View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20729_high_4 (Length: 359)

Name: NF20729_high_4
Description: NF20729
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20729_high_4
NF20729_high_4
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (65-346)||(232950-233231)
scaffold0014 (66-344)||(147535-147814)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (65-346)||(46508552-46508833)
chr7 (66-346)||(46497940-46498220)
chr7 (66-346)||(11625320-11625600)
chr7 (65-346)||(32109643-32109924)
chr7 (66-346)||(8501875-8502155)
chr7 (66-346)||(8512345-8512625)
chr7 (66-346)||(16130870-16131150)
chr7 (66-346)||(32099206-32099486)
chr7 (66-346)||(5390406-5390686)
chr7 (66-346)||(6535310-6535590)
chr7 (66-346)||(6545631-6545911)
chr7 (66-346)||(16141419-16141699)
chr7 (66-346)||(44898124-44898405)
chr7 (66-346)||(44908549-44908830)
chr7 (66-346)||(5380769-5381048)
chr7 (66-346)||(5927961-5928241)
chr7 (66-346)||(26304381-26304662)
chr7 (66-346)||(26307941-26308222)
chr7 (66-346)||(26362156-26362437)
chr7 (65-344)||(13130665-13130947)
chr7 (66-344)||(43984488-43984769)
chr7 (66-344)||(27989922-27990203)
chr7 (66-344)||(14946939-14947220)
chr7 (66-344)||(15374533-15374814)
chr7 (65-344)||(42621920-42622200)
chr7 (66-344)||(9534192-9534472)
chr7 (66-344)||(9544475-9544755)
chr7 (66-167)||(7018361-7018461)
chr7 (66-167)||(7033719-7033819)
chr7 (66-344)||(24539417-24539698)
chr7 (66-343)||(31825548-31825827)
chr7 (66-344)||(9007773-9008054)
chr7 (64-343)||(2990838-2991121)
chr7 (239-344)||(15987794-15987898)
chr7 (66-155)||(13284658-13284748)
chr7 (66-154)||(45554577-45554666)
chr7 (66-344)||(5614405-5614686)
chr7 (259-344)||(14247650-14247735)
chr7 (66-155)||(19801119-19801208)
chr7 (66-155)||(19586766-19586855)
chr7 (66-155)||(42596403-42596493)
chr7 (65-155)||(8341225-8341313)
chr7 (66-154)||(15987617-15987705)
chr7 (264-344)||(12088154-12088234)
chr7 (217-344)||(19800928-19801055)
chr7 (66-125)||(12088382-12088440)
chr7 (286-344)||(7018580-7018638)
chr7 (286-344)||(7033942-7034000)
chr7 (66-344)||(12826329-12826611)
chr7 (66-135)||(14247129-14247197)
chr7 (239-344)||(41028428-41028532)
chr7 (239-344)||(12770911-12771014)
chr7 (66-139)||(12771124-12771195)
chr7 (239-344)||(13284836-13284940)
chr7 (66-125)||(41028651-41028707)
chr7 (264-336)||(8341042-8341114)
chr7 (239-341)||(19586578-19586680)
chr7 (266-336)||(12516099-12516169)
chr7 (239-341)||(42596214-42596315)
chr7 (64-138)||(28344809-28344885)
chr7 (66-122)||(10610732-10610787)
chr7 (233-280)||(7018508-7018554)
chr7 (233-280)||(7033866-7033912)
chr7 (301-344)||(10416812-10416855)
chr7 (82-136)||(14634356-14634411)
chr7 (82-136)||(14644044-14644099)
chr7 (82-138)||(7593426-7593484)
chr7 (64-126)||(11605261-11605322)
chr7 (266-336)||(12492294-12492364)
chr7 (101-162)||(12575207-12575268)
chr7 (98-138)||(15174990-15175031)
chr7 (82-126)||(15946932-15946976)
chr7 (82-136)||(33291754-33291810)
chr7 (217-344)||(45554385-45554512)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (65-346)||(8984227-8984508)
chr3 (66-346)||(8973672-8973952)
chr3 (65-346)||(1684209-1684490)
chr3 (66-346)||(682768-683048)
chr3 (66-346)||(6423133-6423413)
chr3 (66-346)||(9537961-9538241)
chr3 (66-346)||(9548287-9548567)
chr3 (65-346)||(16334374-16334655)
chr3 (66-346)||(5654582-5654865)
chr3 (66-346)||(6433560-6433840)
chr3 (66-312)||(16697765-16698011)
chr3 (66-249)||(12794400-12794583)
chr3 (66-344)||(4372368-4372649)
chr3 (66-344)||(4382109-4382390)
chr3 (66-344)||(10944-11224)
chr3 (66-344)||(10002381-10002662)
chr3 (66-344)||(25433938-25434217)
chr3 (65-344)||(20492859-20493131)
chr3 (66-337)||(4023079-4023357)
chr3 (70-344)||(10506823-10507091)
chr3 (70-344)||(10507637-10507905)
chr3 (66-344)||(24872177-24872458)
chr3 (66-344)||(2487829-2488108)
chr3 (65-155)||(4781401-4781491)
chr3 (66-155)||(13118400-13118489)
chr3 (66-155)||(14801383-14801472)
chr3 (255-344)||(38817110-38817197)
chr3 (66-344)||(49386333-49386614)
chr3 (66-162)||(16127496-16127591)
chr3 (66-125)||(20743661-20743720)
chr3 (69-141)||(20294071-20294141)
chr3 (66-162)||(38816904-38817000)
chr3 (264-344)||(20293874-20293954)
chr3 (66-155)||(24773785-24773873)
chr3 (239-344)||(51977616-51977721)
chr3 (66-155)||(19827177-19827275)
chr3 (239-344)||(24814661-24814765)
chr3 (217-344)||(4781555-4781682)
chr3 (264-344)||(12387062-12387142)
chr3 (264-344)||(24773593-24773673)
chr3 (239-349)||(11459962-11460071)
chr3 (239-344)||(19827361-19827466)
chr3 (66-155)||(24814853-24814942)
chr3 (66-155)||(51977441-51977530)
chr3 (299-344)||(23503056-23503101)
chr3 (217-344)||(20743817-20743944)
chr3 (217-344)||(13118553-13118677)
chr3 (101-159)||(20280641-20280699)
chr3 (66-154)||(11460846-11460933)
chr3 (77-138)||(13327801-13327864)
chr3 (264-344)||(14801581-14801661)
chr3 (77-138)||(23487725-23487788)
chr3 (66-121)||(23502828-23502883)
chr3 (82-138)||(24794253-24794311)
chr3 (82-138)||(28351415-28351473)
chr3 (82-138)||(28375160-28375218)
chr3 (82-138)||(28382982-28383040)
chr3 (101-162)||(12388393-12388454)
chr3 (65-125)||(11043658-11043717)
chr3 (301-349)||(11043902-11043950)
chr3 (66-155)||(13430476-13430567)
chr3 (239-307)||(16127338-16127405)
chr3 (66-94)||(17734994-17735022)
chr3 (66-94)||(19036263-19036291)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (66-346)||(3286672-3286952)
chr6 (66-346)||(16898772-16899052)
chr6 (66-346)||(16909425-16909705)
chr6 (66-346)||(20913108-20913388)
chr6 (66-346)||(31358387-31358667)
chr6 (66-346)||(31368117-31368397)
chr6 (65-346)||(18170699-18170982)
chr6 (66-346)||(24929989-24930269)
chr6 (65-346)||(14792428-14792709)
chr6 (66-346)||(12455879-12456162)
chr6 (66-346)||(18160887-18161171)
chr6 (99-346)||(24920986-24921233)
chr6 (74-344)||(29541274-29541545)
chr6 (66-344)||(20968670-20968951)
chr6 (66-217)||(26439784-26439935)
chr6 (66-344)||(18202375-18202656)
chr6 (66-344)||(12988812-12989092)
chr6 (66-344)||(26019361-26019643)
chr6 (66-155)||(18705278-18705367)
chr6 (66-155)||(18711213-18711302)
chr6 (264-344)||(17826680-17826760)
chr6 (66-344)||(34766186-34766463)
chr6 (66-155)||(1598176-1598266)
chr6 (66-155)||(16322341-16322430)
chr6 (66-155)||(16334489-16334578)
chr6 (239-343)||(790153-790256)
chr6 (66-155)||(24502531-24502622)
chr6 (66-155)||(7753677-7753766)
chr6 (66-155)||(30656833-30656922)
chr6 (66-162)||(789963-790058)
chr6 (239-344)||(22222611-22222715)
chr6 (239-344)||(22248446-22248550)
chr6 (239-344)||(7753852-7753957)
chr6 (66-344)||(15504264-15504543)
chr6 (239-343)||(19363898-19364001)
chr6 (66-125)||(19364120-19364178)
chr6 (239-344)||(1597987-1598092)
chr6 (65-162)||(26512461-26512558)
chr6 (65-162)||(26517577-26517674)
chr6 (239-344)||(18335742-18335845)
chr6 (249-344)||(9034244-9034337)
chr6 (264-344)||(18705478-18705558)
chr6 (264-344)||(18711413-18711493)
chr6 (239-344)||(30657008-30657113)
chr6 (77-138)||(8668400-8668463)
chr6 (264-344)||(16322150-16322230)
chr6 (264-344)||(16334298-16334378)
chr6 (66-125)||(18335964-18336021)
chr6 (242-344)||(24692639-24692737)
chr6 (239-341)||(8562431-8562532)
chr6 (217-335)||(24502686-24502802)
chr6 (291-344)||(26169243-26169296)
chr6 (82-136)||(22066839-22066894)
chr6 (82-136)||(23885241-23885296)
chr6 (66-156)||(28093645-28093735)
chr6 (239-344)||(6314617-6314720)
chr6 (239-344)||(28093451-28093554)
chr6 (98-138)||(18420981-18421022)
chr6 (291-344)||(27786687-27786740)
chr6 (108-155)||(26169600-26169648)
chr6 (108-155)||(26169789-26169837)
chr6 (108-155)||(26169978-26170026)
chr6 (108-155)||(26170167-26170215)
chr6 (108-155)||(26170356-26170404)
chr6 (108-155)||(26170545-26170593)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (66-346)||(26190978-26191258)
chr5 (66-346)||(26201560-26201840)
chr5 (65-346)||(33950546-33950827)
chr5 (66-346)||(11410064-11410344)
chr5 (66-346)||(32071266-32071545)
chr5 (66-346)||(33940146-33940426)
chr5 (66-346)||(18362103-18362383)
chr5 (66-346)||(18391060-18391340)
chr5 (64-346)||(8764318-8764600)
chr5 (66-346)||(27412974-27413254)
chr5 (65-344)||(31917640-31917921)
chr5 (66-344)||(18217747-18218028)
chr5 (66-344)||(18208409-18208690)
chr5 (66-344)||(21754363-21754644)
chr5 (66-344)||(21763650-21763931)
chr5 (66-344)||(21683015-21683295)
chr5 (119-344)||(27578356-27578584)
chr5 (66-344)||(30942437-30942717)
chr5 (66-344)||(30951859-30952139)
chr5 (66-344)||(37646479-37646759)
chr5 (66-344)||(4037127-4037407)
chr5 (66-344)||(20948680-20948962)
chr5 (66-344)||(20959049-20959331)
chr5 (66-155)||(13570826-13570916)
chr5 (66-344)||(19886836-19887116)
chr5 (66-155)||(34129636-34129726)
chr5 (66-344)||(36317275-36317555)
chr5 (239-344)||(23376088-23376192)
chr5 (65-344)||(22172397-22172680)
chr5 (66-155)||(37818618-37818709)
chr5 (66-155)||(204616-204704)
chr5 (217-336)||(27273482-27273601)
chr5 (282-344)||(20897785-20897847)
chr5 (66-162)||(22245625-22245721)
chr5 (178-332)||(42089769-42089920)
chr5 (66-344)||(37537360-37537648)
chr5 (239-344)||(37818427-37818532)
chr5 (264-344)||(19781431-19781511)
chr5 (66-121)||(19547400-19547454)
chr5 (239-336)||(13571002-13571099)
chr5 (66-154)||(37297961-37298050)
chr5 (66-162)||(20903758-20903856)
chr5 (217-344)||(34129790-34129917)
chr5 (217-344)||(37298115-37298242)
chr5 (106-155)||(20808257-20808307)
chr5 (294-336)||(20904001-20904043)
chr5 (301-344)||(204851-204894)
chr5 (301-344)||(19547633-19547676)
chr5 (82-136)||(33955000-33955055)
chr5 (77-124)||(42731942-42731989)
chr5 (82-138)||(18569490-18569548)
chr5 (82-138)||(24422741-24422799)
chr5 (98-155)||(27273360-27273418)
chr5 (289-343)||(29958797-29958851)
chr5 (82-138)||(30444461-30444519)
chr5 (77-139)||(11017583-11017645)
chr5 (77-117)||(11224019-11224059)
chr5 (100-155)||(19781613-19781668)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (66-346)||(16155709-16155989)
chr1 (66-346)||(21459454-21459734)
chr1 (66-346)||(25020294-25020574)
chr1 (66-344)||(2117683-2117963)
chr1 (65-344)||(2369375-2369655)
chr1 (66-344)||(42035042-42035324)
chr1 (65-344)||(30548576-30548858)
chr1 (66-344)||(21904280-21904561)
chr1 (99-344)||(18384172-18384420)
chr1 (66-337)||(13965881-13966159)
chr1 (66-344)||(37013180-37013460)
chr1 (66-214)||(8541157-8541307)
chr1 (66-214)||(8606396-8606546)
chr1 (66-344)||(25868174-25868455)
chr1 (66-155)||(27067099-27067189)
chr1 (66-344)||(1973636-1973918)
chr1 (66-344)||(1988423-1988705)
chr1 (66-344)||(12420237-12420516)
chr1 (65-155)||(20315450-20315541)
chr1 (66-155)||(22401516-22401605)
chr1 (65-162)||(49336773-49336868)
chr1 (66-153)||(18095873-18095960)
chr1 (66-155)||(25038347-25038436)
chr1 (66-155)||(25043559-25043648)
chr1 (68-155)||(41542784-41542871)
chr1 (66-125)||(41200881-41200940)
chr1 (66-155)||(20316644-20316733)
chr1 (63-125)||(26192206-26192267)
chr1 (66-155)||(52948651-52948739)
chr1 (264-344)||(18096072-18096152)
chr1 (282-344)||(21793580-21793642)
chr1 (217-344)||(20315259-20315386)
chr1 (264-344)||(49336577-49336657)
chr1 (66-155)||(20327122-20327215)
chr1 (66-141)||(22961937-22962011)
chr1 (66-349)||(34823791-34824076)
chr1 (239-336)||(21820591-21820686)
chr1 (66-124)||(34000917-34000975)
chr1 (217-344)||(20316797-20316924)
chr1 (66-162)||(21820404-21820498)
chr1 (65-125)||(25822286-25822345)
chr1 (217-344)||(27066908-27067035)
chr1 (69-155)||(4951438-4951525)
chr1 (69-155)||(19735520-19735606)
chr1 (218-344)||(20327280-20327406)
chr1 (264-344)||(4951258-4951338)
chr1 (264-344)||(22961732-22961812)
chr1 (264-344)||(34000694-34000773)
chr1 (217-344)||(41542935-41543062)
chr1 (233-344)||(22957285-22957394)
chr1 (268-341)||(52948855-52948928)
chr1 (66-162)||(21793777-21793872)
chr1 (264-344)||(25038549-25038629)
chr1 (264-344)||(25043761-25043841)
chr1 (301-344)||(26192278-26192321)
chr1 (77-138)||(26905593-26905656)
chr1 (288-342)||(8541091-8541145)
chr1 (288-342)||(8606330-8606384)
chr1 (301-342)||(19867790-19867831)
chr1 (233-344)||(22959172-22959282)
chr1 (82-126)||(14271598-14271642)
chr1 (82-126)||(14281316-14281360)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (65-346)||(6693044-6693325)
chr4 (65-346)||(40922669-40922950)
chr4 (66-346)||(6703450-6703730)
chr4 (66-346)||(16081235-16081515)
chr4 (66-346)||(17983826-17984107)
chr4 (66-346)||(18104376-18104657)
chr4 (66-344)||(7842812-7843093)
chr4 (63-344)||(15670908-15671192)
chr4 (65-344)||(10422611-10422892)
chr4 (65-344)||(3495724-3496006)
chr4 (66-344)||(3486402-3486683)
chr4 (66-344)||(21856706-21856987)
chr4 (66-344)||(21912569-21912850)
chr4 (65-344)||(27679527-27679809)
chr4 (66-344)||(5291863-5292144)
chr4 (66-344)||(5301522-5301803)
chr4 (66-344)||(21847114-21847395)
chr4 (66-344)||(21902977-21903258)
chr4 (66-344)||(27689183-27689464)
chr4 (68-349)||(7845695-7845978)
chr4 (66-344)||(16250274-16250555)
chr4 (66-343)||(16254065-16254344)
chr4 (66-344)||(17144558-17144839)
chr4 (66-344)||(30652495-30652775)
chr4 (66-344)||(13791987-13792268)
chr4 (66-344)||(16059199-16059478)
chr4 (66-344)||(518641-518923)
chr4 (66-349)||(14599608-14599895)
chr4 (66-344)||(17826951-17827231)
chr4 (66-344)||(17836342-17836622)
chr4 (65-344)||(13401740-13402020)
chr4 (66-344)||(6404783-6405061)
chr4 (66-344)||(521148-521429)
chr4 (64-148)||(3475041-3475123)
chr4 (66-155)||(16630552-16630642)
chr4 (66-162)||(16209915-16210011)
chr4 (66-341)||(17420255-17420532)
chr4 (66-344)||(41527127-41527406)
chr4 (66-155)||(2831005-2831094)
chr4 (217-344)||(2830814-2830941)
chr4 (217-344)||(16630361-16630488)
chr4 (272-336)||(17162426-17162490)
chr4 (66-125)||(4836989-4837048)
chr4 (63-125)||(15622066-15622130)
chr4 (264-344)||(53945265-53945345)
chr4 (99-162)||(16398273-16398336)
chr4 (239-344)||(4837128-4837233)
chr4 (66-155)||(44890038-44890127)
chr4 (239-341)||(26459251-26459352)
chr4 (98-138)||(15842494-15842535)
chr4 (264-336)||(16210127-16210198)
chr4 (77-117)||(50515990-50516030)
chr4 (301-336)||(18585698-18585733)
chr4 (82-136)||(33296718-33296773)
chr4 (82-138)||(3241978-3242036)
chr4 (82-138)||(3918493-3918551)
chr4 (98-139)||(9338146-9338188)
chr4 (282-336)||(16398085-16398139)
chr4 (82-138)||(54689606-54689664)
chr4 (82-138)||(54699039-54699097)
chr4 (66-162)||(53945054-53945150)
chr4 (82-136)||(26812949-26813005)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (66-346)||(18652044-18652324)
chr2 (66-346)||(18664162-18664442)
chr2 (66-346)||(9501633-9501913)
chr2 (66-346)||(9512999-9513279)
chr2 (66-346)||(2997570-2997850)
chr2 (65-346)||(17489516-17489800)
chr2 (66-344)||(29424181-29424461)
chr2 (66-344)||(4459206-4459487)
chr2 (66-344)||(5345584-5345865)
chr2 (66-344)||(37861986-37862265)
chr2 (65-344)||(4468831-4469112)
chr2 (66-344)||(5335732-5336013)
chr2 (66-344)||(32935657-32935938)
chr2 (66-344)||(38956720-38957001)
chr2 (66-335)||(24695456-24695727)
chr2 (66-214)||(29115227-29115375)
chr2 (105-344)||(38929418-38929659)
chr2 (66-344)||(27169221-27169503)
chr2 (237-344)||(45015541-45015647)
chr2 (66-344)||(27158874-27159155)
chr2 (65-344)||(45191665-45191945)
chr2 (66-344)||(16901090-16901371)
chr2 (66-344)||(16994481-16994762)
chr2 (66-155)||(22671481-22671571)
chr2 (66-155)||(22678620-22678710)
chr2 (66-154)||(574699-574787)
chr2 (66-344)||(22907745-22908026)
chr2 (66-166)||(41025764-41025863)
chr2 (65-155)||(3604512-3604605)
chr2 (66-155)||(32877729-32877818)
chr2 (69-154)||(12580338-12580422)
chr2 (239-344)||(69220-69324)
chr2 (66-155)||(19343336-19343424)
chr2 (239-344)||(19343144-19343248)
chr2 (248-344)||(41025962-41026056)
chr2 (239-344)||(22902968-22903072)
chr2 (217-344)||(3604670-3604797)
chr2 (65-155)||(6875855-6875944)
chr2 (264-344)||(28451155-28451235)
chr2 (239-342)||(38461328-38461430)
chr2 (66-155)||(44637523-44637616)
chr2 (239-344)||(22678796-22678901)
chr2 (68-125)||(22903192-22903248)
chr2 (77-138)||(35878018-35878081)
chr2 (77-138)||(35885507-35885570)
chr2 (77-138)||(36725220-36725283)
chr2 (289-343)||(22635021-22635075)
chr2 (239-344)||(22671657-22671761)
chr2 (289-343)||(41896423-41896477)
chr2 (304-336)||(21110051-21110083)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (66-346)||(9323990-9324269)
chr8 (66-346)||(21335124-21335404)
chr8 (66-346)||(21201789-21202069)
chr8 (66-346)||(21212205-21212485)
chr8 (66-267)||(18524435-18524636)
chr8 (66-344)||(12900260-12900541)
chr8 (66-344)||(21461933-21462214)
chr8 (66-344)||(3988340-3988621)
chr8 (66-344)||(13675588-13675869)
chr8 (66-344)||(21986701-21986982)
chr8 (66-344)||(21996235-21996516)
chr8 (66-295)||(16582830-16583062)
chr8 (66-155)||(8668963-8669053)
chr8 (66-155)||(14880637-14880727)
chr8 (66-155)||(14892987-14893077)
chr8 (66-155)||(23014006-23014095)
chr8 (66-344)||(31998194-31998474)
chr8 (248-344)||(2689419-2689514)
chr8 (66-162)||(11429421-11429516)
chr8 (66-344)||(14438252-14438533)
chr8 (239-344)||(26361468-26361572)
chr8 (264-336)||(17269568-17269640)
chr8 (83-155)||(20529841-20529913)
chr8 (264-344)||(11429622-11429702)
chr8 (217-344)||(33773234-33773361)
chr8 (239-344)||(14893163-14893268)
chr8 (98-155)||(31990636-31990694)
chr8 (98-155)||(33773113-33773171)
chr8 (242-344)||(14880816-14880918)
chr8 (218-344)||(31990759-31990885)
chr8 (66-155)||(12840412-12840501)
chr8 (217-344)||(20529977-20530104)
chr8 (65-125)||(26361282-26361349)
chr8 (66-130)||(6760700-6760762)
chr8 (77-138)||(12768296-12768359)
chr8 (77-138)||(42711804-42711867)
chr8 (301-344)||(12840644-12840687)
chr8 (271-343)||(45489542-45489615)
chr8 (271-343)||(45498500-45498573)
chr8 (264-344)||(18537479-18537558)
chr8 (77-138)||(20047806-20047868)
chr8 (96-139)||(26193551-26193595)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (66-346)||(18325-18605)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (66-346)||(308983-309262)
scaffold0005 (66-349)||(217483-217770)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (66-346)||(6803-7085)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (66-313)||(14892-15139)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (66-344)||(8939-9220)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (66-344)||(91837-92118)
[»] scaffold0591 (2 HSPs)
scaffold0591 (66-344)||(42-323)
scaffold0591 (239-344)||(1778-1882)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (66-344)||(30615-30895)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (66-344)||(189-468)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (66-336)||(916-1189)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (66-344)||(73686-73967)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (102-344)||(1-246)
[»] scaffold0873 (1 HSPs)
scaffold0873 (65-249)||(4756-4943)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (66-344)||(8965-9246)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (101-207)||(6442-6551)
scaffold0168 (65-94)||(6572-6601)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (66-344)||(19796-20078)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (66-344)||(6598-6875)
scaffold0313 (66-344)||(10380-10657)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (66-155)||(140-230)
[»] scaffold0811 (2 HSPs)
scaffold0811 (66-167)||(2327-2429)
scaffold0811 (285-344)||(2486-2545)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (239-344)||(6145-6248)
scaffold0121 (66-142)||(5957-6031)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (66-344)||(394819-395099)
[»] scaffold0058 (5 HSPs)
scaffold0058 (66-155)||(27973-28062)
scaffold0058 (66-155)||(58669-58759)
scaffold0058 (66-148)||(49178-49260)
scaffold0058 (218-333)||(49331-49446)
scaffold0058 (239-341)||(28148-28250)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (66-153)||(8443-8528)
scaffold0034 (264-349)||(8245-8330)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (239-344)||(16273-16377)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (66-125)||(12-71)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (181-336)||(27852-28007)
scaffold0142 (68-121)||(27738-27789)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (66-155)||(19791-19881)
scaffold0141 (264-344)||(19599-19679)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (66-155)||(20013-20103)
scaffold0234 (264-344)||(20213-20294)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (66-167)||(39527-39628)
scaffold0059 (239-344)||(39704-39808)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (66-155)||(110728-110817)
scaffold0031 (239-344)||(110903-111008)
[»] scaffold0265 (2 HSPs)
scaffold0265 (239-336)||(12123-12218)
scaffold0265 (66-162)||(12311-12405)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (233-344)||(196521-196630)
scaffold0015 (233-336)||(189913-190015)
[»] scaffold0018 (4 HSPs)
scaffold0018 (247-343)||(55468-55562)
scaffold0018 (247-343)||(59417-59511)
scaffold0018 (247-343)||(60845-60939)
scaffold0018 (66-162)||(61031-61127)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (266-344)||(1-80)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (66-125)||(1319-1377)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (301-344)||(55041-55084)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (82-138)||(22-79)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (66-118)||(13897-13948)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (82-136)||(1260-1315)
[»] scaffold0916 (1 HSPs)
scaffold0916 (73-151)||(100-176)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (82-138)||(94110-94168)
scaffold0028 (82-138)||(103553-103611)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (271-343)||(5007-5080)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (66-94)||(5-33)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (66-94)||(65487-65515)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (81-138)||(124601-124660)
scaffold0021 (289-349)||(163886-163946)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (62-113)||(267036-267085)


Alignment Details
Target: scaffold0014 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Original strand, 232950 - 233231
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  232950 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 233049  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  233050 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 233149  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  233150 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 233231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 147814 - 147535
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  147814 tgaagtggataaaatagtcacaaggaag-ag-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtaattctcaagttgtttacttgga 147717  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  147716 atagttaagttaactttctgactttagaacgttctgaagtttataaacaaaaactgtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 147618  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  147617 ttaaagagtatagagaagaaagaaagagcacacaaagaattatagtggttcatccaatgtcggttagtccactcctcacaatc 147535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46508833 - 46508552
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46508833 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 46508734  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46508733 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 46508634  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46508633 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 46508552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 46498220 - 46497940
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46498220 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 46498121  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498120 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 46498021  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498020 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 46497940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 11625320 - 11625600
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11625320 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 11625419  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11625420 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtagataaa 11625519  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11625520 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 11625600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32109924 - 32109643
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32109924 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgactctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 32109825  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32109824 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 32109725  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32109724 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 32109643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8502155 - 8501875
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8502155 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 8502056  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502055 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 8501956  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8501955 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 8501875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8512625 - 8512345
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8512625 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 8512526  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512525 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 8512426  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512425 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 8512345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 16130870 - 16131150
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16130870 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 16130969  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16130970 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtgagtgtgtgttgtgtatactgtagataaa 16131069  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16131070 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 16131150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32099486 - 32099206
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32099486 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgactctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 32099387  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099386 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 32099287  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099286 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 32099206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 5390406 - 5390686
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5390406 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 5390505  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390506 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 5390605  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390606 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 5390686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6535590 - 6535310
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6535590 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattgtcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 6535491  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535490 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 6535391  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535390 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 6535310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6545911 - 6545631
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6545911 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattgtcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 6545812  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6545811 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 6545712  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6545711 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 6545631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 16141419 - 16141699
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16141419 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 16141518  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16141519 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacagaattgtttaataaagtataagtgtgagtgtgtgttgtgtatactgtagataaa 16141618  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141619 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 16141699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44898405 - 44898124
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg-tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44898405 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgg 44898306  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44898305 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 44898206  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44898205 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 44898124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44908830 - 44908549
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg-tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  44908830 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgg 44908731  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44908730 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 44908631  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44908630 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 44908549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 5380769 - 5381048
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5380769 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 5380867  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5380868 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 5380967  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5380968 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 5381048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5928241 - 5927961
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5928241 tgaagttgataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctaaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 5928142  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5928141 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 5928042  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5928041 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 5927961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26304662 - 26304381
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg-tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26304662 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagtagtttacttgg 26304563  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26304562 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 26304463  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26304462 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 26304381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26308222 - 26307941
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg-tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26308222 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagtagtttacttgg 26308123  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26308122 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 26308023  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26308022 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 26307941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 26362156 - 26362437
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg-tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26362156 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagtagtttacttgg 26362255  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26362256 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 26362355  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26362356 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 26362437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13130947 - 13130665
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  13130947 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggatttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgg 13130848  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13130847 aatagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-a 13130749  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13130748 attaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 13130665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43984769 - 43984488
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  43984769 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 43984670  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43984669 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 43984571  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43984570 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 43984488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27990203 - 27989922
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  27990203 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 27990104  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27990103 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacacaaatagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 27990005  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  27990004 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgcgttagtccactcctcacaatc 27989922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14947220 - 14946939
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  14947220 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggagtttgaattgtggcccttaaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 14947121  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  14947120 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaatagtttaataaagtaagtgtgcaagtgtgtgttgtgtataatgt-aa 14947022  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14947021 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 14946939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15374814 - 15374533
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  15374814 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggagtttgaattgtggcccttaaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 15374715  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  15374714 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaatagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtataatgt-aa 15374616  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15374615 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 15374533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42622200 - 42621920
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt-- 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  42622200 atgaagtagataaaatagtcacaaggaa--aggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttactttt 42622103  T
Q  163 -agaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
     | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  42622102 aatagttaagttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcttacacataaacagtttaataaagttaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatactat-a 42622004  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  42622003 attaaagagtatagagaagaaggaaataacacatatagaattatagtggttcacccaacgtgtgctagtccactcctcacaatc 42621920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 9534192 - 9534472
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  9534192 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaaatgattctcaagctgtctacttgga 9534290  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgt-ttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||   | ||||||| |||   ||| |||||||||||||||  ||| | ||    
T  9534291 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatatgcaaaaacatattaataaggtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtgaactat-aa 9534389  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | || |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9534390 ttaacgagtatagagaagaagaaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 9534472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 9544475 - 9544755
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  9544475 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaaatgattctcaagctgtctacttgga 9544573  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||  | ||||||| |||   ||| |||||||||||||||  ||| | ||    
T  9544574 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatatgcagaaacagattaataaggtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtgaactat-aa 9544672  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | || |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  9544673 ttaacgagtatagagaagaagaaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaatc 9544755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 7018361 - 7018461
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  7018361 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 7018459  T
Q  166 at 167  Q
    ||    
T  7018460 at 7018461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 7033719 - 7033819
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  7033719 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 7033817  T
Q  166 at 167  Q
    ||    
T  7033818 at 7033819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 24539417 - 24539698
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  24539417 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 24539515  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tca-taaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | | || | ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||    
T  24539516 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattacaaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagta 24539613  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | | ||| ||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24539614 agt-aaatagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 24539698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31825827 - 31825548
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| ||    
T  31825827 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaattaatcctgtcacttaaaagttattctcaagttgataacttgga 31825729  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| | |  |  ||||   |||||  || ||   ||||  ||||||||||||| ||||||||     
T  31825728 atggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactgtaag 31825629  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31825628 t-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaat 31825548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9008054 - 9007773
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcct-gaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9008054 tgaagtagataaaatactcacaaggaagggg-ggtctgaattgtgaccctttaaaaattaaacttgtaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 9007956  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| ||||      ||||||||||| ||| ||||||   ||  | ||||| | | ||  || ||   ||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  9007955 aatagttaagttagtggaatgacttcagaacgttatgaagtatttatgcaaaaatagctcaaataaataaatgtgtttgtgtgtgtagtgtatattgtaa 9007856  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || ||||||||||| ||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9007855 at-aaagagtatagggaagagaagaataacacacaaagatttatagtggttcatccaatgtgggccagtccactcctcacaatc 9007773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 343
Target Start/End: Original strand, 2990838 - 2991121
Alignment:
Q  64 catgaagtagataaaatagtcacaaggaa-ggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaa-ttatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttact 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2990838 catgaagtagaaaaaatagtcacaagaaaaggag-ggtttgaattgcgaccctttaaaaaattaacctataacttaaaattaattctcaagttgtttact 2990936  T
Q  162 tagaat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    | ||||   || |||||     | |||||| || |||||||||||| ||  || ||| ||||||| ||| ||   ||||   ||||||  || |||||||    
T  2990937 tggaatagttaagttaatgaaattacttcataacgttctgaagttcttatgcataaactgtttaagaaaataaatgtgtttctgtgtggagtatatactg 2991036  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
     |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  2991037 -aaattaatgagtatagggaagagagaaagaacacactaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaat 2991121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 15987794 - 15987898
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15987794 gtgtgtgtaatgtatactgaaaataaa-gagtatagggaagagaggaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgagctagtccactcctc 15987892  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  15987893 acaatc 15987898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 13284658 - 13284748
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  13284658 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttg 13284748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 45554666 - 45554577
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagtt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45554666 tgaagtagataaaatagtcacaaggaatggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagtt 45554577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 5614405 - 5614686
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||   |||||||||||| | |||| |    
T  5614405 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgccacttaaaaggtattctcaagttgataacttgg 5614503  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| | |  |  ||||   |||||  || ||   ||||  ||||||||||||| || ||||     
T  5614504 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttattgtag 5614603  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5614604 gt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 5614686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Original strand, 14247650 - 14247735
Alignment:
Q  259 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14247650 aaattaaagagtgtagaaaagagagaaggaacacacaaatatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 14247735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19801208 - 19801119
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  19801208 tgaagtagataaaacagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctataacttaaaattgattctcaagttg 19801119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19586855 - 19586766
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaa-ttatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  19586855 tgaagtggataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaactaaacctataacttaaaattgattctcaagttg 19586766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42596493 - 42596403
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  42596493 tgaagtagataaaatagtcacaaggaatggggggtttcaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtcacttaaaagttattctcaagttg 42596403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8341313 - 8341225
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||||    
T  8341313 atgaagtagataaaatagtcacaaggaggg---gggttgaattgtgaccctttaaaaattattcagtaacttaaaaagtaattctcaagttg 8341225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 154
Target Start/End: Original strand, 15987617 - 15987705
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagtt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||  ||||||||||||    
T  15987617 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgacactttaaaaattaaacatgtaacttaaaatagattctcaagtt 15987705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12088234 - 12088154
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12088234 aaagagtaaagagaagataagaagaacacacaaaaatttatagcggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 12088154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19801055 - 19800928
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  19801055 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaag-gagtatagggaagaaagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccc 19800957  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19800956 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 19800928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12088440 - 12088382
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12088440 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggga-gtttgaattgtgacccttaaaaaatta 12088382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 344
Target Start/End: Original strand, 7018580 - 7018638
Alignment:
Q  286 agaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7018580 agaacacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 7018638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 344
Target Start/End: Original strand, 7033942 - 7034000
Alignment:
Q  286 agaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7033942 agaacacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 7034000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 12826329 - 12826611
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||  |||||||| | ||||||||||||   ||||||    
T  12826329 tgaagtagataaaatagtcataaggaatggggggtttgaattgtgaccccttaaaaattaaacatgtcacttaaaagttattctcaagttgaaaacttag 12826428  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| | |  |  ||||   |||||  || ||   ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12826429 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactgtaa 12826528  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | |||||||| ||| || | |  ||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  12826529 gt-aaagagtaaagataaaagaagaagaacacatagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatc 12826611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Original strand, 14247129 - 14247197
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaact 135  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14247129 tgaagtagataaaatagtcataagggagg-gaggattgaattgtgaccctttaaaaattaacctgtaact 14247197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41028532 - 41028428
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||  | || |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41028532 gtgtgtgttgtgtttaatgtaagtaaat-attaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctc 41028434  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  41028433 acaatc 41028428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12771014 - 12770911
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| |  ||| |||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |    
T  12771014 gtgtgtatggtgtatactgaaaataaaaaaaaataaagagaagagaaagaacaca--aagagttatagtggttcacccgacatgggctagtccactcctc 12770917  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  12770916 acaatc 12770911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12771195 - 12771124
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaa 139  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  12771195 tgaagtaaataatatagtcacaaggaagggg--gtttgaattgtgaccctttaaaaattaatctgcaacttaaa 12771124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 13284836 - 13284940
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||  |||| |||||||| |  ||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  13284836 gtgtgtgttgtatttactgtaagtaaat-agtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttataatggttcccccaatgtgggttagtccactcctc 13284934  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  13284935 acaatc 13284940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41028707 - 41028651
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41028707 tgaagtagataaagtagtcccaaggaagg---ggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 41028651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8341114 - 8341042
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  8341114 aaagagtatagggaagagagaatcaacacacaaatatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcc 8341042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19586680 - 19586578
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  19586680 gtgtgtgttgtatatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcct 19586582  T
Q  338 caca 341  Q
    ||||    
T  19586581 caca 19586578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12516169 - 12516099
Alignment:
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12516169 agagtatagggaagagagaataaacacacacagatttatagtggttcccccaatgtgggttactccactcc 12516099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42596315 - 42596214
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |    
T  42596315 gtgtgtgttgtgtttgctgtaagtaaat-agtaaagagaagagaagaagaacacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggtcagtctactcctc 42596217  T
Q  339 aca 341  Q
    |||    
T  42596216 aca 42596214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28344885 - 28344809
Alignment:
Q  64 catgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||  ||||||||||||||    
T  28344885 catgaagtggaagaaatagtcacaagaaaggaggggtttgaattgtgaccatttttaaatttaatcctgaaacttaa 28344809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10610787 - 10610732
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10610787 tgaagtaaataaaatagtcacaaagaagggg-gatttgaattgtgaccctttaaaaa 10610732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 280
Target Start/End: Original strand, 7018508 - 7018554
Alignment:
Q  233 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaaga 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  7018508 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aattaaagagtatagggaaga 7018554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 280
Target Start/End: Original strand, 7033866 - 7033912
Alignment:
Q  233 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaaga 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  7033866 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aattaaagagtatagggaaga 7033912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10416855 - 10416812
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10416855 ttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 10416812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 14634356 - 14634411
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14634356 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaactt 14634411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 14644044 - 14644099
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14644044 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaactt 14644099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7593484 - 7593426
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7593484 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 7593426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 126
Target Start/End: Original strand, 11605261 - 11605322
Alignment:
Q  64 catgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||    
T  11605261 catgaagtagatataatagtcacaa-gaaggagaagactgaattgtgacccttttataattat 11605322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12492364 - 12492294
Alignment:
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||    
T  12492364 agagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcctccaatgtgggttactccactcc 12492294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12575268 - 12575207
Alignment:
Q  101 ttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  12575268 ttgaattgtgatcctttaaaaattaatctgcagcttaaaattaattctcaagtggtttactt 12575207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15175031 - 15174990
Alignment:
Q  98 ggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15175031 ggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaacttaa 15174990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 15946932 - 15946976
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat 126  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15946932 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattat 15946976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 33291754 - 33291810
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33291754 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaactt 33291810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45554512 - 45554385
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||| | |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||  ||| || |||||||||| ||    
T  45554512 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtgtgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcccc 45554414  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  45554413 caatgtaggttagtccactcctcacaatc 45554385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8984508 - 8984227
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8984508 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 8984409  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8984408 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 8984309  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8984308 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 8984227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8973952 - 8973672
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8973952 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 8973853  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8973852 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 8973753  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8973752 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 8973672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Original strand, 1684209 - 1684490
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1684209 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 1684308  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1684309 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttactaaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 1684408  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1684409 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 1684490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 682768 - 683048
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  682768 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 682867  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  682868 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 682967  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  682968 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 683048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6423413 - 6423133
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6423413 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattattctgaaacttaaaattgattctcaagttgtttacttgga 6423314  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423313 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 6423214  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423213 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 6423133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9538241 - 9537961
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9538241 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 9538142  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538141 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagtttataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 9538042  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538041 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 9537961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9548567 - 9548287
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9548567 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 9548468  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548467 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagtttataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 9548368  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548367 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 9548287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Original strand, 16334374 - 16334655
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16334374 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 16334473  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16334474 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaggtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 16334573  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16334574 gagagtatagagaagaaggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 16334655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 5654582 - 5654865
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg---tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5654582 tgaagttgataaaatagtcacaaggaaggggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 5654681  T
Q  163 agaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaat 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5654682 ggaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaggtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaat 5654781  T
Q  263 aaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5654782 aaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 5654865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6433840 - 6433560
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  6433840 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattattctgaaacttaaaattgattctcaagttgtttacttgaa 6433741  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6433740 attatgttaactttctgacttcaaaatgttatgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 6433641  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6433640 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtaggctagtccactccccacaatcct 6433560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 66 - 312
Target Start/End: Original strand, 16697765 - 16698011
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16697765 tgaagttgataaaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 16697864  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16697865 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 16697964  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16697965 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttc 16698011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Original strand, 12794400 - 12794583
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12794400 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 12794499  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12794500 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgt 12794583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4372649 - 4372368
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  4372649 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 4372550  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4372549 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 4372451  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4372450 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 4372368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4382390 - 4382109
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  4382390 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 4382291  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4382290 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 4382192  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4382191 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 4382109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 10944 - 11224
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  10944 tgaagtagataaaatagtcataaggaat-aggggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 11042  T
Q  166 at---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattg-tttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||     
T  11043 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaacaatttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatactataat 11142  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11143 taaaa-agtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 11224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 10002381 - 10002662
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  10002381 tgaagtagataaaatagtcacaatgaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagctgtctgcttgga 10002480  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||  | |||||||||||   ||| |||||||||||||||  ||| | ||    
T  10002481 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatatgcagaaacagattaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtgaactat-aa 10002579  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10002580 ttaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 10002662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25434217 - 25433938
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  25434217 tgaagtagataaaatggtcacagggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaactcaaag-tgattctcaagttgtttacttgga 25434120  T
Q  166 at---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    ||   || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||      
T  25434119 atagttaagttaactttctgtcttcagaacattctgaagttcataaacaaaaactgtttaataaggtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatactgtagt 25434020  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25434019 taaa-gagtatagagaagaaggaaagagcacacagagaattaaagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 25433938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20493131 - 20492859
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |    
T  20493131 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg--gtttgaattgtgaccctttataaattatactgaaacttaaaagtgattctcaagatgtctacttgg 20493034  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |    
T  20493033 aatagttaagttaatattctgacttcagaatgttctaaagttcatacacaaaaacagtttaataaa--------gtaagtgtgtgttgtgtatactgt-a 20492943  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20492942 attaaagagtataggaaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 20492859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 337
Target Start/End: Original strand, 4023079 - 4023357
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaact-----taaaaatgattctcaagttgtttac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     ||||| | |||||||||| ||||||    
T  4023079 tgaagtagataaaatagtcacaagaaagagggggtttgaattgtgaccctttaaaa-ttatcctgaaattaactttaaaagtaattctcaagtagtttac 4023177  T
Q  161 ttagaat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatact 256  Q
    || ||||   || |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  4023178 ttggaatagttaagttaatattctgacttcagaacgttatgaagttcatacacaaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatact 4023277  T
Q  257 gtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
     ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4023278 ataattaaa-gagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcagccaatgtgggttagtccactccc 4023357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Original strand, 10506823 - 10507091
Alignment:
Q  70 gtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat-- 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||      
T  10506823 gtagataaaatagtcacaaggaagggg-gacttgaattgtgaccctttaaaaatta--------cttaaaattaattctcaagttgtttacttggaatgt 10506913  T
Q  168 -tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaa-ttgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
     || |||||     ||||||||||| ||||| | |||| ||  ||||| ||| || ||||| ||   ||||  |||||||| |||||||||| |||| ||    
T  10506914 ttaagttaatgaaatgacttcagaacgttctaatgttcttatgcaaaaattgcttgataaaataaatgtgtttgtgtgtgtggtgtatactg-aaattaa 10507012  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10507013 agagtataagaaagagagaaagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 10507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 344
Target Start/End: Original strand, 10507637 - 10507905
Alignment:
Q  70 gtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat-- 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||      
T  10507637 gtagataaaatagtcacaaggaagggg-gacttgaattgtgaccctttaaaaatta--------cttaaaattaattctcaagttgtttacttggaatgt 10507727  T
Q  168 -tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaa-ttgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
     || |||||     ||||||||||| ||||| | |||| ||  ||||| ||| || ||||| ||   ||||  |||||||| |||||||||| |||| ||    
T  10507728 ttaagttaatgaaatgacttcagaacgttctaatgttcttatgcaaaaattgcttgataaaataaatgtgtttgtgtgtgtggtgtatactg-aaattaa 10507826  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10507827 agagtataagaaagagagaaagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 10507905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 24872177 - 24872458
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  24872177 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggga-gtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 24872275  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  24872276 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 24872372  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| ||| |||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24872373 taagt-aaatagtaaagaaaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 24872458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 2487829 - 2488108
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  2487829 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 2487926  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||| |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  2487927 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaatagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 2488024  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2488025 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 2488108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Original strand, 4781401 - 4781491
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4781401 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 4781491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 13118400 - 13118489
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13118400 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 13118489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 14801383 - 14801472
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  14801383 tgaagtagataaaatagtcacaagaaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 14801472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 344
Target Start/End: Original strand, 38817110 - 38817197
Alignment:
Q  255 ctgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  38817110 ctgtaagtaaaagagtaaagagaaga--gaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggttagtccacttctcacaatc 38817197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 49386333 - 49386614
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  49386333 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaaggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtcacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 49386431  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| | |  |  ||||   |||||  || ||   ||||  ||||||||||||| |||||||     
T  49386432 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactgtag 49386531  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  49386532 gt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 49386614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16127591 - 16127496
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  16127591 tgaagtaaataaaatagtcacaaggaatgaggagtttgaattgtgaccctttaaaaattaacttgcaactt-aaaataattctcaagtggtttactt 16127496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Original strand, 20743661 - 20743720
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20743661 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 20743720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20294141 - 20294071
Alignment:
Q  69 agtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20294141 agtagataaaatagtcacaaggaagggg--gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgtaacttcaaaa 20294071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Original strand, 38816904 - 38817000
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  38816904 tgaagtagataaaatagtcacaaggaattgggggtttgaattgtgacccttcaaaaattaatctgcaacttaaaattagttctcaagtggtttactt 38817000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20293954 - 20293874
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20293954 aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 20293874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24773873 - 24773785
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  24773873 tgaagtagataaaatagttacaaagaaggggtg-tttgaattgtgacccttt-aaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 24773785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 51977616 - 51977721
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  51977616 gtgtgtgttgtgtatgcagtaaataaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagttcactcct 51977714  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  51977715 cacaatc 51977721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 19827177 - 19827275
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg--------tttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||        ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19827177 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 19827275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24814765 - 24814661
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |  |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  24814765 gtgtgtgtggtgtttactgtaagtaaa-gagtaaagagaagagaagaagaacacacatgaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactc 24814667  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  24814666 acaatc 24814661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 4781555 - 4781682
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||  ||| || |||||||||| ||    
T  4781555 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcccc 4781653  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4781654 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 4781682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12387142 - 12387062
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  12387142 aaagagtatagggaagagagaataaaaacacagagatttatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatc 12387062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24773673 - 24773593
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||  |||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24773673 aaagagtataggaaagagagaatcaacacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 24773593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11460071 - 11459962
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||||||||  |||  ||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |    
T  11460071 gtgtgtgtagtgtatacttgaaaataaagagtataaggaagagaagaagaacacacaaagt-ttatagtggttcacccattgtgggttagtccacttctc 11459973  T
Q  339 acaatcctatg 349  Q
    |||||| ||||    
T  11459972 acaatcttatg 11459962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 19827361 - 19827466
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  19827361 gtgtgtgttgtgtatgcaataattaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccactcct 19827459  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  19827460 cacaatc 19827466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24814942 - 24814853
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  24814942 tgaagtaaataaaatagtcataaggaaaggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtcacttaaaagttattctcaagttg 24814853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 51977441 - 51977530
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  51977441 tgaagttgataaaatagtcacaaagaaaggg-ggtttgaattgtgactctttaaaaattaaatctgtaacttaaaattgattctcaagttg 51977530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 344
Target Start/End: Original strand, 23503056 - 23503101
Alignment:
Q  299 agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23503056 agttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 23503101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 20743817 - 20743944
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| | ||  |||||||| | | || |||||||||| ||    
T  20743817 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagaaaatcaacacacagacaatttatagtggttcccc 20743915  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20743916 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 20743944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 13118553 - 13118677
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcaccc 316  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||| |  || | ||||||||||||||||    
T  13118553 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatag-gaagagagaatcaacatagcaa-atttatagtggttcaccc 13118649  T
Q  317 aatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13118650 aatgtgggttagtccactcctcacaatc 13118677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20280699 - 20280641
Alignment:
Q  101 ttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgttta 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20280699 ttgaattgtaaccctttaaaaattatcatgcaacttaaaattaattctcacgttgttta 20280641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11460933 - 11460846
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttt-aaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagtt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  11460933 tgaagtagataaaatagtcacaagaaatg-ggggtttaaattgtgaccatttaaaaaattaacctgtaa-ttaaaattgattctcaagtt 11460846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Original strand, 13327801 - 13327864
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  13327801 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 13327864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 14801581 - 14801661
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||  | | | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14801581 aaagagtatagggaagagagaatcaacacacggaaattaatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 14801661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23487788 - 23487725
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  23487788 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 23487725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 121
Target Start/End: Original strand, 23502828 - 23502883
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaa 121  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  23502828 tgaagtagatataatagttacaaggaaggaggagatttaattgtgaccctttaaaa 23502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 24794253 - 24794311
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24794253 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 24794311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 28351415 - 28351473
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28351415 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 28351473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 28375160 - 28375218
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28375160 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 28375218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 28382982 - 28383040
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28382982 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 28383040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 162
Target Start/End: Original strand, 12388393 - 12388454
Alignment:
Q  101 ttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||| |||| ||||||||    
T  12388393 ttgaattttgaccctttaaaaattaacctgcaacttaaaattagttctgaagtggtttactt 12388454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Original strand, 11043658 - 11043717
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11043658 atgaagtagatataatagtcacaa-gaaaaaggggtttgaattgggacccttttaaaatta 11043717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 349
Target Start/End: Original strand, 11043902 - 11043950
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctatg 349  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  11043902 ttataatggttcacccaatatgggctaatccactcctcacaatcttatg 11043950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 13430476 - 13430567
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || |  ||||||| |||||||||||||    
T  13430476 tgaagtagatataataatcataaggaagaggtggtttgaattgtgaccattttaaaatttaatcttgtattttaaaaacgattctcaagttg 13430567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16127405 - 16127338
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagt 307  Q
    |||||| | |||||||||| || |||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  16127405 gtgtgtatagtgtatactgcaattaaaagagtaaagggaagagagaga-aacacacaaagagttatagt 16127338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17735022 - 17734994
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17735022 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 17734994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19036291 - 19036263
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036291 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 19036263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3286952 - 3286672
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3286952 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 3286853  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3286852 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 3286753  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3286752 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 3286672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16899052 - 16898772
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16899052 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 16898953  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898952 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 16898853  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898852 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 16898772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16909705 - 16909425
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16909705 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 16909606  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16909605 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 16909506  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16909505 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 16909425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20913388 - 20913108
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20913388 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 20913289  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913288 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 20913189  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913188 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 20913108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31358667 - 31358387
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31358667 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 31358568  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358567 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 31358468  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358467 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 31358387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31368397 - 31368117
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31368397 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 31368298  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31368297 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 31368198  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31368197 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 31368117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18170982 - 18170699
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg--tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170982 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 18170883  T
Q  163 agaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaat 262  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18170882 ggaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtagat 18170783  T
Q  263 aaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170782 aaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18170699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 24929989 - 24930269
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24929989 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccttttaaaaattatcctgaaacttaaaattgattctcaagttgtttacttgga 24930088  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930089 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 24930188  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930189 agagtatagagaggaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 24930269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14792709 - 14792428
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14792709 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggagtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 14792610  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14792609 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctcaagttcataaacaaaattgtttactaaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 14792510  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14792509 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggatagtccactccccacaatcct 14792428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12456162 - 12455879
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg---tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12456162 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttactt 12456063  T
Q  163 agaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaat 262  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12456062 ggaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaat 12455963  T
Q  263 aaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12455962 aaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 12455879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18161171 - 18160887
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg----tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttact 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161171 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttact 18161072  T
Q  162 tagaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18161071 tggaattatgttaactttctgactttagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaga 18160972  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18160971 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18160887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 99 - 346
Target Start/End: Original strand, 24920986 - 24921233
Alignment:
Q  99 gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaattatgttaactttctgacttcagaatgttctg 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24920986 gtttgaattgtgaccttttaaaaattatcctgaaacttaaaattgattctcaagttgtttacttgaaattatgttaactttctgacttcagaatgttctg 24921085  T
Q  199 aagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24921086 aagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaggaaagaaagaacacacaaag 24921185  T
Q  299 agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24921186 agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 24921233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 74 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29541545 - 29541274
Alignment:
Q  74 ataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat---tat 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |   ||     
T  29541545 ataaaatagtcacaaggaagggg--gtttgaattgttactctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttatattggttaa 29541448  T
Q  171 gttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagag 269  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29541447 attaactttctgacttcagaacgttctgaagttcataaacaaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatactgtaattaaa-gag 29541349  T
Q  270 tatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29541348 tatagagaagaaggaaagaacacatagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 29541274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20968951 - 20968670
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  20968951 tgaagtagataaaatagtcataaggaatggggggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 20968852  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| | | ||    
T  20968851 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatattat-aa 20968753  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20968752 ttaaagagtatagagaagaaggaaagaatacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 20968670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26439935 - 26439784
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26439935 tgaagtatataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 26439836  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26439835 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattg 26439784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18202656 - 18202375
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  18202656 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaatttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 18202557  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  | |||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18202556 atagttaagttaatatcctgacttcagaacgttctaaagttaatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 18202458  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18202457 ttaaagagtataggtaagagagaataaacacacagagaattatagtggtttccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 18202375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 12988812 - 12989092
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  12988812 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtgacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 12988910  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||||||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  12988911 aatggttaagttaa--aacagacttcagaatgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 12989008  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12989009 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 12989092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 26019361 - 26019643
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  26019361 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 26019459  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  26019460 aatggttaagttaaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 26019559  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagag-ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26019560 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagagtttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 26019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 18705278 - 18705367
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  18705278 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 18705367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 18711213 - 18711302
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  18711213 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 18711302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17826760 - 17826680
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17826760 aaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 17826680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34766463 - 34766186
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  34766463 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 34766364  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   |  ||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  34766363 aatggttaagttaacagacaaacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 34766267  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||     ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34766266 taagt-aaatagtaaagagaag-----aagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 34766186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1598266 - 1598176
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1598266 tgaagtagataaaatagtcagaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 1598176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16322430 - 16322341
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  16322430 tgaagtaaataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 16322341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16334578 - 16334489
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  16334578 tgaagtaaataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 16334489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 239 - 343
Target Start/End: Original strand, 790153 - 790256
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  790153 gtgtgtgtggtgtatactg-aaattaaagagtatagggaagagagaaaggacacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctc 790251  T
Q  339 acaat 343  Q
    |||||    
T  790252 acaat 790256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 24502531 - 24502622
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaa--ttatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24502531 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 24502622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 7753677 - 7753766
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7753677 tgaagtagataaaatagtcacaaggaatggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 7753766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 30656833 - 30656922
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  30656833 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggga-gtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacttgtaacttaaaattgattctcaagttg 30656922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Original strand, 789963 - 790058
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||  | |||||||||| ||||||||    
T  789963 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgatcctttaaaaattaacctgcaatttaaagttaattctcaagtagtttactt 790058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 22222611 - 22222715
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  22222611 gtgtgtgtagtgtatactgaaaataaa-gagtatagggaagagaagaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctc 22222709  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  22222710 acaatc 22222715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 22248446 - 22248550
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  22248446 gtgtgtgtagtgtatactgaaaataaa-gagtatagggaagagaagaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctc 22248544  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  22248545 acaatc 22248550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 7753852 - 7753957
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaa-agagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7753852 gtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacaacaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcct 7753950  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  7753951 cacaatc 7753957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15504543 - 15504264
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||   | ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||    
T  15504543 tgaagtagataaaatagtcacaaggagggggtggg--ggattctaaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaattaattctcaagttgtttacctgga 15504446  T
Q  166 attatgttaactttctga-----cttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    ||   ||||| ||  |||     |||||||| ||| |||||||| ||  || ||| |  |||||||| ||   ||||  |||||||| ||| |||||| |    
T  15504445 atg--gttaagttagtgaaatcacttcagaacgttatgaagttcttatgcagaaactacttaataaaataaatgtgtttgtgtgtgtagtgcatactg-a 15504349  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| |||||||| |   |||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15504348 aattaaagagtacatgcaagagagaaggaacacacaaagatttatagaggttcacctaatatgggctagtccacttcccacaatc 15504264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19364001 - 19363898
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |    
T  19364001 gtgtgtgttgtgtttactgaaagtaaa-gagtatagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccacttctc 19363903  T
Q  339 acaat 343  Q
    |||||    
T  19363902 acaat 19363898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19364178 - 19364120
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19364178 tgaagtagataaaatagtcataaggaaggggag-tttgaattgtgaccctttaaaaatta 19364120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1598092 - 1597987
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1598092 gtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacaccgagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcct 1597994  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  1597993 cacaatc 1597987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26512558 - 26512461
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagga-gaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| || |||||    
T  26512558 atgaagtaaataaaatagtcacaaggagggaggggggttgaattgtgacccttt-aaaattaacctgaagcttaaaattaattctcaagtggtctactt 26512461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26517674 - 26517577
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagga-gaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| || |||||    
T  26517674 atgaagtaaataaaatagtcacaaggagggaggggggttgaattgtgacccttt-aaaattaacctgaagcttaaaattaattctcaagtggtctactt 26517577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18335845 - 18335742
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||| | | |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  18335845 gtgtgtgttgtgtttattgtaagtaaa-gagta-agagaagagaaaaagaacacacagaaatttatagaggttcaaccaatgtgggttagtccactcctc 18335748  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  18335747 acaatc 18335742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9034337 - 9034244
Alignment:
Q  249 tgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| |  |||||||||| || |||||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  9034337 tgtatactgaatttaaaagagtaaagggaaga--gaaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgagttagtccactccacacaatc 9034244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 18705478 - 18705558
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18705478 aaagagtatagggaagagagaataaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 18705558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 18711413 - 18711493
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18711413 aaagagtatagggaagagagaataaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 18711493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 30657008 - 30657113
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||     
T  30657008 gtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcct 30657106  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  30657107 cacaatc 30657113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Original strand, 8668400 - 8668463
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  8668400 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaatttaatcctgaaacttaa 8668463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16322230 - 16322150
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16322230 aaagagtataaggaagagagaataaacacacagagatttatggtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 16322150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16334378 - 16334298
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16334378 aaagagtataaggaagagagaataaacacacagagatttatggtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 16334298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18336021 - 18335964
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18336021 tgaagtagaaaaaatagtcacaaggaatgag--gtttgaattgtgatcctttaaaaatta 18335964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24692737 - 24692639
Alignment:
Q  242 tgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccaca 341  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||| |   |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24692737 tgtgttgtgtttaccgtaagtaaa-gagtaaagagaagaga---agaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcaactcctcaca 24692642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Original strand, 8562431 - 8562532
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||  |||| |||||||| |  ||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  8562431 gtgtgtgttgtgtttattgtaagtaaat-agtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatattggttcccccaatgtgggttagtccactcctc 8562529  T
Q  339 aca 341  Q
    |||    
T  8562530 aca 8562532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 335
Target Start/End: Original strand, 24502686 - 24502802
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcaccc 316  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||| | | | |||||||||||| |||    
T  24502686 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacagaga-atttatagtggttccccc 24502783  T
Q  317 aatgtgggctagtccactc 335  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  24502784 aatgtgggttagtccactc 24502802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26169296 - 26169243
Alignment:
Q  291 acacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26169296 acacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 26169243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22066894 - 22066839
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22066894 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaactt 22066839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23885296 - 23885241
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23885296 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaactt 23885241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28093735 - 28093645
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcct-gaaacttaaaaatgattctcaagttgt 156  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  28093735 tgaattagatataacagtcataaggaagaag-ggtttgaattgtgatccttttaaaattaaacttgtaacttaaaattgattctcaagttgt 28093645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 6314617 - 6314720
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||  ||||| |  || |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |    
T  6314617 gtgtgtgttgtgttaactgtaagtaaaag--tataaggaagagaataaaaacacacaaaaatttatagtagttcacccaatgtgggataatctactcctc 6314714  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  6314715 acaatc 6314720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28093554 - 28093451
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||  ||||| |  ||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |    
T  28093554 gtgtgtgttgtgtttactgtaagtaaaag--tataaggaagagaagaagaagacacataaatttatagtggttcacctaacatgggctaatccactcctc 28093457  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  28093456 acaatc 28093451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18421022 - 18420981
Alignment:
Q  98 ggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18421022 ggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaacttaa 18420981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 344
Target Start/End: Original strand, 27786687 - 27786740
Alignment:
Q  291 acacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||| |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27786687 acaccaagaattatagtgattcatccaatatgggctagtccactcctcacaatc 27786740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26169648 - 26169600
Alignment:
Q  108 gtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  26169648 gtgaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 26169600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26169837 - 26169789
Alignment:
Q  108 gtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  26169837 gtgaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 26169789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26170026 - 26169978
Alignment:
Q  108 gtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  26170026 gtgaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 26169978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26170215 - 26170167
Alignment:
Q  108 gtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  26170215 gtgaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 26170167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26170404 - 26170356
Alignment:
Q  108 gtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  26170404 gtgaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 26170356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26170593 - 26170545
Alignment:
Q  108 gtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  26170593 gtgaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 26170545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 26190978 - 26191258
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26190978 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 26191077  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191078 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 26191177  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191178 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 26191258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 26201560 - 26201840
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26201560 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 26201659  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201660 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 26201759  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201760 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 26201840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33950827 - 33950546
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  33950827 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgg 33950728  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33950727 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 33950628  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33950627 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 33950546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 11410064 - 11410344
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11410064 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 11410163  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11410164 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttactaaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 11410263  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11410264 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 11410344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 32071545 - 32071266
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32071545 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 32071446  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32071445 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttact-aagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 32071347  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32071346 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 32071266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 33940426 - 33940146
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33940426 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 33940327  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940326 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 33940227  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940226 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 33940146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18362383 - 18362103
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18362383 tgaagttgataaaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 18362284  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18362283 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtagataaa 18362184  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362183 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18362103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18391340 - 18391060
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18391340 tgaagttgataaaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 18391241  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18391240 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtagataaa 18391141  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18391140 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18391060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 64 - 346
Target Start/End: Original strand, 8764318 - 8764600
Alignment:
Q  64 catgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactta 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8764318 catgaagttgataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttg 8764417  T
Q  164 gaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaata 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8764418 gaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaata 8764517  T
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8764518 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatatgggctagtccactccccacaatcct 8764600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27413254 - 27412974
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27413254 tgaagtagataaaatagtcacaaggaatggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 27413155  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413154 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttactaaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 27413055  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27413054 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacctaatgtgggctagtccactcctcacaatcct 27412974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31917921 - 31917640
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |    
T  31917921 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaggtgattctcaagtagtttacttgg 31917823  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaatt-gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31917822 aatagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 31917723  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  31917722 ttaaa-gagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccaatcctcacaatc 31917640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 18217747 - 18218028
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  18217747 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 18217846  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18217847 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaatagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 18217945  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18217946 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 18218028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 18208409 - 18208690
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  18208409 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattcttaagtagtttacttgga 18208508  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18208509 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaatagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 18208607  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18208608 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 18208690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21754644 - 21754363
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21754644 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21754545  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||   ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21754544 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacccataaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21754446  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21754445 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 21754363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21763931 - 21763650
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21763931 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21763832  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||   ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21763831 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacccataaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21763733  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21763732 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 21763650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21683295 - 21683015
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21683295 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21683196  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21683195 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagta-atgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21683098  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21683097 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 21683015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 344
Target Start/End: Original strand, 27578356 - 27578584
Alignment:
Q  119 aaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||   || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  27578356 aaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttatttagaatagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaa 27578455  T
Q  216 t-gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcac 314  Q
      ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27578456 cagtttaataaagtaagtgcgtaagtgtatgttgtgtatactctaattaaa-gagtatagagaagagagaaagaacgcacaaagatttatagtggttcac 27578554  T
Q  315 ccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27578555 ccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 27578584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 30942437 - 30942717
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  30942437 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 30942535  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  30942536 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 30942633  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30942634 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 30942717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 30951859 - 30952139
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  30951859 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 30951957  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  30951958 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 30952055  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30952056 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 30952139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 37646479 - 37646759
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  37646479 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 37646577  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  37646578 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 37646675  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37646676 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 37646759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 4037127 - 4037407
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  4037127 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-gaggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 4037224  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | |     ||||  |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4037225 aatggttaagttaa-aagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaattaaaagtgtttgtgtgtgttgtgtatacagtaa 4037323  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4037324 at-aaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 4037407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20948962 - 20948680
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  20948962 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 20948863  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  20948862 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 20948766  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| | |||| | |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20948765 taagt-aaatagtaaaaagaaaagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 20948680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20959331 - 20959049
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  20959331 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 20959232  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  20959231 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 20959135  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| | |||| | |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20959134 taagt-aaatagtaaaaagaaaagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 20959049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 13570826 - 13570916
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13570826 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 13570916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 19886836 - 19887116
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  19886836 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-acttgg 19886933  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||    | |||||||||| ||||||| |  | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  19886934 aatggttaagttaaaag-cagacttcagaacgttctgatgcctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 19887032  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19887033 gtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 19887116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 34129636 - 34129726
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34129636 tgaagtagataaaatagttacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 34129726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36317555 - 36317275
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| || |  |||| |    
T  36317555 tgaagtagataaaatagtcacaaggaag--ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaaattttggacttgg 36317458  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| ||||     |||||||||||| ||||||||||   || ||| |||   |||||  |   ||  ||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  36317457 aatagttaagttagtgaactgacttcagaacgttctgaagtagttatacagaaacaatttaaatatacatatgtgtttgtgtgtgtagtgtatactgaaa 36317358  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36317357 at-aaagaggatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 36317275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 23376088 - 23376192
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23376088 gtgtgtgtagtgtatacta-aaattaaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctc 23376186  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  23376187 acaatc 23376192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 22172397 - 22172680
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggt-ttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  22172397 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggattgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-actt 22172495  T
Q  163 agaat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt 258  Q
     ||||   || ||||||   | |||||||||| ||||||| || | |     ||||  ||||||||| |||   ||||  ||||||||||||||| |  |    
T  22172496 ggaatgggtaagttaacag-cagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaggtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcaat 22172594  T
Q  259 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22172595 aagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 22172680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37818709 - 37818618
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaa-ggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  37818709 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacctaaaattgattctcaagttg 37818618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 204616 - 204704
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  204616 tgaagtagataaaatagtcacaaggaa-gaggggtttgaattgtgacccttt-aaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 204704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 336
Target Start/End: Original strand, 27273482 - 27273601
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||| ||    
T  27273482 gtttaataaattaaaagtgtttgtgtgtgttgtgtatacagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacaaagaatttatagtggttcccc 27273580  T
Q  316 caatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  27273581 caatgtgggttagtccactcc 27273601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20897847 - 20897785
Alignment:
Q  282 agaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20897847 agaaagaacacacaaaaagttatactggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 20897785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22245721 - 22245625
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttt-aaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  22245721 tgaagtagataaaataatcacaaggaagg-ggggtttgaattttgaccctttaaaaaattaacctgcaacttaaaattaattctcaagtgatttactt 22245625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 332
Target Start/End: Original strand, 42089769 - 42089920
Alignment:
Q  178 ttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaatt-gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaaataaaagagtataga 275  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||    ||||||||||||||| |||| | | |||| |||| ||||||||     
T  42089769 ttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaggt----gtgtaagtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaa-gagtatagg 42089863  T
Q  276 gaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtcca 332  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42089864 gaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccgatgtgggttagtcca 42089920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 37537360 - 37537648
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg--------tttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||        ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  37537360 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttga 37537459  T
Q  157 ttacttagaattatgttaacttt---ctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgta 252  Q
      |||| ||||   ||||| ||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  |||| |||||||||    
T  37537460 a-acttggaatg--gttaagttaaaacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtttgttgtgta 37537556  T
Q  253 tactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37537557 tgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacatagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 37537648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37818532 - 37818427
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  37818532 gtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcct 37818434  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  37818433 cacaatc 37818427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19781511 - 19781431
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19781511 aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 19781431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 121
Target Start/End: Original strand, 19547400 - 19547454
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaa 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19547400 tgaattagataaaatagtcacaaggaatgag-ggtttgaattgtgaccctttaaaa 19547454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 336
Target Start/End: Original strand, 13571002 - 13571099
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13571002 gtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcc 13571099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 154
Target Start/End: Original strand, 37297961 - 37298050
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagtt 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37297961 tgaagtagataaaatagtcacgagggggggg-ggtttgaattttgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaaactgattctcaagtt 37298050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Original strand, 20903758 - 20903856
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaa---ggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   || | ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  20903758 tgaagtagataaaatagtcacaagaaatggggggtggtttgaattgtgaccctttacaaa-taacctgcaacttaaaattaaatctcaagtggtttactt 20903856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 34129790 - 34129917
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| || ||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  34129790 gtttaataaagtaaatgtgtctgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gaatatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccc 34129888  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  34129889 caatgtgggttagtccactcgtcacaatc 34129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 37298115 - 37298242
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| |  ||| |||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| |||| || |||||||||| ||    
T  37298115 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtacagggaagagagaataaacacacgaagaatttatagtggttcccc 37298213  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37298214 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 37298242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20808307 - 20808257
Alignment:
Q  106 ttgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  20808307 ttgtgaccctttaaaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 20808257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 336
Target Start/End: Original strand, 20904001 - 20904043
Alignment:
Q  294 caaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20904001 caaaaagttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcc 20904043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 204851 - 204894
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  204851 ttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 204894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 19547633 - 19547676
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19547633 ttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 19547676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 33955000 - 33955055
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33955000 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaactt 33955055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 124
Target Start/End: Original strand, 42731942 - 42731989
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt 124  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42731942 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaatt 42731989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18569548 - 18569490
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18569548 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 18569490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24422799 - 24422741
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24422799 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 24422741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 27273360 - 27273418
Alignment:
Q  98 ggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| || |||||||||||    
T  27273360 ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctataacttaaaattggttctcaagttg 27273418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29958851 - 29958797
Alignment:
Q  289 acacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  29958851 acacaaaaagagttatcctggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaat 29958797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 30444461 - 30444519
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30444461 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 30444519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 139
Target Start/End: Original strand, 11017583 - 11017645
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaaa 139  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11017583 aaatagtcacaagaaa--aggggtttgaattgtgacccttttaaaaattagtcctgaaacttaaa 11017645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11224059 - 11224019
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttt 117  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  11224059 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttt 11224019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19781668 - 19781613
Alignment:
Q  100 tttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||    
T  19781668 tttgaattgtgacccttt-aaaattatcctgtaacataaaaagtaattctcaagttg 19781613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16155989 - 16155709
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16155989 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 16155890  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155889 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttactaaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 16155790  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155789 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 16155709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21459734 - 21459454
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21459734 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 21459635  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21459634 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaagaaaattgtttactaaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 21459535  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21459534 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 21459454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25020574 - 25020294
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25020574 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagtagtttacttgga 25020475  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25020474 attatgttaactttctgacttcagaatgttctaaagttcataaacaaaattgtttaataaagtaaaagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 25020375  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25020374 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcct 25020294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2117963 - 2117683
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  2117963 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggagggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 2117864  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaat 262  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  2117863 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcataca-aaaacagtttaataaagtaaaagtgcaagtgtgtgttgtgtatactat-aat 2117766  T
Q  263 aaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgt-gggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2117765 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtggggctagtccacttctcacaatc 2117683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 2369375 - 2369655
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2369375 atgaagtagataaaatagtcacaaagaagggg--gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttactttg 2369472  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2369473 aatagttaagttagtattctgacttcagaatgttatgaagttcatacacaaaaactgattaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 2369572  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2369573 ttaaa-gagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacctaatgtggactagtccactcctcacaatc 2369655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42035324 - 42035042
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42035324 tgaagtagataaaatagtcataaggaag-agggatttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 42035226  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca---aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    |   ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  42035225 atagttaagttaactttatgacttcacaacgttctgaagttcataaacaaagaaactgtttaagaaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt- 42035127  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42035126 aattaaagagtataaagaaagaggaaagaacacacagagaattatagtagttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 42035042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 30548576 - 30548858
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| |    
T  30548576 atgaagtagataaaatagtcacaaggaatggggggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaagagtgattctcaagtagattacttgg 30548675  T
Q  165 aat--tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca--aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||  |||  |||||||||| ||   ||| | |||||||||||||||||| | |    
T  30548676 aatagttagttaactttctgacttcagaacgttatgaagttcagacacaagaaacagtttaataaattaaatgtgcaggtgtgtgttgtgtatactat-a 30548774  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30548775 attaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 30548858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 21904280 - 21904561
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21904280 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagagggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21904379  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    ||| ||||| || || |||||||| | ||    
T  21904380 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtgaatgtgcaagtgcgtattatgtatactat-aa 21904478  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21904479 ttaaagagtgtagagatgaaggaaagagaacacggagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 21904561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18384420 - 18384172
Alignment:
Q  99 gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat---tatgttaactttctgacttcagaatgtt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||   || |||||  ||||||||||||||  ||    
T  18384420 gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgaaatggttaagttaatattctgacttcagaacatt 18384321  T
Q  196 ctgaagttcataaacaaaatt-gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacac 294  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  18384320 ctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaattaaat-agtataaggaagagagaaagaacacac 18384222  T
Q  295 aaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18384221 acatatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 18384172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 13966159 - 13965881
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaact-----taaaaatgattctcaagttgtttac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     ||||| | |||||||||| ||||||    
T  13966159 tgaagtagataaaatagtcacaagaaagagggggtttgaattgtgaccctttaaaa-ttatcctgaaattaactttaaaagtaattctcaagtagtttac 13966061  T
Q  161 ttagaat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatact 256  Q
    || ||||   || |||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  13966060 ttggaatagttaagttaatattctgacttcagaacgttatgaagttcatacacaaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatact 13965961  T
Q  257 gtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
     ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13965960 ataattaaa-gagtatagggaagagagaaagaacacacaaagatttatagtggttcagccaatgtgggttagtccactccc 13965881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37013460 - 37013180
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagag-gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  37013460 tgaagtagataaaatagtcacaaggaat-agagagtttgaattgtgaccctttaaaaatta--ctgaaatttaaaagtgattctcaagtagtttacttgg 37013364  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaatt-gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||  ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||   |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37013363 aatagttaagttaatattctgacttcagaacattatgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-a 37013265  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacac-acaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37013264 attaaagagtatagggaagagagaaggaacacaatttttttttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 37013180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8541307 - 8541157
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  8541307 tgaagtagataaaatagtcacaaggaatggg-gatttgaattgtgaccctttaaaaattatcatgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 8541209  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaa 214  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8541208 attgttaagttaatattctgacttcagaatgttctgaagttcatacacaaaa 8541157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8606546 - 8606396
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  8606546 tgaagtagataaaatagtcacaaggaatggg-gatttgaattgtgaccctttaaaaattatcatgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 8606448  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaa 214  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8606447 attgttaagttaatattctgacttcagaatgttctgaagttcatacacaaaa 8606396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25868455 - 25868174
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||    
T  25868455 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttag 25868357  T
Q  165 aattatgttaactt----tctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    |||  |||||| ||     | |||||||||| ||||||| || | |     ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||    
T  25868356 aat--tgttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagta 25868259  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||| ||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25868258 agtaaaa-agtatagggaagagagaatcaacacacacagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 25868174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27067189 - 27067099
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27067189 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggaggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 27067099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 1973636 - 1973918
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  1973636 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 1973735  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || |||  | ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  1973736 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-gattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 1973832  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1973833 taagt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 1973918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 1988423 - 1988705
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| | |||||||||||| | ||||      
T  1988423 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttga 1988522  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || |||  | ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  1988523 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-gattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 1988619  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1988620 taagt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 1988705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12420516 - 12420237
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   | || |    
T  12420516 tgaaatagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaatttgg 12420419  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  12420418 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 12420321  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12420320 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 12420237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20315541 - 20315450
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20315541 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggctttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 20315450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22401605 - 22401516
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22401605 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 22401516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 49336868 - 49336773
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  49336868 atgaagtagataaaatagtcacaaggaggggg--gtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgcaacttaaaattaattctcaagtggtttactt 49336773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 18095873 - 18095960
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagt 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||    
T  18095873 tgaagtagataaaatattcacaaggaaggag-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcttgtaacttaaaaagtaattctcaagt 18095960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 25038347 - 25038436
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25038347 tgaaatagataaaatagtcacaaggaaggggag-tttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 25038436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 25043559 - 25043648
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25043559 tgaaatagataaaatagtcacaaggaaggggag-tttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 25043648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Original strand, 41542784 - 41542871
Alignment:
Q  68 aagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  41542784 aagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacatgtaacttaaaattgattctcaagttg 41542871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41200940 - 41200881
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41200940 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 41200881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 20316644 - 20316733
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20316644 tgaagtagataaaacagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccttttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 20316733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 125
Target Start/End: Original strand, 26192206 - 26192267
Alignment:
Q  63 acatgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192206 acatgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 26192267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 52948651 - 52948739
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  52948651 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaattaaacctgtcacttaaaagttattctcaagttg 52948739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 18096072 - 18096152
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18096072 aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 18096152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21793642 - 21793580
Alignment:
Q  282 agaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21793642 agaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtggtttagtccactcctcacaatc 21793580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20315386 - 20315259
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  20315386 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccc 20315288  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20315287 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 20315259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 49336657 - 49336577
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  49336657 aaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 49336577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 20327122 - 20327215
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaa---ggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20327122 tgaagtagataaaacagtcacaaggaaagggggggggtttgaattgtgaccttttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 20327215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22962011 - 22961937
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22962011 tgaagtaaataaaatagtcacaaggaggggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattgtcttgtaacttaaaaa 22961937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34824076 - 34823791
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||  ||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34824076 tgaagtagatacattagtcacaaggaagggg--gtttgaattatgacattttaaaaataaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgttaacttag 34823979  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || ||||    | |||| ||| || ||| ||||||   ||  |||||| |||||||  || ||   ||||  |||||||| || |||| |||||    
T  34823978 aatagttaagttagtagtatgacatcaaaacgttatgaagtgtttatgcaaaatctgtttaaataaataaatgtgtttgtgtgtgtagtatatattgtaa 34823879  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctatg 349  Q
     |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||    
T  34823878 gtaaa-gagtatagagaagagaagaagaacacacaaaaatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccatttctcacaatcttatg 34823791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 336
Target Start/End: Original strand, 21820591 - 21820686
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    |||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21820591 gtgtgtatagtgtttactgtaattaaaagagtaaaggaaaga--gaaagaacacgcaaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcc 21820686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34000975 - 34000917
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34000975 tgaagtagatataatagtcacaaggaatgagagttttgaattgtgacccttttaaaatt 34000917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 20316797 - 20316924
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  |||||| |||||||| | |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  20316797 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtattgtgtatgcagtaagtaag-gagtatagggaagaaagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccc 20316895  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20316896 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 20316924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Original strand, 21820404 - 21820498
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  21820404 tgaagtaaataaaatagtcacaagaaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaataat-gtgcaacttaaaattaaatctcaagtggtttactt 21820498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Original strand, 25822286 - 25822345
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  25822286 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagttg-ggcttgaattgtgaccctttaaaaatta 25822345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27067035 - 27066908
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  27067035 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccc 27066937  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27066936 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 27066908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4951525 - 4951438
Alignment:
Q  69 agtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||   | ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  4951525 agtagataaaatagtcataaggaagggggggtttaaattgtgaccctttaaaaaaatttctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 4951438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Original strand, 19735520 - 19735606
Alignment:
Q  69 agtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| | | |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  19735520 agtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgacattttaaaaattaaacatataacttaaaattgattctcaagttg 19735606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Original strand, 20327280 - 20327406
Alignment:
Q  218 tttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcaccc 316  Q
    ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||  |||||||| ||||||||||  |||||| | ||| || |||||||||| |||    
T  20327280 tttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaag-gagtatagggaagaaagaatcaacacatagagaatttatagtggttccccc 20327378  T
Q  317 aatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20327379 aatgtgggttagtccactcctcacaatc 20327406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4951338 - 4951258
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4951338 aaagagtatagggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccctaatgtgggttagtccactcctcacaatc 4951258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22961812 - 22961732
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22961812 aaagagtataaggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 22961732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34000773 - 34000694
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  34000773 aaagagtatagagaagagaagaagaacacacata-atttatagtggttcacccaatgtgggttagtctactcgtcacaatc 34000694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 41542935 - 41543062
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  |||| |||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || ||| |||||| ||    
T  41542935 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtttgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacatagattttataatggttcccc 41543033  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41543034 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 41543062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22957394 - 22957285
Alignment:
Q  233 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtcca 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||   |||| | ||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22957394 gtgtaagtgtgtgtaatgtatacttgaaataaa-gagtataagaaagagaaaaataacacacata-atttatagtggttcatccaatgtgggttagtcca 22957297  T
Q  333 ctccccacaatc 344  Q
    |||| |||||||    
T  22957296 ctcctcacaatc 22957285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 341
Target Start/End: Original strand, 52948855 - 52948928
Alignment:
Q  268 agtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccaca 341  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52948855 agtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcaca 52948928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21793872 - 21793777
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| | | ||| |||| ||||||||    
T  21793872 tgaagtaaataaaatagtcactaaaaagggggggtttgaattctgaccctttaaaaa-taacctgcaacttaaaattaaatctgaagtggtttactt 21793777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 25038549 - 25038629
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  25038549 aaagagtatatggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgtgttagtccactcctcacaatc 25038629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 25043761 - 25043841
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||  ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  25043761 aaagagtatatggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgtgttagtccactcctcacaatc 25043841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 26192278 - 26192321
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26192278 ttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 26192321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Original strand, 26905593 - 26905656
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26905593 aaatagtcacaagaaatggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 26905656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8541145 - 8541091
Alignment:
Q  288 aacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaa 342  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8541145 aacacacagagatttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaa 8541091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8606384 - 8606330
Alignment:
Q  288 aacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaa 342  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8606384 aacacacagagatttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaa 8606330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 19867790 - 19867831
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaa 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  19867790 ttatagtggttcacccaatatgggttagtccactcctcacaa 19867831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22959282 - 22959172
Alignment:
Q  233 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtcc 331  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||  ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||| || ||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22959282 gtgtaagtgtgtgtaatgtatacatgaaataa--gagtataaagaagagaaaaataacacacagagaatttataatggttcatccaatatgggttagtcc 22959185  T
Q  332 actccccacaatc 344  Q
    ||||| |||||||    
T  22959184 actcctcacaatc 22959172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 14271598 - 14271642
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat 126  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14271598 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattat 14271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 126
Target Start/End: Original strand, 14281316 - 14281360
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat 126  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14281316 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattat 14281360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6693325 - 6693044
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6693325 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgg 6693226  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693225 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 6693126  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693125 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 6693044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40922950 - 40922669
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  40922950 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgg 40922851  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922850 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 40922751  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922750 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 40922669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6703730 - 6703450
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6703730 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 6703631  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6703630 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 6703531  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6703530 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 6703450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 16081235 - 16081515
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16081235 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 16081334  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16081335 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 16081434  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16081435 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 16081515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 17983826 - 17984107
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttg-aattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17983826 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttggaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 17983925  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17983926 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacagaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtagataa 17984025  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984026 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 17984107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 18104376 - 18104657
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttg-aattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18104376 tgaagtagataaaatagtcacaagggaaggggggtttggaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgg 18104475  T
Q  165 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataa 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18104476 aattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacagaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtagataa 18104575  T
Q  265 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18104576 aagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18104657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 7842812 - 7843093
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7842812 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 7842911  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7842912 atagttaatttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcataaacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatgctgt-aa 7843010  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7843011 ttaaagagtatagagaagagggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 7843093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 63 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15671192 - 15670908
Alignment:
Q  63 acatgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15671192 acatgaagtagataaaatagttacaaggaaggaggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttactt 15671093  T
Q  163 ---agaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt 258  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15671092 ggaataattaagttaactttctgacttcagaacgttatgtagttcataaacaaaaacagtttaataaagtaattgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt 15670993  T
Q  259 aaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15670992 aaat-aaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcaccctatgtgggttagtccactcctcacaatc 15670908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10422892 - 10422611
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  10422892 atgaagtaaataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtaattctcaagttgtttacttgg 10422794  T
Q  165 aattat---gttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10422793 aataattaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcataaacaaaaactatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 10422694  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10422693 ttaaa-gagtatagagaagaatgaaagagcacacaaagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 10422611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 3495724 - 3496006
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt-- 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  3495724 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttga 3495823  T
Q  163 -agaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
     | | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  3495824 aatagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcataaacaaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtggtgtatactgt-a 3495922  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3495923 attaaagagtatagagaagaaggaaatagcacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 3496006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 3486402 - 3486683
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt--- 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  3486402 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgaa 3486501  T
Q  163 agaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  3486502 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcataaacaaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtggtgtatactgt-aa 3486600  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3486601 ttaaagagtatagagaagaaggaaatagcacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 3486683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21856987 - 21856706
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21856987 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 21856888  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21856887 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21856789  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21856788 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 21856706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21912850 - 21912569
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21912850 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 21912751  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21912750 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21912652  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21912651 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 21912569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 27679527 - 27679809
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  27679527 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgg 27679626  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27679627 aatagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-a 27679725  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27679726 attaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 27679809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 5291863 - 5292144
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  5291863 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 5291962  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5291963 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 5292061  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5292062 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 5292144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 5301522 - 5301803
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  5301522 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 5301621  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5301622 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 5301720  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5301721 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 5301803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21847395 - 21847114
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21847395 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21847296  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21847295 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21847197  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21847196 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 21847114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21903258 - 21902977
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21903258 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21903159  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21903158 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21903060  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21903059 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 21902977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 27689183 - 27689464
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  27689183 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 27689282  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27689283 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 27689381  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27689382 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 27689464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 68 - 349
Target Start/End: Original strand, 7845695 - 7845978
Alignment:
Q  68 aagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7845695 aagtagataaaatagtcacaaggaatggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattttcaagttgtttacttggaat 7845793  T
Q  168 ---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattg-tttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaata 263  Q
       || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7845794 agttaagttaactttctgacttcataacgttctgaagttcataaacaaaaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatgctgtaatta 7845893  T
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctatg 349  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7845894 aa-gagtatagagaagagggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttatg 7845978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16250555 - 16250274
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  16250555 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 16250456  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16250455 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 16250357  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16250356 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 16250274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 66 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16254344 - 16254065
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  16254344 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgtccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtggtttacttgga 16254245  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||| | ||    
T  16254244 atagttaagttaactttctgacttcaaaacgttctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-tgtatactat-aa 16254147  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16254146 ttaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaat 16254065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17144839 - 17144558
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  17144839 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttaattgaa 17144741  T
Q  166 at---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat--tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  17144740 atagttaagttaactttttgacttcagaacattctgaagttcataaacaaaaaactgtttaataaagtaaatgtgttagtgtgtgttgtctatactgcaa 17144641  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| || |||||||||||| ||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17144640 ttaaa-gaatatagagaagaaggaaagagaacatagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 17144558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30652775 - 30652495
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  30652775 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-gatttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgtaacttaaaattaattctcaagttgtttacttgga 30652677  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||      ||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||||   || |  |||||||| |||||||||| |||    
T  30652676 atagttaagttagtgaagtgacttcagaacgttctgaagttcttatgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtttttgtgtgtgtggtgtatactg-aaa 30652578  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  30652577 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacactcaaagatttatagtggttcccccaatgttggttagtcaactcctcacaatc 30652495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 13791987 - 13792268
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  13791987 tgaagtagacaaaatagtcacaaggaaggtggggtttgaattgtgaccttttaaaaattaacctgtaacttaaaattaattctcaagttgtttacttgga 13792086  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaa--gttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |   ||| ||| | |   |||||||||||  |||||||  ||| ||  | |||| || ||||  || ||   |||   |||||||| |||||| ||| ||    
T  13792087 atagttaagtt-agtaaatgacttcagaacattctgaagtgtttatgcaaaaaactgcttaaataaataaatgtgattgtgtgtgtggtgtatgctg-aa 13792184  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792185 attaaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 13792268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16059478 - 16059199
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  16059478 tgaagtagataaaatagtcacaag-aagggg-ggtttaaattgtgaccctttaaaaattaacatgtaacttaaaattaattctcaagttgtttacttgga 16059381  T
Q  166 at---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaatt-gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    ||   || ||||      |||||| |||| ||||| |||||| ||  |||||   |||||||||||||   ||||  |||| ||| |||||| ||| |||    
T  16059380 atagttaagttagtgaagtgactttagaacgttctaaagttcttatgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtatgtggtgtatgctg-aaa 16059282  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16059281 ttaaagagtataaggaagagagaaagaacacacaaagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 16059199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 518641 - 518923
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  518641 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 518740  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  518741 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 518837  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  518838 taagt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 518923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 349
Target Start/End: Original strand, 14599608 - 14599895
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgttt-acttag 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||| |||| |    
T  14599608 tgaagtagataatatagtcacaaggaatgggggtttttaattgtgaccctttaaaaattatcatgcaacttaaat-taattctcaagttgttttacttgg 14599706  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataa--acaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    |||   || ||||      |||||||||||  ||||||||||| |    | ||||   ||| ||||||||   ||||  |||||||| |||||||||| |    
T  14599707 aatatttaagttagtgaagtgacttcagaacattctgaagttcttgtgtaaaaaacaatttgataaagtaaatgtgtttgtgtgtgtagtgtatactg-a 14599805  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctatg 349  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14599806 aattaaagagtataaggaagaaagaaagaacacacaaatatttatagtggttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatg 14599895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 17826951 - 17827231
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  17826951 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattcaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 17827049  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  17827050 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 17827147  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17827148 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 17827231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 17836342 - 17836622
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  17836342 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattcaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttgg 17836440  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  17836441 aatggttaagttaa--aacagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 17836538  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17836539 gt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 17836622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Original strand, 13401740 - 13402020
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactta 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||     
T  13401740 atgaagtagataaattagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgcgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-acttg 13401837  T
Q  164 gaattat---gttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    |||| ||   |||||    | ||||||| || ||||||| || | |     ||||| |||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||||||    
T  13401838 gaatgattaagttaaaag-cagacttcaaaacgttctgatgtctgagtgcaaaaatagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatactgta 13401936  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13401937 aataaaa-agtatagggaagataagaagaacacacaaaaatttatagtggttcaccaaatgtgggttagtccactcctcacaatc 13402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 6404783 - 6405061
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6404783 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg---tggttgaattgtgaccctttaaaaattaacttgtaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 6404879  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaa--gttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |   ||| ||||      ||||||||||| ||||||||  ||| ||  | |||||  || |||||| ||   ||||  |||||||| |||||| ||| ||    
T  6404880 atagttaagttagtggaatgacttcagaacgttctgaagtgtttatgcaaaaaatgcttaaataaa-taaatgtgtttgtgtgtgtagtgtatgctg-aa 6404977  T
Q  261 ataaaagagtatagagaaga-aagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6404978 attaaatagtatagggaagagaagaaa-aacacacaaagatttatagtggttcaaacaatatgggctagtccactcctcacaatc 6405061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 521148 - 521429
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  521148 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 521246  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  521247 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 521343  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  521344 taagt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 521429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Original strand, 3475041 - 3475123
Alignment:
Q  64 catgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattct 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3475041 catgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg--gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattct 3475123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16630642 - 16630552
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16630642 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 16630552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Original strand, 16209915 - 16210011
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  16209915 tgaagtatataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgatcctttaaaaattaacctgtaacttaaaattaattctcaagtggtttactt 16210011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 341
Target Start/End: Original strand, 17420255 - 17420532
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  17420255 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtcacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 17420354  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| | |  |  ||||   |||||  || ||   ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17420355 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactgtaa 17420454  T
Q  261 ataaaagagtatagagaaga-aagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccaca 341  Q
     | ||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17420455 gt-aaatagtaaagagaagagaagaaa-aacacagaa--atttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcaca 17420532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41527406 - 41527127
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | |  ||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41527406 tgaagtagataaaatagttacaagaaagggg-gacttgaattatgaccctttaaaaataaacttgtaacttaaaattgattctcaagttgtttacttgga 41527308  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||   |||| ||||||||| ||||||| || | |     ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||| | | ||||     
T  41527307 atagttaagttagtattctaacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttgcagtaag 41527208  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  41527207 t-aaagagtatagggaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgt-ggttagtccacttctcacaatc 41527127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2831094 - 2831005
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  2831094 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaaggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacatgtaacttaaaattgattctcaagttg 2831005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2830941 - 2830814
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  2830941 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccc 2830843  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2830842 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 2830814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16630488 - 16630361
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  16630488 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccc 16630390  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16630389 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 16630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17162490 - 17162426
Alignment:
Q  272 tagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17162490 tagagaagaaggaaagagcacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggatagtccactcc 17162426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Original strand, 4836989 - 4837048
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4836989 tgaagtagataaaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccattaaaaatta 4837048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 125
Target Start/End: Original strand, 15622066 - 15622130
Alignment:
Q  63 acatgaagtagataaaatagtcacaaggaaggag--aggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15622066 acataaagtagataaaatagtcacaaagaaggtgggaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 15622130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 53945265 - 53945345
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  53945265 aaagagtatagggaagagagaataaacgcacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 53945345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16398336 - 16398273
Alignment:
Q  99 gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  16398336 gtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgcaacttaaaattagttctcaagtggtttactt 16398273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 4837128 - 4837233
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  4837128 gtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaatacacagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcct 4837226  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  4837227 cacaatc 4837233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44890127 - 44890038
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  44890127 tgaagtagataaaatagtcataaagaatggg-ggtttaaattgtgaccctttaaaaattaaacatgtaacttaaaattgattctcaagttg 44890038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26459352 - 26459251
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || |  |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  26459352 gtgtgggttgtgtttactgtaagtacat-agtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctc 26459254  T
Q  339 aca 341  Q
    |||    
T  26459253 aca 26459251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Original strand, 15842494 - 15842535
Alignment:
Q  98 ggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15842494 ggtttgaattgtgaccctttaaaaattattcctgaaacttaa 15842535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Original strand, 16210127 - 16210198
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16210127 aaagagtatagggaagagagaataaacacaaagagatttatagtggttc-cccaatgtgggttagtccactcc 16210198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 117
Target Start/End: Original strand, 50515990 - 50516030
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttt 117  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50515990 aaatagtcacaagaaaggggaggtttgaattgtgacccttt 50516030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 336
Target Start/End: Original strand, 18585698 - 18585733
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18585698 ttatagtggttcacccaatatgggctagtccactcc 18585733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 33296718 - 33296773
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33296718 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaactt 33296773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 3241978 - 3242036
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3241978 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 3242036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3918551 - 3918493
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3918551 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 3918493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9338188 - 9338146
Alignment:
Q  98 ggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9338188 ggtttgaattgtgaccctttaaaaattattgctgaaacttaaa 9338146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16398139 - 16398085
Alignment:
Q  282 agaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  16398139 agaaagaacacacagaaatttatagtggttcatccaatgtggtttagtccactcc 16398085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 54689606 - 54689664
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  54689606 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 54689664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 54699039 - 54699097
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  54699039 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 54699097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Original strand, 53945054 - 53945150
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttt-aaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||| | |||||||||| | ||||||    
T  53945054 tgaagtaggtaaaataatcataagaaagggg-ggtttgaattgtgatcctttaaaaaattaacctgcaatttaaaattaattctcaagtggattactt 53945150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26813005 - 26812949
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26813005 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaactt 26812949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18652324 - 18652044
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18652324 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 18652225  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652224 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 18652125  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652124 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18652044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18664442 - 18664162
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18664442 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 18664343  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18664342 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 18664243  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18664242 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18664162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 9501633 - 9501913
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9501633 tgaagttgataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 9501732  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9501733 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 9501832  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9501833 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 9501913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 9512999 - 9513279
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9512999 tgaagttgataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 9513098  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9513099 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 9513198  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9513199 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 9513279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 2997570 - 2997850
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  2997570 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaattttatcctgaaacttaaaattgattctcaagttgtttactttga 2997669  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2997670 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacagaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtagataaa 2997769  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2997770 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 2997850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 17489800 - 17489516
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagagg---tttgaattgtgacccttt-aaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489800 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggggtttgaattgtgacccttttaaaaataatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttac 17489701  T
Q  161 ttagaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  17489700 ttggaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttactaa-gtatacgtataagtgtgtgttgtgtatactgtaa 17489602  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489601 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 17489516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29424461 - 29424181
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  29424461 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg--gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtaattctcaagttgtttacttgga 29424364  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac--aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29424363 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcataaacaaaaaactgtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgctgtgtatactgt-a 29424265  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29424264 attaaagagtatagagaagaaggaaagagcacacagataattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 29424181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4459487 - 4459206
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  4459487 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 4459388  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4459387 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 4459289  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4459288 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 4459206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 5345584 - 5345865
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  5345584 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 5345683  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5345684 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 5345782  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5345783 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 5345865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 37861986 - 37862265
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |    
T  37861986 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaatgtaattctcaagttgtttacttgaa 37862084  T
Q  166 attat---gttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    ||  |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37862085 atagttgagttaactttctgacttcagaacgttctgaagtttataaacaaaaactgtttaataaagtaa-agtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaat 37862183  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37862184 taaa-gagtatagagaagaaagaaagagcacacaaagaagtatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 37862265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4469112 - 4468831
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  4469112 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgg 4469014  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4469013 aatagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 4468914  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4468913 ttaaa-gagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 4468831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 5335732 - 5336013
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  5335732 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 5335831  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5335832 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 5335930  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5335931 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtctactcctcacaatc 5336013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 32935657 - 32935938
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32935657 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 32935756  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32935757 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 32935855  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32935856 ttaaagagtatatggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 32935938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 38956720 - 38957001
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38956720 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagagaaggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 38956819  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||| | ||    
T  38956820 attgttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatatgcagaaatagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtaaactat-aa 38956918  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38956919 ttaaagagtatagagaagaaggagagaacacacagagaattatagtggttcatccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 38957001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 66 - 335
Target Start/End: Original strand, 24695456 - 24695727
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  24695456 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattattctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 24695554  T
Q  166 at---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    ||   || ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||   |||||||||||    ||| |||||||||||||||||||| |||     
T  24695555 atagttaagttaactttctaacttcagaacattctgaagttcatacacagaaacaatttaataaagtcaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatactataat 24695654  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactc 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24695655 taaa-gagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactc 24695727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 214
Target Start/End: Original strand, 29115227 - 29115375
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29115227 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 29115326  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29115327 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaa 29115375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 105 - 344
Target Start/End: Original strand, 38929418 - 38929659
Alignment:
Q  105 attgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaag 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38929418 attgtgaccctttaaaa-ttatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgaaatagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaag 38929516  T
Q  202 ttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagag 300  Q
    ||||||  || |||  |||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||     
T  38929517 ttcatatgcagaaacagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtaaactataattaaa-gagtatagagaagaaggaaaaaacacacagagaa 38929615  T
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38929616 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 38929659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 27169221 - 27169503
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  27169221 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 27169320  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tca---taaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| | |   |||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  27169321 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtgtaaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 27169417  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27169418 taagt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 27169503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45015647 - 45015541
Alignment:
Q  237 aagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45015647 aagtgtgtgttgtgtatactataattaaa-gagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcc 45015549  T
Q  337 ccacaatc 344  Q
     |||||||    
T  45015548 tcacaatc 45015541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 27158874 - 27159155
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  27158874 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 27158972  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tca---taaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| | |   |||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  27158973 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtgtaaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 27159069  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27159070 taagt-aaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 27159155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45191945 - 45191665
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactta 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||     
T  45191945 atgaagtcgataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg-aaacttg 45191848  T
Q  164 gaa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    |||   ||| |||||  |   |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||    
T  45191847 gaatggttaagttaaaat--agacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagta 45191750  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45191749 agt-aaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 45191665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 16901090 - 16901371
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  16901090 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-acttgg 16901188  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  |||||||||||||||   ||||    
T  16901189 aatggttaagttaaaag-cagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgtagtaa 16901287  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16901288 gtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 16901371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 16994481 - 16994762
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  16994481 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-acttgg 16994579  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||    | |||||||||| ||||||| || | ||    ||||  |||||||||||||   ||||  |||||||||||||||   ||||    
T  16994580 aatggttaagttaaaag-cagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgtagtaa 16994678  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16994679 gtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 16994762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 22671481 - 22671571
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22671481 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggctttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 22671571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 22678620 - 22678710
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22678620 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggctttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 22678710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 574787 - 574699
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagtt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  574787 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagtt 574699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 22907745 - 22908026
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||||||||||||   |||| |    
T  22907745 tgaagtagataaaatagtcacaaggaggggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtcacttaaaagttattctcaagttgaaaacttgg 22907843  T
Q  165 aattat---gttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    ||| ||   ||||||   | |||||||||| ||| |||||| | |  |  ||||  ||||||  || ||   ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  22907844 aatgattaagttaacaaacagacttcagaacgttatgaagtgttagtataaaaacagtttaaataattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactgtaa 22907943  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22907944 gtaaa-gagtaaagagaggagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 22908026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Original strand, 41025764 - 41025863
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||    
T  41025764 tgaagtagataaaatagttacaaggaagg-gaggtttgagttgggaccctttaaaaattaacctgcaacttaaaattagttctcaagtggtttacttaga 41025862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Original strand, 3604512 - 3604605
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagg--agaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3604512 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggagggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 3604605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32877818 - 32877729
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32877818 tgaagtagataaaatagtcacaaggaatggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 32877729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12580422 - 12580338
Alignment:
Q  69 agtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagtt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  12580422 agtagataaaatagtcacaaggaagggg--gtttgaattgtgaccctttaaaaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagtt 12580338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 69220 - 69324
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  69220 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa-gagtgtatggaagagaagaagaacacacagagatttatagtggtttatccaatgttggctagtccactcctc 69318  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  69319 acaatc 69324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19343424 - 19343336
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  19343424 tgaagtagataaaatagtcacaaggaag--ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtcacttaaaagttattctcaagttg 19343336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19343248 - 19343144
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19343248 gtgtgtgttgtgtttactataagcaaa-gagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctc 19343150  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  19343149 acaatc 19343144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 344
Target Start/End: Original strand, 41025962 - 41026056
Alignment:
Q  248 gtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||| |||||||| |||||||||| || |||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  41025962 gtgtttactgtaattaaaagagtaaagggaaga--gaaagagcgcacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcttcacaatc 41026056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22903072 - 22902968
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||  |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22903072 gtgtgtgttgtgttgattgtaagtaaat-agtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctc 22902974  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  22902973 acaatc 22902968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 3604670 - 3604797
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| | || |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  3604670 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtgaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccc 3604768  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3604769 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 3604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 155
Target Start/End: Original strand, 6875855 - 6875944
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaat-tatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||| ||||||||||||    
T  6875855 atgaagtagatataatagttacaaggaagggga--tttgaattgtgaccctttaaaaataaaacatgtaacttaaaaataattctcaagttg 6875944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28451235 - 28451155
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28451235 aaagagtatagggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 28451155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38461430 - 38461328
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagaga-agaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||     
T  38461430 gtgtgtgatgtgtatactgtaagt-aaagagtatagagatagaagaatagaacacac-aagaattatattggttcatccaatgtggactaatccactcct 38461333  T
Q  338 cacaa 342  Q
    |||||    
T  38461332 cacaa 38461328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 44637523 - 44637616
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggaga---ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctga-aacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |     |||||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  44637523 tgaagtagataaaatagtcacaaggaattaagtcgggtttgaattgtcaccctttaaaaattaaacttataacttaaaattgattctcaagttg 44637616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 22678796 - 22678901
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||     
T  22678796 gtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcct 22678894  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  22678895 cacaatc 22678901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22903248 - 22903192
Alignment:
Q  68 aagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22903248 aagtagattaaatattcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaacctttaaaaatta 22903192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35878081 - 35878018
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  35878081 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 35878018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 35885570 - 35885507
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  35885570 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 35885507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 36725283 - 36725220
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  36725283 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 36725220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22635075 - 22635021
Alignment:
Q  289 acacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22635075 acacaaaaagagttatcctggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaat 22635021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 22671657 - 22671761
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||     
T  22671657 gtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtcgttc-cccaatgtgggttagtccactcct 22671754  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  22671755 cacaatc 22671761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41896477 - 41896423
Alignment:
Q  289 acacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  41896477 acacaaaaagagttatcctggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaat 41896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21110083 - 21110051
Alignment:
Q  304 tagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21110083 tagtggttcacccaatgtggactagtccactcc 21110051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 9323990 - 9324269
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9323990 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 9324089  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9324090 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtg-aagtgtgtgttatgtatactgtaaataaa 9324188  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324189 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 9324269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21335404 - 21335124
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21335404 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 21335305  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21335304 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 21335205  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21335204 aaagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 21335124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 21201789 - 21202069
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21201789 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 21201888  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21201889 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 21201988  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21201989 aaggtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 21202069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 21212205 - 21212485
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21212205 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagttgtttacttgga 21212304  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21212305 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 21212404  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21212405 aaggtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 21212485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 66 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18524636 - 18524435
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18524636 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaacctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 18524537  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18524536 attatgttaactttctgactccagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 18524437  T
Q  266 ag 267  Q
    ||    
T  18524436 ag 18524435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 12900260 - 12900541
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  12900260 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctaaagtagtttacttgga 12900359  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12900360 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 12900458  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12900459 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 12900541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21462214 - 21461933
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21462214 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21462115  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    ||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  21462114 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacagaaacagtttaataaagtcaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatgctat-aa 21462016  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21462015 ttaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 21461933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3988621 - 3988340
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  3988621 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 3988522  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3988521 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 3988423  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3988422 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 3988340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13675869 - 13675588
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  13675869 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 13675770  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13675769 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 13675671  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13675670 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 13675588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 21986701 - 21986982
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21986701 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21986800  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21986801 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21986899  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21986900 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 21986982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 21996235 - 21996516
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  21996235 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 21996334  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21996335 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 21996433  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21996434 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 21996516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 66 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16583062 - 16582830
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  16583062 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 16582963  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16582962 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 16582864  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacaca 295  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16582863 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacaca 16582830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8669053 - 8668963
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8669053 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 8668963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 14880637 - 14880727
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14880637 tgaagttgataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 14880727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 14892987 - 14893077
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14892987 tgaagttgataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 14893077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 23014006 - 23014095
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  23014006 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctataacttaaaaagtaattctcaagttg 23014095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 31998194 - 31998474
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  31998194 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-acttgg 31998291  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||    | |||||||||| ||||||| || | |     ||||  |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  31998292 aatggttaagttaaaac-cagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 31998390  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31998391 gtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 31998474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 344
Target Start/End: Original strand, 2689419 - 2689514
Alignment:
Q  248 gtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2689419 gtgtatactg-aaattaaagagtatagtgaagagagaaagaacacacaaagatttatagtggctcgcccaatgtgggctagtccacttctcacaatc 2689514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Original strand, 11429421 - 11429516
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttt-aaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11429421 tgaagtagataaaatagtcacaaggaag--ggggtttgaattgtgaccatttaaaaaattaacctgcaacttaaaaataattctcaagtggtttactt 11429516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14438533 - 14438252
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  14438533 tgaagtatataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccttttaaaaattaaacctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 14438435  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || ||| ||   | |||||||||| |||||||||| | |  |  ||||   |||||  || ||   ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14438434 aatggttaagtttacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactgtaa 14438335  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     ||||  |||| ||||||||||  | ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14438334 gtaaat-agtaaagagaagaaaagaggaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 14438252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 26361468 - 26361572
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26361468 gtgtgtgttgtgtttactgtaagtaaat-agtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctc 26361566  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  26361567 acaatc 26361572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17269640 - 17269568
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17269640 aaagagtctagggaagagagaaagaacacacagcgatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcc 17269568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 155
Target Start/End: Original strand, 20529841 - 20529913
Alignment:
Q  83 tcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20529841 tcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 20529913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 11429622 - 11429702
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11429622 aaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaaggtgggttagtccactcctcacaatc 11429702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 33773234 - 33773361
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacc 315  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||  ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  33773234 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtataaggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccc 33773332  T
Q  316 caatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33773333 caatgtgggttagtccactcctcacaatc 33773361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 14893163 - 14893268
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  14893163 gtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcct 14893261  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  14893262 cacaatc 14893268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 31990636 - 31990694
Alignment:
Q  98 ggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31990636 ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 31990694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 33773113 - 33773171
Alignment:
Q  98 ggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33773113 ggtttgaattgtgaccctttaaaaattacacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 33773171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 344
Target Start/End: Original strand, 14880816 - 14880918
Alignment:
Q  242 tgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccac 340  Q
    |||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14880816 tgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 14880914  T
Q  341 aatc 344  Q
    ||||    
T  14880915 aatc 14880918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Original strand, 31990759 - 31990885
Alignment:
Q  218 tttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcaccc 316  Q
    ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  31990759 tttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcaataagtaaa-gagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttccccc 31990857  T
Q  317 aatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31990858 aatgtgggttagtctactcctcacaatc 31990885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 12840412 - 12840501
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||| || || | ||||||||||||||||||||||    
T  12840412 tgaagtatatataatagtcataaggaaggtg-ggtttgaattatgacccttttaaatttaatcttgtatcttaaaaatgattctcaagttg 12840501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 344
Target Start/End: Original strand, 20529977 - 20530104
Alignment:
Q  217 gtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaa-agaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcac 314  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||| || ||||  |||||||| ||| || |||||||||| |    
T  20529977 gtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtata-agaaaaagagaatcaacacacagagaatttatagtggttccc 20530074  T
Q  315 ccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20530075 ccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 20530104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 125
Target Start/End: Original strand, 26361282 - 26361349
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaa-------ggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361282 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggggggggggggggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 26361349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6760762 - 6760700
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctg 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  6760762 tgaagtggataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaatagtgaccc-ttaaaaataatcctg 6760700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12768359 - 12768296
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  12768359 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 12768296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Original strand, 42711804 - 42711867
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  42711804 aaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 42711867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 12840644 - 12840687
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  12840644 ttatagtggttcacccaatgtgggttaatccactcctcacaatc 12840687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Original strand, 45489542 - 45489615
Alignment:
Q  271 atagagaagaaagaaagaacacacaaaga-gttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  45489542 atagataaggaagaaagatcacacaaaaaagttatcctggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaat 45489615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Original strand, 45498500 - 45498573
Alignment:
Q  271 atagagaagaaagaaagaacacacaaaga-gttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  45498500 atagataaggaagaaagatcacacaaaaaagttattctggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaat 45498573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18537558 - 18537479
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||  ||||| |  ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||    
T  18537558 aaagagtataaggaagagaataagaacacacata-atttatagtggttcatccaatgtgggttaatccactcctcacaatc 18537479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20047868 - 20047806
Alignment:
Q  77 aaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  20047868 aaatagtcacaagaaatgag-ggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 20047806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 139
Target Start/End: Original strand, 26193551 - 26193595
Alignment:
Q  96 gaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaaa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26193551 gagggttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaacttaaa 26193595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 18325 - 18605
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18325 tgaagtagataaaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 18424  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18425 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaggtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 18524  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18525 agagtataaagaggaaggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 18605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 308983 - 309262
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  308983 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 309081  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  309082 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttactaaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataga 309181  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  309182 atagtatatagaagaaagaaagaacacacaaagcgttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 309262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 217770 - 217483
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgttt-acttag 164  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||| |||| |    
T  217770 tgaagtagataatatagtcacaaggaatgggggtttttaattgtgaccctttaaaaattatcatgcaacttaaat-taattctcaagttgttttacttgg 217672  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataa--acaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgta 259  Q
    |||   || ||||      |||||||||||  ||||||||||| |    | ||||   ||| ||||||||   ||||  |||||||| |||||||||| |    
T  217671 aatatttaagttagtgaagtgacttcagaacattctgaagttcttgtgtaaaaaacaatttgataaagtaaatgtgtttgtgtgtgtagtgtatactg-a 217573  T
Q  260 aataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctatg 349  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  217572 aattaaagagtataaggaagaaagaaagaacacacaaatatttatagtggttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatg 217483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Original strand, 6803 - 7085
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaa-tagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactta 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6803 tgaagtagataaaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagtgattctcaagttgtttacttg 6902  T
Q  164 gaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaata 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6903 gaattatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgcttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaata 7002  T
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7003 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcct 7085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 66 - 313
Target Start/End: Original strand, 14892 - 15139
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14892 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatactgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttgga 14991  T
Q  166 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14992 attatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaattgtttaataaagtataagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaa 15091  T
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttca 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15092 agagtatagagaagaaggaaagaacacacaaagagttatagtggttca 15139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 8939
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  9220 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggaggggtttgaattgcgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 9121  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  9120 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttatgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgttgtgtatactat-aa 9022  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  9021 ttaaagagaatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtggactagtccactcctcacaatc 8939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 91837 - 92118
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||    
T  91837 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtattttacttgga 91936  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaa-ttgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  91937 atagttaagttaactttctgacatcagaacgttctgaagttcatacacaaaagcagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactat-aa 92035  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  92036 ttaaagagtaaagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgagctagtccactcctcacaatc 92118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 323 - 42
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  323 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattcttaagtagtttacttgga 224  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||   ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  223 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatactcataaacattttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 125  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  124 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatc 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1882 - 1778
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  1882 gtgtgtgtagtgtatactgaaaataaa-gagtataaggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcactgaatgtgggctagtcaactcctc 1784  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  1783 acaatc 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 30615 - 30895
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  30615 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaacctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 30714  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30715 atagttaagttaatattctgacttcagaacgttctgaagttcatacacataaacagtttaataaagta-atgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 30812  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30813 ttaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 30895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 189
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  468 tgaagtagataaaatagtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccatttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 369  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||    ||| ||  |||||||||||||||| | ||    
T  368 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagctcatacacagaaacagtttaataaagtcaatgtgcaa--gtgtgttgtgtatactat-aa 272  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  271 ttaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 336
Target Start/End: Original strand, 916 - 1189
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  916 tgaagtagataaaatagtcacaacgaagggggagtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgga 1015  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaac-aaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaa 261  Q
    |   ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1016 atagttaagttaacattctaacttcagaacgttctgaagttcatacacaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-aa 1114  T
Q  262 taaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    | ||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1115 ttaaatagtatagagaagaagcaaagaacacatagagaattatagtggttcacccaacgtgggatagtccactcc 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 73686 - 73967
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttaga 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||    
T  73686 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaagtaattctcaagtagattacttgga 73784  T
Q  166 a---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca--aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||   ||||||||| ||   ||| | |||||||||||||||||| | |    
T  73785 atagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacaagaaacaatttaataaattaaatgtgcaggtgtgtgttgtgtatactat-a 73883  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  73884 gttaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatc 73967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 344
Target Start/End: Original strand, 1 - 246
Alignment:
Q  102 tgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||   || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1 tgaattgtgaccctttaaaaattattctgaaacttaaaggtgattctcaagtagtttactttgaataaataagttaagtttctgacttcagaacgttctg 100  T
Q  199 aagttcataaacaaaattg-tttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaa 297  Q
    ||||||||| ||||||    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  101 aagttcatacacaaaaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaattaaa-gagtatagagaagaaggaaagaacacacaga 199  T
Q  298 gagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  200 gaattattgtggttcacccaacgtgggctagtcaactcctcacaatc 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0873 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0873
Description:

Target: scaffold0873; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 249
Target Start/End: Original strand, 4756 - 4943
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  4756 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttgg 4854  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagttcataaaca-aaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgt 249  Q
    ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||    ||| |||||||||||||    
T  4855 aatagttaagttaactttctgacttcagaacgttctgaagttcatacacagaaacagtttaataaagtcaatgtgcaagtgtgtgttgt 4943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9246 - 8965
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcct-gaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  9246 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacttgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-acttgg 9148  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||    | |||||||||| ||||||| || | |     ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9147 aatggttaagttaaaag-cagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgttgtgtatactgt-a 9050  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaag-agttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9049 attaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 8965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6551 - 6442
Alignment:
Q  101 ttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttagaa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttct 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6551 ttgaattgtgaccctttaaaatttatcctgaaacttaaaagtgattctcaagtagtttacttggaatagttaagttaactttctgacttcagaacgttct 6452  T
Q  198 gaagttcata 207  Q
    ||||||||||    
T  6451 gaagttcata 6442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6601 - 6572
Alignment:
Q  65 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601 atgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 6572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 20078 - 19796
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  20078 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 19979  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   | |||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  19978 aatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 19882  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| ||| |||| |  ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19881 taagt-aaatagtaaagaaaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 19796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6875 - 6598
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  6875 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 6776  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   |  ||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  6775 aatggttaagttaacagacaaacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 6679  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||     ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6678 taagt-aaatagtaaagagaag-----aagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10657 - 10380
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||| | |||| |    
T  10657 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaatcctgccacttaaaagttattctcaagttgataacttgg 10558  T
Q  165 aa---ttatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt----tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactg 257  Q
    ||   ||| ||||||   |  ||||||||| ||||||||||      ||||||| |||  || ||| || ||   ||||  ||||||||||||| |||||    
T  10557 aatggttaagttaacagacaaacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaat--ttgaat-aattaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtttactg 10461  T
Q  258 taaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||| | ||| |||| |||||||     ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10460 taagt-aaatagtaaagagaag-----aagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 10380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 230 - 140
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  230 tgaagtggataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 2327 - 2429
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  2327 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacttgtaacttaaaattgattctcaagttttggacttag 2426  T
Q  165 aat 167  Q
    |||    
T  2427 aat 2429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 344
Target Start/End: Original strand, 2486 - 2545
Alignment:
Q  285 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2486 aagaacacacaaagatttatagtggttcattcaatgtgggctagtccactcctcacaatc 2545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 6145 - 6248
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||| | |||||||||| || |||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6145 gtgtgtatagtgtatactgaaattaaaagagtgaagggaaga--gaaagaacacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactcctc 6242  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  6243 acaatc 6248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 142
Target Start/End: Original strand, 5957 - 6031
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaat 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  5957 tgaagtaaataaaatagtcacaaggaagggggg--ttgaattgtgacccattaaaaattaacctggaacttaaaaat 6031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 344
Target Start/End: Original strand, 394819 - 395099
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattat-cctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| |    
T  394819 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-gaggtttgaattgtgacccttcaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttgaa-acttgg 394916  T
Q  165 aat---tatgttaactttctgacttcagaatgttctgaagt-tcataaacaaaattgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaa 260  Q
    |||   || |||||    |  ||||||||| ||||||| || | |     ||||| |||||||||||||    |||  ||||||||||||||| | ||||    
T  394917 aatggttaagttaaaag-caaacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaatagtttaataaagtaaatatgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaa 395015  T
Q  261 ataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
     |||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  395016 gtaaa-gagtatagggaagagagaatcaacacacaaagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 395099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 27973 - 28062
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  27973 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaggttg 28062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 58669 - 58759
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  58669 tgaagtggataaaatagtcacaaggaagggggggtttggattgtgacccattaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaagttg 58759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 148
Target Start/End: Original strand, 49178 - 49260
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattct 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  49178 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg-ggcatttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaattgattct 49260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 333
Target Start/End: Original strand, 49331 - 49446
Alignment:
Q  218 tttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcaccc 316  Q
    ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| | ||  |||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  49331 tttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatagggaagagaaaatcaacacacagagaatttatagtggttccccc 49429  T
Q  317 aatgtgggctagtccac 333  Q
    |||||||| ||||||||    
T  49430 aatgtgggttagtccac 49446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Original strand, 28148 - 28250
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||||| | ||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  28148 gtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtaaagggaagagaaaatcaacacacatagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcct 28246  T
Q  338 caca 341  Q
    ||||    
T  28247 caca 28250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8528 - 8443
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8528 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggga--tttgaattgtgacccttt-aaaattatcctgtaacttaaaaagtgattctcaagt 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8330 - 8245
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctatg 349  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  8330 aaagagtatagggaagagagaatcaacaaatagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttatg 8245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16377 - 16273
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  16377 gtgtgtgtagtgtatacta-aaattaaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctc 16279  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  16278 acaatc 16273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 71 - 12
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagggggggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 336
Target Start/End: Original strand, 27852 - 28007
Alignment:
Q  181 tgacttcagaatgttctgaagttcataaacaaaat-tgtttaataaagtatgagtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaag 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||  || |||||||| ||  ||| |  | |||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||    
T  27852 tgacttccgaatgttctgaagttcttatgcaaaaactgattaataaaataaaagtatttgcgtgtgtagtgtatactg-aaattaaagagtataaggaag 27950  T
Q  280 aaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27951 agagaaataacacacaaagatttatagtgcttcatccaatttgggctagtccactcc 28007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 121
Target Start/End: Original strand, 27738 - 27789
Alignment:
Q  68 aagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaa 121  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27738 aagtagataaattagtcacaaagaagggga--tttgaattgtgaccctttaaaa 27789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19881 - 19791
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttta-aaaattatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttg 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  19881 tgaagtaaataaaatagtcacaagggagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttg 19791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19679 - 19599
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19679 aaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 19599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 20013 - 20103
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20013 tgaagtagatgaaatagtcacaaggaaggggggggttgacttgtgaccctttaaaaattaaagctgtaacttaaaattgattctcaagttg 20103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 344
Target Start/End: Original strand, 20213 - 20294
Alignment:
Q  264 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20213 aaagagtatagggaagagagaatcaacacgcagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 20294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 39527 - 39628
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttacttag 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||| ||||||  ||||||    
T  39527 tgaagcagataaaatagtcacaacgaag-aggggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacctgtaacttaaaagttattctcgagttgtaaacttag 39625  T
Q  165 aat 167  Q
    |||    
T  39626 aat 39628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 39704 - 39808
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcccc 338  Q
    |||||| |||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  39704 gtgtgttttgtgattactgaaaataaa-gagtaaagagaagagaaaaagaacacgcagaaacttatagtggttcacccaatgtgggttagtccccttctc 39802  T
Q  339 acaatc 344  Q
    ||||||    
T  39803 acaatc 39808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 110728 - 110817
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt-atcctgaaacttaaaaatgattctcaagttg 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  110728 tgaagtagataagatagtcacaaggaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaattaaacatgtaacttaaaattgattttcaagttg 110817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 344
Target Start/End: Original strand, 110903 - 111008
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccc 337  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| |||||||  ||||| ||||  |||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  110903 gtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaa-gagtatatggaagagagaataaacacaaagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcct 111001  T
Q  338 cacaatc 344  Q
    |||||||    
T  111002 cacaatc 111008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12218 - 12123
Alignment:
Q  239 gtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcc 336  Q
    |||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12218 gtgtgtatagtgtttactgtaattaaaagagtaaaggaaaga--gaaagaacacgcaaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcc 12123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12405 - 12311
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  12405 tgaagtaaataaaatagtcacaagaaagggg-ggtttgaattgtgaccctttaaaaataat-gtgcaacttaaaattaaatctcaagtggtttactt 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 344
Target Start/End: Original strand, 196521 - 196630
Alignment:
Q  233 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtcca 332  Q
    ||||||||||||||  |||||| |  ||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  196521 gtgtaagtgtgtgtaatgtatagttgaaataaa-gagtataaggaagagaaaaataacacacagagt-ttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 196618  T
Q  333 ctccccacaatc 344  Q
    |||| |||||||    
T  196619 ctcctcacaatc 196630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 189913 - 190015
Alignment:
Q  233 gtgtaagtgtgtgttgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtcc 331  Q
    ||||||||||||||  |||||||   ||||||  ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  189913 gtgtaagtgtgtgtaatgtatacatgaaataa--gagtataaagaagagaaaaataacacacagagaatttatagtggttcacccaatatgggttagtcc 190010  T
Q  332 actcc 336  Q
    |||||    
T  190011 actcc 190015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 55562 - 55468
Alignment:
Q  247 tgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  55562 tgtgtatattgtaattaaaagagtaaagggaaga--gaaagaacatacaaataattatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat 55468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 59511 - 59417
Alignment:
Q  247 tgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  59511 tgtgtatattgtaattaaaagagtaaagggaaga--gaaagaacatacaaataattatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat 59417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 60939 - 60845
Alignment:
Q  247 tgtgtatactgtaaataaaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||||||||| ||||| | ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  60939 tgtgtatattgtaattaaaagagtaaagggaaga--gaaagaacatacaaataattatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat 60845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 61127 - 61031
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaa-attatcctgaaacttaaaaa-tgattctcaagttgtttactt 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | | || ||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  61127 tgaagtaaataaaatagtcacaagga--gggggggttgaattgtaaccctttaaaagtttaacctgcaacttaaaaattaattctcaagtggtttactt 61031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Original strand, 1 - 80
Alignment:
Q  266 agagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagtt-atagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1 agagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 80  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1377 - 1319
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  1377 tgaagtagatataatagtcacaaggaagg-gggatttgaattgtgacccttttaaaatta 1319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 344
Target Start/End: Original strand, 55041 - 55084
Alignment:
Q  301 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatc 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55041 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatc 55084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 79 - 22
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  79 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaacttaa 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 118
Target Start/End: Original strand, 13897 - 13948
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacccttta 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  13897 tgaagtagataaaatggtcacaaggaatg-ggggtttgaattgtgacccttta 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 1260 - 1315
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatta-tcctgaaactt 136  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1260 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaattattcctgaaactt 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 100
Alignment:
Q  73 gataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaattatcctgaaacttaaaaatgattctcaa 151  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| | ||||||| | | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  176 gataaaatagtcacaaagaagggg--gtttgaattgtgatcttttaaaattaaacctgtaacttaaaattgattctcaa 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 94110 - 94168
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  94110 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 94168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 103553 - 103611
Alignment:
Q  82 gtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccc-tttaaaaatta-tcctgaaacttaa 138  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  103553 gtcacaagaaagggggggtttgaattgtgacccttttaaaaattattcctgaaacttaa 103611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5080 - 5007
Alignment:
Q  271 atagagaagaaagaaagaacacacaaa-gagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaat 343  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  5080 atagataaggaagaaggatcacacaaaagagttatcctggttcacccaatgtgggttaatccagtccccacaat 5007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33 - 5
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 94
Target Start/End: Original strand, 65487 - 65515
Alignment:
Q  66 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  65487 tgaagtagataaaatagtcacaaggaagg 65515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 124660 - 124601
Alignment:
Q  81 agtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgaccctttaaaaatt--atcctgaaacttaa 138  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  124660 agtcacaagaaagggggggtttgaattgtgaccctttttaaatttaatcctgaaacttaa 124601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 163946 - 163886
Alignment:
Q  289 acacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctatg 349  Q
    ||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  163946 acacacaagaagttatcttggttcccccaatgtgggttagtccagtccccacaatactatg 163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 113
Target Start/End: Original strand, 267036 - 267085
Alignment:
Q  62 cacatgaagtagataaaatagtcacaaggaaggagaggtttgaattgtgacc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||    
T  267036 cacatgaagtagataaaatagtcacaaaga--ggggggtttgaattgtgacc 267085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University