View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20942_low_12 (Length: 303)

Name: NF20942_low_12
Description: NF20942
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20942_low_12
NF20942_low_12
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (1-303)||(32755852-32756158)
chr6 (1-303)||(28085309-28085613)
chr6 (1-303)||(5258193-5258499)
chr6 (1-303)||(5631751-5632059)
chr6 (1-303)||(30031189-30031493)
chr6 (6-303)||(608097-608398)
chr6 (11-302)||(35043487-35043780)
chr6 (14-303)||(21351882-21352171)
chr6 (38-271)||(20427714-20427948)
chr6 (40-303)||(12890556-12890812)
chr6 (11-220)||(10099987-10100196)
chr6 (11-303)||(9706719-9707007)
chr6 (77-302)||(30679417-30679632)
chr6 (115-243)||(7133795-7133923)
chr6 (115-243)||(7136718-7136846)
chr6 (68-303)||(33496963-33497196)
chr6 (1-289)||(9593767-9594061)
chr6 (38-303)||(14030777-14031032)
chr6 (189-303)||(34143810-34143924)
chr6 (189-303)||(34156426-34156540)
chr6 (131-303)||(5080905-5081077)
chr6 (73-249)||(2689647-2689817)
chr6 (67-279)||(28026896-28027107)
chr6 (1-301)||(6055818-6056119)
chr6 (74-302)||(24665818-24666047)
chr6 (239-303)||(31819004-31819068)
chr6 (217-303)||(10098941-10099025)
chr6 (237-303)||(34934875-34934941)
chr6 (229-303)||(3206504-3206578)
chr6 (189-303)||(34550-34664)
chr6 (16-99)||(5080803-5080888)
chr6 (1-179)||(26291711-26291892)
chr6 (56-136)||(33084048-33084128)
chr6 (270-303)||(1615268-1615301)
chr6 (76-129)||(8364582-8364635)
chr6 (105-181)||(14389335-14389411)
[»] chr1 (76 HSPs)
chr1 (1-303)||(8671853-8672155)
chr1 (1-303)||(1210678-1210982)
chr1 (1-303)||(30202175-30202479)
chr1 (1-303)||(49347438-49347742)
chr1 (11-303)||(51602001-51602293)
chr1 (3-303)||(22090029-22090333)
chr1 (11-303)||(34792394-34792688)
chr1 (13-301)||(51440812-51441102)
chr1 (1-303)||(9592667-9592971)
chr1 (11-303)||(32230999-32231293)
chr1 (56-303)||(4029112-4029359)
chr1 (11-303)||(4001500-4001794)
chr1 (11-302)||(696212-696506)
chr1 (1-301)||(43240426-43240730)
chr1 (1-303)||(8391705-8392009)
chr1 (85-303)||(25979276-25979494)
chr1 (13-303)||(15085879-15086159)
chr1 (11-303)||(32082801-32083084)
chr1 (38-299)||(38807720-38807987)
chr1 (150-303)||(37311800-37311953)
chr1 (129-303)||(39318193-39318366)
chr1 (1-303)||(9509251-9509555)
chr1 (6-266)||(18469164-18469424)
chr1 (1-303)||(9599439-9599743)
chr1 (183-303)||(52921197-52921317)
chr1 (66-303)||(32404571-32404808)
chr1 (11-303)||(37462921-37463210)
chr1 (96-271)||(52561666-52561841)
chr1 (1-206)||(27847947-27848153)
chr1 (94-247)||(34827205-34827358)
chr1 (56-226)||(2544589-2544758)
chr1 (75-245)||(48431509-48431679)
chr1 (38-301)||(39140490-39140750)
chr1 (173-303)||(4415455-4415586)
chr1 (216-302)||(32079223-32079307)
chr1 (238-303)||(24020312-24020377)
chr1 (230-302)||(4707266-4707338)
chr1 (38-135)||(43423689-43423788)
chr1 (210-301)||(27520254-27520345)
chr1 (96-242)||(9002382-9002528)
chr1 (210-303)||(16142025-16142118)
chr1 (56-289)||(40416361-40416594)
chr1 (56-136)||(1661420-1661500)
chr1 (73-225)||(5338731-5338883)
chr1 (11-116)||(52561843-52561950)
chr1 (202-289)||(7762496-7762583)
chr1 (202-289)||(29128919-29129006)
chr1 (73-303)||(6025612-6025842)
chr1 (106-251)||(34074250-34074396)
chr1 (189-302)||(28511847-28511960)
chr1 (31-181)||(35828717-35828869)
chr1 (168-264)||(26299187-26299283)
chr1 (259-303)||(44751677-44751721)
chr1 (186-253)||(8628150-8628217)
chr1 (213-284)||(10200370-10200441)
chr1 (2-173)||(14226004-14226175)
chr1 (38-271)||(36623961-36624178)
chr1 (200-303)||(41560363-41560466)
chr1 (263-301)||(5113940-5113978)
chr1 (202-303)||(11331249-11331350)
chr1 (202-303)||(11489270-11489371)
chr1 (96-225)||(16272944-16273073)
chr1 (230-271)||(46423290-46423331)
chr1 (259-303)||(42337749-42337793)
chr1 (15-132)||(51812472-51812591)
chr1 (67-136)||(8343070-8343139)
chr1 (203-272)||(8676941-8677010)
chr1 (103-152)||(10569263-10569312)
chr1 (266-303)||(29577452-29577489)
chr1 (111-260)||(30834065-30834214)
chr1 (94-127)||(31274578-31274611)
chr1 (122-231)||(50771673-50771782)
chr1 (195-303)||(3818901-3819009)
chr1 (110-182)||(17640219-17640291)
chr1 (186-254)||(40228100-40228168)
chr1 (259-303)||(44941821-44941865)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (1-303)||(36545080-36545386)
chr8 (6-303)||(36565286-36565585)
chr8 (38-303)||(11523768-11524036)
chr8 (1-303)||(40813255-40813561)
chr8 (68-303)||(12491183-12491418)
chr8 (1-300)||(39946790-39947091)
chr8 (38-303)||(42854049-42854316)
chr8 (1-288)||(36395009-36395299)
chr8 (28-289)||(18125135-18125395)
chr8 (28-301)||(2796517-2796788)
chr8 (40-303)||(8932676-8932940)
chr8 (97-302)||(21121177-21121382)
chr8 (140-303)||(42469772-42469935)
chr8 (85-266)||(37077772-37077951)
chr8 (86-303)||(26904952-26905168)
chr8 (167-303)||(2027631-2027767)
chr8 (32-303)||(45419203-45419472)
chr8 (38-286)||(8879506-8879752)
chr8 (11-228)||(18751996-18752212)
chr8 (99-303)||(43904710-43904914)
chr8 (110-303)||(29520694-29520886)
chr8 (216-303)||(25473448-25473535)
chr8 (119-294)||(12025842-12026005)
chr8 (1-226)||(32043523-32043750)
chr8 (33-154)||(12796894-12797015)
chr8 (67-265)||(45512578-45512776)
chr8 (214-302)||(25300247-25300335)
chr8 (75-303)||(32930970-32931197)
chr8 (195-303)||(14742127-14742232)
chr8 (1-158)||(6510618-6510775)
chr8 (97-289)||(9904941-9905132)
chr8 (214-302)||(25288912-25289000)
chr8 (96-303)||(30559723-30559930)
chr8 (236-303)||(44529395-44529462)
chr8 (239-303)||(44047577-44047641)
chr8 (163-277)||(5266027-5266140)
chr8 (227-303)||(15215457-15215533)
chr8 (147-303)||(35362695-35362851)
chr8 (77-286)||(35643668-35643872)
chr8 (102-217)||(42584407-42584522)
chr8 (58-303)||(29700268-29700513)
chr8 (109-260)||(10079995-10080146)
chr8 (1-76)||(12492116-12492191)
chr8 (19-166)||(7046285-7046434)
chr8 (30-129)||(30113416-30113517)
chr8 (53-135)||(41971991-41972072)
chr8 (96-181)||(36143395-36143480)
chr8 (67-143)||(2776434-2776510)
chr8 (67-143)||(9695632-9695708)
chr8 (73-181)||(10824331-10824439)
chr8 (200-268)||(28269759-28269826)
chr8 (212-271)||(25439471-25439530)
chr8 (102-169)||(30748493-30748560)
chr8 (1-63)||(15215558-15215620)
chr8 (44-118)||(42493536-42493610)
chr8 (218-264)||(45041399-45041445)
chr8 (234-303)||(490503-490572)
chr8 (234-302)||(42584527-42584595)
chr8 (15-136)||(44681251-44681374)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (1-303)||(3243698-3244000)
chr2 (1-303)||(3866005-3866309)
chr2 (1-303)||(8180713-8181017)
chr2 (1-303)||(38452731-38453038)
chr2 (1-303)||(36183384-36183688)
chr2 (1-303)||(38429817-38430121)
chr2 (1-303)||(12734634-12734937)
chr2 (56-303)||(2610578-2610825)
chr2 (87-303)||(451693-451909)
chr2 (11-303)||(41197272-41197567)
chr2 (11-303)||(18424422-18424714)
chr2 (11-303)||(11992153-11992445)
chr2 (1-303)||(4807525-4807832)
chr2 (11-303)||(45367670-45367963)
chr2 (39-303)||(25834650-25834915)
chr2 (108-303)||(7326205-7326400)
chr2 (11-303)||(41763088-41763380)
chr2 (137-303)||(28508749-28508915)
chr2 (72-261)||(24583719-24583908)
chr2 (11-301)||(23997560-23997837)
chr2 (123-303)||(39029638-39029818)
chr2 (183-298)||(35643065-35643180)
chr2 (87-289)||(6237812-6238014)
chr2 (67-302)||(12141545-12141780)
chr2 (170-303)||(31959625-31959758)
chr2 (56-303)||(43751992-43752239)
chr2 (1-284)||(9556433-9556717)
chr2 (38-301)||(41545376-41545640)
chr2 (38-303)||(38434921-38435189)
chr2 (67-303)||(18958908-18959148)
chr2 (224-303)||(30306190-30306269)
chr2 (237-303)||(227360-227426)
chr2 (62-146)||(43238296-43238379)
chr2 (208-303)||(9996671-9996766)
chr2 (60-142)||(16097192-16097274)
chr2 (186-302)||(45543119-45543234)
chr2 (227-303)||(38328415-38328489)
chr2 (147-291)||(21834635-21834779)
chr2 (85-303)||(13149350-13149569)
chr2 (105-259)||(42543274-42543428)
chr2 (96-181)||(3481171-3481256)
chr2 (234-303)||(9496034-9496103)
chr2 (103-224)||(26850272-26850393)
chr2 (189-284)||(26784404-26784499)
chr2 (163-303)||(35755290-35755434)
chr2 (32-174)||(11017280-11017422)
chr2 (246-303)||(3635368-3635425)
chr2 (223-303)||(30743686-30743766)
chr2 (38-135)||(37481830-37481929)
chr2 (68-132)||(41330131-41330195)
chr2 (1-136)||(9578915-9579050)
chr2 (44-152)||(11412697-11412807)
chr2 (200-303)||(12882090-12882193)
chr2 (189-303)||(33504346-33504461)
chr2 (96-134)||(907710-907748)
chr2 (96-166)||(13240927-13240997)
chr2 (160-302)||(13443954-13444096)
chr2 (106-236)||(13592410-13592540)
chr2 (6-63)||(2610466-2610523)
chr2 (266-303)||(12474972-12475009)
chr2 (234-303)||(19336938-19337007)
chr2 (1-182)||(23714427-23714607)
chr2 (1-182)||(24102099-24102279)
chr2 (190-303)||(43573175-43573287)
chr2 (103-135)||(41858768-41858800)
chr2 (67-135)||(44437934-44438002)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (6-303)||(49029214-49029513)
chr7 (1-303)||(11593893-11594197)
chr7 (1-303)||(34869353-34869657)
chr7 (1-303)||(12841320-12841624)
chr7 (1-303)||(35906246-35906550)
chr7 (1-303)||(37617877-37618182)
chr7 (11-303)||(33349851-33350145)
chr7 (11-303)||(43281619-43281911)
chr7 (1-299)||(44855223-44855521)
chr7 (13-295)||(13859061-13859345)
chr7 (6-303)||(39906417-39906714)
chr7 (11-303)||(45836527-45836819)
chr7 (1-303)||(36651927-36652229)
chr7 (1-303)||(46355901-46356205)
chr7 (1-273)||(31005156-31005430)
chr7 (38-303)||(6374838-6375105)
chr7 (66-303)||(31682647-31682884)
chr7 (1-303)||(35559038-35559343)
chr7 (38-303)||(29650354-29650621)
chr7 (38-303)||(43491278-43491545)
chr7 (57-303)||(2885767-2886013)
chr7 (73-303)||(22349627-22349857)
chr7 (1-222)||(33072887-33073108)
chr7 (67-303)||(36869289-36869525)
chr7 (11-303)||(38606948-38607229)
chr7 (76-303)||(15682184-15682411)
chr7 (11-289)||(23404361-23404640)
chr7 (179-303)||(38900070-38900194)
chr7 (105-302)||(32631615-32631800)
chr7 (120-303)||(7273154-7273337)
chr7 (124-266)||(24598269-24598411)
chr7 (39-284)||(36136735-36136982)
chr7 (183-303)||(40979973-40980093)
chr7 (96-303)||(28627978-28628185)
chr7 (32-170)||(46014359-46014498)
chr7 (139-303)||(31681065-31681226)
chr7 (1-178)||(7272972-7273151)
chr7 (195-303)||(48919241-48919349)
chr7 (217-303)||(21078068-21078154)
chr7 (56-289)||(47848664-47848896)
chr7 (96-303)||(38135258-38135464)
chr7 (38-302)||(8492282-8492545)
chr7 (223-303)||(27648937-27649017)
chr7 (200-303)||(9210749-9210852)
chr7 (1-184)||(36514371-36514554)
chr7 (56-247)||(7189320-7189518)
chr7 (120-303)||(33139208-33139391)
chr7 (39-173)||(19262609-19262742)
chr7 (242-303)||(33073105-33073166)
chr7 (11-108)||(32630538-32630636)
chr7 (38-220)||(25579205-25579388)
chr7 (200-302)||(21517426-21517528)
chr7 (189-303)||(45601599-45601713)
chr7 (122-264)||(1011103-1011245)
chr7 (120-302)||(1569070-1569252)
chr7 (73-167)||(12966029-12966123)
chr7 (56-134)||(27021906-27021984)
chr7 (1-63)||(36869576-36869638)
chr7 (101-223)||(48202827-48202949)
chr7 (238-303)||(34035199-34035264)
chr7 (38-136)||(36101977-36102077)
chr7 (113-201)||(26925257-26925345)
chr7 (67-143)||(40169650-40169726)
chr7 (96-223)||(6420615-6420742)
chr7 (36-164)||(42187438-42187568)
chr7 (55-174)||(48736073-48736192)
chr7 (122-271)||(1531438-1531587)
chr7 (210-303)||(36239841-36239934)
chr7 (200-289)||(37976369-37976458)
chr7 (55-172)||(45558351-45558468)
chr7 (38-182)||(5335892-5336036)
chr7 (96-139)||(24549902-24549945)
chr7 (1-56)||(24598440-24598495)
chr7 (256-303)||(28208373-28208420)
chr7 (96-135)||(35713725-35713764)
chr7 (56-135)||(43282398-43282477)
chr7 (73-135)||(7220751-7220813)
chr7 (213-303)||(14057625-14057715)
chr7 (213-303)||(14367653-14367743)
chr7 (53-127)||(27893769-27893843)
chr7 (52-133)||(30632954-30633035)
chr7 (147-271)||(28562443-28562567)
chr7 (1-136)||(30200175-30200308)
chr7 (237-301)||(31859046-31859110)
chr7 (67-131)||(38920795-38920859)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (1-303)||(31959859-31960163)
chr4 (1-303)||(48174138-48174442)
chr4 (11-303)||(4440798-4441090)
chr4 (1-303)||(1777062-1777364)
chr4 (1-303)||(52569560-52569864)
chr4 (1-303)||(56375223-56375527)
chr4 (11-303)||(48622588-48622880)
chr4 (1-303)||(53707727-53708031)
chr4 (11-303)||(33227152-33227446)
chr4 (1-303)||(436162-436466)
chr4 (11-300)||(33190896-33191187)
chr4 (1-303)||(43433851-43434161)
chr4 (1-302)||(37797785-37798087)
chr4 (1-303)||(23906342-23906650)
chr4 (38-303)||(46582870-46583136)
chr4 (1-289)||(50286904-50287185)
chr4 (44-303)||(27450225-27450483)
chr4 (11-266)||(39100618-39100872)
chr4 (11-288)||(47265255-47265541)
chr4 (11-279)||(28236128-28236395)
chr4 (11-302)||(37773497-37773789)
chr4 (47-303)||(39708412-39708670)
chr4 (94-303)||(8286459-8286676)
chr4 (58-302)||(20192025-20192269)
chr4 (56-303)||(26037550-26037797)
chr4 (85-303)||(32479057-32479275)
chr4 (11-303)||(27983143-27983430)
chr4 (1-301)||(1793393-1793697)
chr4 (160-301)||(21236952-21237093)
chr4 (120-298)||(50679559-50679736)
chr4 (43-301)||(20591353-20591607)
chr4 (38-303)||(51421702-51421967)
chr4 (195-303)||(6957727-6957835)
chr4 (195-303)||(12494792-12494900)
chr4 (43-301)||(20601699-20601953)
chr4 (17-284)||(41009414-41009683)
chr4 (1-303)||(16002860-16003163)
chr4 (97-303)||(53518368-53518571)
chr4 (11-263)||(1211476-1211729)
chr4 (100-279)||(20821077-20821255)
chr4 (195-303)||(7947066-7947174)
chr4 (1-110)||(12494683-12494794)
chr4 (1-284)||(45204903-45205197)
chr4 (124-266)||(28351617-28351759)
chr4 (187-271)||(50862764-50862849)
chr4 (195-303)||(21528417-21528525)
chr4 (184-303)||(4548140-4548259)
chr4 (1-174)||(25257755-25257928)
chr4 (12-134)||(31458972-31459098)
chr4 (28-180)||(56225028-56225180)
chr4 (1-125)||(49987361-49987487)
chr4 (238-303)||(19154908-19154973)
chr4 (44-135)||(50662365-50662457)
chr4 (243-303)||(19969358-19969418)
chr4 (38-143)||(44047553-44047660)
chr4 (56-279)||(50680729-50680953)
chr4 (56-179)||(35555816-35555939)
chr4 (220-303)||(51811323-51811406)
chr4 (1-217)||(55578964-55579183)
chr4 (71-180)||(20131167-20131276)
chr4 (72-226)||(26356625-26356779)
chr4 (38-135)||(51252674-51252771)
chr4 (56-277)||(54470197-54470418)
chr4 (190-263)||(55809075-55809148)
chr4 (73-181)||(7092387-7092495)
chr4 (103-226)||(13805387-13805510)
chr4 (56-175)||(28497480-28497598)
chr4 (73-215)||(29398825-29398967)
chr4 (38-116)||(10775654-10775734)
chr4 (97-242)||(17666149-17666294)
chr4 (219-288)||(31043225-31043294)
chr4 (96-181)||(47611757-47611842)
chr4 (200-279)||(21107126-21107205)
chr4 (38-134)||(33709894-33709992)
chr4 (56-135)||(42639233-42639312)
chr4 (219-271)||(28550532-28550584)
chr4 (94-134)||(35690320-35690360)
chr4 (73-177)||(38570918-38571022)
chr4 (247-303)||(41729495-41729551)
chr4 (195-303)||(50287988-50288096)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-303)||(52138733-52139037)
chr3 (1-302)||(54278953-54279256)
chr3 (1-301)||(51447764-51448058)
chr3 (1-303)||(28245370-28245674)
chr3 (11-302)||(22016-22308)
chr3 (6-301)||(47233643-47233940)
chr3 (56-303)||(35033136-35033383)
chr3 (17-303)||(5168777-5169069)
chr3 (11-303)||(25191322-25191614)
chr3 (11-249)||(33272122-33272367)
chr3 (99-303)||(48508268-48508472)
chr3 (56-303)||(38850110-38850358)
chr3 (1-303)||(53519519-53519817)
chr3 (67-302)||(43694817-43695046)
chr3 (38-303)||(54128348-54128616)
chr3 (56-215)||(38060421-38060580)
chr3 (178-303)||(12096750-12096875)
chr3 (72-303)||(48953464-48953698)
chr3 (56-240)||(45728137-45728324)
chr3 (56-303)||(19676126-19676374)
chr3 (68-284)||(38430850-38431066)
chr3 (32-303)||(39600726-39600999)
chr3 (85-289)||(39235157-39235361)
chr3 (56-284)||(45289155-45289385)
chr3 (67-275)||(50960710-50960914)
chr3 (32-271)||(3186733-3186973)
chr3 (205-303)||(52156129-52156227)
chr3 (1-220)||(19757832-19758053)
chr3 (1-241)||(27917505-27917745)
chr3 (38-291)||(54425022-54425283)
chr3 (56-289)||(30294180-30294416)
chr3 (1-266)||(26490250-26490515)
chr3 (1-220)||(19736929-19737150)
chr3 (32-224)||(48734259-48734451)
chr3 (11-220)||(49503684-49503893)
chr3 (73-303)||(42510061-42510289)
chr3 (220-302)||(53262295-53262377)
chr3 (210-303)||(38060858-38060951)
chr3 (150-260)||(19162675-19162785)
chr3 (32-254)||(52678944-52679166)
chr3 (53-303)||(54365020-54365271)
chr3 (56-220)||(344839-345003)
chr3 (199-279)||(17022741-17022821)
chr3 (244-303)||(47555377-47555436)
chr3 (211-303)||(49042081-49042174)
chr3 (38-134)||(29600869-29600968)
chr3 (259-302)||(33271956-33271999)
chr3 (66-181)||(41842678-41842793)
chr3 (1-174)||(36820135-36820308)
chr3 (259-303)||(7895925-7895969)
chr3 (15-83)||(33307093-33307161)
chr3 (56-135)||(3987037-3987116)
chr3 (79-226)||(21200561-21200708)
chr3 (235-301)||(311356-311422)
chr3 (225-291)||(54422900-54422966)
chr3 (38-134)||(31454441-31454537)
chr3 (106-219)||(36304018-36304131)
chr3 (70-259)||(37351411-37351600)
chr3 (103-260)||(46431767-46431918)
chr3 (195-254)||(2340811-2340870)
chr3 (241-303)||(2133657-2133719)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (1-301)||(28976906-28977206)
chr5 (6-301)||(12492431-12492731)
chr5 (1-302)||(24178443-24178746)
chr5 (38-303)||(4496354-4496621)
chr5 (1-301)||(2075520-2075823)
chr5 (38-303)||(38684937-38685204)
chr5 (56-303)||(1287624-1287871)
chr5 (1-303)||(1275198-1275501)
chr5 (11-303)||(3301787-3302081)
chr5 (1-303)||(10639230-10639539)
chr5 (73-303)||(20456780-20457010)
chr5 (1-303)||(16347425-16347727)
chr5 (56-279)||(14665704-14665927)
chr5 (56-303)||(34273017-34273250)
chr5 (124-303)||(2915541-2915719)
chr5 (155-303)||(13561431-13561579)
chr5 (200-303)||(29816516-29816619)
chr5 (1-303)||(26884734-26885038)
chr5 (160-303)||(14911266-14911409)
chr5 (38-301)||(14749277-14749542)
chr5 (98-288)||(38501478-38501668)
chr5 (210-303)||(16913928-16914021)
chr5 (44-259)||(31636009-31636224)
chr5 (1-302)||(32516491-32516791)
chr5 (57-301)||(36215489-36215723)
chr5 (38-284)||(17340500-17340749)
chr5 (58-231)||(2712936-2713109)
chr5 (68-303)||(7359306-7359539)
chr5 (56-279)||(79503-79726)
chr5 (147-289)||(27963-28105)
chr5 (216-286)||(2552932-2553002)
chr5 (246-303)||(30213755-30213812)
chr5 (79-226)||(42199299-42199446)
chr5 (209-303)||(2090556-2090650)
chr5 (38-136)||(33667188-33667286)
chr5 (58-242)||(6859373-6859557)
chr5 (38-143)||(15168762-15168869)
chr5 (73-181)||(43475247-43475355)
chr5 (189-303)||(9235172-9235284)
chr5 (56-154)||(4026529-4026627)
chr5 (72-217)||(21952363-21952508)
chr5 (73-181)||(1525651-1525759)
chr5 (115-219)||(27799892-27799996)
chr5 (28-132)||(418201-418307)
chr5 (229-303)||(418079-418153)
chr5 (1-63)||(1287876-1287938)
chr5 (162-260)||(9917538-9917636)
chr5 (67-143)||(18351112-18351189)
chr5 (239-303)||(5558314-5558378)
chr5 (38-126)||(11002645-11002733)
chr5 (96-291)||(23979976-23980169)
chr5 (219-303)||(28276391-28276475)
chr5 (56-164)||(43558011-43558119)
chr5 (96-303)||(6889023-6889230)
chr5 (168-279)||(15168873-15168984)
chr5 (94-181)||(15986904-15986991)
chr5 (122-261)||(33157918-33158057)
chr5 (53-143)||(18698787-18698876)
chr5 (67-136)||(28676596-28676665)
chr5 (94-219)||(36200770-36200894)
chr5 (124-289)||(43035039-43035204)
chr5 (67-135)||(10082952-10083020)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (38-303)||(993-1258)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-303)||(31401-31705)
scaffold0018 (58-136)||(44080-44158)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (11-303)||(82664-82955)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (11-303)||(86654-86946)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-303)||(4326-4621)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (195-303)||(25577-25685)
scaffold0157 (1-110)||(25683-25794)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (108-303)||(11594-11787)
scaffold0113 (11-134)||(11810-11937)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (175-302)||(16687-16814)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (136-303)||(4706-4873)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (47-303)||(7422-7677)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (216-303)||(481-568)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (205-303)||(14722-14820)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (258-303)||(28934-28979)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (202-254)||(1613-1665)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 32755852 - 32756158
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttag 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  32755852 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 32755951  T
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32755952 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 32756051  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32756052 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 32756151  T
Q  297 ttgatcc 303  Q
    |||||||    
T  32756152 ttgatcc 32756158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 28085309 - 28085613
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28085309 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28085408  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28085409 aataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagag 28085508  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  28085509 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcattt 28085608  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  28085609 gatcc 28085613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5258499 - 5258193
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttag 96  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||    || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  5258499 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 5258400  T
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5258399 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtag 5258300  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||  ||||||||| ||||||    
T  5258299 agaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcat 5258200  T
Q  297 ttgatcc 303  Q
    |||||||    
T  5258199 ttgatcc 5258193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 5631751 - 5632059
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag------tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgtt 94  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5631751 gttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggt 5631850  T
Q  95 agaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggc 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5631851 agaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagac 5631950  T
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    | || ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  5631951 aaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtc 5632050  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  5632051 atttgatcc 5632059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 30031189 - 30031493
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagag--agtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||  ||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30031189 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 30031288  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30031289 aataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 30031388  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30031389 ggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 30031488  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  30031489 gatcc 30031493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Original strand, 608097 - 608398
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggc 105  Q
    |||| ||||||||||||| || | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  608097 gttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggc 608196  T
Q  106 ttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacc 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||  ||||||    
T  608197 ttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacc 608296  T
Q  206 ----taggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
        || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  608297 taattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgat 608396  T
Q  302 cc 303  Q
    ||    
T  608397 cc 608398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35043780 - 35043487
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagag--agagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    |||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||    
T  35043780 atgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggctta 35043681  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||     
T  35043680 gattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacctaa 35043581  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35043580 gaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatc 35043487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351882
Alignment:
Q  14 agtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatgg 113  Q
    |||||||||| || | ||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||     
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatga 21352072  T
Q  114 tttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21352071 tttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaa 21351972  T
Q  214 ctattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21351971 ccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatcc 21351882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20427948 - 20427714
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  20427948 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagac 20427849  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| |||||| |||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20427848 ccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaa 20427749  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  20427748 a-atttagaggttaatgagttggatccaaatatggt 20427714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 303
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890812
Alignment:
Q  40 taggaatgacaccattag--agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagaccc 137  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||         |||    
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------ccc 12890646  T
Q  138 gtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaag 237  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12890647 atagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  238 atttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatcc 12890812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10100196 - 10099987
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || |||  |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  10100196 atgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttaga 10100097  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  10100096 tggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagacctagga 10099997  T
Q  211 aaactattag 220  Q
    ||||||||||    
T  10099996 aaactattag 10099987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 9706719 - 9707007
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9706719 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggctta 9706818  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||      |||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | |||  |||     
T  9706819 gatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggctaa 9706912  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9706913 gtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatcc 9707007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 302
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679632
Alignment:
Q  77 tatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggag 176  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  177 agtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatg 276  Q
    |||||||||| |||||| |          |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||| ||||    
T  30679517 agtcaagttataagaggta----------taggaagactattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  277 atacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatc 30679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  115 ttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  215 tattagagaaaccattagaaaagatttag 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  115 ttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  215 tattagagaaaccattagaaaagatttag 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 303
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497196
Alignment:
Q  68 ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa-taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||  ||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33497062 aatgaaggag--tcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  267 ttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     || | ||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatcc 33497196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9594061 - 9593767
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--------taacacctatagtaaaaaagttg 92  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||        || ||||  ||||| ||||| ||    
T  9594061 gttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattagtagaaaagatg 9593962  T
Q  93 ttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 192  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |   |||||    
T  9593961 gtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaaat--caagag 9593864  T
Q  193 gcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  9593863 gtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgatagaacattatg 9593767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 14030777 - 14031032
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagaga--gtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  14030777 attaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagac 14030876  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
      ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||   |||||||||| |||| |||||||| ||            ||| |||||||||    
T  14030877 atgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaacattagaaa 14030964  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| || | | ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14030965 agatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaatactataacgtcatttgatcc 14031032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143810
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  289 gacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatcc 34143810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156426
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  289 gacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatcc 34156426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081077
Alignment:
Q  131 aagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 230  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  231 agaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
      |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatcc 5081077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 249
Target Start/End: Original strand, 2689647 - 2689817
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||| || ||    
T  2689647 cacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagataga 2689746  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtca 249  Q
    | ||||||| || ||||||||       |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2689747 gtagagtcatgtcaaaagagg------tagacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtca 2689817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28027107 - 28026896
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||    
T  28027107 gggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatca 28027009  T
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
     ||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||| |||||  || || |||||    
T  28027008 gatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaat 28026909  T
Q  267 ttggtgtatgata 279  Q
     |||| |||||||    
T  28026908 atggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6056119 - 6055818
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagta-aaaaagttgttagaaa 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || | | |||   |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |  ||| ||    
T  6056119 gttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaaaaattataggaa 6056020  T
Q  100 ataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaga 199  Q
    ||||| ||   |||||||  |||||||||||||||   |||||||  |||||   || | ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||| ||||     
T  6056019 ataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaaggtagagg 6055920  T
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    ||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||| ||| |||| || ||||| |||||    
T  6055919 aagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttg 6055820  T
Q  300 at 301  Q
    ||    
T  6055819 at 6055818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 302
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666047
Alignment:
Q  74 acctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtaga-tgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   |||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtg 272  Q
    | | ||||   | |  |||||||||| ||| | ||| | |||||  |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  273 tatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatc 24666047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819068
Alignment:
Q  239 tttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 31819068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098941
Alignment:
Q  217 ttagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatcc 10098941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934875
Alignment:
Q  237 gatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatcc 34934875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206504
Alignment:
Q  229 ttagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatcc 3206504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34550
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||  |||| |||| ||||||| |||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  289 gacgtcatttgatcc 303  Q
    | ||| |||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatcc 34550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Original strand, 5080803 - 5080888
Alignment:
Q  16 tggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagaga--gagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaa 99  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5080803 tggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 26291711 - 26291892
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagaga----gagtgtgggta-acacctatagtaaaaaagttgtta 95  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  || || ||||| |||||||||||| || ||||||||    ||||  ||||| ||||||||| || ||||  || ||    
T  26291711 gttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatagaaaatatggta 26291810  T
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagt 179  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||   ||||||  | ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  26291811 gaaaatagacttaggtggtttg--catgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagt 26291892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 33084048 - 33084128
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  33084048 agagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1615301 - 1615268
Alignment:
Q  270 gtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1615301 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatcc 1615268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 8364582 - 8364635
Alignment:
Q  76 ctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagaga 129  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8364582 ctatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14389411 - 14389335
Alignment:
Q  105 cttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtca 181  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||    |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  14389411 cttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagactttgtagtaaggagaatagatcagatggaggatagtca 14389335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 76)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 8671853 - 8672155
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8671853 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 8671952  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8671953 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 8672052  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8672053 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttga 8672152  T
Q  301 tcc 303  Q
    |||    
T  8672153 tcc 8672155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 1210678 - 1210982
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  1210678 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 1210777  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1210778 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 1210877  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1210878 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 1210977  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  1210978 gatcc 1210982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30202479 - 30202175
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  30202479 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaa 30202380  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30202379 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagag 30202280  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30202279 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 30202180  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  30202179 gatcc 30202175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 49347742 - 49347438
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  49347742 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaa 49347643  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49347642 aataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 49347543  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49347542 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 49347443  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  49347442 gatcc 49347438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 51602001 - 51602293
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  51602001 atgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 51602100  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51602101 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 51602200  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  51602201 aaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatcc 51602293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 303
Target Start/End: Original strand, 22090029 - 22090333
Alignment:
Q  3 tgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22090029 tgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 22090128  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22090129 aataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagag 22090228  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22090229 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 22090328  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  22090329 gatcc 22090333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34792688 - 34792394
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  34792688 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggctta 34792589  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34792588 gatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 34792489  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34792488 gaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 34792394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51441102 - 51440812
Alignment:
Q  13 gagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  51441102 gagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 51441003  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  51441002 tggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacctagga 51440903  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  51440902 aaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgat 51440812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 9592667 - 9592971
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||  |||||    
T  9592667 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaa 9592766  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9592767 aataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 9592866  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  9592867 gaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcattt 9592966  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  9592967 gatcc 9592971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32231293 - 32230999
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  32231293 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggctta 32231194  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32231193 gatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 32231094  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  32231093 gaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttgatcc 32230999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029359
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatcc 4029359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4001794 - 4001500
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4001794 atgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 4001695  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||     
T  4001694 gatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaa 4001595  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  4001594 gaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatcc 4001500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Original strand, 696212 - 696506
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  696212 atgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 696311  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||     
T  696312 gatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaa 696411  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacacta-tgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  696412 gaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatc 696506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43240730 - 43240426
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttag 96  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||    
T  43240730 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatag 43240631  T
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  43240630 aaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtag 43240531  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43240530 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 43240431  T
Q  297 ttgat 301  Q
    |||||    
T  43240430 ttgat 43240426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 8391705 - 8392009
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8391705 gttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8391804  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |     
T  8391805 aataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatat 8391904  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||||| || |||||| ||||||||    
T  8391905 gaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcattt 8392004  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  8392005 gatcc 8392009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25979494 - 25979276
Alignment:
Q  85 aaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagt 184  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  25979494 aaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcaggt 25979395  T
Q  185 taaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  25979394 taaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaaca 25979295  T
Q  285 ctatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  25979294 ctatggcgtcatttgatcc 25979276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Original strand, 15085879 - 15086159
Alignment:
Q  13 gagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||| || | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15085879 gagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 15085978  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||    
T  15085979 tggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagaggaagacctaaga 15086078  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
                ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15086079 ------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 15086159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32083084 - 32082801
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32083084 atgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 32082985  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||     
T  32082984 gatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaa 32082885  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgac-gtcatttgatcc 303  Q
    ||            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  32082884 ga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatcc 32082801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38807987 - 38807720
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagag------tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagaga 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||      || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  38807987 attagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagaga 38807888  T
Q  132 agacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccatta 231  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||  | |||||||  || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38807887 agacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccatta 38807788  T
Q  232 gaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  38807787 gaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttg 38807720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311800
Alignment:
Q  150 gtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtca 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  250 atgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 37311800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 303
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318366
Alignment:
Q  129 agaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaacca 228  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  229 ttagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatcc 39318366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 9509251 - 9509555
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  9509251 gttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaaaa 9509350  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||   ||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  9509351 aataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagag 9509450  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||   |||||| | || |||||| |||| ||||||  |||| |||| ||| |||     
T  9509451 gaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattc 9509550  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  9509551 gatcc 9509555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18469424 - 18469164
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggc 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||     
T  18469424 gttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaatagga 18469325  T
Q  106 ttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacc 205  Q
    |||| | |||||| ||| ||| ||||||||  |||||||  |||||| ||||| || |||| |||||| ||||||   | |||||||| |||  |||||     
T  18469324 ttaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagact 18469225  T
Q  206 taggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    ||| |||| ||| ||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18469224 tagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaat 18469164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9599743 - 9599439
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  9599743 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaa 9599644  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| || | ||| |||| | |||||   |||||  |||| ||||||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||    
T  9599643 aataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagag 9599544  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||| | |||||| || |||| ||||||| |||  |||| ||| ||||    
T  9599543 gaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaattt 9599444  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  9599443 gatcc 9599439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 303
Target Start/End: Original strand, 52921197 - 52921317
Alignment:
Q  183 gttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaa 282  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  52921197 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaa 52921296  T
Q  283 cactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  52921297 cactattgcgtcatttgatcc 52921317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32404808 - 32404571
Alignment:
Q  66 tgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatc 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||| ||||      
T  32404808 tgggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagaga 32404709  T
Q  166 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaa 265  Q
    | |||||||| |||||  | | |||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |  |||||||    
T  32404708 agatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaa 32404609  T
Q  266 tttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
      |||| ||||||| ||||  ||| ||| |||||||||    
T  32404608 catggtttatgatataacataatggcgtaatttgatcc 32404571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37463210 - 37462921
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    ||||||||||||||||     
T  37463210 atgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaataggcttagg 37463111  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtc-aagttaaaagaggcagagaaagacctagg 209  Q
    |||||||| |   || |||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |   |||||||| |||| |  ||||||     
T  37463110 tggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggattacctaga 37463014  T
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  37463013 aaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatcc 37462921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561666
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |  ||| |||||| |    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggt 52561666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27848153 - 27847947
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||   |||| ||||| | ||| ||||| || |||||    
T  27848153 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatagga-taggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtagaa 27848055  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||    
T  27848054 aataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtagag 27847955  T
Q  199 aaagacct 206  Q
     |||||||    
T  27847954 gaagacct 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34827358 - 34827205
Alignment:
Q  94 tagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 193  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||| | ||||| | |||||||||||| | |||| || |      
T  34827358 tagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttagaaaaaa 34827259  T
Q  194 cagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggt 247  Q
     | || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34827258 taaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt 34827205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544758
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |  |||||||     
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagg 2544688  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaac 226  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||   |  ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2544689 agagtagatcagatggaggatagtcaa-acactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaac 2544758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48431679 - 48431509
Alignment:
Q  75 cctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggagg 174  Q
    ||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||   |||||||  ||| | ||||| |||||||    
T  48431679 cctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatcagatggagg 48431580  T
Q  175 agagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagag 245  Q
    | ||||   ||| |||||| |||| |||||| |  |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  48431579 atagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagag 48431509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Original strand, 39140490 - 39140750
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||  || ||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39140490 attaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 39140589  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    |  || |||  |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||   || |||  |||  |||  ||||||| ||||| ||    
T  39140590 cgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagag---gaactaaaaaagttat--gagaaactattaggaa 39140684  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    | |||||||||| ||| || ||||||||||| |||| |  |||| |||| |||| ||| |||||||    
T  39140685 aaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgat 39140750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 303
Target Start/End: Original strand, 4415455 - 4415586
Alignment:
Q  173 ggagagtcaagttaaaaga-ggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |    
T  4415455 ggagagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 4415554  T
Q  272 gtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     | | ||| |||| |||| | |||||||||||    
T  4415555 tttttatagaacattatggcatcatttgatcc 4415586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079223
Alignment:
Q  216 attagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatc 32079223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020312
Alignment:
Q  238 atttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 24020312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707266
Alignment:
Q  230 tagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatc 4707266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Original strand, 43423689 - 43423788
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43423689 attagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27520345 - 27520254
Alignment:
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||| || |||||||    
T  27520345 aaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgat 27520254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002528
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||  ||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||  ||| |||||| |    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggataatcatattagaagaggta 9002481  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagattta 242  Q
     ||||||||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  9002482 tagaaagacctagagaaactatcagaaaaactatttgaaaagattta 9002528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16142118 - 16142025
Alignment:
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||| | |||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  16142118 aaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatcc 16142025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416594
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||| ||||| || | ||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||   ||||||||     
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaagg 40416460  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| ||||||| ||| |||| |||||  | |  | || ||||  ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  |||||| || || | ||||||     
T  40416461 agagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatgagt 40416560  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  40416561 tggatcgaaatatggtttatgatagaacattatg 40416594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 1661420 - 1661500
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1661420 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 5338731 - 5338883
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||| |  |||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  5338731 cacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcagatgga 5338830  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaa 225  Q
    ||| | |||  | |  |||||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  5338831 ggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa 5338883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  109 gatggttt 116  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7762583 - 7762496
Alignment:
Q  202 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| |||| ||| ||| |||| ||||    
T  7762583 gacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 289
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129006
Alignment:
Q  202 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatg 29129006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Original strand, 6025612 - 6025842
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||  | ||| |   | |||| ||| ||||||| ||| |    
T  6025612 cacctatagtaaaaacgatggttgaaactaggcttagatgacttgggcatgtacagagaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgta 6025711  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtg 272  Q
    ||  |||||| | |  |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || ||||||| ||||| | |||||| |||||  |||| ||||     
T  6025712 gggtagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggta 6025811  T
Q  273 tatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | ||||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  6025812 tctgatagaacatgatggcgtcatttgatcc 6025842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34074396 - 34074250
Alignment:
Q  106 ttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacc 205  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||  ||  |||| || || ||||| | |||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  34074396 ttagatggtttggatatgtagagagaagacctctagatgtcgtcctagaaagaatatattaaatgaaagagaatcaagttaaaagagctagaaaaagacc 34074297  T
Q  206 taggaaaactattagagaaaccattag-aaaagatttagaggtcaat 251  Q
    |   ||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  34074296 tttaaaacctataagagaatctattagaaaaagatttagaggtcaat 34074250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511847
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| || ||| | |||||| |||| | |||  |||| ||||||| |||| |||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattat 28511861  T
Q  289 gacgtcatttgatc 302  Q
    | ||| ||||||||    
T  28511860 ggcgtaatttgatc 28511847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35828869 - 35828717
Alignment:
Q  31 tgataatattaggaatgacaccattagag--agagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagag 128  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||  ||||| || ||| ||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  35828869 tgataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagag 35828770  T
Q  129 agaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtca 181  Q
    ||||||||  |||||   |||||||| |||  |||||| |||||||| |||||    
T  35828769 agaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtca 35828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 264
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299283
Alignment:
Q  168 atggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaa 264  Q
    |||||||| |||||  |||  ||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgggtccaa 26299283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 303
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751721
Alignment:
Q  259 atccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 44751721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 253
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628217
Alignment:
Q  186 aaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 253  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatga 8628217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10200441 - 10200370
Alignment:
Q  213 actattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  10200441 actatgagagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaaca 10200370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14226175 - 14226004
Alignment:
Q  2 ttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaat 101  Q
    |||||||| ||| ||||||||  || ||||||||  ||||| |||| || |||| ||||||||    ||| |||||||  || ||||| || | ||||||    
T  14226175 ttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagagttgcagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaaat 14226076  T
Q  102 aggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggag 173  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |  || ||||||   |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  14226075 aggcttaggtggtttgggcatgtagagaggattcctgtagattttgtagtaaggagagtagatcacatggag 14226004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36624178 - 36623961
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  || |  |||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  36624178 attaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggtttgg-catgtcgagagaagac 36624080  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
      |||      |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   | | |||||| |||| |||||||||            |||||| ||||||||    
T  36624079 tggtat-----gtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacctag------------agaaactattagaaa 36623997  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  36623996 agatttagaggctaatgagttggatccaaatatggt 36623961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Original strand, 41560363 - 41560466
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| | | |||||||| | |||||| ||||||||||| |||  ||||||| |||| |||| ||| |||||    
T  41560363 aagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttg 41560462  T
Q  300 atcc 303  Q
    ||||    
T  41560463 atcc 41560466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Original strand, 5113940 - 5113978
Alignment:
Q  263 aaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5113940 aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgat 5113978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11331350 - 11331249
Alignment:
Q  202 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||| || |||||||    
T  11331350 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11331251  T
Q  302 cc 303  Q
    ||    
T  11331250 cc 11331249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11489371 - 11489270
Alignment:
Q  202 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||| || |||||||    
T  11489371 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11489272  T
Q  302 cc 303  Q
    ||    
T  11489271 cc 11489270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16273073 - 16272944
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||  |||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||| | |||  ||| |||||| |    
T  16273073 gaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggataatcatattacaagaggta 16272974  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaa 225  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  16272973 tagaacgacctagaagaactattagagaaa 16272944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423290
Alignment:
Q  230 tagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 46423290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 303
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337793
Alignment:
Q  259 atccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatcc 42337793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 51812472 - 51812591
Alignment:
Q  15 gtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatg 112  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||| || | |||| ||||||||  ||    
T  51812472 gtggtaagattagacacgataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtg 51812571  T
Q  113 gtttggtcatgtagagagaa 132  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  51812572 atttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8343139 - 8343070
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | |||| ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  8343139 gggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagacc 8343070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8677010 - 8676941
Alignment:
Q  203 acctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtg 272  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||||    
T  8677010 acctaggaaatctataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtg 8676941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569263
Alignment:
Q  103 ggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagta 152  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagta 10569263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 303
Target Start/End: Original strand, 29577452 - 29577489
Alignment:
Q  266 tttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29577452 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 29577489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30834214 - 30834065
Alignment:
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | |||| |  || |||| ||| ||||||| ||||| |  |||||| |  | ||||| |||| ||||||||| |    
T  30834214 tggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaa 30834115  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggat 260  Q
    || |||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| |||||    
T  30834114 aagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggat 30834065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31274611 - 31274578
Alignment:
Q  94 tagaaaataggcttagatggtttggtcatgtaga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31274611 tagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50771782 - 50771673
Alignment:
Q  122 tgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattaga 221  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| | |  ||||| || | ||||||||| |||||||| ||     
T  50771782 tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagc 50771683  T
Q  222 gaaaccatta 231  Q
    ||||| ||||    
T  50771682 gaaactatta 50771673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3819009 - 3818901
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| | |||||| || ||  |||| |||| ||||||  |||| |||| || |    
T  3819009 agaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgcc 3818910  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  3818909 atttgatcc 3818901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17640291 - 17640219
Alignment:
Q  110 atggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaa 182  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||   |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  17640291 atggtttaggcatgtagagaggagacccgtggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaa 17640219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40228168 - 40228100
Alignment:
Q  186 aaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 254  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  40228168 aaaagaggcagacgaagacctagaaaaactataagtgaaactattaggaaagatttgaaggttaatgag 40228100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941821
Alignment:
Q  259 atccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatcc 44941821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 36545080 - 36545386
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttag 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36545080 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtag 36545179  T
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  36545180 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtag 36545279  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36545280 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcat 36545379  T
Q  297 ttgatcc 303  Q
    |||||||    
T  36545380 ttgatcc 36545386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36565585 - 36565286
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaatag 103  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36565585 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 36565486  T
Q  104 gcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaaga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36565485 gcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 36565386  T
Q  204 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  36565385 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatcc 36565286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11524036 - 11523768
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctt-agatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11524036 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaaga 11523937  T
Q  135 cccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11523936 cccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 11523837  T
Q  235 aagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11523836 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 11523768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 40813255 - 40813561
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttag 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  40813255 gttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 40813354  T
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40813355 aaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 40813454  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  40813455 aggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcat 40813554  T
Q  297 ttgatcc 303  Q
    |||||||    
T  40813555 ttgatcc 40813561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 68 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491183
Alignment:
Q  68 ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaa 167  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  168 atggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatt 267  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  268 tggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 12491183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 39946790 - 39947091
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagaga--gagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  39946790 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 39946889  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  39946890 aataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagag 39946989  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  39946990 gacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcattt 39947089  T
Q  299 ga 300  Q
    ||    
T  39947090 ga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42854316 - 42854049
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42854316 attaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 42854217  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42854216 ccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaa 42854117  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42854116 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatcc 42854049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 36395299 - 36395009
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36395299 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 36395200  T
Q  99 aataggctt-agatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  36395199 aataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtata 36395100  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36395099 ggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaacactat 36395009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 289
Target Start/End: Original strand, 18125135 - 18125395
Alignment:
Q  28 acatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtaga 127  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18125135 acatgataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtaga 18125234  T
Q  128 gagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaacc 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18125235 gagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaacc 18125333  T
Q  228 attagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | ||||||| || ||||||    
T  18125334 attagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatg 18125395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Original strand, 2796517 - 2796788
Alignment:
Q  28 acatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgta 125  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2796517 acatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 2796616  T
Q  126 gagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaa 225  Q
    ||||||    | ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2796617 gagaga----ctgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaa 2796712  T
Q  226 ccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || |  |||||||||| | ||||| |||| |||| ||| |||||||    
T  2796713 ccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgat 2796788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 303
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932940
Alignment:
Q  40 taggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  8932676 taggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgt 8932775  T
Q  140 -agatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaaga 238  Q
     | ||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8932776 taaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaga 8932875  T
Q  239 tttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||| |||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8932876 tttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatcc 8932940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 302
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121382
Alignment:
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  297 ttgatc 302  Q
    ||||||    
T  21121377 ttgatc 21121382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469772
Alignment:
Q  140 agatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagat 239  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  240 ttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 42469772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 266
Target Start/End: Original strand, 37077772 - 37077951
Alignment:
Q  85 aaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagt 184  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  37077772 aaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggt 37077869  T
Q  185 taaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
     |||| ||| |||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37077870 caaaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 37077951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904952
Alignment:
Q  86 aaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagtt 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  186 aaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacac 285  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| | || ||| ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  286 tatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatcc 26904952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 303
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027767
Alignment:
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  267 ttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc 2027767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 303
Target Start/End: Original strand, 45419203 - 45419472
Alignment:
Q  32 gataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagaga 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  45419203 gataagattaggaatgacaccattagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagata 45419302  T
Q  132 agacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccatta 231  Q
    ||||| ||||| ||  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |   |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  45419303 agacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatta 45419400  T
Q  232 gaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||| |||| |    |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||    
T  45419401 ggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatcc 45419472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8879752 - 8879506
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagag--tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  8879752 attaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagac 8879653  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    |||    |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||  ||  ||||||   |||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8879652 ccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaa 8879557  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacact 286  Q
     |||||||| |||||| || || |||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  8879556 tgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacact 8879506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18752212 - 18751996
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  18752212 atgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata-gcttaga 18752114  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| |||||||||||| || || |||||||||| || | |||| | |||||||||||  | ||| |  |||||||||| |||| || |||||  |    
T  18752113 tggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaagaggtagaggaatacctaaaa 18752014  T
Q  211 aaactattagagaaacca 228  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  18752013 aaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43904914 - 43904710
Alignment:
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| | ||    
T  43904914 aataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacag 43904815  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||| || ||||| ||||||||  |||  | |||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  43904814 gaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaattt 43904715  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  43904714 gatcc 43904710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 29520694 - 29520886
Alignment:
Q  110 atggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagg 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||   |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | | |||||| |||| ||| |||||     
T  29520694 atggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaag-cctaga 29520792  T
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  29520793 aaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 29520886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473448
Alignment:
Q  216 attagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatcc 25473448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 294
Target Start/End: Original strand, 12025842 - 12026005
Alignment:
Q  119 tcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactatt 218  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||            
T  12025842 tcatttagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaaga-------- 12025933  T
Q  219 agagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  12025934 ----aaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtc 12026005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 32043523 - 32043750
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| || ||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  32043523 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaa 32043622  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    | ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||| | |  ||||| || |    
T  32043623 actagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggg 32043722  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaac 226  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||    
T  32043723 gaagacctaaaaaaactattagagaaac 32043750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12797015 - 12796894
Alignment:
Q  33 ataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaa 132  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  12797015 ataagattaggaataacaccattagaaagagtggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaa 12796916  T
Q  133 gacccgtagatgccgtagtaag 154  Q
    ||| ||| ||| |||| |||||    
T  12796915 gactcgttgattccgtcgtaag 12796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45512776 - 45512578
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| |  ||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  45512776 gggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagatta 45512677  T
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaa 265  Q
     ||||  || |||||| | |  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||| | ||||||||    
T  45512676 gatggcagatagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaa 45512578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 302
Target Start/End: Original strand, 25300247 - 25300335
Alignment:
Q  214 ctattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  25300247 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatc 25300335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 303
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931197
Alignment:
Q  75 cctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggagg 174  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||| | |  ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  175 agagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgta 274  Q
    | |||||  | |  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||| |||| | |||| |||||||    
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  275 tgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| |||| |||| | | |||||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatcc 32931197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14742232 - 14742127
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    | | ||||| ||||||||| ||||    
T  14742232 agaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaat---atttttgatagaacactatggcgtc 14742136  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  14742135 atttgatcc 14742127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6510775 - 6510618
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||||| || |   ||||  ||||| ||||||||||||  |||||| | | ||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  6510775 gttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcgtagcacctataatagaaaagttggtagaaaa 6510676  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaaga 158  Q
     |   ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6510675 caaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaaga 6510618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904941
Alignment:
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||||| || | |||||||   | ||||||||||| | |||||||| ||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaa-aaaaatagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    |  ||||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||  |||||| ||||  ||| ||||||| |||| ||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatg 9904941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 302
Target Start/End: Original strand, 25288912 - 25289000
Alignment:
Q  214 ctattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  25288912 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatc 25289000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 303
Target Start/End: Original strand, 30559723 - 30559930
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||   |||||||| | | | ||||| |||||||| ||||   | |  ||||  |    
T  30559723 gaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactagagata 30559822  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtca 295  Q
    ||  ||||| ||  |||||||| |||||||| || || |||||||||||| | |||||| |||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||| |    
T  30559823 gatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaa 30559922  T
Q  296 tttgatcc 303  Q
    ||||||||    
T  30559923 tttgatcc 30559930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529462
Alignment:
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatcc 44529462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047577
Alignment:
Q  239 tttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatcc 44047577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 277
Target Start/End: Original strand, 5266027 - 5266140
Alignment:
Q  163 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatcc 262  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||    
T  5266027 atcaaacggaggagagt-aagtcagaagaggtagagaaagacctagaaaaactatcatagaaatcattataatggatttggaggtcaatgagttgaatcc 5266125  T
Q  263 aaatttggtgtatga 277  Q
    |||||| || |||||    
T  5266126 aaatttagtttatga 5266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215457
Alignment:
Q  227 cattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatcc 15215457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35362851 - 35362695
Alignment:
Q  147 gtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagagg 246  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |    | |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||      
T  35362851 gtagcaaggagagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaa 35362752  T
Q  247 tcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||||| ||||   |||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  35362751 ttaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 35362695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643668
Alignment:
Q  77 tatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaa----atgga 172  Q
    ||||||| ||||| || | ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||      ||   |||||||| ||| ||||||||     ||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac------at---gtagtaaggagaatagatcaatcagctgga 35643782  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtg 272  Q
    ||| |||||  |||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||||  |||||| ||||| | |||||| |||||| |||| ||||     
T  35643781 ggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtt 35643682  T
Q  273 tatgatacaacact 286  Q
    ||||||| ||||||    
T  35643681 tatgatagaacact 35643668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584522
Alignment:
Q  102 aggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaa 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||| ||||||| ||| |||   ||||  | |||||||| ||| |||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  202 gacctaggaaaactat 217  Q
    ||||||| ||||||||    
T  42584507 gacctagaaaaactat 42584522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 303
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700513
Alignment:
Q  58 agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaag 157  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||   |||| | ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||  | ||| | |||||||| ||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  158 actagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctg 257  Q
    | ||||| | |||||||| |||||  | |  ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||| | ||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcg 29700467  T
Q  258 gatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    || | |||||| || ||||||| |||| ||||  || |||||||||    
T  29700468 gaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatcc 29700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10080146 - 10079995
Alignment:
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||   |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| | |  ||||| |||| |||||||||    
T  10080146 gatggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacctag 10080047  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggat 260  Q
      ||||||| ||| ||||  |||  |||||| ||||| | |||||| |||||    
T  10080046 agaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggat 10079995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 12492191 - 12492116
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacc 76  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12492191 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagagaatgggggtagcacc 12492116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  19 taagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtg--tgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggttt 116  Q
    ||||| || ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||| |||| || ||| ||||| || | |||  | ||||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  117 ggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    || ||||||||||||| || ||||| | | |||||||| ||| |||||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30113517 - 30113416
Alignment:
Q  30 atgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtaga 127  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||    
T  30113517 atgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatataga 30113418  T
Q  128 ga 129  Q
    ||    
T  30113417 ga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41972072 - 41971991
Alignment:
Q  53 attagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| || | ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972072 attagagagagttagggtaacaccta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Original strand, 36143395 - 36143480
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtca 181  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| | |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||    
T  36143395 gaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtca 36143480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2776510 - 2776434
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagat 143  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| | || |||||| | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776510 gggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 9695632 - 9695708
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagat 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  9695632 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10824439 - 10824331
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    |||||| |||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||| | |||||   |||||| | ||| |||||||||||||    
T  10824439 cacctaaagtagaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatgga 10824340  T
Q  173 ggagagtca 181  Q
    ||| |||||    
T  10824339 ggatagtca 10824331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28269826 - 28269759
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaattt 268  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28269826 aagacctagaaaaattataagagaaactattagcaa-gatttagaggttaatgagttggatccaaattt 28269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439530
Alignment:
Q  212 aactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Original strand, 30748493 - 30748560
Alignment:
Q  102 aggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaat 169  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| | | ||||||||||    
T  30748493 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaat 30748560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 15215620 - 15215558
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag 63  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15215620 gttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagag 15215558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 42493610 - 42493536
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttgg 118  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||    
T  42493610 aatgacaacattggagagagttggggtaacacctatagtagaaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041399
Alignment:
Q  218 tagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaa 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa 45041399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 303
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490572
Alignment:
Q  234 aaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 490572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 302
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584595
Alignment:
Q  234 aaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||| || |||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatc 42584595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44681374 - 44681251
Alignment:
Q  15 gtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatg 112  Q
    ||||||||| || ||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  || |  ||| |||||||| || ||||| || | ||||||| ||||||| |    
T  44681374 gtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataagcttagaag 44681275  T
Q  113 gtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||||||  || |||||||||||||    
T  44681274 gtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3244000 - 3243698
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| |||||| |||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  3244000 gttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaa 3243901  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3243900 taggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagga 3243801  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3243800 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 3243701  T
Q  301 tcc 303  Q
    |||    
T  3243700 tcc 3243698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 3866005 - 3866309
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatt--agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3866005 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaa 3866104  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  3866105 aataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagag 3866204  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3866205 gaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcattt 3866304  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  3866305 gatcc 3866309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 8180713 - 8181017
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8180713 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 8180812  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8180813 aataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagag 8180912  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  8180913 gaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcattt 8181012  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  8181013 gatcc 8181017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38453038 - 38452731
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag------tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgtt 94  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||      || ||||| || |||||||| |||||||| |    
T  38453038 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagttggt 38452939  T
Q  95 agaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  38452938 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggt 38452840  T
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  38452839 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacactatggtgtc 38452740  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    ||| |||||    
T  38452739 attcgatcc 38452731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 36183384 - 36183688
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36183384 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 36183483  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36183484 aataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 36183583  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | |||||    
T  36183584 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccattt 36183683  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  36183684 gatcc 36183688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 38429817 - 38430121
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggt--aacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  38429817 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaa 38429916  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  38429917 aataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagag 38430016  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  38430017 gaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcattt 38430116  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  38430117 gatcc 38430121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12734634 - 12734937
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  12734634 gttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaa 12734733  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga-ggcagaga 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||     
T  12734734 taggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagg 12734833  T
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  || |||||    
T  12734834 gagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttg 12734933  T
Q  300 atcc 303  Q
    ||||    
T  12734934 atcc 12734937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610825
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatcc 2610825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451693
Alignment:
Q  87 aagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagtta 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  187 aaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacact 286  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  287 atgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||| |||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatcc 451693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41197567 - 41197272
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagaga--gagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  41197567 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggctta 41197468  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagtt-aaaagaggcagagaaagaccta 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  41197467 gatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagaccta 41197368  T
Q  208 ggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  41197367 agaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatcc 41197272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18424714 - 18424422
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || | ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18424714 atgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 18424615  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  18424614 tggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacatagga 18424515  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || | ||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18424514 aaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatcc 18424422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11992445 - 11992153
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11992445 atgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttaga 11992346  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||| ||    
T  11992345 tggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacctaaga 11992246  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || | | ||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  11992245 aaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatcc 11992153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 4807525 - 4807832
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag------tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgtt 94  Q
    |||| |||| |||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||      || ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  4807525 gttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 4807624  T
Q  95 agaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggc 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4807625 agaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggt 4807723  T
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4807724 agatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtc 4807823  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  4807824 atttgatcc 4807832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45367963 - 45367670
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg-taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttag 109  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  45367963 atgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataaccttag 45367864  T
Q  110 atggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagg 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  | |    
T  45367863 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagactcaag 45367764  T
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45367763 aaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 45367670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 303
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834915
Alignment:
Q  39 ttaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  135 cccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 234  Q
    || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggag--gagttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  235 aagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatcc 25834915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326205
Alignment:
Q  108 agatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagaccta 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  208 ggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 7326205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41763380 - 41763088
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg-taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttag 109  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41763380 atgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 41763281  T
Q  110 atggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagg 209  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  41763280 gtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacctaag 41763181  T
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || | | ||||| |||||   | |||||||||||||    
T  41763180 aaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttgatcc 41763088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 303
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508915
Alignment:
Q  137 cgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaa 236  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  237 gatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 28508915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24583908 - 24583719
Alignment:
Q  72 acacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgg 171  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  24583908 acacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgg 24583809  T
Q  172 aggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatc 261  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||  |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24583808 aggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 24583719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 301
Target Start/End: Original strand, 23997560 - 23997837
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggt--aacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||||   |||| ||| |||||||||| ||||    
T  23997560 atgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaaatttggtagaaaatagcctta 23997656  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||     
T  23997657 gatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtggaagaagacctaa 23997756  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    ||            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  23997757 ga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttgat 23997837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 303
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029818
Alignment:
Q  123 gtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagag 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||  ||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  223 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatcc 39029818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 298
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643180
Alignment:
Q  183 gttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaa 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  283 cactatgacgtcattt 298  Q
    ||||||||| ||||||    
T  35643165 cactatgacatcattt 35643180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6238014 - 6237812
Alignment:
Q  87 aagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagtta 186  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |    
T  6238014 aagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtca 6237915  T
Q  187 aaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacact 286  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| | || ||||||| ||||||    
T  6237914 aaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacact 6237815  T
Q  287 atg 289  Q
    |||    
T  6237814 atg 6237812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 302
Target Start/End: Original strand, 12141545 - 12141780
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  12141545 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatca 12141644  T
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
     || ||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||  |||||||||||    
T  12141645 gattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaat 12141744  T
Q  267 ttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
     |||| ||||||| |||| |||| | | ||||||||    
T  12141745 atggtatatgatagaacattatggcatgatttgatc 12141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 303
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959758
Alignment:
Q  170 ggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttg 269  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 31959724  T
Q  270 gtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    || ||||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  31959725 gtttatgatagaacactatggcataatttgatcc 31959758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43751992
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||   |||||| |     
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtaggg 43752140  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| ||||||| |||||||| | |||  | |   |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  | ||||||     
T  43752139 agagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 43752040  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| | |||  |||||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  43752039 tggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatcc 43751992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9556717 - 9556433
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || ||  ||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||  |||    
T  9556717 gttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaatggtg-gaa 9556619  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| | || |||| |||||||| ||||||  ||  ||||||| ||    
T  9556618 aataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactagaggcaaag 9556519  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
     ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  |||||| ||| | | |||||| |||||| | || |||| ||||||| ||||    
T  9556518 gaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaaca 9556433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Original strand, 41545376 - 41545640
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattag--agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaa-gttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||  |||||||| |||||     
T  41545376 attaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaagaagt 41545475  T
Q  135 ccc-gtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattaga 233  Q
    | | ||||||| ||| ||||||    || |||| ||||||||  ||||||  ||||||| |   | |||| | || |||||||| ||||||||||||| |    
T  41545476 ctctgtagatgtcgttgtaagag---tatatcagatggaggattgtcaagccaaaagagacgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccattata 41545572  T
Q  234 aaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  41545573 aaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgat 41545640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 38434921 - 38435189
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagag--tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggc-ttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |  ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| ||| | || | |||||||| |||||| ||||||||    
T  38434921 attagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaaga 38435020  T
Q  135 cccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 234  Q
    |  ||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  | |  ||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |    
T  38435021 cttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaaga 38435120  T
Q  235 aagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| ||||| | |||| | |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| ||| |||||||||    
T  38435121 aagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatcc 38435189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 303
Target Start/End: Original strand, 18958908 - 18959148
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggt----catgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactag 162  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||| | || |   |||||||| ||| |||    
T  18958908 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagtag 18959007  T
Q  163 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatcc 262  Q
    |||| |||||||| |||||  | |  |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| || || ||||| || ||| | |||||| ||||||     
T  18959008 atcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatca 18959107  T
Q  263 aaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||| | | |||||||||    
T  18959108 aaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatcc 18959148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 303
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306269
Alignment:
Q  224 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 30306269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 303
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227426
Alignment:
Q  237 gatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 227426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238296
Alignment:
Q  62 agtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgcc 146  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaaga-ccgtagatgcc 43238296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9996766 - 9996671
Alignment:
Q  208 ggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| | | |||||||||    
T  9996766 ggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatcc 9996671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 16097274 - 16097192
Alignment:
Q  60 agagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtaga 142  Q
    |||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16097274 agagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543119
Alignment:
Q  186 aaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacac 285  Q
    |||||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  286 tatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||| |||  |||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatc 45543119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328415
Alignment:
Q  227 cattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatcc 38328415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Original strand, 21834635 - 21834779
Alignment:
Q  147 gtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagagg 246  Q
    |||||||||||| || ||||||| || || || ||  ||| |||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||| ||     
T  21834635 gtagtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatagaaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttataga 21834734  T
Q  247 tcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgac 291  Q
    | |||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  21834735 ttaatgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgac 21834779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Original strand, 13149350 - 13149569
Alignment:
Q  85 aaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagt 184  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||  ||||   ||||| ||||| | |||||||| |||||  |    
T  13149350 aaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctcgaagagtagataagatggaggaaagtcagat 13149449  T
Q  185 taaaagaggc-agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaac 283  Q
     | |||| |  |||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||  | |||||||| | ||  |||||| |||    
T  13149450 cagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaac 13149549  T
Q  284 actatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||||| | |||||||||    
T  13149550 attatgacataatttgatcc 13149569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 259
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543428
Alignment:
Q  105 cttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagac 204  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||  | |  ||||| || |  ||||    
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  205 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctgga 259  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||| ||||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 42543428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Original strand, 3481171 - 3481256
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtca 181  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| | |||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  3481171 gaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatcagatggaggatagtca 3481256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 303
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496103
Alignment:
Q  234 aaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 9496103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 26850272 - 26850393
Alignment:
Q  103 ggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaag 202  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||  || ||   |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |  | |||||||||||     
T  26850272 ggcttaggtggttcggccatgtagagagaagacctatatattatgtagtaaggagactagatcagatggaggatagtcaaatcactaaaggcagagaaaa 26850371  T
Q  203 acctaggaaaactattagagaa 224  Q
    |||||| ||| |||| ||||||    
T  26850372 acctagaaaatctataagagaa 26850393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26784499 - 26784404
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| || ||  |||| |||| ||||||| ||||    
T  26784499 agaggcagagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgataaaaca 26784404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35755434 - 35755290
Alignment:
Q  163 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagagg----tcaatgagctgg 258  Q
    |||| |||||||| |||||  | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    | |||| | |||    
T  35755434 atcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttgg 35755335  T
Q  259 atccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||    
T  35755334 atccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatcc 35755290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 11017280 - 11017422
Alignment:
Q  32 gataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagaga 131  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||| |||||||   |||| ||||||||||| ||||| |  | |||| | ||||||  ||||||||  |||| ||||||    
T  11017280 gataagattaggaatgaaaatattaaagagagttgaggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagaga 11017379  T
Q  132 agacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggagg 174  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  11017380 agacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaaatggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635368
Alignment:
Q  246 gtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 3635368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 303
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743766
Alignment:
Q  223 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || | ||| ||| |||| |||| | | |||||||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatcc 30743766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 37481929 - 37481830
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||   ||||||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  37481929 attagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 37481830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 132
Target Start/End: Original strand, 41330131 - 41330195
Alignment:
Q  68 ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaa 132  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41330131 ggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9579050 - 9578915
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| || | ||||||  ||||  |||||||   |||||||||||  |||| |||| |||||||  |||| || |  ||||    
T  9579050 gttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgacaatgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgtaaaa 9578951  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9578950 tagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 9578915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Original strand, 11412697 - 11412807
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtag 141  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||  || | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  11412697 aatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtag 11412796  T
Q  142 atgccgtagta 152  Q
    || | ||||||    
T  11412797 attctgtagta 11412807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12882193 - 12882090
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||| | || ||| |||||    
T  12882193 aagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttg 12882094  T
Q  300 atcc 303  Q
    ||||    
T  12882093 atcc 12882090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Original strand, 33504346 - 33504461
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagag-gtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacacta 287  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||  | ||| || |||||  |||| |||| ||||||| |||| ||    
T  33504346 agaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacatta 33504445  T
Q  288 tgacgtcatttgatcc 303  Q
    || ||| |||||||||    
T  33504446 tggcgtaatttgatcc 33504461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 134
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907748
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaaga 907748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13240997 - 13240927
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  13240997 gaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatca 13240927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13444096 - 13443954
Alignment:
Q  160 tagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctgga 259  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| || || ||| ||| |||| |||||||  |||  ||||  ||||||  | |||||| |||     
T  13444096 tagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaattattgaaaaaattttagatattaatgagatggg 13443997  T
Q  260 tccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
     |||||| |||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13443996 cccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatc 13443954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13592540 - 13592410
Alignment:
Q  106 ttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacc 205  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||  |||||| | || ||||||    
T  13592540 ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttcaagaggtataggaagacc 13592441  T
Q  206 taggaaaactattagagaaaccattagaaaa 236  Q
    ||| | |||||| |||||||| || ||||||    
T  13592440 tagaagaactataagagaaactatcagaaaa 13592410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 63
Target Start/End: Original strand, 2610466 - 2610523
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag 63  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  2610466 gttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagag 2610523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12475009 - 12474972
Alignment:
Q  266 tttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12475009 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 12474972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336938
Alignment:
Q  234 aaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 19336938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23714607 - 23714427
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || |||  |||  ||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || | ||||     
T  23714607 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt-tgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaac 23714509  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaa 182  Q
    ||| ||||  | |||| | ||||||||||||||||  || |||   |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  23714508 tagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaa 23714427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24102279 - 24102099
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || |||  |||  ||||  ||||||  ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || | ||||     
T  24102279 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt-tgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaac 24102181  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaa 182  Q
    ||| ||||  | |||| | ||||||||||||||||  || |||   |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||    
T  24102180 tagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaa 24102099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573175
Alignment:
Q  190 gaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||| | ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || | ||||||  |||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  290 acgtcatttgatcc 303  Q
     ||| |||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatcc 43573175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 135
Target Start/End: Original strand, 41858768 - 41858800
Alignment:
Q  103 ggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41858768 ggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 44438002 - 44437934
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  44438002 gggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagac 44437934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Original strand, 49029214 - 49029513
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaatag 103  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  49029214 gttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 49029313  T
Q  104 gcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaaga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  49029314 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 49029413  T
Q  204 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49029414 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 49029513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 11593893 - 11594197
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatt--agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11593893 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 11593992  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11593993 aatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 11594092  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11594093 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 11594192  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  11594193 gatcc 11594197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 34869353 - 34869657
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  34869353 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 34869452  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34869453 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagag 34869552  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34869553 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 34869652  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  34869653 gatcc 34869657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12841624 - 12841320
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12841624 gttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 12841525  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12841524 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 12841425  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12841424 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcattt 12841325  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  12841324 gatcc 12841320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35906550 - 35906246
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35906550 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 35906451  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35906450 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 35906351  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35906350 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 35906251  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  35906250 gatcc 35906246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 37617877 - 37618182
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37617877 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 37617976  T
Q  99 aa-taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37617977 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 37618076  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatt 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  37618077 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatt 37618176  T
Q  298 tgatcc 303  Q
    ||||||    
T  37618177 tgatcc 37618182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33350145 - 33349851
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33350145 atgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggctta 33350046  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33350045 gatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 33349946  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||    
T  33349945 gaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatcc 33349851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 43281619 - 43281911
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  43281619 atgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 43281718  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  43281719 tggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaaga 43281818  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43281819 aaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 43281911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44855521 - 44855223
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||    
T  44855521 gttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggtagaa 44855422  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  44855421 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagag 44855322  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  44855321 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaattt 44855224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13859345 - 13859061
Alignment:
Q  13 gagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13859345 gagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 13859246  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  13859245 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctagga 13859146  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  13859145 aaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39906714 - 39906417
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtg--ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaatag 103  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39906714 gttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 39906615  T
Q  104 gcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaaga 203  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  39906614 gcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggag--tcaagttaaaagaggtagaggaaga 39906517  T
Q  204 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39906516 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 39906417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45836819 - 45836527
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45836819 atgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 45836720  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  | |||| ||||  ||||||||    
T  45836719 gatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggtt--atgaggtagagggagacctag 45836622  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45836621 gacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 45836527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 36651927 - 36652229
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||  || | |||||| |||||||| |||||||    
T  36651927 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagggtaggggtggcatccatagtagaaaagttggtagaaaa 36652026  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  36652027 taggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagagga 36652126  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36652127 agacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 36652226  T
Q  301 tcc 303  Q
    |||    
T  36652227 tcc 36652229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46356205 - 46355901
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag--tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  46356205 gttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 46356106  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46356105 aataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 46356006  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  46356005 gaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcattt 46355906  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  46355905 gatcc 46355901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 31005156 - 31005430
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31005156 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31005255  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31005256 aataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 31005355  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgt 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31005356 gaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggtgt 31005430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 6374838 - 6375105
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6374838 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac 6374937  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    | |||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6374938 cagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 6375037  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
      |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6375038 gaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 6375105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 66 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31682884 - 31682647
Alignment:
Q  66 tgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatc 165  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  31682884 tgggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatc 31682785  T
Q  166 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |    
T  31682784 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccata 31682685  T
Q  266 tttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31682684 tttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 31682647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35559343 - 35559038
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatt--agagagagtgtgggtaacacct-atagtaaaaaagttgttaga 97  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | |  |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  35559343 gttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaaagttggtaga 35559244  T
Q  98 aaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35559243 aaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 35559144  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatt 297  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||| |||  | |||||    
T  35559143 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacattatagcatcatt 35559044  T
Q  298 tgatcc 303  Q
    ||||||    
T  35559043 tgatcc 35559038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 29650354 - 29650621
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccatt--agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29650354 attaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 29650453  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29650454 ccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaa 29650553  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  29650554 agatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatcc 29650621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 43491278 - 43491545
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43491278 attaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 43491377  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43491378 ccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaa 43491477  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
      |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||| |||||||||| || |||| ||||    
T  43491478 gaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatcc 43491545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885767
Alignment:
Q  57 gagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaa 156  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  157 gactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagct 256  Q
    || ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  257 ggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatcc 2885767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Original strand, 22349627 - 22349857
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || | | ||||||||| |||||||||||||    
T  22349627 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaatgga 22349726  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||     
T  22349727 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaatttggta 22349826  T
Q  273 tatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  22349827 tatgatagaatactatggcgtcatttgatcc 22349857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 33072887 - 33073108
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33072887 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 33072986  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
T  33072987 taggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagagga 33073086  T
Q  201 agacctaggaaaactattagag 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  33073087 agacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 67 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36869525 - 36869289
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||    
T  36869525 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagatca 36869426  T
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||    
T  36869425 aatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaaat 36869326  T
Q  267 ttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36869325 ttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 36869289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 38606948 - 38607229
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatta-gagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttag 109  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  38606948 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacattaagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttag 38607047  T
Q  110 atggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagg 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |    
T  38607048 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagaggaagacctaag 38607147  T
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |            ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  38607148 a------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatcc 38607229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 76 - 303
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682411
Alignment:
Q  76 ctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggagga 175  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  176 gagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtat 275  Q
     |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  276 gatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatcc 15682411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23404361 - 23404640
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattag--agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  23404361 atgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaaataggctta 23404460  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    ||  |||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||    
T  23404461 gacagtttgg-catgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctag 23404559  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| ||   ||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  23404560 gaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 179 - 303
Target Start/End: Original strand, 38900070 - 38900194
Alignment:
Q  179 tcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgat 278  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38900070 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 38900169  T
Q  279 acaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
      ||||||||| |||||||||||||    
T  38900170 tgaacactatggcgtcatttgatcc 38900194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 302
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631800
Alignment:
Q  105 cttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagac 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  205 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    ||| ||            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  32631715 ctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatc 32631800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 303
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273337
Alignment:
Q  120 catgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactatta 219  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||   |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |    
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  220 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatcc 7273337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598269
Alignment:
Q  124 tagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagaga 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  224 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaat 24598269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Original strand, 36136735 - 36136982
Alignment:
Q  39 ttaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||| |||    
T  36136735 ttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacc 36136834  T
Q  137 cgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaa 236  Q
      ||||||  |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||  | | |||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||    
T  36136835 tatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaa 36136934  T
Q  237 gatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  36136935 gatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaaca 36136982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979973
Alignment:
Q  183 gttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaa 282  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  283 cactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatcc 40979973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28628185 - 28627978
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||   |||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||| | | |||||| |    
T  28628185 gaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggta 28628086  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtca 295  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| |    
T  28628085 gaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaa 28627986  T
Q  296 tttgatcc 303  Q
    ||||||||    
T  28627985 tttgatcc 28627978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46014498 - 46014359
Alignment:
Q  32 gataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagaga 129  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46014498 gataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagaga 46014400  T
Q  130 gaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatg 170  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  46014399 gaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681065
Alignment:
Q  139 tagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaaga 238  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  239 tttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatcc 31681065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 7272972 - 7273151
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||||| || ||||| ||||||| || ||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||   |||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7272972 gttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaa 7273071  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagag 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  7273072 aataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 48919241 - 48919349
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  48919241 agagagagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtc 48919340  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  48919341 atttgatcc 48919349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 303
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078154
Alignment:
Q  217 ttagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatcc 21078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Original strand, 47848664 - 47848896
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| || | ||| ||||     
T  47848664 agagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaagg 47848763  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||   | |  |||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||| | | | |||||||    
T  47848764 agagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactatt-ggaaagatttggggattaatgagc 47848862  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  47848863 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatg 47848896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38135464 - 38135258
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  | |  |||||||    
T  38135464 gaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcagatcattagaggca 38135366  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtca 295  Q
    ||  ||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||| | |||| |||  ||||||| || | |||| ||| |    
T  38135365 gatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaa 38135266  T
Q  296 tttgatcc 303  Q
    ||||||||    
T  38135265 tttgatcc 38135258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8492545 - 8492282
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||  | |||||||| |||||    
T  8492545 attacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaataggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagac 8492446  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
      |||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||| || |  ||| |||||| ||||||||||| | |||||  |||| |  |||  |||| ||    
T  8492445 ttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaaagacc-acgaaaa--attataataactgttaggaa 8492349  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||| || |||||| | | ||||||||    
T  8492348 agatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatc 8492282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 303
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649017
Alignment:
Q  223 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatcc 27649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9210852 - 9210749
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  9210852 aagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacattatggcgtaatttg 9210753  T
Q  300 atcc 303  Q
    ||||    
T  9210752 atcc 9210749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36514554 - 36514371
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| |||||  ||||  ||||| || |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  36514554 gttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaac 36514455  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagt 184  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  || ||| | |||||| | ||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  36514454 tagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatagaggggagtcaagt 36514371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7189518 - 7189320
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagt---- 151  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |  ||||||  |||||        
T  7189518 agagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgta 7189419  T
Q  152 --aagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaac-cattagaaaagatttagaggt 247  Q
      | ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| | |||| ||||||||| |||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  7189418 gtatgaagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggt 7189320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 303
Target Start/End: Original strand, 33139208 - 33139391
Alignment:
Q  120 catgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactatta 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || | || |||||| ||||| |||| |||||||  |||| ||||| ||||||||| |  |    
T  33139208 catgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaagagttaagtcaaaagagatagagtaagacataggaaaaccacaa 33139307  T
Q  220 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||| |  ||||| | || ||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  33139308 gagaaacacttaaaaatgatttcgaggttaatgaactgaagtcaaatatagtttatgatacaccattatgatgtaatttgatcc 33139391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19262742 - 19262609
Alignment:
Q  39 ttaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccg 138  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| || |||||| | ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  19262742 ttagaaatgacaatattagagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctg 19262643  T
Q  139 tagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggag 173  Q
    |||||   |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19262642 tagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 303
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073166
Alignment:
Q  242 agaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatcc 33073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 32630538 - 32630636
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatt--agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32630538 atgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25579388 - 25579205
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgg-gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| || ||| |||| |||| | ||||  || | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||     
T  25579388 attagaaatgaccacattagagagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagaca 25579289  T
Q  137 cgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattag 220  Q
     |||||| | || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||| | | |||||  | |  ||||||||| |||||||||||    
T  25579288 tgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcacaagagttaaatgaagacctagaaaaactattag 25579205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21517528 - 21517426
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||| | ||| || ||||||||||| || | ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21517528 aagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttg 21517429  T
Q  300 atc 302  Q
    |||    
T  21517428 atc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601713
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | |||||| |||||| |||| || | ||||||| ||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  289 gacgtcatttgatcc 303  Q
    |  || |||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatcc 45601713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 264
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011245
Alignment:
Q  122 tgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattaga 221  Q
    ||||||||||||||   ||||||  |||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  222 gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaa 264  Q
    ||||  ||||| ||| ||||| |||| |||||  |||||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa 1011245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 302
Target Start/End: Original strand, 1569070 - 1569252
Alignment:
Q  120 catgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactatta 219  Q
    |||||||||||||| |  |||||||  |||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||  ||   ||||||||||  || ||||| |||||||| |    
T  1569070 catgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaaactataa 1569169  T
Q  220 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    ||| ||| ||||  |||||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| || | ||| ||||||||    
T  1569170 gagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatc 1569252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Original strand, 12966029 - 12966123
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaa 167  Q
    ||||||||| | ||||| || | |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||    
T  12966029 cacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaa 12966123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 36869638 - 36869576
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36869638 gttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 36869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202827
Alignment:
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||| | |  | |||||||| |    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  201 agacctaggaaaactattagaga 223  Q
    || ||||| |||||||| |||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagaga 48202827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035199
Alignment:
Q  238 atttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 34035199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36102077 - 36101977
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagag--agagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  ||||||  |||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  36102077 attagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagac 36101978  T
Q  136 c 136  Q
    |    
T  36101977 c 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 201
Target Start/End: Original strand, 26925257 - 26925345
Alignment:
Q  113 gtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaa 201  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| | || ||||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  26925257 gtttgttcatgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagagaaa 26925345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Original strand, 40169650 - 40169726
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagat 143  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169650 gggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6420742 - 6420615
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| ||||||| ||| | || |||||  | |  |||||||    
T  6420742 gaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcactagaggca 6420643  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagaga 223  Q
    |||  |||||||  |||||||| |||||    
T  6420642 gaggtagacctataaaaactataagaga 6420615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 164
Target Start/End: Original strand, 42187438 - 42187568
Alignment:
Q  36 atattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaag 133  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||| ||  ||||| |||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  42187438 atattagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T
Q  134 acccgtagatgccgtagtaagaagactagat 164  Q
     || ||||||   |||||||| ||| |||||    
T  42187538 gcctgtagattatgtagtaaggagagtagat 42187568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48736192 - 48736073
Alignment:
Q  55 tagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaag 154  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||   ||||| ||    
T  48736192 tagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttag 48736093  T
Q  155 aagactagatcaaatggagg 174  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  48736092 gagagtagatcaaatggagg 48736073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531438
Alignment:
Q  122 tgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattaga 221  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| | ||||||| ||  ||||||| ||  | |||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  222 gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
     |||  ||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggt 1531438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36239934 - 36239841
Alignment:
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||||| || | ||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  36239934 aaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 36239841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 289
Target Start/End: Original strand, 37976369 - 37976458
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| | ||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  37976369 aagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatg 37976458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Original strand, 45558351 - 45558468
Alignment:
Q  55 tagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaag 154  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||| |||||||  || |||||||||| ||| || ||| | ||||| ||    
T  45558351 tagagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaatacctgtggattctgtagttag 45558450  T
Q  155 aagactagatcaaatgga 172  Q
     ||| ||||||| |||||    
T  45558451 gagagtagatcagatgga 45558468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 5335892 - 5336036
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagaccc 137  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||  ||||| || ||||||||  |||| || | |||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |     
T  5335892 attagaaatgataacattagagagagttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaact 5335991  T
Q  138 gtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaa 182  Q
    || ||| | ||||| || ||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  5335992 gtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaa 5336036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24549945 - 24549902
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgt 139  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24549945 gaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgt 24549902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 24598495 - 24598440
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatta 56  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24598495 gttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccatta 24598440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28208420 - 28208373
Alignment:
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28208420 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 28208373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 135
Target Start/End: Original strand, 35713725 - 35713764
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35713725 gaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 35713764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Original strand, 43282398 - 43282477
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  43282398 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 135
Target Start/End: Original strand, 7220751 - 7220813
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7220751 cacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 7220813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 303
Target Start/End: Original strand, 14057625 - 14057715
Alignment:
Q  213 actattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||    
T  14057625 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatcc 14057715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 303
Target Start/End: Original strand, 14367653 - 14367743
Alignment:
Q  213 actattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||    
T  14367653 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatcc 14367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27893843 - 27893769
Alignment:
Q  53 attagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtaga 127  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| || || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27893843 attagagagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Original strand, 30632954 - 30633035
Alignment:
Q  52 cattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaag 133  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||  || | |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30632954 cattagagagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28562567 - 28562443
Alignment:
Q  147 gtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagagg 246  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||| | ||| |  ||| |||||| |||| | ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||     
T  28562567 gtagtaagaagattagatcagatagagaatagttagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagaga 28562468  T
Q  247 tcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    | || ||| ||||||| ||| ||||    
T  28562467 ttaacgagttggatcctaatatggt 28562443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30200308 - 30200175
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || |   ||||  ||||| ||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||| || | ||||     
T  30200308 gttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagag--ttagggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaac 30200211  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||||||||| || ||| | |||||| | ||||||||    
T  30200210 taggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 301
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859110
Alignment:
Q  237 gatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgat 31859110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 131
Target Start/End: Original strand, 38920795 - 38920859
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagaga 131  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  38920795 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31960163 - 31959859
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31960163 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31960064  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31960063 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 31959964  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31959963 gaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 31959864  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  31959863 gatcc 31959859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48174442 - 48174138
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48174442 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaa 48174343  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48174342 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 48174243  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  48174242 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcattt 48174143  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  48174142 gatcc 48174138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 4440798 - 4441090
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4440798 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 4440897  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4440898 tggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 4440997  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4440998 aaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 4441090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1777364 - 1777062
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1777364 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggaaatagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaa 1777265  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1777264 taggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 1777165  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  1777164 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtatggcgtcatttga 1777065  T
Q  301 tcc 303  Q
    |||    
T  1777064 tcc 1777062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52569864 - 52569560
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  52569864 gttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 52569765  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52569764 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 52569665  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52569664 gaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 52569565  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  52569564 gatcc 52569560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 56375223 - 56375527
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  56375223 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaa 56375322  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56375323 aacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 56375422  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56375423 gaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 56375522  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  56375523 gatcc 56375527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48622880 - 48622588
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  48622880 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 48622781  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  48622780 tggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 48622681  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  48622680 aaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatcc 48622588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 53707727 - 53708031
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| |||||| |||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  53707727 gttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 53707826  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53707827 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagag 53707926  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53707927 gaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattt 53708026  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  53708027 gatcc 53708031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 33227152 - 33227446
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33227152 atgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 33227251  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  33227252 gattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctag 33227351  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33227352 gaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatcc 33227446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 436162 - 436466
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| |||||| |||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  436162 gttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 436261  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  436262 aataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 436361  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  436362 gaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcattt 436461  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  436462 gatcc 436466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33191187 - 33190896
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  33191187 atgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 33191088  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33191087 gattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 33190988  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33190987 gaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttga 33190896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 43433851 - 43434161
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag--------tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttg 92  Q
    |||| |||| |||||||| |||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||        || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43433851 gttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 43433950  T
Q  93 ttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 192  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43433951 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 43434050  T
Q  193 gcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacg 292  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||    
T  43434051 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcg 43434150  T
Q  293 tcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||    
T  43434151 tcatttgatcc 43434161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 37797785 - 37798087
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37797785 gttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 37797884  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||    
T  37797885 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagag 37797983  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  37797984 gaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcattt 37798083  T
Q  299 gatc 302  Q
    ||||    
T  37798084 gatc 37798087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23906650 - 23906342
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag--------tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttg 92  Q
    |||| |||| |||||||| |||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||        || ||||| ||||||||||| |||||||     
T  23906650 gttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttt 23906551  T
Q  93 ttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 192  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23906550 gtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaag 23906453  T
Q  193 gcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacg 292  Q
    | | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23906452 gtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 23906353  T
Q  293 tcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||    
T  23906352 tcatttgatcc 23906342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 46583136 - 46582870
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||    
T  46583136 attaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agac 46583039  T
Q  136 cc-gtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 234  Q
    || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  46583038 cccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaa 46582939  T
Q  235 aagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  46582938 aggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatcc 46582870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 50286904 - 50287185
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||    |||||||||| |||||||| |||||||    
T  50286904 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag---ggg----acctatagtagaaaagttggtagaaaa 50286996  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  50286997 tagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaaga 50287096  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  50287097 agacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacactatg 50287185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27450483 - 27450225
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagat 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27450483 aatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagat 27450384  T
Q  144 gccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttag 243  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | || |||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27450383 gccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttag 27450284  T
Q  244 aggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || | | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27450283 aggtcaatgagttggatccaaatatgat-tttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 27450225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39100872 - 39100618
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  39100872 atgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttaga 39100773  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39100772 tggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatg-cgttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctagga 39100674  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39100673 aaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaat 39100618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 47265541 - 47265255
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatta--gagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||    
T  47265541 atgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggttta 47265442  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagac-------ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaa 201  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  47265441 gatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagaggtagaggaa 47265342  T
Q  202 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  47265341 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactat 47265255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 28236128 - 28236395
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    |||| |||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  28236128 atgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggcttaga 28236227  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  28236228 tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagacctagga 28236326  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgata 279  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28236327 aaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgata 28236395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37773789 - 37773497
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg-taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttag 109  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  37773789 atgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaaggggtagcacctatagtagaaaagtcggtagaaaataggcttag 37773690  T
Q  110 atggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagg 209  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||  ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || |||||||    
T  37773689 atggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagatgaatacctagg 37773590  T
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  37773589 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacactatgacataatttgatc 37773497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 303
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708670
Alignment:
Q  47 gacaccattag--agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatg 144  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  145 ccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaga 244  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  245 ggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatcc 39708670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 303
Target Start/End: Original strand, 8286459 - 8286676
Alignment:
Q  94 tagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286459 tagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaagagg 8286558  T
Q  194 c--------agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacac 285  Q
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8286559 acaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacac 8286658  T
Q  286 tatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8286659 tatgacgtcatttgatcc 8286676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 302
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192269
Alignment:
Q  58 agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaag 157  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  158 actagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctg 257  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  258 gatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgatc 20192269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037550
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaaga 26037698  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  26037697 agagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgagt 26037598  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||    
T  26037597 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatcc 26037550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479275
Alignment:
Q  85 aaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagt 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  185 taaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    | ||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||||| ||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  285 ctatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatcc 32479275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 27983143 - 27983430
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtg--ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| |||||||| |||       |||||    
T  27983143 atgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtag-------gctta 27983235  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||     
T  27983236 gatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataa 27983335  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27983336 gaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatcc 27983430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 1793393 - 1793697
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattag--agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1793393 gttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaa 1793492  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||  ||   | |||||||| ||||    
T  1793493 aataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggag--tcgtatcaaaagaggtagag 1793590  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccatta----gaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||     
T  1793591 aaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgta 1793690  T
Q  295 atttgat 301  Q
    |||||||    
T  1793691 atttgat 1793697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 160 - 301
Target Start/End: Original strand, 21236952 - 21237093
Alignment:
Q  160 tagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctgga 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21236952 tagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 21237051  T
Q  260 tccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21237052 tccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgat 21237093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 298
Target Start/End: Original strand, 50679559 - 50679736
Alignment:
Q  120 catgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactatta 219  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50679559 catgtagaaagaagatc-gtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 50679657  T
Q  220 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  50679658 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20591607 - 20591353
Alignment:
Q  43 gaatgacaccattag--agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgta 140  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  20591607 gaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcata 20591508  T
Q  141 gatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatt 240  Q
    |||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  20591507 gatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatt 20591413  T
Q  241 tagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  20591412 tagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacacaatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 51421702 - 51421967
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagaccc 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||| |  || || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||     
T  51421702 attatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccg 51421801  T
Q  138 gtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaag 237  Q
    |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||   ||||  | |||||||| |||| ||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  51421802 gtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaag 51421901  T
Q  238 atttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  51421902 atttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatcc 51421967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 6957727 - 6957835
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6957727 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgtc 6957826  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  6957827 atttgatcc 6957835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 12494792 - 12494900
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12494792 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtc 12494891  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||| ||||    
T  12494892 atttaatcc 12494900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20601953 - 20601699
Alignment:
Q  43 gaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgta 140  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  20601953 gaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgta 20601854  T
Q  141 gatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatt 240  Q
    |||||||| ||||||||| || || | |||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||         
T  20601853 gatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaa----- 20601760  T
Q  241 tagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
       ||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  20601759 gtcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatgacgtaatttgat 20601699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41009683 - 41009414
Alignment:
Q  17 ggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag--tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa-taggcttagatgg 113  Q
    ||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||| |||||| ||||   || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  41009683 ggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatgg 41009584  T
Q  114 tttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaa 213  Q
    ||||  |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  41009583 tttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaa 41009485  T
Q  214 ctattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  41009484 ctataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 16002860 - 16003163
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagag--agtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||   |||  ||||||||||||||||||| ||||  |||| || |  ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  16002860 gttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgatagaa 16002959  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||| ||||| || ||| | || ||||||   ||||    
T  16002960 aatagtcttagatggtt-gaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaatagag 16003058  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     || |||    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16003059 gaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaattt 16003158  T
Q  299 gatcc 303  Q
     ||||    
T  16003159 aatcc 16003163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518368
Alignment:
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||   |||||| | | |||||| ||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  297 ttgatcc 303  Q
    |||||||    
T  53518374 ttgatcc 53518368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1211729 - 1211476
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttag--aaaataggctta 108  Q
    ||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||| |||||| |||  || ||| |||||    
T  1211729 atgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatatgctta 1211630  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||  |||||   || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||   | |||||||  |||| ||||| |||    
T  1211629 aatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaagacatag 1211530  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatcca 263  Q
    || |||||| ||| |||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  1211529 gagaactataagataaattattagaaaa-aattagaggtcaatgagttggatcca 1211476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821077
Alignment:
Q  100 ataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaga 199  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || | ||||| | |||||| ||| |||  | |||||||| |||      
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgata 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaa-cattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgata 20821077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 7947066 - 7947174
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||     
T  7947066 agaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgta 7947165  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  7947166 atttgatcc 7947174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 12494683 - 12494794
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatt--agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12494683 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 12494782  T
Q  99 aataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||    
T  12494783 aataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45205197 - 45204903
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccatta--gagagagt-gtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttaga 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||   ||||||||| ||||| || ||||    
T  45205197 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtaga 45205098  T
Q  98 aaataggctt--agatggtttggtcatgtagagagaagacccgtag-------atgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaa 188  Q
    |||||| |||  || |||||||  || |||||||||||||| ||||       |||  || ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||    
T  45205097 aaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagag-cagatcaaa 45204999  T
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    |||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  45204998 agaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaaca 45204903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 266
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351759
Alignment:
Q  124 tagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagaga 223  Q
    ||||||||||||| |||||  | |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  224 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    ||| ||||  |||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaat 28351759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862849
Alignment:
Q  187 aaagaggcagagaaagacctaggaaaactattaga-gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 50862849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 21528417 - 21528525
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||  | |    
T  21528417 agaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtggc 21528516  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||||||||    
T  21528517 atttgatcc 21528525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548259
Alignment:
Q  184 ttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaac 283  Q
    |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  284 actatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| | ||| |||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatcc 4548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25257928 - 25257755
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| ||| || |||||| || ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||| | || ||||| || |||||      
T  25257928 gttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttgaggtaacacctacaatataaaagatggtagaagc 25257829  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggagg 174  Q
    ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  25257828 tagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggagg 25257755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 31458972 - 31459098
Alignment:
Q  12 tgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtg----ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctt 107  Q
    |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  | |    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31458972 tgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctt 31459071  T
Q  108 agatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||    
T  31459072 aggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 56225028 - 56225180
Alignment:
Q  28 acatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtaga 127  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||  || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  56225028 acatgatatgattaggaatgacaccataagagaaagttgggataatacctatagtataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtaga 56225127  T
Q  128 gagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtc 180  Q
    ||||||   | ||||||  |||||| | ||| || |||| |||||||||||||    
T  56225128 gagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtc 56225180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 49987361 - 49987487
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattaga--gagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| |||  | |||||| || ||||||||  ||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||| || | |||    
T  49987361 gttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagtagaaaagatggtggaa 49987460  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgta 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49987461 aataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154908
Alignment:
Q  238 atttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatcc 19154908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 135
Target Start/End: Original strand, 50662365 - 50662457
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatgg-tttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50662365 aatgacagcattagagagagtttgggcaacacctatagtagaaaagatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagac 50662457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 303
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969418
Alignment:
Q  243 gaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatcc 19969418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44047660 - 44047553
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  44047660 attagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagac 44047561  T
Q  136 ccgtagat 143  Q
    | ||||||    
T  44047560 ctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 279
Target Start/End: Original strand, 50680729 - 50680953
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggttt-ggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaag 154  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||  ||||| || | |||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  50680729 agagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaag 50680828  T
Q  155 aagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 254  Q
     ||| |||||| |||| |||| ||| |  | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||  |||   |||||| ||||| | ||||||    
T  50680829 gagagtagatccaatgaaggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattatttagaaagatctagagattaatgag 50680928  T
Q  255 ctggatccaaatttggtgtatgata 279  Q
     ||||||  ||| |||| |||||||    
T  50680929 ttggatcggaatatggtttatgata 50680953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35555939 - 35555816
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||     
T  35555939 agagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagttagg 35555840  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagt 179  Q
    ||| ||||| | || |||||||||    
T  35555839 agagtagattagatagaggagagt 35555816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 51811406 - 51811323
Alignment:
Q  220 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||| | ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51811406 gagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 51811323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 55578964 - 55579183
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccat----tagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttag 96  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||| ||    ||||||||||  |  ||||||||||||| |||||  || |||    
T  55578964 gttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactattttatagagagagttggaataacacctatagtgaaaaa-atggtag 55579062  T
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    |||||| |||||| ||||| || |||||| ||||||||    || |||  |||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  55579063 aaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaaagaggtag 55579162  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactat 217  Q
    |  ||||||||| ||||||||    
T  55579163 aagaagacctagaaaaactat 55579183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20131276 - 20131167
Alignment:
Q  71 aacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggt-catgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaat 169  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||| |||  | |||||| ||||||||| |||||| | | ||||| ||||| ||||||||||    
T  20131276 aacacctatagtagaaaaatggt-agaaaatagacttagatgtttttttgcatgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaat 20131178  T
Q  170 ggaggagagtc 180  Q
    |||||||||||    
T  20131177 ggaggagagtc 20131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 226
Target Start/End: Original strand, 26356625 - 26356779
Alignment:
Q  72 acacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgg 171  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||  || | |   |||||||| ||| ||||||  ||||    
T  26356625 acacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgg 26356724  T
Q  172 aggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaac 226  Q
    ||| ||||||| | |  ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26356725 aggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaac 26356779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 51252771 - 51252674
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  51252771 attagaaatgactacattagagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 277
Target Start/End: Original strand, 54470197 - 54470418
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||   ||||||||     
T  54470197 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaagg 54470296  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| || |||||||||||   |||||| |||  ||||||| |  |||||| || |||||||| |||||| | ||||  |||| | ||||| | ||||||     
T  54470297 agagtaaatcaaatggagagtagtcaaattactagaggcaaaagaagaccaagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagt 54470396  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatga 277  Q
    |||||  |||| |||| |||||    
T  54470397 tggatagaaatatggtatatga 54470418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809075
Alignment:
Q  190 gaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatcca 263  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatcca 55809075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7092495 - 7092387
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||   ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  7092495 cacctatagtagaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatgga 7092396  T
Q  173 ggagagtca 181  Q
     ||||||||    
T  7092395 tgagagtca 7092387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13805510 - 13805387
Alignment:
Q  103 ggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaag 202  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||   |||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||  | |  |||||||||| ||     
T  13805510 ggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaa 13805411  T
Q  203 acctaggaaaactattagagaaac 226  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    
T  13805410 acctagaaaaactataagagaaac 13805387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497598
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||   ||||||||     
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 28497578  T
Q  156 agactagatcaaatggagga 175  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  28497579 agagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 215
Target Start/End: Original strand, 29398825 - 29398967
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||| ||| ||||| || | ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||| || ||| |||| |  || ||    
T  29398825 cacctatggtagaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggataga 29398924  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaact 215  Q
    ||| |||||| | |  |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29398925 ggatagtcaaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaact 29398967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10775734 - 10775654
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggttt 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| | ||| ||||||    
T  10775734 attagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666149
Alignment:
Q  97 aaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcag 196  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||   |||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||  ||| |||||  |     
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcatattacaagagatat 17666195  T
Q  197 agaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagattta 242  Q
    |  ||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17666194 atgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagattta 17666149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 288
Target Start/End: Original strand, 31043225 - 31043294
Alignment:
Q  219 agagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  31043225 agagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactat 31043294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Original strand, 47611757 - 47611842
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtca 181  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||   ||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||    
T  47611757 gaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctagagattttgtaataaggagagtaaatcagatggaggagagtca 47611842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 21107126 - 21107205
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgata 279  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| | | ||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  21107126 aagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgata 21107205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 134
Target Start/End: Original strand, 33709894 - 33709992
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  33709894 attagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 42639312 - 42639233
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||| ||||| || | ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42639312 agagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550532
Alignment:
Q  219 agagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggt 28550532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 134
Target Start/End: Original strand, 35690320 - 35690360
Alignment:
Q  94 tagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  35690320 tagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagatagaaga 35690360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38571022 - 38570918
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||| ||||| |  | |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  || ||| || | ||||| | | ||||||| |||||    
T  38571022 cacctatagtacaaaagatagtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagacatgtggattccatcgtaaggacaatagatcagatgga 38570923  T
Q  173 ggaga 177  Q
    |||||    
T  38570922 ggaga 38570918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729495
Alignment:
Q  247 tcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcc 41729495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50288096 - 50287988
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||  || || ||||| || | ||||||| || |||||| |||     
T  50288096 agaggaagacttagaaaaactataagataaattattaaaaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgatataatactatgtcgta 50287997  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||| ||||    
T  50287996 atttaatcc 50287988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 52138733 - 52139037
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  52138733 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 52138832  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52138833 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 52138932  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  52138933 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttattt 52139032  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  52139033 gatcc 52139037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 54278953 - 54279256
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| || |||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  54278953 gttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 54279052  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  54279053 aataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaa 54279152  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54279153 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 54279252  T
Q  299 gatc 302  Q
    ||||    
T  54279253 gatc 54279256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51448058 - 51447764
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt-gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaa 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51448058 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 51447959  T
Q  100 ataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaga 199  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  51447958 ataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag------- 51447866  T
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  51447865 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 51447766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 28245370 - 28245674
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||  |  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28245370 gttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 28245469  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28245470 aatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagat 28245569  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28245570 gaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcattt 28245669  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  28245670 gatcc 28245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 302
Target Start/End: Original strand, 22016 - 22308
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  22016 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggctta 22114  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||     
T  22115 gatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacttaa 22214  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22215 gaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatc 22308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 47233940 - 47233643
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaatag 103  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  47233940 gttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 47233841  T
Q  104 gcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaaga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  ||||    
T  47233840 gcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaagaaga 47233741  T
Q  204 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47233740 cctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 47233643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033383
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatcc 35033383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Original strand, 5168777 - 5169069
Alignment:
Q  17 ggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag------tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||      || ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  5168777 ggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaatacgcttaga 5168876  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  5168877 tggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagacctaaga 5168976  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5168977 aaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 5169069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 25191322 - 25191614
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||    
T  25191322 atgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagacttaga 25191421  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||| ||| ||    
T  25191422 tggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaagaactaaga 25191521  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25191522 aaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 25191614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33272367 - 33272122
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctata----gtaaaaaagttgttagaaaata 102  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||    ||| |||||||| |||||||||    
T  33272367 atgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaaaata 33272268  T
Q  103 ggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaag 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  33272267 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 33272169  T
Q  203 acctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtca 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33272168 acctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 99 - 303
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508472
Alignment:
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  48508468 gatcc 48508472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Original strand, 38850110 - 38850358
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||| | | ||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||| ||||||    
T  38850110 agagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaaga 38850209  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgag 254  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||     
T  38850210 agagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaa 38850309  T
Q  255 ctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38850310 ttgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatcc 38850358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 53519519 - 53519817
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattaga--gagagtgtgggtaacacctata------gtaaaaaagttg 92  Q
    |||| |||| ||||||||||| | || ||| ||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||      ||| ||||||||    
T  53519519 gttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtagaaaagttg 53519618  T
Q  93 ttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 192  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53519619 gtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagag 53519718  T
Q  193 gcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacg 292  Q
    | |||| |||||||| ||            ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||    
T  53519719 gtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacg 53519806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43695046 - 43694817
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  43695046 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatca 43694947  T
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    |||| |||      ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||     
T  43694946 aatgaagg------aagttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaac 43694853  T
Q  267 ttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  43694852 taggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatc 43694817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 54128348 - 54128616
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  54128348 attatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagac 54128447  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactatt-agagaaaccattagaa 234  Q
    | |||||||  | |||| | ||| ||||||| |||||||  |||||  |  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || || |    
T  54128448 ctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataagga 54128547  T
Q  235 aagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||| |||| | | |||||||||    
T  54128548 aagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatcc 54128616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060580
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaact 215  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 178 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096750
Alignment:
Q  178 gtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatga 277  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  278 tacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    || ||||||||| |||||||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatcc 12096750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48953698 - 48953464
Alignment:
Q  72 acacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaa-gacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatg 170  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||| ||||||| |||    
T  48953698 acacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatg 48953599  T
Q  171 gaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaaga---tttagaggtcaatgagctggatccaaatt 267  Q
    ||||||||||  || |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   | || ||||||||||| |||||||||||     
T  48953598 gaggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaata 48953500  T
Q  268 tggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    || | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  48953499 tgatttatgatagaacactatgacgtaatttaatcc 48953464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 240
Target Start/End: Original strand, 45728137 - 45728324
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga-cccgtagatgccgtagtaag 154  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||    
T  45728137 agagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaag 45728236  T
Q  155 aagactagat--caaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatt 240  Q
    |||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45728237 aagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19676374 - 19676126
Alignment:
Q  56 agagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaa 153  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  19676374 agagagagtgttggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtac 19676275  T
Q  154 gaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 253  Q
     ||||  |||||| || |||||||||||  | |||||||| | || ||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19676274 aaagagaagatcagatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatga 19676176  T
Q  254 gctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    | ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| |||||||||    
T  19676175 gttggatccaaatatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatcc 19676126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431066
Alignment:
Q  68 ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaa 167  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||| | |||||  |||||| ||||| |||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  168 atggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatt 267  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||| |||||||  |||||||| |||    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  268 tggtgtatgatacaaca 284  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  38431050 tggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39600999 - 39600726
Alignment:
Q  32 gataatattaggaatgacaccattagagagagtgt--gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagaga 129  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||  |||||||||| ||||| || | ||||| | |||||| |||||| | |||||| |||    
T  39600999 gataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaaga 39600900  T
Q  130 gaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccat 229  Q
    ||||||| |||||| | ||||  || ||| ||||||| || ||||| |||||  ||  |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  39600899 gaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 39600800  T
Q  230 tagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |||| |||| ||||  || |||||||||    
T  39600799 taagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatcc 39600726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 289
Target Start/End: Original strand, 39235157 - 39235361
Alignment:
Q  85 aaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagt 184  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||  |    
T  39235157 aaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtcagat 39235256  T
Q  185 taaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
     |||||||| |||| |||||| |  ||||||||  || |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||| |||| || |||| ||||    
T  39235257 caaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgatagaaca 39235356  T
Q  285 ctatg 289  Q
     ||||    
T  39235357 ttatg 39235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289155
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctat--agtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaa 153  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  |||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||  ||||||   |||||||    
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  154 gaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 253  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| |  ||| |||||  |||| |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  254 gctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaaca 45289155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 50960914 - 50960710
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatca 166  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     |||  |||| ||||||| |||||||    
T  50960914 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaagagtagatca 50960819  T
Q  167 aatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
     |||||||||||||   |  ||||||| |||| ||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  50960818 gatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaat 50960719  T
Q  267 ttggtgtat 275  Q
     ||||||||    
T  50960718 atggtgtat 50960710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 271
Target Start/End: Original strand, 3186733 - 3186973
Alignment:
Q  32 gataatattaggaatgacaccatta--gagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagaga 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||  |||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  3186733 gataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggct-agatgatttgggcatgtagaga 3186831  T
Q  130 gaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccat 229  Q
    |||||   ||||||| | | ||||||| | ||||||| || ||| | ||||| || ||||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||    
T  3186832 gaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacctaagaaaactataagaaaaatcat 3186931  T
Q  230 tagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggt 271  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  3186932 tagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52156227 - 52156129
Alignment:
Q  205 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  52156227 ctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcc 52156129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19757832 - 19758053
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt---gggtaacacctatagtaaaaaagttgttaga 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||  ||||| | ||| | |||||||||||| ||   ||| | ||||||||||| ||||| || ||||    
T  19757832 gttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtaga 19757931  T
Q  98 aaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | ||| ||| |||    
T  19757932 aaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggtaga 19758030  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattag 220  Q
    | ||||||||| |||||||||||    
T  19758031 ggaagacctagaaaaactattag 19758053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27917505 - 27917745
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || ||  |||   |||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  27917505 gttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaa 27917604  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||  ||| ||  |||| |||||||||||||||| | |||  | | || ||| |||  |    
T  27917605 taggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcagatcataataggtagacga 27917704  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagattt 241  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  27917705 agacctataaaaactataagagagacaactagaaaagattt 27917745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54425283 - 54425022
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtg-ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| || ||||| || |||||||  |||||||||| |||||| | ||||  ||||||| |||||||||    
T  54425283 attatgaatgacaccattaggaagagagtgaggtatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtagggagaagacc 54425184  T
Q  137 cgtagatgccgtagtaagaag-------actagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccat 229  Q
     | ||||||||| ||||| ||       | ||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||  |||||    
T  54425183 tgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagagggaccat 54425084  T
Q  230 tagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgac 291  Q
    || ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||    
T  54425083 taaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgac 54425022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30294416 - 30294180
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcat---gtagagagaagacccgtagatgccgtagta 152  Q
    |||||||| | | ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||   |||||||||||||  |||||||||   |||    
T  30294416 agagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgta 30294317  T
Q  153 agaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatg 252  Q
    |||||| || || | ||  |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| | |||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  30294316 agaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatg 30294217  T
Q  253 agctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    || |||||| || | || | ||||||| |||||||||    
T  30294216 agttggatctaagtatgatttatgataaaacactatg 30294180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 26490250 - 26490515
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||  | ||  ||||  ||||| ||||||  ||||||| |||||   |||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  26490250 gttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagagttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaa 26490349  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||  ||| | ||||||| | |    
T  26490350 taggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattagatgaggcagtgga 26490449  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    |||  ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||    
T  26490450 agatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaat 26490515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19736929 - 19737150
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgt---gggtaacacctatagtaaaaaagttgttaga 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||  ||||| | ||| | |||||||||||| ||   ||| | ||||||||||| ||||| || ||||    
T  19736929 gttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtaga 19737028  T
Q  98 aaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | ||| |||  ||    
T  19737029 aaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggttga 19737127  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattag 220  Q
    | ||||||||| |||||||||||    
T  19737128 ggaagacctagaaaaactattag 19737150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48734451 - 48734259
Alignment:
Q  32 gataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagaga 131  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| | | ||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48734451 gataagattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaga 48734352  T
Q  132 agacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaa 224  Q
    ||| | ||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||   ||| |  | |||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||    
T  48734351 agaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaaggccttgaaaaactattagagaa 48734259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49503893 - 49503684
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtg--ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  49503893 atgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctta 49503794  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| ||  || | ||||||| ||||||| |||||   ||| |||| | |||| |||||||||    
T  49503793 ggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagacctag 49503694  T
Q  209 gaaaactattag 220  Q
      ||||||||||    
T  49503693 --aaactattag 49503684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42510289 - 42510061
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  |||||   || ||||| ||| ||||||| |||||    
T  42510289 cacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatgga 42510192  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtg 272  Q
    ||| |||||  | |  ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||| |||| | |||| ||||     
T  42510191 ggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatggtt 42510092  T
Q  273 tatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||  |||| |||| ||| |||||||||    
T  42510091 tatgattgaacattatggcgtaatttgatcc 42510061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 302
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262377
Alignment:
Q  220 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatc 53262377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060951
Alignment:
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatcc 38060951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162675
Alignment:
Q  150 gtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtca 249  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  250 atgagctggat 260  Q
    ||||| |||||    
T  19162685 atgagttggat 19162675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 52679166 - 52678944
Alignment:
Q  32 gataatattaggaatgacaccattaga--gagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtaga 127  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||   || || |||||| | ||||||||  ||||||||||||  | || ||||| ||||||||    
T  52679166 gataatattaaaaatgacaccattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtaga 52679067  T
Q  128 gagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaacc 227  Q
    ||||||||  |||||||  |  ||||||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||| | |||  |||||||||||||||||  ||||||||     
T  52679066 gagaagacttgtagatgttg--gtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaacta--agagaaact 52678971  T
Q  228 attagaaaagatttagaggtcaatgag 254  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||    
T  52678970 attatgaaagatttagaggttaatgag 52678944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54365271 - 54365020
Alignment:
Q  53 attagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagaga--agacccgtagatgccgtag 150  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||  ||   |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  | ||| |||||| |  |      
T  54365271 attagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctatta 54365173  T
Q  151 taagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaa 250  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||    |  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| | ||    
T  54365172 taaggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaa 54365073  T
Q  251 tgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    || | | || | |||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54365072 tgtgttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatcc 54365020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 345003 - 344839
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||    ||||||      
T  345003 agagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagagaggacctgtaaattttttagtaatg 344904  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattag 220  Q
    ||  ||||||  |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  344903 agcgtagatcggatggaggatagtcagattacaagaggcagagaaagatgtagaaaaactattag 344839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17022821 - 17022741
Alignment:
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgata 279  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  17022821 aaagacctaggaaagctattagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgata 17022741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555377
Alignment:
Q  244 aggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 47555377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 303
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042174
Alignment:
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttgg-tgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatcc 49042174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 134
Target Start/End: Original strand, 29600869 - 29600968
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgg--gtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctt-agatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29600869 attagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagagagaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271956
Alignment:
Q  259 atccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatc 33271956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41842793 - 41842678
Alignment:
Q  66 tgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatc 165  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || | ||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||||| | |||||||  ||| ||||||    
T  41842793 tgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatc 41842694  T
Q  166 aaatggaggagagtca 181  Q
    |||||||||| |||||    
T  41842693 aaatggaggatagtca 41842678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36820308 - 36820135
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| || ||  ||||  ||||| ||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||| ||  |||| || | ||||     
T  36820308 gttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaac 36820209  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggagg 174  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||   |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  36820208 taggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagattatgtagtaaggagggtagatcaaatagagg 36820135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895925
Alignment:
Q  259 atccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 7895925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Original strand, 33307093 - 33307161
Alignment:
Q  15 gtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagta 83  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  33307093 gtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagta 33307161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987116
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 21200561 - 21200708
Alignment:
Q  79 tagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagag 178  Q
    ||||| ||||| || | |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | | |||||| ||| ||||||| ||||||   ||    
T  21200561 tagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatcacatggagagtag 21200660  T
Q  179 tcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaac 226  Q
    |||| | |  || || |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21200661 tcaaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaac 21200708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311356
Alignment:
Q  235 aagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 311356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422900
Alignment:
Q  225 accattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgac 291  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgac 54422900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454441
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtg-tgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgttggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt-ggtggtttgtgcatgtagagagaaga 31454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 219
Target Start/End: Original strand, 36304018 - 36304131
Alignment:
Q  106 ttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacc 205  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||| || ||||  |||||  |||  ||||||||    |||||    
T  36304018 ttagatgggttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagggtagtcagattactagaggcagttgtagacc 36304117  T
Q  206 taggaaaactatta 219  Q
    ||| ||||||||||    
T  36304118 tagtaaaactatta 36304131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 259
Target Start/End: Original strand, 37351411 - 37351600
Alignment:
Q  70 taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaat 169  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||| ||| |||   |||||||| ||||| |||||||| |  ||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  37351411 taacacttatagtagaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagat 37351510  T
Q  170 ggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctgga 259  Q
    ||| | ||| ||| | |  ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| | |||||| ||||    
T  37351511 ggaagggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatgga 37351600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46431918 - 46431767
Alignment:
Q  103 ggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaag 202  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  || | |||||| | |||||||| ||| ||||| | |||||||| | |||| | |  ||||||||||||      
T  46431918 ggcttaggtggtttgggcatgtagagag--gatctgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaggatactcaaatcactagaggcagagaa-- 46431823  T
Q  203 acctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggat 260  Q
      |||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  46431822 --ctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggat 46431767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2340870 - 2340811
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | ||||||    
T  2340870 agagaaagacctaggaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgag 2340811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133657
Alignment:
Q  241 tagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||| || |||||||| | || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatcc 2133657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28977206 - 28976906
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28977206 gttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 28977107  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  28977106 taggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 28977007  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28977006 agacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 28976907  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  28976906 t 28976906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12492731 - 12492431
Alignment:
Q  6 gttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacaccta---tagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||   ||||| |||||||| |||||||    
T  12492731 gttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaa 12492632  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12492631 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 12492532  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12492531 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 12492432  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  12492431 t 12492431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 24178443 - 24178746
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24178443 gttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 24178542  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24178543 aataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 24178642  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  24178643 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcattt 24178742  T
Q  299 gatc 302  Q
    ||||    
T  24178743 gatc 24178746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 4496354 - 4496621
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4496354 attaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 4496453  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496454 ccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 4496553  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4496554 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatcc 4496621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2075823 - 2075520
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| |||||| |||||| || ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||||     
T  2075823 gttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagac 2075724  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2075723 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 2075624  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatt 297  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  2075623 gaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatt 2075524  T
Q  298 tgat 301  Q
    ||||    
T  2075523 tgat 2075520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 38684937 - 38685204
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38684937 attaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 38685036  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38685037 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 38685136  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  38685137 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatcc 38685204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1287871 - 1287624
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1287871 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaaga 1287772  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1287771 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 1287672  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  1287671 tggatccaaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatcc 1287624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 1275198 - 1275501
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg-taacacctatagtaaaaaagttgttagaaa 99  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1275198 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 1275297  T
Q  100 ataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaga 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||     
T  1275298 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaacaggggtagagg 1275397  T
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  1275398 aagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttg 1275497  T
Q  300 atcc 303  Q
    ||||    
T  1275498 atcc 1275501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 3301787 - 3302081
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtg--ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3301787 atgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 3301886  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||     
T  3301887 gatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaa 3301986  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  3301987 gaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatcc 3302081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 10639230 - 10639539
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatag-------taaaaaagtt 91  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||       || |||||||    
T  10639230 gttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagactatagtagaaaagtt 10639329  T
Q  92 gttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 191  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10639330 ggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag--tcaagttaaaaga 10639427  T
Q  192 ggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgac 291  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10639428 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 10639527  T
Q  292 gtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||    
T  10639528 gtcatttgatcc 10639539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Original strand, 20456780 - 20457010
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20456780 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgga 20456879  T
Q  173 ggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtg 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||    
T  20456880 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaatttgatg 20456979  T
Q  273 tatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  20456980 tatgatagaacattatggcgtcatttgatcc 20457010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16347727 - 16347425
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || |||  |||  ||||  ||||| |||||||||||||| | |||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16347727 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 16347628  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16347627 aataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagag 16347528  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||| |||||  || ||||||||    
T  16347527 gaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcattt 16347430  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  16347429 gatcc 16347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 279
Target Start/End: Original strand, 14665704 - 14665927
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14665704 agagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 14665803  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||     
T  14665804 agagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagt 14665903  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgata 279  Q
    ||||||||||| |||| |||||||    
T  14665904 tggatccaaatatggtttatgata 14665927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Original strand, 34273017 - 34273250
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  34273017 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaaga 34273116  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    |||              ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  34273117 aga--------------ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 34273202  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34273203 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatcc 34273250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915541
Alignment:
Q  124 tagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagaga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  224 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-tatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 2915541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 155 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561431
Alignment:
Q  155 aagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  255 ctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatcc 13561431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Original strand, 29816516 - 29816619
Alignment:
Q  200 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  29816516 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 29816615  T
Q  300 atcc 303  Q
    ||||    
T  29816616 atcc 29816619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26885038 - 26884734
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattaga--gagagtgtgggtaacacctatagtaa-aaaagttgttaga 97  Q
    |||| |||| ||||||||||| | || ||  ||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||| ||||    
T  26885038 gttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtaga 26884939  T
Q  98 aaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||   |||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||    
T  26884938 aaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtaga 26884839  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatcc-aaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcat 296  Q
    | | || ||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |  |||||| |||| || | ||||||| ||||||| ||||  ||    
T  26884838 ggatgagctaggaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaat 26884741  T
Q  297 ttgatcc 303  Q
    |||||||    
T  26884740 ttgatcc 26884734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Original strand, 14911266 - 14911409
Alignment:
Q  160 tagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctgga 259  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14911266 tagatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttgga 14911365  T
Q  260 tccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||| || | | ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  14911366 tccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatcc 14911409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 301
Target Start/End: Original strand, 14749277 - 14749542
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgggt--aacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| || |||  | ||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14749277 attagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagac 14749376  T
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    | || ||| | || ||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||| | |  | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |  ||    
T  14749377 ctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaa 14749476  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
     ||| ||||| | || ||| |||||  |||| |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14749477 ggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501478
Alignment:
Q  98 aaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||   | |||||||   ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
      ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||| || |||||    
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactat 38501478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913928
Alignment:
Q  210 aaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatcc 16913928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31636224 - 31636009
Alignment:
Q  44 aatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31636224 aatgacagcattagagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggat 31636125  T
Q  144 gccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttag 243  Q
    |  |||||||| ||| ||||| | |||| || ||||||| | |  ||||  || | |||| |||| ||||||||||||||||| || |  || ||| |||    
T  31636124 gttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatatag 31636025  T
Q  244 aggtcaatgagctgga 259  Q
    || |||||||| ||||    
T  31636024 agatcaatgagttgga 31636009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Original strand, 32516491 - 32516791
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||||   |||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||| || | |||||    
T  32516491 gttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaaaa 32516590  T
Q  101 taggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaa 200  Q
    ||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||  |||||| | |||||| | ||| ||||||  ||| |||| | |||  ||| |||||| |||| |    
T  32516591 taggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagagga 32516690  T
Q  201 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttga 300  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| | ||  || ||||| ||||| |||| ||||||| || | |||||||| ||||||    
T  32516691 agaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttga 32516789  T
Q  301 tc 302  Q
    ||    
T  32516790 tc 32516791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 301
Target Start/End: Original strand, 36215489 - 36215723
Alignment:
Q  57 gagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaa 156  Q
    |||||||||  |||| || |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| || |||| ||| ||| | |||||    
T  36215489 gagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaa 36215588  T
Q  157 gactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagct 256  Q
    || ||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||          ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |    
T  36215589 gagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtag----------aggaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaatt 36215678  T
Q  257 ggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgat 301  Q
    | |||||||  ||   ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  36215679 gaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttgat 36215723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17340749 - 17340500
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacct-atagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| | |||||| |||  || ||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  17340749 attaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtagaaacattattagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaa 17340650  T
Q  135 cccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 234  Q
    | || |||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||  ||||| ||| |||| ||| |  | ||| ||||  |    
T  17340649 ctcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaaagggtagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaaga 17340550  T
Q  235 aagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaaca 284  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  17340549 aagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 231
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713109
Alignment:
Q  58 agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaag 157  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||  ||||| || |||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||  ||| ||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggag 2713035  T
Q  158 actagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccatta 231  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| | |  |||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2713036 agtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaactataagagaaactatta 2713109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359306
Alignment:
Q  68 ggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaa 167  Q
    |||||||||||||||| ||||  || | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||   |||||| | |||||||| ||| |||||||     
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcag 7359441  T
Q  168 atggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaacca-ttagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaat 266  Q
    |||||||| |||||  | |  |||||||||| ||  ||||| ||||| || |||||||| | |||||||| || ||||| | ||| || |||||| ||||    
T  7359440 atggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaat 7359342  T
Q  267 ttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     |||| || |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  7359341 atggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatcc 7359306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 279
Target Start/End: Original strand, 79503 - 79726
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||| ||||| || | ||||| |   |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| | ||||||||     
T  79503 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagg 79602  T
Q  156 agactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 255  Q
    ||| | ||||||||||||||  |||   | | ||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  79603 agagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatgagc 79702  T
Q  256 tggatccaaatttggtgtatgata 279  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||    
T  79703 tggaccgaaatatggtgcatgata 79726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 289
Target Start/End: Original strand, 27963 - 28105
Alignment:
Q  147 gtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagagg 246  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||   ||||||||  | ||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27963 gtagtacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagg 28062  T
Q  247 tcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    | ||| || ||||||||||| || | | ||||| |||||||||    
T  28063 ttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacactatg 28105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 286
Target Start/End: Original strand, 2552932 - 2553002
Alignment:
Q  216 attagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacact 286  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2552932 attagagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 303
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213812
Alignment:
Q  246 gtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 30213812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Original strand, 42199299 - 42199446
Alignment:
Q  79 tagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagag 178  Q
    ||||| ||||| || | |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||   ||    
T  42199299 tagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtag 42199398  T
Q  179 tcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaac 226  Q
    |||| | |  || || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42199399 tcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattagacaaac 42199446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 303
Target Start/End: Original strand, 2090556 - 2090650
Alignment:
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  2090556 gaaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatcc 2090650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 33667188 - 33667286
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33667188 attagaaatgacaacattaacgagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 242
Target Start/End: Original strand, 6859373 - 6859557
Alignment:
Q  58 agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaag 157  Q
    |||||||  ||||| |||||||||| || ||| || | ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||||||||  || ||| | ||||||||  |    
T  6859373 agagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagagagaagacttgtggattctgtagtaagggg 6859472  T
Q  158 actagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagattta 242  Q
    | || || | |||||||| ||||||   |  ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  6859473 aataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagattta 6859557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Original strand, 15168762 - 15168869
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagt--gtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| | |||    
T  15168762 attaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgagaaatgac 15168861  T
Q  136 ccgtagat 143  Q
    | ||||||    
T  15168862 ctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Original strand, 43475247 - 43475355
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||| ||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  43475247 cacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcagatgga 43475346  T
Q  173 ggagagtca 181  Q
    ||| |||||    
T  43475347 ggatagtca 43475355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235284
Alignment:
Q  189 agaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactat 288  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaacta--agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 9235269  T
Q  289 gacgtcatttgatcc 303  Q
    | | | |||||||||    
T  9235270 ggcataatttgatcc 9235284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4026627 - 4026529
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaag 154  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||||| || | |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  4026627 agagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagattctgtagtaag 4026529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Original strand, 21952363 - 21952508
Alignment:
Q  72 acacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgg 171  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||| |  ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  21952363 acacctatagtagaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatgg 21952462  T
Q  172 aggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactat 217  Q
    ||| ||||||| | |  ||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  21952463 aggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactat 21952508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 181
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525759
Alignment:
Q  73 cacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatgga 172  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  || | | ||| || ||| ||||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  173 ggagagtca 181  Q
    |||||||||    
T  1525751 ggagagtca 1525759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799996
Alignment:
Q  115 ttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaac 214  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||   | |  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagacctagaaaaac 27799991  T
Q  215 tatta 219  Q
    |||||    
T  27799992 tatta 27799996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 418307 - 418201
Alignment:
Q  28 acatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga--tggtttggtcatgta 125  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| ||  ||||| | ||||||||  |||||||| ||||||    
T  418307 acatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctggtttgggcatgta 418208  T
Q  126 gagagaa 132  Q
    |||||||    
T  418207 gagagaa 418201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418079
Alignment:
Q  229 ttagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcc 418079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 1287938 - 1287876
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag 63  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1287938 gttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagag 1287876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9917636 - 9917538
Alignment:
Q  162 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggat 260  Q
    ||||| |||||||| |||||| | | ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  9917636 gatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatgacctagaaaaactattagagaaactatttagaaagatatagagatcaatgagttggat 9917538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18351189 - 18351112
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtca-tgtagagagaagacccgtagat 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351189 gggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558378
Alignment:
Q  239 tttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatcc 5558378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11002733 - 11002645
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtag 126  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||  || |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11002733 attagaaatgacaacattagagagagttcgggtagcacctacagtagaaaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 291
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980169
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  || |||||| |  ||||||||||| ||||||| ||  || | |||||  ||| |||||| |    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagat--agaaaagtcatattacaagaggta 23980073  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgac 291  Q
     ||  |||||||| | ||| || |||||||| |||   || |||||| || | |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||    
T  23980074 taggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgac 23980169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 303
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276475
Alignment:
Q  219 agagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||| | || ||||||| || ||||||  || |||||||||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatcc 28276475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43558119 - 43558011
Alignment:
Q  56 agagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaaga 155  Q
    |||||||||  ||||| || ||||| || ||||| || | |||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  43558119 agagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgctgcagtaaga 43558020  T
Q  156 agactagat 164  Q
    ||| |||||    
T  43558019 agagtagat 43558011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 303
Target Start/End: Original strand, 6889023 - 6889230
Alignment:
Q  96 gaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggca 195  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  || |||   || ||||| | | || || | |||||||| ||||||   |   |||| |    
T  6889023 gaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaa 6889122  T
Q  196 gagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtca 295  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| || |||  | |||| |||| ||||||| |||| |||| ||| |    
T  6889123 gaggaaggcctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 6889222  T
Q  296 tttgatcc 303  Q
    ||| ||||    
T  6889223 tttaatcc 6889230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 279
Target Start/End: Original strand, 15168873 - 15168984
Alignment:
Q  168 atggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatt 267  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||| |||| |  |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||| ||| || |||||||| ||     
T  15168873 atggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagata 15168972  T
Q  268 tggtgtatgata 279  Q
    |||| |||||||    
T  15168973 tggtttatgata 15168984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15986991 - 15986904
Alignment:
Q  94 tagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtca 181  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||   |||||| |  ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  15986991 tagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtca 15986904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33158057 - 33157918
Alignment:
Q  122 tgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattaga 221  Q
    ||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||| ||||||||||  | || ||||| |||| |||||| | |  ||||||||| ||| |||| |||    
T  33158057 tgtagagagaaaacatgtagattctgtagtaagaagagtagatcaaatataagatagtcatgttacaagaggtataagaagacctagaaaacctataaga 33157958  T
Q  222 gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatc 261  Q
    ||||| | || |||| ||||| || | |||||| ||||||    
T  33157957 gaaactactaaaaaatatttatagattaatgagttggatc 33157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 143
Target Start/End: Original strand, 18698787 - 18698876
Alignment:
Q  53 attagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagat 143  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||| ||||||||| || ||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  18698787 attaaagagagttagggtaacacctatagt-aaaaagatgatggaaactaggcttaggtgatttgagcgtgtagagaaaagacccgtagat 18698876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || | |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Original strand, 36200770 - 36200894
Alignment:
Q  94 tagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 193  Q
    ||||||||| | |||| ||||||   ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||  | |||| |    
T  36200770 tagaaaatatgattaggtggttttagcatgtagagagaaaaccagtaaatgatgtagtatgaagagtagatcagatagaggagagtaaag-aagaagatg 36200868  T
Q  194 cagagaaagacctaggaaaactatta 219  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||    
T  36200869 tagaggaagacctagaaaaactatta 36200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 289
Target Start/End: Original strand, 43035039 - 43035204
Alignment:
Q  124 tagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagaga 223  Q
    ||||||||||||   ||||| | |||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||    
T  43035039 tagagagaagacgtctagattctgtagtagggagagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgaga 43035138  T
Q  224 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatg 289  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||  |  ||||| |||| | |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  43035139 aactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatg 43035204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10083020 - 10082952
Alignment:
Q  67 gggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagac 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  10083020 gggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1258 - 993
Alignment:
Q  38 attaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagaccc 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1258 attatgaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagaccc 1159  T
Q  138 gtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaag 237  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1158 gtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaag 1059  T
Q  238 atttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1058 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31705
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    |||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31401 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 31500  T
Q  99 aataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagag 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31501 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagag 31600  T
Q  199 aaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcattt 298  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  31601 gaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcattt 31700  T
Q  299 gatcc 303  Q
    |||||    
T  31701 gatcc 31705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44080
Alignment:
Q  58 agagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacc 136  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Original strand, 82664 - 82955
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtggg--taacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggctta 108  Q
    |||||| |||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  82664 atgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggctta 82763  T
Q  109 gatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctag 208  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||   ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  82764 gatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagacctag 82861  T
Q  209 gaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  82862 gaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatcc 82955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 86946 - 86654
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttaga 110  Q
    |||||||||||||  | | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | |  | |   | |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  86946 atgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagagagagagagagtagaaaagttggtagaaaatagtcttaga 86847  T
Q  111 tggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctagga 210  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||    
T  86846 tagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagatggagacctagga 86747  T
Q  211 aaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |   | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  86746 aaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacactatgacgtaatttgatcc 86654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4621 - 4326
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagagtgtg---ggtaacacctatagtaaaaaagttgttaga 97  Q
    |||| |||| |||| |||||||| || ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| | |   |||  ||||||||||| |||||||| || |    
T  4621 gttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaa 4522  T
Q  98 aaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcaga 197  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |      
T  4521 aaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagttaaaagaggta-- 4424  T
Q  198 gaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatt 297  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  4423 --------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacactatgacgttatt 4332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25685 - 25577
Alignment:
Q  195 agagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtc 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25685 agaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtc 25586  T
Q  295 atttgatcc 303  Q
    |||| ||||    
T  25585 atttaatcc 25577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25794 - 25683
Alignment:
Q  1 gttgtgttgtatgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagag--agagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaa 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25794 gttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 25695  T
Q  99 aataggcttaga 110  Q
    ||||||||||||    
T  25694 aataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11594
Alignment:
Q  108 agatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagaccta 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  || |||||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  208 ggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||  | ||||||||||||||  || ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttg--gtttgatagagtactatgacgtcatttgatcc 11594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11937 - 11810
Alignment:
Q  11 atgagtggtaagagtaaacatgataatattaggaatgacaccattagagagag----tgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggct 106  Q
    ||||| ||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||    || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11937 atgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 11838  T
Q  107 tagatggtttggtcatgtagagagaaga 134  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11837 tagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 302
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16814
Alignment:
Q  175 agagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgta 274  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |     
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 16786  T
Q  275 tgatacaacactatgacgtcatttgatc 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16787 tgatagaacactatggcgtcatttgatc 16814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 303
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4873
Alignment:
Q  136 ccgtagatgccgtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||  ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  236 agatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
     |||||||| ||||||||| |  |||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatcc 4873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 303
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7677
Alignment:
Q  47 gacaccattagagagagtgtgggtaacacctatagtaaaaaagttgttagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgcc 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||| |||||||  ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |    
T  7422 gacaccattagagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtc 7521  T
Q  147 gtagtaagaagactagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagagg 246  Q
     |  |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||| |   |  ||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  7522 ttcataagaagagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaaga-gtgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagagg 7620  T
Q  247 tcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||| | || ||||| ||||| ||||  | |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  7621 tcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatcc 7677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 481 - 568
Alignment:
Q  216 attagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 303
Target Start/End: Original strand, 14722 - 14820
Alignment:
Q  205 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  14722 ctaggaaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatcc 14820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28934
Alignment:
Q  258 gatccaaatttggtgtatgatacaacactatgacgtcatttgatcc 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 28934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1665 - 1613
Alignment:
Q  202 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 254  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1665 gacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgag 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University