View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20965_low_1 (Length: 662)

Name: NF20965_low_1
Description: NF20965
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20965_low_1
NF20965_low_1
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-243)||(41383950-41384192)
chr4 (1-244)||(19744629-19744872)
chr4 (1-244)||(19794934-19795177)
chr4 (14-241)||(19744034-19744261)
chr4 (1-242)||(19743886-19744126)
chr4 (14-241)||(19795545-19795772)
chr4 (1-242)||(19744259-19744498)
chr4 (1-242)||(19795308-19795547)
chr4 (8-241)||(41384100-41384330)
chr4 (18-241)||(19744406-19744629)
chr4 (18-241)||(19795177-19795400)
chr4 (8-242)||(19795969-19796202)
chr4 (1-243)||(41383794-41384044)
chr4 (1-241)||(41383641-41383888)
chr4 (70-241)||(19744780-19744951)
chr4 (70-241)||(19794855-19795026)
chr4 (1-168)||(19795680-19795847)
chr4 (18-168)||(13138077-13138227)
chr4 (54-180)||(37591644-37591770)
chr4 (70-241)||(23977040-23977203)
chr4 (140-242)||(37591932-37592034)
chr4 (140-244)||(13138227-13138331)
chr4 (9-93)||(13138230-13138314)
chr4 (1-93)||(37591941-37592033)
chr4 (1-93)||(37592055-37592147)
chr4 (140-235)||(41384251-41384346)
chr4 (1-91)||(37592169-37592259)
chr4 (1-98)||(19743882-19743979)
chr4 (1-98)||(19796109-19796206)
chr4 (1-94)||(41383640-41383733)
chr4 (2-93)||(23977112-23977203)
chr4 (140-242)||(37592046-37592148)
chr4 (140-235)||(37592160-37592255)
chr4 (8-93)||(37592290-37592375)
chr4 (14-86)||(19795894-19795966)
chr4 (7-95)||(44376738-44376826)
chr4 (142-242)||(37592276-37592376)
chr4 (162-234)||(19795894-19795966)
chr4 (154-241)||(44376737-44376824)
chr4 (170-241)||(13138152-13138223)
chr4 (186-237)||(34336834-34336885)
chr4 (7-92)||(11659124-11659210)
chr4 (186-240)||(34337045-34337099)
chr4 (44-93)||(19795846-19795895)
chr4 (5-92)||(34337045-34337133)
chr4 (142-240)||(11659111-11659210)
chr4 (7-93)||(16036155-16036242)
chr4 (5-87)||(34336836-34336919)
chr4 (192-242)||(19795846-19795896)
chr4 (188-241)||(16036189-16036242)
chr4 (5-94)||(34336720-34336810)
chr4 (186-240)||(34336938-34336992)
chr4 (188-241)||(34336721-34336774)
chr4 (5-92)||(34336938-34337026)
chr4 (7-54)||(30826175-30826223)
chr4 (147-202)||(54095476-54095532)
chr4 (7-54)||(54624258-54624306)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (1-243)||(17694851-17695093)
chr8 (1-242)||(25876099-25876340)
chr8 (8-241)||(25875958-25876191)
chr8 (1-241)||(17695001-17695247)
chr8 (1-215)||(9061237-9061451)
chr8 (18-241)||(18485769-18485992)
chr8 (51-213)||(27018429-27018591)
chr8 (70-243)||(405689-405862)
chr8 (1-199)||(18482418-18482624)
chr8 (70-235)||(44832022-44832186)
chr8 (80-241)||(410235-410396)
chr8 (70-240)||(17695156-17695326)
chr8 (80-215)||(24011348-24011483)
chr8 (119-241)||(9061116-9061238)
chr8 (124-241)||(9061359-9061476)
chr8 (119-228)||(24011482-24011591)
chr8 (128-243)||(18482397-18482512)
chr8 (139-244)||(18485664-18485769)
chr8 (1-93)||(405768-405860)
chr8 (1-93)||(9061116-9061208)
chr8 (1-93)||(18485674-18485766)
chr8 (2-93)||(410305-410396)
chr8 (2-93)||(18485901-18485992)
chr8 (140-235)||(24014287-24014382)
chr8 (1-87)||(44832100-44832186)
chr8 (140-241)||(25875942-25876043)
chr8 (1-80)||(24011512-24011591)
chr8 (1-87)||(24014296-24014382)
chr8 (1-66)||(27018428-27018493)
chr8 (1-65)||(24011417-24011481)
chr8 (188-241)||(18291176-18291229)
chr8 (7-92)||(18482311-18482397)
chr8 (5-92)||(23098003-23098091)
chr8 (7-93)||(27016124-27016211)
chr8 (186-241)||(27016124-27016179)
chr8 (186-240)||(27016512-27016566)
chr8 (34-93)||(18291170-18291229)
chr8 (147-240)||(18482303-18482397)
chr8 (7-92)||(27016249-27016335)
chr8 (186-240)||(27016249-27016303)
chr8 (7-92)||(27016512-27016598)
chr8 (180-241)||(27064938-27064999)
chr8 (186-240)||(23098003-23098057)
chr8 (35-93)||(27064941-27064999)
chr8 (147-202)||(39996823-39996879)
chr8 (199-241)||(27018549-27018591)
chr8 (5-54)||(44833143-44833193)
chr8 (44-80)||(405861-405897)
chr8 (192-228)||(405861-405897)
chr8 (69-97)||(15960010-15960038)
chr8 (147-202)||(18568344-18568400)
chr8 (7-54)||(18840954-18841002)
chr8 (147-202)||(19240014-19240070)
chr8 (147-202)||(19313198-19313254)
chr8 (7-54)||(32112106-32112154)
chr8 (147-202)||(38630877-38630933)
chr8 (7-54)||(38630885-38630933)
chr8 (7-54)||(39996823-39996871)
chr8 (68-96)||(44836495-44836523)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (1-235)||(203878-204112)
chr2 (7-241)||(1000117-1000351)
chr2 (8-242)||(203721-203957)
chr2 (1-242)||(1000259-1000499)
chr2 (29-241)||(44665652-44665863)
chr2 (1-241)||(34009010-34009248)
chr2 (1-235)||(1000406-1000647)
chr2 (1-194)||(44665771-44665964)
chr2 (1-241)||(34008867-34009101)
chr2 (7-235)||(34008725-34008951)
chr2 (1-246)||(31571916-31572169)
chr2 (1-212)||(20708570-20708776)
chr2 (8-242)||(208257-208502)
chr2 (70-243)||(31572075-31572248)
chr2 (1-228)||(208112-208350)
chr2 (1-212)||(27314194-27314417)
chr2 (1-244)||(999819-1000051)
chr2 (80-241)||(204117-204278)
chr2 (1-241)||(999956-1000203)
chr2 (73-241)||(44665477-44665645)
chr2 (120-245)||(27314418-27314543)
chr2 (118-241)||(20708777-20708900)
chr2 (124-242)||(27314169-27314287)
chr2 (118-235)||(999788-999905)
chr2 (131-241)||(20708552-20708662)
chr2 (143-241)||(34009247-34009345)
chr2 (1-98)||(44665553-44665650)
chr2 (1-93)||(27314447-27314539)
chr2 (1-93)||(20708808-20708900)
chr2 (143-241)||(204020-204118)
chr2 (140-242)||(208416-208518)
chr2 (1-93)||(204117-204209)
chr2 (1-93)||(203722-203814)
chr2 (1-93)||(34009253-34009345)
chr2 (16-93)||(23762198-23762275)
chr2 (2-97)||(1000562-1000657)
chr2 (1-83)||(999683-999765)
chr2 (164-241)||(23762198-23762275)
chr2 (144-231)||(999678-999765)
chr2 (5-93)||(10791876-10791965)
chr2 (170-241)||(44665645-44665716)
chr2 (134-243)||(10791857-10791967)
chr2 (131-195)||(208844-208908)
chr2 (8-47)||(208844-208883)
chr2 (147-241)||(34008717-34008811)
chr2 (131-180)||(10424244-10424293)
chr2 (31-95)||(7389753-7389817)
chr2 (186-241)||(7389755-7389810)
chr2 (62-96)||(19596974-19597008)
chr2 (147-202)||(31422619-31422675)
chr2 (7-54)||(31422619-31422667)
chr2 (147-202)||(31422854-31422910)
chr2 (147-202)||(31422948-31423004)
chr2 (147-202)||(31423084-31423140)
chr2 (7-54)||(31423084-31423132)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (1-242)||(30089634-30089875)
chr5 (1-241)||(30089486-30089726)
chr5 (1-242)||(30094777-30095018)
chr5 (1-228)||(30096049-30096276)
chr5 (8-242)||(16498241-16498475)
chr5 (1-241)||(16498390-16498630)
chr5 (1-242)||(30095151-30095392)
chr5 (1-234)||(30095525-30095758)
chr5 (14-241)||(30095914-30096141)
chr5 (14-241)||(30095390-30095617)
chr5 (14-228)||(30089873-30090087)
chr5 (1-242)||(30095673-30095916)
chr5 (14-240)||(30095016-30095242)
chr5 (7-241)||(25100163-25100405)
chr5 (7-241)||(25159253-25159495)
chr5 (30-241)||(30094658-30094869)
chr5 (1-202)||(33374596-33374797)
chr5 (1-243)||(2417173-2417427)
chr5 (1-242)||(2416854-2417107)
chr5 (1-242)||(2417014-2417266)
chr5 (70-241)||(30089407-30089578)
chr5 (1-204)||(2417333-2417544)
chr5 (1-241)||(33827179-33827439)
chr5 (80-242)||(30094498-30094660)
chr5 (80-241)||(33374407-33374568)
chr5 (1-168)||(33826955-33827131)
chr5 (83-244)||(37607968-37608129)
chr5 (70-242)||(30089023-30089195)
chr5 (124-242)||(2416829-2416947)
chr5 (124-242)||(33826930-33827048)
chr5 (124-228)||(39878434-39878538)
chr5 (124-243)||(33827154-33827273)
chr5 (140-242)||(16498537-16498639)
chr5 (1-94)||(33374406-33374499)
chr5 (1-93)||(30094567-30094659)
chr5 (7-93)||(17913224-17913310)
chr5 (70-148)||(30096611-30096689)
chr5 (1-93)||(16498242-16498334)
chr5 (1-93)||(25100313-25100405)
chr5 (1-93)||(25159403-25159495)
chr5 (7-93)||(25099896-25099982)
chr5 (7-93)||(25158986-25159072)
chr5 (7-92)||(17912959-17913044)
chr5 (147-244)||(17913221-17913318)
chr5 (140-241)||(33374705-33374806)
chr5 (1-80)||(30090008-30090087)
chr5 (154-244)||(25099895-25099985)
chr5 (154-244)||(25158985-25159075)
chr5 (147-240)||(17912959-17913052)
chr5 (147-235)||(25100155-25100243)
chr5 (147-235)||(25159245-25159333)
chr5 (1-93)||(37607971-37608063)
chr5 (18-93)||(16498660-16498735)
chr5 (2-93)||(30089103-30089194)
chr5 (162-241)||(30089873-30089952)
chr5 (1-80)||(39878434-39878513)
chr5 (170-243)||(16498658-16498731)
chr5 (7-93)||(20656236-20656323)
chr5 (162-241)||(30095016-30095095)
chr5 (147-241)||(20656228-20656323)
chr5 (131-202)||(7957100-7957172)
chr5 (186-243)||(39343443-39343500)
chr5 (31-93)||(39343445-39343507)
chr5 (7-54)||(10730433-10730481)
chr5 (7-54)||(17374409-17374457)
chr5 (7-54)||(33571553-33571601)
chr5 (7-54)||(34109083-34109131)
chr5 (7-54)||(34109338-34109386)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (1-233)||(36078029-36078261)
chr3 (1-240)||(36078177-36078416)
chr3 (1-241)||(36077433-36077672)
chr3 (1-241)||(36077881-36078121)
chr3 (1-242)||(7605466-7605707)
chr3 (1-240)||(36077580-36077819)
chr3 (1-211)||(39145811-39146021)
chr3 (1-244)||(39145559-39145797)
chr3 (1-241)||(36077728-36077973)
chr3 (7-240)||(7605940-7606173)
chr3 (8-242)||(16651949-16652195)
chr3 (1-242)||(16652109-16652362)
chr3 (1-241)||(37434440-37434688)
chr3 (11-243)||(37434981-37435225)
chr3 (1-232)||(16651799-16652042)
chr3 (1-242)||(7605614-7605867)
chr3 (70-242)||(37099266-37099438)
chr3 (1-241)||(37434187-37434435)
chr3 (1-241)||(37434827-37435075)
chr3 (21-243)||(37433954-37434188)
chr3 (21-243)||(37434594-37434828)
chr3 (1-241)||(7605774-7606027)
chr3 (55-245)||(36220389-36220575)
chr3 (70-240)||(37098885-37099055)
chr3 (1-147)||(36078325-36078476)
chr3 (1-168)||(7605272-7605451)
chr3 (124-242)||(16652269-16652387)
chr3 (143-243)||(37434341-37434441)
chr3 (124-242)||(7605247-7605365)
chr3 (140-242)||(7606235-7606337)
chr3 (1-93)||(37099267-37099359)
chr3 (148-241)||(39145705-39145798)
chr3 (1-93)||(7606244-7606336)
chr3 (141-241)||(36077425-36077525)
chr3 (147-241)||(39145929-39146023)
chr3 (1-93)||(37433956-37434048)
chr3 (1-92)||(7606083-7606173)
chr3 (7-93)||(36220393-36220479)
chr3 (140-241)||(7605457-7605558)
chr3 (8-92)||(37098885-37098969)
chr3 (186-241)||(18201647-18201702)
chr3 (142-242)||(51654889-51654990)
chr3 (7-93)||(51654890-51654977)
chr3 (31-93)||(18201647-18201709)
chr3 (147-204)||(10266848-10266906)
chr3 (7-56)||(10266856-10266906)
chr3 (147-202)||(26052634-26052690)
chr3 (147-202)||(36078513-36078569)
chr3 (7-54)||(36078521-36078569)
chr3 (186-242)||(51654826-51654882)
chr3 (33-93)||(51654827-51654887)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-242)||(38542875-38543116)
chr1 (1-242)||(38543183-38543424)
chr1 (1-241)||(28947868-28948108)
chr1 (9-241)||(38542587-38542819)
chr1 (1-241)||(38542431-38542671)
chr1 (1-241)||(38542727-38542967)
chr1 (1-244)||(18848539-18848781)
chr1 (70-241)||(28947789-28947960)
chr1 (1-243)||(38543331-38543584)
chr1 (1-241)||(38543023-38543275)
chr1 (54-180)||(18848360-18848486)
chr1 (124-241)||(15198120-15198237)
chr1 (141-241)||(38542423-38542523)
chr1 (7-93)||(39727463-39727549)
chr1 (140-241)||(18848530-18848631)
chr1 (147-243)||(39727461-39727557)
chr1 (1-93)||(15198145-15198237)
chr1 (8-93)||(39727205-39727286)
chr1 (124-213)||(25872833-25872923)
chr1 (124-213)||(25874100-25874190)
chr1 (156-242)||(39727204-39727286)
chr1 (5-93)||(34109470-34109559)
chr1 (155-242)||(34109472-34109560)
chr1 (7-66)||(25872832-25872892)
chr1 (7-66)||(25874099-25874159)
chr1 (186-242)||(4009288-4009344)
chr1 (186-242)||(37907496-37907552)
chr1 (31-93)||(4009289-4009351)
chr1 (31-93)||(37907489-37907551)
chr1 (7-54)||(1230632-1230680)
chr1 (7-54)||(7333058-7333106)
chr1 (7-54)||(19767710-19767758)
chr1 (7-54)||(29940208-29940256)
chr1 (7-54)||(34889639-34889687)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (7-243)||(24774263-24774499)
chr7 (1-241)||(31097044-31097284)
chr7 (1-241)||(31097192-31097431)
chr7 (1-240)||(24774527-24774766)
chr7 (1-242)||(27904130-27904371)
chr7 (1-241)||(31096748-31096988)
chr7 (1-241)||(31096896-31097136)
chr7 (9-241)||(24775296-24775529)
chr7 (7-235)||(16377184-16377412)
chr7 (1-235)||(40962860-40963094)
chr7 (7-235)||(21759544-21759776)
chr7 (1-243)||(24774850-24775100)
chr7 (1-228)||(32660588-32660823)
chr7 (2-243)||(24773976-24774229)
chr7 (7-243)||(39031842-39032090)
chr7 (1-241)||(24775128-24775380)
chr7 (70-241)||(31097339-31097510)
chr7 (63-241)||(40964156-40964339)
chr7 (80-243)||(24774781-24774944)
chr7 (1-154)||(40964095-40964248)
chr7 (89-241)||(32656461-32656612)
chr7 (140-243)||(32660729-32660832)
chr7 (124-242)||(24773950-24774068)
chr7 (1-93)||(24774135-24774227)
chr7 (1-95)||(16377326-16377420)
chr7 (140-241)||(24774518-24774619)
chr7 (7-92)||(40966456-40966541)
chr7 (1-93)||(24774405-24774497)
chr7 (1-93)||(24775437-24775529)
chr7 (1-93)||(40963099-40963191)
chr7 (7-93)||(21754149-21754235)
chr7 (7-93)||(21758743-21758829)
chr7 (7-93)||(21759010-21759096)
chr7 (7-93)||(21759277-21759363)
chr7 (143-241)||(40963002-40963100)
chr7 (143-241)||(40963099-40963197)
chr7 (147-244)||(21754141-21754238)
chr7 (140-241)||(24774248-24774349)
chr7 (140-241)||(27904121-27904222)
chr7 (153-241)||(16377182-16377270)
chr7 (147-234)||(39031834-39031921)
chr7 (9-91)||(32660833-32660915)
chr7 (147-244)||(21758735-21758832)
chr7 (155-244)||(21759010-21759099)
chr7 (1-90)||(21759690-21759779)
chr7 (141-242)||(24775120-24775221)
chr7 (1-94)||(32656460-32656553)
chr7 (147-240)||(40966456-40966549)
chr7 (154-244)||(21759276-21759366)
chr7 (1-95)||(31096746-31096840)
chr7 (147-236)||(21759536-21759625)
chr7 (1-93)||(39031998-39032088)
chr7 (7-79)||(21754674-21754746)
chr7 (152-235)||(32660837-32660920)
chr7 (17-93)||(39031240-39031317)
chr7 (7-92)||(39031462-39031548)
chr7 (8-94)||(40962853-40962939)
chr7 (147-227)||(21754666-21754746)
chr7 (147-240)||(39031454-39031548)
chr7 (186-241)||(39031262-39031317)
chr7 (7-57)||(21754416-21754466)
chr7 (153-205)||(21754414-21754466)
chr7 (54-93)||(40963196-40963235)
chr7 (147-202)||(30353598-30353654)
chr7 (7-54)||(21805817-21805865)
chr7 (7-54)||(30353598-30353646)
chr7 (147-202)||(33918092-33918148)
chr7 (147-202)||(39031326-39031382)
chr7 (7-54)||(39031334-39031382)
[»] chr6 (51 HSPs)
chr6 (276-646)||(18673948-18674325)
chr6 (1-241)||(2004389-2004627)
chr6 (1-241)||(918768-919008)
chr6 (1-235)||(8658354-8658586)
chr6 (21-242)||(8658691-8658911)
chr6 (10-238)||(33034569-33034802)
chr6 (1-235)||(33034725-33034964)
chr6 (9-243)||(33289342-33289584)
chr6 (1-243)||(24570829-24571061)
chr6 (7-241)||(8658200-8658446)
chr6 (1-241)||(918916-919167)
chr6 (1-197)||(918665-918860)
chr6 (70-244)||(33289255-33289429)
chr6 (1-200)||(920467-920678)
chr6 (113-241)||(2004535-2004663)
chr6 (124-242)||(920585-920703)
chr6 (131-241)||(24570811-24570921)
chr6 (140-242)||(919074-919176)
chr6 (140-241)||(8658591-8658692)
chr6 (1-93)||(8658600-8658692)
chr6 (1-91)||(8658500-8658590)
chr6 (140-235)||(33034878-33034973)
chr6 (12-93)||(8658829-8658910)
chr6 (1-93)||(33289490-33289582)
chr6 (140-242)||(8658185-8658287)
chr6 (130-207)||(8658038-8658115)
chr6 (1-87)||(33034572-33034658)
chr6 (5-93)||(22275553-22275642)
chr6 (5-93)||(22275445-22275534)
chr6 (19-91)||(8658112-8658184)
chr6 (1-59)||(8658057-8658115)
chr6 (142-243)||(22275551-22275653)
chr6 (5-89)||(22275126-22275211)
chr6 (5-93)||(22275230-22275318)
chr6 (7-90)||(22275786-22275870)
chr6 (155-243)||(22275443-22275532)
chr6 (147-235)||(22275789-22275878)
chr6 (5-83)||(6716706-6716785)
chr6 (134-231)||(6716706-6716804)
chr6 (142-235)||(22275128-22275222)
chr6 (142-243)||(22275335-22275437)
chr6 (8-61)||(918653-918706)
chr6 (170-235)||(8658115-8658180)
chr6 (186-243)||(22275228-22275284)
chr6 (5-93)||(22275337-22275426)
chr6 (5-93)||(22275661-22275750)
chr6 (189-243)||(22275659-22275713)
chr6 (186-241)||(2271958-2272013)
chr6 (31-93)||(2271958-2272020)
chr6 (7-54)||(2265702-2265750)
chr6 (7-54)||(19996074-19996122)
[»] scaffold0173 (2 HSPs)
scaffold0173 (7-241)||(23197-23431)
scaffold0173 (147-241)||(23345-23439)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (70-243)||(10559-10731)
scaffold0051 (1-93)||(10637-10729)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (131-241)||(12626-12736)
scaffold0097 (1-93)||(12644-12736)
[»] scaffold0521 (2 HSPs)
scaffold0521 (188-242)||(5321-5375)
scaffold0521 (40-93)||(5321-5374)
[»] scaffold0252 (2 HSPs)
scaffold0252 (5-92)||(23587-23675)
scaffold0252 (186-240)||(23587-23641)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (186-242)||(31525-31581)
scaffold0187 (31-93)||(31526-31588)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (68-96)||(38803-38831)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41384192 - 41383950
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384192 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 41384093  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41384092 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattaggg 41383993  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41383992 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataa 41383950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19744872 - 19744629
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19744872 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 19744773  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||    
T  19744772 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaaggttaaaatagtaaatttatgcaataagtttaggttaaaattatgg 19744673  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19744672 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataat 19744629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 19794934 - 19795177
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794934 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 19795033  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||    
T  19795034 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaaggttaaaatagtaaatttatgcaataagtttaggttaaaattatgg 19795133  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19795134 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataat 19795177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19744261 - 19744034
Alignment:
Q  14 atagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19744261 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgggaagg 19744162  T
Q  114 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19744161 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 19744062  T
Q  214 aagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
      |||||||||||||||||||| |||||    
T  19744061 ctgtgttaactttaatatataagaagat 19744034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19744126 - 19743886
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19744126 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 19744027  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  19744026 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggtt-aaccaagaaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagag 19743928  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19743927 ctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagata 19743886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 19795545 - 19795772
Alignment:
Q  14 atagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795545 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 19795644  T
Q  114 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795645 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttacgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 19795744  T
Q  214 aagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||    
T  19795745 ctgtgttagctttaatatataagaagat 19795772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19744498 - 19744259
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19744498 catcagggttaaaatagtgaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttagctttaatatataagaagatgtatcga 19744399  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19744398 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 19744299  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19744298 ttaaaatatgctt--gtgttaactttaacatataagaagata 19744259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 19795308 - 19795547
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19795308 catcagggttaaaatagtgaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttagctttaatatataagaagatgtatcga 19795407  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19795408 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 19795507  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19795508 ttaaaatatgctt--gtgttaactttaacatataagaagata 19795547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41384330 - 41384100
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattg 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  41384330 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataaga---tgtatcgagaaattg 41384234  T
Q  108 agaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41384233 agaaaggggaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaat 41384134  T
Q  208 atgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  41384133 atgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 41384100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19744629 - 19744406
Alignment:
Q  18 taaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19744629 taaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 19744530  T
Q  118 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19744529 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtgaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgt 19744430  T
Q  218 gttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  19744429 gttagctttaatatataagaagat 19744406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 19795177 - 19795400
Alignment:
Q  18 taaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795177 taaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 19795276  T
Q  118 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19795277 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtgaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgt 19795376  T
Q  218 gttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  19795377 gttagctttaatatataagaagat 19795400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 19795969 - 19796202
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattg 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795969 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaagatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattg 19796068  T
Q  108 agaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaat 207  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  19796069 ggaagggggaaaattcaataaggtt-aaccaagaaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagctaaaat 19796167  T
Q  208 atgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19796168 atgcttatgtgttaactttaatatataagaagata 19796202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41384044 - 41383794
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           
T  41384044 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataagaaga 41383945  T
Q  94 -gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  41383944 tgtatcgagaaattgagaaggaggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaa 41383845  T
Q  193 aattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41383844 aattagggctaaaatatgtttatgtgttaactttaatatataagaagataa 41383794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41383888 - 41383641
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||           
T  41383888 catcagggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttatgtgttaactttaatatataagaagataagaaga 41383789  T
Q  94 -gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  41383788 tgtatcgagaaattgagaaggggggaaattcaataaggttaaacaa-ggaatttaacatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaa 41383690  T
Q  193 aattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  41383689 aattagggctaaaatatacttctgtattaactttaatatataagaagat 41383641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19744951 - 19744780
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19744951 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggagaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 19744852  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  19744851 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 19744780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 19794855 - 19795026
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19794855 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggagaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 19794954  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  19794955 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 19795026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 19795680 - 19795847
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19795680 catcagggttaaaatagtaaatttacgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttagctttaatatataagaagatgtatcga 19795779  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaa 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19795780 gaaattgggaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaa 19795847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13138227 - 13138077
Alignment:
Q  18 taaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13138227 taaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 13138128  T
Q  118 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13138127 aaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcaggattaaaatagtaa 13138077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37591770 - 37591644
Alignment:
Q  54 taaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatca 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37591770 taaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgataaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatca 37591671  T
Q  154 gggttaaaatagtaattttatgcaata 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37591670 gggttaaaatattaaatttatgcaata 37591644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 23977040 - 23977203
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||     
T  23977040 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaatcaaagg--------atcagggttaaaatagtaaa 23977131  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23977132 tttatgtaataagtttatgttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 23977203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 242
Target Start/End: Original strand, 37591932 - 37592034
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  37591932 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 37592031  T
Q  240 ata 242  Q
    |||    
T  37592032 ata 37592034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13138331 - 13138227
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  13138331 ggaatttagcatcagcattaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 13138232  T
Q  240 ataat 244  Q
    |||||    
T  13138231 ataat 13138227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13138314 - 13138230
Alignment:
Q  9 ttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13138314 ttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 13138230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 37591941 - 37592033
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37591941 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 37592033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 37592055 - 37592147
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37592055 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctaggttaactttaatatataagaagat 37592147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41384346 - 41384251
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41384346 ggaatttagcatcagcgttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataa 41384251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 37592169 - 37592259
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaag 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37592169 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctaggttaactttaatatataagaag 37592259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19743979 - 19743882
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19743979 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatatatc 19743882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 19796109 - 19796206
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19796109 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatatatc 19796206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 41383733 - 41383640
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatg 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41383733 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatacttctgtattaactttaatatataagaagatg 41383640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 23977112 - 23977203
Alignment:
Q  2 atcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23977112 atcagggttaaaatagtaaatttatgtaataagtttatgttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 23977203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 242
Target Start/End: Original strand, 37592046 - 37592148
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||    
T  37592046 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctaggttaactttaatatataagaag 37592145  T
Q  240 ata 242  Q
    |||    
T  37592146 ata 37592148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 37592160 - 37592255
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  37592160 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctaggttaactttaatatataa 37592255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 37592290 - 37592375
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37592290 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggttaaaatatacttctgtgttaactttaatatataagaagat 37592375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 19795894 - 19795966
Alignment:
Q  14 atagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatata 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19795894 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatata 19795966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 44376738 - 44376826
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44376738 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaagttaaaattagggctaaaatatgtttttgtgttaaccttaatatataagaagatgt 44376826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 242
Target Start/End: Original strand, 37592276 - 37592376
Alignment:
Q  142 aatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  37592276 aatttaacatcagagttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggttaaaatatacttctgtgttaactttaatatataagaagat 37592375  T
Q  242 a 242  Q
    |    
T  37592376 a 37592376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 234
Target Start/End: Original strand, 19795894 - 19795966
Alignment:
Q  162 atagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatata 234  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19795894 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatata 19795966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 241
Target Start/End: Original strand, 44376737 - 44376824
Alignment:
Q  154 gggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  44376737 gggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaagttaaaattagggctaaaatatgtttttgtgttaaccttaatatataagaagat 44376824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13138223 - 13138152
Alignment:
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13138223 tttatgcaataggtttaggttaaaattagagttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 13138152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34336885 - 34336834
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaa 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34336885 aggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataaaa 34336834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 11659124 - 11659210
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaattta-tgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||| |||||| ||| || | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11659124 ggttaaaacagtaaaattaatgcattagggttaggttaaaattagggctaaaataagcttacatgttaactttaatatataagaaga 11659210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34337099 - 34337045
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34337099 aggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataataaga 34337045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 93
Target Start/End: Original strand, 19795846 - 19795895
Alignment:
Q  44 aaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19795846 aaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 19795895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 34337133 - 34337045
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||||| |||||||| | | | |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  34337133 aaggttaaaacagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataataaga 34337045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 11659111 - 11659210
Alignment:
Q  142 aatttagcatcagggttaaaatagtaatttta-tgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||  ||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11659111 aattaagcattagggttaaaacagtaaaattaatgcattagggttaggttaaaattagggctaaaataagcttacatgttaactttaatatataagaaga 11659210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 16036155 - 16036242
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaattta-tgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||| |||||| ||| || | |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16036155 ggttaaaacagtaaaattaatgcattaggattaagttaaaattagggctaaaataagcttacatgttaactttaatatataagaagat 16036242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 34336919 - 34336836
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa 87  Q
    |||||||||| |||||||| | | | |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  34336919 aaggttaaaacagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataa 34336836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 242
Target Start/End: Original strand, 19795846 - 19795896
Alignment:
Q  192 aaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19795846 aaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 19795896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 16036189 - 16036242
Alignment:
Q  188 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16036189 gttaaaattagggctaaaataagcttacatgttaactttaatatataagaagat 16036242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34336810 - 34336720
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatg 94  Q
    |||||||||| |||||||| | | | |||| |||| |||||||||| | ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34336810 aaggttaaaacagtaaattaaggcattagggtttaagttaaaattaggactaaaataaacttatgtgttaactttaatatataagaagatg 34336720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34336992 - 34336938
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34336992 aggttaaaattagagttaaaataagcttatgtgttaactttaatatataataaga 34336938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34336774 - 34336721
Alignment:
Q  188 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34336774 gttaaaattaggactaaaataaacttatgtgttaactttaatatataagaagat 34336721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 34337026 - 34336938
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||||| |||||||| | | | |||| |||||||||||||||  | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  34337026 aaggttaaaacagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattagagttaaaataagcttatgtgttaactttaatatataataaga 34336938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 30826175 - 30826223
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30826175 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 30826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54095532 - 54095476
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54095532 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaatagagtttaggttaaaattagggct 54095476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 54624306 - 54624258
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggct 54  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54624306 ggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattatggct 54624258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17695093 - 17694851
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17695093 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 17694994  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  17694993 gaaattgagaagggagaaaattcaataaggtaaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattaggg 17694894  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17694893 ctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagataa 17694851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 25876099 - 25876340
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25876099 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggataaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 25876198  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  25876199 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcttcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggcttaggttaaaattaggg 25876298  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25876299 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 25876340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 241
Target Start/End: Original strand, 25875958 - 25876191
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattg 107  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25875958 gttaaaatagtaaatatatgcaataggtttatgttaaaattagggctaaaatatgcttatatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattg 25876057  T
Q  108 agaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  25876058 agaagggggaaaattcaataaggttaaacaaacgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggataaaat 25876157  T
Q  208 atgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25876158 atgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 25876191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17695247 - 17695001
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga------tg 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||    
T  17695247 catcagggttaaaatagtaaatttatgtagtaagtttaggttaaaattagaggtaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagaagaagatg 17695148  T
Q  95 tatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  17695147 tatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaa 17695048  T
Q  195 ttagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17695047 ttagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 17695001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9061451 - 9061237
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9061451 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatgtatcgg 9061352  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  9061351 gaaattgagaagcgggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatttaataggtttaggttaaaattaggg 9061252  T
Q  201 ctaaaatatgcttaa 215  Q
    |||||||||||||||    
T  9061251 ctaaaatatgcttaa 9061237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Original strand, 18485769 - 18485992
Alignment:
Q  18 taaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485769 taaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggga 18485868  T
Q  118 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||  ||    
T  18485869 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagaatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattacgactaaaatatgcttctgt 18485968  T
Q  218 gttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  18485969 gttaactttaatatataagaagat 18485992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27018591 - 27018429
Alignment:
Q  51 ggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagca 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018591 ggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagca 27018492  T
Q  151 tcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27018491 tcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 27018429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Original strand, 405689 - 405862
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  405689 gttagctttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 405788  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  405789 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataa 405862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 18482418 - 18482624
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa--------gaaga 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||    
T  18482418 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttacgttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataagaaga 18482517  T
Q  93 tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  18482518 tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaa 18482617  T
Q  193 aattagg 199  Q
    |||||||    
T  18482618 aattagg 18482624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 235
Target Start/End: Original strand, 44832022 - 44832186
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44832022 gttaactttaatatataagaagatttatcgagaaattgagaagggg-aaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 44832120  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44832121 tttatgcaataagtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataa 44832186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 80 - 241
Target Start/End: Original strand, 410235 - 410396
Alignment:
Q  80 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  410235 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggaaaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagtatcagggttaaaatagtaaatttatgcaat 410334  T
Q  180 agattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  410335 aggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 410396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17695326 - 17695156
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17695326 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 17695227  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||| | ||  || ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  17695226 tttatgtagtaagtttaggttaaaattagaggtaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaaga 17695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 215
Target Start/End: Original strand, 24011348 - 24011483
Alignment:
Q  80 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  24011348 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatttaat 24011447  T
Q  180 agattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaa 215  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24011448 aggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttaa 24011483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9061238 - 9061116
Alignment:
Q  119 aattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  9061238 aattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcaatg 9061139  T
Q  219 ttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  9061138 ttaactttaatatataagaagat 9061116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9061476 - 9061359
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9061476 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaac 9061377  T
Q  224 tttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| |||||    
T  9061376 tttaatatataagaagat 9061359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 228
Target Start/End: Original strand, 24011482 - 24011591
Alignment:
Q  119 aattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24011482 aattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtg 24011581  T
Q  219 ttaactttaa 228  Q
    ||||||||||    
T  24011582 ttaactttaa 24011591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Original strand, 18482397 - 18482512
Alignment:
Q  128 aggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaacttta 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18482397 aggttaaacaaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttacgttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaacttta 18482496  T
Q  228 atatataaaaagataa 243  Q
    |||||||| |||||||    
T  18482497 atatataagaagataa 18482512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 244
Target Start/End: Original strand, 18485664 - 18485769
Alignment:
Q  139 aggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  18485664 aggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattacggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaa 18485763  T
Q  239 gataat 244  Q
    ||||||    
T  18485764 gataat 18485769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 405768 - 405860
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  405768 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 405860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9061208 - 9061116
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9061208 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcaatgttaactttaatatataagaagat 9061116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 18485674 - 18485766
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18485674 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattacggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 18485766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 410305 - 410396
Alignment:
Q  2 atcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  410305 atcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 410396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 18485901 - 18485992
Alignment:
Q  2 atcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18485901 atcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattacgactaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 18485992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 24014287 - 24014382
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  24014287 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatacgtttaggttaaaattagggctaaaatatacttttgtgttaactttaatatataa 24014382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 44832100 - 44832186
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa 87  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44832100 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataagtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataa 44832186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 25875942 - 25876043
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  25875942 ggaatttagcatcagcgttaaaatagtaaatatatgcaataggtttatgttaaaattagggctaaaatatgcttatatgttaactttaatatataagaag 25876041  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  25876042 at 25876043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 24011512 - 24011591
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaa 80  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24011512 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaa 24011591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 24014296 - 24014382
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa 87  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  24014296 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatacgtttaggttaaaattagggctaaaatatacttttgtgttaactttaatatataa 24014382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 27018493 - 27018428
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttc 66  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27018493 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttc 27018428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 24011417 - 24011481
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgctt 65  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24011417 catcagggttaaaatagtaaatttatttaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 24011481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 18291176 - 18291229
Alignment:
Q  188 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18291176 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagat 18291229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 18482311 - 18482397
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18482311 ggttaaaacagtaaaattatccaatagggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgagttaactttaatatataagaaga 18482397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23098091 - 23098003
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaataggttt-aggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||||| |||||||| | | | ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23098091 aaggttaaaacagtaaattaaggcattaggttttaggttaaaattagggataaaataagcttatatgttaactttaatatataagaaga 23098003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27016211 - 27016124
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaattta-tgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||| |||||| ||| || | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27016211 ggttaaaacagtaaaattaatgcattagggttaggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataagaagat 27016124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27016179 - 27016124
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27016179 aggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataagaagat 27016124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27016566 - 27016512
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27016566 aggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataataaga 27016512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Original strand, 18291170 - 18291229
Alignment:
Q  34 gtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18291170 gtttaagttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagat 18291229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 240
Target Start/End: Original strand, 18482303 - 18482397
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||    
T  18482303 agcattagggttaaaacagtaaaattatccaatagggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgagttaactttaatatataagaaga 18482397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27016335 - 27016249
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaattta-tgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||| |||||| ||| || | |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27016335 ggttaaaacagtaaaattaatgcattagggttaggttaaaattagggctacaataagcttatgtgttaactttaatatataagaaga 27016249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27016303 - 27016249
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27016303 aggttaaaattagggctacaataagcttatgtgttaactttaatatataagaaga 27016249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27016598 - 27016512
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaattta-tgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||| |||||| ||| || | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  27016598 ggttaaaacagtaaaattaatgcattagggttaggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatatataataaga 27016512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 27064938 - 27064999
Alignment:
Q  180 agattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27064938 agatttaggttaaaattagggttaaaataaacttatgtgttaactttaatatataagaagat 27064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23098057 - 23098003
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23098057 aggttaaaattagggataaaataagcttatatgttaactttaatatataagaaga 23098003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 93
Target Start/End: Original strand, 27064941 - 27064999
Alignment:
Q  35 tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27064941 tttaggttaaaattagggttaaaataaacttatgtgttaactttaatatataagaagat 27064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39996879 - 39996823
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39996879 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagagtttaggttaaaattagggct 39996823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27018591 - 27018549
Alignment:
Q  199 ggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  27018591 ggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 27018549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Original strand, 44833143 - 44833193
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44833143 aaggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 44833193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 80
Target Start/End: Original strand, 405861 - 405897
Alignment:
Q  44 aaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaa 80  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  405861 aaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaa 405897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 405861 - 405897
Alignment:
Q  192 aaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  405861 aaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaa 405897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15960038 - 15960010
Alignment:
Q  69 tgttaactttaatatataagaagatgtat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15960038 tgttaactttaatatataagaagatgtat 15960010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18568400 - 18568344
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18568400 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaataggatttaggttaaaattagggct 18568344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18841002 - 18840954
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18841002 ggttaaaacagtaaaattatgtaatagggtttatgttaaaattatggct 18840954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19240070 - 19240014
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19240070 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaataggatttaggttaaaattagggct 19240014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19313254 - 19313198
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19313254 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaataggatttaggttaaaattagggct 19313198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 32112106 - 32112154
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32112106 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 32112154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Original strand, 38630877 - 38630933
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  38630877 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 38630933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 38630885 - 38630933
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38630885 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 38630933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 39996871 - 39996823
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatag-gtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39996871 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagagtttaggttaaaattagggct 39996823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44836523 - 44836495
Alignment:
Q  68 atgttaactttaatatataagaagatgta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44836523 atgttaactttaatatataagaagatgta 44836495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 204112 - 203878
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  204112 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaattggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 204013  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  204012 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagagttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattaggg 203913  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  203912 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataa 203878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 1000117 - 1000351
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1000117 ggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 1000216  T
Q  107 gagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  1000217 gagaagggggaaaattcaataagggtaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaa 1000316  T
Q  207 tatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1000317 tatgtttctgtgttaactttaatatataagaagat 1000351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 203957 - 203721
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataaga--agatgtatcgagaaat 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  203957 gttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagataagatgtatcgagaaat 203858  T
Q  106 tgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  203857 tgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttaacatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataaatttaggttaaaattaggactaaa 203758  T
Q  206 atatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  203757 atatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 203721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 1000259 - 1000499
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1000259 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcaa 1000358  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1000359 gaaattgagaagggg-aaaattcaataaagttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaagttaaaattaggg 1000457  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1000458 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 1000499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 44665652 - 44665863
Alignment:
Q  29 aataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44665652 aataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgaaaaattgagaagggggaaa-ttcaataa 44665750  T
Q  129 ggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44665751 ggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaa 44665850  T
Q  229 tatataaaaagat 241  Q
    ||||||| |||||    
T  44665851 tatataagaagat 44665863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 34009010 - 34009248
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34009010 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtgtaggttaaaattaggg-taaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 34009108  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  34009109 gaaattgagaaaggggcaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttattcaataggtttaggttaaaattaggg 34009208  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  34009209 ctaaaatatgcttctgt-ttaactttaatatataagaagat 34009248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1000406 - 1000647
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga-------t 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |    
T  1000406 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaagttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatataagat 1000505  T
Q  94 gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1000506 gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagtatcatggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaa 1000605  T
Q  194 attagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1000606 attagggctaaaatatacttgagtgttaactttaatatataa 1000647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 44665771 - 44665964
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44665771 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 44665870  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaa 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44665871 aaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaa 44665964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 34008867 - 34009101
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  34008867 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaattggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttct--gttaactttaatatataaga---tgtatcga 34008961  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  34008962 gaaattgagaaggggaaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtgtaggttaaaattaggg 34009061  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  34009062 -taaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 34009101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 34008725 - 34008951
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 106  Q
    |||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34008725 ggttaaaacagtaaaattatgcaaaaggtttagattaaaattagggctaatttatgcttctgtattaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 34008824  T
Q  107 gagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  34008825 gagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaattggtttaggttaaaattagggctaaaa 34008924  T
Q  207 tatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||    
T  34008925 tatgctt--ctgttaactttaatatataa 34008951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31572169 - 31571916
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||           
T  31572169 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggtttaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagataagaaga 31572070  T
Q  94 -gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31572069 tgtatcgagaaattgagaaggggaaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttaggatcagaattaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaa 31571970  T
Q  193 aattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataatta 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  31571969 aattagggctaaaatatgtttaagtgttaactttaatatacaagaagattatta 31571916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 20708570 - 20708776
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20708570 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 20708669  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||  |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20708670 gaaattctg-----ggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 20708764  T
Q  201 ctaaaatatgct 212  Q
    ||||||||||||    
T  20708765 ctaaaatatgct 20708776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 208502 - 208257
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtat---------- 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||              
T  208502 gttaaaatagtaaatttatgcaataagtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatatatatgaagattt 208403  T
Q  98 --cgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaat 195  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  208402 atcgagaaattgagaagggg-aaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaat 208304  T
Q  196 tagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  208303 taggactaaaatatgtttatgtgttaactttaatatataagaagata 208257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31572248 - 31572075
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31572248 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggaaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 31572149  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31572148 tttatgcaataggtttaggtttaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagataa 31572075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 208350 - 208112
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||           
T  208350 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggactaaaatatgtttatgtgttaactttaatatataagaagatatataag 208251  T
Q  94 -----gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  208250 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaggattaaaatagtaa-tttatgcaatagatttagg 208152  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  208151 ttaaaattagggttaaaatatgcttttgtgttaactttaa 208112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 27314194 - 27314417
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||            |||||    
T  27314194 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataag 27314293  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  27314294 aagatgtatcgggaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaataaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 27314393  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27314394 ttaaaattagggctaaaatatgct 27314417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 999819 - 1000051
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  999819 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttagattaaaattatagctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataaga---tgtatcga 999915  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  999916 aaaattgaaaaggggaaaaattcaataaggt--------ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattaggg 1000007  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1000008 ctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagttaat 1000051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 204278 - 204117
Alignment:
Q  80 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  204278 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttcaaatagtaaatttatgcaat 204179  T
Q  180 agattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  204178 aggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 204117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 999956 - 1000203
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaag--------- 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||             
T  999956 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagttaatatat 1000055  T
Q  92 ------atgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattc 185  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1000056 aagaagatgtatcgagaaattgagaaggggaaaaattcaataaggt--------ggaatttagcatctgggttaaaatagtaaatttatgcaatagattt 1000147  T
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1000148 aggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 1000203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 241
Target Start/End: Original strand, 44665477 - 44665645
Alignment:
Q  73 aactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaatttt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  44665477 aactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaaggagaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaaggctaaaatagtaaattt 44665576  T
Q  173 atgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  44665577 atgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 44665645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Original strand, 27314418 - 27314543
Alignment:
Q  120 attcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27314418 attcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcaatgt 27314517  T
Q  220 taactttaatatataaaaagataatt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  27314518 taactttaatatataagaagataatt 27314543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 20708777 - 20708900
Alignment:
Q  118 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20708777 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgt 20708876  T
Q  218 gttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  20708877 gttaactttaatatataagaagat 20708900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Original strand, 27314169 - 27314287
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27314169 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaac 27314268  T
Q  224 tttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  27314269 tttaatatataagaagata 27314287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Original strand, 999788 - 999905
Alignment:
Q  118 aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  999788 aaattcaataaggttaaacaaagaaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttagattaaaattatagctaaaatatgcttttgt 999887  T
Q  218 gttaactttaatatataa 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  999888 gttaactttaatatataa 999905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 241
Target Start/End: Original strand, 20708552 - 20708662
Alignment:
Q  131 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20708552 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaata 20708651  T
Q  231 tataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||    
T  20708652 tataagaagat 20708662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 34009247 - 34009345
Alignment:
Q  143 atttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34009247 atttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtattaactttaatatataaaaagat 34009345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 44665553 - 44665650
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44665553 catcaaggctaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatttatc 44665650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 27314447 - 27314539
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27314447 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcaatgttaactttaatatataagaagat 27314539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 20708808 - 20708900
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20708808 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagat 20708900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 204118 - 204020
Alignment:
Q  143 atttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  204118 atttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaattggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 204020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 208518 - 208416
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  208518 ggaatttagcatcagcgttaaaatagtaaatttatgcaataagtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 208419  T
Q  240 ata 242  Q
    |||    
T  208418 ata 208416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 204209 - 204117
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  204209 catcagggttcaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 204117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 203814 - 203722
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  203814 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataaatttaggttaaaattaggactaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 203722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 34009253 - 34009345
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  34009253 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtattaactttaatatataaaaagat 34009345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Original strand, 23762198 - 23762275
Alignment:
Q  16 agtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23762198 agtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 23762275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Original strand, 1000562 - 1000657
Alignment:
Q  2 atcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtat 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1000562 atcatggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatacttgagtgttaactttaatatataagaaaatgtat 1000657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 999683 - 999765
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat 83  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  999683 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttatgttaactgtaatat 999765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Original strand, 23762198 - 23762275
Alignment:
Q  164 agtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23762198 agtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 23762275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 231
Target Start/End: Original strand, 999678 - 999765
Alignment:
Q  144 tttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  999678 tttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttatgttaactgtaatat 999765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 10791876 - 10791965
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  10791876 aaggttaaaatagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattagggctaaaataggattatgtgttaactttaatatataagaagat 10791965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 241
Target Start/End: Original strand, 44665645 - 44665716
Alignment:
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  44665645 tttatccaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 44665716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 243
Target Start/End: Original strand, 10791857 - 10791967
Alignment:
Q  134 aacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatata 232  Q
    |||||| ||| | ||||| | |||||||||||||| || | ||| |||  || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  10791857 aacaaatgaaataagcattaaggttaaaatagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattagggctaaaataggattatgtgttaactttaatata 10791956  T
Q  233 taaaaagataa 243  Q
    ||| |||||||    
T  10791957 taagaagataa 10791967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 208908 - 208844
Alignment:
Q  131 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaat 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  208908 ttaaacaaaggaatttaacatcagcgttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaat 208844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 208883 - 208844
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaat 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208883 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaat 208844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Original strand, 34008717 - 34008811
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||| || || || ||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  34008717 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaaaaggtttagattaaaattagggctaatttatgcttctgtattaactttaatatataagaagat 34008811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 180
Target Start/End: Original strand, 10424244 - 10424293
Alignment:
Q  131 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata 180  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10424244 ttaaacaaaggaattaagcattagggttaaaacagtaaatttatgcaata 10424293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7389817 - 7389753
Alignment:
Q  31 taggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgt 95  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  7389817 tagggttaggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagatgt 7389753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7389810 - 7389755
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  7389810 aggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagat 7389755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 96
Target Start/End: Original strand, 19596974 - 19597008
Alignment:
Q  62 gcttctatgttaactttaatatataagaagatgta 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19596974 gcttatatgttaactttaatatataagaagatgta 19597008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31422675 - 31422619
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  31422675 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 31422619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 31422667 - 31422619
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31422667 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 31422619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31422910 - 31422854
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31422910 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaatagagtttaggttaaaattagggct 31422854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31423004 - 31422948
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31423004 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaataggatttaggttaaaattagggct 31422948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31423140 - 31423084
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  31423140 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 31423084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 31423132 - 31423084
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31423132 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 31423084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 30089634 - 30089875
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30089634 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataacaagatgtatcga 30089733  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30089734 gaaattgagaaggaggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 30089833  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30089834 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 30089875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 30089486 - 30089726
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30089486 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 30089585  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30089586 gaaattgagaaggaggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 30089685  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  30089686 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataacaagat 30089726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 30094777 - 30095018
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30094777 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 30094876  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30094877 gaaattgagaagaaggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 30094976  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30094977 ctaaaatctgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 30095018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30096049 - 30096276
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30096049 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 30096148  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30096149 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 30096248  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaa 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  30096249 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaa 30096276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16498475 - 16498241
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattg 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16498475 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggataaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattg 16498376  T
Q  108 agaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  16498375 agaagggggaaaattcaataaggttaaacataggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggactaaaat 16498276  T
Q  208 atgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16498275 atgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 16498241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16498630 - 16498390
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16498630 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatatcga 16498531  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16498530 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagagttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 16498431  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  16498430 ataaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 16498390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 30095151 - 30095392
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30095151 catcagggttaaaatagtaaatttatgctataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagacgtatcga 30095250  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30095251 gaaattgagaaggaggaaaattcaataaggttaaaccaaggaatttagcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 30095350  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30095351 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 30095392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 30095525 - 30095758
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30095525 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaaaaggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataacaagatgtatcga 30095624  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30095625 gaaattgagaaggaggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 30095724  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatata 234  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30095725 ctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatata 30095758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 30095914 - 30096141
Alignment:
Q  14 atagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30095914 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtattgagaaattgagaagg 30096013  T
Q  114 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30096014 aggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 30096113  T
Q  214 aagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
      |||||||||||||||||||| |||||    
T  30096114 ctgtgttaactttaatatataagaagat 30096141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Original strand, 30095390 - 30095617
Alignment:
Q  14 atagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30095390 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 30095489  T
Q  114 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30095490 aggaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaaaaggtttaggttaaaattagggttaaaatatgctt 30095589  T
Q  214 aagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
      |||||||||||||||||||| |||||    
T  30095590 ctgtgttaactttaatatataacaagat 30095617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 30089873 - 30090087
Alignment:
Q  14 atagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30089873 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 30089972  T
Q  114 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30089973 aggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaaggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 30090072  T
Q  214 aagtgttaactttaa 228  Q
      |||||||||||||    
T  30090073 ctgtgttaactttaa 30090087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 30095673 - 30095916
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat--ataagaagatgtatc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  30095673 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatatataagaagacgtatc 30095772  T
Q  99 gagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattag 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||    
T  30095773 gagaaattgagaaggaggaaaattcaataaggttaaaccaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggtttaaattag 30095872  T
Q  199 ggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30095873 ggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 30095916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 30095016 - 30095242
Alignment:
Q  14 atagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagg 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  30095016 atagtaaatttatgcaataggtttaagttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtttcgagaaattgagaaga 30095115  T
Q  114 gggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30095116 aggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgctataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 30095215  T
Q  214 aagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
      |||||||||||||||||||| ||||    
T  30095216 ctgtgttaactttaatatataagaaga 30095242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 25100163 - 25100405
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa--------gaagatgtatc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  25100163 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaaaataagaagatgtatc 25100262  T
Q  99 gagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  25100263 gagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattag 25100362  T
Q  199 ggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25100363 ggctaaaatatggttctgtgttaactttaatatataagaagat 25100405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 25159253 - 25159495
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa--------gaagatgtatc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||        |||||||||||    
T  25159253 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaaaataagaagatgtatc 25159352  T
Q  99 gagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  25159353 gagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattag 25159452  T
Q  199 ggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25159453 ggctaaaatatggttctgtgttaactttaatatataagaagat 25159495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Original strand, 30094658 - 30094869
Alignment:
Q  30 ataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataag 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30094658 ataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttattatataagaagatgtatcgagaaattgagaaagggaaaaattcaataag 30094757  T
Q  130 gttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30094758 gttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaat 30094857  T
Q  230 atataaaaagat 241  Q
    |||||| |||||    
T  30094858 atataagaagat 30094869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33374797 - 33374596
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374797 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataagtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 33374698  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33374697 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 33374598  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  33374597 ct 33374596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 2417173 - 2417427
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||            |||||    
T  2417173 catcagggttaaaatagtaaaattatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataag 2417272  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  2417273 aagatgtatcgggaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 2417372  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2417373 ttaaaattagggttaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagataa 2417427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 2416854 - 2417107
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||            |||||    
T  2416854 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttcagtgttaactttaatatataagaagatatataag 2416953  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  2416954 aagatgtatcggaaaattgagaagggggaaaattcaataagcttaaacaaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 2417053  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2417054 ttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttcatatataagaagata 2417107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 2417014 - 2417266
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||           
T  2417014 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttcatatataagaagatatataag 2417113  T
Q  94 -----gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
         |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  2417114 aagatgtattgggaaattgagaagggggaaa-ttcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaaattatgcaataggtttagg 2417212  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2417213 ttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagata 2417266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 30089407 - 30089578
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  30089407 gttaactttaatatataagaagatctatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaa 30089506  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30089507 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagat 30089578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 2417333 - 2417544
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa--------gaaga 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||        |||||    
T  2417333 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagataagaaga 2417432  T
Q  93 tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  2417433 tgtatcgggaaattgagaaggggaaaaattcaataaggttaaacaaaagaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataaatttaggttaa 2417532  T
Q  193 aattagggctaa 204  Q
    ||||||||||||    
T  2417533 aattagggctaa 2417544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 33827179 - 33827439
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat----------------- 83  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||                     
T  33827179 catcagggttcaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagataagaaga 33827278  T
Q  84 ---ataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata 180  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33827279 tatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaagaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaata 33827378  T
Q  181 gattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    | || |  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33827379 ggtttatattaaaattagggctaaaatatgtttttgtgttaactttaatatataagaagat 33827439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Original strand, 30094498 - 30094660
Alignment:
Q  80 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaat 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30094498 atatataacaagatgtatcgagaaattgagaaggaggaaaatttaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaat 30094597  T
Q  180 agattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30094598 aggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 30094660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 80 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33374568 - 33374407
Alignment:
Q  80 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33374568 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggggaaattcaataaggttaaacaaatgaatttaacatcagggttaaaatagtaaatttatgcaat 33374469  T
Q  180 agattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33374468 aggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 33374407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 33826955 - 33827131
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga-------- 92  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            
T  33826955 catcagggttcaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatatataag 33827054  T
Q  93 -tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaa 168  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33827055 atgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaa 33827131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37608129 - 37607968
Alignment:
Q  83 tataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37608129 tataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggaaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatata 37608030  T
Q  183 ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37608029 tttaggtttaaattagggctaaaatatgcgtctgtgttaactttaatatataagaagataat 37607968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 242
Target Start/End: Original strand, 30089023 - 30089195
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  30089023 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaagttgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagaatcagggttaaaatagtaaa 30089122  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  30089123 tttatacaataagtttaagttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttagccttaatatataagaagata 30089195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Original strand, 2416829 - 2416947
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2416829 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttcagtgttaac 2416928  T
Q  224 tttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  2416929 tttaatatataagaagata 2416947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Original strand, 33826930 - 33827048
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33826930 aataaggataaacaaaggaattcagcatcagggttcaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaac 33827029  T
Q  224 tttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  33827030 tttaatatataagaagata 33827048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39878538 - 39878434
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39878538 aataaggttaaacaaaggaattcagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtattaac 39878439  T
Q  224 tttaa 228  Q
    |||||    
T  39878438 tttaa 39878434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 243
Target Start/End: Original strand, 33827154 - 33827273
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  33827154 aataaggttaaacaaaggaattcagcatcagggttcaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaac 33827253  T
Q  224 tttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  33827254 tttaatatataagaagataa 33827273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16498639 - 16498537
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16498639 ggaatttaacatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaag 16498540  T
Q  240 ata 242  Q
    |||    
T  16498539 ata 16498537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 33374499 - 33374406
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatg 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33374499 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatg 33374406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 30094567 - 30094659
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30094567 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 30094659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17913310 - 17913224
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17913310 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 17913224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 148
Target Start/End: Original strand, 30096611 - 30096689
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttag 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30096611 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaaggggaaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttag 30096689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16498334 - 16498242
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16498334 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggactaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 16498242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 25100313 - 25100405
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25100313 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatggttctgtgttaactttaatatataagaagat 25100405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 25159403 - 25159495
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25159403 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatggttctgtgttaactttaatatataagaagat 25159495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 25099896 - 25099982
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25099896 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 25099982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 25158986 - 25159072
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25158986 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 25159072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17913044 - 17912959
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17913044 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataataaga 17912959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17913318 - 17913221
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17913318 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataat 17913221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33374806 - 33374705
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  33374806 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataagtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 33374707  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  33374706 at 33374705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 30090008 - 30090087
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30090008 catcaaggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaa 30090087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 25099895 - 25099985
Alignment:
Q  154 gggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25099895 gggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagataat 25099985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 25158985 - 25159075
Alignment:
Q  154 gggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25158985 gggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagataat 25159075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17913052 - 17912959
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  17913052 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataataaga 17912959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Original strand, 25100155 - 25100243
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25100155 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataa 25100243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Original strand, 25159245 - 25159333
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25159245 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataa 25159333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 37608063 - 37607971
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37608063 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatatttaggtttaaattagggctaaaatatgcgtctgtgttaactttaatatataagaagat 37607971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16498735 - 16498660
Alignment:
Q  18 taaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16498735 taaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagat 16498660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 30089103 - 30089194
Alignment:
Q  2 atcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  30089103 atcagggttaaaatagtaaatttatacaataagtttaagttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttagccttaatatataagaagat 30089194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 241
Target Start/End: Original strand, 30089873 - 30089952
Alignment:
Q  162 atagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  30089873 atagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 30089952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 39878513 - 39878434
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaa 80  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  39878513 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtattaactttaa 39878434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16498731 - 16498658
Alignment:
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16498731 tttatgcaataggtttaggttaaaattagagctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagataa 16498658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 20656236 - 20656323
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20656236 ggtttaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagagctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 20656323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 241
Target Start/End: Original strand, 30095016 - 30095095
Alignment:
Q  162 atagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  30095016 atagtaaatttatgcaataggtttaagttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 30095095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Original strand, 20656228 - 20656323
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20656228 agcattagggtttaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagagctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 20656323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7957172 - 7957100
Alignment:
Q  131 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  7957172 ttaaacaaaggaattaagcattagggttaaaacagtaaatttatgcaatatagtttaggttaaaattagggct 7957100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39343500 - 39343443
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  39343500 aggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagataa 39343443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39343507 - 39343445
Alignment:
Q  31 taggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  39343507 tagggttaggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagat 39343445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 10730433 - 10730481
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggct 54  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10730433 ggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattatggct 10730481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 17374409 - 17374457
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17374409 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 17374457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 33571553 - 33571601
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33571553 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 33571601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 34109131 - 34109083
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34109131 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 34109083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 34109386 - 34109338
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34109386 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 34109338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 36078029 - 36078261
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36078029 catcagggttgaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 36078128  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36078129 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 36078228  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatat 233  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36078229 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatat 36078261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 36078177 - 36078416
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36078177 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatatcagaagatgtatcga 36078276  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36078277 gaaattgagaaggggagaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaattgtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 36078376  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36078377 ctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaaga 36078416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36077433 - 36077672
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077433 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattcgagctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 36077532  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36077533 gaaattgagaagggggaaa-ttcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 36077631  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  36077632 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 36077672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36077881 - 36078121
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077881 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 36077980  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36077981 gaaattgagaaggggagaaattcaataagattaaacaaaggaatttagcatcagggttgaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 36078080  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  36078081 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 36078121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 7605466 - 7605707
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7605466 catcagggttcaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaaccgtaatatataagaagatgtatcga 7605565  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7605566 gaaattgagaagagagaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 7605665  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7605666 ctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagata 7605707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 36077580 - 36077819
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077580 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 36077679  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36077680 gaaattgagaagaggaaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaagttaaaattaggg 36077779  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    | ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  36077780 cgaaaatatgctactgtgttaactttaatatataagaaga 36077819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39146021 - 39145811
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39146021 catcagggtttaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgcatcga 39145922  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39145921 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 39145822  T
Q  201 ctaaaatatgc 211  Q
    |||||||||||    
T  39145821 ctaaaatatgc 39145811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39145797 - 39145559
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39145797 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 39145698  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39145697 gaaattgagaagggggaaaattcaata-----aaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 39145603  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39145602 ataaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataat 39145559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36077728 - 36077973
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaa-----gatgt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||     |||||    
T  36077728 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaagttaaaattagggcgaaaatatgctactgtgttaactttaatatataagaagagaagatgt 36077827  T
Q  96 atcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaat 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  36077828 atcgagaaattgagaaaggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaat 36077927  T
Q  196 tagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  36077928 tagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 36077973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Original strand, 7605940 - 7606173
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaat 105  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7605940 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttagtttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactgtaatatataagaagatgtatagagaaat 7606039  T
Q  106 tgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaa 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  7606040 tgagaaaggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg-taaa 7606138  T
Q  206 atatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7606139 atatgcttatgtgttaactttaatatataagaaga 7606173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16652195 - 16651949
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------------gt 95  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||            ||    
T  16652195 gttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataagaagatgt 16652096  T
Q  96 atcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaat 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||    
T  16652095 atcgggaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaaaaggtttaggttaaaat 16651996  T
Q  196 tagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16651995 tagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagata 16651949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16652362 - 16652109
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||           
T  16652362 catcagggttcaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataag 16652263  T
Q  94 -----gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |||    
T  16652262 aagatgtatcgggaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagagttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttagg 16652163  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16652162 ttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagata 16652109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37434688 - 37434440
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||           
T  37434688 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctccagtgttaactttaatatataagaagataagaaga 37434589  T
Q  94 -gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
     |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||    
T  37434588 tgtattggaaaattgagaaggggggaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcagcagggttaaaatggtaaatttatgcaatatgtttaggttaa 37434489  T
Q  193 aattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37434488 aattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 37434440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37435225 - 37434981
Alignment:
Q  11 aaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtat------------c 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||            |    
T  37435225 aaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataagaagatgcatc 37435126  T
Q  99 gagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattag 198  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  37435125 gggaaattgagaagtggggaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattag 37435026  T
Q  199 ggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  37435025 ggctaaaatatgcttcagggttaactttaatatataagaagataa 37434981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16652042 - 16651799
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||           
T  16652042 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaaaaggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataag 16651943  T
Q  94 -----gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
         |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  16651942 aagatgtatcgggaaattaagaagggggaaaattcaataaggttcaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaagttatgcaataggtttagg 16651843  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16651842 ttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatata 16651799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 7605614 - 7605867
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||            |||||    
T  7605614 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagatatataag 7605713  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  7605714 aagatgtatcgagaaattgagtaggaggaaaattcaataaggttaaaccaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 7605813  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  7605814 ttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactatcatatataagaagata 7605867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37099438 - 37099266
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37099438 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggtttaaatagtaaa 37099339  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37099338 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagata 37099266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37434435 - 37434187
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||           
T  37434435 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctccagtgttaactttaatatataagaagataagaaga 37434336  T
Q  94 -gtat-cgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggtta 191  Q
     |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||    
T  37434335 tgtattcga-aaattgagaaggggggaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcagcagggttaaaatggtaaatttatgcaatatgtttaggtta 37434237  T
Q  192 aaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37434236 aaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 37434187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37435075 - 37434827
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||           
T  37435075 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagggttaactttaatatataagaagataagaaga 37434976  T
Q  94 -gtat-cgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggtta 191  Q
     |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  37434975 tgtattcga-aaattgagaaggggggaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcagcagggttaaaatggtaaatttatgcaataggtttaggtta 37434877  T
Q  192 aaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37434876 aaattagggctaaaatatgcatcagtgttaactttaatatataagaagat 37434827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37434188 - 37433954
Alignment:
Q  21 atttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------------gtatcgagaaattga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||            |||||| ||||||||    
T  37434188 atttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataagaagatgtatcgggaaattga 37434089  T
Q  109 gaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaata 208  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37434088 gaaggggggaaatttaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaata 37433989  T
Q  209 tgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37433988 tgctcaagtgttaactttaatatataagaagataa 37433954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37434828 - 37434594
Alignment:
Q  21 atttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------------gtatcgagaaattga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||    
T  37434828 atttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttcagtgttaactttaatatataagaagatatataagaagatgtatcgagaaattga 37434729  T
Q  109 gaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaata 208  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37434728 gaaggggggaaatttaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaata 37434629  T
Q  209 tgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37434628 tgctccagtgttaactttaatatataagaagataa 37434594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 7605774 - 7606027
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||            |||||    
T  7605774 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactatcatatataagaagatatataag 7605873  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcag 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| | || ||    
T  7605874 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttaacaccagggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttag 7605973  T
Q  188 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  7605974 tttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactgtaatatataagaagat 7606027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36220575 - 36220389
Alignment:
Q  55 aaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcag 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  36220575 aaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaa-ttcaataaggttaaacaaagaaatttagca---g 36220480  T
Q  155 ggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataatt 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36220479 ggttaaaatagtaaatttatgcaatagttttaggttaaaattaggactaaaatatgcttctgtgttaactttaatatgtaagaagataatt 36220389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37099055 - 37098885
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     
T  37099055 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaagaaatttagcatcagagttaaaatagtaaa 37098956  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||||| ||||    
T  37098955 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatacttatgtcttgactttaatatataagaaga 37098885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 36078325 - 36078476
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga-----tgt 95  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     |||    
T  36078325 catcagggttaaaattgtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagagaaaatgt 36078424  T
Q  96 atcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaattta 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36078425 atcgagaaattgagaagagggaaaattcaataaggttaaacaaaggaattta 36078476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 7605272 - 7605451
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||            |||||    
T  7605272 catcagggttcaaatagtaaatttatgcaatgggtttaggttaaaattaagactaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatatataag 7605371  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7605372 aagatgtatcgagaaattgagaaggggggaaatttaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaa 7605451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16652387 - 16652269
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16652387 aataaggttaaacaaaggaattcagcatcagggttcaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaac 16652288  T
Q  224 tttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  16652287 tttaatatataagaagata 16652269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37434441 - 37434341
Alignment:
Q  143 atttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37434441 atttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctccagtgttaactttaatatataagaagata 37434342  T
Q  243 a 243  Q
    |    
T  37434341 a 37434341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Original strand, 7605247 - 7605365
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  7605247 aataaggttaaacgaaggaattcagcatcagggttcaaatagtaaatttatgcaatgggtttaggttaaaattaagactaaaatatgcttatgtgttaac 7605346  T
Q  224 tttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  7605347 tttaatatataagaagata 7605365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 242
Target Start/End: Original strand, 7606235 - 7606337
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  7606235 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggtttaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaag 7606334  T
Q  240 ata 242  Q
    |||    
T  7606335 ata 7606337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 37099359 - 37099267
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37099359 catcagggtttaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 37099267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39145798 - 39145705
Alignment:
Q  148 gcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  39145798 gcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagat 39145705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 7606244 - 7606336
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7606244 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggtttaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 7606336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 36077425 - 36077525
Alignment:
Q  141 gaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  36077425 gaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattcgagctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaaga 36077524  T
Q  241 t 241  Q
    |    
T  36077525 t 36077525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39146023 - 39145929
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  39146023 agcatcagggtttaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 39145929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 37434048 - 37433956
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  37434048 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctcaagtgttaactttaatatataagaagat 37433956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 7606083 - 7606173
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7606083 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaatta-gggtaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaaga 7606173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 36220479 - 36220393
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36220479 ggttaaaatagtaaatttatgcaatagttttaggttaaaattaggactaaaatatgcttctgtgttaactttaatatgtaagaagat 36220393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 7605457 - 7605558
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||    
T  7605457 ggaattcagcatcagggttcaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaaccgtaatatataagaag 7605556  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  7605557 at 7605558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 37098969 - 37098885
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | | || |||||||||||||||||||    
T  37098969 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatacttatgtcttgactttaatatataagaaga 37098885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18201702 - 18201647
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18201702 aggttaaaattagggcaacaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagat 18201647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51654990 - 51654889
Alignment:
Q  142 aatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||    
T  51654990 aattaagcattagggttaaaacagtaaatttaatcaatagggtttaggttaaaattagggcaaaaataagctttcgggttaactttaatatataagaaga 51654891  T
Q  241 ta 242  Q
    ||    
T  51654890 ta 51654889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 51654977 - 51654890
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  51654977 ggttaaaacagtaaatttaatcaatagggtttaggttaaaattagggcaaaaataagctttcgggttaactttaatatataagaagat 51654890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18201709 - 18201647
Alignment:
Q  31 taggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18201709 tagggttaggttaaaattagggcaacaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagat 18201647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 10266848 - 10266906
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggctaa 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  10266848 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggctaa 10266906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Original strand, 10266856 - 10266906
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggctaa 56  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10266856 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggctaa 10266906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Original strand, 26052634 - 26052690
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  26052634 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaataggatttaggttaaaatttgggct 26052690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Original strand, 36078513 - 36078569
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  36078513 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 36078569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 36078521 - 36078569
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36078521 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 36078569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 51654882 - 51654826
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  51654882 aggttaaaattagggcaaaaataagttttcgggttaactttaatatataagaagata 51654826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 51654887 - 51654827
Alignment:
Q  33 ggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  51654887 ggtttaggttaaaattagggcaaaaataagttttcgggttaactttaatatataagaagat 51654827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 38542875 - 38543116
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38542875 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatgtatcgg 38542974  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38542975 gaaattgagaaggggaaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 38543074  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38543075 ctaaaatatgtttgagtgttaactttaatatataagaagata 38543116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 38543183 - 38543424
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38543183 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggggtaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatgtatcaa 38543282  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38543283 gaaattgagcagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 38543382  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38543383 ctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagata 38543424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 28947868 - 28948108
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28947868 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatgtatcaa 28947967  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  || |||||||||||    
T  28947968 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgttttggctaaaattaggg 28948067  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28948068 ctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 28948108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 38542587 - 38542819
Alignment:
Q  9 ttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattga 108  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38542587 ttaacatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattga 38542686  T
Q  109 gaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaata 208  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  38542687 gaagggagaaaattcaataagcttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaataataaatttatgcaatagatttaggttaaaattacggttaaaata 38542786  T
Q  209 tgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38542787 tgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 38542819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38542431 - 38542671
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38542431 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggggtaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatgtatcaa 38542530  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38542531 gaaattgagaagggagaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaggattaacatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 38542630  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  38542631 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 38542671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38542727 - 38542967
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38542727 catcagggttaaaataataaatttatgcaatagatttaggttaaaattacggttaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatgtatcgg 38542826  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38542827 aaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaacggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 38542926  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38542927 ctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 38542967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18848539 - 18848781
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18848539 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 18848638  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18848639 gaaattgagaatggaggaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 18848738  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
     |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18848739 ttaaaatatacttctg-gttaactttaatatataaaaagataat 18848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Original strand, 28947789 - 28947960
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28947789 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 28947888  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28947889 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagat 28947960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 38543331 - 38543584
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||           
T  38543331 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataag 38543430  T
Q  94 -----gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
         |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  38543431 aagatgtatcgggaaattgagaagggaaaaaat-caataaggttaaacaaaggaatttaacatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 38543529  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38543530 ttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagataa 38543584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38543023 - 38543275
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||            |||||    
T  38543023 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttgagtgttaactttaatatataagaagatatataag 38543122  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  38543123 aagatgtatcgggaaattgagaagggaaaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 38543222  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38543223 ttaaaattaggggtaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagat 38543275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18848486 - 18848360
Alignment:
Q  54 taaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatca 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18848486 taaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgataaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaagaatttagcatca 18848387  T
Q  154 gggttaaaatagtaattttatgcaata 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18848386 gggttaaaatattaaatttatgcaata 18848360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 15198120 - 15198237
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  15198120 aataaggttaaacaaaggaattcagcatcagggttcaaatagtaaatttatacaataggtttaggttaaaattagggctaaaatctgcttctgtgttaac 15198219  T
Q  224 tttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15198220 tttaatatataagaagat 15198237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 38542423 - 38542523
Alignment:
Q  141 gaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38542423 gaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggggtaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaaga 38542522  T
Q  241 t 241  Q
    |    
T  38542523 t 38542523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39727549 - 39727463
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39727549 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 39727463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 18848530 - 18848631
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  18848530 ggaatttaacatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 18848629  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  18848630 at 18848631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39727557 - 39727461
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39727557 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagataa 39727461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 15198145 - 15198237
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15198145 catcagggttcaaatagtaaatttatacaataggtttaggttaaaattagggctaaaatctgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 15198237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39727286 - 39727205
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||    
T  39727286 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgct----tgttaactttaatatataaaaagat 39727205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25872923 - 25872833
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25872923 aatagggttaaacaaaggaattaagcattagggttaatacagtaaatttatgcaataggatttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 25872833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25874190 - 25874100
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggctaaaatatgctt 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25874190 aatagggttaaacaaaggaattaagcattagggttaatacagtaaatttatgcaataggatttaggttaaaattagggctaaaatatgctt 25874100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39727286 - 39727204
Alignment:
Q  156 gttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  39727286 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgct----tgttaactttaatatataaaaagata 39727204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 34109470 - 34109559
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  34109470 aaggttaaaacagtaaattaatgcaataggatttaggttaaaattagagctaaaatatgctttcgggttaactttaatatataagaagat 34109559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 242
Target Start/End: Original strand, 34109472 - 34109560
Alignment:
Q  155 ggttaaaatagtaattttatgcaatag-attcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  34109472 ggttaaaacagtaaattaatgcaataggatttaggttaaaattagagctaaaatatgctttcgggttaactttaatatataagaagata 34109560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25872892 - 25872832
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttc 66  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25872892 ggttaatacagtaaatttatgcaataggatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttc 25872832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25874159 - 25874099
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttc 66  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25874159 ggttaatacagtaaatttatgcaataggatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttc 25874099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4009344 - 4009288
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4009344 aggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagata 4009288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 37907496 - 37907552
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37907496 aggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagata 37907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4009351 - 4009289
Alignment:
Q  31 taggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4009351 tagggttaggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagat 4009289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Original strand, 37907489 - 37907551
Alignment:
Q  31 taggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37907489 tagggttaggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagat 37907551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 1230680 - 1230632
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggct 54  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1230680 ggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattatggct 1230632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 7333106 - 7333058
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7333106 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 7333058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19767758 - 19767710
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggct 54  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19767758 ggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattatggct 19767710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29940256 - 29940208
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29940256 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 29940208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 34889639 - 34889687
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34889639 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 34889687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 24774263 - 24774499
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24774263 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgctaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 24774362  T
Q  107 gagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaa 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24774363 gagaagggggaaaattccataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatacaataggtttaggttaaaattagggctaaaa 24774462  T
Q  207 tatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24774463 tatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataa 24774499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31097284 - 31097044
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31097284 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctacgttaactttaatatataagaagatgtatcgt 31097185  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  31097184 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaataatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgccataggtttaggttaaaattaggg 31097085  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31097084 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagat 31097044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31097431 - 31097192
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097431 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 31097332  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31097331 gaaattgagaaggggg-aaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattaggg 31097233  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||    
T  31097232 ctaaaatatgcttctacgttaactttaatatataagaagat 31097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24774527 - 24774766
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24774527 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 24774626  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  24774627 gaaattgagtagggggaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataagtttaggttaaaattaggg 24774726  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24774727 ctaaaatatgtttatgtgttaactttaatatataataaga 24774766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 27904130 - 27904371
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27904130 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattaaggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtattaa 27904229  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27904230 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattaggg 27904329  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27904330 ctaaaatatgcttatgtgttaactttaaaatataagaagata 27904371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31096988 - 31096748
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31096988 catcagggttaaaatagtaaatttatgccataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtctcga 31096889  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  31096888 gaaattgagaaggggcaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgccataggtttaggttaaaattaggg 31096789  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31096788 ttaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagat 31096748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31097136 - 31096896
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097136 catcagggttaaaatagtaaatttatgccataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 31097037  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  31097036 aaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgccataggtttaggttaaaattaggg 31096937  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  31096936 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 31096896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 24775296 - 24775529
Alignment:
Q  9 ttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattga 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24775296 ttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgataaattga 24775395  T
Q  109 gaagggggaaaattcaataagg-ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaat 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24775396 gaagggagaaaattcaataaggtttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaat 24775495  T
Q  208 atgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  24775496 atgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 24775529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 16377184 - 16377412
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377184 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 16377283  T
Q  107 gagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaa 206  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16377284 gagattgcggaaaattcaataaggttaaacaaaagaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaa 16377383  T
Q  207 tatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16377384 tatgcttctgtgttaactttaatatataa 16377412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40963094 - 40962860
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40963094 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 40962995  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||    
T  40962994 gatattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaacgaatttagcatcagagttaaaatagtaaatttatgcaataaatttatgttaaaattaagg 40962895  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40962894 ttaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataa 40962860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 21759544 - 21759776
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa----gaagatgtatcgaga 102  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  21759544 ggtttaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataaataagaagatgtatcgaga 21759643  T
Q  103 aattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21759644 aattgagaagggggaaaattcaataagattaaacaaaggattttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggct 21759743  T
Q  203 aaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21759744 aaaatatgctttggtgttaactttaatatataa 21759776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24774850 - 24775100
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa--------gaaga 92  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||    
T  24774850 catcagggttaaaatattaaatttatgcaataggtttaggtttaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataagaaga 24774949  T
Q  93 tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  24774950 tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatggttttaggttaa 24775049  T
Q  193 aattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24775050 aattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataa 24775100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32660823 - 32660588
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           
T  32660823 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataagaaga 32660724  T
Q  94 -gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||    
T  32660723 tgtatcgagaaattgagaagtgggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagcaaatttatgcaataggtttaggttaa 32660624  T
Q  193 aattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32660623 aattagggttaaaatatgcttatgtgttaactttaa 32660588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 24773976 - 24774229
Alignment:
Q  2 atcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataaga 89  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||            ||||||    
T  24773976 atcagggttcaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtattaactttaatatataagaagatatataaga 24774075  T
Q  90 agatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  24774076 agatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttacacaaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggt 24774175  T
Q  190 taaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24774176 taaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataa 24774229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 39031842 - 39032090
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatata--------------agaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||              | ||||    
T  39031842 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatatataagaagatatataataaga 39031941  T
Q  93 tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  39031942 tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcatggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttagattaa 39032041  T
Q  193 aattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39032042 aattagggctaaaatatgctt--gtgttaactttaatatataagaagataa 39032090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24775128 - 24775380
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||            |||||    
T  24775128 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttagattaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatatataag 24775227  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  24775228 aagatgtatcgagaaattgagtagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatccggattaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 24775327  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  24775328 ttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 24775380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31097510 - 31097339
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31097510 gttaactttaatatataaaaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 31097411  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  31097410 tttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 31097339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40964339 - 40964156
Alignment:
Q  63 cttctatgttaactttaatatataagaaga-----tgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggt 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40964339 cttctgtgttaactttaatatataagaagagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaagaaatttagcatcagggt 40964240  T
Q  158 taaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40964239 taaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggataaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagat 40964156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 243
Target Start/End: Original strand, 24774781 - 24774944
Alignment:
Q  80 atatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24774781 atatataagaagatgtatcgagaaattgagtagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatattaaatttatgcaat 24774880  T
Q  180 agattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24774881 aggtttaggtttaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataa 24774944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40964248 - 40964095
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40964248 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggataaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 40964149  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcag 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40964148 gaaattgagaagagggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcag 40964095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32656612 - 32656461
Alignment:
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||    
T  32656612 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaa-ttcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagaaaatttatgcaataggtttagg 32656514  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  32656513 ttaaaattagagctaaaatatacttctgtgttaactttaatatataagaagat 32656461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32660832 - 32660729
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  32660832 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 32660733  T
Q  240 ataa 243  Q
    ||||    
T  32660732 ataa 32660729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Original strand, 24773950 - 24774068
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  24773950 aataaggttaaacaaaggaattcagtatcagggttcaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtattaac 24774049  T
Q  224 tttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  24774050 tttaatatataagaagata 24774068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24774135 - 24774227
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24774135 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 24774227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 16377326 - 16377420
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgt 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377326 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaatatgt 16377420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 24774518 - 24774619
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  24774518 ggaatttaacatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 24774617  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  24774618 at 24774619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40966541 - 40966456
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40966541 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaaga 40966456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24774405 - 24774497
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24774405 catcagggttaaaatagtaaatttatacaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 24774497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24775437 - 24775529
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24775437 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 24775529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 40963191 - 40963099
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40963191 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 40963099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 21754149 - 21754235
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21754149 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 21754235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 21758743 - 21758829
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21758743 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttatgttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 21758829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 21759010 - 21759096
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21759010 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 21759096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 21759277 - 21759363
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21759277 ggttaaaacagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 21759363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40963100 - 40963002
Alignment:
Q  143 atttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  40963100 atttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 40963002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40963197 - 40963099
Alignment:
Q  143 atttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  40963197 atttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 40963099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 21754141 - 21754238
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21754141 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagataat 21754238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 24774248 - 24774349
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||    
T  24774248 ggaatttagcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgctaactttaatatataagaag 24774347  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  24774348 at 24774349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 27904121 - 27904222
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  27904121 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagattaaaattaaggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 27904220  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  27904221 at 27904222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 241
Target Start/End: Original strand, 16377182 - 16377270
Alignment:
Q  153 agggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16377182 agggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagaagat 16377270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 234
Target Start/End: Original strand, 39031834 - 39031921
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatata 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39031834 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgtgttaactttaatatata 39031921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 32660915 - 32660833
Alignment:
Q  9 ttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaag 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32660915 ttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgtaaactttaatatataagaag 32660833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Original strand, 21758735 - 21758832
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21758735 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttatgttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataat 21758832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Original strand, 21759010 - 21759099
Alignment:
Q  155 ggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21759010 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttttgtgttaactttaatatataagaagataat 21759099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 21759690 - 21759779
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaa 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21759690 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgctttggtgttaactttaatatataagaa 21759779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 242
Target Start/End: Original strand, 24775120 - 24775221
Alignment:
Q  141 gaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  24775120 gaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttagattaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaaga 24775219  T
Q  241 ta 242  Q
    ||    
T  24775220 ta 24775221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32656553 - 32656460
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatg 94  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32656553 catcagggttaaaatagaaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagagctaaaatatacttctgtgttaactttaatatataagaagatg 32656460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40966549 - 40966456
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  40966549 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaaga 40966456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 244
Target Start/End: Original strand, 21759276 - 21759366
Alignment:
Q  154 gggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21759276 gggttaaaacagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataat 21759366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31096840 - 31096746
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgt 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  31096840 catcagggttaaaatagtaaatttatgccataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagatgt 31096746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 21759536 - 21759625
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaa 236  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21759536 agcattagggtttaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataaa 21759625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 39031998 - 39032088
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  39031998 catcatggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttagattaaaattagggctaaaatatgct--tgtgttaactttaatatataagaagat 39032088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 79
Target Start/End: Original strand, 21754674 - 21754746
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaacttta 79  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21754674 ggttaaaatagtaaatttaagcaataggtttaggttaaaattaaggctaaaatatgcttctgtgttaacttta 21754746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32660920 - 32660837
Alignment:
Q  152 cagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  32660920 caggtttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgtaaactttaatatataa 32660837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Original strand, 39031240 - 39031317
Alignment:
Q  17 gtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39031240 gtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 39031317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 39031462 - 39031548
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39031462 ggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattaggcctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataataaga 39031548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40962939 - 40962853
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatg 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40962939 gttaaaatagtaaatttatgcaataaatttatgttaaaattaaggttaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagatgatg 40962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Original strand, 21754666 - 21754746
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaacttta 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21754666 agcattagggttaaaatagtaaatttaagcaataggtttaggttaaaattaaggctaaaatatgcttctgtgttaacttta 21754746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 240
Target Start/End: Original strand, 39031454 - 39031548
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  39031454 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattaggcctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataataaga 39031548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Original strand, 39031262 - 39031317
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  39031262 aggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 39031317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 21754416 - 21754466
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaa 57  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21754416 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaa 21754466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 205
Target Start/End: Original strand, 21754414 - 21754466
Alignment:
Q  153 agggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaa 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21754414 agggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaa 21754466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 40963235 - 40963196
Alignment:
Q  54 taaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40963235 taaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 40963196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30353654 - 30353598
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30353654 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagagtttaggttaaaattagggct 30353598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 21805817 - 21805865
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21805817 ggttaaaatagtaaaattatgcaataaggtttaggttaaaattagggct 21805865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 30353646 - 30353598
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatag-gtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30353646 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagagtttaggttaaaattagggct 30353598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Original strand, 33918092 - 33918148
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33918092 agcattagggttaaaatggtaaaattatgcaataggatttaggttaaaattagggct 33918148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 202
Target Start/End: Original strand, 39031326 - 39031382
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaata-gattcaggttaaaattagggct 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  39031326 agcattagggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 39031382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 39031334 - 39031382
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39031334 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 39031382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 51)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 276 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 18674325 - 18673948
Alignment:
Q  276 aaataataacttaagtacttattcaaaattgaaaca-cggtaaannnnnnnnnnngttacatcaatatttgttcccc-tttattcgagtttgaacccgaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  18674325 aaataataacttaagtacttattcaaaattgaaacaacggtaattttttttagttgttacatcaatattttttccccctttattcgagtttgaatccgga 18674226  T
Q  374 actttcaacnnnnnnnnngactcttat--ctcaaaccggttaagataagtgagaaagcaaaaa-tgaaaatctagataagtgtacatgcattacagttac 470  Q
    | |||||||         |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18674225 attttcaacttttgt---gactcttatatctcaaaccggttaagataagtgaaaaagaaaaaaatgaaaatcgagaaaagtgaacatgcattacagttac 18674129  T
Q  471 atatctatatcatcatgcaagtcataatacttttttcttttatgacgtattgttttggagatggagtaaaataagggtgagagttagaagcagccttggt 570  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18674128 atgtctat--catcatgcaagtcataatacttttttcttttatgacgtattattttggagatggagtaaaagaagggtgagagttagaagcagccttggt 18674031  T
Q  571 taatcaatttgactgcc-------atgttatttcaatccgaaaattgtgtgttccctcacaaggaaaatccttcaaagctatg 646  Q
    ||||||||||||| |||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18674030 taatcaatttgaccgccattatagatgttatttcaatcagaaaattgtgtgttccctcacaagaaaaatccttcaaagctatg 18673948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2004627 - 2004389
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2004627 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 2004528  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||     
T  2004527 gaaattgagaa-ggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatca-ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagga 2004430  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  2004429 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 2004389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 919008 - 918768
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  919008 catcagggttaaaatattaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagggttaactttaatatataagaagatgtatcga 918909  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||  |    
T  918908 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattaatg 918809  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  918808 ctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 918768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8658354 - 8658586
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8658354 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgt-tcga 8658452  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8658453 gaaattgagaagggggaaa-ttcaataaggttaaacaaatgaatttatcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggg 8658551  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  8658552 ctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataa 8658586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Original strand, 8658691 - 8658911
Alignment:
Q  21 atttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaa 120  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8658691 atttatgcaataggtttatgttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgt-tcgagaaattgagaagggggaaaa 8658789  T
Q  121 ttcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgtt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8658790 ttcaataaggttaaacaaaagaatttagcatcagagtttaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgtt 8658889  T
Q  221 aactttaatatataaaaagata 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  8658890 aactttaatatataagaagata 8658911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33034802 - 33034569
Alignment:
Q  10 taaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataaga------agatgtatcgagaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  33034802 taaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagatatataagatgtatcgagaa 33034703  T
Q  104 attgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggcta 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33034702 attgaga-gggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaacttatgcaatagatttaggttaaaattaggacta 33034604  T
Q  204 aaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaa 238  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33034603 aaatatgcttctgtgttaactttaatatataaaaa 33034569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33034964 - 33034725
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataaga------agatg 94  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||      |||||    
T  33034964 catcaacgttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataagatatataagatg 33034865  T
Q  95 tatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaa 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33034864 tatcgagaaattgaga-gggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttaacattagggataaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaa 33034766  T
Q  195 ttagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33034765 ttagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataa 33034725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 33289342 - 33289584
Alignment:
Q  9 ttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga--------tgtatcga 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  33289342 ttaaaatagtaaatttatgcaagaggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagataataagatgtatcga 33289441  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||     
T  33289442 gaaattgagaagggggaaaattcaataagattaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagga 33289541  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  33289542 ctaaaatatgcttctgtattaactttaatatataataagataa 33289584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24570829 - 24571061
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24570829 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcga 24570928  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  24570929 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttaacatc----------tagtaaatttatacaataggtttaggttaaaattaggg 24571018  T
Q  201 ctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24571019 ctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagataa 24571061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 8658200 - 8658446
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat------------ataagaagatg 94  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||            |||||||||||    
T  8658200 ggttaaaatagtacatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtggtaactttaatatataagaagatatataagaagatg 8658299  T
Q  95 tatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  8658300 tatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatatgtttaggttaaaa 8658399  T
Q  195 ttagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  8658400 ttagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 8658446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 919167 - 918916
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaat------------atataag 88  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||            |||||||    
T  919167 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagagttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatttataagaagatatataag 919068  T
Q  89 aagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||    
T  919067 aagatgtatcgggaaattgagaagggggaaa-ttcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatattaaatttatgcaataggtttagg 918969  T
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  918968 ttaaaattagggctaaaatatgcttcagggttaactttaatatataagaagat 918916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 918860 - 918665
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcga 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  918860 catcagggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattaatgctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagatgtatcaa 918761  T
Q  101 gaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaatta 197  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  918760 gaaattgagaa-ggggaaaatttaataaggttaaagaaaggaatttagcatcagagttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagtttaaaatta 918665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 33289255 - 33289429
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  33289255 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaggattaaaatagtaaa 33289354  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataat 244  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33289355 tttatgcaagaggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagataat 33289429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 920678 - 920467
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat------- 93  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||           
T  920678 catcagggttcaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatatataagaagatatataag 920579  T
Q  94 -----gtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcagg 188  Q
         ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  920578 aagatgtatcggaaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcaggtttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagg 920479  T
Q  189 ttaaaattaggg 200  Q
    ||||||||||||    
T  920478 ttaaaattaggg 920467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2004663 - 2004535
Alignment:
Q  113 ggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2004663 ggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgct 2004564  T
Q  213 taagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  2004563 tctgtgttaactttaatatataagaagat 2004535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 920703 - 920585
Alignment:
Q  124 aataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaac 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  920703 aataaggttaaacaaatgaatttagcatcagggttcaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaac 920604  T
Q  224 tttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  920603 tttaatatataagaagata 920585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 241
Target Start/End: Original strand, 24570811 - 24570921
Alignment:
Q  131 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24570811 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaata 24570910  T
Q  231 tataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||    
T  24570911 tataagaagat 24570921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 919176 - 919074
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  919176 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagagttaggttaaaattagggctaaaatatgcttcagtgttaactttaatttataagaag 919077  T
Q  240 ata 242  Q
    |||    
T  919076 ata 919074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 241
Target Start/End: Original strand, 8658591 - 8658692
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  8658591 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaataagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaag 8658690  T
Q  240 at 241  Q
    ||    
T  8658691 at 8658692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 8658600 - 8658692
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8658600 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaataagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 8658692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 8658500 - 8658590
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaag 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8658500 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaag 8658590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33034973 - 33034878
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33034973 ggaatttagcatcaacgttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggttaaaatatgcttatgtgttaactttaatatataa 33034878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Original strand, 8658829 - 8658910
Alignment:
Q  12 aaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8658829 aaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 8658910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 33289490 - 33289582
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  33289490 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattaggactaaaatatgcttctgtattaactttaatatataataagat 33289582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 242
Target Start/End: Original strand, 8658185 - 8658287
Alignment:
Q  140 ggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaag 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| |||    
T  8658185 ggaatttagcattagggttaaaatagtacatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtggtaactttaatatataagaag 8658284  T
Q  240 ata 242  Q
    |||    
T  8658285 ata 8658287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Original strand, 8658038 - 8658115
Alignment:
Q  130 gttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaat 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8658038 gttaaacaaatgaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaat 8658115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 33034658 - 33034572
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataa 87  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33034658 catcagggttaaaatagtaaacttatgcaatagatttaggttaaaattaggactaaaatatgcttctgtgttaactttaatatataa 33034572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22275642 - 22275553
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  22275642 aaggttaaaacagtaaattaatgcaataggatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctggattaactttaatatataagaagat 22275553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22275534 - 22275445
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22275534 aaggttaaaacagtaaattaatgcaatagggtttaggttaaaattaggcctaaaatatgcttcggggttaactttaatatataagaagat 22275445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 8658112 - 8658184
Alignment:
Q  19 aaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaag 91  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8658112 aaatttatgcaataagtttaggttaaaattagggataaaatatgcttctgtgttaactttaaaatataagaag 8658184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 8658057 - 8658115
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaat 59  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8658057 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaat 8658115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22275653 - 22275551
Alignment:
Q  142 aatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatag-attcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||    
T  22275653 aattaagcattaaggttaaaacagtaaattaatgcaataggatttaggttaaaattagggctaaaatatgcttctggattaactttaatatataagaaga 22275554  T
Q  241 taa 243  Q
    |||    
T  22275553 taa 22275551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22275211 - 22275126
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatag-gtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataaga 89  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  22275211 aaggttaaaacagtaaattaatgcaatagtgtttaggttaaaattagggctaaaatattcttccgggttaactttaatatataaga 22275126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22275318 - 22275230
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22275318 aaggttaaaacaataaattaatgcaatagggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttc-gggttaactttaatatataagaagat 22275230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22275870 - 22275786
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaa 90  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  22275870 ggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaagtagggctaaaatatgcttccgggttaactttaatatataagaa 22275786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22275532 - 22275443
Alignment:
Q  155 ggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22275532 ggttaaaacagtaaattaatgcaatagggtttaggttaaaattaggcctaaaatatgcttcggggttaactttaatatataagaagataa 22275443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22275878 - 22275789
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  22275878 agcattagggttaaaacagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaagtagggctaaaatatgcttccgggttaactttaatatataa 22275789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6716785 - 6716706
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatat 83  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  6716785 aaggttaaaatagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatat 6716706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6716804 - 6716706
Alignment:
Q  134 aacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatat 231  Q
    |||||| ||| | ||||| | |||||||||||||| || | ||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6716804 aacaaatgaaataagcattaaggttaaaatagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattagggctaaaataagcttatgtgttaactttaatat 6716706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22275222 - 22275128
Alignment:
Q  142 aatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||| || |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  22275222 aattaagcattaaggttaaaacagtaaattaatgcaatagtgtttaggttaaaattagggctaaaatattcttccgggttaactttaatatataa 22275128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22275437 - 22275335
Alignment:
Q  142 aatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaataga-ttcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||| ||||| | |||||| | ||||| || |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||    
T  22275437 aattaagcattaaggttaagacagtaaattaatgcaatagagtttaagttaaaattaggactaaaatatgctttcgggttaactttaatatataagaaga 22275338  T
Q  241 taa 243  Q
    |||    
T  22275337 taa 22275335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 918706 - 918653
Alignment:
Q  8 gttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatat 61  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  918706 gttaaaatagtaaatttatgcaataggtttagtttaaaattattgttaaaatat 918653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Original strand, 8658115 - 8658180
Alignment:
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataa 235  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  8658115 tttatgcaataagtttaggttaaaattagggataaaatatgcttctgtgttaactttaaaatataa 8658180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22275284 - 22275228
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22275284 aggttaaaattagggctaaaatatgctt-cgggttaactttaatatataagaagataa 22275228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22275426 - 22275337
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatag-gtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22275426 aaggttaagacagtaaattaatgcaatagagtttaagttaaaattaggactaaaatatgctttcgggttaactttaatatataagaagat 22275337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22275750 - 22275661
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22275750 aaggttaaaacaataaattaatgcaatagggtttagcttaaaattagggttaaaatatgctttcgggttaactttaatatataagaagat 22275661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22275713 - 22275659
Alignment:
Q  189 ttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22275713 ttaaaattagggttaaaatatgctttcgggttaactttaatatataagaagataa 22275659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2272013 - 2271958
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  2272013 aggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagat 2271958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2272020 - 2271958
Alignment:
Q  31 taggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  2272020 tagggttaggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagat 2271958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2265750 - 2265702
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2265750 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 2265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19996122 - 19996074
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaata-ggtttaggttaaaattatggct 54  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19996122 ggttaaaatagtaaaattatgcaatagggtttaggttaaaattagggct 19996074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23431 - 23197
Alignment:
Q  7 ggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23431 ggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgcgttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaatt 23332  T
Q  107 gagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23331 gagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagtattagggttaaagtagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaa 23232  T
Q  207 tatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23231 tatgcttttgtgttaactttaatatataagaagat 23197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23439 - 23345
Alignment:
Q  147 agcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  23439 agcattagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgcttatgcgttaactttaatatataagaagat 23345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Original strand, 10559 - 10731
Alignment:
Q  70 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggggaaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10559 gttaactttaatatataagaagatgtatcgagaaattgagaagggg-aaaattcaataaggttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaa 10657  T
Q  170 tttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagataa 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10658 tttatgcaatagatttaggttaaaattagggataaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagataa 10731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 10637 - 10729
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10637 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaatagatttaggttaaaattagggataaaatatgcttctgtgttaactttaatatataagaagat 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 131 - 241
Target Start/End: Original strand, 12626 - 12736
Alignment:
Q  131 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaattttatgcaatagattcaggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaata 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  12626 ttaaacaaaggaatttagcatcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaata 12725  T
Q  231 tataaaaagat 241  Q
    ||||| |||||    
T  12726 tataagaagat 12736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 12644 - 12736
Alignment:
Q  1 catcaaggttaaaatagtaaatttatgtaataggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12644 catcagggttaaaatagtaaatttatgcaataggtttaggttaaaattagggctaaaatatgtttctgtgttaactttaatatataagaagat 12736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 5321 - 5375
Alignment:
Q  188 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5321 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagata 5375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 93
Target Start/End: Original strand, 5321 - 5374
Alignment:
Q  40 gttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5321 gttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataagaagat 5374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0252 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0252
Description:

Target: scaffold0252; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23675 - 23587
Alignment:
Q  5 aaggttaaaatagtaaatttatgtaatagg-tttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaaga 92  Q
    |||||||||| |||||||| | | | |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23675 aaggttaaaacagtaaattaaggcattagggtttaggttaaaattaaggctaaaataagcttatatgttaactttaatatataataaga 23587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0252; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23641 - 23587
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaaga 240  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  23641 aggttaaaattaaggctaaaataagcttatatgttaactttaatatataataaga 23587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31581 - 31525
Alignment:
Q  186 aggttaaaattagggctaaaatatgcttaagtgttaactttaatatataaaaagata 242  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31581 aggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagata 31525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 31588 - 31526
Alignment:
Q  31 taggtttaggttaaaattatggctaaaatatgcttctatgttaactttaatatataagaagat 93  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31588 tagggttaggttaaaattagggcaacaataagcttacttgttaactttaatatataagaagat 31526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 96
Target Start/End: Original strand, 38803 - 38831
Alignment:
Q  68 atgttaactttaatatataagaagatgta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38803 atgttaactttaatatataagaagatgta 38831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University