View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20933_low_3 (Length: 376)

Name: NF20933_low_3
Description: NF20933
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20933_low_3
NF20933_low_3
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (19-366)||(43988401-43988751)
chr1 (35-366)||(39445316-39445644)
chr1 (35-366)||(25445029-25445358)
chr1 (36-366)||(44023814-44024140)
chr1 (35-366)||(1054952-1055280)
chr1 (36-366)||(41398055-41398381)
chr1 (204-366)||(41390565-41390726)
chr1 (119-366)||(24787314-24787559)
chr1 (222-318)||(24202769-24202865)
chr1 (221-347)||(47703907-47704034)
chr1 (198-347)||(26644869-26645017)
chr1 (222-318)||(19072928-19073026)
chr1 (222-318)||(19120818-19120916)
chr1 (221-347)||(9476260-9476387)
chr1 (221-318)||(16124515-16124614)
chr1 (221-318)||(27104371-27104470)
chr1 (222-318)||(19358843-19358939)
chr1 (222-318)||(19361432-19361528)
chr1 (222-318)||(19380072-19380168)
chr1 (36-117)||(41386566-41386646)
chr1 (221-347)||(13598397-13598524)
chr1 (222-347)||(3281708-3281833)
chr1 (221-318)||(29651810-29651909)
chr1 (198-347)||(21536541-21536689)
chr1 (222-315)||(37069770-37069864)
chr1 (221-307)||(775671-775759)
chr1 (221-318)||(47098824-47098922)
chr1 (222-318)||(13604623-13604720)
chr1 (226-285)||(9459419-9459479)
chr1 (226-285)||(9463246-9463306)
chr1 (226-285)||(16226386-16226446)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (19-366)||(35745191-35745537)
chr8 (19-366)||(10684203-10684550)
chr8 (36-366)||(39784763-39785091)
chr8 (36-366)||(25328218-25328545)
chr8 (41-366)||(6311121-6311443)
chr8 (41-366)||(7289865-7290188)
chr8 (204-356)||(18853128-18853281)
chr8 (204-366)||(18870511-18870675)
chr8 (204-356)||(33037768-33037919)
chr8 (204-366)||(36979361-36979524)
chr8 (210-366)||(30655636-30655793)
chr8 (204-356)||(10689104-10689256)
chr8 (204-356)||(4760036-4760188)
chr8 (222-304)||(26287902-26287985)
chr8 (222-304)||(26301159-26301242)
chr8 (222-304)||(26313153-26313236)
chr8 (221-347)||(26403201-26403328)
chr8 (222-318)||(1261954-1262050)
chr8 (221-347)||(23799548-23799675)
chr8 (198-347)||(4456005-4456153)
chr8 (225-347)||(7412344-7412466)
chr8 (221-318)||(5702482-5702581)
chr8 (225-318)||(6127224-6127319)
chr8 (222-318)||(19175754-19175851)
chr8 (222-318)||(31071229-31071326)
chr8 (221-290)||(4696624-4696694)
chr8 (224-285)||(9765852-9765914)
chr8 (221-318)||(19752394-19752492)
chr8 (65-131)||(18853353-18853418)
chr8 (226-285)||(43079877-43079937)
chr8 (226-285)||(43082248-43082308)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (19-366)||(6005217-6005563)
chr6 (19-366)||(33330384-33330732)
chr6 (19-366)||(16838544-16838890)
chr6 (19-366)||(33335881-33336229)
chr6 (19-267)||(5343280-5343527)
chr6 (36-366)||(28155510-28155837)
chr6 (35-366)||(6438318-6438645)
chr6 (36-366)||(14737516-14737843)
chr6 (36-366)||(14742376-14742702)
chr6 (36-366)||(28184320-28184650)
chr6 (36-366)||(11856790-11857120)
chr6 (39-366)||(22010636-22010960)
chr6 (223-318)||(5674770-5674865)
chr6 (222-347)||(5757450-5757575)
chr6 (221-347)||(5572212-5572339)
chr6 (221-318)||(10077164-10077263)
chr6 (221-318)||(31086472-31086571)
chr6 (221-318)||(31979512-31979611)
chr6 (222-318)||(4629954-4630052)
chr6 (222-318)||(21356036-21356133)
chr6 (221-318)||(22963699-22963797)
chr6 (221-318)||(23824596-23824694)
chr6 (234-318)||(21801343-21801429)
chr6 (65-169)||(30125940-30126044)
chr6 (243-318)||(18232867-18232943)
chr6 (253-304)||(22709050-22709102)
chr6 (221-285)||(31936586-31936651)
chr6 (226-285)||(12195515-12195575)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (19-366)||(2785175-2785521)
chr5 (22-366)||(31396930-31397275)
chr5 (19-366)||(33791116-33791462)
chr5 (22-366)||(31401787-31402132)
chr5 (19-365)||(33767979-33768324)
chr5 (19-366)||(37561384-37561732)
chr5 (19-366)||(37556562-37556910)
chr5 (19-366)||(28807514-28807860)
chr5 (41-366)||(1457101-1457423)
chr5 (36-366)||(15044507-15044831)
chr5 (61-366)||(43592120-43592425)
chr5 (41-366)||(27444793-27445116)
chr5 (41-366)||(27449637-27449960)
chr5 (41-366)||(43598547-43598870)
chr5 (41-366)||(43604039-43604362)
chr5 (41-366)||(43609531-43609854)
chr5 (61-366)||(30631249-30631553)
chr5 (203-366)||(31180197-31180360)
chr5 (222-318)||(38192174-38192270)
chr5 (222-318)||(38219399-38219495)
chr5 (222-347)||(10281751-10281877)
chr5 (204-366)||(24135831-24135994)
chr5 (222-318)||(35387663-35387759)
chr5 (222-347)||(9353304-9353429)
chr5 (223-347)||(11916943-11917068)
chr5 (222-318)||(36932350-36932447)
chr5 (222-318)||(15464532-15464629)
chr5 (198-347)||(14520207-14520355)
chr5 (221-347)||(3880298-3880425)
chr5 (221-315)||(17003962-17004058)
chr5 (222-318)||(19588746-19588844)
chr5 (198-318)||(12084175-12084295)
chr5 (221-318)||(28832258-28832356)
chr5 (226-285)||(4410241-4410301)
chr5 (221-318)||(42127410-42127508)
chr5 (226-285)||(15552464-15552524)
chr5 (226-285)||(31179371-31179431)
chr5 (226-285)||(31542953-31543013)
chr5 (226-285)||(31545299-31545359)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (19-366)||(2677026-2677374)
chr3 (19-366)||(8512015-8512363)
chr3 (19-366)||(8516895-8517243)
chr3 (19-366)||(2672870-2673218)
chr3 (19-366)||(32475284-32475629)
chr3 (19-366)||(32480141-32480487)
chr3 (69-371)||(24967957-24968258)
chr3 (19-269)||(10207733-10207982)
chr3 (36-366)||(18656251-18656579)
chr3 (39-366)||(22173134-22173458)
chr3 (65-366)||(7167092-7167391)
chr3 (65-318)||(2671586-2671836)
chr3 (61-366)||(28503814-28504108)
chr3 (204-356)||(8739024-8739176)
chr3 (204-356)||(9091262-9091414)
chr3 (204-356)||(40372757-40372908)
chr3 (203-318)||(8477344-8477459)
chr3 (221-347)||(18552844-18552971)
chr3 (203-318)||(26928591-26928705)
chr3 (223-347)||(36029094-36029219)
chr3 (198-347)||(8370448-8370596)
chr3 (221-348)||(40592742-40592870)
chr3 (198-318)||(30709779-30709900)
chr3 (225-318)||(1736294-1736389)
chr3 (222-347)||(16264350-16264475)
chr3 (222-318)||(27974942-27975039)
chr3 (222-318)||(1305949-1306045)
chr3 (221-347)||(3715963-3716090)
chr3 (221-347)||(48438213-48438340)
chr3 (221-318)||(21711222-21711320)
chr3 (222-304)||(27986449-27986533)
chr3 (221-318)||(26298987-26299086)
chr3 (222-318)||(25795781-25795879)
chr3 (265-366)||(28501647-28501750)
chr3 (222-318)||(32143321-32143418)
chr3 (222-304)||(33386669-33386753)
chr3 (221-318)||(6794703-6794801)
chr3 (221-318)||(47923895-47923994)
chr3 (222-318)||(27452958-27453055)
chr3 (198-304)||(39039995-39040102)
chr3 (221-347)||(40844651-40844777)
chr3 (221-285)||(1417513-1417578)
chr3 (221-318)||(24695153-24695252)
chr3 (221-318)||(37466290-37466388)
chr3 (243-318)||(3323680-3323755)
chr3 (252-288)||(4386947-4386983)
chr3 (226-285)||(38210569-38210629)
chr3 (222-269)||(39153357-39153405)
chr3 (226-285)||(50494198-50494258)
chr3 (226-289)||(53894055-53894119)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (19-366)||(19104-19450)
scaffold0197 (19-366)||(14248-14595)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (19-366)||(148895-149241)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (19-366)||(2190-2536)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (19-366)||(24261262-24261609)
chr7 (19-366)||(24266141-24266488)
chr7 (19-366)||(16879872-16880218)
chr7 (19-366)||(16884728-16885074)
chr7 (19-366)||(19992112-19992458)
chr7 (26-366)||(21812178-21812517)
chr7 (36-366)||(24024266-24024594)
chr7 (36-366)||(31109523-31109849)
chr7 (36-366)||(12406150-12406477)
chr7 (36-366)||(12396730-12397057)
chr7 (65-318)||(20357548-20357797)
chr7 (36-307)||(4866548-4866816)
chr7 (204-356)||(2057949-2058101)
chr7 (203-318)||(18408746-18408860)
chr7 (222-318)||(1533444-1533540)
chr7 (221-347)||(29159802-29159929)
chr7 (222-318)||(21639809-21639905)
chr7 (223-347)||(21983285-21983411)
chr7 (203-318)||(18413623-18413736)
chr7 (222-318)||(21646007-21646103)
chr7 (221-347)||(46516281-46516408)
chr7 (221-318)||(49091660-49091759)
chr7 (221-347)||(2647667-2647794)
chr7 (221-318)||(33332449-33332548)
chr7 (221-347)||(55947-56073)
chr7 (222-318)||(44848684-44848781)
chr7 (221-347)||(2580389-2580515)
chr7 (221-318)||(9190008-9190106)
chr7 (221-285)||(20284088-20284153)
chr7 (221-347)||(4796638-4796765)
chr7 (221-318)||(35960815-35960914)
chr7 (65-131)||(2057806-2057871)
chr7 (222-347)||(2479337-2479461)
chr7 (223-318)||(21988909-21989005)
chr7 (222-290)||(47263678-47263745)
chr7 (221-285)||(9185198-9185263)
chr7 (225-285)||(28617258-28617319)
chr7 (222-269)||(8153466-8153514)
chr7 (226-285)||(31155911-31155971)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (19-366)||(19344220-19344567)
chr2 (19-366)||(19349078-19349425)
chr2 (36-356)||(32246602-32246922)
chr2 (36-366)||(39811928-39812255)
chr2 (39-366)||(44312563-44312887)
chr2 (204-366)||(11098877-11099040)
chr2 (111-356)||(14291380-14291624)
chr2 (204-356)||(9296362-9296514)
chr2 (222-318)||(3491751-3491847)
chr2 (221-347)||(8040059-8040188)
chr2 (223-347)||(10707223-10707348)
chr2 (222-318)||(25398496-25398592)
chr2 (225-318)||(13569331-13569426)
chr2 (221-318)||(21629943-21630041)
chr2 (222-318)||(25403634-25403730)
chr2 (221-347)||(10445415-10445542)
chr2 (221-347)||(17865202-17865329)
chr2 (221-347)||(34682305-34682432)
chr2 (222-347)||(28259149-28259274)
chr2 (223-318)||(34388859-34388956)
chr2 (225-347)||(8390121-8390244)
chr2 (221-347)||(14698979-14699105)
chr2 (221-318)||(20522219-20522318)
chr2 (222-304)||(40738844-40738926)
chr2 (222-347)||(23078442-23078567)
chr2 (198-353)||(36757728-36757882)
chr2 (221-347)||(39482930-39483057)
chr2 (221-318)||(16940208-16940307)
chr2 (221-318)||(17010873-17010972)
chr2 (222-315)||(31056044-31056139)
chr2 (221-318)||(33528620-33528719)
chr2 (221-347)||(33118135-33118262)
chr2 (252-318)||(25407653-25407719)
chr2 (226-285)||(35215586-35215646)
chr2 (226-285)||(35217963-35218023)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (19-297)||(181973-182250)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (35-366)||(18855543-18855871)
chr4 (36-366)||(3813841-3814168)
chr4 (36-366)||(5732481-5732809)
chr4 (36-366)||(45357236-45357563)
chr4 (36-366)||(9224346-9224673)
chr4 (36-366)||(9229133-9229460)
chr4 (36-366)||(45347756-45348084)
chr4 (41-366)||(51520280-51520603)
chr4 (40-353)||(56146664-56146974)
chr4 (204-366)||(24741924-24742087)
chr4 (204-318)||(29760625-29760738)
chr4 (221-347)||(10047378-10047505)
chr4 (221-318)||(39245993-39246092)
chr4 (221-347)||(16623264-16623391)
chr4 (221-347)||(38152410-38152537)
chr4 (222-347)||(3796490-3796616)
chr4 (222-304)||(28468542-28468625)
chr4 (221-347)||(16630651-16630778)
chr4 (222-347)||(5396643-5396768)
chr4 (221-318)||(36315229-36315327)
chr4 (221-318)||(36329438-36329536)
chr4 (223-347)||(5147678-5147803)
chr4 (223-347)||(5143260-5143385)
chr4 (221-312)||(24333808-24333901)
chr4 (222-318)||(31985634-31985730)
chr4 (221-304)||(5269204-5269289)
chr4 (223-347)||(3777550-3777674)
chr4 (227-315)||(6743417-6743507)
chr4 (226-285)||(16931789-16931849)
chr4 (226-285)||(16934143-16934203)
chr4 (226-285)||(22780373-22780433)
chr4 (226-285)||(44599838-44599898)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (35-366)||(179-507)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (36-366)||(9583-9907)
scaffold0355 (36-181)||(13-148)
scaffold0355 (309-366)||(3788-3845)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (36-366)||(35001-35328)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (222-318)||(17952-18048)
scaffold0188 (222-318)||(24045-24141)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (222-318)||(8419-8516)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (36-117)||(34136-34216)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (221-347)||(10728-10855)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (221-347)||(5682-5809)
scaffold0006 (221-347)||(2491-2618)
scaffold0006 (222-318)||(133280-133377)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (223-318)||(85684-85780)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (222-347)||(43933-44058)
scaffold0087 (197-347)||(36804-36953)
[»] scaffold0777 (1 HSPs)
scaffold0777 (19-59)||(6301-6341)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (35-99)||(13165-13228)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (203-254)||(300-350)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (222-290)||(45253-45322)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (225-347)||(17266-17389)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (226-285)||(269-329)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43988751 - 43988401
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43988751 atccggctcaactaatgaaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagct 43988652  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988651 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacca 43988552  T
Q  219 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988551 agcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 43988452  T
Q  319 tctagctattcaagcttt-cacaag--aacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  43988451 tctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctagatctaccctttg 43988401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 366
Target Start/End: Original strand, 39445316 - 39445644
Alignment:
Q  35 gaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  39445316 gaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cag 39445413  T
Q  135 cc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    || ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39445414 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 39445510  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  39445511 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaa 39445608  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39445609 gctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 39445644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25445358 - 25445029
Alignment:
Q  35 gaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  25445358 gaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cag 25445261  T
Q  135 cc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    || ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25445260 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 25445164  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  25445163 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaa 25445065  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25445064 gctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttg 25445029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44024140 - 44023814
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  44024140 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagc 44024043  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 232  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||     | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44024042 cctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatg---gtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttga 44023947  T
Q  233 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaag 332  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  44023946 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttgtcaag 44023849  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44023848 ctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 44023814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1055280 - 1054952
Alignment:
Q  35 gaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||| | |||||||| ||||||||||| |||    
T  1055280 gaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaa-cag 1055183  T
Q  135 cc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    || ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1055182 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 1055086  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  1055085 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaa 1054988  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1054987 gctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 1054952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 41398055 - 41398381
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaa---aac 132  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||| |||||||| |||||||||||   |||    
T  41398055 aaccttcacaccaatga-aataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaac 41398153  T
Q  133 agcc-taagcctaatgtatagcacaa--ccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaa--aagaacaaaacaccaagcaagatt 227  Q
    |||| |||  ||| ||||||||| ||  |||||| ||||| || |||      |  |||||  || || |||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  41398154 agccctaa--ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaa------agcataaa--caagataagaaggaagaacaaaacaccgag-aagatt 41398242  T
Q  228 gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctat 327  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  41398243 gttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-ct 41398340  T
Q  328 tcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41398341 tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41398381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Original strand, 41390565 - 41390726
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttaca 303  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41390565 aagaacaaaacatcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 41390663  T
Q  304 aaagagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41390664 aaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41390726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24787559 - 24787314
Alignment:
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacc 217  Q
    |||||||| |||||||||  || || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||   || |||||| || ||||||||||||    
T  24787559 aacaacaa-aaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcaaacaagataag--caagaaaaggaa-gaacaaaacacc 24787464  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  24787463 aag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac-aaagggttacaaga 24787366  T
Q  318 atc--tagctattcaagc-tttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    | |  ||||  ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24787365 aacaatagc-cttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttg 24787314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24202865 - 24202769
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24202865 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 24202769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703907
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 47703935  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  47703934 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 47703907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26645017 - 26644869
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  26645017 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaa 26644920  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26644919 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 26644869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073026
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19073026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120916
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19120916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476387
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaa 9476359  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  9476360 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 9476387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124515
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16124515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104371
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 27104371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358843
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 19358843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361432
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 19361432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19380072
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 19380072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 117
Target Start/End: Original strand, 41386566 - 41386646
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  41386566 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598524
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaa 13598496  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  13598497 attagct-tataagcttacacaagaacaa 13598524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281833
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 3281806  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  3281807 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 3281833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651909
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 29651909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21536689 - 21536541
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatg-tggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat-gtgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||    
T  21536689 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaa 21536592  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  21536591 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 21536541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 315
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 315  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 307
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775759
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaag 307  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098824
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 47098824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604623
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttac-aaagagttacaagaa 13604623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 35745191 - 35745537
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745191 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 35745290  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||     
T  35745291 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccg 35745388  T
Q  219 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745389 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 35745488  T
Q  319 tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35745489 tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 35745537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10684550 - 10684203
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684550 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagct 10684451  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  10684450 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaaacac 10684354  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684353 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 10684254  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  10684253 aatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 10684203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39785091 - 39784763
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  39785091 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagc 39784993  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||   |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39784992 cctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 39784897  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  39784896 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaa 39784799  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39784798 gctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 39784763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25328545 - 25328218
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  25328545 aaccttcacaacaatga-aataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 25328447  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaag-catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    | |||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||  |||| | || | || |   ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25328446 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgac 25328351  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagc 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  25328350 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagc 25328253  T
Q  334 ttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25328252 tttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 25328218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311443
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  6311121 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 6311218  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagtt 239  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6311219 actagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 6311315  T
Q  240 cagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt- 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||     
T  6311316 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaaactctagc-cttcaagcttta 6311413  T
Q  337 cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6311414 cacaag-acaaaccctagattctaccctttg 6311443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7289865
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||  ||    
T  7290188 tcacaccaatga-aataaa-cattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctag 7290091  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagc---atacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |   | |||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7290090 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 7289995  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  7289994 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 7289897  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7289896 acacatgaacaaaccctatattctaccctttg 7289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18853281 - 18853128
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18853281 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttac 18853183  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
    ||||| |||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18853182 aaaagggttacaagaaacaatagc-attcaagcttacacaagaacaaaccctagat 18853128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18870675 - 18870511
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18870675 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttac 18870577  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||||| |||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18870576 aaaagggttacaagaaacaatagc-attcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 18870511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33037919 - 33037768
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttaca 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  33037919 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac- 33037822  T
Q  304 aaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
    |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33037821 aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagat 33037768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Original strand, 36979361 - 36979524
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36979361 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 36979459  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36979460 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 36979524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 366
Target Start/End: Original strand, 30655636 - 30655793
Alignment:
Q  210 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaaga 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||     
T  30655636 aaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttac-aaagg 30655733  T
Q  309 gttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30655734 gttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 30655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10689256 - 10689104
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10689256 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 10689158  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
     | || |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10689157 -agagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaagccctagat 10689104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4760188 - 4760036
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4760188 aagaacaaaacatcaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 4760090  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4760089 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaagccctagat 4760036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287985
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301242
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313236
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403201
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaa 26403229  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26403228 attagct-tacaagcttgcacaagaacaa 26403201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261954
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 1261954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799548
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23799576  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  23799575 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 23799548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 4456005 - 4456153
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  4456005 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 4456102  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||   ||||||| |||||||||||    
T  4456103 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-ggcaagcttacacaagaacaa 4456153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412466
Alignment:
Q  225 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 322  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaata 7412442  T
Q  323 gctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     || | ||||||| |||||||||||    
T  7412443 act-tgcaagcttacacaagaacaa 7412466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702482
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| || | |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5702482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 318
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127319
Alignment:
Q  225 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 6127319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175754
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 19175754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071229
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 31071229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696624
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg 290  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 4696624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  224 gattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752394
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 19752394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18853418 - 18853353
Alignment:
Q  65 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaa 131  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  18853418 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaa 18853353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 6005217 - 6005563
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005217 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 6005316  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||     
T  6005317 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccg 6005414  T
Q  219 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005415 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 6005514  T
Q  319 tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6005515 tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 6005563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33330732 - 33330384
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330732 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 33330633  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33330632 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaac-aaacac 33330535  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330534 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 33330435  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  33330434 aatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 33330384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 16838544 - 16838890
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16838544 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagct 16838643  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  16838644 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaac-aaacacc 16838740  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838741 gagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 16838840  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16838841 atctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 16838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33336229 - 33335881
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33336229 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaact 33336130  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatag-cacaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33336129 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaac-aaacac 33336032  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336031 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 33335932  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  33335931 aatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 33335881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 267
Target Start/End: Original strand, 5343280 - 5343527
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5343280 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 5343379  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||| ||||||    
T  5343380 aacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacgaac-aaacac 5343476  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaga 267  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5343477 cgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28155837 - 28155510
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28155837 aaccttcacaccaatgc-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagc 28155740  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    ||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28155739 ctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgac 28155642  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  28155641 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatttagct-ttcaagc 28155544  T
Q  334 ttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28155543 tttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 28155510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 366
Target Start/End: Original strand, 6438318 - 6438645
Alignment:
Q  35 gaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  | |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  6438318 gaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cag 6438414  T
Q  135 cc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    || ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6438415 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 6438511  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  6438512 tcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttgtcaa 6438609  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6438610 gctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 6438645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14737843 - 14737516
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14737843 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 14737746  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaa-gagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 232  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| || ||| || ||| ||| | ||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  14737745 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttga 14737650  T
Q  233 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaag 332  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  14737649 tccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 14737552  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  14737551 ctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttg 14737516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14742702 - 14742376
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  14742702 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagc 14742605  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  14742604 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagcaaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 14742509  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagc 333  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  14742508 ccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagc 14742411  T
Q  334 ttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  14742410 tttacatatgaacaaaccctagattctaccctttg 14742376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 28184320 - 28184650
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaa--tggcctccaagctaacaacaacaaaaca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28184320 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 28184418  T
Q  134 gcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtt 230  Q
    |||  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  ||| |||||  ||||||||  |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  28184419 gccctagactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataag-cggtaaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgtt 28184514  T
Q  231 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattca 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||    
T  28184515 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaacactctagc-cttca 28184612  T
Q  331 agcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28184613 agctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 28184650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 11856790 - 11857120
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11856790 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 11856887  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaa-aagaacaaaacaccaagcaagattgttga 232  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||| ||  | || ||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  11856888 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagacaag-cgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaag-aagattgttga 11856985  T
Q  233 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaa 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  11856986 cccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaa 11857083  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11857084 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 11857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010636
Alignment:
Q  39 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagccta 138  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||      
T  22010960 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 22010863  T
Q  139 agcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 236  Q
    || | | ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||  | || ||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22010862 agacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag-cgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 22010767  T
Q  237 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22010766 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 22010669  T
Q  336 t-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22010668 tacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 22010636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5674865 - 5674770
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 5674770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757450
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 5757477  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  5757476 atagct-tgcaagcttatacaagaacaa 5757450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572212
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5572240  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  5572239 attagct-tataagcttacacaagaacaa 5572212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077164
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaa 10077164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086472
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaa 31086472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979611
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaa 31979611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630052
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaa 4630052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356133
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-taagagttacaagaa 21356133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963797
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 22963797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824596
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23824596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801343
Alignment:
Q  234 ccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21801343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30126044 - 30125940
Alignment:
Q  65 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaac-aaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 163  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  30126044 gatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgag-ccaaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 30125946  T
Q  164 taagag 169  Q
     |||||    
T  30125945 aaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232943
Alignment:
Q  243 ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 18232943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 304
Target Start/End: Original strand, 22709050 - 22709102
Alignment:
Q  253 ctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22709050 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936651
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 2785175 - 2785521
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785175 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 2785274  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||     
T  2785275 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccg 2785372  T
Q  219 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785373 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2785472  T
Q  319 tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2785473 tctagcttttcaagctttactcatgaacaaaccctagacctaccctttg 2785521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 22 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31397275 - 31396930
Alignment:
Q  22 cggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397275 cggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaac 31397176  T
Q  122 aacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagc 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||  ||||||| |||    
T  31397175 aacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacaaacaaacaccgagc 31397078  T
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397077 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatct 31396978  T
Q  322 agctattcaagcttt-cacaag--aacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||  ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  31396977 agcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctagatctaccctttg 31396930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 33791116 - 33791462
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33791116 atccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 33791215  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||     
T  33791216 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccg 33791313  T
Q  219 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33791314 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33791413  T
Q  319 tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33791414 tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 33791462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 22 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31402132 - 31401787
Alignment:
Q  22 cggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaac 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31402132 cggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaac 31402033  T
Q  122 aacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacaccaag 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||| ||    
T  31402032 aacaacaaaacagcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaac-aaacaccgag 31401936  T
Q  221 caagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401935 caagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 31401836  T
Q  321 tagctattcaagcttt-cacaag--aacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||  ||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  31401835 tagcttatcaagctttacacaagacaaaaaactctagatctaccctttg 31401787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 365
Target Start/End: Original strand, 33767979 - 33768324
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33767979 atccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagct 33768078  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||| |||||||     
T  33768079 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcatacaggat-aaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccg 33768176  T
Q  219 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33768177 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33768276  T
Q  319 tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctacccttt 365  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33768277 tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctacccttt 33768324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37561732 - 37561384
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37561732 atccggttcaactaatcaaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagc 37561633  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| | |||||||||||||    
T  37561632 taacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaagaacaaaaca 37561535  T
Q  216 ccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37561534 ccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaa 37561436  T
Q  316 gaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    | ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37561435 gtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 37561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37556910 - 37556562
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaac-cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37556910 atccggttcaactaatcaaatcttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagc 37556811  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| | |||||||||||||    
T  37556810 taacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaagaacaaaaca 37556713  T
Q  216 ccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaa 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37556712 ccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaa 37556614  T
Q  316 gaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    | ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37556613 gtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 37556562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28807860 - 28807514
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  28807860 atccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagc 28807762  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaa--ccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaa 212  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||    
T  28807761 aaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaa 28807666  T
Q  213 acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagtta 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28807665 acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gtta 28807568  T
Q  313 caagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28807567 caagaatctagct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 28807514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1457101
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  1457423 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 1457326  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||| |  | |||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1457325 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataaga--aagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 1457231  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  1457230 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 1457133  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1457132 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 1457101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 15044507 - 15044831
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  15044507 aaccttcacaccaatga-aata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagc 15044602  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacc 234  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| |  | | || || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15044603 cctagactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacc 15044699  T
Q  235 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15044700 cagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttcaagct 15044797  T
Q  335 tt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15044798 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 15044831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Original strand, 43592120 - 43592425
Alignment:
Q  61 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||    
T  43592120 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaacca 43592219  T
Q  161 cactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 257  Q
    ||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43592220 cacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 43592315  T
Q  258 ctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43592316 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctaga 43592413  T
Q  356 -tctaccctttg 366  Q
     |||||||||||    
T  43592414 ttctaccctttg 43592425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27445116
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27444793 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27444890  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27444891 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 27444986  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  27444987 ttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 27445084  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27445085 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 27445116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27449960
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27449637 tcacaccaatga-aataaa-caatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27449734  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27449735 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 27449830  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  27449831 ttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 27449928  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27449929 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 27449960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43598870
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43598547 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43598644  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  43598645 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43598740  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  43598741 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 43598838  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43598839 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43598870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604362
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43604039 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43604136  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  43604137 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43604232  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  43604233 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 43604330  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43604331 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609854
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43609531 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43609628  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  43609629 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43609724  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  43609725 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 43609822  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43609823 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43609854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Original strand, 30631249 - 30631553
Alignment:
Q  61 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| || ||    
T  30631249 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatca 30631347  T
Q  161 cactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 259  Q
    ||   | || |||||| ||||| |  | | ||  | |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30631348 catatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatct 30631444  T
Q  260 gggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga- 355  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  30631445 gggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac-aaagggttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccatagat 30631542  T
Q  356 tctaccctttg 366  Q
    |||||||||||    
T  30631543 tctaccctttg 30631553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 366
Target Start/End: Original strand, 31180197 - 31180360
Alignment:
Q  203 aaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttac 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31180197 aaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 31180295  T
Q  303 aaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31180296 -aaagggttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacaag-acaaaccctagattctaccctttg 31180360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 38192174 - 38192270
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  38192174 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 38192270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 38219399 - 38219495
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  38219399 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 38219495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281877
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10281850  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10281851 ttagct-tacaagcttacacaagaacaa 10281877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Original strand, 24135831 - 24135994
Alignment:
Q  204 aagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtta 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || | |||| ||||||    
T  24135831 aagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgtta 24135929  T
Q  302 caaaagagttacaag-aatctagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    | |||| |||||||| ||  ||||| | ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  24135930 c-aaagggttacaagaaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaagtcctagattctaccctttg 24135994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387759
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 35387759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353304
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 9353331  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      |||| | ||||||| |||||||||||    
T  9353330 aaagct-tgcaagcttacacaagaacaa 9353304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916943
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||      
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaa 11916969  T
Q  321 tagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||| | | ||||||| |||||||||||    
T  11916968 tag-tttgcaagcttacacaagaacaa 11916943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932350
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 36932350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464629
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 15464629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Original strand, 14520207 - 14520355
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14520207 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaa 14520304  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  14520305 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 14520355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880425
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 3880397  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||| | | ||||||| |||||||||||    
T  3880398 attag-tttacaagcttacacaagaacaa 3880425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003962
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 315  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaagagttacaa 17003962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588844
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19588844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12084295 - 12084175
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||| | ||| | || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  12084295 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aatattgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaa 12084198  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  12084197 agtgttac-aaagagttacaagaa 12084175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832356
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 28832356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127410
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 42127410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2677374 - 2677026
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2677374 atccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagc 2677275  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2677274 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaac-aaacac 2677177  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677176 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 2677077  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  2677076 aatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 2677026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 8512015 - 8512363
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8512015 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagct 8512114  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8512115 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgat-aaacgaaaacgaacaaaacacc 8512213  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512214 gagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 8512313  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8512314 atctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 8512363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 8516895 - 8517243
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8516895 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagct 8516994  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8516995 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgat-aaacgaaaacgaacaaaacacc 8517093  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517094 gagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 8517193  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8517194 atctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 8517243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2673218 - 2672870
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2673218 atccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagc 2673119  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacac 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2673118 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaac-aaacac 2673021  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673020 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 2672921  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  2672920 aatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 2672870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 32475284 - 32475629
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32475284 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaact 32475383  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  32475384 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaaacac 32475480  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32475481 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttac-aaagagttacaag 32475578  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  32475579 aatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 32475629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 32480141 - 32480487
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatc-aatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32480141 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaac 32480240  T
Q  118 taa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaaca 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||    
T  32480241 taatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaaaca 32480337  T
Q  216 ccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaa 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32480338 ccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttac-aaagagttacaa 32480435  T
Q  316 gaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  32480436 gaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 32480487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 69 - 371
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968258
Alignment:
Q  69 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaaga 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaaga 24968056  T
Q  169 gctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaga 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24968057 gctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggaga 24968153  T
Q  268 gaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24968154 gagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgagatctaccctttg 24968253  T
Q  367 ctact 371  Q
     ||||    
T  24968254 gtact 24968258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 10207733 - 10207982
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207733 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 10207832  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10207833 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaac-aaacacc 10207930  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207931 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagaga 10207982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 18656251 - 18656579
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18656251 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 18656347  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaa----caccaagcaagattgt 229  Q
    | ||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||     | |||| |||||||||||    |||  | |||||||||    
T  18656348 cctaagc-tagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaacg---gtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgt 18656443  T
Q  230 tgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattc 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  18656444 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-attc 18656541  T
Q  330 aagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18656542 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 18656579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22173458 - 22173134
Alignment:
Q  39 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagccta 138  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||      
T  22173458 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccct 22173361  T
Q  139 agcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatac-aagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 236  Q
    || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| |  |||||||   |   ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22173360 agactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaataagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 22173265  T
Q  237 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22173264 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 22173167  T
Q  336 t-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22173166 tacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 22173134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 366
Target Start/End: Original strand, 7167092 - 7167391
Alignment:
Q  65 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacact 164  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||||     
T  7167092 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacaca 7167189  T
Q  165 aagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggg 263  Q
    ||||| |||||| ||||| |  | | || || |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7167190 aagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 7167286  T
Q  264 gagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tcta 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7167287 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagattcta 7167384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2671836 - 2671586
Alignment:
Q  65 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  || ||| |||| || | ||||||||    
T  2671836 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacac 2671738  T
Q  164 taagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgg 261  Q
     ||||| |||||| ||| | ||||||||   || |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2671737 aaagagataacaaagcaaaacaagataag--caagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 2671643  T
Q  262 gggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2671642 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 2671586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28504108 - 28503814
Alignment:
Q  61 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 160  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||| |||||    
T  28504108 caatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaacca 28504011  T
Q  161 cactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctg 260  Q
    ||| ||||| ||||||      |  |||||  || |||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28504010 cacaaagagataacaa------agcataaa--caagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 28503922  T
Q  261 ggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-t 356  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  28503921 gggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacaagaataaaccctagatt 28503824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8739176 - 8739024
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8739176 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 8739078  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8739077 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaatccctagat 8739024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9091414 - 9091262
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9091414 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 9091316  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9091315 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaatccctagat 9091262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372757
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40372908 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 40372810  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc-tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
    ||| | ||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40372809 aaagg-gttacaagaaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaagccctagat 40372757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 318
Target Start/End: Original strand, 8477344 - 8477459
Alignment:
Q  203 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8477344 aaagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtt 8477442  T
Q  301 acaaaagagttacaagaa 318  Q
    || |||| ||||||||||    
T  8477443 ac-aaagggttacaagaa 8477459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552844
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 18552872  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  18552871 attagct-tataagcttacacaagaacaa 18552844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26928705 - 26928591
Alignment:
Q  203 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 300  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  26928705 aaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgtt 26928608  T
Q  301 acaaaagagttacaagaa 318  Q
    || |||| ||||||||||    
T  26928607 ac-aaagggttacaagaa 26928591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029219
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 36029193  T
Q  321 tagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  36029194 tagct-tacaaacttacacaagaacaa 36029219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8370596 - 8370448
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  8370596 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 8370499  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  8370498 agtgttac-aaagagttacaagaaattagct-taaaagcttacacaagaacaa 8370448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592742
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 40592771  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaaa 348  Q
      ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  40592770 attagct-tacaagcttacacaagaacaaa 40592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30709900 - 30709779
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||    
T  30709900 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaa 30709803  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  30709802 attgttacaaaagagttacaagaa 30709779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736294
Alignment:
Q  225 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 1736294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264475
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 16264448  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  16264449 atagct-tgcaagcttccacaagaacaa 16264475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974942
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 27974942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306045
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 1306045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715963
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 3715991  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  3715990 attagct-tacaaacttacacaagaacaa 3715963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438340
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||| |||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 48438312  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      |||| ||  |||||| |||||||||||    
T  48438313 attagc-atataagcttacacaagaacaa 48438340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711320
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 21711320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299086
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || | |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 26299086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795879
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaa 25795879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501647
Alignment:
Q  265 agagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctac 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacaagaataaaccctagattctac 28501653  T
Q  361 cctttg 366  Q
    ||||||    
T  28501652 cctttg 28501647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143418
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 32143418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794703
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 6794703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923895
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaagaa 47923895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453055
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 27453055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39040102 - 39039995
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  39040102 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaa 39040005  T
Q  295 tgtgttacaa 304  Q
     |||||||||    
T  39040004 agtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 40844651 - 40844777
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40844651 caagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 40844749  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  40844750 attagct-tataagcttacacaagaacaa 40844777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417513
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatcca 1417513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24695252 - 24695153
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||  |||||||| || | ||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24695252 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 24695153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466388
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 37466388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323680
Alignment:
Q  243 ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 3323680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4386983 - 4386947
Alignment:
Q  252 cctaatctgggggagagaacagctctccaatccaata 288  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4386983 cctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 269
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat 289  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19450 - 19104
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19450 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 19351  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  19350 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaac-aaacacc 19254  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19253 gagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaaga 19154  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19153 atctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagatctaccctttg 19104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14595 - 14248
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14595 atccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagct 14496  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  14495 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaaacac 14399  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 14299  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  14298 aatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 149241 - 148895
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149241 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 149142  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||| |||||||    
T  149141 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacgaac-aaacacc 149045  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149044 gagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 148945  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  148944 atctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttg 148895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2536 - 2190
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2536 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagct 2437  T
Q  119 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacacc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||| |||||||    
T  2436 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacgaac-aaacacc 2340  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2339 gagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 2240  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  2239 atctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttg 2190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24261609 - 24261262
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261609 atccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagct 24261510  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  24261509 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaaacac 24261413  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261412 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 24261313  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24261312 aatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 24261262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24266488 - 24266141
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266488 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagct 24266389  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||    
T  24266388 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaggaaaacgaacaaaacac 24266292  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266291 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 24266192  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24266191 aatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 24266141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 16879872 - 16880218
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16879872 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagct 16879971  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  16879972 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaaacac 16880068  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16880069 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttac-aaagagttacaag 16880167  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16880168 aatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 16880218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 16884728 - 16885074
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884728 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagct 16884827  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  16884828 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaaacac 16884924  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16884925 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttac-aaagagttacaag 16885023  T
Q  317 aatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16885024 aatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 16885074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 19992112 - 19992458
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatg-aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  19992112 atccggttcaactaatggaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagc 19992210  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaac 214  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||||    
T  19992211 ttacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaac 19992306  T
Q  215 accaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttaca 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19992307 accgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttaca 19992405  T
Q  315 agaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19992406 agactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 19992458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21812517 - 21812178
Alignment:
Q  26 tcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaac 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21812517 tcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaac 21812419  T
Q  125 aacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagc 221  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||  |   ||||||||||||||||||||| |||    
T  21812418 aacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagc 21812323  T
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||    
T  21812322 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtgaa-gtcttacaaaag-gttccaagactct 21812225  T
Q  322 agctattc-aagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21812224 agcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 21812178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24024594 - 24024266
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24024594 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 24024497  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaa-caccaagcaagattgttgacc 234  Q
    ||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  24024496 ctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaaaacaccgaacaagattgttgacc 24024398  T
Q  235 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24024397 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaa-tgttacaagactctagc-cttcaagct 24024300  T
Q  335 tt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24024299 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 24024266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31109849 - 31109523
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31109849 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 31109752  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    | |||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||||  || |||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  31109751 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataaa--caagaaaaggaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 31109658  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  31109657 acccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaa 31109560  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31109559 gctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttg 31109523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 12406150 - 12406477
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12406150 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12406247  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12406248 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 12406343  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||    
T  12406344 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaag 12406441  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12406442 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 12406477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 12396730 - 12397057
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12396730 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12396827  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||      | ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12396828 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcg---gtaaagggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgac 12396923  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 332  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||     
T  12396924 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-ctttaat 12397021  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12397022 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 12397057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357548
Alignment:
Q  65 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  164 taagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctggg 262  Q
     ||||| |||||| ||| |||||||||   || |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20357698 aaagagataacaaagcaaacaagataag--caagaaaaggaa-gaacaaaataccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttggg 20357603  T
Q  263 ggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  20357602 ggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac-aaagggttacaagaa 20357548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Original strand, 4866548 - 4866816
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  4866548 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagt 4866645  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaa-ccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 232  Q
    |  || ||| ||||||||| || |||||| || || || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  4866646 cctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttga 4866741  T
Q  233 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4866742 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 4866816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Original strand, 2057949 - 2058101
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2057949 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 2058047  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
     |||| |||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2058048 -aaagggttacaagaaacaatagc-attcaagcttacacaagaacaagccctagat 2058101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 318
Target Start/End: Original strand, 18408746 - 18408860
Alignment:
Q  203 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 300  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  18408746 aaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgtt 18408843  T
Q  301 acaaaagagttacaagaa 318  Q
    || |||| ||||||||||    
T  18408844 ac-aaagggttacaagaa 18408860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1533540 - 1533444
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  1533540 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 1533444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159929
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 29159901  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  29159902 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 29159929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 21639809 - 21639905
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  21639809 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 21639905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983411
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac-aaaagagttacaagaat 319  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaa 21983384  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  21983385 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 21983411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 318
Target Start/End: Original strand, 18413623 - 18413736
Alignment:
Q  203 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 300  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  18413623 aaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtt 18413719  T
Q  301 acaaaagagttacaagaa 318  Q
    || |||| ||||||||||    
T  18413720 ac-aaagggttacaagaa 18413736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 21646007 - 21646103
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  21646007 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta-aaaagggttacaagaa 21646103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516281
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 46516309  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  46516308 attagct-taaaagcttacacaagaacaa 46516281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091759
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 49091759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647667
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcagcc-aatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 2647695  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  2647694 attagct-tataagcttacacaagaacaa 2647667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332449
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33332449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56073
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 56045  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  56046 attagct-tataagcttacacaagaacaa 56073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848684
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 44848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580515
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 2580487  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  2580488 aatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 2580515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190008
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 9190008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284153
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 20284153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4796765 - 4796638
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||  || |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4796765 caagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaa 4796666  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  4796665 attagct-tataagcttacacaagaacaa 4796638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35960914
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaa 35960914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Original strand, 2057806 - 2057871
Alignment:
Q  65 gatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaa 131  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2057806 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaa 2057871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479461
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||| |||| |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttataagaaa 2479434  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  2479435 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 2479461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 318
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21989005
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac-aaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||  || |||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagag--caactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaa 21989005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263745
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg 290  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag--cagctctccaatccactatg 47263745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185198
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatcca 9185198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  225 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagaga 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 19344220 - 19344567
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19344220 atccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagc 19344318  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  19344319 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgataaaaggaaaagaacaaaacacc 19344417  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344418 gagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 19344517  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19344518 atctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 19344567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 19349078 - 19349425
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19349078 atccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagc 19349176  T
Q  118 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacacc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||    
T  19349177 taacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgataaaaggaaaagaacaaaacacc 19349275  T
Q  218 aagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349276 gagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga 19349375  T
Q  318 atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19349376 atctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 19349425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 356
Target Start/End: Original strand, 32246602 - 32246922
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  32246602 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagt 32246700  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaa--aagaacaaaacaccaagcaagattgttga 232  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| |  | | || || ||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  32246701 cctagactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 32246799  T
Q  233 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaag 332  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  32246800 ccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttcaag 32246897  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctagat 356  Q
    |||| |||| |||||||||||||||    
T  32246898 ctttacacatgaacaaaccctagat 32246922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39812255 - 39811928
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39812255 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 39812157  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  39812156 cctaagc-tagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttg 39812063  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  39812062 aaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaa 39811965  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39811964 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 39811928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312563
Alignment:
Q  39 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagccta 138  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||      
T  44312887 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 44312790  T
Q  139 agcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 236  Q
    || | | ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||  | || ||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44312789 agacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag-cgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 44312694  T
Q  237 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44312693 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 44312596  T
Q  336 t-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44312595 tacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11099040 - 11098877
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11099040 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 11098942  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11098941 -aaagggttacaagaaacaatagct-tgcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 11098877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 356
Target Start/End: Original strand, 14291380 - 14291624
Alignment:
Q  111 tccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaaga 207  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||   || |||| |||  ||    
T  14291380 tccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcaaaacaagataag--caagaaaggaa--ga 14291475  T
Q  208 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  14291476 acaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaa 14291573  T
Q  307 gagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
    | |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14291574 gggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaagccctagat 14291624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9296514 - 9296362
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9296514 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 9296416  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 356  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9296415 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttatacaagaacaagccctagat 9296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491847
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 3491847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040188
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaa--agagttacaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaag 8040158  T
Q  317 aatctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  8040159 aaattagct-tacaagcttacacaagaacaa 8040188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707223
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 10707249  T
Q  321 tagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10707248 tagct-tacaagcttacacaagaacaa 10707223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 25398496 - 25398592
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25398496 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 25398592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 318
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569426
Alignment:
Q  225 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 13569426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630041
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 25403634 - 25403730
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25403634 aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 25403730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445415
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaata-tgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10445443  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  10445442 attagct-tacaatcttacacaagaacaa 10445415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865329
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcagcc-aatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 17865301  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  17865302 attagct-tataagcttacacaagaacaa 17865329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682305
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 34682333  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| | || |||| |||||||||||    
T  34682332 attagct-tacaggcttacacaagaacaa 34682305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259149
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 28259176  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  28259175 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 28259149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 318
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388956
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 34388956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390121
Alignment:
Q  225 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 322  Q
    |||||||||||||||| | ||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaatta 8390145  T
Q  323 gctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||    
T  8390144 gct-tacaagcttgcacaagaacaa 8390121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14698979
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaa 14699007  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  14699006 attagct-tataagcttacacaagaacaa 14698979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522318
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaa 20522318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738926
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078442
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||||     
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgtta-gaaagagttacaagaaa 23078469  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  23078468 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 23078442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36757882 - 36757728
Alignment:
Q  198 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaa 294  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36757882 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaa 36757785  T
Q  295 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaaacccta 353  Q
     ||||| | ||||||||| |||||   |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36757784 agtgtttc-aaagagttataagaaaaaagct-ttcaagcttacacaagaacaaaaccta 36757728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39483057
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaa 39483029  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  39483030 attagct-tataagcttacacaagaacaa 39483057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16940307 - 16940208
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16940307 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 16940208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17010972 - 17010873
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17010972 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 17010873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 315
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056139
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 315  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaa 31056139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528620
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||  ||||| || | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33528620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118262
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaa 33118234  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  33118235 attagct-tataagcttacacaagaacaa 33118262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 318
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407719
Alignment:
Q  252 cctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 25407719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 182250 - 181973
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182250 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagct 182151  T
Q  119 aa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacac 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  182150 aatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaacaaaacac 182054  T
Q  217 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  182053 caagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt 181973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 366
Target Start/End: Original strand, 18855543 - 18855871
Alignment:
Q  35 gaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  18855543 gaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cag 18855640  T
Q  135 cc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    || ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18855641 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 18855737  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  18855738 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaa 18855835  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18855836 gctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 18855871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 3813841 - 3814168
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  3813841 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagt 3813939  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaa-ccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacc 234  Q
    |  || ||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3813940 cctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccatgcaagattgttgacc 3814037  T
Q  235 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3814038 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttcaagct 3814135  T
Q  335 tt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3814136 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 3814168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 5732481 - 5732809
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5732481 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 5732577  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaa----caccaagcaagattgt 229  Q
    | ||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||     | |||| |||||||||||    |||  | |||||||||    
T  5732578 cctaagc-tagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaacg---gtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgt 5732673  T
Q  230 tgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattc 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  5732674 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttc 5732771  T
Q  330 aagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5732772 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 5732809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45357563 - 45357236
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  45357563 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagt 45357466  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 232  Q
    |  || ||| |||| |||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||   |   ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45357465 cctagactagtgtaaagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttga 45357370  T
Q  233 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaag 332  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  45357369 cccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttcaag 45357272  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45357271 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 45357236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9224673 - 9224346
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9224673 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 9224576  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||    
T  9224575 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 9224480  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||    
T  9224479 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttagaagaactctagc-cttcaag 9224382  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9224381 ctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 9224346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9229460 - 9229133
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9229460 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 9229363  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  9229362 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttaac 9229267  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||    
T  9229266 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttagaagaactctagc-cttcaag 9229169  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9229168 ctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 9229133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45348084 - 45347756
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  45348084 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagt 45347987  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 232  Q
    |  || ||| |||| |||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||   |   ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45347986 cctagactagtgtaaagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttga 45347891  T
Q  233 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaaga-atctagctattcaa 331  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||    
T  45347890 cccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagacctctagc-cttcaa 45347793  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45347792 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 45347756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 366
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520603
Alignment:
Q  41 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 140  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  51520280 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 51520377  T
Q  141 cctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 237  Q
     ||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51520378 actagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 51520473  T
Q  238 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 336  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  51520474 ttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 51520571  T
Q  337 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51520572 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 51520603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146664
Alignment:
Q  40 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||  |    
T  56146974 ttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcccta 56146877  T
Q  140 gcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 236  Q
    | ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  56146876 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtcca 56146781  T
Q  237 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  56146780 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 56146683  T
Q  336 t-cacaagaacaaacccta 353  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  56146682 tacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Original strand, 24741924 - 24742087
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24741924 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 24742022  T
Q  303 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24742023 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 24742087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 318
Target Start/End: Original strand, 29760625 - 29760738
Alignment:
Q  204 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29760625 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 29760723  T
Q  303 aaaagagttacaagaa 318  Q
     |||| ||||||||||    
T  29760724 -aaagggttacaagaa 29760738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047505
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10047477  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  10047478 attagct-tataagcttacacaagaacaa 10047505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246092
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 39246092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623264
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16623292  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      |||||| | |||||| || ||||||||    
T  16623291 attagctaat-aagcttacagaagaacaa 16623264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152410
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaa 38152438  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  38152437 attagct-tataagcttacacaagaacaa 38152410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796490
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 3796517  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  3796516 ttagct-tacaagcttgcacaagaacaa 3796490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468542
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16630778 - 16630651
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16630778 caaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16630679  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  16630678 attagct-tataagcttacacaagaacaa 16630651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396643
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||     
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgc-aaagagttacaagaaa 5396670  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5396669 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 5396643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315229
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 36315229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329438
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 36329438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147803
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||      
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaa 5147777  T
Q  321 tagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5147778 tagct-tgcaagcttacacaagaacaa 5147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143385
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 320  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||      
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaaaa 5143359  T
Q  321 tagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  5143360 tagct-tgcaagcatacacaagaacaa 5143385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24333901
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagtta 312  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaagagtta 24333901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985634
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 31985634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5269289 - 5269204
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 304  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  5269289 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 347
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777674
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 320  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||| | |||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||      
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaa 3777648  T
Q  321 tagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  3777649 tagct-tgcaaacttacacaagaacaa 3777674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743417
Alignment:
Q  227 tgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 315  Q
    |||||||||||||| | ||||| || ||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctacaa 6743417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 366
Target Start/End: Original strand, 179 - 507
Alignment:
Q  35 gaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  179 gaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cag 276  T
Q  135 cc-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 231  Q
    || ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  277 ccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 373  T
Q  232 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  374 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaa 471  T
Q  332 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  472 gctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9907 - 9583
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  9907 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagc 9809  T
Q  136 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacc 234  Q
    | ||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9808 cctaagc-tagtatatagcaaaaccacac-aagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacc 9714  T
Q  235 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  9713 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagct 9616  T
Q  335 tt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9615 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 13
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag- 134  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||      ||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  148 aaccttcacaccaatta-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagc 56  T
Q  135 cctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcata 181  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  55 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcata 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3788
Alignment:
Q  309 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 366  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagcc-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 3788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35328 - 35001
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35328 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 35231  T
Q  136 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 233  Q
    |  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  35230 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttaac 35135  T
Q  234 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||    
T  35134 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttagaagaactctagc-cttcaag 35037  T
Q  333 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 366  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35036 ctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 35001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17952
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  18048 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 17952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 24045
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 24045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8419
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 8419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34216 - 34136
Alignment:
Q  36 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagc 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  34216 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10855
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10827  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||| | | ||||||| |||||||||||    
T  10828 attag-tttacaagcttacacaagaacaa 10855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5809
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaa 5781  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  5782 attagct-tataagcttacacaagaacaa 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2618
Alignment:
Q  221 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaa 2590  T
Q  319 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  2591 attagct-tataagcttacacaagaacaa 2618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133280
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttac-aaagagttacaagaa 133280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 318
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85780
Alignment:
Q  223 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 85780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43933
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 319  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 43960  T
Q  320 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
     ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  43959 atagct-tgcaagcttatacaagaacaa 43933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36953 - 36804
Alignment:
Q  197 aaaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tga 293  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||| |||| |||    
T  36953 aaaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatga 36856  T
Q  294 atgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    | ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  36855 aagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 36804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0777 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0777
Description:

Target: scaffold0777; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 6301 - 6341
Alignment:
Q  19 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6301 atccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 6341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 13165 - 13228
Alignment:
Q  35 gaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgag 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13165 gaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgag 13228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 350 - 300
Alignment:
Q  203 aaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcct 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  350 aaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45322
Alignment:
Q  222 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg 290  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 45322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 347
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17389
Alignment:
Q  225 attgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 322  Q
    |||||||||||||||| |  |||| || |||||| ||||  ||||| || | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatta 17365  T
Q  323 gctattcaagctttcacaagaacaa 347  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||    
T  17366 gct-tataagcttacacaagaacaa 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  226 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagaacagctctccaatcca 285  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University