View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20721_low_20 (Length: 421)

Name: NF20721_low_20
Description: NF20721
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20721_low_20
NF20721_low_20
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (119-406)||(15724533-15724816)
chr5 (175-406)||(30969223-30969456)
chr5 (119-406)||(38528084-38528368)
chr5 (122-406)||(699193-699475)
chr5 (119-406)||(19119902-19120187)
chr5 (119-406)||(8741732-8742019)
chr5 (119-403)||(5837601-5837883)
chr5 (119-406)||(25500773-25501058)
chr5 (119-406)||(36866805-36867090)
chr5 (119-406)||(40133428-40133713)
chr5 (119-406)||(27330349-27330632)
chr5 (119-406)||(36860466-36860752)
chr5 (174-406)||(27318385-27318619)
chr5 (119-406)||(22980836-22981121)
chr5 (162-406)||(23116108-23116354)
chr5 (182-406)||(26268117-26268343)
chr5 (119-406)||(9200276-9200552)
chr5 (119-370)||(15992387-15992636)
chr5 (119-406)||(32563192-32563468)
chr5 (119-406)||(8466788-8467054)
chr5 (119-406)||(22019675-22019951)
chr5 (119-381)||(21088613-21088873)
chr5 (119-334)||(35934012-35934224)
chr5 (119-406)||(39572862-39573139)
chr5 (119-406)||(1429009-1429277)
chr5 (119-406)||(7693273-7693549)
chr5 (119-406)||(24886147-24886415)
chr5 (119-406)||(31705459-31705743)
chr5 (123-406)||(12910393-12910679)
chr5 (119-406)||(35826333-35826615)
chr5 (119-406)||(17157878-17158162)
chr5 (119-406)||(31786493-31786778)
chr5 (165-392)||(6824370-6824599)
chr5 (179-406)||(14919431-14919660)
chr5 (122-328)||(35504488-35504690)
chr5 (119-328)||(13956209-13956414)
chr5 (119-406)||(22973929-22974214)
chr5 (244-406)||(28416495-28416659)
chr5 (119-402)||(33908280-33908560)
chr5 (119-402)||(14409188-14409454)
chr5 (119-377)||(7208711-7208966)
chr5 (119-406)||(42342776-42343049)
chr5 (119-406)||(22255224-22255510)
chr5 (166-379)||(23954680-23954895)
chr5 (119-406)||(35511329-35511609)
chr5 (119-300)||(2888292-2888469)
chr5 (119-312)||(5830031-5830220)
chr5 (119-404)||(8437011-8437293)
chr5 (119-226)||(25669801-25669904)
chr5 (264-406)||(5112301-5112445)
chr5 (296-406)||(25668693-25668804)
chr5 (119-406)||(43308507-43308783)
chr5 (119-223)||(25889598-25889698)
chr5 (1-49)||(15724886-15724933)
chr5 (354-406)||(13956425-13956477)
chr5 (119-148)||(43254154-43254183)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (119-406)||(11727066-11727351)
chr8 (119-406)||(38644020-38644305)
chr8 (119-406)||(36694829-36695114)
chr8 (127-404)||(9864192-9864467)
chr8 (119-406)||(12876151-12876437)
chr8 (119-406)||(16446738-16447023)
chr8 (127-406)||(27082709-27082986)
chr8 (174-406)||(13307665-13307898)
chr8 (119-406)||(5299809-5300094)
chr8 (119-406)||(1204969-1205254)
chr8 (119-406)||(6098376-6098666)
chr8 (125-406)||(40862461-40862740)
chr8 (119-378)||(1149495-1149752)
chr8 (119-406)||(37970382-37970667)
chr8 (119-325)||(4132549-4132750)
chr8 (119-406)||(44869538-44869824)
chr8 (119-399)||(39098982-39099258)
chr8 (119-404)||(16222907-16223190)
chr8 (119-406)||(43643458-43643743)
chr8 (119-345)||(33906316-33906539)
chr8 (119-406)||(465884-466159)
chr8 (119-406)||(10555065-10555350)
chr8 (166-333)||(41910895-41911061)
chr8 (119-374)||(7890820-7891073)
chr8 (119-406)||(23854294-23854579)
chr8 (119-406)||(31933749-31934034)
chr8 (119-406)||(34895009-34895289)
chr8 (257-406)||(34952028-34952179)
chr8 (162-406)||(30654485-30654731)
chr8 (180-391)||(43025759-43025972)
chr8 (119-324)||(1953851-1954053)
chr8 (119-406)||(8803679-8803958)
chr8 (119-366)||(35459574-35459819)
chr8 (245-406)||(1150090-1150253)
chr8 (119-223)||(1149783-1149883)
chr8 (119-204)||(12587828-12587909)
chr8 (120-304)||(18259229-18259405)
chr8 (257-335)||(7998409-7998488)
chr8 (258-379)||(41362584-41362707)
chr8 (119-226)||(34951920-34952023)
chr8 (119-223)||(35859161-35859261)
chr8 (119-202)||(24823257-24823336)
chr8 (296-345)||(33197953-33198003)
chr8 (163-216)||(34463708-34463761)
chr8 (174-239)||(7998489-7998554)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (162-406)||(21991654-21991900)
chr7 (119-406)||(5657339-5657624)
chr7 (119-406)||(15612617-15612901)
chr7 (198-406)||(27421313-27421522)
chr7 (119-406)||(33688120-33688405)
chr7 (119-406)||(31578922-31579212)
chr7 (119-406)||(30055545-30055830)
chr7 (119-406)||(37109890-37110177)
chr7 (119-391)||(32432485-32432755)
chr7 (119-406)||(27283762-27284047)
chr7 (162-406)||(43686059-43686304)
chr7 (119-406)||(25691402-25691688)
chr7 (119-406)||(8861303-8861588)
chr7 (119-406)||(12165770-12166046)
chr7 (119-378)||(18797373-18797630)
chr7 (119-404)||(9355684-9355967)
chr7 (162-406)||(38258563-38258809)
chr7 (119-399)||(41764936-41765214)
chr7 (119-406)||(4582937-4583222)
chr7 (119-406)||(6546537-6546822)
chr7 (119-406)||(32820911-32821196)
chr7 (119-397)||(10359072-10359348)
chr7 (119-406)||(17842442-17842729)
chr7 (119-406)||(22687257-22687534)
chr7 (119-406)||(26980341-26980609)
chr7 (119-336)||(15672617-15672833)
chr7 (119-406)||(24211759-24212045)
chr7 (119-406)||(37347040-37347324)
chr7 (119-335)||(44598757-44598967)
chr7 (119-402)||(48928155-48928435)
chr7 (119-406)||(29173558-29173825)
chr7 (119-399)||(11071231-11071506)
chr7 (119-406)||(23111208-23111495)
chr7 (174-402)||(48928473-48928702)
chr7 (119-406)||(7334812-7335096)
chr7 (121-406)||(10481622-10481906)
chr7 (119-406)||(31520599-31520866)
chr7 (119-318)||(37703356-37703551)
chr7 (196-335)||(37704248-37704387)
chr7 (119-318)||(46480987-46481182)
chr7 (244-406)||(44413358-44413522)
chr7 (257-406)||(12390622-12390773)
chr7 (119-307)||(26587950-26588126)
chr7 (119-278)||(35353256-35353411)
chr7 (336-406)||(34362221-34362291)
chr7 (162-402)||(32593103-32593327)
chr7 (178-381)||(43925149-43925349)
chr7 (123-234)||(44411402-44411509)
chr7 (119-221)||(37704387-37704485)
chr7 (119-210)||(34362036-34362123)
chr7 (302-405)||(26524364-26524469)
chr7 (119-204)||(12390507-12390588)
chr7 (162-250)||(38053637-38053725)
chr7 (281-318)||(38053586-38053623)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (119-373)||(33341475-33341726)
chr4 (121-406)||(34947980-34948265)
chr4 (119-406)||(17173333-17173618)
chr4 (119-406)||(27396659-27396944)
chr4 (119-406)||(17167756-17168041)
chr4 (119-406)||(19089336-19089621)
chr4 (119-406)||(23761115-23761399)
chr4 (119-378)||(37663624-37663881)
chr4 (119-406)||(7703560-7703837)
chr4 (119-406)||(47253792-47254068)
chr4 (119-406)||(29584083-29584366)
chr4 (119-406)||(36493572-36493856)
chr4 (119-402)||(28002869-28003150)
chr4 (119-406)||(49376010-49376295)
chr4 (175-406)||(25700991-25701225)
chr4 (119-406)||(55240988-55241272)
chr4 (119-406)||(37775712-37775986)
chr4 (119-406)||(55477774-55478063)
chr4 (121-406)||(32592136-32592410)
chr4 (162-402)||(38011901-38012143)
chr4 (122-328)||(3042742-3042944)
chr4 (126-406)||(35020925-35021203)
chr4 (119-406)||(6864078-6864363)
chr4 (119-406)||(25184156-25184441)
chr4 (119-402)||(50697289-50697570)
chr4 (119-405)||(19440531-19440815)
chr4 (123-406)||(37287777-37288052)
chr4 (119-402)||(879431-879712)
chr4 (174-379)||(4934136-4934344)
chr4 (162-398)||(5047888-5048125)
chr4 (119-395)||(50764784-50765048)
chr4 (119-406)||(32912462-32912748)
chr4 (119-406)||(4598036-4598310)
chr4 (119-328)||(17272087-17272292)
chr4 (119-406)||(34361374-34361659)
chr4 (119-406)||(46888041-46888325)
chr4 (174-406)||(54499172-54499407)
chr4 (119-406)||(30002524-30002792)
chr4 (119-342)||(1815409-1815629)
chr4 (132-406)||(42199772-42200045)
chr4 (119-345)||(32579552-32579774)
chr4 (119-392)||(33816399-33816687)
chr4 (172-402)||(35025528-35025752)
chr4 (119-379)||(9139315-9139557)
chr4 (245-406)||(39397961-39398115)
chr4 (119-252)||(7152087-7152216)
chr4 (119-216)||(4205219-4205312)
chr4 (119-226)||(39400233-39400336)
chr4 (344-406)||(4205159-4205221)
chr4 (119-189)||(35025449-35025515)
chr4 (119-252)||(26896286-26896416)
chr4 (162-212)||(56050169-56050219)
chr4 (343-406)||(3042654-3042717)
chr4 (343-406)||(23518408-23518471)
chr4 (119-149)||(46883997-46884027)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (127-404)||(34132971-34133246)
chr3 (119-402)||(7327339-7327620)
chr3 (119-406)||(37203101-37203387)
chr3 (119-403)||(42505932-42506214)
chr3 (119-406)||(2007967-2008251)
chr3 (119-406)||(4015494-4015778)
chr3 (123-406)||(45174537-45174821)
chr3 (119-406)||(46297619-46297904)
chr3 (119-406)||(32373506-32373789)
chr3 (165-406)||(11466858-11467101)
chr3 (119-404)||(39282689-39282971)
chr3 (119-406)||(47481556-47481842)
chr3 (119-406)||(26941117-26941402)
chr3 (119-406)||(29099389-29099665)
chr3 (119-406)||(44891540-44891816)
chr3 (119-404)||(53229009-53229293)
chr3 (119-406)||(52040779-52041065)
chr3 (119-328)||(33698267-33698472)
chr3 (119-406)||(37157742-37158027)
chr3 (119-406)||(25579773-25580058)
chr3 (119-406)||(44186374-44186643)
chr3 (166-379)||(43348319-43348533)
chr3 (122-406)||(40552119-40552401)
chr3 (119-402)||(22451006-22451287)
chr3 (119-406)||(3362287-3362574)
chr3 (187-406)||(35844360-35844581)
chr3 (122-406)||(3655060-3655344)
chr3 (119-406)||(54505842-54506127)
chr3 (119-406)||(4761505-4761791)
chr3 (119-406)||(11357238-11357507)
chr3 (119-401)||(21009658-21009939)
chr3 (119-328)||(22622575-22622780)
chr3 (119-402)||(33378642-33378923)
chr3 (119-406)||(48354975-48355260)
chr3 (119-406)||(54828558-54828842)
chr3 (175-391)||(21193655-21193874)
chr3 (119-333)||(36012246-36012458)
chr3 (119-390)||(14586537-14586796)
chr3 (119-358)||(46994518-46994755)
chr3 (119-402)||(43975749-43976026)
chr3 (119-345)||(29163914-29164128)
chr3 (119-379)||(24707972-24708230)
chr3 (122-402)||(27480218-27480517)
chr3 (176-406)||(24488872-24489104)
chr3 (119-406)||(40936025-40936292)
chr3 (202-367)||(53176127-53176294)
chr3 (119-406)||(22445922-22446206)
chr3 (273-406)||(20373303-20373438)
chr3 (119-324)||(1089811-1090012)
chr3 (123-335)||(11835494-11835697)
chr3 (244-406)||(51212959-51213123)
chr3 (162-406)||(38591728-38591978)
chr3 (119-232)||(50475021-50475130)
chr3 (119-238)||(51212628-51212743)
chr3 (162-251)||(20373140-20373229)
chr3 (162-252)||(11357046-11357136)
chr3 (357-406)||(2613924-2613973)
chr3 (365-406)||(33698222-33698263)
chr3 (162-237)||(53811630-53811701)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (119-406)||(3879795-3880080)
chr6 (165-406)||(29182206-29182450)
chr6 (119-406)||(8513276-8513556)
chr6 (119-406)||(4318678-4318964)
chr6 (119-402)||(7234891-7235171)
chr6 (119-406)||(33892868-33893143)
chr6 (165-406)||(30353256-30353499)
chr6 (119-406)||(1945877-1946163)
chr6 (174-381)||(21017019-21017228)
chr6 (119-406)||(5627434-5627720)
chr6 (119-406)||(6088951-6089231)
chr6 (182-406)||(15491658-15491884)
chr6 (119-379)||(6091038-6091297)
chr6 (119-345)||(20768189-20768410)
chr6 (191-406)||(7055139-7055356)
chr6 (119-402)||(33618881-33619158)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (119-406)||(3176982-3177267)
chr2 (119-404)||(31570609-31570892)
chr2 (119-406)||(33709107-33709392)
chr2 (119-406)||(4263951-4264237)
chr2 (122-406)||(33550865-33551146)
chr2 (119-406)||(4166965-4167250)
chr2 (119-402)||(4763678-4763959)
chr2 (119-406)||(43648120-43648405)
chr2 (174-404)||(36642031-36642265)
chr2 (119-406)||(4478412-4478693)
chr2 (119-406)||(44285992-44286277)
chr2 (193-406)||(19424573-19424788)
chr2 (119-406)||(19313895-19314175)
chr2 (119-406)||(33660252-33660528)
chr2 (119-406)||(43770723-43770999)
chr2 (125-391)||(39167250-39167508)
chr2 (119-406)||(27349823-27350098)
chr2 (177-406)||(41463779-41464010)
chr2 (162-406)||(17071651-17071897)
chr2 (162-406)||(29242052-29242298)
chr2 (119-345)||(41960945-41961168)
chr2 (162-406)||(44913704-44913953)
chr2 (122-406)||(2325256-2325530)
chr2 (119-406)||(19289198-19289483)
chr2 (119-406)||(26357620-26357905)
chr2 (119-406)||(18494156-18494428)
chr2 (119-406)||(37905751-37906038)
chr2 (162-406)||(17054010-17054256)
chr2 (119-404)||(11366255-11366539)
chr2 (119-406)||(13711507-13711787)
chr2 (119-389)||(5881599-5881857)
chr2 (119-345)||(41465606-41465829)
chr2 (162-368)||(45327801-45328009)
chr2 (119-379)||(7006813-7007054)
chr2 (119-325)||(35959023-35959220)
chr2 (119-328)||(31861975-31862180)
chr2 (175-310)||(18258214-18258349)
chr2 (119-252)||(19500790-19500919)
chr2 (198-379)||(33902136-33902319)
chr2 (119-149)||(19424517-19424547)
chr2 (276-345)||(19501768-19501837)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (119-406)||(38823253-38823538)
chr1 (119-406)||(7078915-7079211)
chr1 (119-406)||(47279228-47279513)
chr1 (119-406)||(51128898-51129183)
chr1 (119-371)||(27227337-27227587)
chr1 (119-406)||(9902906-9903191)
chr1 (119-406)||(27532833-27533117)
chr1 (119-406)||(238365-238649)
chr1 (119-406)||(2959787-2960072)
chr1 (119-406)||(11742220-11742487)
chr1 (119-406)||(18422690-18422975)
chr1 (119-402)||(4330323-4330605)
chr1 (119-406)||(28564635-28564918)
chr1 (119-406)||(3534971-3535247)
chr1 (119-406)||(27563757-27564042)
chr1 (119-406)||(32216094-32216379)
chr1 (123-406)||(32267073-32267354)
chr1 (119-406)||(41926202-41926480)
chr1 (123-406)||(10181863-10182145)
chr1 (119-381)||(47682346-47682607)
chr1 (122-404)||(15382974-15383254)
chr1 (119-406)||(37451325-37451609)
chr1 (122-379)||(27267055-27267309)
chr1 (119-406)||(16415684-16415970)
chr1 (119-406)||(15752068-15752353)
chr1 (119-406)||(3309187-3309477)
chr1 (119-406)||(8222170-8222451)
chr1 (119-406)||(23999386-23999672)
chr1 (119-406)||(39393422-39393708)
chr1 (119-406)||(10922766-10923051)
chr1 (119-402)||(40884856-40885137)
chr1 (169-406)||(48620676-48620906)
chr1 (119-404)||(30326804-30327087)
chr1 (119-367)||(25160710-25160956)
chr1 (119-406)||(28769692-28769977)
chr1 (122-406)||(30254463-30254744)
chr1 (119-402)||(14758084-14758356)
chr1 (159-345)||(33725488-33725675)
chr1 (119-379)||(42721105-42721360)
chr1 (119-345)||(15168197-15168420)
chr1 (119-406)||(19899620-19899906)
chr1 (119-406)||(46931450-46931734)
chr1 (119-406)||(34012234-34012514)
chr1 (119-345)||(22170812-22171035)
chr1 (123-406)||(37618757-37619033)
chr1 (119-406)||(1547326-1547595)
chr1 (119-402)||(31621401-31621686)
chr1 (178-331)||(38759649-38759802)
chr1 (119-238)||(48353751-48353866)
chr1 (119-406)||(27763162-27763447)
chr1 (119-252)||(1359787-1359916)
chr1 (303-379)||(21289738-21289816)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (119-406)||(7930-8215)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (119-404)||(11952-12237)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (174-406)||(177-411)
scaffold0002 (119-395)||(408286-408559)
scaffold0002 (230-406)||(94347-94525)
scaffold0002 (119-222)||(93957-94056)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (119-406)||(44000-44284)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (119-406)||(154503-154787)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (162-401)||(267331-267574)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (162-406)||(145912-146158)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (363-406)||(42391-42434)
scaffold0009 (266-307)||(100894-100935)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15724816 - 15724533
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724816 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaat----attttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 15724721  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724720 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 15724621  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaactttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724620 attgatgatattatgggactgaactttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 15724533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 175 - 406
Target Start/End: Original strand, 30969223 - 30969456
Alignment:
Q  175 tactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |  |||||| |||||||| ||    
T  30969223 tactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaa 30969322  T
Q  275 ggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgt 372  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30969323 agtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgt 30969422  T
Q  373 tactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30969423 tactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 30969456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 38528084 - 38528368
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |    
T  38528084 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgat 38528179  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  38528180 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 38528279  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  38528280 attgatgatactatgagactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaact 38528368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 122 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 699475 - 699193
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  699475 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgat 699380  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || |||||||||||| |  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  699379 attatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 699280  T
Q  322 gatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||    
T  699279 gatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaact 699193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19120187 - 19119902
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  19120187 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgct 19120092  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19120091 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatga 19119992  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19119991 attgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaact 19119902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 8741732 - 8742019
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  8741732 atgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaac----attttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgct 8741827  T
Q  219 gata-tcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
     ||| |||| |||||||||||| || |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8741828 cataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatg 8741927  T
Q  318 aattgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagt-ggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8741928 aattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 8742019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 119 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5837883 - 5837601
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||     || |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  5837883 atgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgct 5837788  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || || ||| |||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5837787 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 5837688  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactg-aactttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtta 403  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5837687 attgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgtta 5837601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 25500773 - 25501058
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  25500773 atgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgct 25500868  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||  |||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25500869 gatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatga 25500968  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25500969 attgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaact 25501058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36867090 - 36866805
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||     || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  36867090 atgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaac----atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgat 36866995  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  36866994 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 36866895  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  36866894 attgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaact 36866805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40133713 - 40133428
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||     || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  40133713 atgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgat 40133618  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  40133617 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 40133518  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||    
T  40133517 attgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaact 40133428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27330632 - 27330349
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  27330632 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgct 27330537  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||   || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  27330536 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 27330437  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27330436 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttact--caacacttttgatgttatagtgttaact 27330349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36860752 - 36860466
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||     || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  36860752 atgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgat 36860657  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatactt-aaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||    
T  36860656 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatg 36860557  T
Q  318 aattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||    
T  36860556 aattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaact 36860466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 174 - 406
Target Start/End: Original strand, 27318385 - 27318619
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  27318385 gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaata 27318484  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg 371  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27318485 aggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtg 27318584  T
Q  372 ttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| | | |||| ||||| |||||||||||    
T  27318585 ttactcactacattttttatgttttagtgttaact 27318619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22981121 - 22980836
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  22981121 atgatcaataataattcatctagtaatgattgcaac----atcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttat 22981026  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| |||| |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22981025 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22980926  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||   | |||||||  |||||||||||||    
T  22980925 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaact 22980836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Original strand, 23116108 - 23116354
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  23116108 ttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 23116207  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||  || |||| |    
T  23116208 acacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattccactgtaca 23116307  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  23116308 aacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaact 23116354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 182 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26268343 - 26268117
Alignment:
Q  182 ttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaa 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||  |    
T  26268343 ttatccttgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatga 26268244  T
Q  282 taaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  26268243 taaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaa 26268144  T
Q  380 aaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  26268143 aacacttttgatgctatagtgttaact 26268117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9200552 - 9200276
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  9200552 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 9200457  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9200456 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatga 9200366  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || | ||||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9200365 attgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 9200276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 370
Target Start/End: Original strand, 15992387 - 15992636
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  15992387 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcct 15992482  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||||||| || |||||  ||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  15992483 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatga 15992582  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggt 370  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15992583 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32563468 - 32563192
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |    
T  32563468 atgatcaataataatttatctagtaattcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgct 32563373  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32563372 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 32563282  T
Q  319 attgatgatatt-atgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32563281 attgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 32563192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8467054 - 8466788
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |    
T  8467054 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttggacttacaaataatattttatcgtt-acacctttaatatgtaaacagagttggt 8466960  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||||||||||||||||                 |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8466959 gatatcatatgatagtcttaa-----------------gtgttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 8466877  T
Q  319 attgatgatattatggg-actgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||| |||  || |||| ||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8466876 attgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-ggggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaact 8466788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22019951 - 22019675
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  22019951 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaac----atcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgct 22019856  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         || |||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22019855 gatatcatgtgagtgt---------tatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 22019765  T
Q  319 attgatgata-ttatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  22019764 agtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaact 22019675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 381
Target Start/End: Original strand, 21088613 - 21088873
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     || ||||| |||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  21088613 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaac----atcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgat 21088708  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  21088709 gatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatga 21088808  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaa 381  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21088809 attgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaa 21088873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35934224 - 35934012
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||     || ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35934224 atgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaac----atcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgct 35934129  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35934128 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatg 35934029  T
Q  318 aattgatgatattatgg 334  Q
    ||||||||||| |||||    
T  35934028 aattgatgatactatgg 35934012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39573139 - 39572862
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||         |||||||    
T  39573139 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacag--------agttgtt 39573052  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||  | || ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39573051 gatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 39572952  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||||    
T  39572951 atttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaact 39572862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 1429009 - 1429277
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |    
T  1429009 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtttat 1429104  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||||||||                 |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1429105 gatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatga 1429187  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||    
T  1429188 attgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaact 1429277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7693549 - 7693273
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  7693549 atgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgct 7693454  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     ||||||| |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||    
T  7693453 aatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatga 7693363  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7693362 attgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 7693273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24886415 - 24886147
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  24886415 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 24886320  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||||||||                 |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24886319 gatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 24886237  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||    
T  24886236 gttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaact 24886147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 31705459 - 31705743
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  31705459 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 31705554  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||| ||||||| || |||| |||| |   |||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31705555 gatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31705654  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  31705655 attgatgatactagaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaact 31705743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12910679 - 12910393
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgata 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||  || || ||||| |||||    
T  12910679 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgata 12910584  T
Q  223 tcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattg 322  Q
    | || |||||||||||  || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  12910583 ttatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattg 12910484  T
Q  323 atgatattatg-ggactgaac-tttgatgtc-----attgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | |||| |||| ||||||||| |||||||||     | |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  12910483 acgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaact 12910393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 35826333 - 35826615
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  35826333 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 35826428  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||  ||||||| ||||||  | ||||||||| || ||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  | |||||||| | ||||    
T  35826429 gatat--tatgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct-atga 35826525  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||    
T  35826526 actgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaact 35826615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 17157878 - 17158162
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |    
T  17157878 atgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgat 17157973  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || |||| ||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  17157974 aatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatga 17158073  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||| |||   ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  17158074 attaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 17158162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 31786493 - 31786778
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |    
T  31786493 atgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgat 31786588  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || |||||||||  | |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  31786589 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 31786688  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||||   | ||||| | | |||| ||| |||||||||||||    
T  31786689 attgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaact 31786778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 392
Target Start/End: Original strand, 6824370 - 6824599
Alignment:
Q  165 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttata 264  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |    
T  6824370 gacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 6824467  T
Q  265 cttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac---tttgatgtcattgtataa 360  Q
     |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||| |||| ||    
T  6824468 tttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaa 6824567  T
Q  361 acagtggggtgttactcacaaaacttttgatg 392  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6824568 acagtggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 179 - 406
Target Start/End: Original strand, 14919431 - 14919660
Alignment:
Q  179 attttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggta 278  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| |  |||| |||| |  |||||| ||||| |||||||||    
T  14919431 attttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggta 14919530  T
Q  279 gaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttact 376  Q
    | ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14919531 ggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttact 14919630  T
Q  377 cacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  14919631 cattacatttttgatgttataatgttaact 14919660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 35504690 - 35504488
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| | ||    
T  35504690 atcaatagtaattcatctagtaatacttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataat 35504595  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35504594 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaatt 35504495  T
Q  322 gatgata 328  Q
    |||||||    
T  35504494 gatgata 35504488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 328
Target Start/End: Original strand, 13956209 - 13956414
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  13956209 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgat 13956304  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||  | |||||| |||| ||| ||| || |||||||||| |||||||| | | |||||||| ||||||    
T  13956305 gatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatga 13956404  T
Q  319 attgatgata 328  Q
    ||||||||||    
T  13956405 attgatgata 13956414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 22973929 - 22974214
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  22973929 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 22974024  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || | |||||||||| || |||| |||| |  ||||||  |||| || ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  22974025 aatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatga 22974124  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| |||| | | ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  22974125 gttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaact 22974214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 244 - 406
Target Start/End: Original strand, 28416495 - 28416659
Alignment:
Q  244 tacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaac 342  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||    
T  28416495 tacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaac 28416594  T
Q  343 -tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||  || |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28416595 ttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaact 28416659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33908560 - 33908280
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||      
T  33908560 atgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgac 33908466  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  || |||||| | |||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||  |    
T  33908465 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgaata 33908366  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  33908365 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgtt 33908280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 14409188 - 14409454
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  14409188 atgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 14409283  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  |||||||||||  | ||             |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  14409284 gatattatgcgatagtcttaagag-ta-------------gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 14409369  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  14409370 attgatgatactatgagactgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgtt 14409454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 377
Target Start/End: Original strand, 7208711 - 7208966
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||     || ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||      
T  7208711 atgatcaataataattcatctagtaatacttgcaac----atcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaa 7208806  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || |||||||||||| || ||||||||| |  ||||||   ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7208807 aatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 7208906  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactc 377  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  7208907 attgatgatactagaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactc 7208966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42343049 - 42342776
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  42343049 atgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 42342954  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| || || ||| |||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42342953 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggtgtattacacttaaaacaagtaaga-taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 42342864  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaactttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || |||       |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  42342863 attgatgatactaaggggaaattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacatttttgatgttatagtattaact 42342776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22255510 - 22255224
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||| |    
T  22255510 atgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgat 22255415  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || | ||||| |||| || ||||||||| |  ||||||  |||| || ||  |||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22255414 gatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22255315  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactca-caaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  | |  ||||||||||||| ||||||||    
T  22255314 attgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttgatgttataatgttaact 22255224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 379
Target Start/End: Original strand, 23954680 - 23954895
Alignment:
Q  166 acttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatac 265  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || |||| |||| |  |||||| ||    
T  23954680 acttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacac 23954778  T
Q  266 ttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtca-ttgtataaac 362  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| || | ||| ||||    
T  23954779 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaac 23954878  T
Q  363 agtggggtgttactcac 379  Q
    |||||||||||||||||    
T  23954879 agtggggtgttactcac 23954895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 35511329 - 35511609
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  35511329 atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgat 35511424  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |     | |||| |||| || |||||| |||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35511425 gatattatgtgatagtgt-----gttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35511519  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||    
T  35511520 attggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaact 35511609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Original strand, 2888292 - 2888469
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  2888292 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg----taacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgat 2888387  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgta 300  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||  ||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2888388 gatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgta 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5830220 - 5830031
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  5830220 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 5830125  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatt 312  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||  ||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  5830124 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatt 5830031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8437293 - 8437011
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  8437293 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgat 8437198  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || ||||| |||||| || ||||| ||| || ||||   |||||||| |||| || ||||||||| ||||||  || | |||| ||| |||||     
T  8437197 catattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg- 8437099  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
     |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| | ||||| || | |||||||||||    
T  8437098 gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaa 8437011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25669904 - 25669801
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  25669904 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 25669809  T
Q  219 gatatcat 226  Q
    ||||||||    
T  25669808 gatatcat 25669801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 406
Target Start/End: Original strand, 5112301 - 5112445
Alignment:
Q  264 acttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaa 361  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||| |||    
T  5112301 acttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaa 5112400  T
Q  362 cagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||    
T  5112401 cagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaact 5112445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668693
Alignment:
Q  296 gtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggg-actgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgt 393  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgt 25668705  T
Q  394 tatagtgttaact 406  Q
    || ||||||||||    
T  25668704 ta-agtgttaact 25668693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 43308507 - 43308783
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||  | ||||| |    
T  43308507 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgat 43308602  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||        |||||||| || ||||||||   | |||||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||| || | |||||||  ||||||    
T  43308603 gatat--------agtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatga 43308694  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||| |||  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  43308695 gttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagtggg-tgttattcattacatttttgatgttataatgttaact 43308783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25889698 - 25889598
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    | || || ||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  25889698 atgatcaatagtaattcatctagtaatgctt----tcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagttgat 25889603  T
Q  219 gatat 223  Q
    |||||    
T  25889602 gatat 25889598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 15724933 - 15724886
Alignment:
Q  1 tgcaattggatataatactatggaagcttttaaggtgaagtcatgaaac 49  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15724933 tgcaattggatata-tactatgggagcttttaaggtgaagtcatgaaac 15724886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 406
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956477
Alignment:
Q  354 tgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaact 13956477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43254183 - 43254154
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgct 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254183 atgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11727351 - 11727066
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  11727351 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgtt 11727256  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||| |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11727255 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatga 11727156  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || | || ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11727155 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaact 11727066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38644305 - 38644020
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  38644305 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgct 38644210  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38644209 gatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38644110  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38644109 attgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 38644020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 36694829 - 36695114
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  36694829 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac----atcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgat 36694924  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  36694925 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 36695024  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  36695025 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaact 36695114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 127 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9864467 - 9864192
Alignment:
Q  127 tagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcat 226  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||     || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  9864467 tagttattcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattat 9864372  T
Q  227 atgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatga 326  Q
     |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  9864371 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatga 9864272  T
Q  327 tattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  9864271 tattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaa 9864192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12876437 - 12876151
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |     ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  12876437 atgataaatagtaattcatctagtaatgcctg----taacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 12876342  T
Q  219 gatatcatatgatagtc-ttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  12876341 gatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatg 12876242  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  12876241 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaact 12876151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 16446738 - 16447023
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  16446738 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgat 16446833  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16446834 gatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatga 16446933  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16446934 attgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaact 16447023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 406
Target Start/End: Original strand, 27082709 - 27082986
Alignment:
Q  127 tagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||    
T  27082709 tagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattat 27082804  T
Q  227 atgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatga 326  Q
     |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27082805 gtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatga 27082904  T
Q  327 tattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || |||| ||||||||| ||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  27082905 tactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaact 27082986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 174 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13307898 - 13307665
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  13307898 gtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaata 13307800  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg 371  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  13307799 aagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtg 13307700  T
Q  372 ttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13307699 ttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 13307665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 5299809 - 5300094
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |    
T  5299809 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgct 5299904  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||| |||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5299905 gatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 5300004  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||||| || |||| ||||||| | ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5300005 attgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaact 5300094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1205254 - 1204969
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  1205254 atgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgat 1205159  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1205158 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatga 1205059  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  1205058 actgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaact 1204969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 6098376 - 6098666
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttat-----cgttgacatctttaacatgtaaacaaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||| |||     ||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  6098376 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagag 6098471  T
Q  214 ttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaattt 313  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |    
T  6098472 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatct 6098571  T
Q  314 gatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||||    
T  6098572 gatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaact 6098666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 125 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40862740 - 40862461
Alignment:
Q  125 aatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||     
T  40862740 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatatt 40862645  T
Q  225 atatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgat 324  Q
    || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||  |||||||    
T  40862644 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgat 40862545  T
Q  325 gatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaa-aacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  40862544 gataccatgagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaact 40862461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 378
Target Start/End: Original strand, 1149495 - 1149752
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  1149495 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgat 1149590  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1149591 aatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 1149690  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactca 378  Q
     ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1149691 gttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactca 1149752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 37970382 - 37970667
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| ||    |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  37970382 atgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgat 37970477  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||    
T  37970478 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatga 37970577  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  37970578 attgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 37970667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 4132549 - 4132750
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4132549 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgat 4132644  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||  || ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4132645 gatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 4132743  T
Q  319 attgatg 325  Q
    |||||||    
T  4132744 attgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44869824 - 44869538
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44869824 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaat----atcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgct 44869729  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |    | |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||     
T  44869728 gatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgg-ggacaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgata 44869630  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaa--acttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  44869629 aattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg-atcactcacaaaatacttttaatgttatagtgttaact 44869538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 399
Target Start/End: Original strand, 39098982 - 39099258
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  39098982 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgct 39099077  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  | |||||| ||  ||||| |||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39099078 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 39099177  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagt 399  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||  | |||| ||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  39099178 attgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttacttgc--aacttttgatgttatagt 39099258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16223190 - 16222907
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16223190 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgat 16223095  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || ||||||||  || ||||||   |||||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||    
T  16223094 gatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 16222995  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||| | | |||| |||||||||||||||    
T  16222994 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaa 16222907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 43643458 - 43643743
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||||||| ||||| ||||| |    
T  43643458 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgat 43643553  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || |||||||||||| || ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  43643554 aatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 43643653  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  43643654 gttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 43643743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33906539 - 33906316
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  33906539 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 33906444  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  ||  |||||  ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  33906443 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33906344  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt 345  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33906343 attgatgatactatgaagactgaacttt 33906316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 466159 - 465884
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  466159 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgct 466064  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||   |||  ||| |||       ||||||| || |||||| |||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  466063 gatat---atgtgagtgtta-------cactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 465974  T
Q  319 attgatgata-ttatgggactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| | | |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  465973 attgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaact 465884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 10555065 - 10555350
Alignment:
Q  119 atgatcaatagt--aattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttg 216  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    || ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||    
T  10555065 atgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaat----atcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttg 10555160  T
Q  217 ttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgat 316  Q
     |||||| || ||||||||  || || |||  |||| |  |||||   |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  10555161 atgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgat 10555258  T
Q  317 gaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  10555259 gaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 10555350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 333
Target Start/End: Original strand, 41910895 - 41911061
Alignment:
Q  166 acttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatac 265  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| ||    
T  41910895 acttacaggtaatattttatcgttg-catctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacac 41910993  T
Q  266 ttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg 333  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41910994 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg 41911061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 374
Target Start/End: Original strand, 7890820 - 7891073
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||| |    
T  7890820 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgat 7890915  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || ||||| ||| || ||||||  |||| || || |||  |||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  7890916 gatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatga 7891015  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgtta 374  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  7891016 attgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtta 7891073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 23854294 - 23854579
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| || || ||||| |    
T  23854294 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgat 23854389  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||| ||||||| || ||||||||  |  |||||| ||||| ||  |||||  ||||||||| ||||| |||| | |||||||| | ||||    
T  23854390 gatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatga 23854489  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  23854490 gttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 23854579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 31933749 - 31934034
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||    || || ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||| | ||| |    
T  31933749 atgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaat----atcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgat 31933844  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| | |||| || ||||||||| |  || |||| |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||    
T  31933845 gatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 31933944  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||    
T  31933945 attgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttttgatatcatagtgttaact 31934034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34895289 - 34895009
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     || ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  34895289 atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgat 34895194  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |     | |||| |||| || |||||| |||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34895193 gatattatgtgatagtgt-----gttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 34895099  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || | || ||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  34895098 attgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaact 34895009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 257 - 406
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952179
Alignment:
Q  257 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgata-ttatgggactgaac-tttgatgtcatt 354  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  355 gtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaact 34952179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Original strand, 30654485 - 30654731
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||  |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | |||||    
T  30654485 ttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtt 30654584  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    |  ||||||| || |||   ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||  | |    
T  30654585 acgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaaca 30654684  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  30654685 aacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 30654731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025759
Alignment:
Q  180 ttttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtag 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| || ||||||| |||| || |||| |||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtag 43025873  T
Q  280 aataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactc 377  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  43025872 gataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatc 43025773  T
Q  378 acaaaacttttgat 391  Q
    |||| |||||||||    
T  43025772 acaacacttttgat 43025759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 324
Target Start/End: Original strand, 1953851 - 1954053
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |    
T  1953851 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaa----atcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgat 1953946  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    ||| | || |||||||||||| || ||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||| || | ||||| |||||    
T  1953947 gatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatg 1954046  T
Q  318 aattgat 324  Q
    |||||||    
T  1954047 aattgat 1954053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 8803679 - 8803958
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||     
T  8803679 atgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttga 8803774  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || ||||||| |||| || ||||||||   | ||||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||     
T  8803775 tgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgata 8803874  T
Q  318 aattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||      | |||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  8803875 aattgatgata------ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 8803958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 366
Target Start/End: Original strand, 35459574 - 35459819
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     ||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||  ||||| | ||| |    
T  35459574 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----attttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgat 35459669  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || | |||||||||| || || | | || ||  ||||| | ||| || || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35459670 gatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35459769  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtg 366  Q
     |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  35459770 gttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 406
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150253
Alignment:
Q  245 acactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaact 343  Q
    |||||||| || ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  344 tt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| |||||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaact 1150253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Original strand, 1149783 - 1149883
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  1149783 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaagtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgat 1149878  T
Q  219 gatat 223  Q
    |||||    
T  1149879 gatat 1149883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12587909 - 12587828
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587909 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa--aatcttt--gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatg 12587828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18259405 - 18259229
Alignment:
Q  120 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttg 219  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||| ||    
T  18259405 tgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctg 18259310  T
Q  220 atatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattct 304  Q
    ||||| | |||    ||||  || ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  18259309 atatcttgtga----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998409
Alignment:
Q  257 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggg 335  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggg 7998409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362584
Alignment:
Q  258 tgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattg 355  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  356 tataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    || ||| |||||||||||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcac 41362584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Original strand, 34951920 - 34952023
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  34951920 atgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgct 34952015  T
Q  219 gatatcat 226  Q
    ||||||||    
T  34952016 gatatcat 34952023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35859261 - 35859161
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  35859261 atgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaac----atctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgat 35859166  T
Q  219 gatat 223  Q
    |||||    
T  35859165 gatat 35859161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 202
Target Start/End: Original strand, 24823257 - 24823336
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaaca 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24823257 atgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 24823336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 33198003 - 33197953
Alignment:
Q  296 gtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttt 345  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33198003 gtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttt 33197953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34463761 - 34463708
Alignment:
Q  163 tggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttg 216  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34463761 tggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttg 34463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7998554 - 7998489
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaa 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  7998554 gtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaa 7998489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21991900 - 21991654
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  21991900 ttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 21991801  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||| |    
T  21991800 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtaca 21991701  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  21991700 aacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaact 21991654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 5657339 - 5657624
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  5657339 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgct 5657434  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| ||  ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5657435 gatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatga 5657534  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5657535 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 5657624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 15612617 - 15612901
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  15612617 atgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgct 15612712  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15612713 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 15612812  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15612813 attgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataacac-tttgatgttatagtgttaact 15612901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 198 - 406
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421522
Alignment:
Q  198 taacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagt 297  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  298 gtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttat 396  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27421413 gtattcttgttaatctgataaatttatgatattataggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttat 27421512  T
Q  397 agtgttaact 406  Q
    ||||||||||    
T  27421513 agtgttaact 27421522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 33688120 - 33688405
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  33688120 atgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgct 33688215  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||  || |||||| |||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33688216 gatatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33688315  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||||||| || || | ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33688316 attgatgatactatagagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaact 33688405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 31578922 - 31579212
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  31578922 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgat 31579017  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||   | |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31579018 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31579117  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgta-----taaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  31579118 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 31579212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30055830 - 30055545
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| |    
T  30055830 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgat 30055735  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||  |||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30055734 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 30055635  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||    
T  30055634 attaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaact 30055545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37110177 - 37109890
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  37110177 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 37110082  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataagg--tagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgat 316  Q
    ||||| || || ||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  37110081 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgat 37109982  T
Q  317 gaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  37109981 gaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 37109890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32432755 - 32432485
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||     |  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||| |    
T  32432755 atgattaataataattcatctagtaatgcttgcaac----accttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgat 32432660  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  32432659 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatga 32432560  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgat 391  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  32432559 attgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttgat 32432485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27284047 - 27283762
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27284047 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgat 27283952  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| |    
T  27283951 aatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgataa 27283852  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  27283851 attgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 27283762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 43686304 - 43686059
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||    
T  43686304 ttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgtt 43686205  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  43686204 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgccattgtaca 43686105  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  43686104 aacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaact 43686059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 25691402 - 25691688
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     |||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  25691402 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----attttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgct 25691497  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25691498 gatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatga 25691597  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaact-ttgatgtcattgtataaacagtggggt-gttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||| ||| |||  | |||||||| |||||| || |||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25691598 attgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaact 25691688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8861588 - 8861303
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||     || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  8861588 atgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgct 8861493  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||| ||||| | || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |    
T  8861492 gatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgatta 8861393  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  8861392 attgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaact 8861303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12166046 - 12165770
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  12166046 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacagatactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgct 12165951  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12165950 gatattatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 12165860  T
Q  319 attgatgata-ttatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  12165859 attgatgatacttaagggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaact 12165770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18797630 - 18797373
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  18797630 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 18797535  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| |  |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18797534 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 18797435  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactca 378  Q
     ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18797434 gttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 18797373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Original strand, 9355684 - 9355967
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  9355684 atgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgat 9355779  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9355780 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9355879  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    ||| | |||| |||| | ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| | | |||| ||| |||||||||||    
T  9355880 attaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaa 9355967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38258809 - 38258563
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  38258809 ttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 38258710  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    |  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  38258709 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtaca 38258610  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| ||| |||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  38258609 aacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 38258563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 399
Target Start/End: Original strand, 41764936 - 41765214
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  41764936 atgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaa----atcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgat 41765031  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||  || |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  41765032 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 41765131  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagt 399  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  41765132 attgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagt 41765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4583222 - 4582937
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||     || ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  4583222 atgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgat 4583127  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4583126 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4583027  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||    
T  4583026 attgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaact 4582937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6546822 - 6546537
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |       || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  6546822 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctc----atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgct 6546727  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||| | |||| || || |||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6546726 gatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 6546627  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||||  | | ||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6546626 attgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaact 6546537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 32820911 - 32821196
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  32820911 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 32821006  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  || ||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||    
T  32821007 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatga 32821106  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  32821107 attgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaact 32821196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 397
Target Start/End: Original strand, 10359072 - 10359348
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  10359072 atgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaa----atcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 10359167  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaatta-aattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    | | | || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  10359168 gttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatg 10359267  T
Q  318 aattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttata 397  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  10359268 aattgatgatactatcagactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctata 10359348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 17842442 - 17842729
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  17842442 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 17842537  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataagg--tagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgat 316  Q
    ||||| || || ||||||||| || ||||||||| ||  |||||  |||| || ||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  17842538 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgat 17842637  T
Q  317 gaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  17842638 gaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 17842729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22687534 - 22687257
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||         |||||||    
T  22687534 atgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaacag--------agttgtt 22687447  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22687446 gatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatga 22687347  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  || || | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22687346 attgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaact 22687257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26980609 - 26980341
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| |||     || || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  26980609 atgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaac----atcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgct 26980514  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||||||||||                 |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26980513 gatatcatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 26980431  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  26980430 attgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaact 26980341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 336
Target Start/End: Original strand, 15672617 - 15672833
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactatt---ttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||    
T  15672617 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagtt 15672712  T
Q  216 gttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttga 315  Q
    | |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  15672713 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctga 15672812  T
Q  316 tgaattgatgatattatggga 336  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  15672813 tgaattgatgatactatggga 15672833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24212045 - 24211759
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||     
T  24212045 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttga 24211950  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||  || |||||||||  |  ||||| ||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  24211949 tgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 24211850  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  24211849 aattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 24211759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37347324 - 37347040
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    || |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  37347324 atgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaat----atcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgat 37347229  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || || ||||||||| || ||||||||| || || ||| |||||||| || |||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |    
T  37347228 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaataa 37347130  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  | | |||||||| |||||| ||||||    
T  37347129 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaact 37347040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44598967 - 44598757
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||     ||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44598967 atgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttg----taacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgtt 44598874  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44598873 gatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 44598774  T
Q  319 attgatgatattatggg 335  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  44598773 atttatgatactatggg 44598757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 48928155 - 48928435
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  48928155 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgat 48928250  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  |||||||||||    ||||||||  |  |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  48928251 gatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 48928350  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  48928351 attgataatactatgggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgtt 48928435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29173825 - 29173558
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  29173825 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttgat 29173731  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||||||||                 |||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29173730 gatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatga 29173648  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  29173647 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaact 29173558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11071506 - 11071231
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||  |||||||||| |    
T  11071506 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgat 11071414  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || ||||||||| || || ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  11071413 gatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatga 11071314  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagt 399  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | | | |||||||| ||||||    
T  11071313 attgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagt 11071231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23111495 - 23111208
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     || || || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23111495 atgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaac----atctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgat 23111400  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggta-ga-ataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgat 316  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  ||||||| || ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||    
T  23111399 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaat 23111300  T
Q  317 gaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| || |  |  ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23111299 gaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaact 23111208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 402
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928702
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||    ||||||||  |  |||||| ||||||||||    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaata 48928572  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgt 372  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||     
T  48928573 atgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatgggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgc 48928672  T
Q  373 tactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  48928673 tactcactacacttttgatgttatagtgtt 48928702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7335096 - 7334812
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||| ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||  |||| | |||| |    
T  7335096 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaacta-gttgat 7335002  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || |||||| || || |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  7335001 gatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatga 7334902  T
Q  319 attgatgatattatggga-ctgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |  ||| |||||||||||||||||    
T  7334901 gttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaact 7334812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10481906 - 10481622
Alignment:
Q  121 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     || ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||| | ||||| |||    
T  10481906 gatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaac----atcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatga 10481811  T
Q  221 tatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaat 320  Q
    ||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  10481810 tattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaat 10481711  T
Q  321 tgatgatattat-gggactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagt-ggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| |||   |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  10481710 tgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaact 10481622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 31520599 - 31520866
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||     || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  31520599 atgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgat 31520694  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||||||||                 |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31520695 gatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatga 31520777  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||||    
T  31520778 attgatgatactatgggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaact 31520866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 37703356 - 37703551
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  37703356 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 37703451  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  37703452 gatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704248
Alignment:
Q  196 tttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaa 295  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  296 gtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggg 335  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggg 37704248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 46480987 - 46481182
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  46480987 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaat 46481082  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||  |   ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||| || |||||||||| ||||||    
T  46481083 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 406
Target Start/End: Original strand, 44413358 - 44413522
Alignment:
Q  244 tacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaac 342  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  44413358 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaac 44413457  T
Q  343 -tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  44413458 ttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaact 44413522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 406
Target Start/End: Original strand, 12390622 - 12390773
Alignment:
Q  257 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcatt 354  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||| |    
T  12390622 gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcact 12390721  T
Q  355 gtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | | |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  12390722 gcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaact 12390773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 307
Target Start/End: Original strand, 26587950 - 26588126
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||     || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||         |||||||    
T  26587950 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaac----atcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacag--------agttgtt 26588037  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgt 307  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26588038 gatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35353411 - 35353256
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  35353411 atgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgat 35353316  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggta 278  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || |||| |||  || |||||| |||||||| ||||||    
T  35353315 gatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 406
Target Start/End: Original strand, 34362221 - 34362291
Alignment:
Q  336 actgaactttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34362221 actgaactttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 34362291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 402
Target Start/End: Original strand, 32593103 - 32593327
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||                 |||||    
T  32593103 ttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa-----------------gtgtt 32593185  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataa 360  Q
    | |||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || | | ||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||  ||   |||||    
T  32593186 acacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtgagactgaacttttgataccaccatataa 32593285  T
Q  361 acagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  32593286 acagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgtt 32593327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43925349 - 43925149
Alignment:
Q  178 tattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||| || |||| |  || || ||| |  |||||  |||||||| |||||    
T  43925349 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggt 43925250  T
Q  278 agaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttac 375  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| | ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    |||||| ||||||||    
T  43925249 atgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgt----acagtgaggtgttac 43925155  T
Q  376 tcacaa 381  Q
    ||||||    
T  43925154 tcacaa 43925149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 44411402 - 44411509
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgata 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44411402 tcaatattaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgata 44411497  T
Q  223 tcatatgatagt 234  Q
    | || |||||||    
T  44411498 ttatgtgatagt 44411509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37704485 - 37704387
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  37704485 atgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgat 37704390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 210
Target Start/End: Original strand, 34362036 - 34362123
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaaca 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  34362036 atgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgc----aatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaaca 34362123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 405
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524469
Alignment:
Q  302 tcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagt 399  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| || || | ||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  400 gttaac 405  Q
    ||||||    
T  26524464 gttaac 26524469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 12390507 - 12390588
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12390507 atgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatg 12390588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38053725 - 38053637
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactt 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||  ||| | ||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  38053725 ttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38053623 - 38053586
Alignment:
Q  281 ataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38053623 ataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 38053586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 119 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33341726 - 33341475
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  33341726 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgct 33341631  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33341630 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatga 33341531  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgtt 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  33341530 attgatgatactatgggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgtt 33341475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 406
Target Start/End: Original strand, 34947980 - 34948265
Alignment:
Q  121 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttga 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34947980 gatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttga 34948075  T
Q  221 tatcatatgatagtcttaatt--gatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||| |||||||||||| |  | ||||||||| || |||||  |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34948076 tatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 34948175  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34948176 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 34948265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17173618 - 17173333
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  17173618 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgat 17173523  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  17173522 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17173423  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  17173422 attaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaact 17173333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27396944 - 27396659
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |    
T  27396944 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgct 27396849  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||  |||||||  ||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27396848 gatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 27396749  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||    
T  27396748 attgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaact 27396659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17168041 - 17167756
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  17168041 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgat 17167946  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  17167945 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17167846  T
Q  319 attgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  17167845 attaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaact 17167756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 19089336 - 19089621
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |    
T  19089336 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgat 19089431  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||  | || |  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19089432 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19089531  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||    
T  19089532 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaact 19089621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23761399 - 23761115
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||| |    
T  23761399 atgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgct 23761304  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||||||  |  |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23761303 gatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggtaga-taaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 23761205  T
Q  319 attgatgatattatggg-actgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23761204 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 23761115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 378
Target Start/End: Original strand, 37663624 - 37663881
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| |    
T  37663624 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgat 37663719  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37663720 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 37663819  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactca 378  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37663820 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactca 37663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7703837 - 7703560
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |    
T  7703837 atgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgct 7703742  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  |||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  7703741 gatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaat------- 7703649  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
      |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7703648 -ctgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaact 7703560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47254068 - 47253792
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  47254068 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 47253973  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           
T  47253972 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaat------- 47253880  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
      |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47253879 -ctgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaact 47253792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 29584083 - 29584366
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  29584083 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgct 29584178  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||   || |||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  29584179 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 29584278  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29584279 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttact--caacacttttgatgttatagtgttaact 29584366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 36493572 - 36493856
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    || || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  36493572 atgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaat----atcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgat 36493667  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || || ||||||||| || ||||||||| || || ||| |||||||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36493668 gatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatga 36493766  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||||    
T  36493767 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaact 36493856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 28002869 - 28003150
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28002869 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 28002964  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||    
T  28002965 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatga 28003064  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||| || | |||||||||| |||||||||    
T  28003065 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgtt 28003150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 49376295 - 49376010
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  49376295 atgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaact----tcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgat 49376200  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || ||||| ||| || ||||   |||||||  |||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  49376199 gatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatga 49376100  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || |||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||    
T  49376099 attgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacacttttgatgctataatgttaact 49376010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 406
Target Start/End: Original strand, 25700991 - 25701225
Alignment:
Q  175 tactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||| || ||||||||| |||  ||||| |||||||| |    
T  25700991 tactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaaca 25701090  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg 371  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  25701091 aggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtg 25701190  T
Q  372 ttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  25701191 ttactcactacacttttgatgttataatgttaact 25701225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 55240988 - 55241272
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  55240988 atgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 55241083  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    || ||||| |||||||||||| || ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || || |||| |    
T  55241084 gacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgataa 55241182  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||| ||||||    
T  55241183 attgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaact 55241272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37775986 - 37775712
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  37775986 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgct 37775891  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37775890 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 37775800  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || |||   |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| |||||    
T  37775799 attgatgatactaaggg-gggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaact 37775712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 55477774 - 55478063
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  55477774 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 55477869  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||| | || ||||| ||| || |||||| ||||| || ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  55477870 gatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 55477969  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaaca----gtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    |||| |||||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  55477970 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaact 55478063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32592410 - 32592136
Alignment:
Q  121 gatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttga 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     || ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32592410 gatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaac----atcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctga 32592315  T
Q  221 tatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaat 320  Q
     |||||||||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32592314 aatcatatgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaat 32592224  T
Q  321 tgatgata-ttatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| | | |||||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||    
T  32592223 tgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaact 32592136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38012143 - 38011901
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||| || ||||||||||||  | ||||||||  ||  ||||    
T  38012143 ttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttctgggatgtt 38012044  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| |    
T  38012043 acacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcaccgtaca 38011944  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  38011943 aacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgtt 38011901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 122 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3042944 - 3042742
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  3042944 atcaatactaattcatctagtaatgcttgcaac----atgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgat 3042849  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3042848 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaatt 3042749  T
Q  322 gatgata 328  Q
    |||||||    
T  3042748 gatgata 3042742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 406
Target Start/End: Original strand, 35020925 - 35021203
Alignment:
Q  126 atagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatca 225  Q
    ||||||||||||||||||||| || |    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  35020925 atagtaattcatctagtaatgtttgc----aatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 35021020  T
Q  226 tatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatg 325  Q
    | |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  35021021 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatg 35021120  T
Q  326 atattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| || | ||||  ||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  35021121 atactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaact 35021203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6864363 - 6864078
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  6864363 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgat 6864268  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| |  ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |    
T  6864267 gatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgataa 6864168  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| |||||| || |||||||  |||||| ||| ||| || ||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  6864167 attgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataact 6864078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25184441 - 25184156
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||||||| ||||| ||||| |    
T  25184441 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgat 25184346  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || |||||||||||| || ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  25184345 aatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 25184246  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  25184245 gttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 25184156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 50697570 - 50697289
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacat-gtaaacaaagttgt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||||     
T  50697570 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaac----atcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttga 50697475  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || | ||||||| |  ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  50697474 tgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatg 50697375  T
Q  318 aattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    ||||||||||| ||  | | ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||   | | |||| |||||||||||||    
T  50697374 aattgatgatactagagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgtt 50697289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 405
Target Start/End: Original strand, 19440531 - 19440815
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  19440531 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgat 19440626  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || | |||  |||||  | ||||| ||| || ||||||  |||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19440627 gatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19440726  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaac 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||  | | |||||||||||||||||||||    
T  19440727 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtgttaac 19440815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37288052 - 37287777
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgata 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  37288052 tcaatagtaattcatctaataatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgata 37287957  T
Q  223 tcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaat 320  Q
    |||| || ||||||||| || |||| |||| ||| | |||| |||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||             
T  37287956 tcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaat--------c 37287865  T
Q  321 tgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37287864 ttatgatattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 37287777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 879431 - 879712
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| ||    |||||||||||| ||||||||||| |    
T  879431 atgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgat 879526  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  879527 gatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatga 879626  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
     ||||||||| ||||  || | ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  879627 gttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtt 879712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 379
Target Start/End: Original strand, 4934136 - 4934344
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||  |||||||| |    
T  4934136 gtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaaca 4934235  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagt-ggggt 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| || |||| ||||| | |||||    
T  4934236 aggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggt 4934335  T
Q  371 gttactcac 379  Q
    |||||||||    
T  4934336 gttactcac 4934344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 398
Target Start/End: Original strand, 5047888 - 5048125
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| || |||| |||| || || ||    
T  5047888 ttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcgg-gtatt 5047986  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggg-actgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||| |    
T  5047987 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtaca 5048086  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatag 398  Q
    ||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  5048087 aacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatag 5048125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 50765048 - 50764784
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  50765048 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgct 50764953  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||| | || | || | ||||||| || |||||| ||          |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  50764952 gatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttacac----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatga 50764863  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgtta 395  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50764862 attgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtta 50764784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 32912462 - 32912748
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||     
T  32912462 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttga 32912557  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||     
T  32912558 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgata 32912657  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| || ||| | | ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  32912658 aattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 32912748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4598310 - 4598036
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||     || ||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4598310 atgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaac----atcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgct 4598215  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4598214 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatga 4598125  T
Q  319 attgatga-tattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| | | | |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4598124 attgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacac-tttgatgttatagtgttaact 4598036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17272292 - 17272087
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| | ||||| |    
T  17272292 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgct 17272197  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||   || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  17272196 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 17272097  T
Q  319 attgatgata 328  Q
    ||||||||||    
T  17272096 attgatgata 17272087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 34361374 - 34361659
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||     
T  34361374 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttga 34361469  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || ||||||  |||| || |||||||||  | ||||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||   ||||    
T  34361470 tgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccggatg 34361569  T
Q  318 aattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  34361570 aattgatgatattatgaggctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 34361659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 46888041 - 46888325
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |    
T  46888041 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg----taacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgat 46888136  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||| ||| || |||  |||| || |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  46888137 gatattatgtgatagtc-taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 46888235  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| | |||| ||| |||||||||| ||||||| |  |||| ||| |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  46888236 attaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaact 46888325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 406
Target Start/End: Original strand, 54499172 - 54499407
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||  | |||||| |||||||| |    
T  54499172 gtaccattttatcgttggcat-tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaaca 54499270  T
Q  274 aggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttt-gatgtcatt-gtataaacagtgggg 369  Q
    |||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  54499271 aggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtgggg 54499370  T
Q  370 tgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  54499371 tgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 54499407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 30002524 - 30002792
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  30002524 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgct 30002619  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  30002620 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat------- 30002703  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
      |||||||| || |  |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  30002704 -ctgatgatactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaact 30002792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1815629 - 1815409
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || |||     || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  1815629 atgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgat 1815534  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  1815533 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatga 1815434  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac 342  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    
T  1815433 attgatgatactatgaggactgaac 1815409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42200045 - 42199772
Alignment:
Q  132 attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaag-tactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatga 230  Q
    |||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||  |||||| || |||    
T  42200045 attcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtga 42199950  T
Q  231 tagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatatt 330  Q
    ||||||||| || |||||||||  | ||||||| |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  42199949 tagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatact 42199850  T
Q  331 atg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||| || ||| | |||||| |||||||  | | ||||||||||||||| ||||||    
T  42199849 atgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagtattaact 42199772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32579774 - 32579552
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  32579774 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgat 32579679  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||| |||||||||||  | ||||||||  |  || ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  | || ||||||| ||||||    
T  32579678 gatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatga 32579579  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaacttt 345  Q
    | |||| ||| |||| |||| ||||||    
T  32579578 actgataatactatgagactaaacttt 32579552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 392
Target Start/End: Original strand, 33816399 - 33816687
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  33816399 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 33816494  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgt-----------------gttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtat 301  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||| || ||                 |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |     
T  33816495 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaa 33816594  T
Q  302 tcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatg 392  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  33816595 tcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatg 33816687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 402
Target Start/End: Original strand, 35025528 - 35025752
Alignment:
Q  172 aagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  || |||| | ||||||||    
T  35025528 aagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaa 35025627  T
Q  272 taaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtgggg 369  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| || | ||||||||||         |||||||| || | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35025628 caagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaat--------ctgatgatactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtgggg 35025719  T
Q  370 tgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    || ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  35025720 tgctactcactacacttttgatgctatagtgtt 35025752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9139557 - 9139315
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||       
T  9139557 atgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt--- 9139465  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
      ||           |||||| || |||||||||  | |||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9139464 --ta-----------tcttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9139378  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
     ||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  9139377 gttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcac 9139315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397961
Alignment:
Q  245 acactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaact 343  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||| |  |  |||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatt---------gatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  344 tt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaact 39397961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 252
Target Start/End: Original strand, 7152087 - 7152216
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  7152087 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaa----atcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgat 7152182  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg 252  Q
    ||| | || ||||||| |||| || || ||||||    
T  7152183 gatgttatgtgatagtattaagtgttatactttg 7152216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4205312 - 4205219
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttg 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  4205312 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 4205219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39400336 - 39400233
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  39400336 atgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 39400241  T
Q  219 gatatcat 226  Q
    ||||||||    
T  39400240 gatatcat 39400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205159
Alignment:
Q  344 ttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaact 4205159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 189
Target Start/End: Original strand, 35025449 - 35025515
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgtt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |    || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35025449 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgc----aacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26896416 - 26896286
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | | |||     
T  26896416 atgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaac--at-tttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttga 26896321  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg 252  Q
    | |||| ||  ||||||||||| || |||||||||    
T  26896320 tcatattatgcgatagtcttaagtgttacactttg 26896286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 56050219 - 56050169
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  56050219 ttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaacaaa 56050169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3042717 - 3042654
Alignment:
Q  343 tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | | |||  |||||||||||||||||    
T  3042717 tttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaact 3042654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 406
Target Start/End: Original strand, 23518408 - 23518471
Alignment:
Q  343 tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  23518408 tttgatgccactgtattaacagtggggtgttagtcactacagttttaatgttatagtgttaact 23518471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 149
Target Start/End: Original strand, 46883997 - 46884027
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46883997 atgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 46884027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 127 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34133246 - 34132971
Alignment:
Q  127 tagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  34133246 tagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattat 34133151  T
Q  227 atgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatga 326  Q
     |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  34133150 gtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatga 34133051  T
Q  327 tattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  34133050 tattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaa 34132971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 7327339 - 7327620
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  7327339 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgtt 7327434  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7327435 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatga 7327534  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7327535 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtt 7327620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37203387 - 37203101
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaa-agttgt 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||     
T  37203387 atgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgat----atattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttga 37203292  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  37203291 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatg 37203192  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  37203191 aattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaact 37203101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 119 - 403
Target Start/End: Original strand, 42505932 - 42506214
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| |    
T  42505932 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgat 42506027  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42506028 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42506127  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtta 403  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  42506128 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2008251 - 2007967
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  2008251 atgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgct 2008156  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||| || ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2008155 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatga 2008057  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  2008056 attgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaact 2007967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4015778 - 4015494
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4015778 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaacaa-gttgtt 4015684  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||  ||  ||||||||||| ||  |||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| | ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4015683 gatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatga 4015584  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4015583 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 4015494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174537
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgata 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgata 45174726  T
Q  223 tcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||  | |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45174725 tcatattatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaatt 45174626  T
Q  322 gatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttact--cacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45174625 gatgatactatggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaact 45174537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 46297619 - 46297904
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  46297619 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 46297714  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||    
T  46297715 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatga 46297814  T
Q  319 attgatgatatta-tgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  46297815 attgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaact 46297904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32373789 - 32373506
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  32373789 atgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgct 32373694  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32373693 gatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 32373594  T
Q  319 attgatgatatta-tgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||  | ||||   |||| ||||||| || |||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32373593 attgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 32373506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 165 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11467101 - 11466858
Alignment:
Q  165 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttata 264  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || || ||| |    
T  11467101 gacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattaca 11467002  T
Q  265 cttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaac 362  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| || |||| ||||    
T  11467001 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgtacaaac 11466902  T
Q  363 agtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  11466901 agtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaact 11466858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 39282971 - 39282689
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||| |    
T  39282971 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgat 39282876  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39282875 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 39282776  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    || ||||||| |||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  39282775 atggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaa 39282689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47481842 - 47481556
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||      
T  47481842 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagttta 47481747  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  47481746 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatg 47481647  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  47481646 aattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 47481556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 26941117 - 26941402
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  26941117 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 26941212  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||||||  |  || |||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26941213 gatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 26941312  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||||    
T  26941313 attaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaact 26941402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29099665 - 29099389
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  29099665 atgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgct 29099570  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||| |||         ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29099569 gatatcatgtgaaagt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatga 29099479  T
Q  319 attgatgata-ttatgggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  29099478 attgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaact 29099389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44891816 - 44891540
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||     || || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  44891816 atgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgct 44891721  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  44891720 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatta 44891621  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |         |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44891620 attgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 44891540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Original strand, 53229009 - 53229293
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  53229009 atgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgat 53229104  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||  || |||||||||||| || ||||||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  53229105 gatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatga 53229204  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtg-gggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||  | |||| ||||| || ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  53229205 attgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaa 53229293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 52040779 - 52041065
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  52040779 atgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 52040874  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||||| || || || ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52040875 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 52040974  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaaca-gtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || | || |||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  52040975 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaact 52041065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33698472 - 33698267
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||      
T  33698472 atgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaat----atcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgcc 33698377  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33698376 gatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33698277  T
Q  319 attgatgata 328  Q
    ||||||||||    
T  33698276 attgatgata 33698267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37158027 - 37157742
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaa-agttgt 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | |||     
T  37158027 atgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgac----atattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttga 37157932  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  37157931 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttata 37157832  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  37157831 aattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgta-caacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaact 37157742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25580058 - 25579773
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    || || || ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  25580058 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaat----atcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 25579963  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | || |    
T  25579962 gatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctaataa 25579863  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |  ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  25579862 actgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaact 25579773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 44186374 - 44186643
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||     || || |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44186374 atgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgtt 44186469  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||                || || |||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44186470 gatatcatgtgatagt----------------tgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatga 44186553  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44186554 attgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 44186643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43348533 - 43348319
Alignment:
Q  166 acttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatac 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||  ||  ||||| ||    
T  43348533 acttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttatgggatgttacac 43348434  T
Q  266 ttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacag 364  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||| || |  | ||||||    
T  43348433 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaaagactgaacttttgatgccactaaacaaacag 43348334  T
Q  365 tggggtgttactcac 379  Q
    ||||||||| |||||    
T  43348333 tggggtgttgctcac 43348319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 406
Target Start/End: Original strand, 40552119 - 40552401
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     ||  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40552119 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgat 40552214  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || ||| | || ||| || ||||| ||| ||  |||||  |||| || ||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  40552215 attatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaatt 40552314  T
Q  322 gatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  40552315 gatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 40552401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22451287 - 22451006
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  22451287 atgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 22451192  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||| |||||| |||| || |||||||   || |||||| |||||||| ||||||   |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  22451191 gatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 22451092  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||   || |||||||| |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  22451091 attgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgtt 22451006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3362574 - 3362287
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||     || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  3362574 atgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaac----atattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 3362479  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaatta--agtgtattcttgttaatttgat 316  Q
    ||| | || |||||||||||| || ||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||  ||||    
T  3362478 gatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacatgat 3362379  T
Q  317 gaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||| || |||| ||| |||||| |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||    
T  3362378 gaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaact 3362287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35844581 - 35844360
Alignment:
Q  187 gttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaa 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||  | |||||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  35844581 gttgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaa 35844483  T
Q  287 -ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaa 383  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  35844482 attagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaaca 35844383  T
Q  384 cttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||| ||||||||||||||||    
T  35844382 tttttgttgttatagtgttaact 35844360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 406
Target Start/End: Original strand, 3655060 - 3655344
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcat--ctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttg 219  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||     || ||||||||| | ||  |||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || || ||    
T  3655060 atcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatg 3655155  T
Q  220 atatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||| || |||| |||| || ||||||  |||  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3655156 atatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 3655255  T
Q  320 ttgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  3655256 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 3655344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 54506127 - 54505842
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |     
T  54506127 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----attttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtaga 54506032  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||| |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||    
T  54506031 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatg 54505932  T
Q  318 aattgatgatattatgggactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||| |||||| |||| | |||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  54505931 tatttatgatactatgaggctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 54505842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 4761505 - 4761791
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || |||     |||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||||||||| ||| | ||||| |    
T  4761505 atgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaac----attttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgat 4761600  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    ||||| || |||||||||||| || || |||||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||    
T  4761601 gatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatg 4761700  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  | | ||||||| ||||||| ||||||    
T  4761701 agttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaact 4761791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 11357238 - 11357507
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  11357238 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagttgat 11357333  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||||||||                 |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  11357334 gatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatga 11357416  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagt-ggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  11357417 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaact 11357507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 401
Target Start/End: Original strand, 21009658 - 21009939
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |  ||||     
T  21009658 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttga 21009753  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||| |||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  21009754 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 21009853  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgt 401  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  21009854 aattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 21009939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 328
Target Start/End: Original strand, 22622575 - 22622780
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |    
T  22622575 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgat 22622670  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||| ||||| || |||||| |||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  22622671 gatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 22622770  T
Q  319 attgatgata 328  Q
    ||||||||||    
T  22622771 attgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 33378642 - 33378923
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  33378642 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 33378737  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    || || ||  ||||||||||| |  |||||||   || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  33378738 gagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33378837  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||| | ||||||  ||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  33378838 attgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgtt 33378923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 48355260 - 48354975
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||     || |||||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  48355260 atgatcaataataattcatctagtaatacttgcaac----atcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 48355165  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| | ||| || ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  48355164 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatga 48355065  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  | | |||| || ||||||||||||||    
T  48355064 gttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaact 48354975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 54828558 - 54828842
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||  ||||| ||||| |    
T  54828558 atgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagttgat 54828653  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||    
T  54828654 gatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatgatga 54828753  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||  ||||  || ||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  54828754 attgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattaca-tttttatgttatagtgttaact 54828842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21193874 - 21193655
Alignment:
Q  175 tactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtctt-aattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||  ||||  || |||||| |||||||| |    
T  21193874 tactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaaca 21193775  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg 371  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  21193774 aggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtg 21193675  T
Q  372 ttactcacaaaacttttgat 391  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21193674 ttactcacaacacttttgat 21193655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36012458 - 36012246
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaa-agttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||     
T  36012458 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagc----attttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgc 36012363  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgat 316  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||  ||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||    
T  36012362 tgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgat 36012263  T
Q  317 gaattgatgatattatg 333  Q
    |||||||||||||||||    
T  36012262 gaattgatgatattatg 36012246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 390
Target Start/End: Original strand, 14586537 - 14586796
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||     || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14586537 atgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacc-gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgtt 14586631  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||| ||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14586632 gatatcatacgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatga 14586722  T
Q  319 attgatgata-ttatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttga 390  Q
    |||||||||| | | |||||  ||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14586723 attgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactcacaacacttttga 14586796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 46994518 - 46994755
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    || ||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||| | ||| |    
T  46994518 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaat----atcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttagcatgcaaacataattgat 46994613  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| |||| || | |||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||    
T  46994614 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcatatga 46994713  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtat 358  Q
     ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46994714 gttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtat 46994755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 43975749 - 43976026
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaa---agtt 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||    
T  43975749 atgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaa----atcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagtt 43975844  T
Q  216 gttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttga 315  Q
    | |||||| ||  |||||| |||       ||||||  || |||||| |||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||| | | |||||||| |||    
T  43975845 gatgatattatgcgatagtgtta-------cactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctga 43975937  T
Q  316 tgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  43975938 tgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgtt 43976026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29164128 - 29163914
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  29164128 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg----taacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgct 29164033  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29164032 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatga 29163942  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt 345  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||    
T  29163941 attgatgatactaagaggactgaacttt 29163914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Original strand, 24707972 - 24708230
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| |    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  24707972 atgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaact----tcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgat 24708067  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaat--taagtgtattcttgttaatttgat 316  Q
    ||||| || |||| || |||| || ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||   ||||||| |||||||||| ||||    
T  24708068 gatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgat 24708167  T
Q  317 gaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||    
T  24708168 gaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactg--tacacagtgaggtgttactcac 24708230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 402
Target Start/End: Original strand, 27480218 - 27480517
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaac----aaagttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    | |||||     
T  27480218 atcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttga 27480317  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactt-tggg------------gcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattct 304  Q
    |||||| ||  ||||||||||| || ||||||| ||||            | |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  27480318 tgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtct 27480417  T
Q  305 tgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||| | || || ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  27480418 tgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgtt 27480517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 406
Target Start/End: Original strand, 24488872 - 24489104
Alignment:
Q  176 actattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataag 275  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||  | |||||||||||| || ||||| ||| |  |||||| |||||||| ||     
T  24488872 actattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaat 24488971  T
Q  276 gtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgtt 373  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  24488972 gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgtt 24489071  T
Q  374 actcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| | |||| ||  |||||| ||||||    
T  24489072 actcacaacatttttaatactatagtcttaact 24489104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40936292 - 40936025
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||     || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  40936292 atgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgct 40936197  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     ||||||| ||||||||||||                 |||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40936196 aatatcatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaaaaagttgga-taaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatga 40936115  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40936114 atagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaact 40936025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53176294 - 53176127
Alignment:
Q  202 atgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtat 301  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||     
T  53176294 atgtaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaa 53176195  T
Q  302 tcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtgg 367  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  53176194 tcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtgg 53176127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 22445922 - 22446206
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||| |    
T  22445922 atgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaac----attttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgat 22446017  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||||||||||||| | || || || ||| |  |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| || || ||||||    
T  22446018 gatattatatgatagtcttgagtgttatacattgtga-gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatga 22446116  T
Q  319 attgatgatattat--gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||  |||  ||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||    
T  22446117 attgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaact 22446206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 273 - 406
Target Start/End: Original strand, 20373303 - 20373438
Alignment:
Q  273 aaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggt 370  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20373303 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggt 20373402  T
Q  371 gttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||   | | ||||||||||||||| ||||||    
T  20373403 gttactcgttacatttttgatgttatagtattaact 20373438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1090012 - 1089811
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  1090012 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaa----atcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgtt 1089918  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    ||| | || |||||||||||| || ||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||| || |||| || ||||     
T  1089917 gatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgata 1089818  T
Q  318 aattgat 324  Q
    |||||||    
T  1089817 aattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 335
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835697
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgata 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||     || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||      ||| ||| | ||||| |||||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaac----atcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgata 11835583  T
Q  223 tcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaa-attaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  11835584 tcatgtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaatt 11835683  T
Q  322 gatgatattatggg 335  Q
    ||||||| ||||||    
T  11835684 gatgatactatggg 11835697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 406
Target Start/End: Original strand, 51212959 - 51213123
Alignment:
Q  244 tacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac 342  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  51212959 tacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaac 51213058  T
Q  343 ttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  | | |||| |||||| ||||||||||    
T  51213059 ttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaact 51213123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38591978 - 38591728
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| | | ||| |||||| || |||||||||||| ||  ||  |||| || || ||    
T  38591978 ttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtatt 38591879  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||| ||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |    
T  38591878 acacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgtaca 38591779  T
Q  360 a----acagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |    ||| || | |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  38591778 acaatacaatgagatgttactccctataattttgatgttatagtgttaact 38591728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50475130 - 50475021
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||| |    
T  50475130 atgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgat 50475035  T
Q  219 gatatcatatgata 232  Q
    ||||| ||||||||    
T  50475034 gatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 51212628 - 51212743
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  51212628 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 51212723  T
Q  219 gatatcatatgatagtctta 238  Q
    ||||| || |||||| ||||    
T  51212724 gatattatgtgatagcctta 51212743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 251
Target Start/End: Original strand, 20373140 - 20373229
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacacttt 251  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||| |||| || ||||||||    
T  20373140 ttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacacttt 20373229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 252
Target Start/End: Original strand, 11357046 - 11357136
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg 252  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||  || || ||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||||    
T  11357046 ttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttg 11357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2613973 - 2613924
Alignment:
Q  357 ataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2613973 ataaatagtgtggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaact 2613924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33698263 - 33698222
Alignment:
Q  365 tggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33698263 tggggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaact 33698222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Original strand, 53811630 - 53811701
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtctt 237  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||    |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  53811630 ttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatg----caaagttgatgatattatgtgatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 3879795 - 3880080
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  3879795 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 3879890  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| | |||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  3879891 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatga 3879990  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  3879991 attgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaact 3880080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29182450 - 29182206
Alignment:
Q  165 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttat 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||     
T  29182450 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttac 29182351  T
Q  264 acttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaacttt-gatgtcattgtataaa 361  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29182350 acttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaa 29182251  T
Q  362 cagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29182250 cagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 29182206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8513556 - 8513276
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  8513556 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaag----attttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgct 8513461  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||  | ||||||      ||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  8513460 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtta------aaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatg 8513367  T
Q  318 aattgatgatattatggg-actgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8513366 aattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaact 8513276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 4318678 - 4318964
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4318678 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgct 4318773  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||   | |||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  4318774 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatg 4318873  T
Q  318 aattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4318874 aattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaact 4318964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 7234891 - 7235171
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |    
T  7234891 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgat 7234986  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  |||||||||||  | ||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  7234987 gatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 7235086  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7235087 attgataatactatgagactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgtt 7235171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 33892868 - 33893143
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||     || ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  33892868 atgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgct 33892963  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33892964 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33893054  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33893055 attgatgatactaagggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 33893143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 406
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353499
Alignment:
Q  165 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttata 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  265 cttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgg-gactgaact-ttgatgtcattgtataaac 362  Q
    ||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| || |||| ||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  363 agtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaact 30353499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1946163 - 1945877
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||     ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||     
T  1946163 atgatcaatagtatattcatctaataatgcttg----taacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttga 1946068  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1946067 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttgatg 1945968  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  1945967 aattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 1945877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 174 - 381
Target Start/End: Original strand, 21017019 - 21017228
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  21017019 gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaata 21017118  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg 371  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  21017119 acgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtg 21017218  T
Q  372 ttactcacaa 381  Q
    ||||||||||    
T  21017219 ttactcacaa 21017228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5627720 - 5627434
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||     
T  5627720 atgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttga 5627625  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| |  |||||||||  | ||||||| |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  5627624 tgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 5627525  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  5627524 aattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaact 5627434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6089231 - 6088951
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  6089231 atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaac----attttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgct 6089136  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||||| |||||||||||| || || || |||  | ||||||      ||| ||||||| |||||| ||| || |||  ||||||||||||| |||||    
T  6089135 gatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgtta------aaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatg 6089042  T
Q  318 aattgatgatattatgg-gactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  6089041 aattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaact 6088951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15491884 - 15491658
Alignment:
Q  182 ttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaa 281  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||| ||||| | |||| || |||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |    
T  15491884 ttatcgttagcatctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtagga 15491785  T
Q  282 taaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  15491784 taaaattagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcac 15491685  T
Q  380 aaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||    
T  15491684 aacacttttgatgttacaatgttaact 15491658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Original strand, 6091038 - 6091297
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  6091038 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgat 6091133  T
Q  219 gatatcatatgatagtc-ttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    ||||| || |||||||| |||| || |||||||||  | ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||    
T  6091134 gatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatg 6091233  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    ||||||||||| || | | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  6091234 aattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcac 6091297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20768410 - 20768189
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  20768410 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----accttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgat 20768315  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  |||  |||||| || ||||||||  ||  ||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  20768314 gatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatga 20768217  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt 345  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  20768216 attaatgatactatgaggactgaacttt 20768189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 406
Target Start/End: Original strand, 7055139 - 7055356
Alignment:
Q  191 acatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaa 290  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||| |||||| || ||||||| |||| || |||||||||  |||||||| ||||| || ||||||  |||||||||     
T  7055139 acatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattat 7055238  T
Q  291 attaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaactttt 388  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||||||| |  | | ||||    
T  7055239 attaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttt 7055338  T
Q  389 gatgttatagtgttaact 406  Q
     |||||||||||||||||    
T  7055339 tatgttatagtgttaact 7055356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33619158 - 33618881
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaac-----atgtaaacaaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     ||| ||||| ||    
T  33619158 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatag 33619063  T
Q  214 ttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaattt 313  Q
    ||| |||||| ||  |||| |||||| ||  ||||||   || |||||| |||        ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  33619062 ttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacacttctagg-gtgttacact--------ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 33618972  T
Q  314 gatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||  ||| ||| | |||| || ||||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  33618971 gatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctactcactacacttttgatgcgatagtgtt 33618881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3177267 - 3176982
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  3177267 atgataaatagtaattcatctagtaatgcttg----taatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 3177172  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  3177171 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 3177072  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||    
T  3177071 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaact 3176982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Original strand, 31570609 - 31570892
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31570609 atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaac----atcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgtt 31570704  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||| |||| || |||||| |||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31570705 gatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 31570804  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  31570805 attcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaa 31570892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 33709107 - 33709392
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  33709107 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgct 33709202  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||  | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  |    
T  33709203 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaata 33709302  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709303 tttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaact 33709392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 4263951 - 4264237
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||     || ||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4263951 atgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 4264046  T
Q  219 gatatcatat-gatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||||| | ||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4264047 gatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatgatg 4264146  T
Q  318 aattgatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4264147 aattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 4264237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 406
Target Start/End: Original strand, 33550865 - 33551146
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||     || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  33550865 atcaatagttattcatctagtaatgcttgcaac----atattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgat 33550960  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || ||| | ||||||||| || ||||||||| || ||||||  ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33550961 attatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 33551059  T
Q  322 gatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  33551060 gatgatactatgaagaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaact 33551146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4167250 - 4166965
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||     || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  4167250 atgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgat 4167155  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4167154 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4167055  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||    
T  4167054 attgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaact 4166965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4763959 - 4763678
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | | ||| |    
T  4763959 atgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaat----atcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgat 4763864  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  4763863 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 4763764  T
Q  319 attgatgatattatggg-actgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||    
T  4763763 attgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgtt 4763678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 43648120 - 43648405
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |     || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  43648120 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgac----atcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgat 43648215  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || || |||||| |  |||||| ||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43648216 gatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 43648315  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  43648316 gttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 43648405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36642265 - 36642031
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||| || |||||||||  | |||||| |||||||| |    
T  36642265 gtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaaca 36642166  T
Q  274 aggtagaat--aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtgggg 369  Q
    |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||    
T  36642165 aggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgagg 36642066  T
Q  370 tgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  36642065 tgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaa 36642031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4478693 - 4478412
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4478693 atgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaccgatactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttggt 4478598  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||||||||     |||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4478597 gatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 4478503  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4478502 aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 4478412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44286277 - 44285992
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||     || || ||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44286277 atgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaac----atcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttgtt 44286182  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44286181 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatga 44286082  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| || | || |||||||| | | || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44286081 atttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaact 44285992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 193 - 406
Target Start/End: Original strand, 19424573 - 19424788
Alignment:
Q  193 atctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaat 292  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  19424573 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagat 19424672  T
Q  293 taagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttga 390  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19424673 taagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttga 19424772  T
Q  391 tgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||||    
T  19424773 tgttatagtgttaact 19424788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19314175 - 19313895
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaa---gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagtt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19314175 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacatagtt 19314080  T
Q  216 gttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttga 315  Q
    | ||||||||| ||||||| |||       ||||||| || |||||| |||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  19314079 gctgatatcatgtgatagtgtta-------cactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctga 19313987  T
Q  316 tgaattgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  19313986 tgaattgatgatactataggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaact 19313895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 33660252 - 33660528
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33660252 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgct 33660347  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||   ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  33660348 gatatcatgtgggtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatga 33660438  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33660439 attgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 33660528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 43770723 - 43770999
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     || ||| ||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  43770723 atgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 43770818  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| |  |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43770819 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatga 43770909  T
Q  319 attgatgatatt-atgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43770910 attgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 43770999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 391
Target Start/End: Original strand, 39167250 - 39167508
Alignment:
Q  125 aatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  |    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||     
T  39167250 aatagtaattcatctagtaatgctagcaacaa----tttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatatt 39167345  T
Q  225 atatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgat 324  Q
    || |||||||      || ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  39167346 atgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgat 39167439  T
Q  325 gatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgat 391  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39167440 gatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgat 39167508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 27349823 - 27350098
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||  |    
T  27349823 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagttcct 27349918  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27349919 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 27350009  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  27350010 attgatgatactaagggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaact 27350098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 177 - 406
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41464010
Alignment:
Q  177 ctattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataagg 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| |  |||||| | |||||| || |    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  277 tagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgtta 374  Q
    ||  ||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  41463879 tatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgtta 41463978  T
Q  375 ctcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  41463979 ctcacaacacttttgattttatagtattaact 41464010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Original strand, 17071651 - 17071897
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  17071651 ttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 17071750  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||   || |||| ||||||||||||||| |    
T  17071751 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcattgtaca 17071850  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || | || | ||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||    
T  17071851 aataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaact 17071897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Original strand, 29242052 - 29242298
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||| || |||||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  29242052 ttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgtt 29242151  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||  || |||| |    
T  29242152 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtaca 29242251  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||| ||||||    
T  29242252 aacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaact 29242298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41961168 - 41960945
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |    
T  41961168 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgat 41961073  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41961072 gatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 41960973  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt 345  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41960972 attgatgatactatgtggactgaacttt 41960945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44913953 - 44913704
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  44913953 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgt 44913854  T
Q  261 tatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat--gggactgaac-tttgatgtcattgta 357  Q
    || |||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||| ||    
T  44913853 tacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcatttta 44913754  T
Q  358 taaac-agtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     |||| |||| |||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||    
T  44913753 caaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaact 44913704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 406
Target Start/End: Original strand, 2325256 - 2325530
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  2325256 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgat 2325351  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||        ||    
T  2325352 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------tt 2325443  T
Q  322 gatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  | | || |||||||||| ||||||||    
T  2325444 gatgatactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaact 2325530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 19289198 - 19289483
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    || ||||||||||| ||| |||||||| || |  |||||||||||| | ||| ||||| |    
T  19289198 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaat----atcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgat 19289293  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||  ||||| | ||| || || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  19289294 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 19289393  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| | || | ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  19289394 gttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaact 19289483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26357905 - 26357620
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  26357905 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgat 26357810  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
     |||| || ||||||| |||| || |||| |||| ||  ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26357809 aatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatga 26357710  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||| |   |||  | ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26357709 attgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaact 26357620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 18494156 - 18494428
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  18494156 atgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgtt 18494251  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  || ||||| |  || ||| |||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||    
T  18494252 gatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatga 18494350  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||            |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18494351 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 18494428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37906038 - 37905751
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     || ||||||||||| ||  ||||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  37906038 atgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaac----atcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaat 37905943  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg--gggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgat 316  Q
    ||||| ||  |||||| |||| || |||||||||  ||| ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37905942 gatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 37905843  T
Q  317 gaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   | | |||| |||||||||||||||||    
T  37905842 gaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaact 37905751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Original strand, 17054010 - 17054256
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||    
T  17054010 ttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgtt 17054109  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||| |    
T  17054110 acgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcattgtaca 17054209  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| || | ||||||| || | | ||||||||||||||| ||||||    
T  17054210 aacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaact 17054256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Original strand, 11366255 - 11366539
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||     
T  11366255 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttga 11366350  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | |||||||  ||| || ||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||    
T  11366351 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatg 11366450  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| || ||| |||| | |||||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  11366451 aattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaa 11366539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13711787 - 13711507
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||     || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  13711787 atgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaac----atcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgct 13711692  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| | |||||||||| |  || |||||  || |||||| |||||||| | |     ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13711691 gatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaacatg-----ataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 13711597  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  13711596 attgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaact 13711507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5881857 - 5881599
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5881857 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgtt 5881762  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||  ||         ||||||||| |  || ||| |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5881761 gatatcatgtgagtgt---------tacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatga 5881672  T
Q  319 attgatgatattatggg-actgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttg 389  Q
    |||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5881671 attgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttg 5881599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41465829 - 41465606
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  41465829 atgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgat 41465734  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||| | ||||    
T  41465733 gatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatga 41465634  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaacttt 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41465633 attgatgatattatagggactgaacttt 41465606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45328009 - 45327801
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||  ||||||||||  || ||||||||  |  |||||    
T  45328009 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgttacactttctgaggtgtt 45327910  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||  |||||    
T  45327909 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcaccgtata 45327810  T
Q  360 aacagtggg 368  Q
    |||| ||||    
T  45327809 aacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Original strand, 7006813 - 7007054
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  7006813 atgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 7006908  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||| ||||||                 |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |    
T  7006909 gatatcatgtgatattcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataa 7006991  T
Q  319 attgatgatattatggg-actgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  7006992 attgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgttactcac 7007054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35959220 - 35959023
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||| |    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  35959220 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacat----gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgat 35959129  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35959128 gatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatga 35959030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31862180 - 31861975
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||| ||||| | ||| |    
T  31862180 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtctac----aatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgat 31862085  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| | |||| || ||||||||| || ||||||  |||| || || |||   |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31862084 gatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31861985  T
Q  319 attgatgata 328  Q
    ||||||||||    
T  31861984 attgatgata 31861975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Original strand, 18258214 - 18258349
Alignment:
Q  175 tactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataa 274  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||  || |||||| |||||||| ||    
T  18258214 tactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaa 18258313  T
Q  275 ggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaa 310  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18258314 tgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 252
Target Start/End: Original strand, 19500790 - 19500919
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  19500790 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagttgat 19500885  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg 252  Q
     |||| || |||||||||||| || |||| ||||    
T  19500886 aatattatgtgatagtcttaagtgttacattttg 19500919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902136
Alignment:
Q  198 taacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagt 297  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||||| | |||| || ||||||||| || ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaat 33902220  T
Q  298 gtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
     || |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  33902219 atagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcac 33902136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 149
Target Start/End: Original strand, 19424517 - 19424547
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424517 atgatcaatagtaattcatctagtaatgctt 19424547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 345
Target Start/End: Original strand, 19501768 - 19501837
Alignment:
Q  276 gtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaacttt 345  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  19501768 gtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttt 19501837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 38823538 - 38823253
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |    
T  38823538 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgct 38823443  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||  | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38823442 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38823343  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  38823342 attgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaact 38823253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 7078915 - 7079211
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7078915 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgc----aatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgtt 7079010  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| |  || |||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079011 gatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 7079110  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaac-----------agtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaac 405  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7079111 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaac 7079210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47279513 - 47279228
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||     || |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47279513 atgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaac----atcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgtt 47279418  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47279417 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 47279318  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  47279317 attgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaact 47279228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 51129183 - 51128898
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  51129183 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 51129088  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51129087 gatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatga 51128988  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  51128987 attgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaact 51128898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 371
Target Start/End: Original strand, 27227337 - 27227587
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27227337 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 27227432  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||||| || | ||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27227433 gatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 27227532  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg 371  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  27227533 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 9902906 - 9903191
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||      || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  9902906 atgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagc----atcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgat 9903001  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| |||| || |||||| |||| ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  9903002 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 9903101  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  9903102 attgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaact 9903191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 27532833 - 27533117
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |    
T  27532833 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgct 27532928  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |||||||||| | || ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27532929 gatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatga 27533027  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| || |||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27533028 attgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaact 27533117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 238365 - 238649
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  238365 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgat 238460  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |    
T  238461 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatta 238560  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||    
T  238561 attgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaact 238649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2960072 - 2959787
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  2960072 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgat 2959977  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| |||| ||  ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  2959976 gatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatga 2959877  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||    
T  2959876 attgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaact 2959787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 11742220 - 11742487
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |    
T  11742220 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgct 11742315  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||                 |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  11742316 gatatcatgtgatagtcttaattgttacactt-----------------aaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatga 11742398  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  11742399 attgatgatattatgggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaact 11742487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18422975 - 18422690
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     || ||||||||||| || || |||||||||||  |||||||||||| ||||  || || |    
T  18422975 atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgat 18422880  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  | || || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18422879 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 18422780  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  18422779 attgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaact 18422690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4330605 - 4330323
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  4330605 atgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaac----atattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgat 4330510  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| |    
T  4330509 gatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgataa 4330410  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagt-ggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||  || |||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  4330409 attgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtt 4330323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 28564635 - 28564918
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28564635 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgat 28564730  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||  |||| || ||||||||  || ||||||| |||| || |||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28564731 gatattatgtgatag--ttaagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 28564828  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  28564829 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 28564918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3535247 - 3534971
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  3535247 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 3535152  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| |         || || ||||||||| || |||||| |||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3535151 gatatcatgt---------aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 3535061  T
Q  319 attgatgatatt-atgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3535060 attgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 3534971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 27563757 - 27564042
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||     || |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27563757 atgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaac----atcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgat 27563852  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    || || ||||||||||||||| || | | ||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27563853 gaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 27563952  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  27563953 attgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaact 27564042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32216379 - 32216094
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     || |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||  |    
T  32216379 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaac----atcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttat 32216284  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| || | |||||||| | ||||    
T  32216283 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatga 32216184  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  32216183 attgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaact 32216094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32267354 - 32267073
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgata 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||||| |||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32267354 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgata 32267259  T
Q  223 tcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattg 322  Q
    | || |||||||||| | || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  32267258 ttatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttg 32267159  T
Q  323 atgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  32267158 atgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaact 32267073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41926480 - 41926202
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  41926480 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-----aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgat 41926386  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || | |||      | || ||||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41926385 gatattatttaata------agtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 41926292  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaactt-tgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| | |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  41926291 attgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaact 41926202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 406
Target Start/End: Original strand, 10181863 - 10182145
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaag-tactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||  || || ||||| ||||    
T  10181863 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgat 10181958  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10181959 attatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaatt 10182058  T
Q  322 gatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||| | | |||| |||||| ||| ||||||    
T  10182059 gacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaact 10182145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 381
Target Start/End: Original strand, 47682346 - 47682607
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  47682346 atgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaac----atcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 47682441  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  47682442 gatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatga 47682541  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggg-gtgttactcacaa 381  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||  || |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  47682542 attgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaa 47682607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15383254 - 15382974
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  15383254 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgat 15383159  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || ||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15383158 attatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 15383059  T
Q  322 gatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    ||||||| || |  |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  15383058 gatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaa 15382974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37451609 - 37451325
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  37451609 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 37451514  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||  |  |||||| ||||| || |||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |    
T  37451513 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgataa 37451414  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||    
T  37451413 attgatgatactagaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaact 37451325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 379
Target Start/End: Original strand, 27267055 - 27267309
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     || || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27267055 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgat 27267150  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || |||||||||||| || | ||||||| || |||||| ||| |||| ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27267151 attatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggtag-attaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatt 27267249  T
Q  322 gatgatattatgg-gactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  27267250 gatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcac 27267309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16415970 - 16415684
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16415970 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgat 16415875  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| |  |||| | || || || ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||    
T  16415874 gatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatga 16415775  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaaca-gtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  | |||||| ||||||| || |||| |||||  | ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  16415774 attgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaact 16415684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15752353 - 15752068
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||| |    | ||||||||||| ||| |||||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||  |    
T  15752353 atgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaact----tcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaat 15752258  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||| |||||| || ||||||||  || ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15752257 gatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 15752158  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  15752157 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaact 15752068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3309477 - 3309187
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  3309477 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaat----atcttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgct 3309382  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacact-----ttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatt 312  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||     | | |  |||||| | |||||| || ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3309381 gatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc 3309282  T
Q  313 tgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||  || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3309281 tgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 3309187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8222451 - 8222170
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  8222451 atgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 8222357  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8222356 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 8222257  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||   ||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  8222256 attgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 8222170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23999672 - 23999386
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||     
T  23999672 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttga 23999577  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||| |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  23999576 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 23999477  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||   | | |||| ||||| |||||||||||    
T  23999476 aattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatattttttatgttgtagtgttaact 23999386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39393708 - 39393422
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||| ||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  39393708 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgct 39393613  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaat-aaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  39393612 aatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatg 39393513  T
Q  318 aattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||| |||||| ||| |||| | ||| ||||||| || |||| ||||| ||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39393512 aatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaact 39393422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10923051 - 10922766
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||  ||||||||||| ||    |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  10923051 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----attttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgat 10922956  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||| |||||||| || ||||||||| |  ||||||  |||| || ||||||  ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10922955 gatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 10922856  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
     ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | | |||| |||||||||||||||||    
T  10922855 gttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaact 10922766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40885137 - 40884856
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  40885137 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgat 40885042  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  ||  ||||| |||||||| ||| ||| |||||| || |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  40885041 gatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 40884942  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  40884941 attgaagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgtt 40884856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 48620906 - 48620676
Alignment:
Q  169 tacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatactta 268  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  ||         ||||||||| || |||||| |||||    
T  48620906 tacaggtactatttattcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgagtgt---------tacactttgtggggtgttacactta 48620816  T
Q  269 aaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgata-ttatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtg 366  Q
    ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  48620815 aaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtg 48620716  T
Q  367 gggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48620715 gggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaact 48620676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Original strand, 30326804 - 30327087
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  30326804 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttaaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgat 30326899  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  30326900 gatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatga 30326999  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||||  |||||| |||| || |||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  30327000 attgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaa 30327087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25160956 - 25160710
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |    
T  25160956 atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgat 25160861  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |||| || || |||||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||| | ||||    
T  25160860 gatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatga 25160761  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtgg 367  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  25160760 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28769977 - 28769692
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || |    
T  28769977 atgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgat 28769882  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg-gggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    ||||| || ||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||   ||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  28769881 gatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatg 28769782  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||    
T  28769781 aattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagtgttaact 28769692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 122 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30254744 - 30254463
Alignment:
Q  122 atcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  30254744 atcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgtt 30254649  T
Q  222 atcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaatt 321  Q
    || || ||| |||||||| || ||||||||   | ||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  30254648 attatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatgaatt 30254549  T
Q  322 gatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||  | | ||||||||||||| ||||||||    
T  30254548 gatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttatattgttaact 30254463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14758356 - 14758084
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  14758356 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgat 14758261  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  |||||||||||||       | |||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||    
T  14758260 gatattatgcgatagtcttaatt-------tctgggg--tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatga 14758170  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14758169 attgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgtt 14758084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 345
Target Start/End: Original strand, 33725488 - 33725675
Alignment:
Q  159 attttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgt 258  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||| || ||||||||  || ||    
T  33725488 attttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggt 33725587  T
Q  259 gttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt 345  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33725588 gttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttt 33725675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42721360 - 42721105
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||     || ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |    
T  42721360 atgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaac----atcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgat 42721268  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| |  ||||| |||||| || || |||||| || || ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42721267 gatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42721168  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  42721167 attgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcac 42721105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15168420 - 15168197
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||     || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  15168420 atgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaac----atcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgat 15168325  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| ||  ||||| ||||| || ||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  15168324 gatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatga 15168225  T
Q  319 attgatgatattat-gggactgaacttt 345  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15168224 attgatgatactatggggactgaacttt 15168197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 19899620 - 19899906
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||     
T  19899620 atgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgg 19899715  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||  |||| || || |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  19899716 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 19899815  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  19899816 aattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaact 19899906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 46931734 - 46931450
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||     
T  46931734 atgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttga 46931639  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | ||||||  || || |  |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||    
T  46931638 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgctgaaca--aggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 46931541  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||||||||| || |||||  ||||||| | || || |||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  46931540 aattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaact 46931450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 34012234 - 34012514
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  34012234 atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgat 34012329  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || ||||||| |     | |||| |||| || |||||| |||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34012330 gatattatgtgatagtgt-----gttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 34012424  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || | || ||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  34012425 attgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaact 34012514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22171035 - 22170812
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||     || || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  22171035 atgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaac----atcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgat 22170940  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || |||||| | || ||| ||||||| || |||||| |||||||||| | || ||||| | ||||    
T  22170939 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatga 22170840  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaacttt 345  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||    
T  22170839 attgatgatattatgtagactgaacttt 22170812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 406
Target Start/End: Original strand, 37618757 - 37619033
Alignment:
Q  123 tcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgata 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  37618757 tcaatactaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 37618852  T
Q  223 tcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattg 322  Q
    | ||||||  ||         ||||||||  ||  |||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  37618853 ttatatgagtgt---------tacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattg 37618943  T
Q  323 atgatat--tatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg--ttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||  |||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37618944 atgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaact 37619033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1547595 - 1547326
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||         |||||||    
T  1547595 atgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacag--------agttgtt 1547508  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||||| ||||||| || | || ||||||||| || |||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||           
T  1547507 gatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaat------- 1547415  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
      |||||||| |||| | ||||||| ||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  1547414 -ctgatgatactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaact 1547326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Original strand, 31621401 - 31621686
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaac-----atgtaaacaaag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||     || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     ||| ||||| ||    
T  31621401 atgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaac----atattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatag 31621496  T
Q  214 ttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaattt 313  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| ||  ||||||  ||| || ||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  31621497 ttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacacttctggg-gtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 31621595  T
Q  314 gatgaattgatgatattat-gggactgaa-ctttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgtt 402  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||  ||| ||| || |||||| ||||||  | || |||||||||||||||||    
T  31621596 gatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgtt 31621686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38759802 - 38759649
Alignment:
Q  178 tattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggt 277  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||||| |    
T  38759802 tattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatagtctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagat 38759703  T
Q  278 agaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatatta 331  Q
    |  ||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  38759702 atgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatatta 38759649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48353866 - 48353751
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  48353866 atgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaat----atcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgct 48353771  T
Q  219 gatatcatatgatagtctta 238  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  48353770 gatatcatgtgatagtctta 48353751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 27763162 - 27763447
Alignment:
Q  119 atgatcaatagta-attcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgt 217  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||     || ||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||     
T  27763162 atgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaac----atcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttga 27763257  T
Q  218 tgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatg 317  Q
    | |||| || |||||||||||| |  |||||||||  | ||||||  |||| ||  |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||     
T  27763258 ttatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgata 27763357  T
Q  318 aattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||| || ||||  | ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  27763358 aattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactat-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaact 27763447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 252
Target Start/End: Original strand, 1359787 - 1359916
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||     |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  1359787 atgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaac----attttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgat 1359882  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttg 252  Q
    ||||| |||||||| |||||| || |||||||||    
T  1359883 gatattatatgataatcttaagtgttacactttg 1359916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289738
Alignment:
Q  303 cttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaacttt-gatgtcattgtataaacagtggggtgttactcac 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcac 21289738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8215 - 7930
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| |    
T  8215 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgat 8120  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||| || ||||||  |||| |  ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8119 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 8020  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  8019 attgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaact 7930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12237 - 11952
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  12237 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgct 12142  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||||||| || |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12141 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 12042  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattg-tataaacagt-ggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaa 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || || || ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  12041 attgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaa 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 174 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 177
Alignment:
Q  174 gtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaata 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || ||||||||  || |||||| ||||||||||    
T  411 gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaata 312  T
Q  274 aggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtg 371  Q
    || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  311 agataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtg 212  T
Q  372 ttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| | |||| ||  || ||||||||||    
T  211 ttactcacaacattttttatactacagtgttaact 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 395
Target Start/End: Original strand, 408286 - 408559
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  408286 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 408381  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    |||||  | |||||||||||| || | ||||||| |  ||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  408382 gatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 408481  T
Q  319 attgatgatattatgggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgtta 395  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||| || |||| ||  |||||||||||  | | |||||||||||    
T  408482 attgatgatactagaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Original strand, 94347 - 94525
Alignment:
Q  230 atagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatat 329  Q
    |||||||||| || ||||||||| || |||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||     
T  94347 atagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatag 94446  T
Q  330 tat-gggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||| |||||  ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  94447 tatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaact 94525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 222
Target Start/End: Original strand, 93957 - 94056
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  93957 atgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaac----atcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttgat 94052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44284 - 44000
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  | |    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  44284 atgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaact----tggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgat 44189  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||| ||||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  44188 gatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 44090  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||  | | ||||||| |||||| |||||||    
T  44089 attgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaact 44000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 406
Target Start/End: Original strand, 154503 - 154787
Alignment:
Q  119 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaattaatattttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  | |    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  154503 atgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaact----tggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgat 154598  T
Q  219 gatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 318  Q
    ||||| || |||||| ||||| || ||||||||| || ||||||  |||| || ||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  154599 gatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 154697  T
Q  319 attgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||  | | ||||||| |||||| |||||||    
T  154698 attgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttttgatattatagcgttaact 154787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 162 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 267574 - 267331
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtc-ttaattgatacactttggggcgtgt 260  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || ||||||||| ||  |||    
T  267574 ttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggatgt 267475  T
Q  261 tatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattat-gggactgaac-tttgatgtcattgta- 357  Q
    || | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||     
T  267474 tacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacactgtac 267375  T
Q  358 taaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgt 401  Q
     ||||||| || |||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  267374 aaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 406
Target Start/End: Original strand, 145912 - 146158
Alignment:
Q  162 ttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgtt 261  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| |||||| || |||||||||||| || |||||||||  | |||||    
T  145912 ttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtt 146011  T
Q  262 atacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtata 359  Q
    || |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||| || |    
T  146012 atgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctaca 146111  T
Q  360 aacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    || | ||||||||||||||  | | |||| |||||||| ||||||||    
T  146112 aataatggggtgttactcattacattttttatgttataatgttaact 146158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42434 - 42391
Alignment:
Q  363 agtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaact 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42434 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaact 42391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  266 ttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgt 307  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University