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Alignment Overview

Query: NF20963_high_11 (Length: 444)

Name: NF20963_high_11
Description: NF20963
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20963_high_11
NF20963_high_11
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (1-350)||(47602861-47603211)
chr1 (1-349)||(37441186-37441535)
chr1 (5-349)||(36418896-36419241)
chr1 (54-351)||(24469815-24470113)
chr1 (125-349)||(32179774-32179998)
chr1 (153-350)||(7702779-7702976)
chr1 (4-221)||(35309406-35309622)
chr1 (163-350)||(35810672-35810859)
chr1 (166-351)||(15306450-15306635)
chr1 (163-350)||(42916113-42916300)
chr1 (163-349)||(25124885-25125071)
chr1 (163-349)||(46264944-46265130)
chr1 (163-340)||(7596347-7596524)
chr1 (163-349)||(23916764-23916950)
chr1 (163-350)||(42937028-42937215)
chr1 (179-350)||(45581007-45581178)
chr1 (163-346)||(15662903-15663086)
chr1 (176-350)||(39802766-39802940)
chr1 (179-340)||(20349116-20349277)
chr1 (177-350)||(29677518-29677691)
chr1 (166-350)||(31869551-31869735)
chr1 (177-349)||(38061178-38061350)
chr1 (163-340)||(19508482-19508659)
chr1 (177-349)||(28006318-28006490)
chr1 (214-349)||(15014320-15014455)
chr1 (166-341)||(23915605-23915780)
chr1 (219-350)||(44596527-44596658)
chr1 (211-349)||(50447343-50447481)
chr1 (180-349)||(43087466-43087635)
chr1 (163-349)||(7016075-7016261)
chr1 (163-340)||(20347622-20347797)
chr1 (177-343)||(40159636-40159802)
chr1 (177-349)||(21680656-21680828)
chr1 (177-349)||(47983223-47983395)
chr1 (211-349)||(7995973-7996111)
chr1 (240-350)||(12224574-12224684)
chr1 (231-349)||(14578585-14578703)
chr1 (167-352)||(13645177-13645362)
chr1 (187-340)||(45653441-45653593)
chr1 (266-349)||(6413296-6413379)
chr1 (266-349)||(7841680-7841762)
chr1 (266-349)||(24575966-24576049)
chr1 (176-345)||(3577637-3577807)
chr1 (177-339)||(5204479-5204641)
chr1 (175-340)||(31816534-31816699)
chr1 (166-350)||(36119029-36119212)
chr1 (190-345)||(14796569-14796724)
chr1 (190-345)||(14805443-14805598)
chr1 (163-254)||(40002848-40002939)
chr1 (246-307)||(35309607-35309668)
chr1 (214-350)||(15257170-15257306)
chr1 (182-350)||(48575079-48575247)
chr1 (163-290)||(29113584-29113710)
chr1 (189-246)||(11991252-11991309)
chr1 (177-349)||(7956292-7956464)
chr1 (176-349)||(14101829-14102003)
chr1 (177-254)||(8828321-8828398)
chr1 (394-429)||(48808414-48808449)
chr1 (153-203)||(44596472-44596522)
chr1 (205-285)||(14770580-14770660)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (1-349)||(27905888-27906238)
chr5 (1-345)||(18879985-18880328)
chr5 (1-349)||(29327824-29328183)
chr5 (1-209)||(22921841-22922050)
chr5 (163-350)||(3801363-3801550)
chr5 (163-351)||(15933114-15933305)
chr5 (163-352)||(31620822-31621011)
chr5 (175-352)||(38522858-38523035)
chr5 (177-349)||(26298279-26298451)
chr5 (173-350)||(20188937-20189114)
chr5 (153-349)||(1840687-1840883)
chr5 (180-350)||(26218018-26218188)
chr5 (163-349)||(31021817-31022003)
chr5 (163-343)||(20190591-20190770)
chr5 (177-349)||(27450581-27450753)
chr5 (177-349)||(39407374-39407546)
chr5 (163-346)||(14500709-14500892)
chr5 (177-349)||(10493953-10494125)
chr5 (177-349)||(34719657-34719829)
chr5 (163-349)||(41783279-41783465)
chr5 (177-346)||(26299815-26299984)
chr5 (153-340)||(19282123-19282310)
chr5 (163-350)||(32156945-32157123)
chr5 (177-349)||(34857315-34857487)
chr5 (177-350)||(27196045-27196218)
chr5 (167-339)||(39414140-39414312)
chr5 (182-305)||(11136051-11136173)
chr5 (177-349)||(19716151-19716318)
chr5 (215-330)||(40056382-40056497)
chr5 (212-349)||(34724754-34724891)
chr5 (266-349)||(32945021-32945104)
chr5 (177-290)||(34723712-34723825)
chr5 (163-354)||(43386681-43386863)
chr5 (163-337)||(30660919-30661093)
chr5 (272-349)||(28247473-28247550)
chr5 (177-254)||(39409108-39409185)
chr5 (176-244)||(3457793-3457861)
chr5 (176-307)||(1225318-1225449)
chr5 (266-349)||(5382825-5382908)
chr5 (266-349)||(10327987-10328070)
chr5 (163-252)||(30051408-30051497)
chr5 (273-349)||(4983327-4983402)
chr5 (1-104)||(3805058-3805161)
chr5 (295-349)||(39409212-39409266)
chr5 (272-345)||(17168447-17168520)
chr5 (209-298)||(24536007-24536096)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (1-349)||(19087-19436)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-349)||(41958934-41959283)
chr2 (1-349)||(36538447-36538796)
chr2 (1-337)||(34064505-34064833)
chr2 (1-347)||(26436166-26436491)
chr2 (122-349)||(27634578-27634811)
chr2 (169-349)||(33831455-33831635)
chr2 (26-235)||(33831252-33831453)
chr2 (219-349)||(33163980-33164110)
chr2 (166-349)||(3409188-3409371)
chr2 (166-346)||(44740486-44740665)
chr2 (174-349)||(11027873-11028048)
chr2 (163-349)||(34116173-34116359)
chr2 (163-348)||(30713110-30713295)
chr2 (1-110)||(27633531-27633640)
chr2 (180-348)||(2646975-2647143)
chr2 (208-345)||(24844670-24844807)
chr2 (163-344)||(39690124-39690296)
chr2 (177-349)||(40458889-40459061)
chr2 (163-350)||(27902438-27902624)
chr2 (179-346)||(11006977-11007142)
chr2 (163-307)||(38409613-38409757)
chr2 (163-343)||(41332185-41332365)
chr2 (179-349)||(18667721-18667891)
chr2 (266-350)||(20203713-20203797)
chr2 (274-353)||(29806971-29807050)
chr2 (176-286)||(2578046-2578156)
chr2 (176-305)||(14103234-14103363)
chr2 (166-349)||(40680178-40680349)
chr2 (266-349)||(27464572-27464655)
chr2 (176-350)||(9963726-9963900)
chr2 (163-240)||(20987768-20987845)
chr2 (179-247)||(44935737-44935805)
chr2 (1-52)||(20986455-20986506)
chr2 (211-305)||(13829880-13829974)
chr2 (262-340)||(35796278-35796356)
chr2 (177-233)||(29806885-29806941)
chr2 (219-340)||(45383147-45383268)
chr2 (211-283)||(19589841-19589912)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-343)||(41609678-41610021)
chr3 (1-347)||(23206310-23206657)
chr3 (4-349)||(32688972-32689309)
chr3 (163-349)||(39135308-39135494)
chr3 (153-350)||(9505120-9505317)
chr3 (163-350)||(44574480-44574667)
chr3 (163-349)||(54393443-54393629)
chr3 (166-350)||(25253659-25253843)
chr3 (189-350)||(19560773-19560934)
chr3 (163-343)||(39942806-39942986)
chr3 (166-349)||(52934769-52934952)
chr3 (173-349)||(46293213-46293389)
chr3 (163-350)||(33438730-33438917)
chr3 (163-350)||(39469530-39469717)
chr3 (206-349)||(52199426-52199569)
chr3 (177-349)||(12710670-12710842)
chr3 (166-343)||(28242540-28242717)
chr3 (177-349)||(30662131-30662303)
chr3 (176-341)||(28687039-28687204)
chr3 (177-349)||(40943529-40943701)
chr3 (166-254)||(52199346-52199434)
chr3 (163-353)||(5418632-5418822)
chr3 (176-289)||(50965370-50965484)
chr3 (176-289)||(51068505-51068619)
chr3 (199-340)||(18074566-18074707)
chr3 (1-110)||(39134151-39134260)
chr3 (177-349)||(20550202-20550374)
chr3 (177-348)||(26049541-26049712)
chr3 (230-349)||(30743593-30743712)
chr3 (163-254)||(53529685-53529776)
chr3 (176-345)||(26136300-26136469)
chr3 (271-345)||(45714758-45714832)
chr3 (271-349)||(54432177-54432255)
chr3 (163-305)||(1072753-1072895)
chr3 (189-339)||(1674609-1674759)
chr3 (219-349)||(55452670-55452799)
chr3 (169-225)||(33896790-33896846)
chr3 (163-222)||(45714679-45714738)
chr3 (166-252)||(28700954-28701040)
chr3 (317-350)||(53529616-53529649)
chr3 (266-330)||(48730856-48730920)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (1-345)||(3930720-3931065)
chr7 (1-350)||(5794935-5795276)
chr7 (26-349)||(37334099-37334423)
chr7 (2-348)||(36926796-36927143)
chr7 (1-349)||(48505795-48506137)
chr7 (1-349)||(43052677-43053017)
chr7 (1-350)||(42071888-42072229)
chr7 (38-352)||(26216106-26216413)
chr7 (1-276)||(15434039-15434315)
chr7 (90-349)||(28949758-28950019)
chr7 (130-349)||(5776130-5776349)
chr7 (153-350)||(665846-666043)
chr7 (5-221)||(388787-389003)
chr7 (163-340)||(45176204-45176381)
chr7 (163-350)||(3942135-3942322)
chr7 (163-351)||(20400955-20401143)
chr7 (163-349)||(7447835-7448021)
chr7 (166-349)||(44421901-44422085)
chr7 (166-349)||(33935470-33935653)
chr7 (165-349)||(22075024-22075208)
chr7 (176-349)||(222226-222399)
chr7 (246-343)||(388988-389085)
chr7 (187-343)||(45055711-45055867)
chr7 (168-343)||(10618885-10619060)
chr7 (163-349)||(11595796-11595982)
chr7 (214-352)||(33124705-33124843)
chr7 (163-350)||(27231538-27231725)
chr7 (166-349)||(37401566-37401749)
chr7 (177-349)||(33898944-33899116)
chr7 (177-348)||(18249994-18250165)
chr7 (163-349)||(40480050-40480237)
chr7 (177-349)||(21760583-21760755)
chr7 (177-349)||(23226999-23227171)
chr7 (177-349)||(23236152-23236324)
chr7 (177-349)||(46573612-46573784)
chr7 (190-349)||(49034224-49034383)
chr7 (1-110)||(7444185-7444294)
chr7 (176-349)||(33171534-33171707)
chr7 (1-108)||(45174985-45175092)
chr7 (176-300)||(2466565-2466690)
chr7 (176-349)||(10096443-10096616)
chr7 (177-350)||(18740217-18740390)
chr7 (177-349)||(17025361-17025533)
chr7 (177-349)||(26719788-26719960)
chr7 (177-349)||(32356934-32357106)
chr7 (166-349)||(36472401-36472584)
chr7 (187-292)||(23237574-23237679)
chr7 (217-350)||(46652632-46652765)
chr7 (163-254)||(44994059-44994150)
chr7 (1-55)||(28950018-28950072)
chr7 (231-349)||(37106853-37106971)
chr7 (311-350)||(15434312-15434351)
chr7 (267-350)||(35543555-35543638)
chr7 (166-293)||(48634409-48634536)
chr7 (177-348)||(41449724-41449884)
chr7 (163-349)||(17608671-17608854)
chr7 (187-242)||(23223561-23223616)
chr7 (176-335)||(29037794-29037953)
chr7 (177-300)||(30919395-30919518)
chr7 (272-346)||(33019369-33019443)
chr7 (277-345)||(31491888-31491956)
chr7 (167-222)||(5283008-5283063)
chr7 (211-254)||(29527393-29527436)
chr7 (268-339)||(33140812-33140883)
chr7 (187-254)||(37250017-37250084)
chr7 (122-158)||(45176126-45176162)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (1-349)||(12789552-12789901)
chr4 (1-350)||(45674635-45674976)
chr4 (1-336)||(44791256-44791583)
chr4 (90-349)||(53369752-53370012)
chr4 (4-302)||(49820778-49821075)
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chr4 (78-349)||(19852846-19853118)
chr4 (26-350)||(50605841-50606149)
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chr4 (140-349)||(21441512-21441721)
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chr4 (163-349)||(36543735-36543921)
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[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-349)||(10346512-10346861)
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[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (24-349)||(453304-453623)
chr8 (26-343)||(11161397-11161706)
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[»] scaffold0224 (1 HSPs)
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[»] scaffold0260 (2 HSPs)
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[»] scaffold0223 (1 HSPs)
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[»] scaffold0025 (1 HSPs)
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[»] scaffold0954 (1 HSPs)
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[»] scaffold0444 (1 HSPs)
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[»] scaffold0135 (1 HSPs)
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[»] scaffold0192 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47603211 - 47602861
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47603211 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcaaccac 47603112  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47603111 atttgccacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 47603012  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47603011 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcg 47602912  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47602911 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgtcagccctac 47602861  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37441535 - 37441186
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37441535 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 37441436  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37441435 atttgccacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagacatctcattaacctaacgagtcgaact 37441336  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37441335 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcg 37441236  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37441235 agttgaatgtcgaactataatctagttgattcggttcattgccagcccta 37441186  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 36418896 - 36419241
Alignment:
Q  5 aacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacattt 104  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36418896 aacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattattttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccacattt 36418995  T
Q  105 gccacatttgaattaaattt-tttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatat 203  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36418996 gccacatttgaattaaaaaaatttaaaaactaattcaaattgatttatatatataatcgataatcgagtcatctcatgaacctaacgagtcgaactatat 36419095  T
Q  204 gtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtc 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36419096 gtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcggctcaagtccagctcattaggttcatgaaccaagttcgacggattaaatatcgagtc 36419195  T
Q  304 gaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36419196 gaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 36419241  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24470113 - 24469815
Alignment:
Q  54 taaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatc 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  24470113 taaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagcgacatttgccacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttata 24470014  T
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470013 tatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 24469914  T
Q  253 gtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 351  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24469913 gtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 24469815  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 125 - 349
Target Start/End: Original strand, 32179774 - 32179998
Alignment:
Q  125 tttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatt 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32179774 tttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataattgagtcatctcatgaaccgaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatt 32179873  T
Q  225 taattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32179874 taattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcattaggtttatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgag 32179973  T
Q  325 ttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32179974 ttggttcggttcattgccagcccta 32179998  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Original strand, 7702779 - 7702976
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7702779 tatataatcaataatcgagctatctcatgaacctaacgagtagaattatgcgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 7702878  T
Q  253 gtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7702879 gtccagctcgttagcttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 7702976  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 35309406 - 35309622
Alignment:
Q  4 caacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatt 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||| |||||||    
T  35309406 caacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaacttcaactgctcttccctttaagacaaaattgaattcagccacatt 35309505  T
Q  104 tgccacatttgaatt-aaattttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactata 202  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35309506 tgccacatttgaattaaaaaattttaaaaactaactcaaattgattta--tatataatcgataagcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactata 35309603  T
Q  203 tgtagcttaagttcagctc 221  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  35309604 tgtagctcaagttcagctc 35309622  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 35810672 - 35810859
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||   |||      
T  35810672 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagttcaagttcggctcaattatttgacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 35810771  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35810772 tttggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattgtcgaatcgaattacgaactttaatcgagttggttcggttcattgccagccctac 35810859  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 351
Target Start/End: Original strand, 15306450 - 15306635
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  ||     
T  15306450 atcgagtcagctcatgaaccaatcgagtcgaactatatacagctcaagttcggctcatttatttaatgaacttaattttccgctcaagttcagctcattt 15306549  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |  ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15306550 ggttcatgaaccaagttcaatgaattaattatcgaatcgagttccgaactattgtcaagttggttcggttcattgccagccctaca 15306635  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42916300 - 42916113
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | | | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||      
T  42916300 ataatcgagtcatctcatgaaccaaacgagtcgacctatatatggttcaagttcagctcaattagttagcgaacttaattttcagctcaagttcggctca 42916201  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42916200 tttggttcatgaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatcgaattacgaacactaatcgaattggttcggttcattgccacccctac 42916113  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25125071 - 25124885
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||   |||      
T  25125071 ataatcgaatcatctcgtgaaccaaacgagctgaactacatatagctcaagttcagctcaattagttcacgaaattaattttcagctcaagttcggctca 25124972  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25124971 tttggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattatcaaatcgaattacgaactttaatcgagttggttcggttcattgccagcccta 25124885  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 46265130 - 46264944
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||      
T  46265130 ataatcgagtcatctcatgaaccaaacgagtcgacctatatatagttcaagttcagctcaattagttagcgaacttaattttcagctcaagttcggctca 46265031  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46265030 tttagttcatgaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatcgaattacgaacactaatcgaattggttcggttcattgccaccccta 46264944  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 7596347 - 7596524
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||      
T  7596347 ataatcgagtcatctcatgaatcaaacgagtcgaactacatatagttcaagttcagctcaattagttagcgaacttaattttcagctcaagttcggctca 7596446  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7596447 tttggttcataaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatcaaattacgaactctaatcgagttggttcggttcattg 7596524  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 23916764 - 23916950
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||   |||      
T  23916764 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatattgctcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttaggctca 23916863  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||| ||||||||||||  | |||| || |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23916864 tttggttaatgaaccaagtttgatgaatcaattatcgaatcgaattacgaactttaatcgagttggtttggttcattgtcagcccta 23916950  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 42937028 - 42937215
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||   |||      
T  42937028 ataatcgattcatctcgtgaaccaaacgagttgaactatacatagctcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttaagctcaagttcggctca 42937127  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || | |||||||||||||||| |||||| || | | || ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42937128 tttgattcatgaaccaagttcgacgaatcaattgttgaatcgaattacgaactctaatcgagttggttcagttcattgccagccctac 42937215  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 179 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45581178 - 45581007
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaacca 278  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  | ||  || |||||||||||||    
T  45581178 atgaaccaaacgagtcgaaccatatatagctaatgttcatctcatttagttaatgaacttaattttccgctcaagttcaactcatttggttcatgaacca 45581079  T
Q  279 agttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45581078 agttcaacgagataattatcgaatcgagtttcgaactattttcaagttggttcggttcattgtcagccctac 45581007  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 346
Target Start/End: Original strand, 15662903 - 15663086
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||   |||      
T  15662903 ataatcgagtcatctcatgaaccaaaagagtcgaactacatatagcttaagttcggttcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 15663002  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| || ||| || | ||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15663003 tttggtacatgaaccaagttcgacgaatcaattattgaattgaattacaaactctaattgagttggttcggttcattgtcagcc 15663086  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39802940 - 39802766
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||  || ||||||||||    
T  39802940 ctcatgaaccaaacgaatcgagctatacatagctcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaa 39802841  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||| |||||||||||||| |  |||  ||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39802840 ccatgttcaacgaattaactgccgaaccgagtctcgaactattttcgagttggttcgattcattgccagccctac 39802766  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 340
Target Start/End: Original strand, 20349116 - 20349277
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaacca 278  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||  || |||  ||||| ||    
T  20349116 atgaaccaaacgagtcgaattatatatagttcaaattcagctcatttaattaacgaacttaattttcatctgaagttcggctcatttggtatatgaatca 20349215  T
Q  279 agttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20349216 agttcaacgaattaattatcgagtcaaattttaaactatgttcgagttggttcggttcattg 20349277  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29677691 - 29677518
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    ||  || ||||| |||||    
T  29677691 tcatgaagcaaacgagtcgaactatacttagttcaagttcagctcatttatttaaagagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcgtgaac 29677592  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||  || |||| | |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29677591 caagttcaacgaaccaattatcaaatcgagtatcgaactattttcgagttggttcggttcattgccagccctac 29677518  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Original strand, 31869551 - 31869735
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||  ||     
T  31869551 atcgagccagctcatgaaccaaccgagtcgaattatatacagctcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttcagcttaagttcggctcattt 31869650  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || | |  ||||||||  |||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  31869651 ggttcatgaaccaagttcaacgatttaattgtcgaatcaagttccgaactattgtcgaattagttcggttcattgtcggccctac 31869735  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38061350 - 38061178
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||    ||  |||||||||| ||     
T  38061350 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaacttaagttcgactcattaggttcataaat 38061251  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38061250 caagttcaacgaatcaattatcaaatcgaatctcgcactattttcgagttggttcggttcattgccagcccta 38061178  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 19508482 - 19508659
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||  || |||||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| |    
T  19508482 ataatcgagtcagttcgtgaaccaaacaagtcgaactatatataactcaaggtcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcg 19508581  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  19508582 tttggttcatgaaccaagttcaacgaactaattaccgagtcgagttccgaactttattcgagttgtatcggttcattg 19508659  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 28006318 - 28006490
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||   | || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  28006318 tcatgaactaaacgagtcgaaccatactcaactcaagttcgactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 28006417  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28006418 caagttcaacgagtcaattatcgaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcggttcattgccggcccta 28006490  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 349
Target Start/End: Original strand, 15014320 - 15014455
Alignment:
Q  214 ttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaa 313  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||   |||  || |||||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||  ||||    
T  15014320 ttcagctcaattaattgatgaacttaattttcaactcaagttcggctcatttggttcatgaatcaagttcgacgaatcaattatcgaatcgaattacgaa 15014419  T
Q  314 ctataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15014420 ctctaatcgagttggttcggttcattgccaacccta 15014455  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23915780 - 23915605
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  | || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||     
T  23915780 atcgagccaactcattaaccaatcgagtcgaactatatacaactcaagttcaactcatttatttaatgaacttaattttcagctaaagttcagctcattt 23915681  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | | || |||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  23915680 ggttcatgaaccaagttcaacgagataattgttgaatcgagtttcgaacttttgtcgagttggttcgattcattgc 23915605  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 44596527 - 44596658
Alignment:
Q  219 ctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactata 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| |||| |  | ||||||     
T  44596527 ctcatttatttaacgaacttaattttcagttcaagttcagctcatttggttcatgaaccaaattcaacgagttaattgtcgaatcgagttccaaactatt 44596626  T
Q  319 atcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44596627 gtcgagttggttcggttcattgccagccctac 44596658  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Original strand, 50447343 - 50447481
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtc 310  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||   |||  || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||    
T  50447343 aagttcaactcatttatttaacgaacttaattttaagttcaagttcggctcatttggttcataaaccaagtttaacgaattaattatcgaatcgagtctc 50447442  T
Q  311 gaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  50447443 gaactattttcgagttggtttggttcattgtcagcccta 50447481  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43087635 - 43087466
Alignment:
Q  180 tgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaa 279  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  43087635 tgaaccaaacgaatcgaactatatataactcaagttcaactcatttaattaacgaacttaatctttagttcaagttcggctcgtttggttcatgaaccaa 43087536  T
Q  280 gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||| || ||| || |||||||| |  |||||| || || |||||  || |||||||| ||||||||    
T  43087535 gttcaacaaactaattaccgagtcgagttccgaactttattcaagttgtatcagttcattgtcagcccta 43087466  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7016261 - 7016075
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||| |||   ||||| |||||| |||| |||||||||  ||||      
T  7016261 ataatcgagtcgtctcatgacccaaacgagtcgaaccgtatatagctcaagctcagcttattaggttaacaaacttagttttgagctcaagttcagctca 7016162  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| || | |||| |||| | ||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7016161 tttggttcatgaaccaagttcaacaaatcaattgtcgaatcgagtctcgaattttgttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 7016075  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 20347622 - 20347797
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||  ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||      
T  20347622 ataatcgagtcaactgatgaaccaaacgagtcgaattatat--agtacaaattcagctcatttaattaacgaacttaattttcatcttaagttcggctca 20347719  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    || ||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20347720 tttggtacatgaatcaaattcaacgaattaattgtcgagtcaaattttaaactatattcgagttgattcggttcattg 20347797  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40159802 - 40159636
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||  || | |||||||||    
T  40159802 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactaagttcaagttcaactcatttatttaacgaacttaattttcaactcaagttcgactcatttgattcatgaac 40159703  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||||| ||| |||  || |||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40159702 caagtccaatgaaccaattatcgaatcgaatatcaaactattttcgagttggttcggttcattgcca 40159636  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21680828 - 21680656
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||||||   |||  ||   ||||| |||    
T  21680828 tcatgaactaaacaagttgaactatatgtagtttatgttcagttcgtttagctaacgaacttaatttttagctcaagttcggctcatttcattcataaac 21680729  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| |||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21680728 caagttcaacgagataattatcgaatcgagtttcgaactattttcgagctggttcggttcattgccaacccta 21680656  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 47983223 - 47983395
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||| |||||||  |||  ||| | |||||||    ||  || ||||| |||||    
T  47983223 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatacttaacttaagttcaactcatttatttaacgagtttagattttaactcaagttcgactcatttggttcgtgaac 47983322  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47983323 caagttcaacaaatcaattatcgaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcaacccta 47983395  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Original strand, 7995973 - 7996111
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtc 310  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||    ||  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||    
T  7995973 aagttgagctcatttatttaacgagcttaattttaaacttaagttcgactcattaggtttatgaaccaagttcaacgaatcaattatcgaatcgaatctc 7996072  T
Q  311 gaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| || |||||    
T  7996073 gaactattttcaagttggttcggttcattgtcaacccta 7996111  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12224684 - 12224574
Alignment:
Q  240 attttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 339  Q
    |||||||||||||||   |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12224684 attttcagctcaagttcggctcatttggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgaattccgaactattgtcgagttggttcggttcatt 12224585  T
Q  340 gccagccctac 350  Q
    | |||||||||    
T  12224584 gtcagccctac 12224574  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14578703 - 14578585
Alignment:
Q  231 acgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || | || | ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  14578703 acgaacttaattttcagctccagttcggctcatttggttcatgaaccaagttcaacaaatcaattgtctaatcgaattacgaactctaatcgagttggtt 14578604  T
Q  331 cggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  14578603 cggttcattgtcagcccta 14578585  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13645362 - 13645177
Alignment:
Q  167 tcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttag 266  Q
    ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| || || || |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| |    
T  13645362 tcgagccagttcatgaaccaaatgagtcgaactatatataactcaaattcaactcatttacttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcgtttg 13645263  T
Q  267 gttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctacat 352  Q
     ||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||| |  | |||| || || |||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  13645262 attcatgaaccaagttaaatgaactaattaccgagtcgagttccaaactttattcaagttgtcttggttcattggcagccctacat 13645177  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45653593 - 45653441
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||    
T  45653593 aacgagtcgaactatatatagttcatgttcagttcatttagctaacgaacttaacttttagctcaagttcggctcatttggttcatgaaccaagttcaac 45653494  T
Q  287 gaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||| ||| | |||| |||| | | |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  45653493 gaaataattgtcgaatcgagttttgaactattttcgagttgg-tcggttcattg 45653441  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 6413296 - 6413379
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6413296 ggttcatgaaccaggttcaacgaatcaattatcaaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcgattcattgccagcccta 6413379  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 7841680 - 7841762
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7841680 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaattatcgaatcgagtctcgaa-tattttcgagttggttcggttcattgacagcccta 7841762  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 24575966 - 24576049
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24575966 ggttcatgaaccaagttcaacgagtcaattatcgaatcaaatctcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 24576049  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 345
Target Start/End: Original strand, 3577637 - 3577807
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaag-tctagctggttaggttcatga 274  Q
    ||||| |||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| | ||  |  || | |||||||    
T  3577637 ctcataaaccaaccgagtcgaactacatatagctcaagttcagctcatttatttaacgaattaatttttcagctcaagttttaattcatttgattcatga 3577736  T
Q  275 accaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| |||| |  | ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3577737 accaagttcaacgagttaactgtcgaatcgagttccaaactattgtcgagttagttcggttcattgtcagc 3577807  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5204641 - 5204479
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   |  | ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||  || |||||| ||||    
T  5204641 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactcaattcaagttcgactcatttatttaacgaacttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcacgaac 5204542  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 339  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  5204541 caagttcaacgagtcaattatcgaatcgaatctcaaactattttcgagttggttcgattcatt 5204479  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 340
Target Start/End: Original strand, 31816534 - 31816699
Alignment:
Q  175 tctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatga 274  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||   || || |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||  || ||||  | ||  || |||||||||    
T  31816534 tctcgtgaaccaaacgagtcgaattatccataactcaagttcggctcatttatttgacgagcttaattttcgactgaagttcaactcatttggttcatga 31816633  T
Q  275 accaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    |||||||||||||||| || || ||| | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31816634 accaagttcaacgaatcaattaccgaattgagtttcgaactattttcgagttggttcggttcattg 31816699  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Original strand, 36119029 - 36119212
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||| | |||||||  || |  ||     
T  36119029 atcgagccaactcatgaaccaaacgaatcgaattatatatagttcaagttcagctcgtttagttaacaaacttca-tttgaactcaagttcagttcattt 36119127  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||| |||||||||| ||||   || | |||| |||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36119128 ggttcataaaccaagttcgacgagaaaattgtcgaatcgaatttcgaactattttttagttggttcggttcattgtcagccctac 36119212  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 345
Target Start/End: Original strand, 14796569 - 14796724
Alignment:
Q  190 gagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaa 289  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  | ||   | ||||||||||||| ||||||||||    
T  14796569 gagtcgaactatatatagtcaaagttcaactcatttatttaacgaacttaatttaaagttcaagttcaacttaattggttcatgaaccacgttcaacgaa 14796668  T
Q  290 ttaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||| | |||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14796669 ttaattatcgagtcaagttccgaactttgatcgagttagctcggtttattgtcagc 14796724  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 345
Target Start/End: Original strand, 14805443 - 14805598
Alignment:
Q  190 gagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaa 289  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||  | ||   | ||||||||||||| ||||||||||    
T  14805443 gagtcgaactatatatagtcaaagttcaactcatttatttaacgaacttaatttaaagttcaagttcaacttaattggttcatgaaccacgttcaacgaa 14805542  T
Q  290 ttaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    |||| ||||||||| | |  |||||| | |||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14805543 ttaattatcgagtcaagttccgaactttgatcgagttagctcggtttattgtcagc 14805598  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Original strand, 40002848 - 40002939
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  40002848 ataatcgagtcatctcgtgaatcaaacgagtcgaactacatatagctcaagttcaactcaattagttgacgaacttaattttcaactcaagt 40002939  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 307
Target Start/End: Original strand, 35309607 - 35309668
Alignment:
Q  246 agctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaat 307  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35309607 agctcaagttcagctcgtgaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagtcgaat 35309668  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15257306 - 15257170
Alignment:
Q  214 ttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaa 313  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||||||| ||| |||  || |||||| |||| | || ||    
T  15257306 ttcaactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaaccaagtccaatgaaccaattatcgaatcgagtatcaaa 15257207  T
Q  314 ctataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15257206 ctatttttgagttggttcggttcattgtcagccctac 15257170  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48575247 - 48575079
Alignment:
Q  182 aacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagt 281  Q
    |||| |||| |||||||||||  || || ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |  ||||||     | ||| ||||||||||||||||    
T  48575247 aaccaaacgggtcgaactatacttaactcaagttcaactcatttatttgacgaacttaattttaaattcaagttcgattcgtttggttcatgaaccaagt 48575148  T
Q  282 tcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||| || ||| | || | ||  |||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  48575147 tcaacgaattaattaccgaattgagtctcatactattttcgagttagttcggttctttgccggccctac 48575079  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29113710 - 29113584
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| |||| ||  | |||||||||||||| |||| |  |||       
T  29113710 ataatcgagctaactcatgaaccaaacgagttgaactatacatagctcaagttcacctctttta-ttggcaaacttaattttcagttcaaattcagccta 29113612  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaat 290  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  29113611 tttggttcatgaaccaagttcaacgaat 29113584  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 11991252 - 11991309
Alignment:
Q  189 cgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttca 246  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11991252 cgagtcgaactatatatagtttaagttcagttcatttagttaacgaacataattttca 11991309  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 7956292 - 7956464
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||   || | ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||    ||  ||  ||||||||||    
T  7956292 tcatgaaccaaacgagtcgaatcatactaagttcaagttcaactcatttatttaacaagcttaattttcaattcaagttcgactaattttgttcatgaac 7956391  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||| ||| |||  || |||||| | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7956392 caagtccaatgaaccaattatcgaattgagtatcgaactattttcgagttggttcggttcattgccaacccta 7956464  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 349
Target Start/End: Original strand, 14101829 - 14102003
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaatttt-cagctcaagtctagctggttaggttcatga 274  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||  | || |||||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||  || |||||||||    
T  14101829 ctcaggaaccaaccgagtcgaattatatacaactaaagttcggctcgtttatttaacgaatttaatttttcagctcaaattcagctcatttggttcatga 14101928  T
Q  275 accaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||||||| ||  ||| | |||| |||| | | ||||||| ||| ||||||||||| |||||| | ||||||    
T  14101929 actaagttcaatgagataattgtcgaatcgagtttggaactattatcaagttggttcggatcattgtcggcccta 14102003  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8828398 - 8828321
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| | ||||| ||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8828398 tcatgaatcaaacgagtcgaattatgtctagctcaagttcaacttatttagttaacagacttaattttcagctcaagt 8828321  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 48808449 - 48808414
Alignment:
Q  394 accttcccaaatttcaaagtgtttgagcttgatagt 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48808449 accttcccaaatttgaaagtgtttgagcttgatagt 48808414  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 44596472 - 44596522
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatat 203  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  44596472 tatattattgattatcgagccagctcatgaaccaaccgagtcgaactatat 44596522  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14770660 - 14770580
Alignment:
Q  205 tagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaa 285  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||   |||  || ||||||| ||||||||||||    
T  14770660 tagctcaagttcagctcaattagttcacgaacttaatttttagatcaagttcggctcatttggttcataaaccaagttcaa 14770580  T

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Target: chr5 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 27905888 - 27906238
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27905888 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttctcttcaagacaaaattgtattcagccac 27905987  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttt--ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaac 198  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27905988 atttgccacatttgaattattttttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcatgagcctaacaagtcgaac 27906087  T
Q  199 tatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatc 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27906088 tatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatc 27906187  T
Q  299 gagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27906188 gagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 27906238  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Original strand, 18879985 - 18880328
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18879985 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcaaccac 18880084  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaattttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaacta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18880085 atttgccacatttgaattaaattttttaaaaacta-ctcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcatgtacctaacgagttgaacta 18880183  T
Q  201 tatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcga 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18880184 tatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagcttaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcga 18880283  T
Q  301 gtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18880284 gtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgtcagc 18880328  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 29327824 - 29328183
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  29327824 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaattgctcttcccttcaagacaaaattgtattcaatcac 29327923  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt--aaaaactaactcaaatttatttatctatata-----att-gataatcgagccatctcatgaacctaacgag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29327924 atttgccacatttgaattaaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatatatatatattcgataatcgagtcatctcatgaacctaacgag 29328023  T
Q  193 tcgaactatatgta----gcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacga 288  Q
    ||||||||||||||    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  29328024 tcgaactatatgtacgtagctcaagttaagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctg-ttaggttcatgaatcaagttcaacgg 29328122  T
Q  289 attaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29328123 attaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagtttgttcggttcattgtcagcccta 29328183  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22921841 - 22922050
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  22921841 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaatcgtattcagccac 22921940  T
Q  101 atttgccacatttgaattaa-attttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921941 atttgtcacatttgaattaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcatgaacctaacgagtctaact 22922040  T
Q  200 atatgtagct 209  Q
    ||||||||||    
T  22922041 atatgtagct 22922050  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3801550 - 3801363
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||      
T  3801550 ataatcgagtcatctcatgaacctaacgaatcgaaccatttatagttcaagttcaactcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 3801451  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3801450 tttggttcatgaaccaagttcaatgaaccaattgtcgagtcgaattacgaactatattcgagttggttcggttcattgccagccctac 3801363  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 15933114 - 15933305
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaatt---ttcagctcaagtctagc 259  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    || |||||| ||  | |    
T  15933114 ataatcgagctaactcatgaaccaaacgagtcgaaccatctatagctcaagttcggctcatttatttaacgaacttaatagtatttagctcatgttcaac 15933213  T
Q  260 tggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 351  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15933214 tcattaggttcatgaaccaagttcaacgaattaactgtcgagtcgaatttcgaactatactcgagttggttcggttcattgccagccctaca 15933305  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 352
Target Start/End: Original strand, 31620822 - 31621011
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||      
T  31620822 ataatcgagccaagtcattaaccaaacgagtcgaattatatgtaactcaagttcagctcatttaattaacgaacttaatattcagctgaagttcaactca 31620921  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctacat 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | ||| | ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31620922 ttaggttcatgaaccaaattcaatggactaattgtcgagtcgaatttcgaactatattcaagttggttcggttcattgtcagccctacat 31621011  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38523035 - 38522858
Alignment:
Q  175 tctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatga 274  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||    
T  38523035 tctcatgaacccaacgaatcgaaccatctatagttcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtttggctcatttggttcatga 38522936  T
Q  275 accaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctacat 352  Q
    ||||||||||| | |  || ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38522935 accaagttcaatggaccaattatcgagtcaaattacgaactatattcgagttggttcggttcattgccagccctacat 38522858  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 26298279 - 26298451
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |  ||  |||||||||||||     
T  26298279 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagtttaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagtttgactcattaggttcatgaat 26298378  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||  |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26298379 caagttcaacgaatcaattatcgaatcgaatctcacactatttttgagttggttcggttcattgccagcccta 26298451  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 350
Target Start/End: Original strand, 20188937 - 20189114
Alignment:
Q  173 catctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcat 272  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||   |||  || |||||||    
T  20188937 catctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagctcaagttcagctcaattagttgacgaacttaatttttagttcaagttcggctcatttggttcat 20189036  T
Q  273 gaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20189037 gaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatcaaattacgaactctaatcgagttgattcggttcattgtcagccctac 20189114  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1840883 - 1840687
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    ||||| || ||| ||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||  | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1840883 tatattatcgattatcgagccagcttatgaaccaaccgagccgaactatatacatctcaagttcagctcatttatttcacgaacttaattttcagctcaa 1840784  T
Q  253 gtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||  ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | || |   |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1840783 gttcagctcatttggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaattgagttctgaactattgtcgagttggttcggttcattgccaacccta 1840687  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 180 - 350
Target Start/End: Original strand, 26218018 - 26218188
Alignment:
Q  180 tgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaa 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  26218018 tgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagtttaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcgtttggttcatgaaccaa 26218117  T
Q  280 gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |  |||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26218118 gttcaacgaactaattaccgagtcgagttccgaactttatttgagttgtatcggttcattgccagccctac 26218188  T

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Target: chr5; HSP #13
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Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||| |||||  |||||||| | |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| |  ||||      
T  31021817 ataattgagcctactcatgaatcaaacgagacgaactatgtatagcttaaattcagctcatttagttaacaaacttaatttcaagctcaaattcagctca 31021916  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31021917 tttggttcatgaaccaaactcaacgagttaattatcgagtcgagttccgaactatattcgagttggttcggttcattgtcagtccta 31022003  T

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Target: chr5; HSP #14
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Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||   | ||||||||||||| |||||||||   |||      
T  20190770 ataatcgagtcatctcatgaaccaaacgattcgaactacatatagctcaagttcagctcaattaggcagcgaacttaattttgagctcaagttcggctca 20190671  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    || |||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20190670 tttggttcatgaaccaagttcgatgaatcaattatcgaatcgaattacgaact-taatagagttggttcggttcattgcca 20190591  T

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Target: chr5; HSP #15
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Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    ||  |||||||||||||     
T  27450753 tcatgaaccaaacgagtcgaaccacatttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagttcgactcattaggttcatgaat 27450654  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||| |||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450653 caaattcaacgaatcaattatcgaatcgaatctcgcactattttcgagttggttcggttcattgccagcccta 27450581  T

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Target: chr5; HSP #16
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Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    ||  |||||||||||||     
T  39407374 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagttcgactcattaggttcatgaat 39407473  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39407474 caagttcaacgaatcaattatcgaatcgaatctcgcactatttttgagttggttcggttcattaccagcccta 39407546  T

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Target: chr5; HSP #17
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Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||  || |||||| |||||||||| |||||| || || ||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||   ||| |    
T  14500892 ataatcgagtcagttcgtgaaccaaacgagtcgagctatatataactcaagttcaactcattcagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcg 14500793  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  14500792 tttggttcatgaaccaagttcaacgaactaattatcgagtcgagttccgaactgtattcgagttgtatcggttcatttccagcc 14500709  T

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Target: chr5; HSP #18
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Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || ||||  |||||    
T  10493953 tcatgaaccaaacgagtcgaactatacttagttcaagttcagctcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggtttgtgaac 10494052  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||  || ||| || |||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10494053 caagttcaacgaaccaattattgaatcgaatatcaaactatttttgagttggttcggttcattgccagcccta 10494125  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34719829 - 34719657
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Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    ||  ||| |||||||||     
T  34719829 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagttcgactcattaagttcatgaat 34719730  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| || |||||| || ||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34719729 caagttcaacgaatcaattatcgaatcaaatctcgcactattttcgagttggttcgtttcattgccagcccta 34719657  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 41783279 - 41783465
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Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||  || |||||| |||| ||||||||| || || || ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   |||      
T  41783279 ataatcgagtcagttcgtgaaccaaacgggtcgaactacatataactcaagttcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctca 41783378  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  41783379 tttggttcatgaaccaagttcaacgaactaattaccgagtcgagttccgaactttattcgagttgtatcggttcattgtcagcccta 41783465  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Original strand, 26299815 - 26299984
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| ||| | |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |  ||  |||||||||||||     
T  26299815 tcatgaatcaaacgagtcgaaccatatttagttcaagttcaattcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagtttgactcattaggttcatgaat 26299914  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
     ||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26299915 gaagttcaacgaatcaattatcgaatcgaatctcgcactattttcgagttggttcggttcatttccagcc 26299984  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19282310 - 19282123
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    ||||| || ||| ||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||  || | ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  19282310 tatattatcgattatcgaaccagctcatgaatcaaccgagtcgaactatatacagttcaagttcagctcatctacttaacgaacctaattttcagctcaa 19282211  T
Q  253 gtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||  ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |  | |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  19282210 gttcagctcatttggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatgaagttccgaactattatcgagttggttcagctcattg 19282123  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32157123 - 32156945
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |    
T  32157123 ataatcgagtcatctcatgaacttaacgaatcgaaccatctatagttcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcaactcaa---------g 32157033  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || || ||||||| ||||||||| | |  || | || ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32157032 tttggctcatgaaacaagttcaatggaccaattgtcaagtcgaattacgaactatattcgaattggttcggttcattgcgagccctac 32156945  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 34857315 - 34857487
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    ||  |||| ||||||||     
T  34857315 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagtttaagtttaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagttcgactcattagattcatgaat 34857414  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| || ||| || | |||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34857415 caagttcaacgaatcaattattgaattgaatctcacactattttcgagttggttcggttcattgccaacccta 34857487  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Original strand, 27196045 - 27196218
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||  ||||| ||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  27196045 tcatgaaccagacgagtcgaatcatacttagctcaagttcaactcctttatctaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 27196144  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||| || ||||||| || |||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27196145 caaatttaacgaatcaattatcgaatcgagtctcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagccctac 27196218  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 339
Target Start/End: Original strand, 39414140 - 39414312
Alignment:
Q  167 tcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagc-tcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||  ||||  |||    
T  39414140 tcgagccagctcatgaaccaattgagtcga-ctatatataactcaagttcagctcatttatttaacgaacttaatttttaacttaaagttcagctcatta 39414238  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 339  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| |  | | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39414239 ggttcatggaccaagttcaacgagttaattgtcgaattaagtttcgaactattgtcgagttggttcggttcatt 39414312  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11136173 - 11136051
Alignment:
Q  182 aacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagt 281  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  11136173 aaccaaacgagtcgaactatatataactcaagttcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcgtttggttc-tgaaccaagt 11136075  T
Q  282 tcaacgaattaaatatcgagtcga 305  Q
    |||||||| ||| || ||||||||    
T  11136074 tcaacgaactaattaccgagtcga 11136051  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 19716151 - 19716318
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| ||| | |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||    ||  |||||||||||||     
T  19716151 tcatgaaccaaacgagtcaaaccatatttagttcaagttcaattcatttatttaacgagcttaattttaaacttaagttcgactcattaggttcatgaat 19716250  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||     ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716251 caagttcaacgaatcaattatcgaatc-----tcgcactattttcgagttggttcggttcattgccagcccta 19716318  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40056497 - 40056382
Alignment:
Q  215 tcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaac 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||  || |||||||||||||| ||||||||  ||| | |||| |||||| || |||    
T  40056497 tcagctcatttatttaacgaacttaattttcatctcaaatttaacttatttggttcatgaaccaaattcaacgagataattgtcgaatcgaatttcaaac 40056398  T
Q  315 tataatcgagttggtt 330  Q
    ||| ||||||||||||    
T  40056397 tattatcgagttggtt 40056382  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34724891 - 34724754
Alignment:
Q  212 agttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcg 311  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    ||  ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | |||||| ||     
T  34724891 agttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagttcgactcattaggttcatgaatcaagttcaacgaatcaattatcaaatcgaatctca 34724792  T
Q  312 aactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34724791 cactattttcaagttggttcggttcattgccggcccta 34724754  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32945104 - 32945021
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32945104 ggttcatgaaccaagtttaacgaatcaattaccgaatcgagtttcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 32945021  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34723825 - 34723712
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |    ||  |||||||||||||     
T  34723825 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaaattcgactcattaggttcatgaat 34723726  T
Q  277 caagttcaacgaat 290  Q
    ||||||||||||||    
T  34723725 caagttcaacgaat 34723712  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 354
Target Start/End: Original strand, 43386681 - 43386863
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||| || | || || |||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||               
T  43386681 ataaccgagctaactcatgaaccaaacgagttgaaccatctataactcaagttcaattcatttatttaaagaacttaattttcagctca----------- 43386769  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaa--gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctacatgc 354  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||| |||||| || ||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||||||||    
T  43386770 ttaggttcatgaaccaattgttcaacggattaattgtcgaatcgaatttcaaactatactcaagttgatttgattcattgtcagccctacatgc 43386863  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30661093 - 30660919
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| || || |  ||||      
T  30661093 ataatcgagtcagttcatgaaccaaacgagtcgaactatatatagttcatgttcgactcatataattaacaaacttaattttcaacttaaattcagctca 30660994  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttca 337  Q
    ||  |||||||||| ||||||||  ||| || |||||| |||| | |  ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  30660993 tttagttcatgaactaagttcaataaatcaattatcgaatcgagttttaaactaaattcgagttggttcgattca 30660919  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 349
Target Start/End: Original strand, 28247473 - 28247550
Alignment:
Q  272 tgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| | || ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28247473 tgaaccaagttcaacgaatcaattatcaaatcaaatatcgaactattttcgaattggttcggttcattgtcagcccta 28247550  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Original strand, 39409108 - 39409185
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  39409108 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagt 39409185  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 244
Target Start/End: Original strand, 3457793 - 3457861
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaatttt 244  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  3457793 ctcatgaaccaaacgagtcagactatatatagctcaagtccaactcatttatttaacgaacttaatttt 3457861  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 307
Target Start/End: Original strand, 1225318 - 1225449
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    ||  || ||||||| ||    
T  1225318 ctcatgaaccaaacgagtcgaattatacgtagttcaagttcggttcatttatttgacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcataaa 1225417  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaat 307  Q
    | ||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  1225418 ctaagttcaacgaaacaattatcgaatcgaat 1225449  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5382908 - 5382825
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |  || ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5382908 ggttcatgaatcaagttcaacgaattaattaccgaatcgagtctcgaactcttttcaagttggttcagttcattgtcagcccta 5382825  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 10327987 - 10328070
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||| | | |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10327987 ggttcatgaatcaagttcaacgaatcaattaccgaatcgagttttgaacaattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 10328070  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 252
Target Start/End: Original strand, 30051408 - 30051497
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    ||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30051408 ataatcgagtcagttcatgaactaaacgagtcgaactatatatagttcatgttcgactcatataattaacaaacttaattttcatctcaa 30051497  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4983402 - 4983327
Alignment:
Q  273 gaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4983402 gaaccaagttcaacgaactaattaccgagtcgagtc-cgaactttattcgagttgtatcggttcattgccagcccta 4983327  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3805161 - 3805058
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||| | |||||| ||  |||| ||| ||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||   ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  3805161 atccaacaaaactcaattagtcgataacagaatgcataatatttttctacttccaaactccaattgctctccccttaaagacaaaattgtattcagccac 3805062  T
Q  101 attt 104  Q
    ||||    
T  3805061 attt 3805058  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 349
Target Start/End: Original strand, 39409212 - 39409266
Alignment:
Q  295 tatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39409212 tatcgaatcgaatctcgcactattttcgagttggttcggttcattaccagcccta 39409266  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17168520 - 17168447
Alignment:
Q  272 tgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | | || ||||||  |||||||  |||||||||||| ||||    
T  17168520 tgaaccaagttcaacaaattaaatatcgaatctagtctcaaactattttcgagttacttcggttcattgtcagc 17168447  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 298
Target Start/End: Original strand, 24536007 - 24536096
Alignment:
Q  209 ttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatc 298  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||  || | |||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  24536007 ttaaattcaactcgtttatttaacgaacttaattttgagctcaaatttagctcatttgattcatgaaccagattcaacaaattaattatc 24536096  T

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Target: scaffold0316 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 19087 - 19436
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19087 atccaacaaaatttaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 19186  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatt-ttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19187 atttgccacatttgaattaaaaaattttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaatt 19286  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  19287 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaaaggattagatatcg 19386  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19387 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 19436  T

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Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 41958934 - 41959283
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41958934 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttaattttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 41959033  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41959034 atttgccacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcattaacctaacgagtcgaact 41959133  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41959134 atatgtagcttatgttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaatcaagttcaacggattagatatcg 41959233  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41959234 agtcgaatgtcgaactataatcgagttgattcggttcattgtcagcccta 41959283  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 36538447 - 36538796
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36538447 atccaacaaaattcaattaattgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 36538546  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36538547 atttgtcacatttgaattaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagtcatctcatgaacctaacgagtcgaact 36538646  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36538647 atatgtagctcaagtttagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccaactcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcg 36538746  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36538747 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggtttggttcattgtcagcccta 36538796  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 34064505 - 34064833
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||         
T  34064505 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattca----- 34064599  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
        |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34064600 ----gccacatttgaattaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgaaccatctcatgaacctaacgagtcgaact 34064695  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |    
T  34064696 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaactaagttcaacggattagatattg 34064795  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttca 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34064796 agtcgaatgtcgaactataattgagttggttcggttca 34064833  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 26436166 - 26436491
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||         
T  26436166 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttatactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattca----- 26436260  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaattttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaacta 200  Q
        |||||||||||||||| |||||| |||           || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26436261 ----gccacatttgaattaattttttttaaa-----------ttgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaacta 26436345  T
Q  201 tatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcga 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26436346 tatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcacgttcagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcga 26436445  T
Q  301 gtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccc 347  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26436446 gtcgaatgtc-aattataatcgagttggttcggttcattgccggccc 26436491  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 122 - 349
Target Start/End: Original strand, 27634578 - 27634811
Alignment:
Q  122 ttttttaaaaactaactcaaatttatttatctatata------attgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagtt 215  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||      ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27634578 tttttttaaaactaactcaaattgatttatatatatatatataatcaataatggagtcatctcatgaacctaacgagtcaaactatatgtagctcaagtt 27634677  T
Q  216 cagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27634678 cagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaactaagttcaacggattaaatatcgagtcgaatgtcgaact 27634777  T
Q  316 ataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27634778 ataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 27634811  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 169 - 349
Target Start/End: Original strand, 33831455 - 33831635
Alignment:
Q  169 gagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33831455 gagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggt 33831554  T
Q  269 tcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33831555 tcatgaaccaaattcaacggattagatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 33831635  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 33831252 - 33831453
Alignment:
Q  26 aacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaatttt 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  33831252 aacaaaatttataatattcttttacttttaaactccaactgctcttccattcaagacaaaattgtattca---------gccacatttgaattaaatttt 33831342  T
Q  126 -ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatt 224  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33831343 tttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatt 33831442  T
Q  225 taattaacgaa 235  Q
    |||||||||||    
T  33831443 taattaacgaa 33831453  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 219 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33164110 - 33163980
Alignment:
Q  219 ctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactata 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33164110 ctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcgagtcgaatgtcgaactata 33164011  T
Q  319 atcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  33164010 atcgaattggttcggttcattaccggcccta 33163980  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3409371 - 3409188
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || |||||||| | | |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |  ||     
T  3409371 atcgagtcagctcatgaatcaatcgagtcgaactatatacagctcaaattcagctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagttcattt 3409272  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409271 ggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagtttcgaactattgtcgagttggttcggttcattgccagcccta 3409188  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44740665 - 44740486
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||     
T  44740665 atcgagtcaactcatgaacc-accgagtcgaactatataaagctcaagttcagctcatttgtttaacgaacttaatttttagctcaagttcagctcgttt 44740567  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44740566 ggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagtcccaaactattgtcgagttggttcggttcattgccagcc 44740486  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 349
Target Start/End: Original strand, 11027873 - 11028048
Alignment:
Q  174 atctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatg 273  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||   |||  || ||||||||    
T  11027873 atctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagctcaagttcagctcaattagttgacgaacttaatttttagttcaagttcggctcatttggttcatg 11027972  T
Q  274 aaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| | ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11027973 aaccaagttcgacgaatcaattatcgaattgaattacgaactctaattgagttggttcggttcattgccagcccta 11028048  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34116359 - 34116173
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||   |||      
T  34116359 ataatcgagtcatcacatgaaccaaacgagtcgaactacatatagctcaagttcagctcaattatttagcgaacttaattttaagctcaagttcggctca 34116260  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||| |||||| || ||| || |||  | ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34116259 tttggttcatgaactaagttcgacaaatcaattattaaatcgaattacgaactctaatcgagttggttcggctcattgccaccccta 34116173  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 348
Target Start/End: Original strand, 30713110 - 30713295
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||  || ||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||   |||      
T  30713110 ataatcgagtcttctcttaaaccaaacgagtcgaactgcatatagctcaagttcaactcaattagttgacgaacttaaatttcagctcatgttcggctca 30713209  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30713210 tttggttcatgaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatcgaattacgaacactaatcgagttggttcggttcattgccagccct 30713295  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 27633531 - 27633640
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27633531 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattattttacttctaaactccaattgttattcccttcaagacaaaattgtattcagccac 27633630  T
Q  101 atttgccaca 110  Q
    ||||||||||    
T  27633631 atttgccaca 27633640  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2647143 - 2646975
Alignment:
Q  180 tgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaa 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  2647143 tgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagttcaacttatttagttaacgaacttaatttttagctcaagttcggctcgtttggttcatgaaccaa 2647044  T
Q  280 gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |   ||||| || | ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  2647043 gttcaacgaactaattaccgagtcgagttctgaactttatttgagttgtatcggttcattgccggccct 2646975  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24844807 - 24844670
Alignment:
Q  208 cttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaat 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||| |||| |    
T  24844807 cttaagttcagctcatttatttatcgaatttaattttcagctcaagttcagctcatttggttcatgaaccaagttcaacgagataattgccgaatcgagt 24844708  T
Q  308 gtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24844707 ttcgaactattatcgagttggttcggatcattgtcagc 24844670  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 344
Target Start/End: Original strand, 39690124 - 39690296
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||         |    
T  39690124 ataatcgagtcatctcatgaaccaaacgagtcgaactacatatagctcaagttcaactcaattagttgacgaacttaattttcagctcaa---------g 39690214  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccag 344  Q
    || || |||||||| |||||| |||||| ||   | || ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39690215 tttggctcatgaacaaagttcgacgaatcaatcgttgaatcgaattacgaactataatcaaattggttcggttcattgccag 39690296  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 40458889 - 40459061
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || ||||| |||||    
T  40458889 tcatgaaccaaacgagtcgaactatacttagttcaagttcagctcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcgtgaac 40458988  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| ||  || ||| || |||| | || ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40458989 caagttcaacaaaccaattattgaatcgagtatcaaactattttcaagttggttcggttcattgtcagcccta 40459061  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27902624 - 27902438
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||   | |      
T  27902624 ataatcgagttatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagctcaagttcaactcaattagttgacgat-ttaattttcagctcaagttcggttca 27902526  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27902525 ttttgttcatgaaccaagttcgacgaatcaattgtcgaatcgatttacgaactttaatcgagttggttcggttcaatgtcagccctac 27902438  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11007142 - 11006977
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaacca 278  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||  | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || ||||| |||||||    
T  11007142 atgaaccaaacgagtcgaattatacttatttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcgtgaacca 11007043  T
Q  279 agttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
    |||||||||||| || |||||  ||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11007042 agttcaacgaatcaattatcggatcga--gtcaaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcc 11006977  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38409757 - 38409613
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||   |||      
T  38409757 ataatcgggtcatctcgtgaaccaaacgagccgaactatatatagttaaagttcagctcaattagttcacaaacttaattttcagctcaagttcggctca 38409658  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaat 307  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||| || | |||| ||||||    
T  38409657 tttggttcatgaaccaaattcgacgaatcaattgtcgaatcgaat 38409613  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 41332185 - 41332365
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||| |  | || | |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  | ||      
T  41332185 ataatcgagcaagctcgtgaaccaaccgagtcgaactatgtacaactcatgttcggcccatttatttaacaaacttaattttcagctcaaattcaactca 41332284  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
     | |||| |||||||||||||||| | |||| | |||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41332285 attggtttatgaaccaagttcaacaagttaattgtcgaatcgagtttcgaactatattcgagttggtttggttcattgcca 41332365  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 349
Target Start/End: Original strand, 18667721 - 18667891
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaacca 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||| |||||||| ||||  || ||||||| |   ||| ||| |||||||||||||    
T  18667721 atgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagttcaacttatttatttaacgaaattaagctttagctcaaattatgctcgtttggttcatgaacca 18667820  T
Q  279 agttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||  || ||| || |||||||| |  |||||| || | ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  18667821 agttcaataaaataattaccgagtcgagttccgaactttatttgagttgtatcggttcattgctagcccta 18667891  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20203797 - 20203713
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20203797 ggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattgttgaatcgaattacgaactttaatcgagttggttcggttaattgctagccctac 20203713  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 353
Target Start/End: Original strand, 29806971 - 29807050
Alignment:
Q  274 aaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctacatg 353  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| | | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29806971 aaccaagttcaacgaatcaattatcgaatcgagtcttgaactattttcgaattggttcggttcattgccagccctacatg 29807050  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 286
Target Start/End: Original strand, 2578046 - 2578156
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||| | | |||||||| | |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || | ||||||||    
T  2578046 ctcatgaatcaaccgagtcgatcgatatatagcttaagtttaactcatttatttaacgaatttaattttcagctcaagttcagctcatttgattcatgaa 2578145  T
Q  276 ccaagttcaac 286  Q
     ||||||||||    
T  2578146 tcaagttcaac 2578156  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Original strand, 14103234 - 14103363
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||| | || || ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||  || || |||||||    
T  14103234 ctcatgaatcaaatgaatcgaaatatatatagtttaagttctgctcatttaattaacgaacttaattttcagtttaagttcgacttatttggctcatgaa 14103333  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcga 305  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||||    
T  14103334 ccaagttaaacgagttaattattgagtcga 14103363  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 40680178 - 40680349
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||           ||     
T  40680178 atcgagtcagcttatgaaccaatcgagtcgaactatatataactcaaattcagctcatttatttaacgaacataattttcagctca-----------ttt 40680266  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    | ||||| ||| || |||||||| | || |||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40680267 gattcat-aactaaattcaacgagtcaattatcgaatcgaattccgaactattattgagttggttcggttcattgccagtccta 40680349  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27464655 - 27464572
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||||| || | | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27464655 ggttcatgaaccaaattcaacaaatcaattatcgaatcaagtctcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 27464572  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 350
Target Start/End: Original strand, 9963726 - 9963900
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||  | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||  ||||  || ||||||||||    
T  9963726 ctcatgaaccaatcgagtcagactatatacaactcaagttcagctcatttatctaacgaacttaatttttaacttaagttcagctcatttggttcatgaa 9963825  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||||||||| |||| | |||| |  | | ||||| ||| || || |||  |||||||||||| ||||||||    
T  9963826 cccagttcaacgagttaattgtcgaattaagtttcgaattattattgaattgactcggttcattgctagccctac 9963900  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Original strand, 20987768 - 20987845
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaa 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || | ||| | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20987768 ataatcgagtcatctcatgaatctaacgaatcgaaccatttatagttcaacttcagctcatttaatcaacgaacttaa 20987845  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Original strand, 44935737 - 44935805
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcag 247  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  44935737 atgaaccaaacgagtcaaactatatataatttaagttcagctcatttagttaacgaacatgattttcag 44935805  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 20986455 - 20986506
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttactt 52  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20986455 atccaacaaaattcaattagccgagaacataattcataatattcttctactt 20986506  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 305
Target Start/End: Original strand, 13829880 - 13829974
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcga 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||  | ||  || |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13829880 aagttcaactcatttaattaacgagtttaatttttaactcaagttcaactcatttggtttatgaaccaagttcaacgaatcaattatcgaatcga 13829974  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Original strand, 35796278 - 35796356
Alignment:
Q  262 gttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  35796278 gttagattcatgaaccaagttcaatgaatcaactgttgagtcgaatttcaaactatattcgagttgattcgattcattg 35796356  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Original strand, 29806885 - 29806941
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacg 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  29806885 tcatgaacctaacgagtcgaaccatacgaagctcaagttcaactcatttatttaacg 29806941  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45383268 - 45383147
Alignment:
Q  219 ctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactata 318  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||   || |||||||||| |||||||| ||| | || | | || |||||  |||||||| |    
T  45383268 ctcatttaattaatgaaattaattttaagctcaaatttagcgcatttggttcatgaatcaagttcatcgagtcaattgttgaatcgaacttcgaactaaa 45383169  T
Q  319 atcgagttggttcggttcattg 340  Q
     || |||| |||||||||||||    
T  45383168 ttcaagttagttcggttcattg 45383147  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19589912 - 19589841
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttc 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| || ||  || |||||||||| |||||||    
T  19589912 aagttcagctcatttaattaacaaactt-atttttagttcaagtttatctcatttggttcatgaagcaagttc 19589841  T

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Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 41609678 - 41610021
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41609678 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 41609777  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt--aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaac 198  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41609778 atttgcctcatttgaattaattttttttaaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagtcatctcatgaacccaacgagtcgaac 41609877  T
Q  199 tatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatc 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41609878 tatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatc 41609977  T
Q  299 gagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41609978 gagtcgaatgtcgaactataatcgagttgg-tcggttcattgcca 41610021  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23206657 - 23206310
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| | | ||    
T  23206657 atccaacaaaatttaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgttttttccttcaagacaaaattgtattaagcgac 23206558  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt--aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaac 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  23206557 atttgccacatttgaattaatttttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataattgagtcatctcatgaacctaataagtcgaac 23206458  T
Q  199 tatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  23206457 tatatgtagcttaagttcagctcatttaattaa-gaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaacaaagttcaacagattaaatatc 23206359  T
Q  299 gagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccc 347  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23206358 aagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccc 23206310  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 349
Target Start/End: Original strand, 32688972 - 32689309
Alignment:
Q  4 caacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatt 103  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||            
T  32688972 caacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattca-------- 32689063  T
Q  104 tgccacatttgaattaaatt-ttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactata 202  Q
     |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32689064 -gccacatttgaattaaaaaattttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataattgagtcatctcatgaacttaacgagtcgaactata 32689162  T
Q  203 tgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagt 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32689163 tgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcgagt 32689262  T
Q  303 cgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32689263 cgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgtcagcccta 32689309  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 39135308 - 39135494
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||      
T  39135308 ataatcgagtcatctcatgaacctaacgaatcgaaccatctatagtttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 39135407  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39135408 tttggttcatgaaccaagttcaatgaaccaattgtcgagtcgaattatgaactatattcgagttggttcggtttattgccagcccta 39135494  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9505317 - 9505120
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||||||||| | |||  |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9505317 tatattatcgattatcgagccagctcatgaaccaaccgaaccgaactatatatatctcaagttcagctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaa 9505218  T
Q  253 gtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||  | ||  || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9505217 gttcaactcatttggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagttccgaactattgtcgagttggttcggttcattgccagccctac 9505120  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 44574480 - 44574667
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  ||||      
T  44574480 ataatcgagctaactcatgaaccaaacgagccgaactatatgtagctcaagttcggctcatttaataaacgaacttgatttttaactcaagttcagctca 44574579  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44574580 ttaggttcacgaactaagttcaacgaattaattgccgagtcgagcttcgaactatattcgagttgtctcggttcattgccagccctac 44574667  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 54393629 - 54393443
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||   |||      
T  54393629 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagttcaagttcggctcaattatttgacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 54393530  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54393529 tttggtttatgaaccaagttcaacgaatcaattgtcgaatcgaattacgaactttaatcgagttggttcggttcattgccagcccta 54393443  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Original strand, 25253659 - 25253843
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||  || || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||     
T  25253659 atcgagccaactcatgaaccaatcgagtcgagttacatatagcttaagttcggctcatttatttaacgaacttaatttttagctcaagttcagctcattt 25253758  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25253759 ggttcatgaaccaagttcaacaagtttattgtcgagtcgagttccaaactatattcgagttggttcggttcattgccagccctac 25253843  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19560934 - 19560773
Alignment:
Q  189 cgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacga 288  Q
    |||||| |||||||| || || |||||| ||||||||| |||||| |||||| | | | |||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19560934 cgagtcaaactatatataactcaagttcggctcatttatttaacggacttaactcttaactcaagttcagcttgtttcgttcatgaaccaagttcaacga 19560835  T
Q  289 attaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19560834 attaattgtcgagtcgaattccgaactatattcgagttggttcggttcattgccagccctac 19560773  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39942986 - 39942806
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||| | || | || || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||      
T  39942986 ataatcgagctaactcataaaccaaacgagtcgagccatctataactcaagttcagctcatctatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctca 39942887  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39942886 ttaagttcatgaaccaagttcaacagattaattgccgaatcgaatttcgaactatactcgagttggttcagttcattgcca 39942806  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 52934769 - 52934952
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||     
T  52934769 atcgagtcagctcatgaaccaatcgagtcgaactatatatagatcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttctgctcaagttcagctcattt 52934868  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |  ||||||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  52934869 ggttcatgaaccaagttcaatgagttaattatcgaatcgagttccgaactattgtcaagttggttcagttcattgccagaccta 52934952  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 46293389 - 46293213
Alignment:
Q  173 catctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcat 272  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||    
T  46293389 catctcatgaaccaaacgaatcgaactatttatagtttaagttcaactcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagttcggctcatttggttcat 46293290  T
Q  273 gaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||| |||||   |  || | || |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46293289 gaaccaaattcaattgaccaattgtcaagtcgaattttgaactatattcgagttgattcggttcattgtcagcccta 46293213  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33438917 - 33438730
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| || ||| | || || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    ||      
T  33438917 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacaagtcgaactacatatagttcaactttagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttcgactca 33438818  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33438817 tttggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattgtcgaatcgaattacaaactttaatcgagttggttcggttcattgtcagccctac 33438730  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39469717 - 39469530
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || | ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||      
T  39469717 ataatctagtcatctcatgaacctaacgaatcgaacaatctataattcaagtttagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 39469618  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || | |||||||||||||||||| | |  || |||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  39469617 tttgattcatgaaccaagttcaatggaccaattatcgaatcgaattacgaactatattcgagttggttcagttcattatcagccctac 39469530  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 349
Target Start/End: Original strand, 52199426 - 52199569
Alignment:
Q  206 agcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcga 305  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  52199426 agctcaagttcagctcatttgtttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcgtttggttcatgaaccaagttcaacgaattaattgtcgaatcga 52199525  T
Q  306 atgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     |  | ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52199526 gtcccaaactattgtcgagttggttcgattcattgtcagcccta 52199569  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 12710670 - 12710842
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   | || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  12710670 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactcaactcaagttcgactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 12710769  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710770 caagttcaacgagtcaattatcgaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcggttcattgccagcccta 12710842  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 343
Target Start/End: Original strand, 28242540 - 28242717
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||     
T  28242540 atcgagccagctcatgaaccaaccgagtcgaactatatacagctcaagttcagatcatttatttaacgaatttaattttcagctcaaattcagctcattt 28242639  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| || | |  |||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  28242640 ggttcatgaaccaaattcaacgagttaattgtcgaatcaagttccgaattattgtcgagttgattcggttcattgcca 28242717  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30662303 - 30662131
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   | || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || | |||||||||    
T  30662303 tcatgaaccaaacgagtcgaactatactcaactcaagttcgactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttgattcatgaac 30662204  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  30662203 caagttcaacgagtcaattatcgaatcgaatctcaaactattttcgagttggttcggctcattgtcagcccta 30662131  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 341
Target Start/End: Original strand, 28687039 - 28687204
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||  ||||||||||    
T  28687039 ctcataaaccaaccgagtcaaactacatatagcttaagttgagctcgtttatttaacgaacttaattttcagctcaaatttagcccgtctggttcatgaa 28687138  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgc 341  Q
    ||||||||||| |   || ||| ||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  28687139 ccaagttcaacaagcaaattattgagtcgagttccgaaccatattcgatttggttcgcttcattgc 28687204  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 40943529 - 40943701
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   || | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  40943529 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactaagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 40943628  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||| ||| |||  || |||| | |||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40943629 caagtccaatgaaccaattatcaaatcgagtatcgaactattttcgagttggttcggtttattgccagcccta 40943701  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 254
Target Start/End: Original strand, 52199346 - 52199434
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  52199346 atcgagccaactcatgaaccaactgagtcgaactatataaagctcaagttcagctcatttgtttaacgaacttaattttcagctcaagt 52199434  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 353
Target Start/End: Original strand, 5418632 - 5418822
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||  || |||||| || |||||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    || |    
T  5418632 ataatcgagtcagttcgtgaaccaaatgagtcgaactatatataactcaagttcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcgactcg 5418731  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctacatg 353  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || ||| ||   |||||| |  |||||| || ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  5418732 tttggttcatgaactaagttcaacaaactaattacttagtcgagttccgaactttattcgagttgtatcgattcattgccaaccctacatg 5418822  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 289
Target Start/End: Original strand, 50965370 - 50965484
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaa-ttttcagctcaagtctagctggttaggttcatga 274  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||    
T  50965370 ctcatgagccaatcgagtcgaaccatatatagctcaagttcagctcatttatttaacgaacttaatttttcagctcaaattcagctcattaggttcatga 50965469  T
Q  275 accaagttcaacgaa 289  Q
    ||||| || ||||||    
T  50965470 accaaatttaacgaa 50965484  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 289
Target Start/End: Original strand, 51068505 - 51068619
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaa-ttttcagctcaagtctagctggttaggttcatga 274  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||    
T  51068505 ctcatgagccaatcgagtcgaaccatatatagctcaagttcagctcatttatttaacgaacttaatttttcagctcaaattcagctcattaggttcatga 51068604  T
Q  275 accaagttcaacgaa 289  Q
    ||||| || ||||||    
T  51068605 accaaatttaacgaa 51068619  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 340
Target Start/End: Original strand, 18074566 - 18074707
Alignment:
Q  199 tatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatc 298  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | ||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18074566 tatatatagctcaatttcagctcatttagttaacgaacttaattttcagttcaaattcaactcatttagttcatgaaacaaattcaacgaattaattatc 18074665  T
Q  299 gagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
     | |||| | ||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  18074666 aaatcgagtctcgaactctattcgagttggctcagttcattg 18074707  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 39134151 - 39134260
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||  |||    
T  39134151 atccaacaaaattcaattaactgataacataattcataatattcttctacttccaaactccaattgctctcctcttcaagacgaaattgtattcagtcac 39134250  T
Q  101 atttgccaca 110  Q
    ||||||||||    
T  39134251 atttgccaca 39134260  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20550374 - 20550202
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||  ||| | |||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||    ||  || ||||| |||||    
T  20550374 tcatgaatcaaacgagtcgaaccatacttagttcaagtacaactcatttatttaacgaatttaattttcaactcatgttcgactcatttggttcgtgaac 20550275  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| ||| || |||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  20550274 caagttcaacaaatcaattatcgaatcgagtatcgaactattttcgagttggtttggttcattgacaggccta 20550202  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26049712 - 26049541
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||   | || ||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || | |||||||||    
T  26049712 tcatgaacctaacgaatcgaatcatactcaactcaagttcgactaatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttgattcatgaac 26049613  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
    ||||||||||   | || |||||| |||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26049612 caagttcaacaggtcaattatcgaatcgaatctcaaactattttcgagttggttcggttcattgccagccct 26049541  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 349
Target Start/End: Original strand, 30743593 - 30743712
Alignment:
Q  230 aacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggt 329  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||  || ||||||||||||||||||||||| || |   |||||||||    ||||||||| ||||||||||    
T  30743593 aacgaacttaattctcaactcaaattcagctcatttggttcatgaaccaagttcaacgagttcatcttcgagtcgagctccgaactatattcgagttggt 30743692  T
Q  330 tcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  30743693 tcggttcatttccagcccta 30743712  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53529776 - 53529685
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  53529776 ataatcgagtcatcttgtgaaccaaacgagtcgaacaacatatagttcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagt 53529685  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 345
Target Start/End: Original strand, 26136300 - 26136469
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||| ||| ||||||| | |||||||   |||   |  |||||| ||    
T  26136300 ctcatgaaccaaacgagtcaaactatatgtagtttatgttcaactcatttgtttaacaaacataattttgaactcaagttcggctcacttagttcataaa 26136399  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    ||||||||||| || ||| || ||| |||| | || |||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  26136400 ccaagttcaacaaactaattaacgaatcgagtctcaaactattatcaagttggttgggttcattgtcagc 26136469  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 45714758 - 45714832
Alignment:
Q  271 atgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45714758 atgaatcaagttcaacgaatcaattgtcgaatcgaataacgaactttaatcgagttggttcagttcattgccagc 45714832  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 54432255 - 54432177
Alignment:
Q  271 atgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||| ||| |||  || |||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54432255 atgaaccaagtccaatgaaccaattatcgaatcgagtatcgaactattttcgagttggttcggttcattgccagcccta 54432177  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1072895 - 1072753
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||  || |||||| ||| |||||| |||||||||| || || |||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||    | ||      
T  1072895 ataatcgaatcaactcatggaccaaacgaggcgaactatatataactcaagttcagttcattatattaacaaacttaattttcggctcaaactcaactca 1072796  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcga 305  Q
    || |||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||    
T  1072795 tttggttcatgaacttagtccaacgaatcaattatcgagtcga 1072753  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 339
Target Start/End: Original strand, 1674609 - 1674759
Alignment:
Q  189 cgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacga 288  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||| ||||| |||||  ||  ||||||||||| ||||  | ||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  1674609 cgagtcgaactatatacaactcaagttcagcttatttatttaacatacaaaattttcagcttaagttcaactcatttggttcatgaaccaagttcaacaa 1674708  T
Q  289 attaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 339  Q
      ||| | | || ||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1674709 gataattgttgaatcgaattctgaactattgtcgagttggttcggttcatt 1674759  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 55452799 - 55452670
Alignment:
Q  219 ctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactata 318  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || || | || ||| |||||||||||||||||||||   | || | |||||| |||| || |||| ||    
T  55452799 ctcatttagttaacgaacttaagttttagcttaattcaa-ctcgtttggttcatgaaccaagttcaactcgtcaattgtcgagttgaatctcaaacttta 55452701  T
Q  319 atcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  55452700 attgagttggctcagttcattgccaacccta 55452670  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Original strand, 33896790 - 33896846
Alignment:
Q  169 gagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcattt 225  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  33896790 gagccaactcatgaactaaacgagtcgaactatatataactcaagttcagctcattt 33896846  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Original strand, 45714679 - 45714738
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctca 222  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  45714679 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagttcaagttcagctca 45714738  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 252
Target Start/End: Original strand, 28700954 - 28701040
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    |||||| || |||||||| | | |||||||||||| || || || ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  28700954 atcgagtcaactcatgaatcaaccgagtcgaactagatataactcaagttcaactcatttttttaacgaatttaattttcagttcaa 28701040  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53529649 - 53529616
Alignment:
Q  317 taatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53529649 taatcgagttggttcggttcattgccacccctac 53529616  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 48730920 - 48730856
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggtt 330  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || | | |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  48730920 ggttcatgaatcaagtttaacgaattaattagcaaatcgaatctcgaactattttcgagttggtt 48730856  T

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Target: chr7 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3931065 - 3930720
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3931065 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactagtcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 3930966  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3930965 atttgccacatttgaattaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcatgtacctaacgagttgaact 3930866  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  3930865 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatggaccaagttcaacggattagatatcg 3930766  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3930765 agtcgaatgtcgaactataatcgagttgtttcggttcattgccagc 3930720  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5795276 - 5794935
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||         
T  5795276 atccaacaaaattcaattagttgtgaataaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattca----- 5795182  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5795181 ----gccacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagttgaact 5795086  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5795085 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcg 5794986  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5794985 agtcgaatgtcgaactataatcgggttggttcggttcattgccagccctac 5794935  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 349
Target Start/End: Original strand, 37334099 - 37334423
Alignment:
Q  26 aacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaatttt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37334099 aacaaaattcataatattcttttacttataaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagcgacatttgccacatttgaattaattttt 37334198  T
Q  126 -ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatt 224  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37334199 tttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgacaatcgagccatctcatgaacctaatgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatt 37334298  T
Q  225 taattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37334299 taattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgaatcgaatgtcgaactataatcgag 37334398  T
Q  325 ttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  37334399 ttggttcggttcattgtcaacccta 37334423  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 348
Target Start/End: Original strand, 36926796 - 36927143
Alignment:
Q  2 tccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccaca 101  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36926796 tccaacaaaattctattagctgtgaacaaaattcataatat-cttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcaaccaca 36926894  T
Q  102 tttgccacatttgaattaaatttttt--aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36926895 tttgtcacatttgaattaattttttttaaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcaagcaatctcatgagcctaacgagtcgaact 36926994  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36926995 atatgtagctcaagttcaactcatttaattaacgaacttaatttttagctcaagtccaactcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcg 36927094  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36927095 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 36927143  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48506137 - 48505795
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48506137 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgttcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 48506038  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48506037 atttgccacatttgaattaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcatgtacctaacgagtcgaact 48505938  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  48505937 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcattaggttcatgaaccaagttcaacggattagatattg 48505838  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48505837 a-------gtcgaactataatcgagttggttcggttcattgtcagcccta 48505795  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 43052677 - 43053017
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||         
T  43052677 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattca----- 43052771  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaattt-tttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
        |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43052772 ----gccacatttgaattaaaaaaatttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagtcatctcatgaatctaacgagtcgaact 43052867  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43052868 atatgtagctcaagttcagctcatctaattaacgaacttaattttcggctcaagtccagctcattaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcg 43052967  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43052968 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccaacccta 43053017  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 42071888 - 42072229
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||         
T  42071888 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgttcttcctttcaagacaaaattgtattca----- 42071982  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42071983 ----gccacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagtcatctcatgaacctaacgagtcgaact 42072078  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  42072079 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaatcaagttcaacggattagatatcg 42072178  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  42072179 aatcgaatgtcaaactataatcgagttgtttcggtacattgtcagccctac 42072229  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 352
Target Start/End: Original strand, 26216106 - 26216413
Alignment:
Q  38 aatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaatttttt--aaaaacta 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  26216106 aatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagcgacatttgccacatttgaattaatttttttttaaaaacta 26216205  T
Q  136 actcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaa 235  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26216206 actcaaattgatttat--atataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcctttaattaacgaa 26216303  T
Q  236 cttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggtt 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||       || |||||||||||| |||||||||||||    
T  26216304 cttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcataaaccaagttcaacggattaaatatcg-------tgacgaactataatcaagttggttcggtt 26216396  T
Q  336 cattgccagccctacat 352  Q
    |||||||||||||||||    
T  26216397 cattgccagccctacat 26216413  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 15434039 - 15434315
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15434039 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactcccactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 15434138  T
Q  101 atttgccacatttgaattaa-attttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15434139 atttgccacatttgaattaataaaatttaaaaactaactaaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaagctaacgagtcgaact 15434238  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15434239 agatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaac 15434315  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 90 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 28950019 - 28949758
Alignment:
Q  90 tattcaaccacatttgccacatttgaattaaattttttaaaaa--ctaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaaccta 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  28950019 tattcagccacatttgccacatttgaattaatttttttaaaaaaactacctcaaattgatttatatatataatcgataatcgagtcatttcatgaaccta 28949920  T
Q  188 acgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28949919 acgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaatttttagctcaattccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacg 28949820  T
Q  288 aattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28949819 gattagatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttgattcggttcattgccagcccta 28949758  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 130 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5776349 - 5776130
Alignment:
Q  130 aaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaatt 229  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5776349 aaactaactcaaattgatttttatatataatcgataatcgagtcatctcatgaaccgaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaatt 5776250  T
Q  230 aacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5776249 aacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggt 5776150  T
Q  330 tcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5776149 tcggttcattgccaacccta 5776130  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 666043 - 665846
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  666043 tatataaacgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgagctatatgtagctcaaattcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 665944  T
Q  253 gtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  665943 gtccagctcgttaggttcatgaaccaaatttaacggattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 665846  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 388787 - 389003
Alignment:
Q  5 aacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacattt 104  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  388787 aacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctctcc-cttcaagacaaaattgtattcagcgccattt 388885  T
Q  105 gccacatttgaattaaatttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatat 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  388886 gccacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatat 388985  T
Q  204 gtagcttaagttcagctc 221  Q
    |||||| |||||||||||    
T  388986 gtagctcaagttcagctc 389003  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 45176204 - 45176381
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  45176204 ataatcgagtcatctcatgaacctaacgagtcgaattatatgtagctcaagttcaactcatttaattaacgaacttaattttcagctaaagttcagctcg 45176303  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45176304 tttggttcatgaaccaagttcaacggattaattatcgagtcgaatgtcaaactataatcgagtttgttcggttcattg 45176381  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 3942135 - 3942322
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |      
T  3942135 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagccgaactacatatagctcaagttcagctcaattaattcacgaacttaattttcagctcaagtctggttca 3942234  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3942235 tttggttcatgaaccaagttcaatgaatcaactgtcgaatcgaattacgaactttaatcgagttggttcggttcattgtcagccctac 3942322  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 351
Target Start/End: Original strand, 20400955 - 20401143
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  || |      
T  20400955 ataattgagccaactcattaaccaaacgagtcgaactatatgtaactcaagttcagctcatttaattaaagaacttaatatttagctcaagttcagttca 20401054  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 351  Q
     |||||||||||||||| ||||| | | ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20401055 gtaggttcatgaaccaaattcaatggactaattaccgagtcgaatttcgaactatattcgagttggttcggttcattgtcaaccctaca 20401143  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 7447835 - 7448021
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||      
T  7447835 ataatcgagtcgtctcatgaacctaacgaatcgaaccatctatagttcaagttcaactcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 7447934  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||||||||||||||||||| |||  || | |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7447935 tttggttcatgaaccaagttcaatgaaccaattgtcgagtcgaattatgaactatattcgagttggttcggttcattgtcagcccta 7448021  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44422085 - 44421901
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaa-ttttcagctcaagtctagctggtt 264  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||    
T  44422085 atcgagccaactcatgaaccaaccgagtcgaactatataaagctcaagttcagctcatttgtttaacgaacttaaattttcagctcaagttcagctcgtt 44421986  T
Q  265 aggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |  | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44421985 tggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagtcccaaactattgtcgagttggttcggttcattgacagcccta 44421901  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 33935470 - 33935653
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||     
T  33935470 atcgagccaactcatggactaaccgagtcgaactatataaagctcaagttcatctcatttgtttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcgttt 33935569  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |  | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33935570 ggttcatgaaccaagttcaacgagttaattatcgaatcgagtcccaaactattgtcgagttggttcgattcattgccagcccta 33935653  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 349
Target Start/End: Original strand, 22075024 - 22075208
Alignment:
Q  165 aatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtt 264  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  22075024 aatcgagccaactaatgaaccaatcgagtcgaactatatacagatcaagttcagctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcatt 22075123  T
Q  265 aggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||| |||| |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075124 tggttcgtgaaccacgttcaacgagttaattgtcgaatcgagttctaaactattatcgagttggttcggttcattgccagcccta 22075208  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 176 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 222399 - 222226
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  222399 ctcatgaaccaaccgagtcgaactatataaagctcaagttcagctcatttgtttaacgaatttaattttcagttcaagttcagctcgtttggttcatgaa 222300  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||| |||||||| |||| | |||| || | |  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222299 ccaaattcaacgagttaattgtcgaatcaagtcccaaactattgtcgagttggttcggttcattgccagcccta 222226  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 388988 - 389085
Alignment:
Q  246 agctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  388988 agctcaagttcagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagttgaatgtcgaactataatcgagttgattcggttcattgcca 389085  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 45055711 - 45055867
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45055711 aacgagtcgaactatatataactcaagttcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcgtttggttcatgaaccaagttcaac 45055810  T
Q  287 gaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||| ||| || |||||||| |  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  45055811 gaactaattaccgagtcgagttccgaactttattcgagttgtatcggttcattgcca 45055867  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 343
Target Start/End: Original strand, 10618885 - 10619060
Alignment:
Q  168 cgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttagg 267  Q
    ||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |    
T  10618885 cgagccagctcatgaagcaacagagtcgaactatatacagctcaagttcagctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcatttag 10618984  T
Q  268 ttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |  | ||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  10618985 ttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagttccaaactattgtcgagttgattcggttcatagcca 10619060  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11595982 - 11595796
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||  || |||||| ||| ||||||||||||| || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| |    
T  11595982 ataatcgagtcagttcgtgaaccaaacaagtcgaactatatataactcaaggtcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcg 11595883  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11595882 tttggttcatgaaccaagttcaacgaactaattaccgagtcgagttccgaactttattcgagttgtatcggttcattgtcagcccta 11595796  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Original strand, 33124705 - 33124843
Alignment:
Q  214 ttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaa 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |  || ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||| | || ||    
T  33124705 ttcagctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcaattcatttggttcataaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagtttcaaa 33124804  T
Q  314 ctataatcgagttggttcggttcattgccagccctacat 352  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33124805 ctattgtcgagttggttcggttcattgccagccctacat 33124843  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27231725 - 27231538
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||   |||      
T  27231725 ataatcgagtcatctcatgaaccaaacgagtcaaactacatatagcttaagttcggttcaattagttgacgaacttaattttcagttcaagttcggctca 27231626  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || | | |||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||| ||||  || ||||||||||||||| |||||||||    
T  27231625 tttgatacatgaatcaagttcgacgaatcaattatcgaatcgaattacgaactctaattaagctggttcggttcattgtcagccctac 27231538  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37401749 - 37401566
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| |||||| |||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| | |||  ||     
T  37401749 atcgagtcatctcgtgaatcaaacgagtccaactacatatagctcaacttcagctcaattagttgacgaacttaattttcaactcaagtttggctcattt 37401650  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || | |||| ||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  37401649 ggttcatgaatcaagttcaacaaatcaattttcgaatcgaattacgaactctaatcgaattggtttggttcattgtcagcccta 37401566  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33899116 - 33898944
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   |  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  33899116 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactaaatttaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 33899017  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||| ||| ||| ||| | |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33899016 caagtccaatgaactaattctcgaatcgaatatcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 33898944  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18250165 - 18249994
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  18250165 tcatgaaccagacgagtcgaatcatacttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcataattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 18250066  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18250065 caagttcaacgaatcaattatcgaatcgagtcttgaactattttcgagttggttcggttcattgccagccct 18249994  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 40480237 - 40480050
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagct-g 261  Q
    ||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| |    
T  40480237 ataatcgagtcagttcgtgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagttcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcg 40480138  T
Q  262 gttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |  |||||| || ||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  40480137 ttttggttcatgaaccaagttcaacgaactaattaccgactcgagttccgaactttattcgagttgtatcagttcattaccagcccta 40480050  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21760755 - 21760583
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||    ||  || ||||| |||||    
T  21760755 tcatgaatctaacgagtcgaaccatacgaagctcaagttcaactcatttatttaacgagtttagttttcaactcaagttcgactcatttggttcgtgaac 21760656  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     ||||||||||||| || |||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21760655 aaagttcaacgaatcaattatcgaatcgagtttcgaactattttcgagttggttcggttcattatcagcccta 21760583  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23227171 - 23226999
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||  | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  || | |||||| ||    
T  23227171 tcatgaaccaaccgagtcaagctatatacaactcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcatttgattcatgtac 23227072  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| |  ||| | |||| |||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23227071 caagttcaacaagataattgtcgaatcgagtttcgaactattgtcgagttggttcggatcattaccagcccta 23226999  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23236324 - 23236152
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||  | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  || | |||||| ||    
T  23236324 tcatgaaccaaccgagtcaagctatatacaactcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcatttgattcatgtac 23236225  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||| |  ||| | |||| |||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23236224 caagttcaacaagataattgtcgaatcgagtttcgaactattgtcgagttggttcggatcattaccagcccta 23236152  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 46573784 - 46573612
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   | || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    ||  || |||||||||||    
T  46573784 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactcaactcaagttcgactcatttatttaacgagcttaattttcaacttaagttcgactcatttggttcatgaac 46573685  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46573684 caagttcaacgagtcaattatcgaatcgaatctcgaattatttttgagttggttcggttcattgccagcccta 46573612  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 49034383 - 49034224
Alignment:
Q  190 gagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaa 289  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  49034383 gagtcgaattatatgtagttcaagttcgactcatttatttgacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaaccaagttcaacgaa 49034284  T
Q  290 ttaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
      || || ||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49034283 acaattaccgaatcgaatttcgaactattttcgagttggatcggttcgttgccagcccta 49034224  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 7444185 - 7444294
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||   ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  7444185 atccaacaaaattcaattagccgagaacataattcataatattcttctacttccaaactccaattgctctccccttaaagacaaaattgtattcagccac 7444284  T
Q  101 atttgccaca 110  Q
     |||||||||    
T  7444285 ttttgccaca 7444294  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33171707 - 33171534
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||  | || |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||  || ||||||| ||    
T  33171707 ctcatgaaccaaccgagtcaaactatatacaactcaagttcggctcatttatttaatgaacttaatttttagctcaagttcagctcatttggttcataaa 33171608  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     |||||||||| |  ||| | ||   |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33171607 tcaagttcaacaagataattgtcttatcgagtttcgaactattatcgagttggttcggatcattgccagcccta 33171534  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 45174985 - 45175092
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||   ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  45174985 atccaacaaaattcaagtagctgagaacaaaattcataatattcttctacttctaaactccaattgctctcccctttaagacaaaattgtattcagccac 45175084  T
Q  101 atttgcca 108  Q
    || |||||    
T  45175085 atctgcca 45175092  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2466690 - 2466565
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaag-tctagctggttaggttcatga 274  Q
    |||||||||| | ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||    
T  2466690 ctcatgaaccaatcgagtcgaattacatatagtttaagtttagctcatttatttaacgaactaaattttcagctcaagttttagctcattaagttcgtga 2466591  T
Q  275 accaagttcaacgaattaaatatcga 300  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||    
T  2466590 accaagttcaacaagttaaatgtcga 2466565  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 349
Target Start/End: Original strand, 10096443 - 10096616
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   | ||||||  | ||  || ||||||||||    
T  10096443 ctcatgaatcaaacgagccgaattatatgtagtttaagttcagctcatttagttagcgaacttaatttctcgttcaagttcaactcatttggttcatgaa 10096542  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||| | |||  || | ||||||||| | |||||||||  |||| |||  || |||||||||||||||||    
T  10096543 ccaagttcgatgaacaaattgtcgagtcgagtttcgaactatgttcgaattgcctcagttcattgccagcccta 10096616  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18740390 - 18740217
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||   | || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  18740390 tcatgaactaaacgagtcgaaccatactcaactcaagttcgactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 18740291  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||| || || | || |||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18740290 caagtttaatgagtcaattatcaaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcggttcattgccggccctac 18740217  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17025533 - 17025361
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||   | || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || ||||| |||||    
T  17025533 tcatgaacaaaacgagtcgaaccatactcaactcaagttcgactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcgtgaac 17025434  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17025433 caagttcaacgagtcaattatcgaatcgaaccttgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 17025361  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 26719788 - 26719960
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||   || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  26719788 tcatgaatcaaacgagtcgaaccatactaagttcaagttcaactcatttatttaacgaacttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 26719887  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||| ||| |||  || |||||| |||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  26719888 caagtccaatgaaccaattatcgaatcgagtatcgaactattttcgagttggttcgattcattgtcagtccta 26719960  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 32356934 - 32357106
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||  ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |   |||  ||  |||||||||     
T  32356934 tcatgaaccaaatgagtcgagttatacatagtttaagttcaactcgtttacttaacgaactttattttcaactcaaattcggctcatttagttcatgaat 32357033  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||  |  |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32357034 caagttcaacgaattaattatcgaatcgagtctcgaactatttttaagttggtttggttcattgtcagcccta 32357106  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 36472401 - 36472584
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||     | | ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||   |||  ||     
T  36472401 atcgagccagttcatgaaccaaacgagtcgaaccatgctcggttcaagttcaacttatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcggctcattt 36472500  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| | || |  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36472501 ggttcatgaaccaagttcaacgaatcatttatcgaatcgagtatcaagttattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 36472584  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23237679 - 23237574
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23237679 aacgagtcgaactgtctataactcaagttcaactcatttaattaacgaacttaattcttaactcaagttcggctaattaggttcatgaaccaagtccaac 23237580  T
Q  287 gaatta 292  Q
    ||||||    
T  23237579 gaatta 23237574  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46652765 - 46652632
Alignment:
Q  217 agctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaacta 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||  |||   ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  46652765 agctcatttaattaacaaacttaattcttagtttaagttcagcatattaggttcatgaaccaagtccaacagattaattatcgaatcgaatttcgaacta 46652666  T
Q  317 taatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||| ||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  46652665 tattcgaattggtccggtttattactagccctac 46652632  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44994150 - 44994059
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | || || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44994150 ataatcgagtcatctcatgaacaaaatgagtcgaactatatacaactcaaattcagctcaattagttagcgaacttaattttcagctcaagt 44994059  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 28950072 - 28950018
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttactttta 55  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28950072 atccaacaaaattcaattagctatgaacaaaattcataatattcttttactttta 28950018  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 349
Target Start/End: Original strand, 37106853 - 37106971
Alignment:
Q  231 acgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggtt 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||  || ||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||| |||| ||||    
T  37106853 acgaacttaatttttagctcaagttcggctcatttggtacattaactaagttcgacgaattaattatcgaatcgaattacgaactctaattgagtcggtt 37106952  T
Q  331 cggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  37106953 cggttcattgccaacccta 37106971  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 350
Target Start/End: Original strand, 15434312 - 15434351
Alignment:
Q  311 gaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15434312 gaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 15434351  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35543638 - 35543555
Alignment:
Q  267 gttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | || | || ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35543638 gttcatgaaccaagttcaacgaatcaattatcgaatggagtctcaaactattttcgagttggttcgattcattgtcagccctac 35543555  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 293
Target Start/End: Original strand, 48634409 - 48634536
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||| | |||||||| | | |||||||||||||||  | || || |  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | ||  ||     
T  48634409 atcgagctaactcatgaatcaaccgagtcgaactatattcaactcaattctaactcatttatttaacgaacttaatttttagctcaagttcaactcattt 48634508  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48634509 ggttcatgaaccaagttcaacgagttaa 48634536  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Original strand, 41449724 - 41449884
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| | |||||| ||| ||||  | || |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||           || || ||||||||    
T  41449724 tcatgaaccaaccgagtcaaacgatatacaactcaagttcagctaatttatttaacgaatttaattttcagctca-----------tttggatcatgaac 41449812  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
    ||||||||||||  ||| | |||| |||| | |||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41449813 caagttcaacgagataattgtcgaatcgagtttcgaactattgtcgagttggttcggatcattgtcagccct 41449884  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 17608671 - 17608854
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    |||||| || |||||| |||||| | | ||| |||||| || ||| | ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||   |||      
T  17608671 ataatcaagtcatctcgtgaaccaaccaagttgaactacatatagatcaagttcaactcaattagttgacgaacttaattttcagatcaagttcggctca 17608770  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||| |   || || ||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17608771 tttggttcatcaaccaagttcgacgaatca---attgaatcgaattacgaacttttatcgagttgattcggttcattgtcggcccta 17608854  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23223616 - 23223561
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaatt 242  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23223616 aacgagtcgaactatctataactcaagttcaactcatttaattaacgaacttaatt 23223561  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29037953 - 29037794
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    ||  || ||||||||||    
T  29037953 ctcatgaatcaaacgagtcgaaccatatatagtttaaattcaactcatttgtttaacggacttaattttcaactcaagttcgtctcatttggttcatgaa 29037854  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggtt 335  Q
    | ||||||| | |||||| || ||| |||| | || ||||||  ||||| |||| |||||    
T  29037853 caaagttcagcaaattaattaccgaatcgagtctcaaactattttcgagctggtacggtt 29037794  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 300
Target Start/End: Original strand, 30919395 - 30919518
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||| |||||||    ||  || ||||| | |||    
T  30919395 tcatgaacctaacgagtcgaaccatacgaagctcaagttcaactcatttatctaacgagtttagttttcaactcaagttcgactcatttggttcgtaaac 30919494  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcga 300  Q
    |||||||||||||| || ||||||    
T  30919495 caagttcaacgaatcaattatcga 30919518  T

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Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Original strand, 33019369 - 33019443
Alignment:
Q  272 tgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||| |||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||    
T  33019369 tgaaccaagttcaacgaaccaattatcgaatcgagtatcgaactatttttgagttggttcggttcattgtcagcc 33019443  T

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Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 345
Target Start/End: Original strand, 31491888 - 31491956
Alignment:
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||  | |||||| |||||||||||| ||||    
T  31491888 caagttcaacgaattaattatcgaatcgaatctcaaactatttttgagttgattcggttcattgtcagc 31491956  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5283063 - 5283008
Alignment:
Q  167 tcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctca 222  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  5283063 tcgagtcatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagcttaagttcaactca 5283008  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 254
Target Start/End: Original strand, 29527393 - 29527436
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29527393 aagtttagctcatttaattaacgaacttaatttacagctgaagt 29527436  T

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Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33140883 - 33140812
Alignment:
Q  268 ttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||  ||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  33140883 ttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcaagtcgaattccgaactatgttcgagttgactcggttcatt 33140812  T

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Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 254
Target Start/End: Original strand, 37250017 - 37250084
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37250017 aacgagttgaactatatttagttcaagtttagctcacttggttaacgaaattaattttcagctcaagt 37250084  T

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Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 158
Target Start/End: Original strand, 45176126 - 45176162
Alignment:
Q  122 ttttttaaaaactaactcaaatttatttatctatata 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45176126 ttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatata 45176162  T

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Target: chr4 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12789901 - 12789552
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12789901 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctctttccttcaagacaaaattgtattcagccac 12789802  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaattttttaaaaa-ctaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||    
T  12789801 atttgccacatttgaaataatttttttaaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcattttcctaactagttgaact 12789702  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  12789701 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcgttaggttcataaaccaagttcaacggattagatatcg 12789602  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12789601 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 12789552  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 45674635 - 45674976
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45674635 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaattgctcttcccttcaagacaaaattgtattcaaccac 45674734  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaattttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaacta 200  Q
    ||| |    |||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45674735 attaga---att--aatt---ttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaacta 45674826  T
Q  201 tatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcga 300  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  45674827 tatgtagctcaagttcaactcatttaattaacgaatttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcgacggattagatatcga 45674926  T
Q  301 gtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45674927 gtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 45674976  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44791583 - 44791256
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||         
T  44791583 atccaacaaaatttaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattca----- 44791489  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44791488 ----gccacatttgaattaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagtcatctcatgaacctaacgagtcgaact 44791393  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44791392 atatgtagctcaaattcagctcatttaattaacgaacttaattttcagttcaagtgcagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcg 44791293  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791292 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttc 44791256  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 90 - 349
Target Start/End: Original strand, 53369752 - 53370012
Alignment:
Q  90 tattcaaccacatttgccacatttgaattaaa-ttttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaa 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53369752 tattcaaccacatttgccacatttgaattaaaattttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaa 53369851  T
Q  189 cgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacga 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  53369852 cgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacgg 53369951  T
Q  289 attaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53369952 attaaatatcgagttgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 53370012  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 302
Target Start/End: Original strand, 49820778 - 49821075
Alignment:
Q  4 caacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatt 103  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  49820778 caacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaacttcaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccacatt 49820877  T
Q  104 tgccacatttgaattaaatttttt-aaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactata 202  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49820878 tgtcacatttgaattaaatttttttaaaaactaactcaaattgatttat--atataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactata 49820975  T
Q  203 tgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagt 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49820976 tgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagcttaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagt 49821075  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 53369479 - 53369739
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  53369479 atccaacaaaattcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcctttcaagacaaaattgtattcaaccac 53369578  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53369579 atttgccacatttgaattaattttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 53369678  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagct 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53369679 atatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagct 53369739  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 349
Target Start/End: Original strand, 19852846 - 19853118
Alignment:
Q  78 aagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaatt-ttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatc 176  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19852846 aagagaaaattgtattaagccacatttgccacatttgaattaaaaaattttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatc 19852945  T
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  19852946 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccatctcgttaggttcatgaac 19853045  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19853046 caagttcaacggattaaatatcgagtcgaatgtcaaactataatcgagttggttcgattcattgacagcccta 19853118  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 350
Target Start/End: Original strand, 50605841 - 50606149
Alignment:
Q  26 aacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaatttt 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||           
T  50605841 aacaaaattcacaatattcttttacttttaaattccaattgctcttccattcaagacaaaattgtattca---------gccacatttgaatt------- 50605924  T
Q  126 ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcattt 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50605925 ttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcataaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcattt 50606024  T
Q  226 aattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50606025 aattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgaat 50606124  T
Q  326 tggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50606125 tggttcggttcattgccagccctac 50606149  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 74 - 349
Target Start/End: Original strand, 48977440 - 48977716
Alignment:
Q  74 cttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaatttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagc 172  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  48977440 cttcaagacaaaattgtattcggccacatttgccacatttgaattaaaaaaaattaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagc 48977539  T
Q  173 catctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcat 272  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  48977540 tatctcatgaaccgaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaatttaattttcagctcatgtccagctcattaggttcat 48977639  T
Q  273 gaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48977640 gaacgaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaattataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 48977716  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 140 - 349
Target Start/End: Original strand, 21441512 - 21441721
Alignment:
Q  140 aaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaactta 239  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21441512 aaattgatttatatatataatcaataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatttaattaacgaactta 21441611  T
Q  240 attttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 339  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21441612 attttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 21441711  T
Q  340 gccagcccta 349  Q
    | || |||||    
T  21441712 gtcaacccta 21441721  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 9469731 - 9469917
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Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||      
T  9469731 ataatcgagtcatctcatgaacctaacgaatcgaaccatctatagttcaagttcagctcatttaatcaacgaacttaattttcagctcaagtttggctca 9469830  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||||||||||||   |  || | |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9469831 tttggttcatgaaccaagttcaatagaccaattgtcgagtcgaattacgaactatattcgagttggttcggttcattgtcagcccta 9469917  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 36543735 - 36543921
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Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||      
T  36543735 ataatcgagtcatctcatgaacctaacaaatcgaaccatctatagttcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtttggctta 36543834  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||||||||||||||||||| | |  || | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36543835 tttggttcatgaaccaagttcaatggaccaattgtcgagtcgaattacgaactatattcgagttggttcagttcattgtcagcccta 36543921  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 50147104 - 50146918
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Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||  | |      
T  50147104 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagccgaactacatataacttaagttcagctcaattagttcacgaacttaattttcagctcaagtccggttca 50147005  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50147004 tttggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattgtcgaatcgaattacgaactttaatcgaattggttcggttcattgctagcccta 50146918  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24008075 - 24007903
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || || |||||||||||||||    
T  24008075 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatatttagctcaagttcaactcatttatttaacgaacttaattttaaactcaagtttaactcgttaggttcatgaac 24007976  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24007975 caagttcaacgaatcaatcatcaaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcaattcattgtcagcccta 24007903  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11055409 - 11055226
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Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||     
T  11055409 atcgagtcagctcatgaaccaatcgagtcgaactatatacagctcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttccgctcaagttcagctcattt 11055310  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11055309 ggttcatgaaccaagttcaatgagttaattatcgaatcgagttccgaactattgtcgagttggttcggttcattgtcagcccta 11055226  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 22184460 - 22184643
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||  || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||     
T  22184460 atcgagccaacttatgaaccaactgagtcgaactatataaagttcaagttcagctcatttgtttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcgttt 22184559  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| |  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22184560 ggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagtcccaaactattgtcgagttggttcggttcattgccagcccta 22184643  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 26632893 - 26633076
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |   ||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||     
T  26632893 atcgagccaactcatgaaccaactaagtcggactatatgtaattcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcattt 26632992  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| | |||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26632993 ggttaatgagccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagttacgaactattatcgagttggttcggttcattgccggcccta 26633076  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36156463 - 36156303
Alignment:
Q  180 tgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaa 279  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||| |||||||    
T  36156463 tgaaccaaacgagtcgaactacatatagttcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttcggctcatttggttcaagaaccaa 36156364  T
Q  280 gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36156363 gttcaacgaatcaattgtcgaatcgaattacgaactttaatcgagttggttcggttcattg 36156303  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48731356 - 48731172
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||||||||| ||||||| || || | ||||||| | ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |  ||     
T  48731356 atcgagccatcttatgaaccaaatgaattgaactatctataattcaagtacagctcatttaattaacgaacttaatttttagctcaagttcagtttattt 48731257  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||| ||||| | |  || | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48731256 ggttcatgaaccaaattcaatggaccaattgtcgagtcgaatttcgaactatattcgagttggttcggttcattggcagccctac 48731172  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15697269 - 15697082
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||| | ||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||      
T  15697269 ataatcgaatcaactcatgaaccaaacgagtcggactatgtttagttcatgttcagctcattaagttaacgaacttaatttttagctcaagttcagctta 15697170  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| | ||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15697169 tttggttcatgaatcaagttcaacgaatcaattgtcgagtcgagtctcgaactttattcgagttgtctcggttcattgtcagccctac 15697082  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 52813558 - 52813741
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||     
T  52813558 atcgagccaactcatgaaccaaccgaatcgaactatataaagctcaagttcagctcatttgtttaacgaacttaattttcagcttaagttcagctcgttt 52813657  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || | | || |  | ||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52813658 ggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcaaatagagtcccaaactattgtcgagttggttcggttcattgtcaacccta 52813741  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 19850520 - 19850612
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtatt 93  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19850520 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagagaaaattgtatt 19850612  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48339274 - 48339098
Alignment:
Q  174 atctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatg 273  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    ||  || | ||||||    
T  48339274 atctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagcttaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttcgactcatttgattcatg 48339175  T
Q  274 aaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48339174 aaccaagttcaacaaatcagttgtcgaatcgaattacgaactctaattgagttggttcgattcattgtcagccctac 48339098  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 80465 - 80637
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  80465 tcatgaaccaaacgagtcgaattatacgtagttcaagttcggctcatttatttgacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 80564  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||  || || ||| || ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  80565 caagttcaacgaaacaattaccgaatcaaatttcgaactattttcgagttggatcggttcattgccagcccta 80637  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 22721296 - 22721467
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |  || ||| |||||||||||    
T  22721296 tcatgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagttcaactcatttatttaacgaacttaatttt-agcttaagtttgcctcgtttggttcatgaac 22721394  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||| |||| |  |||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  22721395 caagttcaatgaactaattaccgaatcgagttccgaactttattcgagttgtctcgattcattgccagcccta 22721467  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 343
Target Start/End: Original strand, 51995080 - 51995212
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtc 310  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  51995080 aagttcaactcgtttatttaacaaacttaattttgagctcaagttcggctcatttggttcatgaaccaagttcaacgaattaattatcgaatcgagtctc 51995179  T
Q  311 gaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  51995180 gaactattttcgagttggttcggttcattgcca 51995212  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 349
Target Start/End: Original strand, 52706195 - 52706357
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  52706195 aacgagtcgaactatatataactcaagttcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcgtttggttcatgaaccaagtttaac 52706294  T
Q  287 gaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||| ||| || |||||| | |  |||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52706295 gaactaattaccgagtcaagttccgaattttattcgagttgtatcggttcattgccagcccta 52706357  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 349
Target Start/End: Original strand, 56224100 - 56224285
Alignment:
Q  164 taatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggt 263  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||  |    
T  56224100 taatcgagccaatttatgaaccaaacaaatcgaattatatatagttcaagttcaacttatttaattaacgaatttaattttcagctcaagttcggctcat 56224199  T
Q  264 taggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||| | | ||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56224200 ttggtttattaaccaagttcaacgaattaattgttgagtcaagtttcgaactatgtttgagttggttcggttcattgtcagcccta 56224285  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28265843 - 28265672
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||| | ||||  |    || ||| ||||||||||    
T  28265843 ctcatgaaccaaacgagtcgaactacacttggctcaagttcaactcatttgtttgacgaacttaattttaaactcagatt---ctcgtttggttcatgaa 28265747  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28265746 ccaagttcaacgaattaattaccgaatcgagtctcgaactattttcgagttggttcagttcattgccagccctac 28265672  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12673200 - 12673034
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   | || ||||||  |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  12673200 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactcaactcaagttcgactcatttatttaatgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 12673101  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    |||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12673100 caagttcaacgagtcaattatcgaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcggttcattgcca 12673034  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19455343 - 19455159
Alignment:
Q  164 taatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggt 263  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||  ||||  |    
T  19455343 taatcgagccaacttgtgaaccaaacaagtcgaactgtatatagctcaagttcaactcatttagataacaaacttaattttcaactcaagttcagctcat 19455244  T
Q  264 taggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| | || | |||| | |||||||||  |||| |  | ||||||||||| |||||||    
T  19455243 ttgattcatgaaccaagttcaacgaattaattgtcaaatcgagtttcgaactattttcgaataagctcggttcattgtcagccct 19455159  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32397884 - 32397707
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||||   |||      
T  32397884 ataatcgagtcatctcgtgaatcaaacgagtcgagctacatatagttcaagttcagctcaattagttgacgaacttaatttttagttcaagttcggctta 32397785  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    || | ||||||||||||||||  ||||| || | |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  32397784 tttgattcatgaaccaagttcggcgaatcaattgtcgagtcgaattacgaactttaatcgaattggttcggtttattg 32397707  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49083392 - 49083243
Alignment:
Q  191 agtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaat 290  Q
    |||||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||  ||||||| ||||||||||||||||  |     
T  49083392 agtcgagctatatataactcaagtacagctcatttaattaacgaatttaattttcagatcaagttcaactcattaggtttatgaaccaagttcaacagac 49083293  T
Q  291 taaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||| ||||||||| ||| || ||||||  || |||||||||| |||||||    
T  49083292 taattatcgagtccaatttcaaactattctcaagttggttcgattcattg 49083243  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 40797798 - 40797970
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   || | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  40797798 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactaagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 40797897  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||| |||  || |||||| || | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40797898 caagttcaatgaaccaattatcgaatcaagtatcgaactatttttgagttggttcggttcattgccagtccta 40797970  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 46944716 - 46944544
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   | || ||||||  || ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  46944716 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactcaactcaagttcgacttatttatttaacgagcttaaatttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 46944617  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46944616 caagttcaacgagccaattatcgaatcgaatctcgaactatttttgagttggttcggttcattgtcagcccta 46944544  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 55892157 - 55891985
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||  | ||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||| | | || ||    || ||| |||||||||||    
T  55892157 tcatgaaccaaacgaattgaactatacttggctcaagttcaactcatttgtttgacgaacttaattttaaacccaggttcgactcgtttggttcatgaac 55892058  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  55892057 caagttcaacgaattaattaccgaatcgagtctcgaactatttttgagttggttcagttcattgtcagcccta 55891985  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6866257 - 6866109
Alignment:
Q  195 gaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaa 294  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||||||||||||  |||||| ||     
T  6866257 gaactacatatagctcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttcggctcatttggttcatgaaccaagtttgacgaatcaat 6866158  T
Q  295 tatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||| || |      |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6866157 tatcgaatcaa------aactttaatcgagttggttcggttcattgtcaacccta 6866109  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 349
Target Start/End: Original strand, 1803468 - 1803633
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaacca 278  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    ||  ||||||||||||| ||    
T  1803468 atgaaccaaacgagtcgaaccatatttagttcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttaaactcaagttcgactcattaggttcatgaatca 1803567  T
Q  279 agttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||| ||||||| || ||     |||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1803568 agtttaacgaatcaatta-----tcgaatctcgcactcttttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 1803633  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 349
Target Start/End: Original strand, 13455703 - 13455841
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtc 310  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    ||  || ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  13455703 aagttcaactcgtttatttaacgaacttaattttgagctcaagttggactcatttggttcataaatcaagttcaacgaattaattatcgaatcgaatctc 13455802  T
Q  311 gaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     || |||  || ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13455803 aaattattttcaagttggttcggtttattgtcagcccta 13455841  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 346
Target Start/End: Original strand, 27891354 - 27891523
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  |  | || ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||    
T  27891354 ctcatgaaccaaccgagtcgaactatataaaattcaaattcagctcatttatttaacaaatttgattttcagctcaagttcagctcatt-tgttcatgaa 27891452  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| |||| |  ||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  27891453 ccaagttcaacgagttaattgtcgaatcgagttccgaactattgtcgagttgattcgattcattgtcagcc 27891523  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48151253 - 48151125
Alignment:
Q  222 atttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatc 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||  ||||||||||||||| |  ||| | |||| |||| | |||||||||  ||    
T  48151253 atttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcagctcatttggtttgtgaaccaagttcaacaagataattgtcgaatcgagtttcgaactattgtc 48151154  T
Q  322 gagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  48151153 gagttggttcgaatcattgcaagccctac 48151125  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51408032 - 51407948
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51408032 ggttcatgaaccaagttgaacgaattaattaccgaatcgagtctcgaactattttcgagttggttcagttcattgtcagccctac 51407948  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 348
Target Start/End: Original strand, 7505517 - 7505668
Alignment:
Q  197 actatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaata 296  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||   |||  || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  7505517 actatatataactcaagttcaactcatttagttaacgaatttaatttttagctcaagttcggctcatttggttcatgaatcaagttcaacgaactaatta 7505616  T
Q  297 tcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccct 348  Q
     |||||| | |   ||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  7505617 ccgagtcaagttctgaactttattcgagttgtatcggttcattgtcagccct 7505668  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 43812243 - 43812116
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||   ||       
T  43812243 ataatcgagtcatctcgtgaactaaacgagtcgaactacatctagttcaagttcagctcaattagtttacgaacttaattttcagtttaagttcggccca 43812144  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaat 290  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  43812143 tttggttcatgaaccaagttcgacgaat 43812116  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Original strand, 43387225 - 43387398
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  || | |||||||||||||||  |||||| | |||||||||           |||| |||     
T  43387225 atcgagccaactcatgaaccaaccgagtcgaactatataaagttcaagttcagctcatttgtttaacggatttaattttc-----------agcttgttt 43387313  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | |||| || | |    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43387314 ggttcatgaaccaaattcaacgagttaattgtcgaatcaagtcctaaactattgtcgagttggttcggttcattgccagccctac 43387398  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 49405797 - 49405635
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    |||||||||||||||   || || |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||   ||||||    ||  || ||||||| |||||||||||||    
T  49405797 aacgagtcgaactatccataactcaagttcggctcatttatttgacgagcttaattttcgattcaagttcgactcatttggttcataaaccaagttcaac 49405698  T
Q  287 gaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||| || || ||| |||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49405697 gaatcaattaccgaatcgagtttcgaactattttcgggttggttcggttcattgtcagcccta 49405635  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16742508 - 16742423
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctca 251  Q
    |||||| || |||||||||| | ||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16742508 atcgagtcagctcatgaaccaatcgaatcgaactatatacaactcaagttcagctcatttatttaacgaacttaattttcaactca 16742423  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Original strand, 44378218 - 44378331
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |  | ||  || |||||||||||    
T  44378218 tcatgaaccagacgagtcgaattatacttagctcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttcaacccaaattcaactcatttggttcatgaac 44378317  T
Q  277 caagttcaacgaat 290  Q
    ||||||||||||||    
T  44378318 caagttcaacgaat 44378331  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38493147 - 38493075
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctca 251  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38493147 atgaaccaaacgagtcaaattatatataactcaagttcaactcatttaattaacaaacttaattttcagctca 38493075  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 352
Target Start/End: Original strand, 38791728 - 38791834
Alignment:
Q  245 cagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccag 344  Q
    ||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | || |  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  38791728 cagctcaagttcagctcatttggttcatgaaccaagttcaacgagttaattgtcgaattgattc-caaactattgtcgagttggttcggttcattgccag 38791826  T
Q  345 ccctacat 352  Q
    ||||||||    
T  38791827 ccctacat 38791834  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 48802650 - 48802475
Alignment:
Q  175 tctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatga 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||    ||  || |||||||||    
T  48802650 tctcgtgaaccaaacgagtcgaactattcatagctcaagttcggctcatttatttgacgagcttaattttcgactcaagttcgactcatttggttcatga 48802551  T
Q  275 accaagttcaacgaattaaat-atcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    | |||||||||  || | ||| | | | |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48802550 atcaagttcaaaaaaatcaataaccaaatcgagtttcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 48802475  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 49378168 - 49378093
Alignment:
Q  35 cataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccaca 110  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49378168 cataatattcttctacttccaaactccaattgctcttcccttaaagacaaaattgtattcagccacatttgccaca 49378093  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52733840 - 52733710
Alignment:
Q  209 ttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatg 308  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||  || ||||||||||  || |||||||| |||| |||||| || |||     
T  52733840 ttaagttcaacttatttatttaacgaacttaattttcagctcaattc-aactcatttggttcatgaattaaattcaacgagttaattatcgaatcaaatt 52733742  T
Q  309 tcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  52733741 tcgaattattattaagttggttcagttcattg 52733710  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 350
Target Start/End: Original strand, 9959345 - 9959472
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtc 310  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||           || | ||||||||| ||||||||||| |||  ||| || |||| | ||    
T  9959345 aagttcagcttatttatttaacgaacttaattttcagctca-----------tttgattcatgaac-aagttcaacgagttatttatagaatcgagtttc 9959432  T
Q  311 gaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9959433 gaactattgtcgagttggttcggttcattgtcagccctac 9959472  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Original strand, 25134542 - 25134619
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||   || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25134542 tcatgaaccaaacgagtcgaaccatactaagttcaagttcaactcatttatttaacgaacttaattttcaactcaagt 25134619  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9222209 - 9222138
Alignment:
Q  272 tgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9222209 tgaaccaagttcaacgaaccaattgtcgaatcgagtatcgaactattttcgagttggttcggttcattgcca 9222138  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 251
Target Start/End: Original strand, 41822079 - 41822153
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgta--gcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctca 251  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  41822079 atgaaccaaacgaatcgaactatatatatagtttaagttcagctcatttagttaacaaacttaattttcaactca 41822153  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 24550049 - 24550122
Alignment:
Q  181 gaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||| |||||||||| |||||  || || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24550049 gaaccaaacgagtcgagctatacataactcaagttcaactcatttagttaacaaacttaatttttagctcaagt 24550122  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 251
Target Start/End: Original strand, 27285617 - 27285678
Alignment:
Q  190 gagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctca 251  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27285617 gagtcgaactatatatagctcaagtttaactcatttaattaacaaactaaattttcaactca 27285678  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43798396 - 43798328
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaatttt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| || ||| |||||    
T  43798396 ctcatgaaccaaacgagtcgaactatacatagctcaagttcaactcatttatttaatgatcttcatttt 43798328  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 54623717 - 54623649
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaatttt 244  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||    
T  54623717 ctcatgaatcgaacgagtcgaactatatgtagtttaagttaaactcatctaataaatgaatttaatttt 54623649  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9874291 - 9874212
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||  || |||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  9874291 ggttcatgtaccaatttcaacgaattaattactgaatcgaatcttgaactatttttgagttggttcggttcattgtcagc 9874212  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4274637 - 4274555
Alignment:
Q  268 ttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||| || |||||||||  ||| | |||| || | | |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4274637 ttcatgaatcaggttcaacgagataattgtcgaatcaagtttcgaactattttcgagttggttcggttcattgctagccctac 4274555  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4274757 - 4274680
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  4274757 tcatgaatcaaacgagtcgaactatatatagttaatgttcagctcgtttagctaacaaacttaatttttagctgaagt 4274680  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Original strand, 38791676 - 38791748
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcattt 225  Q
    ||||| || ||| |||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  38791676 tatattatcgattatcgagtcagctcatgaaccaaccgagtcaaactatatacagctcaagttcagctcattt 38791748  T

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Target: chr6 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 10346512 - 10346861
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10346512 atccaacaaaattcaattagttgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcagccac 10346611  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaatt-ttttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10346612 atttgccacatttgaattaaaaaattttaaaaaataactcaaattgatttatatatataatcaataatcgagtcatctcatgaacttaacgagtcgaact 10346711  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  10346712 atatgtaactcaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatag 10346811  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10346812 agtcgaatgtcgaactataatcgatttggtttggttcattgccagcccta 10346861  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 8200433 - 8200771
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8200433 atccaacaaagttcaattagctgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattcaaccac 8200532  T
Q  101 atttgccacatttgaattaaattttttaa-aaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200533 atttgccacatttgaattaattttttttataaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaact 8200632  T
Q  200 atatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcg 299  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8200633 atatgtagctcaagttcaactcatttaattaacgaacttaattttcagctc-----------gttaggttcatgaatcaagttcaacggattaaatatcg 8200721  T
Q  300 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8200722 agtcgaatgtcgaactataatcgagttggtttggttcattgtcagcccta 8200771  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5640434 - 5640250
Alignment:
Q  167 tcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttag 266  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||   |||  || |    
T  5640434 tcgagtcatcttgtgaaccaaacgagtcgaactatatatagttcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagttcaagttcggctcatttg 5640335  T
Q  267 gttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640334 gttcatgaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatcgaattacgaactctaatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 5640250  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10961982 - 10961796
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |    ||      
T  10961982 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagttcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaaattcgactca 10961883  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || | |||| || |||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10961882 tttggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattgtcgaatcaaattacaaactttaatcgagttggttcggttcattgccagcccta 10961796  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3081890 - 3081717
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    ||  || ||||| |||||    
T  3081890 tcatgaaccaaacgagtcgaactatacttagttcaagttcagctcatttaattaacgagcttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcgtgaac 3081791  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3081790 caagttcaacgaaccaattatcgaatcgagtatcgaactattttcgagctggttcggttcattgccagccctac 3081717  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 153 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4441497 - 4441301
Alignment:
Q  153 tatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    ||||| || ||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4441497 tatattatcgattatcgaaccagctcatgaaccaaccgaatcgaactatatacagttcaagttcagctcatttatttaacgaacttaattttcaactcaa 4441398  T
Q  253 gtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||  ||||  ||  |||| |||||||||||||||||  ||| | |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4441397 gttcagctcatttagttcgtgaaccaagttcaacgagctaattgtcgaatcgagtttcgaactattgtcgagttggttcggttcattgccggcccta 4441301  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 1501805 - 1501988
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | |  ||     
T  1501805 atcgagtcagctcatgaaccaaccgagtcgaactatatacagcttaagtttggctcatttatttaacgaacttaattttcagctcaagttcggttcattt 1501904  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | || | |||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1501905 ggttcatgaacgaagttcaacgagttaattgtcaaatcgagtttcgaacaattgtcgagttggttcggttcattgtcagcccta 1501988  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 346
Target Start/End: Original strand, 33110429 - 33110595
Alignment:
Q  180 tgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaa 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  33110429 tgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagttcgactcatttagttaacgaacttaatctttagcttaagttcggctcgtttggttcatgaaccaa 33110528  T
Q  280 gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcc 346  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |  |||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  33110529 gttcaacgaactaattaccgagtcgagttccgaactttattcgagttgtatcggttcattgccagcc 33110595  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Original strand, 6999224 - 6999407
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  || | |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||     
T  6999224 atcgagccaactcatgaaccaaccgagtcgaactatataaagttcaagttcagttcatttgtttaacaaacttaattttcagctcaagttcagctcattt 6999323  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||  |||||||| |||| || |||| | ||||||    
T  6999324 agttcattaaccaagttcaacgaattaattatcgaatcgagtctcaaactattgtcgagttgcttcgatttattgtctgcccta 6999407  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9950946 - 9950759
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||   |||      
T  9950946 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagttgaactacatatagctcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcaactcaagttcggctca 9950847  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||||||||||||||||| | |||| |  | |||| || |||   ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9950846 tttggttcatgaaccaagttcgatgaatcatttgtcgaatcaaattatgaactttaatcgagttgattcgattcattgccagccctac 9950759  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 7437272 - 7437444
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    ||  || ||||| |||||    
T  7437272 tcatgaaccaaacgagtcgaactatacttagttcaagttcagctcatttatttaacgagcttaattttcaactaaagttcgactcatttggttcgtgaac 7437371  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||   | |||||| |||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7437372 caagttcaacgaacccattatcgaatcgagtatcgaactattttcgagttagttcggttcattaccagcccta 7437444  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 13311990 - 13312164
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||   || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||  || |||||||||||    
T  13311990 tcatgaaccaaacgagttgaaccatactaagttcaagttcaactcatttatttaacgaacttaattttcaactcaagttcgactcatttggttcatgaac 13312089  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcga--atgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||| ||| |||  || |||||| ||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13312090 caagtccaatgaaccaattatcgaatcgagtatatcgaactattttcgagttggttcggttcattgccagcccta 13312164  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11460189 - 11460014
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || ||||| |||| | |||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||          ||     
T  11460189 atcgagtcagctcataaaccaaccgagtcgaactatattcaactcaagttcagctcatttatttaacaaacttaattctcagctcaaca--------ttt 11460098  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11460097 ggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattatcgaatcgagttccgaactattattgagttggatcggttcattgccaacccta 11460014  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 286
Target Start/End: Original strand, 32163508 - 32163618
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  32163508 ctcatgaatctaactaggcaaacgatatatggctcaagttaagctcatttagttaacgaacttaattttcaactcaagtttagctcattaggttcatgaa 32163607  T
Q  276 ccaagttcaac 286  Q
    ||| |||||||    
T  32163608 ccatgttcaac 32163618  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Original strand, 17441123 - 17441298
Alignment:
Q  175 tctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagc-tcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatg 273  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||   || || |||||| || ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||  | ||  || ||||||||    
T  17441123 tctcgtgaaccaaatgagtcgaactatccataactcaagttcggcctcatttatttgacgagcttaattttcaactcaagttcaactcatttggttcatg 17441222  T
Q  274 aaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||| |||||||||||||||| || | | |||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17441223 aactaagttcaacgaattaattaccaaatcgagtttcgaactattttcgggttggttcggttcattgccaacccta 17441298  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27985076 - 27984949
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||   |||      
T  27985076 ataatcgagtcatctcgtgaactaaacgagtcgaactacatctagttcaagttcagctcaattagtttacaaacttaattttcagttcaagttcggctca 27984977  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaat 290  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||    
T  27984976 tttggttcataaaccaagttcgacgaat 27984949  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 235
Target Start/End: Original strand, 3901548 - 3901607
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaa 235  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3901548 ctcatgaaccaaacgaaccgaactatatataacttaagttcagctcatttaattaacgaa 3901607  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13355761 - 13355722
Alignment:
Q  213 gttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13355761 gttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 13355722  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 352
Target Start/End: Original strand, 22295884 - 22296059
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| || || || |||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| |||||||||||    
T  22295884 tcatgaaccaaaagagttgaactatatataactcaaattcaacacatttacttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcgtttggttcatgaac 22295983  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctacat 352  Q
    |||||| ||  || ||| ||  ||||||| |  |||||| || || |||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  22295984 caagtttaataaactaattactgagtcgagttccgaactttattcaagttgtcttggttcattggcagccctacat 22296059  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 343
Target Start/End: Original strand, 12428844 - 12429010
Alignment:
Q  166 atcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggtta 265  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||| ||  || || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||     
T  12428844 atcgagtcaactcatgaaccaatcgagttgagttacatatagctcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttcagctca----------gtt- 12428932  T
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | | ||||||||| |   |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12428933 ggttcataaaccaagttcaacaagttcattgtcgagtcgagttctgaactatatttgagttggttcggttcattgcca 12429010  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 18095515 - 18095650
Alignment:
Q  205 tagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcg 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    ||  || ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||    
T  18095515 tagctcaagttcatctcatttatttaacgaacttaatttttaactcaagttcgacttatttggttcgtgaaccaagttcaacgaatccattatcgaatcg 18095614  T
Q  305 aatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    | | || |||| |  | ||||||||| |||||||||    
T  18095615 agtctcaaactttttttgagttggtttggttcattg 18095650  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 340
Target Start/End: Original strand, 18099784 - 18099947
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |    ||  || ||||| |||||    
T  18099784 tcatgaaccaaacgaattgaactatgcatagctcaagttcatctcatttatttaacgaacttaattgttaactcaaattcgactcatttggttcgtgaac 18099883  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||| | || |||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  18099884 caagttcaacgaatccattatcgaatcgagtctcaaacttttttcgagttggtttggttcattg 18099947  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Original strand, 21298915 - 21298955
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctca 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21298915 aagttcagctcagttaattaacaaacttaattttcagctca 21298955  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 7957433 - 7957536
Alignment:
Q  1 atccaacaaaatttaattagccgtgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccac 100  Q
    ||||||||||| | ||||||  | ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||  |||| ||||  |||||||||||| | ||    
T  7957433 atccaacaaaactcaattagttgagaacagaatgcataatattcttctacttccaaactccaattgctctcctctttaagactaaattgtattcagctac 7957532  T
Q  101 attt 104  Q
    ||||    
T  7957533 attt 7957536  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9463507 - 9463360
Alignment:
Q  196 aactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaat 295  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || | || |  ||||  || ||||||| ||| ||||| || || |||| |    
T  9463507 aactatctatagtttaagttcggctcgtttaaataacgaacttaatttttagtttaaattcagctcatttggttcataaactaagtttaatgagttaatt 9463408  T
Q  296 atcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    |||||||||| |  |||||| || |||||| |  ||||||||||||||    
T  9463407 atcgagtcgagttccgaactttattcgagtagtctcggttcattgcca 9463360  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 252
Target Start/End: Original strand, 30774005 - 30774081
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaa 252  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| |||| |||||    
T  30774005 ctcatgaaccaaatgagtcggattatacatagcttaagttcatctcatttatttaacgtgcttaatattcaactcaa 30774081  T

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Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 349
Target Start/End: Original strand, 453304 - 453623
Alignment:
Q  24 tgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttc--ttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||     
T  453304 tgaacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctctcttcccttcaagacaaaattgtattca---------gccacatttgaattaat 453394  T
Q  122 tttt-ttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagct 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  453395 tttttttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatcgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcaact 453494  T
Q  221 catttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataat 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  453495 catttaattaacgaacttaattttcaactcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattagatatcgagtcgaatgtcgaactataat 453594  T
Q  321 cgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  453595 cgagttggttcggttcattgccagcccta 453623  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 343
Target Start/End: Original strand, 11161397 - 11161706
Alignment:
Q  26 aacaaaattcataatattcttttacttttaaactccaactgctcttttcttcaagaaaaaattgtattcaaccacatttgccacatttgaattaaattt- 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||        
T  11161397 aacaaaattcataatattattttacttttaaacttcaactgctcttcccttcaagacaaaattgtattca---------gccacatttgaattaaacaaa 11161487  T
Q  125 tttaaaaactaactcaaatttatttatctatataattgataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatt 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11161488 tttaaaaactaactcaaattgatttatatatataatccataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagctcaagttcagctcatt 11161587  T
Q  225 taattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11161588 taattaacgaacttaattttcagctcaagtccagctcgttaggttcatgaaccaagttcaacggattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcaag 11161687  T
Q  325 ttggttcggttcattgcca 343  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11161688 ttggtttggttcattgcca 11161706  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 351
Target Start/End: Original strand, 3307901 - 3308076
Alignment:
Q  176 ctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaa 275  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||  || ||||||||||    
T  3307901 ctcataaaccaatcgagtcgaactatatacagctcaagttcggctcatttatttaacgaacttaattttctgctcaagttcggctcatttggttcatgaa 3308000  T
Q  276 ccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctaca 351  Q
    | |||||| |||| |||| | |||| |||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3308001 ctaagttctacgagttaattgtcgaatcgagttccgaactattgtcgagttggttcggttcattgccagccctaca 3308076  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Original strand, 34516092 - 34516279
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||   |||      
T  34516092 ataatcgagtcatctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagttcaagttcagctcaattaatcgacgaacttaattttcagctcaagttcggctca 34516191  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||| ||||| ||||||||| |||| || | |||| | ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34516192 tttggttgatgaatcaagttcaatgaatcaattgtcgaattgaattacgaactttaattgagttggttcggttcattgcgagctctac 34516279  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9412686 - 9412524
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  9412686 aacgagtcgaattatatataactcaaattcagctcatttatgtaacgaatttaattctcaactcaagttcagctcatttggttcatgaaccaagttcaac 9412587  T
Q  287 gaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || || | | |||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9412586 gagttcattgtcgagtcgagctccaaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 9412524  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 350
Target Start/End: Original strand, 43967481 - 43967651
Alignment:
Q  180 tgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaa 279  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  43967481 tgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagttcaactcatttagttaacgaacttaatctttagctcaagttcggctcgtttggttcatgaaccaa 43967580  T
Q  280 gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
     ||||||||| ||| ||  ||||||| |  |||||| |  || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  43967581 attcaacgaactaattactgagtcgagttccgaactttgttcaagttgtatcggttcattgccagccctac 43967651  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33280146 - 33279977
Alignment:
Q  180 tgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaa 279  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||  |   |||  || ||||||||||||||    
T  33280146 tgaaccaaacgagtctaactacatatagttcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttaagctcatattcggctcatttggttcatgaaccaa 33280047  T
Q  280 gttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    |||| |||||| || |||||| || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33280046 gttcgacgaatcaattatcgaatcaaattacgaactttaatcgagttggttcggttcattgtcagcccta 33279977  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 349
Target Start/End: Original strand, 34654989 - 34655175
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    || |    
T  34654989 ataatcgagtcagttcgtgaaccaaacgagtcgaactatatataactcaagtttaactcatttagttaacaaacttaatctttagctcaagttcgactcg 34655088  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || ||| || |||||||| |  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34655089 tttggttcatgaactaagttcaacaaactaattaccgagtcgagttccgaactttattcgagttgtatcggttcattgccagcccta 34655175  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27189268 - 27189092
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| |||| | |||||| || || ||||| || || || || ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    ||      
T  27189268 ataatcgagtcatcccgtgaaccaaatgaatcgaattacatataactcaagttcaactcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttcgactca 27189169  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcatt 339  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| || |||||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27189168 tttggttcatgaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatctaattacgaactctaatcgagttgattcggttcatt 27189092  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 341
Target Start/End: Original strand, 43384851 - 43384926
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgc 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43384851 ggttcatgaaccaacttcaacgaattaattatcgaatcgaatctcgaactattttcgagttggttcggttcattgc 43384926  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Original strand, 39478107 - 39478191
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  || |||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39478107 ggttcatgaaccaagtccaatgaaccaattatcgaatcgagtatcgaactattttcgagttggttcggttcattgccagccctac 39478191  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10749381 - 10749314
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagt 254  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10749381 aacgagtcgaactacatatagctcaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagt 10749314  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 22563974 - 22564142
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||| | || |||| ||||||||||| |||||||     |  || |||||||||||    
T  22563974 tcatgaaccaaacgagtcgaattatatgtagttcaagttcggttcattcatttgacgagcttaattttcaactcaagttcgatttatttggttcatgaac 22564073  T
Q  277 caagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagc 345  Q
    |||||||||||||  || || ||| || ||| || || |||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22564074 caagttcaacgaaacaattaccgaatcaaatttcaaattattttcgagttggatcggttcgttgccagc 22564142  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 290
Target Start/End: Original strand, 23181133 - 23181236
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||   |||  || |||||||||||||| ||| ||    
T  23181133 aacgagtcgaactacatctagttcaagttcagctcaattagtttacgaacttaattttcagttcaagttcggctcatttggttcatgaaccaaattcgac 23181232  T
Q  287 gaat 290  Q
    ||||    
T  23181233 gaat 23181236  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 349
Target Start/End: Original strand, 1091711 - 1091867
Alignment:
Q  193 tcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaatta 292  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||| | |||| ||    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1091711 tcgaactatacttggctcaagttcaactcatttgtttgacgaacttaattttaaactcaggttcgactcgtttggttcatgaatcaagttcaacgaatta 1091810  T
Q  293 aatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    | |||||| |||| | || ||||||  | ||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  1091811 attatcgaatcgagtctcaaactatttttgagtttgttcagttcattaccagtccta 1091867  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 305
Target Start/End: Original strand, 9135954 - 9136048
Alignment:
Q  211 aagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcga 305  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||  || | ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  9135954 aagtccagttcatttagttaacaaacttaaatttcagctcaagttcagcttatttgattcataaaccaagttcaacgagttaattgtcgagtcga 9136048  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 349
Target Start/End: Original strand, 24854577 - 24854739
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    |||||| | ||||||||  || ||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||  || ||||||  ||||||||| |||    
T  24854577 aacgagccaaactatatacagtttaggttcggctcgtttaattaacgagtttaattttcagctcaagttcaactcatttggttcacaaaccaagtttaac 24854676  T
Q  287 gaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    || |||| | |||||| |||| || |||| || || || || ||||||| ||||||| |||||    
T  24854677 gagttaattgtcgagttgaatttcaaactttattcaagctgtttcggtttattgccaacccta 24854739  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 12378409 - 12378492
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||| |||||  | ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12378409 ggttcgtgaaccaagttcaacgaatcaattatcgaaccgaatctcggactatttttgagtttgttcggttcattgtcaacccta 12378492  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17865471 - 17865388
Alignment:
Q  266 ggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |  |||| | || | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17865471 ggttcatgaaccaagttaaacgaactaattaccgagtcgagttccgaattttatttgagttgtctcggttcattgccagcccta 17865388  T

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Target: scaffold0224 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7307
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | | | |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||      
T  7494 ataatcgagtcatctcatgaaccaaacgagtcgacctatatatggttcaagttcagctcaattagttagcgaacttaattttcagctcaagttcggctca 7395  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7394 tttggttcatgaaccaagttcgacgaatcaattatcgaatcgaattacgaacactaatcgaattggttcggttcattgccacccctac 7307  T

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Target: scaffold0204 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0204
Description:

Target: scaffold0204; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26796 - 26620
Alignment:
Q  174 atctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatg 273  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    ||  || | ||||||    
T  26796 atctcgtgaaccaaacgagtcgaactacatatagcttaagttcagctcaattagttgacgaacttaattttcagctcaagttcgactcatttgattcatg 26697  T
Q  274 aaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagccctac 350  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26696 aaccaagttcaacaaatcagttgtcgaatcgaattacgaactctaattgagttggttcgattcattgtcagccctac 26620  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 340
Target Start/End: Original strand, 11439 - 11600
Alignment:
Q  179 atgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaacca 278  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||  || |||  ||||| ||    
T  11439 atgaaccaaacgagtcgaattatatatagttcaaattcagctcatttaattaacgaacttaattttcatctgaagttcggctcatttggtatatgaatca 11538  T
Q  279 agttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11539 agttcaacgaattaattatcgagtcaaattttaaactatgttcgagttggttcggttcattg 11600  T

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Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 9945 - 10120
Alignment:
Q  163 ataatcgagccatctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctgg 262  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||  ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||      
T  9945 ataatcgagtcaactgatgaaccaaacgagtcgaattatat--agtacaaattcagctcatttaattaacgaacttaattttcatcttaagttcggctca 10042  T
Q  263 ttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattg 340  Q
    || ||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10043 tttggtacatgaatcaaattcaacgaattaattgtcgagtcaaattttaaactatattcgagttgattcggttcattg 10120  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 124657 - 124487
Alignment:
Q  173 catctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcat 272  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    ||  || |||||||    
T  124657 catctcatgaaccaaacgaatcgaaatatctatagttcaaattcagctcatttaattaacaaacttaataatcagctcaagttcgactcatttggttcat 124558  T
Q  273 gaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||||||||||||| | |  || | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  124557 gaaccaagttcaatggaccaattgtcgagtcaaatttcgaactatattcgagttggttcggttcattgcca 124487  T

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Target: scaffold0171 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 349
Target Start/End: Original strand, 21084 - 21227
Alignment:
Q  205 tagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcg 304  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    ||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  21084 tagctcaagttcaactcatttatttaatgagcttaattttcaactcaagttcgactcttt-ggttcatgaaccaagttcaacgaatcaattatcgaatcg 21182  T
Q  305 aatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    | | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21183 agtctcgaactattttcgagttggttcggttcattgtcagcccta 21227  T

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Target: scaffold0223 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Original strand, 14392 - 14566
Alignment:
Q  175 tctcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatga 274  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||   || || |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||  |  |  || |||||||||    
T  14392 tctcgtgaaccaaacgagtcgaactatccataactaaagttcggctcatttatttgacgagcttaattttcgactcaagttcaaatcatttggttcatga 14491  T
Q  275 accaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    ||||||||||| |||| || || ||| |||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14492 accaagttcaatgaatcaattaccgaatcgagtttcgaactattttcgggttggttcggttcattgtcagcccta 14566  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 349
Target Start/End: Original strand, 11376 - 11530
Alignment:
Q  195 gaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacgaattaaa 294  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||  | ||  || ||||||||||| |||||| ||||  |||     
T  11376 gaactatatatagcttaagttcggctcatttatttaacgaacttaatttttaacttaagttcacctcatttggttcatgaactaagttcgacgaggtaat 11475  T
Q  295 tatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgccagcccta 349  Q
    | |||| |||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11476 tgtcgaatcgagttccaaactattatcgagttggttcggttcattgtcagtccta 11530  T

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Target: scaffold0954 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 241
Alignment:
Q  187 aacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaac 286  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  346 aacgagtcgaactgtctataactcaagttcaactcatttaattaacgaacttaattcttaactcaagttcggctaattaggttcatgaaccaagtccaac 247  T
Q  287 gaatta 292  Q
    ||||||    
T  246 gaatta 241  T

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Target: scaffold0444 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 939 - 826
Alignment:
Q  177 tcatgaacctaacgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaac 276  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |  | ||  || |||||||||||    
T  939 tcatgaaccagacgagtcgaattatacttagctcaagttcaactcatttatttaacgagcttaattttcaacccaaattcaactcatttggttcatgaac 840  T
Q  277 caagttcaacgaat 290  Q
    ||||||||||||||    
T  839 caagttcaacgaat 826  T

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Target: scaffold0135 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32862 - 32791
Alignment:
Q  272 tgaaccaagttcaacgaattaaatatcgagtcgaatgtcgaactataatcgagttggttcggttcattgcca 343  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32862 tgaaccaagttcaacgaaccaattgtcgaatcgagtatcgaactattttcgagttggttcggttcattgcca 32791  T

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Target: scaffold0192 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25726 - 25623
Alignment:
Q  188 acgagtcgaactatatgtagcttaagttcagctcatttaattaacgaacttaattttcagctcaagtctagctggttaggttcatgaaccaagttcaacg 287  Q
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T  25726 acgaatcgaactatatataattcaagttcatctcatttaattaacggacttaattttcagtttaagt-tcgctcatttgactcataaaccaagttcaacg 25628  T
Q  288 aatta 292  Q
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T  25627 aatta 25623  T

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