View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2086_high_4 (Length: 630)
Name: NF2086_high_4
Description: NF2086
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2086_high_4 |
 |  |
|
| [»] scaffold0391 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 549; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 33975735 - 33975124
Alignment:
| Q |
21 |
tgagaccaatccaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaaatcacgcgatcaattgcagaaaagaaattaataacagattgcaacagatttttcaata |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33975735 |
tgagaccaatccaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaactcacgcaatcaattgcagaaaaggaattaataacagattgcaacagatttttcaata |
33975636 |
T |
 |
| Q |
121 |
gcatttttagatggtcaaatttagagaaaggtaagtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggattttgtttaacaca |
220 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33975635 |
gcatttttagatggtcaaatttagaggaaggtaagtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggattttgtttaacaca |
33975536 |
T |
 |
| Q |
221 |
caatctcataaactttgaaaatatacgggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttattgttattcatgtcaataatcagtctttttctt |
320 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33975535 |
caatctcataaactttgaaaatatacgggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttattgttattcatgtcaataatcagtctttttctt |
33975436 |
T |
 |
| Q |
321 |
tgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatcgtccgtgtcac |
420 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33975435 |
tgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttattgtccgtgtcac |
33975336 |
T |
 |
| Q |
421 |
ttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaattatttgacaggatttatgtagagtatcattcatgtgagatatt |
520 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33975335 |
ttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaattatttgacaggatttatgtagagtatcattcatgtgagatatt |
33975236 |
T |
 |
| Q |
521 |
taacaacttaagtagcctagaagaaaatataata------ataacagtcctagtaccttggcattatgacattagccaaattcatgatgcctaatttgtt |
614 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33975235 |
taacaatttaagtagcctagaagaaaatataataataataataatagtcgtagtaccttggtattatgacattagccaaattcatgatgcctaatttgtt |
33975136 |
T |
 |
| Q |
615 |
gatgatgtccat |
626 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
33975135 |
gatgatttccat |
33975124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 33953138 - 33952524
Alignment:
| Q |
17 |
catttgagaccaatccaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaaatcacgcgatcaattgcagaaaagaaattaataacagattgcaacagatttttc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | | ||| | |
|
|
| T |
33953138 |
catttgagaccaatcgaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaactcaagcgatcaattgcggaaaaggaatgaataacagattgcaaaaaaattt-c |
33953040 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatagcattttt-agatggtcaaatttagagaaagg-----taagtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggatttt |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33953039 |
aatagcattttttagatggtcaaagttagaaaaagggagtataagtattactaaccagctgataccgacaatatacgggcagtgagctgttgaggattcc |
33952940 |
T |
 |
| Q |
211 |
gtttaacacacaatctcataaactttgaaaatatacgggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttattgttattcatgtcaataatcag |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33952939 |
gtttaacacacaatctcataaactttgacaatatacaggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttatttttattaatgtcaataatcag |
33952840 |
T |
 |
| Q |
311 |
tctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatcg |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
33952839 |
tctttttctttgctcaaatggttccttggcgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttattg |
33952740 |
T |
 |
| Q |
411 |
tccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaattatttgacaggatttatgtagagtatcattcat |
510 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33952739 |
tccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaatcatttgacaggatttatgtagagtatcattcat |
33952640 |
T |
 |
| Q |
511 |
gtgagatatttaacaacttaagtagcctagaagaaaatataataataacagtcctagtaccttggcattatgacattagccaaattcatgatgcctaatt |
610 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33952639 |
gtgagatatttaacaatttaagtagcctagaagaaaatataataataatagtcatagtaccttggtattatgacattagccaaattcatgatgcctaatt |
33952540 |
T |
 |
| Q |
611 |
tgttgatgatgtccat |
626 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33952539 |
tgttgatgatttccat |
33952524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 33960444 - 33959824
Alignment:
| Q |
17 |
catttgagaccaatccaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaaatcacgcgatcaattgcagaaaagaaattaataacagattgcaacagatttttc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | | ||| | |
|
|
| T |
33960444 |
catttgagaccaatcgaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaaatcaagcgatcaattgcggaaaaggaatgaataacagattgcaaaaaaattt-c |
33960346 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatagcattttt-agatggtcaaatttagagaaagg-----taagtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggatttt |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33960345 |
aatagcattttttagatggtcaaagttagaaaaagggagtataagtattactaaccagctgataccgacaatatacgggcagtgagctgttgaggattcc |
33960246 |
T |
 |
| Q |
211 |
gtttaacacacaatctcataaactttgaaaatatacgggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttattgttattcatgtcaataatcag |
310 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33960245 |
gtttaacacacaatctcataaactttgacaatatacaggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttatttttattaatgtcaataatcag |
33960146 |
T |
 |
| Q |
311 |
tctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatcg |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33960145 |
tctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatcg |
33960046 |
T |
 |
| Q |
411 |
tccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaattatttgacaggatttatgtagagtatcattcat |
510 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33960045 |
tccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaattatttgacaggatttatgtagagtatcattcat |
33959946 |
T |
 |
| Q |
511 |
gtgagatatttaacaacttaagtagcctagaagaaaatataata------ataacagtcctagtaccttggcattatgacattagccaaattcatgatgc |
604 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33959945 |
gtgagatatttaacaatttaagtagcctagaagaaaatataataataataataatagtcgtagtaccttggtattatgacattagccaaattcatgatgc |
33959846 |
T |
 |
| Q |
605 |
ctaatttgttgatgatgtccat |
626 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33959845 |
ctaatttgttgatgatttccat |
33959824 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 33992658 - 33992044
Alignment:
| Q |
17 |
catttgagaccaatccaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaaatcacgcgatcaattgcagaaaagaaattaataacagattgcaacagatttttc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | || | |||||||| |||||| ||| ||||||||||| || || | || || |
|
|
| T |
33992658 |
catttgagaccaatctgacgcacatgcttcatctgcaaatttgaaactaacacaatcaattgtggaaaaggaatgaataacagattacagcaaaattatc |
33992559 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatagcattttta-gatggtcaaatttagagaaaggta-----agtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggatttt |
210 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33992558 |
aatagtatttttttgttggtgtaatatagaaaaaggtagtataagtattactaaccagttgataccgacaatatgtgagcagcaagctgttggggatttt |
33992459 |
T |
 |
| Q |
211 |
gtttaacacacaatctcataaactttgaaaatatacgggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttattgttattcatgtcaataatcag |
310 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33992458 |
gtttaatacacaatctcattacttttgacaatatacgggtcaacaagctttgctgcttctccgcgagctcacttctatttttattaatgtcaataatcag |
33992359 |
T |
 |
| Q |
311 |
tctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatcg |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
33992358 |
tctttttctttgctcaaatggttgcttggtgctttggtaaattccaagatctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttattg |
33992259 |
T |
 |
| Q |
411 |
tccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaattatttgacaggatttatgtagagtatcattcat |
510 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33992258 |
tctgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagaagaggttaattaattactt-aaagataaaaaatcatttgacaggatttatgtagagtatcattcat |
33992160 |
T |
 |
| Q |
511 |
gtgagatatttaacaacttaagtagcctagaagaaaatataataataacagtcctagtaccttggcattatgacattagccaaattcatgatgcctaatt |
610 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33992159 |
gtgagatatttaacaatttaagtagcctagaagaaaatataataataatagtcgtagtaccttggtattatgacattagccaaattcatgatgcctaatt |
33992060 |
T |
 |
| Q |
611 |
tgttgatgatgtccat |
626 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33992059 |
tgttgatgatttccat |
33992044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 33942397 - 33942254
Alignment:
| Q |
310 |
gtctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatc |
409 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| | ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
33942397 |
gtctttttctttgttcaataggttcctgggtgttttgataattcccaagctctctcagcagatcatgaaggacgatgaagtgatta-tgtagtagtaatt |
33942299 |
T |
 |
| Q |
410 |
gtccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaat |
454 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
33942298 |
ttctgtgtcacttgcatttttcctgggaattgaacagaagttaat |
33942254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33913678 - 33913544
Alignment:
| Q |
300 |
tcaataatcagtctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgt |
399 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | || |||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
33913678 |
tcaataagaagtctttttctttgttcaattggttcctggttgttttgataatttcctagctctcttagaagatcatgaaggaatatgaagtggctattgt |
33913579 |
T |
 |
| Q |
400 |
agttgttatcgtccgtgtcacttgcatttttcctg |
434 |
Q |
| |
|
||| || | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33913578 |
agtagtaactttctgtgtcacttgcatttttcctg |
33913544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33913847 - 33913712
Alignment:
| Q |
139 |
atttagagaaaggt--aagtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggattttgtttaacacacaatctcataaacttt |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | | || |||| | ||||||||| || |||||||||||||| | | ||| || |
|
|
| T |
33913847 |
atttagagaaaggtgaaagtataactaaccagttgatatagacactgtgcgagcagggacctgttgaggcttcggtttaacacacaatttaaaaaaattg |
33913748 |
T |
 |
| Q |
237 |
gaaaatatacgggtcatcaagccttgctgcttctcc |
272 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
33913747 |
gacaatatgcgggtcattgtgccctgctgcttctcc |
33913712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 626
Target Start/End: Original strand, 8277615 - 8278231
Alignment:
| Q |
18 |
atttgagaccaatccaacgcacatgtttcatctgcaaatgtgaaaatcacgcgatcaattgcagaaaagaaattaata---acagattgcaacagatttt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
8277615 |
atttgagaccaatccaacgcatatgtttcatctgcaaatgtgaaactcacgtggtcaattgcggaaaagaaatgaatagcaacagattgcaagaaatttt |
8277714 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcaatagcattttt-agatggtcaaatttagagaaaggta-----agtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggatt |
208 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
8277715 |
tcgatagcattttttagttggtcaaatttagagaaagttagtataagtattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcgaaatgttgaggatt |
8277814 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttgtttaacacacaatctcataaactttgaaaatatacgggtcatcaagccttgctgcttctccgcgagcccacttttattgttattcatgtcaataatc |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8277815 |
ttgtttaacacaaaatctcataaactttgacaatatacgggtcatcaaaccttgctgcttctccgcgagcccacttttatttttattcttgtcaataatc |
8277914 |
T |
 |
| Q |
309 |
agtctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttat |
408 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8277915 |
agtttttctctttgctcaaatggttccttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttat |
8278014 |
T |
 |
| Q |
409 |
cgtccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagaggttaattagttacttaaaagataaaaaattatttgacaggatttatgtagagtatcattc |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8278015 |
tgtccgtgtcactttcactttttcaggtaaatgagcagaggttaattagttactt-aaagataagaaattatttcacaggatttatgtagagtatcattc |
8278113 |
T |
 |
| Q |
509 |
atgtgagatatttaacaacttaagtagcctagaagaaaatataataataacagtcctagtaccttggcattatgacattagccaaattcatgatgcctaa |
608 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8278114 |
atgtgagatatttaacaattttattagccaagaagaaaatataataataatagtcctagtaccttggtattatcacattagccaaattcatgaggcctaa |
8278213 |
T |
 |
| Q |
609 |
tttgttgatgatgtccat |
626 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
8278214 |
tttattgatgatttccat |
8278231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 336 - 456
Target Start/End: Original strand, 2891495 - 2891615
Alignment:
| Q |
336 |
ttggtgctttggtaaattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatcgtccgtgtcacttgcatttttcctgg |
435 |
Q |
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| T |
2891495 |
ttggtgctttgagaaattccaagctctagtagaagattatgaaagatgatgaagtggctattatagttgtaattgtatgtgtcacttgcattttttctgg |
2891594 |
T |
 |
| Q |
436 |
taaatgagcagaggttaatta |
456 |
Q |
| |
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| T |
2891595 |
taaatgagcaaagggtaatta |
2891615 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0391 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:
Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 156 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12551 - 12246
Alignment:
| Q |
156 |
tattactaaccagttgataccgacaatatacgggcagcaagctgttgaggattttgtttaacacacaatctcataaactttgaaaatatacgggtcatca |
255 |
Q |
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| T |
12551 |
tattactaaccagttgatactgacaatatacgggcagcgagctgttgcagattttgtttaacacacaatgtcagaagttttgacaatatacaagtcatca |
12452 |
T |
 |
| Q |
256 |
agccttgctgcttctccgcgagcc------cacttttattgttattcatgtcaataatcagtctttttctttgctcaaatggttccttggtgctttggta |
349 |
Q |
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| T |
12451 |
ggctttgatgcttctcccctaaacaccgttcatgtttgttttcattcatgtcaataatcagcctttttctcttctcaattggttctttagtgcattggta |
12352 |
T |
 |
| Q |
350 |
aattccaagttctcttagaatatcatgaaggatgatgaagtgattattgtagttgttatcgtccgtgtcacttgcatttttcctggtaaatgagcagagg |
449 |
Q |
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| T |
12351 |
aattccaagatctcttagaagatcatgaaggatgatgaagtggttattgtagttgtaattgtctgcatcacttgcatttttcctagtatatgagcagagg |
12252 |
T |
 |
| Q |
450 |
ttaatt |
455 |
Q |
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|||||| |
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| T |
12251 |
ttaatt |
12246 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 567 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 12174 - 12115
Alignment:
| Q |
567 |
gtaccttggcattatgacattagccaaattcatgatgcctaatttgttgatgatgtccat |
626 |
Q |
| |
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| T |
12174 |
gtaccttgctattatgacattagccagattcatggagcctaatttgtttatgatttccat |
12115 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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