View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20713_low_4 (Length: 644)

Name: NF20713_low_4
Description: NF20713
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20713_low_4
NF20713_low_4
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (4-494)||(6311097-6311594)
chr8 (4-491)||(36979184-36979672)
chr8 (4-491)||(30655448-30655942)
chr8 (4-491)||(4759875-4760366)
chr8 (4-491)||(18870362-18870849)
chr8 (4-491)||(18852968-18853457)
chr8 (4-455)||(33037609-33038063)
chr8 (4-500)||(10688941-10689442)
chr8 (119-492)||(7289831-7290211)
chr8 (119-470)||(25328184-25328540)
chr8 (4-491)||(1261758-1262238)
chr8 (124-470)||(39784734-39785086)
chr8 (491-637)||(38613611-38613757)
chr8 (6-331)||(31071035-31071362)
chr8 (4-331)||(26287866-26288183)
chr8 (4-331)||(26301123-26301440)
chr8 (4-331)||(26313117-26313434)
chr8 (124-470)||(35745213-35745566)
chr8 (174-470)||(10684224-10684528)
chr8 (1-66)||(7289766-7289831)
chr8 (2-66)||(25327994-25328058)
chr8 (2-66)||(25328120-25328184)
chr8 (213-296)||(26403240-26403327)
chr8 (4-330)||(7412305-7412629)
chr8 (4-296)||(4456028-4456317)
chr8 (4-296)||(19175562-19175851)
chr8 (213-296)||(23799587-23799674)
chr8 (2-65)||(39784665-39784728)
chr8 (4-72)||(4696416-4696482)
chr8 (216-296)||(4696609-4696693)
chr8 (213-293)||(6127224-6127308)
chr8 (235-294)||(9765852-9765914)
chr8 (4-72)||(5702288-5702354)
chr8 (216-296)||(19752407-19752491)
chr8 (213-296)||(5702493-5702580)
chr8 (7-72)||(9054231-9054294)
chr8 (15-65)||(10684116-10684168)
chr8 (4-72)||(19752202-19752268)
chr8 (4-68)||(23799384-23799446)
chr8 (15-65)||(35745572-35745624)
chr8 (417-493)||(19752609-19752683)
chr8 (4-72)||(26403035-26403103)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (4-493)||(7167049-7167541)
chr3 (4-491)||(28503665-28504145)
chr3 (4-491)||(2671387-2671876)
chr3 (1-491)||(8738861-8739354)
chr3 (4-491)||(9091102-9091592)
chr3 (4-492)||(8477170-8477660)
chr3 (119-470)||(22173100-22173456)
chr3 (4-334)||(40372597-40372929)
chr3 (8-255)||(28501502-28501750)
chr3 (134-470)||(18656256-18656598)
chr3 (6-331)||(1305914-1306239)
chr3 (120-470)||(2676993-2677351)
chr3 (4-330)||(26928396-26928721)
chr3 (120-470)||(2672837-2673195)
chr3 (174-470)||(8512037-8512342)
chr3 (174-470)||(8516917-8517222)
chr3 (4-330)||(32143287-32143612)
chr3 (120-444)||(24967957-24968286)
chr3 (174-470)||(32475306-32475608)
chr3 (29-330)||(27452924-27453224)
chr3 (174-470)||(32480163-32480466)
chr3 (250-470)||(10207755-10207981)
chr3 (1-66)||(22173035-22173100)
chr3 (4-330)||(27986253-27986567)
chr3 (388-491)||(40372986-40373085)
chr3 (4-296)||(27974749-27975039)
chr3 (215-296)||(8370488-8370573)
chr3 (213-296)||(18552883-18552970)
chr3 (213-295)||(36029094-36029180)
chr3 (4-296)||(16264350-16264638)
chr3 (215-296)||(21711223-21711308)
chr3 (4-164)||(33386472-33386628)
chr3 (213-293)||(1736305-1736389)
chr3 (216-296)||(33386669-33386753)
chr3 (272-331)||(1309819-1309878)
chr3 (213-296)||(3716002-3716089)
chr3 (213-296)||(30709790-30709877)
chr3 (213-296)||(40592782-40592869)
chr3 (2-65)||(18656614-18656677)
chr3 (4-72)||(4386774-4386840)
chr3 (4-72)||(36029316-36029382)
chr3 (4-72)||(40592579-40592645)
chr3 (213-296)||(48438214-48438301)
chr3 (215-296)||(6794715-6794800)
chr3 (213-296)||(40844652-40844738)
chr3 (7-72)||(47923704-47923767)
chr3 (4-72)||(1736101-1736167)
chr3 (4-72)||(3323488-3323554)
chr3 (4-72)||(3328154-3328220)
chr3 (4-72)||(8370286-8370352)
chr3 (4-72)||(21711445-21711511)
chr3 (4-72)||(24694963-24695029)
chr3 (4-72)||(26299211-26299277)
chr3 (213-296)||(25795781-25795868)
chr3 (213-296)||(26298988-26299075)
chr3 (213-296)||(47923906-47923993)
chr3 (6-72)||(8126853-8126917)
chr3 (4-66)||(23392106-23392166)
chr3 (235-296)||(1417513-1417577)
chr3 (15-65)||(2672783-2672835)
chr3 (15-65)||(2676939-2676991)
chr3 (216-296)||(3328359-3328443)
chr3 (4-72)||(6794512-6794578)
chr3 (15-65)||(8512398-8512450)
chr3 (15-65)||(8517278-8517330)
chr3 (31-72)||(10274605-10274646)
chr3 (15-65)||(24968288-24968340)
chr3 (4-72)||(35925701-35925767)
chr3 (216-296)||(37466291-37466375)
chr3 (4-72)||(39032352-39032417)
chr3 (4-63)||(23410529-23410586)
chr3 (213-296)||(24695164-24695251)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (1-474)||(30631227-30631705)
chr5 (4-372)||(31180138-31180509)
chr5 (119-492)||(1457067-1457446)
chr5 (119-491)||(43592080-43592459)
chr5 (119-491)||(27444771-27445150)
chr5 (119-491)||(27449615-27449994)
chr5 (119-491)||(43598525-43598904)
chr5 (119-491)||(43604017-43604396)
chr5 (119-491)||(43609509-43609888)
chr5 (119-470)||(15044512-15044865)
chr5 (124-470)||(28807485-28807837)
chr5 (4-491)||(24135659-24136142)
chr5 (4-491)||(38219208-38219691)
chr5 (124-470)||(37556533-37556887)
chr5 (124-470)||(37561355-37561709)
chr5 (4-334)||(35387624-35387955)
chr5 (103-491)||(38191983-38192369)
chr5 (124-470)||(2785197-2785550)
chr5 (174-470)||(31396953-31397256)
chr5 (174-470)||(31401810-31402113)
chr5 (124-452)||(33791158-33791491)
chr5 (179-452)||(33768021-33768299)
chr5 (1-66)||(1457002-1457067)
chr5 (1-66)||(27445150-27445215)
chr5 (1-66)||(27449994-27450059)
chr5 (1-66)||(43592459-43592524)
chr5 (1-66)||(43598904-43598969)
chr5 (1-66)||(43604396-43604461)
chr5 (1-66)||(43609888-43609953)
chr5 (4-296)||(15464532-15464823)
chr5 (1-66)||(15044865-15044931)
chr5 (4-296)||(36932156-36932447)
chr5 (215-296)||(9353344-9353429)
chr5 (4-296)||(14520230-14520519)
chr5 (213-296)||(10281751-10281838)
chr5 (426-491)||(31180079-31180142)
chr5 (213-296)||(19588746-19588833)
chr5 (213-295)||(11916982-11917068)
chr5 (15-65)||(28807429-28807479)
chr5 (4-72)||(24553335-24553401)
chr5 (213-296)||(3880299-3880386)
chr5 (213-296)||(17003970-17004057)
chr5 (5-71)||(11181641-11181705)
chr5 (215-293)||(12084187-12084269)
chr5 (6-72)||(28832480-28832544)
chr5 (4-72)||(9353140-9353206)
chr5 (4-72)||(11916780-11916846)
chr5 (216-296)||(28832259-28832343)
chr5 (5-72)||(31300404-31300469)
chr5 (435-491)||(35387474-35387527)
chr5 (15-65)||(2785556-2785608)
chr5 (4-64)||(7160712-7160770)
chr5 (4-72)||(17003767-17003833)
chr5 (4-72)||(19588968-19589034)
chr5 (15-65)||(31396843-31396895)
chr5 (15-65)||(31401700-31401752)
chr5 (15-65)||(33768365-33768417)
chr5 (15-65)||(33791497-33791549)
chr5 (216-296)||(42127423-42127507)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (4-491)||(24741748-24742236)
chr4 (4-491)||(29760449-29760937)
chr4 (119-492)||(51520257-51520637)
chr4 (119-470)||(3813846-3814202)
chr4 (119-470)||(9224312-9224668)
chr4 (119-470)||(9229099-9229455)
chr4 (179-492)||(56146677-56146996)
chr4 (124-470)||(18855549-18855900)
chr4 (120-470)||(45357203-45357558)
chr4 (120-470)||(45347723-45348079)
chr4 (134-470)||(5732486-5732828)
chr4 (4-331)||(28468342-28468660)
chr4 (4-330)||(31985441-31985764)
chr4 (1-66)||(51520637-51520702)
chr4 (1-66)||(18712606-18712671)
chr4 (1-66)||(9224247-9224312)
chr4 (1-66)||(9229034-9229099)
chr4 (4-296)||(16623101-16623390)
chr4 (4-296)||(5396479-5396768)
chr4 (2-66)||(3814202-3814266)
chr4 (213-296)||(10047379-10047466)
chr4 (213-296)||(38152449-38152536)
chr4 (213-296)||(39245994-39246081)
chr4 (2-65)||(45347658-45347721)
chr4 (215-296)||(36315241-36315326)
chr4 (215-296)||(36329450-36329535)
chr4 (2-65)||(5732844-5732907)
chr4 (213-291)||(6743425-6743507)
chr4 (4-145)||(16628680-16628815)
chr4 (7-72)||(5112460-5112523)
chr4 (214-295)||(5143260-5143345)
chr4 (4-72)||(3777772-3777838)
chr4 (216-296)||(5269204-5269288)
chr4 (213-296)||(3796529-3796616)
chr4 (2-65)||(45357138-45357201)
chr4 (214-295)||(5147678-5147763)
chr4 (15-65)||(18855906-18855956)
chr4 (215-295)||(3777550-3777634)
chr4 (4-72)||(5269008-5269074)
chr4 (4-72)||(10047604-10047670)
chr4 (4-72)||(25861841-25861907)
chr4 (4-72)||(36315038-36315104)
chr4 (4-72)||(36329247-36329313)
chr4 (213-292)||(16630690-16630773)
chr4 (213-296)||(24333809-24333896)
chr4 (7-72)||(6743226-6743289)
chr4 (214-296)||(54867184-54867269)
chr4 (4-71)||(38152246-38152311)
chr4 (5-72)||(42599383-42599448)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (4-493)||(11098728-11099219)
chr2 (4-491)||(14291295-14291784)
chr2 (4-491)||(9296203-9296691)
chr2 (153-470)||(44312563-44312885)
chr2 (120-470)||(32246607-32246966)
chr2 (119-470)||(39811894-39812250)
chr2 (4-331)||(3491716-3492043)
chr2 (83-491)||(25398305-25398711)
chr2 (83-491)||(25403443-25403849)
chr2 (124-470)||(19344243-19344596)
chr2 (124-470)||(19349101-19349454)
chr2 (4-330)||(40738810-40739123)
chr2 (83-258)||(25407663-25407838)
chr2 (1-66)||(39811829-39811894)
chr2 (213-296)||(21629944-21630030)
chr2 (213-296)||(8040060-8040147)
chr2 (4-72)||(25409854-25409922)
chr2 (213-293)||(13569331-13569415)
chr2 (215-296)||(28259189-28259274)
chr2 (212-296)||(20522220-20522308)
chr2 (4-296)||(36757570-36757859)
chr2 (213-296)||(10445454-10445541)
chr2 (213-296)||(17865203-17865290)
chr2 (213-296)||(34682344-34682431)
chr2 (2-65)||(32246968-32247031)
chr2 (213-295)||(34388859-34388945)
chr2 (4-72)||(39483156-39483222)
chr2 (213-296)||(14699018-14699104)
chr2 (3-164)||(23078278-23078433)
chr2 (213-296)||(31056044-31056131)
chr2 (213-296)||(33528631-33528718)
chr2 (213-295)||(10707262-10707348)
chr2 (6-72)||(21630168-21630232)
chr2 (4-72)||(41586358-41586425)
chr2 (213-293)||(8390160-8390244)
chr2 (4-72)||(14698817-14698883)
chr2 (4-72)||(17865428-17865494)
chr2 (4-72)||(20522445-20522511)
chr2 (4-72)||(33118358-33118424)
chr2 (4-72)||(33528432-33528498)
chr2 (4-72)||(34389074-34389140)
chr2 (218-296)||(42039684-42039766)
chr2 (4-72)||(10445275-10445341)
chr2 (4-72)||(28258985-28259051)
chr2 (5-72)||(2869501-2869566)
chr2 (213-296)||(16940219-16940306)
chr2 (213-296)||(17010884-17010971)
chr2 (3-66)||(29867780-29867840)
chr2 (4-72)||(31056266-31056334)
chr2 (213-296)||(39482931-39483018)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (4-491)||(20357348-20357837)
chr7 (4-493)||(2057763-2058264)
chr7 (4-491)||(1533245-1533730)
chr7 (119-470)||(24024232-24024589)
chr7 (118-470)||(12406155-12406512)
chr7 (119-470)||(12396735-12397091)
chr7 (119-470)||(31109489-31109844)
chr7 (124-470)||(19992135-19992487)
chr7 (4-491)||(21645818-21646299)
chr7 (4-334)||(21639770-21640101)
chr7 (210-470)||(4866553-4866819)
chr7 (124-470)||(21812149-21812501)
chr7 (4-331)||(18413606-18413931)
chr7 (4-334)||(18408726-18409055)
chr7 (174-470)||(24266162-24266466)
chr7 (174-470)||(24261283-24261587)
chr7 (174-470)||(16879894-16880197)
chr7 (174-470)||(16884750-16885053)
chr7 (1-66)||(12397091-12397156)
chr7 (2-66)||(31109425-31109489)
chr7 (1-64)||(4873310-4873373)
chr7 (1-64)||(12406513-12406576)
chr7 (1-66)||(24024167-24024232)
chr7 (213-296)||(29159803-29159890)
chr7 (214-295)||(21983285-21983370)
chr7 (213-296)||(46516320-46516407)
chr7 (213-296)||(49091661-49091748)
chr7 (219-296)||(47263678-47263757)
chr7 (213-296)||(55948-56034)
chr7 (214-295)||(21988909-21988992)
chr7 (215-296)||(44848696-44848781)
chr7 (216-296)||(9190021-9190105)
chr7 (216-296)||(20284089-20284173)
chr7 (4-72)||(20284312-20284378)
chr7 (4-72)||(23402821-23402887)
chr7 (215-296)||(2479337-2479421)
chr7 (213-296)||(2647706-2647793)
chr7 (5-72)||(4796477-4796542)
chr7 (213-296)||(33332460-33332547)
chr7 (7-72)||(21989131-21989194)
chr7 (4-72)||(2479559-2479625)
chr7 (216-296)||(2580390-2580474)
chr7 (4-72)||(2580613-2580678)
chr7 (4-72)||(2647505-2647571)
chr7 (4-72)||(44847933-44847999)
chr7 (4-72)||(46516113-46516179)
chr7 (15-65)||(21812092-21812143)
chr7 (215-296)||(35960816-35960901)
chr7 (416-491)||(2479148-2479221)
chr7 (4-72)||(3047477-3047543)
chr7 (4-72)||(9184982-9185048)
chr7 (216-296)||(9185178-9185262)
chr7 (15-65)||(24266054-24266106)
chr7 (416-495)||(47263485-47263562)
chr7 (4-72)||(47263889-47263955)
chr7 (215-296)||(5817282-5817366)
chr7 (29-72)||(9189840-9189881)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (4-455)||(24787165-24787624)
chr1 (120-470)||(25444996-25445352)
chr1 (124-470)||(39445322-39445673)
chr1 (124-470)||(44023785-44024135)
chr1 (119-470)||(41398060-41398415)
chr1 (4-491)||(24202573-24203054)
chr1 (124-470)||(1054923-1055274)
chr1 (119-394)||(41390488-41390760)
chr1 (4-331)||(19361237-19361564)
chr1 (4-331)||(19358648-19358975)
chr1 (174-452)||(43988424-43988709)
chr1 (44-331)||(19379916-19380204)
chr1 (4-170)||(19366112-19366276)
chr1 (1-66)||(41398415-41398480)
chr1 (392-470)||(41386571-41386650)
chr1 (1-66)||(41390760-41390825)
chr1 (5-296)||(3281708-3281995)
chr1 (213-296)||(47703946-47704033)
chr1 (215-296)||(26644909-26644994)
chr1 (213-296)||(9476261-9476348)
chr1 (213-296)||(19072928-19073015)
chr1 (213-296)||(19120818-19120905)
chr1 (213-296)||(13598398-13598485)
chr1 (213-296)||(16124526-16124613)
chr1 (213-296)||(27104382-27104469)
chr1 (213-296)||(29651811-29651898)
chr1 (215-296)||(37069770-37069855)
chr1 (4-72)||(47098633-47098699)
chr1 (4-72)||(47102647-47102713)
chr1 (213-296)||(775672-775759)
chr1 (4-296)||(13604430-13604720)
chr1 (2-65)||(1054854-1054917)
chr1 (2-65)||(25439738-25439801)
chr1 (2-65)||(25444931-25444994)
chr1 (2-65)||(39445679-39445742)
chr1 (2-65)||(44023716-44023779)
chr1 (4-72)||(29652036-29652102)
chr1 (216-296)||(47098837-47098921)
chr1 (5-72)||(13598623-13598688)
chr1 (5-72)||(27104211-27104275)
chr1 (120-194)||(25439803-25439877)
chr1 (435-491)||(19359079-19359132)
chr1 (4-69)||(21536378-21536441)
chr1 (215-296)||(21536581-21536666)
chr1 (4-72)||(32889661-32889727)
chr1 (15-65)||(43988314-43988366)
chr1 (29-72)||(16124347-16124388)
chr1 (10-69)||(22819657-22819714)
chr1 (5-64)||(37069998-37070055)
chr1 (4-72)||(40816622-40816690)
chr1 (4-72)||(47703741-47703809)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (4-491)||(5674571-5675057)
chr6 (119-470)||(22010602-22010958)
chr6 (119-470)||(11856795-11857154)
chr6 (119-470)||(14737482-14737838)
chr6 (119-470)||(14742342-14742697)
chr6 (124-470)||(6438324-6438674)
chr6 (119-470)||(28184325-28184684)
chr6 (120-470)||(28155477-28155832)
chr6 (124-470)||(6005239-6005592)
chr6 (120-470)||(16838566-16838923)
chr6 (120-452)||(33330351-33330690)
chr6 (120-470)||(33335848-33336207)
chr6 (4-330)||(22708984-22709299)
chr6 (1-66)||(11857154-11857219)
chr6 (1-66)||(14737417-14737482)
chr6 (1-66)||(22010537-22010602)
chr6 (1-66)||(14742277-14742342)
chr6 (259-452)||(5343322-5343519)
chr6 (346-491)||(30125940-30126084)
chr6 (215-296)||(5757490-5757575)
chr6 (218-296)||(21356036-21356118)
chr6 (1-66)||(28184684-28184752)
chr6 (215-296)||(31086485-31086570)
chr6 (213-296)||(5572251-5572338)
chr6 (214-296)||(4629954-4630040)
chr6 (214-296)||(10077176-10077262)
chr6 (2-65)||(28155412-28155475)
chr6 (213-296)||(22963700-22963786)
chr6 (213-296)||(23824607-23824693)
chr6 (2-65)||(6438680-6438743)
chr6 (4-72)||(5017304-5017370)
chr6 (216-296)||(31936587-31936671)
chr6 (4-72)||(31936798-31936864)
chr6 (213-296)||(31979513-31979600)
chr6 (216-296)||(5017482-5017566)
chr6 (4-72)||(5572051-5572117)
chr6 (4-72)||(5757286-5757352)
chr6 (15-65)||(6005598-6005650)
chr6 (15-65)||(16838925-16838977)
chr6 (4-72)||(22963922-22963988)
chr6 (4-72)||(23824405-23824471)
chr6 (4-72)||(24435780-24435845)
chr6 (4-72)||(31979735-31979801)
chr6 (15-65)||(33330297-33330349)
chr6 (15-65)||(33335794-33335846)
chr6 (4-72)||(21801150-21801218)
chr6 (213-284)||(21801354-21801429)
chr6 (416-491)||(31936398-31936470)
[»] scaffold0355 (5 HSPs)
scaffold0355 (119-470)||(9549-9902)
scaffold0355 (322-470)||(1-143)
scaffold0355 (1-66)||(3689-3754)
scaffold0355 (119-201)||(3754-3836)
scaffold0355 (31-66)||(9514-9549)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (119-470)||(34967-35323)
scaffold0135 (1-66)||(34902-34967)
[»] scaffold0464 (2 HSPs)
scaffold0464 (124-470)||(185-536)
scaffold0464 (2-65)||(542-605)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (4-491)||(23849-24331)
scaffold0188 (4-491)||(17756-18238)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (174-470)||(148916-149219)
scaffold0028 (15-65)||(148808-148860)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (174-470)||(2211-2514)
scaffold0259 (15-65)||(2103-2155)
[»] scaffold0197 (4 HSPs)
scaffold0197 (151-470)||(19102-19428)
scaffold0197 (174-470)||(14269-14573)
scaffold0197 (15-65)||(14161-14213)
scaffold0197 (15-64)||(19017-19068)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (264-492)||(300-528)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (226-470)||(181976-182228)
scaffold0009 (15-65)||(176829-176881)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (4-296)||(8225-8516)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (392-470)||(34132-34211)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (409-470)||(13171-13233)
[»] scaffold0087 (4 HSPs)
scaffold0087 (4-296)||(36640-36929)
scaffold0087 (215-296)||(43973-44058)
scaffold0087 (4-72)||(43769-43835)
scaffold0087 (416-491)||(44174-44247)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (215-295)||(85684-85768)
scaffold0036 (4-72)||(85906-85972)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (213-296)||(5683-5770)
scaffold0006 (213-296)||(2492-2579)
scaffold0006 (4-296)||(133087-133377)
scaffold0006 (5-72)||(5908-5973)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (213-296)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (216-296)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (213-293)||(17266-17350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6311594 - 6311097
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  6311594 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatcaaaagcttc 6311495  T
Q  104 ctctagtgacttctctttt--agggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  6311494 ctctagtgacttctcttttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagag 6311395  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311394 tttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 6311295  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  6311294 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttg 6311195  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacagaa 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6311194 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacagaa 6311097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 36979672 - 36979184
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36979672 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttaggttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 36979574  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  36979573 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattgt 36979475  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36979474 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 36979375  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  36979374 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttg 36979276  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36979275 cttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 36979184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 30655942 - 30655448
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30655942 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 30655843  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  30655842 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattgt 30655744  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30655743 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 30655644  T
Q  300 ggtg----ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg-gttttgttgt 393  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30655643 ggtgttttttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgt 30655544  T
Q  394 --ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
      ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30655543 tgttgcttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 30655448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 4759875 - 4760366
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa-acattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagctt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4759875 gggttgagtgtctttgtagagagagtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagctt 4759974  T
Q  103 cctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||  |    
T  4759975 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattg 4760073  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760074 tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 4760173  T
Q  299 cggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 395  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  4760174 tgatgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 4760273  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4760274 gcttggaaaccattt-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatctttgtt--tttcattgatgtgagtttcaaccggattcacaaca 4760366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 18870362 - 18870849
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18870362 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 18870461  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  18870462 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaatgctattgt 18870560  T
Q  203 ttcttgcaa-ccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18870561 ttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttct 18870660  T
Q  299 cggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtttgc 397  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || ||||||||||   |||||||||||||    
T  18870661 tggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgttttttgttgtttgc 18870759  T
Q  398 ttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18870760 ttggaaaccattt-aactcatagattaccattatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 18870849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 18852968 - 18853457
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18852968 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 18853067  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  18853068 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaatgctattgt 18853166  T
Q  203 ttcttgcaa-ccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853167 ttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 18853266  T
Q  299 cggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggc---tggttttgttgtt 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || ||||||||||   |  ||||||||||    
T  18853267 tggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtt 18853365  T
Q  395 tgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18853366 tgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatc----tttgtttcgttggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 18853457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Original strand, 33037609 - 33038063
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33037609 gggttgagtgtcttcgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 33037708  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  33037709 ctctagtgtcttctc-tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattgt 33037806  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33037807 ttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttg 33037906  T
Q  301 gtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgt--ttg 396  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||  |||    
T  33037907 gtgttttgttcttcttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttgttg 33038005  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgttt 455  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33038006 cttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttt 33038063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Original strand, 10688941 - 10689442
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggtt--ggaaggatttaaagct 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||    
T  10688941 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatctaaagct 10689040  T
Q  102 tcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacacca-aagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctag 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||     
T  10689041 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaggctat 10689139  T
Q  200 agcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     | |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689140 tgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 10689239  T
Q  297 ctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt-- 393  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||  |||||| || |||||||||      
T  10689240 cttggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttg 10689338  T
Q  394 ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 493  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  10689339 ttgcttggaaaccattag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccgaaaacacaacaca 10689435  T
Q  494 agcaaaa 500  Q
    | |||||    
T  10689436 atcaaaa 10689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 119 - 492
Target Start/End: Original strand, 7289831 - 7290211
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  7289831 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 7289929  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289930 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 7290029  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  7290030 ttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttg 7290129  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  7290130 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcaatgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 7290211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 25328184 - 25328540
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  25328184 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 25328281  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc--tt 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25328282 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttt 25328381  T
Q  314 cctttcttgcttatcttgtttatg-cttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 410  Q
    |||||   | |||||| |||||||  ||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  25328382 cctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggttgttttgttgttgttggcttggagaccattt 25328479  T
Q  411 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25328480 gttctcattgattatcactatcacttgctccgcacatcattgatttatttcattgttgtga 25328540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 1261758 - 1262238
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  1261758 gggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 1261855  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  1261856 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 1261953  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  1261954 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatcttttt 1262053  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||   ||||   |||| | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  1262054 ggtgtgtttgttcttcctttctatcttatcttgtt--tgcttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttg 1262148  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||| ||  ||  | ||||| ||||||||||  |  || ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1262149 cttggagacactt--tactcatagattaccactcccttttactccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1262238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Original strand, 39784734 - 39785086
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39784734 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 39784830  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  39784831 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39784929  T
Q  317 ttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgtt 413  Q
    ||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  39784930 ttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgtt 39785028  T
Q  414 ctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39785029 ctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 39785086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 491 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 38613757 - 38613611
Alignment:
Q  491 agaagcaaaattcagcagattcaaaccttggcaacggtgtttgtgcaatgtatttaagaccctgcaggtgaaaacggagattacaatgagtatcaagttt 590  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38613757 agaagcaaaatcgagctgattcaaaccttggcaacggtgtttgtgcaatgtatttaagaccctgcaggtgaaaacggagattacaatgagtatcaagttt 38613658  T
Q  591 aaaattactcataattttgaaacctgggaccagagatgatgatgatg 637  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38613657 aaaattactcataattttgaaagctgggaccagagaagatgatgatg 38613611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 331
Target Start/End: Original strand, 31071035 - 31071362
Alignment:
Q  6 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttcct 105  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| | |||||||||    
T  31071035 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcttaagcttcct 31071132  T
Q  106 ctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagctt 204  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    ||    
T  31071133 cttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-tt 31071230  T
Q  205 cttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcg 300  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | |    
T  31071231 cttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttg 31071330  T
Q  301 gtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31071331 gtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 31071362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26288183 - 26287866
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  26288183 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 26288086  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  26288085 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaa-cacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta---- 26287992  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
     | || |      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26287991 -tttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 26287899  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26287898 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 26287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26301440 - 26301123
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  26301440 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 26301343  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  26301342 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaa-cacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta---- 26301249  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
     | || |      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26301248 -tttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 26301156  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26301155 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 26301123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26313434 - 26313117
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  26313434 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 26313337  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  26313336 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaa-cacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta---- 26313243  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
     | || |      |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26313242 -tttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 26313150  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26313149 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 26313117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 35745566 - 35745213
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 220  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  35745566 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 35745470  T
Q  221 acactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  35745469 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 35745371  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 412  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  35745370 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 35745273  T
Q  413 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35745272 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 35745213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 10684224 - 10684528
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10684224 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 10684321  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  10684322 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 10684418  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 460  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  10684419 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 10684518  T
Q  461 attggtgtga 470  Q
    ||||||||||    
T  10684519 attggtgtga 10684528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 7289766 - 7289831
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289766 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 25327994 - 25328058
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25327994 atgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 25328120 - 25328184
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328120 atgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403327
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26403327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7412629 - 7412305
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||| ||||||  ||||||||    
T  7412629 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttgaaaggatcaaaagcttc 7412534  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || |  || ||||||||  |||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  || ||       
T  7412533 cttttatgtcttctctt--agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttatt- 7412439  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttc 297  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  7412438 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttc 7412340  T
Q  298 tcggtgt-tttgttcttcctttc-ttgcttatctt 330  Q
      ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  7412339 atggtgtgtttgttccttctttcattgcttatctt 7412305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4456317 - 4456028
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    || |||||||  ||||||||    
T  4456317 gggttgagtgtctctgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttagaaggatcaaaagcttc 4456222  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||| || ||||||||  || |   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  4456221 cttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaa-gcttgccagctatt- 4456126  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456125 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 19175562 - 19175851
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||  |||| |||    
T  19175562 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacta-ttggaaggatcaaaagtttc 19175657  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||   ||||       
T  19175658 cttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtggg-aaacacaaatgtgtagaagttaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaggctattt 19175753  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175754 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 23799587 - 23799674
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23799587 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 23799674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 39784665 - 39784728
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784665 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 39784728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 4696416 - 4696482
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4696416 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 4696482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696693
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 4696693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6127308 - 6127224
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127308 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  235 tggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 294  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 5702288 - 5702354
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5702288 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 5702354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752491
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19752491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 5702493 - 5702580
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5702493 cttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5702580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 9054231 - 9054294
Alignment:
Q  7 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9054231 ttgagtgtttttgtagtgagattctcttgggttgg--aaaacattataatcaccttgggtagtgag 9054294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 10684116 - 10684168
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10684116 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 10684168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 19752202 - 19752268
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19752202 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgtg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 19752268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 23799384 - 23799446
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtag 68  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||    
T  23799384 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg--gaacattgtaaacaccttgagtag 23799446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 35745624 - 35745572
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35745624 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 35745572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 417 - 493
Target Start/End: Original strand, 19752609 - 19752683
Alignment:
Q  417 attgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 493  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  19752609 attgattaccacttccttttgctccacacatctttgttt-tttcattggtgtga-tttttaccggattcacaacaga 19752683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 26403035 - 26403103
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  26403035 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 26403103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7167541 - 7167049
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagctt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7167541 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagctt 7167442  T
Q  103 cctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  |    
T  7167441 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattg 7167343  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167342 tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 7167243  T
Q  299 cggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  7167242 tggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggct-gttttgttgttgtt 7167144  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 493  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7167143 gcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaga 7167049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 28503665 - 28504145
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28503665 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 28503764  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||     
T  28503765 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 28503864  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503865 ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 28503964  T
Q  301 gtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttgc 397  Q
    |||||||||||||||||         |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||    
T  28503965 gtgttttgttcttcctt---------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggct-gttttgttgttgttgc 28504054  T
Q  398 ttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  28504055 ttggaaaccattt-ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcattgtt--attcattggtgtgagttaagaccggattcacaaca 28504145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 2671387 - 2671876
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2671387 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 2671486  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||| |||||  | |||  |     
T  2671487 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgcaatctattgt 2671585  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2671586 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 2671685  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgttt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||| ||   |||||||||    
T  2671686 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgttt 2671784  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2671785 gcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 2671876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 8738861 - 8739354
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  8738861 aatgggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaagc 8738960  T
Q  101 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctag 199  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||     
T  8738961 ttcctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgt-aagcttgaaggctat 8739059  T
Q  200 agcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739060 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 8739159  T
Q  297 ctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggttttgttg-- 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||||||      
T  8739160 cttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgtt 8739258  T
Q  393 -tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8739259 atttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 8739354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 9091102 - 9091592
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  9091102 gggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaagcttc 9091201  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  9091202 ctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgt-aagcttgaaggctattgt 9091300  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9091301 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 9091400  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggttttgttg---tt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| | ||||||||   ||    
T  9091401 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatt 9091499  T
Q  395 tgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  9091500 tgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 9091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 8477660 - 8477170
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8477660 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 8477561  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagt-ggggaaacaccaaagggtagaatctagg--gtctgtcttgtgtaaagcttgatagctaga 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | | | |||||| |||||||  |||||      
T  8477560 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgt-aagcttgcaagctatt 8477462  T
Q  201 gcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttc 297  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477461 gtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttc 8477362  T
Q  298 tcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--t 394  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||  | | | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8477361 ttggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttatctttgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgt 8477265  T
Q  395 tgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttca-accggaatcacaacag 492  Q
    ||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  8477264 tgcttgggaaac-tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttataccggattcacaacag 8477170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 22173100 - 22173456
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22173100 ttttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 22173198  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173199 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22173298  T
Q  316 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
     |||   ||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22173299 ttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22173397  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173398 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 22173456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Original strand, 40372597 - 40372929
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40372597 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 40372696  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||| |||||||  |||||        
T  40372697 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta-ttt 40372794  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40372795 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 40372894  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40372895 ggtgttttgttcttcctatcttgcttatcttgttt 40372929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Original strand, 28501502 - 28501750
Alignment:
Q  8 tgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttcctct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28501502 tgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttcctct 28501601  T
Q  108 agtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgatagctagagcttct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  28501602 agtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttct 28501701  T
Q  207 tgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct 255  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28501702 tgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 134 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18656598 - 18656256
Alignment:
Q  134 tgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacat 232  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18656598 tgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcat 18656502  T
Q  233 attggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgct 324  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | |    
T  18656501 attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtt 18656402  T
Q  325 tatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattga 421  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18656401 tatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattga 18656304  T
Q  422 ttaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18656303 ttaccaccatcacttgctccacacatcattgtat-tttcattggtgtga 18656256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1306239 - 1305914
Alignment:
Q  6 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttcct 105  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| | |||||||||    
T  1306239 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcttaagcttcct 1306142  T
Q  106 ctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagctt 204  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  | |||    ||    
T  1306141 cttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-tt 1306044  T
Q  205 cttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcgg 301  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1306043 cttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttgg 1305945  T
Q  302 tgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1305944 tgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 1305914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 2676993 - 2677351
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 216  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  2676993 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2677089  T
Q  217 tgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2677090 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2677188  T
Q  312 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 408  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||    
T  2677189 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 2677287  T
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2677288 ttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 2677351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Original strand, 26928396 - 26928721
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  26928396 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 26928491  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  26928492 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttt 26928590  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26928591 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 26928689  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 330  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  26928690 ggtgtgtttgttctttctttctagcttatctt 26928721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 2672837 - 2673195
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 216  Q
    |||| |||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  2672837 tttaaggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2672933  T
Q  217 tgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2672934 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2673032  T
Q  312 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 408  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||    
T  2673033 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 2673131  T
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
    ||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2673132 ttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 2673195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8512342 - 8512037
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8512342 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8512245  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttg-cttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtt 364  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| | |  ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  8512244 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgcttgttaactcttagtgtggttgtgct 8512147  T
Q  365 atacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 460  Q
    | ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8512146 acacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctc 8512047  T
Q  461 attggtgtga 470  Q
    ||||||||||    
T  8512046 attggtgtga 8512037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8517222 - 8516917
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8517222 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 8517125  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttg-cttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtt 364  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| | |  ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || || |    
T  8517124 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgcttgttaactcttagtgtggttgtgct 8517027  T
Q  365 atacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 460  Q
    | ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8517026 acacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctc 8516927  T
Q  461 attggtgtga 470  Q
    ||||||||||    
T  8516926 attggtgtga 8516917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32143612 - 32143287
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  32143612 gggttgagtgtctttgtagtgatgatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 32143517  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  32143516 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 32143419  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  32143418 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttt 32143319  T
Q  299 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 330  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32143318 -ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 32143287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24968286 - 24967957
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttt 216  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||  ||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||    
T  24968286 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaagtaccaaagggtaga-tctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 24968190  T
Q  217 tgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  24968189 tgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 24968091  T
Q  312 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 408  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||    
T  24968090 tttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccat 24967993  T
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccaca 444  Q
    |||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  24967992 ttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32475608 - 32475306
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32475608 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32475512  T
Q  271 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  32475511 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 32475415  T
Q  367 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 461  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  32475414 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 32475315  T
Q  462 ttggtgtga 470  Q
    |||||||||    
T  32475314 ttggtgtga 32475306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27453224 - 27452924
Alignment:
Q  29 tctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttcctctagtgacttctcttttagggtt 128  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  27453224 tctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttttagggtt 27453129  T
Q  129 catcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacacttt 227  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||    |||||| |||| |||||||||||||    
T  27453128 catattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaaccctttgtaacacttt 27453031  T
Q  228 ca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttg 322  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||    
T  27453030 catcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt-ttggtgtgtttgttccttctttcttg 27452932  T
Q  323 cttatctt 330  Q
    ||||||||    
T  27452931 cttatctt 27452924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32480466 - 32480163
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  32480466 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 32480370  T
Q  271 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  32480369 attggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 32480273  T
Q  367 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg--tttatt-tc 460  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||    
T  32480272 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttggatttattctc 32480173  T
Q  461 attggtgtga 470  Q
    ||||||||||    
T  32480172 attggtgtga 32480163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10207981 - 10207755
Alignment:
Q  250 ctctctcccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgctt-atcttgtttatgcttgttag 345  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  | |||| || || |||||||| |||||||||||    
T  10207981 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtt-atgcttgttag 10207884  T
Q  346 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccac 443  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  10207883 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 10207784  T
Q  444 acatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10207783 acatcattggtttattctcattggtgtga 10207755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 22173035 - 22173100
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173035 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Original strand, 27986253 - 27986567
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  27986253 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 27986348  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    || | ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  ||||         
T  27986349 cttttgtgtcttctcttttagggttgatattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagct----- 27986441  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
    || || |      |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  27986442 ttttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-t 27986534  T
Q  299 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 330  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27986535 tggtgtgtttgttcattctttcttgcttatctt 27986567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 388 - 491
Target Start/End: Original strand, 40372986 - 40373085
Alignment:
Q  388 tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcac 487  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40372986 tgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcac 40373081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 27974749 - 27975039
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  27974749 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtcgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 27974844  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| |||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  27974845 cttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagaatggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt 27974941  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974942 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 8370488 - 8370573
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370488 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 18552883 - 18552970
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18552883 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 18552970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36029180 - 36029094
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgc--tctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029180 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16264638 - 16264350
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  16264638 gggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-ccattggaaggatcaaaagcttc 16264543  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| || | ||||||  ||||   || |||||||  |||||||  ||||  |     
T  16264542 cttttgtgtcttctc--ttagggttcatcattgagagagt-gggtaacacaaatgtgtagaaattaggtcttgttcttgtg-gaagcttgcaagct--at 16264449  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264448 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21711308 - 21711223
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21711308 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21711223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 33386472 - 33386628
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  33386472 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-ccattggaaggatcaaaagcttc 33386567  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttca-tcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaa 164  Q
    || | ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  33386568 cttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaa 33386628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Original strand, 1736305 - 1736389
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736305 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1309878 - 1309819
Alignment:
Q  272 ttggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1309878 ttggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 1309819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 3716002 - 3716089
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3716002 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 3716089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 30709790 - 30709877
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709790 cttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 40592782 - 40592869
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40592782 cttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 40592869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18656677 - 18656614
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656677 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 18656614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 4386774 - 4386840
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4386774 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaatcaccttgagtagtgag 4386840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36029382 - 36029316
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36029382 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 36029316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 40592579 - 40592645
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40592579 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 40592645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 48438301 - 48438214
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  48438301 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatctt 48438214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 6794715 - 6794800
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  6794715 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatctt 6794800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40844738 - 40844652
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  40844738 cttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatctt 40844652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 47923704 - 47923767
Alignment:
Q  7 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  47923704 ttgagtgtctttgtagtgagaatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 47923767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 1736101 - 1736167
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  1736101 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 1736167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 3323488 - 3323554
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  3323488 gggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 3323554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 3328154 - 3328220
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3328154 gggttgaatgtctttgtagtgagcttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 3328220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 8370286 - 8370352
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  8370286 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggtagtgag 8370352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21711511 - 21711445
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21711511 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgagtagtgag 21711445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 24694963 - 24695029
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24694963 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtggtgag 24695029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26299277 - 26299211
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  26299277 gggttgaatgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 26299211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25795868 - 25795781
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||| |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795868 ctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26299075 - 26298988
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26299075 cttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 26298988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 47923906 - 47923993
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||| |||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47923906 cttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 47923993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8126917 - 8126853
Alignment:
Q  6 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  8126917 gttgagtgtctttgtagtgaggttttcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 8126853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 23392166 - 23392106
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23392166 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 23392106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 296
Target Start/End: Original strand, 1417513 - 1417577
Alignment:
Q  235 tggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1417513 tggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 1417577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 2672783 - 2672835
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2672783 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2672835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 2676939 - 2676991
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2676939 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2676991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328443
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc-tgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatctt 3328443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 6794512 - 6794578
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||| |||| | |||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  6794512 gggttgagtgtcattgtagtgaggttctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 6794578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8512450 - 8512398
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8512450 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 8512398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8517330 - 8517278
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8517330 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 8517278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10274646 - 10274605
Alignment:
Q  31 tcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10274646 tcttgggttgggaaacacattatattcaccttgggtagtgag 10274605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 24968340 - 24968288
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24968340 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 24968288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 35925767 - 35925701
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||| ||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  35925767 gggttgaatgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 35925701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466291
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 37466291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 39032352 - 39032417
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  39032352 gggttgagtgtctttgtagtgaga-tctcttgggttggtaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 39032417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23410586 - 23410529
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 63  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  23410586 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttg 23410529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 24695164 - 24695251
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24695164 cttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 24695251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 30631705 - 30631227
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtg-aggagttcattggttggaaggatttaaag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30631705 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtggaggagttcattagttggaaggatctaaag 30631606  T
Q  100 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagcta 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  ||||    
T  30631605 cttcctctagtgacttctcttt-agggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggcta 30631507  T
Q  199 gagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30631506 gagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatctt 30631407  T
Q  297 ctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt-- 393  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  30631406 cttggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggct-gttttgttgttg 30631308  T
Q  394 ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt 474  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30631307 ttgcttgaaaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcatttgtgtgagttt 30631227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31180509 - 31180138
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31180509 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 31180410  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagagct 203  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  31180409 ctctagtgtcttctcttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtcttgtgtaaagcttgaaggctagagtt 31180310  T
Q  204 tcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcgg 301  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31180309 tcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttgg 31180210  T
Q  302 tgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacacta 372  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31180209 tgttttgttctttctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 119 - 492
Target Start/End: Original strand, 1457067 - 1457446
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  1457067 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 1457165  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457166 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 1457265  T
Q  316 tttcttgcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgt 412  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1457266 tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 1457365  T
Q  413 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1457366 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 1457446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 119 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 43592459 - 43592080
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43592459 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43592361  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592360 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43592261  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  43592260 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 43592161  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43592160 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattgatgtgactttggaaccggattcacaaca 43592080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27445150 - 27444771
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  27445150 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 27445052  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445051 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27444952  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  27444951 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27444852  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 491  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27444851 tactcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27444771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 27449994 - 27449615
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  27449994 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 27449896  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449895 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27449796  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  27449795 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27449696  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 491  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27449695 tactcattgattaccactatctcttgctccacatatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27449615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 43598904 - 43598525
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43598904 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43598806  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598805 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43598706  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  43598705 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43598606  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43598605 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43598525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 43604396 - 43604017
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43604396 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43604298  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604297 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43604198  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  43604197 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43604098  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43604097 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43604017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 119 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 43609888 - 43609509
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  43609888 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 43609790  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609789 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43609690  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  43609689 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43609590  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  43609589 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaaca 43609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15044865 - 15044512
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  15044865 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaacctttt 15044768  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15044767 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcc 15044668  T
Q  316 -tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| | ||||| ||||||||    
T  15044667 ttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttg 15044569  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  15044568 ttctcattgattaccactatcacttgctctacacgtcattg--tatttcattggtgtga 15044512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Original strand, 28807485 - 28807837
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaac 222  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||    
T  28807485 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaga--ttcttgtaaccttttgtaac 28807581  T
Q  223 actttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctt 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  28807582 actt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttt 28807680  T
Q  318 tcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 414  Q
    |   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28807681 taccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgagtggttttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttc 28807780  T
Q  415 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807781 tcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 28807837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 24136142 - 24135659
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  24136142 gggttgagtgtctttgtagaaagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 24136044  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||  |||||        
T  24136043 ctctagtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta-ttt 24135946  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24135945 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 24135846  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgttt 395  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||  |  |  |||| | ||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  24135845 ggtgtgtttgttcttccttttctagcttatcttgtt--tgctttgta--ttatcttgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgttt 24135750  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||| ||  | | | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || |   |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24135749 gcttggagac--tctttactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttat---tttcattggtgtgagttttatccggattcacaaca 24135659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 38219691 - 38219208
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  38219691 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 38219594  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  38219593 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 38219496  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38219495 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 38219396  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  38219395 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 38219299  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38219298 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38219208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Original strand, 37556533 - 37556887
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  37556533 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37556629  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37556630 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37556729  T
Q  317 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 414  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  37556730 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37556829  T
Q  415 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  37556830 tcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgtga 37556887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Original strand, 37561355 - 37561709
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  37561355 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37561451  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37561452 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37561551  T
Q  317 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 414  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  37561552 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctc 37561651  T
Q  415 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  37561652 tcatagattatcactatcacttgctccacacatctttggtttattatcattggtgtga 37561709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35387955 - 35387624
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||| ||||    
T  35387955 gggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaaacttc 35387858  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   | | ||||||||| |||||  |||||        
T  35387857 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 35387760  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  35387759 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatcttttt 35387660  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387659 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctcgttt 35387624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 38192369 - 38191983
Alignment:
Q  103 cctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  38192369 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt 38192271  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38192270 -ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt 38192172  T
Q  299 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--t 394  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  38192171 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgt 38192075  T
Q  395 tgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38192074 tgcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38191983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2785550 - 2785197
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 220  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | || ||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  2785550 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 2785454  T
Q  221 acactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  2785453 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 2785355  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 412  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  2785354 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 2785257  T
Q  413 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2785256 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 2785197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 31396953 - 31397256
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31396953 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 31397050  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgt---tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  31397051 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgtt-ttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctt 31397147  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 461  Q
    |||| ||| ||  || || ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31397148 tacattaggcttaggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 31397247  T
Q  462 ttggtgtga 470  Q
    |||||||||    
T  31397248 ttggtgtga 31397256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 31401810 - 31402113
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31401810 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggcca 31401907  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  31401908 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctt 31402004  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 461  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31402005 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 31402104  T
Q  462 ttggtgtga 470  Q
    |||||||||    
T  31402105 ttggtgtga 31402113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 124 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33791491 - 33791158
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 220  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  33791491 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 33791395  T
Q  221 acactttcacatattggattggagagctgctc--tctcccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  33791394 acacattcacatattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 33791296  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 412  Q
     ||| | | ||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  33791295 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctctatatgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 33791198  T
Q  413 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 452  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33791197 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33791158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33768299 - 33768021
Alignment:
Q  179 tgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct--ctcccagattaggccatattg 274  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  33768299 tgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattg 33768202  T
Q  275 gctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacac 370  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| | | ||||| ||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||     
T  33768201 gctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctg--tatgcttgttagctctatatgtggttttgctatacat 33768105  T
Q  371 tagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 452  Q
    ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||   ||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33768104 taggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33768021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 1457002 - 1457067
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457002 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 27445215 - 27445150
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445215 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 27450059 - 27449994
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450059 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43592524 - 43592459
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592524 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43598969 - 43598904
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598969 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43604461 - 43604396
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604461 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43609953 - 43609888
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609953 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15464823 - 15464532
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  15464823 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--catcgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 15464728  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  15464727 cttttgtgtcttctcttttagggttcattattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt 15464630  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464629 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15044931 - 15044865
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044931 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 36932156 - 36932447
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||| | | ||   |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  36932156 gggttgagtgtctttatagtgatgatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 36932251  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||||||  || |   ||| ||| |||||| ||||  |||||       
T  36932252 ctcttgtgtcttctgttttagggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttatgtaaa-cttgcaagctattt 36932349  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932350 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 9353344 - 9353429
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353344 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14520519 - 14520230
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  14520519 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 14520424  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  14520423 cttttgtgtcttctcttt-agggttcataattgagagagtgggtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt- 14520328  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520327 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10281838 - 10281751
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281838 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 31180142 - 31180079
Alignment:
Q  426 cactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31180142 cactatctcttgctccacacatcattgtta--ttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 31180079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19588833 - 19588746
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588833 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Original strand, 11916982 - 11917068
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916982 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 28807429 - 28807479
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807429 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 28807479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 24553335 - 24553401
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24553335 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 24553401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3880386 - 3880299
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  3880386 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatctt 3880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004057
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 17004057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Original strand, 11181641 - 11181705
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtga 71  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11181641 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtga 11181705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 293
Target Start/End: Original strand, 12084187 - 12084269
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 293  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084187 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 28832544 - 28832480
Alignment:
Q  6 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  28832544 gttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 28832480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 9353140 - 9353206
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9353140 gggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 9353206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 11916780 - 11916846
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  11916780 gggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 11916846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832259
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatctt 28832259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 31300404 - 31300469
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31300404 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 31300469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 435 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 35387527 - 35387474
Alignment:
Q  435 ttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35387527 ttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 35387474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2785608 - 2785556
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2785608 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2785556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 7160712 - 7160770
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 64  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7160712 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttggattggg--aaacattgtaatcaccttgg 7160770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 17003767 - 17003833
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  17003767 gggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggtttggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 17003833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19589034 - 19588968
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  19589034 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggcagtgag 19588968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 31396843 - 31396895
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31396843 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 31396895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 31401700 - 31401752
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31401700 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 31401752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 33768417 - 33768365
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33768417 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33768365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 33791549 - 33791497
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33791549 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33791497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127507
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 42127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 24742236 - 24741748
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24742236 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 24742137  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  24742136 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattgt 24742038  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24742037 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 24741938  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  24741937 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttg 24741839  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24741838 cttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 24741748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 29760937 - 29760449
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagctt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29760937 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagctt 29760838  T
Q  103 cctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctaga 200  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||   ||||      
T  29760837 cctctagtgtcttctctt--agggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaggctatt 29760741  T
Q  201 gcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttc 297  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760740 gtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttc 29760641  T
Q  298 tcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--t 394  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||  |    
T  29760640 ttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctaggg-ttgttttgttgttgt 29760543  T
Q  395 tgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29760542 tgcttggaaaccattt-tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 29760449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 119 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 51520637 - 51520257
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  51520637 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 51520539  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520538 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 51520439  T
Q  316 tttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  |  |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  51520438 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 51520339  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt-caaccggaatcacaacag 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  51520338 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacag 51520257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3814202 - 3813846
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  3814202 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaacctttt 3814106  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3814105 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttc 3814006  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgctttt-gttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  3814005 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 3813906  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3813905 ctctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 3813846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 9224312 - 9224668
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  9224312 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 9224410  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224411 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9224510  T
Q  316 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  9224511 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9224609  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224610 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 9224668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 9229099 - 9229455
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  9229099 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 9229197  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229198 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9229297  T
Q  316 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  9229298 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9229396  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229397 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 9229455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 179 - 492
Target Start/End: Original strand, 56146677 - 56146996
Alignment:
Q  179 tgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggc 276  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56146677 tgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggc 56146775  T
Q  277 tgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttg-cttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagt 374  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  56146776 tgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagt 56146875  T
Q  375 ctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagt 472  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56146876 ctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgaat 56146975  T
Q  473 tt-caaccggaatcacaacag 492  Q
    ||  ||||||| |||||||||    
T  56146976 ttggaaccggattcacaacag 56146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18855900 - 18855549
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  18855900 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 18855804  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  18855803 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 18855705  T
Q  319 cttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 415  Q
     |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18855704 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 18855605  T
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18855604 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 18855549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 45357203 - 45357558
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 218  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  45357203 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttg 45357300  T
Q  219 taacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45357301 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45357400  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  45357401 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45357499  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357500 ttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 45357558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 45347723 - 45348079
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 218  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||    
T  45347723 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggt-cttgtaaccttttg 45347821  T
Q  219 taacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45347822 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45347921  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  45347922 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45348020  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45348021 ttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 45348079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5732828 - 5732486
Alignment:
Q  134 tgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacat 232  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5732828 tgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttgtaacactttctcat 5732732  T
Q  233 attggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-ttcctttcttgct 324  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| |||||||   | |    
T  5732731 attggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtt 5732632  T
Q  325 tatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattga 421  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5732631 tatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattga 5732534  T
Q  422 ttaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5732533 ttaccaccatcacttgctccacacatcattgtat-tttcattggtgtga 5732486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 28468342 - 28468660
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  28468342 gggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 28468439  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgtc-ttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||  |||||||| |||||  | |||        
T  28468440 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttattgtgtaa-gcttgcaaacta---- 28468534  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    || || |      |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28468535 ttttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 28468627  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28468628 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 28468660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Original strand, 31985441 - 31985764
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  | ||||    | ||||||||  ||||||||    
T  31985441 gggttgagtgtttttgtattgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgaa-atttcacca-tgggaaggatcaaaagcttc 31985536  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  31985537 cttttgtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 31985633  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |     
T  31985634 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttt- 31985732  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31985733 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 31985764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 51520702 - 51520637
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520702 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 18712606 - 18712671
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18712606 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgttatcaccttgggt 18712671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 9224247 - 9224312
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9224247 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 9229034 - 9229099
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9229034 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 16623101 - 16623390
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  16623101 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttc 16623196  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaa-gggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | |||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||| ||| ||||||||  ||||   ||| ||| ||||| ||||  ||||||       
T  16623197 cttttgtg--ttttcttttaggattcatattgtgagagtgggtga-cacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttctgtaa-gcttattagctaat- 16623291  T
Q  202 cttcttgcaac-cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16623292 -ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 16623390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 5396479 - 5396768
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||| ||  |||||||     
T  5396479 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaagaatcaaaagcttt 5396574  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | || ||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  5396575 cttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgagtaa-cacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt- 5396670  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396671 -ttcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 3814266 - 3814202
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814266 atggggtgtgtgtctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10047466 - 10047379
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10047466 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10047379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152536
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 38152536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39246081 - 39245994
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39246081 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 39245994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 45347658 - 45347721
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347658 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 45347721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 36315241 - 36315326
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36315241 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36315326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 36329450 - 36329535
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36329450 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36329535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5732907 - 5732844
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732907 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 5732844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 291  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 16628680 - 16628815
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  16628680 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-ccattggaaggatcaaaagcttc 16628775  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggg 145  Q
    || | |||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16628776 cttttgtg--ttttcttttaggattcatattgtgagagtggg 16628815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5112523 - 5112460
Alignment:
Q  7 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5112523 ttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 5112460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  214 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3777838 - 3777772
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3777838 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 3777772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269288
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 5269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 3796529 - 3796616
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796529 cttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 45357138 - 45357201
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357138 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 45357201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  214 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18855956 - 18855906
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855956 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 18855906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3777634 - 3777550
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777634 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 5269008 - 5269074
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5269008 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttggatagtgag 5269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10047670 - 10047604
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10047670 gggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 10047604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 25861841 - 25861907
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25861841 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgagtagtgag 25861907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 36315038 - 36315104
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36315038 gggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacacattgggtagtgag 36315104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 36329247 - 36329313
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36329247 gggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacacattgggtagtgag 36329313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 292
Target Start/End: Original strand, 16630690 - 16630773
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 292  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||    
T  16630690 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333809
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 24333809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 6743226 - 6743289
Alignment:
Q  7 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6743226 ttgagtgtctttgtagcgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtaatgag 6743289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867184
Alignment:
Q  214 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||| ||||| |||| | ||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 54867184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 38152246 - 38152311
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtga 71  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38152246 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggatggg--aaatattgtaaacaccttgggtagtga 38152311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 42599383 - 42599448
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42599383 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttcggttggg--aaacattctaaacaccttgggtagtgag 42599448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 493
Target Start/End: Original strand, 11098728 - 11099219
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  11098728 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagtacattagttggaaggatctaaagcttc 11098827  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||  |     
T  11098828 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgcaagctattgt 11098926  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11098927 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 11099026  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 396  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  11099027 ggtgttttgttcttcctttcttccttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttg 11099125  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacaga 493  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11099126 cttggaaaccattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaga 11099219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 14291784 - 14291295
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14291784 gggttgagcgtctttgtagatagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 14291685  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||  |     
T  14291684 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaaggctattgt 14291586  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14291585 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 14291486  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgttt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| ||   |||||||||    
T  14291485 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgttt 14291387  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14291386 gcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 14291295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 9296203 - 9296691
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  9296203 gggttgagtgtctttgtagaaagtgtctattgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 9296301  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||  ||||  |     
T  9296302 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataa-gcttgaaggctattgt 9296400  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9296401 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 9296500  T
Q  300 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgttt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||   |||||||||    
T  9296501 ggtgttttgttcttcctttcttgcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttt 9296599  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9296600 gcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 9296691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 153 - 470
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312885
Alignment:
Q  153 caaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgct 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 44312661  T
Q  252 ctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagct 347  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | || ||    
T  44312662 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  348 ctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 445  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 44312860  T
Q  446 atcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44312861 atcattgtttatttcattggtgtga 44312885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32246966 - 32246607
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 218  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  32246966 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagag--tcttgtaaccttttg 32246869  T
Q  219 taacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32246868 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcc 32246769  T
Q  316 ----tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 408  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||| |||||    
T  32246768 tttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccat 32246670  T
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32246669 ttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 32246607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 39811894 - 39812250
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  39811894 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 39811991  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttc 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39811992 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 39812091  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
     |||   ||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  39812092 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 39812190  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39812191 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 39812250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3492043 - 3491716
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   |||     |||||||||| | |||||||    
T  3492043 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggaaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgaga--ttccaccattggaaggatcttaagcttc 3491946  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  3491945 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 3491848  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3491847 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 3491749  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3491748 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 3491716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 25398711 - 25398305
Alignment:
Q  83 gttggaaggatttaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgt 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| |||||    
T  25398711 gttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25398612  T
Q  182 gtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctg 278  Q
    |||| |||||  |||||    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  25398611 gtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctg 25398514  T
Q  279 aactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtct 376  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||    
T  25398513 aactgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtct 25398417  T
Q  377 agggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt 474  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  25398416 agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt 25398322  T
Q  475 caaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||| || ||||||||    
T  25398321 caaccagattcacaaca 25398305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 25403849 - 25403443
Alignment:
Q  83 gttggaaggatttaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgt 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   ||| |||||    
T  25403849 gttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25403750  T
Q  182 gtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctg 278  Q
    |||| |||||  |||||    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  25403749 gtaa-gcttgcaagctattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctg 25403652  T
Q  279 aactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtct 376  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| | ||| | |||||||||||    
T  25403651 aactgagtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctc-ttgtgtggtgttgctctacactagtct 25403555  T
Q  377 agggctggttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagttt 474  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  25403554 agggctgtttttgttgttgttgcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttt 25403460  T
Q  475 caaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||| ||||||||    
T  25403459 caaccggattcacaaca 25403443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19344596 - 19344243
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 220  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19344596 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19344500  T
Q  221 acactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19344499 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19344400  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 412  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  19344399 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19344302  T
Q  413 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19344301 tctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 19344243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19349454 - 19349101
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 220  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19349454 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19349358  T
Q  221 acactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19349357 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19349258  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 412  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  19349257 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 19349160  T
Q  413 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19349159 tctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 19349101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40739123 - 40738810
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | ||||    ||||||||||  |||||||     
T  40739123 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagctta 40739028  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  40739027 ctattgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaagacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta---- 40738933  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 300  Q
     | || |      |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  40738932 -tttttc------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctccccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttg 40738841  T
Q  301 gtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 330  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40738840 gtgtgtttgttcttcctttctagcttatctt 40738810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25407838 - 25407663
Alignment:
Q  83 gttggaaggatttaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgt 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||   || ||||||    
T  25407838 gttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgt 25407739  T
Q  182 gtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc 258  Q
    || |||||||  |||||    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25407738 gt-aagcttgcaagcta-tttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccc 25407663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 39811829 - 39811894
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39811829 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttgagaaaaacattgtaatcaccttgggt 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21630030 - 21629944
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21630030 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 21629944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040060
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 8040060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25409922 - 25409854
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25409922 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 25409854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13569415 - 13569331
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569415 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 28259189 - 28259274
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259189 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20522308 - 20522220
Alignment:
Q  212 ccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20522308 ccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20522220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 36757570 - 36757859
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  36757570 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-ccattggaaggatcaaaagcttc 36757665  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| || ||||||||  |||| | || |||||||| |||||||| ||||        
T  36757666 cttttgtgtcttctc-tttagggttcatcattgagagagt-gggtaacacaaatgggtagaaattaggttttgttcttgtgt-aagcttgaaagct--tt 36757760  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||  |||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36757761 tttcttataactctttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 10445454 - 10445541
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttcaca-tattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10445454 cttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 10445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17865290 - 17865203
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17865290 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatctt 17865203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 34682344 - 34682431
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34682344 cttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 34682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32247031 - 32246968
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32247031 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 32246968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34388945 - 34388859
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388945 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 39483222 - 39483156
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39483222 gggttgagtgtctttgttgtgaggatctcttgggttggg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 39483156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 14699018 - 14699104
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14699018 cttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14699104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Original strand, 23078278 - 23078433
Alignment:
Q  3 tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagctt 102  Q
    ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||  |||||||    
T  23078278 tgggttgagtgtctttgtgatgagaatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-tcattggaaggatcaaaagctt 23078373  T
Q  103 cctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtg-gggaaacaccaaagggtagaa 164  Q
    ||| | ||| ||||||  |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  23078374 ccttttgtgtcttctc--ttagggttcatcat-tgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaa 23078433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 33528631 - 33528718
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33528631 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 33528718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Original strand, 10707262 - 10707348
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||  | |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707262 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21630232 - 21630168
Alignment:
Q  6 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21630232 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 21630168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 41586358 - 41586425
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaca-ttgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41586358 gggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttgg--aaaacagttgtaaacaccttgggtagtgag 41586425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Original strand, 8390160 - 8390244
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 293  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8390160 cttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 14698817 - 14698883
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14698817 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctctcgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 14698883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17865494 - 17865428
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  17865494 gggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 17865428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20522511 - 20522445
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||    
T  20522511 gggttgagtgtctttgtagtgagtatctcttgggttggg--aagcattgtaaacaacttgggtagtgag 20522445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33118424 - 33118358
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  33118424 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggggaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 33118358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 33528432 - 33528498
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33528432 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacacattgggtagtgag 33528498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 34389140 - 34389074
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  34389140 gggttgtgtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 34389074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 296
Target Start/End: Original strand, 42039684 - 42039766
Alignment:
Q  218 gtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcc--cagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039684 gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 10445275 - 10445341
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||| ||||||||| | |||  ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10445275 gggttgaatgtctttgtagtgaggttctctcgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 10445341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 28258985 - 28259051
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  28258985 gggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggtagtgag 28259051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 2869501 - 2869566
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2869501 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttgg--aaaacattgtaaacacattgggtagtgag 2869566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940306
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 16940306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010971
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctg--ctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || || ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 17010971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Original strand, 29867780 - 29867840
Alignment:
Q  3 tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  29867780 tgggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 29867840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31056334 - 31056266
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31056334 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 31056266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39483018 - 39482931
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39483018 cttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39482931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 20357348 - 20357837
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20357348 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 20357447  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||  |     
T  20357448 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgt 20357547  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20357548 ttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttg 20357647  T
Q  301 gtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---ttgttgttt 395  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||   ||||||||     
T  20357648 gtattttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtta 20357745  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20357746 gcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 20357837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 2058264 - 2057763
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggtt--ggaaggatttaaagct 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||    
T  2058264 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatctaaagct 2058165  T
Q  102 tcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacacca-aagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctag 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  || |||||||| ||||||||  ||||     
T  2058164 tcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgt-aagcttgaatgctat 2058066  T
Q  200 agcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058065 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 2057966  T
Q  297 ctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttg----tttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt---t 387  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||| ||| ||| || ||||||||||| ||||| | || || |||||||||| | ||   |    
T  2057965 cttggtgttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgt 2057866  T
Q  388 tgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcac 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2057865 tgttgtttgcttggaaaccatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtgagtttcaaccggattcac 2057769  T
Q  488 aacaga 493  Q
    ||||||    
T  2057768 aacaga 2057763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 1533245 - 1533730
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  1533245 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 1533343  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||  |||||  |    
T  1533344 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattg 1533442  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1533443 tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttat 1533542  T
Q  299 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 395  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | |||||||| || ||||||||||||||||  ||    
T  1533543 tggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgta-ttctctttgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgtt 1533639  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1533640 gcttggaaac--ttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1533730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 24024232 - 24024589
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| ||||    
T  24024232 ttttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacatttt 24024329  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct-cggtgtttt-gttctt 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  24024330 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttctt 24024429  T
Q  314 ccttt-cttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccattt 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||   ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24024430 ccttttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatatactagtcataggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 24024529  T
Q  411 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024530 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 24024589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 118 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12406512 - 12406155
Alignment:
Q  118 cttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttt 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  12406512 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaaccttt 12406414  T
Q  217 tgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttc 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12406413 tgtaacactttctcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttt 12406314  T
Q  315 ctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccattt 410  Q
    ||||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  12406313 cttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccattt 12406215  T
Q  411 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406214 gttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 12406155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12397091 - 12396735
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  12397091 ttttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagag-ttcttgtaacctttt 12396993  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396992 gtaacactttctcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 12396893  T
Q  316 -tttcttgcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
     |||   ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  12396892 ctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 12396794  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396793 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 12396735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 31109489 - 31109844
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  31109489 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 31109586  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31109587 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttc 31109686  T
Q  315 c-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 410  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  31109687 cttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 31109784  T
Q  411 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109785 gttctcattgattatcactatcacttgctgcacacatcattgtttatttcattggtgtga 31109844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19992487 - 19992135
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19992487 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 19992391  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  19992390 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 19992291  T
Q  317 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 415  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19992290 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagccatttgttct 19992191  T
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19992190 cattgattatcactatcacctgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 19992135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 21646299 - 21645818
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||| ||||    
T  21646299 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaatcttc 21646202  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  21646201 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 21646104  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21646103 ttcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 21646004  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--ttg 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||   |||| | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  21646003 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtttgt-tttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttg 21645908  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||| ||  ||  | ||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21645907 cttggagacactt--tactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 21645818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21640101 - 21639770
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  21640101 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 21640004  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  21640003 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 21639906  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21639905 ttcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 21639806  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639805 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 21639770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 210 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4866819 - 4866553
Alignment:
Q  210 aaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866819 aaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt 4866720  T
Q  308 gttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgctttt-gttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttgga 402  Q
    |||||||||||    ||||||||||||| ||||| | || || |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||    
T  4866719 gttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttgga 4866621  T
Q  403 aaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866620 gaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 4866553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Original strand, 21812149 - 21812501
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagctt-gata-gctagagcttcttgcaaccttttgta 220  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||||||||    
T  21812149 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagag--tcttggaaccttttgta 21812245  T
Q  221 acactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cc 315  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |     
T  21812246 agactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttct 21812344  T
Q  316 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttc 414  Q
    |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  21812345 tttaccgtttatcttgtttatgcttgttaactctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgttagcttggaagccatttgctc 21812444  T
Q  415 tcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21812445 tcatagattaccactatctcttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 21812501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18413931 - 18413606
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| | |||||||    
T  18413931 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacaatgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcttaagcttc 18413834  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  | |||        
T  18413833 ctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaatctattt- 18413737  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18413736 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttg 18413638  T
Q  301 gtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 331  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18413637 gtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttg 18413606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18409055 - 18408726
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||  |||||| | |||||||    
T  18409055 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttaaaaggatcttaagcttc 18408958  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||| |||||  || ||        
T  18408957 ctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttattt- 18408861  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18408860 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 18408762  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgttt 334  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18408761 ggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgttt 18408726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 24266162 - 24266466
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24266162 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24266259  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  24266260 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 24266356  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 460  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  24266357 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 24266456  T
Q  461 attggtgtga 470  Q
    ||||||||||    
T  24266457 attggtgtga 24266466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 24261283 - 24261587
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24261283 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 24261380  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  24261381 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 24261477  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 460  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  24261478 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 24261577  T
Q  461 attggtgtga 470  Q
    ||||||||||    
T  24261578 attggtgtga 24261587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16880197 - 16879894
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16880197 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16880100  T
Q  271 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  16880099 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 16880003  T
Q  367 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 461  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  16880002 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 16879903  T
Q  462 ttggtgtga 470  Q
    |||||||||    
T  16879902 ttggtgtga 16879894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16885053 - 16884750
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccat 270  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  16885053 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccac 16884956  T
Q  271 attggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |    
T  16884955 attggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-t 16884859  T
Q  367 acactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 461  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  16884858 acattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctca 16884759  T
Q  462 ttggtgtga 470  Q
    |||||||||    
T  16884758 ttggtgtga 16884750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12397156 - 12397091
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397156 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 31109425 - 31109489
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109425 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4873373 - 4873310
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873373 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 4873310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12406576 - 12406513
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406576 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 12406513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 24024167 - 24024232
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24024167 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttggaaaaacattgtaatcaccgtgggt 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29159890 - 29159803
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29159890 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 29159803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  214 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 46516320 - 46516407
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46516320 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 46516407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 49091748 - 49091661
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49091748 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatctt 49091661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  219 taacactttca-catattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 56034 - 55948
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  56034 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 55948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  214 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 44848696 - 44848781
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848696 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190105
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9190105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284089
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20284089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20284378 - 20284312
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20284378 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 20284312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 23402821 - 23402887
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23402821 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 23402887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc-agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctccccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 2647706 - 2647793
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2647706 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatctt 2647793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 4796477 - 4796542
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4796477 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 4796542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 33332460 - 33332547
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33332460 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 33332547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21989194 - 21989131
Alignment:
Q  7 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21989194 ttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 21989131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2479625 - 2479559
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  2479625 gggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 2479559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2580474 - 2580390
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2580474 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 2580390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2580678 - 2580613
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2580678 gggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 2580613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 2647505 - 2647571
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2647505 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacatggtaagcaccttgggtagtgag 2647571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 44847933 - 44847999
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44847933 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttggatagtgag 44847999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 46516113 - 46516179
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  46516113 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 46516179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 21812092 - 21812143
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21812092 ctttgatgagagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 21812143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960816
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatctt 35960816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 2479221 - 2479148
Alignment:
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaaca 491  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  2479221 cattgattaccact-tcctttgctccacacatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaaca 2479148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3047543 - 3047477
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  3047543 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacactataatcatcttgggtagtgag 3047477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 9184982 - 9185048
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9184982 gggttgagtatctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 9185048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185262
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 24266054 - 24266106
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24266054 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 24266106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 47263562 - 47263485
Alignment:
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaacagaag 495  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  47263562 cattgattaccact-tcctttgctccacgcatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaacagaag 47263485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 47263955 - 47263889
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  47263955 gggttgagtgtctttgtagtgagaatctcttcggttggg--aaacattgtaaataccttgggtagtgag 47263889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 5817282 - 5817366
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttcacat-attggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  5817282 tttgtatcactttcatattagtggattggagagctgctctctccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 5817366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Original strand, 9189840 - 9189881
Alignment:
Q  29 tctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9189840 tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 9189881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Original strand, 24787165 - 24787624
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24787165 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattataatcaccttgggcagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagcttc 24787264  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||  ||||  |     
T  24787265 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgt 24787364  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctct--ctcccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcg 300  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24787365 ttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttg 24787464  T
Q  301 gtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctg-gttttgttgt---- 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||  |||||||||        
T  24787465 gtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgtt 24787562  T
Q  394 -ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgttt 455  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24787563 gttgcttggaaaccattt-tgctcatttattaccactatctcttgctccacacatctttgttt 24787624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 25444996 - 25445352
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  25444996 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaacctttt 25445092  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt- 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25445093 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttt 25445192  T
Q  314 -cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
     | |||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25445193 ccttttaccgtttatcttgtttacgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttg 25445292  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25445293 ttctcattgattatcactatcgcttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 25445352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39445673 - 39445322
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39445673 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 39445577  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  39445576 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39445478  T
Q  319 cttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 415  Q
     |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39445477 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttca 39445378  T
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39445377 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 39445322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Original strand, 44023785 - 44024135
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44023785 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 44023881  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-cctt 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44023882 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 44023980  T
Q  318 tcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctc 416  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44023981 taccatttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctc 44024080  T
Q  417 attgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44024081 attgattatcactatcagttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 44024135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41398415 - 41398060
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  41398415 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 41398318  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398317 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 41398218  T
Q  316 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggtt-----ttgttgtttgcttggaaacca 407  Q
    ||     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||| ||     |||||||||||||||| ||||    
T  41398217 tt-----cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagacca 41398124  T
Q  408 tttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41398123 tatgttctcattgattatcactatcacttgctccacacataattggtttatttcattggtgtga 41398060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 24202573 - 24203054
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    |||||||||| |||||||||    
T  24202573 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atctcacca-ttggaaggatctaaagcttc 24202670  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  24202671 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 24202768  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24202769 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 24202868  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttg 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  24202869 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttctct-tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgtttg 24202964  T
Q  397 cttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24202965 cttggagacactt--tacacatagattaccactcccttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24203054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Original strand, 1054923 - 1055274
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  1054923 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 1055019  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  1055020 cactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 1055118  T
Q  317 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 415  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||  ||||||||  |||||||||     
T  1055119 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtaagcttggaagacatttgttca 1055218  T
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1055219 cattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 1055274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41390760 - 41390488
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  41390760 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 41390663  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41390662 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatcttctcgatgttttgttcttcc 41390563  T
Q  316 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtg--cttttgttatacactagtctagggctggttttgttgtt 394  Q
    ||     |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41390562 tt-----cttatcttgtttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggct-gttttgttgtt 41390488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 19361237 - 19361564
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  19361237 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaa-cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 19361333  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  | |||        
T  19361334 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt- 19361431  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19361432 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-tt 19361530  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 331  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19361531 ggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19361564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 19358648 - 19358975
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  19358648 gggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaaa-cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 19358744  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||| |||||||  |||||        
T  19358745 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta-ttt 19358842  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19358843 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-tt 19358941  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 331  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19358942 gatgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19358975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 452
Target Start/End: Original strand, 43988424 - 43988709
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  43988424 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 43988521  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttat 366  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||| |||| || || | |  | ||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  43988522 cattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatgcttgttagctcttagtgtggttgtgctat 43988621  T
Q  367 acactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 452  Q
    ||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43988622 acattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 43988709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 331
Target Start/End: Original strand, 19379916 - 19380204
Alignment:
Q  44 aaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtg 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19379916 aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtg 19380013  T
Q  144 gggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattg 241  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  | |||    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19380014 gggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactattt-ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattg 19380111  T
Q  242 gagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttg 331  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19380112 gagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttg 19380204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 19366112 - 19366276
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  19366112 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 19366209  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagg 170  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19366210 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctagg 19366276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 41398480 - 41398415
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398480 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41386650 - 41386571
Alignment:
Q  392 gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41386650 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 41386571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 41390825 - 41390760
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390825 aatggattgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3281995 - 3281708
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttcc 104  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||  |||||||||    
T  3281995 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaagcttcc 3281900  T
Q  105 tctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    | | ||| ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  3281899 ttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-- 3281806  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281805 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704033
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47704033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 26644909 - 26644994
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644909 tttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476261
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9476261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19073015 - 19072928
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073015 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19120905 - 19120818
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120905 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598398
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 13598398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 16124526 - 16124613
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16124526 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 16124613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 27104382 - 27104469
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  27104382 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 27104469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651811
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatctt 29651811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37069855 - 37069770
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069855 tttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 47098633 - 47098699
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47098633 gggttgagtgtctttgtagcgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 47098699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 47102647 - 47102713
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47102647 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 47102713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775672
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 775672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 13604430 - 13604720
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  13604430 gggttgagtatctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-ccattggaaggatcaaaagcttc 13604525  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttca-tcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||||||||  ||||   || |||||||| ||| |||  |||||       
T  13604526 cttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgt-aagtttgcaagcta-tt 13604621  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604622 tttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 1054854 - 1054917
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054854 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 1054917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 25439738 - 25439801
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25439738 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 25439801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 25444931 - 25444994
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25444931 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 25444994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 39445742 - 39445679
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445742 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 39445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 44023716 - 44023779
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023716 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 44023779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 29652102 - 29652036
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  29652102 gggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 29652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098921
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13598688 - 13598623
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  13598688 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 13598623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 27104211 - 27104275
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  27104211 ggttgagtgtctttgtagtgag-gtctcttgggttgggaaa--cattataagcaccttgggtagtgag 27104275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 194
Target Start/End: Original strand, 25439803 - 25439877
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgata 194  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  25439803 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-ctctagggtttgttcatgtgtaaagcttgata 25439877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 435 - 491
Target Start/End: Original strand, 19359079 - 19359132
Alignment:
Q  435 ttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19359079 ttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 19359132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 21536378 - 21536441
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 69  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21536378 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagt 21536441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 21536581 - 21536666
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttcac-atattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca-tattggctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536581 tttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32889727 - 32889661
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  | | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  32889727 gggttgagtgtctttgtagtgaggtttttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 32889661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 43988314 - 43988366
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43988314 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 43988366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Original strand, 16124347 - 16124388
Alignment:
Q  29 tctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  16124347 tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 16124388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22819714 - 22819657
Alignment:
Q  10 agtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 69  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  22819714 agtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagt 22819657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 37070055 - 37069998
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 64  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  37070055 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgg 37069998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 40816622 - 40816690
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40816622 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 40816690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 47703741 - 47703809
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  47703741 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 47703809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 5674571 - 5675057
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  5674571 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 5674669  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt--cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||| |||||  |||||  |    
T  5674670 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattg 5674768  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5674769 tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctctt 5674868  T
Q  299 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgttgt--tt 395  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  5674869 tggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgta-ttctctttgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgtt 5674965  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||| || | ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5674966 gcttgggaaac-tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgt---tttcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 5675057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 22010602 - 22010958
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  22010602 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 22010700  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010701 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22010800  T
Q  316 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||  | ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22010801 ttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22010899  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010900 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 22010958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11857154 - 11856795
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  11857154 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttgtaacctttt 11857056  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtttt---gttct 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  11857055 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtttttttgttct 11856956  T
Q  313 tcctttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccat 408  Q
    ||||||  | |||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||    
T  11856955 tccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccat 11856857  T
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856856 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 11856795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 14737482 - 14737838
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  14737482 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 14737579  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc-ttc 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14737580 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14737679  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc-tttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccattt 410  Q
     |||   ||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  14737680 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 14737778  T
Q  411 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737779 gttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 14737838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 14742342 - 14742697
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  14742342 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 14742439  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14742440 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14742539  T
Q  316 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  14742540 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttg 14742638  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742639 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 14742697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6438674 - 6438324
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  6438674 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 6438578  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttt 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  6438577 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 6438479  T
Q  319 cttgc--ttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 415  Q
     |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6438478 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccattggttct 6438379  T
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438378 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 6438324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28184684 - 28184325
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  | ||| ||||||||    
T  28184684 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tgttgtaacctttt 28184587  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28184586 gtaacactttctcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 28184487  T
Q  316 tttct--tgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca--t 408  Q
    ||| |   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||  |    
T  28184486 tttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 28184388  T
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28184387 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 28184325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 28155477 - 28155832
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaaccttttg 218  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  28155477 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaa--ttcttgtaaccttttg 28155573  T
Q  219 taacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-- 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  28155574 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 28155673  T
Q  314 cctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||| ||  |||||||| ||||| | ||||||||    
T  28155674 catttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 28155773  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155774 ctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttattgcattggtgtga 28155832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6005592 - 6005239
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgta 220  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  6005592 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 6005496  T
Q  221 acactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  6005495 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 6005397  T
Q  315 ctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgt 412  Q
     ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||     
T  6005396 ttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgc 6005299  T
Q  413 tctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6005298 actcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 6005239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16838923 - 16838566
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttga-tagctagagcttcttgcaac-cttt 216  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||    
T  16838923 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 16838827  T
Q  217 tgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  16838826 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 16838728  T
Q  312 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccat 408  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| ||||| |  ||||    
T  16838727 tttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttgaaggccat 16838630  T
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
    |||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16838629 ttgcactcatagattatctctatcacttgctccacatatcattggtttattctcattggtgtga 16838566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 452
Target Start/End: Original strand, 33330351 - 33330690
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 216  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  33330351 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33330447  T
Q  217 tgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33330448 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33330546  T
Q  312 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca 407  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||    
T  33330547 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggtttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggcca 33330645  T
Q  408 tttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 452  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33330646 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33330690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 470
Target Start/End: Original strand, 33335848 - 33336207
Alignment:
Q  120 tttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttt 216  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||    
T  33335848 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33335944  T
Q  217 tgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33335945 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33336043  T
Q  312 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgt-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaacca 407  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| | |||||  |||    
T  33336044 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgcttgttagctcttagtgtggtttttactatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagtttggaggcca 33336142  T
Q  408 tttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatt-tcattggtgtga 470  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33336143 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattggtttattctcattggtgtga 33336207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22709299 - 22708984
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||    ||||||||||  ||| ||||    
T  22709299 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcacca-ttggaaggatcaaaaacttc 22709204  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||   || |||||||| |||||||  |||||        
T  22709203 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta---- 22709109  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttct 298  Q
    || |       | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  | ||||| |||||||||| || |    
T  22709108 tttt-------tcttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaat-tttt 22709017  T
Q  299 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 330  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22709016 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 22708984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11857219 - 11857154
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857219 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 14737417 - 14737482
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737417 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 22010537 - 22010602
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010537 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 14742277 - 14742342
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14742277 aatgggttaagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcactttgggt 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5343519 - 5343322
Alignment:
Q  259 agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtg 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  5343519 agattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtg 5343423  T
Q  355 t-gcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt 451  Q
    | | ||||| |||||  ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5343422 tggtttttgctatactttaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcatt 5343323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 491
Target Start/End: Original strand, 30125940 - 30126084
Alignment:
Q  346 ctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttttgtt---gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcca 442  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  30125940 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttg-gctcatagattatcactacctcttgctcca 30126038  T
Q  443 cacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    |||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30126039 cacatctttgt---tttcattggtgtgattttcaaccggattcacaaca 30126084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 5757490 - 5757575
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757490 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21356118 - 21356036
Alignment:
Q  218 gtaacactttca-catattggattggagagctgctctctc--ccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356118 gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 28184752 - 28184684
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg---aaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||    
T  28184752 aatgggttgagggtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaaaacatagtaatcaccttgggt 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086570
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatctt 31086570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 5572251 - 5572338
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5572251 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 5572338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  214 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077262
Alignment:
Q  214 ttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 10077262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 28155412 - 28155475
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155412 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 28155475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22963786 - 22963700
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22963786 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 22963700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Original strand, 23824607 - 23824693
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct-cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23824607 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 23824693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6438743 - 6438680
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438743 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 6438680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 5017304 - 5017370
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5017304 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtaatgag 5017370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31936671 - 31936587
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttcacat-attggattggagagctgctc--tctcccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31936671 ttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 31936587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31936864 - 31936798
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31936864 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 31936798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31979600 - 31979513
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||| |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31979600 cttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31979513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017566
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatctt 5017566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 5572051 - 5572117
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||| |||||||||| | | |  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  5572051 gggttgggtgtctttgtagtggggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 5572117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 5757286 - 5757352
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||||    ||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  5757286 gggttgagtgtctttgtatttaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 5757352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6005650 - 6005598
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6005650 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 6005598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16838977 - 16838925
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16838977 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 16838925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22963988 - 22963922
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22963988 gggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 22963922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 23824405 - 23824471
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  23824405 gggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 23824471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 24435780 - 24435845
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  24435780 gggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 24435845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31979801 - 31979735
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31979801 gggttgagtgtctttgtagtgaggttcttttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 31979735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 33330297 - 33330349
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33330297 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33330349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 33335794 - 33335846
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33335794 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33335846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 21801150 - 21801218
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21801150 gggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 21801218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Original strand, 21801354 - 21801429
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgct--ctctcccagattaggccatattgg-ctgaactgg 284  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801354 cttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 416 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 31936470 - 31936398
Alignment:
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  31936470 cattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtt--tttcattggtgtga-ttttaaccggattcacaaca 31936398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9902
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||    
T  9549 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 9645  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9745  T
Q  316 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgtt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  9746 tttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctc-ttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgct 9844  T
Q  414 ctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9845 ctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 9902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 470
Target Start/End: Original strand, 1 - 143
Alignment:
Q  322 gcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcatt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  1 gcttatcttgtttatgcttgttagctc---gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcatt 97  T
Q  420 gattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||      ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  98 gat------tatcacttgctccacacatcattggtttatttaattggtgtga 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 3689 - 3754
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3689 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttaggaaaaacattgtaatcaccttgggt 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 201
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3836
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||    
T  3754 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag 3836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 66
Target Start/End: Original strand, 9514 - 9549
Alignment:
Q  31 tcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9514 tcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 119 - 470
Target Start/End: Original strand, 34967 - 35323
Alignment:
Q  119 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagcttcttgcaacctttt 217  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||    
T  34967 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag-ttcttctaacctttt 35065  T
Q  218 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35066 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 35165  T
Q  316 tttctt-gcttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggttt--tgttgtttgcttggaaaccatttg 411  Q
    |||    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  35166 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 35264  T
Q  412 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35265 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 35323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 34902 - 34967
Alignment:
Q  1 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34902 aatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 185
Alignment:
Q  124 gggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaaccttttgtaa 221  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  536 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagag--tcttgtaaccttttgtaa 440  T
Q  222 cactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  439 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 341  T
Q  317 ttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt-ttgttgtttgcttggaaaccatttgttct 415  Q
    ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340 ttaccgtttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttgttgttgtttgcttggaagccatttgttct 241  T
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  240 cattgattatcaccatcacttgctccacacatctttggtttatttcattggtgtga 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 542
Alignment:
Q  2 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 23849 - 24331
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  23849 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 23946  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  23947 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 24044  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24045 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 24144  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctgg-ttttgttgt--tt 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||   ||||   |||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  24145 ggtgtgtttgttcttcctttctttcttatcttgttt-tctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgtt 24240  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24241 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 491
Target Start/End: Original strand, 17756 - 18238
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||| |||||||||    
T  17756 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggatctaaagcttc 17853  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagagc 202  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |   ||| ||||||||| |||||  |||||        
T  17854 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt- 17951  T
Q  203 ttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 299  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17952 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 18051  T
Q  300 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctgg-ttttgttgt--tt 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||  ||| | |||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  18052 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgta-ttctct-tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgtt 18147  T
Q  396 gcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaatcacaaca 491  Q
    ||||||| ||  ||  | | ||| ||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18148 gcttggagacactt--tacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta---cattggtttgagttttaaccggattcacaaca 18238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 148916 - 149219
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  148916 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 149013  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  149014 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 149110  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 461  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  149111 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattgatttattctca 149210  T
Q  462 ttggtgtga 470  Q
    |||||||||    
T  149211 ttggtgtga 149219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 148808 - 148860
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  148808 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 148860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 2211 - 2514
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2211 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggcca 2308  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2309 cattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggttttgcta 2405  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tca 461  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2406 tacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccacacatcattgatttattctca 2505  T
Q  462 ttggtgtga 470  Q
    |||||||||    
T  2506 ttggtgtga 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2155
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2103 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 470
Target Start/End: Original strand, 19102 - 19428
Alignment:
Q  151 accaaagggtagaatctagggtct-gtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagc 247  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  19102 accaaagggtaga-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagc 19198  T
Q  248 tgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttg 341  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||    
T  19199 tgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttg 19295  T
Q  342 ttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgct 439  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19296 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 19395  T
Q  440 ccacacatcattg-tttatt-tcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19396 ccacacatcattgatttattctcattggtgtga 19428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 470
Target Start/End: Original strand, 14269 - 14573
Alignment:
Q  174 tgtcttgtgtaaagcttgata-gctagagcttcttgcaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctct--cccagattaggcca 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14269 tgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca 14366  T
Q  270 tattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgtta 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| |     
T  14367 cattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct- 14463  T
Q  366 tacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tc 460  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  14464 tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctc 14563  T
Q  461 attggtgtga 470  Q
    ||||||||||    
T  14564 attggtgtga 14573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 14161 - 14213
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14161 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 14213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 19017 - 19068
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttgg 64  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19017 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgg 19068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 492
Target Start/End: Original strand, 300 - 528
Alignment:
Q  264 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtgcttttg 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttcttggtgttttgttctttctttctagcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggttttg 398  T
Q  363 ttatacactagtctagggctg-gttttgttgt--ttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttattt 459  Q
     |   ||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||    
T  399 ctcctcactagtttagggctgttttttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgt---ttt 495  T
Q  460 cattggtgtgagtttcaaccggaatcacaacag 492  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  496 cattggtgtgagttttaaatggattcacaacag 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 470
Target Start/End: Original strand, 181976 - 182228
Alignment:
Q  226 ttcacatattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| |||     
T  181976 ttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttta 182075  T
Q  320 ttgcttatcttgtttatgcttgttagctctttgtgtgcttttgttatacactagtctagggctggtt--ttgttg-tttgcttggaaaccatttgttctc 416  Q
    | | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| ||| ||  ||||| ||  |||||| || |||||||  |||||||  |||    
T  182076 tcgtttatcttg--tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactc 182172  T
Q  417 attgattaccactatcacttgctccacacatcattg-tttatt-tcattggtgtga 470  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  182173 atagattacctctatctcttgctccacacatctttgatttattctcattggtgtga 182228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Original strand, 176829 - 176881
Alignment:
Q  15 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 65  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  176829 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 176881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 8225 - 8516
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||    ||||||||||| ||||||||    
T  8225 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacca-ttggaaggattaaaagcttc 8320  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttcatc-ttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctgt-cttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||   ||||||  ||||   ||| ||||||||| |||||  |||||       
T  8321 cttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatacgtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattt 8418  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8419 -ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 470
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34211
Alignment:
Q  392 gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34132 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattggtttatttcattggtgtga 34211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13171
Alignment:
Q  409 ttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcatt-gtttatttcattggtgtga 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacatatctttggtttatttcattggtgtga 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 36640 - 36929
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  36640 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-ccattggaaggatcaaaagcttc 36735  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttca-tcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtag-aatctagggtctgtcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || |||||| ||||  |  |   |||||||| |||||||  ||||  |     
T  36736 cttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaaatcatgtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagct--at 36830  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||  || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36831 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 296
Target Start/End: Original strand, 43973 - 44058
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43973 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 43769 - 43835
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  43769 gggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 43835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 491
Target Start/End: Original strand, 44174 - 44247
Alignment:
Q  416 cattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggaa-tcacaaca 491  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  44174 cattgattaccact-tcctttgctccacacatctttgttt--ttcattggtgtgattatcaaccggaactcacaaca 44247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 85768 - 85684
Alignment:
Q  215 tttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 295  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85768 tttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 85972 - 85906
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  85972 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacactttgggtagtgag 85906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5683
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2492
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctccc--agattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatctt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 296
Target Start/End: Original strand, 133087 - 133377
Alignment:
Q  4 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattggttggaaggatttaaagcttc 103  Q
    ||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||    ||||||||||  ||||||||    
T  133087 gggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttca-ccattggaaggatcaaaagcttc 133182  T
Q  104 ctctagtgacttctcttttagggttca-tcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtctg-tcttgtgtaaagcttgatagctagag 201  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||||||||  ||||   || |||||||| ||| |||  |||||       
T  133183 cttttgtgtcttctc-tttagggttcattattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgt-aagtttgcaagcta-tt 133278  T
Q  202 cttcttgcaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
     |||||| |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133279 tttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5973 - 5908
Alignment:
Q  5 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 72  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  5973 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 5908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 10816 - 10729
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  10816 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  216 ttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctct--cccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 296  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17350 - 17266
Alignment:
Q  213 cttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctc--tcccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaat 293  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||  ||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17350 cttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University