View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20954_low_37 (Length: 423)

Name: NF20954_low_37
Description: NF20954
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20954_low_37
NF20954_low_37
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (13-215)||(1579030-1579232)
chr5 (13-215)||(1605583-1605785)
chr5 (17-210)||(9008073-9008266)
chr5 (16-210)||(27420857-27421051)
chr5 (13-204)||(16737459-16737650)
chr5 (13-211)||(27679181-27679379)
chr5 (13-206)||(16069356-16069549)
chr5 (13-210)||(24105683-24105880)
chr5 (13-210)||(33491208-33491405)
chr5 (13-203)||(3386498-3386688)
chr5 (13-206)||(3921584-3921777)
chr5 (5-210)||(4120936-4121141)
chr5 (13-211)||(8374351-8374548)
chr5 (16-214)||(33991135-33991333)
chr5 (13-202)||(1165613-1165802)
chr5 (13-210)||(19358525-19358722)
chr5 (13-210)||(20992158-20992355)
chr5 (13-210)||(31883143-31883340)
chr5 (17-213)||(38598466-38598662)
chr5 (16-210)||(35782659-35782853)
chr5 (17-209)||(5202972-5203164)
chr5 (13-209)||(31410476-31410672)
chr5 (16-209)||(26602957-26603140)
chr5 (13-164)||(27025001-27025152)
chr5 (74-210)||(20992354-20992494)
chr5 (68-201)||(33284642-33284775)
chr5 (73-197)||(31638157-31638281)
chr5 (57-212)||(25634579-25634732)
chr5 (13-59)||(35420436-35420482)
chr5 (75-172)||(19516044-19516141)
chr5 (90-143)||(41818552-41818605)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (13-209)||(22963-23159)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (13-209)||(26946888-26947084)
chr6 (13-210)||(3347535-3347732)
chr6 (13-212)||(2837541-2837740)
chr6 (13-211)||(6086611-6086809)
chr6 (13-209)||(30691850-30692046)
chr6 (13-209)||(26704351-26704547)
chr6 (16-212)||(16307023-16307219)
chr6 (13-212)||(17261085-17261284)
chr6 (13-209)||(20726790-20726982)
chr6 (17-207)||(3955782-3955972)
chr6 (13-211)||(21893452-21893650)
chr6 (13-209)||(9459562-9459758)
chr6 (13-210)||(18613536-18613733)
chr6 (13-205)||(34887304-34887496)
chr6 (13-212)||(11167236-11167435)
chr6 (13-198)||(1153603-1153788)
chr6 (22-213)||(35198279-35198469)
chr6 (13-211)||(28199520-28199719)
chr6 (45-213)||(52831-52999)
chr6 (13-204)||(30698941-30699132)
chr6 (13-138)||(33464399-33464524)
chr6 (13-115)||(53001-53103)
chr6 (130-206)||(33463703-33463779)
chr6 (73-201)||(12835055-12835183)
chr6 (176-213)||(34800919-34800957)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (13-213)||(50055101-50055301)
chr4 (16-212)||(1756767-1756963)
chr4 (13-210)||(54189541-54189738)
chr4 (13-209)||(19913630-19913826)
chr4 (17-209)||(23776463-23776655)
chr4 (13-213)||(35490773-35490973)
chr4 (13-212)||(2481408-2481607)
chr4 (13-212)||(27488648-27488847)
chr4 (13-212)||(53717464-53717663)
chr4 (13-213)||(48909839-48910039)
chr4 (13-212)||(28032712-28032911)
chr4 (13-212)||(54412622-54412821)
chr4 (15-209)||(38055154-38055348)
chr4 (13-206)||(20877047-20877240)
chr4 (5-210)||(23704201-23704406)
chr4 (13-210)||(50353797-50353994)
chr4 (13-213)||(6611360-6611560)
chr4 (5-208)||(11639570-11639773)
chr4 (13-211)||(43289960-43290158)
chr4 (13-210)||(14987788-14987985)
chr4 (13-210)||(15241028-15241225)
chr4 (13-210)||(44784917-44785114)
chr4 (13-210)||(45424534-45424731)
chr4 (13-208)||(40428720-40428915)
chr4 (13-214)||(15669175-15669376)
chr4 (13-206)||(31969681-31969874)
chr4 (13-205)||(16700782-16700974)
chr4 (13-214)||(6688627-6688822)
chr4 (13-212)||(27536104-27536299)
chr4 (13-206)||(1617084-1617277)
chr4 (13-206)||(30423565-30423757)
chr4 (13-210)||(37464717-37464914)
chr4 (13-206)||(52139203-52139396)
chr4 (13-208)||(47632032-47632228)
chr4 (13-208)||(37968757-37968952)
chr4 (13-210)||(53353051-53353256)
chr4 (13-206)||(8591092-8591285)
chr4 (13-210)||(8932178-8932375)
chr4 (13-205)||(19164973-19165164)
chr4 (13-205)||(30171581-30171773)
chr4 (13-205)||(53875658-53875850)
chr4 (13-211)||(44379187-44379385)
chr4 (13-202)||(27583632-27583821)
chr4 (5-211)||(55344817-55345023)
chr4 (13-197)||(33703850-33704034)
chr4 (16-211)||(40680041-40680236)
chr4 (57-213)||(50053436-50053592)
chr4 (13-207)||(44375844-44376038)
chr4 (35-203)||(28360433-28360602)
chr4 (17-197)||(38071327-38071504)
chr4 (13-212)||(16703819-16704014)
chr4 (13-129)||(23269046-23269162)
chr4 (57-210)||(44548185-44548339)
chr4 (121-206)||(23265865-23265950)
chr4 (58-140)||(51780763-51780845)
chr4 (13-88)||(53408137-53408213)
chr4 (57-199)||(17493340-17493482)
chr4 (13-64)||(23261886-23261937)
chr4 (13-104)||(9595902-9595982)
chr4 (153-211)||(9595975-9596032)
chr4 (13-50)||(50055301-50055338)
chr4 (62-119)||(55344724-55344781)
chr4 (13-67)||(48748197-48748251)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (13-212)||(33510478-33510677)
chr1 (13-213)||(26580282-26580482)
chr1 (5-212)||(1168497-1168704)
chr1 (13-207)||(26663257-26663451)
chr1 (13-213)||(25897367-25897567)
chr1 (13-213)||(39260358-39260558)
chr1 (13-212)||(52753159-52753358)
chr1 (13-211)||(1940759-1940957)
chr1 (13-209)||(52696788-52696984)
chr1 (13-203)||(29078519-29078709)
chr1 (13-210)||(16052092-16052289)
chr1 (13-210)||(20089467-20089664)
chr1 (13-210)||(1170456-1170653)
chr1 (13-213)||(29288142-29288340)
chr1 (15-203)||(38829072-38829260)
chr1 (17-209)||(40092488-40092680)
chr1 (13-207)||(5215384-5215578)
chr1 (5-211)||(8079713-8079919)
chr1 (13-206)||(19715173-19715366)
chr1 (13-210)||(43905650-43905847)
chr1 (17-213)||(41928511-41928707)
chr1 (13-209)||(42370807-42371003)
chr1 (13-212)||(46760960-46761159)
chr1 (13-210)||(32671575-32671772)
chr1 (13-205)||(8120870-8121062)
chr1 (13-209)||(970536-970734)
chr1 (13-213)||(2347649-2347850)
chr1 (13-209)||(12682817-12683013)
chr1 (13-212)||(17591685-17591881)
chr1 (16-210)||(13996738-13996932)
chr1 (13-213)||(2473715-2473915)
chr1 (13-209)||(51359229-51359424)
chr1 (19-210)||(49146168-49146359)
chr1 (17-209)||(15203109-15203301)
chr1 (13-210)||(46409431-46409630)
chr1 (13-211)||(15554164-15554354)
chr1 (13-190)||(17587517-17587694)
chr1 (13-206)||(7145207-7145400)
chr1 (16-209)||(23498457-23498650)
chr1 (13-204)||(15717787-15717977)
chr1 (13-207)||(6765458-6765652)
chr1 (13-172)||(40149497-40149656)
chr1 (40-208)||(29695673-29695842)
chr1 (13-210)||(38171828-38172012)
chr1 (77-212)||(52086261-52086396)
chr1 (58-193)||(23322897-23323032)
chr1 (57-212)||(5217840-5217994)
chr1 (135-210)||(5675101-5675176)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (13-209)||(14422702-14422898)
chr8 (13-212)||(39206582-39206781)
chr8 (13-210)||(18594535-18594732)
chr8 (13-209)||(29938060-29938256)
chr8 (13-203)||(34679469-34679659)
chr8 (16-213)||(10836770-10836967)
chr8 (13-206)||(13110406-13110599)
chr8 (13-209)||(33278399-33278595)
chr8 (13-204)||(2042536-2042727)
chr8 (13-212)||(24113178-24113377)
chr8 (13-211)||(22260642-22260840)
chr8 (13-210)||(6144285-6144482)
chr8 (16-209)||(35118046-35118239)
chr8 (13-210)||(4035845-4036042)
chr8 (13-205)||(144397-144589)
chr8 (13-212)||(39218773-39218972)
chr8 (16-205)||(41575516-41575705)
chr8 (13-208)||(34842377-34842572)
chr8 (13-206)||(34998908-34999101)
chr8 (13-212)||(7774760-7774959)
chr8 (13-202)||(44804956-44805145)
chr8 (13-209)||(38167167-38167363)
chr8 (13-212)||(7791407-7791606)
chr8 (16-212)||(7811991-7812187)
chr8 (17-206)||(8021721-8021902)
chr8 (55-214)||(33287079-33287238)
chr8 (13-209)||(5320563-5320759)
chr8 (55-210)||(40117906-40118061)
chr8 (16-210)||(36491155-36491349)
chr8 (13-212)||(28639274-28639475)
chr8 (69-210)||(26783801-26783942)
chr8 (16-204)||(42571598-42571783)
chr8 (13-205)||(66191-66384)
chr8 (13-129)||(9807339-9807455)
chr8 (57-210)||(2322068-2322221)
chr8 (80-212)||(5005162-5005294)
chr8 (57-206)||(39220258-39220407)
chr8 (121-206)||(9806875-9806960)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (13-212)||(37698141-37698340)
chr3 (16-207)||(38856089-38856280)
chr3 (13-210)||(22174988-22175185)
chr3 (13-212)||(50528920-50529119)
chr3 (16-210)||(42307906-42308100)
chr3 (17-209)||(25999382-25999574)
chr3 (16-210)||(15520143-15520337)
chr3 (13-210)||(46452160-46452357)
chr3 (13-213)||(15520626-15520826)
chr3 (13-211)||(29445480-29445678)
chr3 (13-210)||(8042600-8042797)
chr3 (13-208)||(20699144-20699339)
chr3 (13-212)||(24835697-24835896)
chr3 (16-210)||(12117659-12117853)
chr3 (13-203)||(21581042-21581232)
chr3 (13-210)||(20842346-20842543)
chr3 (13-206)||(32244117-32244310)
chr3 (13-209)||(25494283-25494479)
chr3 (209-405)||(47810799-47811005)
chr3 (13-211)||(54870172-54870370)
chr3 (13-213)||(35226437-35226637)
chr3 (13-213)||(38933936-38934135)
chr3 (16-212)||(44609334-44609530)
chr3 (13-212)||(54534326-54534523)
chr3 (13-215)||(42104969-42105171)
chr3 (19-209)||(26122808-26122998)
chr3 (13-206)||(32359256-32359449)
chr3 (11-212)||(34700332-34700533)
chr3 (13-209)||(44688760-44688950)
chr3 (13-209)||(2895179-2895379)
chr3 (13-212)||(53028216-53028407)
chr3 (13-203)||(48925001-48925189)
chr3 (14-182)||(16354367-16354535)
chr3 (55-208)||(35643212-35643365)
chr3 (69-203)||(50529827-50529961)
chr3 (13-180)||(12915930-12916096)
chr3 (75-210)||(49128042-49128177)
chr3 (13-89)||(24366143-24366219)
chr3 (5-82)||(13696914-13696991)
chr3 (153-210)||(24366085-24366142)
chr3 (16-49)||(50528883-50528916)
chr3 (177-213)||(10449112-10449149)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (13-211)||(24792334-24792532)
chr7 (13-210)||(43067975-43068172)
chr7 (16-212)||(7164179-7164375)
chr7 (13-210)||(30181026-30181223)
chr7 (13-210)||(12101180-12101377)
chr7 (13-210)||(42964998-42965195)
chr7 (13-209)||(33359092-33359288)
chr7 (13-208)||(20346487-20346682)
chr7 (13-206)||(3511324-3511517)
chr7 (13-210)||(15655909-15656106)
chr7 (16-209)||(22649699-22649892)
chr7 (13-209)||(25748485-25748681)
chr7 (13-210)||(42204151-42204349)
chr7 (13-210)||(6394748-6394945)
chr7 (13-211)||(33846531-33846724)
chr7 (13-210)||(933282-933479)
chr7 (13-206)||(5280861-5281054)
chr7 (13-205)||(4477323-4477515)
chr7 (13-209)||(12097592-12097788)
chr7 (13-204)||(1803029-1803220)
chr7 (17-211)||(32041538-32041732)
chr7 (13-210)||(36890832-36891028)
chr7 (13-202)||(43156718-43156907)
chr7 (18-210)||(4347270-4347462)
chr7 (13-205)||(42673467-42673655)
chr7 (13-206)||(9452591-9452784)
chr7 (20-208)||(8630665-8630853)
chr7 (13-204)||(38866547-38866738)
chr7 (13-207)||(17753600-17753794)
chr7 (13-206)||(46891341-46891535)
chr7 (13-172)||(48865665-48865827)
chr7 (16-207)||(46134309-46134500)
chr7 (13-210)||(16894509-16894696)
chr7 (62-210)||(19828267-19828415)
chr7 (13-210)||(43021582-43021775)
chr7 (112-210)||(37704977-37705075)
chr7 (57-210)||(37005857-37006010)
chr7 (57-210)||(43405017-43405170)
chr7 (57-210)||(15655458-15655611)
chr7 (64-209)||(36849590-36849735)
chr7 (73-214)||(20163812-20163953)
chr7 (118-202)||(27691433-27691517)
chr7 (57-209)||(30075277-30075426)
chr7 (177-212)||(22032911-22032947)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (13-213)||(36698-36898)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (13-209)||(31517227-31517423)
chr2 (13-211)||(18806896-18807094)
chr2 (16-210)||(26323201-26323395)
chr2 (13-210)||(33906059-33906256)
chr2 (16-209)||(3873259-3873452)
chr2 (13-213)||(39635445-39635645)
chr2 (21-210)||(1108276-1108464)
chr2 (16-210)||(4232157-4232351)
chr2 (13-206)||(4016039-4016232)
chr2 (13-210)||(30270691-30270888)
chr2 (13-212)||(6174840-6175039)
chr2 (13-211)||(42937714-42937913)
chr2 (13-206)||(28329851-28330042)
chr2 (13-210)||(5733395-5733592)
chr2 (13-212)||(2178781-2178980)
chr2 (16-210)||(19901153-19901346)
chr2 (13-192)||(19383947-19384126)
chr2 (57-212)||(30420223-30420378)
chr2 (13-206)||(850997-851190)
chr2 (13-205)||(1482915-1483106)
chr2 (15-211)||(16588790-16588986)
chr2 (13-202)||(16066306-16066495)
chr2 (16-205)||(429817-430006)
chr2 (13-208)||(44947561-44947749)
chr2 (57-211)||(42446625-42446779)
chr2 (64-170)||(22101210-22101316)
chr2 (57-205)||(3585291-3585439)
chr2 (73-203)||(12517256-12517385)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (13-213)||(18-218)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (5-208)||(3708-3911)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (13-210)||(10234-10431)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (13-206)||(145257-145450)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (13-212)||(307-506)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (13-211)||(18-217)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (182-211)||(1065-1094)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1579232 - 1579030
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1579133  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579132 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 1579033  T
Q  213 gaa 215  Q
    |||    
T  1579032 gaa 1579030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 1605583 - 1605785
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605583 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1605682  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605683 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 1605782  T
Q  213 gaa 215  Q
    |||    
T  1605783 gaa 1605785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008266
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 9008266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420857
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27420857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 16737459 - 16737650
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737459 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16737558  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16737559 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 27679181 - 27679379
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679181 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27679280  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679281 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 27679379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16069549 - 16069356
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069549 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16069450  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16069449 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 16069356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 24105683 - 24105880
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24105683 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24105782  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24105783 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 24105880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 33491208 - 33491405
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33491208 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatga 33491307  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491308 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33491405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 3386498 - 3386688
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386498 aaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3386597  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3386598 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3921777 - 3921584
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921777 aaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3921678  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3921677 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacggg 3921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4121141 - 4120936
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121141 gagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 4121042  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4121041 aactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacg 4120942  T
Q  205 gggcct 210  Q
    ||||||    
T  4120941 gggcct 4120936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 8374351 - 8374548
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374351 aaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8374449  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8374450 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggccta 8374548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991135
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaaga 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcctaaga 33991135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 1165613 - 1165802
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1165613 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 1165712  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  1165713 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19358722 - 19358525
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358722 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 19358623  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19358622 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcct 19358525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 20992158 - 20992355
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20992158 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatga 20992257  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20992258 tatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 20992355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31883340 - 31883143
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31883340 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 31883241  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31883240 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcct 31883143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598662
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 213  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcctaag 38598662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782853
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 35782757  T
Q  115 agctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35782758 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcct 35782853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202972
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31410672 - 31410476
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31410672 aaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatga 31410573  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  31410572 taagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603140
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtag----------ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27025152 - 27025001
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025152 aaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatga 27025053  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||    
T  27025052 taagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 210
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992494
Alignment:
Q  74 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  174 cat----ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 20992494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  68 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 167  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  168 taagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638157
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 172  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  173 ccatataagctcaaaataagccaat 197  Q
     || |||| |  |||||||| ||||    
T  31638181 tcacataaacataaaataagtcaat 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634579
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||| ||||||   ||| |||  ||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||  ||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcctaa 25634579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 35420436 - 35420482
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35420436 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516141
Alignment:
Q  75 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 172  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||||  | |||||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttatgttaatagataagc 19516141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  90 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacc 143  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 22963 - 23159
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22963 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 23062  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 26946888 - 26947084
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26946888 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 26946987  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946988 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 3347535 - 3347732
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3347535 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 3347634  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347635 taagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 3347732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2837740 - 2837541
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2837740 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatga 2837641  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837640 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 2837541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 6086611 - 6086809
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6086611 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6086710  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086711 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 6086809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30692046 - 30691850
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692046 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30691947  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30691946 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 26704351 - 26704547
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704351 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26704450  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26704451 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307219
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 16307219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 17261085 - 17261284
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  17261085 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatatta 17261184  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17261185 taagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctaa 17261284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20726982 - 20726790
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726982 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20726883  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726882 taagttatttttatttac----ccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955972
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21893650 - 21893452
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893650 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21893551  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21893550 taagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggccta 21893452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9459758 - 9459562
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459758 aaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 9459659  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459658 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18613733 - 18613536
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18613733 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatga 18613634  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18613633 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 18613536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 34887304 - 34887496
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34887304 aaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 34887403  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34887404 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11167435 - 11167236
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11167435 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 11167336  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167335 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 11167236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1153788 - 1153603
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153788 aaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 1153689  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatc 198  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  1153688 taatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198279
Alignment:
Q  22 acataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  122 tttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcctaag 35198279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 28199520 - 28199719
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28199520 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 28199618  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta---gataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28199619 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggacc 28199717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52831
Alignment:
Q  45 taagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacct 144  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  145 ttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 213  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 52831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 30698941 - 30699132
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  30698941 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatga 30699040  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  30699041 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33464524 - 33464399
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464524 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33464425  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaa 138  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  33464424 taaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 53103 - 53001
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53103 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 53004  T
Q  113 taa 115  Q
    |||    
T  53003 taa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463703
Alignment:
Q  130 tttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 33463703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12835183 - 12835055
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacac-ctttaaaaaggcttatgggagtagataag 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| || |||||||||||  |||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  12835183 gcttattaaaatattgcttaagcagcttatgaaattagtataagttcttttgattaatgtatccaaacactttttacaaaagcttatgttagtagataag 12835084  T
Q  172 cccatataagctcaaaataagccaatccaa 201  Q
       | |||||||  ||||||||||||||||    
T  12835083 tttacataagct-taaataagccaatccaa 12835055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34800957 - 34800919
Alignment:
Q  176 tataagctcaaaataagc-caatccaaacggggcctaag 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34800957 tataagctcaaaataagctcaatccaaacggggcctaag 34800919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 50055101 - 50055301
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50055101 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 50055200  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055201 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 50055300  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  50055301 g 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756963
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggtctaa 1756963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54189738 - 54189541
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189738 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 54189639  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189638 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54189541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 19913630 - 19913826
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19913630 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 19913729  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913730 taagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776655
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 35490773 - 35490973
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35490773 aaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 35490872  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35490873 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctaa 35490972  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  35490973 g 35490973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 2481408 - 2481607
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481408 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2481507  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481508 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 2481607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 27488648 - 27488847
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488648 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 27488747  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27488748 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcctaa 27488847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 53717464 - 53717663
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53717464 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatga 53717563  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717564 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 53717663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48910039 - 48909839
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48910039 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48909940  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48909939 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcctaa 48909840  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  48909839 g 48909839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 28032712 - 28032911
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28032712 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatga 28032811  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28032812 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaacagggcctaa 28032911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 54412821 - 54412622
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54412821 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatga 54412722  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54412721 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggtctaa 54412622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055154
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  115 agctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20877240 - 20877047
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20877240 aaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20877141  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877140 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 20877047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 23704201 - 23704406
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23704201 gagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatga 23704300  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23704301 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaaca 23704400  T
Q  205 gggcct 210  Q
    ||||||    
T  23704401 gggcct 23704406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50353994 - 50353797
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50353994 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatca 50353895  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353894 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50353797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 6611360 - 6611560
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6611360 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 6611459  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6611460 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcctaa 6611559  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  6611560 g 6611560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 11639570 - 11639773
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639570 gagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 11639669  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11639670 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacg 11639769  T
Q  205 gggc 208  Q
    ||||    
T  11639770 gggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 43289960 - 43290158
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289960 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43290059  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43290060 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagccta 43290158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14987985 - 14987788
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14987985 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 14987886  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987885 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 14987788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 15241028 - 15241225
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15241028 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 15241127  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15241128 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 44784917 - 44785114
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44784917 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 44785016  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785017 taagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 44785114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 45424534 - 45424731
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424534 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 45424633  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45424634 taaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 45424731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 40428720 - 40428915
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40428720 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 40428819  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40428820 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15669376 - 15669175
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15669376 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatga 15669277  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669276 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 15669177  T
Q  213 ga 214  Q
    ||    
T  15669176 ga 15669175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31969874 - 31969681
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31969874 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 31969775  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31969774 taaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacggg 31969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16700974 - 16700782
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16700974 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 16700875  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700874 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 6688627 - 6688822
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  6688627 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatga 6688720  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  6688721 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcccaa 6688820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 27536104 - 27536299
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27536104 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 27536203  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536204 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 27536299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1617277 - 1617084
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1617277 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 1617178  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617177 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 30423565 - 30423757
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423565 aaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30423663  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30423664 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggg 30423757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37464914 - 37464717
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464914 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37464815  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37464814 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52139396 - 52139203
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139396 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52139297  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52139296 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 47632228 - 47632032
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632228 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 47632129  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacc-tttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47632128 gaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 37968757 - 37968952
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968757 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 37968856  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  37968857 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggc 37968952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 53353256 - 53353051
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaact 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353256 aaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 53353157  T
Q  109 atgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccata----taagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  53353156 atgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacg 53353057  T
Q  205 gggcct 210  Q
    ||||||    
T  53353056 gggcct 53353051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 8591092 - 8591285
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatga 8591191  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  8591192 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtcaaacggg 8591285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 8932178 - 8932375
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  8932178 aaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgt 8932277  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932278 taagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 8932375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 19164973 - 19165164
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164973 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatga 19165070  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacaccttt-aaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165071 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30171773 - 30171581
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30171773 aaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 30171674  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171673 taagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53875850 - 53875658
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53875850 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatga 53875751  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53875750 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 44379187 - 44379385
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44379187 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatga 44379286  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44379287 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggccta 44379385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 27583632 - 27583821
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27583632 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatga 27583731  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  27583732 taagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Original strand, 55344817 - 55345023
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||     
T  55344817 gagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgc 55344916  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55344917 aaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacg 55345016  T
Q  205 gggccta 211  Q
    |||||||    
T  55345017 gggccta 55345023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33704034 - 33703850
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33704034 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 33703935  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaat 197  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  33703934 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680236
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaagcgggccta 40680236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053436
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 50053436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44376038 - 44375844
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44376038 aaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 44375939  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44375938 taaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  35 agctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattta 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  134 tccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaat 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16704014 - 16703819
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704014 aagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16703915  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||    |||| ||||||||||| |||||||    
T  16703914 taaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaacgaggcctaa 16703819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Original strand, 23269046 - 23269162
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23269046 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 23269145  T
Q  113 taagctatttttattta 129  Q
    |||||||||||||||||    
T  23269146 taagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548339
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataa-gccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcct 44548339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265950
Alignment:
Q  121 ttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 23265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 140
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  58 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaac 140  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53408213 - 53408137
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaa-ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408213 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcc 199  Q
    || |||||||||| |  |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 23261886 - 23261937
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctga 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23261886 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 9595902 - 9595982
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595902 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-----------gagagtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Original strand, 9595975 - 9596032
Alignment:
Q  153 gcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9595975 gcttatgagagtagataagcccacataaactcaaa-taagccaatccaaacggggccta 9596032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 50055338 - 50055301
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055338 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 119
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  62 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48748251 - 48748197
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaa 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  48748251 aaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33510677 - 33510478
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510677 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33510578  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510577 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 33510478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 26580282 - 26580482
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580282 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 26580381  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580382 taagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 26580481  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  26580482 g 26580482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1168704 - 1168497
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168704 gagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 1168605  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168604 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 1168505  T
Q  205 gggcctaa 212  Q
    ||||||||    
T  1168504 gggcctaa 1168497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26663451 - 26663257
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26663451 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 26663352  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663351 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25897567 - 25897367
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897567 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25897468  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25897467 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 25897368  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  25897367 g 25897367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 39260358 - 39260558
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39260358 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 39260457  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260458 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 39260557  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  39260558 g 39260558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 52753159 - 52753358
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52753159 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 52753258  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753259 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 52753358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 1940759 - 1940957
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  1940759 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatga 1940858  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940859 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 1940957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 52696984 - 52696788
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696984 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 52696885  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696884 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29078709 - 29078519
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078709 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29078610  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29078609 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16052289 - 16052092
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052289 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16052190  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052189 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 16052092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20089664 - 20089467
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20089664 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 20089565  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089564 taagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 20089467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 1170456 - 1170653
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1170456 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 1170555  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170556 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29288340 - 29288142
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288340 aaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29288243  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29288242 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 29288143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829072
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  115 agctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092488
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5215578 - 5215384
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5215578 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 5215479  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215478 taagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Original strand, 8079713 - 8079919
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8079713 gagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatga 8079812  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079813 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 8079912  T
Q  205 gggccta 211  Q
    || ||||    
T  8079913 ggaccta 8079919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 19715173 - 19715366
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19715173 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatga 19715272  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19715273 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43905847 - 43905650
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905847 aaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 43905748  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43905747 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43905650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928707
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 41928707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 42370807 - 42371003
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42370807 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatga 42370906  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42370907 taagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46761159 - 46760960
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46761159 aaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 46761060  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46761059 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacgggacctaa 46760960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32671772 - 32671575
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32671772 aagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatga 32671673  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671672 taagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 32671575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8121062 - 8120870
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8121062 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 8120963  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120962 taaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 970536 - 970734
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat-- 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  970536 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatat 970635  T
Q  111 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  970636 gataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2347850 - 2347649
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2347850 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatg 2347751  T
Q  112 ataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2347750 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggccta 2347651  T
Q  212 ag 213  Q
    ||    
T  2347650 ag 2347649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12683013 - 12682817
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683013 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12682914  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12682913 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17591881 - 17591685
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17591881 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 17591782  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17591781 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcctaa 17591685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996932
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcct 13996932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2473915 - 2473715
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2473915 aaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataa 2473816  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  2473815 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacgggacctaa 2473716  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  2473715 g 2473715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 51359229 - 51359424
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51359229 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatga 51359328  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359329 taagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146168
Alignment:
Q  19 gttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  119 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagcct 49146168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203109
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggcc 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46409630 - 46409431
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409630 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactat 46409531  T
Q  111 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46409530 gataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcct 46409431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 15554164 - 15554354
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||          
T  15554164 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaaat----- 15554258  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15554259 ---gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggccta 15554354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 17587517 - 17587694
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17587517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatga 17587616  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaata 190  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17587617 taagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7145400 - 7145207
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145400 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 7145301  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctc-aaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7145300 taaactatttttgtttattta-cccaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacggg 7145207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498457
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggcc 23498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15717977 - 15717787
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15717977 aaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga 15717878  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15717877 -aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 15717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6765652 - 6765458
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  6765652 aaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatga 6765553  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6765552 taaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40149656 - 40149497
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40149656 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 40149557  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 172  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40149556 taaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  40 cttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaa 139  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  140 cacctttaaaaaggc-ttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38172012 - 38171828
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||    
T  38172012 aaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatga 38171926  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  38171925 taaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacggagcct 38171828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086261
Alignment:
Q  77 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccat 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  177 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcctaa 52086261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 193
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  58 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctta 157  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  158 tgggagtagataagcccatataagctcaaaataagc 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217994
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||||| ||||| |||||    ||| |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||  ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcctaa 5217994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675101
Alignment:
Q  135 ccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggcct 5675101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14422898 - 14422702
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 14422799  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14422798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39206781 - 39206582
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 39206682  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206681 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 39206582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18594732 - 18594535
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18594732 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 18594633  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594632 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18594535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29938256 - 29938060
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938256 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 29938157  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938156 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 34679469 - 34679659
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34679469 aaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 34679568  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34679569 taaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836967
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaag 213  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcctaag 10836967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13110599 - 13110406
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13110599 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatga 13110500  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110499 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33278595 - 33278399
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278595 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33278496  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278495 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Original strand, 2042536 - 2042727
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2042536 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 2042635  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042636 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 24113178 - 24113377
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24113178 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 24113277  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24113278 taatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaa 24113377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 22260642 - 22260840
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22260642 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactagga 22260741  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260742 taagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 22260840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 6144285 - 6144482
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144285 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 6144384  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6144385 taagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 6144482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118239
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4036042 - 4035845
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036042 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4035943  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4035942 taagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcct 4035845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 144589 - 144397
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144589 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 144490  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  144489 taaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39218972 - 39218773
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39218972 aaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatga 39218873  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39218872 taaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 39218773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575516
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 34842377 - 34842572
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842377 aaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 34842476  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842477 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 34998908 - 34999101
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34998908 aaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaaga 34999007  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34999008 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacggg 34999101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7774959 - 7774760
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7774959 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7774860  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7774859 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggcctaa 7774760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 44804956 - 44805145
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44804956 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 44805055  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44805056 taagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 38167167 - 38167363
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167167 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 38167266  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38167267 taaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggcc 38167363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7791606 - 7791407
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7791606 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 7791507  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7791506 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggtctaa 7791407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7811991
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcctaa 7811991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021721
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 33287079 - 33287238
Alignment:
Q  55 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33287079 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagc 33287178  T
Q  155 ttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaaga 214  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33287179 atatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcctaaga 33287238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5320759 - 5320563
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5320759 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatga 5320660  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5320659 taaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 210
Target Start/End: Original strand, 40117906 - 40118061
Alignment:
Q  55 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggc 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  40117906 ggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggc 40118005  T
Q  155 ttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118006 ttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 40118061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491155
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggcct 36491155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28639475 - 28639274
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639475 aaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 28639378  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggct----tatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    ||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  28639377 taaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacgggac 28639278  T
Q  209 ctaa 212  Q
    ||||    
T  28639277 ctaa 28639274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783942
Alignment:
Q  69 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  169 aagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 26783942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571598
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571685 gctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 66191 - 66384
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagg-taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  66191 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatt 66290  T
Q  112 ataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  66291 ataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9807455 - 9807339
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9807455 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatga 9807356  T
Q  113 taagctatttttattta 129  Q
    |||||||||||||||||    
T  9807355 taagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322221
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcct 2322221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005162
Alignment:
Q  80 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 179  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  180 agctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaacaggacctaa 5005162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  121 ttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 37698141 - 37698340
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37698141 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 37698240  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698241 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 37698340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856089
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 22174988 - 22175185
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174988 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 22175087  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175088 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 22175185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50529119 - 50528920
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529119 aaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 50529020  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529019 taagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 50528920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308100
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 42308100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999382
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520337
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 46452160 - 46452357
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46452160 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 46452259  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46452260 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15520826 - 15520626
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520826 aaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15520727  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520726 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 15520627  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  15520626 g 15520626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29445678 - 29445480
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29445678 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatga 29445579  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445578 taagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 29445480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8042797 - 8042600
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042797 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 8042698  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8042697 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcct 8042600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20699339 - 20699144
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699339 aaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20699240  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699239 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 24835697 - 24835896
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24835697 aaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataa 24835796  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24835797 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcctaa 24835896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117853
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 12117853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21581232 - 21581042
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581232 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 21581133  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21581132 taagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 20842346 - 20842543
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20842346 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatga 20842445  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842446 taagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 20842543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32244310 - 32244117
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244310 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32244211  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244210 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 25494283 - 25494479
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494283 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25494382  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25494383 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 209 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 47811005 - 47810799
Alignment:
Q  209 ctaagaacaagatggcattgtgcttttgctttccatcccactgatatactttaaggcataatgcatttactatgaagatgatttgaaaatgacagtggga 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47811005 ctaagaacaagatggcattgtgcttttgctttccatcccactgatatactttaaggcataatgcatttacgatgaagatgatttgaaaatgacagtggaa 47810906  T
Q  309 attgcatttcggagaatggaagaatggttttttacaagatcagagaaacttg----------catggtaacacaccacataaactaacccacttgggttg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47810905 attgcatttcggagaatggaagagtggttttttacaagatcagagaaacttgcatgaacttgcatggtaacacaccacataaactaacccacttgggttg 47810806  T
Q  399 gtctggt 405  Q
    |||||||    
T  47810805 gtctggt 47810799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 54870172 - 54870370
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  54870172 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatga 54870271  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870272 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggccta 54870370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35226637 - 35226437
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226637 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 35226538  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35226537 taagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggcctaa 35226438  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  35226437 g 35226437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38934135 - 38933936
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38934135 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 38934036  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934035 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 38933937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609530
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggtctaa 44609530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 54534326 - 54534523
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54534326 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatga 54534423  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534424 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 54534523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 42104969 - 42105171
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42104969 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 42105068  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  42105069 taaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcctaatggggtctaa 42105168  T
Q  213 gaa 215  Q
    |||    
T  42105169 gaa 42105171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122808
Alignment:
Q  19 gttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  119 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32359449 - 32359256
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359449 aaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 32359350  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359349 taaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34700533 - 34700332
Alignment:
Q  11 caaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34700533 caaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactat 34700434  T
Q  111 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34700433 gataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcct 34700334  T
Q  211 aa 212  Q
    ||    
T  34700333 aa 34700332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44688950 - 44688760
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44688950 aaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatga 44688852  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||     |||||||||| |||||||||||    
T  44688851 taagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc-----ataagccaattcaaacggggcc 44688760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2895379 - 2895179
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 108  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895379 aaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 2895280  T
Q  109 atgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  2895279 atgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaatggggc 2895180  T
Q  209 c 209  Q
    |    
T  2895179 c 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 53028407 - 53028216
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  53028407 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatga 53028308  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53028307 taagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcctaa 53028216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 48925001 - 48925189
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48925001 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatga 48925100  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48925101 taaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354367
Alignment:
Q  14 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  114 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagc 182  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataatctcatataagc 16354367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35643365 - 35643212
Alignment:
Q  55 ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggc 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  35643365 ggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaaggc 35643266  T
Q  155 ttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35643265 ttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 203
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  69 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  169 aagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12916096 - 12915930
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  12916096 aagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatga 12915997  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataa 180  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  12915996 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128042
Alignment:
Q  75 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagccc 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  175 atataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    | ||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcct 49128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24366219 - 24366143
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366219 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13696991 - 13696914
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 82  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696991 gagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366085
Alignment:
Q  153 gcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcct 24366085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 49
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528916
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Original strand, 10449112 - 10449149
Alignment:
Q  177 ataagctcaaaataagcc-aatccaaacggggcctaag 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10449112 ataagctcaaaataagcccaatccaaacggggcctaag 10449149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 24792334 - 24792532
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792334 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 24792433  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24792434 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggccta 24792532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 43067975 - 43068172
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43067975 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatga 43068074  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43068075 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 43068172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164179
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggtctaa 7164179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 30181026 - 30181223
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181026 aagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 30181125  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181126 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 30181223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 12101180 - 12101377
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101180 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 12101279  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12101280 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcct 12101377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 42964998 - 42965195
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964998 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42965097  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42965098 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcct 42965195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 33359092 - 33359288
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359092 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33359191  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359192 taagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20346682 - 20346487
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346682 aaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 20346583  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346582 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3511517 - 3511324
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511517 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 3511418  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3511417 taagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacggg 3511324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15656106 - 15655909
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656106 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 15656007  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656006 taagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15655909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649892
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25748681 - 25748485
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748681 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 25748582  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25748581 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42204349 - 42204151
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204349 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42204250  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacaccttta-aaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204249 taagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 42204151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6394945 - 6394748
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6394945 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 6394846  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6394845 taaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcct 6394748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 33846531 - 33846724
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33846531 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatga 33846625  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846626 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 33846724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 933479 - 933282
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933479 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 933380  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  933379 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcct 933282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5281054 - 5280861
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5281054 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 5280955  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280954 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 5280861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 4477323 - 4477515
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4477323 aaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatga 4477422  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477423 taagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 12097592 - 12097788
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12097592 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatga 12097691  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12097692 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1803220 - 1803029
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1803220 aaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatga 1803121  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1803120 taagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041538
Alignment:
Q  17 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  117 ctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggccta 32041538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 36890832 - 36891028
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36890832 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatga 36890931  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  36890932 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcct 36891028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43156907 - 43156718
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  43156907 aaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatga 43156808  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43156807 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347270
Alignment:
Q  18 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  118 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcct 4347270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42673655 - 42673467
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673655 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42673556  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    |||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42673555 taagctgtttttatttac----ccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9452784 - 9452591
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9452784 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatga 9452685  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9452684 taaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630665
Alignment:
Q  20 ttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  120 tttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38866738 - 38866547
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38866738 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatga 38866639  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  38866638 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17753794 - 17753600
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17753794 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgt 17753695  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17753694 taagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 46891341 - 46891535
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46891341 aaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatga 46891440  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacaccttt-aaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46891441 caaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48865827 - 48865665
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865827 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 48865728  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacaccttta---aaaaggcttatgggagtagataagc 172  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  48865727 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134500
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 207  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 16894509 - 16894696
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894509 aaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16894608  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894609 taaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtag----------ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 16894696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828267
Alignment:
Q  62 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggg 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  162 agtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcct 19828267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 43021582 - 43021775
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  43021582 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataa 43021677  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  43021678 taagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcct 43021775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704977
Alignment:
Q  112 ataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcct 37704977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006010
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    || | ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcct 37006010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405017
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    || |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcct 43405017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655611
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||  |||||| |||| || ||||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcct 15655611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  64 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggag 163  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  164 tagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||| || |||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163812
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 172  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||| | || | ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  173 ccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaaga 214  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaaaaagggcctaaga 20163812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  118 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   | | ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    |||  ||||||||| | || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 212
Target Start/End: Original strand, 22032911 - 22032947
Alignment:
Q  177 ataagctcaaaataagc-caatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22032911 ataagctcaaaataagctcaatccaaacggggcctaa 22032947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36898 - 36698
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36898 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 36799  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36798 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 36699  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  36698 g 36698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 31517227 - 31517423
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31517227 aaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 31517326  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517327 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 18806896 - 18807094
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18806896 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatga 18806995  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806996 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 18807094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323395
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 26323395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 33906059 - 33906256
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906059 aaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 33906158  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33906159 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggcct 33906256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873452
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39635645 - 39635445
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39635645 aaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 39635546  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39635545 taagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcctaa 39635446  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  39635445 g 39635445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108276
Alignment:
Q  21 tacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  121 ttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 1108276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232351
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4016232 - 4016039
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016232 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 4016133  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    || | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016132 tacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 30270691 - 30270888
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30270691 aaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 30270790  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30270791 taaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcct 30270888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 6174840 - 6175039
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6174840 aaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 6174939  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6174940 taaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 6175039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42937913 - 42937714
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937913 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 42937814  T
Q  112 ataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42937813 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagccta 42937714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 28329851 - 28330042
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28329851 aaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagctag--ggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatga 28329948  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28329949 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5733592 - 5733395
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5733592 aaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 5733493  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  5733492 taagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcct 5733395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 2178781 - 2178980
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178781 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 2178880  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||| || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2178881 taagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcctaa 2178980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901346
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901253 gctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 19901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 19383947 - 19384126
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19383947 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatga 19384046  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataag 192  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19384047 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420378
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggactaa 30420378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 851190 - 850997
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  851190 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatga 851091  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  851090 taagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 205
Target Start/End: Original strand, 1482915 - 1483106
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1482915 aaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataa 1483014  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1483015 taagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588986
Alignment:
Q  15 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  115 agctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagccta 16588986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 16066306 - 16066495
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066306 aaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 16066405  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16066406 taagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429817
Alignment:
Q  16 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  116 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacgg 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 44947561 - 44947749
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947561 aaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatga 44947653  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44947654 taaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaatggggc 44947749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446779
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    |||  ||||||||||  |  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggccta 42446779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 170
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101316
Alignment:
Q  64 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggag 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  164 tagataa 170  Q
    |||||||    
T  22101310 tagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  57 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctt 156  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  157 atgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgg 205  Q
    |||  ||| |||||  ||| |||||||   |||||||| ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 203
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517385
Alignment:
Q  73 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 172  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||  || ||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  173 ccatataagctcaaaataagccaatccaaac 203  Q
     || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  12517356 tcacataagct-taaataagccaatccaaac 12517385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 18 - 218
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 117  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  118 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcctaa 217  T
Q  213 g 213  Q
    |    
T  218 g 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3911 - 3708
Alignment:
Q  5 gagaagcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 104  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3911 gagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 3812  T
Q  105 aactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3811 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacg 3712  T
Q  205 gggc 208  Q
    ||||    
T  3711 gggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10431 - 10234
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10431 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatga 10332  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 210  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10331 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 145257 - 145450
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145257 aaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 145356  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  145357 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 307 - 506
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  307 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 406  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaa 212  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  407 taatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggtctaa 506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 18 - 217
Alignment:
Q  13 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18 aaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatga 116  T
Q  113 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta---gataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  117 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggacc 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 1065
Alignment:
Q  182 ctcaaaataagccaatccaaacggggccta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1094 ctcaaaataagccaatccaaacggggccta 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University