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Alignment Overview

Query: NF20762_high_12 (Length: 411)

Name: NF20762_high_12
Description: NF20762
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20762_high_12
NF20762_high_12
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (17-398)||(42736849-42737234)
chr1 (17-348)||(7112199-7112523)
chr1 (34-348)||(29018648-29018966)
chr1 (47-348)||(19082016-19082317)
chr1 (47-348)||(19129904-19130205)
chr1 (47-323)||(4652420-4652699)
chr1 (93-348)||(20582486-20582743)
chr1 (95-348)||(23616003-23616258)
chr1 (95-348)||(23647334-23647589)
chr1 (93-348)||(22867573-22867831)
chr1 (93-348)||(23731722-23731979)
chr1 (93-323)||(5942968-5943200)
chr1 (93-348)||(21443039-21443299)
chr1 (93-348)||(34747723-34747979)
chr1 (93-348)||(39506164-39506424)
chr1 (93-323)||(11921549-11921781)
chr1 (93-348)||(13522233-13522494)
chr1 (47-287)||(5296805-5297062)
chr1 (161-329)||(37691566-37691736)
chr1 (176-348)||(52020653-52020827)
chr1 (93-253)||(29019169-29019326)
chr1 (124-348)||(52348794-52349020)
chr1 (93-274)||(28050135-28050318)
chr1 (93-198)||(10787698-10787803)
chr1 (159-263)||(11932981-11933087)
chr1 (93-183)||(40374991-40375081)
chr1 (238-345)||(29019343-29019450)
chr1 (266-348)||(28051726-28051808)
chr1 (129-220)||(51052870-51052961)
chr1 (47-85)||(13522517-13522555)
chr1 (47-85)||(13522723-13522761)
chr1 (47-85)||(37691797-37691835)
chr1 (47-90)||(5943217-5943261)
chr1 (49-85)||(40374932-40374968)
chr1 (120-168)||(41072977-41073025)
chr1 (47-85)||(5297273-5297311)
chr1 (47-85)||(11931819-11931857)
chr1 (47-85)||(20581262-20581300)
chr1 (47-85)||(20582428-20582466)
chr1 (47-81)||(21443326-21443360)
chr1 (47-85)||(34748549-34748587)
chr1 (47-85)||(39506103-39506141)
chr1 (47-90)||(22867848-22867892)
chr1 (120-164)||(34608764-34608808)
chr1 (17-49)||(35034323-35034355)
chr1 (40-75)||(28050067-28050102)
chr1 (120-186)||(7846005-7846071)
chr1 (47-85)||(10787830-10787868)
chr1 (47-85)||(11922060-11922098)
chr1 (47-85)||(11932349-11932387)
chr1 (143-209)||(19475619-19475685)
chr1 (17-46)||(28410914-28410943)
chr1 (47-79)||(23730152-23730184)
chr1 (17-85)||(34748002-34748075)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (30-348)||(44519733-44520052)
chr4 (102-348)||(43318268-43318515)
chr4 (47-328)||(47526575-47526858)
chr4 (93-347)||(3735799-3736055)
chr4 (95-347)||(36311667-36311921)
chr4 (95-347)||(36325876-36326130)
chr4 (93-348)||(36899238-36899494)
chr4 (93-348)||(6201619-6201876)
chr4 (120-348)||(29004497-29004729)
chr4 (93-348)||(2832288-2832546)
chr4 (93-318)||(38054926-38055154)
chr4 (93-348)||(40696359-40696613)
chr4 (47-295)||(4440423-4440680)
chr4 (95-337)||(36662031-36662283)
chr4 (120-348)||(7526016-7526248)
chr4 (129-319)||(707857-708051)
chr4 (124-348)||(17991887-17992113)
chr4 (153-319)||(728602-728772)
chr4 (120-348)||(30260187-30260415)
chr4 (131-323)||(54131524-54131718)
chr4 (120-253)||(13937261-13937396)
chr4 (120-208)||(30059624-30059712)
chr4 (280-347)||(19730813-19730880)
chr4 (282-348)||(4441145-4441211)
chr4 (120-198)||(4895332-4895410)
chr4 (123-165)||(19729672-19729714)
chr4 (47-85)||(36311350-36311388)
chr4 (47-85)||(36325559-36325597)
chr4 (47-85)||(36898393-36898431)
chr4 (120-209)||(10373887-10373976)
chr4 (120-220)||(17256379-17256479)
chr4 (120-208)||(30029624-30029712)
chr4 (120-208)||(30045893-30045981)
chr4 (47-85)||(707238-707276)
chr4 (47-85)||(707735-707773)
chr4 (47-85)||(728843-728881)
chr4 (47-85)||(729341-729379)
chr4 (47-85)||(29004809-29004847)
chr4 (47-85)||(40696298-40696336)
chr4 (47-90)||(36311604-36311648)
chr4 (47-90)||(36325813-36325857)
chr4 (17-48)||(21798593-21798624)
chr4 (120-245)||(37066774-37066904)
chr4 (47-85)||(707491-707529)
chr4 (47-85)||(729086-729124)
chr4 (47-85)||(2832816-2832854)
chr4 (47-85)||(6202150-6202188)
chr4 (93-146)||(36898317-36898370)
chr4 (17-46)||(51396159-51396188)
chr4 (47-79)||(2832576-2832608)
chr4 (93-133)||(29004746-29004786)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (47-348)||(42709050-42709354)
chr8 (38-348)||(8387802-8388115)
chr8 (132-348)||(16682270-16682488)
chr8 (95-348)||(41529585-41529840)
chr8 (93-348)||(288463-288719)
chr8 (93-348)||(39028456-39028713)
chr8 (93-348)||(24983247-24983506)
chr8 (149-348)||(40940554-40940755)
chr8 (120-346)||(33022204-33022432)
chr8 (120-348)||(18307146-18307376)
chr8 (123-338)||(30438618-30438835)
chr8 (131-323)||(1431890-1432085)
chr8 (47-85)||(39028395-39028433)
chr8 (47-99)||(30438067-30438120)
chr8 (47-85)||(18308075-18308113)
chr8 (47-81)||(24982760-24982794)
chr8 (47-85)||(24982939-24982977)
chr8 (47-85)||(33021667-33021705)
chr8 (17-46)||(6952930-6952959)
chr8 (124-165)||(13773793-13773834)
chr8 (47-99)||(16680819-16680872)
chr8 (17-46)||(27198144-27198173)
chr8 (47-90)||(41529518-41529562)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (47-348)||(43512280-43512584)
chr3 (46-321)||(45876361-45876643)
chr3 (47-323)||(17475966-17476246)
chr3 (93-348)||(42934469-42934728)
chr3 (93-348)||(3696238-3696488)
chr3 (93-348)||(45698327-45698584)
chr3 (120-348)||(9598833-9599063)
chr3 (93-317)||(40319907-40320133)
chr3 (123-348)||(16075979-16076206)
chr3 (155-348)||(34947872-34948069)
chr3 (201-348)||(36633886-36634035)
chr3 (95-340)||(44162080-44162307)
chr3 (129-344)||(52107669-52107866)
chr3 (139-279)||(10380757-10380899)
chr3 (211-347)||(31731267-31731403)
chr3 (120-220)||(36980869-36980970)
chr3 (120-220)||(37006308-37006409)
chr3 (266-348)||(9588428-9588509)
chr3 (37-84)||(19271790-19271837)
chr3 (93-154)||(31731197-31731258)
chr3 (268-348)||(36980753-36980833)
chr3 (268-348)||(37006192-37006272)
chr3 (47-115)||(34947797-34947866)
chr3 (47-99)||(52107568-52107621)
chr3 (19-90)||(44162326-44162402)
chr3 (47-85)||(36632585-36632623)
chr3 (120-177)||(19250508-19250565)
chr3 (124-193)||(36660418-36660487)
chr3 (47-99)||(52107071-52107124)
chr3 (47-90)||(3696505-3696549)
chr3 (122-193)||(9371090-9371161)
chr3 (47-85)||(40319575-40319613)
chr3 (47-85)||(43512790-43512828)
chr3 (47-85)||(45877282-45877320)
chr3 (22-55)||(13865035-13865068)
chr3 (17-50)||(29183728-29183761)
chr3 (47-99)||(37041556-37041608)
chr3 (17-46)||(51549583-51549612)
chr3 (47-83)||(52107325-52107361)
chr3 (17-53)||(54567771-54567807)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (17-324)||(37200066-37200375)
chr2 (92-348)||(24079763-24080020)
chr2 (93-348)||(23865481-23865736)
chr2 (47-348)||(44719572-44719874)
chr2 (47-323)||(44196105-44196398)
chr2 (120-347)||(43843473-43843696)
chr2 (120-298)||(4233044-4233224)
chr2 (120-246)||(32738163-32738291)
chr2 (47-90)||(23865753-23865797)
chr2 (17-46)||(3364327-3364356)
chr2 (17-46)||(18555835-18555864)
chr2 (17-45)||(18701552-18701580)
chr2 (17-45)||(19493277-19493305)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (17-348)||(33053074-33053410)
chr5 (93-348)||(19263051-19263308)
chr5 (93-346)||(7784146-7784401)
chr5 (93-348)||(791201-791460)
chr5 (93-348)||(16467288-16467548)
chr5 (50-347)||(6829100-6829406)
chr5 (111-322)||(294667-294877)
chr5 (102-303)||(29241060-29241263)
chr5 (198-348)||(35169916-35170068)
chr5 (131-323)||(13610377-13610571)
chr5 (131-323)||(33641858-33642052)
chr5 (112-348)||(5250634-5250876)
chr5 (93-194)||(35169320-35169421)
chr5 (120-198)||(36244840-36244918)
chr5 (46-99)||(33052555-33052608)
chr5 (47-85)||(7784085-7784123)
chr5 (19-85)||(294397-294461)
chr5 (47-85)||(7782789-7782827)
chr5 (47-85)||(7783039-7783077)
chr5 (47-85)||(7783286-7783324)
chr5 (47-85)||(35168756-35168794)
chr5 (47-78)||(791140-791171)
chr5 (301-348)||(29241589-29241636)
chr5 (47-85)||(292793-292831)
chr5 (47-81)||(788696-788730)
chr5 (47-85)||(7783823-7783861)
chr5 (47-85)||(19263331-19263369)
chr5 (47-85)||(35169007-35169045)
chr5 (17-47)||(38313169-38313199)
chr5 (47-99)||(19263566-19263619)
chr5 (17-46)||(31861491-31861520)
chr5 (17-49)||(5747324-5747356)
chr5 (47-90)||(29240989-29241033)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (47-322)||(47396313-47396591)
chr7 (93-348)||(44155973-44156229)
chr7 (47-348)||(39956979-39957297)
chr7 (17-249)||(48104756-48104989)
chr7 (93-348)||(37534454-37534702)
chr7 (93-348)||(24481993-24482251)
chr7 (93-348)||(32985321-32985578)
chr7 (93-348)||(31579870-31580126)
chr7 (93-348)||(38433193-38433450)
chr7 (94-348)||(576328-576567)
chr7 (93-285)||(39581076-39581269)
chr7 (93-319)||(39778712-39778923)
chr7 (92-286)||(6496477-6496668)
chr7 (133-284)||(19925804-19925957)
chr7 (135-217)||(34950805-34950887)
chr7 (47-85)||(39778651-39778689)
chr7 (47-90)||(576585-576629)
chr7 (47-85)||(39581015-39581053)
chr7 (47-84)||(24481932-24481969)
chr7 (300-347)||(39581312-39581359)
chr7 (47-99)||(577082-577135)
chr7 (120-157)||(32953004-32953041)
chr7 (174-248)||(16717526-16717604)
chr7 (174-248)||(17691736-17691814)
chr7 (47-90)||(31580143-31580187)
chr7 (159-284)||(32953069-32953190)
chr7 (51-83)||(32984742-32984774)
chr7 (47-90)||(44155912-44155956)
chr7 (18-46)||(44569107-44569135)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (93-348)||(120199-120456)
scaffold0006 (47-85)||(120479-120517)
scaffold0006 (47-85)||(120734-120772)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (47-348)||(216580-216897)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (93-308)||(31297839-31298056)
chr6 (47-90)||(31298073-31298117)
chr6 (47-85)||(8887950-8887988)
chr6 (120-220)||(3840907-3841007)
chr6 (17-47)||(7922316-7922346)
chr6 (120-165)||(14661873-14661918)
chr6 (17-46)||(31851758-31851787)
chr6 (17-46)||(31886056-31886085)
chr6 (17-53)||(14328674-14328710)
chr6 (17-53)||(14421684-14421720)
chr6 (17-57)||(24387789-24387829)
chr6 (17-45)||(30381567-30381595)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (124-184)||(4497-4557)
[»] scaffold1797 (2 HSPs)
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[»] scaffold1637 (1 HSPs)
scaffold1637 (159-208)||(18-67)
[»] scaffold0578 (1 HSPs)
scaffold0578 (143-209)||(6472-6538)
[»] scaffold0638 (1 HSPs)
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[»] scaffold0246 (1 HSPs)
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[»] scaffold0142 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 398
Target Start/End: Original strand, 42736849 - 42737234
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42736849 atattacaggggataaagacctattaacccaatattttactttactttttcattgaattcctaatattttatgtagtagaaataacacaaattcataaaa 42736948  T
Q  116 attgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42736949 attgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattagttttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatatt 42737048  T
Q  216 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 313  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42737049 ttattatatatgtgtgtatttattaagatattcatcatatataaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 42737148  T
Q  314 atatgtctaattcggacaacgccggataaataca-cggtacatatacaaatttcataagtgagaaatgcatgaaactgacgttgtt 398  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42737149 atatgtgtaacccggacaacgccgggtaaatacacccgtacatatacaaatttcataggtgagaaatgcatgaaactgacgttgtt 42737234  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7112523 - 7112199
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7112523 atattacagggggtaaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcataaaa 7112424  T
Q  116 attgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  7112423 attgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgata---- 7112328  T
Q  216 ttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaat 315  Q
        ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7112327 ----tatttgtgtgtatctattaagatattcatcttataccaatccatgataaattttatttacgaatatcatacatgtaatttttttatcttcttgaat 7112232  T
Q  316 atgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  7112231 atgtctaatccgggcaacgctggataaatacac 7112199  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 348
Target Start/End: Original strand, 29018648 - 29018966
Alignment:
Q  34 gacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctat- 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |     
T  29018648 gacctatcaacccaatattttacttaattttttcattgaattcctaatattttatgtgacagaaataacacaaattcataaaagttgattttatacattg 29018747  T
Q  132 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  29018748 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtg 29018847  T
Q  230 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||     
T  29018848 tatttattaagatattaatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacaaataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccggg 29018947  T
Q  330 caacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| || |||||||||    
T  29018948 caacgctgggtaaatacac 29018966  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Original strand, 19082016 - 19082317
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19082016 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatattt 19082115  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19082116 ttactaaatccaattaatttaatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttataatatgatatattttattatatttatgtgtatttattaagata 19082215  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaa 343  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||| ||||    
T  19082216 ttcatcatataccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatata---attttatctttttgaatatgtataacccgaacaacgccgggtaaa 19082312  T
Q  344 tacac 348  Q
    |||||    
T  19082313 tacac 19082317  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Original strand, 19129904 - 19130205
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19129904 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatattt 19130003  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19130004 ttactaaatccaattaatttaatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttataatatgatatattttattatatttatgtgtatttattaagata 19130103  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaa 343  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||| ||||    
T  19130104 ttcatcatataccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatata---attttatctttttgaatatgtataacccgaacaacgccgggtaaa 19130200  T
Q  344 tacac 348  Q
    |||||    
T  19130201 tacac 19130205  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 323
Target Start/End: Original strand, 4652420 - 4652699
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4652420 aatattttacttaaatttttcattgaattcctaatattttacgtaatagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatattt 4652519  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4652520 ttactaaattcaattaattttatatgtatgtgtatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagata 4652619  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4652620 ttcatcctataccaatccatgataaattttatttgcggacatcatagatataatttttttatcatcttgaatatgtctaa 4652699  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 20582486 - 20582743
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20582486 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatctaattaattttatctgtatctgcatctataaatttac 20582585  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20582586 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatatatcaatccgtgataaattttatttgcagatatcatac 20582685  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||    
T  20582686 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgggcaacgtcgggtaaatacac 20582743  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 95 - 348
Target Start/End: Original strand, 23616003 - 23616258
Alignment:
Q  95 aaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacga 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23616003 aaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacga 23616102  T
Q  195 gtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 292  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23616103 gtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 23616202  T
Q  293 ataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||    
T  23616203 gtaatttttttatcttcttgaatatgtctaatccaggaaacgccgggtaaatacac 23616258  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 95 - 348
Target Start/End: Original strand, 23647334 - 23647589
Alignment:
Q  95 aaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacga 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23647334 aaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacga 23647433  T
Q  195 gtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 292  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647434 gtatttataatatggtatattttattatatttatgtgtatttattaagatattcatcctattccattccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 23647533  T
Q  293 ataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||    
T  23647534 ataatttgtttatcttcttgaatatgtctaatgcaggaaacgccgggtaaatacac 23647589  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22867831 - 22867573
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  22867831 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatttataaaattac 22867732  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22867731 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttatatcaatccgtgataaattttatttgtggatatcatac 22867632  T
Q  291 atataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  22867631 atataattttttttatcttcttgaatatgtctaacccgggcaacgccgagtaaatacac 22867573  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 23731722 - 23731979
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23731722 agaaatgacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgcatgtgcatctataaatttac 23731821  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23731822 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttattccaatcggtgataaattttacttgcggatatcatac 23731921  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  23731922 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaatccgagcaacgccgggtaaatacac 23731979  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 5943200 - 5942968
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5943200 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgcatgtgcatctataaatttac 5943101  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5943100 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaatatattaatcgtatatcaatctgtgataaattttatttgcggatatcatac 5943001  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5943000 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaa 5942968  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21443299 - 21443039
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  21443299 agaaataacacaaattcttaaaagttaattttattttatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctagatgtgcatctataaatttat 21443200  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21443199 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 21443100  T
Q  291 atataa---ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||   || ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| || ||||||    
T  21443099 atataattttttttttatcttcttgaatatgtctaacccgaaaaacgccgggtagatacac 21443039  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34747979 - 34747723
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34747979 agaaataacacaatttcctaaag-ttaattttattctatatctgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctatatatttac 34747881  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34747880 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatatttatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 34747781  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||    
T  34747780 acataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgagcaatgccggataaatacac 34747723  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 39506164 - 39506424
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatcttta--tgtgcatctataaattt 190  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39506164 agaaataactcaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgtgcatctataaattt 39506263  T
Q  191 acgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcat 288  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  39506264 acgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtacttattaagatattcatcctataccaatccataataaattttattttcggatatcat 39506363  T
Q  289 acatataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  39506364 acatataattttttttatcttcttgaatatttctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 39506424  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11921781 - 11921549
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  11921781 agaaataacacaaattccttaaagttaattttattatatatgtgataatatttttactaaattcaattaattttatctgcatttgcatctataaatttac 11921682  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921681 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatctattatgatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 11921582  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11921581 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaa 11921549  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13522494 - 13522233
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13522494 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatttgttagtatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 13522395  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtg----tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatc 286  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13522394 gagtatttataatatgatatattttatcatatttgtgtgtatttatttattaagatattcatcatataccaatccgtgataaattttatttgtagatatc 13522295  T
Q  287 atacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  13522294 atacatataagttttttatcttcttgaatatatgtaacccgggcaacgccgggtaaatacac 13522233  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5297062 - 5296805
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtag--------------aaataacacaaattcataaaaattgattttattctat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||              |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  5297062 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaatatctcaacataaataatacaaattcctaaaagttaattttattctat 5296963  T
Q  132 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||  ||||||||||    
T  5296962 atgtgttaatatttttactaaatctaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtagttataatatggtaaattttattatatttgtgtg 5296863  T
Q  230 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5296862 tatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatca 5296805  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37691736 - 37691566
Alignment:
Q  161 aattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaa 258  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  37691736 aatttcatctgtatgtgcatgtataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatattccaa 37691637  T
Q  259 tccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37691636 tccgtgataaattttatttgcggatataatatatataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcgga 37691566  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 52020827 - 52020653
Alignment:
Q  176 tgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaatttt 273  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  52020827 tgcatcaataaatttacgagtatttataatatggtatatttcattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaattcgtaataaatttt 52020728  T
Q  274 atttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  52020727 atttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccggacaatgccggataaatacac 52020653  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Original strand, 29019169 - 29019326
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29019169 agaaataacacaaattcttaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatatgtatgtgcatctataaatttac 29019268  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctat 253  Q
    ||||||||||||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29019269 gagtatttataatatg---tattattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctat 29019326  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 348
Target Start/End: Original strand, 52348794 - 52349020
Alignment:
Q  124 tattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||     
T  52348794 tattctatatgtgttaatatttttactaaatcccgtta-ttttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttataatatggtttattttattata 52348892  T
Q  224 t--gtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttctt-gaatatgtc 320  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  52348893 ttcgtgtgtatttatcaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtggatatcatacataaaattttttgatcttcttaaaatatgtc 52348992  T
Q  321 taattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52348993 taactcggacaatgccggataaatacac 52349020  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 274
Target Start/End: Original strand, 28050135 - 28050318
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  28050135 agaaataacacaaattccttaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtatttgcatctataaatttat 28050234  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaatttta 274  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  28050235 gagtatttataatatggtatatttgattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatattccaattcgtgataaatttta 28050318  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10787803 - 10787698
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  10787803 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatttgtatgtgcatgtataaatttac 10787704  T
Q  193 gagtat 198  Q
    ||||||    
T  10787703 gagtat 10787698  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 263
Target Start/End: Original strand, 11932981 - 11933087
Alignment:
Q  159 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtc 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11932981 ttaattttatctatatgtgcatctataaattcacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatttc 11933080  T
Q  257 aatccgt 263  Q
    |||||||    
T  11933081 aatccgt 11933087  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 183
Target Start/End: Original strand, 40374991 - 40375081
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatcta 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40374991 agaaataacacaaattcttaaaagttaattatattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatcta 40375081  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 345
Target Start/End: Original strand, 29019343 - 29019450
Alignment:
Q  238 aagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccg 337  Q
    |||||||||||| |||  | || ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  29019343 aagatattcatcatatacctattcgttataaattttatttgcggatattatatatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgaacaacgccg 29019442  T
Q  338 gataaata 345  Q
    ||||||||    
T  29019443 gataaata 29019450  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 28051726 - 28051808
Alignment:
Q  266 taaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28051726 taaattttatttgcagatattatatatataatttttttatcttcttgaatatgtctaatccggacaacgccgaataaatacac 28051808  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 220
Target Start/End: Original strand, 51052870 - 51052961
Alignment:
Q  129 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttatt 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||   ||| ||| |||||||  |||||||||    
T  51052870 tatatgtgttaataattttactaaatccaattaattttatccgcatgcgcatctattaatttataggtacttaaaatatgatttattttatt 51052961  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13522555 - 13522517
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522555 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 13522517  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13522761 - 13522723
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522761 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 13522723  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 37691835 - 37691797
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37691835 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 37691797  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 5943261 - 5943217
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5943261 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgta 5943217  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 85
Target Start/End: Original strand, 40374932 - 40374968
Alignment:
Q  49 tattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40374932 tattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 40374968  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 41072977 - 41073025
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  41072977 attttattctatatgtgttaataattttactaaattcagttaattttat 41073025  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5297311 - 5297273
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5297311 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 5297273  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 11931819 - 11931857
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11931819 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 11931857  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 20581262 - 20581300
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20581262 aatattttacttaactttttcattgaattccaaatattt 20581300  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 20582428 - 20582466
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20582428 aatattttacttaactttttcattaaattcctaatattt 20582466  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21443360 - 21443326
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21443360 aatattttacttaactttttcattgaattcctaat 21443326  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 34748587 - 34748549
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34748587 aatattttacttaacttttccattgaattcctaatattt 34748549  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 39506103 - 39506141
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39506103 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 39506141  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22867892 - 22867848
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22867892 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattttatgta 22867848  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34608808 - 34608764
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaatt 164  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34608808 attttattttatatgtgttaataattttactaaatctaattaatt 34608764  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Original strand, 35034323 - 35034355
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaat 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35034323 atattacaggggataaagacctattaacccaat 35034355  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 75
Target Start/End: Original strand, 28050067 - 28050102
Alignment:
Q  40 ttaacccaatattttacttaactttttcattgaatt 75  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28050067 ttaagccaatattttacttaactttttcattgaatt 28050102  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7846071 - 7846005
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataa 186  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||| | | ||||| |||||||    
T  7846071 attttattctatatatgttaataattttactaaattcagttaattatatttgtttgtgcttctataa 7846005  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 10787868 - 10787830
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10787868 aatattttatttaactttttcattgaatttctaatattt 10787830  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11922098 - 11922060
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11922098 aatattttacttaacttttgtattgaattcctaatattt 11922060  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 11932349 - 11932387
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11932349 aatattttacttaacttttttattgaatttctaatattt 11932387  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19475685 - 19475619
Alignment:
Q  143 tttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatga 209  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19475685 tttttactaaattctataaatatcatctgcatgtgcatctataaatttacgagtacttaaaatatga 19475619  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 28410943 - 28410914
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28410943 atattacaggggataaagacctattaaccc 28410914  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 79
Target Start/End: Original strand, 23730152 - 23730184
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattccta 79  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23730152 aatattttacttaactctttcattgaattccta 23730184  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 34748075 - 34748002
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc----aatattttacttaactttttcatt-gaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34748075 atattacagggagtaaagacatattaaacccttaaatattttacttaactttttcattggaattcttaatattt 34748002  T

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Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 348
Target Start/End: Original strand, 44519733 - 44520052
Alignment:
Q  30 taaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattc 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44519733 taaagacctattaaccaaatatt--acttaactttttcattgaattcctaatattttatgtagcagaaataacacaaattcataaaaattgattttattc 44519830  T
Q  129 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  44519831 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttattatatttgt 44519930  T
Q  227 gtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |    
T  44519931 gtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatatctattcc 44520030  T
Q  327 ggacaacgccggataaatacac 348  Q
     | ||||||||| |||||||||    
T  44520031 aggcaacgccgggtaaatacac 44520052  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43318515 - 43318268
Alignment:
Q  102 acaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtattta 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43318515 acaaattcataaaagttgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatatgcatctataaatttacgagtattta 43318416  T
Q  202 taatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatta 299  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  43318415 taatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgc-gatatcatacatataattt 43318317  T
Q  300 ttttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43318316 ttttatcttcttgaatatgtctaactcggacaacgccgggtaaatacac 43318268  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 47 - 328
Target Start/End: Original strand, 47526575 - 47526858
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  47526575 aatattttacttaactttttcattgaattcctaacattttatgtaacagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattttatatgtgttaatattt 47526674  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47526675 ttactaaatccaattagttttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatataatatattttattatatttgtgtgtatttattaagata 47526774  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgg 328  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47526775 ttcatcctataataatccttgataaattttattag-agatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatatctaattcgg 47526858  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 93 - 347
Target Start/End: Original strand, 3735799 - 3736055
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3735799 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 3735898  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3735899 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtttatttattaagatattcatcctatactaattcgtgataaattttattcgcggatatcatac 3735998  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  3735999 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgaataacgccgggtaaataca 3736055  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 95 - 347
Target Start/End: Original strand, 36311667 - 36311921
Alignment:
Q  95 aaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacga 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36311667 aaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatacgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacga 36311766  T
Q  195 gtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36311767 gtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatatccatcatataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 36311866  T
Q  293 ataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||    
T  36311867 ataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccggacagcgtcgggtaaataca 36311921  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 95 - 347
Target Start/End: Original strand, 36325876 - 36326130
Alignment:
Q  95 aaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacga 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36325876 aaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatacgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacga 36325975  T
Q  195 gtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36325976 gtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatatccatcatataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 36326075  T
Q  293 ataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||    
T  36326076 ataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccggacagcgtcgggtaaataca 36326130  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 36899238 - 36899494
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36899238 agaaataatacaaatccctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtg-atctataaatttac 36899336  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36899337 gagtaattataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtaataaattttatttgcggatatcatac 36899436  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  36899437 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaatccgggcaacgccgggtaaatacac 36899494  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6201876 - 6201619
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6201876 agaaataacacaaatttctaaaagttaattttattctatatgtgtaaatatttttactaaatccaattaattttatctgaatgtgcatctataaatttac 6201777  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6201776 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 6201677  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||| || |||||||||    
T  6201676 atataatttttttatcttattgaatatgtctaacccgagcaacgctgggtaaatacac 6201619  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29004729 - 29004497
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatat--ttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||    
T  29004729 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttagaatatgatatatatttt 29004630  T
Q  218 attat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaat 315  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29004629 attatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcataaatataatttttttatcttcttgaat 29004530  T
Q  316 atgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  29004529 atgtctaacccgggcaacgccggataaatacac 29004497  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2832546 - 2832288
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2832546 agaaataacacaaattcctaaaatttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccacttgattttatctgtatgtgcatctataaatttac 2832447  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2832446 gagtatttatgatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatataccaatctgtgataatttttatttgcggatatcatac 2832347  T
Q  291 atataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  2832346 atataattttttttatcttcttgaatatgtctaacccggacaacgccagataaatacac 2832288  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 93 - 318
Target Start/End: Original strand, 38054926 - 38055154
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  38054926 agaaataacacaaattcctaaaagtttattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatcggtatgtgcatcaataaatttac 38055025  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38055026 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtatgtatttattaagatattcatcctattccaagccgtgataaattttatttgcggatatctttc 38055125  T
Q  291 atataa-ttattttatcttcttgaatatg 318  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||    
T  38055126 atataattttttttatcttcttgaatatg 38055154  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 40696359 - 40696613
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    |||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  40696359 agaaataatataaatttgtaaaagttaattttattctat--gtgttaatatttttactaaatccaattaattttatatgcatgtgcatttataaatttac 40696456  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40696457 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatataccaatccatgataaattttatttgcgg-tatcatac 40696555  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  40696556 atataatttgtttatcttcttgaatatgtctaacccgaataacgccggataaatacac 40696613  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 295
Target Start/End: Original strand, 4440423 - 4440680
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaata--------acacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgt 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||        || ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  4440423 aatattttacttaactttt-cattgaatttctaatattttatgtaacagaaatatctcaacaactcaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgt 4440521  T
Q  138 taatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtattta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  4440522 taatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaa-ttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatata 4440620  T
Q  236 ttaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatata 295  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4440621 ttaagatatttatcctatttcaattcgcgataaattttatttgcggatatcaaacatata 4440680  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 337
Target Start/End: Original strand, 36662031 - 36662283
Alignment:
Q  95 aaataacacaaattcataaaaatt-----gattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  36662031 aaataacacaaattcataaaagttaattatattctattctatatgtcttaatacttttactaaatccaattaattttatttgtatgtacatctataaatt 36662130  T
Q  190 tacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatca 287  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36662131 tacgagtatttataatatggtatattttgttatatttgtatgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatca 36662230  T
Q  288 tacatataa---ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccg 337  Q
    |||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  36662231 tacatataattttttttttatattcttcaatatgtctaactcaggcaacgccg 36662283  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 120 - 348
Target Start/End: Original strand, 7526016 - 7526248
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  7526016 attttattttatatgtgttaatatttttactaaatcccattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttataatatggtttattttat 7526115  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 317  Q
      |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  7526116 tatattcgtgtgtatttattaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtagatatcatacatagaatttgttgatcttcttgaatat 7526215  T
Q  318 g--tctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |  |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  7526216 gtctctaatccgggcaacgccgggtaaatacac 7526248  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 129 - 319
Target Start/End: Original strand, 707857 - 708051
Alignment:
Q  129 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgt 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  707857 tatatatgttaatatttttactaaatcctattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgt 707956  T
Q  227 gtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa--ttattttatcttcttgaatatgt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  707957 gtgtatttattaagatattcatcatattccgatcggtgataaattttatttgcagatatcgtacatataatttttttttatctttttgaatatgt 708051  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 348
Target Start/End: Original strand, 17991887 - 17992113
Alignment:
Q  124 tattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||     
T  17991887 tattctatatgtgttaatatttttactaaatcccgtta-ttttatctgtatgtgcatctataaatttacaagtatttataatatggtttattttattata 17991985  T
Q  224 t--gtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttctt-gaatatgtc 320  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  17991986 ttcgtgtgtatttatcaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtggatatcatacataaaattttttgatcttcttaaaatatgtc 17992085  T
Q  321 taattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17992086 taactcggacaatgccggataaatacac 17992113  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 728772 - 728602
Alignment:
Q  153 atccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcc 250  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  728772 atcctattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatca 728673  T
Q  251 tatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa--ttattttatcttcttgaatatgt 319  Q
    |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  728672 tattccgatcggtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttttatctttttgaatatgt 728602  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30260415 - 30260187
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  30260415 attttattctatatgtgttaatattttt-ctaaattccgttaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtttattttat 30260317  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 317  Q
      |||| |||||||||||||||||||||| |   ||    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  30260316 tatattcgtgtgtatttattaagatattcgtgacatacatatccgtgataaaatttattcgtggatatcatacatagaattttttgattttcttgaatat 30260217  T
Q  318 gtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||  |||||||||| || |||||||||    
T  30260216 gtctaacccggacaacgctgg-taaatacac 30260187  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 54131718 - 54131524
Alignment:
Q  131 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  54131718 tatgtgttaatatttttactaaattcagttaatttcatatgtctgtgtatctataaatttacgagtacttataatatgatttattttattctatttgtgt 54131619  T
Q  229 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    |||  |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  54131618 gtacatattaagatattcaacccataccaatccgtgataaattttatttgtggataccatacattgaattttttggtcttcttgagtatgtctaa 54131524  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 253
Target Start/End: Original strand, 13937261 - 13937396
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || |  || || || ||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||    
T  13937261 attttattctatatgtgttaataattttactaaatacaatcaatttcatttgcatatgtatttattaatttacgagtatttaaaatatgatttcttttat 13937360  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctat 253  Q
      ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||    
T  13937361 tatatttatatgtatccattaagatattcgtcctat 13937396  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Original strand, 30059624 - 30059712
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| || | ||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||    
T  30059624 attttattctatatgtgctaataattttactaaatctagttaatttcatatgtatgtgcatctattaatttaagtgtacttaaaatatg 30059712  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19730880 - 19730813
Alignment:
Q  280 ggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  19730880 ggatatcatacatataattttttcatcttcttgaataagtctaacccgggcaacgccgggtaaataca 19730813  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 348
Target Start/End: Original strand, 4441145 - 4441211
Alignment:
Q  282 atatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  4441145 atatcaaacatataatttttttatctgcttgaatatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 4441211  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4895410 - 4895332
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||| | | |||| || |||||||||||||||||    
T  4895410 attttattctatatatgttaataattttactaaattcagttaattatatttgtttgtgtatatataaatttacgagtat 4895332  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19729714 - 19729672
Alignment:
Q  123 ttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattt 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19729714 ttattctatatgtgttaataattttactaaatccaattaattt 19729672  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 36311350 - 36311388
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36311350 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 36311388  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 36325559 - 36325597
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36325559 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 36325597  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36898431 - 36898393
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36898431 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 36898393  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10373976 - 10373887
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatga 209  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||| | |||||||  ||| ||| |||||||    
T  10373976 attttattctatatgttttaataattttactaaatcaaattaatttcatctgcatgtgtatctgttaatttacatgtacttaaaatatga 10373887  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17256479 - 17256379
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |  |||||||||||| |||||| | ||| ||  |||||||  ||||||||    
T  17256479 attttattctatatatgttaataattttactaaattcaattaatttattttgcatgtgcatctattaatttatgtgtacttgaaatatgatttattttat 17256380  T
Q  220 t 220  Q
    |    
T  17256379 t 17256379  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Original strand, 30029624 - 30029712
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 208  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||    
T  30029624 attttatcctatgtgtgttaataattttactaaatccagttaatttcatccgcatgtgcatctattaatttaagggtacttaaaatatg 30029712  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Original strand, 30045893 - 30045981
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 208  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||    
T  30045893 attttatcctatgtgtgttaataattttactaaatccagttaatttcatccgcatgtgcatctattaatttaagggtacttaaaatatg 30045981  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 707238 - 707276
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  707238 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 707276  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 707735 - 707773
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  707735 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 707773  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 728881 - 728843
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  728881 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 728843  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 729379 - 729341
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  729379 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 729341  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 29004847 - 29004809
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29004847 aatattttacttaactttttcattcaattcctaatattt 29004809  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 40696298 - 40696336
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40696298 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 40696336  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Original strand, 36311604 - 36311648
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36311604 aatattttacataactttttcattgaattcctaatattttatgta 36311648  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Original strand, 36325813 - 36325857
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36325813 aatattttacataactttttcattgaattcctaatattttatgta 36325857  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 48
Target Start/End: Original strand, 21798593 - 21798624
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaa 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798593 atattacaggggataaagacctattaacccaa 21798624  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Original strand, 37066774 - 37066904
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||  | ||||||    
T  37066774 attttattctatacgt--taataattttactaaattcaattaatttcatcggtttgtgcatctattaatttatgggtatttaaaatgtgatttgttttat 37066871  T
Q  220 -------tatttgtgtgtatttattaagatatt 245  Q
           |||||||||||||| |||||||||||    
T  37066872 tttattctatttgtgtgtattcattaagatatt 37066904  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 707491 - 707529
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  707491 aatattttacttaacctttttattgaattcctaatattt 707529  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 729124 - 729086
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  729124 aatattttacttaacctttttattgaattcctaatattt 729086  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2832854 - 2832816
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2832854 aatattttacttaacttttttattgaatttctaatattt 2832816  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 6202188 - 6202150
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6202188 aatattttacttgacttttttattgaattcctaatattt 6202150  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 36898370 - 36898317
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttt 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  36898370 agaaataacacaaatccctaaaagtttattttattatgtatgtgttaatatttt 36898317  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 51396188 - 51396159
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51396188 atattacaggggataaagacctattaaccc 51396159  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2832608 - 2832576
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattccta 79  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2832608 aatattttacttacctttttcattgaattccta 2832576  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29004786 - 29004746
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatat 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  29004786 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatat 29004746  T

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Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Original strand, 42709050 - 42709354
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  42709050 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcctcaaagttaattttattatatatgtgttaatattt 42709149  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42709150 ttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagata 42709249  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaa 343  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  42709250 ttcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaatccggacaacgtcagataaa 42709349  T
Q  344 tacac 348  Q
    |||||    
T  42709350 tacac 42709354  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 38 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8388115 - 8387802
Alignment:
Q  38 tattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8388115 tattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaataacaaaaattcataaaaatagattttattctatatgtg 8388016  T
Q  137 ttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtattt 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  8388015 ttaatatttttattaaatccaattagttttatctgtatgtgcatctataactttacgaatatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtattt 8387916  T
Q  235 attaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacg 334  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  8387915 attaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacttataatttttttatcttcttgaatatgtctaactggaacaacg 8387816  T
Q  335 ccggataaatacac 348  Q
     ||| |||||||||    
T  8387815 tcgggtaaatacac 8387802  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 132 - 348
Target Start/End: Original strand, 16682270 - 16682488
Alignment:
Q  132 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  16682270 atgtgttaatatttttattaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtg 16682369  T
Q  230 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16682370 tatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgga 16682469  T
Q  330 caacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16682470 caacgccggataaatacac 16682488  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 95 - 348
Target Start/End: Original strand, 41529585 - 41529840
Alignment:
Q  95 aaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacga 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41529585 aaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacga 41529684  T
Q  195 gtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 292  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41529685 gtatttataatatggtatattttattatatttttgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttattttcggatatcatacat 41529784  T
Q  293 ataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||   || |||| ||||||||||||||    
T  41529785 ataatttttttatcttcttaaatatgtctaaccagggcaacaccggataaatacac 41529840  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 288463 - 288719
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  288463 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttt-actaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 288561  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  288562 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttattccaattcatgataaattttatttgcggatatcatac 288661  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||    
T  288662 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaacctgggcaacgccgggtaaatacac 288719  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 39028456 - 39028713
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39028456 agaaataacacaaatttcgaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtttgtgcatctataaatttac 39028555  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39028556 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatatacaaatccgtgataaattttatttgcgggtatcatac 39028655  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  39028656 atacaatttttttatcttcttgaatatgtctaacctggacaacgccggataaatacac 39028713  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 24983247 - 24983506
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24983247 agaaagaacacaaattctttaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtatttgcatctataaatttac 24983346  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  24983347 gagtatttataatatgatgtattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccattataaattttatttatggatatcatac 24983446  T
Q  291 atataa--ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||  || |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24983447 atataatttttttttatcttcttaaatatgtctaacccggacaacgccggataaatacac 24983506  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 40940554 - 40940755
Alignment:
Q  149 ctaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattc 246  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40940554 ctaaatccaattaattttatttgtatgtacatctataaatttacgagtatttataatatggtatatttttttatatttgtgtgtatttattaagatattc 40940653  T
Q  247 atcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatac 346  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  40940654 atcatatagcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatttttttatcttcttgaacatgtctaattcggacaacgtcaggtaaatac 40940753  T
Q  347 ac 348  Q
    ||    
T  40940754 ac 40940755  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 120 - 346
Target Start/End: Original strand, 33022204 - 33022432
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  33022204 attttattctatatgtgttaatatttttactaaattcctttaattttatctctatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtttattttat 33022303  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 317  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  33022304 tatatttgtgtgtatttattaagatattcgtcacatgccaatctgtgataaaatttatttgtggatatcatacatagaaatttttgatcttcttgaatat 33022403  T
Q  318 gtctaattcggacaacgccggataaatac 346  Q
     |||||  || ||||| ||||||||||||    
T  33022404 atctaacccgaacaacaccggataaatac 33022432  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18307376 - 18307146
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   || |||||    
T  18307376 attttattctatatgtgttaatatttttactaaattccattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttgtaataaggtttactttat 18307277  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 317  Q
      |||| |||||||||||||||||||||  |   ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18307276 tatattcgtgtgtatttattaagatatttgtgacataccaatccgtaataaattttatttgcggatataatacatagaattttttgatcttcttgaatat 18307177  T
Q  318 gtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  18307176 gtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 18307146  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 338
Target Start/End: Original strand, 30438618 - 30438835
Alignment:
Q  123 ttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--t 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |    
T  30438618 ttattctatatgcgttaatatttttactaaatcccgttaattttatctgtatgtggatatataaatttacgagtatttataatatggtttattttattat 30438717  T
Q  221 atttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtc 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  30438718 attcgtgtgtatttattaagatattcgtcacataccaatccgtgataaaatttatttgtggatatcatacatagaattttttgatcttcttgaatatgtc 30438817  T
Q  321 taattcggacaacgccgg 338  Q
    |||  ||| |||||||||    
T  30438818 taacccgggcaacgccgg 30438835  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 323
Target Start/End: Original strand, 1431890 - 1432085
Alignment:
Q  131 tatgtgttaatatttt-tactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtg 227  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| | |    
T  1431890 tatgtggtaatattttttactaaatccagctaattttctctgtttgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatttattctattctattcgag 1431989  T
Q  228 tgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    ||||  |||||||||||||| |   |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  1431990 tgtacctattaagatattcaactgttaccaatctgtgataaattttatttgcggataccatacatataattttttggttttcttgaatatgtctaa 1432085  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 39028395 - 39028433
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39028395 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 39028433  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 30438067 - 30438120
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtagaaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30438067 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattttatgtagcagaaata 30438120  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18308113 - 18308075
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18308113 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 18308075  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 81
Target Start/End: Original strand, 24982760 - 24982794
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24982760 aatattttacttaactttttcattgaattcctaat 24982794  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 24982939 - 24982977
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24982939 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 24982977  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 33021667 - 33021705
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33021667 aatattttacttaacttttttattggattcctaatattt 33021705  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Original strand, 6952930 - 6952959
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6952930 atattacaggggataaagacctattaaccc 6952959  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 13773793 - 13773834
Alignment:
Q  124 tattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattt 165  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13773793 tattctatgtgtgttaataattttagtaaatccaattaattt 13773834  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 16680819 - 16680872
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtagaaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  16680819 aatattttacttaacttttttattgaattcgcaatattttatgtagcagaaata 16680872  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27198173 - 27198144
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27198173 atattacaggggataaagacctattaaccc 27198144  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Original strand, 41529518 - 41529562
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41529518 aatattttacttaattttttgattgaattcctaatattttatgta 41529562  T

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Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43512584 - 43512280
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43512584 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcctaaaatttgattttattctatatgtgttaatattt 43512485  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43512484 ttactaaatccaattaattttatctctatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagata 43512385  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaa 343  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43512384 ttcatcatataccaatccgtgataaattttatttacggatatcaaacatataatttttttatcttctagaatatgtctaatccggacaacgccagataaa 43512285  T
Q  344 tacac 348  Q
    |||||    
T  43512284 tacac 43512280  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 46 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 45876643 - 45876361
Alignment:
Q  46 caatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaa----taacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaa 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45876643 caatattttacttaaatttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaagaaataacacaaattcataaaagttgattttattctatatgtgttaa 45876544  T
Q  141 tatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttatta 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  45876543 tatttttactaaatcaaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttatca 45876444  T
Q  239 agatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtct 321  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45876443 agatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatagatataatttttttatcttcttgaatatgtct 45876361  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 323
Target Start/End: Original strand, 17475966 - 17476246
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17475966 aatattttacttacctttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatattt 17476065  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17476066 ttactaaatctaattaattttatctgtatgtgcatttataaattttcgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagata 17476165  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17476166 ttcatcatataccaatccgtgataaattttatttgcgaatatcatacatataattttttttatcttcttgaatatgtctaa 17476246  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 42934469 - 42934728
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttatt--ctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaattt 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42934469 agaaataacataaattcctaaaagttaatttttttttctatatgtgttaatatttttaccaaatctaattaattttatctgtatgtgcatctataaattt 42934568  T
Q  191 acgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcat 288  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42934569 acgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtatatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcgaatatcat 42934668  T
Q  289 acatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42934669 acatataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcggacaacgtcggataaatacac 42934728  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3696488 - 3696238
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3696488 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttatt--atatgtgttaatatttttattaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 3696391  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||      ||||    
T  3696390 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataagttttatttgcg-----aatac 3696296  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3696295 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcggacaacgccagataaatacac 3696238  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45698584 - 45698327
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  45698584 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttgatatttttactaaatccaattaattttacatgtatgtgcatctataaatttac 45698485  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45698484 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatatttattttataccaatccgtgataaattttatttgtggatatcatac 45698385  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||    
T  45698384 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcaggcaacactggataaatacac 45698327  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 120 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9599063 - 9598833
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9599063 attttattctatatgtgttaatatttttactaaacccagttaattttatctgtacgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttat 9598964  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 317  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  9598963 tatatttgtgtgtatttcttaagatattcatcctatatcaatctgtgataaattttatttgcagatatcatatagagaattattttctcttcttgaatat 9598864  T
Q  318 gtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||||    
T  9598863 gtctaactcgggcaacgccaggtaaatacac 9598833  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 317
Target Start/End: Original strand, 40319907 - 40320133
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  40319907 agaaataacacaaatttctaaatgttaattttattatatatgtgtcaatatttttactaaatgcaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttat 40320006  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40320007 gagcatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatattccaatccatgataaattttatttgcggatattatac 40320106  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatat 317  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40320107 atataatgtttttatcttcttgaatat 40320133  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16076206 - 16075979
Alignment:
Q  123 ttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16076206 ttattgtatatgtgttaatatttttattaaattcacttaattttatttgcatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattat 16076107  T
Q  223 --ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtc 320  Q
      |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16076106 atttgtttgtatttattaagatattcatcatatatcaatccatgataaattttatttgtggttatcatacatataatttttttatcttcttaaatatgtc 16076007  T
Q  321 taattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||  ||  ||||||  |||||||||||    
T  16076006 taacccgagcaacgcgagataaatacac 16075979  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 34947872 - 34948069
Alignment:
Q  155 ccaattaatttt-atctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcct 251  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947872 ccaattaatttttatctgtatgtgcatctataaatttatgagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcct 34947971  T
Q  252 atgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||    
T  34947972 atatcaatccgtgataaattttattcgcggatatcatacatataattttttttatcttcttgaatatgtctaacccaggcaacgccaggtaaatacac 34948069  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 348
Target Start/End: Original strand, 36633886 - 36634035
Alignment:
Q  201 ataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36633886 ataatatgacatattttattatatttgtgtgtattcattaagatattcatcctattccaatcccttataaattttatttgcggatatcatacatataatt 36633985  T
Q  299 attttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36633986 tttttatcttcttgaatatgtctaactcgggcaacgccggataaatacac 36634035  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44162307 - 44162080
Alignment:
Q  95 aaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacga 194  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||    
T  44162307 aaataacataaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatttgtatatgcatc--taaatttacga 44162210  T
Q  195 gtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 292  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||                  ||||||||||||||    
T  44162209 gtatttataatatgatttattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatataccaatc------------------cggatatcatacat 44162128  T
Q  293 ataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggat 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  44162127 ataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcgagcaacgccggat 44162080  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 129 - 344
Target Start/End: Original strand, 52107669 - 52107866
Alignment:
Q  129 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatttgtgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  52107669 tatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatcagtatgtgcatatataaatttacgagtatttataatatga------------------t 52107750  T
Q  229 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgg 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  52107751 atatttattaagatattcatcctattccaatccgctataaattttatttatggatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgt 52107850  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 279
Target Start/End: Original strand, 10380757 - 10380899
Alignment:
Q  139 aatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttat 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  10380757 aatatatttactaaatccaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttaaaatatggtgtattttattatatttatgtgtatttat 10380856  T
Q  237 taagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgc 279  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  10380857 taagatattcatcctatattaatccgtaataaattttatttgc 10380899  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 347
Target Start/End: Original strand, 31731267 - 31731403
Alignment:
Q  211 atattttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttc 309  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||     
T  31731267 atattttattatatttgtgtatttattaagatattcatcatatatcaatccgtgataaattttatttgcggataatatatatataattttttttatcttt 31731366  T
Q  310 ttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 347  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  31731367 ttgaatatgtctaa-tcgggcaacgccgggtaaataca 31731403  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36980970 - 36980869
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatattttt-actaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  36980970 attttattctatatgtgttaatattttttattaaatctagttaattttatttgattgtgcatctataaatttacgaatacttataatatgatttatttta 36980871  T
Q  219 tt 220  Q
    ||    
T  36980870 tt 36980869  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37006409 - 37006308
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatattttt-actaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  37006409 attttattctatatgtgttaatattttttattaaatctagttaattttatttgattgtgcatctataaatttacgaatacttataatatgatttatttta 37006310  T
Q  219 tt 220  Q
    ||    
T  37006309 tt 37006308  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Original strand, 9588428 - 9588509
Alignment:
Q  266 taaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  9588428 taaattttatttgcggatatcatatatataatttctttatcttcttgaatgtgtctaa-ccgaacaatgccggataaatacac 9588509  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 84
Target Start/End: Original strand, 19271790 - 19271837
Alignment:
Q  37 ctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19271790 ctattaacccaatattttacttaacttttttattgaattcctaatatt 19271837  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 154
Target Start/End: Original strand, 31731197 - 31731258
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31731197 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattttatatgtgttaatattattactaaat 31731258  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36980833 - 36980753
Alignment:
Q  268 aattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  36980833 aattttatttgcggataccatacataaatttttttgatcttcttgattatgtctaacccagacaacaccggataaatacac 36980753  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37006272 - 37006192
Alignment:
Q  268 aattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  37006272 aattttatttgcggataccatacataaatttttttgatcttcttgattatgtctaacccagacaacaccggataaatacac 37006192  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 115
Target Start/End: Original strand, 34947797 - 34947866
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtagaaataacacaaattcataaaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||| |||||    
T  34947797 aatattttatttaactttttcattgaattcctaatattttatataacagaaataacataaattcctaaaa 34947866  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 52107568 - 52107621
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtagaaata 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  52107568 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaata 52107621  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 44162402 - 44162326
Alignment:
Q  19 attacaggggataaagacctattaaccc----aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  44162402 attacagggggtaaagacctattaaacccttaaatattttacttaactttttcattgaaatcttaatattttatgta 44162326  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 36632585 - 36632623
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36632585 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 36632623  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19250565 - 19250508
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtg 177  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  19250565 attttattctatatctgttaataattttgctaaatccagttaatttcatctgtatgtg 19250508  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36660487 - 36660418
Alignment:
Q  124 tattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacg 193  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||    
T  36660487 tattttatatgtgttaataattttaataaatcaaattaatctcatcctcatgtgcatctattaatttacg 36660418  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 52107071 - 52107124
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtagaaata 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  52107071 aatattttacttaacttttttattgaattcataatattttatgtaatagaaata 52107124  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3696549 - 3696505
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3696549 aatattttacttaaatttttcattgaattcctaatattttatgta 3696505  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9371161 - 9371090
Alignment:
Q  122 tttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacg 193  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||  |  |||||||||| ||||||||    
T  9371161 tttattatatatgtgttaataattttacaaactccaattaatttcatccgttggtgcatctattaatttacg 9371090  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 40319575 - 40319613
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40319575 aatattttacttaacttttttattgaattcataatattt 40319613  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 43512828 - 43512790
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43512828 aatattttacttgacttttttattgaattcctaatattt 43512790  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45877320 - 45877282
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45877320 aatattttacttgacttttttattgaattcctaatattt 45877282  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 13865068 - 13865035
Alignment:
Q  22 acaggggataaagacctattaacccaatatttta 55  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13865068 acaggggataaaaacctattaacccaatatttta 13865035  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 29183761 - 29183728
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaata 50  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29183761 atattataggggataaagacctattaacccaata 29183728  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 37041556 - 37041608
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtagaaata 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37041556 aatattttacttaactattt-attgaattcctaatattttatgtaatagaaata 37041608  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Original strand, 51549583 - 51549612
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51549583 atattacaggggataaagacctattaaccc 51549612  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Original strand, 52107325 - 52107361
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatat 83  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52107325 aatattttacttaacttttttattgaatttctaatat 52107361  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 54567771 - 54567807
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattt 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  54567771 atattacagggggtaaagacctattaacccaagattt 54567807  T

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Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37200375 - 37200066
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  37200375 atattacagggg-taaagacctattaacccaatattttacttaactttttcactgaattcctaatattttatgtaacataaataacaaaaattcataaaa 37200277  T
Q  116 attgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 215  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37200276 attgattttattctatatatgttaataattttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctatacatttacgagtatttataatatggtatatt 37200177  T
Q  216 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttga 313  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37200176 ttattatatttgtgtgtatttattaagatatttatcctataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacttataatttttttatcttcttga 37200077  T
Q  314 atatgtctaat 324  Q
    |||||||||||    
T  37200076 atatgtctaat 37200066  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 92 - 348
Target Start/End: Original strand, 24079763 - 24080020
Alignment:
Q  92 tagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaattta 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24079763 tagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctat--gtgataatatttttattaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaattta 24079860  T
Q  192 cgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcata 289  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24079861 caagtatttataatataatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatatttatcttatatcaatccgtgataaattttatttgcggatatcata 24079960  T
Q  290 catataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  24079961 catataattttttttatcttcttgaatatgtctaacccggacaacgccgggtaaatacac 24080020  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23865736 - 23865481
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23865736 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 23865637  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23865636 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtatatttattaagatattcatcatattccaatccgtgataaattttatttgtggatatcatac 23865537  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
      |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  23865536 --ataatttttttatcttcttaaatatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 23865481  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44719874 - 44719572
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||   | |||||||| |||||||||||||||||    
T  44719874 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttaattaacagaaataacacaaattcctaaaggctaattttattatatatgtgttaatattt 44719775  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44719774 ttattaaacccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagata 44719675  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaa 343  Q
    |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||  ||  |||||||||||||| | |||  || |||||||||  ||||    
T  44719674 ttcatcatattccaatccgtgataaa-tttatttacaaatatcata-atataatatttaaatcttcttgaatatatgtaacccgaacaacgccgagtaaa 44719577  T
Q  344 tacac 348  Q
    |||||    
T  44719576 tacac 44719572  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44196398 - 44196105
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaata--------------acacaaattcataaaaattgattttattctat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||              |||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  44196398 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaatagaaatatcttaacataaataacacaaattcctaaaagttaattttattctat 44196299  T
Q  132 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtg 229  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  44196298 atttgttaatatttttactaaaaccaatttattttat-tgcatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtg 44196200  T
Q  230 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
     |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44196199 catttattaagatattcatccgaaaccaatccgtgataatttttatttgcggatatcatacatataattttttttatcttcttgaatatgtctaa 44196105  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 120 - 347
Target Start/End: Original strand, 43843473 - 43843696
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||    
T  43843473 attttattcaatatgtgttaatatttttattaaatccctttaattttatctctatgtgtatctataaatttacaagta-ttgtaatatgatttattttat 43843571  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatat 317  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||     |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  43843572 tatattcatgtgtatttattaagatattcgtcacataccaat-----ataaattttatttgtggatatcatacatagaattttttgatcttcttgaatat 43843666  T
Q  318 gtctaattcggacaacgccggataaataca 347  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  43843667 gtctaacccggacaacgccgggtaattaca 43843696  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 298
Target Start/End: Original strand, 4233044 - 4233224
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4233044 attttattttatatgtgttaatatttttactaaatcccgttaattgtatctgtatgtgcattcataaatttacgagtatttataatatgatttattttat 4233143  T
Q  220 --tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatt 298  Q
      |||| || |||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||    
T  4233144 tatattcgtatgtatttattaaaatattcatcacatatcaatccatgataaaatttatttatgaatatcatacatagaatt 4233224  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32738291 - 32738163
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatttta- 218  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |  || || || ||| |||||| | ||| ||| |||||||  || ||||     
T  32738291 attttattttatatgtgttaatagttttactaaattcagttaattttatttgcatttgtatgtattaatttatgggtacttaaaatatgatgtactttat 32738192  T
Q  219 -ttatttgtgtgtatttattaagatattc 246  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32738191 gttatttgtgtgtatccattaagatattc 32738163  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23865797 - 23865753
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23865797 aatattttacttaattttttcattgaattcctaatattttatgta 23865753  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 3364356 - 3364327
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3364356 atattacaggggataaagacctattaaccc 3364327  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Original strand, 18555835 - 18555864
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18555835 atattacaggggataaagacctattaaccc 18555864  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 18701580 - 18701552
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacc 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18701580 atattacaggggataaagacctattaacc 18701552  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 19493305 - 19493277
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacc 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19493305 atattacaggggataaagacctattaacc 19493277  T

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Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 348
Target Start/End: Original strand, 33053074 - 33053410
Alignment:
Q  17 atattacagggga-taaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaa 114  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33053074 atattacaggggggtaaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgttgcagaaataacacaaattcataaa 33053173  T
Q  115 aattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  33053174 aattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatctaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttatgatatggtgtat 33053273  T
Q  215 tttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataa-ttattttatcttctt 311  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  33053274 tttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatgcatataattttttttatcttctt 33053373  T
Q  312 gaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
     |||||||||||  |  ||||||| | ||||||||||    
T  33053374 aaatatgtctaacccaaacaacgctgaataaatacac 33053410  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19263308 - 19263051
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19263308 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctatgaatttac 19263209  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19263208 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatac 19263109  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  19263108 atataattcttttatctttttgaatatgtcaaacccggacaacaccgcataaatacac 19263051  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 93 - 346
Target Start/End: Original strand, 7784146 - 7784401
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  7784146 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtacatctataaattcac 7784245  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7784246 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgcatttattaagatatccatcttatttcaatccgtgataaattttatttgtggatatcatac 7784345  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatac 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||    
T  7784346 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaatacggacaaccccgagtaaatac 7784401  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 791201 - 791460
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  791201 agaaataacacaaattccttaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaattcaattaattttatctgtttttgtatctataaatttac 791300  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  791301 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccatgataaattttatttgcggatatcatac 791400  T
Q  291 atataa--ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  791401 atataatttttttttatcttcttgaatatgtctaatccagacaacgctggataaatacac 791460  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 16467288 - 16467548
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16467288 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaattaac 16467387  T
Q  193 gagta-tttataatatgacatattttatta--tttgtgtgta--tttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatca 287  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16467388 gagtattttataatatggtatattttattatgtttgtttgtatttttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcgaataaca 16467487  T
Q  288 tacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  16467488 tacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgggcaacgccagataaatacac 16467548  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 347
Target Start/End: Original strand, 6829100 - 6829406
Alignment:
Q  50 attttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataaca---------caaattcataaaaattgattttattctatatgtgtta 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||         ||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||    
T  6829100 attttacttaacttttttattgagttcctaatattttatgtgatagaaatatcagagataagacaaattcgtaaaagttaattttattctat--gtgtta 6829197  T
Q  140 atatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttatt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6829198 atatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttaccagtatttataacatgatatattttattatatttgtgtgtatttatt 6829297  T
Q  238 aagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccg 337  Q
    ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||     
T  6829298 aagatattcatcctataccaatccataataaattttatttacgaatatcatacatataatatttttatcttcttaaatatgtctaatccgg-caacgcca 6829396  T
Q  338 gataaataca 347  Q
    ||||||||||    
T  6829397 gataaataca 6829406  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 111 - 322
Target Start/End: Original strand, 294667 - 294877
Alignment:
Q  111 taaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgac 210  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  294667 taaaagttgattttat-ctatatgtgttaatactttttctaaatccaattaattttatcagtatg--catctataaatttacgagtatttataatatgat 294763  T
Q  211 atattttattatttgtg--tgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatctt 308  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  294764 atattttattatttttgggtgtatttattaagatattcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatttcatacatataatttttttatctt 294863  T
Q  309 cttgaatatgtcta 322  Q
    ||||||||||||||    
T  294864 cttgaatatgtcta 294877  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 303
Target Start/End: Original strand, 29241060 - 29241263
Alignment:
Q  102 acaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtattta 201  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29241060 acaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttattaaatccaattaattttatatgtacgtgcatctataaatttacgagtattta 29241159  T
Q  202 taatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataatta 299  Q
    |||| ||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29241160 taatttggtctattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattt 29241259  T
Q  300 tttt 303  Q
    ||||    
T  29241260 tttt 29241263  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 348
Target Start/End: Original strand, 35169916 - 35170068
Alignment:
Q  198 tttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatata 295  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35169916 tttataatatgatataatttattatatttctgtgtatttattaagattttcatcatatatcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatata 35170015  T
Q  296 attattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35170016 atttttttatcttcttgaatatgtctaactcgagcaacgccggataaatacac 35170068  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13610571 - 13610377
Alignment:
Q  131 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||    
T  13610571 tatgtgttaatatttttactaaattcagttaattttatatgtctgtgtatctataaatttacgagtacttataatatgatttattttattctattcgtgt 13610472  T
Q  229 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    |||  |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  13610471 gtacatattaagatattcaactcataccaatccgtgataaattttatttgtggataccatacattgaattttttggtcttcttgagtatgtctaa 13610377  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 131 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33642052 - 33641858
Alignment:
Q  131 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||| ||||    
T  33642052 tatgtgttaatatttttactaaattcagttaatttcatatgtccgtgtatctataaatttacgagtacttataatatgatttattttattctattcgtgt 33641953  T
Q  229 gtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaa 323  Q
    |||  |||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  33641952 gtacatattaagatattcaacccataccaacccgtgataaattttatttgtggataccatacattgaattttttggtcttcttgagtatgtctaa 33641858  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 348
Target Start/End: Original strand, 5250634 - 5250876
Alignment:
Q  112 aaaaattgattttattctata----tgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  5250634 aaaaattaattttattctataagtatgtgttaatatttatactaaatccaattaattttatatgtatgtgcatctataaatttatgatcatttataatat 5250733  T
Q  208 gacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttat 305  Q
    |   ||| ||||  |||| |||||||  ||||||| |||||||||  |  ||||| | ||||||||||||||||  ||  | ||| || |||| |||  |    
T  5250734 ggtttatgttattctattcgtgtgtacctattaaggtattcatcccctaccaatctgcgataaattttatttgcaaatgccgtacttagaattttttggt 5250833  T
Q  306 cttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
     ||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||    
T  5250834 tttcttgaatatatctaacccgggcaacgtcggataaatacac 5250876  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Original strand, 35169320 - 35169421
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||    
T  35169320 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttagtatttttactaaatccaattaattttatttgtacgtgtatatataaatttac 35169419  T
Q  193 ga 194  Q
    ||    
T  35169420 ga 35169421  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36244918 - 36244840
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtat 198  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  36244918 attttattctgtatatgttaataattttactaaatccagttaattatatttgtctgtgcatctataaatttacgagtat 36244840  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 99
Target Start/End: Original strand, 33052555 - 33052608
Alignment:
Q  46 caatattttacttaactttttcattgaattcctaatatttatgtagtagaaata 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33052555 caatattttacttaacttttttattgaattcctaatatttatgtaacagaaata 33052608  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 7784085 - 7784123
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7784085 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 7784123  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 294397 - 294461
Alignment:
Q  19 attacaggggataaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  294397 attacagggggtaaagac--attaacccaatattttacttgatttttttactgaattcctaatattt 294461  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 7782789 - 7782827
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7782789 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 7782827  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 7783039 - 7783077
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7783039 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 7783077  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 7783286 - 7783324
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7783286 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 7783324  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 35168756 - 35168794
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35168756 aatattttacttaattttttcattgaattcctaatattt 35168794  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 78
Target Start/End: Original strand, 791140 - 791171
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791140 aatattttacttaactttttcattgaattcct 791171  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 348
Target Start/End: Original strand, 29241589 - 29241636
Alignment:
Q  301 tttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  29241589 tttatcttcttgaatatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 29241636  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 292793 - 292831
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  292793 aatattttacttgacttttttattgaattcctaatattt 292831  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 81
Target Start/End: Original strand, 788696 - 788730
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaat 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  788696 aatattttacttaactttatcattgaattcctaat 788730  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 7783823 - 7783861
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7783823 aatattttacttaacttttttattgaatttctaatattt 7783861  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 19263369 - 19263331
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19263369 aatattttacttaactttttcattaaattccttatattt 19263331  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 35169007 - 35169045
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35169007 aatattttacttgacttttttattgaattcctaatattt 35169045  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 38313199 - 38313169
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38313199 atattacaggggataaagacctattaaccca 38313169  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19263619 - 19263566
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtagaaata 99  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19263619 aatattttacttgatttttttattgaattcctaatattttatgtaatagaaata 19263566  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 31861520 - 31861491
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31861520 atattacaggggataaagacctattaaccc 31861491  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 5747356 - 5747324
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaat 49  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5747356 atattacatgggataaagacctattaacccaat 5747324  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Original strand, 29240989 - 29241033
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29240989 aatattttacttaactttgtcattaaattcctaatattttatgta 29241033  T

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Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 322
Target Start/End: Original strand, 47396313 - 47396591
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatattt 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47396313 aatattttacttaaatttttcattgtattcctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatattt 47396412  T
Q  146 ttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagata 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  47396413 ttactaaatccaattaattttatctgtatgtccatctataaatttacgagtatttataatatgatatattttattatatttgtatgtatttattaagata 47396512  T
Q  244 ttcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtcta 322  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47396513 ttcatcctataccaatctgtgataaattttatttgcggatatcatacatatattttttttatcttcttgaatatgtcta 47396591  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 44155973 - 44156229
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44155973 agaaataa-acaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccagttaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 44156071  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44156072 gagtatttataatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttataccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 44156171  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  44156172 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaatccggacaacaccagataaatacac 44156229  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39957297 - 39956979
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtag--------------aaataacacaaattcataaaaattgattttattctat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||              |||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||    
T  39957297 aatattttacttaactttttcattgaattcataatactttatgtagcagaaatatctcaacaaaaataacataaattcctaaaagttaattttattatat 39957198  T
Q  132 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  39957197 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgttatattttattatatttgtgtg 39957098  T
Q  230 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||      
T  39957097 tatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacatataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgtg 39956998  T
Q  330 caacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39956997 caacgccggataaatacac 39956979  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 48104756 - 48104989
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaataacacaaattcataaaa 115  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48104756 atattacaggaggtaaagacctattaacccaatattttacttaactttttcattgaatttctaatattttatgtaacagaaataacacaaattcataaaa 48104855  T
Q  116 attgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatt 215  Q
    | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  48104856 aatgattttattctat--gtattaatatttttactaaatccaattaattttatctatatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtacatt 48104953  T
Q  216 ttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatc 249  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48104954 ttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatc 48104989  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37534702 - 37534454
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37534702 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatacttttactaaatctaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttac 37534603  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacat 292  Q
    ||||||||||||| | |      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37534602 gagtatttataatttta------ttat-atttgtgtgtatttattaagatattcatcctattctaatccgtgataaattttatttgcagatatcatacat 37534510  T
Q  293 ataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37534509 ataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcgggcaacgccggataaatacac 37534454  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 24481993 - 24482251
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481993 agaaataacacaaatttctaaaagtttattttattttatatttgttaatatttttactaaatccaattaaatttatctttatgtgcatctataaatttac 24482092  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24482093 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtatatctattaagatattcatcctataccaatccgtaataaattttatttgcgaatatcatac 24482192  T
Q  291 atataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||    
T  24482193 atataattttttttatctttttgaatatgtttaaccctgccaacgccggataaatacac 24482251  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Original strand, 32985321 - 32985578
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  32985321 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcacttataaatttac 32985420  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||     
T  32985421 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatatcaatccttgataaa-tttatttgcggatctaatag 32985519  T
Q  291 atataa-ttattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  32985520 atataattttttttatcttcttaaatatgtgtaatccgagcaacgcggaataaatacac 32985578  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31580126 - 31579870
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  31580126 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattctatatgtgttaatatatttactaaatccaat-aattttatctctacgtgcatcaataaatttat 31580028  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31580027 gagtatttataatatagtatattttattatatttgtgtgtatttatgaagatattcatcctataccaatccatgataaattttatttgcggatatcatac 31579928  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||| |||||||||    
T  31579927 atataatttttttatcttcttgaaaatgtctgacccagacaacgccgggtaaatacac 31579870  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38433450 - 38433193
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38433450 agaaataacacaaattcctaaaagttgattttatt--atttgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 38433353  T
Q  193 gagtatttata--atatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcat 288  Q
     ||||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38433352 aagtatttatagaatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcttattcaaatccgcgataaattttatttgcggatatcat 38433253  T
Q  289 acatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||  || |||||||| |||||||||||    
T  38433252 acatataattttttcatcttcttaaatatttataacccgaacaacgccagataaatacac 38433193  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 576567 - 576328
Alignment:
Q  94 gaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacg 193  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  576567 gaaataacacaaattcctaaaagtgaattttattctatatgtattaatatttttactaaatcctattaattttatctttatgtgcatctataaatttaag 576468  T
Q  194 agtatttataatatgacatattttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacata 293  Q
    |||||||||    ||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  576467 agtatttat----tg-----------tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctataccaatccgtgataaattttatttgcagatatcatatata 576383  T
Q  294 taattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||    
T  576382 taatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgggcaacgccgggtaaatacac 576328  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 93 - 285
Target Start/End: Original strand, 39581076 - 39581269
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39581076 agaaataacacaaatttctaaaagttaattttattatttatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 39581175  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattatttgtgtgt-atttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatat 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39581176 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtaatttattatgatattcatcatatttcaattcgtgataaattttatttgcggatat 39581269  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 319
Target Start/End: Original strand, 39778712 - 39778923
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||||||    
T  39778712 agaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatatatgtgttaatatttttactaaag-----------------tatgtgcatctataaatttac 39778794  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttattat--ttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39778795 gagtatttctaatatggtatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcctattccaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 39778894  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgt 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39778895 atataatttttttatcttcttgaatatgt 39778923  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 286
Target Start/End: Original strand, 6496477 - 6496668
Alignment:
Q  92 tagaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaattta 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  6496477 tagaaataacacaaattcctaaaagttaattttattttatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtacgcgcatctataaattta 6496576  T
Q  192 cgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatc 286  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6496577 tgagtatttataatataatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcccat---aa--cgtgataaattttatttgcggatatc 6496668  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Original strand, 19925804 - 19925957
Alignment:
Q  133 tgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgt 230  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||| | ||||    
T  19925804 tgtgttaatatttttagtaaatttagttaattttatttgtctgcgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttgttctattcgcgtgt 19925903  T
Q  231 atttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggata 284  Q
    |  ||||||||||||| ||| ||  | |||| | | || |||||||||||||||    
T  19925904 acctattaagatattcgtcccataacgatcctttaaaatttttatttgcggata 19925957  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34950887 - 34950805
Alignment:
Q  135 tgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatatttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  34950887 tgttaatatttttactaaattaagttaattttatctgtttatgcatctataaatttactagtatttataatataatatatttt 34950805  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 39778651 - 39778689
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39778651 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 39778689  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 576629 - 576585
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  576629 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgta 576585  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Original strand, 39581015 - 39581053
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39581015 aatattttatttaactttttcattgaattcctaatattt 39581053  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 84
Target Start/End: Original strand, 24481932 - 24481969
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatatt 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24481932 aatattttacttaactttttcattgaaatcctaatatt 24481969  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 347
Target Start/End: Original strand, 39581312 - 39581359
Alignment:
Q  300 ttttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaataca 347  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  39581312 ttttatcttcttgaatatatctaacccggacaacgccagataaataca 39581359  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 577135 - 577082
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt-atgtagtagaaata 99  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  577135 aatattttacttaactcttttattgaattactaatatttaatgtaatagaaata 577082  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Original strand, 32953004 - 32953041
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatcca 157  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32953004 attttattctatatatgttaataattttactaaatcca 32953041  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 248
Target Start/End: Original strand, 16717526 - 16717604
Alignment:
Q  174 tgtgcatctata--aatttacgagtatttataatatgacatattttatt--atttgtgtgtatttattaagatattcat 248  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16717526 tgtgcatctatattaatttacgggtatttaaaatatgatttattctattctattcgtgtgtattcattaagatattcat 16717604  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 248
Target Start/End: Original strand, 17691736 - 17691814
Alignment:
Q  174 tgtgcatctata--aatttacgagtatttataatatgacatattttatt--atttgtgtgtatttattaagatattcat 248  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17691736 tgtgcatctatattaatttacgggtatttaaaatatgatttattctattctattcgtgtgtattcattaagatattcat 17691814  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 31580187 - 31580143
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31580187 aatattttatttaactttttcattgaatttctaatattttatgta 31580143  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 284
Target Start/End: Original strand, 32953069 - 32953190
Alignment:
Q  159 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttattatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaa 258  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| | | ||||||    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||  |  ||| || |    
T  32953069 ttaattttatctgcatgtgcatctattaatttacgggtactaaaaatatg----atttttttattcgtgtgtactcattaagatatttgtgttatatcta 32953164  T
Q  259 tccgtgataaattttatttgcggata 284  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||    
T  32953165 ttcgtggtaaattttatatgcggata 32953190  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 83
Target Start/End: Original strand, 32984742 - 32984774
Alignment:
Q  51 ttttacttaactttttcattgaattcctaatat 83  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32984742 ttttacttaacttttttattgaattcctaatat 32984774  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Original strand, 44155912 - 44155956
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44155912 aatattttacttaatttttttattgaattcctaatattttatgta 44155956  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 46
Target Start/End: Original strand, 44569107 - 44569135
Alignment:
Q  18 tattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44569107 tattacaggggataaagacctattaaccc 44569135  T

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Target: scaffold0006 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 93 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 120456 - 120199
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  120456 agaaataatacaaattcctaaaagttaattttattctacatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctgtatgtgcatctataaatttac 120357  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  120356 gagtatttataatatgatatattttattatatttgtgtgtatttattaagatattcatcatatacctatccatgataaattttatttgcaaatattatac 120257  T
Q  291 atataattattttatcttcttgaatatgtctaattcggacaacgccggataaatacac 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||    
T  120256 atataatttttttatcttcttgaatatgtctaacccgggcaacaccgggtaaatacac 120199  T

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Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 120517 - 120479
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120517 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 120479  T

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Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 120772 - 120734
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  120772 aatattttacttaactttttcagtgaattccaaatattt 120734  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 216897 - 216580
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgtagtag--------------aaataacacaaattcataaaaattgattttattctat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||              ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||    
T  216897 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgtaacagaaatatctcaacaaaaataacacaaattcctaaaagttaattttattatat 216798  T
Q  132 atgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtg 229  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| ||    
T  216797 atatg-taatatttttactaaatccaattaattttatttgtatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatggtatattttgttatatttgtatg 216699  T
Q  230 tatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatacatataattattttatcttcttgaatatgtctaattcgga 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||      
T  216698 tatttattaagatattcatccaattccaatccgtgataaattttatttgcgaatatcatacttataatttttttatcttcttgaatatgtctaactcgcg 216599  T
Q  330 caacgccggataaatacac 348  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  216598 caacaccgggtaaatacac 216580  T

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Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31298056 - 31297839
Alignment:
Q  93 agaaataacacaaattcataaaaattgattttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttac 192  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  31298056 agaaataacacaaatttttaaaagttaattttattctatatgggttaatatttgtactaaatccaattaattttatctttatgtgcgtttatgaatttac 31297957  T
Q  193 gagtatttataatatgacatattttat--tatttgtgtgtatttattaagatattcatcctatgtcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 290  Q
     ||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31297956 tagtatttattatatgatatattatattatatttgtgtgtatttatttaaatattcatcctatatcaatccgtgataaattttatttgcggatatcatac 31297857  T
Q  291 atataattattttatctt 308  Q
    |||||||| |||||||||    
T  31297856 atataatttttttatctt 31297839  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 31298117 - 31298073
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaata-tttatgta 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31298117 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattttatgta 31298073  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8887988 - 8887950
Alignment:
Q  47 aatattttacttaactttttcattgaattcctaatattt 85  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8887988 aatattttacttaacttttttattgaattcctaatattt 8887950  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Original strand, 3840907 - 3841007
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatgacatattttat 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||      ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  3840907 attttattcaatatgtgttaataattttactaaatccatataatttcatccgctgatgcatatattaatttacgggtatttaaaatatgaattattttat 3841006  T
Q  220 t 220  Q
    |    
T  3841007 t 3841007  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 7922346 - 7922316
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccca 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7922346 atattacaggggataaagacctattaaccca 7922316  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14661918 - 14661873
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattt 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  14661918 attttattcaatatgtgttaataattttactaaatctaaataattt 14661873  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 31851787 - 31851758
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31851787 atattacaggggataaagacctattaaccc 31851758  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Original strand, 31886056 - 31886085
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31886056 atattacaggggataaagacctattaaccc 31886085  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 14328674 - 14328710
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattt 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14328674 atattacagggggtaaagacctattaacccaagattt 14328710  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 14421684 - 14421720
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattt 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14421684 atattacagggggtaaagacctattaacccaagattt 14421720  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 57
Target Start/End: Original strand, 24387789 - 24387829
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaatattttact 57  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24387789 atattacagggggtaaagacctattaacccaaaattctact 24387829  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 30381595 - 30381567
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacc 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30381595 atattacaggggataaagacctattaacc 30381567  T

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Target: scaffold0839 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 184
Target Start/End: Original strand, 4497 - 4557
Alignment:
Q  124 tattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctat 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  4497 tattctatatgtgttaataattttactgaatccaattaatttcatctgcatgtgcatctat 4557  T

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Target: scaffold1797 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1797
Description:

Target: scaffold1797; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 422
Alignment:
Q  159 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 208  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  471 ttaattttatatgtatgtgcatctataaatttacgagcatttataatatg 422  T

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Target: scaffold1797; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 737
Alignment:
Q  131 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaatttta 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773 tatgtgttaatatttttactaaatccaattaatttta 737  T

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Target: scaffold1637 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1637
Description:

Target: scaffold1637; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 208
Target Start/End: Original strand, 18 - 67
Alignment:
Q  159 ttaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatg 208  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18 ttaattttatatgtatgtgcatctataaatttacgagcatttataatatg 67  T

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Target: scaffold0578 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0578
Description:

Target: scaffold0578; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6538 - 6472
Alignment:
Q  143 tttttactaaatccaattaattttatctttatgtgcatctataaatttacgagtatttataatatga 209  Q
    |||||||||||| | || ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6538 tttttactaaattctataaatatcatctgcatgtgcatctataaatttacgagtacttaaaatatga 6472  T

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Target: scaffold0638 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0638
Description:

Target: scaffold0638; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 165
Target Start/End: Original strand, 3529 - 3574
Alignment:
Q  120 attttattctatatgtgttaatatttttactaaatccaattaattt 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  3529 attttattctatatgtgttaaaaaatttactaaatccagttaattt 3574  T

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Target: scaffold0246 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15901 - 15872
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaaccc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15901 atattacaggggataaagacctattaaccc 15872  T

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Target: scaffold0142 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Original strand, 34854 - 34886
Alignment:
Q  17 atattacaggggataaagacctattaacccaat 49  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34854 atattacagggggtaaagacctattaacccaat 34886  T

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