View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20827_high_2 (Length: 533)

Name: NF20827_high_2
Description: NF20827
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20827_high_2
NF20827_high_2
[»] chr1 (80 HSPs)
chr1 (22-525)||(50209830-50210333)
chr1 (24-525)||(34509783-34510285)
chr1 (21-525)||(22532269-22532774)
chr1 (21-525)||(27250356-27250850)
chr1 (97-525)||(22354188-22354616)
chr1 (22-525)||(20135188-20135692)
chr1 (21-525)||(21026680-21027174)
chr1 (24-520)||(433012-433507)
chr1 (157-525)||(22355801-22356159)
chr1 (157-525)||(22357487-22357845)
chr1 (21-525)||(38801018-38801508)
chr1 (201-525)||(20846846-20847160)
chr1 (22-263)||(22468576-22468816)
chr1 (24-199)||(23593722-23593897)
chr1 (24-186)||(13988866-13989028)
chr1 (24-186)||(21923291-21923453)
chr1 (24-312)||(21346961-21347249)
chr1 (21-186)||(45574842-45575008)
chr1 (36-312)||(16758664-16758942)
chr1 (18-312)||(21342090-21342384)
chr1 (24-186)||(21475087-21475249)
chr1 (24-186)||(31612313-31612475)
chr1 (23-186)||(21840766-21840929)
chr1 (24-186)||(29298137-29298298)
chr1 (24-186)||(29776688-29776850)
chr1 (40-361)||(35260860-35261180)
chr1 (22-199)||(16361915-16362092)
chr1 (25-146)||(22921864-22921986)
chr1 (24-186)||(16275363-16275526)
chr1 (40-199)||(21861512-21861672)
chr1 (40-199)||(21896198-21896358)
chr1 (24-142)||(21707167-21707285)
chr1 (24-142)||(21711709-21711827)
chr1 (28-142)||(21754052-21754166)
chr1 (21-122)||(20847173-20847275)
chr1 (21-186)||(13212861-13213027)
chr1 (336-525)||(20918917-20919106)
chr1 (434-520)||(21301159-21301245)
chr1 (25-167)||(33681011-33681153)
chr1 (18-131)||(15860064-15860177)
chr1 (24-186)||(22123067-22123230)
chr1 (25-135)||(20248283-20248394)
chr1 (25-167)||(22237631-22237773)
chr1 (25-228)||(21714546-21714754)
chr1 (21-135)||(14295557-14295672)
chr1 (40-169)||(50614088-50614219)
chr1 (40-169)||(50621916-50622047)
chr1 (22-102)||(20454593-20454673)
chr1 (328-510)||(33681316-33681499)
chr1 (37-135)||(20918620-20918719)
chr1 (336-500)||(20248592-20248757)
chr1 (335-510)||(21754350-21754525)
chr1 (27-131)||(40389157-40389261)
chr1 (158-237)||(48603652-48603730)
chr1 (337-510)||(52927612-52927786)
chr1 (36-118)||(52927993-52928076)
chr1 (40-142)||(41050033-41050138)
chr1 (431-509)||(22921499-22921577)
chr1 (431-508)||(22238040-22238117)
chr1 (425-525)||(21162133-21162233)
chr1 (426-525)||(20091090-20091189)
chr1 (40-142)||(16368284-16368388)
chr1 (431-509)||(43697771-43697849)
chr1 (40-287)||(16093738-16093987)
chr1 (48-204)||(21787979-21788136)
chr1 (42-376)||(26064959-26065295)
chr1 (70-195)||(33797570-33797694)
chr1 (40-169)||(50686630-50686761)
chr1 (40-91)||(21533923-21533974)
chr1 (336-377)||(20637165-20637206)
chr1 (70-135)||(22130913-22130978)
chr1 (432-490)||(21895883-21895941)
chr1 (258-312)||(27653052-27653106)
chr1 (25-74)||(21161720-21161769)
chr1 (337-378)||(22921631-22921672)
chr1 (336-377)||(28194213-28194254)
chr1 (336-377)||(35981451-35981492)
chr1 (258-311)||(52940708-52940761)
chr1 (22-74)||(24783160-24783212)
chr1 (25-89)||(42865266-42865330)
[»] chr5 (86 HSPs)
chr5 (24-525)||(24529223-24529726)
chr5 (21-525)||(24493569-24494073)
chr5 (21-525)||(25421532-25422037)
chr5 (21-525)||(9077952-9078457)
chr5 (21-520)||(13095495-13095994)
chr5 (21-525)||(1096467-1096972)
chr5 (21-520)||(13025311-13025810)
chr5 (21-525)||(25431395-25431899)
chr5 (21-520)||(23390117-23390617)
chr5 (21-525)||(8286469-8286964)
chr5 (124-520)||(21985768-21986164)
chr5 (21-525)||(22075018-22075513)
chr5 (24-508)||(36154461-36154942)
chr5 (21-511)||(21292611-21293090)
chr5 (24-508)||(11580878-11581361)
chr5 (156-525)||(22107000-22107358)
chr5 (24-236)||(22412187-22412388)
chr5 (40-470)||(22144068-22144500)
chr5 (21-187)||(21808343-21808510)
chr5 (21-146)||(21729059-21729185)
chr5 (21-128)||(21997547-21997655)
chr5 (24-186)||(264768-264930)
chr5 (24-186)||(39363384-39363546)
chr5 (24-169)||(10732957-10733102)
chr5 (24-186)||(20909012-20909174)
chr5 (24-186)||(29329934-29330096)
chr5 (24-186)||(42245365-42245527)
chr5 (28-228)||(37723910-37724108)
chr5 (24-186)||(29345980-29346142)
chr5 (24-186)||(32027393-32027555)
chr5 (35-236)||(18418594-18418793)
chr5 (24-169)||(39245136-39245281)
chr5 (87-236)||(20766035-20766174)
chr5 (24-186)||(29348453-29348615)
chr5 (24-186)||(29350926-29351088)
chr5 (336-520)||(21871192-21871377)
chr5 (336-520)||(21875472-21875657)
chr5 (24-142)||(20902053-20902172)
chr5 (24-131)||(38619434-38619541)
chr5 (24-142)||(2154658-2154776)
chr5 (336-525)||(22119809-22119998)
chr5 (27-186)||(18319033-18319193)
chr5 (24-186)||(10775675-10775838)
chr5 (25-167)||(21565546-21565688)
chr5 (25-131)||(23064512-23064618)
chr5 (336-508)||(22959166-22959339)
chr5 (24-131)||(31061068-31061175)
chr5 (40-138)||(20026942-20027043)
chr5 (21-138)||(21329500-21329618)
chr5 (21-139)||(21502158-21502277)
chr5 (25-135)||(22959538-22959649)
chr5 (427-525)||(19660453-19660551)
chr5 (340-510)||(21565863-21566034)
chr5 (336-518)||(24766960-24767142)
chr5 (21-143)||(26012033-26012154)
chr5 (21-135)||(19660841-19660956)
chr5 (21-135)||(19668898-19669013)
chr5 (24-117)||(20918017-20918110)
chr5 (21-118)||(36314577-36314675)
chr5 (40-169)||(22178192-22178323)
chr5 (21-236)||(40725853-40726069)
chr5 (23-172)||(17517170-17517320)
chr5 (27-131)||(24067110-24067214)
chr5 (431-510)||(19669311-19669390)
chr5 (70-169)||(29448052-29448152)
chr5 (25-109)||(26704075-26704160)
chr5 (25-109)||(26973808-26973893)
chr5 (24-76)||(20806852-20806904)
chr5 (48-228)||(21873277-21873453)
chr5 (431-509)||(21329127-21329205)
chr5 (70-139)||(18356364-18356432)
chr5 (70-139)||(20910801-20910869)
chr5 (37-90)||(26732884-26732937)
chr5 (40-90)||(26740697-26740747)
chr5 (336-377)||(5888940-5888981)
chr5 (476-525)||(20910428-20910477)
chr5 (328-377)||(21501919-21501968)
chr5 (335-375)||(20026706-20026746)
chr5 (425-509)||(21498649-21498733)
chr5 (436-490)||(20026514-20026568)
chr5 (336-374)||(25744036-25744074)
chr5 (258-316)||(26740472-26740530)
chr5 (340-377)||(21741308-21741345)
chr5 (40-89)||(23469822-23469871)
chr5 (25-89)||(22032323-22032387)
chr5 (251-303)||(22120033-22120085)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (21-525)||(38761-39264)
scaffold0145 (21-238)||(32942-33158)
scaffold0145 (19-142)||(9744-9867)
[»] chr6 (103 HSPs)
chr6 (21-505)||(29060540-29061025)
chr6 (21-525)||(19303157-19303661)
chr6 (22-525)||(18409443-18409947)
chr6 (21-525)||(17287412-17287917)
chr6 (21-525)||(20593773-20594278)
chr6 (21-525)||(22779843-22780348)
chr6 (21-513)||(25628983-25629476)
chr6 (21-525)||(20637910-20638404)
chr6 (21-511)||(20360601-20361081)
chr6 (40-508)||(18456735-18457202)
chr6 (21-520)||(16920265-16920751)
chr6 (21-525)||(22831503-22831996)
chr6 (230-508)||(18821463-18821731)
chr6 (21-187)||(20076700-20076863)
chr6 (335-525)||(29808499-29808691)
chr6 (36-312)||(25644335-25644613)
chr6 (335-525)||(28496089-28496280)
chr6 (24-186)||(22782227-22782389)
chr6 (21-146)||(16496244-16496370)
chr6 (24-186)||(12742317-12742479)
chr6 (24-186)||(18334592-18334754)
chr6 (24-186)||(19005046-19005208)
chr6 (24-186)||(19858919-19859081)
chr6 (24-186)||(24422547-24422709)
chr6 (24-186)||(33861794-33861956)
chr6 (24-186)||(33864278-33864440)
chr6 (22-186)||(30676710-30676874)
chr6 (24-186)||(2291180-2291342)
chr6 (24-186)||(8055029-8055191)
chr6 (24-186)||(25754809-25754971)
chr6 (24-186)||(26924640-26924802)
chr6 (22-186)||(34963371-34963535)
chr6 (40-525)||(11185524-11185996)
chr6 (24-186)||(25656629-25656791)
chr6 (24-169)||(1540928-1541073)
chr6 (24-167)||(1595549-1595692)
chr6 (21-167)||(20109140-20109285)
chr6 (24-186)||(20556894-20557054)
chr6 (24-166)||(25688502-25688644)
chr6 (21-286)||(8227366-8227632)
chr6 (24-186)||(3852017-3852179)
chr6 (336-525)||(21939699-21939888)
chr6 (40-169)||(18461895-18462024)
chr6 (27-186)||(16448526-16448686)
chr6 (21-195)||(35245586-35245758)
chr6 (25-143)||(19652199-19652317)
chr6 (48-525)||(25603001-25603478)
chr6 (338-510)||(19652512-19652685)
chr6 (425-525)||(1561708-1561808)
chr6 (48-263)||(15041430-15041644)
chr6 (21-143)||(23019408-23019529)
chr6 (21-135)||(1561303-1561418)
chr6 (336-525)||(4667829-4668019)
chr6 (40-204)||(18821782-18821946)
chr6 (48-517)||(25611347-25611816)
chr6 (21-135)||(28496477-28496592)
chr6 (21-135)||(29808888-29809003)
chr6 (21-118)||(27333241-27333339)
chr6 (21-118)||(27393981-27394079)
chr6 (336-525)||(4185439-4185629)
chr6 (336-525)||(4189271-4189461)
chr6 (336-525)||(4674676-4674866)
chr6 (36-138)||(19668386-19668491)
chr6 (21-82)||(25714417-25714478)
chr6 (36-135)||(9098518-9098620)
chr6 (426-525)||(22334498-22334597)
chr6 (426-520)||(15894051-15894145)
chr6 (337-509)||(27332916-27333089)
chr6 (337-509)||(27393656-27393829)
chr6 (23-146)||(19847990-19848114)
chr6 (195-272)||(5834367-5834443)
chr6 (195-272)||(20177089-20177165)
chr6 (195-272)||(22158826-22158902)
chr6 (23-172)||(23992429-23992576)
chr6 (33-135)||(4185827-4185930)
chr6 (42-100)||(33443068-33443126)
chr6 (425-525)||(31155014-31155114)
chr6 (21-68)||(22080799-22080846)
chr6 (431-490)||(23019818-23019877)
chr6 (129-204)||(25642120-25642196)
chr6 (40-100)||(23076749-23076810)
chr6 (70-139)||(27415943-27416011)
chr6 (40-100)||(35008167-35008228)
chr6 (33-135)||(4186379-4186482)
chr6 (431-510)||(22080368-22080447)
chr6 (451-525)||(22439230-22439304)
chr6 (25-109)||(19873120-19873205)
chr6 (336-377)||(22080502-22080543)
chr6 (25-109)||(22432249-22432334)
chr6 (25-109)||(22438799-22438884)
chr6 (476-525)||(27415570-27415619)
chr6 (446-509)||(25956253-25956316)
chr6 (25-74)||(19862978-19863027)
chr6 (48-89)||(21766718-21766759)
chr6 (336-385)||(25641942-25641991)
chr6 (25-74)||(31155465-31155514)
chr6 (33-73)||(4738626-4738666)
chr6 (18-62)||(19008799-19008843)
chr6 (336-376)||(19668688-19668728)
chr6 (132-228)||(19863089-19863184)
chr6 (132-228)||(19873231-19873326)
chr6 (424-520)||(31164479-31164575)
chr6 (424-464)||(31316781-31316821)
[»] chr3 (132 HSPs)
chr3 (24-525)||(40213337-40213838)
chr3 (21-525)||(18438534-18439039)
chr3 (21-525)||(25476001-25476506)
chr3 (21-525)||(26686887-26687392)
chr3 (21-525)||(11424379-11424880)
chr3 (21-525)||(14972854-14973359)
chr3 (25-525)||(14576449-14576949)
chr3 (34-525)||(14572602-14573093)
chr3 (21-520)||(17487856-17488357)
chr3 (21-525)||(23082977-23083482)
chr3 (21-471)||(13442274-13442725)
chr3 (21-520)||(17499338-17499839)
chr3 (21-418)||(43840932-43841329)
chr3 (21-525)||(20698063-20698556)
chr3 (39-377)||(42386428-42386767)
chr3 (21-525)||(12399209-12399700)
chr3 (40-519)||(53070321-53070799)
chr3 (24-236)||(24153115-24153326)
chr3 (36-525)||(30029855-30030333)
chr3 (260-514)||(17247913-17248168)
chr3 (24-166)||(36166598-36166739)
chr3 (35-166)||(21618460-21618590)
chr3 (40-377)||(52523492-52523831)
chr3 (24-186)||(17672626-17672788)
chr3 (24-186)||(29172583-29172745)
chr3 (24-186)||(9707607-9707769)
chr3 (24-186)||(17463178-17463340)
chr3 (24-186)||(34159326-34159488)
chr3 (24-186)||(45606907-45607069)
chr3 (24-186)||(55476491-55476653)
chr3 (39-312)||(23274705-23274979)
chr3 (21-286)||(24340578-24340844)
chr3 (24-169)||(28848628-28848773)
chr3 (158-350)||(16796685-16796875)
chr3 (24-186)||(7781347-7781509)
chr3 (24-186)||(8899094-8899256)
chr3 (24-186)||(16454281-16454443)
chr3 (24-186)||(38961891-38962053)
chr3 (24-186)||(13151790-13151953)
chr3 (24-186)||(13154255-13154418)
chr3 (23-186)||(13544024-13544187)
chr3 (26-186)||(41123892-41124049)
chr3 (24-142)||(6469178-6469296)
chr3 (24-186)||(10247723-10247885)
chr3 (28-186)||(12567564-12567722)
chr3 (24-137)||(55500942-55501055)
chr3 (26-186)||(16282811-16282971)
chr3 (336-525)||(12340068-12340257)
chr3 (24-186)||(17446655-17446816)
chr3 (21-167)||(43550497-43550644)
chr3 (24-186)||(50242822-50242984)
chr3 (24-142)||(15977515-15977633)
chr3 (25-167)||(16097332-16097474)
chr3 (24-164)||(27165250-27165391)
chr3 (424-525)||(43842582-43842683)
chr3 (24-131)||(12119780-12119887)
chr3 (24-131)||(15412429-15412536)
chr3 (21-135)||(13210333-13210448)
chr3 (25-143)||(15470928-15471047)
chr3 (25-199)||(16103784-16103957)
chr3 (24-164)||(53301527-53301669)
chr3 (24-131)||(8499518-8499625)
chr3 (425-525)||(14179727-14179827)
chr3 (82-361)||(2050980-2051260)
chr3 (336-525)||(14669076-14669265)
chr3 (28-142)||(32307684-32307798)
chr3 (21-138)||(14234487-14234605)
chr3 (425-519)||(17247142-17247236)
chr3 (24-143)||(10556985-10557105)
chr3 (25-146)||(12174257-12174376)
chr3 (21-236)||(37642170-37642386)
chr3 (336-520)||(12851985-12852169)
chr3 (336-510)||(16097645-16097820)
chr3 (24-123)||(44494809-44494908)
chr3 (336-525)||(14665921-14666110)
chr3 (336-525)||(14735434-14735623)
chr3 (23-172)||(46822267-46822417)
chr3 (25-126)||(49668091-49668193)
chr3 (335-510)||(12933941-12934117)
chr3 (24-122)||(17737236-17737337)
chr3 (335-510)||(32307983-32308158)
chr3 (339-510)||(49389275-49389446)
chr3 (336-525)||(13209944-13210133)
chr3 (40-143)||(43925977-43926083)
chr3 (25-126)||(9512924-9513026)
chr3 (25-126)||(9520899-9521001)
chr3 (40-142)||(37251165-37251270)
chr3 (431-508)||(12171750-12171827)
chr3 (431-494)||(9513321-9513384)
chr3 (431-494)||(9521296-9521359)
chr3 (158-237)||(14179570-14179648)
chr3 (28-142)||(1644674-1644787)
chr3 (23-172)||(12511059-12511209)
chr3 (40-142)||(22110349-22110454)
chr3 (431-508)||(16104191-16104268)
chr3 (335-510)||(49667715-49667890)
chr3 (21-236)||(22147431-22147646)
chr3 (24-76)||(45577948-45578000)
chr3 (431-510)||(1644314-1644393)
chr3 (424-499)||(4588457-4588532)
chr3 (24-74)||(28194693-28194743)
chr3 (408-520)||(16809776-16809885)
chr3 (40-136)||(12377940-12378039)
chr3 (431-490)||(2050852-2050911)
chr3 (438-525)||(15877445-15877532)
chr3 (40-142)||(606324-606428)
chr3 (255-297)||(12339985-12340027)
chr3 (431-509)||(14234901-14234979)
chr3 (431-509)||(15471335-15471413)
chr3 (425-490)||(324640-324705)
chr3 (42-91)||(13919350-13919399)
chr3 (25-228)||(23408428-23408636)
chr3 (258-377)||(324471-324591)
chr3 (25-89)||(856140-856204)
chr3 (25-89)||(15878104-15878168)
chr3 (180-236)||(21618594-21618650)
chr3 (25-89)||(23077530-23077594)
chr3 (184-236)||(36166747-36166799)
chr3 (132-204)||(15877984-15878057)
chr3 (335-377)||(1644447-1644489)
chr3 (436-490)||(14501615-14501669)
chr3 (22-84)||(14665398-14665460)
chr3 (436-490)||(22109926-22109980)
chr3 (436-490)||(23275157-23275211)
chr3 (336-377)||(1465174-1465215)
chr3 (459-508)||(11852006-11852055)
chr3 (335-376)||(37250932-37250973)
chr3 (424-520)||(839623-839719)
chr3 (251-303)||(4588628-4588680)
chr3 (337-377)||(12171869-12171909)
chr3 (22-74)||(14668554-14668606)
chr3 (336-376)||(22110116-22110156)
[»] chr8 (91 HSPs)
chr8 (21-525)||(22626736-22627240)
chr8 (21-525)||(18818026-18818530)
chr8 (22-520)||(28648665-28649164)
chr8 (18-520)||(6759255-6759757)
chr8 (21-525)||(22875065-22875570)
chr8 (21-525)||(20536208-20536713)
chr8 (21-525)||(23406379-23406886)
chr8 (21-525)||(16091957-16092463)
chr8 (21-525)||(21923544-21924049)
chr8 (21-525)||(18878853-18879352)
chr8 (22-520)||(23648554-23649053)
chr8 (21-508)||(7372778-7373237)
chr8 (21-518)||(21918633-21919121)
chr8 (21-525)||(31971257-31971749)
chr8 (24-525)||(41598188-41598689)
chr8 (21-525)||(16199274-16199765)
chr8 (21-348)||(45130793-45131117)
chr8 (158-499)||(25362793-25363123)
chr8 (24-166)||(26219717-26219858)
chr8 (24-166)||(26225268-26225409)
chr8 (24-186)||(14409444-14409606)
chr8 (28-312)||(13507914-13508199)
chr8 (40-525)||(19801043-19801527)
chr8 (24-186)||(1484402-1484564)
chr8 (24-186)||(5853292-5853454)
chr8 (28-186)||(16413316-16413474)
chr8 (24-186)||(20403227-20403389)
chr8 (24-186)||(22001753-22001915)
chr8 (28-312)||(13597446-13597731)
chr8 (24-186)||(4483281-4483442)
chr8 (24-186)||(15203231-15203393)
chr8 (24-186)||(20046195-20046357)
chr8 (21-242)||(21389353-21389571)
chr8 (21-237)||(21395888-21396101)
chr8 (21-237)||(21790381-21790594)
chr8 (21-146)||(38855246-38855372)
chr8 (21-286)||(17611968-17612231)
chr8 (24-186)||(4542373-4542535)
chr8 (25-143)||(21285601-21285720)
chr8 (21-198)||(21778722-21778897)
chr8 (24-186)||(19896265-19896430)
chr8 (24-186)||(14823774-14823935)
chr8 (21-138)||(6520368-6520486)
chr8 (425-525)||(21491397-21491497)
chr8 (336-525)||(5865893-5866082)
chr8 (40-199)||(20498581-20498741)
chr8 (21-135)||(5866280-5866395)
chr8 (21-123)||(17140916-17141019)
chr8 (21-135)||(21490995-21491110)
chr8 (18-131)||(19937061-19937174)
chr8 (33-146)||(21673716-21673830)
chr8 (22-186)||(26223917-26224081)
chr8 (25-141)||(26355699-26355815)
chr8 (425-525)||(17141318-17141418)
chr8 (40-224)||(17439423-17439609)
chr8 (28-186)||(45290694-45290853)
chr8 (37-131)||(15070571-15070665)
chr8 (23-172)||(18678071-18678221)
chr8 (25-146)||(23760839-23760961)
chr8 (24-186)||(25484275-25484430)
chr8 (424-525)||(45130647-45130748)
chr8 (336-510)||(26355329-26355504)
chr8 (336-525)||(21249697-21249886)
chr8 (336-525)||(21255535-21255724)
chr8 (23-172)||(32121734-32121884)
chr8 (40-169)||(37116366-37116497)
chr8 (40-143)||(17266990-17267096)
chr8 (36-138)||(983407-983512)
chr8 (21-135)||(21249384-21249500)
chr8 (21-135)||(21255222-21255338)
chr8 (337-510)||(21674021-21674195)
chr8 (431-509)||(38854883-38854961)
chr8 (40-143)||(24353039-24353144)
chr8 (431-509)||(6520779-6520857)
chr8 (438-525)||(21389069-21389156)
chr8 (42-100)||(22525579-22525637)
chr8 (184-236)||(26222987-26223039)
chr8 (433-500)||(23760481-23760548)
chr8 (25-237)||(17353843-17354060)
chr8 (40-100)||(19154928-19154989)
chr8 (48-204)||(23776772-23776929)
chr8 (336-377)||(39834147-39834188)
chr8 (73-143)||(40492849-40492921)
chr8 (180-236)||(26219862-26219918)
chr8 (40-88)||(28397569-28397617)
chr8 (437-490)||(13507660-13507713)
chr8 (437-490)||(13597192-13597245)
chr8 (40-89)||(20502154-20502203)
chr8 (148-228)||(19983218-19983297)
chr8 (336-376)||(37116664-37116704)
chr8 (337-377)||(38855015-38855055)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (21-520)||(22337115-22337615)
chr2 (21-525)||(23660023-23660527)
chr2 (21-522)||(23076442-23076942)
chr2 (21-516)||(22737805-22738300)
chr2 (21-520)||(22730854-22731355)
chr2 (24-525)||(298431-298933)
chr2 (21-520)||(23285865-23286350)
chr2 (21-326)||(23060513-23060815)
chr2 (21-525)||(23654026-23654507)
chr2 (175-518)||(27753730-27754073)
chr2 (21-518)||(37750-38235)
chr2 (40-508)||(32451562-32452031)
chr2 (21-525)||(20309108-20309599)
chr2 (21-377)||(23708383-23708738)
chr2 (24-186)||(22105412-22105575)
chr2 (22-186)||(32214921-32215085)
chr2 (21-312)||(19671830-19672118)
chr2 (24-186)||(18808943-18809105)
chr2 (21-189)||(23103348-23103516)
chr2 (24-186)||(23130862-23131024)
chr2 (24-186)||(23133329-23133491)
chr2 (24-186)||(23709532-23709694)
chr2 (24-186)||(23712013-23712175)
chr2 (24-186)||(26505379-26505541)
chr2 (24-186)||(26507857-26508019)
chr2 (24-186)||(34402522-34402684)
chr2 (24-186)||(39682313-39682475)
chr2 (24-169)||(23135590-23135735)
chr2 (24-186)||(571397-571559)
chr2 (24-186)||(6725995-6726157)
chr2 (24-186)||(24367774-24367936)
chr2 (24-169)||(45029871-45030016)
chr2 (27-186)||(21155060-21155219)
chr2 (24-186)||(24898195-24898358)
chr2 (24-186)||(24900678-24900841)
chr2 (24-186)||(24903155-24903318)
chr2 (24-186)||(24905632-24905795)
chr2 (24-186)||(24908107-24908270)
chr2 (24-186)||(32039498-32039660)
chr2 (24-186)||(28577099-28577261)
chr2 (26-186)||(43137301-43137461)
chr2 (24-186)||(24529528-24529691)
chr2 (25-146)||(25175854-25175976)
chr2 (26-146)||(28405981-28406103)
chr2 (21-101)||(8946657-8946737)
chr2 (24-186)||(38967374-38967537)
chr2 (21-118)||(23071972-23072070)
chr2 (40-167)||(7707-7835)
chr2 (425-525)||(28291918-28292018)
chr2 (40-357)||(20519976-20520295)
chr2 (22-141)||(22134208-22134326)
chr2 (21-84)||(23040247-23040310)
chr2 (25-138)||(7679589-7679702)
chr2 (28-172)||(25616192-25616337)
chr2 (431-510)||(22133848-22133927)
chr2 (40-242)||(22413035-22413240)
chr2 (40-142)||(23207296-23207401)
chr2 (336-487)||(23071617-23071768)
chr2 (40-143)||(23791292-23791398)
chr2 (36-135)||(18786907-18787009)
chr2 (27-82)||(24643054-24643109)
chr2 (48-204)||(22799063-22799220)
chr2 (40-143)||(23004767-23004873)
chr2 (40-143)||(24697603-24697709)
chr2 (432-509)||(25176254-25176331)
chr2 (339-474)||(28406297-28406433)
chr2 (25-204)||(23019643-23019823)
chr2 (132-204)||(22758652-22758725)
chr2 (129-204)||(22740897-22740973)
chr2 (42-100)||(23287384-23287442)
chr2 (109-186)||(24642856-24642933)
chr2 (40-169)||(25108906-25109037)
chr2 (42-90)||(26392403-26392451)
chr2 (42-204)||(23038048-23038217)
chr2 (336-385)||(22740719-22740768)
chr2 (456-525)||(23100847-23100916)
chr2 (337-378)||(25176158-25176199)
chr2 (48-84)||(21916156-21916192)
chr2 (336-368)||(31756232-31756264)
[»] chr7 (105 HSPs)
chr7 (24-525)||(3563980-3564482)
chr7 (21-520)||(38227481-38227980)
chr7 (21-525)||(9509189-9509694)
chr7 (21-525)||(12698831-12699337)
chr7 (36-510)||(15143667-15144143)
chr7 (21-520)||(16385879-16386369)
chr7 (21-525)||(26211995-26212490)
chr7 (23-518)||(40443393-40443875)
chr7 (24-508)||(17061593-17062077)
chr7 (21-525)||(27847460-27847951)
chr7 (21-368)||(10589039-10589384)
chr7 (24-236)||(18456319-18456530)
chr7 (24-508)||(44116509-44116992)
chr7 (21-377)||(2279883-2280238)
chr7 (24-236)||(48273392-48273594)
chr7 (40-508)||(12756350-12756817)
chr7 (21-186)||(13647325-13647491)
chr7 (24-186)||(456321-456483)
chr7 (24-186)||(11972496-11972658)
chr7 (24-186)||(14949122-14949284)
chr7 (24-186)||(15376713-15376875)
chr7 (24-186)||(16232520-16232682)
chr7 (24-186)||(18640272-18640434)
chr7 (24-186)||(20385123-20385285)
chr7 (24-186)||(21189595-21189757)
chr7 (24-186)||(32125491-32125653)
chr7 (24-186)||(41522917-41523079)
chr7 (24-186)||(41525379-41525541)
chr7 (25-186)||(11393287-11393448)
chr7 (21-186)||(18430709-18430874)
chr7 (28-169)||(24275175-24275316)
chr7 (24-166)||(16410059-16410201)
chr7 (24-186)||(24702238-24702400)
chr7 (24-186)||(27216860-27217022)
chr7 (24-192)||(16213684-16213852)
chr7 (43-377)||(12255556-12255892)
chr7 (24-186)||(3386333-3386495)
chr7 (24-186)||(24704688-24704847)
chr7 (340-525)||(39267262-39267447)
chr7 (21-142)||(67745-67867)
chr7 (21-143)||(22072913-22073037)
chr7 (28-186)||(38898376-38898535)
chr7 (336-525)||(2831922-2832110)
chr7 (336-525)||(9751166-9751355)
chr7 (24-142)||(13831373-13831491)
chr7 (24-131)||(13869346-13869453)
chr7 (21-135)||(16495402-16495517)
chr7 (21-135)||(34200786-34200901)
chr7 (25-146)||(18005650-18005772)
chr7 (21-286)||(19486599-19486865)
chr7 (21-138)||(47831807-47831925)
chr7 (25-133)||(44014182-44014291)
chr7 (25-139)||(16219719-16219834)
chr7 (336-525)||(18302494-18302683)
chr7 (336-525)||(28504917-28505106)
chr7 (21-118)||(28505321-28505419)
chr7 (24-186)||(20110556-20110708)
chr7 (21-135)||(11996033-11996148)
chr7 (44-361)||(15008278-15008597)
chr7 (21-135)||(15754893-15755008)
chr7 (25-130)||(811142-811248)
chr7 (36-242)||(1867895-1868101)
chr7 (335-510)||(810760-810936)
chr7 (425-525)||(15754503-15754603)
chr7 (336-510)||(44014489-44014664)
chr7 (431-525)||(11995674-11995768)
chr7 (25-189)||(14932685-14932851)
chr7 (25-189)||(15356120-15356286)
chr7 (25-189)||(15360234-15360400)
chr7 (24-186)||(26355983-26356156)
chr7 (24-186)||(26358435-26358608)
chr7 (36-143)||(16056343-16056450)
chr7 (27-204)||(18154773-18154956)
chr7 (429-525)||(34201192-34201288)
chr7 (431-510)||(18006052-18006131)
chr7 (21-146)||(10063813-10063939)
chr7 (431-509)||(47832219-47832297)
chr7 (431-510)||(68157-68236)
chr7 (36-126)||(12901338-12901431)
chr7 (40-133)||(20220194-20220290)
chr7 (431-509)||(16324417-16324495)
chr7 (270-377)||(16056576-16056684)
chr7 (25-204)||(19649421-19649606)
chr7 (36-102)||(14044761-14044828)
chr7 (36-102)||(14354791-14354858)
chr7 (40-100)||(18203831-18203891)
chr7 (47-100)||(48991206-48991260)
chr7 (70-139)||(2530140-2530208)
chr7 (25-228)||(9703263-9703471)
chr7 (456-525)||(19649101-19649170)
chr7 (328-377)||(22073223-22073272)
chr7 (431-490)||(2279769-2279828)
chr7 (336-375)||(9389462-9389501)
chr7 (336-374)||(68061-68099)
chr7 (436-490)||(2529628-2529682)
chr7 (431-509)||(16219348-16219426)
chr7 (257-286)||(10063678-10063707)
chr7 (22-74)||(2832509-2832561)
chr7 (40-88)||(9033400-9033448)
chr7 (251-303)||(9751390-9751442)
chr7 (424-468)||(11262705-11262749)
chr7 (25-89)||(12187019-12187083)
chr7 (25-89)||(17138113-17138177)
chr7 (40-88)||(20619399-20619447)
chr7 (424-520)||(44407992-44408088)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (21-525)||(51913-52417)
scaffold0011 (21-525)||(167606-168099)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (21-525)||(39913-40416)
scaffold0080 (40-141)||(19883-19987)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (22-525)||(16831-17337)
scaffold0056 (40-362)||(79109-79430)
scaffold0056 (425-525)||(78978-79078)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (28-520)||(25686-26179)
scaffold0122 (145-525)||(33110-33491)
scaffold0122 (24-166)||(44682-44825)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (24-525)||(339567-340065)
scaffold0003 (24-186)||(158450-158612)
scaffold0003 (70-139)||(71350-71418)
scaffold0003 (476-525)||(71742-71791)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (21-511)||(343-833)
scaffold0292 (21-525)||(3470-3975)
[»] chr4 (100 HSPs)
chr4 (24-514)||(16377149-16377639)
chr4 (26-520)||(14038653-14039149)
chr4 (23-525)||(22636437-22636939)
chr4 (21-525)||(44052829-44053334)
chr4 (21-525)||(12902757-12903250)
chr4 (21-525)||(16239608-16240090)
chr4 (21-381)||(7893703-7894060)
chr4 (21-525)||(7088877-7089371)
chr4 (24-520)||(44928544-44929042)
chr4 (28-377)||(23374125-23374473)
chr4 (24-508)||(44102214-44102697)
chr4 (21-525)||(14052930-14053422)
chr4 (218-525)||(15091093-15091402)
chr4 (21-238)||(16270140-16270356)
chr4 (157-525)||(3096781-3097137)
chr4 (277-525)||(7798953-7799202)
chr4 (21-204)||(7798774-7798958)
chr4 (24-236)||(54798669-54798872)
chr4 (21-192)||(6899891-6900062)
chr4 (158-381)||(17047834-17048055)
chr4 (24-236)||(14280316-14280518)
chr4 (36-377)||(52242958-52243302)
chr4 (21-145)||(52873363-52873488)
chr4 (24-166)||(8574844-8574985)
chr4 (40-508)||(21815265-21815731)
chr4 (24-186)||(18215274-18215436)
chr4 (24-186)||(12307-12469)
chr4 (24-186)||(15118352-15118514)
chr4 (24-186)||(44615288-44615450)
chr4 (24-186)||(44773087-44773249)
chr4 (24-186)||(52312510-52312672)
chr4 (24-192)||(1837503-1837671)
chr4 (18-186)||(19242693-19242861)
chr4 (22-186)||(19618172-19618336)
chr4 (24-186)||(3515007-3515169)
chr4 (40-342)||(6190481-6190782)
chr4 (24-186)||(50222339-50222501)
chr4 (24-169)||(18239436-18239581)
chr4 (24-186)||(23803265-23803427)
chr4 (24-186)||(51463868-51464030)
chr4 (40-199)||(13793-13953)
chr4 (336-525)||(15552129-15552318)
chr4 (21-261)||(17046487-17046724)
chr4 (28-186)||(15355324-15355483)
chr4 (336-520)||(24029057-24029241)
chr4 (21-130)||(39706299-39706409)
chr4 (22-186)||(14970707-14970871)
chr4 (24-186)||(12610950-12611105)
chr4 (336-525)||(13812425-13812614)
chr4 (21-286)||(15371202-15371467)
chr4 (21-286)||(15373483-15373748)
chr4 (21-106)||(3096293-3096379)
chr4 (424-525)||(20156906-20157007)
chr4 (24-186)||(7641192-7641344)
chr4 (21-286)||(16223532-16223797)
chr4 (36-199)||(43198495-43198661)
chr4 (25-142)||(12774011-12774128)
chr4 (21-236)||(15367690-15367905)
chr4 (21-236)||(15402703-15402918)
chr4 (21-131)||(15370018-15370128)
chr4 (21-135)||(15551817-15551932)
chr4 (336-525)||(22633829-22634018)
chr4 (395-508)||(6190807-6190921)
chr4 (36-138)||(12288211-12288316)
chr4 (94-361)||(15464710-15464978)
chr4 (271-508)||(21814936-21815173)
chr4 (271-508)||(21818358-21818595)
chr4 (335-510)||(12774313-12774488)
chr4 (338-525)||(16596963-16597150)
chr4 (25-124)||(8846360-8846460)
chr4 (336-510)||(8846689-8846865)
chr4 (23-186)||(22353835-22353999)
chr4 (431-509)||(39705920-39705998)
chr4 (27-131)||(20149832-20149936)
chr4 (40-142)||(46640453-46640558)
chr4 (431-509)||(13844950-13845028)
chr4 (424-469)||(17046720-17046765)
chr4 (40-169)||(53082124-53082254)
chr4 (424-499)||(17047726-17047801)
chr4 (70-195)||(43256106-43256230)
chr4 (160-204)||(15093911-15093955)
chr4 (431-490)||(43198239-43198298)
chr4 (432-490)||(15868286-15868344)
chr4 (336-377)||(15099665-15099706)
chr4 (184-236)||(8574784-8574836)
chr4 (432-491)||(15190729-15190788)
chr4 (431-490)||(15464580-15464639)
chr4 (42-100)||(17333298-17333356)
chr4 (135-228)||(13569624-13569716)
chr4 (59-123)||(16596686-16596751)
chr4 (437-490)||(32851868-32851921)
chr4 (336-384)||(3332201-3332248)
chr4 (25-89)||(13569502-13569566)
chr4 (424-520)||(14679339-14679435)
chr4 (336-368)||(15190632-15190664)
chr4 (40-88)||(15791793-15791841)
chr4 (251-303)||(20157130-20157182)
chr4 (251-303)||(24028970-24029022)
chr4 (337-377)||(39706052-39706092)
chr4 (148-228)||(44675757-44675836)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (21-525)||(8149-8650)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (24-508)||(22886-23370)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (21-520)||(4508-5008)
scaffold0228 (21-520)||(12090-12590)
scaffold0228 (21-520)||(22042-22542)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (21-525)||(16215-16721)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (21-525)||(39858-40361)
scaffold0026 (21-339)||(25896-26213)
scaffold0026 (425-525)||(39547-39647)
scaffold0026 (351-457)||(26555-26662)
scaffold0026 (425-463)||(59181-59219)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (23-406)||(39479-39861)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-406)||(74951-75333)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (21-520)||(1851-2351)
scaffold0016 (336-499)||(207161-207324)
scaffold0016 (251-303)||(207359-207411)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (21-525)||(8479-8980)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (73-520)||(13144-13592)
scaffold0175 (21-135)||(34123-34238)
scaffold0175 (337-525)||(34437-34625)
scaffold0175 (21-76)||(273-328)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (21-525)||(13211-13705)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (39-520)||(23923-24406)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (21-525)||(5737-6245)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (21-308)||(2985-3271)
scaffold0540 (320-525)||(629-835)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (21-525)||(676-1169)
[»] scaffold0021 (9 HSPs)
scaffold0021 (157-525)||(124722-125087)
scaffold0021 (22-204)||(174767-174949)
scaffold0021 (21-90)||(121766-121835)
scaffold0021 (431-510)||(62972-63051)
scaffold0021 (40-138)||(136370-136471)
scaffold0021 (40-138)||(145078-145179)
scaffold0021 (458-525)||(175202-175269)
scaffold0021 (335-376)||(136132-136173)
scaffold0021 (335-376)||(144840-144881)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (80-525)||(578-1021)
scaffold0395 (21-87)||(4888-4954)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (21-525)||(32575-33077)
scaffold0120 (21-525)||(45928-46430)
scaffold0120 (257-520)||(16323-16586)
scaffold0120 (21-232)||(16113-16323)
scaffold0120 (21-82)||(17389-17450)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (21-520)||(4849-5337)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (21-525)||(13497-13989)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (21-525)||(10053-10544)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (42-525)||(4545-5028)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (21-525)||(4712-5206)
scaffold0358 (86-525)||(1-430)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (101-413)||(27911-28222)
scaffold0130 (425-525)||(28941-29041)
scaffold0130 (22-57)||(27878-27913)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (21-525)||(1952-2446)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (21-525)||(15092-15584)
scaffold0114 (449-525)||(32892-32968)
scaffold0114 (25-89)||(7295-7359)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (21-525)||(32067-32558)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (40-508)||(51517-51985)
scaffold0034 (21-143)||(32538-32658)
scaffold0034 (270-377)||(32784-32892)
scaffold0034 (431-490)||(32947-33006)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (21-525)||(16282-16773)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (213-525)||(20595-20908)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (21-525)||(679-1170)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (21-376)||(20910-21265)
scaffold0088 (424-520)||(21294-21390)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (24-525)||(4758-5246)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (24-508)||(16784-17268)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (40-525)||(20042-20524)
scaffold0031 (21-187)||(128751-128917)
scaffold0031 (25-204)||(65730-65915)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (22-225)||(3103-3306)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (180-525)||(10323-10663)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (80-525)||(6669-7104)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (21-525)||(7266-7757)
scaffold0106 (21-525)||(1289-1780)
scaffold0106 (24-89)||(15291-15356)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (21-519)||(51582-52067)
scaffold0032 (424-510)||(108967-109053)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (280-525)||(163-409)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (21-525)||(46995-47480)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (201-525)||(17624-17927)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (84-247)||(3424-3588)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (158-499)||(1052-1382)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (210-494)||(11171-11445)
scaffold0235 (21-137)||(11447-11564)
scaffold0235 (436-490)||(14055-14109)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (179-499)||(3640-3949)
scaffold0165 (179-499)||(7704-8013)
scaffold0165 (36-227)||(27663-27855)
scaffold0165 (436-490)||(27293-27347)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (24-236)||(116430-116631)
scaffold0022 (40-143)||(128967-129072)
scaffold0022 (28-142)||(78328-78445)
scaffold0022 (336-376)||(128735-128775)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (257-525)||(15231-15500)
scaffold0413 (40-145)||(12587-12693)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (272-525)||(1694-1947)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (36-374)||(15866-16206)
scaffold0357 (40-312)||(13147-13421)
scaffold0357 (40-100)||(2680-2741)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (21-139)||(28414-28533)
scaffold0046 (21-135)||(11292-11407)
scaffold0046 (21-135)||(1997-2112)
scaffold0046 (21-74)||(4552-4605)
scaffold0046 (457-525)||(14914-14982)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (36-167)||(8481-8613)
scaffold0621 (21-146)||(6535-6661)
scaffold0621 (431-510)||(6948-7026)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (335-525)||(20426-20617)
scaffold0100 (25-126)||(23898-24000)
[»] scaffold0023 (10 HSPs)
scaffold0023 (24-169)||(44454-44600)
scaffold0023 (24-186)||(94411-94573)
scaffold0023 (28-186)||(17440-17598)
scaffold0023 (25-146)||(100378-100500)
scaffold0023 (25-146)||(40169-40291)
scaffold0023 (335-510)||(101709-101884)
scaffold0023 (21-92)||(119875-119947)
scaffold0023 (25-97)||(101503-101576)
scaffold0023 (25-228)||(38394-38596)
scaffold0023 (160-228)||(23581-23647)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (24-186)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (24-186)||(37821-37983)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (24-186)||(136680-136842)
scaffold0028 (24-186)||(139149-139311)
scaffold0028 (24-186)||(144087-144249)
scaffold0028 (24-186)||(134211-134373)
scaffold0028 (24-186)||(141618-141780)
scaffold0028 (335-510)||(132967-133143)
scaffold0028 (23-146)||(62200-62321)
scaffold0028 (25-98)||(132662-132736)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (24-169)||(13392-13537)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (24-186)||(4694-4856)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (24-186)||(13947-14109)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (23-186)||(10772-10935)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (24-186)||(82072-82234)
scaffold0037 (336-525)||(79948-80137)
scaffold0037 (36-167)||(22645-22776)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (28-186)||(501088-501246)
scaffold0001 (25-146)||(160688-160809)
scaffold0001 (24-227)||(85539-85742)
scaffold0001 (336-508)||(161000-161173)
scaffold0001 (40-89)||(497445-497494)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (21-286)||(17882-18148)
scaffold0247 (24-227)||(2088-2291)
scaffold0247 (425-520)||(6449-6544)
scaffold0247 (320-376)||(6561-6617)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (78-312)||(225465-225698)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (40-376)||(60479-60818)
scaffold0010 (33-167)||(129917-130051)
scaffold0010 (431-510)||(130318-130397)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (22-186)||(11286-11450)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (395-525)||(18574-18705)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (24-186)||(40400-40562)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (257-508)||(12165-12416)
scaffold0503 (40-82)||(11982-12024)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (25-146)||(19268-19390)
scaffold0102 (328-510)||(19573-19756)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (22-186)||(12249-12413)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (23-186)||(9241-9404)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (25-167)||(133-275)
scaffold1984 (328-510)||(437-620)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (24-186)||(106-268)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (25-146)||(2801-2923)
scaffold0628 (335-510)||(2434-2609)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (424-525)||(2701-2802)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (424-525)||(13224-13325)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (24-164)||(38679-38820)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (24-186)||(4214-4377)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (27-186)||(4300-4459)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (24-186)||(12064-12220)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (339-525)||(12425-12611)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (40-199)||(53491-53651)
scaffold0075 (336-520)||(7915-8099)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (336-525)||(344-532)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (21-135)||(1075-1190)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (21-130)||(15788-15898)
scaffold0020 (431-509)||(15462-15540)
scaffold0020 (25-88)||(178898-178961)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (424-525)||(10548-10649)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (27-131)||(1336-1440)
[»] scaffold0556 (3 HSPs)
scaffold0556 (336-510)||(7126-7301)
scaffold0556 (33-135)||(6824-6927)
scaffold0556 (93-143)||(8088-8138)
[»] scaffold0555 (4 HSPs)
scaffold0555 (36-167)||(10516-10647)
scaffold0555 (426-525)||(985-1084)
scaffold0555 (431-509)||(10200-10278)
scaffold0555 (335-377)||(10305-10347)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (21-236)||(11464-11680)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (21-128)||(6611-6719)
scaffold0333 (21-128)||(13991-14099)
scaffold0333 (431-509)||(7024-7102)
scaffold0333 (431-509)||(14404-14482)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (24-135)||(15664-15776)
scaffold0261 (425-525)||(16063-16163)
scaffold0261 (135-204)||(1452-1522)
scaffold0261 (336-384)||(15974-16021)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (24-186)||(161089-161252)
scaffold0007 (103-227)||(164550-164674)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (40-146)||(1051-1158)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (21-199)||(38198-38377)
scaffold0124 (336-525)||(24266-24456)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (21-138)||(1037-1155)
scaffold0530 (425-491)||(678-744)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (21-138)||(12766-12884)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (33-146)||(5655-5769)
scaffold0278 (431-510)||(6004-6083)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (21-130)||(6134-6244)
scaffold0243 (433-491)||(5772-5830)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (25-146)||(2640-2762)
scaffold0207 (431-508)||(2277-2354)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (336-520)||(2066-2250)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (25-138)||(12943-13057)
scaffold0138 (431-509)||(13351-13429)
scaffold0138 (82-169)||(18210-18298)
scaffold0138 (336-377)||(13255-13296)
scaffold0138 (424-520)||(29840-29936)
scaffold0138 (424-520)||(41836-41932)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (25-146)||(14692-14814)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (38-186)||(29946-30094)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (36-143)||(10542-10650)
scaffold0078 (431-490)||(10939-10998)
scaffold0078 (335-377)||(10842-10884)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (25-143)||(1086-1205)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (336-525)||(9391-9581)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (425-520)||(28901-28996)
scaffold0218 (36-138)||(8075-8180)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (25-228)||(23843-24048)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (336-520)||(10226-10410)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (25-142)||(45791-45909)
scaffold0125 (336-510)||(45420-45596)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (336-518)||(9457-9639)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (36-300)||(25121-25385)
scaffold0123 (70-312)||(586-828)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (42-199)||(8001-8161)
scaffold0507 (431-490)||(7708-7767)
scaffold0507 (335-377)||(7822-7864)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (335-510)||(32397-32573)
scaffold0150 (25-123)||(32102-32202)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (431-510)||(28440-28519)
scaffold0211 (25-97)||(28813-28887)
scaffold0211 (335-377)||(28574-28616)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (431-508)||(3343-3420)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (40-169)||(6255-6386)
scaffold0420 (40-86)||(13793-13840)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (44-169)||(38339-38466)
scaffold0139 (25-204)||(19980-20165)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (443-525)||(10888-10970)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (40-169)||(97024-97155)
scaffold0006 (40-169)||(106302-106433)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (76-146)||(2213-2283)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (40-142)||(267679-267784)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (70-195)||(15362-15486)
scaffold0107 (465-520)||(15051-15106)
scaffold0107 (40-89)||(36199-36248)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (465-520)||(1077-1132)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (40-138)||(569-669)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (40-142)||(1795-1900)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (25-185)||(29558-29720)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (431-508)||(1934-2011)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (25-228)||(36454-36662)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (48-228)||(16264-16442)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (40-126)||(2694-2783)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (36-138)||(103632-103737)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (25-228)||(69794-70000)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (132-239)||(32544-32650)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (48-189)||(29117-29262)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (42-100)||(206566-206624)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (135-228)||(15584-15676)
scaffold0297 (25-89)||(10575-10639)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (108-169)||(13092-13153)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (431-487)||(43438-43494)
scaffold0116 (431-487)||(47358-47414)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (163-202)||(1166-1205)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (73-169)||(57-154)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (465-520)||(17345-17400)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (431-490)||(12406-12465)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (436-490)||(586-640)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (436-490)||(35521-35575)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (258-312)||(24427-24481)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (44-89)||(813-858)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (25-89)||(1881-1945)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (25-89)||(21856-21920)
scaffold0210 (25-89)||(29748-29812)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (48-84)||(9536-9572)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 80)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50209830
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 50210135  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  50210134 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 50210035  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||     
T  50210034 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattccaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaat 50209936  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  50209935 ctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaggcatataa-gatcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatcttgcatgct 50209837  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  50209836 ctctggt 50209830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510285
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 34509981  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  34509982 aagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaaccctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacatgacactc 34510081  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||    
T  34510082 tgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttc-attctacaatctttccaggttcaatct 34510180  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  34510181 catcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaagaatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagctct 34510280  T
Q  521 gtggt 525  Q
     ||||    
T  34510281 ctggt 34510285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532774
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcc 22532368  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22532369 attgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 22532467  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  22532468 tcacagttcataaataacatcatcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctcaacagctcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaagtca 22532567  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  22532568 ctctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcaccgtggcgagttcaagtcagatttccaaaagttc-attctacaatccttccaggttcaa 22532666  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22532667 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaaatcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 22532766  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  22532767 tctctggt 22532774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250356
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 27250751  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  27250750 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagct 27250652  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||       
T  27250651 tcacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatataacaaggga 27250553  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| | || |   |||    ||   |||||| ||||     
T  27250552 ctctgtttctgtgtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgacgtggcgagttcaggtcagaatcccacaggt---ttc----at---tccaggttcaat 27250463  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||    
T  27250462 cccatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaatattacgaaatcttgcatgct 27250363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 97 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354188
Alignment:
Q  97 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaa 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  197 cattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaa 296  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacctaaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaa 22354418  T
Q  297 ggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaa 395  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |    
T  22354417 ggtcgc-aaaacctaacaagtcactctgtttctgggtcacttgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttca 22354319  T
Q  396 ttctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagt 494  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22354318 ttctacaatctatccaggttcaatctcatcctacgttatttcctaatcattataagacatgttcaagcactcaaaagcatataaggttcaactcaaaagt 22354219  T
Q  495 taaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22354218 caaaatcacaaaatcttgcatgctctctggt 22354188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 525
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135692
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| || | | | ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatctt-aaacagctt 20135386  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  20135387 cacagattataattaacaacatcattaggtcttactactaccctaaggttcaactctcaacaactcgtacaacaaaggtcgcataaacctaacaagtcac 20135486  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| |||  |||||| | ||| ||||||  |||    
T  20135487 tctgtttctgggttactcgcgaggtgagagcttctgctcgccatggcgagttc-ggtcagaattccaaaatgtttcattcta-agtctttccaggtccaa 20135584  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  20135585 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaagcactcaaaagcatctaaggataaactcaaaagtcaaaattacaaaatattgcatgc 20135684  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  20135685 tctctggt 20135692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21027174
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatca 21026779  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataat--tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacag 217  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  21026780 attgcaattcaacaacatcttaaatattca--aataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatc-ttaaacag 21026876  T
Q  218 cttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaga 317  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  21026877 cttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagt 21026975  T
Q  318 ctctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatc 416  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  | || |||||           ||  |||||| ||    
T  21026976 cactttgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagtttaggtcagaacctcacaagtt-----------tcattccaggttc 21027064  T
Q  417 aa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcat 515  Q
    || |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| || || ||||||||    
T  21027065 aatctcatcctacattcttacctaatcattattagacatgttcaagcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaggtcaaaattacaaattcttgcat 21027164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 520
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433507
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacggcaacac---aggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || |||||| |    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttta 433208  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    ||||| || ||||| || ||   |||   |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  | |    
T  433209 cagatcatcattaatattatttataatattcatagctaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcattt 433308  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
     ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  433309 -tgcaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaatct 433407  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  433408 cattctacattctttcctaatcattaatagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacggaatcttgcaagctct 433507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 157 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22356159 - 22355801
Alignment:
Q  157 ttcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaa-cattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaa 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22356159 ttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatctt-aaatagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaa 22356061  T
Q  256 tactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaa-gactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctc 354  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22356060 tgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtctc-aaaatctaacaatgtcactctgtttctaggtcactcgcgatgcga-agcctc 22355963  T
Q  355 tactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagaca 453  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||| | |    ||||      ||  |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355962 tgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccaca----aatt------tcattccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagaca 22355873  T
Q  454 tgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  22355872 tgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattatgaaatcttgcatgttctctggt 22355801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 157 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22357845 - 22357487
Alignment:
Q  157 ttcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaa-cattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaa 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22357845 ttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatctt-aaatagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaa 22357747  T
Q  256 tactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaa-gactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctc 354  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22357746 tgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtctc-aaaatctaacaatgtcactctgtttctaggtcactcgcgatgcga-agcctc 22357649  T
Q  355 tactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagaca 453  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||| | |    ||||      ||  |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357648 tgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccaca----aatt------tcattccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagaca 22357559  T
Q  454 tgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  22357558 tgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattatgaaatcttgcatgttctctggt 22357487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801018
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||  ||||| |||||||| ||||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa--cagcaagacataattatatca 38801412  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||| | | ||||||| | ||  ||||||||||||| |  |||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||| |  |||||    
T  38801411 aattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcataa-acattataacacatcgtaatcaacaacaacatatctt-attcagct 38801314  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |     
T  38801313 tcacaaattatagttaatctcattattaagtcttaatcctacccaagggttcaacttccgacaactcgtacaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtca 38801215  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||           |||||| ||||    
T  38801214 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagttcaat-----------tccaggttcaa 38801126  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| | |||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  38801125 tcacatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaagacatctaaagttcaactcaaaagtcaaaaatatgaaatcttgcatgc 38801026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 201 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20847160 - 20846846
Alignment:
Q  201 aacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20847160 aacacatctttaaacagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtc 20847061  T
Q  301 gcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattct 399  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  | || |||||           
T  20847060 gc-aaaatctaacaagtcactctgtttctgggtcactcgcgaggcaagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcaaaacctcacaagtt------- 20846969  T
Q  400 acaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaa 498  Q
        ||  |||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || |||    
T  20846968 ----tcattccaggttcaatctcatcctacattcttacctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaggtcaaa 20846873  T
Q  499 atcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    || || |||||||||||||||| ||||    
T  20846872 attacaaaatcttgcatgctctctggt 20846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468576
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     ||||| |||||||||||| || ||| || | |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatc-ttaaacagctt 22468619  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccc 263  Q
    ||||||||||||||| || | |||  | |||||||||||||||    
T  22468618 cacagattataattaccaacttcaaaaggtctcaatactaccc 22468576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593722
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| ||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacat 23593722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347249
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttc 221  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || |||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
Q  222 acagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    |||    |  ||||| || || |||||   |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  21347159 acaatacagcattaatattataattaatattcataaccaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaacgatcgcaaaaacctaa 21347249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574842
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacca 45574909  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  45574908 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758942
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||| |||  ||||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  133 aacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataa 232  Q
    |||||| |||  || |||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||  ||  ||| ||  ||||||||||||||| || |    
T  16758764 aacatcacaac-attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatca 16758862  T
Q  233 ttaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    |||| ||||| |  ||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  16758863 ttaatatcataaacaatcttcattacgaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaa 16758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342384
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataata 116  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 21342188  T
Q  117 tcaaatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaac 215  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||| ||||||  |||| |||||| ||  |||| | || |    
T  21342189 tcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatc 21342287  T
Q  216 agcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    |||||||||    |  ||||| || || |||||   |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  21342288 agcttcacaatacagcattaatattataattaatattcataaccaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaacgatcgcaaaaacctaa 21342384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||| |||||||||| ||   |||||||||||    
T  21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260860
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   | |||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatc 35261084  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||| ||   |||| ||||||| || | |||||| ||  ||||||  |||| ||||||| |||||  |||| |    
T  35261083 tcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattatcgttaata 35260984  T
Q  239 tcatcattaagtct-caatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcac 336  Q
    |||| ||  | ||| || ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||    | |||  |||||  ||    
T  35260983 tcat-atacaatctccattactaccccaatgttcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaagcaaggtattttgtaactgggaaac 35260885  T
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  35260884 tcgcgaggcgagggcctctactcgc 35260860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362092
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| ||||||    
T  16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacat 16362092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921864
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22921887  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22921886 caaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| ||   | ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861512
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21861573  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||| | ||   |||||||||||| |||| ||||||    
T  21861572 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 21861512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896198
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 21896259  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    ||||| || |||  |||||||| |||||| | ||   |||||||||||| |||| ||||||    
T  21896258 tcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 21896198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707285
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaa 21707285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711827
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaa 21711827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754166
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa 21754151  T
Q  127 gtcaacaacatctcaa 142  Q
     |||||||||||||||    
T  21754152 -tcaacaacatctcaa 21754166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847173
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatca 20847176  T
Q  120 aat 122  Q
    |||    
T  20847175 aat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212861
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13212929  T
Q  120 aatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  13212928 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 13212861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 20918917 - 20919106
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || ||||||| | ||| | |||| |||| |||   |||||||||    
T  20918917 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaatttaaattcta-agtcttttcaggttcaatctcattctacattct 20919014  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  20919015 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatgtaaggatcaactcaaaggtcaaaattataaaatcttgcatgctctctggt 20919106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 434 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21301245 - 21301159
Alignment:
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21301245 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 21301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681153
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 33681110  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  33681111 caagtcgtcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 33681153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataata 116  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 15860079  T
Q  117 tcaaatgcaagtcaa 131  Q
    | |||||||||||||    
T  15860078 ttaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 20248382  T
Q  124 caagtcaacaac 135  Q
    ||| ||||||||    
T  20248383 caaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237773
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22237730  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  22237731 caagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 22237773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714754
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||     |||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacgatatc 21714645  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    ||||  ||   | |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||   ||||    
T  21714646 aaataaaaacaagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaaacattatatcacatcatattcaacacta--acatctcataaca 21714742  T
Q  217 gcttcacagatt 228  Q
    ||||||||||||    
T  21714743 gcttcacagatt 21714754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295557
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 14295573  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  14295572 aatgtaaatcaacaac 14295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614088
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || | || |||||||| ||||||||    
T  50614119 tctcaaacat-cttttataattcatgtaatgca 50614088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621916
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || | || |||||||| ||||||||    
T  50621947 tctcaaacat-cttttataattcatgtaatgca 50621916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454593
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagc 102  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcacataaaacagc 20454593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 328 - 510
Target Start/End: Original strand, 33681316 - 33681499
Alignment:
Q  328 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacc 425  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   | || ||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   |    
T  33681316 ctgggtaattcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtgcaactcacaaaaattca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattc 33681414  T
Q  426 tacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  33681415 tccaatctttcctaatcattattagacatattcaggaactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 33681499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918719
Alignment:
Q  37 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 20918719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 336 - 500
Target Start/End: Original strand, 20248592 - 20248757
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||| |||   || |  |||    
T  20248592 ctcgcgaggcgatagcctctactcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaagtctctccaggttcaatctcattctccgatct 20248690  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  20248691 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctatggatcaactcaaaagtcaaaat 20248757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Original strand, 21754350 - 21754525
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | |||  ||||| |||| |||   || || ||    
T  21754350 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaa-ttca-ttctaaagtcttcccaggttcaatctctttctccaatc 21754447  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  21754448 tttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatct 21754525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  126 agtcaa 131  Q
    ||||||    
T  40389256 agtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 237
Target Start/End: Original strand, 48603652 - 48603730
Alignment:
Q  158 tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaac 237  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603652 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 52927786 - 52927612
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctt 434  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||  |||| |||| ||| | ||||| |||||| |||| |||   || || ||||    
T  52927786 tcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcgagttcaggtctaactttaaaaaattca-ttccaaaatctttccaggttcaatctcattctccaatctt 52927688  T
Q  435 tcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  52927687 tcataatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaagggtcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 52927612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52927993
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 52927993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41050033
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  41050038 tctcaa 41050033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 22921577 - 22921499
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  22921577 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaggtcaaaattacgaaatc 22921499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 508
Target Start/End: Original strand, 22238040 - 22238117
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22238040 tctttcctaaccattattagacatgttcaggcactcaaaaatatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 22238117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Original strand, 21162133 - 21162233
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||    
T  21162133 ctacattctttcccaatcgttattagacttattcaggcactcaaaagcatttaagggtcatctcaaaagtcaaaaacacagaatcttgcatgctctctgg 21162232  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  21162233 t 21162233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20091189 - 20091090
Alignment:
Q  426 tacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  20091189 tacattcactcctaatcaatattagacatgttcaggcaatcaaaggcatctaaggtttaactcaaaagtcaaaaataagaaatcttgcatgctctctggt 20091090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368284
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  16368289 tctcaa 16368284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 43697771 - 43697849
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43697771 tcttttctaatcataaatagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaagtcaaaattacgaaatc 43697849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16093987 - 16093738
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaa-caacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtc-aacaac 135  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||  | |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  16093987 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaaacaac 16093889  T
Q  136 atctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataatta 235  Q
    |||||||| || |||   ||||||| |||||| | ||   | |||||||||| | |||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| || | ||    
T  16093888 atctcaaacat-cataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacattcaatcatcttataacagcttcacagatcatcacta 16093790  T
Q  236 acatcatcattaagtct-caatactaccccaaggttcaactctcaacaactcg 287  Q
    |||| || ||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16093789 acattat-attcaatctccaattctaccccaaggatcaactcacatcaactcg 16093738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21788136 - 21787979
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||   |||| ||||||||||| |  ||||||||| | ||  |||||||||||| ||  ||    
T  21788136 gactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 21788037  T
Q  147 acattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
     || | |||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21788036 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaaca 21787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 376
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065295
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  26064959 tagaccaactcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaataccaa-tgcaaatcaacaacatc 26065057  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    ||||| || |||  |||||||||||||| || ||   | |||||||||| || |   |||| ||  | ||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  26065058 tcaaagat-catatataattcaagtaatacatatacaaatatatcacattattaatgacatcaaatcctcttataacaacttcacagattatcattaaca 26065156  T
Q  239 tcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcact 337  Q
    ||||    ||    || | ||||||||||| | |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||    |||||  |||||  |||    
T  26065157 tcatatacaacatccattcctaccccaaggataaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaaaccctaaacaaggtattctgtaactgggcaact 26065256  T
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  26065257 cgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 26065295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797694
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc--aagtaatg 167  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||| ||   |||||||  ||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattca--aataattcttaagtaatg 33797666  T
Q  168 cacattacattatatcacatcataatca 195  Q
    || |  |||||||||||||| |||||||    
T  33797667 cataaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 50686630 - 50686761
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |  |||||||||||||  | |||| ||  ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  50686630 cttagaccgactcatgcagtttagttaataaacaaacggcaacataggcagttcataaaatagttcatgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaaca 50686729  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  50686730 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 50686761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21533974 - 21533923
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagta 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  21533974 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacaacaacaacatacgcagta 21533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 20637165 - 20637206
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20637165 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggt 20637206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22130978 - 22130913
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  22130978 aacaacagcaacataggcagtatccaaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 22130913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21895941 - 21895883
Alignment:
Q  432 ctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||    
T  21895941 ctttcctaatcattattatacttgttcaggcactcataatcatctaaagatcaacttaa 21895883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27653106 - 27653052
Alignment:
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27653106 ctaccccaaggatcaactcataacatctcgtgcaacaaagatcgcaaaaccctaa 27653052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161769
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaa 21161769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22921672 - 22921631
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  22921672 tcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaagtc 22921631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28194254 - 28194213
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  28194254 ctcgcgaggcgagagcctctacttgccatggcgagttcaggt 28194213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35981492 - 35981451
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  35981492 ctcgcgaggcgagagcctctactcaccatggcgagttcaggt 35981451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52940761 - 52940708
Alignment:
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaaccta 311  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52940761 ctaccccaaggatcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaaaaccta 52940708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783160
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||| |||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaa 24783160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865266
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcag 42865266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529726
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 24529421  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529422 cagattatagttaacatcatcattaagtttcaatactaccccaaggttcaactctcaactactagtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 24529521  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||| ||    
T  24529522 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcagatcagaattccaaaagtttcattctacaacctttccaggttcaatct 24529621  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24529622 catcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactgaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 24529721  T
Q  521 gtggt 525  Q
     ||||    
T  24529722 ctggt 24529726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24494073
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 24493668  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  24493669 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatc-ttaaatagctt 24493767  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24493768 cacagattataattaacatcattattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacac 24493867  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| |||||| ||||     
T  24493868 tctgtttatgggttactcacgaggcgaaagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatccaaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaat 24493966  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24493967 ctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcgttcaaaagcatttaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 24494066  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  24494067 ctctggt 24494073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25422037
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25421631  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  25421632 attgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagct 25421730  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  25421731 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggca 25421830  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagatt-ccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |||||| ||||| ||||||  |||    
T  25421831 ctcggtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaagtcagatttccgaaagtttcattcta-aatctttccaggtccaa 25421929  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25421930 tctcatcctaagttctttcctaatcattaatagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 25422029  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  25422030 tctctggt 25422037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078457
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 9078051  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9078052 agtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 9078150  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| |     
T  9078151 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggca 9078250  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaag-ttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||    
T  9078251 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattcaaaaggtttcattcta-aatctttccaggttcaa 9078349  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9078350 tctcattctacattttttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatataaagatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 9078449  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  9078450 tctctggt 9078457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095994
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaa 13095594  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  13095595 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatctt-aaacaactt 13095693  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13095694 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 13095793  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||| ||||| ||||||  |||     
T  13095794 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagggcctctgctcgctgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattcta-aatctttccaggtccaat 13095892  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13095893 ctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggctttcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 13095992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096972
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatca 1096566  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  1096567 aatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagct 1096665  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||| || ||||||||  |||| ||| |     
T  1096666 tcataggttataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggtccaacttttaacaacttgtgcgacagagatcgcaaaattctaaaaaggca 1096765  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||    
T  1096766 ttctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttc-attctgcaatctttccagattcaa 1096864  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1096865 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 1096964  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  1096965 tctctggt 1096972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025810
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacatattgatatcaa 13025410  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  13025411 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatctt-aaacaactt 13025509  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13025510 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaaatcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 13025609  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||| ||||| ||||||  |||     
T  13025610 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagggcctttgctcgctgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattcta-aatctttccaggtccaat 13025708  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13025709 ctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggctttcaaaagtatctaaggatcaactcaaaattcaaaatcacgaaatcttgcatgct 13025808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431899
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25431493  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  25431494 attgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagct 25431592  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  25431593 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctacctcaaggttcaactctcaacaactcgtgtaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggca 25431692  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||  |||    
T  25431693 ctcgatttctgggtcactcgcgaggtgagagcctctactcgccgtggcgagttcaagtcagatttccaaaagtttcattcta-aatctttccaggtccaa 25431791  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25431792 tctcatcctaaattctttcctaatcattaataaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcacgc 25431891  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  25431892 tctctggt 25431899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390117
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23390518  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  23390517 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaatagct 23390419  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |     
T  23390418 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcacaaaatc-taacaaggca 23390320  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  23390319 ctctgttttagggtcactcgtgaggcgatagcctctactcgccatggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 23390220  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23390219 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttggatgc 23390120  T
Q  518 tct 520  Q
    |||    
T  23390119 tct 23390117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286469
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac--aaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatc 8286865  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8286864 aattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagc 8286766  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  8286765 ttcacataatataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctcaacaactcaagcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtc 8286667  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||| || ||| |||||           ||  |||||| |||    
T  8286666 actctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggctagtttaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttca 8286578  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8286577 atctcatcctacattctttcttaatcattattagacatgttccggcactcaaatgcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaacacgaaatcttgcatg 8286478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 124 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21985768
Alignment:
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||  |||||||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatctt-aaacaacttcac 21986066  T
Q  224 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctct 323  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21986065 aaattatagttaacatcatcatcaagtctgaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacactct 21985966  T
Q  324 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||| |||    
T  21985965 gtttctgggtcactcgcgaggcgagggcctctgcttgccgtggcgagttcaggtcagaattccaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaatctc 21985867  T
Q  422 gacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21985866 attctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 21985768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075513
Alignment:
Q  21 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatc 22075117  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataat--tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  22075118 aattgcaattcaacaacatcttaaatattca--aataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatc-ttaaaca 22075214  T
Q  217 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaag 316  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22075215 gcttcacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa--ctaacaag 22075312  T
Q  317 actctctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccagga 414  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | || |||||           ||  ||||||     
T  22075313 tcactctgttttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaacctcacaagtt-----------tcattccaggt 22075401  T
Q  415 tca-actcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgc 513  Q
    |||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22075402 tcattttcatcctacattcttacctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgc 22075501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154461
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| || ||| ||  |||| | || ||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 36154748  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    || || || ||||| |  ||   |||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  | |    
T  36154747 catatcatcattaataatatatataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcat-t 36154649  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  36154648 ctgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtcagattctcaaagttttattctaaaatctatccaggttcaatct 36154549  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36154548 cactctacattctttcctaatcattattagacatgttcaagcactcaaaagcatctaaggatcaacttaaaagtcaaaatcatgaaat 36154461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292611
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaa-cagtatgacataataatatcaa 21292992  T
Q  121 -atgcaagt-caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
     || ||| | || |||||||| |  |||||| | ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | ||| |    
T  21292991 tattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataa-acattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atacaac 21292894  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |    
T  21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtcttaatcctacccaagggtccaactcccgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaaaaagtc 21292795  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||           |||||| |||    
T  21292794 actctatttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattccacaagtttaat-----------tccaggttca 21292706  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatctt 511  Q
    | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  21292705 atctcatcctacattctttcctaattattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatctt 21292611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11580878
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||| | ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || || |||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaat-catcataaatcaacttca 11581165  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    |||||||| ||||| || ||   |||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||  | |    
T  11581164 cagattatcattaatattatatataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtacgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcat-t 11581066  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  11581065 ctgtaaatgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattctcaaagttttattctaaaatctatccaggttcaatct 11580966  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11580965 cattctacattctttcctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcttctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 11580878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22107358 - 22107000
Alignment:
Q  156 attcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaa 255  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22107358 attcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacacctt-aaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaa 22107260  T
Q  256 tactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 355  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22107259 tactactcaaaggttcatctctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaagta-tcacaaggcactctatttccgggtcactcgcgaggcgagagcctct 22107161  T
Q  356 actcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagaca 453  Q
     |||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||           | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22107160 gctcgccatggtgagttcaggtcagaatcccacaagtttaat-----------ttcaggttcaatctcgtcctacattctttcctaatcaatattagaca 22107072  T
Q  454 tgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| | |||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22107071 tgttcaggcactcaaacgcatctaaagttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaattttgcatgctctctggt 22107000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 22412286  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22412287 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat----------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagcttcac 22412375  T
Q  224 agattataattaa 236  Q
    |||||||||||||    
T  22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 470
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144500
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatc 22144167  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||  |||| |||||||| | || ||||| |    
T  22144168 tcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaata 22144267  T
Q  239 tcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcact 337  Q
    |||| |  ||   ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |  |||||  |||||  |||    
T  22144268 tcataaacaatcttcattacgactccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaag-cattctgtaactgggcaact 22144366  T
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttc 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||   | ||| |||  || |||||  |||   |||||| |||| ||| | ||| | ||||||    
T  22144367 cgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcaggtgtaactcccaaaaatccattcttaaattattccaggttcaatctcaatctagaatctttc 22144466  T
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaa 470  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22144467 ctaatcattgttacacatgttcaggcactcaaaa 22144500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21808411  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataat--tcaagtaatgcacattacattatatcacat 187  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21808410 attgcaattcaacaacatcttaaatattca--aataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729059
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 21997556  T
Q  120 aatgcaagt 128  Q
    |||||||||    
T  21997555 aatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732957
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 10732957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724108
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||  ||    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaaattaaa 37724007  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcaca 224  Q
     ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||    
T  37724008 ttcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaaacattatatcacatcatattcaacacta--acatctcaaaacagcttcaca 37724104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
     |||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 236
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-taacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 133  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcatttgcaattca-ca 18418691  T
Q  134 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataat 233  Q
    |||||| || ||| || | | | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18418692 acatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataat 18418790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245281
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgca 39245281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766035
Alignment:
Q  87 cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||        |||    
T  20766174 cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat---aagtac-------gaca 20766085  T
Q  187 tcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766084 tcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 336 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21871377 - 21871192
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| || ||| | ||||| |||||| |||| |||  |||||| |||    
T  21871377 ctcgcgagccgggagcctctactcgccatggcgagtacaggtcagaatcacaaaagtcca-ttccataatctttccaggttcaatctcatcctacactct 21871279  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21871278 ttcctaatcattaataaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 21871192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 336 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 21875657 - 21875472
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| || ||| | ||||| |||||| |||| |||  |||||| |||    
T  21875657 ctcgcgagccgggagcctctactcgccatggcgagtacaggtcagaatcacaaaagtcca-ttccataatctttccaggttcaatctcatcctacactct 21875559  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21875558 ttcctaatcattaataaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 21875472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902053
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  123 gcaagtcaa 131  Q
    |||||||||    
T  38619533 gcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154658
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22119998 - 22119809
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  22119998 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 22119901  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  22119900 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacaaaattttgcatgctctctggt 22119809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  126 agtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565688
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatccaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 21565645  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  21565646 caagtcatcaacatttcaaatat-caaacataattcatgtaatg 21565688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  124 caagtcaa 131  Q
    ||||||||    
T  23064611 caagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22959339 - 22959166
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||| |||   || || |||    
T  22959339 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaagtctctccaggttcaatctcattctccaatct 22959241  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22959240 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 22959166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  123 gcaagtcaa 131  Q
    |||||||||    
T  31061167 gcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  137 tc 138  Q
    ||    
T  20026943 tc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329500
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||     
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcg 21329519  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  21329518 aattcaagtcatcaacatc 21329500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502158
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||     
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcagcatgatataacaatatcg 21502178  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  21502177 aatgcaagtcatcatcatct 21502158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959538
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||  ||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatg 22959550  T
Q  124 caagtcaacaac 135  Q
    ||| ||||||||    
T  22959549 caaatcaacaac 22959538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 427 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19660551 - 19660453
Alignment:
Q  427 acattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  19660551 acattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacaaaatcttgcatgctctctggt 19660453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 510
Target Start/End: Original strand, 21565863 - 21566034
Alignment:
Q  340 cgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcc 437  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   |||| | ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   || || |||||||    
T  21565863 cgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtacaattcacgaaaattca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattctccaatctttcc 21565961  T
Q  438 taatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21565962 taatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 21566034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 24767142 - 24766960
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||  |||| |||  ||||||||||    
T  24767142 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatgacgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccagattcaatctcatcctacattct 24767045  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  24767044 ttcgtaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcgaaatcatgaaatcttgcatgct 24766960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26012033
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaacatgatataacaatatca 26012057  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||||  | ||||||||||||||||    
T  26012056 aatgtgaatcaacaacatctcaaa 26012033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660841
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| |||||     
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcttgatataatgatatcg 19660857  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||  || ||||||||    
T  19660856 aatataaatcaacaac 19660841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19669013
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || | ||| |||| ||||||     
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaatcatcgtgatataacaatatcg 19668997  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    ||||||| ||||||||    
T  19668998 aatgcaaatcaacaac 19669013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918017
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatat 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatat 20918017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178192
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  22178223 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 22178192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726069
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || |||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaagcatcatgatataataatatcg 40725952  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | || |||||    
T  40725953 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 40726052  T
Q  220 tcacagattataattaa 236  Q
    |||||||| || |||||    
T  40726053 tcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517170
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||     
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 172  Q
     |||| |||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||||||    
T  17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacat 17517170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  126 agtcaa 131  Q
    ||||||    
T  24067209 agtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 19669311 - 19669390
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  19669311 tctttcctaatcattattagacatgttcagacactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 19669390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 169
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448152
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catacgtaattcatgtaatg 29448150  T
Q  168 ca 169  Q
    ||    
T  29448151 ca 29448152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704160
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 109  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26704160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973893
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 109  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806852
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca 76  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaaca 20806852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873453
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||   ||  ||||||   ||| ||  ||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatctcatttcaaca---tcttaaccat 21873373  T
Q  147 acattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
     || | |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  21873374 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcacagatt 21873453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21329205 - 21329127
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21329205 tcttttctaatcataactagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 21329127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 139
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356432
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatacaaa-cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910801
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 20910801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  37 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 90  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5888981 - 5888940
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5888981 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggt 5888940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20910477 - 20910428
Alignment:
Q  476 taaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20910477 taaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 20910428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21501968 - 21501919
Alignment:
Q  328 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21501968 ctgggtaactcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcaggt 21501919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20026746 - 20026706
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcag 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20026746 actcgcgaggcgagagcctctactcgctgtggcgagttcag 20026706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21498733 - 21498649
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||| |||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  21498733 ctacaatctctcctaataattattatacatgttcaggcactcaaaaacatccaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgcaatc 21498649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 20026568 - 20026514
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  20026568 cctaatcattattatacatgttcaggcactcaaaatcatctaaagatcgacttaa 20026514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Original strand, 25744036 - 25744074
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttca 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25744036 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttca 25744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26740530 - 26740472
Alignment:
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaag 316  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  26740530 ctaccccaaggatcaactcacaacatctcttgcgacaaagatcgcaaaaccctaacaag 26740472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21741345 - 21741308
Alignment:
Q  340 cgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21741345 cgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggt 21741308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Original strand, 23469822 - 23469871
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||    
T  23469822 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 23469871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032387
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 22032387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22120085 - 22120033
Alignment:
Q  251 ctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgca 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  22120085 ctcattactatcccaaggttcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgca 22120033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 38761 - 39264
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 38860  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||| | |||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38861 atgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 38959  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38960 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 39059  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||| | ||||| |||||| |||| |    
T  39060 tatgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatccacaagtttcattc-aaaatctttccaggttcaatc 39158  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39159 tcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaacttcaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgctc 39258  T
Q  520 tgtggt 525  Q
    | ||||    
T  39259 tctggt 39264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33158
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 33041  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33042 atgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagctt 33140  T
Q  221 cacagattataattaaca 238  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  33141 cacagattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9867
Alignment:
Q  19 ggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatat 117  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatat 9842  T
Q  118 caaatgcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  9843 caagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 505
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29061025
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 29060639  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29060640 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 29060738  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  29060739 tcacagattataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctcttagcaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggca 29060838  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  29060839 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgtcgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttc-attctacaatctttccaggttcaa 29060937  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacga 505  Q
     |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  29060938 tctcatcctacattccttcctaatcattattggacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcgaaatcacga 29061025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303157
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaacaacatgacataataatatcaa 19303562  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  19303561 atgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttcaacagctt 19303463  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| | |    
T  19303462 cacagattataattaacatcatcattaattctcagtgctaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacatagatcgcaaaatcctaacaaggcac 19303363  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| | |||| ||||     
T  19303362 tctgtttctgggtcactctcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagtttcattcta-aatcttttcaggttcaat 19303264  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19303263 ctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagct 19303164  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  19303163 ctctggt 19303157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 22 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409443
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 18409749  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  18409748 cacatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccctaaggttcaactctcaataactcgtgcaacaaaggtcgtaaaatcctaacaaggcac 18409649  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||| |||||| ||||     
T  18409648 tctgtttctgggtcactagagaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattcaaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaat 18409550  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  18409549 ctcattctacattctttcctaatcattaatagacatgttaaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaggtcaaaatcacgaaatcctgcatgct 18409450  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  18409449 ctctggt 18409443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287412
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatca 17287818  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  17287817 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatctt-aaacagct 17287719  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||     
T  17287718 tcacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaagatagc-aaaccctaacaagaca 17287620  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||    
T  17287619 ctctgtttctgggtcactcacgagacaagagcctctaatcgccgtggcgagtttaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggtacaa 17287520  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17287519 tcacatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaagggtcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 17287420  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  17287419 tctctggt 17287412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594278
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 20593872  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20593873 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 20593971  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| |     
T  20593972 tcacagattataattatcattatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggca 20594071  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  20594072 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtagcgagttcaggtcagatttccaaaagtt-tattctacaatctttccaggttcaa 20594170  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  20594171 tctcatcctacattcttccctaatcatatttagacatgtttaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtaaaaatcacgaaatcttgcaagc 20594270  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  20594271 tctctggt 20594278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22779843
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatca 22780249  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22780248 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 22780150  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||     
T  22780149 tcacagattatgattaacatcatcattaagtctttatactaccccaaggttcaactctcggcaacttgtgcaacaaaggtcacaaaa-cctaacaggaca 22780051  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  22780050 ctctgtttctaggttactcgcgaggcgagagcctttgcttgccgtggcgagtttaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 22779951  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22779950 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 22779851  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  22779850 tctctggt 22779843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25628983
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatca 25629377  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25629376 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 25629278  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |     
T  25629277 tcacagattataattaacaacatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaactcgtgcaacaaaagtcgcaaaatcctaacaaggca 25629178  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||| | || ||||||||  |||||| ||| | |||||| ||||    
T  25629177 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccacggcgagtacaggtcataatcacaaaagtt-tattctaaaatatttccaggttcaa 25629079  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgc 513  Q
     |||   ||||| | |||||||||||||| |||| ||||| ||||  | || | ||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  25629078 tctcattctacaatatttcctaatcattaatagagatgtttaggcgcttaacaacatctaaggttcaactaaaaagtcaaaatcatgaaatcttgc 25628983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20637910
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 20638305  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| | | ||||||||  ||||| ||  |||  ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20638304 attgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 20638206  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  20638205 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaaggca 20638107  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| ||||    
T  20638106 ctctgtttctgggtcactcgcgaggtgagagcctttgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaa 20638018  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20638017 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttggatgc 20637918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360601
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatca 20360982  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  20360981 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagct 20360883  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  20360882 tcacatattataattaacctcatcattaagtcttaatactacccaaaggttcaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaagtca 20360784  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| ||||    
T  20360783 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctcagctcgccatggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaa 20360695  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatctt 511  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  20360694 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactgaaaagtcaaaaacacgaaatctt 20360601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 508
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18457202
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    |||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||||||||||| || ||||| |    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaata 18456932  T
Q  239 tcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcact 337  Q
    | ||   |||   |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| || |||||   ||||  |||    
T  18456933 ttatatataatattcataactgccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctgaacaaggct-tctgtaattgggcaact 18457031  T
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattcttt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||   |||||| |||| |||   |||||||||||    
T  18457032 cgcgaggcgagagcctctactcgccatggctagttcaggtcagcttccaaaaagttc-attct-taattaatccaggttcaatctcattctacattcttt 18457129  T
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18457130 cctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagttaaaatcacgaaat 18457202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920265
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa--catcatgacataagtatatca 16920654  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| | | ||| |||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||| |  |||||    
T  16920653 aattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataa-acattataccacatcataatcaacaacaacttatctt-attcagct 16920556  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||| |     
T  16920555 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgagaaatcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcc-aacaagtca 16920457  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||           ||||||  |||    
T  16920456 ctttgtttctgggtcactcgcaaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagaattccataagtttaat-----------tccaggtacaa 16920368  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     ||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16920367 tcttatcctacattcttttctaatcattattagacatattcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgc 16920268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831996
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | | |||  |  ||||||||||| ||||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttcaa--cgacatgacataatcatatca 22831600  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaat--atacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacag 217  Q
    ||| ||| ||| |||||||| | ||  |||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||    
T  22831601 aattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataa-acattataacacatcataatcaacaacaacatatctt-attcag 22831698  T
Q  218 cttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaga 317  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  | |||||| ||| |||||| | |||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| || ||||||     
T  22831699 cttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgacgaatcgtgcgacaaaggtcgcaaaatcc-aacaagt 22831797  T
Q  318 ctctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatc 416  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||  |||| |||           |||||| ||    
T  22831798 cactctgtttctcggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggttagaatcccatcagtttaat-----------tccaggttc 22831886  T
Q  417 aa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcat 515  Q
    || |||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  22831887 aatctcgtcctatattcttcactaatcaatattagacatgttcaaacactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcat 22831986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 230 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18821731 - 18821463
Alignment:
Q  230 taattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttct 329  Q
    ||||||| |||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  18821731 taattaatatcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactctgtttct 18821633  T
Q  330 gggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgaccta 427  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| |||| |||  ||||    
T  18821632 gggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaatctcatccta 18821544  T
Q  428 cattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  18821543 cattctctcctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 18821463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076863
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaaacagcatgacataataatatcaa 20076799  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacat 187  Q
    ||||||   | |||||||| ||| || || | ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  20076800 atgcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 335 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 29808691 - 29808499
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaa-tctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||| |||||| |||| |||   ||||||||    
T  29808691 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaaatctttccaggttcaatctcattctacattc 29808592  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29808591 ttttctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagttaaaatcacgaaatcttacatgctctctggt 29808499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644613
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  134 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataat 233  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||||||||||  ||   |||||||||||||| || |||||| ||  |||| |  | ||||||||||||| || ||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcat 25644534  T
Q  234 taacatcatcattaagtctcaat-actaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    ||| ||||| ||  | |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25644535 taatatcat-atataatctttataactaccccaaggttcaactctcagcaactcgtgcgacaaagatcgcaaaaacctaa 25644613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 335 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28496280 - 28496089
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||   ||||||||    
T  28496280 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattctcaaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcattctacattc 28496182  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28496181 ttttctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagttaaaatcacgaaatcttacatgctctctggt 28496089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496370
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 16496343  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  16496344 attgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 525
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185996
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| || ||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtacaa--caacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcatc 11185621  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    |    ||||||  |||  ||||||||||||| |  || ||||| ||| ||||||||| ||  |||| ||||| |  || ||||||||||||   |||||     
T  11185622 ttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcataa-actttataacacttcataatcagcaacaacatatctt-attcatcttcacagattacggttaacc 11185719  T
Q  239 tcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactc 338  Q
    |||  ||||||||| ||| |||||| | ||| | |  ||| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  11185720 tcactattaagtcttaatcctacccaagggtccgatcctcgacaacccatgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactatgtttctgggtcactc 11185818  T
Q  339 gcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttc 436  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||           |||||| |||| |||| |||||| ||||      
T  11185819 acgaggcgagggcctctgctcgccgtggcgagttcaggttagaatcccataagtttaat-----------tccaggttcaatctcgtcctacactcttca 11185907  T
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||| | |||   |||||||||| |||||||| ||||    
T  11185908 ctaatcaatattcgacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaaatcaaatatacgaaatcttacatgctctctggt 11185996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656791
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||| || ||| |||||| ||| ||   ||||||||| |||| || ||   |||||||||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcaca 25656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540928
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 1540928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595692
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 1595692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109285
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacataatataacaatatca 20109237  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  20109238 aatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatg 20109285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556894
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctcaatttcacat--ataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20556894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688644
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 25688644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227366
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 8227533  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | || |||||    
T  8227532 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 8227433  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8227432 tcacagatcatcattaatattataattaatattcataactaccctaaggttcaactctcaacaactc 8227366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |   ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 21939699 - 21939888
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  21939699 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagttttattcta-agtctttccaggctcaatctcatcctacattct 21939796  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21939797 ttcctaatcaatattacacatgttcaggcactcaagggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 21939888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462024
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    |||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgca 18462024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  126 agtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac--aacaacatgacataataatatca 35245683  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatca 195  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  35245684 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652317
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19652298  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  19652299 caa-tcaacaacatctcaaa 19652317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25603478 - 25603001
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||  |  || ||| | ||||||||| |||    
T  25603478 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaattat 25603380  T
Q  147 acattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaac-attaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcat 245  Q
     || | | | ||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  25603379 tcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaa-acatctt-aaacagcttcacagattctattaaacatcgtcat 25603282  T
Q  246 taagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggc 345  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||| || ||||||   ||| ||||  | |||||||   |  |  ||| ||||||    
T  25603281 taagtcttaaagctacccaaaggttcaactctaagcaactcatgcgacacagatcgcaagt-cctcacaatgcactctgttctagactagctcacgaggc 25603183  T
Q  346 gagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaa--gttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatc 442  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||| ||| ||   |||  |||||| | ||| ||||||  ||| |||  | | |||||  ||||||||    
T  25603182 gagagcctctgctcgccatggtgagttcaagtcagaatcctaagttgtttcattcta-agtctttccaggtccaatctcatcatgcattcactcctaatc 25603084  T
Q  443 attattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25603083 attattagacatgttcaggcactcaaaggcgtttcaggttcaactcaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 25603001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 338 - 510
Target Start/End: Original strand, 19652512 - 19652685
Alignment:
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattcttt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||| |||   || || |||||    
T  19652512 cgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtacaattcacaaaaattca-ttctaaagtctttccaggttcaatctcattcttcaatcttt 19652610  T
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  19652611 cctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatttaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 19652685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Original strand, 1561708 - 1561808
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  1561708 ctactttctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctgg 1561807  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  1561808 t 1561808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041430
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  147 acattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatt 246  Q
     || | | |  |||||||||||||| ||||||| | || ||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  15041544 tcaataaaatctcaagtaatgcaca-tacattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatc-ttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatt 15041447  T
Q  247 aagtctcaatactaccc 263  Q
    | |||||| ||||||||    
T  15041446 aggtctcattactaccc 15041430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019529
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23019505  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23019506 aatgcaagtcaacaacatctcaaa 23019529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561418
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1561402  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    ||||||| ||||||||    
T  1561403 aatgcaaatcaacaac 1561418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4668019 - 4667829
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||  ||| |||   |||||||||    
T  4668019 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaactctttccaggtccaatctcactctacattct 4667921  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  4667920 ttcctaatcgttattagacttgttcaggcactcaaaagcatctaagggtcatctcaaaagtcaaaaacacagaatcttgcatgctctctggt 4667829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821782
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  138 ctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcat-aatcaacattaaca 204  Q
    ||||| ||| |||| | | ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgta-tacattatatcacatcataaatcaacattaaca 18821782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 25611816 - 25611347
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||  |  || ||| | ||||||||| |||    
T  25611816 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaattat 25611718  T
Q  147 acattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaac-attaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcat 245  Q
     || | | | ||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||    
T  25611717 tcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaa-acatctt-aaacagcttcatagattctgttaaacatcgtcat 25611620  T
Q  246 taagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggc 345  Q
    ||||||  ||  |||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| ||| || ||||||   ||| ||||  | |||||||   |  |  ||||||||||    
T  25611619 taagtcctaaagctacccaaaggttcaactctaagtaactcatgcgacacagatcgcaagt-cctcacaatgcactctgttctagactagctcgcgaggc 25611521  T
Q  346 gagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaa--gttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatc 442  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||   |||  |||||| | ||| ||||||  ||| |||   || |||||  ||||||||    
T  25611520 gagagcctctgctctccatggcgagttcaggtcagaatcctaagttgtttcattcta-agtctttccaggtccaatctcatgctgcattcactcctaatc 25611422  T
Q  443 attattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25611421 attattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 25611347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496477
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 28496493  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  28496492 aatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808888
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 29808904  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  29808903 aatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333241
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27393981
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4185629 - 4185439
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||| |||   |||||||||    
T  4185629 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaactctttccaggttcaatctcactctacattct 4185531  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  4185530 ttcataatcgttattagacttgttcatgcactcaaaagcatctaagggtcatctcaaaagtcaaaaacacagaatcttgcatgctctctggt 4185439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 4189271 - 4189461
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||  ||| |||   |||||||||    
T  4189271 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatgacgagtttaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaactctttccaggtccaatctcactctacattct 4189369  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  4189370 ttcctaatcgttattagacttgttcaggcactcaaaagcatctaagggtcatctcaaaagtaaaaaacacagaatcttgcatgctctctggt 4189461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 4674866 - 4674676
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||  ||| |||   |||||||||    
T  4674866 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatgacgagttaaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaactctttccaggtccaatctcactctacattct 4674768  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  4674767 ttcctaatcgttattagacttgttcaggcactcaaaagcatctaagggtcatctcaaaagtcaaaaacacagaatcttgcatgctctctggt 4674676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  133 aacatc 138  Q
    ||||||    
T  19668486 aacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 82  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098518
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||   ||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  133 aac 135  Q
    |||    
T  9098520 aac 9098518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22334597 - 22334498
Alignment:
Q  426 tacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  22334597 tacattcactcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaatttacgaaatcttgcatgctctctggt 22334498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15894145 - 15894051
Alignment:
Q  426 tacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  15894145 tacattcactcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaagtacgaaatcttgcatgctct 15894051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27333089 - 27332916
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaac-tcgacctacattctt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | || ||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||   ||| | ||||    
T  27333089 tcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtgcaactcacaaaacttca-ttctaaaatctttccaggttcaacctcattctaaaatctt 27332991  T
Q  435 tcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  27332990 tcctaatcatcattatacatgttcagccactcaaaagcatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattatgaaatc 27332916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 27393829 - 27393656
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaac-tcgacctacattctt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | || ||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||   ||| | ||||    
T  27393829 tcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtgcaactcacaaaacttca-ttctaaaatctttccaggttcaacctcattctaaaatctt 27393731  T
Q  435 tcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  27393730 tcctaatcatcattatacatgttcagccactcaaaagcatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattatgaaatc 27393656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847990
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||  ||||  |||||||  |||||| ||||||||     
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  19848014 tgcaattcaacaatatcttaaatat 19847990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5834443 - 5834367
Alignment:
Q  195 aacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttca 272  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5834443 aacattgacacatctt-aaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtcccaatactaccccaaggttca 5834367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 20177089 - 20177165
Alignment:
Q  195 aacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttca 272  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20177089 aacattgacacatctt-aaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtcccaatactaccccaaggttca 20177165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22158902 - 22158826
Alignment:
Q  195 aacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttca 272  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22158902 aacattgacacatctt-aaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtcccaatactaccccaaggttca 22158826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992576
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||     
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 172  Q
    ||||| |   |||||||| |||||| || | |||  |||||||||||||||    
T  23992529 tgcaatt---caacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacat 23992576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185827
Alignment:
Q  33 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||     
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcat 4185831  T
Q  132 caac 135  Q
    ||||    
T  4185830 caac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443126
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaaca 33443126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 31155114 - 31155014
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||  ||  ||||||||||||||| |||    
T  31155114 ctacattctttcccaatcgttattagacttattcaggcactcaaaagcatctaagggtcatctcaaaagtcaaaaaaacagaatcttgcatgctctctgg 31155015  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  31155014 t 31155014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 68  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 23019818 - 23019877
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  23019818 tctttcctaatcattatcacacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaacttaa 23019877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25642196 - 25642120
Alignment:
Q  129 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25642196 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 25642120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076810
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaaca 23076810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415943
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatacaaa-cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatct 27415943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008228
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaaca 35008228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Original strand, 4186379 - 4186482
Alignment:
Q  33 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||| |||  || ||||| |||| |||||| ||||||| |||     
T  4186379 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgcaactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattcat 4186478  T
Q  132 caac 135  Q
    ||||    
T  4186479 caac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22080447 - 22080368
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||| | |||||||||    
T  22080447 tcttttctaatcattattagacatgttcagtcactcaaaaacatctaaggttcaactaaaagtttaaagttacgaaatct 22080368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 525
Target Start/End: Original strand, 22439230 - 22439304
Alignment:
Q  451 acatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  22439230 acatcttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctctctggt 22439304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873205
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 109  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 19873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22080543 - 22080502
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22080543 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggt 22080502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 22432249 - 22432334
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 109  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 22438799 - 22438884
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat 109  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| | || |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27415619 - 27415570
Alignment:
Q  476 taaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27415619 taaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 27415570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 25956316 - 25956253
Alignment:
Q  446 attagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25956316 attagacatgttcaggcactcaaaaatatctaagattcaacttaaaagtcaaaattacgaaatc 25956253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863027
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaa 19863027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 89
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766759
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25641991 - 25641942
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc 385  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  25641991 ctcgcgaggcgagagcatctgctcgccgtggcgagttcaagccagattcc 25641942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155465
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4738666 - 4738626
Alignment:
Q  33 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 73  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4738666 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 62  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Original strand, 19668688 - 19668728
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19668688 ctcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 19668728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 19863089 - 19863184
Alignment:
Q  132 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  19863089 caacatctcaatcattcattcatatttcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcacattcaacacta--acatctcataacagcttcacagatt 19863184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 228
Target Start/End: Original strand, 19873231 - 19873326
Alignment:
Q  132 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  19873231 caacatctcaatcattcattcatatttcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcacattcaacacta--acatctcataacagcttcacagatt 19873326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 31164575 - 31164479
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||   |||  ||| ||||||| ||| || |||||  | ||||||||||||||||    
T  31164575 cctacattcattcctaatcattactaggtatgttcaggcactcaaggacatccaagtatcaactcaaatgtcaaaattgcaaaatcttgcatgctct 31164479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31316821 - 31316781
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcat 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31316821 cctacattcattcctaatcattactaggcatgttcaggcat 31316781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 132)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213337
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttta 40213641  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  40213640 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactc 40213541  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  40213540 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggttagattcccaaaagttca-ttctacaatctttccaggttcaatct 40213442  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  40213441 catcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaatgatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagctct 40213342  T
Q  521 gtggt 525  Q
     ||||    
T  40213341 ctggt 40213337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18439039
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 18438633  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18438634 aatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatctt-aaacagct 18438732  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18438733 tcacagattatagttaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacactcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagaca 18438832  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||    
T  18438833 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcaacttcaggtcagaattccaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaa 18438931  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18438932 tctcattttacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 18439031  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  18439032 tctctggt 18439039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476001
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 25476407  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  25476406 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatctt-aaacagct 25476308  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  25476307 tcacagattgtaattaacatcctcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggca 25476208  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatc-aa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| || |     
T  25476207 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgtcgtggcgagttcaggtcagattccaaaagtttcattctaaaatctttccaggttcgat 25476108  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25476107 ctcattctacattctttcataatcattattagacatgttcaggtactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatcttgcatgct 25476008  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  25476007 ctctggt 25476001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687392
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 26686986  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26686987 attgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 26687085  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  26687086 tcacagattataattaacatcctcattaagtcccaatactaccccaaagttcaactctcaacgattcgtgcaacaaaggtcgtaaaa-cctaacaagaca 26687184  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  26687185 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 26687284  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26687285 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgtttaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 26687384  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  26687385 tctctggt 26687392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424379
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataacaatatcaa 11424781  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
      |||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  11424780 tagcaaatcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatctt-aaacagctt 11424685  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11424684 cacagattaaaattaacatcaacattaagtctcaatactaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacac 11424585  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| |||||| ||||     
T  11424584 tctgtttctaggtcgctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagagttcaaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaat 11424486  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11424485 ctcattctacattatttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 11424386  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  11424385 ctctggt 11424379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973359
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 14972953  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14972954 aatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 14973052  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |  |||||||| ||||||||| |     
T  14973053 tcatagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacacaaatcgcaaaatcctaacaaggca 14973152  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| | | || | ||    
T  14973153 ctctgtttctgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattccaaaagttc-tttctaaaatcttttctggtttaa 14973251  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14973252 tctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagc 14973351  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  14973352 tctctggt 14973359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576449
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 124  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtataaacaacagcatgacataataatatcaattgc 14576850  T
Q  125 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcaca 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  14576849 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacaacttcaca 14576751  T
Q  225 gattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||    
T  14576750 gattataattaacatcatcattaaatcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactttg 14576651  T
Q  325 tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcg 422  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||| |||||| ||||  ||     
T  14576650 tttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagatttccaaaggtttcattcta-agtctttccaggttcaatgtca 14576552  T
Q  423 acctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgt 522  Q
      ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14576551 ttctacattcttttctaatcataattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctct 14576452  T
Q  523 ggt 525  Q
    |||    
T  14576451 ggt 14576449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 34 - 525
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14573093
Alignment:
Q  34 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  134 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataat 233  Q
    |||||| |||||| || | ||| ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  14572702 acatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatctt-aaacaacttcacaaattataat 14572800  T
Q  234 taacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggt 333  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||    
T  14572801 taacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaggtactctgtttctaggt 14572900  T
Q  334 cactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagatt-ccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacatt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| | ||| |||||| |||| |||   |||||||    
T  14572901 cactcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtcagatttccaaaggtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcattctacatt 14572999  T
Q  432 ctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  14573000 ctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaaacacaaaatcttgcatgctctttggt 14573093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488357
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17487955  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  17487956 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagat 17488054  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  17488055 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaaggca 17488153  T
Q  320 ctctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  17488154 ctctgttttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgatttcaggtcagaatcctacaagtttcattctacaatctttccaggttca 17488253  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17488254 atctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggatcatctcaaaagtcaaattcacgaaatcttgcatg 17488353  T
Q  517 ctct 520  Q
    ||||    
T  17488354 ctct 17488357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23082977
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 23083383  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  23083382 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatctt-aaacagct 23083284  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23083283 tcacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaatactacctcaaggttcaactctgaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagaca 23083185  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg-tcagattccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||  ||    
T  23083184 ctatgtttctgggtcattcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttaagggtcagaatccaaaaagtttcattcta-aatctttccaggtcca 23083086  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  |||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  23083085 atctcatcctacattttgtcctaatcactattagacatatccaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatctgacatg 23082986  T
Q  517 ctctgtggt 525  Q
    |||| ||||    
T  23082985 ctctctggt 23082977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 471
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442725
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13442373  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13442374 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 13442472  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  13442473 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgtcatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaaggca 13442571  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  13442572 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcaagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 13442671  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaag 471  Q
     |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13442672 tctcatcctacattttttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaag 13442725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499839
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17499437  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  17499438 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatctt-aaacagat 17499536  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  17499537 tcacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaaggca 17499635  T
Q  320 ctctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
    ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  17499636 ctctgttttctaggtcactagagaggcgagagcctctgctcaccgtggcgaattcaggtcagaatccaacaagtttcattctacaatctttccaggttca 17499735  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||     
T  17499736 atctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggatcatctcaaaagtcaaaatcatgaaatcttgcatt 17499835  T
Q  517 ctct 520  Q
    ||||    
T  17499836 ctct 17499839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 418
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841329
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 43841031  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43841032 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatc-ttaaacagct 43841130  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  43841131 tcacagattataattaacatcctcgttaagtcccaatactaccccaaagtcaaactctcaacaactcgtgtaacaaaggtcgc-aaaacctaacaagaca 43841229  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  43841230 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagggcctttgctcgctgtggcgagttcaggtcagaattccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 43841329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698063
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatca 20698457  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| | |||| ||   ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  20698456 attgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatc-ttgaacagct 20698359  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |     
T  20698358 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatccaaaggttcaactctcgacaactcgtgccacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtca 20698260  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| ||||    
T  20698259 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaa 20698171  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  20698170 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgc 20698071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 377
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386767
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  138 ctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaac 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  238 atcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcac 336  Q
    ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||| || |||||   ||||  ||    
T  42386628 atcataaacaagtcccaatactaccccaaggttcaactcacaacaactcgtgcgacaaagttcgcaaaatcctaaacaaggct-tctgtaattgggcaac 42386726  T
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42386727 tcgcgaggtgagagcctctactcgccatggcgagttcaggt 42386767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399700
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 12399308  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataat--tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacag 217  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  12399309 aatgcaattcaacaacatcttaaatattca--aataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatc-ttaaatag 12399405  T
Q  218 cttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaga 317  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||| |||||| |||| | ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||     
T  12399406 cttcacagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgctacccaaaggcttaatccccaacaactcgtgcaacaaaggtcggaaaa--ctaacaag- 12399502  T
Q  318 ctctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatc 416  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||           ||  |||||| ||    
T  12399503 -tcactgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctttactcgccgtggcgagttcaggtcagaacctcacaagtt-----------tcattccaggttc 12399590  T
Q  417 -aactcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcat 515  Q
     ||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||| ||||    
T  12399591 aaacccatcctatattttttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatctagcat 12399690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070321
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    |||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||   ||| |||||| ||  |||| | || |||||||||| || || ||||| |    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacaaatcatcattaata 53070602  T
Q  239 tcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcact 337  Q
    | ||    ||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| || |||||   ||||  |||    
T  53070601 ttatatacaatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggct-tctgtaattgggcaact 53070503  T
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattcttt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||   |||||| |||| |||   |||||||||||    
T  53070502 cgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtcagcttccaaaaagttc-attct-taattaatccaggttcaatctcattctacattcttt 53070405  T
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  53070404 cctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagctc 53070321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 24153227  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24153226 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagcttcac 24153128  T
Q  224 agattataattaa 236  Q
    |||||||||||||    
T  24153127 agattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 525
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030333
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataatt 234  Q
    | ||| |||||| || | | | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||| |||||| |     
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatctt-aaacagcttcacatattatatta 30030052  T
Q  235 aacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctggg-t 333  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||| ||||||| |    
T  30030053 aacatcatcattaagtcttaaagctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaaggcattctg-ttctgggat 30030150  T
Q  334 cactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacatt 431  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    |  ||      ||  |||||| |||| |||  || |||||    
T  30030151 tactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagtt-aggtcagaattccaaa----ctgtt------tcattccaggttcaatctcatcccacatt 30030239  T
Q  432 ctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  30030240 ctttcgtaatcattattagacatgttcagacactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaatttacgaaatcttgcatgctctctggt 30030333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 260 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17248168 - 17247913
Alignment:
Q  260 accccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctact 358  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17248168 accccaaggtttaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaattctaaacaagcat-tctgtaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgct 17248070  T
Q  359 cgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgtt 457  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248069 cgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaatctcattctacattctttcctaatcattattagacatgtt 17247970  T
Q  458 caggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgca 514  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17247969 caggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgca 17247913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166739
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 36166696  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166697 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618590
Alignment:
Q  35 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 21618558  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618559 catctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523492
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    ||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  ||||||||| ||||| || |||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacagcttctcagatcatcattaa 52523633  T
Q  237 catcatcattaagtc-tcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtc 334  Q
     ||| | ||  | || ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |  |||||  |||||      
T  52523632 tatc-ttatacaatcttcattactaccccaaagttcaactctcaatgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaag-cattctgtaactgggca 52523535  T
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  52523534 actcgtcaggcgagggcctctactcgctatggcgagttcaggt 52523492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172583
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29172583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
     |||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 312
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274979
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 137  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacat 23274804  T
Q  138 ctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaac 237  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||| | | ||   |||| ||||||| |||| |||||| ||  |||| | |  ||||||||||||| || |||||     
T  23274805 ctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagcttcacagatcatcattaat 23274904  T
Q  238 atcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    || || |||||   |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23274905 attataattaatattcataactatcccaaggctcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaaacctaa 23274979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340578
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||     
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaacatcatgatataataatatcg 24340745  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | || |||||    
T  24340744 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 24340645  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    |||||||| || ||||| ||  | | |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24340644 tcacagatcatcattaatattgtaaataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacaactc 24340578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848628
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 28848628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 350
Target Start/End: Original strand, 16796685 - 16796875
Alignment:
Q  158 tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaata 257  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||     
T  16796685 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatctt-aaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatg 16796783  T
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagag 350  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16796784 ctacccaaaggttcaactcttaacaattcgtgcaacaaaggtcgc-aaagtctcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgaggcgagag 16796875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 186
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  26 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgc 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  125 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469178
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  123 gcaagtcaacaacat 137  Q
    |||||||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  26 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgc 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  125 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 12340068 - 12340257
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  12340068 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcagtt-agattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 12340165  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12340166 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 12340257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   || |||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550497
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatca 43550545  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||    
T  43550544 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 43550497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977633
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097474
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||| | |||| |||||| ||||    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 16097474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165391
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaacaacatgatataccaatatcaaat 27165349  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 164  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  27165350 gcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagta 27165391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 525
Target Start/End: Original strand, 43842582 - 43842683
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43842582 cctacattctttcctaatcattattagacatgctcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactaaaaagtcaaaatcatgaaatcttgcatgctctctg 43842681  T
Q  524 gt 525  Q
    ||    
T  43842682 gt 43842683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  123 gcaagtcaa 131  Q
    |||||||||    
T  12119788 gcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  123 gcaagtcaa 131  Q
    |||||||||    
T  15412528 gcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210333
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 13210349  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13210348 aatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471047
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 15471027  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  15471028 caagtcatcaacatctcaaa 15471047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103957
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16103883  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||| | || | ||||||| |||| |||| ||||||    
T  16103884 caa-tcaacaacatctcaaatat-caaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacat 16103957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301527
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 53301570  T
Q  123 gcaagtca-acaacatctcaaatatacattcataattcaagta 164  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  53301569 gcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 53301527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  123 gcaagtcaa 131  Q
    |||||||||    
T  8499617 gcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Original strand, 14179727 - 14179827
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  14179727 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctgg 14179826  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  14179827 t 14179827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2050980
Alignment:
Q  82 ataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacatta 179  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||   ||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaatta 2051161  T
Q  180 tatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctca 279  Q
    |||||||| |||| |||||| ||  ||||||  | |||||||||| || || ||||| ||||| |  ||   ||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  2051160 tatcacattataaacaacatcaa-tcatcttatagcagcttcacaaatcatcattaatatcataaacaatcttcattacgacctcaatgttcaactctca 2051062  T
Q  280 acaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgc 361  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||| |  | |||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2051061 acaactcatgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaag-cattttgtaactgggcaactcacgaggcgagagcctctactcgc 2050980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 14669076 - 14669265
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  14669076 ctcgcgaggtgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 14669173  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14669174 ttcctattcaatattagacatgttcaggcactcaacgacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 14669265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307798
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 32307783  T
Q  127 gtcaacaacatctcaa 142  Q
     |||||||||||||||    
T  32307784 -tcaacaacatctcaa 32307798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234605
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 14234586  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  14234587 aatgcaagtcatcaacatc 14234605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 425 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 17247236 - 17247142
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17247236 ctacattctttcctaatcattattagacatgttccggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagctc 17247142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 143
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557105
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaa 143  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  10557084 gcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174257
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 12174277  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||   ||||||| |||||||||    
T  12174276 caa---aacaacaactcaaatat 12174257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642170
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 37642287  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | || |||||    
T  37642286 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 37642187  T
Q  220 tcacagattataattaa 236  Q
    |||||||| || |||||    
T  37642186 tcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 12852169 - 12851985
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||  |||||| | ||| |||||  |||| |||  ||||||||||    
T  12852169 ctcgcgaggcaagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattatcaaaagtttcattcta-agtctttccagattcaatctcatcctacattct 12852072  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12852071 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaagggcatctaaagttaaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 12851985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 510
Target Start/End: Original strand, 16097645 - 16097820
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  |||| ||||| |||| ||||| ||||| | |||| |||| |||   || || |||    
T  16097645 ctcgcgaggcgagagcctctactcaccatggcgagttcaggtccaattcacaaaaattca-ttctaaaatcttttcaggttcaatctcattctccaatct 16097743  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  16097744 ttcctaataattattagacatgttcagacactcaaaaacatttaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 16097820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 123
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494908
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaat 44494907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 14665921 - 14666110
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  14665921 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccattgcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 14666018  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  14666019 ttcctaatcaatattagccatgttcaggcactcaacgacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcataaaatcttgcatgctctctggt 14666110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 14735434 - 14735623
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  14735434 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccattgcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 14735531  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  14735532 ttcctaatcaatattagccatgttcaggcactcaacgacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcataaaatcttgcatgctctctggt 14735623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822417
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||     
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 172  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||||||    
T  46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacat 46822417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668091
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 49668094  T
Q  124 caa 126  Q
    |||    
T  49668093 caa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12934117 - 12933941
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   ||  | ||    
T  12934117 actcgcgaggcgagagtctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaatttca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattctctaatc 12934019  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  12934018 tttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaagtacgaaatct 12933941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737337
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac----aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||    | |||||||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T
Q  120 aat 122  Q
    |||    
T  17737335 aat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Original strand, 32307983 - 32308158
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| | |||||| |||| ||||| | |||  | ||| |||| |||   || || ||    
T  32307983 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcccaaaa-ttca-ttctaaagtcttcctaggttcaatctcattctccaatc 32308080  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  32308081 tttcctaatcattattagatatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 32308158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 49389446 - 49389275
Alignment:
Q  339 gcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttc 436  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||| |||   || || ||||||    
T  49389446 gcgaggcgagaacctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaa-ttca-ttctaaagtctctccaggttcaatctcattctccaatctttc 49389349  T
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  49389348 ctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 49389275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13210133 - 13209944
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttca-attctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||| ||||   |||||| | ||| |||||| |||| |||   |||| |||    
T  13210133 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttc-ggtcacattctcaagagttttcattcta-agtctttccaggttcaatctcattctactttc 13210036  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  13210035 tttcctaatcat-attagacatgtttaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 13209944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926083
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | ||||||||  |||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  137 tctcaaa 143  Q
    |||||||    
T  43926077 tctcaaa 43926083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9513026
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9513023  T
Q  124 caa 126  Q
    |||    
T  9513024 caa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9521001
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T
Q  124 caa 126  Q
    |||    
T  9520999 caa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251165
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  37251170 tctcaa 37251165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 12171827 - 12171750
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12171827 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactaaaaagtcaaaattacgaaat 12171750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 494
Target Start/End: Original strand, 9513321 - 9513384
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9513321 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagt 9513384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 494
Target Start/End: Original strand, 9521296 - 9521359
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9521296 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagt 9521359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 237
Target Start/End: Original strand, 14179570 - 14179648
Alignment:
Q  158 tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaac 237  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179570 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644674
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 127  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||| ||| |||     
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcattatataacaatatcgaatacaa- 1644689  T
Q  128 tcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||| |||||||    
T  1644688 tcaacaatatctcaa 1644674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511209
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||     
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 172  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| || | |||  |||||||||||||||    
T  12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgcacat 12511209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110349
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  22110354 tctcaa 22110349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 431 - 508
Target Start/End: Original strand, 16104191 - 16104268
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  16104191 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcagaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 16104268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 49667890 - 49667715
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| | |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   ||  | ||    
T  49667890 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcacaatatttca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattctctaatc 49667792  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  49667791 tttcctaatcattattagacatgttcaggcgctcaaaa-catctaaggatcaactcaaaagtcaaaagtacgaaatct 49667715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147431
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | || |||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 22147547  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||||| |||  |||| | || |||||    
T  22147546 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca-taaatcatcataaatcagct 22147448  T
Q  220 tcacagattataattaa 236  Q
    |||||||| || |||||    
T  22147447 tcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577948
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca 76  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca 45577948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 1644393 - 1644314
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  1644393 tctttcctaatcattatcagacatgttcaggcactcaaaaacatccaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 1644314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 424 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 4588532 - 4588457
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaa 499  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  4588532 cctacattctttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaa 4588457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194743
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 28194743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 408 - 520
Target Start/End: Original strand, 16809776 - 16809885
Alignment:
Q  408 tccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaa 506  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  |||||    
T  16809776 tccaggatcaatctcatcctacattctttcctaatcattatt----atgttcaagcactcaaaagcatttaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaa 16809871  T
Q  507 atcttgcatgctct 520  Q
    |||| |||||||||    
T  16809872 atctagcatgctct 16809885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378039
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2050911 - 2050852
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  2050911 tctttcctaatcattattacacatgttgaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaa 2050852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15877532 - 15877445
Alignment:
Q  438 taatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15877532 taatctttaataggcatcttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaactacgaaatcttgcatgctctctggt 15877445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606324
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| | | ||| |||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcacataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaaca 606330  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  606329 tctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Original strand, 12339985 - 12340027
Alignment:
Q  255 atactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaag 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12339985 atactacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaaag 12340027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 14234901 - 14234979
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  14234901 tctttcctaatcatcattatacatgttcaggcactcaaaaaaatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattatgaaatc 14234979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 15471335 - 15471413
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  15471335 tctttcctaatcatcattatacatgttcagggactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaggtcaaaattacgaaatc 15471413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 490
Target Start/End: Original strand, 324640 - 324705
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||    
T  324640 ctacaatctttcctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaagttcaacttaa 324705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 91
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagta 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 23408428 - 23408636
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatc 118  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||  ||||| |||||| |||||| |||     |||||    
T  23408428 catcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaacatagacagattacaacaacagcgtgacatcatacaacgatatc 23408527  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    || |  |||  | || ||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||   ||||    
T  23408528 aattaaaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgta-attaaacattatatcacatcatattcaacacta--acatctcataaca 23408624  T
Q  217 gcttcacagatt 228  Q
    ||||||||||||    
T  23408625 gcttcacagatt 23408636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 377
Target Start/End: Original strand, 324471 - 324591
Alignment:
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaa-aacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctcta 356  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||| || | ||||||||| ||   |||||||||||    |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  324471 ctaccccaaggatcaactcacatcaacttgtacgacaaaggtcacatttaacctaacaaggtgttctgtaacttggtaactcgcgaggcgagagcctcta 324570  T
Q  357 ctcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||  ||||| ||||||||    
T  324571 ctcgctatggcgagttcaggt 324591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856204
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcag 856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878104
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 15878104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 21618594 - 21618650
Alignment:
Q  180 tatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  21618594 tatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 21618650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 236
Target Start/End: Original strand, 36166747 - 36166799
Alignment:
Q  184 acatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  36166747 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15878057 - 15877984
Alignment:
Q  132 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15878057 caacatctcaatcattcattcataattcaagtaatg-aaattaatcattatatcacatcatattcaacactaaca 15877984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1644489 - 1644447
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  1644489 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggt 1644447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 14501615 - 14501669
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  14501615 cctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 14501669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665460
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata 84  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacata 14665460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22109980 - 22109926
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||    
T  22109980 cctaatcattattatacatgttcaggcactcaaaaacatctaaagttcaacttaa 22109926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 23275157 - 23275211
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  23275157 cctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 23275211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1465215 - 1465174
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1465215 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcaagttcaggt 1465174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 508
Target Start/End: Original strand, 11852006 - 11852055
Alignment:
Q  459 aggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  11852006 aggcactcaaaagcatctaaggttcaactgaaaagttaaaattacgaaat 11852055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37250973 - 37250932
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  37250973 actcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 37250932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 520
Target Start/End: Original strand, 839623 - 839719
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||   ||||  ||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||    
T  839623 cctacattcattcctaatcattactaggtatgttcaggcactcaaaggcactcaaggtccaacttaaaagtcgaaattgcaaaatcttacatgctct 839719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4588680 - 4588628
Alignment:
Q  251 ctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgca 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  4588680 ctcattactatcccaaggttcaactcataacaactcgtgcgacaaagctcgca 4588628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12171909 - 12171869
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12171909 tcgcgaggcgagagcctctactcgccatggccagttcaggt 12171869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668606
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22110156 - 22110116
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22110156 ctcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 22110116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22627240
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaa 22626835  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  22626836 atacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatctt-aaacagctt 22626934  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626935 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacac 22627034  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||     
T  22627035 tctgtttctagatcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcaagttcgggtcagatttccaaaggttc-attctacaatctttcgaggttcaat 22627133  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22627134 ctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 22627233  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  22627234 ctctggt 22627240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818026
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 18818431  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | || ||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18818430 attgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 18818332  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18818331 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccctaaatttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaagaca 18818233  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||     
T  18818232 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaaaccaaaagtttcattttacaatctttccaggttcaat 18818133  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18818132 ctcatcctacattttttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcatgaaatcttgcatgct 18818033  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  18818032 ctctggt 18818026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648665
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 28648966  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  28648965 cacatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 28648866  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc-agattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||  |||||| ||||| |||| | ||||     
T  28648865 tctgtttctgggtcatgcgcaaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcaaaattcaaaaggtttcattcta-aatctttccatgttcaat 28648767  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28648766 ctcatcctacattctttcataatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 28648667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 18 - 520
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759757
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 6759354  T
Q  117 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6759355 tcaaatgcaagtcaac---atctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaaca 6759451  T
Q  217 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| || | |||||| |||||||||    
T  6759452 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacacagattgcaaaatcctaacaag 6759551  T
Q  317 actctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggat 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||| | |    
T  6759552 acactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagtttcattctaaaatatttccaagtt 6759651  T
Q  416 caa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgca 514  Q
    ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6759652 caatctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaagcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgca 6759751  T
Q  515 tgctct 520  Q
     |||||    
T  6759752 agctct 6759757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875570
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaa 22875164  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22875165 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagctt 22875264  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||  ||||||||| | |    
T  22875265 cacagattataattaacatcaccattacatctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacatagatcgcaaagccctaacaagtcac 22875364  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| |    
T  22875365 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgtcatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaacc 22875464  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  22875465 tcgttctacaatctttcctaatcattattaaacatgtttagacgctcaaaagcatctaaggattaactcaaaggtcaaaatcacgaaatcttgcaagctc 22875564  T
Q  520 tgtggt 525  Q
    | ||||    
T  22875565 tctggt 22875570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536713
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 20536307  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  20536308 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aaacaact 20536406  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  20536407 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaacactcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaataagtca 20536505  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  20536506 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccataagtttcattctacaatctttccaggttcaa 20536605  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20536606 tctcatcctacattctttcctaatcattatcagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcgaaagtcaaaatcacaaaatcttgcatgc 20536705  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  20536706 tctctggt 20536713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406886
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23406478  T
Q  120 aatgcaagtcaacaa--catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacag 217  Q
    | ||||||||||||   ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||     
T  23406479 attgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatctt-aaacaa 23406577  T
Q  218 cttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaga 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  23406578 cttcacatattataattaacatcctcattaagtcccaatattatcccaaagttcaactctcaataactcgtgcaacaaaggtcacaaaa-cctaacaagg 23406676  T
Q  318 ctctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatc 416  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| ||||||  |    
T  23406677 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggtcc 23406776  T
Q  417 aa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcat 515  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23406777 aatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcat 23406876  T
Q  516 gctctgtggt 525  Q
    ||||| ||||    
T  23406877 gctctctggt 23406886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16091957
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 16092364  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  16092363 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaact 16092264  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| || |||||||| ||||||| | |     
T  16092263 tcgcatattataattaacatcatccttaagtctcaatattaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgtgacacagatcgcaaaatcctaacagggca 16092164  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || || ||||| | |||| | ||    
T  16092163 ctctgtttctgggtcactcgggaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattccaaaagttttttttta-aatcttttcaggtttaa 16092065  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16092064 tctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcatgcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagc 16091965  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  16091964 tctctggt 16091957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923544
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatca 21923950  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  21923949 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagct 21923851  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  21923850 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactacctcaaggttcaactctcaactactcgggcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaaggca 21923752  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg-tcagattccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||  |||||| ||||| | |||| |||    
T  21923751 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcaccgtggcgagttcagggtcagaatccaaaaagtttcattcta-aatcttttcaggttca 21923653  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  21923652 atctcatcctacattctgtcctaatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatctcacatg 21923553  T
Q  517 ctctgtggt 525  Q
    |||| ||||    
T  21923552 ctctctggt 21923544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18878853
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |  |||||||||||||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa----acaacataataatatcaa 18879257  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||    
T  18879256 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt--atcagctt 18879159  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| | |    
T  18879158 cacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggccgcaaaatc-taacaaggcac 18879060  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| ||||     
T  18879059 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgtcttggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaat 18878960  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18878959 ctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 18878860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 520
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23649053
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     |||||  ||||||||||| |||||| || | | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 23648752  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  23648753 aacagattataattaacatcatcattaggtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcataaacctaacaagtcac 23648852  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| |||  |||||| | ||| | ||||  |||    
T  23648853 tctgtttctgggttactcacgaggcgagagcctctgatcgccatggcgagttc-ggtcagaattccaaaatgtttcattcta-agtcttttcaggtccaa 23648950  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23648951 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcagtcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaaacatgaaatcttgcatgc 23649050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 508
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373237
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7372877  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||        |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7372878 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc--------ttatatcacaacataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 7372968  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7372969 tcacagattataattaacatcctcattaagtctcactaccaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaagaca 7373067  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||                     |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  7373068 ctctgtttctgggtcact---------------------cgccgtggcgagttcaggtcagaatttcacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 7373146  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  7373147 tttcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 7373237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918633
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 21919022  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacat-tcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| ||  | ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  21919021 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcataa-acattatatcacatcataatcagcagcaacacatctt-aaacagc 21918924  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||  ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  21918923 ttcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaatcttacccaagggttcaactctcgacaactcatgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtc 21918825  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||  |||          |||||| |||    
T  21918824 actctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcatt----------tccaggttca 21918735  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21918734 atctcttcctacattcttttctaatcattattagacatgttcaggcactccaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatg 21918635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971749
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaa 31971356  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     | ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||| |||    
T  31971357 ttccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatc-ttatacatctt 31971454  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |    
T  31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcagctctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtcac 31971553  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || || ||||| |||           |||||| ||||     
T  31971554 tctatttctgggtcgctcgcgaggtgacagcctctgctcgccggggcgagttcaggtcagaatctcacaagtttaat-----------tccaggttcaat 31971642  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31971643 ctcatcctacatcctttcctaatcattattagacatgttcaggcacacaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaacacgaaatcttgcatgct 31971742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598689
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||| ||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 41598385  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    ||||| || ||||| || ||   |||   |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||  | |    
T  41598386 cagatcatcattaatattatatataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcggcaaagatcgcaaaatcctaaacaagcat-t 41598484  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  41598485 ctgtaactaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaatct 41598584  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  41598585 cattctacattctttcataatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaagggtcaactcaaaagtcaaaatcacggaatcctgcaagctct 41598684  T
Q  521 gtggt 525  Q
     ||||    
T  41598685 ctggt 41598689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199274
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa-caacatgacataataatatca 16199667  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | | ||| ||| | |||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||    
T  16199666 atttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataa-acattatattacatcataatcaacaacaacatatctt-atacagct 16199569  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |     
T  16199568 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcc-aataagtca 16199470  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||           ||| ||||     
T  16199469 ctctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcgtctgctcgctgtggcgagttcaggtcagaatcccacagtttaattct-----------aggttcaat 16199381  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  16199380 ctcatcctacattctttcctaatcattataagacatgttaaggcactcaaaagcatccaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgct 16199281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130793
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaa 45131019  T
Q  121 atgcaagt-caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | ||| | || |||||||| |  |||||| | ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | ||||||    
T  45131018 tttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataa-acattatatcacatcataatcatcaacaacaaatctt-atacagct 45130921  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |     
T  45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaataagtca 45130822  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgag 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130821 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgag 45130793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 158 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 25363123 - 25362793
Alignment:
Q  158 tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaata 257  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  25363123 tcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaata 25363025  T
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctac 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  25363024 ctacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcaagaaaggtcgc-aaagtctcacaaggcactctgtttccgggtcactctcgaggcgagagcctctgc 25362926  T
Q  358 tcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatg 455  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25362925 tcgccatggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagtcatg 25362837  T
Q  456 ttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaa 499  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  25362836 ttcagtcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaa 25362793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219858
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaatagtatgacataataatatcaaatg 26219815  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219816 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225268
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-caatatacaaaacagtatgacataataatatcaaata 26225311  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225310 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13507914
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaacatcatgatataataatatcgaacgcaa 13508100  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacaga 226  Q
    || ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | |  ||| ||||||||    
T  13508099 gtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagtttcacaga 13508000  T
Q  227 ttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    | || ||||| || || |||||   |||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13507999 tcatcattaatattataattaatattcataactatcccacgattcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaaacctaa 13507914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801043
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtct 19801429  T
Q  140 caaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacat 239  Q
    ||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||||||||||| || |||||  |    
T  19801428 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaatgt 19801330  T
Q  240 catcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaaccta-acaagactctctgtttctgggtcactc 338  Q
     ||    ||   |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| || |||||  |      ||||    
T  19801329 tatatacaatattcataactaccccaaggttcaactctcaatgactcgtgcgacaaagatcgaaaaatcctaaacaaggct-tctgtaacacaagtactc 19801231  T
Q  339 gcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttc 436  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||   | ||| | ||||||  |  || | | | |||||| |||| ||    ||  | ||||||    
T  19801230 gcgaggcgaggacctctactcgccatggcgagttcaggtataactcccacaagttcgttcttaaactat-tccaggttcaatcttattctctagtctttc 19801132  T
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19801131 ctaatcattattagacatgttcaggcactcatatgcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 19801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597446
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaacatcatgatataataatatcgaacgcaa 13597632  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacaga 226  Q
    || ||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | |  ||| ||||||||    
T  13597631 gtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagtttcacaga 13597532  T
Q  227 ttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    | || ||||| || || |||||   |||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13597531 tcatcattaatattataattaatattcataactatcccacgattcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaaacctaa 13597446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389353
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac--aacagcatgacataattatatca 21389474  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||| |||  |||||    
T  21389473 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatc-ttattcagct 21389376  T
Q  220 tcacagattataattaacatcat 242  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395888
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac--aacagcatgagataattatatca 21396004  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| |  |||| ||| |||  |||||    
T  21396003 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatc-ttattcagct 21395906  T
Q  220 tcacagattataattaac 237  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21395905 tcacagattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790381
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac--aacagcatgagataattatatca 21790497  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| |  |||| ||| |||  |||||    
T  21790496 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatc-ttattcagct 21790399  T
Q  220 tcacagattataattaac 237  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21790398 tcacagattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855246
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 38855273  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38855272 aatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17611968
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 17612132  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||   ||||| ||  |||| | || |||||    
T  17612131 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattata---aacatcaaatcatcataaatcagct 17612035  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    |||||||| || ||||| ||  | | |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17612034 tcacagatcatcattaatattgtaaataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacaactc 17611968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||| ||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285720
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatg 21285700  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  21285701 caaatcaacaacatctcaaa 21285720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778722
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac--aacagcatgacataattatatca 21778800  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaaca 198  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  21778799 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaaca 21778722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgac---ataataatatca 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520486
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6520467  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  6520468 aatgcaagtcatcaacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Original strand, 21491397 - 21491497
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  21491397 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaacttaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctctctgg 21491496  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  21491497 t 21491497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5866082 - 5865893
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||||| | ||| | |||| |||| |||   |||||||||    
T  5866082 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattctctaaattttcattcta-agtcttttcaggttcaatctcattctacattct 5865985  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  5865984 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 5865893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498741
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 20498680  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||| | ||   |||||||||||| |||| ||||||    
T  20498681 tcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 20498741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866280
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 5866296  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  5866295 aatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141019
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||     
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgacataataatatcg 17141015  T
Q  120 aatg 123  Q
    ||||    
T  17141016 aatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491110
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||      
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 21491094  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  21491095 aatgtaaatcaacaac 21491110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataata 116  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataaga 19937076  T
Q  117 tcaaatgcaagtcaa 131  Q
    |||||||||||||||    
T  19937075 tcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673830
Alignment:
Q  33 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 21673815  T
Q  132 caacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||||||||    
T  21673816 caacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224081
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || || |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||| || ||||||| ||   |||||||||||    
T  26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcaca 26224081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355699
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || || || |||| |||||| ||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcacgatataacaatatcgaatg 26355716  T
Q  124 caagtcaacaacatctca 141  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  26355715 caa-tcaacaacatctca 26355699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Original strand, 17141318 - 17141418
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||| |||    
T  17141318 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtaaaaaatacaaaatcttgcatgctctctgg 17141417  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  17141418 t 17141418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439423
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcaca 224  Q
    ||||||| || |||  |||||||| |||||||| ||   | |||||||||| || |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  17439509 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290694
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 45290755  T
Q  127 gtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    | ||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  45290754 gccaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcaca 45290694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  37 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678071
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||     
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 172  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||||||    
T  18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacat 18678071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760839
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||  |||     
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgtaaatcatcatgatataacaatattgaatt 23760862  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  23760861 caaatcaacaacatctcaaatat 23760839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 424 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 45130748 - 45130647
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  45130748 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaattcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatggtctctg 45130649  T
Q  524 gt 525  Q
    ||    
T  45130648 gt 45130647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26355504 - 26355329
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||| ||| | || || |||    
T  26355504 ctcgtgaggcgagagcctctactcgccatggcaagttcaggtacaattcacaaaaattca-ttctaaagtctttccaggttcaatctcaatcttcaatct 26355406  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26355405 ctcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatttaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 26355329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 21249697 - 21249886
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||| | | ||| |||||| |||  |||  ||||||||||    
T  21249697 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattctccaaattttcattcca-agtctttccaggttcagtctcatcctacattct 21249794  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  21249795 ttcctaatcattattagacatgtttgggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatgcgaaatcttgcatgctctctggt 21249886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 21255535 - 21255724
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||| | | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  21255535 ctcgcgaggcgagagccgctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattctccaaattttcattcca-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 21255632  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  21255633 ttcctaatcattattagacatgtttgggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatgcgaaatcttgcatgctctctggt 21255724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121884
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||     
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 172  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||||||    
T  32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacat 32121884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116497
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  37116466 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 37116497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266990
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  137 tctcaaa 143  Q
    |||||||    
T  17266996 tctcaaa 17266990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  ||  ||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  133 aacatc 138  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249500
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat--aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21249483  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaac 135  Q
     |||| || ||||||||    
T  21249484 gaatgtaaatcaacaac 21249500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255338
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat--aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||| ||||||| |||  || ||||| |||||||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattcatcatgatataataatatc 21255321  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaac 135  Q
     |||| || ||||||||    
T  21255322 gaatgtaaatcaacaac 21255338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 510
Target Start/End: Original strand, 21674021 - 21674195
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctt 434  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   | || ||||  |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   || || ||||    
T  21674021 tcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcgagttcaggtgcaactcacaaatattca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattctccaatctt 21674119  T
Q  435 tcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21674120 tcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacgtccaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 21674195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 38854961 - 38854883
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  38854961 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 38854883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353144
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  137 tctcaaa 143  Q
    |||||||    
T  24353138 tctcaaa 24353144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 6520779 - 6520857
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6520779 tctttcctaattattattagacatgttcagacactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 6520857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 21389156 - 21389069
Alignment:
Q  438 taatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21389156 taatctttattaagcatcttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 21389069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Original strand, 22525579 - 22525637
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22525579 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacttaggcagtacataaaaca 22525637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  184 acatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23760548 - 23760481
Alignment:
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  | ||||||||| |||||| |||||    
T  23760548 tttcctaatcattattagacatgttcaggaactcaaaaacattcagggatcaactcaaaagtcaaaat 23760481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353843
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatc 118  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||     |||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 17353961  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca--cattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    |||| ||||  | || ||||||||  || |||||||||||||||||||| |  ||  |||| || |||||||||| ||||||| ||||  || |  ||||    
T  17353960 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgaaatca-aacatcatctcacatcatattcaacataaacatttcat--aaca 17353864  T
Q  217 gcttcacagattataattaac 237  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  17353863 gcttcacagattacaattaac 17353843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154928
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaaca 19154928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23776929 - 23776772
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||   |||| | ||||||||| |  ||||||||| | ||  |||||||||||| ||  ||    
T  23776929 gactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 23776830  T
Q  147 acattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
     || | |||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23776829 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaaca 23776772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 39834147 - 39834188
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39834147 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggt 39834188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40492921 - 40492849
Alignment:
Q  73 aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||||||| |||| |||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40492921 aacaacatcatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 40492849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 26219862 - 26219918
Alignment:
Q  180 tatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  26219862 tatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 28397569 - 28397617
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggca 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  28397569 cttagaccgactcatgcagcttaattaatagacaacaacaacataggca 28397617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13507713 - 13507660
Alignment:
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13507713 ctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 13507660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 13597245 - 13597192
Alignment:
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13597245 ctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 13597192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20502203 - 20502154
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||    
T  20502203 cttagaccgactcatgcagcttaattaacatacaacagcaacataggcag 20502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 19983218 - 19983297
Alignment:
Q  148 cattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  19983218 cattcataactcaagtaatgca-attaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcacagatt 19983297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Original strand, 37116664 - 37116704
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  37116664 ctcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 37116704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38855055 - 38855015
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38855055 tcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcgagttcaggt 38855015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337615
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatca 22337214  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  22337215 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatctt-aaacaact 22337313  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22337314 tcacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcacaaaaacctaacaagact 22337413  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||  |||||| ||||| |||||| ||||    
T  22337414 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgaattcaggtcagaactcaaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaa 22337512  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22337513 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcatacactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcagaatcacgaaatcttgcatgc 22337612  T
Q  518 tct 520  Q
    |||    
T  22337613 tct 22337615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660527
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaacaggatgacataataatatcaa 23660122  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23660123 atgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 23660221  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  23660222 tacaaattataattaacatcatcaataagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaataactcgtgcaataaaggtcacaaaaacctaacaaggcac 23660321  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||| |    
T  23660322 tctgtttctgggtcactcacgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagattccaaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaatc 23660421  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23660422 tcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctc 23660521  T
Q  520 tgtggt 525  Q
    | ||||    
T  23660522 tctggt 23660527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 522
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076942
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 23076541  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  23076542 attgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagctt-aaacagct 23076640  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  23076641 tcacagattataattaacatcatcataaaatcccaatactaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaaggca 23076739  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||  |||||| ||||| ||||||  |||     
T  23076740 ctctgtttctgggtaactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaattccaaagtttcattcta-aatctttccaggtccaat 23076838  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23076839 ctcatcctacattctttcctaattattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaacttaatagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 23076938  T
Q  519 ctgt 522  Q
    ||||    
T  23076939 ctgt 23076942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22737805
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22738202  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22738201 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 22738103  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  22738102 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaaggca 22738004  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||  |||||||||||| || ||| ||||    
T  22738003 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcagttcagaatcccacaagtttcattctacaatctttctaggttcaa 22737904  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22737903 tctcatcctacattctttcctaatcattattagatatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatg 22737805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22730854
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22731256  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||| | |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22731255 attgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 22731157  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccc-aaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  22731156 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccccaaggttcaattatcaacagctcgtgcaacaaagatcgcaaaa-cctaacaaggc 22731058  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  22731057 actctgtttctgggtgactcgtgaggcgagagcctttgctccccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttca 22730958  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22730957 atctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagttaaaatcacgaaatattgcatg 22730858  T
Q  517 ctct 520  Q
    ||||    
T  22730857 ctct 22730854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298431
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataat--tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||| ||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattca--aataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatc-ttatacagct 298737  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  298736 tcacatattatagttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtca 298638  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |||||| ||||| |||||| ||||    
T  298637 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattcta-aatctttccaggttcaa 298539  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  298538 tctcatcctatattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 298439  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  298438 tctctggt 298431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286350
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa--ca-gacataataatatcaa 23285961  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     ||||| ||| |||||||| |||||| ||    |  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  23285962 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagctt 23286060  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |    
T  23286061 cacagattataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctcaacaactcatgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtcac 23286159  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||  |     |||||      ||  |||| | |||| |    
T  23286160 tctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcataatctca-----caatt-----ttcattccatgttcaatc 23286249  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23286250 tcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgctc 23286349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060815
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23060612  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23060613 attgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagct 23060711  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |     
T  23060712 tcaca-attataattaacatcatcattaagtcccaatactaccccaaagttcaattctcaacaactcgtg-aacaaaggtcgc-aaaacctaacaaggca 23060808  T
Q  320 ctctgtt 326  Q
    |||||||    
T  23060809 ctctgtt 23060815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654026
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   || | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatctt-aaacagct 23654309  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  23654308 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtca 23654210  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||             | |||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||| |||           |||||| ||||    
T  23654209 ctctgtttctgggtcactcgcg-------------tgctcgccgtggcgagttcaagtcagaatcccaacagtttaat-----------tccaggttcaa 23654134  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  23654133 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcagtcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattatgaaatcttgcatgc 23654034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 175 - 518
Target Start/End: Original strand, 27753730 - 27754073
Alignment:
Q  175 cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  27753730 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaagcttcaac 27753828  T
Q  275 tctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttca 374  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27753829 tctcgacaactcgtgcaacgaaggtcgcaaaatc-taacaaggcactctgtttctgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttca 27753927  T
Q  375 ggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagc 472  Q
    ||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27753928 ggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttgaggcactcaaaagc 27754027  T
Q  473 atataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27754028 atctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 27754073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 37750
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 38136  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     | | | ||| || ||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||    
T  38135 tttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataa-acattatatcacatcataatcaacaacaacatgtctt-atacagctt 38038  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    || |||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |    
T  38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaagtctaacaagtcac 37939  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || || ||||| |||           |||||| ||||     
T  37938 tatgtttctgggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggttagaatctcacaagtttaat-----------tccaggttcaat 37850  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  37849 ctcatcctacatcttttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttccactcaaaagtcaaaaatacgaaattttgcatgct 37750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451562
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 136  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataa-tcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataatta 235  Q
    |||||| ||| |||| | | ||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||   | |  |||||||||||| ||| ||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacattaacatcccat--aacagcttcacaaattgtaatta 32451836  T
Q  236 acatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtca 335  Q
    | |||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  32451835 atatcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcatctctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactctgtttctgggtca 32451737  T
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||| | |||| |||  ||||||||||    
T  32451736 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccatgttcaatctcatcctacattct 32451637  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32451636 ctcctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 32451562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309599
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaa-caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 20309205  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||    
T  20309206 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataa-acattataacacatcataatcaacaacaacatatctt-attcagct 20309303  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| |     
T  20309304 tcacagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaaatcgtgcaacaagggtcgcaaaatc-taacaagtca 20309402  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||           |||||| ||||    
T  20309403 ctttgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcaccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttaat-----------tccaggttcaa 20309491  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  20309492 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatatccaggcactcaaaagcatataaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgc 20309591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708383
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 23708641  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| | |||||||||| || ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  |||||||    
T  23708640 attgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagct 23708541  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagac 318  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |  ||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||      
T  23708540 tcacagatcatcattaatatcataaacaatcttcattacgaccccaaggttcaactatcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagca 23708441  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    | |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  23708440 t-tctgtaactgggtaactcgcaaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcaggt 23708383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672118
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19671929  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| |  | |||||    
T  19671930 aacgcaagtaaacaacatctc-aatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa-tcatcatagatcagct 19672026  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    ||||||||||| ||||| || || | |||   |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  19672027 tcacagattatcattaatattataaataatattcataacta-cccaaggttcaactctcaacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaa 19672118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103348
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac-aaacagcatgacatgattatatcaa 23103418  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatca 189  Q
    || ||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  23103417 attcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgca-attaaacattatatcacatca 23103348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135735
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 23135735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    | ||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029871
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 45029871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  126 agtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 186
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  26 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgc 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  125 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529528
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaata-tacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||| |||||| |||||| || | |||  ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 24529528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175976
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 25175953  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  25175954 caaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
Q  26 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 101
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946737
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaacag 8946737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071972
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7707
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 7736  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||| || |||  |||||||||||||||    
T  7735 tcaaacattcatatataattcaagtaatg 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28292018 - 28291918
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  28292018 ctacattctttcctaatcattcttagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctgg 28291919  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  28291918 t 28291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20519976
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    ||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||   | |||||||||| || | | |||| ||  ||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  20520196 tctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcattaa 20520098  T
Q  237 catcatcattaagtct-caatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtc 334  Q
     ||||| ||  |  || || | ||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    |||||  || ||      
T  20520097 tatcat-atacaacctccattcctaccccaaggataaactcataacatctcgtgcaacaaagatcgcaaaaccctaaacaaggtattctgtaactaggca 20519999  T
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctac 357  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20519998 actcgcgaggcgagagcctctac 20519976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134208
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||| ||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcataatataacaatatcgaa 22134227  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctca 141  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  22134226 tgcaa-tcaataacatctca 22134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679702
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatc-aatg 7679687  T
Q  124 caagtcaacaacatc 138  Q
     |||||| |||||||    
T  7679688 taagtcatcaacatc 7679702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 172
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616337
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 172  Q
     |||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacat 25616337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22133927 - 22133848
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  22133927 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaagtacgaaatct 22133848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413035
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataata--atatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattaca-ttatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataat 233  Q
    |||||| || || |||  |||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| || | |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||  ||    
T  22413140 catctc-aacat-cataaataattcatgtaatgcata-tacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattaacat 22413044  T
Q  234 taacatcat 242  Q
    ||| |||||    
T  22413043 taatatcat 22413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207401
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  23207396 tctcaa 23207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 336 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 23071768 - 23071617
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||||| | ||| | |||| |||| |||   |||||||||    
T  23071768 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattctctaaattttcattcta-agtcttttcaggttcaatctcattctacattct 23071671  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaact 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  23071670 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaact 23071617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791398
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  137 tctcaaa 143  Q
    |||||||    
T  23791392 tctcaaa 23791398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786907
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||| |||  ||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaaccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 18786910  T
Q  133 aac 135  Q
    |||    
T  18786909 aac 18786907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643054
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 24643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22799220 - 22799063
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||   |||| |||| |||||| | |||||||||| | ||  |||||||||||| ||  ||    
T  22799220 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 22799121  T
Q  147 acattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
     || | |||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22799120 tcaataatatcttaagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 22799063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004873
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| | |||| ||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  137 tctcaaa 143  Q
    |||||||    
T  23004867 tctcaaa 23004873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697603
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 24697610  T
Q  137 tctcaaa 143  Q
    |||||||    
T  24697609 tctcaaa 24697603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 509
Target Start/End: Original strand, 25176254 - 25176331
Alignment:
Q  432 ctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  25176254 ctttcctaatcataattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaggtcaaaattacgaaatc 25176331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 474
Target Start/End: Original strand, 28406297 - 28406433
Alignment:
Q  339 gcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| || | ||||| ||||| | |||| |||| |||   || || ||||||    
T  28406297 gcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaatttta-ttctaaaatctttacaggttcaatctcattctccaatctttc 28406395  T
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcat 474  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28406396 ctaattattattagacatgttcaggcactcaaaagcat 28406433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019643
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||  | |||||||||||||||| | || |||||||||   |||| |||| |||||| | |||||||||| |     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||  |||||||||||| ||  || || | |||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 23019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22758725 - 22758652
Alignment:
Q  132 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22758725 caacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 22758652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22740973 - 22740897
Alignment:
Q  129 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22740973 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 22740897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287442
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtacataaaaca 23287442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  109 taataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25109037
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||| |||| |||||||||   || ||||||| |    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaatagttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaata 25109005  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  25109006 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 25109037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 23038048 - 23038217
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatcaaatgcaagtcaacaac 135  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||     |||||||||  ||   | ||||    
T  23038048 tagacggactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacgatatcaaataaaaacaagcaac 23038147  T
Q  136 atctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  23038148 atctcaatcattcattcataattcaagtaattca-attaaacattatatcacatcatatttaacactaaca 23038217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22740768 - 22740719
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc 385  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  22740768 ctcgcgaggcgagagcatctgctcgccgtggcgagttcaagccagattcc 22740719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 23100916 - 23100847
Alignment:
Q  456 ttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||| | |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23100916 ttcaggcacttaaaaacatctgaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgctctctggt 23100847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 25176158 - 25176199
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc 378  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25176158 tcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcgagttcaggtc 25176199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21916192 - 21916156
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata 84  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21916192 gactcatgcaacttagttaaataacaaaaacaacata 21916156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 368
Target Start/End: Original strand, 31756232 - 31756264
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31756232 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcg 31756264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 105)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3563980
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacaacttca 3564284  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  3564283 taggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactcttaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactc 3564184  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||    
T  3564183 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcatttgctcgctgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttc-attctacaatctttccaggttcaatct 3564085  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  3564084 catcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaagaatcaactcaaaagtcaaaataacgaaatcttgcaagctct 3563985  T
Q  521 gtggt 525  Q
     ||||    
T  3563984 ctggt 3563980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227980
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 38227580  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  38227581 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatctt-aaatatctt 38227679  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38227680 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaggcac 38227779  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| |||||| ||||     
T  38227780 tctgtttatgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatccaaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaat 38227878  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38227879 ctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 38227978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509694
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatca 9509288  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9509289 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 9509387  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |     
T  9509388 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcttgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggca 9509486  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  9509487 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctcctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 9509586  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9509587 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcatgaaatcttgcatgc 9509686  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  9509687 tctctggt 9509694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699337
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatc 12698930  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12698931 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagc 12699029  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12699030 ttcacagattataattaacatcctcattaactcttaatactaccccaaggttcaactatcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagtc 12699128  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaa-agttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||  |||| ||||||| |||||| |||    
T  12699129 actttgtttctgggtcactcacgaggtgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacgagtttcattcaacaatctttccaggttca 12699228  T
Q  418 actcga-cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12699229 atttcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatg 12699328  T
Q  517 ctctgtggt 525  Q
    |||| ||||    
T  12699329 ctctctggt 12699337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 36 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143667
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataatt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  235 aacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtc 334  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtcttagtactaccccgaggttcaactcttagcaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactctgtttctaggtc 15143845  T
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||   ||| | ||    
T  15143844 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagtacaggtcagaatcacaaaagttc-attctaaaatctttccaggttcaatctcattctaaaatc 15143746  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaact-taaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15143745 tttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggtacaactcaaaaagtcaaaatcacgaaatct 15143667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16385879
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    || || |  ||| |||||||| |||||| ||  ||    |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagc 16386171  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  16386170 ttcacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatgttacccaaaggttcaactctggacaactcatgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtc 16386072  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||           |||||| |||    
T  16386071 actctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagccactgctcgccgtggcgagttcaggttagaatcccacaagtttaat-----------tccaggttca 16385983  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16385982 atctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatg 16385883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212490
Alignment:
Q  21 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 118  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 26212094  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataat--tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26212095 aattgcaattcaacaacatcttaaatattca--aataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatc-ttaaaca 26212191  T
Q  217 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  26212192 gcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaa--ctaacaaa 26212289  T
Q  317 actctctg-tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccagga 414  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||           ||  ||||||     
T  26212290 tcactctgttttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaacctcacaagtt-----------tcattccaggt 26212378  T
Q  415 tcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgc 513  Q
    |||| |||  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  26212379 tcaatctcatcctacattcttacctaataaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgc 26212478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 518
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443875
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa-cagcatgacataataatatcaat 40443491  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttc 221  Q
    | ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | ||||||||    
T  40443492 ttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataa-acattatatcacatcataatcaacaacgacatatctt-atacagcttc 40443589  T
Q  222 acagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||    
T  40443590 acagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcatctctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcc-aataagtcact 40443688  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||           |||||| |||| |    
T  40443689 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-aat-----------tccaggttcaatc 40443776  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  40443777 tcatcctaaattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgct 40443875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061593
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcag-cagtatacaaaatagcatgacataataatatcaaat 17061979  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    |||||||| |||| |||||| |||  |   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||||||    
T  17061978 gcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttca 17061880  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    ||||| || ||||| || ||   |||   |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  | |    
T  17061879 cagatcattattaatattatatgtaatattcataactaccccatggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcat-t 17061781  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  17061780 ctgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccatcgcgagttcaggtcagattctcaaagttttattctaaaatctatccaggttcaatct 17061681  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17061680 cattctacattctttcctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 17061593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847460
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtacaa--cagtatgacataattatatca 27847854  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||    
T  27847853 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataa-acattatcacacatcataatcaacaacaacatatctt-attcagct 27847756  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  27847755 tcacagattatagttaatctcattattaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtca 27847657  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc-agattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | || ||| ||||| |||           |||||| ||||    
T  27847656 ctctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgcttgccgtggcgagttcaggtcaaaatcccataagtttaat-----------tccaggttcaa 27847568  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  27847567 tctcatcctaaattctttcctaatcataattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgc 27847468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 368
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589384
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatca 10589138  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||||||||||||  ||| | ||   ||  |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||    
T  10589139 attgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcataa-acattatatcacatcataatcagcaacaacacatctt-aaatagct 10589236  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |     
T  10589237 tcacagattataattaacctcatcattaagtcttaatcctacccaaaggtccaactctagacaactcgtgcaaaaaaggtcgc-aaaatctaacaagtca 10589335  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10589336 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcg 10589384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 18456431  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18456430 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagcttcac 18456332  T
Q  224 agattataattaa 236  Q
    |||||||||||||    
T  18456331 agattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116992
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||| |||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||| ||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 44116706  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    || || || ||||| || ||   ||    |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||  | |    
T  44116707 catatcatcattaatattatatatattattcataactaccccaaggttcaaccctcaacgactcgtgcaataaagatcgcaaaatcctaaactagcgt-t 44116805  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| || |||| ||    
T  44116806 ctgtaactgagtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattcta-aatctttccgggttcaatct 44116904  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  44116905 cattctacattctttcctaatcattattagacatgttcagggactcaaaggcatataaggatcaactcaagagtcaaaattacgaaat 44116992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2279883
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataataatatca 2280141  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| || || | |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  |||||||    
T  2280140 aatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagct 2280041  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagac 318  Q
    |||||||| || ||| | ||||| | |||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||| |    
T  2280040 tcacagatcatcattgatatcataaataatcttcattacgaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgtgacaaagatcgcaaaatcctaaacaag-c 2279942  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
      ||| |  || ||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  2279941 attctataactaggcaactcgcgaggcgagggcctctactcgctatggcgagttcaggt 2279883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273594
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||             ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatctc-aatatacattcataattcaagtaat----------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 48273580  T
Q  223 cagattataattaa 236  Q
    |||||||| |||||    
T  48273581 cagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756350
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtc 12756719  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    |||| ||| ||   | ||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || |||| |||||||| || ||||| |    
T  12756718 tcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcatcacagatcatcattaata 12756620  T
Q  239 tcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcact 337  Q
    | ||    ||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||| || | |||   ||||  |||    
T  12756619 ttatatacaatattcataactaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggcttt-tgtaattgggcaact 12756521  T
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattcttt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||   |||||| |||| |||   |||||||||||    
T  12756520 cgcgaggcgagagcctctactcgccatggtgagttcaggtcagcttccaaaaagttca-ttcttaaataa-tccaggttcaatctcattctacattcttt 12756423  T
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12756422 cctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 12756350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647491
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatca 13647424  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  13647425 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430874
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatca 18430807  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  18430808 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275316
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 24275316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410201
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 16410201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213852
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataa 192  Q
     |||||||||||| ||| || ||| ||   ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa 16213852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255556
Alignment:
Q  43 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||   ||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  140 caaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacat 239  Q
    |||| || |||  |||||||||||||| || ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  |||| ||||| |||| || ||||| ||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacaacttcatagatcatcattaatat 12255694  T
Q  240 catcattaagtc-tcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcact 337  Q
     || ||  | || ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||| |  |||||  |||||  |||    
T  12255693 -attatacaatcttcattactaccccaaaattcaactctcaacaactcgtgtgacaaagatcgcaaaatcctaaacaag-cattctgtaactgggaaact 12255596  T
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  12255595 cgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcaggt 12255556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386495
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||| || ||   |||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcaca 3386495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaa--aacaagacataataatatcaaatg 24704784  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  24704785 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 340 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39267447 - 39267262
Alignment:
Q  340 cgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcc 437  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||    
T  39267447 cgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattctttcc 39267350  T
Q  438 taatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39267349 taatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatataaggttcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatcttgcatgctctctggt 39267262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67867
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 67844  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  67845 aatgcaaatcaacaacatctcaa 67867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073037
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatctcaaa 22073037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  127 gtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2832110 - 2831922
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| | |||||||| ||||| | ||| || ||| |||| |||  ||||||||||    
T  2832110 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggtgagttcag-tcagattctccaaagttca-ttcta-agtctttctaggttcaatctcatcctacattct 2832014  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2832013 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 2831922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 9751355 - 9751166
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaac-tcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||| |||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  9751355 ctcgcgaggcgagagcctctgctcaccatggcgagttcag-tcaaattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaacctcatcctacattct 9751258  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9751257 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 9751166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831491
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 131
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  123 gcaagtcaa 131  Q
    |||||||||    
T  13869445 gcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495517
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 16495501  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  16495502 aatgtaaatcaacaac 16495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200901
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 34200885  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  34200886 aatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatggaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 18005749  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  18005750 caaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486599
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 19486766  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | || |||||    
T  19486765 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 19486666  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    |||||||| || ||||| ||  | |||||   |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19486665 tcacagatcatcattaatattttaattaatattcataactaccctaaggttcaactctcaacaactc 19486599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831925
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || | || ||||| |||| ||||||     
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatcatcatgatataacaatatcg 47831906  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  47831907 aatgcaagtcatcaacatc 47831925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014291
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 44014281  T
Q  124 caagtcaaca 133  Q
    ||| ||||||    
T  44014282 caaatcaaca 44014291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219719
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16219735  T
Q  124 caagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16219734 caagtcatcaacatct 16219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 18302494 - 18302683
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||  | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  18302494 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattatccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 18302591  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18302592 ttcctaataaatattagacatgttcaggcactcaagggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgctctctggt 18302683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 28505106 - 28504917
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||||| | ||| | |||| |||| |||   |||||||||    
T  28505106 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattctctaaattttcattcta-agtcttttcaggttcaatctcattctacattct 28505009  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  28505008 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctctctggt 28504917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505321
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatc 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110708
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20110708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996033
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||      
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatattg 11996049  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  11996048 aatgtaaatcaacaac 11996033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008278
Alignment:
Q  44 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  141 aaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatc 240  Q
    ||| || |||  ||||||||||||||||| ||   | |||||||||| || | |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15008498 aaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatatc 15008400  T
Q  241 atcattaagtctcaatac-taccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcactc 338  Q
    || ||  |  ||| || | ||| | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||    |||    |||||  ||||    
T  15008399 at-atacaacctccattcatactcgaaggttcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaaaccctaaacaaggtattctacaactgggcaactc 15008301  T
Q  339 gcgaggcgagagcctctactcgc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15008300 gcgaggcgagagcctctactcgc 15008278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754893
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 15754909  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15754908 aatgcaaatcaacaac 15754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811142
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 811149  T
Q  124 caagtca 130  Q
    |||||||    
T  811148 caagtca 811142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| | |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  133 aacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataa 232  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||| |||||||| ||   | |||||||||| || | |||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| || |    
T  1868002 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatc-ttaaaaagcttcacagatcatca 1867905  T
Q  233 ttaacatcat 242  Q
    |||| |||||    
T  1867904 ttaatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 810936 - 810760
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||| ||    || || ||    
T  810936 actcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtacagttcacaaaaattca-ttctaaattctttccaggttcaatcttattctccaatc 810838  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  810837 tttcctaatcattattagatatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 810760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15754603 - 15754503
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||| |||    
T  15754603 ctactttctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaattcgaaatcttgcatgctctctgg 15754504  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  15754503 t 15754503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 510
Target Start/End: Original strand, 44014489 - 44014664
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  |  ||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   || || |||    
T  44014489 ctcgcgaggcgagagcctctactcaccatggcgagttcaggtgcaactaacaaaaattca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattctccaatct 44014587  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  44014588 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaagtatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 44014664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 431 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 11995768 - 11995674
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11995768 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 11995674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |  | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  124 caa-gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatca 189  Q
    |||  |||||||||  | |||||| || | | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |  | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  124 caa-gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatca 189  Q
    |||  |||||||||  | |||||| || | | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |  | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  124 caa-gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatca 189  Q
    |||  |||||||||  | |||||| || | | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26355983
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagg----------cagtatacaaaa-cagcatgacataat 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |            |||||||||||| |||||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  113 aatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358435
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagg----------cagtatacaaaa-cagcatgacataat 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |            |||||||||||| |||||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  113 aatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 143
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056450
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaa 16056441  T
Q  135 catctcaaa 143  Q
    |||||||||    
T  16056442 catctcaaa 16056450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154773
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacag-----catgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |||||     ||| ||||||  |||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatcaa 18154857  T
Q  121 atgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||  ||  ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18154856 at--aaaacaagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaaacattatatcgcatcatattcaacattaaca 18154773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 429 - 525
Target Start/End: Original strand, 34201192 - 34201288
Alignment:
Q  429 attctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  34201192 attctttcttgatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 34201288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 18006052 - 18006131
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18006052 tctttcataatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 18006131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10063939 - 10063813
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||     
T  10063939 acatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaacatcatgatataataatatcg 10063840  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  10063839 aacacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 47832219 - 47832297
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  47832219 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 47832297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 68157 - 68236
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  68157 tctttcctaatcattattagacatattcaggcactcgaaaacatttaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 68236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901431
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaa 12901431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220194
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 20220194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 16324417 - 16324495
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  |||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16324417 tctttcctaatcattattagacatgttcaagcactcaaaaacattcaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 16324495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 377
Target Start/End: Original strand, 16056576 - 16056684
Alignment:
Q  270 tcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaa-aacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcg 368  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||   ||||||||||| |  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16056576 tcaactcacatcaactcgtgctacaaagatcgcatttaacctaacaaggcattctgtaactgggtaactcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcg 16056675  T
Q  369 tgttcaggt 377  Q
     ||||||||    
T  16056676 agttcaggt 16056684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649421
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacat-----aataatatc 118  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||| |||  ||||| ||||  |||||||     || ||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacatcacataacaatatc 19649507  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||||  ||  || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19649506 aaataaaaa-cagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcatattcaacactaaca 19649421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044828
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaa-caacataggcagtatacaaaacagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagc 14044828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354858
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaa-caacataggcagtatacaaaacagc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaacagc 14354858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203891
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacatagacagtacataaaaca 18203891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991260
Alignment:
Q  47 cgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaaca 48991260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530140
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatacaaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 2530140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 9703263 - 9703471
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacag-----catgacataataatatc 118  Q
    ||||||||| |||| |||| | | ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| |||||     ||| ||||||  |||||    
T  9703263 catcatcttgatcatcttatatcaactcatgcaacatagttaaataacaataacagcataggcagattgcaacaacagtatgacatcacataacgatatc 9703362  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    ||||  ||||   || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||  || | || |||||||||||||||||||||||  || |  ||||    
T  9703363 aaataaaagtatgcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaaacgtaatctcacatcataatcaacattaacatttcat--aaca 9703459  T
Q  217 gcttcacagatt 228  Q
    ||||||||||||    
T  9703460 gcttcacagatt 9703471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 19649170 - 19649101
Alignment:
Q  456 ttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  19649170 ttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaactacgaaatcttgcatgctctctggt 19649101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 377
Target Start/End: Original strand, 22073223 - 22073272
Alignment:
Q  328 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22073223 ctgggtaactcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcgagttcaggt 22073272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2279828 - 2279769
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||    
T  2279828 tctttcctaatcattattatgcatgttcaggcactcaaaatcatctaaatatcaacttaa 2279769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9389501 - 9389462
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcag 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9389501 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcag 9389462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 374
Target Start/End: Original strand, 68061 - 68099
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttca 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  68061 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttca 68099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 2529682 - 2529628
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  2529682 cctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 2529628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16219426 - 16219348
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || || |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  16219426 tctttcctaatcattattatacaagtttagacactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattatgaaatc 16219348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10063707 - 10063678
Alignment:
Q  257 actaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10063707 actaccccaaggttcaactctcaacaactc 10063678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832509
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaa 2832509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 9033448 - 9033400
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggca 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  9033448 cttagaccgacacatgcagcttaattaatatacaacaacaacataggca 9033400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9751442 - 9751390
Alignment:
Q  251 ctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgca 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  9751442 ctcattactatcccaaggttcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgca 9751390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 468
Target Start/End: Original strand, 11262705 - 11262749
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaa 468  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  11262705 cctacattcattcctaatcattactaggtatgttcaggcattcaa 11262749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138113
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 17138113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 20619399 - 20619447
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggca 88  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  20619399 cttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacaacaacataggca 20619447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 44408088 - 44407992
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| |||   |||| |||||| ||||||  ||||  | ||||||| ||||||||    
T  44408088 cctacattcattcctaatcattactaggtatgttcaggcactcaaaggcactcaaggttcaactaaaaagtcgaaatttcaaaatcttacatgctct 44407992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52417
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 52012  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  52013 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatctt-aaacagct 52111  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  52112 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaac-aaggtcgc-aaaacctaacaagaca 52209  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  52210 ctcagtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 52309  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  52310 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcaaaaaatcttgcatgc 52409  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  52410 tctctggt 52417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167606
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 168000  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  167999 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatc-ttaaacagct 167902  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  167901 tcaaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaattcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtca 167803  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |     ||| | | ||||||    ||| ||||     
T  167802 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatccca-----caagt-ttcaatct----aggttcaat 167713  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  167712 ctcatcctaaattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgct 167613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40416
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaa 40012  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||    | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||    
T  40013 atgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcat-aaagagctt 40111  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  40112 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaacacctaacaaggtac 40211  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||     
T  40212 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttc-attctacaatctgt-caggttcaat 40309  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40310 ctcatcctacattccttcctaatcattaataaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgct 40409  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  40410 ctctggt 40416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19883
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  137 tctca 141  Q
    |||||    
T  19887 tctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 16831
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa---cagcatgacataataatatc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtctt-aaacagc 17139  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||      
T  17138 tttacagattataattaacatcatgattaagtctcaatactaccccaaggtttaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaataaggt 17039  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||    
T  17038 actctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctctccgtggcgagttcaggtcagaattccaaaagtttcattcta-aatctttccaggttca 16940  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||    
T  16939 atctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcgaaagtcaaaaacaagaaatcttgcatg 16840  T
Q  517 ctctgtggt 525  Q
    |||| ||||    
T  16839 ctctctggt 16831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79109
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    |||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   | |||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||||||| ||| || ||||| |    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcactgatcatcattaata 79233  T
Q  239 tcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcact 337  Q
    | ||    ||   |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| || |||||   ||||  |||    
T  79232 ttatatacaatattcataactaccccaaggttcaactctcaatgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggct-tctgtaattgggcaact 79134  T
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgcc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  79133 cgcgaggcgagagcctctactcgcc 79109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 79078 - 78978
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||| |||    
T  79078 ctacattccttcctaatcattattaaacatgttcatgcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcagaattacaaaatcttgcatgctctctgg 78979  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  78978 t 78978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25686
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacaga 226  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcataga 25981  T
Q  227 ttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  25980 ttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctcttagcaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcactctgtt 25881  T
Q  327 tctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgac 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||| |||  |    
T  25880 tctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaaattc-attctacaatcttttcaggttcaatctcatc 25782  T
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  25781 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaccatctaaggatcaactcaaaagtcaaaaacatgaaatcttgcaagctct 25686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 145 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33491 - 33110
Alignment:
Q  145 atacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  33491 atacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcataggttataattaacatcatca 33393  T
Q  245 ttaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgagg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||| || |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  33392 ttaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtatgacacagatcgcaaaatcctgacaaggcactctgtttctgggtcacacgcgagg 33293  T
Q  345 cgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatc 442  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||    
T  33292 cgagagcctttgctcgccgtggcgagttcaggtaagacttccaaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatc 33193  T
Q  443 attattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33192 attattagacatgtccaggcactcagaagcatctaaggatcaactcaaaagtgaaaatcacgaaatcttgcaagctctctggt 33110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44682
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339567
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaat- 339968  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  339967 caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcac 339869  T
Q  224 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctct 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  339868 agattataattaacgtcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacgactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaaggcactct 339770  T
Q  324 gtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagatt-ccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctc 421  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||    
T  339769 atttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcatgtcagattcccaaaagttc-attctacaatctttccaggttcaatctc 339671  T
Q  422 gacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctg 521  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  339670 atcctacattcattcctaatcattattagacaaattcaggcactcaaaagcatttaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagctctc 339571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 139
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71418
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatacaaa-cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatct 71418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 525
Target Start/End: Original strand, 71742 - 71791
Alignment:
Q  476 taaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  71742 taaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 71791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 21 - 511
Target Start/End: Original strand, 343 - 833
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaatagcatgacgtaataatatcaa 442  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     || ||||||||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  443 ttggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagctt 541  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  542 catatattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcatgcaacaaaggttgcaaaaacctaacaagacac 641  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||| || ||| |||| |    
T  642 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgcggcgagttcagttcagattccaaaagtttcattctaaattctttctaggttcaatc 741  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatctt 511  Q
    ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  742 tcattctacattcttttctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatctt 833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3975
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 3569  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3570 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 3668  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |     
T  3669 tcatagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaagttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaactca 3767  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||  |||||| ||||    
T  3768 ctctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttgattctacaatcattccaggttcaa 3867  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3868 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaagatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 3967  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  3968 tctctggt 3975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 100)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377149
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa-cagcatgacataataatatcaaatg 16377541  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||    
T  16377540 caagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatc-ttaaacagctccac 16377442  T
Q  224 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctca-acaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||     
T  16377441 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcataaaactcgtgcaacaaaggtagcaaaatcctaacaaggcacta 16377342  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagatt-ccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||||| |||| ||    
T  16377341 tgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagattcccaaaagttc-attctacgatcattccaggttcaatct 16377243  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgca 514  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16377242 catcctacattatttcctaatcattattagacatgttcagacgctcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcatgaaatcttgca 16377149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 26 - 520
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14039149
Alignment:
Q  26 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  125 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcaca 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgtt-aaacagcttcaca 14038851  T
Q  225 gattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctg 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||    
T  14038852 gattataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagcaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcactctg 14038951  T
Q  325 tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||| |||| |||     
T  14038952 tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttctggtcagatttccaaaagtttcattctaaaatctttctaggttcaatctca 14039051  T
Q  423 acctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  14039052 ttctacattctttccaaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcatgaaatcttgcaagctct 14039149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 525
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636939
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttc 221  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt--aacagcttc 22636634  T
Q  222 acagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactct 321  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22636635 acagattataattaacatcctcgttaagtcttaatactaccccaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaagacact 22636733  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| || ||| |||||  |||||||||| | |||||| |||| |    
T  22636734 ctgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgaggtcaagtcagaatcccacaagtttcattctacaatttttccaggttcaatc 22636833  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22636834 tcatcctacattctttcctaatcattattagacatcttcagacactcaaaagcatctaaggatcaactcagaagtcaaaatcacaaaatcttgcatgctc 22636933  T
Q  520 tgtggt 525  Q
    | ||||    
T  22636934 tctggt 22636939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053334
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 44052928  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  44052929 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-aaacagct 44053027  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |     
T  44053028 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggca 44053126  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||  || ||| ||||| | |||| ||||    
T  44053127 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagtctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcatcctataatctttacaggttcaa 44053226  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44053227 tctcatcctacattctttcccaatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcatgaaatcttgcatgc 44053326  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  44053327 tctctggt 44053334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12903250
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 12902856  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | || || ||| |||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  12902857 attgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagct 12902955  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  12902956 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcaacagctcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaaggca 12903054  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| ||||    
T  12903055 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgggagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaa 12903143  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12903144 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactc-aaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgc 12903242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239608
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 16239991  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16239990 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagctt 16239892  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16239891 cgcagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagtcac 16239792  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||                      |||||||| ||| |||| |||||  |||||| ||||| |||||| |||| |    
T  16239791 tctgtttctgggtcactcgcgaggcga----------------------gttcaggttagaatccacaagtttcattcta-aatctttccaggttcaatc 16239715  T
Q  420 tcgacctacatt-ctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16239714 tcattctacatttctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggagcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgct 16239615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 381
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7894060
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7893802  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||    
T  7893803 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataatcagca---acacatctt-aaacagct 7893898  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893899 tcacagattataattaacatcatcgttaagtcttaatattaccccaaggttcaactctcggcaactcatgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 7893998  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga 381  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7893999 ctctgtttctgggtcactcgtgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcaga 7894060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089371
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7088976  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| | |||| ||   || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||| ||    
T  7088977 attgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatc-ttaaacaact 7089075  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  7089076 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctactcaaaggttcaactctcgacaactcttgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagaca 7089174  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| ||||    
T  7089175 ctctgtttccgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagaatcccataagtt-----------tcattccaggttcaa 7089263  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7089264 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcataggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgc 7089363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 24 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928544
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    ||||| || ||||| || ||   |||   |||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  | |    
T  44928842 cagatcatcattaatattatatataatattcataactaccacaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcat-t 44928744  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  44928743 ctgtaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttctggtcagattcccaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaatct 44928644  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  44928643 cattctacattctttcctaatcattattagatatgttcaggcactcaaaaacatataaggatcaactcaaaagtcaaaatcacggaatcttgcaagctct 44928544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374125
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataat--tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcaca 224  Q
     |||||||||||| |||||| ||   |||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||| |    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattca--aataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatc-ttaaaaagcttcaga 23374277  T
Q  225 gattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctg 324  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | |||||    
T  23374276 gattatagttaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggttgc-aaaatctaacaagtcactctg 23374178  T
Q  325 tttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23374177 tttctgggtcacccgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggt 23374125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102697
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| || ||| ||  |||| | || ||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 44102411  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactct 321  Q
    ||||| || ||||| || ||   |||   |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||  | |    
T  44102412 cagatcatcattaatattatatataatattcataactatcccaaggttcaactctcaacgactcgtgctacaaagatcgcaaaatcctaaacaagtat-t 44102510  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  44102511 ctgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattctcaaagttttattctaaaatctatccaggttcaatct 44102610  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44102611 catcctacattc-ttcataatcattattaaacatgctcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 44102697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14052930
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa-cagcatgacataataatatca 14053324  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacat-ctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    | | ||| ||| |||||| || |   |||||   ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | || ||    
T  14053323 atttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcataa-acattatatcacatcataatcaacaacaacatatctt-atacggc 14053226  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  14053225 ttcacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtc 14053127  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatca 417  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||           |||| | |||    
T  14053126 actctgtttctgggtcactcgcaaggcgagagcctctgctcgccatggtgagttcaggtcagaatcccacaagtttaat-----------tccaagttca 14053038  T
Q  418 a-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatg 516  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  14053037 atctcatcctacattctttcctaatcattattagacatattcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacg-aatcttgcatg 14052939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 218 - 525
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091402
Alignment:
Q  218 cttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||| || |||||||| |||||||||     
T  15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttagaaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaagg 15091192  T
Q  318 ctctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatc 416  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||  |||||| ||    
T  15091193 cactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagtttcattctaaaatccttccaggttc 15091292  T
Q  417 aa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcat 515  Q
    || |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  15091293 aatctcattctacattctttcctaatcaatattagacatgttcagaaactcaaaagcatctaaagatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaa 15091392  T
Q  516 gctctgtggt 525  Q
    ||||| ||||    
T  15091393 gctctctggt 15091402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270140
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 16270257  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16270256 atgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagctt 16270158  T
Q  221 cacagattataattaaca 238  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16270157 cacagattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 157 - 525
Target Start/End: Original strand, 3096781 - 3097137
Alignment:
Q  157 ttcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaat 256  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||    
T  3096781 ttcaagtaatgcataa-acattgtatctcatcataatcagcaacaacacatctt-aaacagcttcacatattataattaacctcatcattaagtatttat 3096878  T
Q  257 actaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctcta 356  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3096879 cctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctg 3096977  T
Q  357 ctcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacat 454  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096978 ctcgccttggcgagttcaggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacat 3097066  T
Q  455 gttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||| | |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  3097067 gttcaggcactcgaaaacatctaaggtttaactcaaaagtcaaaattatgaaatcttgcatgctctctggt 3097137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 277 - 525
Target Start/End: Original strand, 7798953 - 7799202
Alignment:
Q  277 tcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7798953 tcaacaactcgtgaaacaaaggtcgcaaaa-cctaacaagacactttgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcagg 7799051  T
Q  377 tcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcat 474  Q
    ||||| | | | |||||  ||||||||| || |||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7799052 tcagaatactacaagtttcattctacaaactttccaggttcaatctcatcctacattatgtcctaatcattattagtcatgttcaggcactcaaaagcat 7799151  T
Q  475 ataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
     |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7799152 ctaaggatcaactcagaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 7799202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 204
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798958
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7798873  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  7798874 attgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798669
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat----------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 54798683  T
Q  223 cagattataattaa 236  Q
    |||||||| |||||    
T  54798682 cagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900062
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaacaacatagcataataatatcaa 6899990  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataa 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6899991 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 158 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17048055 - 17047834
Alignment:
Q  158 tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaata 257  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||   || ||||||||||| ||||    
T  17048055 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaata 17047957  T
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctac 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17047956 ctacccaaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaagtctcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgaggcgagagcctctgc 17047858  T
Q  358 tcgccgtggcgtgttcaggtcaga 381  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17047857 tcgccatggcgagttcaggtcaga 17047834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280518
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagtaat----------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 14280504  T
Q  223 cagattataattaa 236  Q
    |||||||| |||||    
T  14280505 cagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52242958
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| ||||||||||| || |||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  133 aacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataa 232  Q
    ||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| || |    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatca 52243103  T
Q  233 ttaacatcatcattaagtc-tcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctg 330  Q
    |||| ||| | ||  | || ||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |  |||||  |||    
T  52243102 ttaatatc-ttatacaatcttcattactaccccaaagttcaactctttacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaag-cattctgtaactg 52243005  T
Q  331 ggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  52243004 ggcaactcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcaggt 52242958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 52873389  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaata 145  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||    
T  52873388 attgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574844
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatg 8574887  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 166  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574886 taattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815265
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaaca 238  Q
    |||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||| |||||| ||  || | | || |||||||||| || || ||||| |    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatataa-caacatcaaatcaccataaatcagcttcacatatcatcattaata 21815534  T
Q  239 tcatcattaagt-ctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcac 336  Q
    | || ||  |||  |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||| ||| |||||| || |||||   ||||  ||    
T  21815533 ttat-atacagtattcataacta-cccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgatgaagatcgcaaaatcctaaacaaggct-tctgtaattgggcaac 21815437  T
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatca-actcgacctacattctt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||   |||||| |||   ||   ||| ||| ||    
T  21815436 tcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtcagcttccaaaaagttc-attct-taattaatccaggttcattatcattctaaattatt 21815339  T
Q  435 tcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21815338 tcctaatcattattaaacatgttcagacactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 21815265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837503
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataa 192  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa 1837503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
Q  18 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataata 116  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataata 19242791  T
Q  117 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  19242792 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 342
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190782
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-ca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcata-atcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataatta 235  Q
    |||||| ||| |||| | | ||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |  |||||||||||  ||| ||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattagatcacatcatacatcaacattaacatctcat--aacagcttcacgaattgtaatta 6190676  T
Q  236 acatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtca 335  Q
    | |||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| ||| |||||||    
T  6190677 atatcatattcaagtcttaatgctacgccaaggttcaactctcgacagctcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtcactctatttttgggtca 6190775  T
Q  336 ctcgcga 342  Q
    |||||||    
T  6190776 ctcgcga 6190782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239436
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 18239436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| ||| || ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13793
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 13854  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| | ||   |||||||||||| |||| ||||||    
T  13853 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 15552129 - 15552318
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||||| | ||| ||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  15552129 ctcgcgaggcgcgagcctctgctcgccgtggcgagttc-ggtcagattctccaaattttgattcta-agtctttccaggtccaatctcatcctacattct 15552226  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15552227 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatataaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 15552318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046724
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat--agaacaacatgacataattatatca 17046584  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||| | |  |||||||| |||||| |||||||||  |||| ||| |||  |||||    
T  17046585 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatc-ttattcagct 17046682  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactac 261  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||    
T  17046683 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaatcctac 17046724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  127 gtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 336 - 520
Target Start/End: Original strand, 24029057 - 24029241
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  24029057 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 24029154  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24029155 ttcataatcaatattagacatgttcaggcactcaaagacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 24029241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706299
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 39706310  T
Q  120 aatgcaagtca 130  Q
    |||||||||||    
T  39706309 aatgcaagtca 39706299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970707
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||| || ||   |||||||||||    
T  14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-aca------aaaacagcatgacataataatatcaaatg 12611042  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  12611043 caaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13812614 - 13812425
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  |||||||| |    
T  13812614 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagtttag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattat 13812517  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13812516 ttcctaatcaatattagacatgttcagacactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 13812425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371467
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15371300  T
Q  120 aatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||| ||   ||||||||| ||| ||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||    
T  15371301 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15371399  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | | |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371400 ttcacagatcatcattaatattgtaaataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacaactc 15371467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373748
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15373581  T
Q  120 aatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||| ||   ||||||||| ||| ||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||    
T  15373582 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15373680  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | | |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373681 ttcacagatcatcattaatattgtaaataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacaactc 15373748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatga 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20157007 - 20156906
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtg 523  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20157007 cctacattctttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggattaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctg 20156908  T
Q  524 gt 525  Q
    ||    
T  20156907 gt 20156906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |          |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------aaaacaacatgacataataatatcaaatg 7641255  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||| |||||| |||  |   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  7641254 caagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223797
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatct 16223630  T
Q  120 aatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| |||  || ||   |||||||||||  |||| |||||| |   |||| | || ||||    
T  16223631 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataa-caacatcacatcatcataaatcagc 16223729  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | | |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223730 ttcacagatcatcattaatatcgtaaataatattcataactaccccaaggttcaactctcaacaactc 16223797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198495
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||   ||||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  133 aacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    || ||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||   |||||||||||| |||| ||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 43198495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774128
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 12774110  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  12774111 caa-tcaacaacatctcaa 12774128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367905
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15367788  T
Q  120 aatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||| ||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||    
T  15367789 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15367887  T
Q  219 ttcacagattataattaa 236  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15367888 ttcacagatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402918
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15402801  T
Q  120 aatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||| ||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || ||||    
T  15402802 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15402900  T
Q  219 ttcacagattataattaa 236  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15402901 ttcacagatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15370116  T
Q  120 aatgcaagtcaa 131  Q
    ||||||||||||    
T  15370117 aatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551932
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||     
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaatccatcatgatataataatatcg 15551916  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    || | || ||||||||    
T  15551917 aaggtaaatcaacaac 15551932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 22634018 - 22633829
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  || ||||  | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  22634018 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaa-tctgattatccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 22633921  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22633920 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaagggcatctaaagttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 22633829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 508
Target Start/End: Original strand, 6190807 - 6190921
Alignment:
Q  395 attctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaag 493  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6190807 attctacaatctttccaggttcaatctcatcctacattctctcctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaag 6190906  T
Q  494 ttaaaatcacgaaat 508  Q
    | ||||||| |||||    
T  6190907 tcaaaatcatgaaat 6190921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  133 aacatc 138  Q
    ||||||    
T  12288216 aacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15464978 - 15464710
Alignment:
Q  94 caaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataat 193  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||| ||   ||||||||| ||  |||     
T  15464978 caaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatcaaattttaaa 15464879  T
Q  194 caacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaac 293  Q
    | |||| ||  |||| |  | |||||||||| || || ||||| |||||    || ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| ||    
T  15464878 cgacatcaaatcatcatatatcagcttcacaaatcatcattaatatcatatacaattctcattactactccaaggttcaactcataacaacttgtgcgac 15464779  T
Q  294 aaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgc 361  Q
    |||| | |||||| ||||| |||| |  |||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15464778 aaagattgcaaaatcctaaacaagtcattctgtaactgggcaactcgcgaggcgagagcctctactcgc 15464710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21815173 - 21814936
Alignment:
Q  271 caactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgt 369  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||| ||||| |||| || |||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21815173 caactctcaacgactcgtgcgatgaagatcgcaaaatcctaaacaaggct-tctgtaattgggcaactcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcga 21815075  T
Q  370 gttcaggtcagattccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatcaac-tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattca 467  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  |||   |||||| |||   ||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  21815074 gttcaagtcagcttccaaaaagttca-ttctt-aattaatccaggttcattatcattctaaattctttcctaatcattattaaacatgttcagacactca 21814977  T
Q  468 aaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21814976 aaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 21814936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21818595 - 21818358
Alignment:
Q  271 caactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgt 369  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||| ||||| |||| || |||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21818595 caactctcaacgactcgtgcgatgaagatcgcaaaatcctaaacaaggct-tctgtaattgggcaactcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcga 21818497  T
Q  370 gttcaggtcagattccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatcaac-tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattca 467  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  |||   |||||| |||   ||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  21818496 gttcaagtcagcttccaaaaagttca-ttctt-aattaatccaggttcattatcattctaaattctttcctaatcattattaaacatgttcagacactca 21818399  T
Q  468 aaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21818398 aaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 21818358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Original strand, 12774313 - 12774488
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| |||||   |||||||||| |||| |||   || || ||    
T  12774313 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaa-ttca-ttctaacgtctctccaggttcaatctcattctccaatc 12774410  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  12774411 ttttctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 12774488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 525
Target Start/End: Original strand, 16596963 - 16597150
Alignment:
Q  338 cgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattcttt 435  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||||| | ||| |||||| |||| |||   |||||||||||    
T  16596963 cgcggggcgagaacctctactcgccatggcgagttc-ggtcagattctctaaattttcattcta-agtctttccaggttcaatctcattctacattcttt 16597060  T
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||| | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  16597061 cctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaattcaaaaatcaaaattacagaatcttgcatgctctctggt 16597150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846460
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgagataacaatatcgaatg 8846459  T
Q  124 c 124  Q
    |    
T  8846460 c 8846460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 510
Target Start/End: Original strand, 8846689 - 8846865
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||   | || |||||  |  |||||| ||||| |||||| |||| |||   || || |||    
T  8846689 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttaaggtgcaactcacaaaaaattcattctaaaatctttccaggttcaatctcattctccaatct 8846788  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  8846789 ttcctaatcattattagacatgttcaggtactcaaaaacatctaagaatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 8846865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtataca-aaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |  |  |||| |||||||||| ||||||||     
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 39705998 - 39705920
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  39705998 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 39705920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||| | ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  126 agtcaa 131  Q
    ||||||    
T  20149931 agtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640453
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  46640458 tctcaa 46640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 13844950 - 13845028
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13844950 tcttttctaatcataattagacatgttcagacactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaagtcaaaattacgaaatc 13845028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 469
Target Start/End: Original strand, 17046720 - 17046765
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaa 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046720 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaa 17046765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082124
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataaca 53082156  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  53082155 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 53082124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17047801 - 17047726
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaa 499  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  17047801 cctacattttttcctaatcattattagtcatgttcaggcactcaaagacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaa 17047726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256106
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc--aagtaatg 167  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||| ||   |||||||  ||||||||    
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa-caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattca--aataattcttaagtaatg 43256134  T
Q  168 cacattacattatatcacatcataatca 195  Q
    || || | |||||||||||| |||||||    
T  43256133 catataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 204
Target Start/End: Original strand, 15093911 - 15093955
Alignment:
Q  160 aagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15093911 aagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 15093955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 43198298 - 43198239
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||||||    
T  43198298 tctttcctaatcattattacacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggtttaacttaa 43198239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15868344 - 15868286
Alignment:
Q  432 ctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  15868344 ctttcctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 15868286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 15099665 - 15099706
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15099665 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggt 15099706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8574836 - 8574784
Alignment:
Q  184 acatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8574836 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 491
Target Start/End: Original strand, 15190729 - 15190788
Alignment:
Q  432 ctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaa 491  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||    
T  15190729 cttttctaatcataattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcgacttaaa 15190788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15464639 - 15464580
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||    
T  15464639 tctttcctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaatatcaacttaa 15464580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333356
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagtacataaaaca 17333356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 13569624 - 13569716
Alignment:
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  13569624 catctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaaacatcatctcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcacagatt 13569716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 123
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596751
Alignment:
Q  59 cttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaaccatcatgatataataatatcgaatg 16596751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 490
Target Start/End: Original strand, 32851868 - 32851921
Alignment:
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  32851868 ctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 32851921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 384
Target Start/End: Original strand, 3332201 - 3332248
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3332201 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttca-gtcagattc 3332248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 13569502 - 13569566
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | | ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13569502 catcatcttgatcatcttatatcaactcatgcaacatagttaaataacaataacagcataggcag 13569566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 520
Target Start/End: Original strand, 14679339 - 14679435
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||  ||||  ||||| ||||||  ||||  | ||||||| ||||||||    
T  14679339 cctacattcattcctaatcattactaggtatgttcaggcactcaaaggcattcaaggtccaactaaaaagtcgaaattgcaaaatcttacatgctct 14679435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 368
Target Start/End: Original strand, 15190632 - 15190664
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15190632 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcg 15190664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 15791793 - 15791841
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggca 88  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  15791793 cttagaccgactcatgtagtttaattaaaagacaacaacaacataggca 15791841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20157182 - 20157130
Alignment:
Q  251 ctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgca 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  20157182 ctcattactatcccaaggttcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgca 20157130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Original strand, 24028970 - 24029022
Alignment:
Q  251 ctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgca 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  24028970 ctcattactatcccaaggttcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgca 24029022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39706092 - 39706052
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39706092 tcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcgagttcaggt 39706052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 44675757 - 44675836
Alignment:
Q  148 cattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  44675757 cattcataactcaagtaatgca-attaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcacagatt 44675836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8149
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagcaaca---taggcagtatcaaaaacagcatgacataataatatcaa 8554  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8553 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatc-ttaaacagctt 8455  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatacta-ccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  8454 cacagattataattaacatcctcattaagtcccaatactacccccaacgttcaactctcaacaactcgtgcaacgaaggtcgc-aaaacctaacaagaca 8356  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  8355 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcaccgtggcgagtttaggccagaattccaaaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 8256  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8255 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcat-caaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 8157  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  8156 tctttggt 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23370
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 23083  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23084 cagattataaataacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagacactc 23183  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||| ||    
T  23184 tgtttctaggtcactcgcgaggcgagggcctctgctcgctgtggcgagctcagttcagaattccaaaa-ttcaattctacaatctttccagatccaatct 23282  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  23283 catcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 23370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 4508 - 5008
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 4606  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4607 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagct 4705  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||| |||||| ||       
T  4706 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacactgatcgcaaaatcctaactaggta 4805  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattct-acaatctctccaggatcaa 418  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||    
T  4806 ccctgtttctgggtcactcgcgaagcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaaatctttccaggttcaa 4905  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4906 tctcattctacattcttttctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagc 5005  T
Q  518 tct 520  Q
    |||    
T  5006 tct 5008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12590
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 12188  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12189 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagct 12287  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||| |||||| ||       
T  12288 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacactgatcgcaaaatcctaactaggta 12387  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattct-acaatctctccaggatcaa 418  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||    
T  12388 ccctgtttctgggtcactcgcgaagcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaaatctttccaggttcaa 12487  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12488 tctcattctacattcttttctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagc 12587  T
Q  518 tct 520  Q
    |||    
T  12588 tct 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22542
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 22140  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22141 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagct 22239  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||| |||||| ||       
T  22240 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacactgatcgcaaaatcctaactaggta 22339  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattct-acaatctctccaggatcaa 418  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||    
T  22340 ccctgtttctgggtcactcgcgaagcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaaatctttccaggttcaa 22439  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22440 tctcattctacattcttttctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagc 22539  T
Q  518 tct 520  Q
    |||    
T  22540 tct 22542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16215
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 16622  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16621 aatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatctt-aaacagct 16523  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||| || |||||| |     
T  16522 tcacagactataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcctaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcccaacaaggca 16423  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||  |||| | ||||| |||||| ||||    
T  16422 ctctgtttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggttagatttccaaacgtttcattcgaaaatctttccaggttcaa 16323  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  16322 tctcattctaaattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgctagc 16223  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||||||||    
T  16222 tctgtggt 16215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40361
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaa 39957  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  39958 atgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatc-ttaaacagctt 40056  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  40057 cacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta-cccaaggttcaactctcaacaaattgtgcaacaaaggtcgcaaaatcataacaaggcac 40155  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-c 419  Q
    || |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||  |||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |    
T  40156 tcggtttctaggtcacccgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagtacaggttagaaaccaaaagtttcattctacaatctttccaggttcaatc 40255  T
Q  420 tcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctc 519  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40256 tcatcctccattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctacggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctc 40355  T
Q  520 tgtggt 525  Q
    | ||||    
T  40356 tctggt 40361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26213
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaatatcatgacataataatatcaa 25995  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  25996 atgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatc-ttaaacagctt 26094  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  26095 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaaatcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacaaggcac 26194  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcg 339  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  26195 ttggtttctgggtcactcg 26213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 39647 - 39547
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  39647 ctacattctttcctaatcattaatagacatgttcaggtactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcatgaaatctggcatgctctctgg 39548  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  39547 t 39547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 457
Target Start/End: Original strand, 26555 - 26662
Alignment:
Q  351 cctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattatta 449  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26555 cctctgctcgccgtggcgacttcaggtcagaatccaaaagtttcattctacaatctttccaggtttaatctcatcctacattctttcctaatcattatta 26654  T
Q  450 gacatgtt 457  Q
    ||||||||    
T  26655 gacatgtt 26662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 59219 - 59181
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggca 463  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  59219 ctacattctgtcctaatcattattagacatgttcaggca 59181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39861
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 39578  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39579 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagcttca 39677  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || |||||||| ||| ||||| | |||    
T  39678 tagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctgacaaggcactc 39777  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39778 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttc-attctacaatct 39861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 74951
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 75234  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  75233 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagcttca 75135  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| || |||||||| ||| ||||| | |||    
T  75134 tagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctgacaaggcactc 75035  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcaga-ttccaaaagttcaattctacaatct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  75034 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttc-attctacaatct 74951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2351
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 1950  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  1951 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaatagct 2049  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |     
T  2050 tcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcacaaaatc-taacaaggca 2148  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  2149 ctctgttttagggtcactcgtgaggcgatagcctctactcgccatggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttcaa 2248  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2249 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttggatgc 2348  T
Q  518 tct 520  Q
    |||    
T  2349 tct 2351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 336 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 207324 - 207161
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  207324 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 207227  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaa 499  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  207226 ctcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaa 207161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 207411 - 207359
Alignment:
Q  251 ctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgca 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  207411 ctcattactatcccaaggttcaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgca 207359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8980
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatca 8578  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | |||||||||||||||||| ||| || ||    || |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  8579 attgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcct-aaacagct 8673  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  8674 tcacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaagaca 8772  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||| || ||| ||||    
T  8773 ctctgtttctgggtcattcgcgaggcgagagcctctactggccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagttccattttacaatctttctaggttcaa 8872  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8873 tctcatcctacattctttcctaatcactattagacatattcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatcttgcatgc 8972  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  8973 tctctggt 8980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 73 - 520
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13592
Alignment:
Q  73 aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcaca 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  172 ttacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttc 271  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatctt-aaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtcccaatactaccccaaagttc 13342  T
Q  272 aactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13343 aactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaacctaacaagacactcagtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagt 13441  T
Q  372 tcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaa 469  Q
    ||||||||| || ||| |||||  |||||||||||| | |||  |||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13442 tcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatcttttcagattcaatctcatcctacattctttcctaatcataattagacatgttcaggcactcaaa 13541  T
Q  470 agcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13542 agcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 13592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34238
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||     
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaacccatcatgatataataatatcg 34222  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  34223 aatgtaaatcaacaac 34238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 525
Target Start/End: Original strand, 34437 - 34625
Alignment:
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctt 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||||| | ||| | |||| |||| |||   ||||||||||    
T  34437 tcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattctccaaattttcattcta-agtcttttcaggttcaatctcattctacattctt 34534  T
Q  435 tcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  34535 tcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 34625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 76
Target Start/End: Original strand, 273 - 328
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca 76  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaaca 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13705
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 13310  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13311 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 13409  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  13410 tcacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactgtcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaaggca 13508  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatca- 417  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |||||| |||     
T  13509 ctctgattctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatgccacaagtt-----------tcattccaggttcag 13597  T
Q  418 actcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13598 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacattttcaggcactcaaaagcatataaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgc 13697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 39 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 23923
Alignment:
Q  39 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataat-caacattaacacatctttaaacagcttcacagattataatta 235  Q
    ||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataatta 24208  T
Q  236 acatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtca 335  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||| |||||    
T  24207 acatcctcaataagtcttaatactatcccaaagttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaaggcactttgtttctaggtca 24109  T
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||| | |||||| |||| |||  |||||||| |    
T  24108 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgctgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaattt-tccaggttcaatctcatcctacatttt 24010  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24009 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagaatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 23923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 5737
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca---taggcagtatacaaaa-cagcatgacataataata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  117 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaaca 6047  T
Q  217 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaag 316  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6046 gcttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttccactctcgataactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaag 5948  T
Q  317 actctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc--aaaagttcaattctacaatctctccagga 414  Q
     | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||   ||| ||| |||| | |||||  |||||     
T  5947 gcactctgtttctgggtcactaacgaggcgagagcctctgctcgccgtggcaagttcaggtcagaatcccgcaaatttc-attcaataatcttcccaggt 5849  T
Q  415 tcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgc 513  Q
    |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  5848 tcaatctcatcctacaatctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtaaaaaacacgaaatcttgc 5749  T
Q  514 atgctctgtggt 525  Q
    ||||||| ||||    
T  5748 atgctctctggt 5737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 2985
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaa 3172  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  3171 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatc-ttaaacagctt 3073  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaac 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3072 cacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacacaggtcgcaaaaac 2985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 320 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 629
Alignment:
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagatt-ccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||  ||||    
T  835 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctccgctcaccgtggcgagttcaggtcagatttccaaaagttca-ttctacaatcttttcagattcaa 737  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||| || ||    
T  736 tctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatataaggatcaactcgaaggtcaaaatcacaaaatcttacaagc 637  T
Q  518 tctgtggt 525  Q
    ||| ||||    
T  636 tctctggt 629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 676
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 1070  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  1069 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatc-ttaaacagct 972  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |     
T  971 tcaaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaattcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacaagtca 873  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |     ||| | | ||||||    ||| ||||     
T  872 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatccca-----caagt-ttcaatct----aggttcaat 783  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  782 ctcatcctaaattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgct 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 9)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 157 - 525
Target Start/End: Original strand, 124722 - 125087
Alignment:
Q  157 ttcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaat 256  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  124722 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 124820  T
Q  257 actaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctcta 356  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  124821 gctatcccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagacactctttttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctg 124919  T
Q  357 ctcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaactcgacctacattctttcctaatcattattagacatg 455  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124920 ctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctacaatctttccaggttc--ctcatcctacattctttcctaatcattattagacatg 125017  T
Q  456 ttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  125018 ttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcaccaaatcttgcatgctctctggt 125087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174949
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacatgattatatcaa 174864  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgc-acattacattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    || ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  174865 attcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaactaaacattatatcacgtcatattcaacactaaca 174949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 62972 - 63051
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  62972 tctttcctaatcattattagacatgttcatgcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaatttacgaaatct 63051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  137 tc 138  Q
    ||    
T  136371 tc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || | |||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  137 tc 138  Q
    ||    
T  145079 tc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 458 - 525
Target Start/End: Original strand, 175202 - 175269
Alignment:
Q  458 caggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  175202 caggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgctctctggt 175269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 136173 - 136132
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  136173 actcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 136132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 144881 - 144840
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  144881 actcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 144840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 80 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 578
Alignment:
Q  80 acataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacatta 179  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1021 acataggcagtatacaa--cagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatta 925  T
Q  180 tatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctca 279  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  924 tatcacatcgtaatcgacatcaacacatctt-aaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctca 826  T
Q  280 acaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtca 379  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  825 acagctcgtgcaacaaaggtcgaaaaatcctaacaagactctctgtttctaggtcactcacgaggcgggaacctctgctcgccatggcgagttcaggtca 726  T
Q  380 ga-ttccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatat 476  Q
    || |||||| |||||  ||||| | |     ||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  725 gatttccaacaagtttcattct-ctactaaaccaggttcaatctcgttctacaatctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatct 627  T
Q  477 aaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  626 aaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggc 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32575
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 32978  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |   |||| | ||| |||||    
T  32977 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatca--gcatcataaaatagctt 32881  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||||      
T  32880 cacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactcttaacaattggtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaagacat 32781  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||  |  ||||| ||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  32780 tctgtttatgggtcactcgcgaggcgggagcctctcctcgctgtggcgagttagggtgcaactcacaaaaattc-attctaaaatctttacaggttcaat 32682  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   || || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32681 ctcattctccagtccttcctaatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggttcgactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagct 32582  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  32581 ctctggt 32575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46430
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 46027  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |   |||| | ||| |||||    
T  46028 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatca--gcatcataaaatagctt 46124  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||||      
T  46125 cacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactcttaacaattggtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaagacat 46224  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||  |  ||||| ||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  46225 tctgtttatgggtcactcgcgaggcgggagcctctcctcgctgtggcgagttagggtgcaactcacaaaaattc-attctaaaatctttacaggttcaat 46323  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   || || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  46324 ctcattctccagtccttcctaatcattattagacatgttcagacactcaaaagcatctaaggttcgactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagct 46423  T
Q  519 ctgtggt 525  Q
    || ||||    
T  46424 ctctggt 46430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 257 - 520
Target Start/End: Original strand, 16323 - 16586
Alignment:
Q  257 actaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctcta 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||     
T  16323 actacctcaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcacttgcgaggtgagggcctctg 16422  T
Q  357 ctcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacat 454  Q
     ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16423 atcgccgtggcgagctcagttcagaattccaaaa-ttcaattctacaatctttccaggttcaatctcgtcctacattctttcctaatcattattagacat 16521  T
Q  455 gttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  16522 gttcaggcactcaaaagc-cctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcttgaaatcttgcatgctct 16586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16323
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatca 16212  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  16213 aatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagct 16310  T
Q  220 tcacagattataa 232  Q
    |||||||||||||    
T  16311 tcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 520
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5337
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 4948  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc--aagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacag 217  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| ||   |||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  4949 aatgcaattcaacaacatcttaagtattcaa--ataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacag 5045  T
Q  218 cttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaaga 317  Q
    ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| | | ||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||     
T  5046 cttcacagattatagctaaccccttcattaagtcttattgctagccaaaggtttaatcctcaacaactcgtgcaacaaaggtggcaaaa--ctaacaagt 5143  T
Q  318 ctctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatc 416  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||           ||  |||||| ||    
T  5144 cactctgtttctaggtcactcgcgaggcaagagcctctactcgccgtggcgagttcaggtcagaacctcacaagtt-----------tcattccaggttc 5232  T
Q  417 aa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcat 515  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  5233 aatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatcttcatgcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgcat 5332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13989
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacatgataatatcaa 13596  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     | | | ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| |||||||    
T  13597 tttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatc-ttatacagctt 13694  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |    
T  13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctaccgaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaagtcgc-aaaatctaacaagtcac 13793  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || || ||||| |||           |||||| ||||     
T  13794 tctgtttctgggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcagctcagaatctcacaagtttaat-----------tccaggttcaat 13882  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  13883 ctcatgctacatcctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgct 13982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10053
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataataatatca 10447  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | | ||| |||||||||||| || ||||||   ||  ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||| | ||||||    
T  10446 atttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcataat-cattatatcacatcataatcatcaacgacatatctt-atacagct 10349  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |     
T  10348 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaatggtcgc-aaaatctaacaagtca 10250  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||           |||||| ||||    
T  10249 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctccccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttaat-----------tccaggttcaa 10161  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  10160 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaattcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgc 10061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 525
Target Start/End: Original strand, 4545 - 5028
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||  || ||||||||||||     
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  141 aaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatc 240  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatcaaca--tcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  241 atcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgc 340  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||||||||||  || ||    
T  4743 ttcaataagtctcaatactacctcaaggttcaactcttaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatcctaacatggcattctgtttctgggtagcttgc 4842  T
Q  341 gaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagat-tccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcct 438  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||| |  |||||| |||   ||||||||| |||||| ||||| | |||| |||| |||   ||||| |||| |||    
T  4843 gaggcgagagcctttgctcgccatggcgaggacaggtctgatcgacaaaagttc-attctaaaatcttttcaggttcaatctcattctacaatcttccct 4941  T
Q  439 aatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4942 agtcattaatagacatgtttaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagttaaagtcacgaaatcttgcaagctctctggt 5028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 4712 - 5206
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatca 4811  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| ||| ||| |||| |  ||||||   ||  ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| | ||| ||    
T  4812 attgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcataa-acattatatcacatcataatcaacaacaacatatctt-atacaact 4909  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |     
T  4910 tcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactgtcgacaactcgtgcaacaaaggttgcaaaaatctaacaagtca 5009  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||           |||||  ||||    
T  5010 ctcttattatgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttaat-----------tccagattcaa 5098  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5099 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgc 5198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 86 - 525
Target Start/End: Original strand, 1 - 430
Alignment:
Q  86 gcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatca 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||| ||| ||| |||| |  ||||||   ||  ||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcataa-acattatatca 99  T
Q  185 catcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaac 284  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatctt-atacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactgtcgacaac 198  T
Q  285 tcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-att 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  199 tcgtgcaacaaaggttgcaaaaatctaacaagtcactcttattatgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcagaatc 298  T
Q  384 ccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggat 482  Q
    ||| ||||| |||           |||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  299 ccacaagtttaat-----------tccagattcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggtt 387  T
Q  483 caacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  388 caactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgctctctggt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 101 - 413
Target Start/End: Original strand, 27911 - 28222
Alignment:
Q  101 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 28010  T
Q  201 aacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtc 300  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |     
T  28011 aacaaatctt-aaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaacttgtgcgacacagatt 28109  T
Q  301 gcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattct 399  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||    
T  28110 gcaaaatcctgacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctttgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattcaaaaagtttcattct 28209  T
Q  400 acaatctctccagg 413  Q
    | ||||| ||||||    
T  28210 a-aatctttccagg 28222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Original strand, 28941 - 29041
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28941 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggaactcaaaagcatctaaggatctactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctgg 29040  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  29041 t 29041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 57
Target Start/End: Original strand, 27878 - 27913
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgca 57  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27878 catcatcatcttcataaacttagaccgactcatgca 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2446
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatca 2051  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||  |||| |||  || ||||||    
T  2052 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatc-atatacagct 2150  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    | ||| ||||| | |||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |     
T  2151 ttacatattattaataaccttatcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacatgtca 2249  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||           |||||| ||||    
T  2250 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagcatccctcaagtttaat-----------tccaggttcaa 2338  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  2339 tctcatcctacattccttcctaattattattagacacgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgc 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15092
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatacaaaacaacatgacataataatatcaa 15485  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     | ||| ||| |||||||| |  |||| |   ||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||    
T  15484 tttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataa-atattatatcacatcataatcatcaacaacatatctt-atacagctt 15387  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  15386 cacagattataattaaccttattattaagtcttaatcctacccaacgagtcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcac 15288  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||  ||           |||||| ||||     
T  15287 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctctccgtggcgagttcaggtcagaatcctacaagttttat-----------tccaggttcaat 15199  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  15198 ctcatcctacattctttcctaatcattattagacatattaaggcactcaaaagcatctacggttcaacttaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgct 15099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 449 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 32968 - 32892
Alignment:
Q  449 agacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  32968 agacatgttcaggcattcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 32892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32558
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaacaaa-caacatgacataataatatcaa 32165  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
     | ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | |||||||    
T  32166 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataa-acattatatcacatcataatcaacaacgacatatctt-atacagctt 32263  T
Q  221 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |  || |||   |    
T  32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactagagcaacaaaggtcgcaaaatcaaaa-aagtaac 32362  T
Q  321 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa- 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| || ||| ||||| |||           |||||| ||||     
T  32363 tctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcaagttcaagtcagaatcccacaagtttaat-----------tccaggttcaat 32451  T
Q  419 ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32452 ctcatcccacattctttcctagtcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgct 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51517
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |  |||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcacataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatcat 51887  T
Q  138 ctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataa-tcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    ||||| ||| |||| | | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |  |||||||||||| ||| |||||||    
T  51886 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat--aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  237 catcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcac 336  Q
     |||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgctaccccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taacaagtcactctgtttctgggtcac 51691  T
Q  337 tcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctt 434  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| | |||||  |||| ||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||     
T  51690 tagcgaggtgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcaaaatcccacaagtttcattcgacaatctttccaggttcaatctcatcctacattctc 51591  T
Q  435 tcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51590 tcctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 51517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32658
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatca 32635  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  32636 aatgcaa-tcaacaacatctcaaa 32658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 377
Target Start/End: Original strand, 32784 - 32892
Alignment:
Q  270 tcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaa-aacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcg 368  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| |||||   |||| |||||| |  |||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32784 tcaactcacatcaactcgtgcgacaaagatcgcatttaacccaacaaggcattctgtaactgggtagctcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcg 32883  T
Q  369 tgttcaggt 377  Q
     ||||||||    
T  32884 agttcaggt 32892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 32947 - 33006
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||| | |||||||||    
T  32947 tctttcctaatcattattacacatgttcaggcactcagaatcatctaaagttcaacttaa 33006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16773
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa--cagcatgacataattatatca 16379  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||| | |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |  |||||    
T  16380 aattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataa-acattataacacatcataatcaacaacaacatatctt-attcagct 16477  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| || |||||| |     
T  16478 tcacagattatagttaacctcattattaagtcttaatcctacccaagcgttcaactctcgagaaatcgtgcaacaaaggtcacaaaatcc-aacaagtca 16576  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc-agattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | || ||| ||||| |||           | |||| ||||    
T  16577 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtgccgagttctggtcaaaatcccataagtttaat-----------ttcaggttcaa 16665  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16666 tctcgtcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaacttaaaagtcaaaagtacgaaatcttgcatgc 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 213 - 525
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20908
Alignment:
Q  213 aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctattccaaggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaatc-taa 20693  T
Q  313 caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaa-aagttcaattctacaatctctcca 411  Q
    |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||  |||||| ||||| ||||    
T  20694 caaggcactctgtttctaggtcgctcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattctataatctttcca 20793  T
Q  412 ggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    || |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20794 ggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatct 20893  T
Q  511 tgcatgctctgtggt 525  Q
    | |||||||| ||||    
T  20894 tacatgctctctggt 20908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 679
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattatatca 1073  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||    
T  1072 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcataa-acattataacacatcataatcaacaacaacatat-tttatacagct 975  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||| || ||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |     
T  974 tcacagattatagttaacctcattcttaagacttaatcctacccaagggttcaactctcgacaaatcgtgcaacaaaggttgcaaaatc-taacaagtca 876  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||           |||||| ||||    
T  875 ctctgtttctgggttactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtcagaattccacaagtttaat-----------tccaggttcaa 787  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  786 tctcatcctacattctttcctaatcattattagacatattcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgaatgc 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 376
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21265
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatc 118  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    || ||||| |||||||||||| | |||| ||    |  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatctt-aaacagc 21108  T
Q  219 ttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagac 318  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |    
T  21109 ttcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctgatcaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaactcaacaagtc 21207  T
Q  319 tctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21208 actctgtttttgggtcactcacgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcagg 21265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 424 - 520
Target Start/End: Original strand, 21294 - 21390
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21294 cctacattctttcataatcattattagacatgttcaggcactaaaaaacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctct 21390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 4758
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa--catcatgacataattatatcaaat 5149  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
     ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||| | |  |||||||| |||||| |||||||||  |||| || ||||  ||| ||||    
T  5148 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtataa-acattataacacatcttaatcaacaacaacatat-tttattcagtttca 5051  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctc 322  Q
    || |||||||||||| | || ||||| ||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||    
T  5050 catattataattaaccttattattaaatcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtctcaaaatcc-aataagtcactc 4952  T
Q  323 tgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||           |||||| |||| ||    
T  4951 tgtttctgtgtcactcgcgaggcgagatcctctgctctctttggcgagttcaggtcagaatcccataagttcaat-----------tccaggttcaatct 4863  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  4862 catcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctct 4763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 508
Target Start/End: Original strand, 16784 - 17268
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttca 222  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  |||| || ||| ||  |||| | || ||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 16981  T
Q  223 cagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactct 321  Q
    ||||| || ||||| |  ||   |||  ||||  || |    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  | |    
T  16982 cagatcatcattaataatatatataatactcataaccattataaggttcaactatcaacgactcgtgctacaaagatcgcaaaatcctaaacaagtat-t 17080  T
Q  322 ctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ct 420  Q
    ||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  17081 ctgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcatattctcaaagttttattctaaaatctatccaggttcaatct 17180  T
Q  421 cgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17181 cattctacattctttcctaatcattattaaacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaat 17268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20042
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 20426  T
Q  140 caaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacat 239  Q
    ||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||  ||||  ||||| ||  |||| | || ||||||||||||| || ||||||||    
T  20425 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaacat 20328  T
Q  240 catcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtcactc 338  Q
     ||    ||   |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||| || |||||   | ||  |||     
T  20327 tatatacaatattcataactatcccaaggttcaactctcaacgactcgtgcgacaaagaccgcaaaatcctaaacaaggct-tctgtaattaggcaactt 20229  T
Q  339 gcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttc 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||   |||||| |||| |||   ||||||||||||    
T  20228 gcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtcagcttccaaaaagttc-attct-taattaatccaggttcaatctcattctacattctttc 20131  T
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20130 ctactcattattaaacatgttcaggaactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaattcacgaaatcttgcatgctctctggt 20042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |   |  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaa 128850  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacat 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  128851 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 65915 - 65730
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatc 118  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||     |||||    
T  65915 catcatcttgatcatcttttacctactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacatcatataaggatatc 65816  T
Q  119 aaatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||||  ||  ||| || ||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  65815 aaataaaa--caagcatcatctcaatcattcattcataattcaattaatgca-attaaacattatatcacatcatattcaacactaaca 65730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagctt 220  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatc-ttaaacagctt 3108  T
Q  221 cacag 225  Q
    |||||    
T  3107 cacag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 180 - 525
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10663
Alignment:
Q  180 tatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctca 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctta 10421  T
Q  280 acaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtca 379  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10422 acaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcactttgtttctaggtcactcgcgaggcgggaagctctgctcgccgtggcgagttcaggtca 10521  T
Q  380 ga--ttccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaactcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatata 477  Q
    ||  ||  |||  ||  |||||| ||||| |||||| |||| ||      |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||||||||| ||    
T  10522 gaatttgaaaatttttcattctaaaatctttccaggttcaa-tc-----tcattctttcctaatcactactaggcatgttaaggcactcaaaagcatcta 10615  T
Q  478 aggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10616 aggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagctctctggt 10663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 525
Target Start/End: Original strand, 6669 - 7104
Alignment:
Q  80 acataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacatt 178  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||| |  || ||    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  179 atatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 278  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcat-atacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaatcctacccaaaggttcaactctc 6867  T
Q  279 aacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc 378  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6868 gacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatctaacatgtcactctgtttatgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcaggtc 6966  T
Q  379 ag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatat 476  Q
    || || ||  ||||| |||           |||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |    
T  6967 agcatccctcaagtttaat-----------tccaggttcaatctcatcctacattccttcctaataattattagacacgttcaggcactcaaaggcatct 7055  T
Q  477 aaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||| |||||| |||||| ||||  | |||||||||| |||||| ||||    
T  7056 aaggttcaactcaaaagtcaaaaatatgaaatcttgcgtgctctctggt 7104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7757
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa--caacatgaaataattatatca 7363  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||| |  |||||    
T  7364 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataa-acattataacacttcataatcaacaacaacatatctt-attcagct 7461  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |     
T  7462 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaactcc-aacaagtca 7560  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | || |||||| ||||| |||           |||||| ||||    
T  7561 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtcgcgagttcagtttagaattccataagtttaat-----------tccaggttcaa 7649  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     | || |||||  | ||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  7650 tcacgtcctaccctattcactaatcaatattagacatgttcaggcacgcaaaagcatctaacgttcaatttaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgc 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1780
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtacaa--catcatgacataattatatca 1386  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||  |||  ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||| |  |||||    
T  1387 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataa-acattataacacttcataatcaacaacaacatatctt-attcagct 1484  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |     
T  1485 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaatcctacccaagggtccaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaactcc-aacaagtca 1583  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | || |||||| ||||| |||           |||||| ||||    
T  1584 ctctgtttctaggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtcgcgagttcagtttagaattccataagtttaat-----------tccaggttcaa 1672  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     | || |||||  | ||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  1673 tcacgtcctaccctattcactaatcaatattagacatgttcaggcacgcaaaagcatctaacgttcaatttaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgc 1772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 519
Target Start/End: Original strand, 51582 - 52067
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa--catcatgacataattataaca 51679  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  |||||| |||||| |  |||||||| ||| ||||| ||||||  |||| ||||| |  |||||    
T  51680 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcataa-acattataacacttcatattcaacaacaacatatctt-attcagct 51777  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    |||||||||||| ||||| |||   |||||||| ||| |||||| | ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |     
T  51778 tcacagattatagttaacctcactcttaagtcttaatcctacccaagggtccaattctcgacaactcgtgcaacaaaagtcgcaaaatc-taacaagtca 51876  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || || ||  |||||           ||  |||||| ||||    
T  51877 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagctcaggttagaatcccgtaagtt-----------tcattccaggttcaa 51965  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||| | |||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  51966 tctcgtcctacattctttcctaatcattattagacttgttcaggcactcaaaggcatcaaaggtttaactcaaaagtaaaaaatacgaaatcttgcaagc 52065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 109053 - 108967
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||| |  || ||||||||||    
T  109053 cctacattcattcctaatcaatactaggtatgttcaggcactcaaaggtatacaaggttcaacttaaaaggtcgaaacacgaaatct 108967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 280 - 525
Target Start/End: Original strand, 163 - 409
Alignment:
Q  280 acaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtca 379  Q
    |||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  163 acaacttgtgcgacacagatcgcaaaatcctaacaaggcactctgtttctgggtcactcgcgtggcgagagcctctactcgctgtggcgagttcaggtca 262  T
Q  380 gat-tccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatata 477  Q
    ||  || |||||||  |||||| ||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  263 gaactcaaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatata 361  T
Q  478 aggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  362 aggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 525
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47480
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac--agcagcatgacataataatatca 47092  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    | | ||| ||| |||||||| |  ||||||   ||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||  |||| ||| ||| ||||||    
T  47093 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatc-ttatacagct 47190  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagact 319  Q
    ||||||||||||       ||||  |||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |   |||||||| |     
T  47191 tcacagattata------ctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaactcgtgcaacaaaggtcgc-catttctaacaagtca 47283  T
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa 418  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||| || ||| ||||| |||           |||||| ||||    
T  47284 ctctggttttgggtcactcgcgaggcgagagcctctgcgctccgtggcgagctcaggtcagaatcccacaagtttaat-----------tccaggttcaa 47372  T
Q  419 -ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgc 517  Q
     |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  47373 tctcatcctacattcattcctaatcattattagacatattcagacactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaacaatacgaaatcttgcatgc 47472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 201 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 17927 - 17624
Alignment:
Q  201 aacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtc 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17927 aacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccaaaggttcaattctcaacaactcgtgcaacaaaggtc 17829  T
Q  301 gcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattct 399  Q
    || ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||                     |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |||||    
T  17828 gc-aaaacctaacaagtcactctatttctgggtgact---------------------cgccgtggcgagttcaggtcagaatcccacaagtttcattct 17751  T
Q  400 acaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaa 498  Q
    ||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |||    
T  17750 acaatctatccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggtttaactcaaaagtcaaa 17651  T
Q  499 atcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17650 atcatgaaatcttgcatgctctctggt 17624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  84 aggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatat 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  183 cacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 158 - 499
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1382
Alignment:
Q  158 tcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaata 257  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  1052 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaata 1150  T
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctac 357  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1151 ctacccaaaagttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaagtctcacaaggcactttgtttccgggtcactcgtgaggcgagagcctctgc 1249  T
Q  358 tcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatg 455  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||||           ||  |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1250 tcgccatggcgagttctggtcagaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagtaatg 1338  T
Q  456 ttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaa 499  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  1339 ttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaa 1382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 210 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11445 - 11171
Alignment:
Q  210 ttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacc 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11445 ttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaattctacccaaaggttcaactctctacaactcgtgcaacaaaggtcgc-aaaatc 11347  T
Q  310 taacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcag-attccaaaagttcaattctacaatctct 408  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||           ||  |    
T  11346 taacaagtcactttgtttctgtgtcactcgcgaggtgagagcctcttctcgccttggcgagttcaggtcagtatcccacaagtt-----------tcatt 11258  T
Q  409 ccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagt 494  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  11257 ccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagaatctaaggttcaactcaaaagt 11171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11447
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacat 137  Q
    | | ||| ||| ||||||    
T  11464 atttcaattcatcaacat 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 14055 - 14109
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  14055 cctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatctaaggttcaacttaa 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 499
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3949
Alignment:
Q  179 atatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 278  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctc 3738  T
Q  279 aacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc 378  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3739 aacaactcgtgcaacaaaggtcac-aaagtctcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgagacgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtc 3837  T
Q  379 ag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatat 476  Q
    || || ||| |||||           ||  |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||| |    
T  3838 agaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattactagtcatgttcaggcactcaaagtcatct 3926  T
Q  477 aaggatcaacttaaaagttaaaa 499  Q
    |||| |||||| |||||| ||||    
T  3927 aaggttcaactcaaaagtcaaaa 3949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 499
Target Start/End: Original strand, 7704 - 8013
Alignment:
Q  179 atatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctc 278  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatctt-aaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctc 7802  T
Q  279 aacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaacaagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtc 378  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  7803 aacaactcgtgcaacaaaggtcac-aaagtctcacaaggcactctgtttccgggtcactcgcgagacgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtc 7901  T
Q  379 ag-attccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatat 476  Q
    || || ||| |||||           ||  |||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||| |    
T  7902 agaatcccacaagtt-----------tcattccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattactagtcatgttcaggcactcaaagtcatct 7990  T
Q  477 aaggatcaacttaaaagttaaaa 499  Q
    |||| |||||| |||||| ||||    
T  7991 aaggttcaactcaaaagtcaaaa 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 27756  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagat 227  Q
    ||||||||| || ||   ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||    
T  27755 catctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 27347 - 27293
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| | |||||||||    
T  27347 cctaatcattattatacatgttcaggcactcaaaatcatctaaagttcaacttaa 27293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116631
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaacagcatgacataatcatatcaaatg 116528  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||        ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  116529 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat---aagtac-------gacatcataatcaacattaacatatcctaaaacagcttcac 116618  T
Q  224 agattataattaa 236  Q
    ||||||| |||||    
T  116619 agattatcattaa 116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128967
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  137 tctcaaa 143  Q
    |||||||    
T  128973 tctcaaa 128967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Original strand, 78328 - 78445
Alignment:
Q  28 catcttcat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||    
T  78328 catcttcattcatcttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatg 78426  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaa 142  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  78427 caaatcaacaacatctcaa 78445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 128775 - 128735
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  128775 ctcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 128735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 15500 - 15231
Alignment:
Q  257 actaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||  | | |||   | |||||||||||||||||||||||||    
T  15500 actaccccaaggttcaactctcaacgattcgtgcgacaaagatcgaaaaatcctaagcaagtattt-tgtaaataggtcactcgcgaggcgagagcctct 15402  T
Q  356 actcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacat 454  Q
     |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15401 gctcgctatggcgagttcaggtcagattcccaaagtttcattctaaaatctatccagattcaatctcattctacattctttcctaatcattattaaacat 15302  T
Q  455 gttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15301 attcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgatatcttgcatgctctctggt 15231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 145
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12693
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 12686  T
Q  139 tcaaata 145  Q
    |||||||    
T  12687 tcaaata 12693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 272 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 1947 - 1694
Alignment:
Q  272 aactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtg 370  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||      
T  1947 aactctcaacgactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaagcat-tctgtaactgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgaa 1849  T
Q  371 ttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaa 469  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1848 ttcaggtcagatttccaaagtttcattctaaaatctttccaggttcaatctcattctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaa 1749  T
Q  470 agcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  1748 a-catctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacagaatcttgcaagctctctggt 1694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 15866
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaa 16107  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataatt 234  Q
    ||||||||| || | |  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| || |||    
T  16106 catctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatcatt 16007  T
Q  235 aacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggt 333  Q
     | |||||    || |  || |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||| |  |||||  |||||     
T  16006 gatatcatatacaatttccattactacccaaaggttcaactcataacaacttgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaaacaaggcattctgtaactgggc 15907  T
Q  334 cactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttca 374  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||    
T  15906 aactcgcgaggcgagggcctatactcgctatggcgagttca 15866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 312
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13421
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc 13246  T
Q  139 tcaaa-tatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaac 237  Q
    | |||  || |||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| || ||| |     
T  13247 tgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatcattgat 13346  T
Q  238 atcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    |||||    || |  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  13347 atcatatacaatttccattactaccccaaggtttaactcataacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaa 13421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2741
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagtacataaaaca 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28533
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 28513  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatct 139  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  28514 attgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11407
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 11391  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  11392 aatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2112
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 2096  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  2097 aatgtaaatcaacaac 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 525
Target Start/End: Original strand, 14914 - 14982
Alignment:
Q  457 tcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  14914 tcaggcactccaaagcatctaaggatcaactctaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctctctggt 14982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8613
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaa 8580  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  8581 catctcaaatattcatatataattcaagtaatg 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6661
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6634  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6635 aatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 6948 - 7026
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  6948 tctttcctaattattattagacatgtccaggcactcaaaa-catcaaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 7026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 335 - 525
Target Start/End: Original strand, 20426 - 20617
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagat-tccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||    ||||||||    
T  20426 actcgcgaggcgagagcctctgctcgtcgtggcgagctcaggtcagaactccaaaagtttcattcta-aatctttccaggttcaatcttattctacattc 20524  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20525 tttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcagaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 20617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23898
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 23901  T
Q  124 caa 126  Q
    |||    
T  23900 caa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 10)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44600
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa--cagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgca 44600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100500
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataataatatcgaatg 100477  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  100478 caaatcaacaacatctcaaatat 100500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40169
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 40192  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  40191 caaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Original strand, 101709 - 101884
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||  ||| |||| ||||| | |||||||||| |||| |||   || || |||    
T  101709 actcccgaggcaagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtcaagttcacaaaattca-ttctaaagtctctccaggttcaatctcattctccaatct 101807  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  101808 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacttctaaggatcaactcaaaagtaaaaattacgaaatct 101884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119947
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtat 92  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 97
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38394
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||   |||| |||| |||||| |  ||||||||| |     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcac 223  Q
    ||  |||||||||||| ||  || || | |||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  || |  |||||||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcac 38399  T
Q  224 agatt 228  Q
    |||||    
T  38398 agatt 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23647 - 23581
Alignment:
Q  160 aagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  23647 aagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcacagatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaa-acagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Original strand, 132967 - 133143
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||| |||   || || ||    
T  132967 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaatttca-ttctaaagtctttccaggttcaatctcattctccaatc 133065  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  133066 tttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 133143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 146
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62321
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaacatcatggtataataatatcgaa 62299  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||||   ||||||||||||||||||    
T  62300 tgca---caacaacatctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132736
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaa 132736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 169
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13537
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 13537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||| |||||||||| ||   |||||||||||    
T  10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 80137 - 79948
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  80137 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatgtcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 80040  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  80039 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaatggcatttaatgttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 79948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22645
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 22677  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  22676 catctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 22645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 186
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  28 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  127 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160809
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||| ||||||||    
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85539
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttc 221  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || |||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
Q  222 acagat 227  Q
    ||||||    
T  85544 acagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 508
Target Start/End: Original strand, 161000 - 161173
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||| |||   || || |||    
T  161000 ctcgtgaggtgagagcctctactcgccatggcgacttcaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaagtctctccaggttcaatctcattctccaatct 161098  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  161099 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 161173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Original strand, 497445 - 497494
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  497445 cttaaaccgacacatgcagcttagttaatatacaacaacaacataggcag 497494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17882
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||| || |||| ||||| |||||||||||     
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaacatcatgatataataatatcg 18049  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | || |||||    
T  18048 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagct 17949  T
Q  220 tcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactc 286  Q
    |||||||| || ||||| ||  | | |||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17948 tcacagatcatcattaatattgtaaataatattcataactaccccaaggttcaactttcaacaactc 17882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2088
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttc 221  Q
    |||||||||  ||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| | || |||||||    
T  2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 2094  T
Q  222 acagat 227  Q
    ||||||    
T  2093 acagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 425 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6544 - 6449
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  6544 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactaaaaggcatctaaggatcatctcaaaagtcaaaatcatgaaatcttgcattctct 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6617 - 6561
Alignment:
Q  320 ctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6617 ctctatttctgggtcacttgcgaggcgagagcctctgctcgccgtggcgagttcagg 6561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 312
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225698
Alignment:
Q  78 caacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacat 177  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||   ||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaat 225563  T
Q  178 tatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 277  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||  |||| |  | ||||||||||| | || ||||| |||||   |||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  225564 tatatcacattataaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagttcattattaatatcatatataatcttcataactaccccaaggttcaactct 225663  T
Q  278 caacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  225664 caacaactcgtgcgacaaagatcgcaaaatcctaa 225698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60479
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 60720  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaa 236  Q
    ||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||   | |||||||||| || | |||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  60719 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcattaa 60620  T
Q  237 catcatcattaagtct-caatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacct-aacaagactctctgtttctgggtc 334  Q
     ||||| ||  | ||| || | |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| || ||||| ||| |||||     |||||  |||||      
T  60619 tatcat-atacaatctccattcctaccccaaggttcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcacaaaaccctaaacaatgtattctgtaactgggaa 60521  T
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcagg 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  60520 actcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcagg 60479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130051
Alignment:
Q  33 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcat 130016  T
Q  132 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  130017 caacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 130051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 130318 - 130397
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  130318 tcttttctaatcataactagacatgttcaggcactcaaaaacatcaaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 130397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   || |||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 395 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 18705 - 18574
Alignment:
Q  395 attctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaag 493  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||    
T  18705 attctacaatctttccaggttcaatctcatcctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcatctcaaaag 18606  T
Q  494 ttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18605 tcaaaatcacaaaatcttgcatgctctctggt 18574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 257 - 508
Target Start/End: Original strand, 12165 - 12416
Alignment:
Q  257 actaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa-caagactctctgtttctgggtcactcgcgaggcgagagcctct 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| || | || |||||   ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12165 actaccccaaggttcaactctcaacgactcgtgtgacaaagatcgcaaaatcctaaacagggct-tctgtaattgggcaactcgcgaggtgagagcctct 12263  T
Q  356 actcgccgtggcgtgttcaggtcagattccaaaa-gttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttcctaatcattattagaca 453  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||   |||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12264 actcgccatggcgagttcaggtcagtttccaaaaagttca-ttctt-aattaatccaggttcaatctcattctacattctttcctaatcattattaaaca 12361  T
Q  454 tgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  12362 tattcagacactcaaaagcatctaaggatcaattcaaaagtcaaaatcacgaaat 12416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 82
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19390
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 19367  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  19368 caaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 510
Target Start/End: Original strand, 19573 - 19756
Alignment:
Q  328 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattcc-aaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacc 425  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   |  |  |||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   |    
T  19573 ctgggtcattcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtgcaacacataaaaattca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattc 19671  T
Q  426 tacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||||    
T  19672 tccaatccttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcagaagtcaaaattacaaaatct 19756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
Q  22 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 120  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
Q  121 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
Q  23 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtata-caaaacagcatgacataataatatcaaa 121  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
Q  122 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||| |||||||||| ||   |||||||||||    
T  9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 133 - 275
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 232  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  233 caaatcaacaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 510
Target Start/End: Original strand, 437 - 620
Alignment:
Q  328 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   | || ||||| |||| ||||| ||||| |||| | |||| |||   |    
T  437 ctgggtcactcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggtgcaactcacaaaaattca-ttctaaaatctttccaagttcaatctcattc 535  T
Q  426 tacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  536 tccaatctttcctaatcattattagacatgtttaggcactcaaaaaagtctaaggatcaattcaaaagtcaaaattacgaaatct 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2801
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatg 2824  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  2823 caaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2609 - 2434
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||  ||| |||| ||||| ||||| | |||| |||| |||   || || ||    
T  2609 actcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggttcag-ttcacaaatttca-ttctaaaatctttacaggttcaaactcattctccaatc 2512  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||| | |||||||    
T  2511 tttcctaatcattattagacatgttcaggtactcaaaagcatctaaggatcatcccaaaagtcaaaattatgaaatct 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2701
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2802 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcaagctctctg 2703  T
Q  524 gt 525  Q
    ||    
T  2702 gt 2701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 424 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 13325 - 13224
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13325 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacgaaatcttgcatgctctctg 13226  T
Q  524 gt 525  Q
    ||    
T  13225 gt 13224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38679
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaat 38721  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta 164  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  38720 gcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagta 38679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  126 agtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    | |||||||| |||||| ||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacagcaaca----ca---gcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  123 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 339 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 12611 - 12425
Alignment:
Q  339 gcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattctttc 436  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||  ||||||   ||| |||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  12611 gcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagtttcattctatg-tctttccaggttcaatctcatcctacattctttc 12514  T
Q  437 ctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12513 ctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcatctcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 12425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53491
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatc 53552  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| | ||   |||||||||||| |||| ||||||    
T  53551 tcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 53491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8099 - 7915
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | | |||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  8099 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttctgtt-agattctccaaagtttcattcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 8002  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8001 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatcttgcatgctct 7915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 344 - 532
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||| | | | |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  344 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagttccattcta-agtatttccaggttcaatctcatcctacattct 441  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  442 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactc-aaggcatctaaggttcaattcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1075
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||     
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaccatcatgatataataatatcg 1091  T
Q  120 aatgcaagtcaacaac 135  Q
    |||| || ||||||||    
T  1090 aatgtaaatcaacaac 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15788
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| ||||||     
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 15799  T
Q  120 aatgcaagtca 130  Q
    |||||||||||    
T  15798 aatgcaagtca 15788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15462
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15540 tctttcctaatcatcattatacatgtttaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaagttaaaattacgaaatc 15462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggca 88  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 424 - 525
Target Start/End: Original strand, 10548 - 10649
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtg 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10548 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcatgcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaggtcaaaatcacgaaatcttgcaagctctctg 10647  T
Q  524 gt 525  Q
    ||    
T  10648 gt 10649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  27 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgca 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  126 agtcaa 131  Q
    ||||||    
T  1341 agtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 336 - 510
Target Start/End: Original strand, 7126 - 7301
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||   || || |||    
T  7126 ctcgcaaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaaatctttccaggttcaatctcattctccaatct 7224  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  7225 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaatct 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6927
Alignment:
Q  33 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||  ||||||| ||||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaa 6923  T
Q  132 caac 135  Q
    ||||    
T  6924 caac 6927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 8088 - 8138
Alignment:
Q  93 acaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8088 acaaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 8138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10516
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10548  T
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  10547 catctcaaatat-caaacataattcatgtaatg 10516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 525
Target Start/End: Original strand, 985 - 1084
Alignment:
Q  426 tacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||  ||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  985 tacattcactcctaatcaatattagacatgttctagcactcaaagacatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10278 - 10200
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || ||| || ||||| ||||||||    
T  10278 tctttactaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcatctcaaaggtcaaaattacgaaatc 10200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10347 - 10305
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  10347 actcgcgaggcgagagcctctactcgctttggcgagttcaggt 10305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11680
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 11563  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagct 219  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| | |  |||||    
T  11564 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcatcactcagct 11663  T
Q  220 tcacagattataattaa 236  Q
    |||||||| || |||||    
T  11664 tcacagatcatcattaa 11680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6719
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| ||||||     
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 6710  T
Q  120 aatgcaagt 128  Q
    |||||||||    
T  6711 aatgcaagt 6719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14099
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| ||||||     
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatgatgatataacaatatcg 14090  T
Q  120 aatgcaagt 128  Q
    |||||||||    
T  14091 aatgcaagt 14099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 7024 - 7102
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  7024 tctttcctaatcatcattatacatgtttaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 14404 - 14482
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14404 tctttcctaatcatcattatacatgtttaggcactcaaaaacatctaaggttcaacttaaaggtcaaaattacgaaatc 14482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15776
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaccatcatgatataataatatcgaat 15763  T
Q  123 gcaagtcaacaac 135  Q
    | || ||||||||    
T  15764 gtaaatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 425 - 525
Target Start/End: Original strand, 16063 - 16163
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtgg 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  16063 ctacattctttcctaatcattattagacatattcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactctaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctctctgg 16162  T
Q  525 t 525  Q
    |    
T  16163 t 16163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1522
Alignment:
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1452 catctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcatattcaacactaaca 1522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 384
Target Start/End: Original strand, 15974 - 16021
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc 384  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  15974 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattc 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161089
Alignment:
Q  24 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  123 gcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 161089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  103 atgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacatta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| ||   |||||||||||  |||| |||||| |    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  202 acacatctttaaacagcttcacagat 227  Q
    |  |||| | || |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||| |||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatc 1150  T
Q  139 tcaaatat 146  Q
    ||||||||    
T  1151 tcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38198
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaacatcatgatataataatatcg 38278  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
     | | |||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| ||||||    
T  38277 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 24456 - 24266
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||  | ||||||  |||||| | ||| || ||| |||| |||  |||| |||||    
T  24456 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattatccaaagtttcattcta-agtctttctaggttcaatctcatcctaaattct 24359  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagt-taaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24358 ttcctaatcaatattagacatgttcaggcactcaagggcatctaaggttaaactcaaaagtcaaaaatcacgaaatcttgcatgctctctggt 24266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1037
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || | || ||||| |||| || |||     
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatcatcatgatataacaacatcg 1056  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  1055 aatgcaagtcatcaacatc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 744 - 678
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaa 491  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  744 ctacaatctttcctaatcattattatacatgttcaggcactcaaaaacatctaagattcaacttaaa 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12884
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 12865  T
Q  120 aatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  12866 aatgcaagtcatcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5769
Alignment:
Q  33 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatgaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaa 5754  T
Q  132 caacatctcaaatat 146  Q
    |||||||||||||||    
T  5755 caacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6083
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  6004 tctttcctaatcattattagacctgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactaaaaagtcaaaattacgaaatct 6083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6134
Alignment:
Q  21 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatca 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||     
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcg 6145  T
Q  120 aatgcaagtca 130  Q
    |||||||||||    
T  6144 aatgcaagtca 6134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 5830 - 5772
Alignment:
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaa 491  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  5830 tttcctaatcattattatacatgttcaggtactcaaaaacatctaagattcaacttaaa 5772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2640
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| || ||||  |||| |||||  ||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatgtaaatcatcatgttataacaatattgaatg 2663  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  2662 caaatcaacaacatctcaaatat 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 2354 - 2277
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  2354 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatttaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 2277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 336 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 2250 - 2066
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| | ||| ||  |||||| | ||| | |||| |||| |||   |||||||||    
T  2250 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttc-ggtcagattctctaaattttcattcta-agtcttttcaggttcaatctcattctacattct 2153  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  2152 ttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaacagtcaaaattacaaaatcttgcatgctct 2066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13057
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcagcatgatataacaatatcgaatg 13042  T
Q  124 caagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||| |||||||    
T  13043 caagtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Original strand, 13351 - 13429
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatc 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  13351 tctttcctaatcataattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaactcaaaggtcaaaattacgaaatc 13429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18298 - 18210
Alignment:
Q  82 ataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  18298 ataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 18210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 377
Target Start/End: Original strand, 13255 - 13296
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13255 ctcgcgaggcgagggcctctactcgccatggcgagttcaggt 13296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 29936 - 29840
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||   ||||  ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||    
T  29936 cctacattcattcctaatcattactaggtatgttcaggcactcaatggcactcaaggtccaactaaaaagtcaaaattacaaaatcttacatgctct 29840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 424 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 41932 - 41836
Alignment:
Q  424 cctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||   ||||  ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||    
T  41932 cctacattcattcctaatcattactaggtatgttcaggcactcaatggcactcaaggtccaactaaaaagtcaaaattacaaaatcttacatgctct 41836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14692
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||   ||| || ||||| ||| ||||||| ||||    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaagaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatg 14715  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  14714 caaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30094
Alignment:
Q  38 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcaca 186  Q
    |||||| ||| ||   ||||||||| |||| || ||   |||||||||||    
T  30045 tctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcaca 30094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 143
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10650
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaa 10641  T
Q  135 catctcaaa 143  Q
    |||||||||    
T  10642 catctcaaa 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 10939 - 10998
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||    
T  10939 tctttcctaatcattattacacatgttcaggcactcaaaaacatctaagattcaacttaa 10998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Original strand, 10842 - 10884
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  10842 actcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcaggt 10884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1205
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| |||     
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaata 1185  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaaa 143  Q
    || |||| |||||| |||||    
T  1186 caggtcatcaacatttcaaa 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 525
Target Start/End: Original strand, 9391 - 9581
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| ||||||  ||| |||   |||||||||    
T  9391 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaaattca-ttctaaactctttccaggtccaatctcactctacattct 9489  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  9490 ttcctaatcgttattagacttgttcaggcactcaaaagcatctaagggtcatctcaaaagtcaaaaacacagaatcttgcatgctctctggt 9581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 425 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28996 - 28901
Alignment:
Q  425 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  28996 ctacattctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaacccaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctct 28901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8075
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaac 8081  T
Q  133 aacatc 138  Q
    ||||||    
T  8080 aacatc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24048
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgac-----ataataatatc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| |||||     |||| ||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacaatatc 23942  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagc 218  Q
    ||||  ||  || |||||||||||  || |||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| | ||||||    
T  23943 aaat--aaaacagcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgaaattaacattatatcacatcatattcaacacta--acatctcttaacagc 24038  T
Q  219 ttcacagatt 228  Q
    ||||||||||    
T  24039 ttcacagatt 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 336 - 520
Target Start/End: Original strand, 10226 - 10410
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||   ||||| | ||| |||||| |||| |||  ||||||||||    
T  10226 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcag-tcagattctccaaagtttccttcta-agtctttccaggttcaatctcatcctacattct 10323  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  10324 ttcctaatcaataatagacatgtttaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaatcacaaaatcttacatgctct 10410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45791
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 45810  T
Q  124 caagtcaacaacatctcaa 142  Q
     |||||| |||||||||||    
T  45809 taagtcatcaacatctcaa 45791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 45596 - 45420
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| |||||  |  |||||| | |||  ||||| |||| |||   |  || |||    
T  45596 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccatggcgagttcaggtacaattcacaaaaaattcattctaaagtcttaccaggttcaatctcattccccaatct 45497  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  45496 ttcctaatcattattagacatattcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtaaaaattacaaaatct 45420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 336 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 9639 - 9457
Alignment:
Q  336 ctcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggtcagattc-caaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattct 433  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||  |||| |||  ||||||||||    
T  9639 ctcgcgaggcgagagcctctgctcgccatgacgagttcag-tcagattctccaaagtttcattcta-agtctttccagattcaatctcatcctacattct 9542  T
Q  434 ttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgct 518  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9541 ttcgtaatcaatattagacatgttcaggcactcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtcgaaatcatgaaatcttgcatgct 9457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25385
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaac 25219  T
Q  133 aacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataa 232  Q
    ||||||||||| || |||  |||||||| |||||| | ||   | |||||||||| || | |||||| ||  | ||||  ||||||||||||||| || |    
T  25220 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattatta-caacatcaaatcgtcttataacagcttcacagatcatca 25317  T
Q  233 ttaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtc 300  Q
    |||| || ||  | ||   ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25318 ttaatattatattcaaccttcatttctaccccaaggatcaactcacaacaactcgtgcgacaaaggtc 25385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 312
Target Start/End: Original strand, 586 - 828
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatg 167  Q
    |||||||||||||||| || || | |||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| || |||  |||||||| ||||||    
T  586 aacaacaacaacatagacaatacataaaacagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatg 683  T
Q  168 cacattaca-ttatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct-caatactacccca 265  Q
    || | |||| ||||||||||| || | |||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||| || | ||| || || ||| |  || || | ||||||||    
T  684 cata-tacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatattataacagcttcacagatcatcagtaatattat-attcaacctccattcctacccca 781  T
Q  266 aggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    ||| |||||||  || | |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  782 aggatcaactcataaaatctcgtgcaacaaagatcgcaaaaccctaa 828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 8001
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaa-caacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatc 138  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  139 tcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacat 199  Q
    | ||| || |||  ||||||||||||||| | || | |||||||||||| |||| ||||||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacat 8001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 7767 - 7708
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  7767 tctttcctaatcattattacacatgttcagacactcaaaaacatctaaggttcaacttaa 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7864 - 7822
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  7864 actcgcgaggcgagagcctctactcgctatggcgagttcaggt 7822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 335 - 510
Target Start/End: Original strand, 32397 - 32573
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt-cagattccaaaagttcaattctacaatctctccaggatcaa-ctcgacctacattc 432  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |  ||||| |||| ||||| | ||| |||||| |||| |||   || || ||    
T  32397 actcgcgaggtgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggttcagttcacaaaatttca-ttctaaagtctttccaggttcaatctcattctccaatc 32495  T
Q  433 tttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  32496 tttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacaaaatct 32573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32202
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 122  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaat 32201  T
Q  123 g 123  Q
    |    
T  32202 g 32202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 28519 - 28440
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatct 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  28519 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaagtacgaaatct 28440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--acaacaacataggcagtatacaaa 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28616 - 28574
Alignment:
Q  335 actcgcgaggcgagagcctctactcgccgtggcgtgttcaggt 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  28616 actcgcgaggcgagagcctctgctcgccatggcgagttcaggt 28574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 508
Target Start/End: Original strand, 3343 - 3420
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  3343 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaattacgaaat 3420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6255
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  6286 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13793
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  13840 cttagaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacaacaacatagg 13793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38466
Alignment:
Q  44 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  141 aaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  38439 aaacat-catatataattcatgtaatgca 38466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 204
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20165
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatc 118  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  | |||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||     |||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaatagtagcataggcagattacaacaacagtatgacatcatataacaatatc 20079  T
Q  119 aaatgcaagtcaa-caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatt--acattatatcacatcataatcaacattaaca 204  Q
    ||||  ||  ||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20080 aaataaaa--caagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaaacattatatcacatcatattcaacactaaca 20165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 443 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10970 - 10888
Alignment:
Q  443 attattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctctgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  10970 attattagacatgttcaggcactcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaaatacgaaatcttgcatgctctctggt 10888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97155
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  97124 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 97155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106433
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  137 tctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    ||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  106402 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 106433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2283 - 2213
Alignment:
Q  76 aacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2283 aacaacataggcagtatgcaaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267784
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  267779 tctcaa 267784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15362
Alignment:
Q  70 aacaacaacaacataggcagtatacaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc--aagtaatg 167  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||| ||   |||||||  ||||||||    
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatacaaa-cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattca--aataattcttaagtaatg 15390  T
Q  168 cacattacattatatcacatcataatca 195  Q
    || |  |||||||||||||| |||||||    
T  15389 cataaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15106 - 15051
Alignment:
Q  465 tcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15106 tcaaaggcatctaaggttcaactcaaaagtgaaaatcacgaaatcttgcatgctct 15051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Original strand, 36199 - 36248
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  36199 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacaacaacataggcag 36248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 465 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1077
Alignment:
Q  465 tcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1132 tcaaaagcatctaaggatcaactcaaaagtcaaaatcacgaaatcttgcatgctct 1077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaaca 667  T
Q  137 tc 138  Q
    ||    
T  668 tc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1900 - 1795
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||| |||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1900 cttagaccgactcatgcagcttagttattaaactaacattaacataggtagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 1801  T
Q  137 tctcaa 142  Q
    ||||||    
T  1800 tctcaa 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29720
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |  | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  124 caa-gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcac 185  Q
    |||  ||||||| |  | |||||| || | | | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29658 caatttcaacaagactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcac 29720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 2011 - 1934
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  2011 tctttcctaatcattattagacatgttcagtgactcaaaaacatctaaggatcaactcaaaagtcaaaaatacgaaat 1934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36662
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatc 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||   ||||| ||||  ||||||| |||     |||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggcaaattacaacaacaatatgacatcatataacgatatc 36553  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    ||||  ||     |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||   ||||    
T  36554 aaatataaacacgcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgca-attaaacattatatcacatcatattcaacacta--acatctcataaca 36650  T
Q  217 gcttcacagatt 228  Q
    ||||||||||||    
T  36651 gcttcacagatt 36662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16264
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtat-acaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaata 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||| |||| |||||| | |||||||||| |  |  |||||||||||| ||  |    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatta-atttcaacaacatcttaatca 16345  T
Q  146 tacattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    | || | |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  16344 ttcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcacagatt 16264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 126
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2783
Alignment:
Q  40 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |  |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaa 2783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103632
Alignment:
Q  36 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca--gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaac 103638  T
Q  133 aacatc 138  Q
    ||||||    
T  103637 aacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 69794 - 70000
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataata-----atatc 118  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||| ||||||| | |     |||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 69893  T
Q  119 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaaca 216  Q
    ||    ||  || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||   ||||    
T  69894 aataaaaa--cagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaatcattatatcacatcatattcaacacta--acatctcataaca 69988  T
Q  217 gcttcacagatt 228  Q
    ||||||||||||    
T  69989 gcttcacagatt 70000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Original strand, 32544 - 32650
Alignment:
Q  132 caacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatta 229  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||     
T  32544 caacatctcaatcattcattcataactcaagtaatgca-attaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcat--aacagcttcacagattg 32640  T
Q  230 taattaacat 239  Q
     |||||||||    
T  32641 caattaacat 32650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 189
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29262
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaa-gtcaacaacatctcaaata 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| || |||||    
T  29117 gactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaattttaacaacaccttaaata 29216  T
Q  146 ta--cattcataattcaagtaatgcacattacattatatcacatca 189  Q
    ||  || | | | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  29217 tattcaataaaacttcaagtaatacacacaacattatatcacatca 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206566
Alignment:
Q  42 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaca 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtacataaaaca 206566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15676 - 15584
Alignment:
Q  135 catctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacatta--cattatatcacatcataatcaacattaacacatctttaaacagcttcacagatt 228  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  15676 catctcaatcattcattcataattcaagtaatgca-attaatcattatctcacatcatattcaacattaacatttcat--aacagcttcacagatt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13153
Alignment:
Q  108 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||| ||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgca 13153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 43494 - 43438
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaact 487  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  43494 tcttttctaatcataattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaact 43438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 47414 - 47358
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaact 487  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  47414 tcttttctaatcataattagacatgttcaggcactcaaaaacatctaaggttcaact 47358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1205 - 1166
Alignment:
Q  163 taatgcacattacattatatcacatcataatcaacattaa 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1205 taatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaa 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 169
Target Start/End: Original strand, 57 - 154
Alignment:
Q  73 aacaacaacataggcagtatacaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgca 169  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||    
T  57 aacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgca 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17400 - 17345
Alignment:
Q  465 tcaaaagcatataaggatcaacttaaaagttaaaatcacgaaatcttgcatgctct 520  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  17400 tcaaaagcatctaaggttcaactcaaaagtcaaaattacaaaatcttgcatgctct 17345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 490
Target Start/End: Original strand, 12406 - 12465
Alignment:
Q  431 tctttcctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||  ||||||||||    
T  12406 tctttcctaatcattattatacatgttcagacactcaaaatcatctaaatatcaacttaa 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 640 - 586
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  640 cctaatcattattatacatattcatgcactcaaaatcatttaaggatcaacttaa 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35575 - 35521
Alignment:
Q  436 cctaatcattattagacatgttcaggcattcaaaagcatataaggatcaacttaa 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  35575 cctaatcattattatacatattcaggcactcaaaatcatttaaggttcaacttaa 35521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24481 - 24427
Alignment:
Q  258 ctaccccaaggttcaactctcaacaactcgtgcaacaaaggtcgcaaaaacctaa 312  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24481 ctaccccaaggatcaactcataacatctcgtgcgacaaagatcgcaaaaacctaa 24427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 858 - 813
Alignment:
Q  44 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  858 gaccgactcatgcagcttaattaatatacaacaacaacataggcag 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1945
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21856
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 21856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29748
Alignment:
Q  25 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcag 89  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 29748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 84
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9572
Alignment:
Q  48 gactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata 84  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9536 gactcatgcaacttagttaaataacaataacaacata 9572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University