View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20794_high_7 (Length: 433)

Name: NF20794_high_7
Description: NF20794
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20794_high_7
NF20794_high_7
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (9-419)||(5525620-5526030)
chr3 (65-419)||(5484632-5484986)
chr3 (156-419)||(5828047-5828310)
chr3 (123-419)||(5502897-5503193)
chr3 (151-419)||(5848776-5849045)
chr3 (148-419)||(5490109-5490380)
chr3 (146-419)||(20343550-20343823)
chr3 (125-419)||(5454907-5455203)
chr3 (146-419)||(5854077-5854350)
chr3 (192-387)||(5802411-5802606)
chr3 (123-419)||(5446346-5446641)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (123-419)||(25809171-25809466)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (261-419)||(34217146-34217304)
chr2 (261-419)||(34194272-34194430)
chr2 (266-335)||(34205805-34205874)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 419
Target Start/End: Original strand, 5525620 - 5526030
Alignment:
Q  9 gattattctcagaagttggcatttatgtgcttttgtgacggttatgttctctgtgaatgttttgtaatctattcctattaattaaactgttaaggtagca 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5525620 gattattttcagaagttggcatttatgtgtttttgtgatggttatgttctctgtgaatgttttgtaatctattcctattaattaaactgttaaggtagca 5525719  T
Q  109 gtgccagttctatcacacaaatgatgaaatatataaatgtgctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5525720 gtgccagttctatcacacaaatgatgaaatatataaatgtgctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctga 5525819  T
Q  209 agatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5525820 agatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctg 5525919  T
Q  309 acatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5525920 acatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgt 5526019  T
Q  409 ctggcaacttc 419  Q
    |||||||||||    
T  5526020 ctggcaacttc 5526030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 65 - 419
Target Start/End: Original strand, 5484632 - 5484986
Alignment:
Q  65 atgttttgtaatctattcctattaattaaactgttaaggtagcagtgccagttctatcacacaaatgatgaaatatataaat--gtgctatatatctaac 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  5484632 atgttttgtaatcttttcctattaattaaacagttaaggtatcagtaccag--ctatcacacaaatgatgaaataaataaatttgtgctatatatctgac 5484729  T
Q  163 tgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtc 262  Q
    |||| ||  |||||||||  | |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5484730 tgaagagataaaatatgtctttggaaatgaaaataccaagttctgaagatgccagccgtatgtaaatttcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtc 5484829  T
Q  263 cacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtctta 362  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5484830 cacaatgttgccaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgatatctaaatttgcatatgcagtgcaagaacagtttttcaaacacattgtctta 5484929  T
Q  363 cattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  5484930 cattccttaaggctcaagctcttgtcaaaccacgatgctgacgtatctggcaacttc 5484986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 156 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5828310 - 5828047
Alignment:
Q  156 atctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttc 255  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  | |||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5828310 atctaactgaagaggtaaaatatgtctttggaaatgaaaataccaagttcggaagatgcgagtcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttc 5828211  T
Q  256 tcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacat 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5828210 tcatgtccacaatattgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgatatcagaatttgcatatgcaatgcaagaacagtttttcaaacacat 5828111  T
Q  356 tgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5828110 tgtcttacattcctcaaggctcaagttcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 5828047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 123 - 419
Target Start/End: Original strand, 5502897 - 5503193
Alignment:
Q  123 acacaaatgatgaaatatataaatgtgctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgta 222  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |    ||||||||||||||| |  ||||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  5502897 acacaaatggtgaaatatgtaaatttatgctatatctaactgaaaggacaaaatatgtaatagcaaatgaaaataccaagctctgaagatgccagccgta 5502996  T
Q  223 tgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgc 322  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5502997 tgtaaatgtcttgtccttggtctggatgttttctcatgtcgacaatgttgtcaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgatatctgaatttgc 5503096  T
Q  323 atatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5503097 atatgcagtgcaagaacagtttttcaaacacattgtcttacattcctcaaggctcaagctcctgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 5503193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 151 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5849045 - 5848776
Alignment:
Q  151 tatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgatagga-agttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggat 249  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||| |   |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5849045 tatatatctcactgacaaggcaaaagatgtaataggatacaaaaaataccgagttctgaagatgcgagtcgtatgtaaatgtcttgtcctatgtcaggat 5848946  T
Q  250 gttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaa 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5848945 gttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgatatctaaatttgcatatgcagtgcaagtacagtttttcaa 5848846  T
Q  350 acacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5848845 gcacagtgtcttacattcctcaaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 5848776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 148 - 419
Target Start/End: Original strand, 5490109 - 5490380
Alignment:
Q  148 tgctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcagg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||  |    
T  5490109 tgctatatatctaactgaaaagacaaaatatgtaataagaaatgaaaataccaagttctgaagatgccatccgtatgtaaatgtcttgtccttggtcttg 5490208  T
Q  248 atgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5490209 atgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtatgcagccactcccaccatctttgatatctgaatttgcatatgcagtgcaagtacagtttttc 5490308  T
Q  348 aaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  | |||| ||| || ||||||||||||    
T  5490309 aaacacattgtcttacattcctcaaggctcaagctcttgttataatacgatgatgatgtatctggcaacttc 5490380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 419
Target Start/End: Original strand, 20343550 - 20343823
Alignment:
Q  146 tgtgctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtca 245  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||  |||     
T  20343550 tgtgcaatatatctaactggaaaggaaaaagatgtaataggaaatgaaaataccaagttctgaagatgctagccgtatataaatgtcttgtccttggtct 20343649  T
Q  246 ggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttt 345  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20343650 cgatgttttctcatgtccaaaatattgtcaaaccaaagtaagcaaccactcccaccatctctgatatctaaatttgcatatgcagtgcaattacaatttt 20343749  T
Q  346 tcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  20343750 tcaaacacgtcgtcttacattcctgaaggctcaagctcttgtcataccatgatgccgacgtgtctggcaacttc 20343823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 125 - 419
Target Start/End: Original strand, 5454907 - 5455203
Alignment:
Q  125 acaaatgatgaaatatataaatgt--gctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgta 222  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5454907 acaaatggtgaaatatataagtttatgctatatatctaactgaaaagacaaaatatgtaataagaaaagaaaataccaagttctgaagatgccatccgta 5455006  T
Q  223 tgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgc 322  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||    
T  5455007 tgtaaatgtcttgtccttggtcttgatgttttctcatgtccacaatgttgtgaaaccaaagtatgcagccactcccatcatctctgatatctaaagttgc 5455106  T
Q  323 atatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  5455107 atatgcattgcaagtacagtttttcaaacacattgtcttacattcctcaaggcttaaggttttgtcaaaccacgatgctgacgtatctggcaacttc 5455203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5854350 - 5854077
Alignment:
Q  146 tgtgctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtca 245  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||     
T  5854350 tgtgctatatatcagactgaaaaggcaaaagatgtaataggaaatgtaaataccaagttctgaagatgccagccgtatgaaaatgtcttgtccttggtct 5854251  T
Q  246 ggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttt 345  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5854250 ggatgttttctcatatcaacaatgttgtcaaaccaaagtaagcagccacttccaacatatctgatatctaaatttgcatatgcagtgcaagaacagtttt 5854151  T
Q  346 tcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  5854150 tcaaacacactgtcatacattcctcaaggctcaagctcttgtcaaaccacgatgctgacgtgtctggtaacttc 5854077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5802606 - 5802411
Alignment:
Q  192 aaaataccaagttctgaagatgccaatcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5802606 aaaataccaagttctgaagatgcgagtcgtatgtaaatgtcttgtcctacgtctggatgttttctcatgtccataatattgttaaaccaaagtaagcagc 5802507  T
Q  292 cactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgt 387  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5802506 cactaccaccatccctgatatctgaatttgcatatgcggtgcaagaacagtttttcaaacacattgtcttacattcttcaaggctaaagctcttgt 5802411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 419
Target Start/End: Original strand, 5446346 - 5446641
Alignment:
Q  123 acacaaatgatgaaatatataaatgt--gctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcg 220  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5446346 acacaaatggtgaaatatgtaaatttatgctatatatctaactgaaaggacaaaatatgtaataacaaatgaaaataccaagttctgaagatgccagccg 5446445  T
Q  221 tatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaattt 320  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |||| || ||    
T  5446446 tatgtaaatgtcttgtccttggtcttgatgtattctcatgtcaacaatgtcgtcaaaccagagtaagcagccact---accatatctgatatctaaagtt 5446542  T
Q  321 gcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||| || ||||| ||||||    
T  5446543 gcatatgcagaacaagaacagtttttcaaacacattgtcttacattcctcaaggctcaagatcttgttataccatgatgatgatgtatctggtaacttc 5446641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25809466 - 25809171
Alignment:
Q  123 acacaaatgatgaaatatataaatgt--gctatatatctaactgaaaaggaaaaatatgtgataggaagttaaaataccaagttctgaagatgccaatcg 220  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25809466 acacaaatggtgaaatatgtaaatttatgctatatatctaactgaaaggacaaaatatgtaataacaaatgaaaataccaagttctgaagatgccagccg 25809367  T
Q  221 tatgtaaatgtcttgtcctacgtcaggatgttttctcatgtccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaattt 320  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |||| || ||    
T  25809366 tatgtaaatgtcttgtccttggtcttgatgtattctcatgtcaacaatgtcgtcaaaccagagtaagcagccact---accatatctgatatctaaagtt 25809270  T
Q  321 gcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtcttacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||| || ||||| ||||||    
T  25809269 gcatatgcagaacaagaacagtttttcaaacacattgtcttacattcctcaaggctcaagatcttgttataccatgatgatgatgtatctggtaacttc 25809171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34217304 - 34217146
Alignment:
Q  261 tccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtct 360  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| | | ||| | |  ||    
T  34217304 tccaaaatgttattaaaccaaagcaagcagccacttccaccatctctgacatctaaatttgcatatgctgtacaagaacagtttctgatacagaatcgct 34217205  T
Q  361 tacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
     |||||| |||||| ||| |||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34217204 cacattcttcgaggttcatgctcttattaaaccaagattttgatgtgtctggcaacttc 34217146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 419
Target Start/End: Original strand, 34194272 - 34194430
Alignment:
Q  261 tccacaatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaagaacaatttttcaaacacattgtct 360  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| | | ||| | |  ||    
T  34194272 tccaaaatgttattaaaccaaagcaagcagccacttccaccatctctgacatctaaatttgcatatgctgtacaagaacagtttctgatacagaatcgct 34194371  T
Q  361 tacattcctcgaggctcaagctcttgtcataccaagatgttgacgtgtctggcaacttc 419  Q
     |||||| |||||| ||| |||||| | | |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  34194372 cacattcttcgaggttcatgctcttattaaaccaagattttgatgtatctggcaacttc 34194430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34205874 - 34205805
Alignment:
Q  266 aatgttgttaaaccaaagtaagcagccactcccaccatctctgacatctgaatttgcatatgcagtgcaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  34205874 aatgttattaaaccaaagtatgcaaccacttccaccatctctgacatctaaacttgcatatgctgtgcaa 34205805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University