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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20969_high_1 (Length: 894)

Name: NF20969_high_1
Description: NF20969
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20969_high_1
NF20969_high_1
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (14-894)||(3087907-3088787)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 801; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 801; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 894
Target Start/End: Original strand, 3087907 - 3088787
Alignment:
Q  14 catcagaagcagttcatcatttgttacctccccatgtcaatggtaacttatcagccttatgtgtatggcctgatcaaattaggcactggtacaaatatag 113  Q
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T  3087907 catcagaagcagttcatcatttgttacctccccatgtcaatggtaacttatcagccttatgtgtatggcctgatcaaattaggcactggtacaaatatag 3088006  T
Q  114 atggacaagtccacttcatttcattgacacaccagatgaaaaatgtggttttcaatattcaagtaagcactatttgtatatgtagttatttttgtcatgt 213  Q
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T  3088007 atggacaagtccactacatttcattgacacaccagatgaaaaatgtggttttcaatattcaagtaagcactatttgtatatgtagttatttttgtcatgt 3088106  T
Q  214 gctcttattaaatctcaaaaatatttatttttaatgcaacattttgttgctgttaacaaacataggggactgccatgaggatatgtgtgttgcaggagct 313  Q
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T  3088107 gctcatattaaatctcaaaaatatttatttttaatgcaacattttgttgctgttaacaaacataggggactgccttgaggacatgtgtgttgcaggagct 3088206  T
Q  314 atcaaaaatttcacttctcaactttctcattacaaagagggaacatctgatcgtagatgtaaggaactcatgtctgtcatttattttccctttcagaaat 413  Q
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T  3088207 atcaaaaatttcacttctcaactttctcattacaaagagggaacatctgatcgtagatgtaaggaactcatgtctgtcattttttttccctttcagaaat 3088306  T
Q  414 ttttagacttattttacttcatgatattaattactggagattttgttnnnnnnnnnnnntaccattaactggagatattgcagataatatgaccgaggca 513  Q
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T  3088307 ttttagacttattttacttcatgatattaattactggagattttgttaaaaaaaaaaaatactattaactggagatattgcagataatatgaccgaggca 3088406  T
Q  514 ttattgttcttgtcacacttcatgggagatattcaccaggtttgtctaaagatttttaaaatttcttttatcatattactccctttgtcttatcatagat 613  Q
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T  3088407 ttattgttcttgtcacacttcatgggagatattcaccaggtttgtctaaagatttttaaaatttcttttatcatattactccctttgtcttatcatagat 3088506  T
Q  614 atctttcattttgtatcagccgatgcacgttggattcacctcagacaaaggtggaaacacgattgatctacgctggtatcggcacaaatctaatctgcat 713  Q
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T  3088507 atctttcatttcatatcagccgatgcacgttggattcacctcagacaaaggtggaaacacgattgatctacgctggtatcggcacaaatctaatctgcat 3088606  T
Q  714 catgtaagcaaaaaatttgttactagcatacggatttacaaaacaactttgttaagcgaattttagattcttcatgctgaaggaaattgagtcagatata 813  Q
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T  3088607 catgtaagcaaaaaatatgttactagcatacagatttacaaaacaacttcgttaagcgaattttagattcttcatgctgaaggaaattgagtcagatata 3088706  T
Q  814 atttcttcatgtgacatttttgtttttcttgtttatgcttataaggtgtgggacagagaaattattctcacagcattagca 894  Q
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T  3088707 atttcttcatgtgacatttttgtttttcttgtttatgcttataaggtgtgggacagagaaattattctcacagcattagca 3088787  T

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