View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20714_low_4 (Length: 229)

Name: NF20714_low_4
Description: NF20714
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20714_low_4
NF20714_low_4
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (12-218)||(85533-85742)
scaffold0001 (45-214)||(501088-501258)
scaffold0001 (168-217)||(160688-160737)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (12-221)||(13212815-13213027)
chr1 (21-224)||(21342090-21342296)
chr1 (21-218)||(21346961-21347161)
chr1 (45-224)||(15859996-15860177)
chr1 (45-218)||(13988866-13989040)
chr1 (45-218)||(21923279-21923453)
chr1 (45-218)||(21475075-21475249)
chr1 (45-218)||(29776688-29776862)
chr1 (51-218)||(23593729-23593897)
chr1 (1-218)||(21707167-21707386)
chr1 (1-218)||(21711709-21711928)
chr1 (45-215)||(40389157-40389329)
chr1 (45-218)||(29298137-29298310)
chr1 (45-218)||(31612313-31612487)
chr1 (45-218)||(16275351-16275526)
chr1 (45-219)||(21840766-21840941)
chr1 (51-220)||(16361915-16362085)
chr1 (45-218)||(22123055-22123230)
chr1 (14-218)||(433012-433217)
chr1 (45-221)||(45574830-45575008)
chr1 (73-220)||(50210186-50210333)
chr1 (111-218)||(34509783-34509891)
chr1 (72-221)||(27250701-27250850)
chr1 (68-221)||(22532269-22532422)
chr1 (120-221)||(20847173-20847275)
chr1 (68-220)||(22468664-22468816)
chr1 (164-220)||(20454617-20454673)
chr1 (111-221)||(21026680-21026791)
chr1 (61-198)||(21861531-21861668)
chr1 (61-198)||(21896217-21896354)
chr1 (168-217)||(21714546-21714595)
chr1 (62-198)||(35261043-35261176)
chr1 (168-207)||(21754059-21754098)
chr1 (123-220)||(20135188-20135286)
chr1 (168-206)||(52928038-52928076)
chr1 (168-221)||(14295619-14295672)
chr1 (168-205)||(20918620-20918657)
chr1 (168-217)||(22921937-22921986)
chr1 (146-217)||(21161720-21161792)
chr1 (160-221)||(22237630-22237689)
chr1 (168-221)||(33681010-33681060)
chr1 (168-206)||(16758664-16758702)
chr1 (168-217)||(18182188-18182237)
chr1 (168-217)||(20248283-20248332)
chr1 (168-221)||(38801456-38801508)
chr1 (168-220)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (3-218)||(2072-2291)
scaffold0247 (14-221)||(17937-18148)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (45-224)||(19936993-19937174)
chr8 (2-218)||(41598188-41598407)
chr8 (45-218)||(1484402-1484576)
chr8 (45-218)||(5853280-5853454)
chr8 (45-218)||(20403227-20403401)
chr8 (47-214)||(45290684-45290853)
chr8 (45-218)||(14409432-14409606)
chr8 (45-218)||(22001753-22001927)
chr8 (45-218)||(15203219-15203393)
chr8 (45-218)||(20046183-20046357)
chr8 (45-218)||(4483281-4483454)
chr8 (45-214)||(16413304-16413474)
chr8 (45-218)||(19896265-19896442)
chr8 (45-218)||(4542361-4542535)
chr8 (45-218)||(14823774-14823947)
chr8 (61-205)||(15070571-15070715)
chr8 (14-198)||(19801338-19801523)
chr8 (45-220)||(26223917-26224093)
chr8 (45-218)||(25484263-25484430)
chr8 (73-224)||(6759255-6759403)
chr8 (111-221)||(16092352-16092463)
chr8 (111-218)||(26225303-26225409)
chr8 (111-221)||(7372778-7372889)
chr8 (111-218)||(26219717-26219823)
chr8 (111-221)||(18818419-18818530)
chr8 (111-221)||(23406379-23406490)
chr8 (74-220)||(28649018-28649164)
chr8 (68-221)||(20536208-20536361)
chr8 (111-221)||(21919010-21919121)
chr8 (68-221)||(21923896-21924049)
chr8 (73-221)||(22875065-22875212)
chr8 (111-221)||(22626736-22626846)
chr8 (122-221)||(31971257-31971356)
chr8 (116-221)||(18879251-18879352)
chr8 (168-221)||(6520368-6520421)
chr8 (168-221)||(38855319-38855372)
chr8 (122-221)||(45131019-45131117)
chr8 (14-203)||(13597527-13597720)
chr8 (122-221)||(16199666-16199765)
chr8 (168-221)||(17140916-17140969)
chr8 (168-221)||(21490995-21491048)
chr8 (14-145)||(13507995-13508129)
chr8 (14-221)||(17612023-17612231)
chr8 (171-221)||(21249384-21249434)
chr8 (171-221)||(21255222-21255272)
chr8 (123-220)||(23648554-23648652)
chr8 (45-104)||(24486032-24486093)
chr8 (168-221)||(5866342-5866395)
chr8 (168-217)||(21285601-21285650)
chr8 (168-221)||(21389518-21389571)
chr8 (168-221)||(21396048-21396101)
chr8 (168-221)||(21778844-21778897)
chr8 (168-221)||(21790541-21790594)
chr8 (68-219)||(18678070-18678221)
chr8 (168-221)||(23760912-23760962)
chr8 (168-206)||(983474-983512)
chr8 (61-147)||(20498637-20498722)
chr8 (168-217)||(26355766-26355815)
chr8 (68-219)||(32121734-32121885)
chr8 (168-217)||(30643359-30643408)
chr8 (45-94)||(32810054-32810105)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (17-218)||(12119683-12119887)
chr3 (45-218)||(17463178-17463352)
chr3 (45-218)||(45606895-45607069)
chr3 (45-218)||(7781335-7781509)
chr3 (45-218)||(8899094-8899268)
chr3 (45-218)||(28848599-28848773)
chr3 (45-218)||(34159326-34159500)
chr3 (45-218)||(38961879-38962053)
chr3 (45-218)||(55476491-55476665)
chr3 (45-218)||(6469122-6469296)
chr3 (45-218)||(9707595-9707769)
chr3 (45-218)||(10247711-10247885)
chr3 (45-218)||(16454269-16454443)
chr3 (45-216)||(16282799-16282971)
chr3 (45-218)||(13151778-13151953)
chr3 (45-218)||(13154243-13154418)
chr3 (61-218)||(15412429-15412586)
chr3 (61-218)||(29172589-29172745)
chr3 (45-218)||(17446643-17446816)
chr3 (45-216)||(41123892-41124061)
chr3 (51-218)||(8499518-8499687)
chr3 (17-218)||(17672626-17672829)
chr3 (45-219)||(13544024-13544199)
chr3 (2-198)||(53070596-53070795)
chr3 (45-214)||(12567564-12567734)
chr3 (45-218)||(50242822-50242996)
chr3 (90-218)||(15977515-15977642)
chr3 (111-218)||(55500942-55501049)
chr3 (99-218)||(10556985-10557104)
chr3 (111-218)||(36166598-36166704)
chr3 (45-221)||(43550466-43550644)
chr3 (111-218)||(21618449-21618555)
chr3 (111-221)||(14972854-14972965)
chr3 (95-218)||(40213716-40213838)
chr3 (119-218)||(44494809-44494908)
chr3 (68-221)||(25476353-25476506)
chr3 (111-221)||(18438534-18438645)
chr3 (116-221)||(17487856-17487962)
chr3 (116-221)||(17499338-17499444)
chr3 (111-221)||(12399209-12399320)
chr3 (111-221)||(23083371-23083482)
chr3 (111-221)||(26686887-26686998)
chr3 (111-221)||(43840932-43841043)
chr3 (68-221)||(13442274-13442427)
chr3 (116-221)||(20698450-20698556)
chr3 (120-218)||(17737236-17737337)
chr3 (68-218)||(24153177-24153326)
chr3 (92-203)||(42386428-42386539)
chr3 (122-207)||(14572603-14572688)
chr3 (122-221)||(11424781-11424880)
chr3 (80-218)||(53301530-53301669)
chr3 (14-221)||(24340633-24340844)
chr3 (111-207)||(14576843-14576939)
chr3 (51-218)||(27165250-27165419)
chr3 (165-218)||(45577947-45578000)
chr3 (2-101)||(17248184-17248287)
chr3 (168-218)||(28194693-28194743)
chr3 (14-147)||(22147436-22147571)
chr3 (14-221)||(37642175-37642386)
chr3 (168-221)||(13210395-13210448)
chr3 (168-221)||(14234487-14234540)
chr3 (14-203)||(23274705-23274898)
chr3 (168-217)||(12174327-12174376)
chr3 (168-217)||(16097332-16097381)
chr3 (14-198)||(52523638-52523827)
chr3 (168-207)||(32307691-32307730)
chr3 (168-219)||(46822267-46822318)
chr3 (14-140)||(2051110-2051238)
chr3 (169-221)||(15470927-15470976)
chr3 (168-217)||(49668144-49668193)
chr3 (168-219)||(12511059-12511110)
chr3 (174-217)||(16103784-16103827)
chr3 (123-220)||(30029841-30029939)
chr3 (168-217)||(9512924-9512973)
chr3 (168-217)||(9520899-9520948)
chr3 (168-217)||(11862793-11862842)
chr3 (168-217)||(18383983-18384032)
chr3 (168-220)||(14665398-14665450)
chr3 (168-220)||(14668554-14668606)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (3-218)||(161033-161252)
scaffold0007 (3-139)||(164534-164674)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (45-214)||(15355312-15355483)
chr4 (14-221)||(15367690-15367900)
chr4 (14-221)||(15402703-15402913)
chr4 (45-218)||(44773075-44773249)
chr4 (14-221)||(15371202-15371412)
chr4 (14-221)||(15373483-15373693)
chr4 (45-218)||(12295-12469)
chr4 (45-218)||(15118340-15118514)
chr4 (45-218)||(52312510-52312684)
chr4 (14-221)||(15370018-15370227)
chr4 (14-221)||(16223532-16223742)
chr4 (45-218)||(18215262-18215436)
chr4 (51-224)||(19242693-19242867)
chr4 (2-218)||(44928821-44929042)
chr4 (2-218)||(44102214-44102433)
chr4 (45-218)||(18239407-18239581)
chr4 (45-218)||(44615288-44615462)
chr4 (61-218)||(50222345-50222501)
chr4 (45-218)||(1837497-1837671)
chr4 (45-215)||(20149832-20150004)
chr4 (45-218)||(3515007-3515181)
chr4 (45-218)||(51463856-51464030)
chr4 (45-220)||(19618160-19618336)
chr4 (45-218)||(23803253-23803427)
chr4 (2-198)||(21815528-21815727)
chr4 (45-220)||(14970695-14970871)
chr4 (45-218)||(12610950-12611117)
chr4 (45-218)||(7641180-7641344)
chr4 (111-218)||(54798764-54798872)
chr4 (111-218)||(14280316-14280423)
chr4 (68-221)||(7798774-7798927)
chr4 (119-218)||(8574887-8574985)
chr4 (111-221)||(52873377-52873488)
chr4 (68-216)||(14038653-14038801)
chr4 (116-221)||(7088877-7088983)
chr4 (61-221)||(7893703-7893863)
chr4 (73-218)||(16377496-16377639)
chr4 (72-221)||(12902757-12902906)
chr4 (116-219)||(22636437-22636541)
chr4 (2-219)||(22353835-22354056)
chr4 (68-221)||(16270204-16270356)
chr4 (116-221)||(44052829-44052935)
chr4 (111-221)||(6899891-6900001)
chr4 (111-221)||(16239980-16240090)
chr4 (136-221)||(3096293-3096379)
chr4 (168-221)||(39706356-39706409)
chr4 (111-214)||(23374369-23374473)
chr4 (61-198)||(13812-13949)
chr4 (168-221)||(15551817-15551870)
chr4 (61-206)||(43198514-43198661)
chr4 (168-217)||(12774011-12774060)
chr4 (168-221)||(17046487-17046540)
chr4 (168-206)||(12288278-12288316)
chr4 (122-221)||(14053323-14053422)
chr4 (168-206)||(52243264-52243302)
chr4 (61-147)||(15464892-15464977)
chr4 (168-217)||(8846360-8846409)
chr4 (168-217)||(13813086-13813135)
chr4 (168-217)||(16488145-16488194)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (45-215)||(16448514-16448686)
chr6 (45-218)||(12742317-12742491)
chr6 (45-218)||(19005046-19005220)
chr6 (45-218)||(19858907-19859081)
chr6 (45-218)||(24422547-24422721)
chr6 (45-218)||(33861794-33861968)
chr6 (45-218)||(33864278-33864452)
chr6 (2-198)||(18456739-18456938)
chr6 (45-218)||(8055029-8055203)
chr6 (45-218)||(18334580-18334754)
chr6 (45-218)||(22782227-22782401)
chr6 (45-218)||(1540899-1541073)
chr6 (45-218)||(2291168-2291342)
chr6 (45-218)||(26924628-26924802)
chr6 (45-220)||(34963371-34963547)
chr6 (45-220)||(30676698-30676874)
chr6 (45-218)||(25754809-25754983)
chr6 (45-218)||(20556882-20557054)
chr6 (45-218)||(1595549-1595723)
chr6 (49-218)||(3852009-3852179)
chr6 (45-218)||(25656629-25656803)
chr6 (46-218)||(25688502-25688675)
chr6 (65-198)||(18461899-18462031)
chr6 (68-221)||(29060540-29060693)
chr6 (73-221)||(25629328-25629476)
chr6 (111-221)||(17287806-17287917)
chr6 (98-220)||(18409825-18409947)
chr6 (95-221)||(20593773-20593899)
chr6 (111-221)||(16496244-16496355)
chr6 (95-221)||(19303536-19303661)
chr6 (111-221)||(20076700-20076810)
chr6 (122-198)||(18821866-18821942)
chr6 (116-221)||(20360975-20361081)
chr6 (116-221)||(20638298-20638404)
chr6 (111-221)||(22780237-22780348)
chr6 (61-206)||(25644335-25644481)
chr6 (164-221)||(25714417-25714474)
chr6 (168-221)||(27333286-27333339)
chr6 (168-221)||(27394026-27394079)
chr6 (64-221)||(20109140-20109295)
chr6 (45-219)||(19847937-19848114)
chr6 (14-221)||(8227421-8227632)
chr6 (174-221)||(22080799-22080846)
chr6 (168-221)||(1561303-1561356)
chr6 (168-221)||(16920698-16920751)
chr6 (168-221)||(28496539-28496592)
chr6 (168-221)||(29808950-29809003)
chr6 (180-224)||(19008799-19008843)
chr6 (168-206)||(9098582-9098620)
chr6 (168-217)||(18907111-18907160)
chr6 (168-217)||(19652199-19652248)
chr6 (111-221)||(23019408-23019517)
chr6 (168-221)||(35245586-35245639)
chr6 (168-219)||(23992429-23992480)
chr6 (169-207)||(4185890-4185928)
chr6 (169-207)||(4186381-4186419)
chr6 (169-207)||(4738626-4738664)
chr6 (168-198)||(11185528-11185558)
chr6 (168-206)||(19668386-19668424)
chr6 (168-198)||(22831526-22831556)
chr6 (168-217)||(16523451-16523500)
chr6 (168-217)||(31155465-31155514)
chr6 (110-150)||(15041559-15041599)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (45-215)||(18319021-18319193)
chr5 (2-218)||(11581143-11581361)
chr5 (45-218)||(264756-264930)
chr5 (3-218)||(31061068-31061287)
chr5 (45-218)||(29329934-29330108)
chr5 (45-218)||(39245136-39245310)
chr5 (45-218)||(39363384-39363558)
chr5 (14-218)||(36154739-36154942)
chr5 (61-218)||(10732946-10733102)
chr5 (61-218)||(10775681-10775838)
chr5 (45-215)||(24067110-24067282)
chr5 (45-218)||(20909012-20909186)
chr5 (45-218)||(29345980-29346154)
chr5 (45-218)||(42245353-42245527)
chr5 (45-218)||(29348453-29348627)
chr5 (45-218)||(29350926-29351100)
chr5 (45-218)||(2154601-2154776)
chr5 (61-218)||(38619434-38619591)
chr5 (45-218)||(32027393-32027567)
chr5 (61-217)||(23064512-23064668)
chr5 (45-218)||(20901996-20902172)
chr5 (45-218)||(20917940-20918110)
chr5 (68-221)||(23390464-23390617)
chr5 (114-221)||(21997547-21997655)
chr5 (95-221)||(9077952-9078078)
chr5 (111-221)||(25421532-25421643)
chr5 (111-218)||(24529223-24529331)
chr5 (116-221)||(8286857-8286964)
chr5 (111-221)||(21729074-21729185)
chr5 (111-221)||(21808399-21808510)
chr5 (111-221)||(1096467-1096578)
chr5 (111-221)||(24493569-24493679)
chr5 (111-218)||(22412187-22412294)
chr5 (111-221)||(13025311-13025421)
chr5 (111-221)||(13095495-13095605)
chr5 (111-221)||(25431395-25431505)
chr5 (168-221)||(21329565-21329618)
chr5 (111-221)||(22075018-22075130)
chr5 (159-218)||(20806845-20806904)
chr5 (111-162)||(20766130-20766180)
chr5 (175-221)||(21502231-21502277)
chr5 (168-221)||(19660903-19660956)
chr5 (122-221)||(21292992-21293090)
chr5 (168-217)||(21565546-21565595)
chr5 (168-217)||(22959600-22959649)
chr5 (168-221)||(36314577-36314630)
chr5 (14-109)||(40725965-40726064)
chr5 (61-198)||(22144072-22144209)
chr5 (168-221)||(19668898-19668951)
chr5 (168-217)||(26704075-26704124)
chr5 (168-217)||(26973808-26973857)
chr5 (111-198)||(20026949-20027039)
chr5 (168-219)||(17517269-17517320)
chr5 (123-211)||(18418590-18418678)
chr5 (175-221)||(26012110-26012154)
chr5 (72-194)||(37723930-37724050)
chr5 (168-217)||(21366732-21366781)
chr5 (176-221)||(40725853-40725898)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (45-218)||(20747-20921)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (45-218)||(37821-37995)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (45-218)||(94411-94585)
scaffold0023 (45-214)||(17428-17598)
scaffold0023 (61-218)||(44454-44611)
scaffold0023 (168-221)||(119875-119928)
scaffold0023 (61-217)||(100378-100532)
scaffold0023 (171-217)||(40245-40291)
scaffold0023 (168-217)||(101503-101552)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (45-218)||(158438-158612)
scaffold0003 (74-218)||(339924-340065)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (45-218)||(456321-456495)
chr7 (45-218)||(11972496-11972670)
chr7 (45-218)||(15376701-15376875)
chr7 (45-218)||(16232520-16232694)
chr7 (45-218)||(18640272-18640446)
chr7 (45-218)||(20385111-20385285)
chr7 (45-218)||(21189583-21189757)
chr7 (45-218)||(32125491-32125665)
chr7 (14-214)||(38898332-38898535)
chr7 (45-218)||(41522917-41523091)
chr7 (45-218)||(41525379-41525553)
chr7 (45-217)||(11393275-11393448)
chr7 (45-218)||(14949110-14949284)
chr7 (45-218)||(24702238-24702412)
chr7 (45-218)||(27216860-27217034)
chr7 (2-218)||(44116509-44116728)
chr7 (61-218)||(16410059-16410215)
chr7 (45-221)||(18430709-18430886)
chr7 (61-218)||(13869346-13869503)
chr7 (49-218)||(3386333-3386503)
chr7 (45-218)||(24704688-24704859)
chr7 (15-218)||(17061872-17062077)
chr7 (72-214)||(24275175-24275316)
chr7 (45-218)||(16213684-16213858)
chr7 (2-198)||(12756614-12756813)
chr7 (45-218)||(20110556-20110720)
chr7 (45-221)||(13647325-13647503)
chr7 (45-218)||(26355971-26356156)
chr7 (45-218)||(26358423-26358608)
chr7 (98-218)||(48273392-48273512)
chr7 (91-218)||(13831373-13831499)
chr7 (73-218)||(3564337-3564482)
chr7 (68-221)||(12698831-12698985)
chr7 (68-221)||(9509189-9509342)
chr7 (68-221)||(38227481-38227633)
chr7 (68-218)||(18456381-18456530)
chr7 (45-125)||(15081937-15082019)
chr7 (111-221)||(10589039-10589150)
chr7 (111-221)||(26211995-26212107)
chr7 (115-206)||(15144052-15144143)
chr7 (168-221)||(67745-67798)
chr7 (122-221)||(16386268-16386369)
chr7 (168-221)||(47831807-47831860)
chr7 (61-221)||(2280080-2280238)
chr7 (111-221)||(22072913-22073025)
chr7 (168-221)||(28505366-28505419)
chr7 (168-221)||(34200786-34200839)
chr7 (14-221)||(19486654-19486865)
chr7 (168-217)||(811199-811248)
chr7 (168-221)||(15754955-15755008)
chr7 (168-221)||(16495402-16495455)
chr7 (168-217)||(18005650-18005699)
chr7 (168-217)||(44014182-44014231)
chr7 (122-219)||(40443393-40443490)
chr7 (168-221)||(11996095-11996148)
chr7 (168-217)||(14932802-14932851)
chr7 (168-217)||(15356237-15356286)
chr7 (168-217)||(15360351-15360400)
chr7 (168-221)||(16219785-16219835)
chr7 (168-215)||(18154909-18154956)
chr7 (171-221)||(27847901-27847951)
chr7 (168-217)||(9751822-9751871)
chr7 (168-217)||(14429883-14429932)
chr7 (168-220)||(2832509-2832561)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (45-218)||(18808943-18809117)
chr2 (45-218)||(23709520-23709694)
chr2 (45-218)||(23712001-23712175)
chr2 (45-218)||(39682313-39682487)
chr2 (45-218)||(571397-571571)
chr2 (45-218)||(6725995-6726169)
chr2 (45-218)||(23130862-23131036)
chr2 (45-218)||(23133329-23133503)
chr2 (45-218)||(23135590-23135764)
chr2 (45-218)||(24367774-24367948)
chr2 (45-218)||(34402510-34402684)
chr2 (45-215)||(21155048-21155219)
chr2 (45-218)||(32039486-32039660)
chr2 (45-218)||(24898183-24898358)
chr2 (45-218)||(24900666-24900841)
chr2 (45-218)||(24903143-24903318)
chr2 (45-218)||(24905620-24905795)
chr2 (45-218)||(24908095-24908270)
chr2 (61-218)||(38967374-38967531)
chr2 (45-218)||(26505379-26505553)
chr2 (45-218)||(26507857-26508031)
chr2 (45-218)||(28577099-28577273)
chr2 (42-218)||(45029839-45030016)
chr2 (45-220)||(32214909-32215085)
chr2 (45-218)||(22105412-22105587)
chr2 (49-216)||(43137301-43137469)
chr2 (45-218)||(24529516-24529691)
chr2 (73-221)||(22337115-22337263)
chr2 (111-221)||(23060513-23060624)
chr2 (111-221)||(23076442-23076553)
chr2 (116-221)||(22731249-22731355)
chr2 (140-215)||(24643034-24643109)
chr2 (68-221)||(22738148-22738300)
chr2 (122-221)||(38136-38235)
chr2 (18-221)||(19671830-19672034)
chr2 (45-133)||(24642844-24642933)
chr2 (111-218)||(298824-298933)
chr2 (116-221)||(23285865-23285967)
chr2 (111-221)||(23660023-23660133)
chr2 (116-221)||(23654401-23654507)
chr2 (164-221)||(23040253-23040310)
chr2 (92-221)||(23103389-23103516)
chr2 (168-217)||(7679589-7679638)
chr2 (168-221)||(8946657-8946710)
chr2 (61-221)||(23708580-23708738)
chr2 (168-221)||(20309108-20309161)
chr2 (170-221)||(23072019-23072070)
chr2 (111-216)||(28405981-28406088)
chr2 (61-147)||(7694-7779)
chr2 (168-206)||(18786971-18787009)
chr2 (164-220)||(22134270-22134326)
chr2 (68-214)||(25616192-25616338)
chr2 (168-217)||(21916166-21916215)
chr2 (168-217)||(22811979-22812028)
chr2 (168-217)||(25175854-25175903)
chr2 (45-94)||(22173817-22173868)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (45-218)||(13392-13566)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (45-218)||(13947-14121)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (14-218)||(16784-16990)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (61-218)||(4214-4371)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (45-218)||(136680-136854)
scaffold0028 (45-218)||(139149-139323)
scaffold0028 (45-218)||(144087-144261)
scaffold0028 (45-218)||(134211-134385)
scaffold0028 (45-218)||(141618-141792)
scaffold0028 (168-217)||(132662-132711)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (45-223)||(9744-9924)
scaffold0145 (68-221)||(32942-33094)
scaffold0145 (116-221)||(38761-38866)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (14-215)||(4300-4503)
scaffold0761 (168-217)||(6376-6425)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (45-215)||(1268-1440)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (45-218)||(4694-4868)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (45-218)||(40400-40574)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (45-219)||(10772-10947)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (45-219)||(9241-9416)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (2-198)||(79227-79426)
scaffold0056 (73-220)||(17188-17337)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (45-218)||(106-280)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (45-218)||(82072-82246)
scaffold0037 (61-206)||(22632-22776)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (45-218)||(29931-30106)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (14-198)||(20336-20520)
scaffold0031 (111-221)||(128751-128861)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (48-220)||(11286-11459)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (45-220)||(12237-12413)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (45-218)||(12064-12232)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (68-218)||(22886-23035)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (111-218)||(116430-116536)
scaffold0022 (168-217)||(73834-73883)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (111-218)||(44717-44825)
scaffold0122 (73-214)||(26038-26179)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (111-221)||(16610-16721)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (68-221)||(1851-2004)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (111-221)||(51913-52024)
scaffold0011 (72-221)||(167950-168099)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (72-221)||(3123-3271)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (73-221)||(4508-4655)
scaffold0228 (73-221)||(12090-12237)
scaffold0228 (73-221)||(22042-22189)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (73-220)||(3159-3306)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (68-219)||(39479-39629)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (68-219)||(75183-75333)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (116-221)||(13211-13317)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (111-221)||(4849-4960)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (111-221)||(32967-33077)
scaffold0120 (111-221)||(45928-46038)
scaffold0120 (115-221)||(16113-16220)
scaffold0120 (159-221)||(17388-17450)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (111-221)||(28414-28525)
scaffold0046 (168-221)||(1997-2050)
scaffold0046 (168-221)||(4552-4605)
scaffold0046 (168-221)||(11292-11345)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (72-221)||(1020-1169)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (111-221)||(8479-8590)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (116-221)||(3470-3576)
scaffold0292 (111-221)||(343-453)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (68-221)||(6089-6245)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (72-221)||(1952-2101)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (111-221)||(8543-8650)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (110-221)||(39913-40024)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (131-221)||(4712-4803)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (73-156)||(3503-3585)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (92-221)||(25896-26024)
scaffold0026 (92-221)||(39858-39986)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (68-203)||(24270-24406)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (64-206)||(8481-8623)
scaffold0621 (168-221)||(6535-6588)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (51-218)||(38651-38820)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (168-221)||(1102-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (168-221)||(6611-6664)
scaffold0333 (168-221)||(13991-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (168-221)||(6191-6244)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (122-221)||(32067-32165)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (168-221)||(15845-15898)
scaffold0020 (168-217)||(178898-178947)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (142-198)||(11986-12042)
scaffold0503 (18-109)||(12041-12135)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (122-221)||(13497-13596)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (122-221)||(11464-11564)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (122-221)||(15485-15584)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (166-221)||(121766-121821)
scaffold0021 (72-220)||(174767-174913)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (61-134)||(13092-13164)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (168-218)||(15664-15714)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (168-218)||(15306-15356)
scaffold0106 (168-221)||(1289-1342)
scaffold0106 (168-221)||(7266-7319)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (168-217)||(1086-1135)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (164-221)||(4897-4954)
scaffold0395 (68-145)||(931-1006)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (111-156)||(13158-13203)
scaffold0175 (165-221)||(273-329)
scaffold0175 (168-221)||(34123-34176)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (122-221)||(10446-10544)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (61-147)||(53510-53595)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (120-221)||(16282-16382)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (168-217)||(2713-2762)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (168-217)||(23843-23892)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (168-221)||(1137-1190)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (168-217)||(36454-36503)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (168-217)||(45860-45909)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (168-217)||(19268-19317)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (15-147)||(225482-225616)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (2-194)||(11491-11688)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (61-206)||(27710-27855)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (168-218)||(5196-5246)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (168-217)||(2874-2923)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (168-221)||(12766-12819)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (72-141)||(27911-27979)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (168-221)||(46995-47048)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (168-221)||(51582-51635)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (168-217)||(14765-14814)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (120-198)||(1055-1134)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (169-217)||(28839-28887)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (116-221)||(32538-32642)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (61-207)||(129919-130064)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (61-206)||(10503-10647)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (168-207)||(5657-5696)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (168-221)||(23951-24001)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (175-221)||(1124-1170)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (168-217)||(133-182)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (168-217)||(393-442)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (168-217)||(4430-4479)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (99-198)||(12591-12690)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (168-217)||(1494-1543)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (168-217)||(29558-29607)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (168-217)||(32102-32151)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (168-217)||(42627-42676)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (111-147)||(8090-8126)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (166-198)||(4547-4579)


Alignment Details
Target: scaffold0001 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 85533 - 85742
Alignment:
Q  12 acgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgtt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  85533 acgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgtt 85632  T
Q  109 gattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  85633 gattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatt 85732  T
Q  209 aagatgatga 218  Q
    ||||||||||    
T  85733 aagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 501258 - 501088
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  501258 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 501160  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  501159 gtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 160737 - 160688
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  160737 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 13212815 - 13213027
Alignment:
Q  12 acgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgtt 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212815 acgatgatctgtgaagttgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgtt 13212914  T
Q  109 gattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13212915 gattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13213014  T
Q  209 aagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||    
T  13213015 aagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21342296 - 21342090
Alignment:
Q  21 tgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgat--aattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342296 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 21342197  T
Q  118 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21342196 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T
Q  218 atgtcca 224  Q
    | |||||    
T  21342096 aagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21347161 - 21346961
Alignment:
Q  21 tgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347161 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 21347062  T
Q  118 gcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21347061 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T
Q  218 a 218  Q
    |    
T  21346961 a 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 15859996 - 15860177
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15859996 atgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgtt 15860095  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgtcca 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15860096 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13989040 - 13988866
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989040 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 13988942  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13988941 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 21923279 - 21923453
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923279 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 21923377  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923378 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 21475075 - 21475249
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475075 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 21475173  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21475174 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29776862 - 29776688
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29776862 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 29776764  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29776763 atttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 23593729 - 23593897
Alignment:
Q  51 ttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 148  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593729 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 23593827  T
Q  149 gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23593828 gtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21707386 - 21707167
Alignment:
Q  1 aatataatattacgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||  ||| |||| ||||||||    
T  21707386 aatataatatgatgatgatctgtgaatctgatttctgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaata 21707287  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707286 attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 21707188  T
Q  198 ccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21707187 ctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21711928 - 21711709
Alignment:
Q  1 aatataatattacgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||  ||| |||| ||||||||    
T  21711928 aatataatatgatgatgatctgtgaatctgatttctgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaata 21711829  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711828 attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 21711730  T
Q  198 ccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21711729 ctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389157
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29298310 - 29298137
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29298310 atgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat-tcatgct 29298213  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29298212 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31612487 - 31612313
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612487 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 31612389  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31612388 gtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 16275351 - 16275526
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16275351 atgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgct 16275450  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16275451 gtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21840941 - 21840766
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21840941 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 21840843  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21840842 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16362085 - 16361915
Alignment:
Q  51 ttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 148  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16362085 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 16361987  T
Q  149 gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16361986 atatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 22123055 - 22123230
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123055 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 22123153  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22123154 atttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 433217 - 433012
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgtt-atattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  433217 gatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg 433118  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  433117 -ttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgt---tgccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 433022  T
Q  209 aagatgatga 218  Q
    ||||||||||    
T  433021 aagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 45574830 - 45575008
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45574830 atgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattattatgtcatgct 45574928  T
Q  143 gtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  45574929 gtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 50210186 - 50210333
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  50210186 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 50210284  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  50210285 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34509891 - 34509783
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34509891 ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 34509792  T
Q  210 agatgatga 218  Q
    |||||||||    
T  34509791 agatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 27250701 - 27250850
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg 170  Q
    ||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||    
T  27250701 tgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattg 27250799  T
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  27250800 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22532422 - 22532269
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||| || ||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
T  22532422 tatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 22532324  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  22532323 gttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  120 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  219 tgt 221  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Original strand, 22468664 - 22468816
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||  | ||| |||    
T  22468664 tatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttg-ttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgct 22468762  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  22468763 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 20454617 - 20454673
Alignment:
Q  164 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20454617 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21026791 - 21026680
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  21026791 ttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 21026692  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
     |||||||||||    
T  21026691 cgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 21861531 - 21861668
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttg 159  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  |     
T  21861531 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgccta 21861628  T
Q  160 tgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    ||| |||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21861629 tgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtc 21861668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 21896217 - 21896354
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttg 159  Q
    |||||||||| | |||||  |||||||| | |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |     
T  21896217 ataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgtatactgccta 21896314  T
Q  160 tgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  21896315 tgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 21896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 198
Target Start/End: Original strand, 35261043 - 35261176
Alignment:
Q  62 taattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgt 160  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||||    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |    
T  35261043 taattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgatt----tgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctat 35261137  T
Q  161 gtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    || |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35261138 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 35261176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21754098 - 21754059
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21754098 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20135286 - 20135188
Alignment:
Q  123 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | ||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  20135286 tgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 14295619 - 14295672
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||    
T  14295619 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 22921937 - 22921986
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  22921937 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21161792 - 21161720
Alignment:
Q  146 tttgtatactgttgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21161792 tttgcatactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22237689 - 22237630
Alignment:
Q  160 tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  22237689 tgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33681060 - 33681010
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  33681060 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16758702 - 16758664
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16758702 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 18182188 - 18182237
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  18182188 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18182237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248283
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 38801456 - 38801508
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||    
T  38801456 ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||||||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 2072 - 2291
Alignment:
Q  3 tataatatta-cgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataa 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2072 tataatattaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataa 2171  T
Q  99 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2172 ttgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtc 2271  T
Q  199 caagttgattaagatgatga 218  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  2272 taagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 17937 - 18148
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  17937 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg 18036  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
     || |||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| ||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |    
T  18037 -tttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgtt 18134  T
Q  208 taagatgatgatgt 221  Q
     |||||| ||||||    
T  18135 gaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 19936993 - 19937174
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19936993 atgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgct 19937092  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgtcca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19937093 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41598407 - 41598188
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41598407 atataatattaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 41598308  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41598307 attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggt 41598209  T
Q  198 ccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  41598208 ctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1484576 - 1484402
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484576 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 1484478  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1484477 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 5853280 - 5853454
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853280 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 5853378  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5853379 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20403401 - 20403227
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403401 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20403303  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20403302 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 45290684 - 45290853
Alignment:
Q  47 gttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 144  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45290684 gttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgt 45290783  T
Q  145 ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45290784 ttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 14409432 - 14409606
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409432 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 14409530  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14409531 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22001927 - 22001753
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001927 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 22001829  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22001828 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 15203219 - 15203393
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15203219 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgct 15203317  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15203318 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 20046183 - 20046357
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20046183 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 20046281  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20046282 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4483454 - 4483281
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483454 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 4483356  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4483355 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 16413304 - 16413474
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413304 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16413402  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16413403 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19896442 - 19896265
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat---gtcat 139  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  19896442 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattattatgtcat 19896344  T
Q  140 gctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19896343 gctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 4542361 - 4542535
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542361 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 4542459  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4542460 gtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14823947 - 14823774
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823947 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 14823849  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  14823848 gtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15070715 - 15070571
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15070715 ataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgt 15070616  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15070615 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 19801338 - 19801523
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttgttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19801338 gatgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 19801436  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19801437 ttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtc 19801523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26224093 - 26223917
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224093 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 26223995  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
     |||||||||| || | | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  26223994 atttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 25484263 - 25484430
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25484263 atgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 25484361  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25484362 gtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6759403 - 6759255
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  6759403 gcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttga----cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgt 6759308  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgtcca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6759307 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 16092352 - 16092463
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16092352 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16092451  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  16092452 agatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 26225303 - 26225409
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26225303 ttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 26225401  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  26225402 gatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7372889 - 7372778
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7372889 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 7372790  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  7372789 agatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26219823 - 26219717
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26219823 ttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattat 26219725  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  26219724 gatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 18818419 - 18818530
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18818419 ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 18818518  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  18818519 agatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23406490 - 23406379
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23406490 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23406391  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  23406390 agatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 220
Target Start/End: Original strand, 28649018 - 28649164
Alignment:
Q  74 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgtt 172  Q
    ||||| |||||||||   || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| |||||    
T  28649018 cattacttgaattatgaatgtataattaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgtt 28649116  T
Q  173 atttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28649117 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20536361 - 20536208
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||    
T  20536361 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttct 20536263  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20536262 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 21919010 - 21919121
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  21919010 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 21919109  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  21919110 agatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 21923896 - 21924049
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  | ||| |||    
T  21923896 tatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgct 21923994  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21923995 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22875212 - 22875065
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||| ||     
T  22875212 gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgc 22875115  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22875114 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22626846 - 22626736
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22626846 ttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 22626748  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  22626747 agatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971257
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 18879251 - 18879352
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18879251 ttgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  18879346 atgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6520421 - 6520368
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6520421 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 38855319 - 38855372
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38855319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131117
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 13597527 - 13597720
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgtt-atattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||    
T  13597527 gatgatctgtgaaactgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttg 13597626  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagt 203  Q
     || |||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || ||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13597627 ttt-acttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199765
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17140969 - 17140916
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  17140969 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21491048 - 21490995
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  21491048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 145
Target Start/End: Original strand, 13507995 - 13508129
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  13507995 gatgatctgtgaaactgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg 13508094  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 145  Q
     || |||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  13508095 -tttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtt 13508129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 17612023 - 17612231
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttgttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||     
T  17612023 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgt--ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg- 17612119  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| | || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |     
T  17612120 tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttg 17612218  T
Q  209 aagatgatgatgt 221  Q
    |||||| ||||||    
T  17612219 aagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23648652 - 23648554
Alignment:
Q  123 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||  | ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  23648652 tgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Original strand, 24486032 - 24486093
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24486032 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 5866342 - 5866395
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  5866342 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21285650 - 21285601
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21285650 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 21389518 - 21389571
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  21389518 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 21396048 - 21396101
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  21396048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 21778844 - 21778897
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  21778844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 21790541 - 21790594
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  21790541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 219
Target Start/End: Original strand, 18678070 - 18678221
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  |||||| || ||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | ||  |||    
T  18678070 tatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 18678168  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  18678169 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 23760912 - 23760962
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  23760912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 983474 - 983512
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  983474 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20498722 - 20498637
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 147  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  20498722 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 20498637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355815
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32121885 - 32121734
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  |||||| || ||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | ||  |||    
T  32121885 tatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 32121787  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  32121786 attgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 30643359 - 30643408
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  30643359 ttgttatttaactaagttgcatgagtctattcaagatgattaagatgatg 30643408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32810105 - 32810054
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtga 94  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  32810105 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 12119683 - 12119887
Alignment:
Q  17 gatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12119683 gatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattg 12119782  T
Q  114 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119783 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 12119882  T
Q  214 gatga 218  Q
    |||||    
T  12119883 gatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17463352 - 17463178
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463352 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 17463254  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17463253 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 45606895 - 45607069
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606895 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 45606993  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45606994 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 7781335 - 7781509
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7781335 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 7781433  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7781434 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8899268 - 8899094
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899268 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 8899170  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8899169 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 28848599 - 28848773
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgat--aattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848599 atgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 28848697  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28848698 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34159500 - 34159326
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159500 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 34159402  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34159401 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 38961879 - 38962053
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961879 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 38961977  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38961978 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55476665 - 55476491
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476665 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 55476567  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55476566 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 6469122 - 6469296
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469122 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 6469220  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6469221 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 9707595 - 9707769
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9707595 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgtatttgatattattatgtcatgct 9707693  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9707694 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 10247711 - 10247885
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247711 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 10247809  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10247810 gtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 16454269 - 16454443
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454269 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16454367  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16454368 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Original strand, 16282799 - 16282971
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16282799 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattcaatattattatgtcatgct 16282897  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgat 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16282898 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 13151778 - 13151953
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151778 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 13151876  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13151877 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 13154243 - 13154418
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154243 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 13154341  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13154342 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15412586 - 15412429
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15412586 ataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgt 15412487  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15412486 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Original strand, 29172589 - 29172745
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29172589 ataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgt 29172687  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29172688 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 17446643 - 17446816
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446643 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 17446741  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17446742 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41124061 - 41123892
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124061 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 41123963  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgat 216  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41123962 gtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8499687 - 8499518
Alignment:
Q  51 ttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 148  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8499687 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 8499588  T
Q  149 gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8499587 gtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17672829 - 17672626
Alignment:
Q  17 gatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17672829 gatctgtgaagcttatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttg 17672731  T
Q  114 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17672730 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17672631  T
Q  214 gatga 218  Q
    |||||    
T  17672630 gatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13544199 - 13544024
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13544199 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 13544101  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13544100 gtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 53070596 - 53070795
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53070596 atataatattaatgatgatttgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 53070695  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070696 attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 53070794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12567734 - 12567564
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12567734 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 12567636  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12567635 gtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50242996 - 50242822
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  50242996 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgtt 50242898  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  50242897 gtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15977642 - 15977515
Alignment:
Q  90 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcat 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15977642 tgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 15977544  T
Q  190 gagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15977543 gagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55501049 - 55500942
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55501049 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 55500950  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  55500949 gatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556985
Alignment:
Q  99 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10557005  T
Q  199 caagttgattaagatgatga 218  Q
     |||||||||||||||||||    
T  10557004 taagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36166704 - 36166598
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36166704 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 36166606  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  36166605 gatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 43550466 - 43550644
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43550466 atgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 43550564  T
Q  143 gtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||| ||||||  | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  43550565 gtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21618555 - 21618449
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21618555 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattga 21618457  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    || |||||    
T  21618456 gaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14972965 - 14972854
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14972965 ttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 14972866  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  14972865 agatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 218
Target Start/End: Original strand, 40213716 - 40213838
Alignment:
Q  95 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 194  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40213716 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtc 40213814  T
Q  195 ggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  40213815 ggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  119 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 25476353 - 25476506
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gttgtgtcgct 166  Q
    |||| |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  25476353 tatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgct 25476451  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25476452 gttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18438645 - 18438534
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  18438645 ttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 18438546  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  18438545 agatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17487962 - 17487856
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17487962 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17487863  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  17487862 atgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17499444 - 17499338
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17499444 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17499345  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  17499344 atgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12399320 - 12399209
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  12399320 ttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 12399221  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  12399220 agatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 23083371 - 23083482
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23083371 ttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23083470  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  23083471 agatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26686998 - 26686887
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  26686998 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaga 26686899  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  26686898 agatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43841043 - 43840932
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  43841043 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatga 43840944  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    |||| |||||||    
T  43840943 agataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13442427 - 13442274
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||     
T  13442427 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgcc 13442329  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13442328 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 20698450 - 20698556
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20698450 ttgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20698549  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  20698550 atgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  120 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T
Q  217 ga 218  Q
    ||    
T  17737237 ga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Original strand, 24153177 - 24153326
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||| |||    
T  24153177 tatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgct 24153274  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24153275 atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42386539 - 42386428
Alignment:
Q  92 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 190  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42386539 tgaatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatg 42386441  T
Q  191 agtcggtccaagt 203  Q
    |||||||| ||||    
T  42386440 agtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572603
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424880
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 218
Target Start/End: Original strand, 53301530 - 53301669
Alignment:
Q  80 ttgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttattta 177  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  53301530 ttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttattta 53301628  T
Q  178 actaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53301629 actaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 24340633 - 24340844
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  24340633 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg 24340732  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
     || |||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |    
T  24340733 -tttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgtt 24340830  T
Q  208 taagatgatgatgt 221  Q
     |||||| ||||||    
T  24340831 gaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Original strand, 14576843 - 14576939
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14576843 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27165419 - 27165250
Alignment:
Q  51 ttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 148  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||| || || |||||| | |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||     
T  27165419 ttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt- 27165322  T
Q  149 gtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | ||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27165321 gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 218
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  165 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Original strand, 17248184 - 17248287
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17248184 atataatattaaagatgatctgtgaagatgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaata 17248283  T
Q  98 attg 101  Q
    ||||    
T  17248284 attg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194693
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 22147436 - 22147571
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||     
T  22147436 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg- 22147534  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 147  Q
    || |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147535 tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 37642175 - 37642386
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  37642175 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 37642274  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
     || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  37642275 -tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgtt 37642372  T
Q  208 taagatgatgatgt 221  Q
     |||||| ||||||    
T  37642373 gaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210448
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14234540 - 14234487
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14234540 ttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23274898 - 23274705
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtga--taattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || |||||| ||||| |||||  ||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  23274898 gatgatctgtgaagctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttg 23274799  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagt 203  Q
     || |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  23274798 -tttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 12174327 - 12174376
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  12174327 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16097381 - 16097332
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  16097381 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 52523638 - 52523827
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattcatgttgtt-atattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||| ||||||| | |  ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||     
T  52523638 gatgatctgagaagctgttataagatgattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg- 52523736  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| | ||||||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523737 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52523827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32307730 - 32307691
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32307730 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822267
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 2051110 - 2051238
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattcatgttgtt-atattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    |||||| |||||||||| | |  ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||     
T  2051110 gatgatttgtgaagctgctataagatgattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg- 2051208  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 140  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2051209 ttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15470976 - 15470927
Alignment:
Q  169 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  15470976 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 49668144 - 49668193
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  49668144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12511110 - 12511059
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  12511110 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16103827 - 16103784
Alignment:
Q  174 tttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  16103827 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029841
Alignment:
Q  123 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | ||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9512973 - 9512924
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  9512973 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9520948 - 9520899
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  9520948 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11862842 - 11862793
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  11862842 ttgttatttaactaagttgcatgagtctttacaagatgattaagatgatg 11862793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 18383983 - 18384032
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  18383983 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18384032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 161033 - 161252
Alignment:
Q  3 tataatatta-cgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataa 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161033 tataatattaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataa 161132  T
Q  99 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  161133 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtc 161232  T
Q  199 caagttgattaagatgatga 218  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  161233 taagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 164534 - 164674
Alignment:
Q  3 tataatatta-cgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataa 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164534 tataatattaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataa 164633  T
Q  99 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164634 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 15355312 - 15355483
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355312 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 15355411  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15355412 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15367900 - 15367690
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15367900 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttga 15367801  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  15367800 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaa 15367701  T
Q  211 gatgatgatgt 221  Q
    |||| ||||||    
T  15367700 gatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15402913 - 15402703
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15402913 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttga 15402814  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  15402813 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaa 15402714  T
Q  211 gatgatgatgt 221  Q
    |||| ||||||    
T  15402713 gatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 44773075 - 44773249
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773075 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 44773173  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44773174 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15371412 - 15371202
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15371412 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattga 15371313  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaa 15371213  T
Q  211 gatgatgatgt 221  Q
    |||| ||||||    
T  15371212 gatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15373693 - 15373483
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15373693 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattga 15373594  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaa 15373494  T
Q  211 gatgatgatgt 221  Q
    |||| ||||||    
T  15373493 gatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 12295 - 12469
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12295 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 12393  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12394 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 15118340 - 15118514
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118340 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 15118438  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15118439 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 52312684 - 52312510
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312684 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 52312586  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52312585 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15370227 - 15370018
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15370227 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttga 15370129  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaa 15370029  T
Q  211 gatgatgatgt 221  Q
    |||| ||||||    
T  15370028 gatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16223742 - 16223532
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgat-tcatgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16223742 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttga 16223643  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaa 16223543  T
Q  211 gatgatgatgt 221  Q
    |||| ||||||    
T  16223542 gatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 18215262 - 18215436
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215262 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18215360  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18215361 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19242867 - 19242693
Alignment:
Q  51 ttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 148  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242867 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 19242769  T
Q  149 gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgtcca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19242768 gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 44928821 - 44929042
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgtt-atattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaat 96  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  44928821 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat 44928920  T
Q  97 aattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 195  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928921 aattgagatgtt-attgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 44929019  T
Q  196 gtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  44929020 gtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44102433 - 44102214
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44102433 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 44102334  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102333 attgagacgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 44102235  T
Q  198 ccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  44102234 ctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 18239407 - 18239581
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgat--aattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239407 atgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18239505  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18239506 gtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44615462 - 44615288
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615462 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 44615364  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615363 gtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Original strand, 50222345 - 50222501
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50222345 ataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgt 50222443  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50222444 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 1837497 - 1837671
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  || |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1837497 atgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattattatgtcatgct 1837595  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1837596 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149832
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3515181 - 3515007
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3515181 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcttgct 3515083  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3515082 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 51463856 - 51464030
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51463856 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 51463954  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51463955 gtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 19618160 - 19618336
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618160 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 19618258  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19618259 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 23803253 - 23803427
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23803253 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 23803351  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23803352 gtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 21815528 - 21815727
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21815528 atataatattaatgatgatatgtgaagctgatttatggtgatttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 21815627  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21815628 attgagacgttg-ttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggt 21815726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 14970695 - 14970871
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970695 atgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 14970793  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14970794 gtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12611117 - 12610950
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12611117 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 12611019  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12611018 gtttt-------tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 7641180 - 7641344
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7641180 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 7641278  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7641279 gttt----------ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 54798764 - 54798872
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54798764 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 54798863  T
Q  210 agatgatga 218  Q
    |||||||||    
T  54798864 agatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14280423 - 14280316
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280423 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 14280324  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  14280323 gatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7798927 - 7798774
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||    
T  7798927 tatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgat-gacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7798829  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7798828 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Original strand, 8574887 - 8574985
Alignment:
Q  119 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8574887 catttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 52873377 - 52873488
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  52873377 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 52873476  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  52873477 agatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14038801 - 14038653
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||| |||   || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| |||    
T  14038801 tatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgct 14038703  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  14038702 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7088983 - 7088877
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7088983 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7088884  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  7088883 atgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7893863 - 7893703
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  7893863 ataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta 7893765  T
Q  160 tgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7893764 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Original strand, 16377496 - 16377639
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| ||||||||    
T  16377496 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgt 16377592  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  16377593 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12902906 - 12902757
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg 170  Q
    ||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  12902906 tgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg 12902808  T
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  12902807 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22636541 - 22636437
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22636541 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22636442  T
Q  215 atgat 219  Q
    |||||    
T  22636441 atgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22354056 - 22353835
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattcat-gttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22354056 atataatattaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttattgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 22353957  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 196  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||  |  |  |||  | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22353956 attgagacgttg-ttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcgg 22353858  T
Q  197 tccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    || ||| || | || ||||||||    
T  22353857 tctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 16270204 - 16270356
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||    
T  16270204 tatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgct 16270301  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  16270302 attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44052935 - 44052829
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  44052935 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatg 44052836  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  44052835 atgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6900001 - 6899891
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  6900001 ttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 6899903  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  6899902 agatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 16239980 - 16240090
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | | ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |    
T  16239980 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatga 16240078  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  16240079 agatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  136 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706409
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 23374369 - 23374473
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  23374369 ttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttga 23374468  T
Q  210 agatg 214  Q
    |||||    
T  23374469 agatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 13812 - 13949
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttg 159  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |     
T  13812 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgccta 13909  T
Q  160 tgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13910 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 13949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15551870 - 15551817
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  15551870 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Original strand, 43198514 - 43198661
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt-t 158  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||   | ||||| ||| ||| |    
T  43198514 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtct 43198612  T
Q  159 gtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43198613 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12774060 - 12774011
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  12774060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17046540 - 17046487
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  17046540 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 12288278 - 12288316
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12288278 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053422
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| || | |||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 52243264 - 52243302
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52243264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Original strand, 15464892 - 15464977
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 147  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||| | |||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464892 ataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8846409 - 8846360
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||    
T  8846409 ttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 13813086 - 13813135
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  13813086 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 13813135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 16488145 - 16488194
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  16488145 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16488194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448686
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12742491 - 12742317
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742491 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 12742393  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12742392 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19005220 - 19005046
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005220 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 19005122  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19005121 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 19858907 - 19859081
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858907 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 19859005  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19859006 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24422721 - 24422547
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422721 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24422623  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24422622 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33861968 - 33861794
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861968 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 33861870  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33861869 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33864452 - 33864278
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864452 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 33864354  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33864353 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18456938 - 18456739
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18456938 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 18456839  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456838 attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18456740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8055203 - 8055029
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055203 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 8055105  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8055104 gtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 18334580 - 18334754
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334580 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18334678  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334679 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22782401 - 22782227
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782401 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 22782303  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782302 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 1540899 - 1541073
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgat--aattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1540899 atgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatact 1540997  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1540998 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 2291168 - 2291342
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2291168 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 2291266  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2291267 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 26924628 - 26924802
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924628 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 26924726  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26924727 gtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34963547 - 34963371
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963547 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 34963449  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34963448 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 30676698 - 30676874
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30676698 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatatcatgct 30676796  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30676797 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25754983 - 25754809
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25754983 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 25754885  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25754884 gtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 20556882 - 20557054
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20556882 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgccatgct 20556978  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20556979 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1595723 - 1595549
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1595723 atgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgaattgcatttgatattattatgtcatgtt 1595625  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1595624 gtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 3852009 - 3852179
Alignment:
Q  49 tgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 146  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3852009 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgttt 3852107  T
Q  147 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3852108 ttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25656803 - 25656629
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656803 atgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtcatgct 25656705  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25656704 gtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25688675 - 25688502
Alignment:
Q  46 tgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctg 143  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25688675 tgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatattattatgtcatgctg 25688577  T
Q  144 tttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  25688576 tttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461899
Alignment:
Q  65 ttgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcg 164  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttg 18461933  T
Q  165 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461932 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18461899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29060693 - 29060540
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||    
T  29060693 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgct 29060595  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  29060594 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 25629328 - 25629476
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||    
T  25629328 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgt 25629426  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25629427 aatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 17287806 - 17287917
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17287806 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 17287905  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  17287906 agatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 220
Target Start/End: Original strand, 18409825 - 18409947
Alignment:
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 196  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18409825 attgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcgg 18409923  T
Q  197 tccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  18409924 tctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593773
Alignment:
Q  95 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 193  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  20593899 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgatt 20593801  T
Q  194 cggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20593800 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16496355 - 16496244
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  16496355 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 16496256  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  16496255 agatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303661
Alignment:
Q  95 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 193  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T
Q  194 cggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  19303634 cggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20076810 - 20076700
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20076810 ttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 20076712  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  20076711 agatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 198
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821942
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18821942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 20360975 - 20361081
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||    
T  20360975 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatg 20361074  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  20361075 atgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638404
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  20638398 atgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 22780237 - 22780348
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  22780237 ttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 22780336  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  22780337 agatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25644481 - 25644335
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||  |     
T  25644481 ataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgccta 25644383  T
Q  160 tgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25644382 tgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25714474 - 25714417
Alignment:
Q  164 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25714474 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 27333286 - 27333339
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27333286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 27394026 - 27394079
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27394026 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109140
Alignment:
Q  64 attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgt 162  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| | ||||||  | |||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatattatgttgtttt-gcatactgcctatgt 20109198  T
Q  163 cgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  20109197 tgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Original strand, 19847937 - 19848114
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 141  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| || || |||  ||| |||| ||||| |||||||| ||||||  |||    
T  19847937 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattg-ttgaattgcaattgatatttttatgtgttgc 19848035  T
Q  142 tgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    ||||  ||||  |||  | ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  19848036 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 8227421 - 8227632
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  8227421 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 8227520  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
     || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  |  || |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8227521 -tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgtt 8227618  T
Q  208 taagatgatgatgt 221  Q
     |||||| ||||||    
T  8227619 gaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  174 tttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920751
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496592
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29809003
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  180 taagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgtcca 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 9098582 - 9098620
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9098582 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18907160 - 18907111
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  18907160 ttgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652199
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23019517 - 23019408
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||      
T  23019517 ttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatga-- 23019421  T
Q  209 aagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||    
T  23019420 aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35245639 - 35245586
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  35245639 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992429
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Original strand, 4185890 - 4185928
Alignment:
Q  169 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4185890 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4186419 - 4186381
Alignment:
Q  169 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4186419 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 207
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738664
Alignment:
Q  169 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4738664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185528
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11185528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19668424 - 19668386
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19668424 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22831556 - 22831526
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831556 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22831526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 16523451 - 16523500
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  16523451 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 16523500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 150
Target Start/End: Original strand, 15041559 - 15041599
Alignment:
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15041559 attgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgt 15041599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319193
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 11581143 - 11581361
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattcatgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataa 98  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||    
T  11581143 atataatattaatgataatctgtgaagttgatttatgatgattgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataa 11581242  T
Q  99 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581243 ttgagacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11581341  T
Q  199 caagttgattaagatgatga 218  Q
     |||||||||||||||||||    
T  11581342 taagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 264756 - 264930
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264756 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 264854  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  264855 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31061287 - 31061068
Alignment:
Q  3 tataatatta-cgatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataa 98  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31061287 tataatattaacgatgatctgcgaagctgatttatggtgatttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataa 31061188  T
Q  99 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31061187 ttgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 31061088  T
Q  199 caagttgattaagatgatga 218  Q
     |||||||||||||||||||    
T  31061087 taagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29330108 - 29329934
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29330108 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 29330010  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29330009 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39245310 - 39245136
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgat--aattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245310 atgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcatgct 39245212  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39245211 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39363558 - 39363384
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363558 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 39363460  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363459 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 36154739 - 36154942
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36154739 gatgatatgtgaagctgatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 36154837  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36154838 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 36154934  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  36154935 gatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Original strand, 10732946 - 10733102
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732946 ataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 10733044  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10733045 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Original strand, 10775681 - 10775838
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  10775681 ataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgctgt 10775780  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10775781 gtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067110
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20909186 - 20909012
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909186 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20909088  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20909087 gtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29346154 - 29345980
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346154 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 29346056  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29346055 gtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 42245353 - 42245527
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245353 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 42245451  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42245452 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29348627 - 29348453
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348627 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 29348529  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29348528 gtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29351100 - 29350926
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351100 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 29351002  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29351001 gtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 2154601 - 2154776
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 141  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154601 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatattattatgtcatgc 2154699  T
Q  142 tgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2154700 tgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38619591 - 38619434
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  38619591 ataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgt 38619492  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38619491 gtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32027567 - 32027393
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32027567 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtcatgct 32027469  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32027468 gtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23064668 - 23064512
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  23064668 ataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgt 23064569  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23064568 gtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 20901996 - 20902172
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 141  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20901996 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatattattatgtcatgc 20902094  T
Q  142 tgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttg-attaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20902095 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 20917940 - 20918110
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    || |||||||| |||||||||    
T  20917940 atgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttg-ttgactt----tttatattattttgtcatgct 20918034  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20918035 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 23390464 - 23390617
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||    
T  23390464 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgct 23390562  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23390563 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 221
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  114 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaaga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  213 tgatgatgt 221  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9078078 - 9077952
Alignment:
Q  95 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 193  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9078078 ataattgagatgttg-ttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggt 9077980  T
Q  194 cggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9077979 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25421643 - 25421532
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25421643 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 25421544  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  25421543 agatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24529331 - 24529223
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24529331 ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 24529232  T
Q  210 agatgatga 218  Q
    |||||||||    
T  24529231 agatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 8286857 - 8286964
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8286857 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 8286956  T
Q  214 gatgatgt 221  Q
    ||||||||    
T  8286957 gatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 21729074 - 21729185
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  21729074 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 21729173  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  21729174 agatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 21808399 - 21808510
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  21808399 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 21808498  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  21808499 agatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1096578 - 1096467
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1096578 ttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 1096479  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||| ||||||    
T  1096478 agatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24493679 - 24493569
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24493679 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 24493581  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  24493580 agatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22412294 - 22412187
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22412294 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatta 22412196  T
Q  210 agatgatga 218  Q
    |||||||||    
T  22412195 agatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13025421 - 13025311
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  13025421 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatga 13025323  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  13025322 agatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13095605 - 13095495
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  13095605 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatga 13095507  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  13095506 agatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25431505 - 25431395
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |    
T  25431505 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatga 25431407  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  25431406 agatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 21329565 - 21329618
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21329565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22075130 - 22075018
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |    
T  22075130 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttga 22075031  T
Q  210 ag-atgatgatgt 221  Q
    || ||||||||||    
T  22075030 agaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806904
Alignment:
Q  159 gtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 162
Target Start/End: Original strand, 20766130 - 20766180
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20766130 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgt 20766180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Original strand, 21502231 - 21502277
Alignment:
Q  175 ttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21502231 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 19660903 - 19660956
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  19660903 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293090
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21565595 - 21565546
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21565595 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 22959600 - 22959649
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22959600 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36314630 - 36314577
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  36314630 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 40726064 - 40725965
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  40726064 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 40725965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22144209 - 22144072
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||   |     
T  22144209 ataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg-ttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactaccta 22144112  T
Q  160 tgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144111 tgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22144072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668898
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 198
Target Start/End: Original strand, 20026949 - 20027039
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026949 ttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20027039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 17517269 - 17517320
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  123 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Original strand, 26012110 - 26012154
Alignment:
Q  175 ttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  26012110 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723930
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgt-t 169  Q
    ||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||||| || ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | ||| ||||| |    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgat-gaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtct 37723955  T
Q  170 gttatttaactaagctgcatgagtc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37723954 gttatttaactaagctgcatgagtc 37723930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 21366732 - 21366781
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  21366732 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21366781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40725898 - 40725853
Alignment:
Q  176 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  40725898 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20921 - 20747
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20921 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20823  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20822 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37995 - 37821
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37995 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 37897  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37896 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 94585 - 94411
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94585 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 94487  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94486 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 17428 - 17598
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17428 atgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 17526  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17527 gtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44611 - 44454
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgttg 159  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44611 ataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgttg 44513  T
Q  160 tgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44512 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 119928 - 119875
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  119928 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 100532 - 100378
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    |||||||||| | |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  |     
T  100532 ataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgccta 100437  T
Q  160 tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  100436 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 40245 - 40291
Alignment:
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  40245 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101503
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 158438 - 158612
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158438 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 158536  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  158537 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Original strand, 339924 - 340065
Alignment:
Q  74 cattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgtt 172  Q
    ||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| | ||| |||    
T  339924 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttgt-gtt 340019  T
Q  173 atttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  340020 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 456495 - 456321
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456495 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 456397  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  456396 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11972670 - 11972496
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972670 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 11972572  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11972571 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 15376701 - 15376875
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376701 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 15376799  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15376800 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16232694 - 16232520
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232694 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16232596  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232595 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18640446 - 18640272
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640446 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18640348  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18640347 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 20385111 - 20385285
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385111 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20385209  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20385210 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 21189583 - 21189757
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189583 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 21189681  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21189682 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32125665 - 32125491
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125665 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 32125567  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125566 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 38898332 - 38898535
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898332 gatgatctgcgaagctgatttatgatgatttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttga 38898431  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38898432 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaa 38898531  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  38898532 gatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41523091 - 41522917
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523091 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 41522993  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41522992 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41525553 - 41525379
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525553 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 41525455  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41525454 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 11393275 - 11393448
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393275 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 11393373  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11393374 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 14949110 - 14949284
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949110 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 14949208  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14949209 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24702412 - 24702238
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24702412 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24702314  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702313 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27217034 - 27216860
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217034 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 27216936  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27216935 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44116728 - 44116509
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  44116728 atataatattaatgatgatatgtgaaactgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaata 44116629  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44116628 attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggt 44116530  T
Q  198 ccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  44116529 ctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16410215 - 16410059
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410215 ataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 16410117  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16410116 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18430886 - 18430709
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18430886 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 18430788  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18430787 gtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13869503 - 13869346
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13869503 ataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgt 13869404  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13869403 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3386503 - 3386333
Alignment:
Q  49 tgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 146  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3386503 tgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgttt 3386405  T
Q  147 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3386404 ttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24704859 - 24704688
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  24704859 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcttg-- 24704763  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24704762 -tttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 17061872 - 17062077
Alignment:
Q  15 atgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgat 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  17061872 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgct 17061971  T
Q  112 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17061972 -gacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 17062069  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  17062070 gatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgt 171  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16213858 - 16213684
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16213858 atgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtcatgtt 16213760  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16213759 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 12756614 - 12756813
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12756614 atataatattaatgatgatctgtgatgctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaata 12756713  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12756714 attgagacgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggt 12756812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20110720 - 20110556
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110720 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20110622  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20110621 gtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13647503 - 13647325
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647503 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 13647405  T
Q  143 gtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  13647404 gtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 26355971 - 26356156
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355971 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgttatgct 26356069  T
Q  143 gtttttgtatac-----------tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||           |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  26356070 gtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 26358423 - 26358608
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26358423 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgttatgct 26358521  T
Q  143 gtttttgtatac-----------tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||           |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  26358522 gtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273392
Alignment:
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 196  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48273512 attgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcgg 48273414  T
Q  197 tccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  48273413 tctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  91 gtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 13831401  T
Q  191 agtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Original strand, 3564337 - 3564482
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  3564337 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 3564435  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3564436 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12698985 - 12698831
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt-tgtgtcgc 165  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||    
T  12698985 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgc 12698887  T
Q  166 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12698886 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9509342 - 9509189
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||  ||    
T  9509342 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttact 9509244  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9509243 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38227633 - 38227481
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||    
T  38227633 tatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgct 38227536  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  38227535 attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Original strand, 18456381 - 18456530
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||    
T  18456381 tatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgct 18456478  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18456479 atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 125
Target Start/End: Original strand, 15081937 - 15082019
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttga 125  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15081937 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10589150 - 10589039
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |    
T  10589150 ttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcga 10589051  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  10589050 agatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26212107 - 26211995
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |    
T  26212107 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttga 26212008  T
Q  210 ag-atgatgatgt 221  Q
    || ||||||||||    
T  26212007 agaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 206
Target Start/End: Original strand, 15144052 - 15144143
Alignment:
Q  115 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15144052 cttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 67798 - 67745
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  67798 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386369
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  220 gt 221  Q
    ||    
T  16386368 gt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831807
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 221
Target Start/End: Original strand, 2280080 - 2280238
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttg 159  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |     
T  2280080 ataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgccta 2280177  T
Q  160 tgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  2280178 tgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22073025 - 22072913
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22073025 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatt 22072926  T
Q  209 aagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||    
T  22072925 aagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 28505366 - 28505419
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  28505366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34200839 - 34200786
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  34200839 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 19486654 - 19486865
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  19486654 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttg 19486753  T
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
     || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19486754 -tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgtt 19486851  T
Q  208 taagatgatgatgt 221  Q
     |||||| ||||||    
T  19486852 gaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811248
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16495455 - 16495402
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  16495455 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18005699 - 18005650
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  18005699 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014182
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443393
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996148
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 16219785 - 16219835
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  16219785 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 215
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154956
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Original strand, 27847901 - 27847951
Alignment:
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||||||||||    
T  27847901 ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 9751822 - 9751871
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  9751822 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 9751871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14429932 - 14429883
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  14429932 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 14429883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 220
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18809117 - 18808943
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809117 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18809019  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18809018 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 23709520 - 23709694
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709520 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23709618  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23709619 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 23712001 - 23712175
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712001 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23712099  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23712100 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39682487 - 39682313
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682487 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 39682389  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39682388 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 571571 - 571397
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571571 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 571473  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  571472 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6726169 - 6725995
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6726169 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgct 6726071  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6726070 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23131036 - 23130862
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131036 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23130938  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23130937 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23133503 - 23133329
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133503 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23133405  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133404 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23135764 - 23135590
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgat--aattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135764 atgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23135666  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135665 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24367948 - 24367774
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367948 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24367850  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24367849 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 34402510 - 34402684
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402510 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 34402608  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402609 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 21155048 - 21155219
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21155048 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgct 21155146  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21155147 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 32039486 - 32039660
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039486 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 32039584  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32039585 gtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 24898183 - 24898358
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898183 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24898281  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898282 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 24900666 - 24900841
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900666 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24900764  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900765 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 24903143 - 24903318
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903143 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24903241  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903242 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 24905620 - 24905795
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905620 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24905718  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905719 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 24908095 - 24908270
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908095 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 24908193  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24908194 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38967531 - 38967374
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  38967531 ataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgt 38967432  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38967431 gtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26505553 - 26505379
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505553 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 26505455  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26505454 atttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26508031 - 26507857
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508031 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 26507933  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26507932 atttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28577273 - 28577099
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28577273 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttggcttgcatttgatattattatatcatgct 28577175  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28577174 gtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Original strand, 45029839 - 45030016
Alignment:
Q  42 ttcatgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029839 ttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcat 45029937  T
Q  140 gctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45029938 gttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 32214909 - 32215085
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214909 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 32215007  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32215008 gtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22105587 - 22105412
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105587 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 22105489  T
Q  143 gtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22105488 gtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43137469 - 43137301
Alignment:
Q  49 tgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 146  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43137469 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt 43137371  T
Q  147 ttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgat 216  Q
    ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43137370 ttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Original strand, 24529516 - 24529691
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 141  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529516 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttg-ttaacttgcacttgatattattatgtcatgc 24529614  T
Q  142 tgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24529615 tgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22337263 - 22337115
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||    
T  22337263 gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgt 22337165  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22337164 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23060624 - 23060513
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23060624 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23060525  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  23060524 agatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23076553 - 23076442
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  23076553 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatga 23076454  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  23076453 agatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 22731249 - 22731355
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  22731249 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 22731348  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  22731349 atgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 215
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  140 gctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 22738148 - 22738300
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg 167  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |   ||    
T  22738148 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatttaatg 22738246  T
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38235
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19672034 - 19671830
Alignment:
Q  18 atctgtgaagctgatttctgatgattcatgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgac 115  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||    
T  19672034 atctgtgaagctgatctatgatgattgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgagatgttgttt-ac 19671937  T
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 213  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | | |||||    
T  19671936 ttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagat 19671838  T
Q  214 gatgatgt 221  Q
    | ||||||    
T  19671837 gttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 24642844 - 24642933
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 133  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24642844 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 298824 - 298933
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  298824 ttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 298923  T
Q  209 aagatgatga 218  Q
    ||||||||||    
T  298924 aagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23285967 - 23285865
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23285967 ttgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23285872  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  23285871 atgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23660133 - 23660023
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |    
T  23660133 ttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatga 23660035  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  23660034 agatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Original strand, 23654401 - 23654507
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  23654401 ttgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 23654500  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  23654501 atgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Original strand, 23040253 - 23040310
Alignment:
Q  164 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23040253 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103516
Alignment:
Q  92 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 190  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgat-gaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatg 23103485  T
Q  191 agtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  23103486 agtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7679638 - 7679589
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7679638 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8946710 - 8946657
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8946710 ttgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 221
Target Start/End: Original strand, 23708580 - 23708738
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  |||||| || ||| || ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |     
T  23708580 ataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgat-gatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgccta 23708677  T
Q  160 tgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  23708678 tgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20309161 - 20309108
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  20309161 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 221
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072070
Alignment:
Q  170 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28406088 - 28405981
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  28406088 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatg 28405989  T
Q  209 aagatgat 216  Q
    | ||||||    
T  28405988 atgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Original strand, 7694 - 7779
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 147  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  7694 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Original strand, 22134270 - 22134326
Alignment:
Q  164 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | ||||||||||    
T  22134270 gctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25616338 - 25616192
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||  ||||  |||||| || ||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | ||  |||    
T  25616338 tatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 25616240  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25616239 attgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 21916166 - 21916215
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  21916166 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 21916215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 22811979 - 22812028
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  22811979 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 22812028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25175903 - 25175854
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||    
T  25175903 ttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 94
Target Start/End: Original strand, 22173817 - 22173868
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtga 94  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  22173817 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13566 - 13392
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgat--aattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566 atgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 13468  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13467 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14121 - 13947
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14121 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 14023  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14022 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16990 - 16784
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  16990 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg- 16892  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16891 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 16792  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  16791 gatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4371 - 4214
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgt 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4371 ataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgctgt 4272  T
Q  161 gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4271 gtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 136854 - 136680
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136854 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 136756  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  136755 gtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 139323 - 139149
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139323 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 139225  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  139224 gtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 144261 - 144087
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144261 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 144163  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  144162 gtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 134385 - 134211
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134385 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 134287  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  134286 gtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 141792 - 141618
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141792 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 141694  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  141693 gtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 132711 - 132662
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  132711 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9924 - 9744
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 141  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9924 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatattattatgtcattc 9826  T
Q  142 tgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgtcc 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9825 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33094 - 32942
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||    
T  33094 tatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgct 32997  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  32996 attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38866 - 38761
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  38866 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatg 38768  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  38767 atgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4503 - 4300
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4503 gatgatctgtgaagctgatttctgatgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttg- 4405  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4404 ttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 4305  T
Q  211 gatga 215  Q
    |||||    
T  4304 gatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 6376 - 6425
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  6376 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 6425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 1268 - 1440
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1268 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 1367  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatga 215  Q
    |||||||||||||  |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1368 gtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4868 - 4694
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4868 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 4770  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4769 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40574 - 40400
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40574 atgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatcct 40476  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40475 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10947 - 10772
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10947 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 10849  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10848 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9416 - 9241
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9416 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 9318  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9317 gtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Original strand, 79227 - 79426
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgataa--ttgtatgtgcattaattgaattatttgtgaata 97  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  79227 atataatattaatgatgatcagtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaata 79326  T
Q  98 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79327 attgagacgttg-ttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 79425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 17188 - 17337
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt--gtatactgt-tgtgtcgctgtt 169  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| ||||||    
T  17188 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt 17286  T
Q  170 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17287 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 106
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  280 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgtt 182  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  181 gtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 82246 - 82072
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  82246 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatgct 82148  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  82147 gtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Original strand, 22632 - 22776
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    |||||||||| | |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |     
T  22632 ataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtcta 22728  T
Q  160 tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22729 tgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30106 - 29931
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30106 atgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacacttgatattattatgtcatgct 30008  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagtt-gattaagatgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30007 gtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 20336 - 20520
Alignment:
Q  14 gatgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20336 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg- 20433  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20434 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 128861 - 128751
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  128861 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaa 128762  T
Q  211 gatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||    
T  128761 gatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11459 - 11286
Alignment:
Q  48 ttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 145  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11459 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 11361  T
Q  146 tttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  11360 tttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 12237 - 12413
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12237 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattttgtcatgct 12335  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12336 gtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12232 - 12064
Alignment:
Q  45 atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12232 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 12134  T
Q  143 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12133 gttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23035 - 22886
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg 167  Q
    ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23035 tatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactggtgtgttgctg 22937  T
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22936 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 116536 - 116430
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaa 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  116536 ttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 116438  T
Q  211 gatgatga 218  Q
    ||||||||    
T  116437 gatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 73834 - 73883
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  73834 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 73883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 44717 - 44825
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44717 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatta 44816  T
Q  210 agatgatga 218  Q
    |||||||||    
T  44817 agatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Original strand, 26038 - 26179
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  26038 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttg-ttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 26136  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26137 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 16610 - 16721
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  16610 ttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatga 16709  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  16710 agatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2004 - 1851
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||    
T  2004 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgct 1906  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1905 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52024 - 51913
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  52024 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 51925  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  51924 agatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 167950 - 168099
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg 170  Q
    ||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| | |||||    
T  167950 tgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg 168048  T
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  168049 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 3123 - 3271
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg 170  Q
    ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||    
T  3123 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttg 3220  T
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3221 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4655 - 4508
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  4655 gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgt 4557  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  4556 tatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12237 - 12090
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  12237 gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgt 12139  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  12138 tatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22189 - 22042
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  22189 gcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgt 22091  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  22090 tatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 220
Target Start/End: Original strand, 3159 - 3306
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgt 171  Q
    |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  3159 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 3257  T
Q  172 tatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3258 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39629 - 39479
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | |    
T  39629 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgtt 39532  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  39531 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 219
Target Start/End: Original strand, 75183 - 75333
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgct 166  Q
    ||||||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | |    
T  75183 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgtt 75280  T
Q  167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  75281 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13211
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  13317 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 13218  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  13217 atgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4960 - 4849
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |    
T  4960 ttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttga 4861  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  4860 agatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 32967 - 33077
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32967 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 33065  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  33066 agatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46038 - 45928
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  46038 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 45940  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  45939 agatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16220 - 16113
Alignment:
Q  115 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 213  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16220 cttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16121  T
Q  214 gatgatgt 221  Q
    ||||||||    
T  16120 gatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17450
Alignment:
Q  159 gtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28525 - 28414
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28525 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 28426  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  28425 agatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1997
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11345 - 11292
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  11345 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 1020 - 1169
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg 170  Q
    ||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| | |||||    
T  1020 tgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttg 1118  T
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  1119 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8590 - 8479
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8590 ttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 8491  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  8490 agatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3576 - 3470
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3576 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3477  T
Q  215 atgatgt 221  Q
    |||||||    
T  3476 atgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 343
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  453 ttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataa 355  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  354 agatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 6089 - 6245
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg----ttgtgtc 163  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     |  |||     
T  6089 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgtt 6187  T
Q  164 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6188 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2101 - 1952
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg 170  Q
    ||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||    
T  2101 tgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttg 2003  T
Q  171 ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  2002 ttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 8543 - 8650
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8543 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgctgtt---atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 8638  T
Q  210 agatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||    
T  8639 agatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40024 - 39913
Alignment:
Q  110 attgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  40024 attgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatg 39926  T
Q  209 aagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||    
T  39925 aagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4712
Alignment:
Q  131 ttatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 156
Target Start/End: Original strand, 3503 - 3585
Alignment:
Q  73 gcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 156  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3503 gcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26024 - 25896
Alignment:
Q  92 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 190  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26024 tgaatatttgagatgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatg 25927  T
Q  191 agtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  25926 agtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39986 - 39858
Alignment:
Q  92 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 190  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39986 tgaatatttgagatgttgttt-acttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatg 39889  T
Q  191 agtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  39888 agttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Original strand, 24270 - 24406
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgt-tgtgtcgc 165  Q
    ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||    
T  24270 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgc 24368  T
Q  166 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24369 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8481
Alignment:
Q  64 attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgt 162  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||    
T  8623 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgt 8526  T
Q  163 cgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8525 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6588 - 6535
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  6588 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 38651 - 38820
Alignment:
Q  51 ttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 148  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||| || ||||||||| | | |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||     
T  38651 ttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt- 38748  T
Q  149 gtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38749 gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1155
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6611
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13991
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6244
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32165 - 32067
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15898
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11986
Alignment:
Q  142 tgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12135 - 12041
Alignment:
Q  18 atctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgttatattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12135 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttg 12041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13497
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11564
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  221 t 221  Q
    |    
T  11564 t 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15584
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 121821 - 121766
Alignment:
Q  166 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  121821 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174767
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt- 169  Q
    ||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | ||| ||||||     
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg-ttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgttt 174818  T
Q  170 gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  174817 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13164 - 13092
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 134  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13164 ataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15714 - 15664
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15714 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1342 - 1289
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  1342 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7266
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1086
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 221
Target Start/End: Original strand, 4897 - 4954
Alignment:
Q  164 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4897 gctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Original strand, 931 - 1006
Alignment:
Q  68 tatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 145  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  931 tatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttg-ttgacttgcatt-gatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13203 - 13158
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13203 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  165 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34123
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 221
Target Start/End: Original strand, 10446 - 10544
Alignment:
Q  122 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10446 ttgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 147
Target Start/End: Original strand, 53510 - 53595
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 147  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  53510 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt 53595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16382 - 16282
Alignment:
Q  120 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  16382 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16286  T
Q  218 atgt 221  Q
    ||||    
T  16285 atgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2762
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1190
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  1137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45909
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19317 - 19268
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  19317 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 225616 - 225482
Alignment:
Q  15 atgatctgtgaagctgatttctgatgattc-atgttgtt-atattgtgata--attgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 110  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||     
T  225616 atgaactgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg- 225518  T
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  225517 ttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11688 - 11491
Alignment:
Q  2 atataatattac-gatgatctgtgaagctgatttctgatga-ttcatgttg-ttatattgtg--ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaat 96  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  11688 atataatattaatgatgatctgtgaagctgagtgatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgatt 11589  T
Q  97 aattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 194  Q
    | |||||| |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11588 atttgagatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtc 11491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Original strand, 27710 - 27855
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gttg 159  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||  |||||| |||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   |     
T  27710 ataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttg-ttgatttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactaccta 27807  T
Q  160 tgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27808 tgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5246
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 2874 - 2923
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  2874 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12766
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27979 - 27911
Alignment:
Q  72 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgc 141  Q
    ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27979 tgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47048 - 46995
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  47048 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51635 - 51582
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  51635 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 14765 - 14814
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  14765 ttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1055
Alignment:
Q  120 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28887
Alignment:
Q  169 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32642 - 32538
Alignment:
Q  116 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagat 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  32642 ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagat 32546  T
Q  214 gatgatgt 221  Q
    ||||||||    
T  32545 gatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 130064 - 129919
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    |||||||||| | |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |     
T  130064 ataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgccta 129968  T
Q  160 tgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  129967 tgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Original strand, 10503 - 10647
Alignment:
Q  61 ataattgtatgtgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tg 159  Q
    |||||||||| | |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |     
T  10503 ataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgccta 10599  T
Q  160 tgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttga 206  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10600 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5696 - 5657
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5696 ttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 221
Target Start/End: Original strand, 23951 - 24001
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||    
T  23951 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1170
Alignment:
Q  175 ttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgatgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  1124 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 182 - 133
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  182 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 442 - 393
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  442 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4479 - 4430
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  4479 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 4430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12591
Alignment:
Q  99 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 196  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  12690 ttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcgg 12593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1543 - 1494
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  1543 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32151 - 32102
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42627
Alignment:
Q  168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  42676 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 42627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8126 - 8090
Alignment:
Q  111 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8126 ttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4579 - 4547
Alignment:
Q  166 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4579 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University