View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20794_high_3 (Length: 518)

Name: NF20794_high_3
Description: NF20794
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20794_high_3
NF20794_high_3
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (115-504)||(26986790-26987193)
chr8 (115-504)||(26981676-26982080)
chr8 (115-504)||(34108229-34108634)
chr8 (115-504)||(14318416-14318819)
chr8 (115-504)||(18493978-18494380)
chr8 (115-504)||(14314712-14315115)
chr8 (248-502)||(43956798-43957051)
chr8 (249-506)||(10340916-10341163)
chr8 (389-504)||(25953248-25953363)
chr8 (396-504)||(18608724-18608832)
chr8 (151-241)||(10340754-10340845)
chr8 (432-503)||(18885065-18885136)
chr8 (248-354)||(18608598-18608703)
chr8 (113-196)||(43956649-43956732)
chr8 (113-160)||(10340696-10340743)
chr8 (248-345)||(25953123-25953220)
chr8 (404-474)||(1781869-1781939)
chr8 (256-354)||(1781968-1782066)
chr8 (118-160)||(18608435-18608477)
chr8 (115-171)||(1782181-1782237)
chr8 (273-309)||(18616167-18616203)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (115-504)||(12856789-12857192)
chr7 (115-504)||(26051021-26051424)
chr7 (115-504)||(26060380-26060783)
chr7 (115-504)||(26056134-26056537)
chr7 (115-504)||(26065493-26065896)
chr7 (115-504)||(12851674-12852079)
chr7 (360-504)||(14610364-14610508)
chr7 (149-321)||(14610512-14610698)
chr7 (409-504)||(11056625-11056720)
chr7 (396-504)||(4181478-4181585)
chr7 (248-354)||(4181351-4181457)
chr7 (254-504)||(5440254-5440492)
chr7 (254-504)||(5449264-5449502)
chr7 (397-506)||(37459938-37460047)
chr7 (443-504)||(35352434-35352495)
chr7 (115-171)||(2248853-2248909)
chr7 (115-169)||(4181276-4181330)
chr7 (462-506)||(5436692-5436736)
chr7 (113-163)||(35352119-35352169)
chr7 (115-171)||(37459703-37459759)
chr7 (298-354)||(37459861-37459917)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (115-504)||(21275773-21276176)
chr6 (248-506)||(21936634-21936886)
chr6 (248-506)||(21937568-21937822)
chr6 (249-504)||(24509703-24509955)
chr6 (389-504)||(20752207-20752322)
chr6 (389-504)||(24508917-24509032)
chr6 (398-504)||(2887490-2887596)
chr6 (398-504)||(2889212-2889318)
chr6 (397-504)||(11183263-11183370)
chr6 (248-354)||(24508808-24508914)
chr6 (116-200)||(11182989-11183073)
chr6 (115-171)||(21936408-21936464)
chr6 (115-192)||(20751881-20751957)
chr6 (117-171)||(12909621-12909675)
chr6 (117-171)||(12934728-12934782)
chr6 (115-200)||(21937943-21938028)
chr6 (249-354)||(20752087-20752192)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (114-504)||(35096028-35096432)
chr4 (115-504)||(35090915-35091318)
chr4 (248-504)||(30019796-30020054)
chr4 (249-504)||(32429242-32429487)
chr4 (115-248)||(32429034-32429168)
chr4 (115-239)||(3424114-3424238)
chr4 (394-504)||(18737162-18737272)
chr4 (258-506)||(18670838-18671076)
chr4 (397-504)||(34279588-34279695)
chr4 (394-504)||(18716489-18716599)
chr4 (396-505)||(34128333-34128442)
chr4 (396-504)||(14643826-14643934)
chr4 (397-504)||(54859254-54859361)
chr4 (248-354)||(3409556-3409662)
chr4 (398-504)||(47071408-47071514)
chr4 (151-248)||(18716809-18716907)
chr4 (151-247)||(18737483-18737580)
chr4 (115-192)||(34279254-34279331)
chr4 (166-248)||(18671159-18671242)
chr4 (162-239)||(3409396-3409474)
chr4 (400-504)||(3424799-3424904)
chr4 (248-354)||(54859125-54859232)
chr4 (115-172)||(22119073-22119130)
chr4 (124-197)||(54858987-54859060)
chr4 (115-171)||(47071758-47071814)
chr4 (115-171)||(14643526-14643582)
chr4 (287-354)||(3424697-3424764)
chr4 (260-354)||(14643705-14643799)
chr4 (257-357)||(25618264-25618357)
chr4 (115-160)||(3409329-3409374)
chr4 (248-354)||(22118855-22118963)
chr4 (248-354)||(47071535-47071647)
chr4 (274-354)||(34128234-34128314)
chr4 (274-354)||(34279487-34279567)
chr4 (114-173)||(25618049-25618108)
chr4 (114-171)||(34601824-34601881)
chr4 (115-197)||(34128122-34128205)
chr4 (119-157)||(18716920-18716958)
chr4 (119-157)||(18737596-18737634)
chr4 (114-171)||(30019637-30019692)
chr4 (415-476)||(34602060-34602121)
chr4 (151-197)||(14643582-14643628)
chr4 (151-197)||(30019692-30019738)
chr4 (248-286)||(32429182-32429220)
chr4 (398-479)||(3409695-3409781)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (115-504)||(9877340-9877743)
chr5 (115-504)||(9872225-9872628)
chr5 (115-504)||(39903845-39904248)
chr5 (115-504)||(39908958-39909361)
chr5 (248-504)||(13556252-13556509)
chr5 (249-504)||(2022964-2023208)
chr5 (250-504)||(35368851-35369095)
chr5 (388-504)||(4555653-4555769)
chr5 (115-197)||(13556105-13556187)
chr5 (398-469)||(43540857-43540928)
chr5 (410-482)||(25184114-25184186)
chr5 (120-195)||(24091794-24091869)
chr5 (450-504)||(43378437-43378491)
chr5 (151-208)||(2024354-2024411)
chr5 (115-160)||(2024422-2024467)
chr5 (115-171)||(43540564-43540620)
chr5 (153-242)||(4555870-4555960)
chr5 (293-352)||(4555772-4555831)
chr5 (115-166)||(4555967-4556018)
chr5 (114-172)||(35368622-35368680)
chr5 (373-431)||(43378485-43378543)
chr5 (255-354)||(43540737-43540834)
chr5 (248-286)||(2023230-2023268)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (115-504)||(10672739-10673142)
chr3 (114-504)||(6852752-6853156)
chr3 (114-504)||(8464750-8465154)
chr3 (115-504)||(6857856-6858259)
chr3 (115-504)||(31081308-31081711)
chr3 (119-504)||(10591100-10591499)
chr3 (115-504)||(4049807-4050211)
chr3 (115-504)||(5481289-5481692)
chr3 (115-504)||(31076201-31076606)
chr3 (114-504)||(1302044-1302449)
chr3 (115-504)||(4054941-4055345)
chr3 (115-504)||(8458311-8458715)
chr3 (114-504)||(10584658-10585062)
chr3 (115-504)||(10677852-10678257)
chr3 (114-504)||(33702399-33702804)
chr3 (114-504)||(5457816-5458216)
chr3 (295-504)||(33703299-33703509)
chr3 (248-506)||(49784494-49784742)
chr3 (114-248)||(49784815-49784950)
chr3 (22-114)||(49513888-49513980)
chr3 (117-242)||(20891424-20891550)
chr3 (397-506)||(3187551-3187660)
chr3 (401-504)||(20891059-20891162)
chr3 (115-212)||(269483-269580)
chr3 (398-506)||(18024246-18024354)
chr3 (248-357)||(29827551-29827659)
chr3 (396-504)||(29827429-29827532)
chr3 (287-348)||(18024167-18024228)
chr3 (115-171)||(29827829-29827885)
chr3 (115-166)||(18023914-18023965)
chr3 (113-241)||(3187244-3187373)
chr3 (288-349)||(20891182-20891243)
chr3 (117-151)||(18023324-18023358)
chr3 (162-208)||(18023982-18024028)
chr3 (288-336)||(18023560-18023607)
chr3 (248-286)||(20891354-20891392)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (115-504)||(28574297-28574700)
chr1 (115-504)||(28598309-28598712)
chr1 (113-504)||(3468067-3468473)
chr1 (249-504)||(10186530-10186783)
chr1 (366-504)||(3465473-3465611)
chr1 (248-502)||(43358755-43358999)
chr1 (249-504)||(44523980-44524226)
chr1 (250-502)||(19310826-19311067)
chr1 (114-248)||(43359071-43359206)
chr1 (248-493)||(21431629-21431865)
chr1 (386-504)||(17414621-17414740)
chr1 (395-504)||(35626172-35626281)
chr1 (115-354)||(16051335-16051588)
chr1 (396-506)||(1187826-1187935)
chr1 (381-504)||(13654335-13654461)
chr1 (143-241)||(3701293-3701392)
chr1 (443-504)||(16051206-16051267)
chr1 (248-335)||(13654478-13654565)
chr1 (116-171)||(17414304-17414359)
chr1 (151-241)||(17414359-17414450)
chr1 (117-171)||(13654676-13654730)
chr1 (117-171)||(35653036-35653090)
chr1 (115-171)||(1188333-1188389)
chr1 (248-354)||(1187961-1188067)
chr1 (121-171)||(19311180-19311230)
chr1 (462-506)||(29681588-29681632)
chr1 (462-506)||(48366213-48366257)
chr1 (153-247)||(3696169-3696264)
chr1 (293-350)||(3701491-3701548)
chr1 (126-171)||(10186056-10186101)
chr1 (113-169)||(3696109-3696165)
chr1 (119-171)||(10186307-10186359)
chr1 (128-171)||(1188178-1188221)
chr1 (293-352)||(17414561-17414620)
chr1 (256-354)||(35653209-35653307)
chr1 (115-150)||(35626556-35626591)
chr1 (248-286)||(10186470-10186508)
chr1 (151-197)||(19311134-19311180)
chr1 (151-200)||(1188129-1188178)
chr1 (115-172)||(21430777-21430833)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (115-504)||(17720327-17720730)
chr2 (115-504)||(14917183-14917586)
chr2 (115-504)||(45120386-45120790)
chr2 (114-504)||(30283250-30283645)
chr2 (115-248)||(17720000-17720133)
chr2 (115-248)||(39178869-39179002)
chr2 (258-504)||(42780184-42780419)
chr2 (396-504)||(716267-716375)
chr2 (396-504)||(16284437-16284546)
chr2 (274-356)||(716402-716484)
chr2 (115-169)||(42780542-42780596)
chr2 (249-357)||(20892299-20892406)
chr2 (151-200)||(20892154-20892203)
chr2 (114-197)||(716634-716716)
chr2 (151-197)||(42780494-42780540)
chr2 (127-160)||(20892110-20892143)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (115-504)||(1820-2223)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (396-504)||(173358-173466)
scaffold0005 (115-171)||(173710-173766)
scaffold0005 (260-354)||(173493-173587)
scaffold0005 (151-197)||(173664-173710)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (381-504)||(144096-144222)
scaffold0006 (248-335)||(144239-144326)
scaffold0006 (117-171)||(144437-144491)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 26986790 - 26987193
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26986790 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 26986889  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26986890 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 26986989  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26986990 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 26987089  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26987090 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 26987189  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  26987190 aata 26987193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 26981676 - 26982080
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981676 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 26981775  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981776 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatacggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 26981875  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26981876 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 26981975  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981976 ttttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 26982075  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  26982076 aaata 26982080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 34108634 - 34108229
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108634 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 34108535  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34108534 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagaggtgcttt 34108435  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatata--caaaaaccatacaactacacacaatttggacaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34108434 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatatacaaaaaccacacaactacacacaacttggacaga 34108335  T
Q  399 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108334 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 34108235  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  34108234 aaaata 34108229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 14318416 - 14318819
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318416 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 14318515  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14318516 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgtttt 14318615  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14318616 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagagacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 14318715  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318716 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 14318815  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  14318816 aata 14318819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 18493978 - 18494380
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18493978 tgttggtgatttccaaaataatggaatcaatttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 18494077  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18494078 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaa-aggtgcttt 18494176  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18494177 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagatacaaaaaccacacaactacacacaatttggatagaat 18494276  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494277 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 18494376  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  18494377 aata 18494380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 14314712 - 14315115
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314712 tgttggtgattttcaaaataatggaattactttagaaccaaaagttgtaactcttaatgggaaccattcgtatacattggaacattattatttattatta 14314811  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14314812 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgtttt 14314911  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14314912 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagagacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 14315011  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315012 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 14315111  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  14315112 aata 14315115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 248 - 502
Target Start/End: Original strand, 43956798 - 43957051
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43956798 gcaaaaaggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaatgagtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttg 43956897  T
Q  348 ggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaat 447  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43956898 ggcattagttggacatacaaaaac-acacaactacacacaatttggacataattttgttgcattaacaacataattcttcatcattctcttattctaaat 43956996  T
Q  448 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaa 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43956997 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctgaaaccataaatttgtaaaa 43957051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 249 - 506
Target Start/End: Original strand, 10340916 - 10341163
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  10340916 caaaagggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaagaggtgctttttctcatgtgaagagtcatataatgcaccataaatgcttggcatttgg 10341015  T
Q  349 gcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatc 448  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||||| |         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  10341016 gcattagttggacatataaaaac-atacaatt---------ttggacagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatc 10341105  T
Q  449 atccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10341106 atccataaattctctaatgcatgagtgaattgctggaatcataaatctgtaaaatatt 10341163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 504
Target Start/End: Original strand, 25953248 - 25953363
Alignment:
Q  389 tttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaacc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25953248 tttggacagaattttgttacattaacaacataattctccatcattctcatactctaaatcatccatcaattgtctaatgcatgagtgaattgcttgaacc 25953347  T
Q  489 ataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||| |||| ||||    
T  25953348 ataaatatgtacaata 25953363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Original strand, 18608724 - 18608832
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  18608724 agaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagttaattgacggaacgataaatc 18608823  T
Q  496 tgtaaaata 504  Q
    |||||||||    
T  18608824 tgtaaaata 18608832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Original strand, 10340754 - 10340845
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt-attaataatgaaccatgacattgattcaagt 241  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10340754 accaagagttgtaactcttcatggaaaccattcatatacattggaacattattatttattgatagataatgaaccatgacattgattcaagt 10340845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 432 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18885136 - 18885065
Alignment:
Q  432 ttctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaat 503  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18885136 ttctcttactctaaatcatcaatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaat 18885065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Original strand, 18608598 - 18608703
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||     
T  18608598 gcaaaggggtgcttaatgaaccataacattgattcaagttaaaggggtgttttctctcatgtgaag-gtcatataatgcactacaaatgtttggcattta 18608696  T
Q  348 ggcatta 354  Q
    |||||||    
T  18608697 ggcatta 18608703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 196
Target Start/End: Original strand, 43956649 - 43956732
Alignment:
Q  113 aatgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaa 196  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  43956649 aatgttggtgatttttaaaataatggaatcactttagaatcaagagttgtaactcttcatggaaatctttcatatacattggaa 43956732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 160
Target Start/End: Original strand, 10340696 - 10340743
Alignment:
Q  113 aatgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtt 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10340696 aatgttggtgatttcccaaataatggaatcactttagaaccaaaagtt 10340743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Original strand, 25953123 - 25953220
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatt 345  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25953123 gcaaaaggatgcttaatgaaccataaaattgatttaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaatggtcatataatgcactataaatgtttggcatt 25953220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1781939 - 1781869
Alignment:
Q  404 gttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagt 474  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1781939 gttacattaacaacataattatccctcattctcttactcaaaatcatccaccaattctctaattcatgagt 1781869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1782066 - 1781968
Alignment:
Q  256 gtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1782066 gtgcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaaatagtattttctctcatgtgaaaggtcgtatactgcactataaatgtttgacatttggacatta 1781968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 160
Target Start/End: Original strand, 18608435 - 18608477
Alignment:
Q  118 tggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18608435 tggtgatttccaaaataatggaatcactttagaactaaaagtt 18608477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1782237 - 1782181
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1782237 tgttggagatttctaaaataatggaattattttagaacaaaaagttataactcttca 1782181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18616203 - 18616167
Alignment:
Q  273 gcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgt 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18616203 gcattgattcaagttaaaggggtgttttctctcatgt 18616167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 12857192 - 12856789
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857192 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 12857093  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857092 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 12856993  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12856992 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 12856893  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856892 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 12856793  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  12856792 aata 12856789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 26051424 - 26051021
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051424 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 26051325  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051324 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 26051225  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26051224 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 26051125  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26051124 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 26051025  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  26051024 aata 26051021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 26060783 - 26060380
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060783 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 26060684  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060683 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 26060584  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26060583 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 26060484  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26060483 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 26060384  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  26060383 aata 26060380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 26056537 - 26056134
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26056537 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattattg 26056438  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056437 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 26056338  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26056337 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 26056238  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26056237 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 26056138  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  26056137 aata 26056134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 26065896 - 26065493
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26065896 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattattg 26065797  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065796 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 26065697  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26065696 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 26065597  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065596 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 26065497  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  26065496 aata 26065493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 12852079 - 12851674
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12852079 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattgttacattattatttattatta 12851980  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12851979 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaataggtgcttt 12851880  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaa--tatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacaga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12851879 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatacttgacatttgggcattagttgaagatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacaaa 12851780  T
Q  399 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851779 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 12851680  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  12851679 aaaata 12851674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 360 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 14610508 - 14610364
Alignment:
Q  360 atatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaatt 459  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14610508 atatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctcttattctaaatcatccatcaatt 14610409  T
Q  460 ctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610408 ctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 14610364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 149 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14610698 - 14610512
Alignment:
Q  149 gaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattattaataatgaaccatgacattgattcaagtatatat- 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14610698 gaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattattaataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 14610599  T
Q  248 -------------gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatat 321  Q
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610598 gttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagtcaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatat 14610512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 11056720 - 11056625
Alignment:
Q  409 attaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11056720 attaacaacataattctttatcattctcttactttaaatcatccatcaattctttaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatctgtaaaata 11056625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Original strand, 4181478 - 4181585
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  4181478 agaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttaatctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtg-attgctcgaaccataaacc 4181576  T
Q  496 tgtaaaata 504  Q
     ||||||||    
T  4181577 cgtaaaata 4181585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Original strand, 4181351 - 4181457
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    ||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4181351 gcaaaggggtgcttaatgaaccttaacattgattcaagtcaaaatggtgttttctctcatatgaagagtcatataatgcactataaatgtttgacatttg 4181450  T
Q  348 ggcatta 354  Q
    |||||||    
T  4181451 ggcatta 4181457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 504
Target Start/End: Original strand, 5440254 - 5440492
Alignment:
Q  254 gggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatt 353  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||    
T  5440254 gggtgattaatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttggcatttgggcttt 5440353  T
Q  354 agtt-gaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatcc 452  Q
    | || | | | |||||||| |  |||  ||| | |||||          || ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||     
T  5440354 aatttggacacacaaaaacaa--caagaaca-agaattt----------ttattacattaacaacataattctccctcattcccttactctaaatcatcg 5440440  T
Q  453 atcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5440441 atcaattctctaaagcttgagtaaattgctggaaccatacatctgtaaaata 5440492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 504
Target Start/End: Original strand, 5449264 - 5449502
Alignment:
Q  254 gggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatt 353  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||    
T  5449264 gggtgattaatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttggcatttgggcttt 5449363  T
Q  354 agtt-gaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatcc 452  Q
    | || | | | |||||||| |  |||  ||| | |||||          || ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||     
T  5449364 aatttggacacacaaaaacaa--caagaaca-agaattt----------ttattacattaacaacataattctccctcattcccttactctaaatcatcg 5449450  T
Q  453 atcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5449451 atcaattctctaaagcttgagtaaattgctggaaccatacatctgtaaaata 5449502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 397 - 506
Target Start/End: Original strand, 37459938 - 37460047
Alignment:
Q  397 gaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 496  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  37459938 gaattatgttacatgaacaacataattctcccacattctcttactctaaatcatccatcaattctctgatgcattagcgaattgctgaaaccatatatct 37460037  T
Q  497 gtaaaatatt 506  Q
    ||||||||||    
T  37460038 gtaaaatatt 37460047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 443 - 504
Target Start/End: Original strand, 35352434 - 35352495
Alignment:
Q  443 taaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35352434 taaaccatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctataaaata 35352495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Original strand, 2248853 - 2248909
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2248853 tgttggtgatttctaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtagtaactcttca 2248909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 4181276 - 4181330
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactctt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||    
T  4181276 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttaaaatcaaaagttgcaactctt 4181330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 506
Target Start/End: Original strand, 5436692 - 5436736
Alignment:
Q  462 ctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5436692 ctaatgcattagtgaattgcttgaaccataaatctgtaaaatatt 5436736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 163
Target Start/End: Original strand, 35352119 - 35352169
Alignment:
Q  113 aatgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttata 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  35352119 aatgttggtgatttccgaaataatgaaattactttagaatcaaaagttata 35352169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Original strand, 37459703 - 37459759
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  37459703 tgttagtgatttttaaaataatggaatcactttaaaatcaaaagttttaactcttca 37459759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Original strand, 37459861 - 37459917
Alignment:
Q  298 tttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  37459861 tttctctcatgtgaatggacatataatgcactataaatacttgacatttgggcatta 37459917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21276176 - 21275773
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21276176 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 21276077  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21276076 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 21275977  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21275976 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 21275877  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275876 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 21275777  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  21275776 aata 21275773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 248 - 506
Target Start/End: Original strand, 21936634 - 21936886
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    |||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  21936634 gcaaaaaggtgcttaataaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttaacatttg 21936733  T
Q  348 ggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaa 446  Q
    |||||||||| || |  ||| |||     ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  21936734 ggcattagtttaaca--caacaac-----aacaacacacaattttggactgaactttgttacattaacaacataattctccatcattctcatactctaaa 21936826  T
Q  447 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21936827 tcatctatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 21936886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 248 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21937822 - 21937568
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21937822 gcaaaagggtgtttaatgaaccatcacattgattcaagtcaaaggggtattttctctcatgtgaagggtcatataacgcactataaatgtttggcatttg 21937723  T
Q  348 ggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaa 446  Q
    |||||||||| || |  ||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  21937722 ggcattagtttaaca--caacaacaa--caacaacacacaattttggacataattttgt-acattaacaacataattttccatcactctcttattctaaa 21937628  T
Q  447 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21937627 acatccatcaattctcaaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatttgtataatatt 21937568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 24509955 - 24509703
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    |||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24509955 caaaagtgtgtttaatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaaggttcatataatgcactataaatgcttgacatttgg 24509856  T
Q  349 gcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttgg-acagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaat 447  Q
    ||||||||| || |  | | ||| |  ||| || ||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  24509855 gcattagtttaaca--cgacaacaa--caattatacataattttgtacaaaattatgttacattaacaacataattctccatcattcttttactttaaat 24509760  T
Q  448 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24509759 catccatcaattctctaatgcattagtgaattgttggaaccataaatttgtaaaata 24509703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 504
Target Start/End: Original strand, 20752207 - 20752322
Alignment:
Q  389 tttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaacc 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20752207 tttggaaagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctcttactataagtcatccatcaattctctgatgcatgagtgaattgttggaacc 20752306  T
Q  489 ataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||||||    
T  20752307 ataaatctgtaaaata 20752322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 504
Target Start/End: Original strand, 24508917 - 24509032
Alignment:
Q  389 tttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaacc 488  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24508917 tttgtacaaaattatgttacattaacaacataattctccatcattcttttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaatc 24509016  T
Q  489 ataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||| |||||||||    
T  24509017 ataaatttgtaaaata 24509032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 2887596 - 2887490
Alignment:
Q  398 aattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 497  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2887596 aattttgttccattaccaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaactctctaatgcatgagtgaattgctggaatcataaatctg 2887497  T
Q  498 taaaata 504  Q
    |||||||    
T  2887496 taaaata 2887490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 2889318 - 2889212
Alignment:
Q  398 aattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 497  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2889318 aattttgttccattaccaacataattctccctcattctcttactctaaatcattcatcaactctctaatgcatgagtgaattgctggaatcataaatctg 2889219  T
Q  498 taaaata 504  Q
    |||||||    
T  2889218 taaaata 2889212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 397 - 504
Target Start/End: Original strand, 11183263 - 11183370
Alignment:
Q  397 gaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 496  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  11183263 gaattttgttacaataataacataattctctctcattctcttactctaaatcatcaatcaattctctaatgcatgagtaaattgctgaaaccataaacct 11183362  T
Q  497 gtaaaata 504  Q
    ||||||||    
T  11183363 gtaaaata 11183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Original strand, 24508808 - 24508914
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| | | |||||||||| ||||||    
T  24508808 gcaaaagggtgcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgagaagggtcatattatgtactgtaaatgtttggcatttg 24508907  T
Q  348 ggcatta 354  Q
    |||||||    
T  24508908 ggcatta 24508914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 11182989 - 11183073
Alignment:
Q  116 gttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacatt 200  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  11182989 gttggtcatttctaaaataatggaatcaatttagaaccaaatgttgtaactcttcatggaaatctttcatatacattggaacatt 11183073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Original strand, 21936408 - 21936464
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21936408 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttca 21936464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 20751881 - 20751957
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20751881 tgttggtgatttccaaaataatggattcactttag-atcaaaagttgtaactcttcatgagaacctttcatatacatt 20751957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12909675 - 12909621
Alignment:
Q  117 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12909675 ttggtgatttctaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttca 12909621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 12934782 - 12934728
Alignment:
Q  117 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12934782 ttggtgatttccaaaataatggaatcactctagaaccaaaagttgtaactcttca 12934728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21938028 - 21937943
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||    
T  21938028 tgttggtgatttccaaaataatggaatcattttagaaccataatatgtaactcttcatgaaaatatttcgtatacattggaacatt 21937943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 354
Target Start/End: Original strand, 20752087 - 20752192
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| |    
T  20752087 caaaatggtgcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaaaggtcatctaatgcactataaatacttggcatttag 20752186  T
Q  349 gcatta 354  Q
    ||||||    
T  20752187 gcatta 20752192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 35096432 - 35096028
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096432 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaacaaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 35096333  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096332 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 35096233  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35096232 tctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 35096133  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35096132 ttttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 35096033  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  35096032 aaata 35096028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 35091318 - 35090915
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091318 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 35091219  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091218 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 35091119  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091118 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagagacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 35091019  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35091018 tttgttacattaacaacataattcatcaaaattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 35090919  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  35090918 aata 35090915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 248 - 504
Target Start/End: Original strand, 30019796 - 30020054
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30019796 gcaaaaaggtgcttaatgaaccataacat-gattcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttg 30019894  T
Q  348 ggcattagttgaatatacaaaa--accatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattcta 444  Q
    ||||||||||  | | | || |  || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  30019895 ggcattagtttgacagagaacagaacaacacaacaacacacaattttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctcttactcta 30019994  T
Q  445 aatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  30019995 aatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatatgtgaaata 30020054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 249 - 504
Target Start/End: Original strand, 32429242 - 32429487
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||     
T  32429242 caaaggggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatttgaagagtcatataatgcactataaatgcttggcatttgt 32429341  T
Q  349 gcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaat 447  Q
    |||||||||| |           || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  32429342 gcattagttgga-----------cacacaacaacacacaattttggacagaattttgttggattaacaacataattctccctcattctcttactctaaat 32429430  T
Q  448 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32429431 catccatcaattctttaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatctgtaaaata 32429487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Original strand, 32429034 - 32429168
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt-att 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  32429034 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaagagttgtaactcttcatggaaatcattcatatacattggaacattattatttattgata 32429133  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 248  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32429134 gataatgaaccatgacaatgattcaagtgtatatg 32429168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 3424114 - 3424238
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt-att 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3424114 tgtttgtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgagaacca-tcatatacattggaacattattatttattgata 3424212  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaa 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  3424213 gataatgaaccatgacattgattcaa 3424238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 394 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18737272 - 18737162
Alignment:
Q  394 acagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaa 493  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18737272 acagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaattcatgagtgaattgctggaaccataaa 18737173  T
Q  494 tctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||    
T  18737172 tctgtaaaata 18737162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 18671076 - 18670838
Alignment:
Q  258 gcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagtt 357  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||| ||    
T  18671076 gcttaatgaaccatagcattgattcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatggactataaatgcttggcatttgggaattaatt 18670977  T
Q  358 -gaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatca 456  Q
     | | | |||| ||  | |||| || | ||        ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18670976 tggacacacaacaa--agacaa-tagaaac--------cagaattatgttgcattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatca 18670888  T
Q  457 attctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18670887 attctctaatgcatgagtgacttgttggaaccataaatctgtaaaatatt 18670838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 397 - 504
Target Start/End: Original strand, 34279588 - 34279695
Alignment:
Q  397 gaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34279588 gaattttgttacattaacaacataattcttcctcgttctcttactctaaatcaaccatcaattctctaatgcatgagtgaattcctgaaaccataaatct 34279687  T
Q  497 gtaaaata 504  Q
    ||||||||    
T  34279688 gtaaaata 34279695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 394 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18716599 - 18716489
Alignment:
Q  394 acagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaa 493  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18716599 acagaattttgttgcattaacaacataattctcccccattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatacaagagtgaattgctggaaccataaa 18716500  T
Q  494 tctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||    
T  18716499 tctgtaaaata 18716489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 396 - 505
Target Start/End: Original strand, 34128333 - 34128442
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34128333 agaattttgttgcattaacatcataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattttctaatgcatgagtgaattgttgaaaccataaatc 34128432  T
Q  496 tgtaaaatat 505  Q
    ||||||||||    
T  34128433 tgtaaaatat 34128442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Original strand, 14643826 - 14643934
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  14643826 agaattttgttacatcaacaacataattcttcctaattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgtataggtgaattgctggaaccataaatc 14643925  T
Q  496 tgtaaaata 504  Q
    | |||||||    
T  14643926 tctaaaata 14643934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 397 - 504
Target Start/End: Original strand, 54859254 - 54859361
Alignment:
Q  397 gaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 496  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  54859254 gaattttgtcacattaacaacatgattctccctcattctcttgctctaaatcatccatcaattctctaatgcacgagtgaattgctggaaccataaatcc 54859353  T
Q  497 gtaaaata 504  Q
    ||||||||    
T  54859354 gtaaaata 54859361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Original strand, 3409556 - 3409662
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3409556 gcaaaggggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaaggagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatatttgacatttg 3409655  T
Q  348 ggcatta 354  Q
    |||||||    
T  3409656 ggcatta 3409662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 47071514 - 47071408
Alignment:
Q  398 aattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  47071514 aattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaattatctatcaattctctaatgaatgagtgaattgtttgaaccataaatttg 47071415  T
Q  498 taaaata 504  Q
    |||||||    
T  47071414 taaaata 47071408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18716907 - 18716809
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta-ttattaataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 248  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18716907 accaagagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggtacattattatttagtgatagataatgaaccatgacattgattcaagtgtatatg 18716809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18737580 - 18737483
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta-ttattaataatgaaccatgacattgattcaagtatatat 247  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18737580 accaagagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggtacattattatttagtgatagataatgaaccatgacattgattcaagtgtatat 18737483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 34279254 - 34279331
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34279254 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtttcaattcttcatgggaatcattcatatacatt 34279331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18671242 - 18671159
Alignment:
Q  166 tcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt-attaataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18671242 tcttcatgggaaccattcatatacattggtacattattatttattgataaataatgaaccatgacattgatttaagtgtatatg 18671159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Original strand, 3409396 - 3409474
Alignment:
Q  162 taactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt-attaataatgaaccatgacattgattcaa 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3409396 taactcttcatgagaaccattcatatacattggaacattattatttattgatagataatgaaccatgacattgattcaa 3409474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 400 - 504
Target Start/End: Original strand, 3424799 - 3424904
Alignment:
Q  400 ttttgttacattaacaacataat-tcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  3424799 ttttgttactttaacaacataagatctccctcattctcttactctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgagttactggaaacataaatctgt 3424898  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  3424899 aaaata 3424904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Original strand, 54859125 - 54859232
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagagg-tgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacattt 346  Q
    ||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  54859125 gcaaatggatgcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaagggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttgatattt 54859224  T
Q  347 gggcatta 354  Q
    ||||||||    
T  54859225 gggcatta 54859232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22119130 - 22119073
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcat 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22119130 tgttggtgattttcaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcat 22119073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 197
Target Start/End: Original strand, 54858987 - 54859060
Alignment:
Q  124 tttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  54858987 tttccaaaataatagaatcactttacaaccaaaaattgtaactcttcattggaatcattcatatacattggaac 54859060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 47071814 - 47071758
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47071814 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttacaaccaaaagttgtaactcttca 47071758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Original strand, 14643526 - 14643582
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14643526 tgttggtgatttacaaaataattgaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttca 14643582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 354
Target Start/End: Original strand, 3424697 - 3424764
Alignment:
Q  287 taaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3424697 taaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatatttgatatttgggcatta 3424764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 354
Target Start/End: Original strand, 14643705 - 14643799
Alignment:
Q  260 ttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14643705 ttaatgaaccttagcattgattcaagtcaaatgggtgttttctatcatgtgaagggtcatataatgcgctataaatgtttgatatttgtgcatta 14643799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 357
Target Start/End: Original strand, 25618264 - 25618357
Alignment:
Q  257 tgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagt 356  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||       ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25618264 tgcttaatgaatcataacattgattcaagtcacagaggtgttttctctcat-------gtcatataatgcactataaatgcttggcatttgggcattagt 25618356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 160
Target Start/End: Original strand, 3409329 - 3409374
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3409329 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaactaaaagtt 3409374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22118963 - 22118855
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgc--tttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatt 345  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   ||| |||||||| |||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  22118963 gcaaaggggtgcttaatgaaccatattattcattcaagtcaaaggggtgtattttctctcatgtgaagggtcatataatatactataaatgcttgacatt 22118864  T
Q  346 tgggcatta 354  Q
    |||||||||    
T  22118863 tgggcatta 22118855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 47071647 - 47071535
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgt------gaagagtcatataatgcattataaatgtttga 341  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||      |||| ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  47071647 gcaaatggatgcttaatgaaccattgcattgattcaagtcaaaaaagtgttttctctcatgttcatgtgaagggtcatataatgtactataaatgtttaa 47071548  T
Q  342 catttgggcatta 354  Q
    |||||||||||||    
T  47071547 catttgggcatta 47071535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 354
Target Start/End: Original strand, 34128234 - 34128314
Alignment:
Q  274 cattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    ||||||||||||| |||   ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34128234 cattgattcaagtcaaatgagtgttttctctaatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttgacatttggccatta 34128314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 354
Target Start/End: Original strand, 34279487 - 34279567
Alignment:
Q  274 cattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  34279487 cattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgctcgacatttgagcatta 34279567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 25618049 - 25618108
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||    
T  25618049 atgttggtgatttccaaaatattggaatcactttagaactaagagttgtaactgttcatg 25618108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Original strand, 34601824 - 34601881
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  34601824 atgttggtgatttctaaaataatggaatcattttagaactaaaagttgtaacttttca 34601881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 34128122 - 34128205
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaa-taatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   || ||| | |||||||| ||||||||    
T  34128122 tgttggtgatttccaaaaattatggaatcattttagaaccaaaagttgtaactctctgtgagaatctttcatatatattggaac 34128205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18716958 - 18716920
Alignment:
Q  119 ggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18716958 ggtgatttccaaaataatggaatcagtttagaaccaaaa 18716920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18737634 - 18737596
Alignment:
Q  119 ggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18737634 ggtgatttccaaaataatggaatcagtttagaaccaaaa 18737596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 171
Target Start/End: Original strand, 30019637 - 30019692
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  30019637 atgttggtgatttctaaaataatggaatcactttagaatc--aagttgtaactcttca 30019692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 476
Target Start/End: Original strand, 34602060 - 34602121
Alignment:
Q  415 aacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtga 476  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34602060 aacacaattctccctcattcttttactctaaatcatccatcaattttcttatgcatgagtga 34602121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Original strand, 14643582 - 14643628
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14643582 accaagagttgtaactattcatgggaatcattcatatacattggaac 14643628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Original strand, 30019692 - 30019738
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30019692 accaagagttgtaactcttcatgggaatctttcatatacattggaac 30019738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 286
Target Start/End: Original strand, 32429182 - 32429220
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32429182 gcaaaagggtgcttaatgaatcataacattgattcaagt 32429220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 479
Target Start/End: Original strand, 3409695 - 3409781
Alignment:
Q  398 aattttgttacattaacaacataat-tcttcatcattctattattctaaatcatccatc----aattctctaatgcatgagtgaatt 479  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  3409695 aattttgatactttaacaacataagatctccctcattctcttactctaaatcatccatatattaattctctaatgcatgagtgaatt 3409781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 9877340 - 9877743
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877340 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 9877439  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9877440 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgcttt 9877539  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9877540 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 9877639  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9877640 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 9877739  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  9877740 aata 9877743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 9872225 - 9872628
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872225 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 9872324  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9872325 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgcttt 9872424  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9872425 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 9872524  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9872525 tttgttacattaacaacataattcttcacaattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 9872624  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  9872625 aata 9872628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 39904248 - 39903845
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39904248 tgttggtgatttccaaaataattgaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 39904149  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39904148 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaatagtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgcttt 39904049  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39904048 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacattttggcattagttgaaaaaacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 39903949  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39903948 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 39903849  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  39903848 aata 39903845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 39909361 - 39908958
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39909361 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcgtgtaaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 39909262  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39909261 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgcttt 39909162  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39909161 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaaaaaacaaaaatcacacaactacacacaatttggacagaat 39909062  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39909061 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 39908962  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  39908961 aata 39908958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 248 - 504
Target Start/End: Original strand, 13556252 - 13556509
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13556252 gcaaaaaggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttg 13556351  T
Q  348 ggcattagttgaatataca-aaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaa 446  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13556352 ggcattagttggacatacagaaaaggacacaactacacacaatttggacagaagtttgttacattaacaacataattcttcatcattctcttattctaaa 13556451  T
Q  447 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13556452 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatatgtaaaata 13556509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 249 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 2023208 - 2022964
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  2023208 caaatgggtgtttaatgaatcataacattgattcaagtcaaag-ggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatatgg 2023110  T
Q  349 gcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaat 447  Q
    |||||||||| |           || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2023109 gcattagttgga-----------cacacaacaacacataattttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctcttattctaaat 2023021  T
Q  448 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2023020 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 2022964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 504
Target Start/End: Original strand, 35368851 - 35369095
Alignment:
Q  250 aaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttggg 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35368851 aaaaaggtgtttaatgaatcataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaaaagtcatataatgcactataaatgcttgacatttggg 35368950  T
Q  350 cattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatca 449  Q
    ||||| ||  | | |||| ||| | ||||| | | ||||        |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35368951 cattaatttgacacacaacaac-acacaacaaaa-acaa--------gaattttgttgcatcaaaaacataattcttcctcattctcttactctaaatca 35369040  T
Q  450 tccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35369041 tccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttgtaaccataaatctgtaaaata 35369095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 388 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 4555769 - 4555653
Alignment:
Q  388 atttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaac 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  4555769 atttggacacaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattactctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgaattattggtac 4555670  T
Q  488 cataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||    
T  4555669 cataaatctgtaaaata 4555653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 13556105 - 13556187
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13556105 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttaaaaccaagagttgtaactcttcatgggaatctttcatatacattggaac 13556187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 469
Target Start/End: Original strand, 43540857 - 43540928
Alignment:
Q  398 aattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgca 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43540857 aattttgttacattaacaacatagttctccatcattctcttactctaaatcatctatcaattctctaatgca 43540928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 410 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25184186 - 25184114
Alignment:
Q  410 ttaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgct 482  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25184186 ttaacaacatatttcttcaccattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgtattagtgaattgct 25184114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 24091794 - 24091869
Alignment:
Q  120 gtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattgga 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  24091794 gtgatttccaaaataatagaatcactttagaaccaagagttgtaactctttatgagaatctttcatatacattgga 24091869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 450 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 43378491 - 43378437
Alignment:
Q  450 tccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43378491 tccatcaattctttaatgcattagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 43378437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2024411 - 2024354
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta 208  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2024411 accaagagttgtaactcttcacgggaaccattcatatacattggaacattattattta 2024354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2024467 - 2024422
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2024467 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtt 2024422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Original strand, 43540564 - 43540620
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43540564 tgttggtgatttccaaaataattgaatcaatttagaaccaaaagttgtaactcttca 43540620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4555960 - 4555870
Alignment:
Q  153 caaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta-ttattaataatgaaccatgacattgattcaagta 242  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4555960 caaaagttatacctcttcacggaaatcattcatatacattgaaaaattattatttacttatagatagtgaaccataacattgattcaagta 4555870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4555831 - 4555772
Alignment:
Q  293 ggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcat 352  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4555831 ggtgttttctctcatgttaatagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcat 4555772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4556018 - 4555967
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataact 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4556018 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaattaaaagttgtaact 4555967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 172
Target Start/End: Original strand, 35368622 - 35368680
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcat 172  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  35368622 atgttggtaatttctaaaagaatggaatcactttagaatcaaaagttgtaacttttcat 35368680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43378543 - 43378485
Alignment:
Q  373 atacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatca 431  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43378543 atacaacaacacataatttggacacaatattgttacattatcaacataattctccatca 43378485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 354
Target Start/End: Original strand, 43540737 - 43540834
Alignment:
Q  255 ggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||   |||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||    
T  43540737 ggtgcttaatgaaccataacattgactcaagtcaaatgagtg--ttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatacttggcatctgggcatta 43540834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2023268 - 2023230
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2023268 gcaaaagggtgcttaatgaatcataacattgattcaagt 2023230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 10672739 - 10673142
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10672739 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 10672838  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10672839 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 10672938  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10672939 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 10673038  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10673039 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 10673138  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  10673139 aata 10673142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Original strand, 6852752 - 6853156
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6852752 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 6852851  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6852852 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttgatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 6852951  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6852952 tctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttggatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 6853051  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6853052 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcacgagtgaattgctggaaccataaatctgta 6853151  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  6853152 aaata 6853156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 8465154 - 8464750
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8465154 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 8465055  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||              ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8465054 aataatgaaccatgacattgactcaagtatatatggttataacctttggcaaaatggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagaggtgctt 8464955  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8464954 tctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 8464855  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464854 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 8464755  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  8464754 aaata 8464750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 6857856 - 6858259
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6857856 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 6857955  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6857956 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttgatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgattt 6858055  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6858056 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttggatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 6858155  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6858156 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 6858255  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  6858256 aata 6858259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 31081308 - 31081711
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31081308 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtgactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 31081407  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31081408 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 31081507  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31081508 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgcttgacatttgggcattagttgaacatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 31081607  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31081608 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatctgtaa 31081707  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  31081708 aata 31081711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 119 - 504
Target Start/End: Original strand, 10591100 - 10591499
Alignment:
Q  119 ggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattattaataa 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591100 ggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattattaataa 10591199  T
Q  219 tgaaccatgacattgattcaagtatatatgc--------------aaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctct 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591200 tgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggtaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctct 10591299  T
Q  305 catgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591300 catgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaattttg 10591399  T
Q  405 ttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10591400 ttacattaacaacataattcctcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 10591499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 4050211 - 4049807
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4050211 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 4050112  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4050111 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgtttt 4050012  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4050011 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagatacaaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 4049912  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4049911 ttttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 4049812  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  4049811 aaata 4049807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 5481289 - 5481692
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481289 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 5481388  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5481389 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaataggtgcttt 5481488  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5481489 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagataaaaaaaccacacaactacacacaacttggacagaat 5481588  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5481589 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 5481688  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  5481689 aata 5481692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 31076201 - 31076606
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt--at 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31076201 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtgactcttcatggaaaccattcatatacattggaacattattatttattgtat 31076300  T
Q  213 taataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgct 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076301 taataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgct 31076400  T
Q  299 ttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31076401 ttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgcttgacatttgggcattagttgaacatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacaga 31076500  T
Q  399 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31076501 attttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 31076600  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  31076601 aaaata 31076606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Original strand, 1302044 - 1302449
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1302044 atgttggtaatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatatattggaacattattatttattatt 1302143  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302144 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 1302243  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1302244 tctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaaccacacaactacacacaatttggacaaa 1302343  T
Q  399 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1302344 attttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 1302443  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  1302444 aaaata 1302449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 4055345 - 4054941
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055345 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 4055246  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055245 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 4055146  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4055145 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagatacaaaaaaccacacaactacacacaatttggatagaa 4055046  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4055045 ttttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctttaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 4054946  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  4054945 aaata 4054941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 8458715 - 8458311
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458715 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaactaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 8458616  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8458615 ataatgaaccataacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtggttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgtttt 8458516  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacattt-gggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8458515 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacattttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 8458416  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8458415 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 8458316  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  8458315 aaata 8458311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Original strand, 10584658 - 10585062
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10584658 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 10584757  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10584758 aataatgaaccatgacattgattcaaatatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgttt 10584857  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10584858 tctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 10584957  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10584958 ttttgttacattaacaacataattcctcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaatagctagaaccataaatctgta 10585057  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  10585058 aaata 10585062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 10677852 - 10678257
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10677852 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 10677951  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10677952 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaaaaggtgcttt 10678051  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtca--tataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacaga 398  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10678052 ctttcatgtgaagagtcacatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacaga 10678151  T
Q  399 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10678152 attttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 10678251  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  10678252 aaaata 10678257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Original strand, 33702399 - 33702804
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33702399 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacataggaacattattatttattatt 33702498  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33702499 aataatgaaccatgacattgattcaagtatataaggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 33702598  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33702599 tctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatagacaaaaaaccacacaactacacacaatttggacaga 33702698  T
Q  399 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33702699 attttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatatgt 33702798  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  33702799 aaaata 33702804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Original strand, 5457816 - 5458216
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5457816 atgttggtgatttccaaaataatggaat-----tagaatcaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 5457910  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5457911 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacccttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaataggtgctt 5458010  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacaga 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5458011 tctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagataaaaaaaaccacacaactacacacaacttggacaga 5458110  T
Q  399 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5458111 attttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt 5458210  T
Q  499 aaaata 504  Q
    ||||||    
T  5458211 aaaata 5458216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 295 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 33703509 - 33703299
Alignment:
Q  295 tgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttgg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33703509 tgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaaccacacaactacacacaatttgg 33703410  T
Q  394 acagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaa 493  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703409 acataattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaa 33703310  T
Q  494 tctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||    
T  33703309 tctgtaaaata 33703299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 248 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 49784742 - 49784494
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  49784742 gcaaatgggtgcttaatgaatcataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttg 49784643  T
Q  348 ggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaa 446  Q
    ||||||||||| |           |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| | ||||    
T  49784642 ggcattagttgga-----------catacaacaacacacaattttggacagaattttgttgcattaacaacataattccccctcattcttttactttaaa 49784554  T
Q  447 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49784553 tcatctatcaattctctaattcatgagtgaattgctggaaccataaatctggaaaatatt 49784494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49784950 - 49784815
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt-at 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49784950 atgttggtgatttccaaaataatagaatcactttaaaaccaaaagttgtaactcttcatggaaatcattcatatacattggaacattattatttattgat 49784851  T
Q  213 taataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 248  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49784850 agataatgaaccatgacattgattcaagtgtatatg 49784815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Original strand, 49513888 - 49513980
Alignment:
Q  22 gtgcatcctttatttgatagaggactacactcccaaaaatacatggtaagctgtgaaggcaaacatgattcactttcgtatgtcataagtcaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49513888 gtgcatcctttatttgatagaggattacactcccaaaaatacatggtaagctgtgaaggcaaacatgattcactttcgtatttcataagtcaa 49513980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20891550 - 20891424
Alignment:
Q  117 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta-ttattaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | ||  |    
T  20891550 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgagaatcattcatatacattgaaaaattattatttactgataga 20891451  T
Q  216 taatgaaccatgacattgattcaagta 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20891450 taatgaaccataacattgattcaagta 20891424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 506
Target Start/End: Original strand, 3187551 - 3187660
Alignment:
Q  397 gaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 496  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3187551 gaattttgtgacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatctatcaattctttaatgcatgagtgaattgctcgaaccataaatct 3187650  T
Q  497 gtaaaatatt 506  Q
    ||||||||||    
T  3187651 gtaaaatatt 3187660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 401 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 20891162 - 20891059
Alignment:
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20891162 tttgttacataaacaacataattctccctcattcgcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctataa 20891063  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  20891062 aata 20891059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 269580 - 269483
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  269580 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaatcaaaagttgtagctctttatggaaaccattcatatatattggaacattattatttattat 269483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 506
Target Start/End: Original strand, 18024246 - 18024354
Alignment:
Q  398 aattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  18024246 aattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgaatgaattgttagaacaataaatctg 18024345  T
Q  498 taaaatatt 506  Q
    |||||||||    
T  18024346 taaaatatt 18024354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29827659 - 29827551
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29827659 gcaaaatggtgcttaatgaatcataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctatcatgtgaa-agtcatataatgcattataaatgcttggcatttg 29827561  T
Q  348 ggcattagtt 357  Q
    ||||||||||    
T  29827560 ggcattagtt 29827551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 29827532 - 29827429
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  29827532 agaattttgttgcattaataacctaattctccctcattctcttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctg-----ataaatc 29827438  T
Q  496 tgtaaaata 504  Q
    |||||||||    
T  29827437 tgtaaaata 29827429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 18024167 - 18024228
Alignment:
Q  287 taaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18024167 taaagaggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttgacatttgg 18024228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 29827885 - 29827829
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29827885 tgttggtgatttccaaaagaatggaatcactttagaatcaaaagttgtaactcttca 29827829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Original strand, 18023914 - 18023965
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataact 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18023914 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttataaccaaaagttgtaact 18023965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 241
Target Start/End: Original strand, 3187244 - 3187373
Alignment:
Q  113 aatgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta-tta 211  Q
    |||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |    
T  3187244 aatgtttgtgatttttaaaacaattgaatcactttaaaatcaaaagttgtaattttttatgagaatcattcatatgcattggaacaatattatttactga 3187343  T
Q  212 ttaataatgaaccatgacattgattcaagt 241  Q
    |  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  3187344 tagataatgaactataacattgattcaagt 3187373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20891243 - 20891182
Alignment:
Q  288 aaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttggg 349  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  20891243 aaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttggcatttggg 20891182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 151
Target Start/End: Original strand, 18023324 - 18023358
Alignment:
Q  117 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18023324 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaa 18023358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 208
Target Start/End: Original strand, 18023982 - 18024028
Alignment:
Q  162 taactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta 208  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18023982 taactcttcataggaatcaatcatatacattggaacattattattta 18024028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 336
Target Start/End: Original strand, 18023560 - 18023607
Alignment:
Q  288 aaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatg 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18023560 aaagaggtgttttctctcatgtgaag-gtcatataatacattataaatg 18023607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20891392 - 20891354
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagt 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20891392 gcaaaagggtgcttaatgaaccatagcattgattcaagt 20891354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 28574700 - 28574297
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574700 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 28574601  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28574600 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgtttt 28574501  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28574500 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 28574401  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28574400 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 28574301  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  28574300 aata 28574297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 28598712 - 28598309
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598712 tgttggtgatttccaaaataatggaatcaatttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 28598613  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28598612 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgtttt 28598513  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28598512 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 28598413  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28598412 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 28598313  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  28598312 aata 28598309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 113 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 3468473 - 3468067
Alignment:
Q  113 aatgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468473 aatgttggtgatttccaaaataatggaatcattttagaatcaaaagttgtaattcttcataggaaccattcatatacattggaacattattatttattat 3468374  T
Q  213 taataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgct 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3468373 taataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagatgtgct 3468274  T
Q  299 ttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3468273 ttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagatacaaaaaaccacacaactacacacaatttggacag 3468174  T
Q  398 aattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3468173 aattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 3468074  T
Q  498 taaaata 504  Q
    |||||||    
T  3468073 taaaata 3468067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 249 - 504
Target Start/End: Original strand, 10186530 - 10186783
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10186530 caaaggggtgcttaatgaaccatagcattggttcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttgacatttgg 10186629  T
Q  349 gcattagtt-gaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaat 447  Q
    |||||| || ||| | | || ||| |||  || ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  10186630 gcattaatttgaacacagaagaacaata--acaacata-attttggacagaattttgttacattaacaacataattctccatcattctcttactctaaat 10186726  T
Q  448 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10186727 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 10186783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 366 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 3465611 - 3465473
Alignment:
Q  366 aaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaa 465  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465611 aaaaaccacacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaa 3465512  T
Q  466 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465511 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 3465473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 248 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 43358999 - 43358755
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  43358999 gcaaaggggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaatgagtgctttctctcatgtgaagagtcctataatgcactataaatgcttggcatttg 43358900  T
Q  348 ggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaat 447  Q
    ||||||||||| | | ||        |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  43358899 ggcattagttggacacac--------tacaac-acaca-attttggactgaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaat 43358810  T
Q  448 catccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaa 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43358809 tatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaa 43358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 249 - 504
Target Start/End: Original strand, 44523980 - 44524226
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcat--gtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacattt 346  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44523980 caaaggggtgcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttccctcatatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttgacattt 44524079  T
Q  347 gggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaa 446  Q
    |||||||| ||  |   ||||        |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  44524080 gggcattaatttga---acaa--------caacaacacacaatttgaacagaatattgttgcattaacaacataattctccatcattctcttactttaaa 44524168  T
Q  447 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44524169 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 44524226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 250 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19311067 - 19310826
Alignment:
Q  250 aaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttggg 349  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19311067 aaaagggtgcttaatgaactataacattgattcaagtcaaaggggtgctttctctcatgtgaagggtcatgtaatgcactataaatgtttgacatttggg 19310968  T
Q  350 cattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatca 449  Q
    ||||| ||  | | | ||  | ||||           | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| | |||||||    
T  19310967 cattaatttgacacaaaagcaacata-----------attttggacagagttttgttacattaacaatataattctccctcattctcttactataaatca 19310879  T
Q  450 tccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaa 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19310878 tccatcaattctctaatgcatgaatgaattgctggaaccataaatctgtaaaa 19310826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43359206 - 43359071
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttatt-at 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43359206 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaagagttgtaactcttcatgagaatcattcatatacattggaacattattatttattgat 43359107  T
Q  213 taataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 248  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43359106 tgataatgaaccatgatattgattcaagtgtatatg 43359071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 248 - 493
Target Start/End: Original strand, 21431629 - 21431865
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagagg-tgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacattt 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21431629 gcaaaagggtgcttaatgaaccataacattgatttaagtcaaagggggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttgacattt 21431728  T
Q  347 gggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaa 446  Q
    |||||||||||| | | | || ||| | | ||| | | ||||        |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  21431729 gggcattagttggacagagaacaac-agaaaacaaga-acaa--------gaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttaatctaaa 21431818  T
Q  447 tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaa 493  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21431819 tcatccatcaattctctaatgcatcagtgaattgatggaaccataaa 21431865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 386 - 504
Target Start/End: Original strand, 17414621 - 17414740
Alignment:
Q  386 caatttggaca-gaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctgg 484  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17414621 caatttggacatgaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctgg 17414720  T
Q  485 aaccataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  17414721 aaccataaatctggaaaata 17414740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 35626281 - 35626172
Alignment:
Q  395 cagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaat 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35626281 cagaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaaccataaat 35626182  T
Q  495 ctgtaaaata 504  Q
    || |||||||    
T  35626181 ctataaaata 35626172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16051588 - 16051335
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttat-tatt 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |  |  ||  ||     
T  16051588 tgttggtgatttctaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactctttatgggaatcattcatatacattataacatt-tggtaaatggata 16051490  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatat--------------gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
      |||||||||||  ||||||||||||| |||||              ||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  |||| ||    
T  16051489 cttaatgaaccatagcattgattcaagtgtatatgatcataacatttggcaaatgagtgcttaatgaaccatatcattgattcaagtcaaaagggtgttt 16051390  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16051389 tcactcatgtgaatggtcatataatgcactataaatgtttgacatttgggcatta 16051335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 396 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 1187935 - 1187826
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1187935 agaattttgttacattaacaacataaatctcc-tcattctcttactctaaatcatccatcaattctttaatgcatgagtgaattggtagaaccataaatc 1187837  T
Q  496 tgtaaaatatt 506  Q
    |||||||||||    
T  1187836 tgtaaaatatt 1187826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13654461 - 13654335
Alignment:
Q  381 acacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctatt--attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaa 477  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13654461 acacacaattttggatagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttgctctctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgaa 13654362  T
Q  478 ttgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13654361 ttgctgaaaccataaatctgtaaaata 13654335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 3701293 - 3701392
Alignment:
Q  143 actttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta-ataatgaaccatgacattgattcaagt 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3701293 actttagaaccaaaagttgtaactctttataggaaccattcatatacattagaacattattatttactaatagataatgaaccatagcattgattcaagt 3701392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16051267 - 16051206
Alignment:
Q  443 taaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16051267 taaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctgaaaccataaatctgtaaaata 16051206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13654565 - 13654478
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaat 335  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13654565 gcaaaagggtacttaatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaat 13654478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 171
Target Start/End: Original strand, 17414304 - 17414359
Alignment:
Q  116 gttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17414304 gttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaacttgtaactcttca 17414359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Original strand, 17414359 - 17414450
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta-ataatgaaccatgacattgattcaagt 241  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  17414359 accaaaagttgtaactcttcattagaatcattcatatacattagaacattattatttactaatagataatgaaccatagcattgattcaagt 17414450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13654730 - 13654676
Alignment:
Q  117 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13654730 ttggtaatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttca 13654676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Original strand, 35653036 - 35653090
Alignment:
Q  117 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35653036 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttggaaccaaaagttgtaactcttca 35653090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1188389 - 1188333
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1188389 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaaattgtaacttttca 1188333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1188067 - 1187961
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttg 347  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||  |||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||    
T  1188067 gcaaatgggtgtttaatgaaccataacattaattcaagtcaaaggggtgtttactctcatgtgtagagtcatataatccataataagtgcttgccatttg 1187968  T
Q  348 ggcatta 354  Q
    |||||||    
T  1187967 ggcatta 1187961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19311230 - 19311180
Alignment:
Q  121 tgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19311230 tgatttccaaaataatggaatcactttataaccaaaagttgtaactcttca 19311180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 29681632 - 29681588
Alignment:
Q  462 ctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29681632 ctaatgcattagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 29681588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 506
Target Start/End: Original strand, 48366213 - 48366257
Alignment:
Q  462 ctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 506  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48366213 ctaatgcattagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatatt 48366257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 247
Target Start/End: Original strand, 3696169 - 3696264
Alignment:
Q  153 caaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattattta-ttattaataatgaaccatgacattgattcaagtatatat 247  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  3696169 caaaagttgcaacttttcatgggaatcattcatatacattaaaacattattatttaccgataaataatgaaccataatattgattcaagtttatat 3696264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 350
Target Start/End: Original strand, 3701491 - 3701548
Alignment:
Q  293 ggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggc 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  3701491 ggtgttttctctcatgtgaagagtcacataatgcactataaatacttgacatttgggc 3701548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10186101 - 10186056
Alignment:
Q  126 tccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10186101 tccaaaataatggaatcactttagaatcaaaagttgtaactcttca 10186056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Original strand, 3696109 - 3696165
Alignment:
Q  113 aatgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactctt 169  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3696109 aatgttggtaatttctaaaataatggaatcactttggaatcaaaagttgtaactctt 3696165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 171
Target Start/End: Original strand, 10186307 - 10186359
Alignment:
Q  119 ggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  10186307 ggtgctttccaaaataatggaatcactttagactcaaaagttttaactcttca 10186359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1188221 - 1188178
Alignment:
Q  128 caaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1188221 caaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaacttttca 1188178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 352
Target Start/End: Original strand, 17414561 - 17414620
Alignment:
Q  293 ggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcat 352  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  17414561 ggtggtttctctcatgtgaatggtcatataatgcactataaatgcttggcatttgggcat 17414620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 354
Target Start/End: Original strand, 35653209 - 35653307
Alignment:
Q  256 gtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||| | |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||  || |||||||   |||||||||||||||||    
T  35653209 gtgcttaatgaaccatatcattgattcaattcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatatatagccttataaacacttgacatttgggcatta 35653307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35626591 - 35626556
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttaga 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35626591 tgttggtgatttctaaaataatggaatcactttaga 35626556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 286
Target Start/End: Original strand, 10186470 - 10186508
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagt 286  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10186470 gcaaaagggtgcttaatgaaccatagcattgattcaagt 10186508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19311180 - 19311134
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19311180 accaagagttgtaactcttcatgggaatctttcatatacattggaac 19311134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1188178 - 1188129
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacatt 200  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1188178 accaagagttgtaactattcatgggaatctttcatatacattggaacatt 1188129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 172
Target Start/End: Original strand, 21430777 - 21430833
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcat 172  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21430777 tgttggtgattttcaaaataatagaatcattttag-atcaaaagttgtaactcttcat 21430833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 17720327 - 17720730
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720327 tgttggtgatttccaaaataatagaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 17720426  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720427 ataatgaaccatgacattgattgaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 17720526  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17720527 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagatacaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaat 17720626  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720627 tttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 17720726  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  17720727 aata 17720730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 14917183 - 14917586
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917183 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 14917282  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  14917283 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaatagctgtttt 14917382  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14917383 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaagatacaaaaaccacacaactacacacaacttggacagaat 14917482  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14917483 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 14917582  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  14917583 aata 14917586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 45120790 - 45120386
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45120790 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaattaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattgaaacattattatttattatta 45120691  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45120690 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagaggtgcttt 45120591  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaa-ccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45120590 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttggatatacaaaaaaccacacaactacacacaatttggacagaa 45120491  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45120490 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctccaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 45120391  T
Q  500 aaata 504  Q
    |||||    
T  45120390 aaata 45120386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 114 - 504
Target Start/End: Original strand, 30283250 - 30283645
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30283250 atgttggtgatttccaaaataatggaatcattttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatgtacattggaacattattatttattatt 30283349  T
Q  214 aataatgaaccatgacattgattcaagtatatat--------------gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctt 299  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||| ||    
T  30283350 gatactgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataatctttggcaaaagggtgcttaatgaaccataatattgattcaagttaaaggggtgttt 30283449  T
Q  300 tctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaa 399  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||         ||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  30283450 tctttcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgtttggcatttgggcattagttg---------aaaacacacaactaaacacaatttggacagaa 30283540  T
Q  400 ttttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgta 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30283541 ttttgttacattaacaacataattctccatccttctcttactctaaatcatcaatcaattctctaatgcatgagtgaattgctagaaccataaatctgta 30283640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Original strand, 17720000 - 17720133
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720000 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttcatgggaactattcatatacattggaacattattatttattatta 17720099  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720100 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 17720133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39179002 - 39178869
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39179002 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaactaaaagttgtaactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 39178903  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39178902 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg 39178869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 258 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 42780419 - 42780184
Alignment:
Q  258 gcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagtt 357  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42780419 gcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgattgacagttgggcattagtt 42780320  T
Q  358 gaatatacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatca 456  Q
    | |           || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42780319 gga-----------cacacaacaacacacaattttggacagaattttgttacatta-ctacataattcttcaccattctcttactctaaatcatccatca 42780232  T
Q  457 attctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42780231 attctctaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatttgtaaaata 42780184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 716375 - 716267
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  716375 agaattttgcttctttaacaacataattctccttcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccctaaatc 716276  T
Q  496 tgtaaaata 504  Q
    |||||||||    
T  716275 tgtaaaata 716267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16284546 - 16284437
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaa-tcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaat 494  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16284546 agaattttgttgcattaacaatataattctccctcattctcttactctaaaatcattcatcaactctctaatgcatgagtgaattgctgaaaccataaat 16284447  T
Q  495 ctgtaaaata 504  Q
    | ||||||||    
T  16284446 cagtaaaata 16284437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 716484 - 716402
Alignment:
Q  274 cattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagt 356  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  716484 cattgattcaagtcaaagggatgttttctctcatatgaaaggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgggcattagt 716402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42780596 - 42780542
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactctt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42780596 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgttactctt 42780542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 357
Target Start/End: Original strand, 20892299 - 20892406
Alignment:
Q  249 caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgg 348  Q
    ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| | |||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  20892299 caaaaaggtgcttaatgaaccaaa-cattgattcaaatcaaatgagtgttttctctcgtgtgaagagtcatataatgcactataaatacttgacatttgg 20892397  T
Q  349 gcattagtt 357  Q
    |||||||||    
T  20892398 gcattagtt 20892406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Original strand, 20892154 - 20892203
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacatt 200  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20892154 accaagagttgtaactcttcatgagaaccattcatatacattggaacatt 20892203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 716716 - 716634
Alignment:
Q  114 atgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  716716 atgttgatgatttttaaaataatggaatcattttagatt-aaaagttgtaactctttatgtgaatctttcatatacattggaac 716634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42780540 - 42780494
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  42780540 accaaaagttgtaactcttcatgagaatctttcatatacattggaac 42780494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 160
Target Start/End: Original strand, 20892110 - 20892143
Alignment:
Q  127 ccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagtt 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20892110 ccaaaataatggaatcactttaaaaccaaaagtt 20892143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 115 - 504
Target Start/End: Original strand, 1820 - 2223
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaacattattatttattatta 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1820 tgttggtgattttcaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtatctcttcatgggaaccattcatatacattggaacattactatttattatta 1919  T
Q  215 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatg--------------caaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgcttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1920 ataatgaaccatgacattgattcaagtatatatggttataacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgtttt 2019  T
Q  301 ctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccatacaactacacacaatttggacagaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2020 ctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaacttggacagaat 2119  T
Q  401 tttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2120 tttattacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaa 2219  T
Q  501 aata 504  Q
    ||||    
T  2220 aata 2223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 396 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 173466 - 173358
Alignment:
Q  396 agaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 495  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  173466 agaattttgttacatcaacaacataattcttcctaattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgtataggtgaattgctggaaccataaatc 173367  T
Q  496 tgtaaaata 504  Q
    | |||||||    
T  173366 tctaaaata 173358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 173766 - 173710
Alignment:
Q  115 tgttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  173766 tgttggtgatttacaaaataattgaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttca 173710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 173587 - 173493
Alignment:
Q  260 ttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgtttgacatttgggcatta 354  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  173587 ttaatgaaccttagcattgattcaagtcaaatgggtgttttctatcatgtgaagggtcatataatgcgctataaatgtttgatatttgtgcatta 173493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 173710 - 173664
Alignment:
Q  151 accaaaagttataactcttcatgggaaccattcatatacattggaac 197  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  173710 accaagagttgtaactattcatgggaatcattcatatacattggaac 173664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 144222 - 144096
Alignment:
Q  381 acacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctatt--attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaa 477  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  144222 acacacaattttggatagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttgctctctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgaa 144123  T
Q  478 ttgctggaaccataaatctgtaaaata 504  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  144122 ttgctgaaaccataaatctgtaaaata 144096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 144326 - 144239
Alignment:
Q  248 gcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaat 335  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  144326 gcaaaagggtacttaatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaat 144239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 144491 - 144437
Alignment:
Q  117 ttggtgatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttataactcttca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144491 ttggtaatttccaaaataatggaatcactttagaaccaaaagttgtaactcttca 144437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University