View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20736_high_7 (Length: 415)

Name: NF20736_high_7
Description: NF20736
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20736_high_7
NF20736_high_7
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (37-398)||(14084669-14085032)
chr1 (37-333)||(12884107-12884404)
chr1 (37-331)||(48722339-48722637)
chr1 (37-325)||(50552299-50552590)
chr1 (37-333)||(51110070-51110369)
chr1 (37-340)||(18127906-18128213)
chr1 (39-340)||(33124601-33124906)
chr1 (37-332)||(17487252-17487551)
chr1 (37-272)||(27703499-27703737)
chr1 (37-260)||(30899526-30899753)
chr1 (37-334)||(10109514-10109815)
chr1 (152-340)||(20470518-20470706)
chr1 (37-303)||(29208067-29208333)
chr1 (37-333)||(6150503-6150816)
chr1 (37-322)||(20905256-20905545)
chr1 (37-283)||(25930450-25930698)
chr1 (37-333)||(52055347-52055647)
chr1 (34-272)||(12971278-12971503)
chr1 (34-333)||(6333483-6333782)
chr1 (37-272)||(30004877-30005108)
chr1 (37-215)||(50371050-50371228)
chr1 (138-294)||(28189229-28189390)
chr1 (67-215)||(5560399-5560547)
chr1 (15-206)||(17674301-17674492)
chr1 (34-189)||(37873729-37873884)
chr1 (34-189)||(42740052-42740207)
chr1 (34-228)||(15441193-15441387)
chr1 (37-202)||(24556735-24556900)
chr1 (37-214)||(28885640-28885824)
chr1 (62-269)||(1269420-1269620)
chr1 (35-215)||(26486341-26486513)
chr1 (37-272)||(44836695-44836931)
chr1 (34-122)||(13120833-13120921)
chr1 (37-136)||(2-102)
chr1 (61-262)||(3907339-3907541)
chr1 (34-189)||(22386803-22386959)
chr1 (345-399)||(14085033-14085087)
chr1 (38-157)||(9777387-9777507)
chr1 (71-189)||(38263806-38263924)
chr1 (110-215)||(31369432-31369536)
chr1 (228-340)||(28886140-28886251)
chr1 (86-131)||(32810370-32810415)
chr1 (232-323)||(26207184-26207275)
chr1 (361-397)||(14076122-14076158)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (37-331)||(2618155-2618450)
chr6 (37-340)||(3514819-3515125)
chr6 (37-334)||(6360558-6360854)
chr6 (37-334)||(6754003-6754301)
chr6 (37-320)||(57498-57783)
chr6 (40-332)||(29400939-29401232)
chr6 (62-333)||(7525161-7525434)
chr6 (37-246)||(12614685-12614895)
chr6 (152-340)||(31258543-31258732)
chr6 (130-334)||(24455016-24455220)
chr6 (34-224)||(628061-628254)
chr6 (37-214)||(29149316-29149498)
chr6 (34-189)||(3748535-3748690)
chr6 (36-323)||(19231420-19231707)
chr6 (55-272)||(1690621-1690824)
chr6 (34-340)||(29308434-29308724)
chr6 (34-272)||(1093008-1093231)
chr6 (67-333)||(31860815-31861065)
chr6 (61-189)||(30915360-30915488)
chr6 (38-242)||(350306-350508)
chr6 (35-125)||(21946113-21946203)
chr6 (38-237)||(11088450-11088640)
chr6 (242-340)||(12622136-12622234)
chr6 (62-215)||(14893412-14893564)
chr6 (34-106)||(6294279-6294351)
chr6 (37-123)||(22503751-22503838)
chr6 (86-125)||(31234917-31234956)
chr6 (138-202)||(6294208-6294272)
chr6 (147-210)||(7341130-7341193)
chr6 (88-125)||(32056066-32056103)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (37-331)||(28132705-28133000)
chr3 (37-334)||(29387723-29388022)
chr3 (62-340)||(41707050-41707329)
chr3 (37-333)||(51939524-51939822)
chr3 (62-340)||(8363962-8364241)
chr3 (42-340)||(46791671-46791971)
chr3 (37-340)||(21784752-21785057)
chr3 (37-327)||(18407995-18408286)
chr3 (37-333)||(24252416-24252715)
chr3 (37-333)||(52655092-52655390)
chr3 (37-340)||(23067693-23067999)
chr3 (37-334)||(23164541-23164838)
chr3 (37-340)||(27729738-27730041)
chr3 (37-334)||(6715247-6715533)
chr3 (37-272)||(54430412-54430647)
chr3 (37-272)||(25599056-25599291)
chr3 (142-347)||(27110882-27111087)
chr3 (37-281)||(13401311-13401555)
chr3 (34-260)||(36538153-36538375)
chr3 (34-333)||(48626996-48627279)
chr3 (15-215)||(42009209-42009410)
chr3 (15-215)||(27303103-27303303)
chr3 (38-270)||(40152100-40152332)
chr3 (37-269)||(21596199-21596429)
chr3 (34-189)||(7767005-7767163)
chr3 (34-125)||(50677281-50677372)
chr3 (34-272)||(1649798-1650040)
chr3 (205-332)||(51064299-51064424)
chr3 (36-245)||(19965849-19966056)
chr3 (34-175)||(1255019-1255158)
chr3 (46-159)||(46904714-46904827)
chr3 (34-189)||(51146880-51147035)
chr3 (86-201)||(43905862-43905977)
chr3 (37-124)||(15987207-15987294)
chr3 (37-125)||(20762055-20762144)
chr3 (147-200)||(40501273-40501326)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (37-340)||(28463557-28463862)
chr4 (37-340)||(53011506-53011807)
chr4 (37-340)||(32130759-32131063)
chr4 (37-340)||(19661171-19661474)
chr4 (37-331)||(11681711-11682008)
chr4 (37-331)||(11689990-11690287)
chr4 (37-322)||(23426135-23426417)
chr4 (100-340)||(21168847-21169088)
chr4 (37-340)||(41038039-41038345)
chr4 (37-331)||(23256394-23256688)
chr4 (37-340)||(44477829-44478135)
chr4 (41-333)||(27632199-27632489)
chr4 (37-340)||(29221590-29221897)
chr4 (38-232)||(21791518-21791712)
chr4 (15-207)||(35653927-35654120)
chr4 (34-334)||(45172612-45172895)
chr4 (34-215)||(43154755-43154936)
chr4 (80-226)||(16072498-16072645)
chr4 (37-226)||(29579783-29579975)
chr4 (34-199)||(5545261-5545426)
chr4 (34-272)||(34982097-34982321)
chr4 (220-332)||(39372815-39372927)
chr4 (34-189)||(10575490-10575642)
chr4 (62-215)||(22423600-22423753)
chr4 (61-215)||(24449040-24449196)
chr4 (34-201)||(55134138-55134306)
chr4 (38-247)||(26329002-26329211)
chr4 (212-323)||(29579655-29579766)
chr4 (175-252)||(48512330-48512409)
chr4 (232-323)||(16072220-16072310)
chr4 (225-272)||(55134081-55134127)
chr4 (34-92)||(51066389-51066449)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (37-325)||(18015549-18015839)
chr7 (37-333)||(46221672-46221969)
chr7 (37-334)||(33909863-33910159)
chr7 (67-331)||(8358294-8358558)
chr7 (37-333)||(42161091-42161389)
chr7 (37-333)||(36796340-36796636)
chr7 (37-340)||(33419086-33419390)
chr7 (37-297)||(4099801-4100063)
chr7 (37-283)||(11672431-11672681)
chr7 (37-340)||(6380053-6380358)
chr7 (145-334)||(12251466-12251655)
chr7 (37-333)||(44893998-44894299)
chr7 (171-331)||(38524984-38525145)
chr7 (34-235)||(32956670-32956872)
chr7 (62-272)||(7636321-7636536)
chr7 (37-215)||(26633279-26633457)
chr7 (62-340)||(26282537-26282799)
chr7 (80-333)||(25061702-25061954)
chr7 (47-262)||(41908046-41908262)
chr7 (34-210)||(36438318-36438494)
chr7 (34-215)||(18895364-18895545)
chr7 (34-316)||(773849-774121)
chr7 (50-260)||(9479002-9479208)
chr7 (67-272)||(40001696-40001887)
chr7 (34-201)||(1365939-1366106)
chr7 (34-272)||(40841212-40841454)
chr7 (34-272)||(30738986-30739220)
chr7 (34-206)||(7366612-7366784)
chr7 (37-144)||(12251257-12251365)
chr7 (70-265)||(40737994-40738187)
chr7 (34-198)||(42311943-42312106)
chr7 (234-333)||(27432390-27432489)
chr7 (34-210)||(44876123-44876292)
chr7 (34-272)||(28590111-28590347)
chr7 (34-238)||(41852267-41852469)
chr7 (37-215)||(3799731-3799906)
chr7 (34-106)||(25610091-25610163)
chr7 (279-340)||(44877006-44877067)
chr7 (221-272)||(25609964-25610014)
chr7 (221-272)||(1365882-1365932)
chr7 (308-340)||(4099743-4099775)
chr7 (308-340)||(11672391-11672423)
chr7 (232-272)||(32956450-32956489)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (37-334)||(18420578-18420879)
chr8 (37-334)||(7857883-7858180)
chr8 (37-331)||(43968039-43968334)
chr8 (37-333)||(13585098-13585394)
chr8 (34-272)||(32098145-32098383)
chr8 (37-340)||(3471384-3471695)
chr8 (41-340)||(43926296-43926597)
chr8 (37-333)||(44665015-44665308)
chr8 (37-334)||(42951734-42952042)
chr8 (34-340)||(34523918-34524208)
chr8 (151-332)||(3445481-3445661)
chr8 (37-340)||(27074376-27074669)
chr8 (15-209)||(3628694-3628889)
chr8 (34-331)||(5869289-5869579)
chr8 (37-229)||(18112011-18112212)
chr8 (37-201)||(23567244-23567408)
chr8 (36-273)||(39697907-39698130)
chr8 (34-201)||(12531489-12531656)
chr8 (48-241)||(30915268-30915465)
chr8 (61-215)||(35874840-35874996)
chr8 (228-340)||(18111605-18111717)
chr8 (166-261)||(1003958-1004055)
chr8 (38-244)||(33452677-33452885)
chr8 (36-272)||(42777610-42777840)
chr8 (171-272)||(41666040-41666141)
chr8 (37-133)||(1004056-1004155)
chr8 (34-272)||(29372227-29372454)
chr8 (34-185)||(2545893-2546038)
chr8 (34-113)||(36515122-36515202)
chr8 (44-102)||(3575117-3575175)
chr8 (34-125)||(42076114-42076207)
chr8 (190-232)||(3575170-3575212)
chr8 (221-273)||(12531432-12531482)
chr8 (224-272)||(23567418-23567464)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (37-334)||(18676279-18676579)
chr2 (37-340)||(13020212-13020518)
chr2 (37-331)||(7993433-7993728)
chr2 (37-331)||(19367388-19367683)
chr2 (37-340)||(42411527-42411831)
chr2 (37-334)||(6530456-6530754)
chr2 (37-334)||(25222119-25222418)
chr2 (37-340)||(26151716-26152020)
chr2 (37-333)||(41096506-41096806)
chr2 (37-333)||(45618774-45619071)
chr2 (37-334)||(4855786-4856088)
chr2 (37-332)||(36481204-36481489)
chr2 (37-334)||(42759725-42760015)
chr2 (37-323)||(2063616-2063900)
chr2 (37-278)||(12269279-12269519)
chr2 (39-331)||(45042187-45042485)
chr2 (37-226)||(34061825-34062015)
chr2 (34-272)||(18172907-18173130)
chr2 (34-260)||(39081271-39081494)
chr2 (37-209)||(1418832-1419003)
chr2 (34-258)||(36059872-36060095)
chr2 (37-260)||(31273136-31273357)
chr2 (15-245)||(13997204-13997430)
chr2 (34-340)||(15457308-15457598)
chr2 (37-201)||(21747200-21747364)
chr2 (35-270)||(1226234-1226465)
chr2 (34-272)||(17117612-17117828)
chr2 (37-272)||(18916024-18916245)
chr2 (34-201)||(38985676-38985842)
chr2 (36-200)||(27302497-27302661)
chr2 (34-272)||(38599261-38599498)
chr2 (34-207)||(29480604-29480777)
chr2 (118-272)||(9029472-9029625)
chr2 (118-215)||(13001560-13001658)
chr2 (49-159)||(18482488-18482599)
chr2 (133-260)||(32186216-32186342)
chr2 (221-272)||(38985849-38985899)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (37-334)||(16501-16805)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (37-340)||(13423651-13423959)
chr5 (37-332)||(26377742-26378042)
chr5 (37-283)||(13656056-13656305)
chr5 (37-331)||(13474427-13474725)
chr5 (37-332)||(12661102-12661404)
chr5 (37-340)||(36718535-36718841)
chr5 (37-333)||(19099283-19099582)
chr5 (127-331)||(8398778-8398985)
chr5 (37-340)||(43511425-43511712)
chr5 (34-334)||(42291848-42292131)
chr5 (34-209)||(138066-138241)
chr5 (34-332)||(29156004-29156287)
chr5 (37-272)||(17513906-17514138)
chr5 (108-283)||(26311853-26312029)
chr5 (34-272)||(4734549-4734772)
chr5 (36-267)||(27351212-27351444)
chr5 (15-188)||(10033489-10033663)
chr5 (36-273)||(20975855-20976080)
chr5 (34-201)||(10591240-10591407)
chr5 (34-232)||(40956217-40956410)
chr5 (37-201)||(5829315-5829477)
chr5 (34-201)||(3349696-3349862)
chr5 (34-198)||(17325777-17325942)
chr5 (34-125)||(7390367-7390458)
chr5 (43-130)||(18873458-18873545)
chr5 (84-237)||(8379538-8379691)
chr5 (84-247)||(23069102-23069267)
chr5 (36-185)||(931326-931470)
chr5 (35-196)||(40779127-40779288)
chr5 (56-215)||(16515440-16515599)
chr5 (43-125)||(33281680-33281762)
chr5 (34-82)||(8379409-8379457)
chr5 (86-145)||(37029051-37029108)
chr5 (193-282)||(40778695-40778785)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (37-323)||(46143-46429)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (151-340)||(22847-23038)
scaffold0035 (37-106)||(22774-22844)
[»] scaffold0181 (2 HSPs)
scaffold0181 (37-241)||(17101-17307)
scaffold0181 (233-334)||(18128-18229)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (37-224)||(979-1156)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (34-197)||(8360-8525)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 37 - 398
Target Start/End: Original strand, 14084669 - 14085032
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaa--taattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14084669 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattgattattgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatacattttagggg 14084768  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084769 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacctgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 14084868  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14084869 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttaaaggcccgtaacatttggaggtccggtctggttgagcaccttgcacaccctcaaggc 14084968  T
Q  335 agggccagcctattaccttgtacttctcatacgatgatgagcttgacttttttatgagaactaa 398  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084969 agggcctccgtattaccttgtacttctcatacgatgatgagcttgacttttttatgagaactaa 14085032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 12884107 - 12884404
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12884107 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtg 12884206  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12884207 gtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 12884306  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12884307 ttatttaagtaggggttggatattagatttaatttttcgttagaggtccgtagcatgtggaggcccgacctagttgagtaccttacacaccctcaagg 12884404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 48722339 - 48722637
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48722339 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattatttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 48722438  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat---tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48722439 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaaatagagtctagaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatat 48722538  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  48722539 tttttatttaagtggggggtggatattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcactttgcacaccctcaa 48722637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50552590 - 50552299
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50552590 aaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattaggggt 50552491  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta-gaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-tt 233  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50552490 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctacaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 50552391  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacac 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  50552390 ttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggtccatagcatttggagacctggtctggttgagcaccttgcacac 50552299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 51110070 - 51110369
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaa-taattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51110070 aaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaacttattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatagaaattaggggt 51110169  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-tt 233  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51110170 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggataactatagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 51110269  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  51110270 ttttatttaagtgggtggtaggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttacacaccctcaagg 51110369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 18127906 - 18128213
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18127906 aaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattcttgcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggt 18128005  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18128006 ggtttgataggatccgatttacgtac-aaaaggagaactagaatctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatttt 18128104  T
Q  234 t--tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    |  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18128105 ttatttatttaagtgggggctgggtattaaatttaatttttcgttagaggtccgtagcatttagaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 18128204  T
Q  332 ggcagggcc 340  Q
    ||| |||||    
T  18128205 ggccgggcc 18128213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 39 - 340
Target Start/End: Original strand, 33124601 - 33124906
Alignment:
Q  39 aacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtga 137  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  33124601 aacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgacttattaagtgattatacaaattagaggtgg 33124700  T
Q  138 tttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaacta--gagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33124701 tttaataggatccgatttatgtagaaaaaggagaactatagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattt 33124800  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33124801 tttatttaagttggggatgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcgtttggaggcccagcctgattgagcaccttgcacaccctcaaggc 33124900  T
Q  335 agggcc 340  Q
    ||||||    
T  33124901 agggcc 33124906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Original strand, 17487252 - 17487551
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  17487252 aaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgatttattaagtgattatataaattaggggt 17487351  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtac--tgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17487352 ggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaatgtgtacactaaagaaagaaaagaatataacatatatat 17487451  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  17487452 tttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtatcatttggaggcccggcttggttgaggaccttgcacaccctcaag 17487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 27703499 - 27703737
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27703499 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtg 27703598  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27703599 gtttgatagcatcaaatttatgttcaaaaaagagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagaagtaacatatatattttt 27703698  T
Q  237 t---atttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27703699 tttaatttaagtggggggtgggtattagacttaattttt 27703737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30899753 - 30899526
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa---aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30899753 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaattaggg 30899654  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa--aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30899653 gtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatata 30899554  T
Q  232 ttttttatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30899553 ttttttatttaagtgg-gggtgggtatta 30899526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10109815 - 10109514
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10109815 aaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattgctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggt 10109716  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa--aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacata-tatat 232  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | | |    
T  10109715 ggtttgataggatccaatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtaataaaaaaagaaaatgatataacatatttttt 10109616  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||  |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10109615 tttttatttaagtggggggtggatattagatttaatttttcgtttgagacccgtagtatttaaaggctcggcttagttgagcaccttgcacaccctcaag 10109516  T
Q  333 gc 334  Q
    ||    
T  10109515 gc 10109514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20470706 - 20470518
Alignment:
Q  152 atttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggaggg 251  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  20470706 atttatgtacaaaaaggataattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttatgtgggggg 20470607  T
Q  252 tgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20470606 tgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgtaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggcggggcc 20470518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 303
Target Start/End: Original strand, 29208067 - 29208333
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29208067 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccagattgactgattaaatgattatacaaattaggggt 29208166  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29208167 ggtttgatatgattagatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaattcaaacgtgtaccgaagaaagaaaaggatataacatatat-ttt 29208265  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccgg 303  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||   ||  ||||||||||||||    
T  29208266 tttatttaagtgg-gggtgagtattagacttaattttttgtttgaggctcatataatttggaggtccgg 29208333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6150816 - 6150503
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaata-attgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  6150816 aaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaattgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatataaattaggggt 6150717  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat-- 232  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||      
T  6150716 ggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtatagcgaagaaagaaaagaatataacatatatatat 6150617  T
Q  233 -------------tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcacctt 319  Q
                 | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||  |||||||||||    
T  6150616 atatatatatatatatatatttaagtagggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaagcccggcctgattgagcacctt 6150517  T
Q  320 gcacaccctcaagg 333  Q
    ||||||||||||||    
T  6150516 gcacaccctcaagg 6150503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Original strand, 20905256 - 20905545
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  20905256 aaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgactgaataagtgattatacaaattagggct 20905355  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa--aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatata-tat 232  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| | |    
T  20905356 ggtttgataggattagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaataaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaagaatataacatatatttt 20905455  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgca 322  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| ||  | ||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||    
T  20905456 tttttatttaagtcgggggtgagtattagacttaattttttgtttgagacccatgacatttggaggcccggcctgattgatcaccttgca 20905545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25930698 - 25930450
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||| |||||||||| | || |  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  25930698 aaaacaaatggtttatccaaagaaaaaatgattgttgtgatcctttcaatgaaatagcttttcaagttgactgattaagtgattatacaaattaggggta 25930599  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| || | |||    
T  25930598 gtttgataggatcagatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagacaaaaaactcaaacgtgtaccgaaaaaagaaaaggatatcacacattttttt 25930499  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||    
T  25930498 tttatttaagtggagggtgggtattaaacttaaatttttgtttgaggcc 25930450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52055647 - 52055347
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaa-taattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| || |    
T  52055647 aaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaactgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatataaattatggat 52055548  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtct--agaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52055547 agtttgatatgattagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaaaactcaaacgtatactgaagaaagaaaatgatataacatatatttt 52055448  T
Q  234 t-tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    | || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||  || ||| ||  || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  52055447 tattcatttaagtggggagtgggtattagacttaattttttatttgagacccatagcatttggaggctcggcctggttgagcaccttgcactcccccaag 52055348  T
Q  333 g 333  Q
    |    
T  52055347 g 52055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12971503 - 12971278
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12971503 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggg 12971404  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  12971403 gtggtttgataatatcagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 12971317  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12971316 ttttatttaagtggggggtgggtattagagttaattttt 12971278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 333
Target Start/End: Original strand, 6333483 - 6333782
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  6333483 gggaaagcgaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaataaaataactttccaatttgactgattaagtgattttacagattagga 6333582  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaga-aaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||| |    
T  6333583 -tggtttgatagtatcagatttatgtacaggaatgagaactagagtctaaagaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaagaaaaataagtaacatatattt 6333681  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||| ||| || ||  |||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  6333682 tttttatttaaatgggggatgaatattagacataattttttgtttgaggcttgtaacatttggaggtccgccctgttagagcaccttgcactccctcaag 6333781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 30004877 - 30005108
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |         
T  30004877 aaaacgaatggtttatgggaagaacaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattaattgattaagtgattatacaaattgg----- 30004971  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag---aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| ||    
T  30004972 -tttgataggatcggatttatgtacaaaaaggagaagtagagtctagaaaaaaaaactcaaacgtgtaccgaaaaaagaaaaggatataacacatat-tt 30005069  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  30005070 ttttatttaaatgggaggtgggtattagacttaattttt 30005108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50371228 - 50371050
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  50371228 aaaactaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgagggtg 50371129  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    ||||||||| ||||  ||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||    
T  50371128 atttgatagcatcaactttatatccagaaaggagaactagagtctagaagaaatccaaatgcgtattgaagaaagaaaa 50371050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 138 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28189390 - 28189229
Alignment:
Q  138 tttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-----t 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  28189390 tttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctaaaaaaaactcaaacgtgtattgaagaaagaaaatgatataacatatatatattct 28189291  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttg 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||| || ||| ||||||    
T  28189290 tttttatttaagtggggggtgggtattagacttgattttttgtttgagacccgtagcatttg 28189229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5560547 - 5560399
Alignment:
Q  67 attgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaa 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||| || |||    
T  5560547 attgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttggtagcaccagatttatgtccagaaa 5560448  T
Q  167 ggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
     |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5560447 tgagaactatagtctaaaaaaatctcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 5560399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Original strand, 17674301 - 17674492
Alignment:
Q  15 actcttacgtcgtatgaacggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatta 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17674301 actcttacgtcgtaggaaaggggaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgatta 17674400  T
Q  114 agtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaa 206  Q
    ||||||||| || |||   |||| ||| |||| |||| |||||| |  | ||||   ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  17674401 agtgattattcaaattgatggtggtttaatagcatcaaatttatatctagaaagtgaaactagagtctag-aaaaactcatacgtgtactgaa 17674492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 37873729 - 37873884
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||   |    
T  37873729 gggaaaacgaatggtttatgcagaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattaactgattaagtgactatacaaattgatg 37873828  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  37873829 gtggtttgatagcatcaaatttatgtctagaaagtagaactagagtctagaaaaaa 37873884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42740207 - 42740052
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||   |    
T  42740207 gggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgcgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactaattaagttattatacaaattgatg 42740108  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
    ||  |||||||| |||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  42740107 gttgtttgatagcatcaaacttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaa 42740052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15441387 - 15441193
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg 132  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||       
T  15441387 gggaaaatgaatgatttatgcaaaaaagaatta-ttgttgtgattctttttaatgaaatagctttataaattgagtgattaagtgattatacaaattgta 15441289  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatat 228  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||    
T  15441288 ggtggtttgatagcattatatttatgtctagaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtatcgaagaaagaaaaagaagtaacatat 15441193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24556900 - 24556735
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||   ||||    
T  24556900 aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttaaatgaaatagtttttcaaattgacttattaagtgattattcaaattgatggtg 24556801  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtac 202  Q
     ||| |||| | || ||||||||  | ||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24556800 gtttaatagcaccaaatttatgttgagaaagtggaattagagtctagaaaaaactcatacgtgtac 24556735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Original strand, 28885640 - 28885824
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28885640 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttacaatgaaatagctttcaaaattgattgattaagtgattatacaaattatgggt 28885739  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtac--aaaaaggagaactagagt----ctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaa 214  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||      | |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28885740 ggtttgataggatccgatttatgcacaaaaaaaagagaactagagtaaaaaaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaa 28885824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1269620 - 1269420
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||         |||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||||      
T  1269620 aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgactaattt--------tacaaattgggggtggtttcatagcatcagatttatgtct 1269529  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat-tttttatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||    
T  1269528 agaaaggagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtacagaaaaaagaaaaagaaaaaacatatatatatttttatttaagtgaggtgtggatatta 1269429  T
Q  261 gatttaatt 269  Q
    || ||||||    
T  1269428 gacttaatt 1269420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 26486341 - 26486513
Alignment:
Q  35 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||   |     
T  26486341 ggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttatgattttttcaatgaaatagcttttca--------gattaagtgattatacaaattgatga 26486432  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    || |||||||| |||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  26486433 tggtttgatagcatcaaatttatttccagaaagtagaactagagtttagaaaaaactcatacgtgtactaaagaaaaaaaa 26486513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 44836695 - 44836931
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  44836695 aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgat----gtgattctttcagtgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtg 44836790  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag------aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatat 230  Q
     |||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||      |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||  |||||| ||     
T  44836791 gtttgatagcatcaaatttatgttcagaaagtagaactagaatctagaaagaaaaaaaactcatacgtgtatcgaagaaagaaaatgaagtaacatgtaa 44836890  T
Q  231 attttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
      |||| |||||||||| |||| | ||||| | |||||||||    
T  44836891 tattttaatttaagtgg-gggtagatattatacttaattttt 44836931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Original strand, 13120833 - 13120921
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattat 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120833 gggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtggtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattat 13120921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 2
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  102 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatcactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggt 3  T
Q  136 g 136  Q
    |    
T  2 g 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3907541 - 3907339
Alignment:
Q  61 gaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgta 160  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||  |||  ||||||||     
T  3907541 gaaattatttttatgattctttcaatgaaataatttttcaaattgattgattaaatgattatacaaatt-ggagtggtttgataccatcgtatttatgtt 3907443  T
Q  161 caaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttttt--atttaagtggagggtgggtat 258  Q
    || |||| | || || |||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||| ||  |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  3907442 cataaagaaaaaataaagtctaaaaaaaacttaaacgtgtactaaaaaaagaaaaagaagtaacatatttttttttttaatttaagtggagggtggatat 3907343  T
Q  259 taga 262  Q
    ||||    
T  3907342 taga 3907339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 22386803 - 22386959
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaat-aattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg 132  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||       
T  22386803 gggaaaacaaatggtttatgcaaaaaaaatattaattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattgttcaaattgat 22386902  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
    |||| ||  |||| |||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||    
T  22386903 ggtggttaaatagcatcaaatttatgtccagacagtggaactagagtctagaaaaaa 22386959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 399
Target Start/End: Original strand, 14085033 - 14085087
Alignment:
Q  345 tattaccttgtacttctcatacgatgatgagcttgacttttttatgagaactaac 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14085033 tattaccttgtacttctcatacgatgatgagcttgacttttttatgagaactaac 14085087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9777507 - 9777387
Alignment:
Q  38 aaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  9777507 aaacaaatggtttatgagaaaaggtaatgattgttgtgattctttttattgaaatagttattcaaattgactgattgagtgattatataaattgggggtg 9777408  T
Q  137 atttgataggatcagatttat 157  Q
     |||| ||| |||||||||||    
T  9777407 gtttggtagcatcagatttat 9777387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38263924 - 38263806
Alignment:
Q  71 ttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggag 170  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || ||     ||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||  |    
T  38263924 ttgtgattctatcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtaataattcaaatcgatagtggtttaatagcatcaaatttatgtccaaaaagtgg 38263825  T
Q  171 aactagagtctagaaaaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38263824 aactagagtctagaaaaaa 38263806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 215
Target Start/End: Original strand, 31369432 - 31369536
Alignment:
Q  110 attaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaa 209  Q
    |||||||||||||||| |||    ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  31369432 attaagtgattatacaaattgaaagtggtttgataacatcagatttatgtccagaaaggagaattagagtttagaaaaaactcaaacatgttc-gaagaa 31369530  T
Q  210 agaaaa 215  Q
    ||||||    
T  31369531 agaaaa 31369536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Original strand, 28886140 - 28886251
Alignment:
Q  228 tatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccc 327  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | | ||||  |||||||||  |||    
T  28886140 tatattttttatttgagtgaagg-tggatattagatttaattcttcgttaaaggcacgtaacatttgaaggtccgatttggttggacaccttgcaacccc 28886238  T
Q  328 tcaaggcagggcc 340  Q
    | ||||| |||||    
T  28886239 ttaaggccgggcc 28886251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Original strand, 32810370 - 32810415
Alignment:
Q  86 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattag 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  32810370 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattattcaaattag 32810415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26207275 - 26207184
Alignment:
Q  232 ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcac 323  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||  | |||| |||||||||| |||  || |||||||| |||||||    
T  26207275 ttttttatttaagtgtggggtgggtatcagacttaattttttgtttgatacatgtagcatttggaggcccgacctggttgagcatcttgcac 26207184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 397
Target Start/End: Original strand, 14076122 - 14076158
Alignment:
Q  361 tcatacgatgatgagcttgacttttttatgagaacta 397  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14076122 tcatacgatgatgagcttgatttttttatcagaacta 14076158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2618450 - 2618155
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2618450 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 2618351  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2618350 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 2618251  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  2618250 ttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcaatagaggcccgtaacatttggagacccgacctggttgagcaccttgcacactctcaa 2618155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 3514819 - 3515125
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3514819 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgatatagctttccaaattgaatgattacgtgattatacaaattaggggt 3514918  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-tt 233  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3514919 ggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtttagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 3515018  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3515019 ttttatttaagtggggggtgagtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgtaggcccggcttggttgagcaccttgcacaccctcaagg 3515118  T
Q  334 cagggcc 340  Q
    | |||||    
T  3515119 ccgggcc 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6360854 - 6360558
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6360854 aaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaa-taacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggt 6360756  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360755 ggtttgataggatccgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 6360656  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6360655 ttatttaagtggggggtggatattagatttaa-ttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcctggcctgattgagcaccttgcacaccctcaaggc 6360558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6754301 - 6754003
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  6754301 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgactatacaaattagggat 6754202  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754201 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagaatctagaaaaaactcaaacgcgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 6754102  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  6754101 ttatttaagtggggagtgagtattagaattaatttttcgatagaggcccgtagcatttggaggtccgacctgattgaacaccttgcacatcctcaaggc 6754003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 57783 - 57498
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  57783 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttgaatgaaatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggt 57684  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtct-agaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  57683 ggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtttaaaaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaagaaaatgatataacatatatatct 57584  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttg 320  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  57583 tttatttaagtggggagtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccgtagcatttggaggtccgacctggttgagcaccttg 57498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29401232 - 29400939
Alignment:
Q  40 acgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgat 138  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |    
T  29401232 acgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatactaattaggggtagt 29401133  T
Q  139 ttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttttt 237  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29401132 ttgataggattcgatttatgtacaaaaatgaaaactagagtcaagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatatgacatatatatttttt 29401033  T
Q  238 atttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||   ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29401032 atttaagtgga-ggtgggtattatatttaattttttgttagaggcccgtagcatttggaaacccgatctgattgagcaccttgcacaccctcaag 29400939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 333
Target Start/End: Original strand, 7525161 - 7525434
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7525161 aaatgattgttgtgattctttcaataaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttatgtac 7525260  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaag-aaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtatt 259  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7525261 aaaatggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaaaaaaaaggatataatatataaattttttatttaagtggggggtgagtatt 7525360  T
Q  260 agatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||| |||||||| |||  ||||||||||||    
T  7525361 agatttaatttttcgttagagacccgtagcatttggaggccccgtctggttgagcatcttatacaccctcaagg 7525434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 12614685 - 12614895
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12614685 aaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 12614784  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-ttt 234  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12614785 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaactcaaacgtgtact-aaaaaagaaaaggatataacatatatatttt 12614883  T
Q  235 tttatttaagtg 246  Q
    ||||||||||||    
T  12614884 tttatttaagtg 12614895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Original strand, 31258543 - 31258732
Alignment:
Q  152 atttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagt-ggagg 250  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  31258543 atttatgtacaaaaaggataattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttatgtgggggg 31258642  T
Q  251 gtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31258643 gtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgtaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggcggggcc 31258732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24455220 - 24455016
Alignment:
Q  130 aggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa-ttcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatat 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||||||    
T  24455220 aggggtggtttgataggatccgatttatatataaaaaggagaactagagtctagaaaaaaattcaaacgtgtactaaaggatataaa-gatataacatat 24455122  T
Q  229 atattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccct 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  24455121 atattttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcattagaggtccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccct 24455022  T
Q  329 caaggc 334  Q
    ||||||    
T  24455021 caaggc 24455016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 224
Target Start/End: Original strand, 628061 - 628254
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  628061 gggaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagg 628160  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaa--aaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataac 224  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  628161 ggtggtttgataagatctgatttgtgtacaaaaaggtgaactagagtctagaaaagaaaatcaaacatgtactaaagaaagaagaggatataac 628254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29149498 - 29149316
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29149498 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaactaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggtgt 29149399  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat----tcaaacgtgtactgaagaaagaaa 214  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||    
T  29149398 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaacaactcaaacgtgtactaaagaaagaaa 29149316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 3748535 - 3748690
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |    
T  3748535 gggaaaacgaatagtttatgtgacaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgatg 3748634  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
    | | |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3748635 gcggtttgatagcatcaaatttatgtccaaaaagtagaactagaatctaaaaaaaa 3748690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19231707 - 19231420
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||   |||    
T  19231707 gaaaaagaatagtttatacgaaaaagaaatgattgttgtgattttttcaatgtcatagcttttcaaattgattgattaagtga-tatacaaattgaaggt 19231609  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt- 234  Q
      |||||||| | ||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||| |||     
T  19231608 agtttgatagcaccagatttatgtccagaaagtagaactaaactctagaaaaaactcaaacgtgtcctgaagaaa-aaaaaaatgtaacatatatttttc 19231510  T
Q  235 --tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcac 323  Q
      ||||||||||||| |||||  |||||||  |||| |||  ||  || ||| |||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19231509 tatttatttaagtgg-gggtgaatattagacataatattttttttaagacctataacttttggaggtccgacttggttgagcaccttgcac 19231420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 272
Target Start/End: Original strand, 1690621 - 1690824
Alignment:
Q  55 gaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||| | ||||||    
T  1690621 gaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataaattttcaaattgattgatcaagtgattatacaaattggtggtggtttgatagtaccagatt 1690720  T
Q  155 tatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgg 254  Q
    ||||| |||| |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1690721 tatgtccaaataggagaactaaaatttagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatattttatttaagtgga-ggtgg 1690806  T
Q  255 gtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||| |||||||||    
T  1690807 gtattagagttaattttt 1690824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 29308434 - 29308724
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |      
T  29308434 gggaaaacgaatgatttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattacttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggta 29308533  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| | || |||||||| || | || | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||             || ||||||||||    
T  29308534 gtggtttgatagtaccaaatttatgtccagatagaaaaactaaagtttagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taccatatatatt 29308620  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |  || |||| |||| | |||||| |||   |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  29308621 ttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt--tcggaagcctataacttctggaggcccgacttgattgagcaccttgcactccctcaagg 29308717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 1093008 - 1093231
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||| |      
T  1093008 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttca-tgaaatagctttttaaattgactgatttagtcattataccaattggta 1093106  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| | || |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  ||||             ||||||||||| |    
T  1093107 gtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacatgcaaagaag-------------taacatatatagt 1093193  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1093194 ttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt 1093231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31861065 - 31860815
Alignment:
Q  67 attgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaa 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||  | ||||||||||| || | |    
T  31861065 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt-ggggtggtttgata-taccagatttatgtccagata 31860968  T
Q  167 ggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagattta 266  Q
    | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||             |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  31860967 gaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatattttttatttaggtgg-gggtgggtattagagtta 31860882  T
Q  267 atttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    ||||||  ||  |||||  || | ||| |||||||||  |  ||||||||||||||  |||||||||    
T  31860881 atttttttttttaggcccatagcttttcgaggtccggcttgattgagcaccttgcattccctcaagg 31860815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 30915360 - 30915488
Alignment:
Q  61 gaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgta 160  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   || | |||||||| |||| ||||||||     
T  30915360 gaaatgattgttgtgattctttcaattaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtc 30915459  T
Q  161 caaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||    
T  30915460 cagaaagtagaactagagtctagaaaaaa 30915488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 350508 - 350306
Alignment:
Q  38 aaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||   ||||    
T  350508 aaacaaattgtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagctttcgaaattgactgattgagtgattatataaattgatggtg 350409  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||||||| |||| |||||||| |  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| | | |||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  350408 gtttgatagcatcatatttatgtcc--aaaggagaattagtgtctggaaaaaattcaaacatgtaccggaaaaagaaaaagaagtaacatatat-ttttt 350312  T
Q  237 tattta 242  Q
    ||||||    
T  350311 tattta 350306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21946203 - 21946113
Alignment:
Q  35 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21946203 ggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttatggttctttcaatgaaatagcttttcaaatagactgattaagtgattataca 21946113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11088640 - 11088450
Alignment:
Q  38 aaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||        || | ||| ||||||    
T  11088640 aaacaaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagcttttcaaattgactgatta--------tataaattgggggtg 11088549  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||| | |||||    
T  11088548 gtttggtagcatcagatttatgtccaaa--ggagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtaccgaaaaaagaaaaagaagtaacatattttttttt 11088451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 340
Target Start/End: Original strand, 12622136 - 12622234
Alignment:
Q  242 aagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12622136 aagtggatggtggatattagatttaattttttgttagaggtccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggctgggcc 12622234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 14893412 - 14893564
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    |||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||  |||||||| ||||||||||| |      
T  14893412 aaatgattgttgtgattcttttaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattcagagttgtttgatagcatcagatttatatct 14893511  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    | ||||||||| ||||   || |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14893512 agaaaggagaattaga-agtacaaaaaactcaaacatgtactgaagaaagaaaa 14893564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6294351 - 6294279
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattga 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6294351 gggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattgcttttcaaattga 6294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22503838 - 22503751
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattata 123  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||  |||| |||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503838 aaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttttaattctttcaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattata 22503751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 31234956 - 31234917
Alignment:
Q  86 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31234956 tgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattataca 31234917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6294272 - 6294208
Alignment:
Q  138 tttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtac 202  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  6294272 tttgatagcatcaaatttatgcccaaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacatgtac 6294208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7341193 - 7341130
Alignment:
Q  147 atcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaa 210  Q
    |||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  7341193 atcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtctagaaaaaactcatatgtgtactgaagaaa 7341130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 32056103 - 32056066
Alignment:
Q  88 aaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32056103 aaatagctttttaaattgagtgattaagtgattataca 32056066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 28132705 - 28133000
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28132705 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggtg 28132804  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28132805 atttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaatctcaaatgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 28132904  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28132905 ttagttaaatggggggtgggtattatatttaatttttcgttaaaggcccgtaacatttgaaggcccgatctggttgagcaccttgcacaccctcaa 28133000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Original strand, 29387723 - 29388022
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29387723 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggt 29387822  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29387823 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 29387922  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29387923 tttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaagctcgtagcatttgaaggtccggcctggttgagcaccttgcacacactcaaggc 29388022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 62 - 340
Target Start/End: Original strand, 41707050 - 41707329
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  41707050 aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatgcaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtac 41707149  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41707150 aaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagatataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtatta 41707249  T
Q  261 gatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41707250 aatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgaacaccttgcacaccctcaaggctgggcc 41707329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 51939524 - 51939822
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51939524 aaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 51939623  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51939624 tggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtggactaaagaaagaaaaggatataacatatatattt 51939723  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51939724 tttatttaagtggggggtgggtattagatttaattttttgttagaggcccatagaatttggaggccccgcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 51939822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 62 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8364241 - 8363962
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8364241 aaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtac 8364142  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8364141 aaaaaggagaacaagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattttttatttaagtggggggtggatatta 8364042  T
Q  261 gatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8364041 gatttaatttttcgttagaggcccgtagcaattggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggccgggcc 8363962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 42 - 340
Target Start/End: Original strand, 46791671 - 46791971
Alignment:
Q  42 gaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgattt 140  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  46791671 gaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagaggtggttt 46791770  T
Q  141 gataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttat 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46791771 gataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgttataacatatatattttttat 46791870  T
Q  240 ttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46791871 ttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggtccgtagcatttggaggcccgacttagttaagcaccttgcacaccctcaaggcggggc 46791970  T
Q  340 c 340  Q
    |    
T  46791971 c 46791971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 21784752 - 21785057
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21784752 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaactgattaagtgattatacaaattagggg 21784851  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-tt 233  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||    
T  21784852 tggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaataaagttatataacatatatattt 21784951  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| |    
T  21784952 ttttatttaagtgg-gggtgaatattagatttaatttttcgttagagacccgtagcattgggaggcccggcctggttaagcaccttgcacaccctcaaag 21785050  T
Q  334 cagggcc 340  Q
    | |||||    
T  21785051 ccgggcc 21785057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18408286 - 18407995
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaa-taattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18408286 aaaacgaattgtttatgcgaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatggattagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 18408187  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408186 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 18408087  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccc 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||| || ||| ||| |||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  18408086 ttatttaagtggaaggtgggtattatatttaatttttcgttaaagatccgtagcaattgaaggcccggcctaattgaacaccttacacaccc 18407995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24252715 - 24252416
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24252715 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcactgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaagggt 24252616  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat---tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24252615 ggtttgataggatctgatt-atgtacaaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagatataacatatatat 24252517  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24252516 tttttacttaagtcgggggtgggtattagatctaatttttagttagaggcccgtaacatttggaggcccggtctggttgagcaccttacacaccctcaag 24252417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 52655092 - 52655390
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  52655092 aaaacgaatggtttatgcgaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagtggt 52655191  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaga-aaaaattcaaac--gtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52655192 ggtttgataggatccgatttatatacaaaaaggagaactagagtctagagaaaaactcaaacgtgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatat 52655291  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  52655292 tttttatttatgtagggggtggggattagatttaattttt-gttagaggcccataacattt-gaggcccggcctggttaagcaccttgcacaccctcaag 52655389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 23067693 - 23067999
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaa-atgaaataattgt-tgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||| |||||||||||||||  |  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  23067693 aaaacaaatggtttatgcgaattaaaaaatgattgtgtgtgattctttaaatgaaataacttttcaaattgactggtgaagtgattatacaaattagggg 23067792  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23067793 tggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatat 23067892  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23067893 attttatttaaatgg-gggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggtccgtagcaattggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 23067991  T
Q  333 gcagggcc 340  Q
    || |||||    
T  23067992 gccgggcc 23067999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Original strand, 23164541 - 23164838
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23164541 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggt 23164640  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23164641 ggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactgaaaaaagaaaaggatataacatatat-tttt 23164739  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||  |  |||||||||| |||  || ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23164740 ttatttaagtgaggggtgggtattagacataattttttgtttgaggcccatggcatttggaggcccgacctggttgaacaccttgcactcccccaaggc 23164838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 27729738 - 27730041
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatga-aataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27729738 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcgatcaaattgctttccaaattgattgattatgtgattatacaaattaggggt 27729837  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtcta-gaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729838 ggtttgataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctacaaaaaaactcaaacgtgtactaatgaaagaaaatgatataacatatatattt 27729937  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  27729938 tttatttaagtg--gggtacgtattatatttaatttttcgttagaggcccgtaccatttggaggtccgacctgattgagcatcttgcacactctcaaagc 27730035  T
Q  335 agggcc 340  Q
     |||||    
T  27730036 tgggcc 27730041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6715533 - 6715247
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||          || ||||  ||||    
T  6715533 aaaacgaatggtttatgcgaaaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaataactttcaaaattgactgatta----------caaattataggtg 6715444  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | | | || ||||||||||||||||||||    
T  6715443 gtttgataggatccgatttatatacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaatcaaacgtgtattaaa-agatataaagatataacatatatattttt 6715345  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6715344 tatttaaatggagggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtaacatttagaggctcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggc 6715247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54430647 - 54430412
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54430647 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgcaattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 54430548  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  54430547 ggtttgataacatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagcctagaaaaaactcaaacgtgtaccgaaaaaagaaaaggatataacacatat-tttt 54430449  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  54430448 ttatttaagtgggaggtgggtattagacttaattttt 54430412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 25599056 - 25599291
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  25599056 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaacatgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatataaattagaggtg 25599155  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtct--agaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||    
T  25599156 gtttgatagaatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaaaactcaaacctgtactgaagaaagaaaagaatataac--atattttt 25599253  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  25599254 tttatttaagtggagggtagatattagacttaattttt 25599291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 142 - 347
Target Start/End: Original strand, 27110882 - 27111087
Alignment:
Q  142 ataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatt 240  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27110882 ataggatacgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagatataacatatatattttttatt 27110981  T
Q  241 taagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27110982 taagtagggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggccccgcctggttgagcacctt-cacaccctcaaggccgggcc 27111080  T
Q  341 agcctat 347  Q
     ||||||    
T  27111081 tgcctat 27111087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13401555 - 13401311
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcg--aaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  13401555 aaaacaaatggtttatgcgggaaaaaaaaatgattgttgtgattcttccaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagag 13401456  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| || ||| |||||||| |||||  |||| || |||    
T  13401455 tggtttgataggatcgaatgtatgtacaaaaaggagaactagagtttagaaaaaaactcaacgtggaccgaaaaaagaaaaggatat--catacattttt 13401358  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagagg 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||    
T  13401357 tttatttaagtgtagggtgggtattaaacttaaatttttgttcgagg 13401311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 36538153 - 36538375
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  36538153 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatg 36538252  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| |   |||||| ||  ||    
T  36538253 gtggtttgatagcatcaagtttatgtccataaagtataactagagtttagaaaaaactcatacgtgtagtgaaggaaaaaaaag---taacatgtaattt 36538349  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36538350 ttttatttaagt-gagggtgggtatta 36538375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 333
Target Start/End: Original strand, 48626996 - 48627279
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |    
T  48626996 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaagtgattatacaaattggcg 48627095  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  48627096 gtggtctgatagtatcagatttatgtccagatatgagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 48627182  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |  ||||||  || | |||||||| ||||  |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  48627183 ttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt--tatgaggcccatagcttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcaccccctcaagg 48627279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 42009209 - 42009410
Alignment:
Q  15 actcttacgtcgtatgaacggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatta 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42009209 actcttacgtcgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgatta 42009308  T
Q  114 agtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaa 213  Q
    |||||||||||| |||   |||| |||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||    
T  42009309 agtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactaaagtctaaaaaaaactcatacgtgtcatgaagaaaaaa 42009408  T
Q  214 aa 215  Q
    ||    
T  42009409 aa 42009410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27303303 - 27303103
Alignment:
Q  15 actcttacgtcgtatgaacgggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 114  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27303303 actcctacgtcgtaggaaagggaaaacaaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaa 27303204  T
Q  115 gtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaa 214  Q
    ||||||||||| |||   |||| ||| || | |||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||    
T  27303203 gtgattatacaaattgatggtggtttcatggcatcaaatttatgtccataaagtagaagtagagtctagaaaaaacacatacgtgtcctgaagaaaaaaa 27303104  T
Q  215 a 215  Q
    |    
T  27303103 a 27303103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 270
Target Start/End: Original strand, 40152100 - 40152332
Alignment:
Q  38 aaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattt-tttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  40152100 aaacaaatggtttatgcgcaaaagaaatgattgttgtgattcgttttaatgaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattggggatg 40152199  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||| |||||    
T  40152200 atttggtagcatcagatctatgtctaaaaagaagaattagagtctaaaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaaaaaaaagaagtaacatatattttttt 40152299  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtattagatttaattt 270  Q
    | ||||| ||||| ||  |||||||| |||||||    
T  40152300 tgtttaaatggagtgt-tgtattagacttaattt 40152332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21596429 - 21596199
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||| ||||||||  || ||||  |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  21596429 aaaacaaatggtttgagcaaaaaataaatgattgttgtgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgactgattaagtgattatacaaattgggagtg 21596330  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| || |||||    
T  21596329 gtttgatagcatctgatttatgtccagaaaggagaattagagtctagaaaaaacgcaaacgtgtaacgaaaaaagtaaaagaaataacata-at-ttttt 21596232  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtattagatttaatt 269  Q
    ||||||||||| |  ||  ||||||||||||||    
T  21596231 tatttaagtggggcatgaatattagatttaatt 21596199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7767163 - 7767005
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaa---aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatatta 130  Q
    |||||||||||| ||||||| |||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7767163 gggaaaacgaatagtttatgtgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattg 7767064  T
Q  131 ggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
      |||  |||||||| |||| |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  7767063 atggttgtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactggagtctagaaaaaa 7767005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 50677281 - 50677372
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50677281 gggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattgtttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattataca 50677372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 1649798 - 1650040
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  1649798 gggaaaacaaatggcttatgcaaaaaagaattgattgttgcgaagctttcagtgaaatagattttcaaattgaatgattaagtgattatacaaattgggg 1649897  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactg----aagaaagaaaatgata--taacata 227  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  | ||| |||||||||| | |||| |||| | ||| |||||| |    |||||||||||  | |  |||| ||    
T  1649898 gtgatttgatagcaccagatttatgtctagaaaagagaactagattttagacaaaacttaaatgtgtaccgatgaaagaaagaaaaaaaaaagtaacgta 1649997  T
Q  228 tatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1649998 tat-ttttttatttaa-tggagggtgggtattagacttaattttt 1650040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51064424 - 51064299
Alignment:
Q  205 aagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggt 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| | ||||     
T  51064424 aagaaagaaaaagatataacatatatattttttatttaagtggaa--tgggtattagatttaatttttcgttagaggtccgtagtatttggaagcccggc 51064327  T
Q  305 ctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  51064326 ctgattgaacaccttgcacaccctcaag 51064299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 19965849 - 19966056
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattg-ttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |  |    
T  19965849 gaaaacgaatggtttatgcgggaa-aaaatgattgtttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaatttaactaattaagtgattatacaaattggcag 19965947  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaa--aattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||  || |||||||| ||| ||| |||||||| ||  ||    ||||||    
T  19965948 tggtttgatagcatcagatttatgtccaaaaaggagaattagagtttaaaaaaccaactcaaacgtatacggaataaagaaaaagaagta----atatat 19966043  T
Q  233 tttttatttaagt 245  Q
    |||||||||||||    
T  19966044 tttttatttaagt 19966056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 175
Target Start/End: Original strand, 1255019 - 1255158
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||  |    
T  1255019 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaattattgttg--attctttcaatgaaataactttctaaattgaccgattaagtcattatacaaattaaag 1255116  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaacta 175  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1255117 gtcgtttgatagcatcagatttatgtccaaaaagaagaacta 1255158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 46904827 - 46904714
Alignment:
Q  46 ggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgatag 145  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||    
T  46904827 ggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtggtttgatag 46904728  T
Q  146 gatcagatttatgt 159  Q
     |||| || |||||    
T  46904727 catcaaatctatgt 46904714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51147035 - 51146880
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaa-atgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||       
T  51147035 gggaaaacgaatggtttatgcgagagaaaaaataattgttgtgattctttcaataaaatagttttttaaattgactgattaagtga-tattcaaattgat 51146937  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||    
T  51146936 ggtggtttaatagcatcaaatttatgtccaaaaagtggaactagaatctagaaaaaa 51146880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 43905862 - 43905977
Alignment:
Q  86 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||  |||||||| | ||||||||||| || | |||||||||| |||||| ||    
T  43905862 tgaaataacttttcaaattgactgattgagtgattatacaaattgagggtagtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctaaaa 43905961  T
Q  186 aaaattcaaacgtgta 201  Q
    |||  |||||||||||    
T  43905962 aaacctcaaacgtgta 43905977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15987294 - 15987207
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15987294 aaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgatagttgtaattcttttaatgaaataactttcgaaattgaatgattaagtgattatac 15987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20762144 - 20762055
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||||||    
T  20762144 aaaacgaatggtttatgcgacgaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaatagacttccaaattaactgatcaagtgattataca 20762055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Original strand, 40501273 - 40501326
Alignment:
Q  147 atcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||||    
T  40501273 atcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtttaaaaataactcaagcgtgt 40501326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 28463557 - 28463862
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28463557 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaacttgattgattaagtgattatacaaattaggggt 28463656  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28463657 ggtttgataagatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtttactaaagaaagaaaaggatataacatatatattt 28463756  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||| ||    
T  28463757 tttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggtccggcctgattgaacaccttgcacaccttcaaagc 28463856  T
Q  335 agggcc 340  Q
     |||||    
T  28463857 cgggcc 28463862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 53011807 - 53011506
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53011807 aaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 53011708  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  53011707 ggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaattagagtttagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacat--atatttt 53011610  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggca 335  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  53011609 ttatttaaatgggggatgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggagg-ccggtctggttgagcaccttgcacaccctcaaggct 53011511  T
Q  336 gggcc 340  Q
    |||||    
T  53011510 gggcc 53011506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 32130759 - 32131063
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32130759 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 32130858  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32130859 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactagtgtctagaaaaaactcaaacgggtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 32130958  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggca 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| |||||||||| || | || ||||| |||||| ||||||||||||||     
T  32130959 ttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgtgagaagctcgtagcatttggaggcccagcctggttgaacaccttacacaccctcaaggcc 32131058  T
Q  336 gggcc 340  Q
    |||||    
T  32131059 gggcc 32131063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19661474 - 19661171
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||  ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19661474 aaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaggattgttgtgtttctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 19661375  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19661374 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatttt 19661275  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggca 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||     
T  19661274 ttatttaagtgggggatgggtattaaatttaatttttcgttagagacccatagcatttgaagg-cccgcctggttgagcaccttgcacaccctcaaggcg 19661176  T
Q  336 gggcc 340  Q
    |||||    
T  19661175 gggcc 19661171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 11681711 - 11682008
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11681711 aaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattaggggt 11681810  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaa-ggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  11681811 ggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaagaatataatatatatatt 11681910  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11681911 ttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggctcgtagcatttgaaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 11682008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 11689990 - 11690287
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  11689990 aaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattataaaaattaggggt 11690089  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaa-ggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  11690090 ggtttgataggatccgatttatgtaaaaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaagaatataatatatatatt 11690189  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11690190 ttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggctcgtagcatttgaaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 11690287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Original strand, 23426135 - 23426417
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23426135 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagaggt 23426234  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||       
T  23426235 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaagtatataacatatata--- 23426331  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgca 322  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23426332 --tatttaagtagggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagtatttcgaggtccagcctagttgagcaccttgca 23426417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21169088 - 21168847
Alignment:
Q  100 aaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgt 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21169088 aaattgactcattaattgattatacaaattaggggtgatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgt 21168989  T
Q  199 gtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggagg 298  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  21168988 gtacaaaagaaagaaaaggttataacatatatattttttatttaagtgtggggtgggcattagatttaatttttcgttagaggcccgtatcatttggaga 21168889  T
Q  299 tccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21168888 tccggcctggttgagcaccttgcataccctcaaggccgggcc 21168847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41038345 - 41038039
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41038345 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 41038246  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtaca-aaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-t 232  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||| |    
T  41038245 gatttgataggattcgatttatgtacaaaaaaaaaaaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaataaaaaagatataatatatatatt 41038146  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  41038145 tttttatttaaatggggggtggatattagatttaatttttcgttagagacc-gtatcatttggaggcccggcctggttgagcatcttgcacaccctcaag 41038047  T
Q  333 gcagggcc 340  Q
    || |||||    
T  41038046 gccgggcc 41038039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23256688 - 23256394
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23256688 aaaacgaatggtttatgggaagaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatagctttctaaattgactgattaagtggttatacaaattaggggtg 23256589  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata--ttt 234  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  23256588 gtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactggagtctaaaaaaaactcaaatgtgtact-aagaaagaaaaggatataacatatatattttt 23256490  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  23256489 tttgtttaagtgg-gggtggatattatatttaatttttcgttaaagacccataacatttggaggttcggcctgattgagcaccttgcacaccctcaa 23256394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44478135 - 44477829
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  44478135 aaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatttagtgattatacaaattatggg 44478036  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactag-agtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44478035 tggtttgataggatctgatttatgtacaaaaatgataactagaagtttagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaataaaatgatataacatatatat 44477936  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||  || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  44477935 tttttatttaaatgaggggtggatattagattt-atttttcgttagaggtccgtaatatttggaggcccgacctggttgaacaccttacacaccctcaag 44477837  T
Q  333 gcagggcc 340  Q
    || |||||    
T  44477836 gccgggcc 44477829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27632489 - 27632199
Alignment:
Q  41 cgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatt 139  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27632489 cgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgatgtgattctttcaatgaagtagcttttcaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggtggtt 27632390  T
Q  140 tgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttttta 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||    
T  27632389 tgataggatcaaatttatgtacaaaaaggagaactagaatctagaaaaaaactcaaacgtgtactgaagaaagaaaattatataac--atatttttttta 27632292  T
Q  239 tttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||  || || ||||||||||  ||||| |||  ||  ||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27632291 tttaacagggggatgggtattagtcttaatattt--ttttaggcccgtagcatttggaggcccggcctagttgagcaccttgcactccctcaagg 27632199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 29221590 - 29221897
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| | ||    
T  29221590 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattccttcaatgaaatagacttccaaattgaccgtttaagtgattatacaaattaagagt 29221689  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata--t 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  29221690 ggtttgataggatcagatttatgtacaaaaacgagaattagagtctagaaaaaaactcaaacgtgaaatgaagaaagaaaaggatataacatatatattt 29221789  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||  |  |||||||||| || |||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  29221790 tttttatttaagtggggggtgggtattaaacttaattttttgtttgaggcccatggcatttggaggcccagtccggttgagcaccttgcactcccacaag 29221889  T
Q  333 gcagggcc 340  Q
    || |||||    
T  29221890 gccgggcc 29221897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Original strand, 21791518 - 21791712
Alignment:
Q  38 aaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtga 137  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||     
T  21791518 aaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacacattgaaggtgg 21791617  T
Q  138 tttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    |||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21791618 tttgatggcatcaaatttatgttcagaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacatgtactgatgaaagaaaaagaagtaacatatatat 21791712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 35653927 - 35654120
Alignment:
Q  15 actcttacgtcgtatgaacgggaaaa-cgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatta 113  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35653927 actcctacgtcgtaggaaagggaaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgatta 35654026  T
Q  114 agtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaag 207  Q
    |||||||||||| |||   |||| |||||||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  35654027 agtgattatacaaattgatggtggtttgatagcatcatatttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtagtgaag 35654120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Original strand, 45172612 - 45172895
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  45172612 gggaaaacgaatggtctatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatta-gg 45172710  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  45172711 gtggtttgatagtaccagatttatgtccagattggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 45172797  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||   |||| |||| ||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  45172798 ttttatttaagtgg-gggtggatattagatttaattttt--tttgaggcacataacttttgtaggtccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 45172894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 43154755 - 43154936
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  43154755 gggaaaacgaatgatttatgcgaaaaataaataattgttgtgattcttttaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattgatg 43154854  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  43154855 gtggtttgatagcatcaaatttatgtccaaaaagtagaactagaatctagaaaaaactcatacgtgtcctaaagaaagaaaa 43154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16072645 - 16072498
Alignment:
Q  80 tttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagt 179  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  16072645 tttcattgaaatagtttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattagggatggtttgataggatcaaatttatgtacaaaaaggagatctagagc 16072546  T
Q  180 ctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacat 226  Q
     ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16072545 ttagaaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaagaaaatgatataacat 16072498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29579975 - 29579783
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
T  29579975 aaaacgaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatagcttttcaatttgactgattaattaattatacaaattatgggt 29579876  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa---attcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacat 226  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   | |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  29579875 ggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaatagaactagagtctagaaaaagaaactcaaacatgtt-tgaagaaagaaaaggatataacat 29579783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5545426 - 5545261
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |    
T  5545426 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgaccgattaagtgattatacaaattggtg 5545327  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtg 199  Q
    ||| |||||| | |||| |||||||| || | || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5545326 gtggtttgatggcatcaaatttatgtccagacagaagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtg 5545261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34982321 - 34982097
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  34982321 gggaaaacaaatgatttatatgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagtttttccaattgactgattaagtgattatacaaattgggg 34982222  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
     || |||| ||| | ||||||||||| || | || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  34982221 atggtttgttagtaccagatttatgtccagatagaaaaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 34982135  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34982134 ttttatttaagtag-gggtgggtattagatttaattttt 34982097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 332
Target Start/End: Original strand, 39372815 - 39372927
Alignment:
Q  220 ataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcacctt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39372815 ataacatatatattttttatttaagtggcgggtggatattagatttaatttttcgttaaaggcccgtagaatttggaggtccggcctggttgagcacctt 39372914  T
Q  320 gcacaccctcaag 332  Q
    |||||||||||||    
T  39372915 gcacaccctcaag 39372927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Original strand, 10575490 - 10575642
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  10575490 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattatttcaatgaaataactttctaaattgactgattaagtgattatacaagttgagg 10575589  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaa 189  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||  ||||   ||||||||||| |||||||||    
T  10575590 gtggtttgatagcataaaatttatgttaaaaa---agaactagagtttagaaaaaa 10575642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22423753 - 22423600
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||   |||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  22423753 aaataattgttttgattctttcaataaaatagtttttcaaattgattgattaagtgatcatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtcc 22423654  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||||    
T  22423653 agaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtaccaaagaaaaaaaa 22423600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24449196 - 24449040
Alignment:
Q  61 gaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg--gtgatttgataggatcagatttatg 158  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      ||| |||||||| |||| ||||||     
T  24449196 gaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatttata 24449097  T
Q  159 tacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24449096 tccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtactgaagaaagaaaa 24449040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55134306 - 55134138
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaat-gaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg 132  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |     
T  55134306 gggaaaacgaatgatttatgtaaaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggt 55134207  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
     ||| |||||||| | || |||||||| || | | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  55134206 agtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataagagaactaaagtctacaaaaaactcaaacgtgta 55134138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Original strand, 26329002 - 26329211
Alignment:
Q  38 aaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| |||||||||| | ||||  |||| || ||||||||| |||| | ||||  ||||||  ||||||||||||| | |||||||| | ||| | ||||    
T  26329002 aaacaaatggtttatccaaaaaataaatgatcgttgtgattctttttattgaagcagctttctaaattgactgattgaatgattatataaattggaggtg 26329101  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt-t 235  Q
     |||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||| ||| |    
T  26329102 gtttggtagcatcagatttatgtccaaa--ggagaattacagtctagaaaaaattcaaacgtgtaccaaagaaagaaaaagaagtaacatatatttttat 26329199  T
Q  236 ttatttaagtgg 247  Q
    ||||||||||||    
T  26329200 ttatttaagtgg 26329211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29579766 - 29579655
Alignment:
Q  212 aaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttg 311  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||  |||    
T  29579766 aaaaggatataacatatattttttttatttaagtggggggtgagcattagacttaattttttgtttgagacccgtagcatttggaggtccggcctgattg 29579667  T
Q  312 agcaccttgcac 323  Q
    ||||| ||||||    
T  29579666 agcactttgcac 29579655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 252
Target Start/End: Original strand, 48512330 - 48512409
Alignment:
Q  175 agagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttttt--atttaagtggagggt 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  48512330 agagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagaaataacatatattttttttaaatttaagtggggggt 48512409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 16072310 - 16072220
Alignment:
Q  232 ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcac 323  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16072310 ttttttatttatgtgg-gggtgggtattagacttaattttttatttaaggcctttagcattttgaggtctggtctaattgagcatcttgcac 16072220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 55134127 - 55134081
Alignment:
Q  225 atatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  55134127 atatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattagagtaaattttt 55134081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 51066389 - 51066449
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcg--aaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaata 92  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  51066389 gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaata 51066449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Original strand, 18015549 - 18015839
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa---aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18015549 aaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggg 18015648  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18015649 gtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctagaaaaaactcaaacatgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatt 18015748  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacac 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  18015749 ttttatttaagtgg-gggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtaacatttggaggcccggcctggttgagcatcttgcacac 18015839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 46221672 - 46221969
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46221672 aaaacgaatggtttatgcgaataaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattctacaaattaggggt 46221771  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46221772 agtttgataggattcgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 46221871  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46221872 tttatttaagtag-gggtgggtattagatttaatttttcgttagaggtccgtagcatttggaggcccggcctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 46221969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33910159 - 33909863
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33910159 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagcgattatacaaattaggggt 33910060  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| | |||    
T  33910059 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaagaaa--gatataacatat-ttttt 33909963  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33909962 tttatttaagtgaggggtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacacccccaaggc 33909863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Original strand, 8358294 - 8358558
Alignment:
Q  67 attgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaa 166  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8358294 attgttgtgattctttcaatgagataactttttaaattgactgattaagtgattatataaattaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaa 8358393  T
Q  167 ggagaactagagtctaga-aaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagattt 265  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8358394 ggagaactaaagtctagagaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagt-gagggtggatattagattt 8358492  T
Q  266 aatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  8358493 aattttttgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggatgagcaccttgcacaccctcaa 8358558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 42161091 - 42161389
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42161091 aaaacgaatggtttatgcgaagaa-aaattgttgctgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaactgatcaagtgattatacaaattaggggtg 42161189  T
Q  137 atttgata--ggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
     |||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42161190 gtttgatataggatccaatttatgtacaaaaatgagaattagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatt 42161289  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42161290 ttttatttaagtggggggaggatattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggctcggcctggttgagcaccttgcacaccctcaagg 42161389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 36796340 - 36796636
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  36796340 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttccaaattgactgattaagttattatacaaattaaggg 36796439  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactag-agtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36796440 tagtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaag-aaatgatataacatatatatt 36796538  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36796539 ttttatttaaatgggaggtgggtattagattt-atttttcgttagaggtccgtagtatttggagg-ccggcctggttgagcaccttgcacagcctcaagg 36796636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 33419086 - 33419390
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactga-ttaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  33419086 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattattgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgacttaattaagtgattatacaaattagggg 33419185  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33419186 tagtttgataggatccgatttatgtacaaaaacaagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtattaaagaaagaaaaggatataacatatatatt 33419285  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||| || |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  33419286 ttttatttaagtg--gggtggttattagatttaatttttcgttagaggaccgtaatatttggagacccggcctggttgagcaccatgctcaccctcgagg 33419383  T
Q  334 cagggcc 340  Q
    | |||||    
T  33419384 ccgggcc 33419390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4100063 - 4099801
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4100063 aaaacgaatggtttttgcgaagaaaaaaatgattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggt 4099964  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat--tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4099963 ggtttgatag-atccgatttatgtacaaaaaggagaattagcgtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatt 4099865  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggag 297  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  4099864 ttttatttaagtgggaggtgggtattaaatttaatttttcgttagaagcccgtagcatttggag 4099801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11672681 - 11672431
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11672681 aaaacgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggagt 11672582  T
Q  136 gatttgataggatcagatttat--gtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11672581 ggtttgataggatccgatttatatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatat 11672482  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcc 283  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11672481 tttttatttaagtggggggtggatattagatttaatttttcgttaaaggcc 11672431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 6380053 - 6380358
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaa-ataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6380053 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggt 6380152  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6380153 ggtttgataggatcagattcatgtacaaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaataaaatgatataacatatat-tt 6380251  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||   ||||||||| |||| || ||| |||||||||| | ||||||| |    
T  6380252 ttttatttaagtagggagtggatattagacttaattttttgtttgaggcctgtggtatttggaggcccggcctggttaagcaccttgcgctccctcaaag 6380351  T
Q  334 cagggcc 340  Q
    | |||||    
T  6380352 ccgggcc 6380358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 145 - 334
Target Start/End: Original strand, 12251466 - 12251655
Alignment:
Q  145 ggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaag 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12251466 ggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgagataacatatatattttttatttaag 12251565  T
Q  245 tggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12251566 tggagggtgggtattagatttaattttttgatagaggctcgtagcatttggaggtccggcctgattgagtaccttgcacaccctcaaggc 12251655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 44893998 - 44894299
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44893998 aaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaattaggggt 44894097  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | | || ||||||||||||||||||    
T  44894098 ggtttaataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactatagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaag-gatataaagatataacatatatattt 44894196  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgg----gtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctca 330  Q
    ||||||||| ||  ||||||    ||||||||||||||||||  ||||||  | ||| |||||||||| |||  || |||||||| |||| ||| |||||    
T  44894197 tttatttaaatgaggggtgggtatgtattagatttaattttttcttagagatccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcatcttgtacatcctca 44894296  T
Q  331 agg 333  Q
    |||    
T  44894297 agg 44894299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 171 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 38525145 - 38524984
Alignment:
Q  171 aactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatt 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38525145 aactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagatataacatatatattttttatttaagtggagagtgggtattagatttaatt 38525046  T
Q  270 tttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38525045 tttcgttagaggtccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 38524984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32956872 - 32956670
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  32956872 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatcattgttgtgattctttcaatgaaataactttataaattgactgattaaatgattataaaaattgggg 32956773  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtct-agaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| |    
T  32956772 gtggtttgatagcatcagatttatgtccagaaaggagaactagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaagaaaaagaagtaacatatattt 32956673  T
Q  233 ttt 235  Q
    |||    
T  32956672 ttt 32956670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 272
Target Start/End: Original strand, 7636321 - 7636536
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7636321 aaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattaggggtggtttgataggatcagagttatgtac 7636420  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctag------aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtggg 255  Q
    |||| |||||| ||||||||||      |||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  7636421 aaaagggagaagtagagtctagaagaaaaaaaaacttaaacgtgtaccgaaaaaagaaaaagatataacacatat-ttttttatttaagtgggaggtggg 7636519  T
Q  256 tattagatttaattttt 272  Q
    | ||||| |||||||||    
T  7636520 tgttagacttaattttt 7636536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26633457 - 26633279
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  26633457 aaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtg 26633358  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
     ||| |||| |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  26633357 gttttatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtaccgaagaaagaaaa 26633279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 340
Target Start/End: Original strand, 26282537 - 26282799
Alignment:
Q  62 aaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtac 161  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |    
T  26282537 aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtggtttgatagtaccagatttatgtgc 26282636  T
Q  162 aaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattag 261  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26282637 agataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatattttttatttaagtgg-gggtgggtattag 26282722  T
Q  262 atttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    | |||||||||  |  ||||||| || | |||||||| ||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26282723 agttaattttt--tctgaggcctatagcttttggaggcccggcttgattgagtaccttgcactccctcaaggccgggcc 26282799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25061954 - 25061702
Alignment:
Q  80 tttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||  |  |  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25061954 tttcaatgaaatagcttttcaaattaactgataaagtgattgtacaaattgagaatagtttgatagcatcagatttatgtccaaaaagaagaactagagt 25061855  T
Q  180 ctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacata-tatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttag 278  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| | | |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||  ||      
T  25061854 cta-aaaaaattaaaacgtgtaccgaagaaagaaaaagaagtaacatatttttttttttatttaagtagggggtggatattagacttaattttt-ttttt 25061757  T
Q  279 aggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||    
T  25061756 aggcccataatatttggaggtccggcttggttgagcaccttgcactcccccaagg 25061702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41908262 - 41908046
Alignment:
Q  47 gtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgatagg 146  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||| ||     
T  41908262 gtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttctaattgactgattaagtgattgtacaaattggaggtggtttgaaagc 41908163  T
Q  147 atcagatttatgtac-aaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaag 244  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| || |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||     
T  41908162 atcagatttatgtccaaaaaatgagaaccagagtcaagaaaaaaactcaaacatgtaccgaagaaagaaaaagaagtaacatat-ttttttttatttaaa 41908064  T
Q  245 tggagggtgggtattaga 262  Q
      ||||||||||||||||    
T  41908063 aagagggtgggtattaga 41908046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Original strand, 36438318 - 36438494
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||        
T  36438318 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataaattattgttgtgattctttcaatgaaatggtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgata 36438417  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaa 210  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  36438418 gtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtagaactagagcctagaaaaaactcatacctgtactgaagaaa 36438494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 18895364 - 18895545
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||       
T  18895364 gggaaaacgaattgtttatgcgaaaaggaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaattgattatacaaattaata 18895463  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    ||| |||||||  |||| ||||||||  || ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||    
T  18895464 gtggtttgataacatcaaatttatgtctaataagtagaactcgagtctagaaaaaactcatacgtgtatcgaaggaagaaaa 18895545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 316
Target Start/End: Original strand, 773849 - 774121
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcg--aaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattag 131  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  773849 gggaaaacgaatggtttatgcacaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgataaagtaattatacaaattag 773948  T
Q  132 gggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | || ||| || ||||            ||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||     
T  773949 gggtgatttgatagcatcagatttatttccagaaatgataact------------aaagtcaaacatgtactgaagaaagaaaaagaagtaacaaatatt 774036  T
Q  232 t-tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcac 316  Q
    | |||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||  || ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  774037 tatttttatttaagt-aagggtgagtatcagactaaatttttattttgagacctataacttttggaggtccggtttagttgagcac 774121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9479208 - 9479002
Alignment:
Q  50 tatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatc 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||   |||| |||||||| |||    
T  9479208 tatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagttttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatc 9479109  T
Q  150 agatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggag 249  Q
    | |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||     |||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  9479108 aaatttatgtccagaaagtagaactagagtttagaaaaaaatcatacgtgtattaaagaaaaaaaa----gtaacatgtaattttttaatttaagtggag 9479013  T
Q  250 ggtgggtatta 260  Q
     ||||||||||    
T  9479012 agtgggtatta 9479002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 272
Target Start/End: Original strand, 40001696 - 40001887
Alignment:
Q  67 attgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaa 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| | ||||||||||| || | |    
T  40001696 attgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattggaggtggtttgatagtaccagatttatgttcagata 40001795  T
Q  167 ggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagattta 266  Q
    | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||             ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  40001796 gaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatattttttatttaagtag-gggtgggtattagagtta 40001881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1366106 - 1365939
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |      
T  1366106 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaataacttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggta 1366007  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
    ||| |||||||| | || |||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  1366006 gtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaagaaactcaaacgtgta 1365939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 40841212 - 40841454
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg- 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| |||  |||| ||||  ||||||| |  |||||| |||||||| ||||||     
T  40841212 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgagtgttgtaattcttttaatagaataactttataaattgattagttaagtaattatacaaattagga 40841311  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    |||| |||||||  |||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||| |    
T  40841312 ggtggtttgataacatcatatttatgtccaaaaagaataattagagtctagaaaaaactcaaacatgtactgaagaaagaaaaagaagaaacatatattt 40841411  T
Q  233 t---ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |   |||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  40841412 tttattttatttcagtggggtgtgggtattaaacttaattttt 40841454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30739220 - 30738986
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |    
T  30739220 gggaaaactaattgtttatgcgaaaaggaaatgatcgttgtgattcttttaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattataaaaattgaag 30739121  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
     || |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||     | |    
T  30739120 atggtttgatagcatccgatttatgtccagaaaggagaattggaatctagaaaaaaactcaaacgtgtaccgaaaaaagaaaaagaagtaac-----ttt 30739026  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||    
T  30739025 tttttatttaagtgtggtgtgtgtattagacttaattttt 30738986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7366784 - 7366612
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| || |||   |    
T  7366784 gggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttcaaattgacaaattaagtaattattcaaattgatg 7366685  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaa 206  Q
    ||| ||| |||  |||| |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  7366684 gtggtttaatatcatcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtatagaaaaaactcatacgtgtgctgaa 7366612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 144
Target Start/End: Original strand, 12251257 - 12251365
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  12251257 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaaatgattatagaaattaggggt 12251356  T
Q  136 gatttgata 144  Q
    | |||||||    
T  12251357 ggtttgata 12251365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 265
Target Start/End: Original strand, 40737994 - 40738187
Alignment:
Q  70 gttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaagga 169  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||   |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||| |    
T  40737994 gttgtgattctttcaataaaatagctttttaaattgactgattaagtaattatacaaattgatggtggtttgatagcatcaaatttatgtcaaaaaagta 40738093  T
Q  170 gaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagattt 265  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||  |  |||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40738094 gaactagagtttagaaaaaactcatacgcgtaccgaataaa-aaaaaaacgtaacatgtaattttttaatttaagtgg-gggtgggtattatattt 40738187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42312106 - 42311943
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||    
T  42312106 gggaaaacgaattatttaagcgaaaaataaatgactgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgactaatcaagtgattatacaaatcgagg 42312007  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgt 198  Q
    ||  |||| ||  ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42312006 gtagtttg-taacatcagatttatgtccagaaaagagaattagagtctagaaaaaactcaaacgt 42311943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27432489 - 27432390
Alignment:
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | || || |||||||||||| |||||||||||||    
T  27432489 ttttatttaagtgtggggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttgaaggccgggcctggttgagcaccttacacaccctcaagg 27432390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 210
Target Start/End: Original strand, 44876123 - 44876292
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || | ||| ||     
T  44876123 gggaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttctaaattgactgattaaatgattttaaaaatt-ggt 44876220  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaa 210  Q
    | | |||||||| |||| ||||||||||    ||||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||    
T  44876221 gcggtttgatagtatca-atttatgtac----aggagaactagagtctaaaaaaaactcaatcatatactgaagaaa 44876292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 28590111 - 28590347
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||| | ||| ||||||| |||||| | ||| |||    
T  28590111 gggaaaacgaatggtt-acgcgaaaaagaaataattgttgtgattcttttaatgaaatag--ttaaaaagtaactaattaagtaattatataaattgggg 28590207  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaac--gtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata 231  Q
    ||| |||| ||| |||  |||| ||| || |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||  |   ||||||| |     
T  28590208 gtggtttggtagcatcgtatttttgtccagaaaggataacta-aatctagaaaaaactcaaacatgtatacggaagaaagaaaaaaaagcaacatatttt 28590306  T
Q  232 ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
     |||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  28590307 gtttttaattaagtggaatgtggatattagacttaattttt 28590347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 238
Target Start/End: Original strand, 41852267 - 41852469
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||     
T  41852267 gggaaaatgaattatttatgcaaaaaagaaatgagtgttgcgattctttcaatgaaataactctttaaattgactgagtaagtgattata-aaatt-gga 41852364  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| ||| |||| | || |||||  | |  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||  |  |||||||||| ||    
T  41852365 gtggttttatagcaccatatttacatcctgaaaggagaactaaagtctagaaaaaacccaaacgtgtattaaagagagaaaaataagtaacatatatttt 41852464  T
Q  234 tttta 238  Q
    |||||    
T  41852465 tttta 41852469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 3799731 - 3799906
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||||||  || | ||||    
T  3799731 aaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttccaaaattggcttattaaatgattatacaatttggaggtg 3799829  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
     ||||| || |||| |||||  | || |||||||||||| | |||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  3799830 gtttga-agcatcaaattta-atccagaaaggagaactaaaatctaaaagaaacccaaacgcgtaatgaagaaagaaaa 3799906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 25610163 - 25610091
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattga 106  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  25610163 gggaaaactattggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatgacttttcaaattga 25610091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 340
Target Start/End: Original strand, 44877006 - 44877067
Alignment:
Q  279 aggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  44877006 aggcccgtaacatttgaaggcccggcctagtagagcaccttgcactccctcaaggccgggcc 44877067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25610014 - 25609964
Alignment:
Q  221 taacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25610014 taacatacatattttttatttaaatgga-ggtgggtattagagttaattttt 25609964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1365932 - 1365882
Alignment:
Q  221 taacatatatattttt-tatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  1365932 taacatatatatttttatatttaagtgg--ggtgggtattagagttaattttt 1365882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4099775 - 4099743
Alignment:
Q  308 gttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4099775 gttgagcaccttgcacaccctcaaggccgggcc 4099743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11672423 - 11672391
Alignment:
Q  308 gttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11672423 gttgagcaccttgcacaccctcaaggccgggcc 11672391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32956489 - 32956450
Alignment:
Q  232 ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32956489 ttttttatttaagtgg-gggtgggttttagatttaattttt 32956450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Original strand, 18420578 - 18420879
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  18420578 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaagtgt 18420677  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataac--atatatat 232  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18420678 ggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctggaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatat 18420777  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  18420778 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaagcccgtaacatttggaggcccgacctagttgaaaaccttgcacaccatcaag 18420877  T
Q  333 gc 334  Q
    ||    
T  18420878 gc 18420879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7858180 - 7857883
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7858180 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaattaactttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 7858081  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7858080 gatttgataggatccgatttatgttcaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 7857981  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7857980 tttatttaagtg--gggtgggtattaaatttaatttttcgttagaagcccgtagcaattggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaaggc 7857883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 43968039 - 43968334
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43968039 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattaggagt 43968138  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  43968139 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatattttt 43968238  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  43968239 ttta-ttaagtgtggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaatatttggaggcccaacctgattgagcaccttgcacactctcaa 43968334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13585394 - 13585098
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13585394 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaattgattatacaaattaggggt 13585295  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13585294 ggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaagaaaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataac--atatattt 13585197  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  13585196 tttagttaaatggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgttgcatttgaaggcccggtctgattgagcaccttgcacacccttaagg 13585098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 32098145 - 32098383
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |     
T  32098145 gggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgatcatacaaattaaga 32098244  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  32098245 gtggtttgatagcatcaaatttatgtccaaaaaggataactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactgaagaaagaaaaagaagtaacatatatatt 32098344  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32098345 ttttaattaagtggggggtgggtattagacttaattttt 32098383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3471695 - 3471384
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3471695 aaaatgaatggttcatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 3471596  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag------aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacata-t 228  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||      |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3471595 ggtttgatagaatcacatttatgtacaaaaatgagaactagattctagaaagaaaaaaaactcaaatgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatt 3471496  T
Q  229 atattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccct 328  Q
     | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||| |||     
T  3471495 tttttttttatttaagtggggggtgggtattacacttaattttttgtttgaggcccgtagcatttggaggtccgacctggttgagcatcttgcactcccc 3471396  T
Q  329 caaggcagggcc 340  Q
    |||||| |||||    
T  3471395 caaggccgggcc 3471384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 340
Target Start/End: Original strand, 43926296 - 43926597
Alignment:
Q  41 cgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatt 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  43926296 cgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattatgggtggtt 43926395  T
Q  140 tgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaa-gaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || || | |||  ||||||||||||||||||||    
T  43926396 tgataggatccgatttatatacaaaaagtagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaatgatataaa--gatataacatatatattttt 43926493  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcag 336  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||  |||  ||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  43926494 tatttaagtgggaggtgggtattaaatttaatttttccttagaggcccgtggcatttggagacccgacctgattgagcaccttgcacaccctcaaggccg 43926593  T
Q  337 ggcc 340  Q
    ||||    
T  43926594 ggcc 43926597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 44665015 - 44665308
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  44665015 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaatagactgattaagtgatgatacaaattagaggt 44665114  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtc--tagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  44665115 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctataaaaaaaactcaaacgtgt----aagaaagaaaaagatataac--atatatt 44665208  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  44665209 ttttatttaagtgaggggtgggtattagatttaattatgcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcttgattgagcaccttacacaccctcaagg 44665308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Original strand, 42951734 - 42952042
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgt----tgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattag 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42951734 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgtgtgattctttcaataaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattag 42951833  T
Q  132 gggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-----aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacat 226  Q
    | ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42951834 gagtggtttgataggattcgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacat 42951933  T
Q  227 ata-tattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacac 325  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  || ||||| || |||||  ||  | |||||||||||||||    
T  42951934 atatttttttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgctagaagcccatagcatttagaagtccgaactgatcgagcaccttgcacac 42952033  T
Q  326 cctcaaggc 334  Q
    |||||||||    
T  42952034 cctcaaggc 42952042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Original strand, 34523918 - 34524208
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  34523918 gggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggg 34524017  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  34524018 gtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 34524104  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  34524105 ttttatttaagtgg-gggtgggtattagatttaattttt--tctgaggcccgtagcttttggaggtccggcttgattgagcaccttgcactccctcaagg 34524201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3445661 - 3445481
Alignment:
Q  151 gatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3445661 gatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaattcaaacgtgtactaaagaaagaaaaagatataacatatatattttttatttaagtgg-gg 3445563  T
Q  251 gtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3445562 gtgggtattagatttaattcttcgttagaaacccgtagcatttgaagacccggtctcattgagcaccttgcacaccctcaag 3445481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27074669 - 27074376
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27074669 aaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagacttttaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 27074570  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |          |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27074569 ggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagtactagagtaggg----------agtgagtattgaagaaagaaaatgatataacatatat-tttt 27074481  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggca 335  Q
    |||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |  |  |||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  27074480 ttatttaagtagggagtgagtattagacttaattttttgtttgaggtccattgcatttgaaggcccgatctaattgagcatcttgcactccctcaaggcc 27074381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Original strand, 3628694 - 3628889
Alignment:
Q  15 actcttacgtcgtatgaa-cgggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatta 113  Q
    |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3628694 actcctacgtcgtaggaaacggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgatta 3628793  T
Q  114 agtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaa 209  Q
     ||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||| |||||||  || || | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3628794 tgtgattatacaaattaatggtggtttgatagcatcaaatttatgaccagaatgtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtactgaagaa 3628889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 331
Target Start/End: Original strand, 5869289 - 5869579
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |    
T  5869289 gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattttaaaaatt-gtg 5869387  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |  |||||||| | ||    
T  5869388 gtggtttgatagtatca-atttatgtacagaaaggagaactaaagtctaaaaaaaactcaatcgtgtactgaataaagaaaaataagtaacatat-tttt 5869485  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||   ||  ||||| ||| |||||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  5869486 ttttattt-agacgagggtgggtattagacataatttt---ttttaggccagtaccatttggaggcccggcctggtagagcaccttgcactccctcaa 5869579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18112212 - 18112011
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18112212 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggag 18112113  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-------aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacata 227  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||       |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18112112 tggtttgatatgatccgatttatgtacataaaagagaactagattctagaaagaaaaaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaatgatataacata 18112013  T
Q  228 ta 229  Q
    ||    
T  18112012 ta 18112011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 23567244 - 23567408
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23567244 aaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatcattgttgtgatactttcaatgaaatagtatttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtg 23567343  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
     |||||||| | ||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  23567344 gtttgatagtagcagatttatgttcagataagagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgta 23567408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
Target Start/End: Original strand, 39697907 - 39698130
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  39697907 gaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactaattaaatgatcatacaaattggtggt 39698006  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||| | || |||||||   | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||||    
T  39698007 ggtttgatagtaccaaatttatgccaagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatttt 39698093  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttc 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  39698094 ttatttaagtgga-ggtgggtattaaagttaatttttc 39698130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12531656 - 12531489
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  12531656 gggaaaacaaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagatttttaaattgactgattaagtgattatacaaattggag 12531557  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
    ||  |||||||| |  |||||||||| |  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12531556 gtagtttgatagtacaagatttatgttcggataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 12531489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 241
Target Start/End: Original strand, 30915268 - 30915465
Alignment:
Q  48 tttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgatagg 146  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||     
T  30915268 tttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattggaggaggtttggtagc 30915367  T
Q  147 atcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat---tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttattt 241  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||    | ||| || ||| ||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||    
T  30915368 atcagatctatgtccagaaaggagaattagagtctaaaaaaaaaaacttaaatgtataccgaagaaagaaaaaaaagtaacatatattttttttattt 30915465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35874996 - 35874840
Alignment:
Q  61 gaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg--gtgatttgataggatcagatttatg 158  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      ||| |||||||| |||| ||||||     
T  35874996 gaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgatatagtggtttgatagcatcaaatttata 35874897  T
Q  159 tacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35874896 tccagaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtactgaagaaagaaaa 35874840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18111717 - 18111605
Alignment:
Q  228 tatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccc 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  18111717 tatattttttatttaagttgagggtgggtgttagatttaatttttcgatagagacccatagcatttggaggtccgacctgattgagcaccttgcacaccc 18111618  T
Q  328 tcaaggcagggcc 340  Q
    ||||||| |||||    
T  18111617 tcaaggccgggcc 18111605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1004055 - 1003958
Alignment:
Q  166 aggagaactagagtctagaaaaaat--tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattag 261  Q
    |||||||||||||| | |||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1004055 aggagaactagagtttcgaaaaaaaactcaaacatgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggggggtgggtattag 1003958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33452885 - 33452677
Alignment:
Q  38 aaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||| | ||||    
T  33452885 aaacaaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattaaaataacttttcaaattgattaattgagtgattatataaattggaggtg 33452786  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgata--taacatatatat-t 233  Q
     |||||||  || |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| || |  ||||||| |||| |    
T  33452785 gtttgataccataagatttatgtccaaaa--gagaattagagtctagaaaaaactcaaactggtaccgaagaaagaaaaagaaaagtaacatacatatat 33452688  T
Q  234 ttttatttaag 244  Q
    |||||||||||    
T  33452687 ttttatttaag 33452677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42777840 - 42777610
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||         ||| ||| |||||    
T  42777840 gaaaacgaatggtatatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaattaaatagctttctaaattgactaattac--------acaaattgggggt 42777749  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataac--atatatatt 233  Q
    | |||||||  |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||  | | |||  |||||| ||    
T  42777748 ggtttgatatcatcatatttatgtatagaaaggagaattagaatctagaaaaaattcaaacgtgtatcgaaaaaaaaaaaaaaaaaaacagatatatctt 42777649  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||    
T  42777648 ttttatttaagtagggtgtggatattagacttaattttt 42777610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 272
Target Start/End: Original strand, 41666040 - 41666141
Alignment:
Q  171 aactagagtctagaaaaaat--tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaat 268  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  41666040 aactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaagaagatgaagtaacatatatattttttatttaagtg--gggttggtattagacttaat 41666137  T
Q  269 tttt 272  Q
    ||||    
T  41666138 tttt 41666141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1004155 - 1004056
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcga--aaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagctttt-caaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1004155 aaaacgaatggtttatgcgatgaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggg 1004056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29372454 - 29372227
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||    
T  29372454 gggaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtcattctttcaattgaataactttccaaattgactgattaaatgattatacaaattgtgg 29372355  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||  |||||||| |       ||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||     ||||    |||||||||  ||    
T  29372354 gtagtttgatagca-------tatgtccagaaaggaaaactaaagtttagaaaaaactcaaacatgtactaaagtttccaaat----taacatataattt 29372266  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  29372265 tttaatttaagtgggtggtgggtattagacttaattttt 29372227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 185
Target Start/End: Original strand, 2545893 - 2546038
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||      ||||||| ||||  ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||    
T  2545893 gggaaaacgaatggtttatacgaaaaa-----aattgttttgatagtttcaatgaaataacttcccaatttgattgattaagtgattatata-atttggg 2545986  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa 185  Q
    |||||||||||| ||  || ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  2545987 gtgatttgatagcatgcgaattatgtcaaataaggagaactagagtctagaa 2546038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 36515122 - 36515202
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatta 113  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  36515122 gggaaaacaaatgatttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattaactgatta 36515202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 102
Target Start/End: Original strand, 3575117 - 3575175
Alignment:
Q  44 atggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3575117 atggtttatgcaaaaatgaaatgatttaggtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 3575175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 42076207 - 42076114
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaa--ataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||  ||  || ||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42076207 gggaaaacgaatagtttatgcggaaaaaaataattattattatgattctttcaatgttatagcttttcaaattgattgattaagttattataca 42076114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 232
Target Start/End: Original strand, 3575170 - 3575212
Alignment:
Q  190 ttcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  3575170 ttcaaacgtgtactgacgaaagaaaatgaagtaacatatatat 3575212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12531482 - 12531432
Alignment:
Q  221 taacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttc 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  12531482 taacatatctattttttatttaagtg--gggtgggtattagagttgatttttc 12531432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 272
Target Start/End: Original strand, 23567418 - 23567464
Alignment:
Q  224 catatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  23567418 catatatattttttatttaagtgga--gtgggtatcagagttaattttt 23567464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Original strand, 18676279 - 18676579
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18676279 aaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagttattatacaaattagggg 18676378  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18676379 tagtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatatt 18676478  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| | |||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  18676479 ttttatttaagtgaggggtgggtattagatttaatttttcgttagaaacccgtagcatttggatgcccggcctggttgagcaccttgcacactctcaagg 18676578  T
Q  334 c 334  Q
    |    
T  18676579 c 18676579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13020518 - 13020212
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13020518 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 13020419  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa--aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-t 232  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13020418 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatt 13020319  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  13020318 tttttatttaagtgg-gggtgggtattaaatttaatttttcgttagaggcccgtagcaattggaggcccgccctggttgagcaccttgcacaccctcaag 13020220  T
Q  333 gcagggcc 340  Q
    || |||||    
T  13020219 gccgggcc 13020212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7993728 - 7993433
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataa--ttgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7993728 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaagattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattggctgattaagtgattatacaaattagggg 7993629  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7993628 tggtttgataggatccggtttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattt 7993529  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  7993528 tttatttaaatagggggtgggtattaaatttaatttttcgttagagg-ctgtagcatttggaggcccggtcagattgagcaccttgcacaccctcaa 7993433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Original strand, 19367388 - 19367683
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19367388 aaaacgaatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 19367487  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19367488 ggtttgatagaatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatattt 19367587  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  19367588 tttatttaaatgggggataggtattagatttaa-ttttcgttagagacccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaa 19367683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 42411527 - 42411831
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaa-atgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42411527 aaaacgaatggtttatgcgaagtaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactaattaagtgattatacaaattaggggt 42411626  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  42411627 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatatatt 42411726  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggca 335  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  42411727 ttttttaagtgggggttgggtattagatttaatttttcgttagaggctcttagcaattggaggcccggcctgattgagcaccttgcacaccctcaatgcc 42411826  T
Q  336 gggcc 340  Q
    |||||    
T  42411827 gggcc 42411831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6530754 - 6530456
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatga-aataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6530754 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcaatgaaataccttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 6530655  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6530654 ggtttgatagtatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaaacttaaacatctactaaagaaagaaaaggatataacgtatatattt 6530555  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6530554 tttatttaagtgg-gggtggatattagatttaatttttcgttagaggcccgtatcatttagaggtccggtctcgttgagcaccttacacaccctcaaggc 6530456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 25222418 - 25222119
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  25222418 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttctaaattgactaattaagtgattatacaaattaggaat 25222319  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25222318 gatttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactaaagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 25222219  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggc 334  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  25222218 tttatttaagtaggcggtcggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggttgagcacctttcataccctcaaggc 25222119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 26151716 - 26152020
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26151716 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 26151815  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactag-agtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26151816 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaaggatataacatatatatt 26151915  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||||||||    
T  26151916 ttttatttaaatgg-gggtgggtattagattt-atttttcgttagagacccgtagcatttggaggcccgacctggttgagcatcttgcacaccctcaagg 26152013  T
Q  334 cagggcc 340  Q
    | |||||    
T  26152014 ccgggcc 26152020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 41096506 - 41096806
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41096506 aaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 41096605  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat- 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41096606 tgatttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaatgtgtactaaagaaagaaaaggatataacatatatata 41096705  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  41096706 tttttatttaagtggggggtgggtattaaatttaatttttcgttagagacccgtagcatttagaggtccggcctgattgagtaccttgcacaccttcaag 41096805  T
Q  333 g 333  Q
    |    
T  41096806 g 41096806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45619071 - 45618774
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45619071 aaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttc-caaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 45618973  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactag-agtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-tt 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45618972 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagaagtctagaaaaaactcaaacgtatactaaagaaagaaaaggatataacatatatattt 45618873  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  45618872 ttttatttaaatggggggtgggtattagattt-atttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggcctggctgagcaccttgcacaccctcaagg 45618774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4856088 - 4855786
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4856088 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattcactgattaagtgattatacaaattaggggt 4855989  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatg-tacaaaaaggagaact-agagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata 231  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | |||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  4855988 ggtttgataggatctgatttatgttacaaaaaggagaactaaaaatctagaaaaaaaactcaaacgtgtacgaaagaaagaaagggatataacatatata 4855889  T
Q  232 -ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctca 330  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4855888 tttttttatttaaatggagggtgggtattagattt-atttttcgttagaggcccgtagaatttggaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctca 4855790  T
Q  331 aggc 334  Q
    ||||    
T  4855789 aggc 4855786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36481489 - 36481204
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||| |||||||||    
T  36481489 aaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttcca----------ttaagtgattatacaaattaggggt 36481400  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36481399 ggtttgaaaggatccaatttatgtacaaaaaggagaattagagtctaaaagaaactcaaatgtgtact-aagaaagaaaatgatataacatatatatttt 36481301  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36481300 ttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggtccggcctggttgagcaccttgcacaccctcaag 36481204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Original strand, 42759725 - 42760015
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||        || | |||| ||||    
T  42759725 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgatta--------taaaaattatgggt 42759816  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt 234  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42759817 ggtttgatatgatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatattt 42759916  T
Q  235 ttt-atttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42759917 ttttatttaagtgg--ggtggatattagatttaatttttcgttagaggcctgtagcatttggaggcccgacctagttgagcaccttgtacaccctcaagg 42760014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2063900 - 2063616
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcga-aaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||| ||||  |||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2063900 aaaacgaatggtttttgcgggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 2063801  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || | | || |    
T  2063800 ggtttgataggattatatttatgtacaaaaaggaaaactagagtctaaaaaaaactcaaacgtataccgaagaaagaaaaggatataatat-ttttttat 2063702  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcac 323  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  2063701 ttatttaagtg--gggtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccgtagtatttggaggcccggtctggttgaacaccttgcac 2063616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12269519 - 12269279
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12269519 aaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgtggtgatttttttaatgaaatagctttccaaatc-actgattaagtgattatacaaattaggggt 12269421  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12269420 ggtttgataggatctgatttatgtgcaaaaaagagaactagagtctaaaaaaaattcaaatgtgtactaaagaaaaaaaatgatataacatatatatttt 12269321  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttag 278  Q
    |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12269320 ttatttaagctg-gggtggatattagatttaatttttcgttag 12269279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 45042485 - 45042187
Alignment:
Q  39 aacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttca---aattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45042485 aacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagactttcaccaaattgactgattaagtgattatacaaattagggg 45042386  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa--aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  45042385 tggtttgataggatcaaatttatgtacgaaaagaagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtatactgaagaaagaaaatgatatgacatatattt 45042286  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||||||||||| |   | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  45042285 tttttatttaaataaggagtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccataacatttggaggcccgacctgattgagcaccttgcgctccctcaa 45042187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 34061825 - 34062015
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  34061825 aaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgattaagtaatcatacaaattatgggt 34061924  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacat 226  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34061925 ggtttgataggaccagatttatgtacaaaaagaagaactatagtctaaaaaaaactcatacgtgtactgaagaaagaaaaagatataacat 34062015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 18172907 - 18173130
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18172907 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgagtgattaagtgattatacaaattaggg 18173006  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  18173007 gtggtttgatagtaccagatttatgtccatataggagaa-taaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 18173092  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18173093 ttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt 18173130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39081494 - 39081271
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  39081494 gggaaaactaatggtttatatgaaaa-gaaataattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatg 39081396  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||  ||    
T  39081395 gtggtttgatagcatcaaatttatgtccagaaagtaaaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtactgaagaaaaaaaaaga-gtaacatgtaattt 39081297  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||    
T  39081296 tttaatttaagtgg-ggatgggtatta 39081271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1419003 - 1418832
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  1419003 aaaatgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttacaaattgactgattaagtgattatacaaattgatggtg 1418904  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaa 209  Q
     |||||||| |||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1418903 gtttgatagcatca-aattatgtctaaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtactgaagaa 1418832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 258
Target Start/End: Original strand, 36059872 - 36060095
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||   |    
T  36059872 gggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtggttctttcaatgaaatagctttttaaattaactgattaagtgattatacaaattgatg 36059971  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| |||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| ||||  ||||||||||| ||  |||||| ||  ||    
T  36059972 gtggtttgatagcatcaaatttttgtctaaaaagtagaactagagtctagaaaaaacttatacgcgtaccaaagaaagaaaaagaagtaacatgtaattt 36060071  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtat 258  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36060072 tttaatttaagtgg-gggtgggtat 36060095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 260
Target Start/End: Original strand, 31273136 - 31273357
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  31273136 aaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgaatgttatgattcttttaatgaaatagtattccaaattgactgattaaatgattatacaaatt-ggggtg 31273234  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||||||  |||| ||||| || || |||||||| || |||| || |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31273235 gtttgataacatcaaatttaagtccagaaaggagagctggagtatacaaaaaactcaaatgtatactaaagaaagaaaatgatgtaacatatatattttt 31273334  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  31273335 tatttgagtgg-gggtgggtatta 31273357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13997430 - 13997204
Alignment:
Q  15 actcttacgtcgtatgaacgggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 114  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13997430 actcatacgtcgtaggaaagggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactcattaa 13997331  T
Q  115 gtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaa 214  Q
    |||||||| || |||   |||| ||  |||| |||| |||||||| || ||||   ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||| |||    
T  13997330 gtgattattcaaattgacggtggttcaatagcatcaaatttatgtccagaaagtgaaactagagtctaggaaaaactcatacgtgtattgaataaaaaaa 13997231  T
Q  215 atgatataacatatatattttttatttaagt 245  Q
    |     |||||||||  ||||||||||||||    
T  13997230 a----gtaacatataatttttttatttaagt 13997204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15457598 - 15457308
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaa-taattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg 132  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15457598 gggaaaacgaatggtttgtgtgaaaaaaaaaattattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattggg 15457499  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    |||  |||||||| | ||||||||||| |  | | | |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             ||||||||||||    
T  15457498 ggtagtttgatagtaccagatttatgtccggataagtgaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatat 15457412  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    ||||||  |||| |||||||| ||||  |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  15457411 tttttatttaagtgg-gggtgggtattagagttaatttttc---tgaggcccataacttttggaggcccggcttgattgagcaccttgcactctctcaag 15457316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Original strand, 21747200 - 21747364
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21747200 aaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgacatagtattttaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtg 21747299  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
     |||||||| | ||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  21747300 gtttgatagtaccagatttatgttcagatagaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgta 21747364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 270
Target Start/End: Original strand, 1226234 - 1226465
Alignment:
Q  35 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatt-ttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | |||  ||    
T  1226234 ggaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaataacttttcaaattgtctgattgagtgattatataaattgagg 1226333  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-- 231  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||     |||||||||||      
T  1226334 gtggtttggtagcatcagatttatgtccaaa--ggagaattagagtctagaaaaaactcaaacgtgtaccgaagaaaaagaag----taacatatatatt 1226427  T
Q  232 ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattt 270  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  1226428 ttttttatttaagtggggtgt-ggtattagacttaattt 1226465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 17117612 - 17117828
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| |||    
T  17117612 gggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgac--------tgattatacaaattgggg 17117703  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  17117704 gtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagagctaaaatctagaaaaaattcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 17117790  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17117791 ttttatttaagtgg-gggtgagtattagatttaattttt 17117828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 18916024 - 18916245
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  18916024 aaaacaaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgctgtgattctttcagtgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattggggatg 18916123  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||||||| | ||||||||||| || |  | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||    || ||||         ||||||||||||||||    
T  18916124 gtttgatagtaccagatttatgtccagattgaagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgt----aaaaaag---------taacatatatattttt 18916210  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18916211 tatttaagtgg-gggtgggtattagagttaattttt 18916245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 38985676 - 38985842
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |    
T  38985676 gggaaaacaaatgttttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaaatgattatacaaattggag 38985775  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
    ||| |||||||| | || |||||||| || | ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  38985776 gtggtttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaa-taaagtttagaaaaaactcaaacgtgta 38985842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 200
Target Start/End: Original strand, 27302497 - 27302661
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||    
T  27302497 gaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgatatagcttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattgagggt 27302596  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgt 200  Q
    |||||| ||| |||  |||| ||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27302597 gatttggtagcatcgaatttttgtccagacagaagaattagagtctagaaaaaactcaaatgtgt 27302661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38599498 - 38599261
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||        
T  38599498 gggaaaacgaatggtttatgaaaaaat-aaataattgttttgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgata 38599400  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
     ||||||||||| |||| |||||| | || |||  |||||| ||||  |||||||| ||| |  ||||| |||||||||||| ||  |||||| ||  ||    
T  38599399 atgatttgatagcatcaaatttatatccataaaatagaacttgagttaagaaaaaactcatagttgtaccgaagaaagaaaaagaagtaacatgtaattt 38599300  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||| |||||| || ||| ||| ||||| | |||||||||    
T  38599299 tttaatttaaatgaaggatggatattatacttaattttt 38599261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 29480604 - 29480777
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| || |||   |    
T  29480604 gggaagacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataatttttcaaattgactgaataagtgtttattcaaattgatg 29480703  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaag 207  Q
    ||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||  |||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  29480704 gtggtttaatagcatcaaatttatgtccagaaagttgaactaaagtctaaaaaaaaatcatacgtctactgaag 29480777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9029625 - 9029472
Alignment:
Q  118 attatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatg 217  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||| | || ||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| ||| |||  |    
T  9029625 attatacaaattggggctgctttgatagcaacatatttatgtctagaaaggagaattagagtctaaaaaaaactcaaacatataccgaaaaaaaaaa--g 9029528  T
Q  218 atataacatatatatttttt-atttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  9029527 aaataacatatatatttttttatttaagtggggtgtggatattagacttaattttt 9029472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13001658 - 13001560
Alignment:
Q  118 attatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattc-aaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||    
T  13001658 attatacaaattgggggtggtttgatagcatcaaatttatgtataaaaaggagaattagagtttagaaaaaactcaaaacgtataccgaaaaaagaaaa 13001560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Original strand, 18482488 - 18482599
Alignment:
Q  49 ttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttt-tcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgatagga 147  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||| ||| |    
T  18482488 ttatgagaaaaagacattattgttgttattctttcaatgaaataactgtgttaaattgactgattaagcgattatacaaattgggggtagtttgttagca 18482587  T
Q  148 tcagatttatgt 159  Q
    ||| ||||||||    
T  18482588 tcaaatttatgt 18482599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 260
Target Start/End: Original strand, 32186216 - 32186342
Alignment:
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||||||||| ||  |||||| ||  |    
T  32186216 ggtggtttgatagcatcaaatttatgtctaaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatatatgtgccgaagaaagaaaaagaagtaacatgtaatt 32186315  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtatta 260  Q
    |||| |||||| ||| |||||| |||||    
T  32186316 ttttaatttaattgg-gggtggatatta 32186342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 272
Target Start/End: Original strand, 38985849 - 38985899
Alignment:
Q  221 taacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  38985849 taacatatatattttttatttaagtgg-ggtggggtattagagttaattttt 38985899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16805 - 16501
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaa-ataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16805 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgatcgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 16706  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaa-gaaagaaa---atgatata-acatata 229  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || | |||   || ||||| | |||||    
T  16705 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacgtgtactaaaggatataaagatataatatatatatata 16606  T
Q  230 tattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctc 329  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16605 tatcttttatttaagtggggggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtagcatttggaggcccggtctggttgagcaccttgcacaccctc 16506  T
Q  330 aaggc 334  Q
    |||||    
T  16505 aaggc 16501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13423959 - 13423651
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |    
T  13423959 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgattgattaagtgattatacaaattaggaat 13423860  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat----tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata 231  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13423859 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtctaaaaaaaaaaaactcatacgtgtgctaaagaaagaaaaggatataacatatata 13423760  T
Q  232 ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13423759 ttttttatttaagtgggagataggtattagatttaatttttcgttagaggcccgtaacatttggaggccccgcctggttgagcaccttgcacaccctcaa 13423660  T
Q  332 ggcagggcc 340  Q
    ||| |||||    
T  13423659 ggcggggcc 13423651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Original strand, 26377742 - 26378042
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26377742 aaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttctcacattgactgaataagtgattatacaaattagggg 26377841  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  26377842 tggtttgataggatctgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaaaatataacatatatat 26377941  T
Q  233 tttttatttaagt-ggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaa 331  Q
    ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  26377942 tttttatttaagtgggggggtgattattagatttaatttttcgttagagacccgtagaatttgaaggcccgacctggttgagcaccttgcacaccctcaa 26378041  T
Q  332 g 332  Q
    |    
T  26378042 g 26378042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13656305 - 13656056
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13656305 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattagggat 13656206  T
Q  136 gatttgat---aggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    | |||  |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656205 ggtttttttttaggatccgatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgatataacatatatat 13656106  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcc 283  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656105 tttttatttaagtgga-ggtggttattagatttaatttttcgttagaggcc 13656056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13474725 - 13474427
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13474725 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacaacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 13474626  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata--- 231  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||       
T  13474625 ggtttgataggatccgatttatgtacaaaaaagagaactagagtttagaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaaaaaaatgatataatatatatattt 13474526  T
Q  232 -ttttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctca 330  Q
     |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  || | || ||| |||||||||||||||||||    
T  13474525 tttttttatttaagtg--gggtgagtattagatttaatttttcgttaaaggcccataacatttggagacccagcctggttaagcaccttgcacaccctca 13474428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12661404 - 12661102
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaata-attgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  12661404 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactggttaagtgattatacaaattagaggt 12661305  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaa------ctagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatata 229  Q
    | |||||||| ||| ||||||| ||||||||  | ||      ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12661304 ggtttgatagaatccgatttatatacaaaaaaaaaaaaaaaaactagagtctagaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaatgaaataacatata 12661205  T
Q  230 tattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||| | ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12661204 tattttttatttaagtggagggtagatattagatttaattttttgattgaggtccgtagcatttggaggcccgatctggttgagcaccttgcacaccctc 12661105  T
Q  330 aag 332  Q
    |||    
T  12661104 aag 12661102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Original strand, 36718535 - 36718841
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa--aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagggg 134  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36718535 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaattatggttgtgattctttcaataaaataactttacaaattgactgattaaatgattatacaaattagggg 36718634  T
Q  135 tgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  36718635 tggtttgataggatccgattcatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaaactcacacgtgtactaaaaaaagaaaagaatataacatatatat 36718734  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  36718735 tttttatttaagtggggagagagtattagattt-atttttcgttagagacccgtagcattcggaggcccggcctagttgagcaccttgcacatcctcaaa 36718833  T
Q  333 gcagggcc 340  Q
    || |||||    
T  36718834 gccgggcc 36718841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 333
Target Start/End: Original strand, 19099283 - 19099582
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19099283 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaattagggat 19099382  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtct---agaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||| |||||| ||| | ||| || ||||| ||||||||| || | |    
T  19099383 ggtttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactatagtctaaaaaaaaaaactcaaacatgtgccgaaaaaggaaaaggatataacacat-ttt 19099481  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19099482 tttttatttaaatggggggtgggtattagacttaattttttgtttgaggcccgtagtatttggaggcccgacctggttgagcaccttgcactcccacaag 19099581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8398985 - 8398778
Alignment:
Q  127 attaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat-tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataaca 225  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8398985 attaggggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaatgagaactagagtctaaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaagaaaaggatataaca 8398886  T
Q  226 tatatat--tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcac 323  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  8398885 tatatatattttttatttaagtggggggtgagtattagatttaatttttcgttaggggcccgtagcatttggaggtccggcctgattgagcaccttgcac 8398786  T
Q  324 accctcaa 331  Q
    ||||||||    
T  8398785 accctcaa 8398778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43511712 - 43511425
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43511712 aaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtg 43511613  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||||||| | ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             ||||||||||||||||    
T  43511612 gtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatattttt 43511526  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcag 336  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||  || | |||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43511525 tatttaagtgga-ggtgggtattagatttaattttt--tctgaggcccatagcttttggaggtccggcttgattgagcaccttgcactccctcaaggccg 43511429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Original strand, 42291848 - 42292131
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  42291848 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgattaagtgattatacaaattggtg 42291947  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    |||||||||||| | || |||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  42291948 gtgatttgatagtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtttagaaaaaagtcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 42292034  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaagg 333  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||  |  ||||||| || | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42292035 ttttatttaagtgg-gcgtgagtattagagttaattttt--tctgaggcctatagcttttggaggcccgg-ctaattgagcaccttgcactccctcaagg 42292130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 138241 - 138066
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  138241 gggaaaacgaatggtttatgcggaaaaaaaataattgttgtgattatttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgatg 138142  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaa 209  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  138141 gtggtttgatagcatcaaatttatgtccgaaaagtagaactagagtctagaaaaaactcatacgtgtccagaagaa 138066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29156287 - 29156004
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29156287 gggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattaggg 29156188  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatata-t 232  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||             ||||||||||| |    
T  29156187 gtggtttgatagtaccagatttatgttcagataggataactatagtctagaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 29156101  T
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |  |||| |  |||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  29156100 tttttatttaaataga-ggtgggtattagatttaattttt--tctgaggtccataacttttggaggtccggtttgattgagcatcttgcactccctcaag 29156004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 17513906 - 17514138
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17513906 aaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcagtgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattgggggtg 17514005  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttt 236  Q
     |||| ||| | ||||||||| | || | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||| |  | | |  | |   ||||||||||||    
T  17514006 gtttgttagtaccagatttatatccagataggagaactaaagtctagaaaaacctcaaacgtgtaaagaagta--acattttttttttatatatattttt 17514103  T
Q  237 tatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17514104 tatttaagtgg-gggtgggtattagatttaattttt 17514138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 108 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26312029 - 26311853
Alignment:
Q  108 tgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat--tcaaacgtgtactga 205  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |    
T  26312029 tgattaagtgattatacaaattatgggtggtttgataggatccgatttatgtacaaaaagaagaactagaatctagaaaaaaaactcaaacgagtactaa 26311930  T
Q  206 agaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcc 283  Q
    || |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26311929 aggatataaa-gatataacatatatattttttatttaagttgggggtaggtattagatttaatttttcgttagaggcc 26311853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Original strand, 4734549 - 4734772
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| | |    
T  4734549 gggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgagtgatcaagggattatacaaattggtg 4734648  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||             |||||||||||||    
T  4734649 gtggtttgatagtaccagatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacatgtaaagaag-------------taacatatatatt 4734735  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaattttt 272  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  4734736 ttttatttaagtg--gggtgggtattagagttaattttt 4734772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27351444 - 27351212
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||| || |||||||||| |||| ||||| |||   || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||    
T  27351444 gaaaatgactggtttatgcaaaaaagaaatgatttaggttattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtggttatacaaattggaggt 27351345  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt-t 234  Q
    | |||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| || |    
T  27351344 ggtttgatagcaccaaatttatgttcagaaaggagaactagagtctagaaaaatctcaaacgtatactgaagaaagaaaaggaagtaacatatattttat 27351245  T
Q  235 tttatttaagtggagggtgggtattagatttaa 267  Q
    |||||| |||| | ||||| |||||||| ||||    
T  27351244 tttattcaagtagggggtgagtattagacttaa 27351212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10033663 - 10033489
Alignment:
Q  15 actcttacgtcgtatgaacgggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgac-tgatta 113  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | |     
T  10033663 actcctacgtcgtaggaaagggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattattgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactttaatc 10033564  T
Q  114 agtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa 188  Q
    |||||||||||| |||   || | |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10033563 agtgattatacaaattgatgggggtttgatagcatcaaatttatgtacagaaagtagaactagagtctagaaaaa 10033489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20976080 - 20975855
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||    
T  20976080 gaaaacgaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattggtggt 20975981  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag--aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    | |||||||| | || ||||||||  | | | |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||             |||||||||||||    
T  20975980 ggtttgatagtaccaaatttatgtcaagataagagaactaaagtctagaaaaaaaactcaaacgtgtaaagaag-------------taacatatatatt 20975894  T
Q  234 ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20975893 ttttatttaagtgga-ggtgggtattagagttaatttttc 20975855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 10591240 - 10591407
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10591240 gggataacgaatgatttttgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattaactgattaagtgattatacaaattgggg 10591339  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
    ||| |||||||| | || |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10591340 gtggtttgatagtaccatatttatgttcagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 10591407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40956410 - 40956217
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |    
T  40956410 gggaaaacgaatggtgtatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagtttttcaaattaaatgattaagtgattatacaaattggag 40956311  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatat 232  Q
        |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  40956310 aatgtttgattgcatcagatttatgtccacaaaggagaactagagtctagaaaaaactcaaacg-----tgaagaaagaaaaagaagtaacatatatat 40956217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5829477 - 5829315
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||    
T  5829477 aaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttt--aaattgactgattaagtgattatacaaattgaggttg 5829380  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
     |||||||| | |||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5829379 gtttgatagtaccagatttatgtcaagataggagaactaaagtctataaaaaactcaaacgtgta 5829315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 201
Target Start/End: Original strand, 3349696 - 3349862
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |      
T  3349696 gggaaaacgaacggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattattccaattggta 3349795  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgta 201  Q
    ||| |||||| | | || |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3349796 gtggtttgat-gtaccaaatttatgtccagataggagaactaaagtctagaaaaaactcaaacgtgta 3349862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17325942 - 17325777
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatag-cttttcaaattgactgattaagtgattatacatattagg 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||        
T  17325942 gggaaagcgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttcaaattgactgattaagtgattattcaaatcgat 17325843  T
Q  133 ggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgt 198  Q
    |||  ||| |||| |||| |||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  17325842 ggtagtttaatagcatcaaatttatgtccagaaagtggaactagagtctaaaaaaaactcatacgt 17325777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 7390367 - 7390458
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7390367 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtcgtgattctttcgatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattataca 7390458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18873545 - 18873458
Alignment:
Q  43 aatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatatta 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18873545 aatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattggctgattaagtggttatacaaatta 18873458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 237
Target Start/End: Original strand, 8379538 - 8379691
Alignment:
Q  84 aatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 183  Q
    ||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  8379538 aatgaaataactttcgaaattaattgattaagtaattatacaaattaggggtgatttgataacatcatatttatgtccataaatgagaatgagagtctag 8379637  T
Q  184 aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttttt 237  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  8379638 aaaaaactcaaatgtgtaccgaagaaagaaaaagaaataacatatttttttttt 8379691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23069267 - 23069102
Alignment:
Q  84 aatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag 183  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||     
T  23069267 aatgaaatagctttccaaatcgaatgattaagggattatacaaattgggggtggtttgctagcatcatatttatgttcagaaaggagaattagagtataa 23069168  T
Q  184 aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattt--tttatttaagtgg 247  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23069167 aaaaaacacaaacgtgtaacgaagaaagaaaaagaagtaacatatatcttttatttatttaagtgg 23069102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 931470 - 931326
Alignment:
Q  36 gaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||     ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  931470 gaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgtgattctttcaat-----agctttctaaattgactgattaagtgattatacaaattgggtgt 931376  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa 185  Q
    ||||| |||| |||| |||||| || | ||| |||||||| |||||||||    
T  931375 gatttaatagcatcaaatttatatatagaaaagagaactatagtctagaa 931326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40779288 - 40779127
Alignment:
Q  35 ggaaaacgaatggtttatgcgaaaat-gaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggg 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||    
T  40779288 ggaaaacgaatggtttatacgaaaaaagaaatgattgttgtgattcct-caatggaatagtttttcaaattgacttattaaacgattatacaaattgggg 40779190  T
Q  134 gtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaac 196  Q
     |  |||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40779189 atagtttgataacatcaaatttatgttcagaaaggagaactagactctagaaaaaactcaaac 40779127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16515599 - 16515440
Alignment:
Q  56 aaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgataggatcagattt 155  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||  | |||   |||| ||| |||| |||| ||||    
T  16515599 aaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaataatttttcaaattgattgattaagtgattattaaaattgatggtgttttaatagcatcaaattt 16515500  T
Q  156 atgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaa 215  Q
    ||||  | |||| ||||||| ||| || |||||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16515499 atgtctagaaagtagaactaaagtttaaaaaaagctcatacgtgtactgaagaaaaaaaa 16515440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33281762 - 33281680
Alignment:
Q  43 aatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattataca 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33281762 aatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgggattctttcaatgaaataactttttaaattgactaattaagtgattataca 33281680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Original strand, 8379409 - 8379457
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgatttttt 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8379409 gggaaaacgaatggattatgcgaaaaagaaattattgttgtgatttttt 8379457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 37029051 - 37029108
Alignment:
Q  86 tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtgatttgatag 145  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  37029051 tgaaatagctttttaaattgattgattaagtgattatacaaatt--ggatgatttgatag 37029108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40778785 - 40778695
Alignment:
Q  193 aaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt-ttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggc 282  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  40778785 aaacgtgcactcaagaaagaaaaggaagtaacatatattttattttatttaagtagggggtgagtattagacttaatattttgtttgaggc 40778695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Original strand, 46143 - 46429
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggtg 136  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  46143 aaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaatgattgttgtgattatttcaatgaaatagacttccaaattgactgattaagtgattatccaaattatgggtg 46242  T
Q  137 atttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctag-aaaaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatttt 235  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  46243 gtttgataggatcagatatatgtataaaaatgagaactagagtctagaaaaaaattcaaatgtgtaccgaagaaataaaatgatataacat-tttttttt 46341  T
Q  236 ttatttaagtggagggtgggtattagatttaa-tttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcac 323  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||  |  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  46342 ttatttaagt-gtgtgtgggtattagacttaatttttttgtttgaggcccatggcatttgaaggtccggcctggttgagcaccttgcac 46429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Original strand, 22847 - 23038
Alignment:
Q  151 gatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaat--tcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatattttttatttaagtgga 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22847 gatttatgtacaaaaaggagaattagagtctacaaaaaaaactcaaacgtgtactaaagaaataaaaggatataacatatatattttttatttaagtgga 22946  T
Q  249 gggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaaggcagggcc 340  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22947 gggtggatattagatttaatttttcgttagagacccgtatcatttggaggtccggcctggttgagcaccttacacaccctgaaggcaaggcc 23038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 106
Target Start/End: Original strand, 22774 - 22844
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattga 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  22774 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattattgtgattctttcaatgaaatagtttttcatattga 22844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 241
Target Start/End: Original strand, 17101 - 17307
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaa-taattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17101 aaaacgaatggtttatgcgaagaagaaaatgattgttgtgattctttcaacgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaattaggggt 17200  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaa--attcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataacatatatatt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  | | || | |||||||||||||||    
T  17201 gatttgataggatccgatttatatacaaaaatgagaactagagtctagaaaaaacattcaaacgtgtactaaag-gatataaagttataacatatatatt 17299  T
Q  234 ttttattt 241  Q
    ||||||||    
T  17300 ttttattt 17307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 334
Target Start/End: Original strand, 18128 - 18229
Alignment:
Q  233 tttttatttaagtggagggtgggtattagatttaatttttcgttagaggcctgtaacatttggaggtccggtctagttgagcaccttgcacaccctcaag 332  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  18128 tttttatttaaatggggggtgagtattagatttaatttttcgttaaaggcccataacatttggaggcccggcctgattgaacacctttcacaccctcaag 18227  T
Q  333 gc 334  Q
    ||    
T  18228 gc 18229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1156 - 979
Alignment:
Q  37 aaaacgaatggtttatgcgaa-aatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattaggggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||            ||||||| |||||||||    
T  1156 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattga------------ttatacaaattaggggt 1069  T
Q  136 gatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaa-aaaattcaaacgtgtactgaagaaagaaaatgatataac 224  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||||||    
T  1068 ggtttgataggatccgatttatgcacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaaactcaaacatgtaataaagaaataaaaggatataac 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 8360 - 8525
Alignment:
Q  34 gggaaaacgaatggtttatgcg--aaaatgaaataattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacatattag 131  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  8360 gggaaaacgaatggtttgtgtggaaaaaaaaaataatttttgtgattctttcaatgaaatagttttcgaaattgactgattaattgattatacaaattat 8459  T
Q  132 gggtgatttgataggatcagatttatgtacaaaaaggagaactagagtctagaaaaaattcaaacg 197  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||| || |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||    
T  8460 gggtggtttgatagcataaggtttatgtccagaaaggaaatctagagtctagtagaaactcaaacg 8525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University