View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20815_low_1 (Length: 297)

Name: NF20815_low_1
Description: NF20815
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20815_low_1
NF20815_low_1
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (110-297)||(41334571-41334758)
chr5 (116-297)||(2614563-2614744)
chr5 (110-297)||(18033987-18034174)
chr5 (108-297)||(7617138-7617327)
chr5 (109-297)||(5257000-5257188)
chr5 (135-297)||(22512310-22512472)
chr5 (109-297)||(33801474-33801662)
chr5 (116-297)||(38470584-38470765)
chr5 (108-297)||(25914902-25915082)
chr5 (135-294)||(39122366-39122524)
chr5 (108-215)||(39122262-39122369)
chr5 (203-297)||(32473395-32473489)
chr5 (227-297)||(33855068-33855138)
chr5 (110-182)||(30622627-30622699)
chr5 (111-182)||(32473303-32473374)
chr5 (203-297)||(17208079-17208173)
chr5 (203-297)||(30622720-30622813)
chr5 (136-199)||(6679724-6679788)
chr5 (136-199)||(28177801-28177865)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (109-297)||(36743390-36743578)
chr8 (116-297)||(11582771-11582952)
chr8 (111-297)||(42197344-42197530)
chr8 (116-297)||(29705367-29705548)
chr8 (108-297)||(30660648-30660837)
chr8 (108-297)||(30912468-30912657)
chr8 (109-297)||(45397321-45397508)
chr8 (114-297)||(29800862-29801045)
chr8 (111-297)||(26125640-26125825)
chr8 (108-297)||(20148765-20148954)
chr8 (110-297)||(2547001-2547188)
chr8 (116-294)||(2165877-2166055)
chr8 (110-294)||(31384672-31384856)
chr8 (110-260)||(9241594-9241744)
chr8 (110-297)||(42295200-42295386)
chr8 (108-294)||(1375550-1375736)
chr8 (133-297)||(5754908-5755072)
chr8 (110-286)||(3743787-3743963)
chr8 (110-293)||(40528542-40528726)
chr8 (206-297)||(42699262-42699353)
chr8 (203-297)||(35181521-35181615)
chr8 (108-297)||(34304793-34304981)
chr8 (203-297)||(18066719-18066813)
chr8 (203-297)||(33629994-33630088)
chr8 (209-297)||(16603633-16603721)
chr8 (110-182)||(10678060-10678132)
chr8 (109-182)||(35181636-35181709)
chr8 (110-182)||(33629901-33629973)
chr8 (208-297)||(16358839-16358929)
chr8 (258-297)||(19386626-19386665)
chr8 (203-261)||(10678153-10678211)
chr8 (200-253)||(32328815-32328868)
chr8 (110-182)||(19386473-19386545)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (108-297)||(36150135-36150324)
chr3 (110-297)||(54237101-54237288)
chr3 (108-297)||(42394325-42394514)
chr3 (110-297)||(24688310-24688497)
chr3 (110-297)||(40808870-40809057)
chr3 (110-297)||(40480754-40480941)
chr3 (110-297)||(53581766-53581953)
chr3 (108-297)||(54246054-54246243)
chr3 (109-297)||(25413686-25413874)
chr3 (109-297)||(46941058-46941246)
chr3 (110-297)||(45126836-45127023)
chr3 (108-297)||(47190932-47191120)
chr3 (118-297)||(42100693-42100872)
chr3 (110-297)||(27748568-27748746)
chr3 (109-260)||(52629870-52630021)
chr3 (108-297)||(1078232-1078412)
chr3 (108-297)||(53273599-53273779)
chr3 (158-287)||(51249323-51249452)
chr3 (108-290)||(11064628-11064810)
chr3 (203-297)||(4190266-4190360)
chr3 (108-200)||(29556865-29556956)
chr3 (110-297)||(9434129-9434316)
chr3 (200-297)||(29558232-29558329)
chr3 (203-297)||(10457893-10457987)
chr3 (108-188)||(19148882-19148962)
chr3 (214-297)||(25996273-25996356)
chr3 (203-294)||(51757601-51757692)
chr3 (203-297)||(34791834-34791928)
chr3 (203-297)||(52627978-52628072)
chr3 (110-182)||(51757713-51757784)
chr3 (108-182)||(4190171-4190245)
chr3 (110-172)||(54429173-54429235)
chr3 (208-259)||(19148822-19148873)
chr3 (136-198)||(26141543-26141606)
chr3 (108-182)||(10457798-10457872)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (114-297)||(7292752-7292935)
chr6 (116-297)||(9698247-9698428)
chr6 (108-297)||(26669915-26670104)
chr6 (111-297)||(13743130-13743316)
chr6 (111-297)||(13748630-13748816)
chr6 (108-297)||(3213405-3213594)
chr6 (116-297)||(7367554-7367735)
chr6 (108-297)||(21279934-21280123)
chr6 (108-297)||(26466804-26466993)
chr6 (110-297)||(24203895-24204082)
chr6 (110-297)||(30735987-30736174)
chr6 (108-297)||(7273241-7273430)
chr6 (111-297)||(30014348-30014534)
chr6 (109-297)||(21293584-21293772)
chr6 (203-297)||(27441547-27441641)
chr6 (110-297)||(33242408-33242595)
chr6 (203-297)||(31109223-31109317)
chr6 (203-297)||(33253918-33254012)
chr6 (108-182)||(27441662-27441736)
chr6 (109-182)||(33254034-33254107)
chr6 (108-182)||(31109128-31109202)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (108-297)||(112660-112849)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (116-297)||(24000926-24001107)
chr7 (116-297)||(42538345-42538526)
chr7 (110-297)||(41861679-41861868)
chr7 (108-297)||(5810830-5811019)
chr7 (114-297)||(5015400-5015583)
chr7 (108-297)||(44326183-44326372)
chr7 (110-297)||(26898310-26898497)
chr7 (116-293)||(32029731-32029908)
chr7 (116-297)||(42972857-42973038)
chr7 (109-297)||(44416841-44417029)
chr7 (110-297)||(43343532-43343719)
chr7 (108-297)||(16180263-16180451)
chr7 (109-297)||(4638106-4638294)
chr7 (108-296)||(45326026-45326214)
chr7 (116-286)||(27393174-27393344)
chr7 (108-297)||(35069726-35069915)
chr7 (110-297)||(10573754-10573941)
chr7 (128-279)||(38160505-38160656)
chr7 (110-297)||(43317448-43317635)
chr7 (116-297)||(9216307-9216487)
chr7 (110-297)||(5194139-5194326)
chr7 (161-297)||(24280555-24280691)
chr7 (108-222)||(47279630-47279744)
chr7 (109-297)||(40236924-40237112)
chr7 (203-297)||(31513292-31513386)
chr7 (203-297)||(31408634-31408728)
chr7 (203-297)||(27535232-27535326)
chr7 (108-182)||(31408539-31408613)
chr7 (108-182)||(33384991-33385065)
chr7 (203-297)||(33384875-33384970)
chr7 (108-182)||(27535137-27535211)
chr7 (235-297)||(39998413-39998475)
chr7 (108-182)||(31513407-31513481)
chr7 (136-180)||(35522902-35522947)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (108-297)||(19047162-19047351)
chr2 (108-297)||(30838637-30838826)
chr2 (108-297)||(43490307-43490496)
chr2 (110-297)||(1750419-1750606)
chr2 (116-297)||(12302167-12302348)
chr2 (109-297)||(4764633-4764821)
chr2 (110-297)||(16096752-16096940)
chr2 (110-297)||(43335671-43335858)
chr2 (111-260)||(42849768-42849916)
chr2 (108-297)||(34817682-34817871)
chr2 (143-297)||(13780676-13780830)
chr2 (116-297)||(42026772-42026955)
chr2 (160-297)||(8896541-8896678)
chr2 (109-260)||(39149201-39149350)
chr2 (203-297)||(43114562-43114656)
chr2 (110-297)||(11825562-11825749)
chr2 (203-297)||(41281975-41282069)
chr2 (203-297)||(12415461-12415555)
chr2 (203-297)||(12427521-12427615)
chr2 (203-297)||(16803973-16804067)
chr2 (203-297)||(16843255-16843349)
chr2 (208-293)||(33229310-33229396)
chr2 (108-296)||(34895647-34895835)
chr2 (209-297)||(18491710-18491798)
chr2 (203-297)||(966835-966929)
chr2 (108-182)||(6518400-6518474)
chr2 (108-182)||(18491825-18491899)
chr2 (108-182)||(41281880-41281954)
chr2 (110-182)||(966742-966814)
chr2 (217-297)||(6518484-6518563)
chr2 (110-182)||(43114677-43114749)
chr2 (220-287)||(14285691-14285758)
chr2 (203-260)||(4451951-4452008)
chr2 (217-297)||(4299435-4299515)
chr2 (213-297)||(7070421-7070505)
chr2 (110-174)||(12415368-12415432)
chr2 (110-174)||(12427428-12427492)
chr2 (110-182)||(16804088-16804160)
chr2 (110-182)||(16843370-16843442)
chr2 (108-182)||(12531569-12531643)
chr2 (110-182)||(4299328-4299400)
chr2 (136-198)||(40613913-40613976)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (110-297)||(5489781-5489968)
chr1 (110-297)||(43570994-43571181)
chr1 (110-297)||(48498870-48499057)
chr1 (111-297)||(37814783-37814969)
chr1 (110-297)||(23989431-23989619)
chr1 (108-297)||(7447831-7448019)
chr1 (108-297)||(24769405-24769594)
chr1 (109-297)||(50448167-50448355)
chr1 (108-297)||(750211-750400)
chr1 (109-293)||(4401336-4401521)
chr1 (109-297)||(2497469-2497657)
chr1 (109-252)||(4888093-4888235)
chr1 (203-297)||(44112682-44112776)
chr1 (203-297)||(48119633-48119727)
chr1 (203-297)||(35003299-35003393)
chr1 (203-297)||(38335923-38336017)
chr1 (203-297)||(41065158-41065252)
chr1 (203-297)||(46168388-46168482)
chr1 (203-297)||(45427746-45427840)
chr1 (110-182)||(35000021-35000093)
chr1 (209-297)||(38113202-38113290)
chr1 (108-182)||(35003414-35003488)
chr1 (108-182)||(44112797-44112871)
chr1 (203-297)||(45639733-45639827)
chr1 (110-182)||(45705945-45706017)
chr1 (113-182)||(48119748-48119817)
chr1 (110-182)||(45639640-45639712)
chr1 (108-182)||(26585582-26585656)
chr1 (203-297)||(35000114-35000208)
chr1 (108-182)||(38113101-38113175)
chr1 (109-179)||(45427652-45427722)
chr1 (203-297)||(45705830-45705924)
chr1 (109-182)||(41065271-41065344)
chr1 (136-199)||(45044570-45044634)
chr1 (255-297)||(14427352-14427394)
chr1 (130-182)||(46168503-46168555)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (108-297)||(27550314-27550503)
chr4 (108-297)||(1771172-1771361)
chr4 (110-297)||(25051698-25051885)
chr4 (108-297)||(28982728-28982917)
chr4 (109-297)||(23035985-23036173)
chr4 (110-297)||(27893750-27893937)
chr4 (108-297)||(55966252-55966441)
chr4 (110-297)||(33703146-33703333)
chr4 (110-297)||(35017738-35017924)
chr4 (108-297)||(27864569-27864758)
chr4 (110-297)||(43514594-43514781)
chr4 (110-297)||(23204686-23204873)
chr4 (110-293)||(43949709-43949893)
chr4 (109-297)||(31680907-31681095)
chr4 (108-294)||(43735750-43735936)
chr4 (116-297)||(12496961-12497142)
chr4 (109-297)||(27316619-27316808)
chr4 (108-297)||(28988478-28988666)
chr4 (113-297)||(48463361-48463545)
chr4 (110-260)||(51512173-51512323)
chr4 (114-297)||(45490225-45490408)
chr4 (128-293)||(39631109-39631275)
chr4 (108-297)||(41878411-41878593)
chr4 (108-297)||(21687011-21687200)
chr4 (115-297)||(41847976-41848158)
chr4 (137-297)||(41327478-41327638)
chr4 (109-261)||(56215805-56215956)
chr4 (122-249)||(46412389-46412516)
chr4 (203-297)||(711965-712059)
chr4 (203-297)||(17619153-17619247)
chr4 (15-95)||(48187484-48187566)
chr4 (110-297)||(55272284-55272471)
chr4 (208-297)||(3756252-3756341)
chr4 (109-182)||(19880074-19880147)
chr4 (203-296)||(48435580-48435673)
chr4 (222-297)||(960890-960965)
chr4 (214-297)||(35037010-35037093)
chr4 (203-297)||(32728362-32728456)
chr4 (111-182)||(35037125-35037195)
chr4 (108-182)||(17619058-17619132)
chr4 (114-182)||(712080-712148)
chr4 (110-182)||(48435487-48435559)
chr4 (108-182)||(46827612-46827686)
chr4 (108-148)||(32728511-32728551)
chr4 (217-297)||(46827721-46827801)
chr4 (112-158)||(960753-960799)
chr4 (109-182)||(3756159-3756232)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (108-297)||(690-879)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (110-297)||(14097-14283)
scaffold0187 (110-297)||(24425-24611)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (110-297)||(11256-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (116-297)||(23335-23516)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (203-297)||(45720-45814)
scaffold0003 (108-182)||(45625-45699)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (203-297)||(35457-35551)
scaffold0100 (116-167)||(35370-35421)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 41334571 - 41334758
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334571 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 41334670  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334671 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 41334758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 2614563 - 2614744
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2614563 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 2614662  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2614663 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 2614744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18034174 - 18033987
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034174 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccatataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 18034075  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18034074 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 18033987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7617327 - 7617138
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| |||| | || |||||| |||||||||||    
T  7617327 aagagtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccttttacaccaacacaaaattctgacatgtgacaacttagatcccacataaatagaagat 7617228  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617227 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggagtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 7617138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5257188 - 5257000
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  5257188 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagata 5257089  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5257088 aagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacat 5257000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22512472 - 22512310
Alignment:
Q  135 tgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 234  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512472 tgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 22512373  T
Q  235 aaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22512372 aaaatatccctaatacatggagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 22512310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33801662 - 33801474
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33801662 agagtgatgatatatgtaccttcccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagata 33801563  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  33801562 aagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatggagtgtacaatggggtgtagaaataaaggatgttcatgtaacat 33801474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38470765 - 38470584
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38470765 tgatacatgtaccacctcatatggcaatacaccctttacacccacataaaattctgatacgtggtaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 38470666  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38470665 attgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 38470584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 25914902 - 25915082
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25914902 aagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 25915001  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |        || |||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25915002 a--------ttatgagatgaacctacaaaaatat-tctaatacattgggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 25915082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 294
Target Start/End: Original strand, 39122366 - 39122524
Alignment:
Q  135 tgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 234  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39122366 tgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaatttacc 39122465  T
Q  235 aaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaa 294  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39122466 aaaatattcctaatacat-gggtgtctaattagatgtatgaataaaaggtgttcatgtaa 39122524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Original strand, 39122262 - 39122369
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39122262 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagat 39122361  T
Q  208 aaagtgtg 215  Q
    ||||||||    
T  39122362 aaagtgtg 39122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 32473395 - 32473489
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32473395 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatgcatgtggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 32473489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Original strand, 33855068 - 33855138
Alignment:
Q  227 aacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33855068 aacttaccaaaatgttcctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 33855138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 30622627 - 30622699
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30622627 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattttgacatgtggcaa 30622699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 182
Target Start/End: Original strand, 32473303 - 32473374
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32473303 agtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 32473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17208173 - 17208079
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||   |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17208173 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaataaagtgtatgattaaagggtgttcacgtaacat 17208079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 30622720 - 30622813
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||  || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30622720 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcat-gggcttacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacat 30622813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 6679724 - 6679788
Alignment:
Q  136 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 199  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  6679724 gtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaa 6679788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 28177801 - 28177865
Alignment:
Q  136 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 199  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  28177801 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaa 28177865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 36743390 - 36743578
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36743390 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 36743489  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36743490 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 36743578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11582952 - 11582771
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582952 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 11582853  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11582852 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 11582771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Original strand, 42197344 - 42197530
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42197344 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaa 42197443  T
Q  211 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42197444 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagtgtgtgcaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacat 42197530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29705548 - 29705367
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29705548 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaatagaagataaagtgtg 29705449  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29705448 gttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 29705367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 30660648 - 30660837
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660648 aagagtgatgatacatgtatcatcctatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 30660747  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30660748 aaagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 30660837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 30912468 - 30912657
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30912468 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagat 30912567  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30912568 aaggtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatacccctaatacatgaagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 30912657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45397508 - 45397321
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45397508 agagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaacacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaatctggagcccacacaaatagaagata 45397410  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45397409 aattgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtagaatggggtgtaggaataaagggtgttcacgtaacat 45397321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 29800862 - 29801045
Alignment:
Q  114 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29800862 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtg 29800961  T
Q  214 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29800962 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacat 29801045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26125825 - 26125640
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26125825 agtggtgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccgcataaaattctgacacgtggcaatctggaccc-acataaatagaagataaa 26125727  T
Q  211 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26125726 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 26125640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20148954 - 20148765
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  20148954 aagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgat 20148855  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20148854 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 20148765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2547188 - 2547001
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2547188 gagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataa 2547089  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2547088 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacat 2547001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 116 - 294
Target Start/End: Original strand, 2165877 - 2166055
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165877 tgatacatgtaccatcccatgtgacaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaaccccacacaaatagaagataaagtgtg 2165976  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaa 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2165977 gttatgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtatacaatggggtgtaggaataaatggtgttcatgtaa 2166055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31384856 - 31384672
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384856 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacatccacataaaattctgacacgtagcaacctggaccccacacaaatagaagataa 31384757  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  31384756 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaatagaatgtaagaataaagggtgttcatgtaa 31384672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9241744 - 9241594
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9241744 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacaccctttgcacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 9241645  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9241644 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgta 9241594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42295386 - 42295200
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42295386 gagtgatgataaatgtaccatcctatgtggcaatataccctttacatccacacaaaattctgacatgtggcaacttggaccc-acataaatagaagataa 42295288  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42295287 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 42295200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1375736 - 1375550
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  1375736 aagagtggtgatacatgtaccaccctatgtgacaatacattctttacacccacacaagattctaacacgtggcaatctgaactccacacaaatagaagat 1375637  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaa 294  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1375636 aaagtgtagttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaa 1375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 133 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5755072 - 5754908
Alignment:
Q  133 catgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaactta 232  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755072 catggggcaatacaccctttacacccacacaaaattctaacacgtggcaacttggatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaactta 5754973  T
Q  233 ccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5754972 ccaaaatatccctaatatatgggatgtacaatgggatgtaggaataaaaggtgttcatgtaacat 5754908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3743963 - 3743787
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  3743963 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtagcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctgaaccctacataaatagaagataa 3743864  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  3743863 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatacttaatatatggggtgtataatgggagggatgaataaagggtgt 3743787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Original strand, 40528542 - 40528726
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  40528542 gagtggtgatacatgtgcaccctcatgtgacaatatatcatttacatccacacaaaattatgacatgtgacaacttgaaccccacacaaatagaagagaa 40528641  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgta 293  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  40528642 agtgtggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatatatggggtgtacaatggggtttgtgaataaaagggtgttcatgta 40528726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42699353 - 42699262
Alignment:
Q  206 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42699353 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccataatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 42699262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35181615 - 35181521
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35181615 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 35181521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34304981 - 34304793
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  ||||     
T  34304981 aagagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatacacctcttacacccaaacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagtgagaggagatgaaagag 34304883  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34304882 aaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacat 34304793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 18066719 - 18066813
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18066719 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatatccctaatacatgggatgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 18066813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 33629994 - 33630088
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33629994 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattactaaaatgtccctaatgcatagggtgtacaatgaggtgtatgattaaagggtgttcgtgtaacat 33630088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Original strand, 16603633 - 16603721
Alignment:
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16603633 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtctttaatgcatggggtgtataataaggtgtatgattaaagggtgtgcatgtaacat 16603721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 10678060 - 10678132
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10678060 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10678132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35181709 - 35181636
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  35181709 agagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35181636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 33629901 - 33629973
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  33629901 gagtggtgatatatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacctacacaaaattttgacatgtggcaa 33629973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 297
Target Start/End: Original strand, 16358839 - 16358929
Alignment:
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttc-atgtaacat 297  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  16358839 aaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatattcttaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtcttcaatgtaacat 16358929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 297
Target Start/End: Original strand, 19386626 - 19386665
Alignment:
Q  258 gtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19386626 gtataatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 19386665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 261
Target Start/End: Original strand, 10678153 - 10678211
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtat 261  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  10678153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatatatggggtgtat 10678211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 253
Target Start/End: Original strand, 32328815 - 32328868
Alignment:
Q  200 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacata 253  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32328815 tagaagagaaagtatagttgtgagataaacttaccaaaatattcctaatgcata 32328868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 19386473 - 19386545
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19386473 gagtggtgatacatgtacatctccatgtggtaatgcacctcatacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19386545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36150324 - 36150135
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36150324 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagat 36150225  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36150224 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctgatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtattcatgtaacat 36150135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 54237288 - 54237101
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54237288 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaatattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 54237189  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54237188 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 54237101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 42394325 - 42394514
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42394325 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 42394424  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42394425 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 42394514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 24688310 - 24688497
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24688310 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacccccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 24688409  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24688410 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 24688497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40809057 - 40808870
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809057 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 40808958  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  40808957 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacat 40808870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40480941 - 40480754
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40480941 gagtgatgatacatgtatcaccccatgcggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaaatagaagataa 40480842  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40480841 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggcatatgaataaagggtgttcatgtaacat 40480754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 53581766 - 53581953
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581766 gagtgatgatacctgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 53581865  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53581866 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacataggatgtacaatggagtgtatgaataaagagtgttcatgtaacat 53581953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 54246054 - 54246243
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246054 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacattctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 54246153  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54246154 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatctctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 54246243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25413874 - 25413686
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25413874 agagtgatgatacatgtaccaccccatatgacaatacaccctttacacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaagata 25413775  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25413774 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 25413686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46941246 - 46941058
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46941246 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 46941147  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46941146 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgagatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 46941058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 45126836 - 45127023
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45126836 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctggcatgtggtaatctggaccccacataaatagaaaataa 45126935  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45126936 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 45127023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 47190932 - 47191120
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47190932 aagagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaatagaagat 47191031  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47191032 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacat-gggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 47191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 118 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42100872 - 42100693
Alignment:
Q  118 atacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42100872 atacatgtaccacctcatgtggcaatgcaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaataaaagataaaatgtggt 42100773  T
Q  218 tgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42100772 tgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 42100693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27748746 - 27748568
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27748746 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccg---------acacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 27748656  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27748655 agtattgttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataaggtgtataatgaggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacat 27748568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52630021 - 52629870
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  52630021 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccctacataaatagaagata 52629922  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  52629921 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccttaatacatagggtgta 52629870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1078412 - 1078232
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1078412 aagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaatagaagat 1078313  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |        ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1078312 a--------ttgtgagatgaacctacaaaaatat-cctaatacattaggtgtacaatgaggtgcaggaataaagggtgttcatgtaacat 1078232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 53273599 - 53273779
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||      |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  53273599 aagagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacacc---tacac------aaaattctgatacgtggtaacctggatcccacataaataaaagat 53273689  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| || ||||||| | ||||||| ||||||    
T  53273690 aaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtataggaataaatgatgttcatataacat 53273779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51249452 - 51249323
Alignment:
Q  158 catacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggt 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||    
T  51249452 catacaaaattctgacatgtggcaatctggatcccacacaaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgaggt 51249353  T
Q  258 gtataatggggtgtatgaataaagggtgtt 287  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  51249352 gtataatgggttgggtgaataaagggtgtt 51249323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 290
Target Start/End: Original strand, 11064628 - 11064810
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||   |   |||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||||||     
T  11064628 aagagtggtgatacatgtacactcttgtgtgacaatacaccccttacacccacacaaaattttgacatgtggtaatctagaccccacacaaatagaagag 11064727  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcat 290  Q
     ||||||| || ||||||||| | | ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  11064728 taagtgtgattatgagatgaattaatcaaaatatctctaaagcatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttcat 11064810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 4190266 - 4190360
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4190266 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatctctaatacataaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 4190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 200
Target Start/End: Original strand, 29556865 - 29556956
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29556865 aagagtggtgatacatgtaccactacatgtggcaatacacaatttacacccatataaaa-tctgacatgtggcaacctgaaccccacacaaat 29556956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9434316 - 9434129
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  9434316 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaaggaaaagtgagaggagatgaaagagaa 9434217  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9434216 agtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 9434129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 297
Target Start/End: Original strand, 29558232 - 29558329
Alignment:
Q  200 tagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29558232 tagaaaataaaatgtgattgtgagatgaatttaccaatatattcctaatatatagggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgttcatataacat 29558329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 10457893 - 10457987
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10457893 aagagaaagtatggttgtgagataaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacat 10457987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19148962 - 19148882
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctgga 188  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19148962 aagaatggtgacacatgtacacccccatgtggcaatacaccacttacacccacacaaaattctgacatatggcaacctgga 19148882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25996356 - 25996273
Alignment:
Q  214 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||| |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25996356 tggttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatatatggggtgtacaataagatgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 25996273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51757692 - 51757601
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaa 294  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51757692 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatgtccataatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtttatgtaa 51757601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34791928 - 34791834
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||  ||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34791928 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattattaaaatgtccctaatgcatgaggtttacaatatggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 34791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 52627978 - 52628072
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||  |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52627978 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatacttaatgcatgaggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcacgtaacat 52628072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 51757784 - 51757713
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  51757784 gagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatatacctcttacacccacacacaatcctgacatgtggcaa 51757713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 4190171 - 4190245
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  4190171 aagagtggtgatacatgtatacccttatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4190245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 172
Target Start/End: Original strand, 54429173 - 54429235
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctga 172  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  54429173 gagtggcgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaattctga 54429235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19148873 - 19148822
Alignment:
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgt 259  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19148873 aaagtgtgattgtgagataaatttactaaaatgtccctaatacatagggtgt 19148822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26141606 - 26141543
Alignment:
Q  136 gtggcaatacaccattta-cacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaa 198  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  26141606 gtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaa 26141543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 10457798 - 10457872
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10457798 aagagtgttgatacatgtataccctcatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10457872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7292935 - 7292752
Alignment:
Q  114 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292935 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacacaaacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 7292836  T
Q  214 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7292835 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatgaggtgtatgaataaatggtgttcttgtaacat 7292752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 9698247 - 9698428
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698247 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 9698346  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9698347 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 9698428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 26669915 - 26670104
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26669915 aagagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagat 26670014  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26670015 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 26670104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Original strand, 13743130 - 13743316
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743130 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13743229  T
Q  211 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13743230 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacat 13743316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Original strand, 13748630 - 13748816
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748630 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13748729  T
Q  211 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13748730 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaattggatgtatgaataaaaggtgttcatgtaacat 13748816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3213594 - 3213405
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3213594 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagat 3213495  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3213494 aaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 3213405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7367735 - 7367554
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7367735 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaaaataaagtgtg 7367636  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  7367635 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtatgaataaatgatgttcatataacat 7367554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21280123 - 21279934
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21280123 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 21280024  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21280023 aaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatacatgggatgtgcaatggaatgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 21279934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26466993 - 26466804
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26466993 aagagtgatgatacatttaccaccctatgtggcaatacaccttttacacccatacaaaatcctgatacgtggcaacctgaaccccaaacaaatagaagat 26466894  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26466893 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatggagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgtttatgtaacat 26466804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 24203895 - 24204082
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24203895 gagtgatgatacatgtaccactccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaatataa 24203994  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24203995 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggagtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttcatgtaacat 24204082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30736174 - 30735987
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30736174 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 30736075  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  30736074 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatcactaatacatgaggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgttcatgtaacat 30735987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 7273241 - 7273430
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7273241 aagagtgatgatgcatgtaccaccccatgtggtaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagat 7273340  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7273341 aaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaataaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 7273430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30014534 - 30014348
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 210  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  30014534 agtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggaccccatataaatagaagataaa 30014435  T
Q  211 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30014434 gtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatgcctaatacatgggatgtataatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 30014348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 21293584 - 21293772
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21293584 agagtggtgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 21293683  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21293684 aagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacagtgaaatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 21293772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27441641 - 27441547
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27441641 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 27441547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33242595 - 33242408
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  33242595 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagagaa 33242496  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33242495 agtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccttaatacatggggtgtacaataaggtgtatgattaaatggtgttcatgtaacat 33242408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 31109223 - 31109317
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||| |||||| || || |||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31109223 aagagaaaatgtggtcgtaagttgaatttatcaaaatatccctagtgcatggggtgtataatgggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 31109317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33254012 - 33253918
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  33254012 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaacat 33253918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27441736 - 27441662
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  27441736 aagagtggtgatacatgtacacacccatgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 27441662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33254107 - 33254034
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  33254107 agagtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacaccttttatacccacacaaaatccggacatgtggcaa 33254034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 31109128 - 31109202
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||| ||| |||||| |  ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31109128 aagagtgttgacacatgtgcacccctatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 31109202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 112849 - 112660
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  112849 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 112750  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  112749 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 112660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 24000926 - 24001107
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24000926 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 24001025  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24001026 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 24001107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 42538345 - 42538526
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538345 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 42538444  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42538445 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 42538526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41861868 - 41861679
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41861868 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccatacaaatagaagataa 41861769  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccc--taatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41861768 agtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatctctataatacatagggtgtataattgggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 41861679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 5810830 - 5811019
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5810830 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacatgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 5810929  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5810930 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatatatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtggtcatgtaacat 5811019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5015583 - 5015400
Alignment:
Q  114 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015583 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacactcacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtg 5015484  T
Q  214 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  5015483 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacat 5015400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44326372 - 44326183
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  44326372 aagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgat 44326273  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44326272 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgaggtgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 44326183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 26898310 - 26898497
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26898310 gagtggtgatacatgtaccatcctatgtggcaatacaccttttacacccacataaaattctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaatataa 26898409  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26898410 agtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggaatgtacaattgggtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacat 26898497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 32029731 - 32029908
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32029731 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtg 32029830  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgta 293  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  32029831 gttgttagatgaatttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaaaagtgtttatgta 32029908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42973038 - 42972857
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42973038 tgatacatgtactatcctatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaaatgtg 42972939  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  42972938 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtaggaataaaggatgttcaggtaacat 42972857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 44416841 - 44417029
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44416841 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 44416940  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  44416941 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacat 44417029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 43343532 - 43343719
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43343532 gagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43343631  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  43343632 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatagggtgtagaaataaatgatgttcatgtaacat 43343719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 16180263 - 16180451
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180263 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 16180362  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  16180363 aaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacgtggggtgtacaat-gggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacat 16180451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 4638106 - 4638294
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4638106 agagtggtgatacatgtaccaccctacgtgacaatacaccctttacatccatacaagattctgacacgtggtaacctagaccccacacaaatagaagata 4638205  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4638206 aagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccataatatatggggtgtacaattgagtgtatgaataaaaggtgttcatgtaacat 4638294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45326214 - 45326026
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  45326214 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatacaccatttacacccacataaaattctgacaggtggtagtctggaccccacataaatagaagat 45326115  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaaca 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  45326114 aaagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatgtgatgtatgaataaaaggtgtttatgtaaca 45326026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 116 - 286
Target Start/End: Original strand, 27393174 - 27393344
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27393174 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcctttacacccacataaaattctgacatgaggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 27393273  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgt 286  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  27393274 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagagtgtacaataggatgtaggaataaagggtgt 27393344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35069915 - 35069726
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | | |||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  35069915 aagagtgatgatacatgtaccatcctatgtggcaatatatcctttacatctacacaaaattctgacacgtggcaacttggacctcacataaatagaagat 35069816  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35069815 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagagtgttcatgtaacat 35069726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10573941 - 10573754
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | |||||||||| | |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  10573941 gagtggtgatacatgtaccaccgcatgtgacaatatatcctttacacccacataaaattctgatatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 10573842  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10573841 agtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatattcctaatacatggggtgtacaataggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 10573754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 279
Target Start/End: Original strand, 38160505 - 38160656
Alignment:
Q  128 caccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38160505 caccccatgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatga 38160604  T
Q  228 acttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataa 279  Q
    | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  38160605 agttactaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggagtgtaagaataa 38160656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43317635 - 43317448
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  43317635 gagtggtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 43317536  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43317535 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccctaaagcataggatgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacat 43317448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9216487 - 9216307
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9216487 tgatatatataccaccccatgtgacaatacaccttttacatccacacaaaattctgacatgcggcaacttaaaccccacacaaatagaagataaaatgtg 9216388  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9216387 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatgcat-gggtgtacaataggatataggaataaagggtgttcatgtaacat 9216307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 5194139 - 5194326
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    |||| |||||||||||||  ||   |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  5194139 gagtagtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaacccttacacccacacaaaattttgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 5194238  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5194239 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccttaaaacatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaatggtgttcatgtaacat 5194326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 297
Target Start/End: Original strand, 24280555 - 24280691
Alignment:
Q  161 acaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 260  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| || ||||    
T  24280555 acaaaattctgatatatggcaacttggaccccacacaaatagaagagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatatttctagtgcatgggatgta 24280654  T
Q  261 taatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24280655 gaatagggtgtatgaataaagggtgttcacgtaacat 24280691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Original strand, 47279630 - 47279744
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| | |||||||||| | |||| || ||||| || | | |||||||||||    
T  47279630 aagagtggtgatacatgtaccatcccatctgacaatacaccctttatacccacataaaattctgatatgtggtaatctggatcctatataaatagaagat 47279729  T
Q  208 aaagtgtggttgtga 222  Q
    |||||||||||||||    
T  47279730 aaagtgtggttgtga 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40237112 - 40236924
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| |    
T  40237112 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagtgagaggagatgaaagaga 40237013  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40237012 aaatatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataggatgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 40236924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31513386 - 31513292
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31513386 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtatacaatagggtgtatgattaaagagtgttcatgtaacat 31513292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 31408634 - 31408728
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31408634 aagagaaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 31408728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 27535232 - 27535326
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||| | ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27535232 aagagaaagtatagttgtgagatgaaattaccaaaatgtctttaacacatggagtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 27535326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 31408539 - 31408613
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  31408539 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 31408613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33385065 - 33384991
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  33385065 aagagtggtgatacatgtaaacccccatgtgacaatacacctcttacacccatacaaaatcctgatatgtggcaa 33384991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33384970 - 33384875
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataat-ggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || || ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  33384970 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatgtccctaatgcatggagtatacaataggggtgtatgattaaatgatgttcatgtaacat 33384875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 27535137 - 27535211
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  27535137 aagagtggtgatacatgtattcctccatgtggcaatacatctcttacatccacacaaaattctgacatgtggcaa 27535211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39998475 - 39998413
Alignment:
Q  235 aaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39998475 aaaatatccctaatacatggggtgtacaataggatgtatgattaaaatgtgttcatgtaacat 39998413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 31513481 - 31513407
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||  ||||| | | ||||||| |||||| |||||||    
T  31513481 aagagtggtgatacatgtacacccttatgtggcaatacacctcttacatctacacaaaatcctgacatgtggcaa 31513407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 35522902 - 35522947
Alignment:
Q  136 gtggcaatacaccattta-cacccatacaaaattctgacacgtggc 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  35522902 gtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggc 35522947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19047351 - 19047162
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19047351 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagat 19047252  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19047251 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggaatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 19047162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30838826 - 30838637
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838826 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacacctacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 30838727  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30838726 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 30838637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 43490307 - 43490496
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43490307 aagagtgatgctacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagat 43490406  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43490407 aaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagagtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 43490496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1750606 - 1750419
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1750606 gagtgatgatatttgtaccaccccatgtggcaacacaccctttacactcacacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 1750507  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1750506 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 1750419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 12302167 - 12302348
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12302167 tgatacatgtatcaccccatgtggcaatacatcctttacatccacacaaaattctgacacatggtaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 12302266  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12302267 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 12302348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 4764633 - 4764821
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764633 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 4764732  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  4764733 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacatggggtgtacaatagggtgtaggaataaatggtgttgatgtaacat 4764821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16096940 - 16096752
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggacccc-acacaaatagaagata 208  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||    
T  16096940 gagtgatgatacatgtaccacatcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttagacccccacataagtagaagata 16096841  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16096840 aagtgtggttgtgagattaactcaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 16096752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 43335671 - 43335858
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43335671 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaagataa 43335770  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||    
T  43335771 agtgtagttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaggtgtaggaataaatgatgttcatataacat 43335858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 111 - 260
Target Start/End: Original strand, 42849768 - 42849916
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42849768 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa-ataaa 42849866  T
Q  211 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42849867 gtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgta 42849916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 34817682 - 34817871
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||     
T  34817682 aagagtgatgatacatgtacacccccatgtggcaatgctccccttacacccatacaaaattctgacatgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagag 34817781  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || | ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34817782 aaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatgtgcgtagtgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaagggtgttcatgtaacat 34817871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 13780676 - 13780830
Alignment:
Q  143 tacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 242  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13780676 tacaccctttacacctatacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttatcaaaatatc 13780775  T
Q  243 cctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||  || ||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  13780776 cctaatgtatggggtgtacaatgaggtgtgtgaataaaatgtgttgatgtaacat 13780830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42026955 - 42026772
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||     
T  42026955 tgatacatgtacacctccatgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatcttgcaacctagaccccacacaaatagaaaagaaagtgta 42026856  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaa--gggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |   || |||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42026855 gttgtgagatgaatttgccaaaatatccctaatgcgcgggatgtacaatggaatgtatgaataaattgggtgttcatgtaacat 42026772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 297
Target Start/End: Original strand, 8896541 - 8896678
Alignment:
Q  160 tacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgt 259  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  8896541 tacaaaattctgacatgtggcaacctgaacctcacacaaatagaaaagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatattcctattgtatagggtgt 8896640  T
Q  260 ataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8896641 acaatggaatgtgtgaataaagggtgttcatgtaacat 8896678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Original strand, 39149201 - 39149350
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||    
T  39149201 agagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggtaatacaccttttacacccacacaaaattatgagacgtggtaatttagaccc-acacaaataaaagata 39149298  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 260  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39149299 aagtgtagttgtgggatgaacttaccaaaatatctctaatacataggatgta 39149350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43114656 - 43114562
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43114656 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 43114562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 11825562 - 11825749
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  11825562 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagagaa 11825661  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11825662 agtatgattgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 11825749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 41281975 - 41282069
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41281975 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 41282069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 12415461 - 12415555
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12415461 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 12415555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 12427521 - 12427615
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12427521 aagagaaagtatggttgtgagataaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 12427615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16804067 - 16803973
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16804067 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 16803973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16843349 - 16843255
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16843349 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattatcaaaatgtccctaatgcatgggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 16843255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33229396 - 33229310
Alignment:
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgta 293  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33229396 aaagtgtgattgtatgatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggtgttcatgta 33229310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 296
Target Start/End: Original strand, 34895647 - 34895835
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||||    
T  34895647 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagat 34895746  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaaca 296  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  34895747 aaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaaca 34895835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18491798 - 18491710
Alignment:
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | |||| |||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18491798 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgttcttaatgcatgaggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 18491710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 966835 - 966929
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||  | | |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  966835 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaacgttcttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 966929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 6518400 - 6518474
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6518400 aagagtggtgatacatgtacacctccatgtgtcaatacaccttttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 6518474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18491899 - 18491825
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  18491899 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 18491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 41281880 - 41281954
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  41281880 aagagtggtgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 41281954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 966742 - 966814
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  966742 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggaaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 966814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 297
Target Start/End: Original strand, 6518484 - 6518563
Alignment:
Q  217 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6518484 ttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaa-ggtgttcatgtaacat 6518563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43114749 - 43114677
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  43114749 gagtggtgatacatgtacaccctcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacaagtggcaa 43114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14285758 - 14285691
Alignment:
Q  220 tgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgtt 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14285758 tgagatgaatttaccaaaatatctttaatatatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgtt 14285691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 4451951 - 4452008
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 260  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4451951 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatgcatatggtgta 4452008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 297
Target Start/End: Original strand, 4299435 - 4299515
Alignment:
Q  217 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4299435 ttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacat 4299515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7070505 - 7070421
Alignment:
Q  213 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||| || | |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7070505 gtggttgtaagatgaatttatcaaaatgtccccaataaatggaggttacaatgggatgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 7070421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 12415368 - 12415432
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgaca 174  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12415368 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaattctgaca 12415432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 12427428 - 12427492
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgaca 174  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12427428 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacatccacacaaaattctgaca 12427492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16804160 - 16804088
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16804160 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16804088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16843442 - 16843370
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16843442 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16843370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 12531569 - 12531643
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  12531569 aagagtgatgatacatgtacacctccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 12531643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 4299328 - 4299400
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  4299328 gagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40613976 - 40613913
Alignment:
Q  136 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaa 198  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  40613976 gtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaa 40613913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5489968 - 5489781
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5489968 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 5489869  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5489868 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgggatgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 5489781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 43570994 - 43571181
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43570994 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43571093  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43571094 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 43571181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 48498870 - 48499057
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48498870 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 48498969  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  48498970 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacat 48499057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 111 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37814969 - 37814783
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37814969 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccatataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaa 37814870  T
Q  211 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37814869 gtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgagatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 37814783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 23989431 - 23989619
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989431 gagtggtgatacatgtaccaccctatatggcaatacaccctttacacccacacaagattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 23989530  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23989531 agtgtggttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatacatagggtatacaattgagtgtatgaataaaagggtgttcatgtaacat 23989619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7448019 - 7447831
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7448019 aagagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 7447920  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7447919 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctgtaatacat-gggtgtacaatgggatgtaggaataaaggatgttcatgtaacat 7447831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 24769405 - 24769594
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24769405 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 24769504  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  24769505 aaagtgtggttgtgataagaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggagtgtagaaataaaaggtgttcatgaaacat 24769594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 50448167 - 50448355
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  50448167 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacatggaacccacaaaaatagaagata 50448266  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  50448267 aaatgtggttgtaagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggagtgtagaaataaagagtgttcatgtaacat 50448355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 750211 - 750400
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  750211 aagagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaatagaagat 750310  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  750311 aaagtgtggttttgagatgaatttatcaaaatatccctgatacatggggtgtacaatggggtgtaggaaataagggtgttcacgtaacat 750400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 109 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4401521 - 4401336
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4401521 agagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcatattggaccccacacaaatagaagata 4401422  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgta 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  4401421 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaatgaagtgtaggaataaaagagtgttcatgta 4401336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 2497469 - 2497657
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  2497469 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttatacccacataaaattctgacacgtgacaatctggatcccacataaatagatgata 2497568  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2497569 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccttaatatatggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacat 2497657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4888235 - 4888093
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||| |||    
T  4888235 agagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaatatatcctttacatccacacaaaattctgatacatggcaatttggacaccacacaaatagaaaata 4888137  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4888136 aagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatccctaatacat 4888093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44112776 - 44112682
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44112776 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 44112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48119727 - 48119633
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48119727 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 48119633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35003393 - 35003299
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35003393 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 35003299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38336017 - 38335923
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38336017 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgtacaataaggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 38335923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41065252 - 41065158
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41065252 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgcccctaatgcatggggtgtacaacagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 41065158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46168482 - 46168388
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  46168482 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcattgggtgtacaataggatatatgattaaagggtgttcatgtaacat 46168388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 45427746 - 45427840
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  45427746 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattaccaaaatgtccctaatgcatggagtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtattcatgtaacat 45427840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 35000021 - 35000093
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35000021 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccatacaaaatcctgacatgtggcaa 35000093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 297
Target Start/End: Original strand, 38113202 - 38113290
Alignment:
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38113202 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtcattaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatataacat 38113290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35003488 - 35003414
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  35003488 aagagtggtgatacatgcacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44112871 - 44112797
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44112871 aagagtggtgatacatgtacaccttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 44112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 45639733 - 45639827
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45639733 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgtatggggtgtacaataggatgtatgattaaagagtgttcatgtaacat 45639827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45706017 - 45705945
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  45706017 gagtggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 45705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 48119817 - 48119748
Alignment:
Q  113 tggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48119817 tggtgatacatgtacacccccacgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 48119748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 45639640 - 45639712
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  45639640 gagtggtgatacatgtacacccccttgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 45639712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26585656 - 26585582
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  26585656 aagagtggtgatacatgtacacccccatgcggcaatacatctcttacatccacacaaaatcctgacatgtggcaa 26585582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 35000114 - 35000208
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||   || || ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35000114 aagagaaagtatggttgtgagataaatttatcaaaatgtccctaatacatgaagtatacaatagagtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacat 35000208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 38113101 - 38113175
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  38113101 aagagtggtgattcatgtacacctccatgtgacaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 38113175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Original strand, 45427652 - 45427722
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtgg 179  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  || || ||| ||||||| |||||| ||||    
T  45427652 agagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttccatccacacaaaatcctgacatgtgg 45427722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45705924 - 45705830
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||| | ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45705924 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttatcaaaatgtccataatgcatggagtgtacaatagaatgtatgattaaagggtgttcatataacat 45705830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41065344 - 41065271
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||||| |||||||    
T  41065344 agagtggtgatatatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacatccgcacaaaatcctgacatgtggcaa 41065271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45044634 - 45044570
Alignment:
Q  136 gtggcaatacaccattt-acacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || || |||||||| ||||||    
T  45044634 gtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaa 45044570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14427394 - 14427352
Alignment:
Q  255 ggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14427394 ggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 14427352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 46168555 - 46168503
Alignment:
Q  130 ccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  46168555 ccccatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaattatgacatgtggcaa 46168503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27550503 - 27550314
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27550503 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagat 27550404  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27550403 aaagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatggagtgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 27550314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 1771172 - 1771361
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1771172 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgagacgtggcaacttggaccccacataaatagaagat 1771271  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1771272 aaaatgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 1771361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25051885 - 25051698
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25051885 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatcatttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataa 25051786  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  25051785 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggggtgtaggaataaagtgtgttcatgtgacat 25051698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 28982728 - 28982917
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28982728 aagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 28982827  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28982828 aaagtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgggatgtacaatagggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 28982917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23036173 - 23035985
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23036173 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagata 23036074  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  23036073 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgtacaatagggtgtaggaataaaggaggttcatgtaacat 23035985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 27893750 - 27893937
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  27893750 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 27893849  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27893850 agtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacat 27893937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Original strand, 55966252 - 55966441
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  55966252 aagagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacaggtggcaatctagaccccacataaatagaagat 55966351  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55966352 aaattgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgggatgtatgaataaagggtgtttatgtaacat 55966441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33703333 - 33703146
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33703333 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaatagaagataa 33703234  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33703233 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaataagatgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 33703146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35017924 - 35017738
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35017924 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 35017825  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | | || ||||||||||||||||||||||||    
T  35017824 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccct-atacatggggtgtacaatgagatataggaataaagggtgttcatgtaacat 35017738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27864758 - 27864569
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||| ||    
T  27864758 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaat 27864659  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27864658 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgggatgtatgaataaatggtgtttatgtaacat 27864569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 43514594 - 43514781
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43514594 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacaaaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataa 43514693  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43514694 ggtgtggttgtgagatgaacttaccaaaataaccctaatacatgaagtgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 43514781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 23204686 - 23204873
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23204686 gagtgatgatacacgtaccatcccatgtggcaatatatcctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 23204785  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23204786 agtgtggttgtgacatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatgggatgtaggaataaagagtgttcatgtaacat 23204873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 293
Target Start/End: Original strand, 43949709 - 43949893
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43949709 gagtgatgatacatgtaccaccctatttggcaatacaccctttatacccatacaaaattctgacacgtggcatattggatcccgcacaaatagaagataa 43949808  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgta 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  43949809 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgaggtgcaggaataaaagggtgttcatgta 43949893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31681095 - 31680907
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  31681095 agagtggtgatacatgtagcatcccatgtggcaatacaccctttacacctacataaaattctgacacgtggcaatctaaaccccacataaatagaagata 31680996  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  31680995 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatacggggtgtacaatggaatgtatgaataaatggtgtttacgtaacat 31680907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43735936 - 43735750
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43735936 aagagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtgacaacttggatcccacacaaatagaagat 43735837  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  43735836 aaagtgtgattgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggaatgtataatgagatgtaggaataaaggatgttcatgtaa 43735750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12497142 - 12496961
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12497142 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 12497043  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12497042 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacat 12496961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 297
Target Start/End: Original strand, 27316619 - 27316808
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaa-ttctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  27316619 agagtgatgatacatttatcatcccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaaattctgacacgtggcaacttggactccaaataaatagaagat 27316718  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  27316719 aaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccttaatacatggggtgtataatgaggtgtaggaataaagggtgttcgtttaacat 27316808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28988666 - 28988478
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28988666 aagagtggtgatacatgtacaccctcatgtgacaatacaccccttac-ctcatacaaaattctgacatatggcaacctggaccccacacaaatagaagag 28988568  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28988567 aaagtgtggttatgagatgaatttatcaaaatgtccctagtgcatggggtgtacaatgaggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 28988478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 297
Target Start/End: Original strand, 48463361 - 48463545
Alignment:
Q  113 tggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagt 212  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  48463361 tggtgatacatgtaccactctatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagt 48463460  T
Q  213 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||   |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48463461 atggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatgaaatgtatgaataaatggtgtttatgtaacat 48463545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 260
Target Start/End: Original strand, 51512173 - 51512323
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51512173 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatctttaatacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaataaaagataa 51512272  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgta 260  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51512273 agtgtggttataagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgta 51512323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 297
Target Start/End: Original strand, 45490225 - 45490408
Alignment:
Q  114 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 213  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45490225 ggtgatacatgtagtaccctatgtggcaatatatcatttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagataaagtg 45490324  T
Q  214 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  45490325 tggttgtgagatgaatttactaaagtatccctaatacatgaggtgtacaattggatgtataaataaaatgtgttcatgtaacat 45490408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39631275 - 39631109
Alignment:
Q  128 caccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 227  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631275 caccccatgtgacaatacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtgacatattgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatga 39631176  T
Q  228 acttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaat-aaagggtgttcatgta 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  39631175 acttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaaagggggttcatgta 39631109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41878593 - 41878411
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  41878593 aagagtggtgatacatgtaccacc-----tg--aatacactctttacaccaacacaaaattctgacacgtgacaatctggaccccacacaaatagaagag 41878501  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41878500 aaggtttggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatggatagggtgtacaatgaggtgtatgaataaagagtgttcatgtaacat 41878411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21687200 - 21687011
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||   ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  21687200 aagagtgatgatatatgtaccaacctatgtggcaatacattctttacattcacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccagacaaatagaagat 21687101  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  21687100 aaagtatggttatgagatgaacttactaaaatatttctaatacataagatgtataatggggtgtaaaaataaaggatgttcatgtaacat 21687011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 115 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41848158 - 41847976
Alignment:
Q  115 gtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgt 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41848158 gtgatacatgtacacccccatgtggcaatacaccccttacatccacgcaaaattctgacatgtgacaatctgaaccccacacaaatagaagagaaagtgt 41848059  T
Q  215 ggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| || ||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41848058 ggttgtgcgatgaatttgccaaaatgtctctaatgcatggggtgtacaatgaggtgtgtgaaaaaaggatgttcttgtaacat 41847976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Original strand, 41327478 - 41327638
Alignment:
Q  137 tggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaa 236  Q
    ||||||||||||  |||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41327478 tggcaatacaccccttacactcacaaaaaattctaacatgtggcaacctggaccccacacaaattgaagagaaagtgtggatgtgagatgaatttaccaa 41327577  T
Q  237 aatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| ||| || | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  41327578 aatgtccgtagtgcataaggtgtacaatggggtgtgtgaataaagggtgtctatgtaacat 41327638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 261
Target Start/End: Original strand, 56215805 - 56215956
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 208  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  56215805 agagtggtgatacatgtacaccaccatgtggccatacacctcttacacccacacaaaattctgacatatagcaacctagaccccacacaaatag-agaga 56215903  T
Q  209 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtat 261  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  56215904 aagtgtggttgtgagataaattttccaaaatatcgctaatgcataggatgtat 56215956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 249
Target Start/End: Original strand, 46412389 - 46412516
Alignment:
Q  122 atgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtg 221  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46412389 atgtaccaccctatatgacaatatactttttacatctacacaaaattctgacacgtggcaatttaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtg 46412488  T
Q  222 agatgaacttaccaaaatatccctaata 249  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  46412489 agaagaacttaccaaaatatctctaata 46412516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 712059 - 711965
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  712059 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatagggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 711965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 17619153 - 17619247
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17619153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaaggtgttcatgtaacat 17619247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 48187566 - 48187484
Alignment:
Q  15 cataggtaaaccaaatagtcagtcgtacaaatacaattttaccataaataaacacaag--cttaacggactaagttcggaacg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  48187566 cataggtaaaccaaatagtcagtcgtacaaatacaattttaccataaacacaagcaagatattaacggactaagttcggaacg 48187484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 55272284 - 55272471
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||     |        | ||  |||| ||    
T  55272284 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaaggaaaagggagaggagatgaaagagaa 55272383  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  55272384 agtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagagtgtatgattaaaggatgttcatgtaacat 55272471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 297
Target Start/End: Original strand, 3756252 - 3756341
Alignment:
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3756252 aaagtatgattgtgagataaatttactaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 3756341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19880147 - 19880074
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19880147 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 296
Target Start/End: Original strand, 48435580 - 48435673
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaaca 296  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  48435580 aagataaagtatgattgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatagggtgtgtgattaaatggtgttcatgtaaca 48435673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Original strand, 960890 - 960965
Alignment:
Q  222 agatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  960890 agatgaatttaccaaaatgtccctaatgtatagggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 960965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35037093 - 35037010
Alignment:
Q  214 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  35037093 tggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatggggtgtacaatagagtgtatggttaaagggtgctcatgtaacat 35037010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32728456 - 32728362
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32728456 aagagaaagtatgattgtgagatgaatttactaaaatgtccttaatgcatggggtgtacaatagggtgtatgattaaaggatgttcatgtaacat 32728362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35037195 - 35037125
Alignment:
Q  111 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  35037195 agtggtgatacatgtac-actccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35037125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 17619058 - 17619132
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  17619058 aagagtggtgatacatgtacatccccacctggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 17619132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 712148 - 712080
Alignment:
Q  114 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  712148 ggtgatacatgtacacctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 712080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 48435487 - 48435559
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48435487 gagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 48435559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 46827612 - 46827686
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  46827612 aagagtggtgatacatgtacacctccatgtggaaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 46827686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32728551 - 32728511
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacacc 148  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  32728551 aagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacc 32728511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 297
Target Start/End: Original strand, 46827721 - 46827801
Alignment:
Q  217 ttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    ||||||||| || |||||||||  | | |||| ||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46827721 ttgtgagataaatttaccaaaacgttcttaatgcattgggtgtacaatagagtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 46827801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 158
Target Start/End: Original strand, 960753 - 960799
Alignment:
Q  112 gtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacaccc 158  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  960753 gtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacaccc 960799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 182
Target Start/End: Original strand, 3756159 - 3756232
Alignment:
Q  109 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||  ||||| |||||||    
T  3756159 agagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacaactcttacacccacataaaatcatgacatgtggcaa 3756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 879 - 690
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 207  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  879 aagagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagat 780  T
Q  208 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  779 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgaggtgtacaatgaggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacat 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 14097 - 14283
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14097 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 14195  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14196 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 14283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Original strand, 24425 - 24611
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24425 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 24523  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24524 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggggtgtagaaataaagggtgttcatgtaacat 24611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11256
Alignment:
Q  110 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 209  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  11443 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacactatttacacctacacaaaattctgacacgtagcaacttggaccccacatcaatagaagataa 11344  T
Q  210 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11343 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatggggtgtatgaataaagtgtgttcatgtgacat 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Original strand, 23335 - 23516
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23335 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 23434  T
Q  216 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23435 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatggagtgtaggaataaagggtgttcatataacat 23516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 45720 - 45814
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45720 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgtacaatagggtgtatgattaaagggtgttcatgtaacat 45814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 182
Target Start/End: Original strand, 45625 - 45699
Alignment:
Q  108 aagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaa 182  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  45625 aagagtggtgatacatgtacacacccatgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 45699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 297
Target Start/End: Original strand, 35457 - 35551
Alignment:
Q  203 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatggggtgtatgaataaagggtgttcatgtaacat 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  35457 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaatatgtccctaatgcatggggtgtacaatatggtgtatgattaaatggtgtttatgtaacat 35551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 167
Target Start/End: Original strand, 35370 - 35421
Alignment:
Q  116 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaat 167  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35370 tgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccatacaaaat 35421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University