View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20756_high_13 (Length: 367)

Name: NF20756_high_13
Description: NF20756
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20756_high_13
NF20756_high_13
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (213-354)||(2094410-2094551)
chr2 (18-139)||(2094215-2094336)
chr2 (219-354)||(771981-772116)
chr2 (213-354)||(921022-921163)
chr2 (213-354)||(2456010-2456151)
chr2 (213-354)||(9276574-9276715)
chr2 (213-354)||(16246193-16246334)
chr2 (213-354)||(27328584-27328725)
chr2 (213-354)||(41500502-41500643)
chr2 (214-354)||(36444229-36444369)
chr2 (213-350)||(17484550-17484687)
chr2 (213-354)||(28650426-28650567)
chr2 (213-354)||(40854609-40854750)
chr2 (214-354)||(17134229-17134369)
chr2 (220-354)||(3430631-3430765)
chr2 (213-354)||(1106559-1106700)
chr2 (213-354)||(11949426-11949567)
chr2 (213-354)||(33106969-33107110)
chr2 (213-354)||(34253142-34253283)
chr2 (213-354)||(7378963-7379104)
chr2 (213-354)||(33865267-33865408)
chr2 (213-350)||(37838301-37838438)
chr2 (213-352)||(2314975-2315114)
chr2 (213-351)||(2056929-2057067)
chr2 (213-354)||(8899682-8899822)
chr2 (213-354)||(12759750-12759890)
chr2 (218-354)||(36211046-36211182)
chr2 (214-354)||(38751048-38751188)
chr2 (213-352)||(7297234-7297373)
chr2 (213-354)||(19180422-19180562)
chr2 (213-350)||(25087796-25087933)
chr2 (213-354)||(43249412-43249553)
chr2 (213-354)||(29737748-29737889)
chr2 (213-354)||(42629962-42630103)
chr2 (213-354)||(37732193-37732334)
chr2 (234-354)||(8396572-8396692)
chr2 (213-353)||(45124120-45124260)
chr2 (213-353)||(9331757-9331897)
chr2 (213-305)||(14630663-14630755)
chr2 (238-350)||(37654112-37654224)
chr2 (253-354)||(41178059-41178160)
chr2 (234-354)||(19916008-19916128)
chr2 (213-303)||(23671811-23671901)
chr2 (298-354)||(23672958-23673014)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (213-354)||(31684134-31684275)
chr7 (214-354)||(47219145-47219285)
chr7 (213-354)||(1469493-1469634)
chr7 (213-354)||(47281124-47281265)
chr7 (214-354)||(44544409-44544549)
chr7 (213-354)||(11476556-11476697)
chr7 (213-354)||(23842305-23842446)
chr7 (213-354)||(30798368-30798509)
chr7 (213-354)||(35600122-35600263)
chr7 (213-354)||(40851274-40851415)
chr7 (213-354)||(41113377-41113518)
chr7 (213-354)||(47294291-47294432)
chr7 (213-341)||(2960640-2960768)
chr7 (213-354)||(30876259-30876400)
chr7 (213-350)||(37393998-37394135)
chr7 (213-354)||(38427563-38427704)
chr7 (213-354)||(47271981-47272122)
chr7 (213-354)||(41139408-41139553)
chr7 (213-354)||(8162712-8162853)
chr7 (213-354)||(27364339-27364480)
chr7 (213-354)||(30971941-30972082)
chr7 (213-354)||(43752776-43752917)
chr7 (213-354)||(48628805-48628946)
chr7 (218-350)||(4923220-4923352)
chr7 (214-350)||(33884323-33884459)
chr7 (213-350)||(11050261-11050398)
chr7 (213-354)||(43968259-43968400)
chr7 (213-327)||(221302-221416)
chr7 (213-349)||(7336065-7336200)
chr7 (213-354)||(45723491-45723632)
chr7 (214-354)||(29248342-29248482)
chr7 (234-350)||(37354284-37354400)
chr7 (213-354)||(42979338-42979479)
chr7 (234-354)||(3797544-3797664)
chr7 (213-354)||(47119991-47120134)
chr7 (213-354)||(47579086-47579228)
chr7 (213-350)||(44800410-44800547)
chr7 (234-354)||(27774108-27774228)
chr7 (213-350)||(18353148-18353285)
chr7 (261-354)||(40520918-40521011)
chr7 (213-266)||(42888937-42888990)
chr7 (213-269)||(5106127-5106182)
chr7 (294-354)||(39034062-39034122)
chr7 (305-354)||(29739781-29739829)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (213-354)||(12626636-12626777)
chr6 (213-354)||(8178249-8178390)
chr6 (213-354)||(10256237-10256378)
chr6 (213-354)||(2707459-2707600)
chr6 (213-350)||(17428272-17428409)
chr6 (213-354)||(29050272-29050413)
chr6 (213-350)||(30379021-30379158)
chr6 (214-354)||(6503718-6503858)
chr6 (213-354)||(1915343-1915484)
chr6 (213-354)||(3408189-3408330)
chr6 (213-354)||(9382519-9382660)
chr6 (213-352)||(2390267-2390406)
chr6 (213-350)||(16193314-16193451)
chr6 (213-350)||(17943040-17943177)
chr6 (213-350)||(26393009-26393146)
chr6 (213-343)||(2598099-2598229)
chr6 (213-350)||(1077241-1077378)
chr6 (213-354)||(26230932-26231073)
chr6 (213-354)||(3258807-3258948)
chr6 (213-354)||(11133873-11134015)
chr6 (213-350)||(26196321-26196458)
chr6 (233-339)||(35223919-35224025)
chr6 (234-354)||(26936607-26936727)
chr6 (213-354)||(6785101-6785239)
chr6 (213-300)||(31375971-31376058)
chr6 (213-333)||(10931148-10931267)
chr6 (214-320)||(25820550-25820656)
chr6 (213-273)||(12612971-12613031)
chr6 (213-288)||(12612848-12612923)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (213-354)||(33807780-33807921)
chr4 (213-354)||(31973591-31973732)
chr4 (213-354)||(42273802-42273943)
chr4 (213-354)||(11795154-11795295)
chr4 (213-354)||(19496102-19496243)
chr4 (213-354)||(28264643-28264784)
chr4 (213-354)||(28812287-28812427)
chr4 (213-352)||(26017425-26017564)
chr4 (213-354)||(4544985-4545126)
chr4 (213-354)||(12196469-12196610)
chr4 (213-354)||(17847096-17847236)
chr4 (213-354)||(31591076-31591216)
chr4 (213-354)||(48707733-48707874)
chr4 (213-354)||(55517185-55517326)
chr4 (214-354)||(40988633-40988773)
chr4 (213-349)||(49118616-49118752)
chr4 (213-352)||(24458631-24458770)
chr4 (213-343)||(23135006-23135136)
chr4 (213-354)||(5227390-5227531)
chr4 (213-350)||(30467003-30467140)
chr4 (213-350)||(48551764-48551901)
chr4 (213-354)||(51371047-51371188)
chr4 (213-352)||(8882013-8882152)
chr4 (214-353)||(33174021-33174160)
chr4 (213-354)||(9339123-9339267)
chr4 (213-354)||(14564796-14564937)
chr4 (213-354)||(28159953-28160094)
chr4 (213-354)||(30141108-30141249)
chr4 (213-350)||(32317957-32318094)
chr4 (213-354)||(35930040-35930180)
chr4 (213-354)||(39995167-39995308)
chr4 (214-354)||(32118714-32118854)
chr4 (213-349)||(44490324-44490460)
chr4 (215-354)||(10588580-10588719)
chr4 (213-351)||(48149502-48149640)
chr4 (213-354)||(17993017-17993158)
chr4 (213-354)||(33693333-33693474)
chr4 (213-352)||(50276138-50276274)
chr4 (213-354)||(50542354-50542495)
chr4 (213-352)||(2055280-2055419)
chr4 (213-354)||(15985010-15985151)
chr4 (213-350)||(25730244-25730381)
chr4 (213-322)||(31208776-31208885)
chr4 (213-354)||(39700045-39700186)
chr4 (213-354)||(22298517-22298659)
chr4 (214-352)||(37381848-37381986)
chr4 (213-350)||(23553069-23553205)
chr4 (213-350)||(25734223-25734360)
chr4 (234-354)||(19168816-19168936)
chr4 (234-354)||(24623148-24623268)
chr4 (234-338)||(42549643-42549747)
chr4 (213-294)||(20534225-20534306)
chr4 (273-354)||(56555200-56555281)
chr4 (213-248)||(56555165-56555200)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (213-354)||(21564496-21564637)
chr3 (213-354)||(33151696-33151837)
chr3 (213-354)||(1017044-1017185)
chr3 (213-350)||(1687655-1687792)
chr3 (213-354)||(20086314-20086455)
chr3 (213-354)||(31122662-31122803)
chr3 (213-350)||(35346471-35346608)
chr3 (219-354)||(22851996-22852131)
chr3 (213-354)||(20813441-20813582)
chr3 (213-354)||(21656518-21656659)
chr3 (213-354)||(26455582-26455723)
chr3 (213-354)||(38446476-38446617)
chr3 (213-354)||(41250886-41251027)
chr3 (213-354)||(47329175-47329316)
chr3 (213-350)||(50287570-50287707)
chr3 (213-352)||(20913754-20913893)
chr3 (213-352)||(20921872-20922011)
chr3 (221-354)||(12748391-12748524)
chr3 (213-354)||(20760071-20760212)
chr3 (213-350)||(32650820-32650957)
chr3 (213-354)||(36314972-36315113)
chr3 (213-354)||(37247956-37248097)
chr3 (213-354)||(42107099-42107240)
chr3 (213-352)||(3697148-3697287)
chr3 (213-354)||(44798268-44798408)
chr3 (213-354)||(48651248-48651389)
chr3 (213-354)||(51562162-51562303)
chr3 (213-354)||(53925979-53926120)
chr3 (218-354)||(19664541-19664677)
chr3 (213-349)||(21890175-21890311)
chr3 (213-349)||(42016878-42017014)
chr3 (213-350)||(40922165-40922302)
chr3 (213-354)||(53196014-53196155)
chr3 (214-354)||(29677476-29677616)
chr3 (213-354)||(1448735-1448873)
chr3 (213-350)||(10618480-10618617)
chr3 (213-354)||(35608131-35608272)
chr3 (213-354)||(39069726-39069867)
chr3 (213-354)||(52821049-52821190)
chr3 (213-354)||(27070739-27070880)
chr3 (213-354)||(19268521-19268668)
chr3 (234-354)||(50364908-50365028)
chr3 (213-354)||(45380260-45380401)
chr3 (213-354)||(55164115-55164256)
chr3 (234-352)||(50977866-50977984)
chr3 (234-352)||(51080998-51081116)
chr3 (213-354)||(38923998-38924139)
chr3 (234-350)||(51475267-51475383)
chr3 (213-354)||(33473239-33473380)
chr3 (241-354)||(28699685-28699798)
chr3 (234-352)||(34019462-34019580)
chr3 (234-328)||(42641199-42641293)
chr3 (277-354)||(44152700-44152777)
chr3 (290-354)||(47473230-47473294)
chr3 (213-255)||(44152772-44152814)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (213-349)||(15847117-15847253)
chr8 (213-354)||(43806533-43806674)
chr8 (213-354)||(3875908-3876049)
chr8 (213-354)||(35443311-35443452)
chr8 (213-354)||(513308-513448)
chr8 (213-354)||(2533272-2533413)
chr8 (213-350)||(37933646-37933783)
chr8 (213-352)||(35884430-35884569)
chr8 (213-354)||(12010549-12010693)
chr8 (213-354)||(22683988-22684129)
chr8 (213-354)||(36400070-36400211)
chr8 (213-350)||(38107103-38107240)
chr8 (213-354)||(38633710-38633851)
chr8 (213-354)||(41536527-41536668)
chr8 (213-350)||(259982-260118)
chr8 (213-350)||(440844-440981)
chr8 (213-350)||(655803-655939)
chr8 (213-350)||(841538-841674)
chr8 (213-354)||(1293486-1293627)
chr8 (213-354)||(28707446-28707587)
chr8 (213-354)||(9056338-9056479)
chr8 (234-354)||(23935233-23935353)
chr8 (213-350)||(38208756-38208894)
chr8 (213-354)||(28496355-28496495)
chr8 (213-354)||(33651841-33651982)
chr8 (213-350)||(40301893-40302030)
chr8 (218-354)||(39513344-39513480)
chr8 (213-327)||(23972295-23972409)
chr8 (213-350)||(4649154-4649291)
chr8 (213-354)||(24430571-24430712)
chr8 (234-354)||(7434886-7435006)
chr8 (234-352)||(6016207-6016325)
chr8 (213-343)||(13797100-13797229)
chr8 (213-354)||(42988227-42988367)
chr8 (234-354)||(29485287-29485406)
chr8 (213-350)||(36218781-36218917)
chr8 (214-278)||(24193131-24193195)
chr8 (276-354)||(24193356-24193433)
chr8 (290-348)||(8137180-8137238)
chr8 (218-252)||(8137240-8137274)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (213-354)||(11000728-11000869)
chr5 (213-350)||(14717609-14717746)
chr5 (213-354)||(42993518-42993659)
chr5 (213-354)||(3352002-3352143)
chr5 (213-354)||(6251972-6252113)
chr5 (213-350)||(6600136-6600273)
chr5 (213-354)||(6739955-6740096)
chr5 (213-354)||(8215900-8216041)
chr5 (213-354)||(27457197-27457338)
chr5 (213-354)||(30297749-30297890)
chr5 (213-354)||(40074950-40075091)
chr5 (213-352)||(39002025-39002164)
chr5 (213-343)||(1052544-1052674)
chr5 (213-354)||(16095960-16096100)
chr5 (213-354)||(26593280-26593421)
chr5 (213-354)||(33760470-33760611)
chr5 (213-354)||(38964114-38964254)
chr5 (213-354)||(39824556-39824697)
chr5 (214-354)||(30863253-30863393)
chr5 (214-354)||(41282342-41282482)
chr5 (213-354)||(8689572-8689713)
chr5 (213-350)||(14952328-14952465)
chr5 (213-350)||(20408537-20408674)
chr5 (213-362)||(23128913-23129062)
chr5 (213-354)||(31710282-31710423)
chr5 (213-354)||(35342180-35342321)
chr5 (213-354)||(4015874-4016015)
chr5 (213-354)||(11692147-11692288)
chr5 (213-354)||(19659501-19659642)
chr5 (213-354)||(20079258-20079399)
chr5 (213-354)||(43166269-43166410)
chr5 (213-354)||(30208402-30208543)
chr5 (213-354)||(28078405-28078546)
chr5 (213-350)||(27116099-27116236)
chr5 (234-354)||(16752116-16752236)
chr5 (213-350)||(19398193-19398330)
chr5 (252-354)||(6331377-6331479)
chr5 (234-354)||(26035367-26035487)
chr5 (213-350)||(11935450-11935586)
chr5 (234-343)||(444965-445074)
chr5 (213-354)||(8694866-8695007)
chr5 (213-354)||(27509978-27510112)
chr5 (213-257)||(6332873-6332917)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (213-354)||(12143072-12143213)
chr1 (213-354)||(23767414-23767555)
chr1 (213-354)||(41106016-41106157)
chr1 (213-354)||(46825531-46825672)
chr1 (213-354)||(19315640-19315781)
chr1 (213-354)||(28425363-28425504)
chr1 (213-354)||(33674017-33674158)
chr1 (213-354)||(38473626-38473767)
chr1 (213-354)||(46051450-46051591)
chr1 (213-350)||(49094711-49094848)
chr1 (213-352)||(25988271-25988410)
chr1 (213-354)||(7553016-7553157)
chr1 (213-354)||(7651662-7651803)
chr1 (213-354)||(36157678-36157818)
chr1 (213-354)||(50689943-50690084)
chr1 (213-352)||(49814302-49814441)
chr1 (216-354)||(24204474-24204612)
chr1 (213-354)||(26549388-26549529)
chr1 (213-354)||(43396675-43396816)
chr1 (214-354)||(19274559-19274699)
chr1 (213-352)||(36781172-36781311)
chr1 (213-354)||(16705870-16706011)
chr1 (213-354)||(23228194-23228335)
chr1 (213-354)||(33325727-33325868)
chr1 (213-350)||(37216900-37217037)
chr1 (213-354)||(46095075-46095216)
chr1 (213-350)||(45350717-45350852)
chr1 (213-339)||(48669396-48669522)
chr1 (213-354)||(7608766-7608907)
chr1 (213-350)||(9962755-9962892)
chr1 (213-354)||(18892329-18892470)
chr1 (213-354)||(48802331-48802472)
chr1 (213-354)||(52349924-52350065)
chr1 (213-349)||(5400876-5401011)
chr1 (214-354)||(50533383-50533523)
chr1 (213-354)||(6711440-6711581)
chr1 (233-350)||(9974846-9974963)
chr1 (213-350)||(21965069-21965206)
chr1 (213-350)||(26069896-26070033)
chr1 (214-354)||(18917524-18917664)
chr1 (213-350)||(45670486-45670623)
chr1 (213-350)||(8141486-8141623)
chr1 (213-350)||(9878784-9878921)
chr1 (213-350)||(34971084-34971221)
chr1 (213-354)||(52146993-52147134)
chr1 (234-350)||(16506809-16506925)
chr1 (234-354)||(33194672-33194792)
chr1 (234-350)||(48319067-48319183)
chr1 (213-350)||(18782089-18782226)
chr1 (213-354)||(52067651-52067792)
chr1 (215-350)||(41982237-41982372)
chr1 (213-349)||(21929526-21929667)
chr1 (213-354)||(40721342-40721484)
chr1 (213-354)||(17983898-17984039)
chr1 (250-354)||(12964646-12964750)
chr1 (234-354)||(30281631-30281751)
chr1 (213-349)||(33714361-33714495)
chr1 (213-350)||(25800648-25800782)
chr1 (213-314)||(44978768-44978868)
chr1 (276-354)||(50099220-50099298)
chr1 (306-354)||(44979281-44979329)
chr1 (310-354)||(32373650-32373694)
chr1 (310-352)||(17989864-17989906)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (213-354)||(114-255)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (213-354)||(218885-219027)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (213-354)||(252438-252579)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (213-350)||(5027-5164)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (214-350)||(11362-11498)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (213-350)||(5190-5326)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (213-349)||(47967-48103)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (213-350)||(13099-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (213-350)||(59608-59745)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (234-354)||(1994-2114)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (213-294)||(599-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (213-294)||(1913-1994)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (213-294)||(3371-3452)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (213-294)||(1877-1958)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (301-354)||(289-342)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (304-354)||(19781-19831)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 2094410 - 2094551
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2094410 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaa 2094509  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2094510 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 2094551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Original strand, 2094215 - 2094336
Alignment:
Q  18 agaggggaggaagaaggtgagagtaaggaaagaagaggaagtagatttggtgacgagggtgtaccaaaacatttggtggaattataagatctaatattaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2094215 agaggggaggaagaaggtgagagtaaggaaagaagaggaagtagatttggtgacgagggtgtaccaaaacatttggtggaattataagatctaatattaa 2094314  T
Q  118 aaaggtcaaatgcatctaaagg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2094315 aaaggtcaaatgcatctaaagg 2094336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 219 - 354
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772116
Alignment:
Q  219 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  319 atctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 772116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 921163 - 921022
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  921163 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 921064  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  921063 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 921022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2456151 - 2456010
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2456151 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaa 2456052  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2456051 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 2456010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9276715 - 9276574
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9276715 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 9276616  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9276615 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctct 9276574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 16246193 - 16246334
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16246193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16246292  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16246293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 16246334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27328725 - 27328584
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  27328725 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 27328626  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27328625 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27328584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 41500502 - 41500643
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41500502 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaa 41500601  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41500602 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41500643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444369
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 36444369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 17484550 - 17484687
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17484550 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaa 17484649  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17484650 ttagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataatg 17484687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 28650426 - 28650567
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28650426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28650525  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28650526 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctct 28650567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40854750 - 40854609
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40854750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40854651  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40854650 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40854609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134229
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctct 17134229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 220 - 354
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430765
Alignment:
Q  220 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  320 tctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatgctct 3430765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 1106559 - 1106700
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1106559 gaatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1106658  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1106659 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 1106700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 11949426 - 11949567
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  11949426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaata 11949525  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11949526 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11949567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 33106969 - 33107110
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33106969 gaatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 33107068  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  33107069 ttagtcatctttttaggcatgaaaaatggtaaataatgctct 33107110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34253283 - 34253142
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  34253283 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaata 34253184  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34253183 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 34253142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7379104 - 7378963
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7379104 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7379005  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7379004 ttagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7378963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 33865267 - 33865408
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33865267 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33865366  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  33865367 ttagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataatactct 33865408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37838438 - 37838301
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37838438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37838339  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  37838338 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 37838301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 2314975 - 2315114
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2314975 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2315074  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  2315075 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgct 2315114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2057067 - 2056929
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  2057067 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaa 2056968  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgc 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  2056967 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgc 2056929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8899822 - 8899682
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8899822 gaatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8899724  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8899723 ctagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 8899682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 12759750 - 12759890
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  12759750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcct-ctaacacccacttaaaa 12759848  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12759849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211046
Alignment:
Q  218 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagt 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
Q  318 catctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 36211046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751048
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38751048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 7297234 - 7297373
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  7297234 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 7297373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19180562 - 19180422
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19180562 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct-ctaacacccacttaaaa 19180464  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19180463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 19180422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 25087796 - 25087933
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25087796 gaattgtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 25087895  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  25087896 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 25087933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 43249412 - 43249553
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43249412 gaatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43249511  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43249512 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 43249553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29737889 - 29737748
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  29737889 gaattgtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaa 29737790  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29737789 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29737748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42630103 - 42629962
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42630103 gaatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 42630004  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||    
T  42630003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggatgatgctct 42629962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 37732193 - 37732334
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37732193 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37732292  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  37732293 ttagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctct 37732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 8396572 - 8396692
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8396572 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 8396671  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  8396672 acaaatggtggataatgctct 8396692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45124260 - 45124120
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  45124260 gaatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaa 45124161  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctc 353  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  45124160 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctc 45124120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9331897 - 9331757
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9331897 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaaga 9331798  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctc 353  Q
    ||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9331797 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 9331757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14630755 - 14630663
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacaccca 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14630755 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37654224 - 37654112
Alignment:
Q  238 tagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaa 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  37654224 tagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaa 37654125  T
Q  338 atggtgaataatg 350  Q
    ||| |||||||||    
T  37654124 atgatgaataatg 37654112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 253 - 354
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178160
Alignment:
Q  253 gtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgct 41178158  T
Q  353 ct 354  Q
    ||    
T  41178159 ct 41178160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 19916008 - 19916128
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||||| || ||    
T  19916008 attgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttg 19916107  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||| ||| ||||||||||    
T  19916108 acaaattgtggataatgctct 19916128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 303
Target Start/End: Original strand, 23671811 - 23671901
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacc 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23671811 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673014
Alignment:
Q  298 aacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggaaaatgctct 23673014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 31684134 - 31684275
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31684134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 31684233  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31684234 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31684275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219145
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47219145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 1469493 - 1469634
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1469493 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1469592  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1469593 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1469634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 47281124 - 47281265
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47281124 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47281223  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47281224 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47281265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544409
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 44544409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 11476556 - 11476697
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11476556 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11476655  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||    
T  11476656 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 11476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23842446 - 23842305
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23842446 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaa 23842347  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  23842346 ttagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctct 23842305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 30798368 - 30798509
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30798368 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30798467  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  30798468 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30798509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 35600122 - 35600263
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35600122 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 35600221  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35600222 ttagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35600263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40851415 - 40851274
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40851415 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40851316  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  40851315 ttagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctct 40851274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41113518 - 41113377
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41113518 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 41113419  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  41113418 ttagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatgctct 41113377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 47294291 - 47294432
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  47294291 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataa 47294390  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47294391 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47294432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 341
Target Start/End: Original strand, 2960640 - 2960768
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2960640 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2960739  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatgg 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2960740 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30876400 - 30876259
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30876400 gaatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaa 30876301  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30876300 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30876259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 37393998 - 37394135
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37393998 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaa 37394097  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  37394098 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37394135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 38427563 - 38427704
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38427563 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38427662  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  38427663 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctct 38427704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47272122 - 47271981
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47272122 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 47272023  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  47272022 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 47271981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 41139408 - 41139553
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcata----gttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccactt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  41139408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctt 41139507  T
Q  309 aaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41139508 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 41139553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 8162712 - 8162853
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8162712 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8162811  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  8162812 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 8162853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 27364339 - 27364480
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364339 gaatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 27364438  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  27364439 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 27364480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 30971941 - 30972082
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971941 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 30972040  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  30972041 ttagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctct 30972082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 43752776 - 43752917
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  43752776 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaa 43752875  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  43752876 ttagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctct 43752917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48628946 - 48628805
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48628946 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 48628847  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48628846 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48628805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923220
Alignment:
Q  218 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  318 catctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataatg 4923220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 214 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884323
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 33884323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 11050261 - 11050398
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||    
T  11050261 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaa 11050360  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  11050361 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11050398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 43968259 - 43968400
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43968259 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaa 43968358  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43968359 ttagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctct 43968400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 221416 - 221302
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  221416 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221317  T
Q  313 ttagtcatcttttta 327  Q
    |||||| ||||||||    
T  221316 ttagtcttcttttta 221302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7336200 - 7336065
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7336200 gaatcgtttcaaaca-gttctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7336102  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7336101 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataat 7336065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 45723491 - 45723632
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  45723491 gaatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 45723590  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45723591 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 45723632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248342
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataattctct 29248342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Original strand, 37354284 - 37354400
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37354284 attgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 37354383  T
Q  334 gcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||| ||||||    
T  37354384 gcaaatggtggataatg 37354400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 42979338 - 42979479
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  42979338 gaatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaa 42979437  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  42979438 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 42979479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 3797544 - 3797664
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3797544 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 3797643  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
      |||||||| ||||||||||    
T  3797644 ttaaatggtggataatgctct 3797664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47120134 - 47119991
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcata--gttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  47120134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaa 47120035  T
Q  311 aattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  47120034 aattagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 47119991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 47579086 - 47579228
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatt-gcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaa 311  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47579086 gaattgtttcagacaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaa 47579185  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  47579186 attaaccatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 47579228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 44800410 - 44800547
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44800410 gaattgtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaa 44800509  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||    
T  44800510 ttagtcatctttttaggcatgatatatggtggataatg 44800547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27774228 - 27774108
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  27774228 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatg 27774129  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  27774128 gcaaatggtggataatgctct 27774108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18353285 - 18353148
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| | ||||||    
T  18353285 gaatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaa 18353186  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||    
T  18353185 ttagtcatctttttagacatgataaatggtggataatg 18353148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520918
Alignment:
Q  261 ttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctct 40520918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42888990 - 42888937
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888990 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5106182 - 5106127
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 269  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5106182 gaatcgtttcaaacat-tcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 5106127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034062
Alignment:
Q  294 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39034062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739781
Alignment:
Q  305 acttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatc-ttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 29739781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12626777 - 12626636
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12626777 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 12626678  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12626677 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12626636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 8178249 - 8178390
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8178249 gaatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8178348  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8178349 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctct 8178390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10256378 - 10256237
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10256378 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 10256279  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  10256278 ttagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctct 10256237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2707600 - 2707459
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2707600 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2707501  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2707500 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 2707459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 17428272 - 17428409
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17428272 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 17428371  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17428372 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataatg 17428409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29050413 - 29050272
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29050413 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 29050314  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||  |||||||||    
T  29050313 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctct 29050272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30379158 - 30379021
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30379158 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 30379059  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  30379058 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 30379021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503718
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6503718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 1915343 - 1915484
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1915343 gaatagtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1915442  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1915443 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1915484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3408330 - 3408189
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3408330 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 3408231  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3408230 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3408189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9382660 - 9382519
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9382660 gaatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 9382561  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9382560 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 9382519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2390406 - 2390267
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||    
T  2390406 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataa 2390307  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  2390306 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16193451 - 16193314
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193451 gaatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 16193352  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16193351 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 16193314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17943177 - 17943040
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17943177 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17943078  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  17943077 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatg 17943040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 26393009 - 26393146
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26393009 gaatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 26393108  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  26393109 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26393146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Original strand, 2598099 - 2598229
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2598099 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2598198  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtg 343  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2598199 ttactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1077378 - 1077241
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1077378 gaatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 1077279  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1077278 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 1077241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 26230932 - 26231073
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26230932 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 26231031  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26231032 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26231073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 3258807 - 3258948
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaa 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  3258807 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaa 3258905  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  3258906 attagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctct 3258948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11134015 - 11133873
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt-gaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11134015 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 11133916  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||    
T  11133915 attagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctct 11133873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 26196321 - 26196458
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaa 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  26196321 gaatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaaca-acacttaaa 26196419  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  26196420 attaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26196458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Original strand, 35223919 - 35224025
Alignment:
Q  233 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35223919 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 35224018  T
Q  333 ggcaaat 339  Q
    | |||||    
T  35224019 gtcaaat 35224025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26936727 - 26936607
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26936727 attgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 26936628  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||| ||||| ||||    
T  26936627 acaaatggtggataatactct 26936607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 6785101 - 6785239
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||   |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6785101 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6785197  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||  || ||||||||||    
T  6785198 ttagtcatctttttagtcatgtcaaattttgtataatgctct 6785239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31376058 - 31375971
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31376058 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 333
Target Start/End: Original strand, 10931148 - 10931267
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||    
T  10931148 gaatcgtatcaaacaagtcctaatgtggatagcatagttg-taattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaa 10931246  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  10931247 ttagtcatctttttaggcatg 10931267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 320
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820656
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |  ||| ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  314 tagtcat 320  Q
    |||||||    
T  25820650 tagtcat 25820656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 273
Target Start/End: Original strand, 12612971 - 12613031
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12612971 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaa 12613031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 288
Target Start/End: Original strand, 12612848 - 12612923
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaat 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  12612848 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaat 12612923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 33807780 - 33807921
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33807780 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 33807879  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33807880 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33807921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31973732 - 31973591
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  31973732 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 31973633  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31973632 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31973591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42273943 - 42273802
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  42273943 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 42273844  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42273843 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 42273802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 11795154 - 11795295
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11795154 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 11795253  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11795254 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 11795295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 19496102 - 19496243
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19496102 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaa 19496201  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19496202 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 19496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28264784 - 28264643
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  28264784 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 28264685  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28264684 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28264643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 28812287 - 28812427
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28812287 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 28812385  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28812386 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 28812427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26017564 - 26017425
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26017564 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26017465  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||    
T  26017464 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgct 26017425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 4544985 - 4545126
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4544985 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 4545084  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4545085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 4545126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12196610 - 12196469
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12196610 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12196511  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12196510 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12196469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 17847096 - 17847236
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17847096 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17847195  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17847196 ttagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 17847236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31591216 - 31591076
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31591216 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 31591117  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  31591116 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 31591076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 48707733 - 48707874
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48707733 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48707832  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48707833 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 48707874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 55517185 - 55517326
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  55517185 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 55517284  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  55517285 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 55517326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988633
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 40988633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 49118752 - 49118616
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  49118752 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 49118653  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  49118652 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 49118616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 24458631 - 24458770
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24458631 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 24458730  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  24458731 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 24458770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Original strand, 23135006 - 23135136
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23135006 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23135105  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtg 343  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  23135106 ttagtcatttttttaggcatgccaaatggtg 23135136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5227531 - 5227390
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||    
T  5227531 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaa 5227432  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5227431 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 5227390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 30467003 - 30467140
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30467003 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaa 30467102  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30467103 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 30467140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 48551764 - 48551901
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  48551764 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaa 48551863  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48551864 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 48551901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 51371047 - 51371188
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  51371047 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 51371146  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51371147 ttagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctct 51371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 8882013 - 8882152
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8882013 gaatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8882112  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  8882113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 8882152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 214 - 353
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174160
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctc 353  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctc 33174160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 9339123 - 9339267
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatc---tttggtactaaatttggctcctaacacccactta 309  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9339123 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccactta 9339222  T
Q  310 aaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9339223 aaattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctct 9339267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14564937 - 14564796
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14564937 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 14564838  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14564837 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 14564796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 28159953 - 28160094
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28159953 gaatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28160052  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28160053 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28160094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 30141108 - 30141249
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30141108 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 30141207  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  30141208 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctct 30141249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32318094 - 32317957
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  32318094 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaa 32317995  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  32317994 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 32317957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35930180 - 35930040
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35930180 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35930081  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  35930080 ttagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctct 35930040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 39995167 - 39995308
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39995167 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaa 39995266  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39995267 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataatcctct 39995308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118714
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 32118714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44490460 - 44490324
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||     
T  44490460 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaag 44490361  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  44490360 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 44490324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 215 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588580
Alignment:
Q  215 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatt 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  315 agtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatggtaaatggcagataatgctct 10588580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 48149640 - 48149502
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  48149640 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaa 48149541  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgc 351  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  48149540 ttactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgc 48149502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 17993017 - 17993158
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17993017 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 17993116  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17993117 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 17993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 33693333 - 33693474
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  33693333 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 33693432  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  33693433 ttattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctct 33693474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 50276138 - 50276274
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50276138 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 50276237  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||   |||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  50276238 ttag---tctttttaggcatggcaaacggtggataatgct 50276274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 50542354 - 50542495
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  50542354 gaatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 50542453  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  50542454 ttaatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 50542495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2055419 - 2055280
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  2055419 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaag 2055320  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  2055319 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 2055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15985151 - 15985010
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15985151 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 15985052  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15985051 tcagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 15985010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25730381 - 25730244
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  25730381 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaa 25730282  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  25730281 ttagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataatg 25730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31208885 - 31208776
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31208885 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaa 31208786  T
Q  313 ttagtcatct 322  Q
    ||||||||||    
T  31208785 ttagtcatct 31208776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39700186 - 39700045
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  39700186 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaa 39700087  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39700086 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctct 39700045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22298659 - 22298517
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22298659 gaatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22298560  T
Q  313 ttagtcatct-ttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  22298559 ttagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctct 22298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381848
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgct 37381848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23553205 - 23553069
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23553205 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 23553107  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  23553106 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 23553069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 25734223 - 25734360
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25734223 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25734322  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  25734323 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataatg 25734360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 19168816 - 19168936
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19168816 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 19168915  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  19168916 acaaatggtggataatgctct 19168936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24623268 - 24623148
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||    
T  24623268 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatg 24623169  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  24623168 acaaatggtggataatgctct 24623148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 338
Target Start/End: Original strand, 42549643 - 42549747
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  42549643 attgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatg 42549742  T
Q  334 gcaaa 338  Q
     ||||    
T  42549743 acaaa 42549747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20534306 - 20534225
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggct 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20534306 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggct 20534225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 354
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555281
Alignment:
Q  273 atctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 56555281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 248
Target Start/End: Original strand, 56555165 - 56555200
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcata 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56555165 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacata 56555200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21564637 - 21564496
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21564637 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaa 21564538  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21564537 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 21564496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33151837 - 33151696
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33151837 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33151738  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33151737 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33151696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1017185 - 1017044
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  1017185 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 1017086  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1017085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1017044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1687792 - 1687655
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1687792 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1687693  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1687692 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 1687655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 20086314 - 20086455
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20086314 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20086413  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  20086414 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 20086455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31122803 - 31122662
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||    
T  31122803 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaa 31122704  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31122703 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 31122662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 35346471 - 35346608
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35346471 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35346570  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  35346571 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 35346608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22851996
Alignment:
Q  219 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtc 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  319 atctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatgctct 22851996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 20813441 - 20813582
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20813441 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20813540  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20813541 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 20813582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21656659 - 21656518
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21656659 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 21656560  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  21656559 ttagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 21656518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26455723 - 26455582
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26455723 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 26455624  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  26455623 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctct 26455582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38446617 - 38446476
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38446617 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38446518  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  38446517 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctct 38446476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41251027 - 41250886
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41251027 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 41250928  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41250927 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 41250886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 47329175 - 47329316
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47329175 gaatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47329274  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  47329275 ttagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctct 47329316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50287707 - 50287570
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287707 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50287608  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  50287607 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 50287570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 20913754 - 20913893
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20913754 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20913853  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20913854 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20913893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 20921872 - 20922011
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20921872 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20921971  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20921972 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataatgct 20922011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 221 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748391
Alignment:
Q  221 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  321 ctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 12748391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 20760071 - 20760212
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  20760071 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 20760170  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20760171 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 20760212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 32650820 - 32650957
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32650820 gaatcatttcaaacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 32650919  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  32650920 ttagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataatg 32650957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 36314972 - 36315113
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36314972 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 36315071  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36315072 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36315113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37248097 - 37247956
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37248097 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37247998  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  37247997 ttagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctct 37247956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 42107099 - 42107240
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42107099 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42107198  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42107199 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 42107240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3697287 - 3697148
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  3697287 gaatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 3697188  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3697187 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgct 3697148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44798408 - 44798268
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44798408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 44798309  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44798308 ttactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctct 44798268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48651389 - 48651248
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48651389 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 48651290  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48651289 ttaatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 48651248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 51562303 - 51562162
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  51562303 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 51562204  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51562203 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 51562162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 53925979 - 53926120
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  53925979 gaatcatttcaaataagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaa 53926078  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  53926079 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctct 53926120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664541
Alignment:
Q  218 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  318 catctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19664541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21890311 - 21890175
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  21890311 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 21890212  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  21890211 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 21890175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42017014 - 42016878
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42017014 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42016915  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  42016914 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataat 42016878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 40922165 - 40922302
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40922165 gaatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40922264  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  40922265 ttagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataatg 40922302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 53196155 - 53196014
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  53196155 gaatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 53196056  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  53196055 ttagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 53196014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677476
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 29677476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 1448735 - 1448873
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1448735 gaatcgtttcaaagaagtcctattgt---taccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1448831  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1448832 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 1448873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 10618480 - 10618617
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  10618480 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 10618579  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  10618580 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 10618617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 35608131 - 35608272
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||     
T  35608131 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaac 35608230  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  35608231 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatactct 35608272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39069867 - 39069726
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39069867 gaatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaa 39069768  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39069767 ttagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctct 39069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 52821049 - 52821190
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52821049 gaatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaa 52821148  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||    
T  52821149 ttagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctct 52821190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 27070739 - 27070880
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||    
T  27070739 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaa 27070838  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||| |  |||   |||||||| ||||||||||    
T  27070839 ttagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctct 27070880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19268668 - 19268521
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagca------tagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccac 306  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||      ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19268668 gaatcgttttaaacaagtcctaatgtagataacaataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccac 19268569  T
Q  307 ttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19268568 ttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19268521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 50364908 - 50365028
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  50364908 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatg 50365007  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  50365008 gcaaatggtgggtaatgctct 50365028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 45380260 - 45380401
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgg-taattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaa 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  45380260 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaa 45380358  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  45380359 attagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctct 45380401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 55164115 - 55164256
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55164115 gaattgtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaa 55164214  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||    
T  55164215 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgctct 55164256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 50977984 - 50977866
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  50977984 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 50977885  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgct 352  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  50977884 acaaatggtggataatgct 50977866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 51081116 - 51080998
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  51081116 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatg 51081017  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgct 352  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  51081016 acaaatggtggataatgct 51080998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 38923998 - 38924139
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  38923998 gaattgtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaa 38924097  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  38924098 ttaatcatctctttaagcatgacaaataatgaataacgctct 38924139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Original strand, 51475267 - 51475383
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  51475267 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 51475366  T
Q  334 gcaaatggtgaataatg 350  Q
     ||||||||| ||||||    
T  51475367 acaaatggtggataatg 51475383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 33473239 - 33473380
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  33473239 gaatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaa 33473338  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||    
T  33473339 ttagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctct 33473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28699798 - 28699685
Alignment:
Q  241 atagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatg 340  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28699798 atagcttagtagataattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatg 28699699  T
Q  341 gtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||    
T  28699698 gtggataatgctct 28699685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34019580 - 34019462
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |   ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||    
T  34019580 attgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatg 34019481  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgct 352  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  34019480 tcaaatggtggataatgct 34019462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 328
Target Start/End: Original strand, 42641199 - 42641293
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaa 328  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  42641199 attgtatatagccaagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatcttattaa 42641293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152700
Alignment:
Q  277 ttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44152700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47473294 - 47473230
Alignment:
Q  290 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47473294 tggctcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 47473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44152814 - 44152772
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggta 255  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  44152814 gaatcgtttcaaacaagtcatattatagataacatagttggta 44152772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15847253 - 15847117
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15847253 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 15847154  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15847153 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataat 15847117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 43806533 - 43806674
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43806533 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaa 43806632  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  43806633 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 43806674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3876049 - 3875908
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  3876049 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaa 3875950  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3875949 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 3875908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35443452 - 35443311
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35443452 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35443353  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35443352 ttagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 35443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 513448 - 513308
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  513448 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 513349  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  513348 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctct 513308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2533413 - 2533272
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2533413 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaa 2533314  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2533313 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 2533272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37933783 - 37933646
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37933783 gaatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37933684  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  37933683 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 37933646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 35884430 - 35884569
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35884430 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 35884529  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  35884530 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataatgct 35884569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12010693 - 12010549
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtag---atagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccactta 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12010693 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccactta 12010594  T
Q  310 aaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12010593 aaattagtcatctttttatgcatggcaaatggtggataatgctct 12010549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 22683988 - 22684129
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22683988 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22684087  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22684088 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatgctct 22684129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 36400070 - 36400211
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||     
T  36400070 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaac 36400169  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36400170 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36400211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38107240 - 38107103
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38107240 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38107141  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  38107140 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 38107103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 38633710 - 38633851
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  38633710 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaa 38633809  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38633810 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 38633851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 41536527 - 41536668
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41536527 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41536626  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  41536627 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaaaaatactct 41536668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 260118 - 259982
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  260118 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 260019  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||| |||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  260018 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 259982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 440981 - 440844
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  440981 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 440882  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||    
T  440881 ttactcatctttttagacatggcaaacggtggataatg 440844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 655803 - 655939
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  655803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 655902  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||| |||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  655903 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 655939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 841538 - 841674
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  841538 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 841637  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||| |||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  841638 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataatg 841674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1293627 - 1293486
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  1293627 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaa 1293528  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1293527 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 1293486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 28707446 - 28707587
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28707446 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaa 28707545  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28707546 ttagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctct 28707587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 9056338 - 9056479
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  9056338 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 9056437  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  9056438 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 9056479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23935353 - 23935233
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23935353 attgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 23935254  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23935253 gcaaatggtggataatgctct 23935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38208894 - 38208756
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38208894 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38208795  T
Q  313 ttagtcat-ctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  38208794 ttagtcatccattttagacatggcaaatggtggataatg 38208756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 28496355 - 28496495
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | | |||| ||||||||||||    
T  28496355 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctag-ttctaatacccacttaaaa 28496453  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||    
T  28496454 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatactct 28496495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33651982 - 33651841
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  33651982 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 33651883  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||||    
T  33651882 ttagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctct 33651841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 40301893 - 40302030
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40301893 gaatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaa 40301992  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  40301993 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 40302030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 354
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513480
Alignment:
Q  218 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagt 317  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
Q  318 catctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataatactct 39513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 213 - 327
Target Start/End: Original strand, 23972295 - 23972409
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  23972295 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaa 23972394  T
Q  313 ttagtcatcttttta 327  Q
    |||||||||||||||    
T  23972395 ttagtcatcttttta 23972409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4649291 - 4649154
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| || || | |||| ||||||||||    
T  4649291 gaatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaa 4649192  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4649191 ttagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataatg 4649154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 24430571 - 24430712
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||    
T  24430571 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaa 24430670  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24430671 ttagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctct 24430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7435006 - 7434886
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  7435006 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttg 7434907  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  7434906 acaaatggtggataatgctct 7434886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6016325 - 6016207
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6016325 attgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 6016226  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgct 352  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  6016225 acaaatggtggataatgct 6016207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13797229 - 13797100
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13797229 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaa 13797131  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtg 343  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13797130 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtg 13797100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 42988227 - 42988367
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  42988227 gaatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 42988325  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  42988326 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 42988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29485406 - 29485287
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  29485406 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatg 29485308  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  29485307 gcaaatgatggataatgctct 29485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 36218781 - 36218917
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || ||| |||||||||||||    
T  36218781 gaatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaa 36218879  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  36218880 ttagccatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 36218917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 278
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatcttt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193433
Alignment:
Q  276 tttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 24193433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8137238 - 8137180
Alignment:
Q  290 tggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataa 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  8137238 tggctcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8137274 - 8137240
Alignment:
Q  218 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttg 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8137274 gtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttg 8137240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 11000728 - 11000869
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11000728 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11000827  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  11000828 ttagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctct 11000869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14717746 - 14717609
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14717746 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14717647  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  14717646 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 14717609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42993659 - 42993518
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993659 gaattgtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 42993560  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  42993559 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctct 42993518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 3352002 - 3352143
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3352002 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 3352101  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  3352102 ttagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctct 3352143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6252113 - 6251972
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  6252113 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaa 6252014  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6252013 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctct 6251972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 6600136 - 6600273
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6600136 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6600235  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  6600236 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 6600273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 6739955 - 6740096
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  6739955 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 6740054  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6740055 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 6740096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8216041 - 8215900
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8216041 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8215942  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  8215941 ttagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 8215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 27457197 - 27457338
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27457197 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaa 27457296  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27457297 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 27457338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 30297749 - 30297890
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30297749 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaa 30297848  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30297849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30297890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40075091 - 40074950
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40075091 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40074992  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40074991 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 39002025 - 39002164
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39002025 gaattgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 39002124  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  39002125 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 39002164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1052674 - 1052544
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1052674 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1052575  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtg 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1052574 ttactcatctttttaagcatggcaaatggtg 1052544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 16095960 - 16096100
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16095960 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatc-ttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16096058  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  16096059 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctct 16096100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 26593280 - 26593421
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26593280 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26593379  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26593380 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 26593421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 33760470 - 33760611
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33760470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33760569  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33760570 ttagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctct 33760611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 38964114 - 38964254
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38964114 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38964213  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38964214 ttagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38964254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 39824697 - 39824556
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  39824697 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 39824598  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39824597 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 39824556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863253
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 30863253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282342
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 41282342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8689713 - 8689572
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8689713 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8689614  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8689613 ttagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctct 8689572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14952465 - 14952328
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14952465 gaatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14952366  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14952365 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 14952328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20408674 - 20408537
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||    
T  20408674 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaa 20408575  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20408574 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 20408537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 362
Target Start/End: Original strand, 23128913 - 23129062
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23128913 gaatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaa 23129012  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctctctgctgct 362  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  23129013 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgctgct 23129062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31710423 - 31710282
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31710423 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 31710324  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31710323 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 31710282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35342321 - 35342180
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35342321 gaatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35342222  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35342221 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 35342180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 4015874 - 4016015
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4015874 gaatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 4015973  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  4015974 ttagtcatatttttaggcatgataaatggtggataatgctct 4016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 11692147 - 11692288
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  11692147 gaatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 11692246  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  11692247 ttagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctct 11692288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 19659501 - 19659642
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19659501 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaa 19659600  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  19659601 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 19659642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 20079258 - 20079399
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20079258 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 20079357  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  20079358 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctct 20079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 43166269 - 43166410
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  43166269 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaa 43166368  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||    
T  43166369 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctct 43166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 30208402 - 30208543
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30208402 gaatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaa 30208501  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  30208502 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 30208543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 28078405 - 28078546
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28078405 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28078504  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||| | ||  ||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  28078505 ttagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctct 28078546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 27116099 - 27116236
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||    
T  27116099 gaatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaa 27116198  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||    
T  27116199 ttagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataatg 27116236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16752236 - 16752116
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16752236 attgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 16752137  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16752136 acaaatggtgaataatgctct 16752116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 19398193 - 19398330
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||    
T  19398193 gaatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaa 19398292  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  19398293 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatg 19398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 252 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331377
Alignment:
Q  252 ggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgc 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgc 6331380  T
Q  352 tct 354  Q
    |||    
T  6331379 tct 6331377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 26035367 - 26035487
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  26035367 attgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacg 26035466  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  26035467 acaaatggtggataatgctct 26035487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11935586 - 11935450
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11935586 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatcttt-gaaccaaatgtggctcctaacactcacttaaaa 11935488  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||    
T  11935487 ttagccatctttttaggcataacaaatagtggataatg 11935450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 445074 - 444965
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  445074 attgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtg 444975  T
Q  334 gcaaatggtg 343  Q
    ||||||||||    
T  444974 gcaaatggtg 444965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8695007 - 8694866
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||| ||| || |||||||||    
T  8695007 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaa 8694908  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  8694907 ttagtcatgttcttaggcatgataaatggtggataatgctct 8694866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 27510112 - 27509978
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||        |||| |   ||||||||    
T  27510112 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaa------aactaa-aaggacttaaaa 27510020  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27510019 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 27509978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6332917 - 6332873
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaat 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6332917 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagaatagttggtaat 6332873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12143213 - 12143072
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12143213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12143114  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12143113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 12143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 23767414 - 23767555
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23767414 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23767513  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23767514 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 23767555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41106157 - 41106016
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41106157 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41106058  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41106057 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 41106016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 46825672 - 46825531
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46825672 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 46825573  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46825572 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 46825531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19315781 - 19315640
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  19315781 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 19315682  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19315681 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 19315640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 28425363 - 28425504
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  28425363 gaatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 28425462  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28425463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 28425504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33674158 - 33674017
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33674158 gaatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33674059  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33674058 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 33674017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 38473626 - 38473767
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38473626 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 38473725  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38473726 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 38473767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 46051591 - 46051450
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46051591 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 46051492  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46051491 ctagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctct 46051450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 49094711 - 49094848
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49094711 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49094810  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  49094811 ttagtcatctttttaggcataacaaatggtggataatg 49094848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 25988271 - 25988410
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25988271 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25988370  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  25988371 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 25988410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 7553016 - 7553157
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7553016 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7553115  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  7553116 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctct 7553157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7651803 - 7651662
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7651803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7651704  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7651703 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 36157678 - 36157818
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36157678 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 36157776  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36157777 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 36157818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50690084 - 50689943
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50690084 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50689985  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  50689984 ttagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctct 50689943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 49814441 - 49814302
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49814441 gaatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49814342  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  49814341 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgct 49814302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 354
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204612
Alignment:
Q  216 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  316 gtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctct 24204612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26549529 - 26549388
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26549529 gaatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 26549430  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  26549429 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctct 26549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43396816 - 43396675
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43396816 gaatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43396717  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  43396716 ttagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctct 43396675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274559
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 352
Target Start/End: Original strand, 36781172 - 36781311
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36781172 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 36781271  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  36781272 ttagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataatgct 36781311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16706011 - 16705870
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  16706011 gaatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaa 16705912  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  16705911 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctct 16705870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 23228194 - 23228335
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  23228194 gaatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaa 23228293  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23228294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 23228335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33325868 - 33325727
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  33325868 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaa 33325769  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33325768 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 33325727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37217037 - 37216900
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||    
T  37217037 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaa 37216938  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  37216937 ttagtcatctttttagacatggcaaatggtggataatg 37216900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 46095075 - 46095216
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  46095075 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaa 46095174  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  46095175 ttagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctct 46095216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 45350717 - 45350852
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45350717 gaatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 45350814  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  45350815 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45350852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 339
Target Start/End: Original strand, 48669396 - 48669522
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48669396 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48669495  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaat 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48669496 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 48669522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 7608766 - 7608907
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7608766 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 7608865  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7608866 ttagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 7608907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9962892 - 9962755
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  9962892 gaatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaa 9962793  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  9962792 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 9962755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18892470 - 18892329
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18892470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaa 18892371  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  18892370 ttagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctct 18892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 48802331 - 48802472
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48802331 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaa 48802430  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||    
T  48802431 ttagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctct 48802472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 52349924 - 52350065
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52349924 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 52350023  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  52350024 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 52350065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5401011 - 5400876
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  5401011 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaa 5400912  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  5400911 ttagtcatctttttaggcat-gcaaatggtggataat 5400876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533383
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctct 50533383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6711581 - 6711440
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6711581 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6711482  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6711481 ttagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctct 6711440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9974963 - 9974846
Alignment:
Q  233 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9974963 tattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcat 9974864  T
Q  333 ggcaaatggtgaataatg 350  Q
    || |||||||| ||||||    
T  9974863 ggtaaatggtggataatg 9974846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21965206 - 21965069
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21965206 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaa 21965107  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21965106 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataatg 21965069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26070033 - 26069896
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26070033 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaa 26069934  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  26069933 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 26069896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917524
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataattctct 18917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 45670486 - 45670623
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||    
T  45670486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacc-acttaaa 45670584  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  45670585 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 45670623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 8141486 - 8141623
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| || ||  ||||||||||||||||    
T  8141486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaa 8141585  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  8141586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 8141623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 9878784 - 9878921
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||  || |||||||||||||||||||    
T  9878784 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaa 9878883  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  9878884 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 9878921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34971221 - 34971084
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  |||| || |||||||||| |||||||||    
T  34971221 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaa 34971122  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34971121 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 34971084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 52147134 - 52146993
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  52147134 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 52147035  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52147034 ttattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 52146993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Original strand, 16506809 - 16506925
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16506809 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatg 16506908  T
Q  334 gcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16506909 gcaaatggtggataatg 16506925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 33194672 - 33194792
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33194672 attgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatg 33194771  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    || |||||||  |||||||||    
T  33194772 gcgaatggtggttaatgctct 33194792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Original strand, 48319067 - 48319183
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  48319067 attgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatt 48319166  T
Q  334 gcaaatggtgaataatg 350  Q
     ||||||||| ||||||    
T  48319167 acaaatggtggataatg 48319183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 18782089 - 18782226
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||    
T  18782089 gaatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaa 18782188  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18782189 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatg 18782226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 52067651 - 52067792
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  52067651 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 52067750  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||| ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  52067751 ttattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgctct 52067792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 215 - 350
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982372
Alignment:
Q  215 atcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatt 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  315 agtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataatg 41982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21929667 - 21929526
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaac-------taatctttggtactaaatttggctcctaacaccca 305  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  21929667 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaaccca 21929568  T
Q  306 cttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  21929567 cttaaaattagtcatcttttta--gatggcaaatggtggataat 21929526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40721484 - 40721342
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacaccc-acttaaa 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||| || ||||    
T  40721484 gaatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaa 40721385  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40721384 attaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 40721342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 17983898 - 17984039
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||    
T  17983898 gaatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaa 17983997  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17983998 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctct 17984039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964646
Alignment:
Q  250 ttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||    
T  12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
Q  350 gctct 354  Q
    |||||    
T  12964650 gctct 12964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 30281751 - 30281631
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||    
T  30281751 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatg 30281652  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
      |||||||| ||||||||||    
T  30281651 taaaatggtggataatgctct 30281631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Original strand, 33714361 - 33714495
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| | |    
T  33714361 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-aca 33714458  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  33714459 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 33714495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25800782 - 25800648
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatc----tttggtactaaatttggctcctaacacccactt 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| |||      || ||||||||||||    
T  25800782 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaa------tcttaacacccactt 25800690  T
Q  309 aaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  25800689 aaaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatg 25800648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 314
Target Start/End: Original strand, 44978768 - 44978868
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44978768 gaatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaa 44978866  T
Q  313 tt 314  Q
    ||    
T  44978867 tt 44978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099220
Alignment:
Q  276 tttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||| |||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 50099220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 354
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979329
Alignment:
Q  306 cttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 44979329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 354
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373694
Alignment:
Q  310 aaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 32373694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 352
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989906
Alignment:
Q  310 aaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgct 352  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataatgct 17989906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 114
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  255 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 156  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  155 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 219027 - 218885
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaaca-cccacttaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  219027 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaa 218928  T
Q  312 attagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  218927 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 218885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 252438 - 252579
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  252438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 252537  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  252538 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctct 252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5164
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5027 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaa 5126  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  5127 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatg 5164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 214 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11498 - 11362
Alignment:
Q  214 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaat 313  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11498 aatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11399  T
Q  314 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  11398 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatg 11362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5190
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5326 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 5228  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  5227 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatg 5190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48103 - 47967
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  48103 gaatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 48004  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataat 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  48003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataat 47967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13099
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  13236 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 13137  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13136 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 13099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 213 - 350
Target Start/End: Original strand, 59608 - 59745
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  59608 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 59707  T
Q  313 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatg 350  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  59708 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataatg 59745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 354
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2114
Alignment:
Q  234 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaagcatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  1994 attgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatg 2093  T
Q  334 gcaaatggtgaataatgctct 354  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  2094 acaaatggtggataatgctct 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 599
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggct 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  680 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Original strand, 1913 - 1994
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggct 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1913 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Original strand, 3371 - 3452
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggct 294  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  3371 gaatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct 3452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1877
Alignment:
Q  213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtactaaatttggct 294  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  1958 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaatctggct 1877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 354
Target Start/End: Original strand, 289 - 342
Alignment:
Q  301 acccacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctct 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19781
Alignment:
Q  304 cacttaaaattagtcatctttttaagcatggcaaatggtgaataatgctct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctct 19781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University