View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20808_low_7 (Length: 546)

Name: NF20808_low_7
Description: NF20808
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20808_low_7
NF20808_low_7
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (114-403)||(14925377-14925666)
chr6 (114-403)||(18057438-18057727)
chr6 (114-403)||(17443181-17443465)
chr6 (114-402)||(3932729-3933018)
chr6 (116-403)||(17867755-17868043)
chr6 (116-403)||(17877538-17877826)
chr6 (115-403)||(24203282-24203570)
chr6 (114-399)||(2614814-2615100)
chr6 (145-403)||(11613712-11613971)
chr6 (118-400)||(10959923-10960205)
chr6 (114-403)||(32409773-32410063)
chr6 (118-402)||(166845-167130)
chr6 (114-402)||(3259596-3259890)
chr6 (114-404)||(11212175-11212466)
chr6 (118-403)||(10485081-10485365)
chr6 (114-400)||(10324035-10324322)
chr6 (114-403)||(15276858-15277148)
chr6 (118-403)||(34176752-34177038)
chr6 (126-371)||(24242594-24242840)
chr6 (171-403)||(11382040-11382270)
chr6 (114-357)||(32132347-32132591)
chr6 (160-400)||(11279093-11279333)
chr6 (114-403)||(15277201-15277491)
chr6 (118-403)||(31870018-31870306)
chr6 (120-402)||(9902580-9902863)
chr6 (118-403)||(11675295-11675581)
chr6 (175-400)||(3379690-3379915)
chr6 (114-403)||(32859970-32860259)
chr6 (118-403)||(18597079-18597364)
chr6 (118-400)||(23636146-23636428)
chr6 (114-403)||(29054277-29054564)
chr6 (114-403)||(8177803-8178093)
chr6 (160-403)||(3290637-3290867)
chr6 (118-403)||(14807939-14808206)
chr6 (199-357)||(4494081-4494240)
chr6 (125-388)||(34683929-34684185)
chr6 (145-402)||(7396048-7396302)
chr6 (333-403)||(14925138-14925208)
chr6 (211-398)||(9613990-9614177)
chr6 (114-217)||(29814783-29814887)
chr6 (333-401)||(33041404-33041472)
chr6 (221-395)||(9200316-9200491)
chr6 (114-217)||(28502377-28502482)
chr6 (150-365)||(27824612-27824824)
chr6 (333-399)||(13415862-13415928)
chr6 (205-254)||(27756315-27756364)
chr6 (115-178)||(4494244-4494308)
chr6 (125-232)||(32614030-32614137)
chr6 (160-278)||(29424613-29424731)
chr6 (160-237)||(16542362-16542439)
chr6 (114-158)||(32805396-32805440)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (114-403)||(9807078-9807366)
chr4 (140-402)||(32181211-32181473)
chr4 (114-403)||(24002259-24002550)
chr4 (114-403)||(23521801-23522091)
chr4 (114-403)||(20802406-20802696)
chr4 (118-403)||(33552717-33553003)
chr4 (114-403)||(56154542-56154832)
chr4 (114-403)||(29785411-29785702)
chr4 (120-403)||(44324217-44324500)
chr4 (118-403)||(50178367-50178653)
chr4 (121-404)||(29592824-29593107)
chr4 (114-402)||(49151976-49152264)
chr4 (130-400)||(2725011-2725281)
chr4 (114-400)||(33176910-33177197)
chr4 (130-403)||(38486132-38486406)
chr4 (118-403)||(3649562-3649847)
chr4 (140-403)||(50727788-50728052)
chr4 (140-403)||(50735802-50736066)
chr4 (114-403)||(20517896-20518187)
chr4 (114-403)||(12600807-12601097)
chr4 (126-403)||(55065208-55065485)
chr4 (118-403)||(52949647-52949931)
chr4 (114-403)||(6776499-6776789)
chr4 (114-403)||(21579947-21580236)
chr4 (114-403)||(52319247-52319539)
chr4 (140-403)||(46680385-46680649)
chr4 (118-403)||(1231236-1231522)
chr4 (118-403)||(44649039-44649322)
chr4 (114-402)||(55593806-55594096)
chr4 (127-403)||(11055977-11056253)
chr4 (145-403)||(36885883-36886143)
chr4 (115-402)||(54542912-54543198)
chr4 (172-403)||(38812500-38812731)
chr4 (151-402)||(41711806-41712057)
chr4 (126-398)||(24210251-24210525)
chr4 (114-402)||(9512216-9512505)
chr4 (120-403)||(36497144-36497428)
chr4 (118-381)||(47642388-47642651)
chr4 (114-386)||(37865674-37865947)
chr4 (119-403)||(2786891-2787175)
chr4 (123-403)||(50186459-50186739)
chr4 (118-403)||(29616095-29616377)
chr4 (118-379)||(21202665-21202926)
chr4 (126-403)||(36743564-36743841)
chr4 (118-403)||(47361288-47361570)
chr4 (126-399)||(20694304-20694578)
chr4 (114-298)||(43641020-43641205)
chr4 (118-403)||(50729417-50729686)
chr4 (133-403)||(4325731-4326002)
chr4 (118-403)||(26083264-26083548)
chr4 (118-404)||(53200517-53200804)
chr4 (127-399)||(39078596-39078868)
chr4 (120-403)||(7554832-7555115)
chr4 (118-403)||(16320447-16320729)
chr4 (160-403)||(42869941-42870182)
chr4 (126-355)||(34929848-34930078)
chr4 (118-349)||(37695470-37695701)
chr4 (211-403)||(2629826-2630018)
chr4 (118-403)||(22318259-22318544)
chr4 (182-403)||(28115243-28115462)
chr4 (131-292)||(37931859-37932020)
chr4 (245-403)||(6973788-6973946)
chr4 (271-402)||(14296646-14296777)
chr4 (271-402)||(14314894-14315025)
chr4 (116-249)||(14296520-14296654)
chr4 (116-249)||(14314768-14314902)
chr4 (126-399)||(30942722-30942995)
chr4 (120-297)||(23327844-23328024)
chr4 (240-403)||(42772836-42772999)
chr4 (225-403)||(25978487-25978664)
chr4 (118-316)||(7001780-7001976)
chr4 (114-289)||(13110250-13110425)
chr4 (272-403)||(56487162-56487288)
chr4 (311-404)||(23328015-23328108)
chr4 (210-398)||(9947947-9948135)
chr4 (125-301)||(43739394-43739570)
chr4 (210-399)||(3579142-3579332)
chr4 (286-404)||(44640417-44640534)
chr4 (123-399)||(44355734-44356010)
chr4 (160-252)||(42772726-42772818)
chr4 (333-399)||(13110447-13110513)
chr4 (137-403)||(20644116-20644382)
chr4 (160-249)||(56487281-56487370)
chr4 (311-398)||(43739557-43739644)
chr4 (118-195)||(53343560-53343638)
chr4 (347-399)||(2114191-2114243)
chr4 (211-277)||(38520518-38520584)
chr4 (140-264)||(45577706-45577828)
chr4 (131-254)||(7381219-7381339)
chr4 (126-248)||(985217-985338)
chr4 (184-254)||(40792409-40792479)
chr4 (149-289)||(52755477-52755617)
chr4 (120-178)||(52673756-52673814)
[»] chr1 (79 HSPs)
chr1 (114-403)||(844681-844971)
chr1 (114-403)||(42510452-42510742)
chr1 (114-403)||(39281822-39282111)
chr1 (116-404)||(6711002-6711291)
chr1 (114-399)||(16476116-16476401)
chr1 (114-403)||(35387268-35387558)
chr1 (118-403)||(31004064-31004349)
chr1 (118-403)||(26118172-26118458)
chr1 (114-403)||(45490832-45491122)
chr1 (114-402)||(16386781-16387069)
chr1 (114-409)||(1351386-1351681)
chr1 (114-404)||(16451054-16451345)
chr1 (118-403)||(30105636-30105923)
chr1 (114-399)||(41972839-41973124)
chr1 (114-403)||(51264422-51264712)
chr1 (114-402)||(28340262-28340550)
chr1 (118-403)||(42512727-42513012)
chr1 (114-403)||(24339595-24339884)
chr1 (114-399)||(32270285-32270566)
chr1 (118-403)||(50304583-50304868)
chr1 (118-403)||(6029253-6029543)
chr1 (141-398)||(16437317-16437574)
chr1 (114-373)||(12890165-12890425)
chr1 (160-403)||(32289301-32289544)
chr1 (114-402)||(7183845-7184134)
chr1 (120-403)||(11772589-11772872)
chr1 (114-403)||(50540271-50540561)
chr1 (114-403)||(17887874-17888165)
chr1 (120-403)||(45658755-45659038)
chr1 (118-403)||(15539847-15540132)
chr1 (114-403)||(17327606-17327896)
chr1 (118-405)||(41967803-41968092)
chr1 (114-403)||(26764752-26765036)
chr1 (125-403)||(1601111-1601387)
chr1 (114-399)||(46154827-46155120)
chr1 (114-403)||(44737999-44738288)
chr1 (118-383)||(38086973-38087238)
chr1 (125-409)||(13994022-13994310)
chr1 (127-408)||(5109671-5109950)
chr1 (119-403)||(10384300-10384579)
chr1 (114-403)||(51703120-51703409)
chr1 (125-399)||(6143947-6144221)
chr1 (150-385)||(16704689-16704925)
chr1 (165-403)||(49303311-49303548)
chr1 (126-299)||(25539795-25539968)
chr1 (160-355)||(42705242-42705438)
chr1 (115-341)||(20494927-20495137)
chr1 (118-281)||(38663064-38663227)
chr1 (131-355)||(25343213-25343438)
chr1 (160-399)||(3414814-3415054)
chr1 (205-404)||(7837152-7837352)
chr1 (155-349)||(50382411-50382608)
chr1 (272-403)||(8838983-8839114)
chr1 (309-402)||(38663230-38663323)
chr1 (309-403)||(21071737-21071831)
chr1 (210-403)||(26733579-26733772)
chr1 (114-302)||(570314-570504)
chr1 (118-269)||(34663858-34664010)
chr1 (242-404)||(7837430-7837593)
chr1 (114-368)||(504383-504637)
chr1 (326-403)||(40811328-40811405)
chr1 (210-399)||(47242477-47242665)
chr1 (211-391)||(6771393-6771573)
chr1 (205-404)||(39792826-39793024)
chr1 (180-254)||(16643288-16643360)
chr1 (349-403)||(25539981-25540035)
chr1 (354-403)||(16643189-16643238)
chr1 (219-399)||(17291612-17291791)
chr1 (245-293)||(23799604-23799652)
chr1 (187-254)||(46447665-46447732)
chr1 (123-189)||(21071661-21071727)
chr1 (118-230)||(8838870-8838987)
chr1 (327-399)||(23799531-23799603)
chr1 (131-235)||(52030330-52030434)
chr1 (324-399)||(31574492-31574566)
chr1 (183-254)||(46815835-46815906)
chr1 (160-254)||(32467927-32468021)
chr1 (370-403)||(20494876-20494909)
chr1 (170-230)||(15324141-15324201)
[»] chr2 (70 HSPs)
chr2 (114-403)||(34338728-34339018)
chr2 (114-403)||(9732812-9733102)
chr2 (114-398)||(35114703-35114988)
chr2 (114-403)||(2644969-2645258)
chr2 (160-403)||(7761455-7761698)
chr2 (114-403)||(17540632-17540923)
chr2 (114-404)||(32497833-32498124)
chr2 (114-403)||(18685754-18686044)
chr2 (114-403)||(30326214-30326503)
chr2 (114-399)||(33366528-33366814)
chr2 (128-402)||(44284561-44284836)
chr2 (114-403)||(37308574-37308864)
chr2 (114-402)||(7258814-7259104)
chr2 (118-403)||(33889165-33889451)
chr2 (118-403)||(6896091-6896376)
chr2 (114-400)||(5278720-5279006)
chr2 (114-402)||(19513571-19513861)
chr2 (114-403)||(40692223-40692505)
chr2 (114-380)||(16104192-16104459)
chr2 (118-403)||(32766386-32766672)
chr2 (114-385)||(42706276-42706549)
chr2 (142-399)||(10399756-10400013)
chr2 (118-403)||(28824439-28824724)
chr2 (140-403)||(30798371-30798635)
chr2 (118-402)||(3913343-3913627)
chr2 (114-399)||(39461232-39461518)
chr2 (114-403)||(40832351-40832642)
chr2 (114-403)||(2085990-2086270)
chr2 (118-403)||(13829361-13829634)
chr2 (114-399)||(42365495-42365781)
chr2 (125-399)||(16177769-16178041)
chr2 (114-403)||(38992953-38993239)
chr2 (116-387)||(4641436-4641706)
chr2 (118-399)||(11114795-11115074)
chr2 (118-402)||(30712780-30713067)
chr2 (165-357)||(12672402-12672594)
chr2 (118-402)||(27462685-27462967)
chr2 (114-292)||(37003861-37004041)
chr2 (153-297)||(9717182-9717326)
chr2 (118-301)||(26418845-26419029)
chr2 (166-399)||(38623190-38623419)
chr2 (118-401)||(12939202-12939469)
chr2 (213-388)||(26981606-26981781)
chr2 (118-304)||(1247078-1247256)
chr2 (206-403)||(41365992-41366189)
chr2 (156-348)||(8112259-8112453)
chr2 (311-403)||(9717317-9717409)
chr2 (309-403)||(37863248-37863342)
chr2 (318-403)||(37003773-37003858)
chr2 (114-398)||(41934500-41934785)
chr2 (276-398)||(18793180-18793300)
chr2 (140-283)||(45463112-45463254)
chr2 (126-282)||(20907520-20907675)
chr2 (116-238)||(18793308-18793431)
chr2 (138-225)||(37088216-37088303)
chr2 (299-399)||(83374-83474)
chr2 (120-197)||(26981777-26981856)
chr2 (217-392)||(15303133-15303308)
chr2 (166-315)||(130265-130418)
chr2 (219-399)||(18278926-18279104)
chr2 (150-302)||(35472983-35473135)
chr2 (214-349)||(26796247-26796382)
chr2 (138-279)||(13249406-13249547)
chr2 (366-404)||(1247256-1247294)
chr2 (284-350)||(6453249-6453315)
chr2 (333-399)||(31193954-31194020)
chr2 (333-399)||(31212587-31212653)
chr2 (310-403)||(45463004-45463098)
chr2 (246-395)||(40876514-40876663)
chr2 (327-399)||(16061980-16062052)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (114-403)||(26994108-26994398)
chr7 (114-403)||(47953112-47953402)
chr7 (114-399)||(36769456-36769742)
chr7 (114-403)||(10932440-10932730)
chr7 (114-407)||(3922582-3922876)
chr7 (114-403)||(43158569-43158859)
chr7 (114-402)||(11321769-11322058)
chr7 (114-400)||(41211086-41211374)
chr7 (114-403)||(26371692-26371982)
chr7 (118-403)||(40753081-40753367)
chr7 (114-402)||(21784793-21785082)
chr7 (116-399)||(18386449-18386732)
chr7 (114-403)||(46633619-46633904)
chr7 (118-400)||(43368128-43368410)
chr7 (114-397)||(18470606-18470888)
chr7 (140-402)||(44748643-44748906)
chr7 (114-399)||(32873659-32873942)
chr7 (120-400)||(43213811-43214091)
chr7 (119-403)||(48894645-48894929)
chr7 (126-403)||(29661257-29661534)
chr7 (116-403)||(1870058-1870347)
chr7 (118-403)||(9913452-9913736)
chr7 (118-403)||(9927140-9927424)
chr7 (160-403)||(47316581-47316824)
chr7 (114-403)||(30849129-30849419)
chr7 (128-403)||(11250558-11250829)
chr7 (114-403)||(43189125-43189416)
chr7 (114-403)||(1363560-1363848)
chr7 (116-403)||(11822156-11822435)
chr7 (155-403)||(38301307-38301555)
chr7 (118-402)||(329397-329687)
chr7 (118-403)||(34295294-34295572)
chr7 (149-403)||(17237034-17237288)
chr7 (114-403)||(22723915-22724204)
chr7 (120-399)||(37966903-37967182)
chr7 (120-403)||(48445450-48445733)
chr7 (120-402)||(20127214-20127500)
chr7 (114-398)||(3891930-3892199)
chr7 (120-403)||(46448527-46448810)
chr7 (114-358)||(23349219-23349463)
chr7 (227-403)||(16963174-16963350)
chr7 (114-355)||(30598939-30599181)
chr7 (114-405)||(22724412-22724703)
chr7 (115-403)||(26910294-26910578)
chr7 (120-290)||(26652795-26652965)
chr7 (114-254)||(47947682-47947823)
chr7 (210-403)||(34519527-34519720)
chr7 (118-347)||(21133297-21133528)
chr7 (131-290)||(34117392-34117551)
chr7 (114-297)||(41665564-41665747)
chr7 (114-302)||(46408818-46408999)
chr7 (126-410)||(15035127-15035413)
chr7 (125-302)||(22631671-22631849)
chr7 (136-232)||(16963051-16963149)
chr7 (286-403)||(26700572-26700689)
chr7 (160-280)||(46627139-46627259)
chr7 (127-293)||(48699334-48699500)
chr7 (114-189)||(12982225-12982301)
chr7 (125-345)||(29372720-29372940)
chr7 (120-368)||(2048881-2049128)
chr7 (311-399)||(41665485-41665573)
chr7 (119-363)||(29455772-29456013)
chr7 (286-350)||(3359773-3359837)
chr7 (339-401)||(29773522-29773584)
chr7 (114-236)||(30259957-30260079)
chr7 (167-252)||(29992729-29992813)
chr7 (205-298)||(42332073-42332166)
chr7 (118-178)||(14608500-14608560)
chr7 (125-197)||(16028013-16028084)
chr7 (166-254)||(21408332-21408420)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (114-403)||(12349047-12349337)
chr3 (114-403)||(2134989-2135279)
chr3 (114-403)||(28675709-28675999)
chr3 (114-403)||(51259656-51259946)
chr3 (115-403)||(44116859-44117148)
chr3 (114-399)||(1344587-1344873)
chr3 (118-403)||(31882898-31883183)
chr3 (114-405)||(29584794-29585086)
chr3 (120-403)||(51925084-51925367)
chr3 (114-403)||(40094422-40094712)
chr3 (118-383)||(20609544-20609810)
chr3 (114-403)||(21221237-21221526)
chr3 (126-403)||(42636279-42636557)
chr3 (118-394)||(34026590-34026867)
chr3 (114-403)||(47958308-47958598)
chr3 (118-403)||(33364654-33364939)
chr3 (118-403)||(50386332-50386617)
chr3 (114-403)||(3864553-3864840)
chr3 (114-404)||(24571200-24571491)
chr3 (160-403)||(20255011-20255253)
chr3 (114-388)||(25860312-25860587)
chr3 (125-402)||(3964219-3964496)
chr3 (114-403)||(25927203-25927493)
chr3 (114-398)||(54622678-54622958)
chr3 (145-399)||(21373882-21374135)
chr3 (120-403)||(53557671-53557955)
chr3 (114-403)||(4851339-4851622)
chr3 (114-402)||(39052715-39053005)
chr3 (134-403)||(38213293-38213563)
chr3 (120-403)||(29645991-29646275)
chr3 (165-403)||(49748787-49749025)
chr3 (130-403)||(3867525-3867798)
chr3 (117-403)||(5442213-5442488)
chr3 (114-348)||(26282315-26282553)
chr3 (199-402)||(19906767-19906970)
chr3 (145-403)||(45690782-45691034)
chr3 (114-403)||(22484619-22484908)
chr3 (160-403)||(51296547-51296788)
chr3 (114-403)||(50678716-50679007)
chr3 (118-403)||(3695183-3695449)
chr3 (199-410)||(24721490-24721701)
chr3 (118-400)||(10747141-10747406)
chr3 (257-403)||(41682929-41683075)
chr3 (140-403)||(6179378-6179635)
chr3 (196-388)||(52300439-52300633)
chr3 (114-254)||(53046671-53046807)
chr3 (140-254)||(41694926-41695040)
chr3 (143-405)||(44267691-44267947)
chr3 (309-403)||(43175590-43175684)
chr3 (150-298)||(25954407-25954554)
chr3 (205-344)||(34351303-34351442)
chr3 (205-344)||(39215404-39215543)
chr3 (150-396)||(44000217-44000462)
chr3 (282-345)||(53046605-53046668)
chr3 (166-249)||(32621841-32621924)
chr3 (114-210)||(43175488-43175585)
chr3 (150-233)||(25395570-25395653)
chr3 (217-399)||(26847349-26847532)
chr3 (200-280)||(8067056-8067136)
chr3 (184-403)||(8253664-8253882)
chr3 (282-325)||(53046517-53046560)
chr3 (190-364)||(32768588-32768764)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (114-403)||(45113974-45114263)
chr8 (114-402)||(8672953-8673242)
chr8 (118-403)||(4052404-4052688)
chr8 (114-403)||(41709695-41709985)
chr8 (114-403)||(34063046-34063336)
chr8 (118-403)||(37664179-37664466)
chr8 (118-403)||(30542919-30543205)
chr8 (114-403)||(32019898-32020188)
chr8 (114-403)||(45446373-45446663)
chr8 (114-403)||(29672219-29672510)
chr8 (114-403)||(5968761-5969051)
chr8 (114-403)||(27103877-27104167)
chr8 (114-403)||(34101426-34101716)
chr8 (118-403)||(7591344-7591629)
chr8 (120-403)||(37618289-37618572)
chr8 (114-403)||(31513480-31513770)
chr8 (114-403)||(6386494-6386784)
chr8 (118-404)||(10466987-10467273)
chr8 (120-405)||(29610950-29611235)
chr8 (118-403)||(30501068-30501353)
chr8 (120-399)||(40388965-40389244)
chr8 (114-403)||(3251553-3251843)
chr8 (118-403)||(41548541-41548826)
chr8 (140-403)||(39642828-39643091)
chr8 (118-400)||(15001389-15001671)
chr8 (118-400)||(22999180-22999463)
chr8 (114-403)||(7394711-7395001)
chr8 (118-401)||(14004943-14005227)
chr8 (114-403)||(25478166-25478451)
chr8 (114-357)||(29563169-29563413)
chr8 (114-402)||(31731982-31732257)
chr8 (116-401)||(13406834-13407120)
chr8 (114-399)||(12753226-12753512)
chr8 (125-403)||(35225592-35225870)
chr8 (114-297)||(32303588-32303772)
chr8 (125-403)||(17805619-17805899)
chr8 (118-403)||(37474642-37474908)
chr8 (114-403)||(16485706-16485995)
chr8 (2-118)||(38104577-38104693)
chr8 (404-527)||(38104693-38104816)
chr8 (205-403)||(37861869-37862066)
chr8 (118-399)||(10656587-10656868)
chr8 (125-399)||(17520531-17520798)
chr8 (187-403)||(21272676-21272875)
chr8 (114-282)||(27109559-27109729)
chr8 (166-387)||(16595063-16595283)
chr8 (120-402)||(6460188-6460465)
chr8 (311-403)||(32303505-32303597)
chr8 (333-403)||(38047484-38047554)
chr8 (150-399)||(10932691-10932940)
chr8 (153-347)||(10320232-10320424)
chr8 (152-235)||(32918842-32918925)
chr8 (210-399)||(22756317-22756501)
chr8 (184-371)||(11944864-11945051)
chr8 (141-347)||(54117-54322)
chr8 (210-348)||(36426201-36426337)
chr8 (118-178)||(37861803-37861864)
chr8 (184-252)||(11926878-11926946)
chr8 (113-249)||(28746241-28746377)
chr8 (184-255)||(5859517-5859588)
chr8 (214-363)||(5892087-5892236)
chr8 (211-264)||(14958975-14959027)
chr8 (153-254)||(15351694-15351794)
chr8 (322-403)||(15351820-15351901)
chr8 (114-158)||(21272631-21272675)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (114-403)||(32528633-32528923)
chr5 (114-399)||(7523089-7523376)
chr5 (114-403)||(2351598-2351888)
chr5 (114-403)||(11963259-11963549)
chr5 (114-403)||(39918425-39918715)
chr5 (118-404)||(24181511-24181798)
chr5 (114-403)||(35701195-35701485)
chr5 (118-406)||(3735280-3735568)
chr5 (118-403)||(29241300-29241586)
chr5 (118-403)||(7770167-7770452)
chr5 (114-402)||(31770480-31770769)
chr5 (118-400)||(4689589-4689871)
chr5 (118-403)||(7208118-7208404)
chr5 (114-403)||(34794805-34795095)
chr5 (118-403)||(31644369-31644654)
chr5 (114-403)||(8136757-8137045)
chr5 (114-403)||(6284188-6284477)
chr5 (118-403)||(31879964-31880250)
chr5 (118-403)||(41459511-41459796)
chr5 (114-357)||(21739095-21739334)
chr5 (116-398)||(41790356-41790638)
chr5 (125-398)||(7725702-7725975)
chr5 (118-403)||(18470316-18470601)
chr5 (118-403)||(39788114-39788401)
chr5 (114-346)||(4818085-4818318)
chr5 (125-388)||(22493322-22493585)
chr5 (146-399)||(553346-553601)
chr5 (112-399)||(32092874-32093160)
chr5 (160-403)||(40489302-40489544)
chr5 (118-402)||(24036155-24036436)
chr5 (118-403)||(23091192-23091478)
chr5 (150-403)||(8560870-8561122)
chr5 (128-403)||(5571545-5571806)
chr5 (114-350)||(28090461-28090698)
chr5 (118-403)||(37148477-37148747)
chr5 (199-403)||(5598484-5598688)
chr5 (184-403)||(27838962-27839180)
chr5 (118-287)||(40182386-40182556)
chr5 (118-357)||(22432243-22432479)
chr5 (126-379)||(700513-700767)
chr5 (114-327)||(5673062-5673271)
chr5 (170-388)||(17031132-17031350)
chr5 (287-403)||(4664923-4665039)
chr5 (213-402)||(11090758-11090946)
chr5 (114-199)||(20119689-20119777)
chr5 (368-403)||(21739018-21739053)
chr5 (266-373)||(36175002-36175109)
chr5 (359-403)||(40182552-40182596)
chr5 (118-196)||(35954936-35955014)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (114-403)||(23495-23783)
scaffold0054 (134-371)||(19846-20083)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (118-398)||(5332-5613)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (114-403)||(2227-2516)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (114-403)||(101867-102157)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (114-403)||(4467-4757)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (118-403)||(13575-13860)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (116-403)||(51359-51646)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (120-402)||(1532-1814)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (114-357)||(17988-18232)
scaffold0169 (114-300)||(12527-12714)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (120-403)||(18980-19262)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (116-403)||(15092-15380)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (118-403)||(15261-15551)
scaffold0360 (184-254)||(13616-13686)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (160-399)||(372856-373095)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (114-403)||(2384-2673)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (118-399)||(42843-43122)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (242-403)||(19043-19205)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (166-302)||(33534-33669)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (166-278)||(108318-108427)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14925666 - 14925377
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  14925666 agatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatacgatttttaggggacggaatgctat 14925567  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14925566 tttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 14925467  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14925466 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcatgtcctgtccttcattttttaacgaatcaaacgcac 14925377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 18057438 - 18057727
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18057438 agatagaacagcacaacacaaggcataatagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatacgatttttagaggacgaaatgctat 18057537  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18057538 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacatctagttt 18057637  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18057638 gtcatgtatctcaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttgtcctatcctgtccttcattttttagcgaatcaaacgcac 18057727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 17443181 - 17443465
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17443181 agatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctat 17443280  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17443281 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagttt 17443380  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17443381 gtcctgtacctgaaatggttttacaaatcaaacactggacaactaaagt-----tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 17443465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3933018 - 3932729
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3933018 agatagaacagtacaacacaagacaaaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 3932919  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  3932918 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgccccttgcctccagtt 3932819  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3932818 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3932729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 17867755 - 17868043
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17867755 atagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt 17867854  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||    
T  17867855 ttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttg 17867954  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17867955 tcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 17868043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 17877538 - 17877826
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17877538 atagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt 17877637  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||    
T  17877638 ttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttg 17877737  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17877738 tcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 17877826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 403
Target Start/End: Original strand, 24203282 - 24203570
Alignment:
Q  115 gatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||    
T  24203282 gatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacaatttt-gagggacaaaatgttat 24203380  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||    
T  24203381 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagttt 24203480  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24203481 gtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 24203570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 2614814 - 2615100
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2614814 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgcta 2614913  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  2614914 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatt 2615013  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2615014 tgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacagtggacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaac 2615100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 145 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11613971 - 11613712
Alignment:
Q  145 cacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcggga 243  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11613971 cacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttatacaacttgtacgtggga 11613872  T
Q  244 caaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatca 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11613871 caaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgtctccattttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatca 11613772  T
Q  344 aacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11613771 aacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 11613712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Original strand, 10959923 - 10960205
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  10959923 agaacatcacagcacaaggcagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaatgatattttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttt 10960022  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||    
T  10960023 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgttgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcc 10960122  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10960123 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacg 10960205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32410063 - 32409773
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32410063 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatacta 32409964  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  32409963 ttttggtattttagacaacttgtgagtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtt 32409864  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32409863 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttattctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 32409773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 167130 - 166845
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  167130 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacgaaatgctatttt 167031  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  167030 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgtcccttgcctctagtttgtc 166931  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  166930 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaagtagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgca 166845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Original strand, 3259596 - 3259890
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggaca------aatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||      | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3259596 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa 3259695  T
Q  208 tgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  3259696 tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctc 3259795  T
Q  308 tagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259796 cagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3259890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 404
Target Start/End: Original strand, 11212175 - 11212466
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  11212175 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatgttttatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgagggacaaaatgtta 11212274  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  11212275 ttttggtattttagacaacttgcacgtgagacaaaaggttatgttgtggtttggtgagggacaaaagtatgagtttttgtcatgtcccttatctccagtt 11212374  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212375 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcccgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 11212466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 10485081 - 10485365
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10485081 agaacagcacaatacaaggga-aacaacacaggacaaatatttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 10485179  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  10485180 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 10485279  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10485280 tgtacctgaaataattttacaaatcaaacactggacaactggagttgttttgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 10485365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 114 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10324322 - 10324035
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  10324322 agatagaacattacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatgggattgagtaattttttgttttatacgattttttggggacaaaatgtta 10324223  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10324222 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 10324123  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10324122 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactgaacaactagagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 10324035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15277148 - 15276858
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15277148 agatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgcta 15277049  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  15277048 ttttgttcttttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 15276949  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15276948 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaatgcac 15276858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 34176752 - 34177038
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34176752 agaacagtacaacataagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34176851  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||    
T  34176852 ggtattttagactacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcatgtcacttgcctccagtttgtc 34176951  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176952 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaagtgacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 34177038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 126 - 371
Target Start/End: Original strand, 24242594 - 24242840
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24242594 acaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 24242693  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  24242694 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttgtgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 24242793  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtc 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  24242794 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 24242840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 171 - 403
Target Start/End: Original strand, 11382040 - 11382270
Alignment:
Q  171 ataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgat 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||     
T  11382040 ataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtga- 11382138  T
Q  271 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgt 370  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  11382139 -gacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgt 11382237  T
Q  371 cctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382238 catgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 11382270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32132591 - 32132347
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32132591 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgcta 32132492  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  32132491 ttttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 32132392  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaact 357  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32132391 tgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 32132347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 160 - 400
Target Start/End: Original strand, 11279093 - 11279333
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||    
T  11279093 tatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgt 11279192  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11279193 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgg 11279292  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11279293 agttgttctgtcccgtctttcattttttagcaaatcaaacg 11279333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15277491 - 15277201
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  15277491 agatagaacagtacaacacaaggtaaaacaacacagaacaaattttttatagcattgagtaatttgttgttttatacgatttttggaagacaaaatgcta 15277392  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  15277391 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 15277292  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15277291 tgtcctgtaccttaaacaattttacaaatcaaacactggacaaatagagttgttttgtcttgtctttcattttttagcaaatcaaacgcac 15277201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31870306 - 31870018
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| | |||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  31870306 agaacaacacaatataagggagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgagttttgggggacgaaatgctattttt 31870207  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||| |    
T  31870206 gtattttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgttttgtcccttgcctctagtttgttc 31870107  T
Q  318 ---tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
       ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31870106 tgttgttcctgagacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtccagtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 31870018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9902863 - 9902580
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataat-tttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||  |||| ||| |||  ||||||||||  ||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9902863 aacaacacaacacaaggcagatcagtacataacaattttttataacattgaataaaatttttggtttatatgatttttgggggacgaaatgttattttgg 9902764  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9902763 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttaatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttacctctagtttgtcct 9902664  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
     |||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9902663 atacctgaaacagttcaacaaattaaacactgaacaactgaagttgttctatcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 9902580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11675581 - 11675295
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    |||||| ||||||| |||| | || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  11675581 agaacaacacaacaaaaggtaaaatagcacatgacaaatttctatagcattgaataatttttttgttttatacgatttttgggggacgagatgccattta 11675482  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    ||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  11675481 ggtattttacaaagcttgtacgtgggataaaaagttgtgttatggtttggtgagagacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtc 11675382  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11675381 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtcttgtctttatttttttagcaaatcaaacgcac 11675295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 175 - 400
Target Start/End: Original strand, 3379690 - 3379915
Alignment:
Q  175 ttttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggac 274  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  3379690 ttttttgttttatatgatttttggaggacgaaatgctattttggtatttaagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctatggtttggtgagcgac 3379789  T
Q  275 aaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctg 374  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || ||    
T  3379790 aaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactaaagttgttctatcatg 3379889  T
Q  375 tccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3379890 tccttcattttttagcaaatcaaacg 3379915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 32859970 - 32860259
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||    
T  32859970 agataggacaacacaatataaggcagaacagcacaatacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatttgatttttgggtgacgaaatgttat 32860069  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| |||||||| | || |||||    
T  32860070 ttttgtattttagaaaacttgtacgtgagacaaaaggttgtgctgtggtttggcgatggacaaaaattgcagcttttgtcatgtcccttgcctccagttt 32860169  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32860170 gtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaattggagttgttttgtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgcac 32860259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18597364 - 18597079
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||     
T  18597364 agaacaacacaacactaggtagaacaacacataataaatttttatggtattgaataattttttgttttatatgatttttgagggacgaagtactatttta 18597265  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||| | ||  |||||||     
T  18597264 gcgttttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagattttgtcatgtcccttgcctccggtttgtca 18597165  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18597164 tatccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaattgttcaatcccgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 18597079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Original strand, 23636146 - 23636428
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| | ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  23636146 agaacaacacaacagaaggcagaactgtacatgacagttttttatggcattgaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttg 23636245  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    |  ||||| | |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||||  |||   |||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||| ||     
T  23636246 gatttttaaataacttgtacgtgagacaaaaatttgtgttgtggtttaatgaataacaaaaatatgagtttttatcctattccttgcatccagtttatca 23636345  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23636346 tgtacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacg 23636428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 29054277 - 29054564
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||    
T  29054277 agataggacaacacaacataagacagaacagcacaagataaattt-tatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgttat 29054375  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||   |||||||||| |||||||| | || | |||    
T  29054376 tttg-tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgtagtttttgtcatgtcccttgcttccaattt 29054474  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||  | || | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29054475 gtcctgttcctgaaactgttttacaaatcaaacattggacagctttaattattctgttctgtccttcattttttatcaaatcaaacgcac 29054564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8178093 - 8177803
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat--gttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||  || |||||||| | |||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  8178093 agatagaatagcacaacacaagacagaacagtacatgacaagttttaatagcattgaacatttttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgtt 8177994  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||| | || |||    
T  8177993 attttggtattttagacaacttgaacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatca-tttttatcctgtcccttgcctccagt 8177895  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8177894 ttgttttgtacctgaaacagttttataaatcaaacaccggataattgaagttgttttttcatgtcctttattttttagcaaatcaatcgcac 8177803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Original strand, 3290637 - 3290867
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||  |||    
T  3290637 tatgacattgaataattgtttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtggg--aaaaagttgtgttgt 3290734  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||           ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||      
T  3290735 ggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt-----------tgacacagttatacaaatcaaacactgaacaactag 3290823  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3290824 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 3290867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14808206 - 14807939
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  14808206 agaacaacacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatggaattgaataatttttagttttatacgatttttgggggatgaaatgttattttg 14808107  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    |||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||| | |||||||| |      
T  14808106 gta-cttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcaatttttatcctatcccttgcctctagtttat-- 14808010  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
                   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808009 ---------------tttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 14807939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4494240 - 4494081
Alignment:
Q  199 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagt-ttttgtcctgt 297  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4494240 gggacaaaatgttatttcggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttgtcctgt 4494141  T
Q  298 cccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaact 357  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4494140 cacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagtcttacaaatcaaacactggacaact 4494081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34684185 - 34683929
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt--atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatt 222  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||   ||  ||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  34684185 cacaacataaggcataacaacacaggataaaaaagtttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtatt 34684086  T
Q  223 tt-agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgta 321  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||    
T  34684085 tttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgta 34683988  T
Q  322 cctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttttta 388  Q
    |||        ||||||||||||| |||||||||||  |||||  ||| ||| ||||| ||||||||    
T  34683987 cct--------tttacaaatcaaaaactggacaactagagttggtctgacctatcctttatttttta 34683929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 145 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7396302 - 7396048
Alignment:
Q  145 cacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggac 244  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  || | |||| |||||||| |||| |||  ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  7396302 cacatgacaaatttttatggtattgaataatttt--gtctcataccatttttgatggacaaaacactatttttgtattttagataacttgtacgtgagac 7396205  T
Q  245 aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaa 344  Q
    ||||||||||   ||||||| |||| |||||| | | |  ||||||||||||||| || | || || ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7396204 aaaaagttgtgtagtggtttagtgagggacaagatt-tctgtttttgtcctgtccattgcttccagcttgtcatgtcccagaaacagctttacaaatcaa 7396106  T
Q  345 acactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||   ||||||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7396105 acaccatacaactgaaattgttttgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgca 7396048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14925208 - 14925138
Alignment:
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14925208 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 14925138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 398
Target Start/End: Original strand, 9613990 - 9614177
Alignment:
Q  211 tattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctag 310  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||  || ||||| ||||   |||||||  | |  ||||||| |||||||| | || ||    
T  9613990 tattttagtattttagacaacttatacgtggaacaaaaaattgtgttgcggtttagtgagtaacaaaaacttcaaattttgtcatgtcccttgcctccag 9614089  T
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9614090 tttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacattgtacaactgaagttttcttgttatgtccttcattttttagcagatcaaa 9614177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Original strand, 29814783 - 29814887
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  29814783 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgtta 29814882  T
Q  213 ttttg 217  Q
    |||||    
T  29814883 ttttg 29814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 401
Target Start/End: Original strand, 33041404 - 33041472
Alignment:
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  33041404 tttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctattcttcattttttaacaaatcaaacgc 33041472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9200491 - 9200316
Alignment:
Q  221 ttttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctta-catctagtttgtcctg 319  Q
    ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||| ||| || ||| |  ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||    
T  9200491 ttttaaacaatttgtatgtgggacaaaaagttgttatatggtttggtgagggagaagaatttttgtttttgtcttgtctcttagcctctagtttgtcatg 9200392  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatc 395  Q
    |   | |||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9200391 tctttaaaacagttttacaaatcaaacattgtacaacttgagttgtcatgtcttgtccttaactttttagcaaatc 9200316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Original strand, 28502377 - 28502482
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgta--tggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |   ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28502377 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttattggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgtt 28502476  T
Q  212 attttg 217  Q
    ||||||    
T  28502477 attttg 28502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27824824 - 27824612
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||   | ||||| ||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  27824824 gacaaacttttatggtattgaataatttttgatcttatatgatttttgttggacaaaaagctatttttgtattttggataactcgtacgtgggacaaaaa 27824725  T
Q  250 gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacact 349  Q
    |||||  |||||| |  ||| ||||   ||| |   || || || | |||||| | ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27824724 gttgtgatgtggtataatgagggac---aattttttttcttctcttatcccttgcctctagtttgtcctttcccaaaaacagttttacaaatcaaacact 27824628  T
Q  350 ggacaactgaagttgt 365  Q
    | ||||||||| ||||    
T  27824627 gtacaactgaaattgt 27824612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 399
Target Start/End: Original strand, 13415862 - 13415928
Alignment:
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13415862 tttacaaatcaaacactgtacaactagagttgttatgttctgtctttcgttttttagcaaatcaaac 13415928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Original strand, 27756315 - 27756364
Alignment:
Q  205 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27756315 aaatgttattttgatattttagacaacttatacgggggacaaaaagttgt 27756364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4494308 - 4494244
Alignment:
Q  115 gatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataatttt 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  4494308 gatagaacagcacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcaatgagtaatttt 4494244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32614137 - 32614030
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||| || ||||| |||  ||||||||  || ||||||||||||||  |||| ||| | ||||||  ||||||    
T  32614137 cacaacacaaggcataacaacatatgacaaacttttatggtattatataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaagttatttttatatttt 32614038  T
Q  225 agacaact 232  Q
    ||| ||||    
T  32614037 agataact 32614030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29424731 - 29424613
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||  || || |||| ||||||  |||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||  || | |||| ||||  |||    
T  29424731 tatggtattgaataatttttggtcttgtacgttttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacttgtacgtaggtctaaaaattgtgttgt 29424632  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaa 278  Q
     |||| |||||||||||||    
T  29424631 cgtttagtgatggacaaaa 29424613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16542439 - 16542362
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtac 237  Q
    ||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||  | |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16542439 tatggtattgaataattttttatcttatacaatttttgttgcataaaaggttattttggtattttagacaacttgtac 16542362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 32805396 - 32805440
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaattt 158  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32805396 agatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattt 32805440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 9807078 - 9807366
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9807078 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctat 9807177  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9807178 tttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttggtga-ggacaaaaagttgagtttttgtcctgtccattgcatctagttt 9807276  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9807277 gtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctatccttcatgttttagcaaatcaaacgcac 9807366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Original strand, 32181211 - 32181473
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32181211 aacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatactatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgt 32181310  T
Q  240 gggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32181311 gggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaa 32181410  T
Q  340 atcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32181411 atcaaacactggacaactaaagttgtcatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 32181473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 24002259 - 24002550
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtat-ggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa-tgct 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24002259 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttttggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgct 24002358  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  24002359 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 24002458  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002459 ttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtactgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 24002550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 23521801 - 23522091
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23521801 agataaaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 23521900  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||    
T  23521901 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcttccagtt 23522000  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522001 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 23522091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20802696 - 20802406
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20802696 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 20802597  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  20802596 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtt 20802497  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20802496 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactaaagttgttctgtcctatccttcattttttaacaaatcaaacgcac 20802406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33553003 - 33552717
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33553003 agaacagtacaacacaaggcaaaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 33552904  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  33552903 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtc 33552804  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33552803 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcac 33552717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 56154542 - 56154832
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  56154542 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 56154641  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||    
T  56154642 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtt 56154741  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56154742 tttcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctaaccttcattttttagcaaatcaaacgcac 56154832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29785702 - 29785411
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29785702 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 29785603  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||    
T  29785602 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagctgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgtctccagtt 29785503  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29785502 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttttagcaaatcaaacgcac 29785411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44324500 - 44324217
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44324500 aacagcacaacataaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggt 44324401  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  || | ||||||||||||||    
T  44324400 atttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcccgtcttttgcctctagtttgtcctg 44324301  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44324300 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgcac 44324217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50178653 - 50178367
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50178653 agaacatcacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 50178554  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa-gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  50178553 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 50178454  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50178453 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 50178367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 121 - 404
Target Start/End: Original strand, 29592824 - 29593107
Alignment:
Q  121 acagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggta 220  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||      
T  29592824 acagaacaacacaaggcagaacagaacaagacaaatttttttggcattgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgccattttggat 29592923  T
Q  221 ttttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgt 320  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  29592924 ttttagacaacttttatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaagtacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgt 29593023  T
Q  321 acctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29593024 acctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaggtgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 29593107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 49152264 - 49151976
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  49152264 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgatggacaaaatgtta 49152165  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  49152164 ttttggt-ttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcgtgtcccttgcatccagtt 49152066  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152065 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggataactaaagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 49151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2725281 - 2725011
Alignment:
Q  130 cacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagac 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2725281 cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac 2725182  T
Q  229 aacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaa 328  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||    
T  2725181 aacttgtacgtgg-acaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaa 2725083  T
Q  329 cagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
     || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725082 gagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 2725011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 114 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33177197 - 33176910
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  33177197 agatagaacagtacaacacaagacagaacaacaaaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgtta 33177098  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  33177097 ttttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 33176998  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33176997 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaacg 33176910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 130 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38486406 - 38486132
Alignment:
Q  130 cacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagac 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38486406 cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcgttgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 38486307  T
Q  229 aacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaa 328  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||    
T  38486306 aacttgtacgttagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttatcctgtacctgaaa 38486207  T
Q  329 cagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486206 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 38486132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 3649562 - 3649847
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  3649562 agaacagcacaacacaaggcataacagcacatcacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgttttttgggggacgaaatgttattttg 3649661  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||||||| |    
T  3649662 gtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaattttagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttc 3649761  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3649762 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 3649847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 140 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50728052 - 50727788
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 238  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50728052 aacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacg 50727953  T
Q  239 cgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttaca 338  Q
     |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50727952 tgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttaca 50727853  T
Q  339 aatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50727852 aatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 50727788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 140 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50736066 - 50735802
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 238  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50736066 aacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacg 50735967  T
Q  239 cgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttaca 338  Q
     |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50735966 tgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttaca 50735867  T
Q  339 aatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50735866 aatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 50735802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20518187 - 20517896
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  20518187 agatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatagaatttttgagggacaaaatgcta 20518088  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||    
T  20518087 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaagaagttatgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgactttttgtcctgtctcttgcctccagtt 20517988  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20517987 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgcac 20517896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 12600807 - 12601097
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  12600807 agatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacttgacaaattttttatggcattgagtagttttttgttttaaacgattttttagggacaaaatgcta 12600906  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  12600907 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttatctccagtt 12601006  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12601007 tgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 12601097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 126 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 55065485 - 55065208
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttta 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  55065485 acaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatatttta 55065386  T
Q  226 gacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt-acatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||    
T  55065385 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccctccagtttgtcttgtacct 55065286  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55065285 gaaacagttttacaaatcaaacactgaataactagagttgttctgtcatgtcctt-attttttagcaaattaaacgcac 55065208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 52949647 - 52949931
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  52949647 agaacagcacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataatttt-tgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 52949745  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  52949746 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 52949845  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52949846 tgtacctgaaacagttttacaaatgaaacactggacaactagagttgttttgtcgtgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 52949931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 6776499 - 6776789
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||    
T  6776499 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgata 6776598  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  6776599 ttttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatt 6776698  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| || ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776699 tgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 6776789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 21579947 - 21580236
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21579947 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggtattgagtaatttttagttttatacgatttttgagggacaacatgcta 21580046  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  21580047 ttttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatt 21580146  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21580147 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaattagaattgttctgtcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgcac 21580236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 52319247 - 52319539
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  52319247 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattt---gttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 52319343  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  52319344 ttttgacattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttcgtcctgtcccttgcctccagtt 52319443  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagt-----tgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52319444 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 52319539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 140 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 46680649 - 46680385
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 238  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46680649 aacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttttagggacaaaatgctattatggtattttagacaatttgtacg 46680550  T
Q  239 cgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttaca 338  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46680549 tgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaca 46680450  T
Q  339 aatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680449 aatcaaacactgaacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 46680385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 1231236 - 1231522
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||| | ||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1231236 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaagataaattttttatggcattatgtaatattttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 1231335  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||| ||    
T  1231336 gatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttttgtgagggacaaaaatatgagtttttgtccagtctcttgcctccagtttatc 1231435  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1231436 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 1231522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44649322 - 44649039
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44649322 agaacagtacaatacaagggagaacaacacatgacaaattttgatgacattgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 44649225  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  44649224 atattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 44649125  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44649124 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaaaactggataactggagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 44649039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Original strand, 55593806 - 55594096
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  55593806 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaatgcaaaacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 55593905  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  55593906 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggactaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 55594005  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  55594006 tatcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgttctgtcctgttcttcatttttttagcaaatcaaacgca 55594096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 127 - 403
Target Start/End: Original strand, 11055977 - 11056253
Alignment:
Q  127 caacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttag 226  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  11055977 caacacaaggtagaacagtacgggacaaatctttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggcacgaaatgttattttggtatttttg 11056076  T
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctga 326  Q
    ||||  |||||  |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  11056077 acaatctgtacatgggacataaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11056176  T
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11056177 aacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgaccttcattttttagcaaatcaaacgcac 11056253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 145 - 403
Target Start/End: Original strand, 36885883 - 36886143
Alignment:
Q  145 cacaggacaaatttgt-atggcattgaat-aattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcggg 242  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  36885883 cacaggacaaattttttatggcattgagttaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttaggtattttagacaatttgtacgtggg 36885982  T
Q  243 acaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatc 342  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36885983 ataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatc 36886082  T
Q  343 aaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36886083 aaacactggacaactagagttgttttgtcttgtcctttattttttagcaaatcaaacgcac 36886143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Original strand, 54542912 - 54543198
Alignment:
Q  115 gatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  54542912 gatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaagacaaattttttatgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatat 54543011  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||    
T  54543012 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa-gttgtgctatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaattt 54543110  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54543111 gtcctgtacttgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgt-cttcattttttagcaaatcaaacgca 54543198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 172 - 403
Target Start/End: Original strand, 38812500 - 38812731
Alignment:
Q  172 taattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatg 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  38812500 taattttttgttttatacgatttttgcggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 38812599  T
Q  272 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  38812600 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtc 38812699  T
Q  372 ctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38812700 ctgtcctttattttttagcaaatgaaacgcac 38812731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 151 - 402
Target Start/End: Original strand, 41711806 - 41712057
Alignment:
Q  151 acaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaag 250  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  41711806 acaaatttttatgctattgaataattttttgttttatacgatatttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgagacaaaaag 41711905  T
Q  251 ttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactg 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41711906 ttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtctttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactg 41712005  T
Q  351 gacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||||||  |||||| |||| || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  41712006 gacaactagagttgttctgttctatcattcattttttagtaaatcaaacgca 41712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 126 - 398
Target Start/End: Original strand, 24210251 - 24210525
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa-tgctattttggtattt 223  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24210251 acaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattt 24210350  T
Q  224 tagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacc 323  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  24210351 tagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaataatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacc 24210450  T
Q  324 tgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24210451 tgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaattagagttgttccgtcctatctttcattttttagcaaatcaaa 24210525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9512505 - 9512216
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||||| ||  ||||| ||| || || |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9512505 agatagaatagtgcaacaaaagacagaatagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 9512406  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||    
T  9512405 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgttacttgcctccagtt 9512306  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9512305 tatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctatcatgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 9512216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Original strand, 36497144 - 36497428
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatt-tgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||   | ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  36497144 aacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaaaaatttatagcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacagaatgctattttga 36497243  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||    
T  36497244 tattttagacaacttgtatgttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgtctccagtttgtcct 36497343  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36497344 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 36497428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 118 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 47642651 - 47642388
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47642651 agaacaacacaatacaagggagaacagcacaggataaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 47642552  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||| || |||||||||    
T  47642551 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtctcttacctccagtttgtcc 47642452  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca 381  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47642451 tgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcctgtccttca 47642388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 386
Target Start/End: Original strand, 37865674 - 37865947
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37865674 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaatttttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttctgagggacaaaatgcta 37865773  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || || |    
T  37865774 ttttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtctcttgcctccagat 37865873  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttt 386  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  37865874 tgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtcgtgtccttcattttt 37865947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 119 - 403
Target Start/End: Original strand, 2786891 - 2787175
Alignment:
Q  119 gaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2786891 gaacaacacaacataaggcaaaacagcactagacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttgg 2786990  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
      ||||||| || ||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  2786991 atttttagataatttgtacgtgggacaaaaatttgtgatgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtact 2787090  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2787091 gtacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 2787175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 123 - 403
Target Start/End: Original strand, 50186459 - 50186739
Alignment:
Q  123 agcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatt 222  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  50186459 agcacaacataagacataacaacataggacaaatttttatgacattgaataattttttattttatacgatttttggggtgcgaaatgctatttttgtatt 50186558  T
Q  223 ttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtac 322  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  50186559 ttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcccgtcccttgcctctagtttgtcctgcac 50186658  T
Q  323 ctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    || |||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50186659 ctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctttcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 50186739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 29616095 - 29616377
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  29616095 agaacagtacaacacaagacagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggacaaaatgttatttt 29616194  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  29616195 ggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtcagg-----gacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 29616289  T
Q  317 ctgtacct-gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29616290 ctgtaccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 29616377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 379
Target Start/End: Original strand, 21202665 - 21202926
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21202665 agaacagcacaacacaaaacagaacagcacatgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgctatttt 21202763  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  21202764 gatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 21202863  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtcctt 379  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  21202864 ctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 21202926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 126 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36743841 - 36743564
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36743841 acaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 36743742  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  36743741 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 36743642  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36743641 gaaacagttttacaattcaaacactgaacaactagagttgttttgttatatccttcat-ttttagcaaatcaaacgcac 36743564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 47361570 - 47361288
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  47361570 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgatattgagtaattttttgttttatacgaatttttagggacaaaatgctatttt 47361471  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||  |||||||    
T  47361470 ggtattttagacaacttgtt----ggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttt-gtcttgtcccttgcctccggtttgtc 47361376  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47361375 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgcac 47361288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 126 - 399
Target Start/End: Original strand, 20694304 - 20694578
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaattt-gtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20694304 acaacacaaggcagaatagcacatgacaaattttgtatggcaatgagtaattttttgttttatataatttttgggggacaaaatgctattttggtatttt 20694403  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||    
T  20694404 agacaacttgtacgttggacaaaaagttgcgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgccttcagtttgtcctgtacct 20694503  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20694504 aaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtgttgtccttcagtttttagcaaatcaaac 20694578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 298
Target Start/End: Original strand, 43641020 - 43641205
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43641020 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 43641119  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43641120 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 43641205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50729686 - 50729417
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||                || ||| |||||||||||||||||||    
T  50729686 agaacagcacaacacaaggcataacagcacagaacaaatttttatgatattaaataat----------------ttattgcgggacgaaatgctattttg 50729603  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| | || ||||||| |    
T  50729602 gtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatagacaaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgttc 50729503  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50729502 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 50729417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 133 - 403
Target Start/End: Original strand, 4325731 - 4326002
Alignment:
Q  133 aaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaac 231  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4325731 aaggcagaacaacacacgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatgcgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 4325830  T
Q  232 ttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacag 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||    
T  4325831 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgcggttttgtgagagacaaaaatatgagtttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacag 4325930  T
Q  332 atttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4325931 ttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgcac 4326002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 26083264 - 26083548
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  26083264 agaacaacacaacacaaggcataacagtacacgacaaatttttatggtattgaataatttcatgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttg 26083363  T
Q  218 g-tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    | | |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| | || |||||||     
T  26083364 ggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtt 26083463  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  26083464 ctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactaaacaactgaagttgttctgt--tgtccttcattttctaacaaattaaacgcac 26083548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 118 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 53200804 - 53200517
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53200804 agaacatcacaacataaggcataacaacacagaacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtatgatttttgagggacgaaatactattttg 53200705  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggac-aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
     | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||| | || ||||| ||    
T  53200704 atgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgttccttgcctccagtttatc 53200605  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53200604 ctgtctctgaaacagttttgcaaatcaaacactaaacagctgaagttattatgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaca 53200517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 127 - 399
Target Start/End: Original strand, 39078596 - 39078868
Alignment:
Q  127 caacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttag 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  39078596 caacacaaggcataacaacacaggataaatttttatggtattgaataatttcttattttatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttag 39078695  T
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctga 326  Q
    |||||| |||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| || ||| | || ||||||| |||| |||||    
T  39078696 acaactcgtacgtaggacaaaaatttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcctatctcttgcctccagtttgttctgtccctga 39078795  T
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39078796 aacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaac 39078868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7555115 - 7554832
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||     
T  7555115 aacaacacaacacaagacagaacatcacacgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggccgaaatgctattttgga 7555016  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||  |||||||  ||    
T  7555015 tttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttagtgaaggacaaaaatacgagtttttatcatgtctcttgcattcagtttgttttg 7554916  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||||    
T  7554915 tacatgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctgaaattgttctgtcatatctttcactttttagcaaatcaaacgcac 7554832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 16320447 - 16320729
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| | |||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||     
T  16320447 agaacaacacaatagaagggagaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttt--gttttatacgagttttgggggatgaaattctattttt 16320544  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||| |||    
T  16320545 gtattttaggcaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttttcc 16320644  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16320645 tatacctgagacagttttacaaatcaaatactggacaactggagttgttctgtccagtcctt-attttttagcatatcaaacgcac 16320729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Original strand, 42869941 - 42870182
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa-tgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactg 258  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||   ||||| |||    
T  42869941 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaa---gttgtgctg 42870037  T
Q  259 tggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactg 358  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  42870038 tggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcccccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacaccggacaacta 42870137  T
Q  359 aagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42870138 gagttgttatgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgcac 42870182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 126 - 355
Target Start/End: Original strand, 34929848 - 34930078
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34929848 acaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattcagtaaatttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatatttt 34929947  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||| ||    
T  34929948 agacaacttgtatatggggcaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttattctgtatct 34930047  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaa 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34930048 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 34930078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37695701 - 37695470
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37695701 agaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttg 37695602  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || | ||| ||     
T  37695601 atattttagacaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttacctccaatttatca 37695502  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacact 349  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  37695501 tgtacctgaaacagttttccaaataaaacact 37695470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 211 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2630018 - 2629826
Alignment:
Q  211 tattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||    
T  2630018 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatttggtctggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcctttgcctctag 2629919  T
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629918 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 2629826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22318544 - 22318259
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||| ||||| |||||||    
T  22318544 agaacagcacaacacaagacataacaacacatgacaaatttttatgatattgaataatttcttgttttatatgatttttggatgacaaaatgttattttg 22318445  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||| ||| | |  ||||||| |    
T  22318444 gtgttttagacaacttctacgtaagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcaaattttgtcctgtctcttgccttcagtttgttc 22318345  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22318344 tgtccctaaaacagttttacaaatcaaacactagacagctggggttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 22318259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 182 - 403
Target Start/End: Original strand, 28115243 - 28115462
Alignment:
Q  182 ttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaata 281  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  28115243 ttttataagattcttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 28115341  T
Q  282 tgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca 381  Q
    | | ||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||| | |||||    
T  28115342 tcaatttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacc-aaaacagttttacaaatcaaacactagacaacttgagttgttctgccctttgcttca 28115440  T
Q  382 ttttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  28115441 ttttttagcaaatcaaatgcac 28115462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 292
Target Start/End: Original strand, 37931859 - 37932020
Alignment:
Q  131 acaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaa 230  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  37931859 acaaggcagaacagcacaagacaactttttatggcattgaataatttttcgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttgacattttaaacaa 37931958  T
Q  231 cttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgt 292  Q
    |||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37931959 cttgtatgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgt 37932020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6973946 - 6973788
Alignment:
Q  245 aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaa 344  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  || | ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6973946 aaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtcaattgcctcccgtttgtccagtacctgaaacagttttacaaatcaa 6973847  T
Q  345 acactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6973846 acactggacaacaaaagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 6973788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 271 - 402
Target Start/End: Original strand, 14296646 - 14296777
Alignment:
Q  271 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||    
T  14296646 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatgt 14296745  T
Q  371 cctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14296746 cctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14296777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 271 - 402
Target Start/End: Original strand, 14314894 - 14315025
Alignment:
Q  271 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||    
T  14314894 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatgt 14314993  T
Q  371 cctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14314994 cctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14315025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Original strand, 14296520 - 14296654
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  14296520 atagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttatt 14296619  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14296620 ttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 14296654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Original strand, 14314768 - 14314902
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  14314768 atagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttatt 14314867  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14314868 ttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 14314902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 399
Target Start/End: Original strand, 30942722 - 30942995
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttta 225  Q
    |||| |||||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  30942722 acaatacaaggtataatagcatatgacaaatttttatagcattgaataatttcttgttttatatgatttttgggggatgaaatgatattttggtgtttta 30942821  T
Q  226 gacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgag-tttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||| || | | | ||||| |||||  |||||||||||||  |||| |||| | || ||||||||| ||| ||| | || | ||||| |||| |||    
T  30942822 gacaacttatatgtgaggcaaaatgttgtgttgtggtttggtgagagacagaaatttcagttttttgtcccgtctcttgcctccaatttgttctgtccct 30942921  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  30942922 gaaacagttttataaatcaaacactgaataactggagttgttctgtcttatcctt-attttttaacaaatcaaac 30942995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 297
Target Start/End: Original strand, 23327844 - 23328024
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgaggg-acgaaatgctattttg 217  Q
    |||| |||||||||| | | ||||  ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||    
T  23327844 aacaacacaacacaaagtagaacattacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggggggataaaatgttattttg 23327943  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggac-aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23327944 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 23328024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 403
Target Start/End: Original strand, 42772836 - 42772999
Alignment:
Q  240 gggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaa 339  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  42772836 gggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctcaagtttgtcatgtacctgaaacaattttacaa 42772935  T
Q  340 atcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||| || |||| |||||||  |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  42772936 atcaaacacttgaaaactaaagttgttatgtcatgtcattcattttttaatgaatcaaacgcac 42772999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25978664 - 25978487
Alignment:
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | || | || | |||||| ||| |||    
T  25978664 agacaacttgtaagtgagacaaaaagttgtgatatggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgttcattgcctccaatttgtcatgt-cct 25978566  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25978565 gaaacagttttacaaatcaaacactggataattgaagttgttttgtcatgtcctttattttttaacaaatcaaacgcac 25978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 316
Target Start/End: Original strand, 7001780 - 7001976
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  7001780 agaacatcacaacacaagacagaacaatacaggacaaatttttatggcattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggac-aaatgttattttg 7001878  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    ||| |||||||||||| |||   | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||| | || ||||||||    
T  7001879 gta-tttagacaacttatacatagaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttttgtttttgttctgtctcttgcctcgagtttgtc 7001976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 289
Target Start/End: Original strand, 13110250 - 13110425
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| || | ||||||| | |||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  13110250 agatagaacaacatagcacaaggtagaacaacgcagaacaaatttttatggcattgcataatttt-tgttttgtatgatttttgggggacgaaatgctat 13110348  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtgg-tttggtgatggacaaaaatatgagtttt 289  Q
    |||||  |||||||||| || |||| |||||||| ||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13110349 tttggatttttagacaaattttacgtgggacaaacagttgtgttgtggttttagtgaaggacaaaaatatgagtttt 13110425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 56487288 - 56487162
Alignment:
Q  272 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtc 371  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| | || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||     ||||  |||||| |||||    
T  56487288 gacaaaaatataaatttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatatctgaaacagttttacaaatcaaacac-----aactagagttgttctgtc 56487194  T
Q  372 ctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56487193 atgtctttcattttttagcaaatcaaacgcac 56487162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 404
Target Start/End: Original strand, 23328015 - 23328108
Alignment:
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328015 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaagtcaaacacatgacaactagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 23328108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 398
Target Start/End: Original strand, 9947947 - 9948135
Alignment:
Q  210 ctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatcta 309  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||| | |||||||||| |||| ||| | || |    
T  9947947 ctattttggtattttgaataacttgtacgtgagacaaaaagttgtaatgtggtttagtgagggataagaattttagtttttgtcatgtctcttgcctcaa 9948046  T
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| | |  |||||| | ||||||| |||||||||    
T  9948047 gtttgtcatgttccttaaacagttttacaaatcaaacattatacaattgaaattgtcatttgatgtcctccgttttttaacaaatcaaa 9948135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 301
Target Start/End: Original strand, 43739394 - 43739570
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| || |||||| | ||| ||| |||||||||  || |||||| ||||||   |||  ||||| ||||||  ||||||    
T  43739394 cacaacataaggcagaacaacacatgataaatttttttggtattaaataatttttggtcttatacaattttttgtggataaaatgttattttaatatttt 43739493  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccct 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  43739494 agacaacttgtatgtgggacaaaatgttgtgttgtggtttggtgagggacaataatttcagtttttgtcatgtccct 43739570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 399
Target Start/End: Original strand, 3579142 - 3579332
Alignment:
Q  210 ctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaa-aaatatgagtttttgtcctgtcccttacatct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||  | |||||| |||||||| || |||| |   |||||||| |||||||| | ||     
T  3579142 ctattttggtattttagacaacttgaatgttggacaaaaagttgtgatatggtttagtgatggaaaataaatttacttttttgtcatgtcccttgcctca 3579241  T
Q  309 agtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||| |||    || |||  |||||||||||||||||    
T  3579242 agtttgtcctgcccctaaaacagatttacgaatcaaacgttgtacaattgaagttgtcatgttacatcattcggtttttagcaaatcaaac 3579332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 404
Target Start/End: Original strand, 44640417 - 44640534
Alignment:
Q  286 tttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttt 385  Q
    |||||||| |||| ||| | ||||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  44640417 tttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcattttccataaacagttttacaaatcaaacactgtacaactgaagttgttctgt-ctgtcattcatttt 44640515  T
Q  386 ttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  44640516 ttagtagatcaaacgcaca 44640534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 44356010 - 44355734
Alignment:
Q  123 agcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatt 222  Q
    |||||||  |||| || |||| |||||| |||| || ||||  ||||||||| |||  || || |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||     
T  44356010 agcacaaagcaagtcagaacaacacaggccaaacttttatgctattgaataacttttggtcttgtacgatttttgatggacaaaagactattttggtata 44355911  T
Q  223 ttagacaacttgtacgcgggac-aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgta 321  Q
    | | ||||||||||||   ||| ||||| ||||  ||||||||  ||| |||||||||| | | |||||||||| || ||||| || |||||||||| |     
T  44355910 tcatacaacttgtacgtaagacaaaaaaattgtgttgtggtttaatgagggacaaaaatttcaatttttgtcctctctcttacctccagtttgtcctatc 44355811  T
Q  322 cctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||  | ||||| | || | |||||||||||||| || |||||||    
T  44355810 cctaaaacag-tttacaaatcaaacaccacacaactagatttgtcatatcatatccttcattttttaacatatcaaac 44355734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 252
Target Start/End: Original strand, 42772726 - 42772818
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagtt 252  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  42772726 tatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttggaggaaaaaatgttattttggtattttagataacttatacgtgggacaaaaagtt 42772818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 399
Target Start/End: Original strand, 13110447 - 13110513
Alignment:
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13110447 tttacaaatcaaacactggacaactgaaatttttctgtcatgtctttcattttttagcaaatcaaac 13110513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20644382 - 20644116
Alignment:
Q  137 cataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgta 236  Q
    ||||||| |||| |||| | || ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  | || |||  ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20644382 cataacaacacatgacacacttttatcgcattgaataatttttgattttatacgatttttggtgtacaaaaatctatttttgtatcttagataacttgta 20644283  T
Q  237 cgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagattta 336  Q
    | || ||||| ||| ||   |||||||| ||||  ||||||||| |   |||||| | ||| | || | ||||||||    ||| || |||| || |||     
T  20644282 cacgagacaagaagctgggatgtggtttagtgagagacaaaaatttatatttttgacatgttcattgcctctagtttagattgtcccagaaatagttttg 20644183  T
Q  337 caaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| | | ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20644182 caaatcaaacaccgtataactgaaattatcctgtcatgtccttcattttttaacagatcaaacgcac 20644116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 56487370 - 56487281
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  56487370 tatgtcattgattgattttttgttttatatgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttaaacaacttgtacgcgtgacaaaaa 56487281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 398
Target Start/End: Original strand, 43739557 - 43739644
Alignment:
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43739557 tttgtcatgtccctcaaacagttttacaaatcaaacattttacaactgaagttgtcttatcacgtccttcattttttagcaaatcaaa 43739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 53343638 - 53343560
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttt 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53343638 agaacagtacaacacaatgcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttt 53343560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 399
Target Start/End: Original strand, 2114191 - 2114243
Alignment:
Q  347 actggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2114191 actggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 2114243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 277
Target Start/End: Original strand, 38520518 - 38520584
Alignment:
Q  211 tattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaa 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  38520518 tattttggtattttatacaacttgtgcgtgggacaaaaaattatgctgtggtttggtgagggacaaa 38520584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45577828 - 45577706
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgc 239  Q
    |||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||  || |||  | ||||||   |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||     
T  45577828 aacaacacatgacaaagttttatggtattgaataatttt--gtcttaatcaattttttgtggacaaaatgtcattttggtattttagacaacttgcacgt 45577731  T
Q  240 gggacaaaaagttgtactgtggttt 264  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  45577730 gggacaaaaagttgtgttgtggttt 45577706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 254
Target Start/End: Original strand, 7381219 - 7381339
Alignment:
Q  131 acaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaa 230  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||| || |||||  |||| |||  ||||||| |||||||||| ||    
T  7381219 acaagacagaacatcacaggacaaatttgtatggtattgaataattt--tttcttatatga-ttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataa 7381315  T
Q  231 cttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  7381316 tttgtacgcgtgaaaaaaagttgt 7381339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Original strand, 985217 - 985338
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttta 225  Q
    |||||||||| || |||| || | ||||||||| |||||  ||||||||||||  || ||||| ||||||||  |||| |||  |||||||| |||||||    
T  985217 acaacacaagacaaaacatcataagacaaatttttatggt-ttgaataatttttggtcttatatgatttttgctggacaaaagactattttgatatttta 985315  T
Q  226 gacaacttgtacgcgggacaaaa 248  Q
     ||||||||||| || |||||||    
T  985316 aacaacttgtacacgagacaaaa 985338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 254
Target Start/End: Original strand, 40792409 - 40792479
Alignment:
Q  184 ttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||    
T  40792409 ttatacgatttttgatggacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacatgaaacaaaaagttgt 40792479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 289
Target Start/End: Original strand, 52755477 - 52755617
Alignment:
Q  149 ggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaa 248  Q
    |||||||||  |||||  ||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||  ||||| ||||||| || |||| ||| ||||| |  || ||||||    
T  52755477 ggacaaattgttatggtgttgaacaattttttgttttatacaatgtttgatggaaaaaatgttattttgctaatttacacagcttgtgcttggaacaaaa 52755576  T
Q  249 agttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttt 289  Q
    ||||||  |||| |||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  52755577 agttgttttgtgctttggtgagggacaagaattttagtttt 52755617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 52673756 - 52673814
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataatttt 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  52673756 aacaacacaacacaaggcagaactgcacatgacaaacttttatggtattgaataatttt 52673814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 79)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 844971 - 844681
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  844971 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 844872  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  844871 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 844772  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844771 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 844681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 42510452 - 42510742
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42510452 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 42510551  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  42510552 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtt 42510651  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42510652 tgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 42510742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 39281822 - 39282111
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  39281822 agatagaacagcacaacacaatgcataacaacacatgacaactttgtatgacattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgttat 39281921  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39281922 tttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagttt 39282021  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39282022 gtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttatcttgtcatgtccttcatgttttagcaaatcaaacgcac 39282111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 116 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6711291 - 6711002
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6711291 atagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt 6711192  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6711191 ttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttg 6711092  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711091 tcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 6711002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16476401 - 16476116
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16476401 agatagaacaacacgacataaggcataacaccacatgacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacaatttttgggggacaaaatgctat 16476302  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16476301 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcatctagttt 16476202  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16476201 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgtcctctcctctccttcattttttagcaaatcaaac 16476116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35387558 - 35387268
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35387558 agatagaacagtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgcta 35387459  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  35387458 ttttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacctccagtt 35387359  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387358 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 35387268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 31004064 - 31004349
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||| ||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31004064 agaacagcgcaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgttttataggatttttgggggacgaaatactattttg 31004163  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  31004164 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaacatcagtttttgtcctgtcccgtgcctccagtttgtcc 31004263  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004264 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 31004349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26118458 - 26118172
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26118458 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 26118359  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  26118358 ggtattttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtc 26118259  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26118258 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcatacgcac 26118172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45491122 - 45490832
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaattt-gtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45491122 agatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttgtatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 45491023  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  45491022 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtt 45490923  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45490922 tgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtctttcattttttagcaaatcaaacgcac 45490832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Original strand, 16386781 - 16387069
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16386781 agatagaacagtacaatacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 16386880  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16386881 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 16386980  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16386981 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaactgttctgtcatgtccttcattttttag-aaatcaaacgca 16387069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 114 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1351681 - 1351386
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  1351681 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtattttt-tgttttatatgatttttgagagacaaaatgcta 1351583  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||    
T  1351582 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtt 1351483  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacataagg 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1351482 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacctaagg 1351386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 114 - 404
Target Start/End: Original strand, 16451054 - 16451345
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||||| || |||||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16451054 agatagaatagtacaacacatggcagaatagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 16451153  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  16451154 ttttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 16451253  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16451254 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttatgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaca 16451345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30105923 - 30105636
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30105923 agaacagtacaacacaaggcagaacaacactggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 30105824  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  30105823 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 30105724  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30105723 ctttacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcatttttttagcaaatcaaaagcac 30105636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 41972839 - 41973124
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  41972839 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttt-gagggacaaaatgtta 41972937  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  41972938 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtagtgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtt 41973037  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41973038 tgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 41973124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 51264422 - 51264712
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  51264422 agatagaacagtacaacacaagacagaatagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaaaggacaaaatgcta 51264521  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  51264522 ttttagtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtt 51264621  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51264622 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 51264712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28340550 - 28340262
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28340550 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaatttttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 28340451  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  28340450 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtt 28340351  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28340350 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgca 28340262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42513012 - 42512727
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  42513012 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaattctattttg 42512913  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  42512912 atattttagacaatttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 42512813  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42512812 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcac 42512727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24339884 - 24339595
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  |||||||    
T  24339884 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatgtttgggggac--aatgcta 24339787  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggttt-ggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  24339786 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgttgtggttttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 24339687  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24339686 ttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcac 24339595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 32270285 - 32270566
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||     |||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32270285 agatagaacagtacaacacaag-----acagaataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 32270379  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  32270380 ttttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 32270479  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270480 tgtcctctacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32270566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 50304583 - 50304868
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  50304583 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttg 50304682  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||  ||| | || |||||||||    
T  50304683 atattttagacaacttaaacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgcagagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtttcttgcctccagtttgtcc 50304782  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50304783 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 50304868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6029543 - 6029253
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  6029543 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttg 6029444  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||||||| |    
T  6029443 gtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttc 6029344  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctg-----tccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6029343 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 6029253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 141 - 398
Target Start/End: Original strand, 16437317 - 16437574
Alignment:
Q  141 acagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcg 240  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16437317 acagtacaggacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 16437416  T
Q  241 ggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaa 340  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16437417 ggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctctagtttgtcctgtagctgaaacagttttacaaa 16437516  T
Q  341 tcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16437517 tcaaacattggacaactagagttgttctattctgtccttcattttttagcaaatcaaa 16437574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 373
Target Start/End: Original strand, 12890165 - 12890425
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12890165 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 12890264  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  12890265 ttttggtatcttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 12890364  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcct 373  Q
    | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  12890365 tatcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 12890425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32289544 - 32289301
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  32289544 tatgacattgaataattttatgttttatataatttttgagggacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgt 32289445  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  32289444 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 32289345  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289344 agttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 32289301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Original strand, 7183845 - 7184134
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  7183845 agatagaacagtacaacacaagacagaacaatacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatacta 7183944  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  7183945 tattggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 7184044  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  7184045 tgtcctgtacctgaaacagttttacatatcaaacactggacaactaaagttattctgtcctgtctttcaaattttagcaaatcaaacgca 7184134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11772872 - 11772589
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11772872 aacaacacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggttttgaattattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggt 11772773  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    |||| | |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || | || || ||| | ||    
T  11772772 atttaaaacaatttgtaggtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcctccagattgccttg 11772673  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11772672 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcctgtccttcattttctagcaaatcaaacgcac 11772589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 50540271 - 50540561
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  50540271 agatagaacagtacaacacacgtcagaacagcacagggcaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatatgatttttgggggacaaaatgcta 50540370  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||    
T  50540371 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgaaggacaaaaatatgagtttatgtcctgtcccttgcctccagtt 50540470  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50540471 tgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagctgttttgttctgtcctttcttttttagcaaatcaaacgcac 50540561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 17887874 - 17888165
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgaggg-acgaaatgct 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||| |    
T  17887874 agatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttggggggacaaaatgtt 17887973  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  17887974 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 17888073  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17888074 ttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgttttgtcatgtcattcattttttagcaaatcaaatgcac 17888165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Original strand, 45658755 - 45659038
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||||||||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45658755 aacagcacaacacaagacagaatagcacatgacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgctattttggt 45658854  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    |||| | |||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||   || |||||||||||    
T  45658855 atttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgtctccagtttgtcctg 45658954  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45658955 tacttgaaacagttttacaaatcagacactagacaactggagttgttttgtcctgtccttcattttctagcaaatcaaacgcac 45659038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15540132 - 15539847
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15540132 agaacagcacaacacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattttg 15540033  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | || |||||||||||| ||| | || ||||||| |    
T  15540032 gtgttttagacaacttctacgtatgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaagacaaaagtttcaggttttgtcctgtctcttgcctccagtttgttc 15539933  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539932 tgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 15539847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17327896 - 17327606
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  17327896 agatagaacagtacaatacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcgttgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatatta 17327797  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  17327796 ttttggtattttagataatttgtacatgagacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgactccagtt 17327697  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17327696 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttttgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 17327606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 41968092 - 41967803
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||  ||| ||||||||| | ||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  41968092 agaacaacacaacacaaggcggaacaatacatgacaaattttttatgacaatgagtaattttttgttttatacaatttttgggagacaaaaggctatttt 41967993  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  41967992 ggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtc 41967893  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttag-caaatcaaacgcacat 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41967892 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagtcaaatcaaacgcacat 41967803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26765036 - 26764752
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||||||||| ||| |||||||||  |||||     ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26765036 agatagaacaacacaacacaaggcagaacaatataggacaaatttttatagcattgaattttttta-----tatacgatttttgagggacgaaatattat 26764942  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | || |||||    
T  26764941 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttcggtgagggacaaaaatataagtttttgtcctgtcctttgcctccagttt 26764842  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     || ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26764841 atcttgtacctaaaacaattgtacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtcttttattttttagcaaatcaaacgcac 26764752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 125 - 403
Target Start/End: Original strand, 1601111 - 1601387
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattt 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  1601111 cacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttgtacgatttttggtggacaaaatgctattttggtattt 1601210  T
Q  224 tagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacc 323  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||    
T  1601211 tagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa--atgagtttttgttctatcccttgcctccagtttgtcctgtacc 1601308  T
Q  324 tgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1601309 tgaaaccgttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttctgtcatgttcttca-tttttagcaaatcaaacgcac 1601387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 46154827 - 46155120
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  46154827 agatagaacagtataacacaagacataacggcacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgttttataagatttttgaaggacaaaatgtta 46154926  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttg-------gtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttaca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  46154927 ttttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtgctgtagtttgtagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcacc 46155026  T
Q  306 tctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    || ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46155027 tccagtttgtccagtacctgaaataattttacaaatcaaacactgaacaattagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 46155120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44738288 - 44737999
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||  |||    
T  44738288 agatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaataaaaa-cta 44738190  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |  |    
T  44738189 ttttgctattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggtcctgtcccttgcctccaagt 44738090  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  44738089 tgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaattagagttgttctgtcttgtctttcattttttagcaaaacaaacgcac 44737999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 118 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 38087238 - 38086973
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  38087238 agaacagtacaacataaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgaataatattttgctttatgcaatttttggggaacgaaatgctattttg 38087139  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | ||| |||    
T  38087138 gatttttagacaacttgtacttgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccattgcatccattttatcc 38087039  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt 383  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  38087038 tgtacttgaaactgttttataaatcaaacacaggacaactgaagttgttttgtcctatccttcatt 38086973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 125 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13994310 - 13994022
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaattt-gtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattt 223  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13994310 cacaatacaaggcagaacaacacaagacaaattttgtatgatattgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattt 13994212  T
Q  224 tagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacc 323  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || |||| | || | |||||| ||| |     
T  13994211 tagacaacttgtacatgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtcca 13994112  T
Q  324 tgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtcc----ttcattttttagcaaatcaaacgcacataagg 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||  ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13994111 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctatccttttttttttttttatcaaatcaaacgcacttaagg 13994022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 127 - 408
Target Start/End: Original strand, 5109671 - 5109950
Alignment:
Q  127 caacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttag 226  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||||| || | |||||| |  |||| | |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  5109671 caacacaaagcataacaccatatgacaaatttttacgacattgatttttttttt-ttttatacaatttttgggggacaaaatgttattttgc-attttag 5109768  T
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctga 326  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |||||| |||||||||    
T  5109769 acaacttgtactttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaacatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcttgtacctga 5109868  T
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacataag 408  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5109869 aacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcctgcacttcattttttagcaaatcaaacgcacttaag 5109950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 403
Target Start/End: Original strand, 10384300 - 10384579
Alignment:
Q  119 gaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||     
T  10384300 gaacagcacaacacagggcaaaacaacactggacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttga 10384399  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
      ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | ||||| ||    
T  10384400 atttttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcatccaatttgtact 10384499  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||  |||     ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10384500 gtacctgaaataattttacaaatcaaacactagacaactagagt-----tgttcagttcttcattttttagcaaatcaaacgcac 10384579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51703409 - 51703120
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  51703409 agatataacagaacaacacaaggcaaaacaatacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttataccatttt-gagggacaaaatgtta 51703311  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||    
T  51703310 tttttgtattttagacaacatgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtt-ggtgaggaacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgccttcagtt 51703212  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttag-caaatcaaacgcac 403  Q
    | |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51703211 tatcctgtacttgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttctgtcttgtccttcattttttagtcaaatcaaacgcac 51703120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 6144221 - 6143947
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||| || ||||    
T  6144221 cacaacataaggcagaacatcacaagacaaatttttatggtattgaataattttctgttttatatgatttttgggtgacaaaatgttatttttgtgtttt 6144122  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||  ||    
T  6144121 agacaacttctacgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttgccgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtctct 6144022  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6144021 gaaactgttttacaaatcaaacattggacaactgcagttgttctgtcctgtccttcattttgtatcaaatcaaac 6143947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 385
Target Start/End: Original strand, 16704689 - 16704925
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataa-ttttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaa 248  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||     
T  16704689 gacaaatttttatggcattaaataaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaaagctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaag 16704788  T
Q  249 agttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacac 348  Q
    ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16704789 agttgtgatgtggtttggtaagggacaaaaatatatgtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacat 16704888  T
Q  349 tggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttt 385  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16704889 tggacaattgaagttgttctgtcctgtcctttatttt 16704925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 49303548 - 49303311
Alignment:
Q  165 cattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggttt 264  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||    
T  49303548 cattgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgttattttagtattttagacaacttgtacgtaggataaaaaattgtgctgtggttt 49303450  T
Q  265 ggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||   || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  49303449 ggtgaaggacaaaaatatgagtttttctcttgtcccttgtctccagtttgtcttatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttg 49303350  T
Q  365 tcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49303349 ttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgcac 49303311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Original strand, 25539795 - 25539968
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttta 225  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  25539795 acaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 25539894  T
Q  226 gacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc 299  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25539895 aacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcc 25539968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42705438 - 42705242
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||    
T  42705438 tatggcaatgagtaattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgacatttcagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgt 42705339  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagt-ttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaa 355  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||   || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  42705338 ggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttttcccgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaa 42705242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20495137 - 20494927
Alignment:
Q  115 gatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20495137 gatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctat 20495038  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  20495037 tttggtattttagacaacttgtacgtgggaca-----------------ttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 20494955  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaat 341  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||    
T  20494954 gtcctgtacctgaaacaattttacaaat 20494927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 281
Target Start/End: Original strand, 38663064 - 38663227
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38663064 agaacaacacaatataagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttg 38663163  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaata 281  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  38663164 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaata 38663227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 25343438 - 25343213
Alignment:
Q  131 acaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaa 230  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||    
T  25343438 acaagacagaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgctttatgcgatttttgagggacgaaatactattttggatttttggacaa 25343339  T
Q  231 cttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcc-cttacatctagtttgtcctgtacctgaaac 329  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||  || |||| |||||||||||||  ||||||    
T  25343338 cttgtacgtgcgacaaaaagttgtactatggtttagtgaaggacaaaaatatgtgtttttatcctatccatttgcatccagtttgtcctgtatatgaaac 25343239  T
Q  330 agatttacaaatcaaacactggacaa 355  Q
     | |||| ||||||||| | ||||||    
T  25343238 tgttttataaatcaaacgcaggacaa 25343213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3415054 - 3414814
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactg 258  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| || |  ||    
T  3415054 tatggcattgagtaatttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaactagtacgtgggataaaaaattatgatg 3414955  T
Q  259 tggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactg 358  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    || || |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |     
T  3414954 tagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcgtctccagattgtccagtacctaaaatagttttacaaatcaaacactggataatta 3414855  T
Q  359 aagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
     ||||||  |||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3414854 gagttgttttgtcatatccttcatattttaacaaatcaaac 3414814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 404
Target Start/End: Original strand, 7837152 - 7837352
Alignment:
Q  205 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttac 304  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||  | | |||||||| |||||||| |    
T  7837152 aaatactattttgatattttagacaacttgtctgtgagacaaaaagttgtgatgtgatttggtaatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtcccttgc 7837251  T
Q  305 atctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  7837252 ctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttctatcatatccttcatttttttagcaaatcaagcgcac 7837351  T
Q  404 a 404  Q
    |    
T  7837352 a 7837352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 50382608 - 50382411
Alignment:
Q  155 atttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    |||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50382608 atttttatggtattgaataatattttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 50382509  T
Q  255 actgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt---acatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacact 349  Q
      ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||    | || |||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50382508 gttgtggtttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctccagtttgttatgtccctgaaacagttttaaaaatcaaacact 50382411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 272 - 403
Target Start/End: Original strand, 8838983 - 8839114
Alignment:
Q  272 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtc 371  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| || | || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  8838983 gacaaaaatatcagtttttgtcatgtccatttcctccagtttgtcttgtaccagaaacagttttacaaatcaaacattggacaattggagttgttctgtc 8839082  T
Q  372 ctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8839083 ttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 8839114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 309 - 402
Target Start/End: Original strand, 38663230 - 38663323
Alignment:
Q  309 agtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38663230 agtttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 38663323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 403
Target Start/End: Original strand, 21071737 - 21071831
Alignment:
Q  309 agtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21071737 agtttgtcatgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattgaagttgttctgtcatgtacttcattctttagcaaatcaaacgcac 21071831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 403
Target Start/End: Original strand, 26733579 - 26733772
Alignment:
Q  210 ctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatcta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||  | |||||| |||  |||||| ||| | |||||||||| ||||| |    ||||    
T  26733579 ctattttggtattttagacaacttgtacatgaggcaaaaagttgtgttatggtttagtgggggacaagaatttcagtttttgtcatgtccatcgtctcta 26733678  T
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||| || |   |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26733679 gtttgtccggtcctaaaaacagttttacaaatcaaacatcgtacaactgaagttgtcatgtcttgttcttcattttttagcaagtcaaatgcac 26733772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 114 - 302
Target Start/End: Original strand, 570314 - 570504
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| |||| |||| || |||||| ||||| | |||||| |||| | | |||||| |||||||  |||  ||||| |||    
T  570314 agatagaacaacacaacataaagcagaacaacacaagataaatttttatggtactgaatacttttttatcttatacaatttttggtggaaaaaatgttat 570413  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt--actgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 302  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  570414 tttgatattttagacaacttatacgcgagacaaaaagttgtgcattgtggtttggtgagggacaaaaatttctgtttttatcatgtccctt 570504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 269
Target Start/End: Original strand, 34663858 - 34664010
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| |||||| |||| | || |||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  34663858 agaacagtacaacataaggtagaagagcacatgacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatatgatttttgagtgacaaaatgttatttt 34663957  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtga 269  Q
    | |||||||||||| || || | ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  34663958 gatattttagacaatttataagtgggtcaaaaagttgtgttgtggtttggtga 34664010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 404
Target Start/End: Original strand, 7837430 - 7837593
Alignment:
Q  242 gacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaat 341  Q
    |||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||  | | |||||||| |||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  7837430 gacaaaaagttgtgatgtgatttgataatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtcccctgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttataaat 7837529  T
Q  342 caaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  7837530 caaacactgaacaactgaagttattctatcatatccttcatttttttagcaaattaagcgcaca 7837593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 504637 - 504383
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||| ||||| |||||||||| | | || | |||| | ||||||| ||||| |||| | ||||||  ||  | |||||||||||  | || ||| ||||     
T  504637 agatggaacaacacaacacaaagtagaataacacatgtcaaatttttatggtattggacaatttttagtcctctacgatttttggtgaacaaaaagctac 504538  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||  | |||||| ||||  ||||||| | | |||||||||  |||||||| | || |||||    
T  504537 tttggtattttagacaacttctatgtgggacaaaaaattgtgttatggtttagtgagagacaaaattttcagtttttgtgttgtcccttgcctcaagttt 504438  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcct 368  Q
    ||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  504437 gtcttgtccctaaaacaattttgcaaatcaaacgctgtacaactgaagttatcct 504383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40811405 - 40811328
Alignment:
Q  326 aaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40811405 aaacagttttataaatcaaacgctggacaactaaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 40811328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 47242665 - 47242477
Alignment:
Q  210 ctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatcta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||  | |||  |||  || |||||| | |||||||||| |||| | ||| || |    
T  47242665 ctattttggtattttagacaactaacacgtgagacaaaaagttgtactaggttttaatgagagaaaaaaattt-agtttttgtcttgtcacctacctcca 47242567  T
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||| ||| ||  |||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  47242566 gtttgtcatgtcccataaacaattttacaaattaaacaccatacaactgaagttgtcatgtcatgtcatttattttttagcaaatgaaac 47242477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 391
Target Start/End: Original strand, 6771393 - 6771573
Alignment:
Q  211 tattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctag 310  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||  |||| ||| ||||  ||||| ||| | |||||||||| ||||||||   ||||     
T  6771393 tattttgatattttagtcaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtgatttagtgagtgacaagaattttagtttttgtcttgtcccttgtctctaa 6771492  T
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagca 391  Q
    ||| || ||| ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| | || ||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  6771493 tttatcatgtccctaaaacagttttataaatcaaacaccgcacaaataaaattgtcatgtcttgtccttctatttttagca 6771573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 404
Target Start/End: Original strand, 39792826 - 39793024
Alignment:
Q  205 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttac 304  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||| | ||  ||      
T  39792826 aaatgttattttattattttagacaatttgtacgtgaaacaacaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaagaatttcaatttttgtcatatcttttgt 39792925  T
Q  305 atctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
     || | ||| || ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39792926 ctccaatttatcttgtccctaaaacagttttgcaaatcaaacactgtacaacctaagttgtcatttcatgtcctcca-tttttagcaaatcaaacgcaca 39793024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16643360 - 16643288
Alignment:
Q  180 tgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16643360 tgttttatacgattttgg--ggacgaaatggtatttttgtattttagacaacctgtatgtgggacaaaaagttgt 16643288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 403
Target Start/End: Original strand, 25539981 - 25540035
Alignment:
Q  349 tggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25539981 tggacaactggagttgttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgcac 25540035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16643238 - 16643189
Alignment:
Q  354 aactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643238 aactgcagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 16643189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 399
Target Start/End: Original strand, 17291612 - 17291791
Alignment:
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt-acatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| || || | ||  |||    
T  17291612 tattttatataacttgtacgagggacaaaaagttttgttgtggtttagtgg-ggacaaaaatttatgtttttgtcctgtctcttgacttcaactta-tcc 17291709  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||| |   |||||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  17291710 tgtcctaaaaacagttttacaaatcaaataccgtacaactggagttgtcctgtcatgttctcaattttttagcagatcaaac 17291791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23799652 - 23799604
Alignment:
Q  245 aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtc 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23799652 aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtc 23799604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 254
Target Start/End: Original strand, 46447665 - 46447732
Alignment:
Q  187 tacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  46447665 tacgatttttgatggacaaaagactattttgatattttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgt 46447732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 21071661 - 21071727
Alignment:
Q  123 agcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatac 189  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21071661 agcacaacacaaggcagaacaatacatgacaaatttttattacattgaataattttttgttttatac 21071727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Original strand, 8838870 - 8838987
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat-gtttta----tacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||| |||||||||||  | || | ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    || |||||||| |||||||||||| |    
T  8838870 agaacaacacaacacaagatagaaaaacacataacaaatttttatagcattgaataatttttttgttttaattatatgatttttgggggacgaaatgcca 8838969  T
Q  213 ttttggtattttagacaa 230  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  8838970 ttttgatattttagacaa 8838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23799603 - 23799531
Alignment:
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  23799603 aacagttttataaatcaaacactaaacaactgaaattgttgtgtcatgtcattcaatttttagcaaatcaaac 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52030434 - 52030330
Alignment:
Q  131 acaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaa 230  Q
    |||||||||||||||||| | |||| || || || ||||||| ||||| |||| |||| |||||||   |||| |||  ||||||| |||||||||| ||    
T  52030434 acaaggcataacagcacatggcaaacttttacggtattgaatcattttttgttatatatgattttttgtggacaaaaaactatttttgtattttagataa 52030335  T
Q  231 cttgt 235  Q
    |||||    
T  52030334 cttgt 52030330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Original strand, 31574492 - 31574566
Alignment:
Q  324 tgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31574492 tgaaatagttttacaaatcaaa-attgtacaactgaagttgtcatgtcatgtgcttcatttcttagcagatcaaac 31574566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46815906 - 46815835
Alignment:
Q  183 tttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    |||| ||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  46815906 tttagacggtttttggcggacaaaatgttattttggtattttagacaactagtacgtgggaaaaaaggttgt 46815835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32468021 - 32467927
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||   | || |||  |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32468021 tatggtattgactaattttttgtcttatatgattttttgtgaacaaaaaactattttgatattgtagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgt 32467927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20494909 - 20494876
Alignment:
Q  370 tcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20494909 tcctgtccttcattttttagcaaatcaaaagcac 20494876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Original strand, 15324141 - 15324201
Alignment:
Q  170 aataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaa 230  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||    
T  15324141 aataattttttgtcttatacgatgtttgatggacaaattactattttgatattttagacaa 15324201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 70)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 34338728 - 34339018
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34338728 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 34338827  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  34338828 ttttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggtcaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 34338927  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338928 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 34339018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9733102 - 9732812
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9733102 agatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 9733003  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  9733002 ttttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtt 9732903  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9732902 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 9732812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 114 - 398
Target Start/End: Original strand, 35114703 - 35114988
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35114703 agatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 35114802  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35114803 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 35114902  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35114903 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagttgtcctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaa 35114988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2645258 - 2644969
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2645258 agatagaacagtacaacataaggcagaacagcactggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgcta 2645159  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||    
T  2645158 ttttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctct-ccttgcctccagtt 2645060  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645059 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 2644969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7761698 - 7761455
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  7761698 tatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgt 7761599  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  7761598 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 7761499  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761498 agttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 7761455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 17540632 - 17540923
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  17540632 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacatattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatacta 17540731  T
Q  213 tttt-ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  17540732 tttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 17540831  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17540832 ttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttctgtcatatctttcattttttaacaaatcaaacgcac 17540923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 114 - 404
Target Start/End: Original strand, 32497833 - 32498124
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  32497833 agatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgtta 32497932  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||    
T  32497933 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggtacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtt 32498032  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32498033 tgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgccatgcccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 32498124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 18685754 - 18686044
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  18685754 agatagaacagtacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttataggatttttgagggacaaaatgtta 18685853  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||    
T  18685854 ttttaatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcctccagtt 18685953  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685954 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 18686044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30326503 - 30326214
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  30326503 agatagaaccgtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggaattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatacta 30326404  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||    
T  30326403 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagagacaaaa-tatgagtttttgtcctgtcccctgcctccagtt 30326305  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326304 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgctctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 30326214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 33366528 - 33366814
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33366528 agatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 33366627  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  33366628 ttttggtattttagacaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 33366727  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33366728 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagaattgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 33366814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 402
Target Start/End: Original strand, 44284561 - 44284836
Alignment:
Q  128 aacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44284561 aacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgttattttag 44284660  T
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctga 326  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||    
T  44284661 acaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttagtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctga 44284760  T
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44284761 aacagttttacaaatcaaacactgaacaactctagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 44284836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 37308574 - 37308864
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  37308574 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaatttttttgttt-tacgattttttagggacaaaatacta 37308672  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  37308673 ttttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 37308772  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37308773 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgcac 37308864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Original strand, 7258814 - 7259104
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa-tgct 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || |    
T  7258814 agatagaacagtacaacacaaggcagaatagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaaatgtt 7258913  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  7258914 attttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 7259013  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7259014 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacagctagagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 7259104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 33889165 - 33889451
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33889165 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacataacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttt 33889264  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  33889265 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggaaaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 33889364  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33889365 ctgtatctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagtaaatcaaacgcac 33889451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 6896091 - 6896376
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  6896091 agaacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgccttttgggggacgaaatgctattttg 6896190  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | || |||||||      
T  6896191 gtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgttgtttggtgagggacaaaaatttcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgttt 6896290  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6896291 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtctttcattttttaacaaatcaaacgcac 6896376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5279006 - 5278720
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5279006 agatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgcta 5278907  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  5278906 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 5278807  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| |  |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5278806 tgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacctaacaattagagttgttctgtcatatcctt-attttttagcaaatcaaacg 5278720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19513861 - 19513571
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||| | ||| || |||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19513861 agatagaacagtacaatagaagacagaacagcacgggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 19513762  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||    
T  19513761 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctcccgtt 19513662  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19513661 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggaaaactagagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatgaaacgca 19513571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 40692223 - 40692505
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40692223 agatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 40692322  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||        |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||    
T  40692323 tt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgttctgtggtttggtgagggacaaaaatacgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtt 40692414  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40692415 tgtcttgtacctaaaacagtttcacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 40692505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 380
Target Start/End: Original strand, 16104192 - 16104459
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16104192 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 16104291  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  16104292 ttttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatt 16104391  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttc 380  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  16104392 tgtcgtgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttctgtcctatccttc 16104459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32766672 - 32766386
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||||  ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  32766672 agaacaacacaatgcaagggagaacaacacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttg 32766573  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa-gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  32766572 gtattttagacaacctgtacgtaggacaaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 32766473  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32766472 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattatagttgttctgttctgtccttcgttttttagcaaatcaaacgcac 32766386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 114 - 385
Target Start/End: Original strand, 42706276 - 42706549
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42706276 agatagaacaatacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgct 42706375  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||    
T  42706376 attttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttatcccttgcctccagt 42706475  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttt 385  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||    
T  42706476 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtcctttatttt 42706549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 142 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10400013 - 10399756
Alignment:
Q  142 cagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgg 241  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |     
T  10400013 cagcacatgataaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgacttttgggggacaaaatgctattttggatttttagacaacttatacatga 10399914  T
Q  242 gacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaat 341  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10399913 gacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtatcttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaat 10399814  T
Q  342 caaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10399813 caaacactgaacaactgaagttgttctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10399756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28824724 - 28824439
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||  ||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||     
T  28824724 agaacagcacaacataagacagaacaatacatgacaaatttttatgacatggaataaatttttgttttatacaatttttggggtgcgaaatgctatttta 28824625  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| ||| |    
T  28824624 gtattttagacaacttgcacgtgagataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgacccttgactccagtatgtgc 28824525  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28824524 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 28824439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30798635 - 30798371
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaattt-gtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 238  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30798635 aacagcacatgacaaattttgtatggtatttagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacg 30798536  T
Q  239 cgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagt-ttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttac 337  Q
     |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30798535 tgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttttcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttac 30798436  T
Q  338 aaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798435 aaatcaaacactggacaactagagttgttctgt-ctgcccttcattttttagcaaatcaaacgcac 30798371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3913627 - 3913343
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  3913627 agaacaacacaacacaaggcagaacaacataggataaatttttatggcattgaataatattttgttttatacgatttttggggagcaaaatgctattttg 3913528  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||| | || ||||||||     
T  3913527 gtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaacatgtgagtttttgtcctgtttcttgcctccagtttgtca 3913428  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3913427 tatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttttgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 3913343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 39461232 - 39461518
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39461232 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgcta 39461331  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttg---tactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatcta 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||   |  |||| |||||||| |||||||||    | ||||||||||||| ||| | || |    
T  39461332 ttttggtattttagacagcttgtacgtgagataaaaagttgtgttgttgtgatttggtgagggacaaaaa---caatttttgtcctgtcacttgcctcca 39461428  T
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461429 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 39461518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40832642 - 40832351
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataatt--ttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||   ||||||| |||  || |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  40832642 agatagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatattattgaattattatttttgttttatacgatttttgggggacgaaatact 40832543  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||    
T  40832542 attttggtattttagactacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatccgtttttgtcctgtcccttgcctccagt 40832443  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  40832442 ttgtcttgtacctgaaatagctttacaaatcaaacactggacaacttaagttgttatgtcatgtgcttccttttttagcaaattaaaagcac 40832351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 2085990 - 2086270
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2085990 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgccattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 2086089  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||         || | || ||||    
T  2086090 ttttggtatttcagacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtactgtggtttgggtagggacaaaaatatgagtttttg---------ttgcctccagtt 2086180  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086181 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt-ctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 2086270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 13829361 - 13829634
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13829361 agaacagcacaacacaaggcagaacatcacagaacaaatttttatgatattgaataattttttgttttatatgatttttgagggacgaaatgatattttg 13829460  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13829461 gtgttttagataacttgtacctgggacaaaaagttgtgatgtggtctagtgatggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcc 13829560  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||            || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13829561 tgt------------ttcacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 13829634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 42365495 - 42365781
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||    
T  42365495 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttaggggacaaaatgtta 42365594  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  42365595 ttttggtattttagacaacttgtccgtgatataaaaagttgtgttgtggtttgatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtt 42365694  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42365695 tgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactagacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 42365781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 125 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16178041 - 16177769
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    |||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  16178041 cacaacacaagatagaacaacacacgacaaatttttatagcattgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacgaaattccattttggtatttt 16177944  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||| || | || ||||| |||||||| |    
T  16177943 agacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagcgacaaaaatatcagtttatgtcctgtccattgcctccagtttatcctgtactt 16177844  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16177843 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgttatgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 16177769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38993239 - 38992953
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||   |||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  38993239 agataggacagcacaacataaggcagaacaacacaagacaaatt---atggtattgaataattttctgtattatattatttttgggtgacgaaatgctat 38993143  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  || | ||||||||   ||||||||||||||||||| | || |||||    
T  38993142 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgacgaggaacaaaaattgtagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 38993043  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38993042 gtcctcttcctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttattctgtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgcac 38992953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 116 - 387
Target Start/End: Original strand, 4641436 - 4641706
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4641436 atagaacagtacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttataccattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctatt 4641535  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |||||  || || ||||||    
T  4641536 ttggtattttaaacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaatatgaatttttgttccgtccc--acctccagtttg 4641633  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttttt 387  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4641634 tcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttctgtcttttccttcatttttt 4641706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 118 - 399
Target Start/End: Original strand, 11114795 - 11115074
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||  | | || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  11114795 agaacaacacaacacaagacagaacaatataagaaaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgattgttagcggacgaaatactattttg 11114894  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  11114895 gaattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcc 11114994  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11114995 tgtaactg-aacag-tttacaaatcaaacattggacaattggagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 11115074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Original strand, 30712780 - 30713067
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  30712780 agaacaacacaacacagcgcataacagcaaaggacaaatttttatggtattgaataattttttgttttatatgatttttg-gggatgaaatgatattttg 30712878  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtt----tggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||    |||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || || ||    
T  30712879 gtgttttagacaacttctacgtgggataaaaagttgtgttgtggttaatttggtgagggacaaaaatttcagtttgtgtcctgtcccttgcctccaggtt 30712978  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30712979 gttctgtccctgaaacagtattacaaatcaaacactggataactggagttgttttgtcatgtctttcattttttaacaaatcaaacgca 30713067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 165 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12672594 - 12672402
Alignment:
Q  165 cattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggttt 264  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||  ||||||||    
T  12672594 cattgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgggataaaaacttgtgttgtggttt 12672495  T
Q  265 ggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaact 357  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12672494 ggtgagggacaaaaatatgagattttgtcccgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacacaggacaact 12672402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27462967 - 27462685
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27462967 agaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttatatgacattgaataattttttgtttt-tacgatttttagggcacgaaatgctattttg 27462869  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||| |||||  |||| | | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||   |  ||||||||     
T  27462868 gtatttttgacaatatgtatg-gtgataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaataacagcttttgtcttgtcccttgtctacagtttgtca 27462770  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  27462769 tgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttatatcctgtctttcatcttttaaaaaatcaaacgca 27462685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 37004041 - 37003861
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcaca-ggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37004041 agatagaacagtacaatacaaggtaaaacagcacaaggacaaattttttatggcattgaataattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgtt 37003942  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37003941 attttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgt 37003861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 297
Target Start/End: Original strand, 9717182 - 9717326
Alignment:
Q  153 aaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagtt 252  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9717182 aaatttttatggcattgggtaattttttgtttgatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 9717281  T
Q  253 gtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 297  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9717282 gtgctgtggtttggtgagggacaaaaacatgagtttttgtcctgt 9717326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 301
Target Start/End: Original strand, 26418845 - 26419029
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||  || ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  26418845 agaacagcacaacgcaaggcagaacaacacatgacaaaaattttatggcaatgagtaattttttgttttatacaatttttgggggataaaatgttatttt 26418944  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccct 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26418945 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcatgtccct 26419029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38623419 - 38623190
Alignment:
Q  166 attgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttg 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | || |||||| ||    ||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38623419 attgaataattttttgttttatatgatttatgggagatgaaatgtta----ggcgttctagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 38623324  T
Q  266 gtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 365  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| | ||| || | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38623323 gtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttttccattgcctcaagtttgtcctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacattggataactgaagttgt 38623224  T
Q  366 cctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
      |||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38623223 tatgtcatgtccttcaatttttaacaaatcaaac 38623190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12939469 - 12939202
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataat--tttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||  ||  ||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12939469 agaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttaataacattgaatattgttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattt 12939370  T
Q  216 tggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||         
T  12939369 tggtatcttagacaacttgtacgtgagataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcccttgcctccag----- 12939275  T
Q  316 cctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 401  Q
                 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12939274 -------------cagttttataaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttatccttcattttttagtaaatcaaacgc 12939202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26981781 - 26981606
Alignment:
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || | ||  |||    
T  26981781 ttttggtattttagacaacttgtacgtagaacaaaaagttttgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcatttgcctcccgtt 26981682  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttttta 388  Q
    |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26981681 tgtcttgtatctggaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgttctgtccttcatttttta 26981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 304
Target Start/End: Original strand, 1247078 - 1247256
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||       
T  1247078 agaacaacacaacacaaagcagtacagtacaagacaaatttttatggcattgaataattttttattttatacgatttttggggaacgaaatgctatt--- 1247174  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttac 304  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1247175 -----ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtctcttac 1247256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41366189 - 41365992
Alignment:
Q  206 aatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttaca 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||| |     
T  41366189 aatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatctcttgcc 41366090  T
Q  306 tctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    || |||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||| || |||| || |||||| || || |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  41366089 tccagtttgtcatgtccctgaaactgtttcacaaatcaaacattgcacaattggagttgttctatcttgtttttcagtttttagcaaatcaaacgcac 41365992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 348
Target Start/End: Original strand, 8112259 - 8112453
Alignment:
Q  156 tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa-tgctattttggtatttt-agacaacttgtacgcgggacaaaaagttg 253  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||| |||| | |||||   || |||||||||||    
T  8112259 tttgtatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggaaaaaaatgttattttggtatttttagactatttgtatctggaacaaaaagttg 8112358  T
Q  254 tactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacac 348  Q
    |  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||| | || ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8112359 tgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtattgtctcttgcctccagtttgttctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacac 8112453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 311 - 403
Target Start/End: Original strand, 9717317 - 9717409
Alignment:
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717317 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 9717409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 309 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37863342 - 37863248
Alignment:
Q  309 agtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37863342 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaagcgcac 37863248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 318 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37003858 - 37003773
Alignment:
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37003858 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaacttgagttgttatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 37003773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 398
Target Start/End: Original strand, 41934500 - 41934785
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || | | ||  |||||||| || || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| |||    
T  41934500 agatagaacaacacaacacaagataaaataacgcataacaaatttttacggtattgaatgattttatgtcttatatgatttttggtggacaaaatgttat 41934599  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| |||| | |||| ||| | |||||||||| ||||  || |||| |||||    
T  41934600 tttggtattttagacaacttatacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaagtacaagaatttcagtttttgtcttgtcttttgcatccagttt 41934699  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaac-tgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
     ||   | ||| || ||| ||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  41934700 atctcatcccttaatcagttttacaaatcacacactatacaacttgagtttgtcatatcatgttcttcattttttaacaaatcaaa 41934785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18793300 - 18793180
Alignment:
Q  276 aaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgt 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||| |||    
T  18793300 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc--tttgtactgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgagcaactagagttgttctgtcatgt 18793203  T
Q  376 ccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18793202 ccttcattttttagcaaatcaaa 18793180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45463254 - 45463112
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgc 239  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||     
T  45463254 aacaacacatgacaaatttttattgcattaaataattttttgttttatacgatttctg-gggacgaaatgttattttgatattttagacaatctgtacgt 45463156  T
Q  240 gggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatg 283  Q
      |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  45463155 atgacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagtgacaaaaatatg 45463112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 282
Target Start/End: Original strand, 20907520 - 20907675
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttta 225  Q
    ||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20907520 acaacacaagggagaacaacatatgacaaatttttatgtcattgaataattttttgttttgtacgatttttgggggataaaatgttattttagtatttta 20907619  T
Q  226 gacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatat 282  Q
     |||| ||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  20907620 tacaatttgtacataggacaaaaaattgttctgtggtttggtga-gtacaaaaatat 20907675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18793431 - 18793308
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| |||||| |||| | |||| |||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||    
T  18793431 atagaacagtacaacataaggtagaacatcacaagacaaattttttatgggattgagtaattttttgttttatacaatttttggaggacaaaatgttatt 18793332  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18793331 ttggtattttagacaacttgtacg 18793308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Original strand, 37088216 - 37088303
Alignment:
Q  138 ataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttta 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37088216 ataacagcacaagacaaatttgtatggtattgaacaattttgtgtcttatccgatgtttgatggacaaaatgctattttggtatttta 37088303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 299 - 399
Target Start/End: Original strand, 83374 - 83474
Alignment:
Q  299 ccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  83374 ccttacctctagtttgtcatgtcccacaaacagttttacaaatcaaacactgtgcaactgaagttgtcttgtcatgtccttcgttttttaacagatcaaa 83473  T
Q  399 c 399  Q
    |    
T  83474 c 83474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26981856 - 26981777
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa--tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttg 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26981856 aacagcacaacacaaggcagaacagcacaggataaatttttttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttg 26981777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15303308 - 15303133
Alignment:
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||  ||| ||||| | | |||||||||| |  ||||||||| |||  ||| | |||||||||||    
T  15303308 ggtattttagacaacttacatgtggaacaaaaagttgtgatgtagtttgataaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtgtcttgcctctagtttgtc 15303209  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaa 392  Q
    ||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||  | || | || ||||| |||| | ||||| ||||||||||||    
T  15303208 ctgtctctgaagcagttttacaaatcaaatactatataatttaaattgtcttgtcatatcctttattttttagcaa 15303133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 315
Target Start/End: Original strand, 130265 - 130418
Alignment:
Q  166 attgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaa-----agttgtactgtg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||   || ||||     | ||||  ||||    
T  130265 attgaataattttatgtattatataatttttgtaggatgaaatgatattttggtattttagataatttgtacgtaagataaaaatattaattgtgttgtg 130364  T
Q  261 gtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    ||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  130365 gtttggtgagggacaaaaatttaag-ttttgttctgtccctaacctctagtttgt 130418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 399
Target Start/End: Original strand, 18278926 - 18279104
Alignment:
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    ||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||   ||| ||| |||| | |||||||| | ||||||||| | |||| ||   || |||||||| |    
T  18278926 tattttatacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgacgtgatttagtgaggaacaaaaattttagtttttgtgccgtcctttgtctccagtttgtctt 18279025  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    || ||| |||||  |||| |||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18279026 gtccctaaaacat-tttataaatcaaacattgcacaactaaa-ttgtcatgtcctgtccttaattttttagcagatcaaac 18279104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35473135 - 35472983
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||||||  || |||||| | |||| | |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35473135 gacaaattttgatggtattaaataatttttggtcttatacaaatttttatggacaaaaggatattatggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 35473036  T
Q  250 gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 302  Q
     ||| |  ||||||| |||| | | || ||| | |||||||| | ||||||||    
T  35473035 attgcagagtggtttagtgaggaataagaatttcagtttttgacttgtccctt 35472983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 349
Target Start/End: Original strand, 26796247 - 26796382
Alignment:
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||| |||| ||||| |||| | | ||||| |||| ||| || | |  |||||    
T  26796247 tttggtattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgcgttgtgctttagtgagggacacaaattttaatttttatcctatccattgcctgaagttt 26796346  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacact 349  Q
    ||  ||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  26796347 gttttgtccttgtaacagttttacaaatcaaacact 26796382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13249547 - 13249406
Alignment:
Q  138 ataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtac 237  Q
    |||||| |||| |||| |||| || | |||||||||||||| | || ||| | || ||||| |||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13249547 ataacaacacaagacacatttttaagacattgaataattttttattatattctatatttgatggacaaaagtctattttgatattttaaacaacttgtac 13249448  T
Q  238 gcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaa 279  Q
       ||||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||||||    
T  13249447 tttggacaaaaaattgtgttgtggtttagtggtagacaaaaa 13249406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 404
Target Start/End: Original strand, 1247256 - 1247294
Alignment:
Q  366 cctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1247256 cctgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgcaca 1247294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6453315 - 6453249
Alignment:
Q  284 agtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactg 350  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  6453315 agtttttgtcttgtcccttacctccggtttatcctgtccctgaaacaattttaaaaatcaaacactg 6453249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31194020 - 31193954
Alignment:
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  31194020 tttacaaatcaaacattatacaactgaagttgttatgttttatccttcattttttagcatatcaaac 31193954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31212653 - 31212587
Alignment:
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||||    
T  31212653 tttacaaatcaaacattatacaactgaagttgtcatgttttatccttcattttttagtatatcaaac 31212587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45463098 - 45463004
Alignment:
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattt-tttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||   || ||||||| ||||||  |||| | || ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45463098 gtttgtcttgtacctgaagcagttttacaaatcaaatgttgaacaactggagttgttatgtcatctctttcatttgtttaacaaatcaaacgcac 45463004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40876663 - 40876514
Alignment:
Q  246 aaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaa 345  Q
    |||||||||  ||||||||  |||  || |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||  || |||| ||| | | ||| || |||||||||||||    
T  40876663 aaaagttgtgttgtggtttaatgaaagataaaaatttgagcttttgtcatgtcccttacctccggtgtgtcatgtccttaaaatagttttacaaatcaaa 40876564  T
Q  346 cactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatc 395  Q
    || ||||||| | || ||||| | |  ||| ||| |||||||||||||||    
T  40876563 cattggacaaataaaattgtcttatattgttctttattttttagcaaatc 40876514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16062052 - 16061980
Alignment:
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| || ||| || || |||||| ||||||||||||    
T  16062052 aacagttttacaaatcaaaaactgtacaacttgagttgtcttgacctatcttttatttttgagcaaatcaaac 16061980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26994398 - 26994108
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26994398 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgcta 26994299  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  26994298 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccagtt 26994199  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994198 tgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 26994108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 47953112 - 47953402
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47953112 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 47953211  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  47953212 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtt 47953311  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47953312 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcgttcattttttagcaaatcaaacgcac 47953402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 36769742 - 36769456
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36769742 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgcta 36769643  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  36769642 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 36769543  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769542 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctattctgtccttcattttttagcaaatcaaac 36769456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 10932730 - 10932440
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10932730 agatagaacagtacaacacacggcagaacagcataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 10932631  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  10932630 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 10932531  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932530 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 10932440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3922876 - 3922582
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3922876 agatagaccagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 3922777  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  3922776 ttttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtt 3922677  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacataa 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922676 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacataa 3922582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 43158859 - 43158569
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43158859 agatagaacagtacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 43158760  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  43158759 ttttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 43158660  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158659 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 43158569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11322058 - 11321769
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11322058 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 11321959  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||    
T  11321958 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccgttgcctccagtt 11321859  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11321858 tgtcctgtacctgaatcagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgca 11321769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 114 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41211374 - 41211086
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa-tgct 211  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  41211374 agatagaacaatacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttttagggataaaaatgct 41211275  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41211274 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagt 41211175  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41211174 ttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaacttgagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 41211086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26371982 - 26371692
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| ||  || |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26371982 agatagaacagtacaacataaaacagaacatcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 26371883  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  26371882 ttttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 26371783  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26371782 tgtcctgtacctgaaatagttttgcaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 26371692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 40753081 - 40753367
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40753081 agaacagtacaacacaaagcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 40753180  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  40753181 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 40753280  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40753281 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacgagagttgttctgtcatgtcccttattttttagcaaatcaaacgcac 40753367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Original strand, 21784793 - 21785082
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  21784793 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaatcttttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttggaggacaaaatgcta 21784892  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  21784893 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtt 21784992  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21784993 tgtcatgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 21785082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 116 - 399
Target Start/End: Original strand, 18386449 - 18386732
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18386449 atagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt 18386548  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||    
T  18386549 ttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtcccttgcctccagtttg 18386647  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18386648 tcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 18386732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 46633619 - 46633904
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46633619 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 46633718  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||     || ||||    
T  46633719 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcttgttcc-----tccagtt 46633813  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633814 tgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 46633904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Original strand, 43368128 - 43368410
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43368128 agaacagcacaatacaagggagaacagcacatgacaaatttttatcacattgaataattttttgttttatacgattttggagggacaaaatgctattttg 43368227  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||| | || |||||||||    
T  43368228 atattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcccgtctcttgcctccagtttgtcc 43368327  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43368328 tatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 43368410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 397
Target Start/End: Original strand, 18470606 - 18470888
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  18470606 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgtta 18470705  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||    
T  18470706 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgt--cttgcctccagtt 18470803  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaa 397  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18470804 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactcgacaactagagttgttctatcctgtccttcattttgtagcaaatcaa 18470888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 140 - 402
Target Start/End: Original strand, 44748643 - 44748906
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 238  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748643 aacaacacagaacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacg 44748742  T
Q  239 cgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttaca 338  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44748743 tgggacaaaaagttgtattgtggtttggtgagggacaaaaatttgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttaca 44748842  T
Q  339 aatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44748843 aatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 44748906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32873942 - 32873659
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32873942 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 32873843  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  32873842 ttttggtatttcagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 32873743  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32873742 tatccggtacctgaaacaattttacaaatcaaacaatggacaactagagtt---ttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32873659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 120 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43214091 - 43213811
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43214091 aacagcacaacacaaggtagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaatcattttttgttttataggatttttgaggcacgaaatgctattttggt 43213992  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||| || |||||||| | |  |||||||||||    
T  43213991 atttttgacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagcttttatcttgtcccttgccttcagtttgtcctg 43213892  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43213891 tactgaaaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgttctgtcctgttcttcattttttagcaaatcaaacg 43213811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 119 - 403
Target Start/End: Original strand, 48894645 - 48894929
Alignment:
Q  119 gaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  48894645 gaacagtacaacacaaggtaaaacagcactggacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacaaaatgttattttgg 48894744  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
      |||||||  | ||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  48894745 atttttagatgatttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtact 48894844  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48894845 gtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 48894929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 126 - 403
Target Start/End: Original strand, 29661257 - 29661534
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29661257 acaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgtgggacaaaatgctattttggtatttt 29661356  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||    
T  29661357 agataacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacct 29661456  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||  |||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661457 gaatcagttctacaaatcaaacactggacaactagagttgttctat-ctatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 29661534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 1870058 - 1870347
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttg-agggacgaaatgctat 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  1870058 atagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttttagggacaaaatgttat 1870157  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  1870158 tttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 1870257  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1870258 atcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgcactgtccttcattttttagcaaatcaaatgcac 1870347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 9913452 - 9913736
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9913452 agaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatggaattgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttg 9913551  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  9913552 gtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagcgac-aaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcc 9913650  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9913651 tgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcac 9913736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 9927140 - 9927424
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9927140 agaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatggaattgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttg 9927239  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  9927240 gtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagcgac-aaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcc 9927338  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9927339 tgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcac 9927424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 47316824 - 47316581
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||  |||    
T  47316824 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtaatttagacaacttgcatgtgagacaaaaagttgtgttgt 47316725  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||      
T  47316724 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactag 47316625  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47316624 agttattctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 47316581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30849419 - 30849129
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  30849419 agatagaacagtacaacacaagacagaacaacacaggacaatttttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgtta 30849320  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  30849319 ttttggtattttatacaacttgtatatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtt 30849220  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30849219 tgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaatcattggacaactagaattgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 30849129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 403
Target Start/End: Original strand, 11250558 - 11250829
Alignment:
Q  128 aacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11250558 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctagtttggtattttag 11250657  T
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctga 326  Q
    ||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  11250658 acaactat-----gggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11250752  T
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250753 aacaattttacaaatgaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 11250829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 43189416 - 43189125
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgaggg-acgaaatgct 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||  || ||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||| || |||| ||    
T  43189416 agatagaacagtacaacacaaggcagaatagtgcatgacaaattttttatggcattgagtaatttgttgtttcatacgatttttggggggacaaaatact 43189317  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  43189316 attttggtattctagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacctccagt 43189217  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43189216 ttgtcctgtacctgaaacatttttataaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcatgtcctccattttttagcaaatcaaacgcac 43189125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 1363560 - 1363848
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| |||| || |||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1363560 agatagaacaacacatcagaaggtagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttg-ggtacgaaatgctat 1363658  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| | || |||||    
T  1363659 ttttgtatttttgacaacctgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgatgagggacaaaaatatcagcttttgtcatgtcccttgcctccagttt 1363758  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1363759 gtcctgtacatgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttgtcctatcctttattttttagcaaatcaaaggcac 1363848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 11822156 - 11822435
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattt 215  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11822156 atagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggacaaatttttatggcattgaat--tttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattt 11822253  T
Q  216 tggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    ||   ||||| ||||| ||      ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11822254 tgaatttttaaacaacgtg------ggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgt 11822347  T
Q  316 cctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11822348 cctgtacctcaaacagttttacgaatcaaacactggacaagtgaagttgttctgtcctgtcctttattttttagtaaatcaaacgcac 11822435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 155 - 403
Target Start/End: Original strand, 38301307 - 38301555
Alignment:
Q  155 atttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38301307 atttttatgacattgaataattttttgtttaatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgt-cgtgggacaaaaagttgt 38301405  T
Q  255 actgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggaca 354  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38301406 gttgtggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 38301505  T
Q  355 actgaagttgtcctgtcctgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38301506 attggagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgcac 38301555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Original strand, 329397 - 329687
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  329397 agaacagcacaacacaaggcataacagtacatgacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttg 329496  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| || | || ||||||| |    
T  329497 gtgttttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgttc 329596  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaac------tgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||      || ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  329597 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactggagttggagttgttttgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 329687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34295572 - 34295294
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34295572 agaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttg 34295473  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||       ||| | || ||||||||     
T  34295472 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttgt-------cttgcctccagtttgtca 34295380  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  34295379 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcctatcttttattttttagctaatcaaacgcac 34295294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 149 - 403
Target Start/End: Original strand, 17237034 - 17237288
Alignment:
Q  149 ggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaa 248  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||| | |||||||    
T  17237034 ggacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgagacaaaa 17237133  T
Q  249 agttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacac 348  Q
    ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  17237134 agttgtgttgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcatgttccttgcatccagtttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacac 17237233  T
Q  349 tggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17237234 tggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 17237288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22724204 - 22723915
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  22724204 agataggacaacacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctat 22724105  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||   |||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22724104 ttttgtattttatacaacttgtacgtgggataaaaagttgcgttgtggtttggcgatggacaaacattgcagtttttgtcctgtcccttacctcgagttt 22724005  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22724004 gtccggtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcacatccttcattttttatcaaatcaaacgcac 22723915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 120 - 399
Target Start/End: Original strand, 37966903 - 37967182
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||||||||||||| ||| || || |||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  37966903 aacagcacaacacaaagcagaatagtacataacaaatttttatggtattaaataattttttgttttatacgatttttttgggacgaaatgctattttgga 37967002  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
     ||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||    
T  37967003 tttttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtggtctagtgaaagacaaaaatatgggtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtcatg 37967102  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37967103 tacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggagaactaaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 37967182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Original strand, 48445450 - 48445733
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  48445450 aacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattttcgt 48445549  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| | || ||||||| |||    
T  48445550 gttttagacaacttgtatgcgagacaaaaagttgtcctgtgatttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctg 48445649  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | ||| |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48445650 tccctcaaacagttttacaaattaaacattggataactggagttgttctgtcttttccttcattttttaacaaattaaacgcac 48445733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 20127214 - 20127500
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataatt----ttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattt 215  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||| |||    || |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  20127214 aacaacacaacacaagatagaacagcacatgacaaatttttgtagcattgaattattatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgtcattt 20127313  T
Q  216 tggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||||| | || |||||||    
T  20127314 tggtattttacacaaattgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgt 20127413  T
Q  316 cctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  20127414 cctgtacctgaaatagttttaaaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctatctttcatttattagcaaatcaaacgca 20127500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3892199 - 3891930
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  3892199 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcatatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttacacgatttttgaggaacaaaatgcta 3892100  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  3892099 ttttggtattctagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 3892000  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    |||||                |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3891999 tgtcc----------------ttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 3891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 46448810 - 46448527
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||  |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  46448810 aacagtacaagacaaggcaaaacaacattggacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttaggggacgaaatgttattttgga 46448711  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
     ||||||| || || |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| | |    
T  46448710 tttttagataatttatacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgacggacaaaaatatgagtttttatcatgtcccttgcatccagtttgtaccg 46448611  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  46448610 tacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactgaagttgttctatcttgtcttctattttttaacaaatcaaacgcac 46448527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23349463 - 23349219
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  23349463 agatagaacaaaacaacataaggtagaacagcacatgacaaatttttataacattgaataattttttgttttctacgattgttgggggacgaaatgtcat 23349364  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||    
T  23349363 tttagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgttctgtcccttgcctccagttt 23349264  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactg 358  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23349263 gtcatgtacttgaaatagttttacaattcaaacactggacaactg 23349219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 227 - 403
Target Start/End: Original strand, 16963174 - 16963350
Alignment:
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctga 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  16963174 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttgataagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctctagtttgtcatgtacctga 16963273  T
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16963274 aacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 16963350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30599181 - 30598939
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  30599181 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgaaattgagtaatttgttgttttatacgatttttaggggacaaaatgtta 30599082  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||    
T  30599081 ttttggtattttagataatttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagcttttgtcctgtcccttgcctccagtt 30598982  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaa 355  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  30598981 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacagtggacaa 30598939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22724703 - 22724412
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| || |||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  22724703 agatagaatatcacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttctggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggcgacgaaatgctat 22724604  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||   || ||||||| | |||||| | || |||||    
T  22724603 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgcgctgtggtttggtgagggacaaaaattgcagcttttgtcatatcccttgcctccagttt 22724504  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacat 405  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||| | ||||||   ||||||| ||||||    
T  22724503 gtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacgctgaacaactggaattgttctgtcctatcctttactttttattcaatcaaaagcacat 22724412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 115 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26910578 - 26910294
Alignment:
Q  115 gatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||| ||| || ||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||| | |||||| | |||||    
T  26910578 gataggacatcataacacaaggtagaacagcgcaagacaaattt-tatggtattgaataattttctgatttat--gatttttgggtgacgaattactatt 26910482  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||   ||||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  26910481 tttgtatttttgacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttg 26910382  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26910381 ccctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactgtagttgttctgtcatgtccttca-tttatatcaaatcaaacgcac 26910294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Original strand, 26652795 - 26652965
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |    
T  26652795 aacagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggcggacaaaatgctattttgat 26652894  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagttttt 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  26652895 attttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggacaaaaatatcagttttt 26652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Original strand, 47947682 - 47947823
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47947682 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 47947781  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47947782 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 47947823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 403
Target Start/End: Original strand, 34519527 - 34519720
Alignment:
Q  210 ctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatcta 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||| | || |    
T  34519527 ctatttttgtattttagacaacttgtacctgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctcca 34519626  T
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | ||||| ||| |||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  34519627 gcttgtcatgtccctgaaactgttttacaattcgaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtcctttattttttattaaatcaaacgcac 34519720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 347
Target Start/End: Original strand, 21133297 - 21133528
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgctattt 215  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21133297 agaacatcacaacacaaggcagaacaacacagtacaaattttttatgacattgagtaatttttttgttttatacgatttttgggagacgaaatgctattt 21133396  T
Q  216 tggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||  ||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||| | |  |||||||    
T  21133397 tggtattttagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttattgagggaaaataatatcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgt 21133496  T
Q  316 cctgtacctgaaacagatttacaaatcaaaca 347  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21133497 cctgtacttgaaacagttttacaaattaaaca 21133528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 131 - 290
Target Start/End: Original strand, 34117392 - 34117551
Alignment:
Q  131 acaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaa 230  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34117392 acaagacagaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcattttagacaa 34117491  T
Q  231 cttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagttttt 290  Q
    |||||||  || ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34117492 cttgtacatggaacaaaaaattgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt 34117551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41665747 - 41665564
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  41665747 agataggacagcacaacataacgcataatagcacaagacaaatttttatggtattgaataattttctgttttatataatttttgggtgacgaaatgctat 41665648  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  41665647 ttttgtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgt 41665564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 302
Target Start/End: Original strand, 46408818 - 46408999
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||       ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  46408818 agatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacat------tttttatggcattgagtaattttttattttatacgatttttgagagacaatatgctat 46408911  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 302  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46408912 tttgatattttagacaacttgtatgtcggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtccctt 46408999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15035413 - 15035127
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttta 225  Q
    |||||||||  || |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  || | ||||| ||||||| |||||||    
T  15035413 acaacacaaaacagaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtacgatttttggtgggcaaaatgttattttgatatttta 15035314  T
Q  226 gacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctg 325  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||||  |||||| |||||| | |||| ||| | | |||| ||||||||| || | || |||||||||||| | ||    
T  15035313 gacaatttgtatgtggtacaaaaagttgtgttgtggtctggtgaggaacaagaatttcaattttcgtcctgtcctttgcttccagtttgtcctgtccttg 15035214  T
Q  326 aaacag--atttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacataagga 410  Q
     | |||   ||||||||| ||||| || | || |  ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15035213 gagcagttttttacaaattaaacattgtataattagagttgtcatgtcatgtatttcattttttagcaaatcaaacgcacctaagga 15035127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 302
Target Start/End: Original strand, 22631671 - 22631849
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattt 223  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  22631671 cacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattattagagcattaaataatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatatcattttggtattt 22631770  T
Q  224 tagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 302  Q
    |||||||||||||||    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||    
T  22631771 tagacaacttgtacgtataacaaaaagttatgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagttattgtcgcgtccctt 22631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Original strand, 16963051 - 16963149
Alignment:
Q  136 gcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaact 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963051 gcataacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaact 16963149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 403
Target Start/End: Original strand, 26700572 - 26700689
Alignment:
Q  286 tttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttt 385  Q
    |||||||||| || ||| | || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||    
T  26700572 tttttgtcctttctcttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactggacaactggaattgttatgtcatgtccttcatttt 26700671  T
Q  386 ttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  26700672 ttaccaaatcaaacgcac 26700689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Original strand, 46627139 - 46627259
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| | |||||||| |||| ||||    
T  46627139 tatggcattgaataattttttgttttatacaatttttgggagacgaaatactatttttgtattttagacaatccgtacgtgagacaaaaaattgtgctgt 46627238  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaat 280  Q
    |||||| ||| ||| ||||||    
T  46627239 ggtttgatgagggataaaaat 46627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Original strand, 48699334 - 48699500
Alignment:
Q  127 caacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttag 226  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||  || ||||| ||||||| | |||  || || ||||||||||   ||||  ||  |||||||||||||||||    
T  48699334 caacataaggcagaacagcacaagacaagcttttatggtattgaatgacttttggtcttgtacgattttttgtggacataagtctattttggtattttag 48699433  T
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtc 293  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  48699434 acaacttgtacgtggaacaaatagttgtgttgtggtttagtgagggacaagaatttcagtttttgtc 48699500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 12982225 - 12982301
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggac-aaatttgtatggcattgaataattttatgttttatac 189  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12982225 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatac 12982301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 29372940 - 29372720
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    |||||| |||| || ||||  ||| |||||| || ||||| ||| |||||||||  || ||||| ||||||||  |||  ||| | || ||||  |||||    
T  29372940 cacaacgcaagtcagaacaatacaagacaaacttttatggtattaaataatttttggtcttatatgatttttggtggataaaaggttaatttgaaatttt 29372841  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |  |||  ||  || ||| |||    
T  29372840 agacaacttgtacatggaacagaaagttgtgttgtggtttagtgacggacaaaaattttagtttttgtcgtgtccctcatctctgattcttcatgtccct 29372741  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaa 345  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  29372740 gaaacatatttacaaatcaaa 29372720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 368
Target Start/End: Original strand, 2048881 - 2049128
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| || ||| | |||||| |||  |||| |||  || |||||| |||||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  2048881 aacaacacaacacaaggcagaacaacacatgataaactcgtatggtattacataagttttggtcttatacaattttttatggacaaaaa-ctatttttgt 2048979  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    |||||  | ||||| |||| ||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||| |   |||||||  ||| |||| | |||||||||||| |    
T  2048980 attttttataacttctacgtgggacaaaatgttttgttgtggtttagtgatggacaaaaatttatatttttgttatgttccttgcctctagtttgtcccg 2049079  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcct 368  Q
    | ||  |||||  ||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  2049080 tcccaaaaacaatttttcaaatcaaacattatacaattgaagttgtcct 2049128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41665573 - 41665485
Alignment:
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||| | |||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  41665573 tttgtcctgttcttgaaacagttttataattgaaacactggacaactggagttgttctgtcctatcctttattatttatcaaatcaaac 41665485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29456013 - 29455772
Alignment:
Q  119 gaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||| || ||||| |||||||||| ||  || ||||| |||||| | || || ||| ||||||||||    
T  29456013 gaacaacacaacataaggcaaaacaacacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggtcttatatgattttggtgg-acaaaacgctattttgg 29455915  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    ||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||  ||| |||  | || |||||| ||| | | |||||||  |||||||| | || | ||| | ||    
T  29455914 tatttt--ataactagtatgtgggacaaaaagttgtgttgttgttaagcgaaggacaagaatttcactttttgttatgtcccttgcctccaatttctact 29455817  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagtt 363  Q
    ||  |||||| ||  |||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  29455816 gtctctgaaatagtgttacaaatcaaacattgcacaactgtagtt 29455772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3359837 - 3359773
Alignment:
Q  286 tttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactg 350  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3359837 tttttgtcatgtcccttacctctagtttatcttgtgccagaaacagttttacaaatcaaagactg 3359773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29773584 - 29773522
Alignment:
Q  339 aatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 401  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||||    
T  29773584 aatcaaaccttgtacaactgaagttgtcttgtcatgtcatttattttttagcagatcaaacgc 29773522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30260079 - 30259957
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||   | |||||||| |||||| | |  |||   ||     
T  30260079 agatagaacaacgcaacacaatgcataaaagtacaagacaaatttttatgatattgaataatttttgatcttatacgagttttgatgaataaaaaattaa 30259980  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgta 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  30259979 tttgatattttagacaacttgta 30259957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29992813 - 29992729
Alignment:
Q  167 ttgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagtt 252  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||  |||| |||   ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  29992813 ttgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaattattttg-tattttagataacttgtacgtgagacaaaaagtt 29992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 298
Target Start/End: Original strand, 42332073 - 42332166
Alignment:
Q  205 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 298  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||| | || | ||| |  ||||||||||||||    
T  42332073 aaatgttattttgatatttaagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaagaactagaatttatgtttttgtcctgtc 42332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14608560 - 14608500
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataatttt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||| || ||||||    
T  14608560 agaacaacacaacacaaggcataacaacataggacaaacttttatggtattaaacaatttt 14608500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16028084 - 16028013
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttg 197  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16028084 cacaacacaaggcataacaacataggacagatttttatggtatttaacaatttt-tgtcttatatgatttttg 16028013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21408420 - 21408332
Alignment:
Q  166 attgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||| ||| | | |||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||    
T  21408420 attgaataattctttgtcttatacaatttttgatggacaaaaggttcttttcgtattttaaacaacttatacgtaggacaaaaaattgt 21408332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12349337 - 12349047
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12349337 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 12349238  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  12349237 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgtgctgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 12349138  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349137 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 12349047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 2134989 - 2135279
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2134989 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaagtgcta 2135088  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  2135089 ttttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctctagtt 2135188  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135189 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 2135279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 28675709 - 28675999
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28675709 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 28675808  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||    
T  28675809 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctccagtt 28675908  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28675909 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgttcttcattttttaacaaatcaaacgcac 28675999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51259946 - 51259656
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||    
T  51259946 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacaaaatgtta 51259847  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  51259846 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 51259747  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259746 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 51259656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 115 - 403
Target Start/End: Original strand, 44116859 - 44117148
Alignment:
Q  115 gatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44116859 gatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 44116958  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  44116959 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 44117058  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44117059 gtcctgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtccagtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 44117148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1344873 - 1344587
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| |||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1344873 agatagaacagtacaacacaagacagaacatcacatgacaatttttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 1344774  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||    
T  1344773 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttctgtcctgtcccttgcctccagtt 1344674  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344673 tgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 1344587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31883183 - 31882898
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31883183 agaacagcacaatacaagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 31883084  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||| | || |||||||||    
T  31883083 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcgtgtctcttgcctccagtttgtcc 31882984  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882983 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 31882898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 114 - 405
Target Start/End: Original strand, 29584794 - 29585086
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| | || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29584794 agatagaacagtacaacataaggcagaacagtacagaacaaattttttattgcattgagtaattttttattttatacgatttttgaaggacaaaatgcta 29584893  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  29584894 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtt 29584993  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacat 405  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29584994 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcacat 29585086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51925367 - 51925084
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51925367 aacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggt 51925268  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    |||  | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||| ||    
T  51925267 attaaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcatg 51925168  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51925167 tacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactggagttgttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgcac 51925084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 40094422 - 40094712
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40094422 agatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatgcgatttttgagggacaaaatgcta 40094521  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  40094522 ttttggtattttagacaatttgtacgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 40094621  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094622 tgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 40094712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 20609810 - 20609544
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20609810 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttatatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 20609711  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||    
T  20609710 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtc 20609611  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20609610 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 20609544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21221526 - 21221237
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21221526 agatagaacagtacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgcta 21221427  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |    
T  21221426 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccag-t 21221328  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21221327 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcac 21221237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 126 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42636557 - 42636279
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42636557 acaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttaaacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatttt 42636458  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||    
T  42636457 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcctatacct 42636358  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42636357 aaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcac 42636279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 394
Target Start/End: Original strand, 34026590 - 34026867
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34026590 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34026689  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  34026690 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 34026789  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaat 394  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34026790 ctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaaatagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaat 34026867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 47958598 - 47958308
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||||||| || |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47958598 agatagaacactacaatacaaggcagaacagcatagaacaaattttttatgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 47958499  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  47958498 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 47958399  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47958398 tttcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatactgtccatcgttttttagcaaatcaaacgcac 47958308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33364939 - 33364654
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||| ||||||| |||||  | |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33364939 agaatagcacaatacaagagagaacaacccaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 33364840  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  33364839 atattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgctgaggggcaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 33364740  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33364739 tgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactgaagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 33364654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50386617 - 50386332
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  50386617 agaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataattttttgttttatacaatttttggggaacaaaatgctattttg 50386518  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||| |||| ||| | || |||||||||    
T  50386517 atattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgttgaggcacaaaaatatcaatttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcc 50386418  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50386417 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 50386332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3864840 - 3864553
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  3864840 agatagaacattacaacataacgcataacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttg-gggacaaaatgcta 3864742  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||    
T  3864741 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtt 3864642  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  3864641 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactaaagttgttctgtcctgtc--tcattttttagcaaatgaaacgcac 3864553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 404
Target Start/End: Original strand, 24571200 - 24571491
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||    
T  24571200 agatagaacaatacaacataaggcagaacagtacatgacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttattcgatttttgggggacaaaatccta 24571299  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  24571300 tttttgtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 24571399  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24571400 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacacaca 24571491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Original strand, 20255011 - 20255253
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  20255011 tatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta-gtgggacaagaagttgtgctgt 20255109  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  20255110 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 20255209  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255210 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 20255253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25860587 - 25860312
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  25860587 agatagaacagcacaacaaaaggcataacaacacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggagaacaaaatgcta 25860488  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  25860487 tttcggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtt 25860388  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttttta 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  25860387 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcaagtccttcatttttta 25860312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 125 - 402
Target Start/End: Original strand, 3964219 - 3964496
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaattt-gtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattt 223  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3964219 cacaatacaaggcagaacagcacaagacaaattttgtatgatattgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattt 3964317  T
Q  224 tagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacc 323  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || |||| | || | |||||| ||| |     
T  3964318 tagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtcca 3964417  T
Q  324 tgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3964418 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctatccttcattttttatcaaatcaaacgca 3964496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25927493 - 25927203
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  25927493 agatagaacagtacaatacaaggtagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtgattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgtta 25927394  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  25927393 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgttttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 25927294  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25927293 tgtcctgtatttgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagttgttctgtcctgtccatcattttttagcaaatcaaacgcac 25927203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 54622958 - 54622678
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| ||||   | |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54622958 agataaaacaacagaacacaaggcagaaca---cgggacaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctat 54622862  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  54622861 tttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttcgtgagcgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatttagttt 54622762  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54622761 gt-cagtacctgaaacagttttacaaatcaaataccggacaactgaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 54622678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 145 - 399
Target Start/End: Original strand, 21373882 - 21374135
Alignment:
Q  145 cacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggac 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21373882 cacaggacaaatttttatggcattgaataatttt-tattttatacgatttttggccgaagaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac 21373980  T
Q  245 aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaa 344  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21373981 aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 21374080  T
Q  345 acactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  21374081 acactagacaactgaagttgttatgtcattttcttcattttttagcaaaccaaac 21374135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 53557955 - 53557671
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  53557955 aacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgg 53557856  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  53557855 tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaactatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcct 53557756  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  53557755 gtacctaaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagttgctctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaatgcac 53557671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4851622 - 4851339
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4851622 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaagacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 4851523  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | || |  |    
T  4851522 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgggttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcctgtcccttgcctccaaat 4851425  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4851424 tgtcttgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt-----tgttctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 4851339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39053005 - 39052715
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt--atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||| |  || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  39053005 agatagaacagtacaacacaagatagaacaacacatgacaaatttttttatagcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgtt 39052906  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | || |||    
T  39052905 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagt 39052806  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39052805 ttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagttgttttgtcttgtctttcattttttagcaaatcaaacgca 39052715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 134 - 403
Target Start/End: Original strand, 38213293 - 38213563
Alignment:
Q  134 aggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaact 232  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38213293 aggcagaacagcacatgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatggtattttggtattttagacaact 38213392  T
Q  233 tgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacaga 332  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||| |||||||||||      
T  38213393 tgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttcgtgagtgacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagattgtcctatacctgaaacaat 38213492  T
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38213493 tttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtctttcattttttagcaaataaaacgcac 38213563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Original strand, 29645991 - 29646275
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29645991 aacaacacaacataaggtataacatcacaagacaaatttttatggcattaaataatttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgg 29646090  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| | || ||||| || |    
T  29646091 tattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatatgtttttgtcctatcccttgcctccagtttatcgt 29646190  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29646191 gtacctaaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtcttgtccttcattttttagaaaatcaaatgcac 29646275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 165 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 49749025 - 49748787
Alignment:
Q  165 cattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggttt 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  49749025 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 49748926  T
Q  265 ggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttg 364  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  49748925 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactaaacaacttgagttg 49748826  T
Q  365 tcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49748825 ttctatcctatccttcattttctagcaaatcaaacgcac 49748787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 130 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3867798 - 3867525
Alignment:
Q  130 cacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagaca 229  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  3867798 cacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataatttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttagaaa 3867699  T
Q  230 acttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaac 329  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||   || ||| ||| |||| ||||||||    
T  3867698 acttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcatgtctcttgtctccagtatgttctgtccctgaaac 3867599  T
Q  330 agatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3867598 agttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 3867525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 117 - 403
Target Start/End: Original strand, 5442213 - 5442488
Alignment:
Q  117 tagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattt 215  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5442213 tagaacagtacaatacaaggtataacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattt 5442312  T
Q  216 tggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||              ||||||||| | || |||||||    
T  5442313 tgatattttagacagcttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaa------------ctctgtcccttgcctccagtttgt 5442400  T
Q  316 cctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442401 cttgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 5442488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26282553 - 26282315
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26282553 agatagaacagtacaacacaagacagaacagcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 26282454  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||    
T  26282453 ttttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagagacaaaaatataagtttttgtcccgtctcttacctccagtt 26282354  T
Q  313 tgtcctgtacctga---aacagatttacaaatcaaacac 348  Q
    |||| ||||||| |   || || ||||||||||||||||    
T  26282353 tgtcttgtaccttaaataatagttttacaaatcaaacac 26282315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 402
Target Start/End: Original strand, 19906767 - 19906970
Alignment:
Q  199 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  19906767 gggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtc 19906866  T
Q  299 ccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    |||| | || ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19906867 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgtccttcattttttaacaaatcaat 19906966  T
Q  399 cgca 402  Q
    ||||    
T  19906967 cgca 19906970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 145 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45691034 - 45690782
Alignment:
Q  145 cacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggac 244  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |||    
T  45691034 cacatgacaaatttttatagcattgaataatttt-tgttttatacgatttttggaggacgaaatgcgattttggtattttagacaacttatgcgtgagac 45690936  T
Q  245 aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaa 344  Q
    |||||||||| |||||||     || ||| |||||||| |||||||||||||||| || | || | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45690935 aaaaagttgtgctgtggt-----gagggagaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttatcctgtacctgaaacagttttgcaaatcaa 45690841  T
Q  345 acactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45690840 acactggacaactgaagttgttctatcctgtccttcactttatagcaaatcaaacgcac 45690782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22484908 - 22484619
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  22484908 agataggacaacacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatataatttttgggtgacgaaatgctat 22484809  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||  | | ||||||||   || ||||||| |||||||| | || |||||    
T  22484808 ttttgtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggcaaggaacaaaaattgtagcttttgtcatgtcccttgcctccagttt 22484709  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22484708 gtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaatcactggacaattggagttgttctgtcctgtccttcattttttatcaaatcaaacgcac 22484619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Original strand, 51296547 - 51296788
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||  |||    
T  51296547 tatggtattgagtaattttttgttttatacgattttttggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttaggacaaaaaattgtgttgt 51296646  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |      
T  51296647 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaattag 51296746  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  51296747 agttgttctgttctgtcttt--atttttagcaaatcaaacgcac 51296788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 50678716 - 50679007
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat--gttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| | | || ||||||||| |||   ||||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || | ||||| ||    
T  50678716 agatagaatagcacaacataaggtataatatcgcaagacaaatttttatattattgaattattttttttgttttataggatttatgtggaatgaaatact 50678815  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | || | || |||    
T  50678816 attttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatcagtttttgtcctgttctttgcctccagt 50678915  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50678916 ttgtcctgtacctgaaacagtttttcaaatcaaacactggacaacttgaattgttatgtcttgtacttcattttttagcaaatcaaacgcac 50679007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3695449 - 3695183
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||    || ||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  3695449 agaacagtacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgggggataaaatactattttg 3695354  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||               |||||||||||||||||| | || ||||||||     
T  3695353 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaggttgtgatgtggtttggtga---------------gtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtca 3695269  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3695268 tgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 3695183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 410
Target Start/End: Original strand, 24721490 - 24721701
Alignment:
Q  199 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 298  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||| | || ||||| | |||||||||||||||    
T  24721490 gggatgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttgttgaggtaccaaaattttagtttttgtcctgtc 24721589  T
Q  299 ccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    | |||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  24721590 ctttacctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaattaaa 24721689  T
Q  399 cgcacataagga 410  Q
    ||||| ||||||    
T  24721690 cgcacctaagga 24721701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Original strand, 10747141 - 10747406
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgaggg-acgaaatgctatttt 216  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  10747141 agaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggggggacaaaatgctatttt 10747240  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    | ||||||||||||||||||||                  ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| || |||   || ||||||||    
T  10747241 gatattttagacaacttgtacg------------------tgtggtttgctgacgaacaaaaatatcagtttttgtcctatctcttgtctccagtttgtc 10747322  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10747323 ctgtacctaaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaattgttttgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacg 10747406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41683075 - 41682929
Alignment:
Q  257 tgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaac 356  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41683075 tgtggtttgctgagggacaaaagtatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 41682976  T
Q  357 tgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41682975 tgaagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 41682929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 403
Target Start/End: Original strand, 6179378 - 6179635
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgc 239  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||       ||     
T  6179378 aacaacacaagacgaatttttatggtattgaataattttctttattatatgattttttggtgacgaaatgttatttttgtattttagaca-------cgt 6179470  T
Q  240 gggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatgg-acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttaca 338  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| | ||||||    
T  6179471 gtgacaaaaagttgtgctgtggtttggcgaggggacaaaaattacagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgacctgtttctgaaactgttttaca 6179570  T
Q  339 aatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6179571 aatcaaacactggacaactggagttgttttatcctgtccttcattttttataaaatcaaacgcac 6179635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 196 - 388
Target Start/End: Original strand, 52300439 - 52300633
Alignment:
Q  196 tgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcct 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  52300439 tgagggacgaaatgatattttggtgttttagacaacttgtact-gggacaaaaaattgcgttgtggtttggtgatggacaaaaatttcagtttttgtcct 52300537  T
Q  296 gtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactgg---acaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttttta 388  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52300538 gtcccttacctgcagtttgtcccgtctctgaaacagttttatgaatcaaacattggacaacaaccgaagttgttctgtcatgtccttcatttttta 52300633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53046807 - 53046671
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53046807 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 53046708  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    ||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||    
T  53046707 ttttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgt 53046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41695040 - 41694926
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgc 239  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |     
T  41695040 aacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttcagtattttagacaacttgtatgt 41694941  T
Q  240 gggacaaaaagttgt 254  Q
    |||||||||||||||    
T  41694940 gggacaaaaagttgt 41694926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 405
Target Start/End: Original strand, 44267691 - 44267947
Alignment:
Q  143 agcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcggg 242  Q
    |||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  44267691 agcacaagacaaatttttatcgtattcaataattttttgttttatatgatttttggatgacgaaatgctatttttgtattttagacaatttgtatgtggg 44267790  T
Q  243 acaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatc 342  Q
    | |||||||| |  |||||||||| || |||||     || | |||||||| |||||||||| |  |||||||| | | ||| |||| | ||||||||||    
T  44267791 ataaaaagttatgttgtggtttggcgagggaca-----attattttttgtcatgtcccttacctacagtttgtcatat-cctaaaactgttttacaaatc 44267884  T
Q  343 aaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacat 405  Q
    |||||  | |||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  44267885 aaacatcgaacaactgaagttgttcgatcatgtccttcattttttatcaaataaaacacacat 44267947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 309 - 403
Target Start/End: Original strand, 43175590 - 43175684
Alignment:
Q  309 agtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43175590 agtttgtcctatacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 43175684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 298
Target Start/End: Original strand, 25954407 - 25954554
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| || | | ||||||||    
T  25954407 gacaaatttttatgatattgaataattttttattttatacgctttttg-gggacgaaatgttatattagtattttaaacaacttatatgtgagacaaaaa 25954505  T
Q  250 gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 298  Q
    ||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25954506 gttgtgctgtaatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcgtgtc 25954554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34351442 - 34351303
Alignment:
Q  205 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttac 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |    
T  34351442 aaatgttattttgatattttagacaacttgtatgtgcgacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaataatttttgtttttgtcgtgtctatttc 34351343  T
Q  305 atctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaa 344  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34351342 ctctagtttgtcatgtccctgaaacagttttacaaatcaa 34351303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39215543 - 39215404
Alignment:
Q  205 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttac 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | ||||| ||| | ||  |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  39215543 aaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattatgatttggttcggtaaggggtaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttac 39215444  T
Q  305 atctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaa 344  Q
     ||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  39215443 ctccggtttgtcctgttcttgaaacagttttacaaatcaa 39215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 396
Target Start/End: Original strand, 44000217 - 44000462
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||  |||| |||  ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44000217 gacaaacttttatggtattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaactatttttgtatttcagataacttgtacgtgggacaaaaa 44000316  T
Q  250 gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacact 349  Q
     ||||  |||||||| |||| ||| |||||  |  ||||||||| ||||| || | |  ||||| || | | ||  |||||| ||||||||| ||||||     
T  44000317 attgtgatgtggtttagtgagggaaaaaaaattctgtttttgtcatgtcctttgccttgagtttatcatttcccaaaaacagttttacaaatgaaacacg 44000416  T
Q  350 ggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatca 396  Q
    | ||||||  ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  44000417 gtacaactagagttgtcatgtcatgtcattca-tttttagcaaatca 44000462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 53046668 - 53046605
Alignment:
Q  282 tgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  53046668 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaa 53046605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 249
Target Start/End: Original strand, 32621841 - 32621924
Alignment:
Q  166 attgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32621841 attgaataattttttgttgtatacaatttttgatggacaacatattattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaa 32621924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 210
Target Start/End: Original strand, 43175488 - 43175585
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgc 210  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||||||||| || |||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43175488 agatagaacagtataatacaagacagaacagcacacgataaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 43175585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Original strand, 25395570 - 25395653
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaactt 233  Q
    |||||| || |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||   | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25395570 gacaaacttttatgacattgcattattttttgttttatacgatttttagtgaacaaaatgttattttggtattttagacaactt 25395653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 399
Target Start/End: Original strand, 26847349 - 26847532
Alignment:
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa-gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |  |||| |||  | | |||||  ||| | ||||||||||||||| ||| | || | |||||    
T  26847349 ggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaaagttttgttgtgattttataagggacatgaatttcagtttttgtcctgtctcttgcctccaatttgt 26847448  T
Q  316 cctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
      | |  || |||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  26847449 tatatcacttaaacagttttacaaattaaacactatacaagtggagttgtcatgtcatatgcttcattttttagcaaatcaaac 26847532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8067136 - 8067056
Alignment:
Q  200 ggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaat 280  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||    
T  8067136 ggacaaaaagctattttgatattttatataacttgtacgtgtgacaaaaagttgtactatgattttgtgaaggacacaaat 8067056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 403
Target Start/End: Original strand, 8253664 - 8253882
Alignment:
Q  184 ttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatg 283  Q
    |||||| |||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||| ||||||   ||||||| || |  ||||| ||  |     
T  8253664 ttatacaatttttgatgaataaaatgttattttggtattttagacaacttttaattggggcaaagagttgtgtcgtggtttagt-agagacaagaacttc 8253762  T
Q  284 agtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt 383  Q
    ||||||| || ||| ||||   || |||||||| ||| | |||||||  |||||||||| |||| |  ||||||  ||||||| |||| | |||||||||    
T  8253763 agtttttatcatgttccttgactccagtttgtcttgtccttgaaacaactttacaaatcgaacattatacaactagagttgtcttgtcttatccttcatt 8253862  T
Q  384 ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  8253863 ttttagtagatcaaacgcac 8253882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 53046560 - 53046517
Alignment:
Q  282 tgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  53046560 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctg 53046517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 364
Target Start/End: Original strand, 32768588 - 32768764
Alignment:
Q  190 gatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttt 289  Q
    |||||||| | ||| ||| | |||||| ||||||||||||| | |||   || ||  ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||| | | ||||    
T  32768588 gatttttgggtgacaaaaggttattttagtattttagacaaatagtaattggaacggaaagttgtgatgtggtttagtgagggacaataatttcaatttt 32768687  T
Q  290 tgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgta--cctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttg 364  Q
    |||| |||| ||| | | | ||||||| |||   |||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32768688 tgtcatgtctcttgctttttgtttgtcatgtctccctgaaacaattttacaaatcaaacactgtacaattgaagttg 32768764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 45113974 - 45114263
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45113974 agatagagcagcacaacacaaggcataacaacacatgataaatttgtatgacattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctat 45114073  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  45114074 tttggtattttagacaacttgtacctatgacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctctcccttgcatctcgttt 45114173  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45114174 gttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattgaagttgtcatgtcctgtccttcatgttttagcaaatcaaacgcac 45114263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 8673242 - 8672953
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8673242 agatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 8673143  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  8673142 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 8673043  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8673042 tgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 8672953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 4052404 - 4052688
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4052404 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 4052501  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||    
T  4052502 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtc 4052601  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4052602 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcac 4052688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 41709695 - 41709985
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41709695 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaatttttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 41709794  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||    
T  41709795 ttttggtattttagataacttgtacgttggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcatttgcctccagtt 41709894  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709895 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 41709985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 34063046 - 34063336
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34063046 agatagaacagtacaacataaggcagcacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 34063145  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  34063146 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 34063245  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063246 tgtcctgtacctgaaagagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 34063336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37664466 - 37664179
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37664466 agaacagtacaacacaatgcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagcgacaaaatgctatttt 37664367  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37664366 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtc 37664267  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37664266 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgcac 37664179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30543205 - 30542919
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  30543205 agaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttatttt 30543106  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  30543105 ggtattttagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtc 30543006  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30543005 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 30542919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32020188 - 32019898
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32020188 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatacta 32020089  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||    
T  32020088 ttttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctaccccttgcttccagtt 32019989  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32019988 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcaatttttagcaaatcaaacgcac 32019898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 45446373 - 45446663
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45446373 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 45446472  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  45446473 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcctccagtt 45446572  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45446573 tgtcgtgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattttgtcttatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 45446663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29672510 - 29672219
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29672510 agatagaacagtgcaacacaagacagaacaacacaggacaaatttttcatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 29672411  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29672410 ttttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 29672311  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttt-tagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29672310 tgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcatttttaaagcaaatcaaacgcac 29672219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5969051 - 5968761
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5969051 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 5968952  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5968951 ttttggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 5968852  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5968851 tgtcatgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagcaaattaaacgcac 5968761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 27103877 - 27104167
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27103877 agatagaacattacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 27103976  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  27103977 ttttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtt 27104076  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104077 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 27104167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 34101426 - 34101716
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34101426 agatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacaggacaaattttttatggcgttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 34101525  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||    
T  34101526 ttttggtattttagacaacttgtacgtggaaaaaaaagttatgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtgttgtcccttgcctccagtt 34101625  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101626 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 34101716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7591629 - 7591344
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7591629 agaacagtacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 7591530  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  7591529 atattttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 7591430  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7591429 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaaacaaacgcac 7591344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37618572 - 37618289
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37618572 aacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatgtttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttggt 37618473  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    |||| | |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | || | |||||||||    
T  37618472 atttaaaacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtcctg 37618373  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37618372 tacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgcac 37618289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31513770 - 31513480
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31513770 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgcta 31513671  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  31513670 ttttggtattttagacaacttgtacctaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 31513571  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31513570 tgtcatctacctgaaacaattttacaaatcaaacactggataactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 31513480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 6386494 - 6386784
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6386494 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaaaacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 6386593  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||    
T  6386594 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcttttacctccagtt 6386693  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6386694 tgtcctatacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactacagttgttatgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 6386784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 118 - 404
Target Start/End: Original strand, 10466987 - 10467273
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10466987 agaacaacacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacatagaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg 10467086  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||| | || |||||||||    
T  10467087 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcc 10467186  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10467187 tgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 10467273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 120 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 29611235 - 29610950
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29611235 aacaacacaacacaaggcataacaacacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgctattttggt 29611136  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||||| |||    
T  29611135 gttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgttctg 29611036  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacat 405  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29611035 tccctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaacgcacat 29610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 30501068 - 30501353
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||     
T  30501068 agaacaacacaacataagacaaaacaccataggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttattttt 30501167  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||     
T  30501168 gtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtct 30501267  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30501268 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaactgaagttgttctgccatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 30501353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 120 - 399
Target Start/End: Original strand, 40388965 - 40389244
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40388965 aacagcacaacacaaggcagaacaacacaggaaaaaattttatggcattgaataattttttattttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggc 40389064  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
    |||| | |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  40389065 atttaaaacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagagataaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctg 40389164  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40389165 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaac 40389244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3251843 - 3251553
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3251843 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 3251744  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||    
T  3251743 ttttggtattttagacaacttgtacgtaggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatataagtttttgttctgtcgcttgcctccagtt 3251644  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3251643 tgtcctgtacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttatcctttattttttagcaaatcaaacgcac 3251553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 41548541 - 41548826
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  41548541 agaacaacacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 41548640  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||     
T  41548641 atattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtctgctgaggtacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtca 41548740  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41548741 tgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaattaaacgcac 41548826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 140 - 403
Target Start/End: Original strand, 39642828 - 39643091
Alignment:
Q  140 aacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgc 239  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  39642828 aacatcacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacaatttttgggggatgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgt 39642927  T
Q  240 gggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaa 339  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  39642928 gggacagaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaaaa 39643027  T
Q  340 atcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39643028 atcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 39643091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Original strand, 15001389 - 15001671
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15001389 agaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggtattgaataattttctgttttatatgatttttgggggac-aaatgctatttt 15001487  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||  || | || ||||||||    
T  15001488 ggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgttctgtctattgcctccagtttgtc 15001587  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15001588 ctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttatcaaatcaaacg 15001671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Original strand, 22999180 - 22999463
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22999180 agaacagcacaatacaagggagaacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttg 22999279  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa-gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  22999280 atattttagacaagttgtacgtgggacaaaaaagttttgctatggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 22999379  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999380 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaaccggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 22999463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7395001 - 7394711
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||    
T  7395001 agatagaacagtacaacacaagacagaacagcataggacaagttttttatggcactgagtaattttttgttttatgcgatttttgaaggacaaaatgtta 7394902  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  7394901 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctctagtt 7394802  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394801 tgtcatgtacctgaaacagttttgtaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 7394711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 118 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14005227 - 14004943
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| |||||||||| || |||| || ||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||    
T  14005227 agaacagtacaacacaagacagaacaacataggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattttttatggacaaaatgttatttt 14005128  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  14005127 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtc 14005028  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 401  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14005027 ctgtacctcaaacagttttacaaatcaaatactggacaactaaaattgttatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 14004943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 25478166 - 25478451
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  25478166 agatagaacaatacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatactat 25478261  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||    
T  25478262 tttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttgatgagggacaaaaatatgagtttttttcctgtcccttgtctccagttt 25478361  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25478362 gtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 25478451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29563413 - 29563169
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29563413 agatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatacta 29563314  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  29563313 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcgagtt 29563214  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaact 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  29563213 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataact 29563169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Original strand, 31731982 - 31732257
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31731982 agatagaacagtacaacacaagacagaatagcacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 31732081  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  31732082 ttttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtt 31732181  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||||              | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732182 tgtc--------------gttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 31732257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 116 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13407120 - 13406834
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  13407120 atagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttggggcacaaaatgctatt 13407021  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||    
T  13407020 ttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaaattatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgttccttgcctccagtttg 13406921  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 401  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13406920 tcatatacctgaaacagttttacaaattaaacactagacaactagagttgttctgccctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 13406834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12753512 - 12753226
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  |||||||||| || |||| |||| ||||||  || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  12753512 agatagaacaatacaacacaagacagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgtta 12753413  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  || | |  ||||    
T  12753412 ttttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcatttgccttcagtt 12753313  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12753312 tgtcctgtacctgaaacagtcttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 12753226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 125 - 403
Target Start/End: Original strand, 35225592 - 35225870
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  35225592 cacaacacaagacagaacaacacaagacaaatttttatggtattgaataatttcctgttttatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtatttt 35225691  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||    
T  35225692 agacaacttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtccct 35225791  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35225792 gaaactgttttacaaaccaaacactggacaactggagttgttctgtcctatccttcattttttatcaaatcaaacgcac 35225870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32303772 - 32303588
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32303772 agatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 32303673  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32303672 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 32303588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 125 - 403
Target Start/End: Original strand, 17805619 - 17805899
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgag-ggacgaaatgctattttggtatt 222  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | ||||  || ||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  17805619 cacaacacaaggtagaacaacacaggacaaattttttagggcaacgagtaattttttgttttatacgatttttgggaggacaaaatgttattttggtatt 17805718  T
Q  223 ttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtac 322  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  17805719 ttagacaacttgtacgtgagacaaagagttgtgctttggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctctagtttgtcctgtac 17805818  T
Q  323 ctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||| |  |||||  ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  17805819 ttgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttggtctgttatgtccttcatttttaaacaaattaaacgcac 17805899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 37474642 - 37474908
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || |  ||| |||| ||||    
T  37474642 agaacagcacaatacaagggataacagcacatgacaaatttttatgacattgaataattttttattttatacgatttttggggaaaaaaacgctagtttg 37474741  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||                   ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  37474742 gtattttagacaacttgt-------------------actgtggtttgctgagggacaaaaatataagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 37474822  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37474823 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 37474908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16485995 - 16485706
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctat 213  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  16485995 agataggacaacacaatataaggcagaacagcacaaaacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctat 16485896  T
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||   ||||||||| |||||| || | |  | |||    
T  16485895 ttttgtattttagaaaacttatacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgttctgtcctttgccttcaattt 16485796  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16485795 gtcatgtccctgaaactattttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttctatcatgtccttcattctttatcaaatcaaacgcac 16485706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 118
Target Start/End: Original strand, 38104577 - 38104693
Alignment:
Q  2 gcagtgcagttgcttttttatttgtttgaaattactgagcaaaaggcttacagaatgcacaatttatgataaataataaattgatgatagagtgagtaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38104577 gcagtgcagttgcttttttatttgtttgaaattactgagcaaaaggcttacagaatgcacaatttatgataaataataaattgatgatagagtgagtaaa 38104676  T
Q  102 aaagattaacagagata 118  Q
    |||||||||||||||||    
T  38104677 aaagattaacagagata 38104693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 404 - 527
Target Start/End: Original strand, 38104693 - 38104816
Alignment:
Q  404 ataaggattttacaaacatgaaagatcagttgcagtaacttttgaacagataaagacacaacacaataagttagatagattgtatgctaatagcctaaac 503  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38104693 ataaggattttacaaacatgaaaggtcagttgcagtaacttttgaacagataaagacgcaacacaataagttagatagattgtatgctaatagcctaaac 38104792  T
Q  504 atctatggcatccagagtaggggt 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38104793 atctatggcatccagagtaggggt 38104816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 205 - 403
Target Start/End: Original strand, 37861869 - 37862066
Alignment:
Q  205 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttac 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37861869 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttatgatgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgc 37861968  T
Q  305 atctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37861969 ctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttactaatcaaacattgaacaactagagttgt-atgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 37862066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10656868 - 10656587
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |  | ||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||   |||| || || |||||||    
T  10656868 agaacaacacaacacaagacataacaacgtatgacaaatttttatgttattgaataattttttcttttatacgattttttgtggacaaattgttattttg 10656769  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
     |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||  || | |||||||||||     
T  10656768 atattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttttgtgaaggacaaaaaattcagtttttgtcctgtcttttgcctctagtttgtca 10656669  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||  || ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10656668 tgtctctaaaaaagatttacaaatcaaatactggacaattgaggttgttctgacatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10656587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 125 - 399
Target Start/End: Original strand, 17520531 - 17520798
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat--gttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatt 222  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || ||| || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        
T  17520531 cacaacacaagacagaacagtacaggacaaatttttatagcgttggattattttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgg---- 17520626  T
Q  223 ttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtac 322  Q
        |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| | || | ||| || || ||    
T  17520627 ----acaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa-tataagtttttgccctgtcccttgcctccattttatcatgcac 17520721  T
Q  323 ctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    || |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17520722 ctaaaacacttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaattaaac 17520798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 403
Target Start/End: Original strand, 21272676 - 21272875
Alignment:
Q  187 tacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagt 286  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21272676 tacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 21272775  T
Q  287 ttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttt 386  Q
    ||||||||||||                  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||||| ||    
T  21272776 ttttgtcctgtc-----------------gctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctctcgtgtcattcattctt 21272858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27109729 - 27109559
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttat--gttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  27109729 agatagaacaacacaatacaatgcagaacggtacaggacaaattttaatagcattgaataattttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgtt 27109630  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatat 282  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||    
T  27109629 attttggtattttaaacaatttgtacgcgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaaggaacaaaaatat 27109559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16595283 - 16595063
Alignment:
Q  166 attgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttg 265  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||  | || ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||     
T  16595283 attgaataatttttggtcttatacgatttttggtgaacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggatta 16595184  T
Q  266 gtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 365  Q
    | || |||||||| |    |||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |  |||||||  |||||    
T  16595183 gcgagggacaaaacttcatgtttttgtcctgtcccttgcctacagtttgttctgtcccagaaaca-atttacaaatcaaacaatatacaactggtgttgt 16595085  T
Q  366 cctgtcctgtccttcatttttt 387  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  16595084 cctgtcatgtccttcatttttt 16595063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 6460188 - 6460465
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||    
T  6460188 aacagcacagcacagggcagagtagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttt--gtcttatacgattttttatggacaaaatgttattttggt 6460285  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggac-aaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||        |||||||| |||||||| | || || ||||| |    
T  6460286 attttagacaacttatacgtgggacaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaa--------tttttgtcttgtcccttgcctccagattgtcat 6460377  T
Q  319 gtacctgaaacagatttac-aaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca---ttttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    ||  || |||||| ||||| |||||||||| || ||||||   ||| || |||| | |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  6460378 gtctctaaaacagctttacaaaatcaaacaatgtacaacttgggttatcatgtcttatccttcatttttttttagcaaatcaaacgca 6460465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32303597 - 32303505
Alignment:
Q  311 tttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32303597 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttctatcatttccttcgttttttagcaaatcaaacgcac 32303505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 38047484 - 38047554
Alignment:
Q  333 tttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38047484 tttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 38047554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 399
Target Start/End: Original strand, 10932691 - 10932940
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||  |  ||| | |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||    
T  10932691 gacaaatttgtatggtattgaataatttttggtcttataaaaaattttatggacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacgtggaactaaaa 10932790  T
Q  250 gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacact 349  Q
    |||||  |||||||| |||| |||| ||||| | ||||||| || |||| ||| | |||| |||||| ||| ||  |||||  |||| |||||||||||     
T  10932791 gttgtgatgtggtttagtgagggac-aaaattttagtttttatcatgtctcttgcctctactttgtcttgtcccataaacaattttataaatcaaacacc 10932889  T
Q  350 ggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 399  Q
      ||||||||||||||   ||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10932890 atacaactgaagttgtttggtcttgtcctttatttttttagtaaatcaaac 10932940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10320424 - 10320232
Alignment:
Q  153 aaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagtt 252  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||   ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||    
T  10320424 aaatttttatggtattgaataatttttggttttatacgattgttgttagacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgtggtaaaaagtt 10320325  T
Q  253 gtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaaca 347  Q
    ||  ||||||||||||| ||| || ||| |  |||||| | | ||||||| | || |||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||    
T  10320324 gtgttgtggtttggtgagggataagaatttctgttttttttc-gtcccttgc-tcaagtttgtcatgtccctaaaacggttttacaaatcaaaca 10320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Original strand, 32918842 - 32918925
Alignment:
Q  152 caaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgt 235  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  32918842 caaatttttatgacattaaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggtattaaaaacaacttgt 32918925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22756501 - 22756317
Alignment:
Q  210 ctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatcta 309  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||  |||||| |  ||| ||| |||||| |  ||||||||| |||| ||| | || |    
T  22756501 ctatttttgtattttagataacttgtacgtgatacaaaaagttgtgttgtggtataatgagggataaaaatttatgtttttgtcttgtctcttgcctcaa 22756402  T
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
     |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||     |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22756401 atttgtcctatcccagaaacagttttacaaatcaaacattgtataactggagt-----tgttttgtccttcattttttagcagatcaaac 22756317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 371
Target Start/End: Original strand, 11944864 - 11945051
Alignment:
Q  184 ttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatg 283  Q
    |||||| |||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||  | || | | | ||    
T  11944864 ttatacaatttttgaggcaaaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagttgtagtgtggtttagtggggaactagagtttg 11944963  T
Q  284 agtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtc 371  Q
    |||||||    |||| ||| | ||||||||||| | | | | |||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11944964 agtttttactatgtctcttgcctctagtttgtcatctccataaaacaattttacatatcaaacactgtacaattgaagttgtcatgtc 11945051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 347
Target Start/End: Original strand, 54117 - 54322
Alignment:
Q  141 acagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcg 240  Q
    |||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||   |||  ||||  ||||||| |||||| || |||||||| | |    
T  54117 acagcacaagataaacttttatggtattgaataattttttgtcttaaacgattttttgtggataaaatattattttg-tattttcgataacttgtatgtg 54215  T
Q  241 ggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaa 340  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |  | |||||||||| |  ||||||||| ||||||||   ||  | ||||| |||  | ||||||| ||||||||    
T  54216 ggacaaaaagttgtgatgtggtttagcaaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtcccttgtgtccggattgtcatgtctcagaaacagttttacaaa 54315  T
Q  341 tcaaaca 347  Q
    |||||||    
T  54316 tcaaaca 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36426337 - 36426201
Alignment:
Q  210 ctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatcta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||  |||||||| || |  ||||||| | | |||||||||| | |||||| | || |    
T  36426337 ctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagatgtgttgtggtttagtaaatgacaaaatttttagtttttgtcttatcccttgcctcaa 36426238  T
Q  310 gtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacac 348  Q
    | ||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  36426237 gattgtcgtgt--ctgaaccaattttacaaatcaaacac 36426201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 37861803 - 37861864
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataatttt 178  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  37861803 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaatttt 37861864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11926946 - 11926878
Alignment:
Q  184 ttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagtt 252  Q
    |||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  11926946 ttatacaatttttgaggcacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagtt 11926878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 249
Target Start/End: Original strand, 28746241 - 28746377
Alignment:
Q  113 gagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||| |||| ||||||| |||  | ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||   | || |||||||||||  | || ||||  ||    
T  28746241 gagataaaacaacacaacataagataaaacagcacatgataaatttttatgacattgaataatttttgatcttgtacgatttttggtgaacaaaatttta 28746340  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||    
T  28746341 ttttggtattttaaatagcttgtacgtaggacaaaaa 28746377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5859588 - 5859517
Alignment:
Q  184 ttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgta 255  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  5859588 ttataagattttttatggacaaaatactattttagtattttagataacttgtacgtatgacaaaaagttgta 5859517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 363
Target Start/End: Original strand, 5892087 - 5892236
Alignment:
Q  214 tttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagttt 313  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||  |  |||||  ||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | | | ||||||||    
T  5892087 tttggtaatttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttacggtttaatgaaggacaataatttcagtttttgtcttgtctcgttcgtctagttt 5892186  T
Q  314 gtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagtt 363  Q
    ||| |||  || ||| || ||||||||| ||| |||  | ||||||||||    
T  5892187 gtcatgtctctaaaatagttttacaaataaaatactttataactgaagtt 5892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 264
Target Start/End: Original strand, 14958975 - 14959027
Alignment:
Q  211 tattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggttt 264  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  14958975 tattttgatattttagaca-cttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 14959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Original strand, 15351694 - 15351794
Alignment:
Q  153 aaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagtt 252  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||    
T  15351694 aaatttttatgatattgaataattttga-ttttatacgatttttggttgataaaatgttattttggtattttagacaatttgtaactgagacaaaaagtt 15351792  T
Q  253 gt 254  Q
    ||    
T  15351793 gt 15351794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 403
Target Start/End: Original strand, 15351820 - 15351901
Alignment:
Q  322 cctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||    || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15351820 cctgaaacaattttacaaatcaaacacggcataactgtagttgttctgttacatcattcattttttagcaaatgaaacgcac 15351901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 21272631 - 21272675
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaattt 158  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21272631 agatagatcagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattt 21272675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 32528633 - 32528923
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32528633 agatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 32528732  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||    
T  32528733 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtt 32528832  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32528833 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtcctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 32528923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 114 - 399
Target Start/End: Original strand, 7523089 - 7523376
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttat-gttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7523089 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgct 7523188  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  7523189 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 7523288  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7523289 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaac 7523376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 2351598 - 2351888
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2351598 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggataaattttttatggcattgagtaattttttgttttgtacgatttttgagggacaaaatgtta 2351697  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  2351698 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtt 2351797  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2351798 tgtcctataccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 2351888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 11963259 - 11963549
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| || | |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11963259 agatagaacagtacaacacaaagcagaataacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttgtattttatacgatttttgagggacaaaatgcta 11963358  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  11963359 ttttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtt 11963458  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963459 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 11963549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 39918425 - 39918715
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  39918425 agatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacaggacaaatattttatagtattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgtta 39918524  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  39918525 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 39918624  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918625 tgtcttgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtcttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 39918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 118 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24181798 - 24181511
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  24181798 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatctttgggggacaaaatgctatttt 24181699  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  24181698 ggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttggctccagtttgtc 24181599  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181598 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaca 24181511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 35701195 - 35701485
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35701195 agatagaacagtacaacacaaggcagaataacacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 35701294  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  35701295 ttttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttatgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 35701394  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701395 tgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 35701485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 118 - 406
Target Start/End: Original strand, 3735280 - 3735568
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  3735280 agaatagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgttattttg 3735379  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || | ||||||     
T  3735380 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatggacaaaaatatcagtttttgtcctgtccattgcctccattttgtca 3735479  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacata 406  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3735480 tgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgcacata 3735568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 29241300 - 29241586
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29241300 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 29241399  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | ||||||    
T  29241400 gatattttagccaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagcttttggcctgtcccttgcctccaatttgtc 29241499  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29241500 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctggcctggccttcattttttagcaaatcaaacgcac 29241586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7770452 - 7770167
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||     
T  7770452 agaacaacacaacacaagacagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttattttt 7770353  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  7770352 gtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcc 7770253  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7770252 tgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 7770167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 114 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 31770769 - 31770480
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31770769 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgcta 31770670  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  31770669 ttttggtatttcagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 31770570  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31770569 tgtcttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 31770480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 118 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4689871 - 4689589
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||     
T  4689871 agaacaacacaacataaggcagaacaacacatgacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgacttttggggctcgaaatgttattttt 4689772  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||     
T  4689771 gtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtct 4689672  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689671 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 4689589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7208404 - 7208118
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| |||| ||||| |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7208404 agaacagtacaatacaagacggaacagcacgggacaaatattttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctatttt 7208305  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  7208304 ggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggttctgtctcttgcatccagtttgtc 7208205  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7208204 ccgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcac 7208118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 34794805 - 34795095
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgta-tggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  34794805 agatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgataaattttttgtggcattgaataattttttgttttatacgaattttggggaacaaaatgcta 34794904  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34794905 ttttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtt 34795004  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34795005 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 34795095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 31644369 - 31644654
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  31644369 agaatagcacaatacaaggtagaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttatgttttatatgatttttaggggacaaaatgctattttg 31644468  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||| | || |||||||||    
T  31644469 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcttg-ctcttgcctccagtttgtcc 31644567  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttttt-agcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31644568 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcccgtccttcattttttaagcaaatcaaacgcac 31644654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 8136757 - 8137045
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||||| ||||||  |||||  |||| ||    
T  8136757 agatagaacagtacaacacaaggcataacaacacaggacaatttttttatggcattgagtaatgttttgttttatactattttttggggac--aatgtta 8136854  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  8136855 ttttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtt 8136954  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8136955 tgtcctgtatctgaaacagttttacaaaacaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcac 8137045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6284477 - 6284188
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6284477 agatagaacagtacaacacaaggcagtacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 6284378  T
Q  213 tttt-ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | | || |||    
T  6284377 tttttggtattttggacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaaaataagtttttgtcctgtcccatgcctccagt 6284278  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6284277 ttgtcctgtacctgaagcagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttat--tctcccgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 6284188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31880250 - 31879964
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  31880250 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgtattatacgattgttgggggacaaaatgctatttt 31880151  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  31880150 ggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtc 31880051  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880050 ctgtacctgaaacagttttactaatcaaacactgaacaactagagttgttatatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 31879964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 41459511 - 41459796
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgta-tggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41459511 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaggacaaaaatttaatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 41459610  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||||    
T  41459611 gatattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctctggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt-tcttgtcccttgcctccagtttgtc 41459709  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41459710 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactaaacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 41459796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21739334 - 21739095
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||     |||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21739334 agatagaacagtacaacacaag-----acagaacaggacaaattttttatggcattgtgtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgcta 21739240  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  21739239 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt 21739140  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaact 357  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21739139 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 21739095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 116 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41790638 - 41790356
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  41790638 atagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttatt 41790539  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    || ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || | || ||||||    
T  41790538 ttagtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtttattgcctccagtttg 41790439  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41790438 tcctgta-ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttctgtcctgtctttcattttttagcgaatcaaa 41790356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 125 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7725975 - 7725702
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    |||||||||||| | || || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    
T  7725975 cacaacacaaggtagaatagtataggacaaatttttatggaattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggatattt 7725876  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  7725875 agacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttaatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgttctgcacct 7725776  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7725775 gaaacaattttactaatcaaacactggacaactgaagttgttttgtcctgtccttaattttttagcaaatcaaa 7725702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18470601 - 18470316
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18470601 agaacagcacaatacaagacataacagcacagaacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttg 18470502  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||| | |  ||||||| |    
T  18470501 gtgttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgttc 18470402  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18470401 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaaagcac 18470316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Original strand, 39788114 - 39788401
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaa-tgctattt 215  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  39788114 agaacagtacaacataatgcagaacagcacatgacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaaatgttattt 39788213  T
Q  216 tggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgt 315  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||    
T  39788214 tagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctacagtttgt 39788313  T
Q  316 cctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  39788314 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagaattgttctgtcctgtcctttattttttaacaaatcaaacgcac 39788401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4818318 - 4818085
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4818318 agatagaacagtgcaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgcta 4818219  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || ||||    
T  4818218 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgttccttgcctccagtt 4818119  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaac 346  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4818118 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 4818085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 125 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22493585 - 22493322
Alignment:
Q  125 cacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattt 223  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  22493585 cacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgcgg-acaaaatgctattttgatattt 22493487  T
Q  224 tagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacc 323  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || ||||| |||||||||    
T  22493486 tagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttggctccagtttatcctgtacc 22493387  T
Q  324 tgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatttttta 388  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22493386 tgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatttttta 22493322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 399
Target Start/End: Original strand, 553346 - 553601
Alignment:
Q  146 acaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgaggg-acgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcggga 243  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  553346 acaggacaaatattttatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 553445  T
Q  244 caaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatca 343  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  553446 caaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttataaatca 553545  T
Q  344 aacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  553546 aacactagacaattaaagttgttctgtcatattcttcattttttagcaaatcaaac 553601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 112 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32093160 - 32092874
Alignment:
Q  112 agagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgct 211  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32093160 agagacagaacaacataacacaaggcagaacagcacaacacaaatttttatggtattgaaaatttttatgttttatataatttttgggggacgaaatgct 32093061  T
Q  212 attttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagt 311  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| || | || | |    
T  32093060 attttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-ggacaaaaatttcagtttttgtcctatcctttgcctccaat 32092962  T
Q  312 ttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  32092961 ttgtcctgttcctgaaacaattttacaaatcaaacactgcacaactggagttgttctgtcttgtccttcattttttataaaatcaaac 32092874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 160 - 403
Target Start/End: Original strand, 40489302 - 40489544
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  40489302 tatggcattgagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgt 40489401  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |      
T  40489402 gatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcccgtcccttgcctccagtttgtcttctacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattag 40489501  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40489502 agttattctgtcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgcac 40489544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Original strand, 24036155 - 24036436
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||||| ||| || |||| |||| ||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  24036155 agaacagcacaacataagacagaacaacacatgacaaattttt--gacattgaataattttttgttttatacgatttttggggtgcaaaatgttattttg 24036252  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||| |    
T  24036253 gtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgc 24036352  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24036353 tgtacctgaaacagttttccaaatcaaacactggacaacttgaattgttttgtcctgt-cttcattttttagcaaatcaaacgca 24036436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23091478 - 23091192
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23091478 agaacagtacaacacaagatagaacaacacaagacaaatttcttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 23091379  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    | |||||||||||| || |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||    
T  23091378 gatattttagacaatttatacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgacggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttatc 23091279  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23091278 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacttgagtagttatatcttgtcattcattttttagcaaatcaaacgcac 23091192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8561122 - 8560870
Alignment:
Q  150 gacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaa 249  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  8561122 gacaaatttttatggcattgattaattttttgttttatacgatttttg-gggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacctggaacaaaaa 8561024  T
Q  250 gttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacact 349  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || | |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8561023 gttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgctttcagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacact 8560924  T
Q  350 ggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | | ||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8560923 gaataactgaagttgttatgtcacgtccttcgttttttagcaaatcaaacgcac 8560870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 128 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571545
Alignment:
Q  128 aacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  5571806 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggac--aatgctattttggtattttag 5571709  T
Q  227 acaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctga 326  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  5571708 acaacttgtacgttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg- 5571610  T
Q  327 aacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
                |||||||||||||||||||  ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5571609 ------------aatcaaacactggacaactagagttgttttgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 5571545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28090698 - 28090461
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||| | ||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28090698 agatagaacagtacaactcacggcagaacagtacaggacaaattttttatattattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtta 28090599  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  28090598 tttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtt 28090499  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactg 350  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28090498 tgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 28090461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37148747 - 37148477
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  37148747 agaacagcacaacacaaggtataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttattttatattctttttgggggacgaaatgctattttg 37148648  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||||||||||               |||||| | |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||| | || ||||||| |    
T  37148647 gtgttttagacaactt---------------agttgtgccgtggtttggtgaggaacaaaaatttcagtttttgtcccgtcccttgcctccagtttgttc 37148563  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37148562 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaattgacaactggagttgttctgtcatatccttcattttttaacaaatcaaacgcac 37148477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 403
Target Start/End: Original strand, 5598484 - 5598688
Alignment:
Q  199 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 298  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  5598484 gggacgaaatgttattttgatattttagacaagttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgttgtttgatgaaggacaaaaatatctgtttttgtcctctc 5598583  T
Q  299 ccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
    |||| | || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5598584 ccttgcctccagtttgtctcgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacttgagttgttctgttctgtgcttcattttttagcaaatcaaa 5598683  T
Q  399 cgcac 403  Q
    |||||    
T  5598684 cgcac 5598688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27839180 - 27838962
Alignment:
Q  184 ttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatg 283  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |     
T  27839180 ttatacgatttttggaggacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgttttatggtttggtgagggacaaaaattta 27839081  T
Q  284 agtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt 383  Q
     |||||  |||||||| || | |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  27839080 tgtttta-tcctgtccattgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 27838982  T
Q  384 ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27838981 ttttaacaaatcaaacgcac 27838962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 287
Target Start/End: Original strand, 40182386 - 40182556
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40182386 agaacagtacaacacaaggcaaaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctatttt 40182485  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtt 287  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40182486 ggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatataagtt 40182556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22432479 - 22432243
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||   ||||| |  ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22432479 agaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatatgattgatttttttt---ttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttg 22432383  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||    
T  22432382 gtattttagacaacttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttatcc 22432283  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaact 357  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  22432282 tgaacctgaaacagttttacaaatcaaacataggacaact 22432243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 700767 - 700513
Alignment:
Q  126 acaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtatttt 224  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  700767 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaaatttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgattttcgggggacaaaataatattttggtatttt 700668  T
Q  225 agacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacct 324  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||||   ||| ||||||| |||||||    
T  700667 agataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgaatttttgttttgtcccttgtctcttgtttgtcttgtacct 700568  T
Q  325 gaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtcctt 379  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||  ||||||  |||| |||||||    
T  700567 gaaacagttttacaaatcaatcattgaacaactagagttgttttgtcatgtcctt 700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 327
Target Start/End: Original strand, 5673062 - 5673271
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaat-ttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  5673062 agatataacagcacaacacaaggcataacatcaaaggacaaatattttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgtta 5673161  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| ||||||||||     ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | || ||||    
T  5673162 ttttgatattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgacttgtcccttgcctccagtt 5673256  T
Q  313 tgtcctgtacctgaa 327  Q
    | || ||||||||||    
T  5673257 tatcgtgtacctgaa 5673271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Original strand, 17031132 - 17031350
Alignment:
Q  170 aataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtga 269  Q
    |||||||||  || ||||| |||||||   |||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||  |||    
T  17031132 aataatttttggtcttatatgattttttgtggacaaaaagctatttttgtattttaaataacttgtacgtgggacgaaaagttgtgctgtgatttaatga 17031231  T
Q  270 tggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctg 369  Q
     || ||||||| |  ||||||||||||||| || | || | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||| || ||||||  ||    
T  17031232 ggggcaaaaatttatgtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtactgtccctgaaacagttttacaaatcaaacattatacaagtggagttgtgttg 17031331  T
Q  370 tcctgtccttcatttttta 388  Q
    || ||||||||||||||||    
T  17031332 tcttgtccttcatttttta 17031350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Original strand, 4664923 - 4665039
Alignment:
Q  287 ttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttt 386  Q
    ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4664923 ttttgtcatgtcccttgcctcctgtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcatgtccttcattttt 4665022  T
Q  387 tagcaaatcaaacgcac 403  Q
     | ||||||||||||||    
T  4665023 aatcaaatcaaacgcac 4665039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11090946 - 11090758
Alignment:
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||   |||| || |||| || ||| ||| | |||||| ||||  || || || |||||||    
T  11090946 ttttgatattttagacaacgtgtacgtgagacaaaaagttgtgtcgtggcttagtgagggtcaagaatttcagttttcgtccaatctctgacctctagtt 11090847  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    |||| ||| ||  |||||  ||||||||| ||||||   |||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11090846 tgtcatgttccaaaaacaattttacaaattaaacaccttacaattgaagttgtcatatcctatcctt-attttttaacaaatcaaacgca 11090758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 199
Target Start/End: Original strand, 20119689 - 20119777
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataa---ttttatgttttatacgatttttgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  || |||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||    
T  20119689 agatagaacagcacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttaatagcattgaataatatttgtttgttttatatgatttttgag 20119777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21739053 - 21739018
Alignment:
Q  368 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739053 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 21739018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36175109 - 36175002
Alignment:
Q  266 gtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 365  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||| | || | |  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  36175109 gtgagggacaataatttcagtttttgtcttgtcccttacctctaatttttactatcctagaaacagttttacaaatcaaacaccgtacaactgaagttat 36175010  T
Q  366 cctgtcct 373  Q
    | ||||||    
T  36175009 cttgtcct 36175002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 403
Target Start/End: Original strand, 40182552 - 40182596
Alignment:
Q  359 aagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40182552 aagttgttctgtcatttccttcattttttagcaaatcaaacgcac 40182596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 196
Target Start/End: Original strand, 35954936 - 35955014
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgattttt 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |  ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  35954936 agaacagcacatcacaaggcaaaatagtattggataaatttttatggtattgaataattttttgtctaatacgattttt 35955014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 23495 - 23783
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  23495 agatagaacaatacaacacaaggcagaacagcactggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac--aatgtta 23592  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  23593 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtt 23692  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23693 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgcccttcattttttagcaaatcaaacgcac 23783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 371
Target Start/End: Original strand, 19846 - 20083
Alignment:
Q  134 aggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaactt 233  Q
    ||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||||| ||  |  |||| |||||||||| | || |||  |||||||||||||| | |||||||    
T  19846 aggcatagcaacacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggcgttatgcgatttttgatgaacaaaagactattttggtatttcaaacaactt 19945  T
Q  234 gtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagat 333  Q
    ||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||| | |||||||||| | ||||||   |  | |||||| | |  || |||||| |    
T  19946 gtacgtgaaacaaaaagttgtacagtggtttagtgagtgacaagaatttcagtttttgtcatatcccttttctacaatttgtcttatctctaaaacagtt 20045  T
Q  334 ttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtc 371  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  20046 ttacatatcaaacactgtataactgaaattgtcatgtc 20083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 118 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5613 - 5332
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||     
T  5613 agaacaacacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttattttt 5514  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgag-tttttgtcctgtcccttacatctagtttgtc 316  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  5513 gtattttaggcaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgtgttttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 5414  T
Q  317 ctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaa 398  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5413 ttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaa 5332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 2227
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||  |||    
T  2516 agatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttataggatttttatgggacaaaaaacta 2417  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  2416 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatt 2317  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2316 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact-gaaaactaaagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 2227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Original strand, 101867 - 102157
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  101867 agatagaacagtacaatataaggtagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgcta 101966  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | || |  |    
T  101967 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccgttgcctccaagt 102066  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102067 tgtcctgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 102157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4757 - 4467
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||    
T  4757 agatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgata 4658  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  4657 ttttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatt 4558  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| || ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4557 tgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 4467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13860 - 13575
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||    
T  13860 agaacaacaaaatacaaggcataattgcacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacggaatgctattttg 13761  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||| | || ||||||| |    
T  13760 gtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgttc 13661  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13660 tgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 51359 - 51646
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| | || ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51359 atagaacagtataatacaagacagaacagcacaagacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt 51458  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  51459 ttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg-tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccagtttg 51557  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51558 ttctgcacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaaagttgttctgttttgtccttcattttttatcaaatcaaacgcac 51646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1532
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggt 219  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1814 aacagcacaacacaagagagaacaacacagaacaaatttttatggtattgaataattttttgttttatatgacttttgagggacgaaatgctattttggt 1715  T
Q  220 attttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctg 319  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| | || ||||||||||     
T  1714 tttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtccta 1615  T
Q  320 tacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 402  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1614 tccttgaaacagttttacaaatcaaacactggagaactgaagttgttctgttttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 114 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18232 - 17988
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232 agatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 18133  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  18132 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatt 18033  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaact 357  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18032 tgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 17988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12714 - 12527
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12714 agatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta 12615  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccc 12527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 120 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19262 - 18980
Alignment:
Q  120 aacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttgg 218  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  19262 aacagtacaacacaaggtagaacagcacatggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttgg 19163  T
Q  219 tattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcct 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  19162 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 19064  T
Q  319 gtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19063 gtacctg-aacagttttacaaatcaaacactggacaaatataattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaattaaaggcac 18980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 116 - 403
Target Start/End: Original strand, 15092 - 15380
Alignment:
Q  116 atagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatt-tgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatt 214  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| |||| || |||   | ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||    
T  15092 atagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgaaaaaaaatttatggcattgagtaatttgttgttttataagatttttgggggacaaaatactatt 15191  T
Q  215 ttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttg 314  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||    
T  15192 ttagtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgggggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttg 15291  T
Q  315 tcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15292 tcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttttgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 15380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 118 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15551 - 15261
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctatttt 216  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  15551 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg----aaatgctatttt 15456  T
Q  217 ggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttg--------tcctgtcccttacatct 308  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||        || |||||||| | ||     
T  15455 ggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtgatcttgtcccttgcctcc 15356  T
Q  309 agtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15355 agtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctatcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgcac 15261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13686 - 13616
Alignment:
Q  184 ttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgt 254  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13686 ttatacgatttttgatggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacatgtgacaaaaagttgt 13616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 160 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 373095 - 372856
Alignment:
Q  160 tatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgt 259  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |    
T  373095 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttat 372996  T
Q  260 ggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactga 359  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||   || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |    
T  372995 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatatcccttgtctccagttttttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacatttgacaactaa 372896  T
Q  360 agttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    | |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  372895 aattgttctgtcatatccttcattttttagcaaataaaac 372856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 114 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2673 - 2384
Alignment:
Q  114 agatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgt-atggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgcta 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | |||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2673 agatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgagattgggtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgcta 2574  T
Q  213 ttttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || | ||    
T  2573 ttttggtattttagacaacttgtacgtgagacaata-gttgtgttgtggtttggttagggacaaagatatgagtttttgtcctgtccctttcctccaatt 2475  T
Q  313 tgtcctgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2474 tgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcttgtccttcaatttttagcaaatcaaacgcac 2384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 43122 - 42843
Alignment:
Q  118 agaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggcattgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||  ||||| | |||||||||||    
T  43122 agaacagcacaatacaaggcataataatacagatcaaatttttgtggtattgaataatttcttgttttatatgattgtttggggacaacatgctattttg 43023  T
Q  218 gtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcc 317  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| | || ||||||| |    
T  43022 gtgttttagacaa-ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacacaaatttcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgttc 42924  T
Q  318 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 399  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  42923 tgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacta-tggagttgttctgtcttatccttcattttttaacaaatcaaac 42843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19205 - 19043
Alignment:
Q  242 gacaaaaagttgtactgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagatttacaaat 341  Q
    |||||||||||||  || | |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| || | ||  |||| | |||| |||||||||| |||||||||    
T  19205 gacaaaaagttgtgttgagctttgatgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctgtttattctgtccctgaaacagttttacaaat 19106  T
Q  342 caaacactggacaactgaagttgtcctgtcctgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgcac 403  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19105 caaacactggataactggaattgttatgtcctatccttcatttttttaacaaatcaaacgcac 19043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33669 - 33534
Alignment:
Q  166 attgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttg 265  Q
    |||||||||||||  || |||||| | |||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  33669 attgaataatttttggtcttatacaagttttgatggacaaaagcctattttggtattttatacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 33570  T
Q  266 gtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctt 302  Q
     ||| |||||| ||| | | |||||||| ||||||||    
T  33569 atgagggacaagaatttca-tttttgtcatgtccctt 33534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 108427 - 108318
Alignment:
Q  166 attgaataattttatgttttatacgatttttgagggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgcgggacaaaaagttgtactgtggtttg 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   || | | |||||||||| ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||| |||     
T  108427 attgaataattttatgtcttatacgatttttgatg---gataagttattttggtactttagacaatttgcacttgagacaaaaagttgtattgtgcttta 108331  T
Q  266 gtgatggacaaaa 278  Q
    ||||  |||||||    
T  108330 gtgaatgacaaaa 108318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University