View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF20739_low_11 (Length: 308)
Name: NF20739_low_11
Description: NF20739
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF20739_low_11 |
 | |
|
| [»] chr8 (13 HSPs) |
| |
|
| [»] chr4 (6 HSPs) |
| |
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| [»] scaffold0468 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0045 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0070 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0330 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30650087 - 30649797
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30650087 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
30649988 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30649987 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
30649888 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
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|
|
| T |
30649887 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
30649797 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 17971586 - 17971876
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17971586 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
17971685 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17971686 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatagcacatacactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttga |
17971785 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17971786 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttctttaacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
17971876 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 9181639 - 9181858
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9181639 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
9181738 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9181739 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttga |
9181838 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaat-aaaattgatatgct |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9181839 |
aaaataaaaattgatatgct |
9181858 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 25479778 - 25480034
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25479778 |
acttaattacaaagttatataattagacaattttattttttgcagtcaggataaatgaattaaaagttcatataaatcggtgtttagagaatttgaatct |
25479877 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25479878 |
ctaaatttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataacctagaaatgataaaataatcttttatcatacttattgatgactgtgaattttgg |
25479977 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat |
272 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25479978 |
aaactaaaattgatacgtttgatatgttcaacttctataatgaaaattgaaatttat |
25480034 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 25487384 - 25487640
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25487384 |
acttaattacaaagttatataattagacaattttattttttgcagtcaggataaatgaattaaaagttcatataaatcggtgtttagagaatttgaatct |
25487483 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25487484 |
ctaaatttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataacctagaaatgataaaataatcttttatcatacttattgatgactgtgaattttgg |
25487583 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat |
272 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25487584 |
aaactaaaattgatacgtttgatatgttcaacttctataatgaaaattgaaatttat |
25487640 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30654642 - 30654532
Alignment:
| Q |
145 |
acttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttc |
244 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30654642 |
acttgatggcacataaattaaaaatgataaaataatcttttatcataatcatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
30654543 |
T |
|
| Q |
245 |
aatttttataa |
255 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
30654542 |
aatttctataa |
30654532 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30654777 - 30654702
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaa |
91 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30654777 |
acttaattccaaagttatatgattagacaattttattttttacagtcaagatatatgaaccaaatgttcatataaa |
30654702 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 40126801 - 40127094
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40126801 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaattt |
40126900 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40126901 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
40127000 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttc-aatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatttt |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40127001 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctacgaacaaaaattctaatttt |
40127094 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 23082795 - 23083086
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23082795 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtaaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
23082894 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatat-gtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23082895 |
ctaaatataatagattatgatattgtgtgaacttgatgacacataaactagaaatgataatatgatattttatcatatttatcgatgactgtgaattttg |
23082994 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
23082995 |
gaaaataaaattgatatgtttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaataaaaattctaatt |
23083086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34117535 - 34117281
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34117535 |
acttaattccaaagttatatgattaaacaattttaatttttgcagtcaagatatatgaactaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
34117436 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34117435 |
ctaaacataataaattatgatatgtgtgaacttgatgacacataaactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaatattga |
34117336 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaattt |
270 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34117335 |
aaaataaaatcgatatgtttgatatgttcaatttctataaagaaaattgaaattt |
34117281 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 8319544 - 8319842
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8319544 |
acttaattccaaagttatatgattaaacaattttattttttgcagtcaagttaaatgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatct |
8319643 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaa-tataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
8319644 |
ctaaactttaataaattatgatatgtgcaaacttgatggcacataacctagaaatgataaaacgatattttatcaaatttattggtgactgcgaattttg |
8319743 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaattt-------atagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8319744 |
aaaaataaaattgatatgcttaaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaatctatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
8319842 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 25368648 - 25368901
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25368648 |
acttaatttcaaagttatatgattagacaattttattttttgcaatcaatttaaatgaaccaaaagttcatataaattagtgtttagagaatttgaatct |
25368747 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaa-tataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| ||||||||||||| || |||| | || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25368748 |
ctaaactttaataaattatgatatgtgcaaatttgacgacaaataacctagaaatgataaaacgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttg |
25368847 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25368848 |
aaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
25368901 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17024019 - 17023860
Alignment:
| Q |
147 |
ttgatggcacataaattagacatgataaaatgatatttt-atcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttca |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17024019 |
ttgatggcacataaattagaaatgataaaaggatatttttatcatatttat-gatgattgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttca |
17023921 |
T |
|
| Q |
246 |
atttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17023920 |
atttttataacgaaaattgaaatttatagagttcccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
17023860 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17554512 - 17554353
Alignment:
| Q |
147 |
ttgatggcacataaattagacatgataaaatgatatttt-atcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttca |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17554512 |
ttgatggcacataaattagaaatgataaaaggatatttttatcatatttat-gatgattgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttca |
17554414 |
T |
|
| Q |
246 |
atttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17554413 |
atttttataacgaaaattgaaatttatagagttcccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
17554353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 38183606 - 38183792
Alignment:
| Q |
98 |
tttagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatat-tttatcatatttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38183606 |
tttagagaattagaatctcaaact-taataaattatgatatgtgcaaatttgatggcacataaattagaaataataaaatgatatgtttatcatatttat |
38183704 |
T |
|
| Q |
197 |
tgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat-agagtacccaa |
283 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
38183705 |
tgatgacggtgaattttggaaaataaaattgatatgtttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaattcataagagtacccaa |
38183792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Original strand, 4239367 - 4239477
Alignment:
| Q |
145 |
acttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttc |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4239367 |
acttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
4239466 |
T |
|
| Q |
245 |
aatttttataa |
255 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
4239467 |
aatttctataa |
4239477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 4239265 - 4239360
Alignment:
| Q |
18 |
ttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4239265 |
ttaattccaacgttatatgattaaacaattttatattttgcagtcaagatatatgaaccaaatgttcatataaacaagtgtttagagaatttgaat |
4239360 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17025022 - 17024899
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17025022 |
acttaattccaaagttataagattaga-aattttattttttgcaatcaagataaatgaaccaaaagttcatataaattaatgattagagaat-tgaatct |
17024925 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtg |
141 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17024924 |
ctaaacttaataaattatgatatgtg |
17024899 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17555514 - 17555391
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17555514 |
acttaattccaaagttataagattaga-aattttattttttgcaatcaagataaatgaaccaaaagttcatataaattaatgattagagaat-tgaatct |
17555417 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtg |
141 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17555416 |
ctaaacttaataaattatgatatgtg |
17555391 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 92
Target Start/End: Original strand, 38183241 - 38183304
Alignment:
| Q |
29 |
gttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaat |
92 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38183241 |
gttatatcactaggcaattttattatttgcagccaagataaatgaaccaaaagttcatataaat |
38183304 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 37260783 - 37261077
Alignment:
| Q |
13 |
tgaacttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaa |
112 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37260783 |
tgaacttagttccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaac-aaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaa |
37260881 |
T |
|
| Q |
113 |
tctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattt |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37260882 |
tctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattt |
37260981 |
T |
|
| Q |
213 |
tggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatttt |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37260982 |
tggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaggtctaagaacaaaaattctaatttt |
37261077 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31272653 - 31272363
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31272653 |
acttagttccaacgttatatgattagacaattttaattattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
31272554 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31272553 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
31272454 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31272453 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataatgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
31272363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 33465232 - 33465489
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33465232 |
acttaactccaaagttatatgattagacaattttatttattgcagtcaacatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
33465331 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgata-ttttatcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
33465332 |
ctaaacataataaattatgatatgtgtaaatttgatggcacataaattagaaatgataaaataatatttttatcatatttattgatgactctgaattttg |
33465431 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33465432 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttctttaacgaaaattgaaatttat |
33465489 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41815885 - 41815661
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41815885 |
acttaattccaaagttatatgattgtacaattttatttttcatagtcaagtttaatgaaccaaaagttcatacaaatcattgtttagagaatttgaatct |
41815786 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41815785 |
ctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatggcacataacctagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttga |
41815686 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatat |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41815685 |
aaaataaaattgatatgcttgatat |
41815661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 32222075 - 32222334
Alignment:
| Q |
13 |
tgaacttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaa |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
32222075 |
tgaacttaattccaaagttgtataagtagataattttattttttgcagtcaagataaatgaaccaaaagttcatataaatcag-tgttagagaatttgaa |
32222173 |
T |
|
| Q |
113 |
tctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattt |
212 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
32222174 |
tctctaaacttaataaattatgatatgtgcgaacttgatgaaacataaattagaaatgataaaataata-tttatcatatttattgatgatagtaaatct |
32222272 |
T |
|
| Q |
213 |
tg--gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat |
272 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32222273 |
tgaaaaaaataaaattgatatgtttgatttgttcaatttctttaacgaaaatcgaaatttat |
32222334 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19105888 - 19105661
Alignment:
| Q |
29 |
gttatatgattagacaattttatttatt-gcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataata |
127 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19105888 |
gttatataattagacgattttatttttttgcaagcaagataaatgaatcaaaagttcatatgaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaatttaata |
19105789 |
T |
|
| Q |
128 |
gattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattg |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19105788 |
aattatgatatgtgcgaacttgatgatatataacctagaaatgataaaataatcttttatcatacttactgatgactgtgaattttggaaaataaaattg |
19105689 |
T |
|
| Q |
228 |
atatgcttgatatgttcaatttttataa |
255 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19105688 |
atacgcttgatatgttcaatttttataa |
19105661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 23662334 - 23662624
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23662334 |
acttagttccaacgttatatgattagacaattttagttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
23662433 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23662434 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
23662533 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23662534 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataatgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
23662624 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Original strand, 12966731 - 12966989
Alignment:
| Q |
18 |
ttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctct |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12966731 |
ttaattccaaagttatatgattagacaattttattttttgcagtcaagataaatgaaccaaa-gttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctct |
12966829 |
T |
|
| Q |
118 |
aaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattag--------acatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaa |
209 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12966830 |
aaacttaataaattatgatatgtgcaaacttgatgacacataaattagaaatgataaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaa |
12966929 |
T |
|
| Q |
210 |
ttttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatt |
269 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12966930 |
ttttgaaaaataaaattgatatgtttgatatgctcaatttctaaaacgaaaattgaaatt |
12966989 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18471098 - 18470822
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18471098 |
acttaattccaaa-ttatatgattag-caattttattttttgcagtcaagataaatgaatcaaaagttcatataaattaatgcttagagaat-tgaatct |
18471002 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatatttt-atcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18471001 |
ctaaacttaataaattat--tatgtgcgaatttgatggcacataaattagaaatgataaaaggatatttttatcatatttattgattactgtgaattttg |
18470904 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18470903 |
gaaaataaaattga---------tatgttcaa-ttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtttaagaacaaaaattctaatt |
18470822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 24755416 - 24755665
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
24755416 |
acttatttccaaagttgtatgattagacaattttattttttgcag----gttaaatgaaccaaaagttcatataaatcaatgtttacagaatttgaatct |
24755511 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaa-tataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
24755512 |
ctaatgtttaataaattatgatatgtgcaaacttgacggcacataacctagaaatgataaaacggtattttatcatatttattgatgactgcgaattttg |
24755611 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaat |
268 |
Q |
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|
| T |
24755612 |
aaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
24755665 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 24764413 - 24764662
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
24764413 |
acttatttccaaagttgtatgattagacaattttattttttgcag----gttaaatgaaccaaaagttcatataaatcaatgtttacagaatttgaatct |
24764508 |
T |
|
| Q |
116 |
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214 |
Q |
| |
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|||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
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| T |
24764509 |
ctaatgtttaataaattatgatatgtgcaaacttgacggcacataacctagaaatgataaaacggtattttatcatatttattgatgactgcgaattttg |
24764608 |
T |
|
| Q |
215 |
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268 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24764609 |
aaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
24764662 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Original strand, 7572154 - 7572256
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7572154 |
acttaatttcaacgttatatgattagacaattttatttattgcaagcaagaaatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
7572253 |
T |
|
| Q |
116 |
cta |
118 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
7572254 |
cta |
7572256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8887076 - 8886981
Alignment:
| Q |
18 |
ttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8887076 |
ttaattccaacgttatatgattaaacaattttattttttgcagtcaagatatatgaaccaaatgttcatataaacaagtgtttagagaatttgaat |
8886981 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8886978 - 8886870
Alignment:
| Q |
147 |
ttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaa |
246 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8886978 |
ttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgattgtgaattttgaaaaataaaattgatgcgcttgatgtgttcaa |
8886879 |
T |
|
| Q |
247 |
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255 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
8886878 |
tttctataa |
8886870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27606288 - 27606226
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaa |
78 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
27606288 |
acttaattccaaaattatatgattagacaatttaattttttgcagtcaaggtaaatgaaccaa |
27606226 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26671176 - 26670886
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
26671176 |
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26671077 |
T |
|
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26671076 |
caaaatataatagattatgatatgtgtgaatttgatggcacatacactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
26670977 |
T |
|
| Q |
216 |
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306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26670976 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
26670886 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26942773 - 26942483
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26942773 |
acttaattccaatgttatatgattatacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaatttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
26942674 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26942673 |
caaaatataatagattatgatatgtgtgaatttgatggcacatacactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
26942574 |
T |
|
| Q |
216 |
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306 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26942573 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
26942483 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36427536 - 36427248
Alignment:
| Q |
18 |
ttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctct |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
36427536 |
ttaattccaaagttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagaga-tataaatctct |
36427438 |
T |
|
| Q |
118 |
aaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatatttt-atcatatttattgatgactgtgaattttgga |
216 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
36427437 |
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36427338 |
T |
|
| Q |
217 |
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306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36427337 |
aaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaatt |
36427248 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39522329 - 39522035
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaatttta-----tttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatg |
110 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |
|
|
| T |
39522329 |
acttaatctcaaagttatataattagacaattttaattttttttttacagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaattaatgtttagagaat-tg |
39522231 |
T |
|
| Q |
111 |
aatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaat |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39522230 |
aatctctaaacttaatagattatgatatgtgtgaacttgatgggacataaattagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaat |
39522131 |
T |
|
| Q |
211 |
tttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39522130 |
tttggaaaataaaattgatatgcttgatatgctcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagtttaagaacaaaaattctaatt |
39522035 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 23978372 - 23978628
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
23978372 |
acttaattccaaagttatatgattagacaattttgtattttgcagttgagataaatgtaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatat |
23978471 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23978472 |
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23978571 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
23978572 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaatttaagtttat |
23978628 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Original strand, 36938540 - 36938650
Alignment:
| Q |
145 |
acttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttc |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36938540 |
acttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
36938639 |
T |
|
| Q |
245 |
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255 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
36938640 |
aatttctataa |
36938650 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42000472 - 42000363
Alignment:
| Q |
147 |
ttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaa |
246 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42000472 |
ttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttcaa |
42000373 |
T |
|
| Q |
247 |
tttttataac |
256 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
42000372 |
tttctataac |
42000363 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 560520 - 560410
Alignment:
| Q |
145 |
acttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttc |
244 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
560520 |
acttgatagcacataaattagaaatgataaaataatcttttatcatacttatcaatgactgtgaattttggaaaataaaattgatgcgcttgatatgttc |
560421 |
T |
|
| Q |
245 |
aatttttataa |
255 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
560420 |
aatttctataa |
560410 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 42000576 - 42000481
Alignment:
| Q |
18 |
ttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42000576 |
ttaattccaacgttatatgattaaacaattttattttttgcagtcaagatatatgaaccaaatgttcatataaacaagtgtttagagaatttgaat |
42000481 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 560622 - 560527
Alignment:
| Q |
18 |
ttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
560622 |
ttaattccaacgttatatgattaaacaattttatattttgcagtcaagatatatgaaccaaatgttcatataaacaagtgtttagagaatttgaat |
560527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Original strand, 36938438 - 36938533
Alignment:
| Q |
18 |
ttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaat |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36938438 |
ttaattccaacgttatatgattaaacaattttatattttgcagtcaagatatatgaaccaaatgttcatataaacaagtgtttagagaatttgaat |
36938533 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10139202 - 10138912
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10139202 |
acttaattctaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaaaatatatgaaccaaaagttcatagaaatcagaatttagagaatatgaatct |
10139103 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10139102 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtaaacttgatggcacataaactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgattgtgaattttgg |
10139003 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaatactaagcacaaaaattctaatt |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10139002 |
aaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtatccaagtctgagaacaaaaattctaatt |
10138912 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25854303 - 25854000
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25854303 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaattagaatttagagaatatgaatct |
25854204 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcata--------------tttattgatg |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25854203 |
ctaaatataatagattatgatatgtgggaa-ttgatggcacataaactagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgcttgtttattgatg |
25854105 |
T |
|
| Q |
202 |
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301 |
Q |
| |
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| T |
25854104 |
actgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttatagagtacccaagcctaagaacaaaaattc |
25854005 |
T |
|
| Q |
302 |
taatt |
306 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
25854004 |
taatt |
25854000 |
T |
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 16749661 - 16749956
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16749661 |
acttaattccaaagttatataagtagacaattttattttttgcagtcaagataaatgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatct |
16749760 |
T |
|
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16749761 |
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16749860 |
T |
|
| Q |
216 |
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306 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
16749861 |
aaaataaaattgacaagtgcgcttgatattttcaatttttataacgaagattgaaatttatagagtacccaagtctaagaacaaaaaattctaatt |
16749956 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 47453071 - 47453361
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47453071 |
acttgattccaaagttatatgattagataattttattttttgtagacaaaataaatgaaccaaaagttcatataaatcattgtttagagaattcgaatct |
47453170 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||| |||| ||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
47453171 |
ctaaacttaaaa-attaagatacgtgggaacttgatgacatataaactagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgactgtgaattctga |
47453269 |
T |
|
| Q |
216 |
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306 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
47453270 |
aaaataaaatcgatatgcttgatatattcaatttttataacaaaaatttaaattgaatagactacctaagtctaagaacaaaaactctaatt |
47453361 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0468 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:
Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 97 - 353
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
97 |
acttaattccaaagttatatgattagacaattttattttttgcagtcaagataaatgaaccaaaagttcatataaattagtgtttagggaatttgaatct |
196 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |
|
|
| T |
197 |
ctaaacttaataaattatgatatgtgtgaacttgatggcacataacctagaaaagataaaatgatattttatcatatttattgatgattgcgaattataa |
296 |
T |
|
| Q |
216 |
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272 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
297 |
aaaaaaaatttgatatgtttgatatgttcaatttatttaacgaaaattgaaatttat |
353 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 48936 - 49189
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48936 |
acttaattccaaagttatatgattagacaattttatttttcgaagtcaagttaaatgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatct |
49035 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaa-tataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49036 |
ctaaactttaataaattatgatatgtgcaaactttatggcacataacctagaaatgataaaacgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttg |
49135 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49136 |
aaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataacaaaaattgaaat |
49189 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0045 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:
Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 82211 - 81993
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
82211 |
acttaattccaatgttatatgattagacaattttattttttgcagtcaagattaatgaaccaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatct |
82112 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
82111 |
ctaaacttaatgaattatgatatgtgtgaacttgatgacacataacctagaaatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttaa |
82012 |
T |
|
| Q |
216 |
aaaataaaattgatatgct |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
82011 |
aaaataaaattgatatgct |
81993 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0070 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:
Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 62475 - 62222
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
62475 |
acttaatttcaaagttatatgattagacaattttattttttgcaatcaatttaaatgaaccaaaagttcatataaattagtgtttagagaatttgaatct |
62376 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaa-tataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttg |
214 |
Q |
| |
|
||||| | ||||| ||||||||||||| || |||| | || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
62375 |
ctaaactttaataaattatgatatgtgcaaatttgacgacaaataacctagaaatgataaaacgatattttatcatatttattgatgactgcgaattttg |
62276 |
T |
|
| Q |
215 |
gaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaat |
268 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
62275 |
aaaaataaaattgatatgcttgaaatgttcaatttctataatgaaaattgaaat |
62222 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 10389276 - 10389477
Alignment:
| Q |
29 |
gttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatctctaaatataatag |
128 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10389276 |
gttatatgattagaaaattttattt--tacagtcaggataaatgaatcaaaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatctctaaacttaataa |
10389373 |
T |
|
| Q |
129 |
attatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttggaaaataaaattga |
228 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
10389374 |
aatatgatatgtgcaaacttgatggcacataaattagaaatgataaaataatattttatcatatttattgatgaccgtgaattttgaaaaataaaattca |
10389473 |
T |
|
| Q |
229 |
tatg |
232 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
10389474 |
tatg |
10389477 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21668464 - 21668174
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21668464 |
acttaattccaaaattatatgattagacaattttgttttttgcaatcaagatatttgaaccagaagttcatataaatcagtgtttagagaatttgaatct |
21668365 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattgatgactgtgaattttgg |
215 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21668364 |
ctaaacttaataaatcatgatataagcgaacttgatagcacataaactagaaatgatagaataatattttatcatat----------cagtgaattttga |
21668275 |
T |
|
| Q |
216 |
a---aaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaattt-------atagagtacccaatactaagcacaaaaattctaat |
305 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21668274 |
aaagaaaaaaaattgatatgcttgatatgtttaattttcataacgaaaattgaaatttatgttggatagagtacccaagtctaagaacaaaaattctaat |
21668175 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 24147602 - 24147667
Alignment:
| Q |
208 |
aattttggaaaataaaat-tgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat |
272 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24147602 |
aattttgaaaaataaaaactgataagcttgacatgttcaatttttgtaacataaattgaaatttat |
24147667 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 15997615 - 15997787
Alignment:
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100 |
tagagaatatgaatctctaaatataatagattatgatatgtgtgaacttgatggcacataaattagacatgataaaatgatattttatcatatttattga |
199 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15997615 |
tagagaatttgaacctctaaacttaataaattatgatatgtgcaaacttgatggaacataaactagaatttataaaaatatattgtatcatatttattga |
15997714 |
T |
|
| Q |
200 |
tgactgtgaattttggaaaataaaattgatatgcttgatatgttcaatttttataacgaaaattgaaatttat |
272 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15997715 |
tgaccgtaaattttgacaaataaaattgatacactttatatgttcaagttttataacaaaaattgaaatttat |
15997787 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Original strand, 15992721 - 15992795
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| Q |
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acttaattccaacgttatatgattagacaatttt-atttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15992721 |
acttaattctaaagttatatgattagaaattttttatctattgcagtcaggataaatgaaccaaaaattcatata |
15992795 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Original strand, 16000383 - 16000457
Alignment:
| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaatttt-atttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatata |
89 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16000383 |
acttaattctaaagttatatgattagaaattttttatctattgcagtcaggataaatgaaccaaaaattcatata |
16000457 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0330 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:
Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18872 - 18755
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| Q |
16 |
acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18872 |
acttaatttcaaagttatatgattagacaattttatattttgtagtcaagatgaatgaactaaaagttcatataaaccagtgtttagagaatttgaatct |
18773 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattat |
133 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
18772 |
ctaaacttaataaattat |
18755 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2890 - 2773
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| Q |
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acttaattccaacgttatatgattagacaattttatttattgcagtcaagatatatgaaccaaaagttcatataaatcagaatttagagaatatgaatct |
115 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2890 |
acttaatttcaaagttatatgattagacaattttatattttgtagtcaagatgaatgaactaaaagttcatataaaccagtgtttagagaatttgaatct |
2791 |
T |
|
| Q |
116 |
ctaaatataatagattat |
133 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
2790 |
ctaaacttaataaattat |
2773 |
T |
|
Back To:
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