
    |||||||||||||||||   || | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  33110333 tttaaaaagctagaatccaatatttgatcgtgagattttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagtcatatctcttctc 33110235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9417264 - 9417072
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  9417264 atgttaatattttacaatcacttttaatctagaatttaatgcttttggtttgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcgactttgtg 9417165  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgat 213  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  9417164 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccctagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgat 9417072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19731065 - 19730985
Alignment:
Q  192 gatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgctt 272  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19731065 gatattgtcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgctt 19730985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 279
Target Start/End: Original strand, 6640476 - 6640551
Alignment:
Q  204 tgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgat 279  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6640476 tgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcacgagattgcagttgttacgcttggttgat 6640551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19730984 - 19730922
Alignment:
Q  388 acaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  19730984 acaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatactt 19730922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Original strand, 8895205 - 8895275
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgatta 99  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  8895205 tttgataatcactttgaaatcaagaacttaatgcttttggatcgtttaataggttgagaaatcatcgatta 8895275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13230173 - 13229744
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  13230173 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttagttcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 13230074  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||  ||    
T  13230073 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatcg 13229974  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13229973 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 13229874  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||     
T  13229873 tacttttatgttgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattataaaaatgcttataaaatacgca 13229774  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  13229773 actccatgtggaaacgatcatattatactt 13229744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 29224045 - 29224467
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  29224045 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 29224144  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  29224145 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 29224244  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29224245 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 29224344  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  29224345 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 29224444  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  29224445 actccctgtggacacgatcctat 29224467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 29337344 - 29337766
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  29337344 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 29337443  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  29337444 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 29337543  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29337544 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 29337643  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  29337644 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 29337743  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  29337744 actccctgtggacacgatcctat 29337766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 27257715 - 27258144
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  27257715 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 27257814  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  27257815 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 27257914  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  27257915 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgattggttgatgtctctaaccccaagtgaaattgccctatctcttctcgttt 27258014  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  27258015 tacttttatgtcaaataggaaaatagttttacacaaacaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 27258114  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  27258115 acttcctgcggaaacaatcatattatactt 27258144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 42700802 - 42700376
Alignment:
Q  23 gttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  42700802 gttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgctttttggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtgat 42700703  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  | ||    
T  42700702 cgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcatt 42700603  T
Q  223 taaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtttta 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  42700602 taaaaagctagaatccgttaatcgatcgagaga-tgtagttgttacgcttggttgatgtctccgactgcaagccaaatagccatatctcttctcgtttta 42700504  T
Q  323 cttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgac 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  42700503 cttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgcaac 42700404  T
Q  423 tccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42700403 tccctgcggaaacgatcctattatactt 42700376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 435
Target Start/End: Original strand, 32523259 - 32523675
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  32523259 atgttaatatttgataatcacttttaatctaaaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgagaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 32523358  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  32523359 atcgtttaaatatttgggaaatcgatgtttcaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 32523458  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32523459 tttaaaaagctagaatatgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttatcgttt 32523558  T
Q  321 tacttttatgtc--gaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacg 418  Q
    || |||||||||   | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  32523559 taattttatgtcataagtaggaaaatagttttacacaaacaaacactttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgtttatgaaatatg 32523658  T
Q  419 cgactccctgcggaaac 435  Q
    | ||||||||| |||||    
T  32523659 caactccctgcagaaac 32523675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23924863 - 23924435
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| || ||||||    
T  23924863 atgttaatttttgataatcacttttaatctaggttttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcaattaaattatccaatcgactttgtg 23924764  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  23924763 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 23924664  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||    
T  23924663 tttaaaaagcaagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgtttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatggccctatctcttattgttt 23924564  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  23924563 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacagaaacgaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 23924464  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23924463 actccctacggaaacgatcctattatact 23924435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36667700 - 36667291
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  36667700 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatccgttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 36667601  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||||| ||  ||    
T  36667600 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgttt------tcccttagaaataacgatatcatttggacacgagtgat-------------tgtgataatatcg 36667520  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36667519 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagatttcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaattgccctatctcttctcgttt 36667420  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  36667419 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatattcaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 36667320  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36667319 actccctgcggaaacgatcctattatact 36667291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28457708 - 28457279
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||    
T  28457708 atgttaatatttgataattacatttaatctagaatttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcaactttgtg 28457609  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  28457608 attgtttaaatgtttgggaaatagacatttaaacaatctcttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 28457509  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28457508 ttttaaaagctagaatccgttatttgatcgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcattt 28457409  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||     
T  28457408 tacttttatgtcaaatagaaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 28457309  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28457308 actccctgcggaaacgatcatattatactt 28457279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 36040093 - 36039664
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||| ||    
T  36040093 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttgatgtttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatcctatcgactttttg 36039994  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  36039993 attgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttataaataacgatatcatttggacatgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 36039894  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36039893 tttaaaaagctagaatcctttaatcgatcgagagattgtatttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcattt 36039794  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||     
T  36039793 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcatatgaaatacgca 36039694  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| || | | ||| |||||||||||||    
T  36039693 actccttgtgaacacgatcctattatactt 36039664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 43991856 - 43992272
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||| || ||||||    
T  43991856 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacgtaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgataaaactatctaatcgactttgtg 43991955  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  43991956 atcgtttaaatgtttgggaaatcgat-----------cccttagaaataacgatatcatttggacactaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 43992044  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43992045 tttaaaaagctagaatatgttaattgatcgagagattgcagatgttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 43992144  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  43992145 tac-tttatgtcgattaggaaaatagttttgcgcaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 43992243  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| || || |||| |||||||||||||    
T  43992244 actccatgtgg-aacgatcctattatactt 43992272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Original strand, 14700974 - 14701404
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  14700974 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatatttttaggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 14701073  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  14701074 attgtttaaatgtttggaaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcttttagacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 14701173  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    | ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  14701174 tctaaaaagctagaatccgtttattgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatttctaaccccaagcgaaatagctctatcttgtctcgttt 14701273  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  14701274 tacttttatgtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacactcaatgtgataaatattatgaaaatgcttatgaaatacgc 14701373  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14701374 aactccctgcggaaacgatccaattatactt 14701404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 36557393 - 36556964
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  36557393 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcattcaaacggctgggaaatcgtcgattatacaatgcaatcgactttgtg 36557294  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || || ||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| ||  ||    
T  36557293 attgtgtaaatgtttggaaaattgacatttaaacgatcccttataaataacgatatcatttggacacgaatgatattatcaagtgattgtgataatatcg 36557194  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36557193 tttaaaaggctagaatccgttatttgatcgagagattgcaactgttacgctttgttgatatctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 36557094  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |     
T  36557093 tacttttatgtcgaataaaacaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacaca 36556994  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36556993 actccctgcggaaacgatcatattatactt 36556964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 120 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8679527 - 8679197
Alignment:
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  |    
T  8679527 gatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatc 8679428  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  8679427 gtttaaaaagatagaatctattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctccgaccgcaagctagataaccctatctcttctcgtt 8679328  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |    
T  8679327 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaattattc 8679228  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8679227 aactccctgtggaaacgatcctattatactt 8679197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9786935 - 9786588
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||    
T  9786935 atgtcaatatttgataatcacttttaatccaagacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgattcaatcgactttgtg 9786836  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  ||    
T  9786835 attgtttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaattccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcg 9786736  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  9786735 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgatagattgcagttgttacgcttggttgatgtctttgaccccaagcgaaataattctatctcttatcgttt 9786636  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacacttta 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  9786635 tacttttatgtcgaatagaaaaatagttttacacaaataaacatttta 9786588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 21160296 - 21160560
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  21160296 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtg 21160395  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||  ||    
T  21160396 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgccgagtgattgtgataatatcg 21160495  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctct 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21160496 tttaaaaagttagaatctgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctct 21160560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 41977925 - 41978242
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| || ||||||    
T  41977925 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgagaaatcgtcgattaagctatccaatcgactttgtg 41978024  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||   |    
T  41978025 atcgtttaaatgtttgggaaatcaatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgttgagtgattgtgataatatag 41978124  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  41978125 tttaaaaagttagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttctctat 41978224  T
Q  320 ttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  41978225 tta-ttttatgtcaaatag 41978242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 31758607 - 31758800
Alignment:
Q  20 aatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||    
T  31758607 aatgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgttgattaaacgatccaatcgactttgt 31758706  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgat 213  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  31758707 gattgtttaaatgtttggtaaatcgacatttaaacgatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgat 31758800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24662958 - 24662530
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |  |||||||    
T  24662958 ttaatctttgataatcactttgtaatcaagaacttaatgctttttggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaatgatccaatcaacattgtgat 24662859  T
Q  123 cgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgt 221  Q
      ||||||| |||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||  |||    
T  24662858 tatttaaatagtttgggaaatcgacttttaaataatccattagaaatcacgacattatttggacacgaatgatgttattgaatgattgtgataatatcgt 24662759  T
Q  222 ttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||| || ||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | | | || |||||||| ||||||| || || ||    
T  24662758 ttaaagagttagaatccgttatttggtcgagagattgcagttgttacgcttggttgattatctctaatccctagtgaaatagccctatctcgtcccgatt 24662659  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||  ||||||| ||||||| |||| ||| |||    ||  ||||||||| || ||||||    
T  24662658 tacttttttgtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaaac-ttttatacccaaacacctaatatgataaatgatgttgaaatgcttaagatatacgc 24662560  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24662559 aactccctgcagaaacgatcctattatact 24662530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 40200270 - 40200359
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40200270 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaatttaatgcttttgggtcgtttaataggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaat 40200359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 450
Target Start/End: Original strand, 28006753 - 28006844
Alignment:
Q  359 aaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28006753 aaacaatttatacccaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacacaacttcctacggaaacgatcctattatactt 28006844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15805 - 15376
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  15805 atgttaatatttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 15706  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  15705 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 15606  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15605 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 15506  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  15505 tactattatgtcgattaggaaaatagttttacataaacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 15406  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  15405 actccctgtggacacgatcctattatactt 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12035 - 11606
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  12035 atgttaatatttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatctactttgtg 11936  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||   |    
T  11935 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgacgagtgattgtgataatatag 11836  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11835 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 11736  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  11735 tactattatgtcgattaggaaaatagttttacataaacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 11636  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11635 actccctgtggacacgatcctattatactt 11606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28730 - 28301
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  28730 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 28631  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  28630 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 28531  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  28530 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagggggatagccctatctcttctcgttt 28431  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  28430 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 28331  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  28330 actccctgtggacacgatcctattatactt 28301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 116399 - 115971
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  116399 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttggataatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 116300  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  116299 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttaaaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattg 116200  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  116199 tttaaaaagttagaatccgttaattgatcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttcaagttt 116100  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  116099 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgca 116000  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  115999 actccctgcggaaacgatcctattatact 115971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 34 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 169226 - 168810
Alignment:
Q  34 ataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgt 133  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  169226 ataatcactttaaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttttgatcgtttaaatgt 169127  T
Q  134 ttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctag 233  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  169126 ttggaaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaacgatattatcgagtgattgtgataatatagtttaaaaagctag 169027  T
Q  234 aatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcg 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  169026 aatccgttaatcgatcgagagattacagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtca 168927  T
Q  334 aataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaa 433  Q
    | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  168926 attaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggac 168827  T
Q  434 acggtcctattatactt 450  Q
    ||| |||||||||||||    
T  168826 acgatcctattatactt 168810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26515259 - 26514855
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  26515259 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 26515160  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  26515159 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 26515060  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26515059 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcagaatagccctatctcttctcgttt 26514960  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  26514959 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 26514860  T
Q  421 actcc 425  Q
    |||||    
T  26514859 actcc 26514855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 3539378 - 3539800
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  3539378 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 3539477  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  3539478 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 3539577  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  3539578 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagtggaatagccctatctcttctcgttt 3539677  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  3539678 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 3539777  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||    
T  3539778 actccttgtggacacgatcctat 3539800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9932636 - 9932214
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  9932636 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 9932537  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  9932536 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9932437  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9932436 tttaataagctagaatccattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttcttgttt 9932337  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  9932336 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 9932237  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  9932236 actccctgtggacacgatcctat 9932214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21596359 - 21595931
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| ||    
T  21596359 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaccttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaaatatccaatcgactttttg 21596260  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  21596259 atcgtttaaatgtttgagaaatcgatgtttaaacgacctcttagcaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 21596160  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21596159 tttaaaaagctagaatccgttaatcgattgagagattgcagctgttacgtttggttgatgtatctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgatt 21596060  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||     
T  21596059 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatgcgca 21595960  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21595959 cctccctgcggaaacgatcctattatact 21595931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24161087 - 24160656
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  24161087 atgttaatatttgataatcacttttaatcaaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 24160988  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||    
T  24160987 atcgtttaaatgtttggggaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtgataatatcg 24160888  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24160887 tttaaaaagctagaatccattaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgatcgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 24160788  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag--gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacg 418  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||| ||| | ||||||| ||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24160787 tacttttatgtcgaatagttaaaaatagttttacacaaacaaataatttatacccaaccacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacg 24160688  T
Q  419 cgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24160687 caactccatgcggaaacgatcctattatactt 24160656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32806594 - 32806165
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||    
T  32806594 atgttaatatttaataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgacgttgtg 32806495  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||| ||   |    
T  32806494 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatgtttaaacgacctcttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgtcgagcgattgtgataatattg 32806395  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32806394 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttgattgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 32806295  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  32806294 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaaattatacccaaacacttaatatgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 32806195  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32806194 actccctgtggaaacgatcctatcatactt 32806165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 449
Target Start/End: Original strand, 16698240 - 16698668
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  16698240 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggtttggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 16698339  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  16698340 atcgtttaaatgtttggaaaatcgatttttaagcgatcccttagaaataacgttatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 16698439  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  16698440 tttaaaaaggtagaatccattaatcgatcgagagattacagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcattt 16698539  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  16698540 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 16698639  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    ||| | || ||| ||  ||||||||||||    
T  16698640 acttcttgtggacacaatcctattatact 16698668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 383
Target Start/End: Original strand, 24879196 - 24879558
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||    
T  24879196 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaattggttgggaaatcgtcgattaaattatccaatcgactttgtg 24879295  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||| ||  ||    
T  24879296 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacaagaatgatattgtcgagcgattgtgataatatcg 24879395  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24879396 tttaaaaagctagaatccgttaatcgattgagagattgcagctattacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 24879495  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  24879496 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttacaaaaacaaacaatttatacccaaatacttaa 24879558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5988833 - 5988419
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||    
T  5988833 atgttaatatttgataatcacttttaatttagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggtagggaaatcgtcaattaaacgatccaatcgacgttgtg 5988734  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    |   ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  ||    
T  5988733 aatatttaaatgtttgggaaatcgacatttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgaatgattgtaataatatcg 5988634  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5988633 tttaaaaagctagaatccgttatttgatcgagagattgcagttgttgcgcttggttgatgtctctgaccccaagtgaaatagccctatctcttctcgttt 5988534  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  5988533 tacttttatgtcggatagaaaaatagttttacacaaacaaacattttatacccaaacagttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatatgca 5988434  T
Q  421 actccctgcggaaac 435  Q
    ||||||||| |||||    
T  5988433 actccctgcagaaac 5988419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 14271003 - 14271319
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  14271003 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 14271102  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  14271103 atcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 14271202  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |   |||||||||||  ||    
T  14271203 tttaaaaagctagaatctgttaattgatagagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaacccgaagcgaaatggtcatatctcttctctatt 14271302  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    || ||||||||| |||||    
T  14271303 ta-ttttatgtcaaatag 14271319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 25977280 - 25977596
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  25977280 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactaaccaatcgactttgtg 25977379  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||   |    
T  25977380 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggaaacgaatgatattgtcgagagattgtgataatatag 25977479  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttg-atgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |    
T  25977480 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgaatgtc-ctgaccccaagtgaaatagccctatctcttctctat 25977578  T
Q  320 ttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  25977579 tta-ttttatgtcaaatag 25977596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 34914019 - 34914335
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  34914019 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttgggtaatttaatcagttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcgactttgtg 34914118  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  34914119 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 34914218  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |   |||||||||||  ||    
T  34914219 tttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaacccgaagcgaaatggttatatctcttctctatt 34914318  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    || ||||||||| |||||    
T  34914319 ta-ttttatgtcaaatag 34914335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 1455122 - 1455439
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||    
T  1455122 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactatccaatcgactttgtg 1455221  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  1455222 atcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1455321  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |   |||||||||||  ||    
T  1455322 ttgaaaaagctagaatctattaattgatcgagagattgcagctgttatgcttggttgatctctctaaccccaagcgaaatggtcttatctcttctctatt 1455421  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    |  ||||||||| |||||    
T  1455422 ttattttatgtcaaatag 1455439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 1466814 - 1467131
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||    
T  1466814 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgttgattaaactatccaatcgactttgtg 1466913  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||    
T  1466914 atcgtttaaatgtttgggaaattgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatcg 1467013  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |   |||||||||||  ||    
T  1467014 ttgaaaaagctagaatctattaattgatcgagagattgcagctgttatgcttggttgatctctctaaccccaagcgaaatggtcttatctcttctctatt 1467113  T
Q  321 tacttttatgtcgaatag 338  Q
    |  ||||||||| |||||    
T  1467114 ttattttatgtcaaatag 1467131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13182192 - 13181908
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| || ||    
T  13182192 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagtacttaatgcttttgggtaatttaatcggttggaaaatcgtcgattgaactatccaatcgactt 13182093  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  13182092 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcctttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 13181993  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
       |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  13181992 attgtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgatcccaagcgaaat 13181908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13173659 - 13173419
Alignment:
Q  17 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || ||    
T  13173659 atgaatgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcttcgattgaactatccaatcgactt 13173560  T
Q  117 tgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcat 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  13173559 tgtgatcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacaatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataat 13173460  T
Q  217 tccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagatt 257  Q
      ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  13173459 atcgtttaaaaagctagaatccgttattggatcgtgagatt 13173419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 220 - 450
Target Start/End: Original strand, 8667461 - 8667691
Alignment:
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8667461 gtttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgtt 8667560  T
Q  320 ttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgc 419  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||| ||    
T  8667561 ttacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttataccctaacacttaacttgacaaatattgcgaaaatgcttatgaaatatgc 8667660  T
Q  420 gactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  8667661 aactccctgtggacacgatcctattatactt 8667691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Original strand, 34006833 - 34007023
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||    
T  34006833 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaaacgactttgtg 34006932  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtg 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  34006933 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtg 34007023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 231 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5670898 - 5670686
Alignment:
Q  231 tagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatg 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5670898 tagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatg 5670799  T
Q  331 tcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcg 430  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  5670798 tcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaaaacgcaactccctgtg 5670699  T
Q  431 gaaacggtcctat 443  Q
    || ||| ||||||    
T  5670698 gacacgatcctat 5670686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 248 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25056161 - 25055959
Alignment:
Q  248 tcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25056161 tcgagagattgcagctgttacgcttgactgatgtctctgacagcaagcgaaataaccctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagt 25056062  T
Q  348 tttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattata 447  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  25056061 tttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaatatgataaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgcggaaacgatcttattata 25055962  T
Q  448 ctt 450  Q
    |||    
T  25055961 ctt 25055959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 21631514 - 21631831
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||    
T  21631514 atgttaatctttgataatcacttataatctagaacttaatgtttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatctaatcgactttgtg 21631613  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || || |||  |||| ||| |||||  ||||||   |||||| ||||| |||| |  |||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| ||  ||    
T  21631614 attgtgtaatagtttgggatatcgaattttaaatagtcccttggaaatcacgacacaatttggacacgaatgatgatgttgagtgattgtgataatatcg 21631713  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||  |    
T  21631714 tttaaaaagttagaatccgttatttgatcgagaggttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcggaatgaccctatctcttctctat 21631813  T
Q  320 ttacttttatgtcgaatag 338  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  21631814 tta-ttttatgtcaaatag 21631831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 15642751 - 15643064
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  15642751 ttaatctttcataatcactttgtaatcaagaacttaatgcttttggatcgtttaataggttaggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtgat 15642850  T
Q  123 cgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgt 221  Q
      ||||||| |||| | |||||||  ||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||   ||| |  ||||||| || ||  |||    
T  15642851 tatttaaatagtttggaaaatcgacttttaaataatccattagaaatcacgacatcatttggacaagaatga---tgttgagtgattgtaataatatcgt 15642947  T
Q  222 ttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgc-aagcgaaatagcactatctcttctcgtt 319  Q
    ||||| || || |||| |||| | |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||  | ||||||| ||||| |    
T  15642948 ttaaagaggtaaaatccgttatttgatcgaaagattgcagttgttatgcttggttgattgtctctgaccccaaagcgaaatttccctatctcgtctcgat 15643047  T
Q  320 ttacttttatgtcgaat 336  Q
    |||||||||||||||||    
T  15643048 ttacttttatgtcgaat 15643064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9518275 - 9517961
Alignment:
Q  24 ttaatatttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtgat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  9518275 ttaatctttgataatcactttgtaattaagaacttaatacttttgggtcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgtgat 9518176  T
Q  123 cgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtt 222  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||| |    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||    ||||| || | ||  ||||    
T  9518175 tgtttaatagtttgggaaatcgacttttgagtagtccattagaaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtttagtgattatgctaatatcgtt 9518076  T
Q  223 taaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgtttt 321  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||    
T  9518075 taaaaagctagaatctgttatttgattgtgagattgcagttgttacacttggttgagtgtgtctgacc-caagcgaaatggccctatctcttctctattt 9517977  T
Q  322 acttttatgtcgaatag 338  Q
    | ||||||||| |||||    
T  9517976 a-ttttatgtcaaatag 9517961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 305 - 449
Target Start/End: Original strand, 6778170 - 6778314
Alignment:
Q  305 ctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaat 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||| || ||||| ||    
T  6778170 ctatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaatacttaaagtgataaacattgtgaatat 6778269  T
Q  405 gcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||| || |||||||||    
T  6778270 gcttatgaaatatgcaactccctgcagaaacgatcatattatact 6778314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 267 - 382
Target Start/End: Original strand, 34007032 - 34007147
Alignment:
Q  267 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||| ||    
T  34007032 acgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgttgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatt 34007131  T
Q  367 tatactcaaacactta 382  Q
    ||||| ||||||||||    
T  34007132 tatacccaaacactta 34007147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 419
Target Start/End: Original strand, 26604850 - 26605050
Alignment:
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgt 318  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| || || |||| ||||      
T  26604850 gtttaaaaagctagaatccgttatttgctcgtgagattgcagctgttacgcttggttgattatctctaaccccaagcgaaatggccctctctcgtctcca 26604949  T
Q  319 tttacttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatac 417  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||||||||   |||| ||||  ||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  26604950 tttatttttatgtcaaatagttaaaatagttttaaacaaacaaac-ttttatacccaaacacttaagatgataaatatcgttaaaatgcttatcagatac 26605048  T
Q  418 gc 419  Q
    ||    
T  26605049 gc 26605050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Original strand, 26604679 - 26604763
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattga 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26604679 tttgataatcactttgtaatcaagaacttaatgctatttgatcgtttaatagattgggaaatcgtcgattaaacgatccgattga 26604763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 401
Target Start/End: Original strand, 14479776 - 14479812
Alignment:
Q  365 tttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaa 401  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14479776 tttatacccaaacacttaatgtgacaaaaattgtgaa 14479812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12319 - 11896
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  12319 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 12220  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||   |    
T  12219 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcaagtgattgtgataatatag 12120  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12119 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 12020  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  12019 tacttttatgtcaattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatactcaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 11920  T
Q  421 ac-tccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    || |||||| ||| ||| ||||||    
T  11919 acttccctgtggacacgatcctat 11896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 12525 - 12947
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||    
T  12525 atgttaatatttgataattacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactatccaatcaactttgtg 12624  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||   |    
T  12625 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgacgagtgattgtgataatatag 12724  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12725 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 12824  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  12825 tacttttatgtcgattaggaaaataattttacacaaacaaacaatttatacccaaacaattaatgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 12924  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  12925 actccctgtggacacgatcctat 12947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Original strand, 9073 - 9495
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  9073 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactacccaatcgactttgtg 9172  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  9173 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtctaaatgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 9272  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9273 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagattgcagttgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 9372  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  9373 tacttttatgtctattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 9472  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  9473 actccctgtggacacgatcctat 9495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25481 - 25059
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| || || |||    
T  25481 atgttaatatttgataatcacttttaatctagtacttaatgcttttgggtaaattaatcggtttggaaatcgtcgattaaattatccaatcgacttcgtg 25382  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||   |    
T  25381 atcgtttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatatag 25282  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25281 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagccctatctcttctcgctt 25182  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | | |||| || |||||||||| ||||||||||||     
T  25181 tacttttatgttgatttggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgcggcaaatattgtgaaaatgcctatgaaatacgca 25082  T
Q  421 actccctgcggaaacggtcctat 443  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  25081 actccctgtggacacgatcctat 25059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 426
Target Start/End: Original strand, 7062 - 7467
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||    ||||||| || ||||||    
T  7062 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgcttttgggtaaattaattggttggaaaatcgtcgattaagttatccaatcgactttgtg 7161  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||   |    
T  7162 atcttttaaatgtttgggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatgttgtcgagtgattgtgataatatag 7261  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7262 tttaaaaagctagaatccgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctttgactgcaagcgaaatagccctatctcttctcgttt 7361  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcg 420  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  7362 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttgcataaacaaacaatttatatccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgca 7461  T
Q  421 actccc 426  Q
    ||||||    
T  7462 actccc 7467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 76283 - 75892
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  76283 atgttaatatttgataatcacttttaatctacgacttaatgcttttgggtaatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaactattcaatcgactttgtg 76184  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||  ||    
T  76183 atcgtttaaatcattgggaaatcgttgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtctagtgattgtgataatatcg 76084  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttt 320  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  76083 tttaaaaagctagaattcgttaatcgatcgagagattgtagttgttacgtttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttt 75984  T
Q  321 tacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatga 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  75983 tacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgataaatattgtgaaaatgcttatga 75892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 815 - 535
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  815 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgattttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 716  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||        
T  715 attgttttaatgtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgaatgatattgtcgagtgattgtgataatattt 616  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  615 tttaaaaagctagaatccattatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccgagcgaaat 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16304 - 16009
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  16304 atgttaatctttgataatcatttttaatctagaacttaatgcttttggatcgattaatagattgggaaatcatcgattaaacgatccaatcgactttgtg 16205  T
Q  121 atcgtttaaat-gtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||| ||| |    
T  16204 atcgtttaaatagtttgggaaatcgacatttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacaaatgatattgttgagtgattgtgataatt-c 16106  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttct 315  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16105 gtttaaaaaggtagaatccgttatttgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaatagccctatctcttct 16009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Original strand, 14516 - 14810
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgtg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  14516 atgttaatatttgataatcactttaaatcaagagcttaatgcttttggatcgtttaatagattggaaaatcgtcgattaaacgatccaatcgactttgtg 14615  T
Q  121 atcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattccg 220  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  |||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||| ||  ||    
T  14616 attgtttaatagtttgggaaatcgacttttaaatggtccattataaatcacgacatcatttggacacgaatgatgttgtcg-agaattgtgataatatcg 14714  T
Q  221 tttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  14715 tttaaaaagctagaatccgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatatctctaacctcaagcgaaatggtcctatctcttctc 14810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 262 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 350196 - 350008
Alignment:
Q  262 ctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaataggaaaatagttttgcgcaaataaa 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||    
T  350196 ctgttacgcttggttgatgtctctgaccgcaagcggaatagccctatctcttctcgttttacttttatgtcgattaggaaaatagttttacacaaacaaa 350097  T
Q  362 cactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaacggtcctattatactt 450  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  350096 caatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacacgatcctattatactt 350008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35155 - 34874
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaa-tctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgatccaattgattttgt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||    
T  35155 atgttaatatttgataatcacttttaaatctagaacttaatgctttttggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattaaacgatccgatcgactttgt 35056  T
Q  120 gatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgactgatattgtcgcatgattgtgatcattcc 219  Q
    |||  |||||  |||| |||||||||  ||||||   ||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||    |||||||||| ||       
T  35055 gattatttaatagtttgggaaatcgacttttaaatagtccattagaaatcacaacatcatttggacacgaatgatgttgtttagtgattgtgataatatt 34956  T
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34955 gtttaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgaccccaagcgaaat 34874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5107 - 4860
Alignment:
Q  92 gtcgattagacgatccaattgattttgtgatcgtttaaatgtttaggaaatcgatgtttaaacgatcccttagaaataacgatatcatttggacacgact 191  Q
    |||||||| || |||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5107 gtcgattaaactatccaatcaactttgtgaacgtttaaatgttaaggaaatcgatgtttaaatgacctcttagaaataacgatatcatttggacacgaat 5008  T
Q  192 gatattgtcgcatgattgtgatcattccgttt-aaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgacc 289  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  5007 gatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaaagctagaatccgttatttgatcgtgagattgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgacc 4908  T
Q  290 gcaagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
     |||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  4907 ccaagcgaaatggccctatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 7257 - 7403
Alignment:
Q  191 tgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccg 290  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  7257 tgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaaccc 7356  T
Q  291 caagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
    |||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  7357 caagcgaaatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 7403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 7267 - 7413
Alignment:
Q  191 tgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccg 290  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  7267 tgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaatctgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaaccc 7366  T
Q  291 caagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
    |||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  7367 caagcgaaatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0152 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0152
Description:

Target: scaffold0152; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 24878 - 25024
Alignment:
Q  191 tgatattgtcgcatgattgtgatcattccgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttgatgtctctgaccg 290  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  24878 tgatattgtcgagtgattgtgataatatcgtttaaaaagctagaaactgttaattgatcgagagattgcagctgttacgcttgattgatatctctaaccc 24977  T
Q  291 caagcgaaatagcactatctcttctcgttttacttttatgtcgaatag 338  Q
    |||||||||| |   |||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  24978 caagcgaaatggtcatatctcttctctattta-ttttatgtcaaatag 25024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 450
Target Start/End: Original strand, 175247 - 175361
Alignment:
Q  336 taggaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacgcgactccctgcggaaac 435  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  175247 taggaaaatagttttacacaaacaaacaatttatacccaaacacttaacgtgacaaatattgtgaaaatgcttatgaaatacgcaactccctgtggacac 175346  T
Q  436 ggtcctattatactt 450  Q
    | |||||||||||||    
T  175347 gatcctattatactt 175361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 449
Target Start/End: Original strand, 6044 - 6275
Alignment:
Q  219 cgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaatagcactatctcttctcg 317  Q
    |||||||| |||||||||  |||| | ||||| ||||||  || |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  6044 cgtttaaagagctagaattcgttatttgatcgtgagattatagttgttacgcttggttgattatctctaaccccaagcgaaatggccctatctcgtctcg 6143  T
Q  318 ttttacttttatgtcgaatag-gaaaatagttttgcgcaaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaata 416  Q
     |||| ||||| |||||||||  ||||||||||| | |||| ||||  ||||||| |||| ||||||  ||| ||| || ||  ||||||||||||  ||    
T  6144 atttatttttaagtcgaatagttaaaatagttttacacaaacaaac-ttttatacccaaatacttaagatgataaatattgtttaaatgcttatgaggta 6242  T
Q  417 cgcgactccctgcggaaacggtcctattatact 449  Q
     || | |||||||||||||| || | |||||||    
T  6243 agctagtccctgcggaaacgatcatgttatact 6275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45861 - 45781
Alignment:
Q  219 cgtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgaccgcaagcgaaat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45861 cgtttaaaaaactagaatctgttatttgatc--gagattgcatttgttacgcttggttgagtgtctctgacctcaagcgaaat 45781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 7363 - 7409
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7363 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 11977 - 12023
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11977 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 12023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 9972 - 10018
Alignment:
Q  21 atgttaatatttgataatcacttttaatctagaacttaatgcttttg 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9972 atgttaatatttgataatcacttttaatctaggacttaatgtttttg 10018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Original strand, 266 - 334
Alignment:
Q  220 gtttaaaaagctagaatctgttaatcgatcgagagattgcagctgttacgcttggttga-tgtctctgacc 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  266 gtttaaaaagctagaatatgttatttgatcgaga--ttgcagttgttacgcttggttgagtgtctctgacc 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 418
Target Start/End: Original strand, 399 - 463
Alignment:
Q  354 caaataaacactttatactcaaacacttaatgtgacaaaaatcgtgaaaatgcttatgaaatacg 418  Q
    |||| ||||| |||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  399 caaacaaacattttaaacccaaacacttaatgtgataaatattgtgaaaatgcttatgagatacg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7090 - 7014
Alignment:
Q  30 tttgataatcacttt-taatctagaacttaatgcttttgggtcatttaatcggttgggaaatcgtcgattagacgat 105  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||| |||| ||||||||||    
T  7090 tttggtaatcactttgtaatcaagaacttaatgctattggatcgtttaatagattgagaaaacgtcaattagacgat 7014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University